README.md
pyproject.toml
src/vstol.egg-info/PKG-INFO
src/vstol.egg-info/SOURCES.txt
src/vstol.egg-info/dependency_links.txt
src/vstol.egg-info/entry_points.txt
src/vstol.egg-info/top_level.txt
src/vstolib/__init__.py
src/vstolib/annotator.py
src/vstolib/constants.py
src/vstolib/default.py
src/vstolib/gencode.py
src/vstolib/index.py
src/vstolib/intersect.py
src/vstolib/logging.py
src/vstolib/main.py
src/vstolib/overlap.py
src/vstolib/position_annotation.py
src/vstolib/utilities.py
src/vstolib/cli/__init__.py
src/vstolib/cli/cli_annotate.py
src/vstolib/cli/cli_diff.py
src/vstolib/cli/cli_intersect.py
src/vstolib/cli/cli_main.py
src/vstolib/cli/cli_merge.py
src/vstolib/cli/cli_overlap.py
src/vstolib/cli/cli_vcf2tsv.py
src/vstolib/vcf/__init__.py
src/vstolib/vcf/clairs.py
src/vstolib/vcf/common.py
src/vstolib/vcf/cutesv.py
src/vstolib/vcf/dbsnp.py
src/vstolib/vcf/deepvariant.py
src/vstolib/vcf/delly2.py
src/vstolib/vcf/gatk4_mutect2.py
src/vstolib/vcf/lumpy.py
src/vstolib/vcf/manta.py
src/vstolib/vcf/pbsv.py
src/vstolib/vcf/savana.py
src/vstolib/vcf/severus.py
src/vstolib/vcf/sniffles2.py
src/vstolib/vcf/strelka2.py
src/vstolib/vcf/svim.py
src/vstolib/vcf/svisionpro.py
test/test_annotate.py
test/test_diff.py
test/test_intersect.py
test/test_merge.py
test/test_overlap.py
test/test_vcf2tsv.py