README.md
setup.py
test/test_endtoend_tooldog.py
test/test_unit_tooldog.py
tooldog/__init__.py
tooldog/biotool_model.py
tooldog/main.py
tooldog/tmp.py
tooldog/version.py
tooldog.egg-info/PKG-INFO
tooldog.egg-info/SOURCES.txt
tooldog.egg-info/dependency_links.txt
tooldog.egg-info/entry_points.txt
tooldog.egg-info/requires.txt
tooldog.egg-info/top_level.txt
tooldog/analyse/__init__.py
tooldog/analyse/code_collector.py
tooldog/analyse/container.py
tooldog/analyse/language_analyzer.py
tooldog/analyse/tool_analyzer.py
tooldog/analyse/utils.py
tooldog/annotate/__init__.py
tooldog/annotate/cwl.py
tooldog/annotate/edam_to_galaxy.py
tooldog/annotate/galaxy.py
tooldog/annotate/data/edam_data.json
tooldog/annotate/data/edam_formats.json
tooldog/annotate/data/edam_to_galaxy.json
tooldog/annotate/data/mapping.json
tooldog/annotate/data/version.json