chr	start	end	type	size	id	coverage	covr	dpe_rat	sr_rat	HET_ratio	normHET_ratio	HET_SNPs	copy_number
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG00096	1.311	1.38	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG00268	1.175	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG00419	1.557	1.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG00759	1.424	1.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG01051	1.587	1.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG01112	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG01500	1.127	1.186	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG01565	1.516	1.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG01583	1.258	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG01595	1.243	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG01879	1.417	1.492	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG02568	0.734	0.773	0.0	0.077	0.75	0.75	1	1
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG02922	1.425	1.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG03006	1.471	1.549	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG03052	1.462	1.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG03642	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	HG03742	1.392	1.466	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA12878	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA18525	1.584	1.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA18939	1.128	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA19017	0.954	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA19238	1.063	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA19239	1.281	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA19625	0.938	0.987	0.0	0.038	0.688	0.688	1	1
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA19648	1.174	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA20502	1.125	1.185	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	100843536	100843594	DEL	59	NA20845	1.166	1.227	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG00096	1.067	0.997	0.0	0.0	0.903	0.946	1	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG00268	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG00419	0.0	0.0	0.214	0.177	nan	nan	0	0
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG00759	0.498	0.466	0.053	0.043	0.389	0.389	7	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG01051	1.079	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG01112	0.987	0.922	0.0	0.0	1.0	0.944	1	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG01500	0.0	0.0	0.185	0.193	nan	nan	0	0
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG01565	1.281	1.197	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG01583	1.233	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG01595	0.601	0.562	0.043	0.048	0.411	0.411	10	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG01879	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG02568	0.986	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG02922	1.166	1.09	0.004	0.002	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG03006	1.08	1.01	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG03052	1.178	1.101	0.0	0.0	0.821	0.775	2	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG03642	0.592	0.553	0.01	0.034	nan	nan	0	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	HG03742	0.545	0.509	0.058	0.063	0.632	0.665	9	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA12878	1.086	1.015	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA18525	0.498	0.466	0.037	0.075	0.329	0.343	10	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA18939	0.564	0.527	0.028	0.044	nan	nan	0	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA19017	0.63	0.589	0.039	0.033	0.154	0.154	9	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA19238	1.076	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA19239	0.988	0.923	0.0	0.0	0.979	0.979	1	2
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA19625	0.599	0.56	0.047	0.05	0.375	0.375	10	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA19648	0.485	0.453	0.063	0.056	0.433	0.462	10	1
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA20502	0.0	0.0	0.14	0.121	nan	nan	0	0
chr1	104443176	104443721	DEL	546	NA20845	0.628	0.587	0.066	0.063	nan	nan	0	1
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG00096	1.404	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG00268	1.264	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG00419	1.178	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG00759	1.343	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG01051	1.312	1.203	0.0	0.0	0.692	0.698	2	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG01112	1.423	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG01500	1.533	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG01565	1.409	1.293	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG01583	0.937	0.86	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG01595	1.305	1.198	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG01879	0.951	0.872	0.003	0.0	0.833	0.833	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG02568	0.928	0.851	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG02922	1.08	0.991	0.0	0.0	0.926	0.992	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG03006	1.471	1.35	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG03052	1.244	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG03642	1.261	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	HG03742	1.17	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA12878	0.534	0.49	0.081	0.045	nan	nan	0	1
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA18525	1.193	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA18939	1.276	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA19017	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA19238	1.305	1.197	0.0	0.0	0.589	0.589	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA19239	1.228	1.126	0.0	0.0	0.804	0.804	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA19625	1.224	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA19648	1.072	0.983	0.0	0.0	0.864	0.921	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA20502	1.079	0.989	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	105218662	105219460	DEL	799	NA20845	1.323	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG00096	1.03	1.084	0.0	0.0	0.955	0.911	2	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG00268	0.908	0.956	0.0	0.0	0.571	0.571	2	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG00419	0.82	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG00759	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG01051	0.656	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG01112	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG01500	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG01565	0.619	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG01583	0.666	0.701	0.0	0.0	0.755	0.755	2	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG01595	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG01879	0.578	0.608	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG02568	0.541	0.57	0.0	0.0	0.606	0.606	2	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG02922	0.389	0.409	0.029	0.032	nan	nan	0	1
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG03006	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG03052	0.349	0.367	0.036	0.042	0.375	0.397	1	1
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG03642	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	HG03742	0.666	0.701	0.0	0.0	0.525	0.499	2	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA12878	0.845	0.889	0.0	0.0	0.72	0.72	3	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA18525	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA18939	0.925	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA19017	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA19238	0.78	0.821	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA19239	0.948	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA19625	0.651	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA19648	0.791	0.833	0.0	0.0	0.684	0.641	1	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA20502	0.938	0.987	0.0	0.0	0.762	0.762	2	2
chr1	105269141	105269597	DEL	457	NA20845	0.717	0.755	0.0	0.005	0.933	0.989	3	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG00096	0.412	0.4	0.052	0.036	nan	nan	0	1
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG00268	1.095	1.063	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG00419	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG00759	1.16	1.126	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG01051	1.312	1.273	0.0	0.0	0.621	0.662	1	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG01112	1.025	0.995	0.0	0.0	0.643	0.607	1	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG01500	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG01565	1.26	1.223	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG01583	0.518	0.503	0.104	0.054	nan	nan	0	1
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG01595	1.347	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG01879	1.063	1.032	0.0	0.003	0.567	0.567	1	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG02568	1.237	1.201	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG02922	0.0	0.0	0.264	0.157	nan	nan	0	0
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG03006	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG03052	0.851	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG03642	0.566	0.55	0.07	0.034	nan	nan	0	1
chr1	105667567	105668446	DEL	880	HG03742	1.09	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA12878	0.982	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA18525	0.855	0.83	0.0	0.0	0.905	0.867	1	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA18939	0.629	0.61	0.068	0.03	nan	nan	0	1
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA19017	1.126	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA19238	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA19239	0.52	0.505	0.08	0.036	nan	nan	0	1
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA19625	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA19648	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA20502	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	105667567	105668446	DEL	880	NA20845	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG00096	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG00268	1.246	1.165	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG00419	1.136	1.062	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG00759	1.139	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG01051	1.269	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG01112	1.12	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG01500	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG01565	0.897	0.838	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG01583	1.036	0.968	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG01595	1.119	1.046	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG01879	0.615	0.575	0.044	0.061	nan	nan	0	1
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG02568	1.082	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG02922	1.49	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG03006	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG03052	1.244	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG03642	1.261	1.178	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	HG03742	1.271	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA12878	0.913	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA18525	1.139	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA18939	0.999	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA19017	0.63	0.589	0.023	0.041	nan	nan	0	1
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA19238	0.996	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA19239	0.974	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA19625	1.25	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA19648	0.995	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA20502	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	107081794	107082334	DEL	541	NA20845	0.986	0.922	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG00096	0.58	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG00268	0.498	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG00419	0.61	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG00759	0.427	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG01051	0.508	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG01112	0.569	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG01500	0.757	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG01565	0.662	0.871	0.0	0.0	0.917	0.917	2	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG01583	0.666	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG01595	0.269	0.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG01879	0.634	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG02568	0.58	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG02922	0.626	0.824	0.0	0.0	0.727	0.679	1	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG03006	0.689	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG03642	0.695	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	HG03742	0.585	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA12878	0.862	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA18525	0.908	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA18939	0.536	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA19017	0.477	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA19238	0.74	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA19239	0.867	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA19625	0.625	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA19648	0.893	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA20502	0.633	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1086817	1087023	DUP	207	NA20845	0.695	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG00096	1.086	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG00268	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG00419	1.01	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG00759	0.997	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG01051	1.015	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG01112	0.968	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG01500	1.274	1.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG01565	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG01583	1.085	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG01595	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG01879	1.137	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG02568	1.237	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG02922	0.788	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG03006	1.006	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG03052	1.156	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG03642	1.004	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	HG03742	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA12878	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA18525	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA18939	1.017	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA19017	0.897	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA19238	0.902	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA19239	1.014	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA19648	0.944	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA20502	1.055	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109028617	109028676	DUP	60	NA20845	0.941	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG00096	0.992	0.992	0.0	0.0	0.783	0.747	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG00268	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG00419	0.989	0.989	0.0	0.0	0.414	0.414	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG00759	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG01051	0.867	0.867	0.0	0.0	0.402	0.429	2	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG01112	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG01500	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG01565	0.961	0.961	0.0	0.0	0.346	0.346	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG01583	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG01595	0.642	0.642	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG01879	0.82	0.82	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG02568	0.928	0.928	0.007	0.0	0.875	0.875	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG02922	0.475	0.475	0.025	0.014	nan	nan	0	1
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG03006	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG03052	0.786	0.786	0.006	0.0	0.701	0.703	2	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG03642	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	HG03742	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA18525	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA18939	0.832	0.832	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA19017	0.897	0.897	0.0	0.0	0.78	0.78	2	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA19238	0.915	0.915	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA19239	0.467	0.467	0.063	0.023	0.129	0.129	12	1
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA19625	0.208	0.208	0.087	0.035	0.8	0.8	12	1
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA19648	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA20502	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	109602616	109603316	DEL	701	NA20845	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG00096	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG00268	0.997	0.997	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG00419	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG00759	0.936	0.936	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG01051	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG01112	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG01500	0.85	0.85	0.0	0.0	0.699	0.699	2	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG01565	0.961	0.961	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG01583	1.036	1.036	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG01595	1.326	1.326	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG01879	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG02568	1.276	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG02922	1.145	1.145	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG03006	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG03052	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG03642	1.004	1.004	0.0	0.0	0.632	0.684	1	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	HG03742	1.17	1.17	0.0	0.0	0.669	0.666	2	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA12878	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA18525	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA18939	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA19017	0.592	0.592	0.065	0.048	0.529	0.529	1	1
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA19238	1.346	1.346	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA19239	1.228	1.228	0.0	0.0	0.744	0.744	1	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA19625	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA19648	1.021	1.021	0.007	0.0	0.902	0.846	2	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA20502	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	111359565	111360435	DEL	871	NA20845	1.121	1.121	0.0	0.0	0.76	0.702	1	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG00096	0.524	0.582	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG00268	1.122	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG00419	0.484	0.538	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG00759	0.407	0.452	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG01112	0.55	0.612	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG01500	1.164	1.293	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG01565	0.342	0.38	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG01583	0.469	0.521	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG01595	0.974	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG01879	0.82	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG02568	0.966	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG02922	0.518	0.576	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.182	nan	nan	0	0
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG03052	1.091	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG03642	0.592	0.658	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	HG03742	0.293	0.325	0.0	0.074	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA12878	0.448	0.498	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA18525	0.935	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA18939	0.758	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA19017	0.916	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA19238	0.996	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA19239	0.921	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA19625	0.911	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.214	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA20502	0.563	0.625	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr1	112074694	112074805	DEL	112	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG00096	0.356	0.374	0.04	0.048	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG00268	0.463	0.487	0.021	0.051	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG00419	0.0	0.0	0.115	0.123	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG00759	0.0	0.0	0.093	0.172	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG01051	0.0	0.0	0.089	0.161	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG01112	0.0	0.0	0.085	0.108	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG01500	0.0	0.0	0.083	0.271	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG01565	0.0	0.0	0.159	0.135	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG01583	0.0	0.0	0.209	0.063	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG01595	0.0	0.0	0.099	0.095	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG01879	0.373	0.393	0.03	0.047	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG02568	0.271	0.285	0.081	0.031	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG02922	0.432	0.455	0.013	0.016	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG03006	0.0	0.0	0.201	0.152	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG03052	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG03642	0.335	0.352	0.03	0.023	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	HG03742	0.0	0.0	0.103	0.132	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA12878	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA18525	0.0	0.0	0.059	0.19	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA18939	0.0	0.0	0.101	0.185	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA19017	0.0	0.0	0.07	0.175	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA19238	0.807	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA19239	0.561	0.59	0.014	0.064	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA19625	0.417	0.439	0.019	0.032	nan	nan	0	1
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA19648	0.0	0.0	0.014	0.106	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA20502	0.0	0.0	0.089	0.102	nan	nan	0	0
chr1	113799625	113800089	DEL	465	NA20845	0.314	0.33	0.045	0.031	nan	nan	0	1
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG00096	0.768	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG00268	0.855	1.03	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG00419	0.379	0.456	0.049	0.126	nan	nan	0	1
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG00759	0.203	0.245	0.027	0.093	nan	nan	0	1
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG01051	0.571	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG01112	0.626	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG01500	0.665	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG01565	0.875	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG01583	1.011	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG01595	0.746	0.899	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG01879	0.205	0.247	0.017	0.068	nan	nan	0	1
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG02568	0.966	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG02922	0.67	0.807	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG03006	0.82	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG03052	0.938	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG03642	0.721	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	HG03742	0.706	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA12878	0.913	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA18525	0.0	0.0	0.005	0.214	nan	nan	0	0
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA18939	0.795	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA19017	0.744	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA19238	0.565	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA19239	0.734	0.884	0.0	0.0	0.821	0.821	1	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA19625	1.042	1.255	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA19648	1.123	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA20502	0.938	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1142714	1143140	DEL	427	NA20845	0.695	0.837	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG00096	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG00268	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG00419	0.715	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG00759	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG01051	0.762	0.802	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG01112	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG01500	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG01565	0.939	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG01583	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG01595	1.036	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG01879	0.634	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG02568	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG02922	0.475	0.5	0.017	0.095	nan	nan	0	1
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG03006	1.127	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG03052	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG03642	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	HG03742	0.787	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA12878	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA18525	0.712	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA18939	0.61	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA19017	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA19238	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA19239	0.881	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA19625	0.859	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA19648	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA20502	0.703	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	115445072	115445435	DEL	364	NA20845	0.807	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG00096	0.356	0.409	0.008	0.077	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG00268	0.0	0.0	0.007	0.16	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.169	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG00759	0.468	0.538	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG01112	0.0	0.0	0.007	0.182	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.139	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG01565	0.363	0.417	0.009	0.037	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG01583	0.395	0.454	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG01595	0.0	0.0	0.011	0.204	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG01879	0.373	0.429	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG02568	0.541	0.622	0.0	0.01	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG02922	0.454	0.521	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG03006	0.279	0.321	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG03052	0.873	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG03642	0.643	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	11682873	11683189	DEL	317	HG03742	0.303	0.348	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA12878	0.534	0.614	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA18525	1.015	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA18939	0.37	0.425	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA19017	0.458	0.526	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.216	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA19239	0.747	0.859	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA19625	0.443	0.509	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA19648	0.0	0.0	0.024	0.182	nan	nan	0	0
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA20502	0.328	0.377	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr1	11682873	11683189	DEL	317	NA20845	0.56	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG00096	1.067	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG00268	1.264	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG00419	0.736	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG00759	1.18	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG01051	1.142	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG01112	0.873	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG01500	0.924	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG01565	1.067	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG01583	1.233	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG01595	0.87	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG01879	0.82	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG02568	1.082	0.993	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG02922	0.95	0.872	0.0	0.004	0.8	0.857	1	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG03006	1.285	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG03052	0.436	0.4	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG03642	1.312	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	HG03742	1.19	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA12878	0.379	0.348	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA18525	0.89	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA18939	0.851	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA19017	0.935	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA19238	1.157	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA19239	1.121	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA19625	1.042	0.956	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA19648	1.378	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA20502	0.938	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	117002162	117002292	DEL	131	NA20845	1.121	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG00096	0.899	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG00268	0.659	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG00419	0.736	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG00759	0.977	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG01051	0.677	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG01112	0.873	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG01500	0.776	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG01565	0.427	0.491	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG01583	1.036	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG01595	0.58	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG01879	0.503	0.579	0.003	0.038	nan	nan	0	1
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG02568	0.734	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG02922	0.389	0.447	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG03006	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG03052	0.807	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG03642	0.798	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	HG03742	0.767	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA12878	0.793	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA18525	0.89	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA18939	1.11	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA19017	0.84	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA19238	0.888	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA19239	0.787	0.905	0.0	0.0	0.906	0.906	1	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA19625	0.573	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA19648	1.123	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA20502	0.985	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	118263749	118263990	DEL	242	NA20845	0.785	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG00096	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG00268	0.623	0.656	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG00419	0.715	0.753	0.0	0.0	0.719	0.719	2	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG00759	0.753	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG01051	0.783	0.824	0.0	0.0	0.674	0.632	4	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG01112	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG01500	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG01565	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG01583	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG01595	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG01879	0.634	0.667	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG02568	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG02922	0.626	0.659	0.0	0.0	0.561	0.524	2	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG03006	0.82	0.863	0.0	0.0	0.861	0.861	4	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG03052	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG03642	0.695	0.731	0.0	0.0	0.793	0.732	2	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	HG03742	0.827	0.871	0.0	0.0	0.769	0.81	3	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA12878	0.776	0.816	0.0	0.0	0.66	0.66	4	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA18525	0.677	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA18939	0.74	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA19017	1.088	1.145	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA19238	0.821	0.864	0.0	0.0	0.865	0.865	2	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA19239	0.747	0.787	0.0	0.0	0.863	0.863	2	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA19625	0.365	0.384	0.094	0.051	nan	nan	0	1
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA19648	0.893	0.94	0.0	0.0	0.765	0.816	3	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA20502	0.821	0.864	0.0	0.0	0.887	0.887	2	2
chr1	120012853	120013656	DEL	804	NA20845	0.717	0.755	0.0	0.005	0.857	0.791	3	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG00096	1.18	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG00268	1.335	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG00419	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG00759	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG01051	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG01112	1.177	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG01500	1.219	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG01565	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG01583	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG01595	0.995	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG01879	0.951	0.951	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG02568	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG02922	1.188	1.188	0.0	0.0	0.909	0.974	1	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG03006	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG03052	1.047	1.047	0.0	0.0	0.679	0.641	1	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG03642	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	HG03742	0.969	0.969	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA12878	0.758	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA18525	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA18939	0.37	0.37	0.0	0.023	0.885	0.885	1	1
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA19017	1.26	1.26	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA19238	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA19239	1.188	1.188	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA19625	1.198	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA19648	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA20502	1.266	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	12467580	12467652	DEL	73	NA20845	0.74	0.74	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG00096	0.917	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG00419	0.589	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG00759	0.326	0.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG01051	0.613	0.739	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG01112	0.493	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG01500	0.674	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG01565	0.64	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG01583	0.789	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG01595	0.414	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG01879	0.634	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG02568	0.657	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG02922	0.583	0.703	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG03006	0.671	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG03052	0.829	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG03642	0.54	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	HG03742	0.525	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA12878	0.724	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA18525	0.801	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA18939	0.703	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA19017	0.592	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA19238	0.565	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA19239	0.547	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA19625	0.703	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA19648	0.791	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA20502	0.657	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	1294138	1294195	DUP	58	NA20845	0.717	0.864	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG00096	0.805	0.895	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG00268	0.623	0.692	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG00759	0.387	0.43	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG01051	0.317	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG01112	0.759	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG01565	0.32	0.356	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG01583	1.011	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG01595	0.477	0.53	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG01879	0.503	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG02568	0.657	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG02922	0.324	0.36	0.0	0.012	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG03006	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG03052	0.349	0.388	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	14437868	14438136	DEL	269	HG03742	0.626	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA12878	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA18939	0.518	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA19017	0.592	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA19238	0.323	0.359	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA19239	0.601	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA19625	0.391	0.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA19648	0.613	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	14437868	14438136	DEL	269	NA20845	0.426	0.473	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	150037842	150037898	DUP	57	HG03052	0.502	0.469	0.0	0.004	0.818	0.773	1	2
chr1	150037842	150037898	DUP	57	NA19017	0.611	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	150037842	150037898	DUP	57	NA19625	0.469	0.438	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG00096	0.431	0.402	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG00268	0.997	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG00419	0.589	0.55	0.047	0.062	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG00759	0.651	0.608	0.01	0.038	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG01051	0.656	0.613	0.01	0.058	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG01112	0.304	0.284	0.017	0.03	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG01500	0.0	0.0	0.01	0.098	nan	nan	0	0
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG01565	0.427	0.399	0.0	0.023	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG01583	0.567	0.53	0.012	0.053	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG01595	0.725	0.678	0.015	0.056	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG01879	1.007	0.941	0.0	0.0	0.613	0.613	1	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG02568	0.0	0.0	0.03	0.068	nan	nan	0	0
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG02922	0.713	0.666	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG03006	0.522	0.487	0.0	0.038	0.368	0.368	1	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG03052	1.418	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG03642	1.107	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	HG03742	1.433	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA12878	0.396	0.37	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA18525	0.677	0.632	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA18939	0.555	0.519	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA19017	0.439	0.41	0.0	0.053	0.526	0.526	1	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA19238	1.399	1.308	0.0	0.0	0.702	0.702	1	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA19239	1.121	1.048	0.0	0.0	0.844	0.844	1	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA19625	0.872	0.815	0.029	0.044	nan	nan	0	1
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA19648	0.893	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA20502	0.0	0.0	0.015	0.08	nan	nan	0	0
chr1	153133703	153133960	DEL	258	NA20845	0.0	0.0	0.005	0.093	nan	nan	0	0
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG00096	0.749	0.788	0.007	0.0	0.579	0.553	3	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG00268	0.712	0.75	0.0	0.0	0.819	0.819	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG00419	0.905	0.952	0.0	0.0	0.817	0.817	4	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG00759	0.814	0.857	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG01051	0.783	0.824	0.0	0.0	0.912	0.855	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG01112	0.74	0.779	0.0	0.0	0.857	0.81	3	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG01500	1.053	1.108	0.0	0.0	0.685	0.685	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG01565	0.576	0.607	0.0	0.0	0.849	0.849	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG01583	0.937	0.986	0.0	0.0	0.622	0.622	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG01595	0.642	0.676	0.0	0.0	0.71	0.71	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG01879	0.671	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG02568	0.734	0.773	0.0	0.0	0.325	0.325	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG02922	0.67	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG03006	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG03052	0.676	0.712	0.0	0.0	0.857	0.908	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG03642	0.798	0.84	0.0	0.0	0.727	0.788	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	HG03742	0.706	0.743	0.0	0.0	0.417	0.439	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA12878	0.776	0.816	0.003	0.0	0.701	0.701	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA18525	0.89	0.937	0.0	0.0	0.85	0.887	3	1
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA18939	0.758	0.798	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA19017	0.802	0.844	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA19238	0.969	1.02	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA19239	0.814	0.857	0.0	0.0	0.95	0.95	2	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA19625	0.885	0.932	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA19648	1.072	1.128	0.0	0.0	0.722	0.677	3	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA20502	0.914	0.963	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr1	15343948	15344881	DEL	934	NA20845	0.74	0.779	0.0	0.0	0.778	0.843	1	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG00096	0.468	0.468	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG00268	1.211	1.211	0.0	0.0	0.634	0.634	1	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG00419	0.0	0.0	0.04	0.051	nan	nan	0	0
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG00759	0.651	0.651	0.0	0.017	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG01051	0.508	0.508	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG01112	0.0	0.0	0.034	0.045	nan	nan	0	0
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG01500	0.794	0.794	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG01583	0.543	0.543	0.014	0.041	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG01879	1.119	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG02568	1.276	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG02922	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	0
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG03052	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG03642	0.412	0.412	0.016	0.024	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	HG03742	0.424	0.424	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA18525	0.979	0.979	0.0	0.0	0.786	0.82	1	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA18939	0.647	0.647	0.0	0.029	0.502	0.502	2	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA19017	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA19238	1.224	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA19239	0.667	0.667	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA19625	0.651	0.651	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA19648	0.408	0.408	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA20502	0.516	0.516	0.008	0.037	nan	nan	0	1
chr1	157540655	157540871	DEL	217	NA20845	0.0	0.0	0.015	0.065	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG00096	0.917	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG00268	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG00419	0.379	0.368	0.008	0.038	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG00759	0.285	0.277	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG01112	0.512	0.498	0.016	0.028	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG01500	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG01565	0.299	0.29	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG01583	0.271	0.263	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG01595	0.228	0.221	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG02922	0.0	0.0	0.037	0.057	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG03006	0.0	0.0	0.015	0.057	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG03052	0.393	0.381	0.012	0.023	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG03642	0.425	0.412	0.027	0.041	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	HG03742	0.484	0.47	0.0	0.015	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA12878	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA18525	0.481	0.467	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA18939	0.0	0.0	0.01	0.047	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA19017	0.0	0.0	0.013	0.088	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA19238	0.363	0.353	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA19239	0.0	0.0	0.003	0.084	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA19625	0.0	0.0	0.028	0.069	nan	nan	0	0
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA19648	0.459	0.446	0.02	0.036	nan	nan	0	1
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA20502	0.938	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	158488410	158488679	DEL	270	NA20845	0.381	0.37	0.0	0.014	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG00096	0.0	0.0	0.306	0.227	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG00268	0.409	0.409	0.084	0.054	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG00419	0.358	0.358	0.087	0.065	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG00759	0.0	0.0	0.214	0.16	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG01051	0.0	0.0	0.263	0.168	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG01112	0.0	0.0	0.241	0.162	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG01500	0.0	0.0	0.288	0.185	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG01565	0.491	0.491	0.086	0.061	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG01583	0.543	0.543	0.064	0.027	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG01595	0.0	0.0	0.19	0.137	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG01879	0.0	0.0	0.286	0.177	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG02568	0.0	0.0	0.266	0.092	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG02922	0.0	0.0	0.341	0.159	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG03006	0.0	0.0	0.311	0.213	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG03052	0.0	0.0	0.301	0.194	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG03642	0.926	0.926	0.0	0.0	0.375	0.406	1	2
chr1	159648708	159649659	DEL	952	HG03742	0.464	0.464	0.072	0.059	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA12878	0.465	0.465	0.06	0.021	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA18525	0.0	0.0	0.203	0.125	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA18939	0.0	0.0	0.257	0.181	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA19017	0.611	0.611	0.093	0.068	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA19238	0.511	0.511	0.067	0.039	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA19239	0.0	0.0	0.341	0.183	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA19625	1.146	1.146	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA19648	0.0	0.0	0.246	0.157	nan	nan	0	0
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA20502	0.422	0.422	0.137	0.067	nan	nan	0	1
chr1	159648708	159649659	DEL	952	NA20845	0.448	0.448	0.067	0.043	nan	nan	0	1
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG00096	0.917	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG00268	1.068	1.124	0.005	0.0	0.708	0.708	1	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG00419	0.883	0.93	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG00759	0.285	0.3	0.054	0.092	0.214	0.214	3	1
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG01051	0.656	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG01112	0.901	0.949	0.0	0.0	0.714	0.756	1	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG01500	1.053	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG01565	0.897	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG01583	0.764	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG01595	0.808	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG01879	0.82	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG02568	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG02922	0.778	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG03006	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG03052	0.916	0.965	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG03642	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	HG03742	0.908	0.956	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA12878	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA18525	1.157	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA18939	0.703	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA19017	0.878	0.924	0.006	0.0	0.667	0.667	3	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA19238	0.821	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA19239	1.014	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA19625	1.094	1.151	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA19648	0.842	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA20502	1.102	1.16	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr1	160979498	160979991	DEL	494	NA20845	0.919	0.967	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG00096	1.18	1.18	0.004	0.0	0.8	0.838	3	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG00268	1.015	1.015	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG00419	0.694	0.694	0.0	0.0	0.864	0.864	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG00759	1.017	1.017	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG01051	0.867	0.867	0.0	0.0	0.864	0.921	3	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG01112	1.196	1.196	0.0	0.0	0.841	0.891	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG01500	0.979	0.979	0.0	0.0	0.642	0.642	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG01565	1.196	1.196	0.0	0.0	0.837	0.837	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG01583	0.888	0.888	0.0	0.0	0.521	0.521	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG01595	1.368	1.368	0.0	0.0	0.862	0.862	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG01879	1.156	1.156	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG02568	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG02922	1.102	1.102	0.0	0.0	0.773	0.721	3	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG03006	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG03052	0.916	0.916	0.0	0.0	0.941	0.997	1	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG03642	1.029	1.029	0.0	0.004	0.882	0.814	1	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	HG03742	1.17	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA12878	0.931	0.931	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA18525	0.908	0.908	0.0	0.0	0.727	0.697	1	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA18939	1.202	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA19017	0.515	0.515	0.029	0.038	nan	nan	0	1
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA19238	1.09	1.09	0.0	0.0	0.698	0.698	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA19239	1.041	1.041	0.0	0.0	0.632	0.632	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA19625	1.276	1.276	0.0	0.0	0.872	0.872	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA19648	0.995	0.995	0.0	0.0	0.754	0.707	2	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA20502	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166396577	166397091	DEL	515	NA20845	1.031	1.031	0.0	0.0	0.773	0.837	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG00096	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG00268	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG00419	0.905	0.905	0.0	0.0	0.646	0.646	2	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG00759	0.793	0.793	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG01051	0.825	0.825	0.0	0.0	1.0	0.938	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG01112	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG01500	0.979	0.979	0.003	0.0	0.88	0.88	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG01565	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG01583	0.986	0.986	0.0	0.0	0.66	0.66	2	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG01595	0.932	0.932	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG01879	1.044	1.044	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG02568	0.85	0.85	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG02922	0.994	0.994	0.0	0.0	0.842	0.856	4	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG03006	0.764	0.764	0.0	0.0	0.743	0.743	2	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG03052	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG03642	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	HG03742	1.09	1.09	0.0	0.0	0.758	0.72	2	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA18525	0.979	0.979	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA18939	0.703	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA19017	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA19238	0.982	0.982	0.004	0.0	0.815	0.815	2	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA19239	0.467	0.467	0.113	0.049	nan	nan	0	1
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA19625	0.964	0.964	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA19648	0.944	0.944	0.0	0.0	0.889	0.884	2	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA20502	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	166551580	166552537	DEL	958	NA20845	0.874	0.874	0.0	0.0	0.48	0.443	1	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG00096	0.824	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG00268	0.588	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG00419	0.926	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG00759	0.997	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG01051	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG01112	0.911	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG01500	0.748	0.831	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG01565	0.918	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG01583	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG01595	0.642	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG01879	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG02568	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG02922	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG03006	0.875	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG03052	0.764	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG03642	0.643	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	HG03742	0.787	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA12878	0.724	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA18525	1.095	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA18939	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA19017	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA19238	0.78	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA19239	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA19625	0.469	0.521	0.0	0.019	0.632	0.632	1	1
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA19648	0.97	1.078	0.0	0.0	0.55	0.587	1	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA20502	0.961	1.068	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr1	167663109	167663162	DEL	54	NA20845	0.874	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG00096	1.142	1.109	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG00268	0.0	0.0	0.268	0.173	nan	nan	0	0
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG00419	1.094	1.062	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG00759	1.322	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG01051	0.508	0.493	0.066	0.036	nan	nan	0	1
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG01112	0.38	0.369	0.07	0.052	nan	nan	0	1
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG01500	0.0	0.0	0.255	0.162	nan	nan	0	0
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG01565	1.046	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG01583	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG01595	0.912	0.885	0.0	0.0	0.735	0.735	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG01879	1.305	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG02568	1.044	1.013	0.0	0.0	0.929	0.929	3	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG02922	1.145	1.111	0.0	0.0	0.598	0.559	2	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG03006	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG03052	1.2	1.165	0.0	0.0	0.743	0.787	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG03642	1.107	1.074	0.0	0.005	0.75	0.692	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	HG03742	1.211	1.175	0.0	0.0	0.875	0.831	2	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA12878	0.965	0.937	0.0	0.0	0.845	0.845	2	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA18525	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA18939	1.295	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA19017	1.412	1.371	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA19238	1.13	1.097	0.0	0.0	0.837	0.837	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA19239	1.281	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA19625	0.964	0.935	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA19648	1.276	1.239	0.0	0.0	0.7	0.656	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA20502	1.266	1.229	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr1	169004356	169005229	DEL	874	NA20845	1.21	1.175	0.0	0.0	0.857	0.791	1	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG00096	0.374	0.394	0.0	0.0	0.655	0.686	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG00268	0.374	0.394	0.0	0.021	0.8	0.8	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	0
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG00759	0.346	0.364	0.0	0.023	0.786	0.786	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG01112	0.266	0.28	0.0	0.023	0.875	0.826	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG01500	0.332	0.35	0.0	0.032	0.88	0.88	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG01565	0.747	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG01583	0.197	0.208	0.0	0.006	0.889	0.889	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	0
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG02568	0.232	0.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG02922	0.432	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG03006	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG03052	0.153	0.161	0.0	0.033	0.476	0.45	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG03642	0.592	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	HG03742	0.242	0.255	0.0	0.017	1.0	0.95	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA12878	0.31	0.327	0.0	0.02	0.88	0.88	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA18525	0.677	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA18939	0.203	0.214	0.0	0.022	0.938	0.937	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA19017	0.477	0.502	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA19238	0.309	0.326	0.0	0.014	0.333	0.333	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA19239	0.36	0.379	0.0	0.042	0.452	0.452	1	1
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA19625	0.417	0.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA20502	0.563	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	171783587	171783649	DEL	63	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG00096	1.283	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG00268	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG00419	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG00759	1.078	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG01051	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG01112	0.74	0.779	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG01500	1.311	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG01565	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG01583	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG01595	0.808	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG01879	0.737	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.187	nan	nan	0	0
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG02922	0.778	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG03006	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG03052	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG03642	0.875	0.921	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	HG03742	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA12878	0.689	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA18525	1.033	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA18939	0.703	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA19017	0.706	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA19238	0.592	0.623	0.0	0.073	0.431	0.431	1	1
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA19239	0.614	0.646	0.0	0.054	0.31	0.31	1	1
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA19625	1.068	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA19648	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA20502	1.149	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	172461530	172461631	DEL	102	NA20845	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG00096	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG00268	1.086	1.086	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG00419	1.262	1.262	0.006	0.0	0.931	0.931	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG00759	0.956	0.956	0.0	0.0	0.486	0.486	2	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG01051	0.783	0.783	0.0	0.0	0.938	1.0	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG01112	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG01500	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG01565	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG01583	0.789	0.789	0.0	0.0	0.95	0.95	2	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG01595	0.974	0.974	0.007	0.0	0.88	0.88	2	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG01879	0.448	0.448	0.072	0.049	0.75	0.75	1	1
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG02568	0.889	0.889	0.0	0.0	0.544	0.544	2	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG02922	0.907	0.907	0.0	0.0	0.941	0.878	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG03006	1.08	1.08	0.0	0.0	0.587	0.587	2	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG03052	1.091	1.091	0.0	0.0	0.815	0.863	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG03642	0.978	0.978	0.0	0.0	0.55	0.508	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	HG03742	1.029	1.029	0.0	0.0	0.727	0.691	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA12878	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA18525	1.104	1.104	0.0	0.0	0.784	0.818	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA18939	0.906	0.906	0.0	0.0	0.962	0.962	2	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA19017	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA19238	1.036	1.036	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA19239	0.988	0.988	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA19625	1.198	1.198	0.0	0.0	0.826	0.826	3	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA19648	1.149	1.149	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA20502	1.055	1.055	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr1	175411521	175412145	DEL	625	NA20845	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG00096	0.506	0.506	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG00268	0.463	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG00419	0.316	0.316	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG00759	0.468	0.468	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG01051	0.762	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG01112	0.342	0.342	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG01500	0.776	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG01565	0.448	0.448	0.013	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG01583	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG01595	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG01879	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG02568	0.734	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG02922	0.0	0.0	0.015	0.0	nan	nan	0	0
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG03006	0.577	0.577	0.005	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG03052	0.327	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG03642	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	HG03742	0.525	0.525	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA12878	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA18525	1.157	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA18939	0.647	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA19017	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA19238	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA19239	0.467	0.467	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA19625	0.469	0.469	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA19648	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA20502	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	178495321	178495683	DEL	363	NA20845	0.65	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG00096	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG00268	0.516	0.516	0.092	0.045	nan	nan	0	1
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG00419	0.589	0.589	0.059	0.046	nan	nan	0	1
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG00759	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG01051	0.0	0.0	0.208	0.137	nan	nan	0	0
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG01112	0.323	0.323	0.06	0.041	nan	nan	0	1
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG01500	0.0	0.0	0.211	0.156	nan	nan	0	0
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG01565	0.512	0.512	0.04	0.021	nan	nan	0	1
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG01583	0.592	0.592	0.058	0.026	nan	nan	0	1
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG01595	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG01879	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG02568	0.966	0.966	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG02922	0.0	0.0	0.303	0.16	nan	nan	0	0
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG03006	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG03052	0.0	0.0	0.267	0.17	nan	nan	0	0
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG03642	0.0	0.0	0.284	0.148	nan	nan	0	0
chr1	179607260	179608065	DEL	806	HG03742	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA12878	0.793	0.793	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA18525	0.819	0.819	0.0	0.0	0.95	0.991	1	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA18939	0.499	0.499	0.044	0.03	nan	nan	0	1
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA19017	1.011	1.011	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA19238	0.552	0.552	0.115	0.048	nan	nan	0	1
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA19239	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA19625	0.807	0.807	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA19648	0.817	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA20502	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	179607260	179608065	DEL	806	NA20845	0.493	0.493	0.032	0.014	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG00096	0.711	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG00268	0.32	0.337	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG00419	0.862	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG00759	0.468	0.493	0.003	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG01051	0.36	0.379	0.015	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG01112	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG01500	0.96	1.011	0.017	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG01565	0.961	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG01583	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG01595	0.352	0.371	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG01879	0.615	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG02568	0.309	0.326	0.007	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG02922	0.518	0.546	0.012	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG03006	0.689	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG03052	0.305	0.322	0.014	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG03642	0.386	0.406	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	HG03742	0.686	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA12878	0.431	0.454	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA18525	0.997	1.049	0.004	0.0	0.69	0.661	1	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA18939	0.296	0.311	0.028	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA19017	0.744	0.783	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA19238	0.0	0.0	0.016	0.0	nan	nan	0	0
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA19239	0.961	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA19625	0.365	0.384	0.023	0.0	nan	nan	0	1
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA19648	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA20502	0.868	0.913	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr1	181043348	181043808	DEL	461	NA20845	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG00096	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG00268	0.979	1.031	0.0	0.0	0.839	0.839	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG00419	0.484	0.509	0.05	0.067	nan	nan	0	1
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG00759	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG01051	0.719	0.757	0.0	0.0	0.667	0.625	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG01112	1.025	1.079	0.0	0.0	0.667	0.63	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG01500	1.053	1.108	0.0	0.0	0.929	0.929	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG01565	0.897	0.944	0.0	0.005	0.875	0.875	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG01583	1.085	1.142	0.0	0.0	0.714	0.714	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG01595	0.953	1.003	0.0	0.0	0.882	0.882	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG01879	0.802	0.844	0.0	0.004	0.667	0.667	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG02568	1.198	1.261	0.0	0.0	0.614	0.614	4	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG02922	0.842	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG03006	0.969	1.019	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG03052	1.069	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG03642	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	HG03742	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA12878	0.741	0.78	0.0	0.0	0.895	0.895	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA18525	0.445	0.469	0.032	0.076	nan	nan	0	1
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA18939	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA19017	1.031	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA19238	0.902	0.949	0.0	0.0	0.893	0.893	5	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA19239	0.908	0.955	0.003	0.001	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA19625	0.99	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA19648	0.995	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA20502	0.914	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	183308627	183309115	DEL	489	NA20845	0.74	0.779	0.0	0.0	0.643	0.593	5	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG00096	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG00268	0.908	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG00419	1.241	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG00759	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG01051	1.269	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG01112	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG01500	1.182	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG01565	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG01583	1.208	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG01595	1.285	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG01879	1.193	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG02568	1.353	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG02922	1.08	1.048	0.0	0.0	0.864	0.925	2	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG03006	0.857	0.832	0.0	0.0	0.645	0.645	1	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG03052	1.222	1.186	0.0	0.0	0.966	0.912	2	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG03642	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	HG03742	0.504	0.49	0.051	0.054	nan	nan	0	1
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA12878	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA18525	0.908	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA18939	1.128	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA19017	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA19238	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA19239	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA19625	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA19648	0.817	0.793	0.0	0.0	0.737	0.691	1	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA20502	0.938	0.911	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	187932575	187933145	DEL	571	NA20845	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG00096	0.0	0.0	0.165	0.11	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG00268	0.0	0.0	0.244	0.176	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG00419	0.0	0.0	0.172	0.145	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG00759	0.0	0.0	0.14	0.096	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG01051	0.0	0.0	0.186	0.149	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG01112	0.0	0.0	0.213	0.157	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG01500	0.0	0.0	0.304	0.187	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG01565	0.0	0.0	0.264	0.204	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG01583	0.0	0.0	0.146	0.083	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG01595	0.0	0.0	0.19	0.126	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG01879	0.0	0.0	0.27	0.205	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG02568	0.58	0.563	0.109	0.063	nan	nan	0	2
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG02922	0.0	0.0	0.262	0.196	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG03006	0.0	0.0	0.202	0.148	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG03052	0.0	0.0	0.263	0.171	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG03642	0.0	0.0	0.325	0.191	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	HG03742	0.0	0.0	0.293	0.205	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA12878	0.0	0.0	0.234	0.165	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA18525	0.0	0.0	0.203	0.148	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA18939	0.0	0.0	0.206	0.155	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA19017	0.0	0.0	0.297	0.241	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA19238	0.0	0.0	0.33	0.207	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA19239	0.0	0.0	0.381	0.272	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA19625	0.0	0.0	0.357	0.21	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA19648	0.0	0.0	0.216	0.142	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA20502	0.0	0.0	0.359	0.241	nan	nan	0	0
chr1	188539457	188540228	DEL	772	NA20845	0.538	0.522	0.068	0.046	nan	nan	0	1
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG00096	1.105	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG00268	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG00419	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG00759	1.119	1.046	0.0	0.0	0.663	0.663	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG01051	1.227	1.147	0.0	0.0	0.706	0.662	3	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG01112	1.063	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG01500	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG01565	1.153	1.077	0.0	0.0	0.849	0.849	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG01583	1.134	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG01595	1.14	1.065	0.0	0.0	0.795	0.795	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG01879	1.026	0.958	0.0	0.0	0.657	0.657	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG02568	1.16	1.084	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG02922	1.274	1.191	0.0	0.0	0.851	0.794	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG03006	1.043	0.975	0.0	0.0	0.919	0.919	1	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG03052	1.222	1.142	0.0	0.0	0.711	0.672	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG03642	1.364	1.275	0.0	0.0	0.655	0.654	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	HG03742	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA12878	0.982	0.918	0.0	0.0	0.55	0.55	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA18525	1.086	1.015	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA18939	1.11	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA19017	1.26	1.177	0.0	0.0	0.903	0.903	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA19238	1.319	1.232	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA19239	1.081	1.01	0.0	0.0	0.585	0.585	1	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA19625	1.094	1.022	0.0	0.0	0.947	0.947	3	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA19648	1.302	1.217	0.0	0.0	0.77	0.722	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA20502	1.172	1.096	0.0	0.0	0.748	0.748	2	2
chr1	189200860	189201831	DEL	972	NA20845	0.583	0.545	0.053	0.028	nan	nan	0	1
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG00096	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG00268	0.712	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG00419	0.589	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG00759	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG01051	1.058	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG01112	1.158	1.219	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG01500	1.182	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG01565	1.388	1.461	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG01583	0.617	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG01595	0.808	0.851	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG01879	0.988	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG02568	0.734	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG02922	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG03006	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG03052	0.851	0.896	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG03642	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	HG03742	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA12878	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA18525	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA18939	1.11	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA19017	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA19238	1.009	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA19239	0.974	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA19625	0.286	0.302	0.0	0.005	0.545	0.545	1	1
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA19648	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA20502	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189279850	189279908	DEL	59	NA20845	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG00096	1.254	1.172	0.0	0.0	0.511	0.487	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG00268	1.122	1.048	0.016	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG00419	1.094	1.022	0.0	0.001	0.808	0.808	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG00759	1.099	1.027	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG01051	1.396	1.305	0.0	0.0	0.955	0.982	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG01112	1.272	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG01500	0.96	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG01565	1.003	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG01583	0.912	0.853	0.0	0.003	0.818	0.818	2	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG01595	1.264	1.181	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG01879	0.634	0.592	0.078	0.035	nan	nan	0	1
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG02568	1.005	0.939	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG02922	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG03006	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG03052	0.96	0.897	0.0	0.0	0.88	0.831	3	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG03642	1.029	0.962	0.0	0.0	1.0	0.923	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	HG03742	1.09	1.018	0.0	0.0	0.923	0.877	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA12878	1.0	0.934	0.0	0.0	0.676	0.676	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA18525	0.926	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA18939	1.165	1.089	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA19017	1.374	1.284	0.0	0.0	0.862	0.862	2	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA19238	0.579	0.541	0.064	0.027	nan	nan	0	1
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA19239	0.921	0.861	0.0	0.0	0.683	0.683	3	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA19625	0.625	0.584	0.114	0.033	nan	nan	0	1
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA19648	1.072	1.002	0.0	0.0	0.889	0.833	1	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA20502	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189530165	189530735	DEL	571	NA20845	1.098	1.027	0.0	0.0	0.719	0.755	3	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG00096	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG00268	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG00419	1.241	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG00759	1.139	1.106	0.0	0.0	0.738	0.738	4	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG01051	1.121	1.089	0.0	0.0	0.766	0.817	4	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG01112	0.949	0.921	0.0	0.0	0.955	0.925	4	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG01500	1.108	1.076	0.0	0.0	0.861	0.861	3	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG01565	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG01583	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG01595	1.264	1.227	0.0	0.0	0.84	0.84	3	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG01879	0.541	0.525	0.051	0.035	nan	nan	0	1
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG02568	0.812	0.788	0.0	0.0	0.312	0.313	1	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG02922	1.037	1.007	0.0	0.0	0.809	0.867	4	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG03006	1.192	1.157	0.0	0.0	0.634	0.634	3	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG03052	0.589	0.572	0.074	0.061	nan	nan	0	1
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG03642	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	HG03742	1.029	0.999	0.0	0.0	0.906	0.954	3	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.0	0.888	0.888	4	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA18525	0.908	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA18939	0.98	0.952	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA19017	1.011	0.982	0.0	0.0	0.981	0.981	4	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA19238	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA19239	1.174	1.14	0.0	0.0	0.766	0.766	1	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA19625	0.443	0.43	0.115	0.063	nan	nan	0	1
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA19648	0.995	0.966	0.0	0.0	0.792	0.84	4	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA20502	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	189853331	189854117	DEL	787	NA20845	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG00419	0.0	0.0	0.005	0.164	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.187	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.203	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG02568	1.044	1.044	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG02922	0.886	0.886	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG03052	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.128	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	HG03742	0.0	0.0	0.007	0.128	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.167	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA18525	0.463	0.463	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.149	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA19017	0.553	0.553	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA19238	0.552	0.552	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA19239	0.534	0.534	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA19625	0.599	0.599	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA20502	0.539	0.539	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr1	190837319	190837490	DEL	172	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	0
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG00268	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG00419	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG00759	1.18	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG01051	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG01112	0.664	0.645	0.0	0.032	0.784	0.83	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG01565	0.683	0.663	0.0	0.038	0.719	0.719	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG01583	0.493	0.479	0.0	0.022	0.533	0.533	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG01595	1.015	0.986	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG01879	0.485	0.471	0.0	0.026	0.774	0.774	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG02568	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG02922	0.324	0.315	0.0	0.024	0.812	0.871	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG03052	0.502	0.487	0.0	0.039	0.793	0.84	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG03642	0.54	0.525	0.0	0.023	1.0	0.923	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	HG03742	1.09	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA12878	1.069	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA18525	0.641	0.622	0.0	0.007	0.641	0.669	1	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA18939	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA19017	1.145	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA19238	1.05	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA19239	0.52	0.505	0.0	0.02	0.667	0.667	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA19625	0.599	0.582	0.0	0.031	0.917	0.917	1	1
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA19648	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	0
chr1	192609798	192609864	DEL	67	NA20845	0.538	0.522	0.0	0.025	0.526	0.57	1	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG00096	0.0	0.0	0.017	0.15	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG00268	0.0	0.0	0.017	0.218	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG00419	0.0	0.0	0.018	0.199	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG00759	0.57	0.532	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.176	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG01565	0.491	0.459	0.034	0.088	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG01583	0.592	0.553	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG01595	0.0	0.0	0.006	0.229	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG01879	0.466	0.436	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG02568	0.155	0.145	0.0	0.072	0.583	0.583	8	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG02922	0.54	0.505	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG03006	0.577	0.54	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG03052	0.578	0.54	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG03642	0.425	0.397	0.006	0.083	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	HG03742	1.039	0.971	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA12878	0.0	0.0	0.014	0.106	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA18525	0.338	0.316	0.01	0.106	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA18939	0.407	0.38	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA19017	1.078	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA19238	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA19239	0.494	0.461	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA19625	0.911	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA19648	1.097	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.23	nan	nan	0	0
chr1	194517604	194517863	DEL	260	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG00096	0.824	0.8	0.011	0.053	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG00268	0.872	0.847	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG00419	0.547	0.531	0.0	0.123	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG00759	0.631	0.612	0.02	0.079	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG01051	0.508	0.493	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG01112	0.683	0.663	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG01500	0.526	0.511	0.005	0.087	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG01565	0.0	0.0	0.018	0.192	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG01583	0.0	0.0	0.01	0.162	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG01595	0.0	0.0	0.013	0.174	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG01879	1.147	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG02568	0.618	0.6	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG02922	0.0	0.0	0.02	0.191	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG03006	0.0	0.0	0.033	0.259	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG03052	1.396	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG03642	0.0	0.0	0.007	0.177	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	HG03742	0.0	0.0	0.012	0.223	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA12878	0.465	0.452	0.011	0.094	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA18525	1.113	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA18939	0.629	0.61	0.012	0.074	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA19017	0.0	0.0	0.026	0.202	nan	nan	0	0
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA19238	0.511	0.496	0.004	0.119	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA19239	0.641	0.622	0.004	0.1	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA19625	0.781	0.758	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA19648	0.715	0.694	0.011	0.07	nan	nan	0	1
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA20502	1.079	1.047	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr1	197894025	197894310	DEL	286	NA20845	0.583	0.566	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG00096	0.768	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG00268	0.944	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG00759	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG01051	0.656	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG01112	0.493	0.548	0.0	0.03	0.609	0.645	2	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG01500	0.406	0.452	0.0	0.036	0.636	0.636	2	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG01565	0.598	0.664	0.0	0.023	0.36	0.36	2	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG01583	0.271	0.301	0.0	0.018	1.0	1.0	2	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG01595	0.332	0.368	0.0	0.0	0.467	0.467	2	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG01879	0.448	0.497	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG02568	0.657	0.73	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG02922	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG03006	0.764	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG03052	0.633	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG03642	0.437	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	HG03742	0.767	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA12878	0.707	0.785	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA18939	0.795	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA19017	0.687	0.763	0.0	0.0	0.368	0.368	1	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA19238	0.753	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA19239	0.36	0.4	0.0	0.02	0.727	0.727	3	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA19625	0.495	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA19648	0.434	0.482	0.0	0.041	0.611	0.652	2	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA20502	0.234	0.261	0.0	0.039	0.917	0.917	2	1
chr1	19954877	19954943	DEL	67	NA20845	0.448	0.498	0.0	0.024	0.583	0.632	2	1
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG00096	0.58	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG00268	0.677	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG00419	0.526	0.554	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG00759	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG01051	0.529	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG01112	0.702	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG01500	0.72	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG01565	0.811	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG01583	0.493	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG01595	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG01879	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG02568	0.85	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG02922	0.454	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG03006	0.633	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG03052	0.393	0.413	0.0	0.04	0.579	0.613	1	1
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG03642	0.721	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	HG03742	0.827	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA12878	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA18525	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA18939	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA19017	0.649	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA19238	0.659	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA19239	0.614	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA19625	0.729	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA19648	0.638	0.672	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA20502	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	202843679	202843757	DEL	79	NA20845	0.986	1.038	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG00096	0.73	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG00268	0.712	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG00419	0.778	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG00759	0.264	0.335	0.032	0.046	nan	nan	0	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG01051	0.106	0.134	0.08	0.075	nan	nan	0	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG01112	0.493	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG01500	0.665	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG01565	0.662	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG01583	0.715	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG01595	0.518	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG01879	0.541	0.684	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG02568	0.0	0.0	0.071	0.119	nan	nan	0	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG02922	0.389	0.492	0.012	0.016	0.647	0.604	1	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG03006	0.317	0.401	0.08	0.055	0.55	0.55	2	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG03052	0.633	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG03642	0.386	0.489	0.016	0.027	0.667	0.615	2	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	HG03742	0.383	0.485	0.033	0.045	0.25	0.263	2	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA12878	0.689	0.873	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA18525	0.481	0.608	0.027	0.039	0.428	0.447	2	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA18939	0.592	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA19017	0.553	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA19238	0.35	0.443	0.045	0.056	nan	nan	0	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA19239	0.507	0.642	0.039	0.037	nan	nan	0	1
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA19625	0.755	0.956	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA19648	0.893	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA20502	0.75	0.95	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr1	20496899	20497748	DEL	850	NA20845	0.493	0.624	0.072	0.044	nan	nan	0	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG00096	0.655	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG00268	0.694	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG00419	0.736	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG00759	0.224	0.283	0.037	0.053	nan	nan	0	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG01051	0.106	0.134	0.09	0.084	nan	nan	0	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG01112	0.455	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG01500	0.628	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG01565	0.619	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG01583	0.789	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG01595	0.518	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG01879	0.541	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG02568	0.0	0.0	0.093	0.155	nan	nan	0	0
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG02922	0.324	0.41	0.013	0.018	nan	nan	0	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG03006	0.261	0.33	0.085	0.061	0.55	0.55	2	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG03052	0.589	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG03642	0.309	0.391	0.019	0.032	0.667	0.615	2	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	HG03742	0.323	0.409	0.034	0.047	0.25	0.263	2	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA12878	0.672	0.851	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA18525	0.427	0.541	0.025	0.041	0.428	0.447	2	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA18939	0.518	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA19017	0.496	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA19238	0.309	0.392	0.044	0.062	nan	nan	0	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA19239	0.48	0.608	0.028	0.04	nan	nan	0	1
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA19625	0.703	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA19648	0.842	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA20502	0.75	0.95	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr1	20497183	20497735	DEL	553	NA20845	0.291	0.369	0.08	0.049	nan	nan	0	1
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG00096	0.861	0.957	0.0	0.0	0.852	0.813	9	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG00268	0.748	0.831	0.0	0.0	0.72	0.72	9	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG00419	0.82	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG00759	0.732	0.814	0.0	0.0	0.822	0.822	2	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG01051	0.613	0.682	0.0	0.0	0.778	0.83	1	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG01112	0.664	0.738	0.0	0.0	0.857	0.81	7	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG01500	0.72	0.8	0.006	0.0	0.783	0.783	9	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG01565	0.576	0.64	0.0	0.0	0.875	0.875	9	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG01583	0.715	0.795	0.0	0.0	0.5	0.5	9	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG01595	0.767	0.852	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG01879	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG02568	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG02922	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG03006	0.689	0.766	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG03052	0.873	0.97	0.0	0.0	0.9	0.953	1	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG03642	0.669	0.743	0.0	0.0	0.488	0.529	2	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	HG03742	0.706	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA12878	0.724	0.804	0.0	0.0	0.643	0.643	2	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA18525	0.837	0.93	0.0	0.0	0.667	0.674	9	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA18939	0.721	0.801	0.0	0.0	0.714	0.714	7	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA19017	0.706	0.785	0.0	0.0	0.8	0.8	7	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA19238	0.794	0.882	0.0	0.0	0.885	0.885	7	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA19239	0.534	0.593	0.094	0.0	nan	nan	0	1
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA19625	0.99	1.1	0.0	0.0	0.764	0.764	8	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA19648	0.689	0.766	0.0	0.0	0.556	0.521	9	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA20502	0.868	0.964	0.0	0.0	0.856	0.856	2	2
chr1	205616161	205617135	DEL	975	NA20845	0.695	0.772	0.0	0.0	0.583	0.538	9	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.019	nan	nan	0	0
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG00268	0.463	0.514	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.01	nan	nan	0	0
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG01112	0.512	0.569	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG01500	0.573	0.636	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG01565	0.406	0.451	0.0	0.006	0.389	0.389	1	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG01583	0.962	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG01595	0.373	0.414	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG01879	0.485	0.539	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG02568	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG02922	0.54	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG03052	1.135	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG03642	0.566	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	HG03742	0.585	0.65	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.018	nan	nan	0	0
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA18525	0.641	0.712	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA18939	0.481	0.534	0.0	0.017	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA19017	0.878	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA19238	0.511	0.568	0.0	0.004	nan	nan	0	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA19239	0.881	0.979	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA19625	0.599	0.666	0.0	0.0	0.316	0.316	10	1
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA20502	1.172	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292375	207292595	DEL	221	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG00096	0.0	0.0	0.225	0.075	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG00268	0.498	0.498	0.099	0.028	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG00419	0.0	0.0	0.167	0.057	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG00759	0.0	0.0	0.139	0.035	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG01051	0.0	0.0	0.163	0.087	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG01112	0.664	0.664	0.048	0.024	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG01500	0.61	0.61	0.042	0.02	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG01565	0.555	0.555	0.039	0.018	0.389	0.389	1	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG01583	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG01595	0.684	0.684	0.013	0.008	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG01879	0.541	0.541	0.066	0.028	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG02568	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG02922	0.518	0.518	0.028	0.013	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG03006	0.0	0.0	0.197	0.056	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG03052	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG03642	0.592	0.592	0.036	0.011	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	HG03742	0.666	0.666	0.05	0.029	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA12878	0.0	0.0	0.189	0.051	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA18525	0.641	0.641	0.079	0.024	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA18939	0.499	0.499	0.065	0.01	nan	nan	0	2
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA19017	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA19238	0.471	0.471	0.07	0.015	nan	nan	0	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA19239	1.001	1.001	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA19625	0.599	0.599	0.045	0.007	0.263	0.263	1	1
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA19648	0.0	0.0	0.278	0.071	nan	nan	0	0
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA20502	1.29	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	207292405	207293149	DEL	745	NA20845	0.0	0.0	0.161	0.075	nan	nan	0	0
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG00096	0.431	0.453	0.101	0.021	0.184	0.193	4	1
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG00268	0.944	0.993	0.0	0.0	0.955	0.955	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG00419	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG00759	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG01051	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG01112	0.854	0.899	0.0	0.0	0.762	0.722	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG01500	0.979	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG01565	0.747	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG01583	0.814	0.857	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG01595	0.559	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG01879	0.858	0.903	0.0	0.0	0.759	0.759	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG02568	1.16	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG02922	0.821	0.864	0.0	0.0	0.812	0.786	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG03006	0.82	0.863	0.0	0.0	0.593	0.593	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG03052	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG03642	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	HG03742	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA12878	1.241	1.306	0.0	0.0	0.879	0.879	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA18525	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA18939	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA19017	0.687	0.723	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA19238	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA19239	1.028	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA19625	1.068	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA19648	0.868	0.913	0.0	0.0	0.643	0.686	3	2
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA20502	0.516	0.543	0.099	0.011	nan	nan	0	1
chr1	20864015	20864732	DEL	718	NA20845	0.807	0.849	0.0	0.0	0.714	0.659	3	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG00096	0.955	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG00268	0.409	0.383	0.0	0.047	0.981	0.981	2	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG00419	1.031	0.963	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG00759	0.671	0.627	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG01051	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG01112	0.437	0.408	0.0	0.053	0.892	0.938	2	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG01500	0.554	0.518	0.0	0.047	0.842	0.842	2	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG01565	0.32	0.299	0.0	0.032	0.806	0.806	2	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG01583	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG01595	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG01879	0.97	0.906	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG02568	0.812	0.759	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG02922	0.518	0.484	0.009	0.019	0.526	0.564	1	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG03006	1.211	1.131	0.0	0.0	0.906	0.906	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG03052	0.786	0.734	0.0	0.0	0.684	0.646	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG03642	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	HG03742	0.948	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA12878	0.845	0.789	0.0	0.0	0.452	0.452	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA18525	0.534	0.499	0.0	0.037	0.829	0.865	1	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA18939	0.407	0.38	0.0	0.026	0.621	0.621	1	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA19017	0.897	0.838	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA19238	0.821	0.767	0.0	0.0	0.906	0.906	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA19239	0.454	0.424	0.0	0.028	0.605	0.605	1	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA19625	0.286	0.268	0.0	0.029	0.833	0.833	2	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA19648	0.664	0.62	0.0	0.006	0.692	0.649	1	2
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA20502	0.586	0.548	0.0	0.011	0.383	0.383	2	1
chr1	209844846	209844910	DEL	65	NA20845	0.74	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG00096	0.861	0.957	0.136	0.156	nan	nan	0	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG00268	0.783	0.87	0.026	0.049	0.65	0.65	5	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG00419	0.778	0.865	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG00759	0.895	0.995	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG01051	0.846	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG01112	0.683	0.759	0.059	0.076	0.417	0.441	5	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG01500	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG01565	0.918	1.02	0.066	0.071	0.8	0.8	5	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG01583	0.74	0.822	0.045	0.058	0.6	0.6	5	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG01595	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG01879	0.82	0.912	0.042	0.048	0.789	0.789	5	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG02568	0.696	0.773	0.041	0.059	0.9	0.9	3	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG02922	0.842	0.936	0.113	0.106	0.275	0.295	2	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG03006	0.894	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG03052	0.916	1.018	0.139	0.144	nan	nan	0	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG03642	1.055	1.172	0.044	0.058	0.786	0.781	5	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	HG03742	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA12878	0.982	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA18525	0.819	0.91	0.078	0.082	0.87	0.833	4	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA18939	0.74	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA19017	0.821	0.912	0.127	0.142	nan	nan	0	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA19238	0.848	0.942	0.039	0.064	0.939	0.939	3	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA19239	0.834	0.927	0.158	0.12	nan	nan	0	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA19625	0.964	1.071	0.12	0.137	0.75	0.75	1	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA19648	0.868	0.964	0.096	0.106	0.213	0.228	2	1
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA20502	0.703	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	209935335	209936076	DEL	742	NA20845	0.785	0.872	0.047	0.052	0.615	0.667	5	1
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG00096	0.506	0.506	0.084	0.038	nan	nan	0	1
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG00268	0.837	0.837	0.0	0.0	0.852	0.852	3	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG00419	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG00759	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG01051	0.952	0.952	0.0	0.0	0.737	0.786	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG01112	0.873	0.873	0.0	0.0	0.5	0.472	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG01500	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG01565	0.747	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG01583	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG01595	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG01879	0.82	0.82	0.0	0.0	0.607	0.607	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG02568	0.734	0.734	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG02922	0.929	0.929	0.0	0.0	0.375	0.35	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG03006	0.894	0.894	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG03052	0.72	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG03642	0.721	0.721	0.0	0.0	0.286	0.31	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	HG03742	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA12878	0.448	0.448	0.041	0.021	nan	nan	0	1
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA18525	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA18939	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA19017	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA19238	0.834	0.834	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA19239	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA19625	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA19648	0.97	0.97	0.0	0.0	0.412	0.427	2	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA20502	0.985	0.985	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr1	211965009	211965782	DEL	774	NA20845	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG00096	1.217	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG00268	0.57	0.553	0.029	0.06	nan	nan	0	1
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG00419	0.883	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG00759	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG01051	0.91	0.883	0.006	0.013	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG01112	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG01500	0.979	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG01565	0.918	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG01583	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG01595	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG01879	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG02568	1.082	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG02922	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG03006	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG03052	0.786	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG03642	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	HG03742	1.13	1.097	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA12878	0.724	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA18525	1.015	0.985	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA18939	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA19017	0.477	0.463	0.026	0.054	nan	nan	0	1
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA19238	1.144	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA19239	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA19625	0.885	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA19648	0.919	0.892	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA20502	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	216231483	216232002	DEL	520	NA20845	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG00096	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG00268	0.534	0.562	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG00419	0.568	0.598	0.0	0.022	0.719	0.719	2	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG00759	0.834	0.878	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG01051	0.91	0.958	0.0	0.0	0.636	0.597	1	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG01112	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG01500	0.554	0.583	0.0	0.027	0.778	0.778	2	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG01565	0.213	0.225	0.0	0.031	0.692	0.692	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG01583	0.912	0.96	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG01595	0.332	0.349	0.0	0.028	0.9	0.9	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG01879	0.531	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG02568	0.309	0.326	0.0	0.027	1.0	1.0	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG02922	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG03006	0.652	0.686	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG03052	0.753	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG03642	1.184	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	HG03742	0.282	0.297	0.0	0.046	0.812	0.855	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA12878	0.465	0.49	0.0	0.019	0.323	0.323	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA18525	0.659	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA18939	0.573	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA19017	0.344	0.362	0.0	0.032	0.85	0.85	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA19238	0.431	0.453	0.0	0.039	0.73	0.73	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA19239	0.4	0.421	0.0	0.051	0.95	0.95	1	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA19625	0.781	0.822	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA19648	0.689	0.725	0.0	0.0	0.833	0.889	1	2
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA20502	0.492	0.518	0.0	0.011	0.441	0.441	2	1
chr1	217269958	217270023	DEL	66	NA20845	0.112	0.118	0.0	0.028	0.778	0.718	1	1
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG00096	0.412	0.4	0.031	0.055	nan	nan	0	1
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG00268	0.944	0.916	0.0	0.0	0.576	0.576	1	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG00419	1.262	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG00759	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG01051	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG01112	1.215	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG01500	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG01565	0.384	0.373	0.048	0.048	nan	nan	0	1
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG01583	0.986	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG01595	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG01879	0.858	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG02568	0.0	0.0	0.075	0.226	nan	nan	0	0
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG02922	0.518	0.503	0.049	0.07	nan	nan	0	1
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG03006	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG03052	1.396	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG03642	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	HG03742	0.646	0.627	0.014	0.071	nan	nan	0	1
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA12878	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA18525	1.122	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA18939	1.147	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA19017	0.821	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA19238	0.484	0.47	0.014	0.083	nan	nan	0	1
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA19239	0.961	0.933	0.0	0.0	0.878	0.878	1	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA19625	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA19648	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA20502	1.125	1.093	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	217457929	217458372	DEL	444	NA20845	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG00096	0.974	0.974	0.0	0.0	0.88	0.922	3	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG00268	0.463	0.463	0.041	0.029	nan	nan	0	1
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG00419	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG00759	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG01051	0.899	0.899	0.0	0.0	0.878	0.87	4	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG01112	0.664	0.664	0.057	0.064	0.586	0.621	4	1
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG01500	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG01565	0.278	0.278	0.068	0.064	nan	nan	0	1
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG01583	0.444	0.444	0.114	0.061	nan	nan	0	1
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG01595	0.414	0.414	0.068	0.054	0.611	0.611	4	1
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG01879	0.839	0.839	0.0	0.0	0.533	0.533	3	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG02568	1.044	1.044	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG02922	1.037	1.037	0.0	0.0	0.737	0.789	1	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG03006	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG03052	0.524	0.524	0.044	0.028	nan	nan	0	1
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG03642	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	HG03742	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA18525	0.677	0.677	0.0	0.0	0.88	0.918	3	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA18939	0.943	0.943	0.0	0.0	0.923	0.923	3	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA19017	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA19238	0.861	0.861	0.0	0.0	0.676	0.676	1	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA19239	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA19625	0.547	0.547	0.027	0.03	0.19	0.19	1	1
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA19648	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA20502	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	220502866	220503587	DEL	722	NA20845	0.762	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG00096	0.843	0.887	0.0	0.0	0.646	0.677	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG00268	0.89	0.937	0.0	0.0	0.849	0.849	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG00419	0.862	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG00759	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG01051	0.973	1.024	0.0	0.0	0.814	0.763	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG01112	0.759	0.799	0.0	0.0	0.907	0.96	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG01500	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG01565	0.833	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG01583	1.085	1.142	0.0	0.0	0.745	0.745	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG01595	0.995	1.047	0.0	0.0	0.906	0.906	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG01879	0.895	0.942	0.0	0.0	0.708	0.708	3	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG02568	0.889	0.936	0.0	0.0	0.819	0.819	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG02922	0.929	0.978	0.0	0.0	0.833	0.893	3	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG03006	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG03052	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG03642	1.132	1.192	0.0	0.0	0.769	0.71	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	HG03742	0.464	0.489	0.077	0.0	nan	nan	0	1
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA12878	0.862	0.907	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA18525	0.427	0.45	0.085	0.0	nan	nan	0	1
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA18939	0.925	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA19017	0.935	0.984	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA19238	0.888	0.935	0.004	0.0	0.806	0.806	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA19239	1.041	1.096	0.0	0.0	0.78	0.78	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA19625	1.068	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA19648	0.944	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA20502	0.821	0.864	0.0	0.0	0.636	0.636	2	2
chr1	222550320	222551217	DEL	898	NA20845	0.807	0.849	0.0	0.0	0.711	0.77	2	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG00096	1.105	1.072	0.0	0.0	0.803	0.841	2	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG00268	0.89	0.864	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG00419	0.379	0.368	0.016	0.08	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG00759	0.468	0.454	0.012	0.094	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG01051	0.317	0.308	0.018	0.084	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG01112	1.006	0.977	0.0	0.0	0.931	0.931	2	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG01500	0.536	0.52	0.013	0.09	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG01565	0.683	0.663	0.02	0.067	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG01583	0.666	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG01595	0.974	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG01879	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG02568	0.541	0.525	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG02922	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG03006	0.0	0.0	0.108	0.19	nan	nan	0	0
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG03052	0.786	0.763	0.0	0.0	0.455	0.481	1	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG03642	0.335	0.325	0.03	0.072	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	HG03742	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA12878	0.414	0.402	0.012	0.066	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA18525	0.926	0.899	0.0	0.002	0.947	0.908	1	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA18939	0.314	0.305	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA19017	0.84	0.815	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA19238	1.09	1.058	0.0	0.002	0.615	0.615	1	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA19239	0.961	0.933	0.0	0.0	0.898	0.898	2	2
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA19625	0.365	0.354	0.037	0.031	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA19648	0.0	0.0	0.038	0.083	nan	nan	0	0
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA20502	0.422	0.41	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr1	229373395	229373771	DEL	377	NA20845	0.74	0.718	0.0	0.0	0.5	0.542	2	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG00096	0.824	1.043	0.0	0.0	0.519	0.495	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG00268	0.712	0.901	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG00419	0.505	0.639	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG00759	0.488	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG01051	0.465	0.589	0.0	0.0	0.667	0.711	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG01112	0.474	0.601	0.0	0.004	0.7	0.741	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG01500	0.591	0.748	0.0	0.0	0.582	0.582	2	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG01565	0.512	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG01583	0.814	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG01595	0.601	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG01879	0.653	0.826	0.0	0.0	0.435	0.435	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG02568	0.696	0.881	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG02922	0.389	0.492	0.0	0.008	0.75	0.804	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG03006	0.764	0.967	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG03642	0.566	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	HG03742	0.626	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA12878	0.758	0.96	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA18525	0.694	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA18939	0.555	0.702	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA19017	0.744	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA19238	0.888	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA19625	0.547	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA19648	0.817	1.034	0.0	0.0	0.933	0.875	1	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA20502	0.961	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	230451094	230451202	DUP	109	NA20845	0.852	1.078	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG00096	0.543	0.572	0.0	0.005	1.0	0.955	1	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG00268	0.712	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG00419	0.568	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG00759	0.936	0.985	0.0	0.0	0.842	0.842	2	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG01051	0.55	0.579	0.0	0.0	0.667	0.625	3	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG01112	0.455	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG01500	0.887	0.933	0.0	0.0	0.66	0.66	4	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG01565	1.067	1.124	0.0	0.0	0.789	0.789	3	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG01583	0.395	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG01595	0.29	0.305	0.0	0.076	0.75	0.75	4	1
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG01879	0.597	0.628	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG02568	0.773	0.814	0.012	0.0	0.652	0.652	4	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG02922	0.302	0.318	0.0	0.07	0.557	0.593	4	1
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG03006	0.726	0.765	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG03052	0.676	0.712	0.0	0.0	0.628	0.62	2	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG03642	0.656	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	HG03742	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA12878	0.586	0.617	0.0	0.0	0.692	0.692	3	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA18525	0.944	0.993	0.0	0.0	0.8	0.767	3	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA18939	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA19017	0.782	0.824	0.0	0.0	0.664	0.664	4	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA19238	0.639	0.673	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA19239	0.694	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA19625	0.807	0.85	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA19648	0.689	0.725	0.0	0.0	0.708	0.712	2	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA20502	0.586	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	231346673	231346796	DEL	124	NA20845	0.482	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG00096	0.3	0.333	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG00268	0.303	0.336	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG00419	0.21	0.234	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG00759	0.224	0.249	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG01051	0.254	0.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG01112	0.171	0.19	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG01500	0.425	0.472	0.007	0.076	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG01565	0.213	0.237	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG01583	0.37	0.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	0
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG01879	0.392	0.435	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG02568	0.155	0.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG02922	0.518	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG03006	0.0	0.0	0.009	0.112	nan	nan	0	0
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG03052	0.305	0.339	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr1	232836575	232836759	DEL	185	HG03742	0.121	0.135	0.012	0.059	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA12878	0.414	0.46	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA18525	0.427	0.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA18939	0.277	0.308	0.012	0.043	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA19017	0.496	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA19238	0.188	0.209	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA19239	0.254	0.282	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA19625	0.417	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA19648	0.077	0.085	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA20502	0.188	0.208	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr1	232836575	232836759	DEL	185	NA20845	0.247	0.274	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG00096	0.843	0.843	0.0	0.0	0.5	0.524	1	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG00268	0.516	0.516	0.019	0.006	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG00419	0.0	0.0	0.104	0.025	nan	nan	0	0
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG00759	0.407	0.407	0.061	0.003	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG01051	1.037	1.037	0.0	0.002	0.848	0.795	2	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG01112	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG01500	0.499	0.499	0.022	0.008	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG01565	0.47	0.47	0.036	0.006	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG01583	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG01595	0.477	0.477	0.002	0.004	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG01879	1.007	1.007	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG02568	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG02922	0.389	0.389	0.021	0.012	0.125	0.134	1	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG03006	0.0	0.0	0.083	0.017	nan	nan	0	0
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG03052	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG03642	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	HG03742	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA12878	0.664	0.664	0.011	0.002	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA18525	0.588	0.588	0.01	0.002	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA18939	0.462	0.462	0.01	0.002	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA19017	0.496	0.496	0.032	0.004	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA19238	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA19239	0.641	0.641	0.008	0.005	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA19625	0.443	0.443	0.017	0.003	nan	nan	0	1
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA19648	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA20502	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236279278	236279832	DEL	555	NA20845	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG00096	0.824	0.915	0.0	0.0	0.833	0.844	5	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG00268	0.267	0.297	0.031	0.0	0.286	0.286	13	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG00419	0.989	1.098	0.0	0.0	0.733	0.733	5	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG00759	1.038	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG01051	0.381	0.423	0.059	0.003	0.909	0.97	9	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG01112	0.399	0.443	0.052	0.0	0.281	0.298	8	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG01500	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG01565	0.192	0.213	0.044	0.007	0.364	0.364	3	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG01583	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG01595	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG01879	0.615	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG02568	0.773	0.859	0.0	0.0	0.727	0.727	3	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG02922	0.54	0.6	0.051	0.006	nan	nan	0	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG03006	0.671	0.745	0.0	0.0	0.579	0.579	5	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG03052	0.633	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG03642	0.283	0.315	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	HG03742	0.646	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA12878	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA18525	0.445	0.495	0.033	0.0	nan	nan	0	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA18939	0.795	0.884	0.0	0.0	0.826	0.826	5	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA19017	0.744	0.827	0.004	0.0	0.579	0.579	2	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA19238	0.794	0.882	0.0	0.0	0.758	0.758	3	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA19239	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA19625	0.469	0.521	0.049	0.011	nan	nan	0	1
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA19648	0.817	0.907	0.0	0.0	0.611	0.652	5	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA20502	0.633	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	236584123	236584886	DEL	764	NA20845	0.359	0.399	0.033	0.004	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG00096	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG00268	0.392	0.412	0.011	0.011	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG00419	0.715	0.753	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG00759	0.692	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG01051	0.846	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG01112	0.38	0.4	0.006	0.0	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG01500	0.61	0.642	0.005	0.0	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG01565	0.299	0.315	0.033	0.008	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG01583	0.345	0.363	0.017	0.006	0.571	0.571	3	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG01595	0.0	0.0	0.075	0.009	nan	nan	0	0
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG01879	0.988	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG02568	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG02922	0.67	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG03006	0.615	0.647	0.01	0.0	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG03052	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG03642	0.849	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	HG03742	0.383	0.404	0.007	0.004	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA12878	0.0	0.0	0.017	0.0	nan	nan	0	0
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA18525	0.374	0.394	0.005	0.0	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA18939	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA19017	0.0	0.0	0.027	0.0	nan	nan	0	0
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA19238	0.363	0.382	0.006	0.003	nan	nan	0	1
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA19239	0.894	0.941	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA19625	0.938	0.987	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA19648	0.842	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA20502	0.0	0.0	0.086	0.0	nan	nan	0	0
chr1	240641200	240641602	DEL	403	NA20845	0.0	0.0	0.036	0.008	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG00096	0.0	0.0	0.024	0.128	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG00268	0.481	0.481	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG00419	0.379	0.379	0.01	0.094	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG00759	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG01051	0.338	0.338	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG01112	0.437	0.437	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG01500	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.18	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG01583	0.0	0.0	0.01	0.171	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG01879	0.709	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG02568	0.85	0.85	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG02922	0.756	0.756	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG03006	0.0	0.0	0.021	0.157	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG03052	0.545	0.545	0.007	0.08	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG03642	0.335	0.335	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	HG03742	0.343	0.343	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA18939	0.425	0.425	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA19017	0.439	0.439	0.004	0.101	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA19238	0.565	0.565	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA19239	0.44	0.44	0.005	0.093	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA19625	0.443	0.443	0.02	0.046	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA19648	0.434	0.434	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA20502	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241586225	241586489	DEL	265	NA20845	0.0	0.0	0.008	0.193	nan	nan	0	0
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG00096	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG00268	0.837	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG00419	0.905	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG00759	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG01051	0.804	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG01112	0.721	0.7	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG01500	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG01565	0.662	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG01583	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG01595	1.16	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG01879	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG02568	0.85	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG02922	0.907	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG03006	0.838	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG03052	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG03642	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	HG03742	0.888	0.862	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA12878	0.81	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA18525	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA18939	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA19017	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA19238	1.09	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA19239	0.534	0.518	0.0	0.094	0.382	0.382	6	1
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA19625	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA19648	0.868	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA20502	0.868	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	241908722	241908988	DEL	267	NA20845	0.74	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG00096	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG00268	0.837	0.812	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG00419	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG00759	0.916	0.889	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG01051	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG01112	1.082	1.05	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG01500	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG01565	0.769	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG01583	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG01879	0.914	0.887	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG02568	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG02922	0.929	0.902	0.0	0.0	0.6	0.643	1	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG03006	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG03052	1.113	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	HG03742	0.908	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA18525	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA19017	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA19238	0.74	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA19239	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA19625	0.807	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA19648	0.766	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA20502	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246125965	246126155	DUP	191	NA20845	0.807	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG00419	1.136	1.306	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG00759	0.916	1.052	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG01565	0.961	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG01583	0.937	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG01879	1.193	1.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG02568	1.044	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG02922	0.799	0.919	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG03052	0.742	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	HG03642	0.952	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	NA18525	0.766	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	NA18939	0.888	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	NA19017	1.031	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	NA19238	0.922	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	NA19239	0.948	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	NA19625	0.833	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	246167282	246167379	DUP	98	NA20845	0.874	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG00096	0.805	0.805	0.0	0.0	0.812	0.851	3	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG00268	1.104	1.104	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG00419	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG00759	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG01051	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG01112	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG01500	0.813	0.813	0.0	0.0	0.688	0.688	3	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG01565	0.918	0.918	0.0	0.0	0.263	0.263	3	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG01583	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG01595	0.829	0.829	0.0	0.0	0.519	0.519	1	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG01879	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG02568	0.928	0.928	0.0	0.0	0.571	0.571	3	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG02922	0.842	0.842	0.0	0.0	0.636	0.682	2	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG03006	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG03052	0.436	0.436	0.065	0.005	0.333	0.353	4	1
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG03642	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	HG03742	0.747	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA12878	0.862	0.862	0.008	0.003	0.8	0.8	1	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA18525	1.068	1.068	0.0	0.0	0.591	0.566	1	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA18939	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA19017	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA19238	0.821	0.821	0.0	0.0	0.808	0.808	3	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA19239	0.454	0.454	0.128	0.011	nan	nan	0	1
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA19625	1.068	1.068	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA19648	0.995	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA20502	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247186233	247187157	DEL	925	NA20845	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG00096	1.011	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG00268	0.588	0.675	0.006	0.028	0.816	0.816	1	1
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG00419	0.799	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG00759	1.567	1.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG01051	1.354	1.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG01112	1.12	1.287	0.0	0.0	0.885	0.937	1	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG01500	0.665	0.764	0.0	0.02	0.667	0.667	1	1
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG01565	1.089	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG01583	0.641	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG01595	0.953	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG01879	1.604	1.843	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG02568	0.387	0.444	0.0	0.019	0.875	0.875	1	1
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG02922	0.432	0.497	0.0	0.032	0.684	0.639	1	1
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG03006	1.229	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG03052	0.916	1.053	0.0	0.009	0.5	0.529	1	1
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG03642	1.004	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	HG03742	0.726	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA12878	0.414	0.475	0.0	0.023	0.769	0.769	1	1
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA18525	0.961	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA18939	0.98	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA19017	0.305	0.351	0.0	0.035	0.594	0.594	1	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA19238	1.036	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA19239	1.061	1.22	0.0	0.0	0.519	0.519	1	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA19625	1.016	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA19648	1.327	1.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA20502	0.961	1.105	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr1	247959050	247959103	DEL	54	NA20845	1.143	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG00096	1.442	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG00268	1.353	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG00419	1.241	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG00759	0.631	0.579	0.008	0.053	nan	nan	0	1
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG01051	1.142	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG01112	1.12	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG01500	1.145	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG01565	1.099	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG01583	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG01595	1.181	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG01879	0.541	0.496	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG02568	1.585	1.454	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG02922	1.317	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG03006	0.559	0.513	0.008	0.093	nan	nan	0	1
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG03052	1.069	0.981	0.0	0.0	0.857	0.81	1	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG03642	1.415	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	HG03742	1.433	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA12878	0.552	0.506	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA18525	0.605	0.555	0.01	0.071	nan	nan	0	1
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA18939	1.295	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA19017	0.458	0.42	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA19238	1.278	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA19239	0.961	0.882	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA19625	0.599	0.55	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA19648	0.944	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA20502	1.196	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	248849861	248850138	DEL	278	NA20845	1.21	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG00096	0.768	0.882	0.0	0.0	0.882	0.842	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG00268	0.481	0.553	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG00419	0.883	1.015	0.005	0.003	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG00759	0.651	0.748	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG01051	0.656	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG01112	0.626	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG01500	0.96	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG01565	0.662	0.761	0.0	0.0	0.7	0.7	2	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG01583	0.715	0.822	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG01595	0.539	0.619	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG01879	0.82	0.943	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG02568	0.58	0.666	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG02922	0.518	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG03006	0.633	0.728	0.0	0.0	0.435	0.435	2	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG03052	0.436	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG03642	0.618	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	HG03742	0.565	0.649	0.0	0.0	0.667	0.633	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA12878	0.845	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA18525	0.783	0.9	0.0	0.0	0.545	0.523	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA18939	0.666	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA19017	0.744	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA19238	0.848	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA19239	0.427	0.491	0.0	0.036	0.375	0.375	5	1
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA19625	0.703	0.808	0.0	0.0	0.412	0.412	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA19648	0.587	0.675	0.0	0.0	0.8	0.75	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA20502	0.774	0.889	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chr1	26148939	26149265	DEL	327	NA20845	0.516	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG00096	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG00268	0.89	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG00419	0.631	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG00759	0.529	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG01051	0.529	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG01112	0.588	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG01500	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG01565	0.598	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG01583	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG01595	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG01879	0.764	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG02568	0.657	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG02922	0.605	0.637	0.0	0.0	0.727	0.679	1	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG03006	0.708	0.745	0.0	0.005	0.8	0.8	1	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG03052	0.545	0.574	0.0	0.0	0.895	0.947	1	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG03642	0.772	0.813	0.0	0.0	0.875	0.808	1	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	HG03742	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA12878	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA18525	0.855	0.9	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA18939	0.721	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA19017	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA19238	0.39	0.411	0.063	0.035	nan	nan	0	1
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA19239	0.694	0.731	0.0	0.003	0.708	0.708	1	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA19625	0.573	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA19648	0.842	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA20502	0.539	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	26268411	26269112	DEL	702	NA20845	0.785	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG00096	0.936	0.936	0.0	0.0	0.679	0.711	1	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG00268	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG00419	0.358	0.358	0.0	0.039	0.667	0.667	1	1
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG00759	0.692	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG01051	0.846	0.846	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG01112	0.911	0.911	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG01500	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG01565	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG01583	0.592	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG01595	0.518	0.518	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG01879	1.119	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG02568	1.16	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG02922	0.821	0.821	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG03006	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG03052	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG03642	0.515	0.515	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	HG03742	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA12878	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA18525	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA18939	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA19017	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA19238	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA19239	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA19625	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA19648	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA20502	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	31470733	31470813	DEL	81	NA20845	0.941	0.941	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG00096	0.917	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG00268	0.748	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG00759	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG01051	0.762	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG01112	0.816	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG01500	0.757	0.735	0.0	0.004	0.83	0.83	2	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG01565	1.11	1.078	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG01583	0.962	0.934	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG01595	0.559	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG01879	0.988	0.959	0.0	0.0	0.648	0.648	4	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG02568	1.121	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG02922	0.842	0.818	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG03006	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG03052	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG03642	0.823	0.799	0.0	0.0	0.722	0.782	1	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	HG03742	0.888	0.862	0.0	0.008	0.909	0.864	1	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA12878	0.931	0.904	0.0	0.001	0.571	0.571	3	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA18525	0.837	0.812	0.0	0.0	0.826	0.862	4	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA18939	0.943	0.916	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA19017	0.763	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA19238	0.78	0.758	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA19239	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA19625	0.781	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA19648	0.944	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA20502	1.008	0.979	0.0	0.0	0.438	0.438	3	2
chr1	3581723	3582247	DUP	525	NA20845	1.009	0.979	0.0	0.0	0.773	0.713	1	2
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG00096	0.0	0.0	0.01	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG00268	0.463	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG00419	0.379	0.421	0.01	0.0	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG00759	0.448	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG01112	0.342	0.38	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG01500	0.0	0.0	0.013	0.006	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG01565	0.384	0.427	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG01583	0.0	0.0	0.011	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG01879	0.336	0.373	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG02568	0.503	0.558	0.0	0.007	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG02922	0.41	0.456	0.01	0.017	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG03006	0.0	0.0	0.006	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG03052	0.0	0.0	0.006	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA19017	0.992	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA19238	0.323	0.359	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA19239	0.841	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA19625	0.521	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.008	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA20502	0.0	0.0	0.01	0.0	nan	nan	0	0
chr1	36733282	36733515	DEL	234	NA20845	0.0	0.0	0.006	0.006	nan	nan	0	0
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.176	nan	nan	0	0
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG00268	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG00419	1.073	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG00759	1.078	1.135	0.0	0.0	0.655	0.655	1	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG01051	0.36	0.379	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG01112	0.455	0.479	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG01500	0.702	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.169	nan	nan	0	0
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.223	nan	nan	0	0
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG01595	0.332	0.349	0.013	0.075	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG01879	0.336	0.353	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG02568	1.276	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG02922	0.842	0.887	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG03006	0.335	0.353	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG03052	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG03642	0.283	0.298	0.007	0.092	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	HG03742	0.908	0.956	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA18525	0.552	0.581	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA18939	0.499	0.526	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA19017	0.916	0.964	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA19238	0.848	0.892	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA19239	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA19625	0.469	0.493	0.015	0.03	nan	nan	0	1
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA20502	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	37816478	37816722	DEL	245	NA20845	0.381	0.401	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG00096	0.73	0.839	0.0	0.0	0.706	0.674	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG00268	0.783	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG00419	0.442	0.508	0.08	0.064	nan	nan	0	1
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG00759	0.732	0.842	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG01051	0.698	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG01112	0.778	0.894	0.0	0.0	0.889	0.941	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG01500	0.887	1.019	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG01565	0.747	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG01583	0.986	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG01595	0.456	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG01879	0.764	0.879	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG02568	0.966	1.111	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG02922	0.778	0.894	0.0	0.0	0.846	0.907	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG03006	0.913	1.049	0.007	0.0	0.947	0.947	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG03052	0.764	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG03642	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	HG03742	0.928	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA12878	0.724	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA18525	0.944	1.085	0.0	0.0	0.828	0.864	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA18939	0.647	0.744	0.0	0.0	0.864	0.864	2	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA19017	0.878	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA19238	0.928	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA19239	0.841	0.966	0.0	0.0	0.59	0.59	1	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA19625	0.911	1.048	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA19648	1.072	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA20502	0.891	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	38132306	38132989	DEL	684	NA20845	0.874	1.005	0.0	0.0	0.895	0.89	2	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG00096	0.693	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG00268	0.748	0.831	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG00419	0.82	0.912	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG00759	0.834	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG01051	0.635	0.705	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG01112	0.797	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG01500	0.776	0.862	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG01565	0.662	0.735	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG01583	0.814	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG01595	0.808	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG01879	0.671	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG02568	1.044	1.16	0.023	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG02922	0.842	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG03006	0.708	0.786	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG03052	1.091	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG03642	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	HG03742	0.767	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA12878	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA18525	0.801	0.89	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA18939	0.758	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA19017	0.706	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA19238	0.727	0.807	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA19239	0.427	0.475	0.061	0.003	nan	nan	0	1
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA19625	0.807	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA19648	0.995	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA20502	0.868	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	39277013	39277955	DEL	943	NA20845	0.695	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG00096	0.843	0.887	0.0	0.0	0.95	0.995	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG00268	0.89	0.937	0.0	0.0	0.64	0.64	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG00419	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG00759	0.814	0.857	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG01051	0.91	0.958	0.0	0.0	0.875	0.82	3	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG01112	0.588	0.619	0.0	0.0	0.625	0.662	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG01500	0.85	0.894	0.0	0.0	0.655	0.655	2	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG01565	0.79	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG01583	0.838	0.883	0.0	0.0	0.819	0.819	2	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG01595	0.85	0.894	0.0	0.0	0.771	0.771	2	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG01879	0.914	0.962	0.0	0.005	0.633	0.633	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG02568	0.734	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG02922	0.778	0.818	0.0	0.0	0.571	0.612	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG03006	0.801	0.843	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG03052	0.0	0.0	0.254	0.142	nan	nan	0	0
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG03642	0.823	0.867	0.0	0.0	0.625	0.677	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	HG03742	0.787	0.828	0.0	0.0	0.789	0.782	2	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA12878	0.879	0.925	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA18525	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA18939	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA19017	0.0	0.0	0.32	0.183	nan	nan	0	0
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA19238	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA19239	0.427	0.45	0.047	0.044	nan	nan	0	1
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA19625	0.833	0.877	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA19648	0.919	0.967	0.0	0.0	0.733	0.731	4	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA20502	0.774	0.814	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr1	41743816	41744510	DEL	695	NA20845	0.897	0.944	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG00096	1.067	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG00268	0.783	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG00419	0.841	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG00759	0.753	0.792	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG01051	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG01112	0.702	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG01500	0.794	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG01565	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG01583	0.74	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG01595	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG01879	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG02568	0.58	0.61	0.064	0.04	nan	nan	0	1
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG02922	0.842	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG03006	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG03052	0.436	0.459	0.079	0.044	0.615	0.652	1	1
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG03642	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	HG03742	0.787	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA12878	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA18525	1.033	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA18939	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA19017	0.496	0.522	0.051	0.023	nan	nan	0	1
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA19238	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA19239	0.921	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA19625	1.068	1.124	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA19648	0.842	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA20502	0.821	0.864	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr1	43538303	43539041	DEL	739	NA20845	0.74	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG00096	1.18	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG00268	1.246	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG00419	0.61	0.56	0.0	0.063	0.375	0.375	1	1
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG00759	0.773	0.709	0.0	0.073	0.395	0.395	1	1
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG01051	0.973	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG01112	1.158	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG01500	1.108	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG01565	1.43	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG01583	1.381	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG01595	1.264	1.16	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG01879	1.156	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG02568	1.237	1.135	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG02922	1.317	1.209	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG03006	1.006	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG03052	1.527	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG03642	1.57	1.44	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	HG03742	1.19	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA12878	0.913	0.838	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA18525	0.694	0.637	0.0	0.083	0.489	0.511	1	1
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA18939	0.851	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA19017	0.973	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA19238	1.076	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA19239	1.121	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA19625	1.198	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA19648	1.149	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA20502	1.196	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4488122	4488222	DEL	101	NA20845	1.166	1.069	0.0	0.0	0.833	0.903	1	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG00096	0.824	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG00268	0.712	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG00419	0.905	0.952	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG00759	0.895	0.942	0.0	0.0	0.538	0.538	3	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG01051	0.529	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG01112	0.74	0.779	0.0	0.0	0.882	0.833	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG01500	0.831	0.875	0.0	0.0	0.646	0.646	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG01565	0.769	0.809	0.0	0.0	0.652	0.652	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG01583	0.715	0.753	0.0	0.0	0.483	0.483	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG01595	0.725	0.763	0.0	0.0	0.615	0.615	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG01879	0.671	0.707	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG02568	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG02922	0.842	0.887	0.0	0.0	0.828	0.773	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG03006	0.633	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG03052	0.807	0.85	0.0	0.0	0.684	0.724	1	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG03642	0.823	0.867	0.0	0.0	0.533	0.492	3	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	HG03742	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA12878	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA18525	0.516	0.543	0.067	0.047	nan	nan	0	1
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA18939	0.61	0.642	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA19017	0.763	0.804	0.0	0.0	0.636	0.636	3	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA19238	0.888	0.935	0.0	0.0	0.615	0.615	3	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA19239	0.841	0.885	0.0	0.0	0.647	0.647	3	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA19625	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA19648	0.74	0.779	0.0	0.0	0.735	0.784	2	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA20502	1.079	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48352571	48353250	DEL	680	NA20845	0.695	0.731	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG00096	1.123	1.183	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG00268	1.104	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG00419	1.073	1.129	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG00759	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG01051	0.973	1.024	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG01112	1.006	1.059	0.0	0.0	0.75	0.794	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG01500	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG01565	0.79	0.831	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG01583	1.134	1.194	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG01595	0.787	0.829	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG01879	0.373	0.393	0.066	0.0	nan	nan	0	1
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG02568	0.812	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG02922	1.015	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG03006	1.136	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG03052	1.178	1.24	0.0	0.0	0.778	0.735	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG03642	0.875	0.921	0.009	0.0	1.0	0.923	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	HG03742	0.847	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA12878	1.103	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA18525	1.068	1.124	0.0	0.004	1.0	0.958	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA18939	0.98	1.032	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA19017	1.145	1.205	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA19238	0.982	1.034	0.007	0.006	nan	nan	0	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA19239	0.881	0.927	0.003	0.0	0.875	0.875	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA19625	0.99	1.042	0.0	0.003	0.856	0.856	2	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA19648	1.046	1.102	0.0	0.0	0.682	0.639	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA20502	0.938	0.987	0.0	0.005	0.714	0.714	1	2
chr1	48370208	48370801	DEL	594	NA20845	0.941	0.991	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG00096	0.861	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG00268	0.872	0.918	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG00419	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG00759	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG01051	0.74	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG01112	0.911	0.959	0.0	0.0	1.0	0.944	1	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG01500	0.702	0.739	0.0	0.0	0.95	0.95	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG01565	0.79	0.831	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG01583	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG01595	0.891	0.938	0.0	0.0	0.783	0.783	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG01879	0.932	0.981	0.0	0.0	0.793	0.793	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG02568	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG02922	0.972	1.023	0.004	0.002	0.737	0.789	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG03006	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG03052	0.895	0.942	0.0	0.0	0.824	0.872	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG03642	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	HG03742	0.908	0.956	0.0	0.0	0.818	0.777	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA12878	0.81	0.853	0.0	0.0	0.81	0.81	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA18525	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA18939	0.925	0.973	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA19017	1.031	1.085	0.0	0.0	0.789	0.789	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA19238	1.009	1.062	0.0	0.0	0.933	0.933	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA19239	0.961	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA19625	0.911	0.959	0.0	0.0	0.636	0.636	3	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA19648	0.893	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA20502	1.032	1.086	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr1	4882232	4883040	DEL	809	NA20845	0.403	0.425	0.058	0.029	0.75	0.692	1	1
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG00096	1.348	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG00268	1.139	1.106	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG00419	1.241	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG00759	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG01051	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG01112	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG01500	1.053	1.022	0.0	0.0	0.796	0.796	2	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG01565	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG01583	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG01595	1.223	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG01879	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG02568	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG02922	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG03006	1.211	1.175	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG03052	1.178	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG03642	1.312	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	HG03742	1.412	1.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA12878	0.913	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA18525	1.104	1.072	0.0	0.0	0.75	0.719	1	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA18939	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA19017	1.164	1.13	0.0	0.0	0.671	0.671	2	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA19238	0.592	0.575	0.1	0.0	0.308	0.308	2	1
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA19239	1.014	0.985	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA19625	0.964	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA19648	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA20502	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5165240	5166206	DEL	967	NA20845	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG00096	0.73	0.811	0.0	0.0	0.685	0.684	4	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG00268	0.783	0.87	0.007	0.001	nan	nan	0	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG00419	0.736	0.818	0.006	0.0	0.667	0.667	3	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG00759	0.712	0.791	0.0	0.0	0.752	0.752	2	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG01051	0.783	0.87	0.0	0.0	0.683	0.641	2	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG01112	0.304	0.337	0.026	0.026	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG01500	0.0	0.0	0.144	0.171	nan	nan	0	0
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG01565	0.662	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG01583	0.691	0.767	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG01595	0.414	0.46	0.038	0.027	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG01879	0.429	0.477	0.033	0.035	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG02568	0.309	0.344	0.021	0.021	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG02922	0.886	0.984	0.0	0.0	0.364	0.39	3	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG03006	0.317	0.352	0.035	0.033	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG03052	0.371	0.412	0.021	0.029	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG03642	0.437	0.486	0.027	0.021	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	HG03742	0.565	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA12878	0.379	0.421	0.023	0.027	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA18939	0.629	0.699	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA19017	0.687	0.763	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA19238	0.444	0.493	0.038	0.032	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA19239	0.827	0.919	0.0	0.0	0.613	0.613	3	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA19625	0.547	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA19648	0.434	0.482	0.045	0.031	nan	nan	0	1
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA20502	0.868	0.964	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53594104	53594942	DEL	839	NA20845	0.807	0.897	0.0	0.0	0.477	0.482	4	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG00096	0.917	1.055	0.0	0.0	0.802	0.841	2	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG00268	0.872	1.003	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG00419	0.799	0.919	0.0	0.0	0.522	0.522	1	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG00759	0.671	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG01051	0.571	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG01112	0.247	0.284	0.03	0.069	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG01500	0.0	0.0	0.098	0.283	nan	nan	0	0
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG01565	0.662	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG01583	0.814	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG01595	0.311	0.357	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG01879	0.429	0.493	0.025	0.062	0.077	0.077	1	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG02568	0.464	0.533	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG02922	0.734	0.844	0.0	0.0	0.708	0.701	2	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG03006	0.391	0.45	0.023	0.06	0.092	0.092	2	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG03052	0.458	0.527	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG03642	0.54	0.621	0.027	0.11	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	HG03742	0.605	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA12878	0.414	0.475	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA18525	0.855	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA18939	0.703	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA19017	0.63	0.724	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA19238	0.363	0.418	0.0	0.107	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA19239	0.787	0.905	0.0	0.0	0.677	0.677	1	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA19625	0.911	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA19648	0.434	0.499	0.023	0.101	nan	nan	0	1
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA20502	0.844	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	53595112	53595602	DEL	491	NA20845	0.403	0.464	0.0	0.014	0.6	0.554	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG00096	1.329	1.291	0.0	0.0	0.406	0.426	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG00268	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG00419	1.01	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG00759	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG01051	1.248	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG01112	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG01500	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG01565	1.067	1.036	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG01583	0.814	0.79	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG01595	1.046	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG01879	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG02568	0.618	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG02922	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG03006	0.866	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG03052	0.96	0.932	0.006	0.0	0.909	0.963	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG03642	1.081	1.049	0.0	0.0	0.833	0.903	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	HG03742	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA12878	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA18525	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA19017	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA19238	0.996	0.967	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA19239	1.108	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA19625	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA19648	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA20502	1.079	1.047	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr1	55000991	55001880	DUP	890	NA20845	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG00096	0.655	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG00268	0.498	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG00419	0.778	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG00759	0.529	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG01051	0.698	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG01112	0.759	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG01500	0.757	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG01565	0.833	0.957	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG01583	0.691	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG01595	0.559	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG01879	0.69	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG02568	1.237	1.422	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG02922	0.475	0.546	0.0	0.047	0.714	0.765	2	1
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG03006	0.782	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG03052	0.545	0.627	0.0	0.017	0.424	0.449	2	1
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG03642	0.721	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	HG03742	0.908	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA12878	0.776	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA18525	0.908	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA18939	0.962	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA19017	1.05	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA19238	0.888	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA19239	0.294	0.337	0.0	0.016	0.818	0.818	2	1
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA19625	0.677	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA19648	0.817	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA20502	0.492	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	5534618	5534684	DEL	67	NA20845	0.56	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG00096	1.03	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG00268	0.997	0.932	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG00419	1.031	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG00759	1.129	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG01051	1.058	0.989	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG01112	0.968	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG01500	0.96	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG01565	0.0	0.0	0.009	0.136	nan	nan	0	1
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG01583	1.036	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG01595	1.14	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG01879	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG02568	0.966	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG02922	1.015	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG03006	1.118	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG03052	1.266	1.183	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG03642	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	HG03742	0.827	0.773	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA12878	0.922	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA18525	0.668	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA18939	0.842	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA19017	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA19238	0.861	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA19239	1.188	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA19625	1.12	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA19648	0.842	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA20502	1.36	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	55995472	55995577	DEL	106	NA20845	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG00096	0.824	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG00268	0.837	0.812	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG00419	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG00759	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG01051	1.037	1.006	0.0	0.0	0.796	0.795	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG01112	0.797	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG01500	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG01565	0.811	0.788	0.0	0.0	0.761	0.761	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG01583	0.715	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG01595	1.077	1.046	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG01879	0.839	0.815	0.0	0.0	0.923	0.923	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG02568	0.657	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG02922	0.95	0.923	0.0	0.0	0.639	0.597	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG03006	0.522	0.506	0.049	0.029	nan	nan	0	1
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG03052	0.851	0.826	0.0	0.0	0.684	0.724	3	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG03642	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	HG03742	1.049	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA12878	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA18525	0.908	0.882	0.0	0.0	0.719	0.722	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA18939	0.758	0.736	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA19017	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA19238	0.996	0.967	0.0	0.0	0.879	0.879	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA19239	0.894	0.868	0.0	0.0	0.83	0.83	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA19625	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA19648	0.842	0.818	0.0	0.0	0.75	0.746	2	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA20502	0.938	0.911	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr1	57384819	57385642	DEL	824	NA20845	0.852	0.827	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG00096	0.0	0.0	0.392	0.254	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG00268	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG00419	0.0	0.0	0.276	0.167	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG00759	0.0	0.0	0.339	0.206	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG01051	0.0	0.0	0.201	0.143	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG01112	0.0	0.0	0.32	0.224	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG01500	0.0	0.0	0.431	0.25	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG01565	0.0	0.0	0.249	0.162	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG01583	0.0	0.0	0.204	0.118	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG01595	0.0	0.0	0.276	0.148	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG01879	0.0	0.0	0.343	0.239	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG02568	0.0	0.0	0.22	0.144	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG02922	0.0	0.0	0.289	0.144	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG03006	0.0	0.0	0.339	0.22	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG03052	0.0	0.0	0.329	0.184	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG03642	0.0	0.0	0.206	0.132	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	HG03742	0.0	0.0	0.368	0.214	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA12878	0.0	0.0	0.262	0.172	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA18525	0.0	0.0	0.4	0.267	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA18939	0.0	0.0	0.244	0.132	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA19017	0.573	0.603	0.07	0.046	nan	nan	0	1
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA19238	0.0	0.0	0.399	0.222	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA19239	0.374	0.393	0.118	0.07	nan	nan	0	1
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA19625	0.0	0.0	0.212	0.136	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA19648	0.0	0.0	0.215	0.151	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA20502	0.0	0.0	0.373	0.217	nan	nan	0	0
chr1	58743910	58744826	DEL	917	NA20845	0.0	0.0	0.24	0.169	nan	nan	0	0
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG00096	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG00268	0.552	0.552	0.066	0.044	nan	nan	0	1
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG00419	1.052	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG00759	0.834	0.834	0.0	0.0	0.591	0.591	1	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG01051	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG01112	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG01500	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG01565	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG01583	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG01595	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG01879	0.578	0.578	0.103	0.067	nan	nan	0	1
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG02568	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG02922	0.994	0.994	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG03006	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG03052	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG03642	1.261	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	HG03742	1.049	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA12878	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA18525	1.282	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA18939	1.054	1.054	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA19017	1.05	1.05	0.0	0.0	0.656	0.656	1	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA19238	1.157	1.157	0.004	0.0	0.955	0.955	1	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA19239	0.561	0.561	0.098	0.045	nan	nan	0	1
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA19625	1.25	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA19648	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA20502	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	60106249	60107104	DEL	856	NA20845	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG00096	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG00268	0.498	0.498	0.09	0.053	nan	nan	0	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG00419	1.052	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG00759	0.0	0.0	0.344	0.211	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG01051	0.656	0.656	0.079	0.043	nan	nan	0	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG01112	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG01500	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG01565	0.576	0.576	0.062	0.044	nan	nan	0	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG01583	0.715	0.715	0.119	0.067	nan	nan	0	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG01595	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG01879	0.522	0.522	0.089	0.046	nan	nan	0	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG02568	0.618	0.618	0.087	0.041	nan	nan	0	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG02922	0.0	0.0	0.339	0.22	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG03006	0.0	0.0	0.321	0.228	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG03052	0.0	0.0	0.223	0.163	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG03642	0.0	0.0	0.242	0.16	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	HG03742	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA12878	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA18525	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA18939	0.629	0.629	0.099	0.061	0.625	0.625	1	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA19017	0.0	0.0	0.279	0.169	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA19238	0.0	0.0	0.389	0.24	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA19239	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA19625	0.651	0.651	0.089	0.043	nan	nan	0	1
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA19648	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA20502	0.0	0.0	0.342	0.165	nan	nan	0	0
chr1	62082822	62083701	DEL	880	NA20845	0.493	0.493	0.046	0.04	nan	nan	0	1
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG00096	0.936	1.04	0.0	0.0	0.722	0.689	3	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG00268	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG00419	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG00759	0.59	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG01051	0.571	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG01112	0.588	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG01500	0.85	0.944	0.0	0.0	0.682	0.682	3	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG01565	0.576	0.64	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG01583	0.691	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG01595	0.642	0.714	0.0	0.0	0.59	0.59	2	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG01879	0.541	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG02568	0.85	0.945	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG02922	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG03006	0.615	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG03052	0.829	0.921	0.0	0.0	1.0	0.944	1	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG03642	0.875	0.972	0.0	0.0	0.893	0.887	2	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	HG03742	0.666	0.74	0.0	0.0	0.643	0.677	3	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA12878	0.793	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA18525	0.926	1.029	0.0	0.0	0.812	0.779	3	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA18939	0.647	0.719	0.0	0.0	0.641	0.641	2	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA19017	0.668	0.742	0.0	0.0	0.776	0.776	2	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA19238	0.7	0.777	0.0	0.0	0.842	0.842	2	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA19239	0.454	0.504	0.164	0.042	0.788	0.788	4	1
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA19625	0.599	0.666	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA19648	0.664	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA20502	0.914	1.016	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	6458634	6459611	DEL	978	NA20845	0.717	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG00096	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG00268	0.73	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG00419	0.673	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG00759	0.732	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG01051	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG01112	0.702	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG01500	0.979	0.979	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG01565	0.64	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG01583	1.06	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG01595	0.912	0.912	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG01879	0.0	0.0	0.011	0.188	nan	nan	0	0
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG02568	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG02922	0.0	0.0	0.048	0.147	nan	nan	0	0
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG03006	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG03052	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG03642	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	HG03742	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA12878	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA18525	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA18939	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA19017	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA19238	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA19239	0.374	0.374	0.005	0.104	nan	nan	0	1
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA19625	0.417	0.417	0.018	0.085	nan	nan	0	1
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA19648	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA20502	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	65682234	65682602	DEL	369	NA20845	0.74	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG00096	0.899	0.873	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG00268	0.757	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG00419	0.726	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG00759	0.407	0.395	0.0	0.016	0.905	0.905	1	1
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG01051	0.889	0.863	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG01112	0.968	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG01565	0.918	0.891	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG01583	0.395	0.383	0.0	0.032	0.571	0.571	1	1
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG01595	0.394	0.382	0.0	0.01	0.524	0.524	1	1
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG01879	0.839	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG02568	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG02922	0.648	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG03006	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG03052	0.829	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG03642	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	HG03742	0.605	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA12878	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA18525	0.303	0.294	0.0	0.018	1.0	0.958	1	1
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA18939	0.777	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA19017	0.534	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA19238	0.807	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA19239	0.761	0.739	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA19625	0.964	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA19648	0.766	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA20502	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	66694579	66694640	DEL	62	NA20845	0.493	0.479	0.0	0.035	0.5	0.542	1	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG00096	0.0	0.0	0.284	0.012	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG00268	0.0	0.0	0.387	0.029	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG00419	0.0	0.0	0.205	0.021	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG00759	0.285	0.3	0.101	0.014	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG01051	0.0	0.0	0.293	0.013	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG01112	0.0	0.0	0.128	0.019	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG01500	0.554	0.583	0.088	0.007	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG01565	0.427	0.449	0.036	0.009	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG01583	0.469	0.493	0.054	0.007	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG01595	0.29	0.305	0.131	0.007	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG01879	0.0	0.0	0.211	0.018	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG02568	1.005	1.058	0.0	0.008	0.667	0.667	1	2
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG02922	0.324	0.341	0.08	0.004	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG03006	0.0	0.0	0.169	0.023	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG03052	0.458	0.482	0.04	0.0	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG03642	0.335	0.352	0.066	0.005	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	HG03742	0.0	0.0	0.196	0.018	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA12878	0.0	0.0	0.285	0.028	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA18525	0.0	0.0	0.262	0.026	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA18939	0.0	0.0	0.222	0.019	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA19017	0.84	0.884	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA19238	0.404	0.425	0.052	0.004	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA19239	0.374	0.393	0.112	0.008	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA19625	0.495	0.521	0.053	0.012	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA19648	0.0	0.0	0.197	0.038	nan	nan	0	0
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA20502	0.445	0.469	0.079	0.013	nan	nan	0	1
chr1	68007970	68008811	DEL	842	NA20845	0.762	0.802	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG00096	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG00268	0.926	0.899	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG00419	1.031	1.001	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG00759	1.119	1.086	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG01051	1.015	0.986	0.0	0.0	0.75	0.703	1	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG01112	0.949	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG01500	1.108	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG01565	1.302	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG01583	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG01595	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG01879	0.951	0.923	0.0	0.0	0.7	0.7	2	1
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG02568	1.121	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG02922	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG03006	1.024	0.995	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG03052	0.938	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG03642	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	HG03742	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA12878	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA18525	1.122	1.089	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA18939	0.814	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA19017	1.355	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA19238	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA19239	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA19625	0.911	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA19648	0.766	0.743	0.0	0.0	0.733	0.782	1	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA20502	0.938	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	69479743	69480631	DEL	889	NA20845	1.009	0.979	0.0	0.0	0.833	0.903	1	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG00096	0.58	0.542	0.007	0.097	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG00268	0.445	0.416	0.018	0.069	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG00419	0.442	0.413	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG00759	0.427	0.399	0.006	0.064	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG01051	1.375	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG01112	0.607	0.568	0.007	0.062	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG01500	1.238	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG01565	0.726	0.678	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG01583	0.838	0.784	0.01	0.059	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG01595	0.642	0.6	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG01879	1.231	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG02568	0.928	0.867	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG02922	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG03006	1.49	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG03052	0.786	0.734	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG03642	1.261	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	HG03742	0.605	0.566	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA12878	0.879	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA18525	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA18939	0.61	0.57	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA19017	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA19238	1.265	1.182	0.0	0.0	0.894	0.894	1	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA19239	1.228	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA19625	0.547	0.511	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA19648	1.353	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA20502	0.75	0.701	0.009	0.083	nan	nan	0	1
chr1	71148798	71149047	DEL	250	NA20845	1.166	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG00096	0.824	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG00268	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG00419	0.505	0.49	0.06	0.1	nan	nan	0	1
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG00759	0.529	0.514	0.035	0.118	nan	nan	0	1
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG01051	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG01112	0.759	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG01500	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG01565	0.993	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG01583	0.617	0.599	0.03	0.065	nan	nan	0	1
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG01595	0.0	0.0	0.094	0.276	nan	nan	0	0
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG01879	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG02568	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG02922	0.886	0.86	0.0	0.0	0.75	0.804	1	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG03006	1.304	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG03052	0.829	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG03642	0.515	0.5	0.021	0.073	nan	nan	0	1
chr1	72449620	72450027	DEL	408	HG03742	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA12878	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA18525	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA18939	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA19017	0.973	0.945	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA19238	1.13	1.097	0.0	0.0	0.974	0.974	1	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA19239	1.281	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA19625	0.703	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA19648	1.174	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA20502	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	72449620	72450027	DEL	408	NA20845	0.314	0.305	0.055	0.071	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG00096	0.468	0.437	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG00268	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG00419	0.0	0.0	0.028	0.198	nan	nan	0	0
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG00759	0.997	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG01051	1.259	1.176	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG01112	0.55	0.514	0.0	0.071	0.35	0.371	2	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG01500	1.053	0.984	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG01565	0.64	0.599	0.004	0.097	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG01583	1.332	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG01595	0.953	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG01879	0.97	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG02568	0.889	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG02922	0.972	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG03006	0.0	0.0	0.025	0.216	nan	nan	0	0
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG03052	0.502	0.469	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG03642	0.618	0.577	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	HG03742	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA12878	0.0	0.0	0.006	0.25	nan	nan	0	0
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA18525	0.427	0.399	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA18939	0.592	0.553	0.006	0.066	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA19017	1.107	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA19238	0.713	0.666	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA19239	0.627	0.586	0.004	0.082	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA19625	1.094	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA19648	1.097	1.026	0.0	0.0	0.654	0.613	1	2
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA20502	0.539	0.504	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr1	74312425	74312678	DEL	254	NA20845	0.516	0.482	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG00096	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG00268	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG00419	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG00759	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG01051	0.952	0.952	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG01112	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG01500	1.164	1.164	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG01565	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG01583	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG01595	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG01879	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG02568	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG02922	0.626	0.626	0.0	0.039	0.833	0.893	1	1
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG03006	0.82	0.82	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG03052	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG03642	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	HG03742	0.888	0.888	0.0	0.0	0.87	0.826	1	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA12878	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA18525	1.113	1.113	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA18939	1.165	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA19017	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA19238	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA19239	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA19625	1.25	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA19648	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA20502	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	79160066	79160141	DEL	76	NA20845	0.785	0.785	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG00096	0.974	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG00268	1.211	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG00419	0.883	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG00759	1.221	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG01051	1.227	1.191	0.0	0.0	0.952	0.893	1	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG01112	1.234	1.198	0.0	0.0	0.778	0.824	1	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG01500	1.385	1.345	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG01565	1.217	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG01583	1.134	1.101	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG01595	1.202	1.167	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG01879	1.193	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG02568	0.425	0.413	0.048	0.005	nan	nan	0	1
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG02922	0.0	0.0	0.169	0.005	nan	nan	0	0
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG03006	1.285	1.248	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG03052	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG03642	1.158	1.124	0.0	0.0	0.611	0.564	1	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	HG03742	1.17	1.136	0.0	0.0	0.741	0.704	1	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA12878	0.845	0.82	0.0	0.0	0.607	0.607	1	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA18525	1.139	1.106	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA18939	1.424	1.383	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA19017	0.992	0.963	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA19238	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA19239	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA19625	1.146	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA19648	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA20502	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	80116488	80117280	DEL	793	NA20845	1.255	1.219	0.0	0.0	1.0	0.923	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG00096	1.086	1.086	0.0	0.0	0.957	0.913	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG00268	0.899	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG00419	1.115	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG00759	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG01051	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG01112	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG01500	1.201	1.201	0.007	0.0	0.724	0.724	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG01565	1.153	1.153	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG01583	0.641	0.641	0.05	0.039	nan	nan	0	1
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG01595	0.87	0.87	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG01879	0.97	0.97	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG02568	0.889	0.889	0.0	0.0	0.755	0.755	2	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG02922	1.08	1.08	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG03006	0.764	0.764	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG03052	1.091	1.091	0.0	0.0	0.889	0.941	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG03642	1.235	1.235	0.0	0.0	0.938	0.865	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	HG03742	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA12878	0.948	0.948	0.0	0.0	0.735	0.735	2	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA18525	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA18939	0.999	0.999	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA19017	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA19238	0.888	0.888	0.0	0.0	0.861	0.861	2	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA19239	1.081	1.081	0.0	0.0	0.882	0.882	2	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA19625	0.807	0.807	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA19648	0.893	0.893	0.0	0.0	0.55	0.587	1	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA20502	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	81654586	81655431	DEL	846	NA20845	0.964	0.964	0.0	0.0	0.846	0.781	1	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG00096	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG00268	0.997	0.968	0.0	0.0	0.817	0.817	4	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG00419	1.178	1.144	0.0	0.0	0.748	0.748	4	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG00759	1.099	1.067	0.0	0.0	0.869	0.869	4	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG01051	1.079	1.047	0.0	0.0	0.618	0.621	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG01112	0.892	0.866	0.0	0.0	0.883	0.871	4	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG01500	1.034	1.004	0.0	0.0	0.751	0.751	4	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG01565	1.025	0.995	0.0	0.0	0.63	0.63	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG01583	1.134	1.101	0.0	0.0	0.664	0.664	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG01595	1.015	0.986	0.0	0.0	0.731	0.731	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG01879	0.988	0.959	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG02568	0.425	0.413	0.075	0.046	0.409	0.409	2	1
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG02922	0.842	0.818	0.0	0.0	0.864	0.862	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG03006	1.08	1.049	0.0	0.0	0.818	0.818	4	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG03052	0.895	0.869	0.0	0.0	0.667	0.63	1	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG03642	1.081	1.049	0.0	0.0	0.726	0.787	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	HG03742	0.868	0.842	0.0	0.0	0.855	0.854	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA18525	0.979	0.951	0.0	0.0	0.867	0.868	4	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA18939	1.313	1.275	0.0	0.0	0.823	0.823	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA19017	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA19238	1.063	1.032	0.0	0.0	0.707	0.707	1	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA19239	1.068	1.037	0.0	0.0	0.844	0.844	2	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA19625	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA19648	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA20502	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84126145	84127093	DEL	949	NA20845	0.785	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG00096	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG00268	1.211	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG00419	0.989	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG00759	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG01051	1.121	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG01112	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG01500	1.053	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG01565	1.409	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG01583	1.011	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG01595	1.347	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG01879	1.231	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG02568	0.966	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG02922	1.123	1.05	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG03006	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG03052	1.222	1.142	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG03642	1.004	0.938	0.0	0.0	0.665	0.614	2	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	HG03742	1.13	1.056	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA12878	0.982	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA18525	0.944	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA18939	1.35	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA19017	0.515	0.482	0.086	0.065	0.483	0.483	2	1
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA19238	1.05	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA19239	0.601	0.561	0.048	0.053	nan	nan	0	1
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA19625	1.224	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA19648	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA20502	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	84388330	84388946	DEL	617	NA20845	1.21	1.131	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG00096	1.086	1.054	0.0	0.0	0.911	0.87	4	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG00268	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG00419	1.262	1.225	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG00759	1.119	1.086	0.0	0.0	0.677	0.677	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG01051	1.164	1.13	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG01112	1.348	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG01500	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG01565	1.324	1.285	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG01583	1.48	1.437	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG01595	1.388	1.348	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG01879	1.156	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG02568	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG02922	0.454	0.44	0.025	0.083	nan	nan	0	1
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG03006	1.322	1.284	0.0	0.0	0.629	0.629	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG03052	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG03642	1.544	1.499	0.0	0.0	0.88	0.812	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	HG03742	1.069	1.038	0.0	0.0	0.782	0.777	2	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA12878	0.776	0.753	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA18525	1.175	1.141	0.0	0.0	0.897	0.936	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA18939	1.221	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA19017	0.992	0.963	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA19238	1.224	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA19239	1.054	1.024	0.0	0.0	0.844	0.844	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA19625	1.276	1.239	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA19648	1.251	1.214	0.0	0.0	0.741	0.694	1	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA20502	1.29	1.252	0.004	0.0	0.7	0.7	3	2
chr1	86994125	86994526	DEL	402	NA20845	1.031	1.001	0.0	0.0	0.579	0.627	1	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG00096	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG00268	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG00419	1.346	1.307	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG00759	1.282	1.244	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG01051	0.973	0.945	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG01112	1.272	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG01500	1.348	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG01565	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG01583	1.48	1.437	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG01595	1.057	1.026	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG01879	1.044	1.014	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG02568	1.469	1.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG02922	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG03006	1.583	1.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG03052	0.633	0.614	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG03642	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	HG03742	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA12878	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA18525	1.211	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA18939	0.684	0.664	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA19017	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA19238	0.713	0.692	0.0	0.06	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA19239	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA19625	1.536	1.492	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA19648	0.944	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA20502	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88047131	88047237	DEL	107	NA20845	1.435	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG00096	0.917	0.966	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG00268	0.748	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG00419	0.442	0.465	0.0	0.019	0.826	0.826	1	1
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG00759	0.732	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG01051	1.227	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG01112	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG01500	1.071	1.128	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG01565	0.576	0.607	0.0	0.027	0.462	0.462	1	1
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG01583	1.529	1.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG01595	1.036	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG01879	0.494	0.52	0.0	0.046	0.964	0.964	1	1
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG02568	0.966	1.017	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG02922	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG03006	0.996	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG03052	1.069	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG03642	1.235	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	HG03742	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA18525	0.944	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA18939	1.017	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA19017	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA19238	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA19239	1.168	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA19625	1.042	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA19648	1.302	1.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA20502	0.563	0.592	0.0	0.014	0.667	0.667	1	1
chr1	88873547	88873598	DEL	52	NA20845	0.471	0.496	0.0	0.051	0.632	0.583	1	1
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG00096	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG00268	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG00419	1.409	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG00759	0.448	0.418	0.091	0.056	0.5	0.5	1	1
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG01051	1.227	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG01112	1.234	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG01500	1.053	0.984	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG01565	1.153	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG01583	1.011	0.945	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG01595	0.642	0.6	0.082	0.058	nan	nan	0	1
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG01879	1.063	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG02568	1.044	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG02922	1.231	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG03006	0.615	0.574	0.044	0.024	nan	nan	0	1
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG03052	1.178	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG03642	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	HG03742	1.412	1.32	0.0	0.0	0.722	0.76	1	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA12878	1.017	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA18525	1.389	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA18939	1.184	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA19017	1.145	1.07	0.0	0.0	0.781	0.781	1	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA19238	1.144	1.069	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA19239	1.188	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA19625	1.224	1.144	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA19648	1.225	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA20502	0.961	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89094521	89095354	DEL	834	NA20845	1.3	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG00096	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG00268	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG00419	0.862	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG00759	0.712	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG01051	0.889	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG01112	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG01500	0.813	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG01565	0.961	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG01583	0.925	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG01595	0.995	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG01879	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG02568	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG02922	0.929	0.978	0.006	0.003	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG03006	0.782	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG03052	0.938	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG03642	0.399	0.42	0.1	0.024	nan	nan	0	1
chr1	89811425	89812284	DEL	860	HG03742	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA12878	0.982	1.034	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA18525	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA18939	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA19017	0.763	0.804	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA19238	0.902	0.949	0.0	0.0	0.946	0.946	1	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA19239	0.921	0.969	0.0	0.0	0.758	0.758	1	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA19625	1.094	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA19648	0.562	0.591	0.088	0.018	nan	nan	0	1
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA20502	1.079	1.135	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr1	89811425	89812284	DEL	860	NA20845	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG00096	0.843	0.887	0.0	0.0	0.579	0.553	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG00268	0.605	0.637	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG00419	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG00759	0.305	0.321	0.145	0.0	nan	nan	0	1
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG01051	0.613	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG01112	0.759	0.799	0.0	0.0	0.522	0.552	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG01500	0.85	0.894	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG01565	0.363	0.382	0.138	0.0	0.238	0.238	6	1
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG01583	0.617	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG01595	0.601	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG01879	0.485	0.51	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG02568	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG02922	0.648	0.682	0.0	0.0	0.438	0.408	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG03006	0.0	0.0	0.315	0.0	nan	nan	0	0
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG03052	0.48	0.505	0.0	0.0	0.955	0.954	2	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG03642	0.592	0.623	0.0	0.0	0.636	0.587	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	HG03742	0.726	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA12878	0.638	0.671	0.005	0.0	0.895	0.895	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA18525	0.944	0.993	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA18939	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA19017	0.763	0.804	0.0	0.0	0.68	0.68	3	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA19238	0.767	0.807	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA19239	0.734	0.773	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA19625	0.443	0.466	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA19648	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA20502	0.352	0.37	0.164	0.0	0.25	0.25	6	1
chr1	93291972	93292789	DEL	818	NA20845	0.695	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG00096	0.955	0.955	0.0	0.0	0.889	0.931	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG00268	0.694	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG00419	0.968	0.968	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG00759	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG01051	1.1	1.1	0.0	0.0	0.789	0.74	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG01112	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG01500	1.164	1.164	0.0	0.0	0.903	0.903	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG01565	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG01583	0.838	0.838	0.0	0.0	0.749	0.749	2	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG01595	1.015	1.015	0.0	0.0	0.619	0.619	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG01879	0.82	0.82	0.0	0.0	0.809	0.809	4	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG02568	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG02922	0.972	0.972	0.0	0.004	0.8	0.747	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG03006	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG03052	0.96	0.96	0.0	0.0	0.783	0.739	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG03642	1.029	1.029	0.0	0.0	0.714	0.774	3	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	HG03742	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA12878	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA18525	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA18939	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA19017	0.897	0.897	0.0	0.0	0.586	0.586	1	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA19238	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA19239	0.427	0.427	0.121	0.056	nan	nan	0	1
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA19625	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA19648	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA20502	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	96996364	96997214	DEL	851	NA20845	0.852	0.852	0.0	0.004	0.923	0.869	3	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG00096	1.311	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG00268	1.282	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG00419	1.22	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG00759	1.241	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG01051	1.121	1.089	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG01112	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG01500	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG01565	1.174	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG01583	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG01595	1.14	1.106	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG01879	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG02568	1.044	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG02922	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG03006	0.857	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG03052	1.004	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG03642	1.261	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	HG03742	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA12878	1.275	1.238	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA18525	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA18939	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA19017	0.725	0.704	0.0	0.031	0.279	0.279	1	1
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA19238	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA19239	1.054	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA19625	0.911	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA19648	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA20502	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	97640730	97640828	DEL	99	NA20845	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG00096	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG00268	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG00419	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG00759	1.241	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG01051	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG01112	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG01500	1.071	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG01565	0.854	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG01583	1.282	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG01595	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG01879	0.97	0.906	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG02568	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG02922	1.058	0.989	0.0	0.004	0.5	0.467	1	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG03006	1.267	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG03052	1.113	1.04	0.0	0.0	0.955	0.989	1	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG03642	1.158	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	HG03742	1.09	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA12878	0.913	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA18525	1.104	1.032	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA18939	0.832	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA19017	1.145	1.07	0.0	0.0	0.229	0.229	1	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA19238	1.103	1.031	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA19239	1.001	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA19625	1.094	1.022	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA19648	1.149	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA20502	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99044269	99044759	DEL	491	NA20845	0.516	0.482	0.05	0.045	nan	nan	0	1
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG00096	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG00268	0.855	0.855	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG00419	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG00759	0.61	0.61	0.0	0.0	0.928	0.928	2	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG01051	0.867	0.867	0.0	0.0	0.789	0.842	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG01112	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG01500	1.108	1.108	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG01565	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG01583	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG01595	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG01879	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG02568	1.044	1.044	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG02922	0.972	0.972	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG03006	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG03052	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG03642	0.926	0.926	0.0	0.0	0.632	0.684	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	HG03742	0.868	0.868	0.0	0.0	0.667	0.633	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA12878	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA18525	0.997	0.997	0.0	0.0	0.87	0.833	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA18939	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA19017	0.458	0.458	0.067	0.042	nan	nan	0	1
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA19238	1.245	1.245	0.0	0.0	0.969	0.969	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA19239	0.827	0.827	0.0	0.0	0.795	0.795	4	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA19625	1.198	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA19648	1.097	1.097	0.005	0.002	nan	nan	0	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA20502	1.172	1.172	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr1	99890888	99891651	DEL	764	NA20845	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG00096	0.377	0.397	0.0	0.084	0.833	0.833	1	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG00268	1.044	1.099	0.0	0.0	0.734	0.734	2	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG00419	0.0	0.0	0.08	0.287	nan	nan	0	0
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG00759	0.807	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG01051	0.839	0.883	0.0	0.006	0.906	0.906	2	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG01112	0.308	0.324	0.0	0.106	0.643	0.643	1	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG01500	0.391	0.412	0.022	0.093	nan	nan	0	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG01565	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG01583	0.749	0.789	0.0	0.006	0.809	0.809	2	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG01595	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG01879	0.718	0.756	0.0	0.0	0.892	0.849	2	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG02568	0.864	0.91	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG02922	0.921	0.97	0.0	0.0	0.975	0.975	2	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG03006	0.643	0.677	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG03052	0.42	0.442	0.013	0.071	nan	nan	0	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG03642	0.336	0.353	0.011	0.071	nan	nan	0	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	HG03742	0.755	0.795	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA12878	0.349	0.367	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA18525	0.305	0.321	0.0	0.098	0.714	0.685	1	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA18939	0.696	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA19017	0.675	0.71	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA19238	0.449	0.473	0.0	0.028	0.464	0.464	1	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA19239	0.712	0.749	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA19625	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA19648	0.438	0.461	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA20502	0.568	0.598	0.013	0.065	0.118	0.118	1	1
chr10	100025125	100025464	DEL	340	NA20845	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG00096	0.622	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG00268	0.504	0.607	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG00419	0.467	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG00759	0.435	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG01051	0.538	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG01112	0.558	0.672	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG01500	0.652	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG01565	0.46	0.555	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG01583	0.674	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG01595	0.529	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG01879	0.567	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG02568	0.786	0.947	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG02922	0.702	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG03006	0.738	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG03052	0.53	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG03642	0.645	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	HG03742	0.551	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA12878	0.558	0.672	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA18525	0.7	0.843	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA18939	0.433	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA19017	0.598	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA19238	0.259	0.311	0.0	0.018	0.571	0.571	1	1
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA19239	0.51	0.615	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA19625	0.632	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA19648	0.645	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA20502	0.497	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100205889	100205939	DEL	51	NA20845	0.685	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG00096	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG00268	0.0	0.0	0.019	0.263	nan	nan	0	0
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG00419	0.404	0.425	0.009	0.148	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG00759	0.0	0.0	0.018	0.256	nan	nan	0	0
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG01051	0.839	0.883	0.0	0.002	0.667	0.667	3	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG01112	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG01500	0.466	0.49	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG01565	0.504	0.531	0.006	0.07	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG01583	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG01595	0.444	0.468	0.012	0.054	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG01879	0.813	0.856	0.0	0.0	0.75	0.788	3	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG02568	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG02922	1.031	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG03006	0.416	0.438	0.004	0.094	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG03052	0.972	1.024	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG03642	0.826	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	HG03742	0.408	0.43	0.015	0.057	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA12878	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA18525	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA18939	0.508	0.535	0.046	0.095	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA19017	0.733	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA19238	0.49	0.516	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA19239	1.168	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA19625	0.685	0.721	0.008	0.058	nan	nan	0	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA19648	0.722	0.76	0.008	0.0	0.667	0.711	3	2
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA20502	0.426	0.448	0.0	0.098	0.632	0.632	1	1
chr10	100496977	100497288	DEL	312	NA20845	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG00096	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG00268	0.936	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG00419	1.126	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG00759	0.579	0.61	0.0	0.036	0.5	0.528	1	1
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG01051	1.097	1.154	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG01112	0.865	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG01500	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG01565	0.943	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG01583	0.974	1.026	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG01595	0.36	0.379	0.0	0.021	0.75	0.75	1	1
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG01879	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG02568	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG02922	1.481	1.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG03006	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG03052	1.017	1.07	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG03642	1.343	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	HG03742	1.266	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA12878	1.055	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA18525	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA18939	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA19017	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA19238	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA19239	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA19625	1.001	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA19648	1.238	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA20502	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	101062093	101062152	DEL	60	NA20845	0.891	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG00096	0.585	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG00268	0.666	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG00419	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG00759	0.352	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG01051	0.495	0.495	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG01112	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG01500	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG01565	1.206	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG01583	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG01595	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG01879	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG02568	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG02922	0.79	0.79	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG03006	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG03052	0.818	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG03642	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	HG03742	0.857	0.857	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA12878	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA18525	0.7	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA18939	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA19017	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA19238	0.408	0.408	0.0	0.04	0.679	0.679	1	1
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA19239	0.94	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA19625	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA19648	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA20502	0.781	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	103579341	103579411	DEL	71	NA20845	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG00096	0.434	0.549	0.02	0.09	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG00268	0.306	0.387	0.016	0.099	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG00419	0.361	0.457	0.01	0.089	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG00759	0.662	0.838	0.015	0.209	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG01051	0.194	0.245	0.017	0.088	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG01112	0.654	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG01500	0.838	1.061	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG01565	0.439	0.555	0.019	0.09	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG01583	0.575	0.727	0.021	0.211	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG01595	1.079	1.366	0.015	0.238	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG01879	0.321	0.407	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG02568	0.747	0.945	0.03	0.223	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG02922	0.285	0.361	0.009	0.107	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG03006	0.17	0.216	0.021	0.158	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG03052	0.221	0.28	0.017	0.106	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG03642	0.788	0.997	0.049	0.214	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	HG03742	0.388	0.491	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA12878	0.584	0.739	0.006	0.186	nan	nan	0	0
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA18525	0.341	0.432	0.005	0.077	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA18939	0.357	0.452	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA19017	0.0	0.0	0.016	0.183	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA19238	0.626	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA19239	0.389	0.493	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA19625	0.527	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA19648	0.89	1.126	0.038	0.243	nan	nan	0	1
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA20502	0.402	0.509	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr10	10493409	10493732	DEL	324	NA20845	0.571	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG00096	0.886	0.985	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG00268	0.774	0.86	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG00419	0.935	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG00759	1.076	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG01051	0.731	0.812	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG01112	0.769	0.855	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG01500	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG01565	0.767	0.853	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG01583	0.65	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG01595	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG01879	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG02568	0.354	0.393	0.0	0.024	nan	nan	0	1
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG02922	0.834	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG03006	1.022	1.136	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG03052	0.663	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG03642	0.62	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	HG03742	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA12878	0.959	1.065	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA18525	1.005	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA18939	0.828	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA19017	0.848	0.943	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA19238	0.837	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA19239	1.061	1.179	0.0	0.0	0.805	0.805	1	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA19625	1.132	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA19648	0.413	0.458	0.0	0.022	0.333	0.356	1	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA20502	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	106199833	106199984	DEL	152	NA20845	0.685	0.761	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG00268	0.324	0.324	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG00419	0.0	0.0	0.095	0.22	nan	nan	0	0
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG00759	0.0	0.0	0.025	0.253	nan	nan	0	0
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG01051	0.495	0.495	0.008	0.058	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG01112	0.5	0.5	0.016	0.084	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG01500	0.0	0.0	0.047	0.212	nan	nan	0	0
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG01565	0.636	0.636	0.024	0.075	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG01583	0.4	0.4	0.045	0.116	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG01595	0.36	0.36	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG01879	0.529	0.529	0.004	0.093	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG02568	0.432	0.432	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG02922	0.526	0.526	0.005	0.072	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG03006	0.379	0.379	0.038	0.095	0.737	0.737	1	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG03052	1.105	1.105	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG03642	0.413	0.413	0.035	0.1	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	HG03742	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA12878	0.471	0.471	0.007	0.071	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA18525	0.0	0.0	0.015	0.266	nan	nan	0	0
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.242	nan	nan	0	0
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA19017	0.636	0.636	0.006	0.081	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA19238	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA19239	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA19625	0.606	0.606	0.011	0.098	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA19648	0.438	0.438	0.007	0.087	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA20502	0.544	0.544	0.008	0.071	nan	nan	0	1
chr10	107252997	107253348	DEL	352	NA20845	0.868	0.868	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG00096	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG00268	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG00419	1.359	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG00759	1.573	1.47	0.0	0.0	0.707	0.747	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG01051	1.247	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG01112	1.442	1.348	0.004	0.001	0.5	0.5	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG01500	1.155	1.08	0.0	0.0	0.658	0.658	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG01565	1.513	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG01583	1.049	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG01595	1.206	1.127	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG01879	1.285	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG02568	0.589	0.551	0.043	0.061	0.6	0.6	3	1
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG02922	1.338	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG03006	1.211	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG03052	1.282	1.198	0.0	0.0	1.0	0.944	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG03642	1.42	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	HG03742	1.225	1.145	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA12878	0.889	0.831	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA18525	1.167	1.09	0.0	0.0	0.939	0.9	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA18939	1.166	1.09	0.0	0.0	0.559	0.533	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA19017	1.504	1.405	0.0	0.0	0.542	0.542	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA19238	1.088	1.017	0.0	0.0	0.829	0.829	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA19239	1.142	1.067	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA19625	1.343	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA19648	1.031	0.964	0.0	0.0	0.706	0.662	1	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA20502	1.065	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107698689	107699235	DEL	547	NA20845	1.348	1.259	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG00096	0.0	0.0	0.33	0.197	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG00268	0.0	0.0	0.315	0.202	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG00419	0.0	0.0	0.326	0.2	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG00759	0.0	0.0	0.261	0.176	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG01051	0.452	0.438	0.099	0.063	nan	nan	0	1
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG01112	0.0	0.0	0.321	0.188	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG01500	0.0	0.0	0.229	0.119	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG01565	0.0	0.0	0.262	0.191	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG01583	0.0	0.0	0.365	0.212	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG01595	0.0	0.0	0.236	0.154	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG01879	0.567	0.551	0.079	0.064	nan	nan	0	1
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG02568	0.864	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG02922	0.0	0.0	0.276	0.159	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG03006	0.416	0.404	0.096	0.075	nan	nan	0	1
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG03052	1.171	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG03642	0.594	0.577	0.077	0.042	nan	nan	0	1
chr10	107950652	107951600	DEL	949	HG03742	0.388	0.377	0.062	0.051	nan	nan	0	1
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA12878	0.0	0.0	0.281	0.181	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA18525	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA18939	0.0	0.0	0.249	0.16	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA19017	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA19238	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA19239	0.551	0.535	0.134	0.056	nan	nan	0	1
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA19625	0.579	0.563	0.073	0.059	nan	nan	0	1
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA19648	0.0	0.0	0.325	0.166	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA20502	0.0	0.0	0.332	0.179	nan	nan	0	0
chr10	107950652	107951600	DEL	949	NA20845	0.0	0.0	0.312	0.158	nan	nan	0	0
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG00096	1.075	1.075	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG00268	1.242	1.242	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG00419	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG00759	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG01051	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG01112	1.0	1.0	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG01500	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG01565	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG01583	0.375	0.375	0.051	0.0	0.333	0.333	3	1
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG01595	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG01879	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG02568	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG02922	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG03006	1.117	1.117	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG03052	1.017	1.017	0.0	0.0	0.5	0.529	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG03642	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	HG03742	0.919	0.919	0.0	0.003	0.812	0.812	2	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA12878	0.941	0.941	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA18525	0.987	0.987	0.0	0.0	0.913	0.953	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA18939	0.922	0.922	0.007	0.001	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA19017	0.983	0.983	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA19238	1.088	1.088	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA19239	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA19625	1.08	1.08	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA19648	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA20502	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	111789861	111790821	DEL	961	NA20845	0.959	0.959	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG00096	0.905	1.006	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG00268	0.882	0.98	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG00419	0.722	0.802	0.023	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG00759	1.014	1.127	0.0	0.0	0.826	0.783	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG01051	0.839	0.932	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG01112	0.904	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG01500	0.913	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG01565	0.965	1.072	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG01583	0.999	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG01595	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG01879	1.04	1.155	0.0	0.0	0.741	0.778	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG02568	1.139	1.266	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG02922	0.79	0.877	0.006	0.0	0.818	0.818	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG03006	0.946	1.051	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG03052	1.238	1.375	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG03642	0.723	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	HG03742	0.857	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA12878	0.837	0.93	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA18525	1.005	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA18939	0.733	0.815	0.0	0.0	0.71	0.718	2	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA19017	0.887	0.985	0.005	0.004	0.95	0.95	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA19238	0.952	1.058	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA19239	0.994	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA19648	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA20502	0.946	1.051	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr10	1125089	1125389	DUP	301	NA20845	0.982	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG00096	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG00268	0.432	0.455	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG00419	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG00759	1.345	1.416	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG01051	0.968	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG01112	1.077	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG01500	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG01565	0.548	0.577	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG01583	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG01595	0.635	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG01879	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG02568	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG02922	1.097	1.154	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG03006	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG03052	1.26	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG03642	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	HG03742	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA12878	0.994	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA18525	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA18939	0.903	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA19017	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA19238	0.966	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA19239	0.94	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA19625	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA19648	1.573	1.656	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA20502	1.23	1.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	11484966	11485147	DEL	182	NA20845	0.777	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG00096	0.566	0.549	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG00268	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG00419	0.573	0.557	0.083	0.081	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG00759	0.703	0.683	0.007	0.103	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG01051	1.118	1.085	0.0	0.0	0.52	0.52	1	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG01112	0.5	0.485	0.014	0.086	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG01500	1.192	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG01565	0.636	0.617	0.043	0.158	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG01583	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG01595	0.719	0.698	0.026	0.064	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG01879	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG02568	0.511	0.496	0.034	0.069	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG02922	0.636	0.618	0.024	0.094	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG03006	0.625	0.606	0.037	0.108	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG03052	0.928	0.901	0.0	0.0	0.938	0.885	1	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG03642	0.749	0.727	0.007	0.073	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	HG03742	0.572	0.555	0.04	0.06	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA12878	0.575	0.559	0.004	0.087	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA18525	0.556	0.54	0.007	0.084	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA18939	1.128	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA19017	0.617	0.599	0.02	0.141	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA19238	0.585	0.568	0.012	0.096	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA19239	0.564	0.548	0.011	0.098	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA19625	0.658	0.639	0.05	0.095	nan	nan	0	1
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA19648	1.186	1.152	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA20502	0.0	0.0	0.09	0.217	nan	nan	0	0
chr10	117711613	117711999	DEL	387	NA20845	1.188	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG00096	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG00268	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG00759	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG01051	0.43	0.43	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG01112	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG01500	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG01565	0.702	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG01583	0.724	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG01595	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG01879	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG02568	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG02922	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG03006	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG03052	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG03642	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	HG03742	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA12878	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA18525	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA18939	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA19017	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA19238	0.694	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA19239	0.672	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA19625	0.869	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA19648	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA20502	0.781	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	117924820	117924941	DEL	122	NA20845	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG00096	0.377	0.397	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG00268	0.54	0.569	0.011	0.05	nan	nan	0	1
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG00419	0.404	0.425	0.025	0.054	nan	nan	0	1
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG00759	0.703	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG01051	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG01112	0.0	0.0	0.035	0.156	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG01500	0.466	0.49	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG01565	0.745	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG01583	0.0	0.0	0.024	0.074	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG01595	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG01879	0.0	0.0	0.041	0.163	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG02568	0.196	0.207	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG03006	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG03052	0.0	0.0	0.024	0.151	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG03642	0.594	0.625	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr10	122701143	122701437	DEL	295	HG03742	0.347	0.365	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA12878	0.0	0.0	0.006	0.136	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA18525	0.915	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA18939	0.846	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA19017	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA19238	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA19239	0.0	0.0	0.003	0.148	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA19625	0.0	0.0	0.006	0.118	nan	nan	0	0
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA19648	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA20502	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	122701143	122701437	DEL	295	NA20845	0.525	0.553	0.015	0.064	nan	nan	0	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG00096	0.339	0.357	0.006	0.042	nan	nan	0	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG00268	0.0	0.0	0.032	0.121	nan	nan	0	0
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG00419	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG00759	0.455	0.479	0.006	0.041	0.2	0.211	1	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG01051	0.731	0.77	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG01112	0.327	0.344	0.0	0.06	0.844	0.844	2	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG01500	0.354	0.373	0.026	0.07	0.699	0.699	2	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG01565	0.658	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG01583	0.749	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG01595	0.571	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG01879	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG02568	0.432	0.455	0.018	0.072	nan	nan	0	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG02922	0.351	0.369	0.023	0.038	nan	nan	0	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG03006	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG03052	0.884	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG03642	0.491	0.516	0.017	0.074	nan	nan	0	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	HG03742	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA12878	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA18525	1.005	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA18939	0.489	0.515	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA19017	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA19238	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA19239	0.376	0.396	0.006	0.046	0.865	0.865	2	1
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA19625	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA19648	1.031	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA20502	0.994	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	124216824	124217266	DEL	443	NA20845	0.0	0.0	0.049	0.098	nan	nan	0	0
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG00096	0.0	0.0	0.016	0.162	nan	nan	0	0
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG00268	0.0	0.0	0.031	0.129	nan	nan	0	0
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG00419	1.041	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG00759	0.248	0.276	0.016	0.054	0.25	0.264	4	1
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG01051	0.516	0.573	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG01112	0.288	0.32	0.015	0.061	nan	nan	0	1
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG01500	0.764	0.849	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG01565	0.504	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG01583	0.749	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG01595	0.317	0.353	0.007	0.053	nan	nan	0	1
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG01879	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG02568	0.55	0.611	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG02922	0.921	1.024	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG03006	0.681	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG03052	0.796	0.884	0.0	0.0	0.7	0.741	1	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG03642	0.852	0.947	0.0	0.0	0.958	0.958	2	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	HG03742	0.306	0.34	0.009	0.044	nan	nan	0	1
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA12878	0.0	0.0	0.025	0.152	nan	nan	0	0
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA18525	0.754	0.838	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA18939	0.658	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA19017	0.79	0.878	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA19238	0.83	0.922	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA19239	0.752	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA19625	0.421	0.468	0.007	0.045	nan	nan	0	1
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA19648	0.0	0.0	0.08	0.178	nan	nan	0	0
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA20502	0.379	0.421	0.014	0.094	0.283	0.283	6	1
chr10	12596183	12596570	DEL	388	NA20845	0.777	0.863	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG00096	0.717	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG00268	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG00419	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG00759	0.662	0.662	0.056	0.028	nan	nan	0	1
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG01051	0.667	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG01112	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG01500	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG01565	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG01583	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG01595	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG01879	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG02568	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG02922	0.526	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG03006	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG03052	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG03642	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	HG03742	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA12878	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA18525	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA18939	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA19017	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA19238	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA19239	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA19625	0.869	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA19648	1.135	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA20502	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	126129380	126129922	DEL	543	NA20845	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG00096	0.736	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG00268	0.846	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG00419	0.786	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG00759	1.117	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG01051	0.624	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG01112	1.0	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG01500	0.838	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG01565	0.943	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG01583	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG01595	0.571	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG01879	0.775	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG02568	0.354	0.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG02922	0.351	0.39	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG03006	0.265	0.294	0.0	0.059	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG03052	0.442	0.491	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG03642	0.542	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	HG03742	0.735	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA12878	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA18525	1.158	1.286	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA18939	0.376	0.418	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA19017	0.578	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA19238	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA19239	0.631	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA19625	0.579	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA19648	0.413	0.458	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA20502	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	127300790	127300925	DEL	136	NA20845	0.959	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG00096	0.773	0.773	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG00268	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG00419	0.361	0.361	0.0	0.043	0.737	0.737	1	1
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG00759	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG01051	0.387	0.387	0.0	0.023	0.727	0.727	1	1
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG01112	0.769	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG01500	0.429	0.429	0.0	0.05	0.796	0.796	2	1
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG01565	0.57	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG01583	0.974	0.974	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG01595	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG01879	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG02568	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG02922	0.746	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG03006	0.643	0.643	0.0	0.022	0.316	0.316	1	1
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG03052	0.619	0.619	0.0	0.0	0.8	0.847	1	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG03642	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	HG03742	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA12878	0.994	0.994	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA18525	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA18939	0.715	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA19017	0.578	0.578	0.008	0.033	0.324	0.324	1	1
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA19238	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA19239	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA19625	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA19648	0.258	0.258	0.0	0.023	0.798	0.748	2	1
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA20502	0.355	0.355	0.0	0.051	0.9	0.9	1	1
chr10	129021039	129021119	DEL	81	NA20845	0.343	0.343	0.0	0.059	0.643	0.643	1	1
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG00096	0.622	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG00268	0.558	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG00419	0.743	0.783	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG00759	0.703	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG01051	0.688	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG01112	0.75	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG01500	0.634	0.667	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG01565	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG01583	1.024	1.078	0.0	0.0	0.586	0.586	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG01595	0.762	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG01879	0.473	0.497	0.0	0.0	0.417	0.438	3	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG02922	0.702	0.739	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG03006	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG03052	0.928	0.977	0.0	0.0	0.706	0.722	3	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG03642	0.645	0.679	0.0	0.0	0.896	0.9	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	HG03742	0.612	0.645	0.0	0.0	0.831	0.831	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA12878	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA18525	0.772	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA18939	1.053	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA19017	0.983	1.035	0.0	0.004	0.769	0.769	3	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA19238	0.884	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA19239	0.645	0.679	0.0	0.0	0.783	0.783	3	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA19625	0.737	0.776	0.0	0.0	0.821	0.821	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA19648	0.928	0.977	0.0	0.0	0.799	0.803	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA20502	0.923	0.971	0.0	0.0	0.946	0.946	2	2
chr10	129120559	129120694	DUP	136	NA20845	0.617	0.649	0.0	0.0	0.839	0.839	2	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG00096	0.604	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG00268	0.486	0.559	0.0	0.021	0.806	0.806	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG00419	0.786	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG00759	0.29	0.333	0.0	0.058	0.5	0.474	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG01051	0.774	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG01112	0.788	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG01500	0.391	0.45	0.0	0.013	0.81	0.81	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG01565	0.307	0.353	0.0	0.028	0.5	0.5	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG01583	1.124	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG01595	0.275	0.316	0.0	0.028	0.636	0.636	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG01879	0.378	0.435	0.0	0.025	0.625	0.656	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG02568	0.864	0.994	0.0	0.012	1.0	1.0	1	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG02922	0.746	0.857	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG03006	0.397	0.457	0.0	0.015	0.684	0.684	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG03052	0.663	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG03642	0.336	0.386	0.0	0.007	0.733	0.794	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	HG03742	0.184	0.211	0.0	0.029	0.45	0.45	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA12878	0.68	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA18525	0.79	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA18939	0.527	0.605	0.0	0.005	0.438	0.458	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA19017	0.925	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA19238	0.463	0.532	0.0	0.018	0.583	0.583	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA19239	0.483	0.556	0.0	0.018	0.763	0.763	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA19625	0.579	0.666	0.0	0.028	0.435	0.435	1	1
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA19648	1.057	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA20502	0.71	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130162293	130162344	DEL	52	NA20845	0.32	0.368	0.0	0.055	0.75	0.75	1	1
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG00096	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG00268	0.36	0.36	0.026	0.11	nan	nan	0	1
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	0.905	0.905	2	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG00759	0.6	0.6	0.02	0.092	nan	nan	0	1
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG01051	0.71	0.71	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG01112	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG01500	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG01565	0.0	0.0	0.112	0.299	nan	nan	0	0
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG01583	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG01595	1.312	1.312	0.0	0.0	0.957	0.957	2	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG01879	1.115	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG02568	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG02922	0.834	0.834	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG03006	1.192	1.192	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG03052	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG03642	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	HG03742	0.612	0.612	0.017	0.12	nan	nan	0	1
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA12878	0.976	0.976	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA18525	0.413	0.413	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA18939	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA19017	1.157	1.157	0.0	0.0	0.781	0.781	3	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA19238	1.061	1.061	0.0	0.0	0.956	0.956	1	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA19239	1.101	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA19625	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA19648	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA20502	0.379	0.379	0.029	0.091	nan	nan	0	1
chr10	130836867	130837271	DEL	405	NA20845	0.388	0.388	0.033	0.096	0.556	0.556	1	1
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG00096	0.962	0.962	0.0	0.0	0.935	0.935	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG00268	0.558	0.558	0.08	0.033	nan	nan	0	1
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG00419	0.892	0.892	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG00759	1.014	1.014	0.0	0.0	0.95	0.997	1	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG01051	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG01112	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG01500	1.062	1.062	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG01565	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG01583	0.999	0.999	0.0	0.0	0.824	0.824	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG01595	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG01879	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG02568	0.707	0.707	0.0	0.0	0.909	0.909	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG02922	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG03006	1.079	1.079	0.0	0.0	0.735	0.735	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG03052	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG03642	1.136	1.136	0.0	0.0	0.357	0.33	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	HG03742	0.939	0.939	0.0	0.0	0.71	0.71	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA12878	1.168	1.168	0.0	0.0	0.804	0.804	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA18525	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA18939	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA19017	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA19238	1.129	1.129	0.0	0.0	0.977	0.977	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA19239	1.142	1.142	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA19625	1.159	1.159	0.0	0.0	0.667	0.667	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA19648	1.006	1.006	0.0	0.0	0.761	0.729	4	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA20502	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131416108	131417053	DEL	946	NA20845	1.005	1.005	0.0	0.0	0.489	0.489	4	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG00096	0.472	0.568	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.216	nan	nan	0	0
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG00419	0.552	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG00759	0.31	0.374	0.008	0.107	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG01051	0.43	0.518	0.007	0.067	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG01112	0.173	0.208	0.008	0.08	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG01500	0.727	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG01565	0.263	0.317	0.008	0.079	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG01583	0.375	0.451	0.006	0.036	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG01595	0.169	0.204	0.029	0.116	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG01879	0.454	0.547	0.006	0.092	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG02568	1.022	1.231	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG02922	0.307	0.37	0.013	0.093	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG03006	0.0	0.0	0.01	0.193	nan	nan	0	0
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG03052	0.0	0.0	0.021	0.208	nan	nan	0	0
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG03642	0.232	0.28	0.009	0.069	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	HG03742	0.0	0.0	0.045	0.192	nan	nan	0	0
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA12878	0.68	0.819	0.0	0.004	0.47	0.47	2	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA18525	0.718	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA18939	0.583	0.702	0.0	0.0	0.337	0.321	2	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA19017	0.54	0.65	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA19238	0.476	0.574	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA19239	0.833	1.003	0.0	0.0	0.968	0.968	3	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA19625	0.211	0.254	0.02	0.088	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA19648	0.645	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA20502	0.284	0.342	0.009	0.101	nan	nan	0	1
chr10	131595173	131595473	DEL	301	NA20845	0.251	0.303	0.013	0.067	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG00096	0.472	0.496	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG00268	0.774	0.815	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG00419	0.797	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG00759	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG01051	0.323	0.339	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG01112	0.269	0.283	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG01500	0.447	0.471	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG01565	0.406	0.427	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG01583	1.149	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG01595	0.36	0.379	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG01879	0.397	0.418	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG02568	0.472	0.496	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG02922	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG03006	0.984	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG03052	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG03642	1.059	1.114	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	HG03742	0.286	0.301	0.012	0.117	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA12878	0.436	0.459	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	0
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA18939	0.545	0.574	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA19017	0.559	0.589	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA19238	0.483	0.508	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA19625	0.658	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA20502	0.591	0.623	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr10	132372179	132372324	DEL	146	NA20845	0.32	0.337	0.0	0.068	0.455	0.455	3	1
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG00096	0.622	0.715	0.0	0.0	0.917	0.917	3	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG00268	0.576	0.662	0.0	0.0	0.4	0.4	4	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG00419	0.828	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG00759	0.641	0.737	0.006	0.0	0.555	0.555	2	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG01051	0.581	0.667	0.0	0.0	0.8	0.8	5	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG01112	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG01500	0.652	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG01565	0.658	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG01583	0.849	0.976	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG01595	0.444	0.511	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG01879	0.284	0.326	0.093	0.052	0.235	0.247	3	1
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG02568	1.022	1.174	0.0	0.0	0.785	0.785	2	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG02922	0.658	0.756	0.0	0.0	0.371	0.371	2	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG03006	0.643	0.74	0.0	0.0	0.857	0.857	5	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG03052	0.641	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG03642	0.723	0.831	0.0	0.0	0.462	0.5	3	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	HG03742	0.572	0.657	0.0	0.0	0.709	0.709	2	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA12878	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA18525	0.826	0.949	0.0	0.0	0.778	0.812	5	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA18939	0.545	0.627	0.0	0.0	0.923	0.881	2	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA19017	0.771	0.886	0.0	0.0	0.588	0.588	3	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA19238	0.653	0.751	0.0	0.0	0.825	0.825	2	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA19239	0.591	0.679	0.0	0.0	0.862	0.862	3	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA19625	0.764	0.878	0.0	0.0	0.785	0.785	4	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA19648	0.928	1.067	0.0	0.0	0.673	0.709	4	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA20502	0.686	0.789	0.0	0.0	0.634	0.634	6	2
chr10	13275313	13276286	DEL	974	NA20845	0.708	0.814	0.0	0.0	0.753	0.753	4	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG00096	1.113	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG00268	0.846	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG00419	0.467	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG00759	0.6	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG01051	0.452	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG01112	0.577	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG01500	0.447	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG01583	0.699	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG01595	0.55	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG01879	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG02568	0.943	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG02922	0.768	0.882	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG03006	0.681	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG03052	0.552	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG03642	0.361	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	HG03742	0.469	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA12878	0.662	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA18525	0.844	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA18939	0.828	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA19017	0.713	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA19238	0.626	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA19239	0.873	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA19625	0.579	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA19648	0.825	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA20502	0.686	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134354496	134354612	DUP	117	NA20845	0.48	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG00096	0.905	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG00268	0.36	0.434	0.0	0.017	0.925	0.925	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG00419	0.722	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG00759	0.331	0.399	0.0	0.016	0.804	0.848	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG01051	0.366	0.44	0.0	0.023	0.9	0.9	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG01112	0.596	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG01500	0.634	0.763	0.0	0.012	0.814	0.814	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG01583	0.799	0.963	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG01595	0.317	0.382	0.0	0.0	0.335	0.335	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG01879	0.52	0.626	0.0	0.01	0.501	0.526	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG02922	0.329	0.396	0.0	0.011	0.722	0.722	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG03006	0.833	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG03052	0.796	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG03642	0.852	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	HG03742	0.572	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA12878	1.046	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA18525	0.359	0.433	0.0	0.027	0.707	0.738	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA18939	0.545	0.657	0.0	0.011	0.464	0.486	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA19239	0.457	0.55	0.0	0.019	0.97	0.97	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA19625	0.711	0.857	0.0	0.008	0.49	0.49	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA19648	0.387	0.466	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA20502	0.379	0.456	0.0	0.027	0.847	0.847	2	1
chr10	134965041	134965092	DEL	52	NA20845	0.708	0.853	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG00096	1.264	1.264	0.0	0.0	0.821	0.821	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG00268	1.062	1.062	0.0	0.003	0.583	0.583	3	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG00419	1.062	1.062	0.0	0.002	0.739	0.739	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG00759	1.117	1.117	0.0	0.0	1.0	0.947	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG01051	0.968	0.968	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG01112	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG01500	1.081	1.081	0.006	0.0	0.5	0.5	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG01565	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG01583	1.099	1.099	0.004	0.0	0.8	0.8	3	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG01595	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG01879	1.115	1.115	0.0	0.001	0.767	0.735	3	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG02568	0.864	0.864	0.0	0.007	0.167	0.167	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG02922	1.031	1.031	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG03006	0.984	0.984	0.0	0.0	0.847	0.847	2	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG03052	0.95	0.95	0.0	0.0	0.536	0.567	2	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG03642	0.93	0.93	0.0	0.0	0.5	0.542	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	HG03742	0.898	0.898	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA12878	0.837	0.837	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA18525	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA18939	0.978	0.978	0.0	0.0	0.614	0.625	2	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA19017	0.983	0.983	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA19238	1.061	1.061	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA19239	0.631	0.631	0.088	0.0	nan	nan	0	1
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA19625	0.922	0.922	0.0	0.0	0.554	0.554	2	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA19648	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA20502	1.041	1.041	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr10	13717586	13718458	DEL	873	NA20845	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG00096	0.641	0.599	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG00419	1.338	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG00759	0.724	0.677	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG01051	1.032	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG01112	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG01500	0.559	0.522	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG01565	1.03	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG01583	0.575	0.537	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG01595	0.741	0.692	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.148	nan	nan	0	0
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG02568	0.825	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG02922	1.228	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG03006	0.606	0.566	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG03052	1.017	0.95	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG03642	1.11	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	HG03742	0.531	0.496	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA12878	0.61	0.57	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA18525	0.485	0.453	0.007	0.091	nan	nan	0	1
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA18939	1.298	1.213	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA19017	1.041	0.973	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA19238	1.361	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA19239	1.108	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA19625	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA19648	0.774	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA20502	1.348	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	1537791	1537898	DEL	108	NA20845	1.005	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG00096	0.245	0.258	0.064	0.055	0.5	0.5	3	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG00268	0.252	0.265	0.051	0.051	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG00419	0.0	0.0	0.171	0.161	nan	nan	0	0
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG00759	0.29	0.305	0.075	0.059	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG01051	0.387	0.407	0.065	0.058	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG01112	0.346	0.364	0.048	0.06	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG01500	0.391	0.412	0.046	0.044	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG01565	0.329	0.346	0.064	0.06	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG01583	0.0	0.0	0.167	0.087	nan	nan	0	0
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG01595	0.423	0.445	0.04	0.04	0.353	0.353	1	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG01879	0.397	0.418	0.021	0.043	0.55	0.578	1	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG02568	0.314	0.331	0.035	0.04	0.5	0.5	1	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG02922	0.197	0.208	0.054	0.062	0.273	0.273	1	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG03006	0.265	0.279	0.063	0.063	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG03052	0.552	0.582	0.0	0.0	0.417	0.441	3	2
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG03642	0.284	0.299	0.024	0.04	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	HG03742	0.0	0.0	0.092	0.126	nan	nan	0	0
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA12878	0.0	0.0	0.059	0.143	nan	nan	0	0
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA18525	0.359	0.378	0.014	0.06	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA18939	0.583	0.614	0.0	0.0	0.646	0.616	2	2
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA19017	0.733	0.771	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA19238	0.939	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA19239	0.792	0.834	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA19625	0.29	0.305	0.005	0.044	nan	nan	0	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA19648	0.258	0.271	0.109	0.064	0.6	0.562	1	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA20502	0.379	0.398	0.03	0.057	0.409	0.409	1	1
chr10	18503073	18503589	DEL	517	NA20845	0.0	0.0	0.141	0.124	nan	nan	0	0
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG00096	1.528	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG00268	1.188	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG00419	1.105	1.013	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG01051	1.183	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG01112	0.865	0.794	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG01500	1.248	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG01565	1.294	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG01583	1.049	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG01595	1.312	1.204	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG01879	1.361	1.249	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG02568	1.061	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG02922	1.228	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG03006	1.363	1.25	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG03052	1.039	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG03642	1.11	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	HG03742	0.755	0.693	0.0	0.073	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA12878	0.889	0.816	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA18525	1.239	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA19238	1.197	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA19239	0.967	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA19625	1.29	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA19648	1.521	1.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA20502	1.254	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	20824450	20824567	DUP	118	NA20845	1.348	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG00096	1.037	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG00268	1.386	1.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG00419	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG00759	0.972	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG01051	0.925	0.973	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG01112	1.115	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG01500	1.155	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG01565	1.206	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG01583	1.249	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG01595	1.185	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG01879	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG02568	1.179	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG02922	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG03006	0.625	0.657	0.0	0.067	0.487	0.487	1	1
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG03052	1.392	1.466	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG03642	1.162	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	HG03742	0.98	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA12878	0.976	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA18525	1.203	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA18939	1.241	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA19017	0.733	0.771	0.0	0.004	0.7	0.7	1	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA19238	1.211	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA19239	1.115	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA19625	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA19648	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA20502	1.396	1.469	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	21420573	21420668	DEL	96	NA20845	1.142	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG00096	1.018	1.072	0.0	0.0	0.881	0.881	2	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG00268	1.08	1.137	0.004	0.0	0.702	0.702	2	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG00419	0.998	1.051	0.0	0.0	0.719	0.719	1	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG00759	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG01051	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG01112	0.827	0.87	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG01500	0.894	0.941	0.0	0.0	0.68	0.68	7	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG01565	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG01583	1.049	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG01595	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG01879	0.851	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG02568	0.864	0.91	0.0	0.0	0.464	0.464	2	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG02922	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG03006	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG03052	0.442	0.465	0.082	0.054	nan	nan	0	1
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG03642	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	HG03742	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA12878	0.889	0.936	0.0	0.0	0.857	0.857	5	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA18525	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA18939	0.809	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA19017	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA19238	0.803	0.845	0.0	0.0	0.88	0.88	8	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA19239	0.9	0.947	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA19625	1.001	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA19648	0.928	0.977	0.0	0.0	0.727	0.762	5	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA20502	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	22868693	22869571	DEL	879	NA20845	0.914	0.962	0.0	0.0	0.732	0.732	2	2
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG00096	0.547	0.547	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG00419	0.0	0.0	0.008	0.159	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.107	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG01500	0.0	0.0	0.005	0.145	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG01583	0.525	0.525	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG01595	0.402	0.402	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG02568	0.668	0.668	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG02922	0.461	0.461	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG03642	0.542	0.542	0.01	0.077	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	HG03742	0.347	0.347	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA12878	0.558	0.558	0.0	0.082	0.36	0.36	1	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA19238	0.612	0.612	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA19239	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA19625	0.448	0.448	0.01	0.073	0.762	0.762	2	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA20502	0.544	0.544	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr10	23635492	23635621	DEL	130	NA20845	0.594	0.594	0.007	0.085	0.368	0.368	1	1
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG00096	0.773	0.814	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG00268	1.188	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG00419	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG00759	0.952	1.002	0.0	0.0	0.833	0.789	1	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG01051	0.903	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG01112	0.788	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG01500	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG01565	1.009	1.062	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG01583	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG01595	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG01879	0.945	0.995	0.0	0.0	0.85	0.893	1	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG02568	0.943	0.993	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG02922	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG03006	0.965	1.016	0.0	0.0	0.577	0.577	1	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG03052	0.0	0.0	0.111	0.121	nan	nan	0	0
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG03642	1.11	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	HG03742	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA12878	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA18525	1.059	1.115	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA18939	0.94	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA19017	0.983	1.035	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA19238	0.626	0.659	0.019	0.032	0.138	0.138	6	1
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA19239	1.074	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA19625	0.0	0.0	0.205	0.163	nan	nan	0	0
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA19648	0.98	1.031	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA20502	1.088	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	25638274	25638854	DEL	581	NA20845	0.937	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG00096	0.698	0.64	0.0	0.047	0.8	0.8	2	1
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG00268	0.882	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG00419	1.317	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG00759	1.055	0.968	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG01112	0.865	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG01500	0.578	0.53	0.0	0.031	0.59	0.59	2	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG01565	0.943	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG01583	1.149	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG01595	0.571	0.524	0.0	0.049	0.748	0.748	2	1
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG01879	0.624	0.572	0.0	0.053	0.388	0.407	2	1
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.101	nan	nan	0	0
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG02922	1.206	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG03006	0.662	0.608	0.0	0.036	0.553	0.553	2	1
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG03052	0.729	0.669	0.0	0.044	0.816	0.77	2	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG03642	0.749	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	HG03742	1.102	1.011	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA12878	1.116	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA18525	1.364	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA18939	0.733	0.673	0.0	0.031	0.519	0.543	2	1
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA19017	0.675	0.619	0.0	0.053	0.917	0.917	2	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA19238	0.707	0.649	0.0	0.025	0.738	0.738	2	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA19239	1.249	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA19625	1.343	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA19648	0.516	0.473	0.0	0.044	0.863	0.921	2	2
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA20502	0.71	0.651	0.0	0.026	0.459	0.459	2	1
chr10	26185093	26185161	DEL	69	NA20845	0.662	0.608	0.0	0.056	0.525	0.525	2	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG00096	0.509	0.566	0.019	0.197	nan	nan	0	0
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG00268	0.36	0.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG00419	0.255	0.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG00759	0.207	0.23	0.017	0.073	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG01051	0.387	0.43	0.0	0.002	0.667	0.667	1	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG01112	0.269	0.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG01500	0.559	0.621	0.0	0.0	0.528	0.528	2	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG01565	0.373	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG01583	0.25	0.278	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG01595	0.402	0.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG01879	0.189	0.21	0.0	0.0	0.667	0.635	1	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG02568	0.0	0.0	0.063	0.225	nan	nan	0	0
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG02922	0.066	0.073	0.012	0.107	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG03006	0.284	0.315	0.0	0.0	0.586	0.586	2	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG03052	0.221	0.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG03642	0.413	0.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	HG03742	0.286	0.318	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA12878	0.453	0.504	0.008	0.173	nan	nan	0	0
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA18525	0.431	0.479	0.005	0.065	nan	nan	0	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA18939	0.263	0.293	0.0	0.0	0.417	0.398	2	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA19017	0.154	0.171	0.0	0.145	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA19238	0.163	0.181	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA19239	0.416	0.463	0.005	0.002	0.867	0.867	1	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA19625	0.369	0.41	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA19648	0.077	0.086	0.013	0.092	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA20502	0.52	0.578	0.02	0.212	nan	nan	0	1
chr10	26354751	26355068	DEL	318	NA20845	0.32	0.355	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG00096	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG00268	0.594	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG00419	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG00759	0.972	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG01051	0.753	0.792	0.0	0.003	0.5	0.5	1	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG01112	0.673	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG01500	0.969	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG01565	0.373	0.392	0.007	0.089	0.429	0.429	1	1
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG01583	0.999	1.052	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG01595	0.656	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG01879	0.643	0.677	0.0	0.002	0.7	0.667	1	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG02568	0.904	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG02922	0.658	0.693	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG03006	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG03052	1.017	1.07	0.0	0.0	0.826	0.78	1	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG03642	0.93	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	HG03742	0.469	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA12878	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA18525	0.485	0.51	0.005	0.063	0.267	0.278	2	1
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA18939	0.828	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA19017	1.137	1.197	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA19238	0.776	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA19239	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA19625	0.711	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA19648	1.238	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA20502	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29110846	29111176	DEL	331	NA20845	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG00096	0.792	0.834	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG00268	0.414	0.436	0.031	0.024	nan	nan	0	1
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG00419	0.85	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG00759	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG01051	0.925	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG01112	0.519	0.546	0.037	0.028	nan	nan	0	1
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG01500	1.062	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG01565	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG01583	0.899	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG01595	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG01879	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG02568	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG02922	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG03006	0.833	0.877	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG03052	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG03642	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	HG03742	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA12878	0.436	0.459	0.019	0.031	nan	nan	0	1
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA18525	0.933	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA18939	0.715	0.752	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA19017	0.694	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA19238	0.571	0.602	0.042	0.04	nan	nan	0	1
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA19239	1.021	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA19625	0.711	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA19648	1.031	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA20502	0.828	0.872	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29742213	29742935	DEL	723	NA20845	0.822	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG00419	0.722	0.76	0.0	0.031	0.462	0.462	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG00759	1.066	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG01112	0.25	0.263	0.0	0.017	0.652	0.652	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG01565	0.789	0.831	0.0	0.046	0.417	0.417	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG01583	1.074	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG01595	1.079	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG02568	1.061	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG02922	0.548	0.577	0.0	0.042	0.619	0.619	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG03006	0.918	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG03052	0.354	0.372	0.0	0.048	0.654	0.692	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG03642	0.516	0.544	0.0	0.037	0.5	0.462	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	HG03742	0.551	0.58	0.0	0.06	0.59	0.59	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA12878	0.349	0.367	0.0	0.025	0.92	0.92	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA18525	0.449	0.472	0.0	0.053	0.784	0.751	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA18939	0.527	0.554	0.0	0.033	0.903	0.946	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA19017	0.559	0.589	0.0	0.023	0.903	0.903	1	1
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA19625	0.974	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA19648	1.341	1.411	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr10	29883209	29883264	DEL	56	NA20845	0.708	0.745	0.0	0.032	0.895	0.895	1	1
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG00096	0.679	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG00268	0.522	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG00419	0.51	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG00759	0.579	0.644	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG01051	0.581	0.645	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG01112	0.769	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG01500	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG01565	0.526	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG01583	0.999	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG01595	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG01879	0.87	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG02568	0.943	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG02922	0.526	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG03006	0.852	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG03052	0.663	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG03642	1.084	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	HG03742	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA12878	0.697	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA18525	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA18939	0.451	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA19017	1.022	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA19238	0.599	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA19239	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA19625	0.922	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA19648	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA20502	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29900004	29900066	DEL	63	NA20845	0.32	0.355	0.0	0.029	0.857	0.857	1	1
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG00096	0.566	0.596	0.0	0.013	nan	nan	0	1
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG00268	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG00419	0.786	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG00759	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG01051	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG01112	0.865	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG01500	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG01565	0.46	0.485	0.049	0.116	nan	nan	0	1
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG01583	0.55	0.579	0.023	0.083	nan	nan	0	1
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG01595	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG01879	0.548	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG02568	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG02922	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG03006	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG03052	0.862	0.907	0.0	0.0	0.882	0.934	1	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG03642	0.904	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	HG03742	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA12878	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA18525	0.915	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA18939	0.677	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA19017	1.022	1.076	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA19238	0.857	0.902	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA19239	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA19625	0.158	0.166	0.066	0.123	nan	nan	0	1
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA19648	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA20502	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29918527	29918997	DEL	471	NA20845	0.525	0.553	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG00096	1.245	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG00268	1.224	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG00419	0.786	0.714	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG00759	0.683	0.621	0.007	0.075	nan	nan	0	1
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG01051	1.376	1.251	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG01112	1.192	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG01500	1.062	0.965	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG01565	1.316	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG01583	1.249	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG01595	1.375	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG01879	1.172	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG02568	1.061	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG02922	1.141	1.037	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG03006	1.117	1.015	0.0	0.0	0.697	0.697	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG03052	1.381	1.256	0.0	0.0	0.875	0.926	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG03642	1.188	1.08	0.0	0.0	0.727	0.788	3	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	HG03742	1.266	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA12878	0.889	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA18525	1.203	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA18939	1.58	1.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA19017	1.272	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA19238	1.075	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA19239	1.128	1.026	0.0	0.0	0.977	0.977	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA19625	1.37	1.245	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA19648	1.238	1.125	0.0	0.0	0.9	0.844	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA20502	1.561	1.419	0.0	0.0	0.605	0.605	1	2
chr10	29943133	29943338	DEL	206	NA20845	1.211	1.101	0.0	0.0	0.591	0.591	3	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG00096	0.736	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG00268	0.792	0.834	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG00419	0.828	0.872	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG00759	0.662	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG01051	0.323	0.339	0.0	0.078	0.471	0.471	1	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG01112	0.788	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG01500	0.429	0.451	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG01565	0.767	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG01583	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG01595	0.487	0.512	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG01879	0.699	0.736	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG02568	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG02922	1.053	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG03006	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG03642	0.826	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	HG03742	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA12878	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA18525	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA18939	0.884	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA19017	1.022	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA19238	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA19239	0.846	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA19625	1.001	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA19648	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA20502	1.017	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	30593536	30593649	DUP	114	NA20845	0.64	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG00096	1.094	1.094	0.0	0.0	0.694	0.694	1	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG00419	0.467	0.467	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG00759	0.497	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG01051	0.452	0.452	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG01112	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG01500	0.41	0.41	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG01565	0.417	0.417	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG01583	0.45	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG01595	1.164	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG01879	1.078	1.078	0.0	0.0	0.828	0.869	1	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG02568	0.904	0.904	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG02922	0.965	0.965	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG03006	0.379	0.379	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG03052	0.762	0.762	0.0	0.0	0.893	0.892	2	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG03642	0.62	0.62	0.0	0.004	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	HG03742	0.5	0.5	0.0	0.007	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA12878	0.436	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA18939	1.034	1.034	0.0	0.0	0.733	0.7	1	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA19017	0.81	0.81	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA19238	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA19239	0.954	0.954	0.0	0.003	0.904	0.904	2	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA19648	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA20502	0.473	0.473	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	31443804	31444139	DEL	336	NA20845	1.074	1.074	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG00096	1.037	1.153	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG00268	0.72	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG00419	1.02	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG00759	0.931	1.035	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG01051	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG01112	0.846	0.94	0.0	0.019	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG01500	0.708	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG01565	1.03	1.145	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG01583	0.999	1.11	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG01595	0.741	0.823	0.0	0.029	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG01879	1.323	1.47	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG02568	0.982	1.091	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG02922	0.219	0.244	0.01	0.09	0.857	0.857	1	1
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG03006	0.908	1.009	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG03052	1.083	1.203	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG03642	0.775	0.861	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	HG03742	0.49	0.544	0.0	0.021	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA12878	0.593	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA18525	0.682	0.758	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA18939	0.884	0.982	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA19017	0.752	0.835	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA19238	0.435	0.484	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA19239	0.927	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA19625	1.29	1.434	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA19648	0.799	0.888	0.0	0.021	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA20502	0.994	1.104	0.0	0.018	nan	nan	0	2
chr10	3210617	3210815	DEL	199	NA20845	0.548	0.609	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG00096	1.113	1.04	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG00268	1.08	1.01	0.005	0.0	0.747	0.747	2	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG00419	1.105	1.032	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG00759	1.304	1.218	0.0	0.0	0.636	0.672	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG01051	1.333	1.246	0.0	0.006	0.857	0.857	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG01112	1.211	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG01500	1.248	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG01565	1.25	1.168	0.0	0.0	0.657	0.657	2	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG01583	1.074	1.004	0.007	0.0	0.727	0.727	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG01595	1.143	1.068	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG01879	1.38	1.29	0.0	0.0	0.8	0.84	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG02568	1.061	0.991	0.0	0.0	0.673	0.673	2	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG02922	1.097	1.025	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG03052	1.304	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG03642	1.394	1.303	0.0	0.0	0.913	0.989	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	HG03742	1.347	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA12878	0.819	0.766	0.0	0.0	0.932	0.932	2	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA18525	1.212	1.132	0.0	0.0	0.875	0.839	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA18939	1.26	1.178	0.0	0.0	0.641	0.672	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA19017	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA19238	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA19239	1.168	1.092	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA19625	1.053	0.985	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA19648	1.212	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA20502	1.041	0.973	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr10	32872723	32873216	DUP	494	NA20845	1.325	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG00096	0.679	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG00268	0.414	0.46	0.0	0.046	1.0	1.0	1	1
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG00419	0.658	0.732	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG00759	0.662	0.736	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG01051	0.473	0.526	0.0	0.029	0.545	0.545	1	1
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG01112	0.731	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG01500	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG01565	0.504	0.56	0.0	0.014	0.318	0.318	1	1
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG01583	0.999	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG01595	0.508	0.564	0.0	0.02	0.407	0.407	1	1
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG01879	0.737	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG02568	0.589	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG02922	0.812	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG03006	0.946	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG03052	0.95	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG03642	0.775	0.861	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	HG03742	0.919	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA12878	1.255	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA18525	0.485	0.539	0.0	0.028	0.677	0.707	1	1
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA18939	0.282	0.313	0.0	0.022	0.882	0.924	1	1
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA19017	0.945	1.05	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA19238	1.163	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA19239	1.061	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA19625	0.895	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA19648	1.122	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA20502	0.946	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	33097530	33097589	DEL	60	NA20845	1.074	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG00096	0.736	0.817	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG00268	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG00419	0.212	0.236	0.0	0.043	0.8	0.8	1	1
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG00759	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG01051	0.71	0.788	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG01112	0.942	1.047	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG01500	0.857	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG01565	0.548	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG01583	1.024	1.138	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG01595	0.91	1.011	0.0	0.0	0.591	0.591	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG01879	0.378	0.42	0.0	0.028	0.474	0.497	1	1
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG02568	1.022	1.135	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG02922	0.746	0.829	0.0	0.009	0.5	0.5	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG03006	0.852	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG03052	0.84	0.933	0.0	0.0	1.0	0.944	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG03642	1.188	1.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	HG03742	0.633	0.703	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA12878	1.011	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA18525	1.239	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA18939	0.752	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA19017	0.79	0.878	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA19238	1.02	1.134	0.0	0.003	0.972	0.972	1	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA19239	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA19625	0.922	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA19648	0.851	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA20502	0.923	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	34017766	34017858	DEL	93	NA20845	0.891	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG00096	0.566	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG00268	0.792	0.88	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG00419	0.786	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG00759	0.579	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG01051	0.817	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG01112	0.731	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG01500	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG01565	0.658	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG01583	0.699	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG01595	0.571	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG01879	0.662	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG02568	0.432	0.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG02922	0.504	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG03006	0.681	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG03052	0.398	0.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG03642	0.826	0.918	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	HG03742	0.694	0.771	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA12878	0.558	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA18525	0.539	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA18939	0.451	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA19017	0.887	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA19238	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA19239	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA19625	0.395	0.439	0.0	0.014	0.417	0.417	1	1
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA19648	0.387	0.43	0.0	0.017	0.556	0.521	1	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA20502	0.189	0.21	0.0	0.019	1.0	1.0	1	2
chr10	35733064	35733118	DEL	55	NA20845	0.822	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG00096	0.415	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG00268	0.684	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG00419	0.807	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG00759	0.476	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG01051	0.301	0.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG01112	0.654	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG01500	0.559	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG01565	0.439	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG01583	0.5	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG01595	0.423	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG01879	0.643	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG02568	0.786	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG02922	0.614	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG03006	0.492	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG03052	0.597	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG03642	0.387	0.49	0.0	0.0	0.455	0.42	1	1
chr10	35780785	35780835	DEL	51	HG03742	0.469	0.594	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA12878	0.802	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA18525	0.592	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA18939	0.696	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA19017	0.655	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA19238	0.776	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA19239	0.967	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA19625	0.869	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA19648	0.413	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA20502	0.615	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	35780785	35780835	DEL	51	NA20845	0.297	0.376	0.0	0.005	1.0	1.0	1	1
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG00096	1.113	1.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG00268	1.224	1.655	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG00419	1.02	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG00759	1.055	1.426	0.0	0.0	0.619	0.586	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG01051	1.032	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG01112	1.192	1.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG01500	1.118	1.511	0.0	0.0	0.69	0.69	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG01583	1.074	1.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG01595	1.037	1.401	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG01879	0.964	1.303	0.0	0.0	0.833	0.875	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG02568	0.943	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG02922	1.075	1.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG03006	0.984	1.33	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG03052	0.928	1.254	0.0	0.0	0.467	0.494	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	HG03742	0.959	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA12878	0.819	1.107	0.0	0.002	0.812	0.812	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA18525	1.257	1.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA18939	1.072	1.449	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA19017	1.311	1.772	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA19238	1.02	1.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA19239	1.115	1.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA19625	0.843	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA19648	1.006	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA20502	0.804	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	36813183	36813361	DUP	179	NA20845	0.982	1.327	0.0	0.002	0.667	0.667	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG00096	0.811	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG00268	0.828	0.92	0.0	0.0	0.72	0.72	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG00419	0.637	0.708	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG00759	0.724	0.805	0.0	0.0	0.409	0.388	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG01051	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG01112	0.788	0.876	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG01500	0.838	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG01565	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG01583	0.924	1.027	0.0	0.0	0.721	0.721	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG01595	0.719	0.799	0.0	0.0	0.581	0.581	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG01879	0.643	0.714	0.0	0.009	0.769	0.733	3	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG02568	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG02922	0.746	0.829	0.0	0.005	0.607	0.607	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG03006	1.079	1.199	0.0	0.0	0.533	0.533	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG03052	0.818	0.909	0.0	0.0	0.412	0.389	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG03642	0.8	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	HG03742	0.857	0.953	0.0	0.0	0.69	0.69	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA12878	0.837	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA18525	1.059	1.177	0.0	0.0	0.657	0.63	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA18939	1.091	1.212	0.0	0.0	0.893	0.935	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA19238	0.925	1.028	0.0	0.0	0.634	0.634	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA19239	0.86	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA19625	0.685	0.761	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA19648	0.954	1.06	0.0	0.0	0.833	0.781	1	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA20502	1.325	1.472	0.0	0.0	0.672	0.672	2	2
chr10	44230915	44231143	DUP	229	NA20845	0.685	0.761	0.0	0.0	0.646	0.646	4	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG00096	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG00268	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG00419	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG00759	1.179	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG01051	0.688	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG01112	0.846	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG01500	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG01565	0.767	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG01583	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG01595	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG01879	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG02568	0.943	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG02922	0.768	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG03006	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG03052	0.994	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG03642	1.059	1.028	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	HG03742	1.041	1.011	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA12878	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA18525	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA18939	0.922	0.895	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA19017	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA19238	1.048	1.017	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA19239	0.43	0.417	0.081	0.053	nan	nan	0	1
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA19625	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA19648	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA20502	0.757	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44383342	44384084	DEL	743	NA20845	1.051	1.02	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG00096	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG00268	0.504	0.504	0.0	0.078	0.559	0.559	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG00419	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG00759	0.435	0.435	0.0	0.035	0.538	0.568	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG01051	0.301	0.301	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG01112	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG01500	0.671	0.671	0.0	0.089	0.5	0.5	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG01565	0.548	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG01583	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG02568	0.393	0.393	0.0	0.066	0.791	0.791	2	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG02922	1.053	1.053	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG03006	0.625	0.625	0.0	0.05	0.3	0.3	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG03052	0.354	0.354	0.0	0.061	0.647	0.611	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG03642	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	HG03742	0.408	0.408	0.0	0.061	1.0	1.0	1	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA12878	0.471	0.471	0.0	0.052	0.571	0.571	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA18525	0.359	0.359	0.0	0.037	0.667	0.696	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA18939	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	0
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA19238	0.34	0.34	0.0	0.073	0.972	0.972	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA19239	0.336	0.336	0.0	0.059	1.0	1.0	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA19625	0.421	0.421	0.0	0.061	0.692	0.692	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA19648	0.464	0.464	0.0	0.044	0.45	0.422	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA20502	0.426	0.426	0.0	0.059	0.591	0.591	1	1
chr10	44675233	44675325	DEL	93	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG00096	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG00268	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG00419	0.786	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG00759	1.19	1.252	0.0	0.0	0.652	0.688	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG01051	0.903	0.951	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG01112	0.884	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG01500	0.745	0.785	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG01565	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG01583	1.024	1.078	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG01595	0.846	0.891	0.0	0.0	0.835	0.835	2	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG01879	0.586	0.617	0.0	0.0	0.778	0.776	2	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG02568	0.825	0.869	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG02922	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG03006	0.738	0.777	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG03052	0.751	0.791	0.0	0.0	0.824	0.778	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG03642	1.059	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	HG03742	0.857	0.902	0.007	0.0	0.571	0.571	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA12878	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA18525	0.826	0.869	0.0	0.0	0.944	0.986	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA18939	0.621	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA19017	1.08	1.136	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA19238	0.884	0.931	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA19239	0.86	0.905	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA19625	0.869	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA19648	0.748	0.787	0.0	0.0	0.6	0.64	1	2
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA20502	0.426	0.448	0.109	0.066	0.409	0.409	1	1
chr10	44687297	44687938	DEL	642	NA20845	0.868	0.914	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG00096	1.056	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG00268	0.954	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG00419	1.105	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG00759	1.386	1.272	0.0	0.0	0.818	0.775	1	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG01051	1.441	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG01112	1.134	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG01500	1.211	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG01565	1.403	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG01583	0.849	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG01595	1.418	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG01879	1.021	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG02568	1.257	1.154	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG02922	0.987	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG03006	1.192	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG03052	0.619	0.568	0.0	0.068	0.885	0.836	2	1
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG03642	1.11	1.019	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	HG03742	1.49	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA12878	0.819	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA18525	1.239	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA18939	1.016	0.932	0.0	0.0	0.514	0.538	1	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA19017	1.137	1.044	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA19238	1.333	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA19239	1.37	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA19625	1.528	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA19648	1.341	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA20502	1.348	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	45366778	45366847	DEL	70	NA20845	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG00096	1.471	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG00268	1.332	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG00419	1.115	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG00759	1.428	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG01051	1.269	1.164	0.0	0.0	0.656	0.656	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG01112	1.096	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG01500	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG01565	1.337	1.227	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG01583	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG01595	0.423	0.388	0.0	0.046	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG01879	1.437	1.318	0.0	0.006	0.737	0.774	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG02568	0.825	0.757	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG02922	1.601	1.469	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG03006	1.173	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG03052	1.304	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG03642	1.097	1.007	0.0	0.0	0.882	0.956	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	HG03742	0.837	0.768	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA12878	0.959	0.88	0.0	0.003	0.793	0.793	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA18525	1.167	1.07	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA18939	0.997	0.914	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA19017	1.369	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA19238	1.374	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA19239	1.283	1.177	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA19625	1.396	1.281	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA19648	1.418	1.301	0.0	0.004	0.885	0.944	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA20502	1.183	1.085	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr10	52633946	52634087	DEL	142	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	1
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG00096	1.113	1.04	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG00268	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG00419	1.189	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG00759	1.366	1.276	0.0	0.0	0.893	0.895	2	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG01051	1.247	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG01112	1.519	1.42	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG01500	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG01565	1.381	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG01583	0.999	0.934	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG01595	1.27	1.187	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG01879	1.55	1.449	0.0	0.0	0.821	0.781	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG02568	1.375	1.285	0.0	0.0	0.55	0.55	2	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG02922	0.987	0.922	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG03006	1.23	1.15	0.0	0.0	0.595	0.595	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG03052	0.906	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG03642	1.291	1.207	0.0	0.0	0.565	0.58	3	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	HG03742	1.225	1.145	0.005	0.0	0.926	0.926	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA12878	0.802	0.749	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA18525	0.951	0.889	0.0	0.0	0.83	0.795	2	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA18939	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA19017	1.215	1.135	0.0	0.0	0.933	0.933	2	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA19238	1.129	1.055	0.0	0.0	0.85	0.85	2	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA19239	1.222	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA19625	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA19648	1.238	1.157	0.009	0.0	0.767	0.818	1	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA20502	1.112	1.039	0.0	0.0	0.738	0.738	2	2
chr10	55591815	55592513	DEL	699	NA20845	1.348	1.259	0.0	0.003	0.851	0.851	2	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG00096	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG00268	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG00419	0.276	0.291	0.027	0.06	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG00759	0.0	0.0	0.035	0.122	nan	nan	0	0
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG01051	0.86	0.905	0.0	0.008	0.792	0.792	9	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG01112	0.25	0.263	0.046	0.034	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG01500	0.727	0.765	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG01565	0.351	0.369	0.064	0.03	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG01583	0.724	0.763	0.08	0.031	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG01595	0.36	0.379	0.011	0.045	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG01879	0.907	0.955	0.0	0.0	0.769	0.808	1	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG02568	1.139	1.199	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG02922	0.373	0.393	0.019	0.044	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG03006	0.397	0.418	0.041	0.03	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG03052	1.083	1.14	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG03642	0.878	0.924	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	HG03742	0.878	0.924	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA12878	1.133	1.193	0.0	0.0	0.475	0.475	1	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA18525	0.0	0.0	0.057	0.139	nan	nan	0	0
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA18939	0.263	0.277	0.017	0.058	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA19017	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA19238	0.49	0.516	0.005	0.087	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA19239	1.048	1.103	0.0	0.003	0.647	0.647	9	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA19625	0.342	0.36	0.027	0.062	nan	nan	0	1
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA19648	1.135	1.194	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA20502	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	55893654	55894108	DEL	455	NA20845	1.005	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG00096	1.075	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG00268	0.99	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG00419	1.253	1.15	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG00759	1.2	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG01051	1.355	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG01112	1.077	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG01500	1.081	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG01565	1.096	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG01583	0.999	0.917	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG01595	1.121	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG01879	1.267	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG02568	1.336	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG02922	1.009	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG03006	1.325	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG03052	0.619	0.568	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG03642	1.265	1.161	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	HG03742	1.123	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA12878	1.029	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA18525	0.987	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA18939	1.279	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA19017	1.234	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA19238	1.279	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA19239	1.168	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA19625	1.449	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA19648	1.031	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA20502	1.23	1.129	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	56645817	56645992	DEL	176	NA20845	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG00096	1.226	1.226	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG00268	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG00419	0.743	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG00759	1.304	1.304	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG01051	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG01112	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG01500	1.267	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG01565	1.557	1.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG01583	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG01595	1.333	1.333	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG01879	0.605	0.605	0.007	0.111	nan	nan	0	1
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG02568	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG02922	1.382	1.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG03006	0.946	0.946	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG03052	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG03642	1.265	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	HG03742	1.082	1.082	0.0	0.0	0.781	0.781	1	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA12878	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA18525	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA18939	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA19017	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA19238	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA19239	1.209	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA19625	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA19648	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA20502	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	58431502	58431709	DEL	208	NA20845	1.096	1.096	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG00096	0.773	0.859	0.0	0.055	0.609	0.609	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG00268	0.684	0.76	0.0	0.034	0.578	0.578	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG00419	0.255	0.283	0.0	0.088	0.667	0.667	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG00759	0.538	0.598	0.0	0.027	0.724	0.764	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG01051	1.312	1.457	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG01112	1.057	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG01500	0.335	0.373	0.0	0.023	0.583	0.583	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG01565	0.373	0.414	0.0	0.016	1.0	1.0	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	0
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG01595	1.047	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG01879	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG02568	1.218	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG02922	1.25	1.389	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG03006	0.36	0.4	0.0	0.038	0.704	0.704	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG03052	0.895	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG03642	0.904	1.004	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	HG03742	0.49	0.544	0.0	0.041	0.63	0.63	1	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA12878	1.168	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA18525	0.628	0.698	0.0	0.038	0.694	0.725	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA19017	0.578	0.643	0.0	0.028	0.447	0.447	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA19238	0.571	0.635	0.0	0.043	0.942	0.942	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA19239	1.222	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA19625	1.238	1.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA19648	1.096	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA20502	0.449	0.499	0.0	0.052	0.857	0.857	1	1
chr10	6064768	6064841	DEL	74	NA20845	0.994	1.104	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG00096	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG00268	1.278	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG00419	0.977	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG00759	1.324	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG01051	1.441	1.346	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG01112	1.096	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG01500	0.689	0.644	0.09	0.058	nan	nan	0	1
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG01565	1.316	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG01583	0.999	0.934	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG01595	1.248	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG01879	1.456	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG02568	1.218	1.138	0.0	0.0	0.481	0.481	1	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG02922	1.25	1.168	0.006	0.0	0.833	0.833	1	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG03006	1.022	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG03052	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG03642	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	HG03742	1.368	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA12878	1.151	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA18525	1.185	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA18939	1.204	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA19017	1.08	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA19238	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA19239	1.289	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA19625	1.264	1.181	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA19648	0.98	0.916	0.0	0.0	0.727	0.776	1	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA20502	1.23	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	61202684	61203532	DEL	849	NA20845	0.914	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG00096	0.302	0.382	0.007	0.14	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG00268	0.486	0.615	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG00419	0.17	0.215	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG00759	0.414	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG01051	0.172	0.218	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG01112	0.231	0.292	0.0	0.112	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG01500	0.689	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG01565	0.636	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG01583	0.325	0.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG01595	0.466	0.589	0.0	0.232	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG01879	0.51	0.646	0.0	0.239	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG02568	0.393	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG02922	0.329	0.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG03006	0.246	0.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG03052	0.464	0.587	0.011	0.137	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG03642	0.31	0.392	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	HG03742	0.388	0.491	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA12878	0.296	0.375	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA18525	0.431	0.545	0.009	0.201	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA18939	0.564	0.714	0.009	0.252	nan	nan	0	0
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA19017	0.231	0.293	0.0	0.129	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA19238	0.34	0.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.204	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA19625	0.579	0.733	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA19648	0.129	0.163	0.0	0.126	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA20502	0.118	0.15	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr10	63743614	63743792	DEL	179	NA20845	0.183	0.231	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG00096	1.122	1.122	0.0	0.0	0.773	0.773	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG00268	0.558	0.558	0.103	0.042	nan	nan	0	1
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG00419	0.743	0.743	0.0	0.0	0.903	0.903	3	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG00759	0.579	0.579	0.135	0.052	0.438	0.462	2	1
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG01051	1.097	1.097	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG01112	1.115	1.115	0.0	0.0	0.91	0.91	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG01500	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG01565	0.877	0.877	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG01583	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG01595	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG01879	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG02568	1.139	1.139	0.0	0.0	0.601	0.601	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG02922	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG03006	1.06	1.06	0.0	0.0	0.793	0.793	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG03052	1.26	1.26	0.0	0.0	0.607	0.609	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG03642	1.162	1.162	0.0	0.0	1.0	0.923	3	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	HG03742	1.021	1.021	0.0	0.0	0.93	0.93	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA12878	0.907	0.907	0.0	0.0	0.784	0.784	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA18525	0.736	0.736	0.0	0.0	0.889	0.928	1	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA18939	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA19017	1.08	1.08	0.0	0.0	0.838	0.837	2	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA19238	1.048	1.048	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA19239	1.088	1.088	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA19625	1.211	1.211	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA19648	1.16	1.16	0.0	0.0	0.792	0.844	3	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA20502	1.112	1.112	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr10	65633497	65634362	DEL	866	NA20845	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG00096	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG00268	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG00419	1.211	1.175	0.004	0.0	0.593	0.593	1	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG00759	1.304	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG01051	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG01112	1.269	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG01500	1.397	1.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG01565	1.425	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG01583	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG01595	1.333	1.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG01879	1.191	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG02568	1.179	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG02922	1.119	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG03006	1.363	1.323	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG03052	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG03642	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	HG03742	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA12878	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA18525	1.221	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA18939	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA19017	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA19238	0.612	0.594	0.089	0.041	nan	nan	0	1
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA19239	1.303	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA19625	1.053	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA19648	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA20502	1.443	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66225854	66226777	DEL	924	NA20845	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG00096	1.169	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG00268	1.044	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG00419	0.807	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG00759	1.448	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG01051	1.29	1.184	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG01112	0.577	0.529	0.005	0.059	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG01500	0.634	0.581	0.0	0.072	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG01583	1.124	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG01595	1.502	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG01879	1.38	1.266	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG02568	0.864	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG02922	1.316	1.207	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	HG03006	1.06	0.972	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	NA18525	0.987	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	NA19017	1.35	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	NA19238	1.211	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	NA19239	1.101	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	NA19625	0.948	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	66841805	66842061	DUP	257	NA20502	0.544	0.499	0.0	0.081	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG00096	1.301	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG00268	0.468	0.454	0.053	0.041	nan	nan	0	1
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG00419	1.041	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG00759	1.221	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG01051	1.355	1.315	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG01112	1.077	1.045	0.0	0.0	0.683	0.683	2	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG01500	1.137	1.103	0.0	0.0	0.61	0.61	2	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG01565	1.272	1.235	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG01583	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG01595	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG01879	1.229	1.193	0.0	0.0	0.794	0.756	1	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG02568	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG02922	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG03006	1.079	1.047	0.0	0.0	0.732	0.732	2	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG03052	1.193	1.159	0.0	0.0	0.816	0.771	2	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG03642	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	HG03742	0.98	0.951	0.0	0.0	0.414	0.414	2	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA12878	1.133	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA18525	1.257	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA18939	1.11	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA19017	1.176	1.142	0.0	0.0	0.932	0.932	2	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA19238	1.197	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA19239	1.115	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA19625	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA19648	1.264	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA20502	1.088	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	68954168	68954838	DEL	671	NA20845	1.188	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG00096	0.736	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG00268	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG00759	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG01051	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG01112	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG01500	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG01565	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG01583	0.5	0.5	0.052	0.026	nan	nan	0	1
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG01595	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG01879	0.813	0.813	0.0	0.0	0.659	0.692	2	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG02568	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG02922	0.417	0.417	0.07	0.04	nan	nan	0	1
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG03006	1.06	1.06	0.006	0.0	0.769	0.769	3	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG03052	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG03642	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	HG03742	0.347	0.347	0.039	0.032	nan	nan	0	1
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA12878	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA18525	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA18939	0.715	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA19017	1.041	1.041	0.0	0.0	0.778	0.778	2	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA19238	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA19239	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA19625	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA19648	1.031	1.031	0.0	0.0	0.609	0.571	3	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA20502	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	69039299	69040227	DEL	929	NA20845	0.777	0.777	0.0	0.0	0.647	0.647	3	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG00096	0.886	0.886	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG00268	0.432	0.432	0.078	0.036	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG00419	0.913	0.913	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG00759	0.0	0.0	0.284	0.18	nan	nan	0	0
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG01051	0.344	0.344	0.075	0.054	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG01112	0.442	0.442	0.085	0.042	0.75	0.75	1	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG01500	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG01565	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG01583	0.824	0.824	0.0	0.0	0.643	0.643	2	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG01595	0.423	0.423	0.064	0.036	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG01879	0.888	0.888	0.003	0.0	0.586	0.615	4	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG02568	0.629	0.629	0.0	0.0	0.394	0.394	2	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG02922	0.395	0.395	0.034	0.021	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG03006	0.549	0.549	0.091	0.061	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG03052	0.398	0.398	0.085	0.047	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG03642	0.645	0.645	0.0	0.0	0.778	0.718	1	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	HG03742	1.102	1.102	0.0	0.0	0.214	0.214	2	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA12878	1.046	1.046	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA18525	0.359	0.359	0.071	0.038	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA18939	0.903	0.903	0.005	0.0	0.72	0.754	1	2
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA19017	0.347	0.347	0.066	0.041	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA19238	0.367	0.367	0.109	0.046	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA19239	0.47	0.47	0.085	0.041	0.341	0.341	3	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA19625	0.211	0.211	0.093	0.059	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA19648	0.567	0.567	0.095	0.044	nan	nan	0	1
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA20502	0.0	0.0	0.323	0.14	nan	nan	0	0
chr10	70786356	70787310	DEL	955	NA20845	1.165	1.165	0.0	0.004	0.812	0.812	1	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG00096	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG00268	1.314	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG00419	1.551	1.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG00759	0.786	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG01051	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG01112	0.904	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG01500	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG01565	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG01583	0.949	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG01595	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG01879	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG02568	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG02922	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG03006	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG03052	0.928	0.901	0.0	0.0	0.522	0.493	1	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG03642	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	HG03742	1.082	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA12878	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA18525	0.377	0.366	0.0	0.019	0.893	0.856	1	1
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA18939	0.828	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA19017	0.945	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA19238	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA19239	1.101	1.069	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA19625	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA19648	0.903	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA20502	1.278	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	71738863	71738928	DEL	66	NA20845	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG00096	0.868	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG00268	0.702	0.846	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG00419	0.743	0.896	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG00759	0.414	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG01051	0.688	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG01112	0.558	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG01500	0.447	0.539	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG01565	0.526	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG01583	0.674	0.813	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG01595	0.762	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG01879	0.397	0.478	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG02568	0.55	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG02922	0.746	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG03006	0.748	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG03052	0.729	0.879	0.0	0.0	0.412	0.389	1	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG03642	0.8	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	HG03742	0.633	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA12878	0.715	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA18525	0.808	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA18939	0.564	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA19017	0.945	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA19238	0.898	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA19239	0.725	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA19625	0.658	0.793	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA19648	1.135	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA20502	0.946	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73216159	73216304	DEL	146	NA20845	0.594	0.716	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG00096	0.453	0.52	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG00268	0.378	0.435	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG00759	0.414	0.476	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG01051	0.258	0.297	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG01112	0.288	0.332	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	0
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG01565	0.241	0.277	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG01583	0.5	0.574	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG01879	0.302	0.348	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG02568	0.747	0.858	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG02922	0.57	0.656	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG03006	0.435	0.5	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG03052	0.663	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG03642	0.955	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73256581	73256701	DEL	121	HG03742	0.51	0.587	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	0
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA18525	0.359	0.413	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.135	nan	nan	0	0
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA19017	0.443	0.51	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA19238	0.435	0.5	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA19239	0.483	0.556	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA19625	0.474	0.545	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA19648	0.464	0.534	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA20502	0.426	0.489	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr10	73256581	73256701	DEL	121	NA20845	0.365	0.42	0.012	0.072	nan	nan	0	1
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG00096	0.849	0.943	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG00268	0.756	0.84	0.0	0.0	0.916	0.916	2	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG00419	0.935	1.038	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG00759	0.766	0.851	0.0	0.0	0.781	0.74	2	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG01051	0.559	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG01112	0.481	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG01500	0.783	0.87	0.0	0.0	0.858	0.858	2	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG01565	0.614	0.682	0.0	0.0	0.744	0.744	2	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG01583	0.724	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG01595	0.635	0.705	0.0	0.003	0.75	0.75	3	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG01879	0.321	0.357	0.055	0.066	nan	nan	0	1
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG02568	0.786	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG02922	0.943	1.048	0.0	0.01	0.866	0.866	2	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG03006	0.7	0.778	0.0	0.0	0.381	0.381	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG03052	0.685	0.761	0.0	0.0	0.8	0.756	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG03642	0.62	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	HG03742	0.796	0.885	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA12878	0.785	0.872	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA18525	0.951	1.057	0.0	0.0	0.75	0.783	3	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA18939	0.564	0.627	0.0	0.0	0.648	0.618	2	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA19017	0.752	0.835	0.0	0.0	0.6	0.6	5	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA19238	0.762	0.847	0.0	0.0	0.933	0.933	3	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA19239	0.819	0.91	0.0	0.0	0.865	0.865	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA19625	0.685	0.761	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA19648	0.542	0.602	0.0	0.0	0.667	0.625	1	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA20502	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	73636654	73637170	DEL	517	NA20845	0.685	0.761	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG00096	0.868	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG00268	0.972	0.944	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG00419	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG00759	0.807	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG01051	0.495	0.48	0.093	0.043	nan	nan	0	1
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG01112	0.904	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG01500	1.043	1.013	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG01565	1.118	1.086	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG01583	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG01595	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG01879	0.718	0.697	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG02568	0.747	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG02922	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG03006	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG03052	0.84	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG03642	0.684	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	HG03742	0.714	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA12878	0.697	0.677	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA18525	0.808	0.784	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA18939	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA19017	0.771	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA19238	0.776	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA19239	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA19625	0.606	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA19648	0.774	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA20502	0.863	0.838	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr10	76052422	76053365	DEL	944	NA20845	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG00096	0.453	0.412	0.0	0.026	0.666	0.666	2	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG00268	0.738	0.671	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG00419	1.062	0.965	0.0	0.005	0.786	0.786	1	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG00759	0.683	0.621	0.0	0.0	0.75	0.792	1	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG01051	0.237	0.215	0.0	0.02	0.594	0.594	2	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG01112	0.211	0.192	0.0	0.047	0.667	0.667	1	1
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG01500	0.699	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG01565	0.614	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG01583	0.749	0.681	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG01595	0.55	0.5	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG01879	0.775	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG02568	0.236	0.214	0.0	0.05	1.0	1.0	1	1
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG02922	0.79	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG03006	0.549	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG03052	1.017	0.924	0.0	0.0	0.929	0.877	1	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr10	79136316	79136399	DEL	84	HG03742	0.592	0.538	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA12878	0.837	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA18525	0.485	0.441	0.0	0.046	0.794	0.829	1	1
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA18939	0.451	0.41	0.0	0.081	0.696	0.69	2	1
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA19017	0.463	0.421	0.0	0.037	0.611	0.611	3	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA19239	0.833	0.757	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA19625	0.895	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA20502	0.946	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	79136316	79136399	DEL	84	NA20845	0.388	0.353	0.0	0.032	0.739	0.739	2	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG00096	0.679	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG00268	0.36	0.434	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG00419	0.404	0.486	0.011	0.068	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG00759	0.703	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG01051	0.452	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG01112	0.615	0.741	0.0	0.0	0.385	0.385	2	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG01565	0.373	0.449	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG01583	0.4	0.482	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG01595	0.571	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG01879	0.51	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG02568	0.943	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG02922	0.79	0.951	0.0	0.0	0.917	0.917	2	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG03052	0.729	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG03642	0.542	0.653	0.009	0.056	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA12878	0.785	0.945	0.0	0.004	0.667	0.667	1	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA18525	0.359	0.433	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA18939	0.244	0.295	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA19017	0.366	0.441	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA19238	0.762	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA19239	0.645	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA19625	0.764	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.213	nan	nan	0	0
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA20502	0.52	0.627	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr10	81176903	81177144	DEL	242	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG00096	1.32	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG00268	1.224	1.189	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG00419	1.296	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG00759	1.21	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG01051	1.226	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG01112	0.519	0.504	0.0	0.024	0.857	0.857	1	1
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG01500	0.745	0.724	0.0	0.027	0.587	0.587	1	1
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG01565	1.392	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG01583	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG01595	0.529	0.514	0.0	0.042	0.962	0.962	1	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG01879	1.304	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG02568	1.218	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG02922	1.448	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG03006	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG03052	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG03642	1.549	1.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	HG03742	1.388	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA12878	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA18525	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA18939	0.724	0.703	0.005	0.039	0.347	0.363	1	1
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA19017	1.176	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA19238	1.156	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA19239	1.168	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA19625	1.37	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA19648	1.212	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA20502	0.804	0.781	0.0	0.032	0.656	0.656	1	1
chr10	84367095	84367168	DEL	74	NA20845	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG00096	0.585	0.65	0.0	0.0	0.692	0.692	6	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG00268	0.81	0.9	0.0	0.0	0.67	0.67	4	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG00419	0.871	0.968	0.0	0.0	0.571	0.571	3	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG00759	0.724	0.805	0.0	0.0	0.706	0.745	1	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG01051	0.645	0.717	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG01112	0.596	0.662	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG01500	0.689	0.766	0.0	0.0	0.81	0.81	3	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG01565	0.548	0.609	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG01583	0.824	0.916	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG01595	0.614	0.682	0.0	0.0	0.933	0.933	2	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG01879	0.699	0.777	0.0	0.0	0.842	0.884	5	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG02568	0.707	0.786	0.0	0.0	0.583	0.583	5	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG02922	0.746	0.829	0.0	0.0	0.947	0.947	3	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG03006	0.625	0.694	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG03052	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG03642	0.981	1.09	0.0	0.0	1.0	0.923	1	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	HG03742	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA12878	0.61	0.678	0.0	0.0	0.807	0.807	2	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA18525	0.556	0.618	0.0	0.0	0.881	0.919	2	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA18939	0.715	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA19017	0.752	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA19238	0.748	0.831	0.002	0.0	0.9	0.9	3	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA19239	0.645	0.716	0.0	0.0	0.74	0.74	2	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA19625	0.843	0.936	0.0	0.0	0.351	0.351	6	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA19648	0.438	0.487	0.053	0.036	nan	nan	0	1
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA20502	0.733	0.815	0.0	0.0	0.562	0.562	6	2
chr10	84817497	84818462	DEL	966	NA20845	0.594	0.66	0.0	0.0	0.424	0.424	2	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG00096	1.188	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG00268	1.08	1.08	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG00419	1.126	1.126	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG00759	1.117	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG01051	1.14	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG01112	0.981	0.981	0.006	0.0	0.944	0.944	1	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG01500	0.857	0.857	0.033	0.07	0.5	0.5	1	1
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG01565	1.009	1.009	0.026	0.062	0.8	0.8	1	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG01583	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG01595	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG01879	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG02568	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG02922	1.184	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG03006	1.117	1.117	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG03052	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG03642	1.291	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	HG03742	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA12878	0.994	0.994	0.005	0.0	0.84	0.84	1	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA18525	1.023	1.023	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA18939	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA19017	1.137	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA19238	1.156	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA19239	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA19625	1.106	1.106	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA19648	1.006	1.006	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA20502	1.112	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	86801826	86802449	DEL	624	NA20845	0.891	0.891	0.031	0.089	0.667	0.667	1	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG00096	0.962	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG00268	0.954	1.004	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG00419	0.807	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG00759	0.869	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG01051	0.366	0.385	0.047	0.03	nan	nan	0	1
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG01112	0.961	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG01500	1.099	1.157	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG01565	0.844	0.889	0.0	0.0	0.931	0.931	2	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG01583	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG01595	0.952	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG01879	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG02568	0.982	1.034	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG02922	0.592	0.623	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG03006	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG03052	0.95	1.0	0.0	0.0	0.689	0.697	2	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG03642	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	HG03742	0.898	0.945	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA12878	0.732	0.771	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA18525	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA18939	0.903	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA19017	0.424	0.446	0.038	0.016	nan	nan	0	1
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA19238	0.762	0.802	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA19239	0.47	0.495	0.043	0.029	nan	nan	0	1
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA19625	0.974	1.026	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA19648	0.825	0.869	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA20502	0.568	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	87021854	87022585	DEL	732	NA20845	0.822	0.866	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG00096	1.226	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG00268	0.576	0.559	0.045	0.024	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG00419	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG00759	1.097	1.065	0.0	0.0	0.583	0.616	1	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG01051	1.183	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG01112	0.558	0.541	0.042	0.027	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG01500	0.447	0.434	0.093	0.044	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG01565	0.636	0.617	0.085	0.056	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG01583	0.525	0.509	0.047	0.022	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG01595	0.0	0.0	0.227	0.122	nan	nan	0	0
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG01879	0.529	0.514	0.067	0.028	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG02568	1.257	1.221	0.0	0.0	0.692	0.692	2	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG02922	1.294	1.256	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG03006	1.268	1.231	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG03052	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG03642	0.491	0.476	0.05	0.025	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	HG03742	0.0	0.0	0.271	0.121	nan	nan	0	0
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA12878	0.384	0.372	0.065	0.044	nan	nan	0	1
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA18525	0.844	0.819	0.0	0.003	0.87	0.907	1	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA18939	0.997	0.968	0.0	0.0	0.808	0.771	1	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA19017	1.003	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA19238	1.143	1.11	0.0	0.0	0.805	0.805	2	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA19239	1.209	1.173	0.0	0.0	0.71	0.71	2	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA19625	1.027	0.997	0.0	0.0	0.562	0.563	1	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA19648	1.315	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA20502	1.278	1.24	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr10	89275802	89276561	DEL	760	NA20845	0.0	0.0	0.256	0.084	nan	nan	0	0
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG00096	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG00268	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG00419	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG00759	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG01051	0.817	0.817	0.009	0.0	0.595	0.595	2	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG01112	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG01500	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG01565	0.877	0.877	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG01583	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG01595	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG01879	0.302	0.302	0.059	0.045	nan	nan	0	1
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG02568	1.336	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG02922	1.053	1.053	0.0	0.0	0.649	0.649	2	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG03006	1.079	1.079	0.0	0.0	0.594	0.594	1	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	0.839	0.793	2	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG03642	0.826	0.826	0.01	0.007	0.846	0.917	1	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	HG03742	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA12878	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA18525	1.131	1.131	0.0	0.0	0.6	0.575	1	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA18939	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA19017	0.752	0.752	0.0	0.0	0.785	0.785	4	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA19238	1.007	1.007	0.0	0.0	0.917	0.917	2	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA19239	0.954	0.954	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA19625	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA19648	1.212	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA20502	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	91840212	91840808	DEL	597	NA20845	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG00096	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG00268	1.044	1.044	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG00419	0.871	0.871	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG00759	1.159	1.159	0.0	0.0	0.333	0.352	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG01051	0.903	0.903	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG01112	0.884	0.884	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG01500	0.838	0.838	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG01565	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG01583	1.049	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG01595	1.037	1.037	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG01879	0.359	0.359	0.123	0.08	nan	nan	0	1
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG02568	1.022	1.022	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG02922	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG03006	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG03052	0.486	0.486	0.085	0.054	nan	nan	0	1
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG03642	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	HG03742	1.041	1.041	0.0	0.0	0.935	0.935	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA12878	1.063	1.063	0.003	0.003	0.897	0.897	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA18525	1.095	1.095	0.003	0.003	0.886	0.924	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA18939	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA19017	0.578	0.578	0.067	0.027	nan	nan	0	1
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA19238	1.048	1.048	0.0	0.0	0.902	0.902	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA19239	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA19625	0.869	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA19648	0.954	0.954	0.0	0.0	0.947	0.888	1	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA20502	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	92087632	92088290	DEL	659	NA20845	1.211	1.211	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG00096	1.283	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG00268	1.242	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG00419	1.083	1.052	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG00759	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG01051	0.473	0.459	0.0	0.044	0.542	0.542	1	1
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG01112	1.173	1.139	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG01500	0.913	0.886	0.0	0.0	0.565	0.565	1	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG01565	0.811	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG01583	1.049	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG01595	0.952	0.924	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG01879	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG02568	0.314	0.305	0.0	0.066	0.75	0.75	1	1
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG02922	0.526	0.511	0.0	0.114	0.629	0.629	2	1
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG03006	0.397	0.386	0.0	0.064	0.656	0.656	2	1
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG03052	0.751	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG03642	0.981	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	HG03742	0.857	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA12878	0.959	0.931	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA18525	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA18939	1.11	1.077	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	1
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA19238	1.129	1.096	0.0	0.0	0.758	0.758	1	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA19239	0.497	0.482	0.0	0.063	0.656	0.656	2	1
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA19625	0.948	0.921	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA19648	0.748	0.726	0.0	0.068	0.515	0.483	1	1
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA20502	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	93396109	93396205	DEL	97	NA20845	0.822	0.798	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG00419	0.595	0.595	0.0	0.022	0.353	0.353	1	1
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG01051	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG01112	0.327	0.327	0.0	0.012	0.545	0.545	1	1
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG01565	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG01583	0.625	0.625	0.0	0.02	0.368	0.368	1	1
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG01595	0.444	0.444	0.0	0.031	0.583	0.583	1	1
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG01879	0.586	0.586	0.0	0.039	0.581	0.61	1	1
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG02568	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG02922	0.921	0.921	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG03006	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG03052	0.663	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG03642	0.284	0.284	0.0	0.021	0.846	0.917	1	1
chr10	9436189	9436251	DEL	63	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA19017	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA19238	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA19239	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA19625	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.082	nan	nan	0	0
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA20502	0.449	0.449	0.0	0.024	0.783	0.783	1	1
chr10	9436189	9436251	DEL	63	NA20845	0.365	0.365	0.0	0.014	0.5	0.5	1	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG00096	0.66	0.641	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG00268	0.81	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG00419	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG00759	1.159	1.125	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG01051	0.882	0.856	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG01112	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG01500	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG01565	0.724	0.702	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG01583	1.024	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG01595	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG01879	1.04	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG02568	0.943	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG02922	1.097	1.065	0.007	0.007	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG03006	1.249	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG03052	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG03642	1.188	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA12878	0.924	0.897	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA18525	0.449	0.436	0.006	0.113	nan	nan	0	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA18939	0.696	0.676	0.005	0.06	nan	nan	0	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA19017	0.463	0.449	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA19238	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA19239	1.168	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA19625	1.29	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA19648	0.851	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA20502	0.52	0.505	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr10	96251541	96251717	DEL	177	NA20845	0.777	0.754	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG00096	0.773	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG00268	0.972	0.909	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG00419	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG00759	0.766	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG01051	1.107	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG01112	1.077	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG01500	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG01565	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG01583	0.6	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG01595	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG01879	0.633	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG02568	0.707	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG02922	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG03006	1.06	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG03052	0.597	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG03642	0.904	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	HG03742	0.97	0.906	0.0	0.004	0.938	0.938	1	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA12878	1.308	1.222	0.0	0.003	0.8	0.8	1	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA18525	0.915	0.856	0.0	0.0	0.556	0.58	1	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA18939	0.846	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA19017	0.569	0.532	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA19239	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA19625	0.764	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA19648	0.645	0.602	0.0	0.0	0.6	0.562	1	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA20502	0.923	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	97151966	97152049	DUP	84	NA20845	0.937	0.875	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG00096	0.868	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG00268	0.954	1.06	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG00419	0.425	0.472	0.0	0.008	0.217	0.217	1	1
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG00759	0.786	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG01051	0.28	0.311	0.0	0.008	1.0	1.0	1	1
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG01112	0.692	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG01500	0.335	0.373	0.0	0.012	0.5	0.5	1	1
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG01565	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG01583	1.099	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG01595	0.614	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG01879	0.851	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG02568	0.629	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG02922	1.009	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG03006	0.927	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG03052	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG03642	0.852	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	HG03742	0.592	0.658	0.0	0.007	0.346	0.346	1	1
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA12878	0.401	0.446	0.011	0.008	0.588	0.588	1	1
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA18525	0.915	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA18939	0.828	0.919	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA19017	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA19238	0.912	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA19239	0.443	0.492	0.0	0.012	0.774	0.774	1	1
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA19625	0.816	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA19648	1.135	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA20502	1.017	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99417568	99417626	DEL	59	NA20845	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG00096	0.679	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG00268	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG00419	1.232	1.196	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG00759	0.952	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG01051	0.903	0.877	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG01500	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG01565	0.745	0.724	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG01583	1.049	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG01595	0.868	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG01879	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG02568	1.022	0.992	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG02922	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG03006	1.268	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG03052	1.083	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG03642	0.878	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	HG03742	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA12878	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA18525	0.951	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA18939	1.053	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA19017	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA19238	1.197	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA19239	1.048	1.017	0.0	0.0	0.961	0.961	2	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA19625	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA19648	0.774	0.751	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr10	99716275	99716443	DUP	169	NA20502	1.065	1.034	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG00096	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG00268	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG00419	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG00759	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG01051	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG01112	1.115	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG01500	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG01565	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG01583	0.799	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG01595	1.259	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG01879	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG02568	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG02922	0.855	0.831	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG03006	0.833	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG03052	0.608	0.59	0.01	0.073	nan	nan	0	1
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG03642	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	HG03742	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA12878	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA18525	1.185	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA18939	0.978	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA19017	1.041	1.011	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA19238	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA19239	0.846	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA19625	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA19648	1.109	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA20502	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr10	99743004	99743341	DEL	338	NA20845	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG00096	0.915	0.888	0.0	0.0	0.889	0.848	8	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG00268	0.797	0.774	0.0	0.0	0.733	0.733	9	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG00419	1.237	1.201	0.0	0.0	0.609	0.643	5	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG00759	1.204	1.169	0.0	0.0	0.557	0.557	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG01051	0.927	0.9	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG01112	1.09	1.059	0.0	0.0	0.657	0.657	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG01500	1.038	1.007	0.0	0.0	0.622	0.622	9	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG01565	1.103	1.07	0.0	0.0	0.875	0.875	5	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG01583	1.073	1.042	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG01595	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG01879	1.025	0.996	0.006	0.0	0.666	0.666	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG02568	0.855	0.83	0.0	0.0	0.638	0.638	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG02922	0.834	0.81	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG03006	1.005	0.975	0.005	0.0	0.81	0.81	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG03052	1.038	1.008	0.007	0.0	0.8	0.8	1	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG03642	1.004	0.975	0.0	0.0	0.56	0.56	7	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	HG03742	0.841	0.817	0.0	0.0	0.753	0.752	8	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA12878	0.912	0.885	0.0	0.0	0.714	0.714	5	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA18525	0.791	0.768	0.006	0.0	0.551	0.551	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA18939	1.02	0.991	0.0	0.0	0.587	0.587	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA19017	0.909	0.882	0.0	0.0	0.824	0.824	2	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA19238	0.685	0.665	0.077	0.0	nan	nan	0	1
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA19239	1.002	0.973	0.0	0.0	0.909	0.909	7	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA19625	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA19648	1.109	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA20502	0.566	0.55	0.054	0.0	nan	nan	0	1
chr11	101444635	101445461	DEL	827	NA20845	1.056	1.026	0.0	0.0	0.59	0.59	2	2
chr11	103087928	103088084	DUP	157	HG03742	0.882	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG00096	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG00268	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG00419	0.746	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG00759	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG01051	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG01112	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG01500	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG01565	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG01583	0.649	0.683	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG01595	0.917	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG01879	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG02568	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG02922	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG03006	0.72	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG03052	0.884	0.93	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG03642	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	HG03742	0.472	0.497	0.07	0.035	0.214	0.226	2	1
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA12878	0.757	0.797	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA18525	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA18939	0.737	0.776	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA19017	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA19238	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA19239	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA19625	1.078	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA19648	0.851	0.896	0.0	0.0	0.647	0.607	1	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA20502	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106174141	106174894	DEL	754	NA20845	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG00096	1.124	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG00268	0.797	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG00419	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG00759	1.266	1.183	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG01051	0.755	0.705	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG01112	1.168	1.092	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG01500	1.188	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG01565	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG01583	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG01595	1.216	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG01879	1.367	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG02568	0.972	0.908	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG02922	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG03006	1.08	1.01	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG03052	1.325	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG03642	1.391	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	HG03742	1.19	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA12878	0.877	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA18525	0.539	0.504	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA18939	1.361	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA19017	1.063	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA19238	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA19239	1.138	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA19625	1.183	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA19648	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA20502	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	106583241	106583381	DEL	141	NA20845	1.102	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG00268	0.507	0.474	0.0	0.034	0.895	0.895	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG00419	1.152	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG01051	0.712	0.665	0.006	0.032	0.6	0.6	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG01112	1.324	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG01500	0.924	0.864	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG01565	0.595	0.556	0.0	0.028	0.586	0.586	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG01583	1.273	1.19	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG01595	1.152	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG01879	0.893	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG02568	0.505	0.472	0.0	0.064	0.941	0.941	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG02922	0.878	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG03006	0.929	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG03052	0.906	0.846	0.0	0.027	0.372	0.372	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG03642	0.824	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA12878	0.499	0.466	0.0	0.044	0.8	0.8	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA18525	1.186	1.108	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA18939	0.529	0.494	0.006	0.019	0.684	0.684	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA19017	1.334	1.247	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA19238	1.267	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA19239	1.165	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA19625	1.209	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA19648	1.006	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA20502	0.66	0.617	0.0	0.029	0.793	0.84	1	1
chr11	107158610	107158665	DEL	56	NA20845	1.401	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG00096	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG00268	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG00419	0.832	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG00759	1.162	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG01051	0.41	0.398	0.0	0.051	0.714	0.714	1	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG01112	0.72	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG01500	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG01565	0.706	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG01583	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG01595	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG01879	1.082	1.051	0.0	0.0	0.606	0.577	1	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG02922	0.637	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG03006	1.099	1.067	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG03052	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG03642	1.082	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	HG03742	0.78	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA12878	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA18525	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA18939	0.775	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA19017	0.87	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA19239	1.219	1.184	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA19625	1.524	1.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA19648	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA20502	0.873	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	107640757	107640843	DUP	87	NA20845	1.102	1.07	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG00268	0.435	0.406	0.0	0.068	0.962	0.962	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG00759	0.643	0.601	0.0	0.049	0.486	0.486	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG01051	0.561	0.524	0.0	0.03	0.464	0.464	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG01112	0.555	0.519	0.0	0.033	0.469	0.469	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG01500	0.547	0.511	0.0	0.057	0.545	0.545	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG01595	0.747	0.698	0.0	0.053	0.5	0.5	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG01879	0.38	0.355	0.0	0.062	0.846	0.806	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG02568	0.428	0.4	0.0	0.052	0.533	0.533	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG03642	0.618	0.578	0.0	0.054	0.417	0.417	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	HG03742	0.677	0.633	0.0	0.019	0.486	0.512	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA19017	0.445	0.416	0.0	0.032	0.731	0.731	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA19238	0.602	0.563	0.0	0.05	0.792	0.792	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.082	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA20502	0.472	0.441	0.0	0.042	0.87	0.821	1	1
chr11	109930919	109930994	DEL	76	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG00096	0.696	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG00268	0.869	0.966	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG00419	0.917	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG00759	0.789	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG01051	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG01112	0.915	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG01500	0.849	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG01565	0.551	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG01583	0.799	0.887	0.016	0.108	nan	nan	0	1
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG01595	0.64	0.711	0.024	0.11	nan	nan	0	1
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG01879	0.779	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG02568	0.972	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG02922	0.527	0.585	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG03006	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG03052	0.685	0.761	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG03642	0.747	0.83	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr11	113805809	113806182	DEL	374	HG03742	0.821	0.912	0.015	0.117	nan	nan	0	1
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA12878	0.86	0.956	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA18525	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA18939	0.567	0.63	0.007	0.132	nan	nan	0	1
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA19017	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA19238	0.876	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA19239	0.691	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA19625	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA19648	0.761	0.845	0.005	0.225	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA20502	0.637	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	113805809	113806182	DEL	374	NA20845	0.827	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG00096	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG00268	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG00419	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG00759	1.349	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG01051	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG01112	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG01500	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG01565	0.397	0.397	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG01583	0.399	0.399	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG01595	0.683	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG01879	0.38	0.38	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG02568	0.311	0.311	0.0	0.061	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG02922	1.186	1.186	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG03006	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG03052	1.171	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG03642	0.361	0.361	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr11	114386459	114386570	DEL	112	HG03742	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA12878	1.135	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA18525	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA18939	1.342	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA19017	0.464	0.464	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA19238	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA19239	0.528	0.528	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA19625	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA19648	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA20502	0.425	0.425	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr11	114386459	114386570	DEL	112	NA20845	0.436	0.436	0.01	0.071	nan	nan	0	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG00096	0.819	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG00268	0.417	0.389	0.0	0.06	0.867	0.867	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG00419	0.491	0.458	0.0	0.026	0.786	0.829	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	0
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG01051	0.949	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG01112	0.604	0.564	0.007	0.055	0.839	0.839	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG01500	1.056	0.987	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG01565	0.639	0.598	0.0	0.05	0.5	0.5	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG01583	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG01595	0.469	0.439	0.0	0.039	0.667	0.667	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG01879	0.93	0.87	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG02568	0.311	0.291	0.0	0.048	0.909	0.909	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG02922	0.79	0.739	0.0	0.034	0.581	0.581	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG03006	0.967	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG03052	0.574	0.537	0.0	0.057	0.562	0.562	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG03642	0.953	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	114397160	114397230	DEL	71	HG03742	0.595	0.556	0.0	0.038	0.541	0.569	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA18525	0.629	0.588	0.0	0.035	0.435	0.435	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	0
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA19017	0.483	0.452	0.0	0.039	0.933	0.933	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA19238	0.466	0.435	0.0	0.053	0.84	0.84	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA19239	0.447	0.418	0.0	0.046	0.923	0.923	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA19625	0.394	0.368	0.0	0.032	0.947	0.947	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA20502	0.637	0.595	0.0	0.021	0.5	0.529	1	1
chr11	114397160	114397230	DEL	71	NA20845	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG00096	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG00268	1.087	1.087	0.004	0.0	0.875	0.875	1	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG00419	1.088	1.088	0.0	0.0	0.769	0.729	1	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG00759	1.162	1.162	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG01051	0.949	0.949	0.0	0.005	0.827	0.827	2	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG01112	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG01500	1.075	1.075	0.003	0.0	0.85	0.85	1	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG01565	1.169	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG01583	1.273	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG01595	0.469	0.469	0.05	0.003	0.278	0.278	4	1
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG01879	0.912	0.912	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG02568	0.7	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG02922	1.12	1.12	0.0	0.0	0.688	0.688	3	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG03006	0.986	0.986	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG03052	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG03642	0.824	0.824	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	HG03742	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA12878	0.877	0.877	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA18525	1.024	1.024	0.0	0.0	0.736	0.736	2	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA18939	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA19017	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA19238	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA19239	0.881	0.881	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA19625	0.972	0.972	0.0	0.0	0.611	0.611	2	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA19648	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA20502	0.943	0.943	0.0	0.0	0.77	0.727	2	2
chr11	116991783	116992487	DEL	705	NA20845	1.148	1.148	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG00096	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG00268	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG00419	0.917	0.917	0.0	0.0	0.643	0.679	1	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG00759	0.996	0.996	0.0	0.0	0.777	0.777	2	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG01051	0.819	0.819	0.0	0.0	0.735	0.735	4	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG01112	1.012	1.012	0.0	0.0	0.766	0.766	2	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG01500	1.188	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG01565	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG01583	1.048	1.048	0.0	0.0	0.841	0.841	2	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG01595	1.024	1.024	0.0	0.0	0.69	0.69	3	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG01879	1.044	1.044	0.0	0.0	0.585	0.615	1	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG02568	1.05	1.05	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG02922	0.966	0.966	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG03006	1.005	1.005	0.009	0.0	0.808	0.808	3	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG03052	0.884	0.884	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG03642	0.489	0.489	0.064	0.0	nan	nan	0	1
chr11	11875573	11876539	DEL	967	HG03742	0.882	0.882	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA12878	0.533	0.533	0.12	0.0	nan	nan	0	1
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA18525	0.898	0.898	0.0	0.0	0.977	0.977	2	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA18939	0.907	0.907	0.0	0.0	0.971	0.971	1	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA19017	1.083	1.083	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA19238	0.972	0.972	0.0	0.0	0.594	0.594	1	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA19239	1.03	1.03	0.0	0.0	0.712	0.712	2	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA19625	0.604	0.604	0.081	0.0	0.6	0.6	3	1
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA19648	0.516	0.516	0.061	0.0	0.429	0.402	1	1
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA20502	0.967	0.967	0.0	0.0	0.625	0.59	2	2
chr11	11875573	11876539	DEL	967	NA20845	1.034	1.034	0.0	0.0	0.837	0.837	4	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG00096	0.591	0.679	0.007	0.114	0.429	0.449	1	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG00268	0.869	0.999	0.007	0.189	0.318	0.318	1	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG00419	0.768	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG00759	0.623	0.716	0.009	0.384	1.0	1.0	1	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG01051	0.712	0.818	0.0	0.089	0.286	0.286	1	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG01112	0.798	0.918	0.006	0.272	0.388	0.388	2	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG01500	0.924	1.062	0.0	0.137	0.261	0.261	1	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG01565	0.706	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG01583	0.774	0.889	0.0	0.198	0.9	0.9	1	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG01595	0.64	0.736	0.0	0.167	0.457	0.457	2	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG01879	0.57	0.655	0.0	0.194	0.273	0.286	3	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG02568	0.816	0.938	0.0	0.374	nan	nan	0	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG02922	0.703	0.807	0.0	0.138	1.0	1.0	1	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG03006	0.739	0.85	0.008	0.152	0.643	0.643	2	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG03052	0.773	0.889	0.019	0.247	nan	nan	0	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG03642	0.824	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	HG03742	0.739	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA12878	0.757	0.87	0.0	0.146	0.8	0.8	1	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA18525	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA18939	0.548	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA19017	0.638	0.733	0.0	0.188	0.625	0.625	3	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA19238	0.671	0.771	0.0	0.247	nan	nan	0	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA19239	0.718	0.825	0.0	0.278	0.522	0.522	1	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA19625	0.631	0.725	0.0	0.285	0.5	0.5	1	1
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA19648	0.903	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA20502	1.179	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	119932287	119932656	DEL	370	NA20845	0.666	0.766	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG00096	0.705	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG00268	0.761	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG00419	0.853	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG00759	0.56	0.675	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG01051	0.625	0.753	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG01112	0.545	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG01500	0.717	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG01565	0.617	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG01583	0.824	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG01595	0.576	0.694	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG01879	0.741	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG02568	0.972	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG02922	0.856	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG03006	0.701	0.845	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG03052	0.663	0.798	0.006	0.003	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG03642	0.567	0.683	0.0	0.0	0.444	0.444	2	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	HG03742	0.533	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA12878	0.722	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA18525	0.881	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA18939	0.378	0.455	0.05	0.031	nan	nan	0	1
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA19017	0.0	0.0	0.302	0.14	nan	nan	0	0
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA19238	0.767	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA19239	0.366	0.441	0.077	0.044	nan	nan	0	1
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA19625	0.0	0.0	0.223	0.128	nan	nan	0	0
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA19648	0.825	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA20502	0.731	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	120387634	120388361	DEL	728	NA20845	0.712	0.858	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG00096	0.629	0.662	0.0	0.006	0.314	0.329	1	1
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG00268	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG00419	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG00759	0.623	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG01051	0.582	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG01112	0.312	0.328	0.0	0.006	0.267	0.267	1	1
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG01500	0.736	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG01565	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG01583	0.674	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG01595	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG01879	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG02568	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG02922	0.395	0.416	0.0	0.044	0.882	0.882	1	1
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG03006	0.986	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG03052	0.641	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG03642	0.695	0.732	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	HG03742	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA12878	0.619	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA18525	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA18939	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA19017	0.715	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA19238	0.356	0.375	0.0	0.044	0.667	0.667	1	1
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA19239	0.745	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA19625	0.657	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA19648	0.748	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA20502	0.991	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	122595306	122595360	DEL	55	NA20845	0.482	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG00096	1.21	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG00268	0.924	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG00419	1.322	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG00759	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG01051	1.121	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG01112	1.129	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG01500	1.17	1.231	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG01565	1.08	1.137	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG01583	1.198	1.261	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG01595	1.237	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG01879	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG02568	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG02922	0.933	0.982	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG03006	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG03052	1.149	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG03642	1.056	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	HG03742	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA12878	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA18525	0.431	0.454	0.0	0.037	0.846	0.846	1	1
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA18939	1.209	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA19017	1.16	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA19238	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA19239	1.002	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA19625	1.012	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA19648	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA20502	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123083102	123083167	DEL	66	NA20845	0.781	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG00096	0.591	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG00268	0.543	0.604	0.0	0.032	0.857	0.857	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG00419	0.213	0.237	0.0	0.037	0.684	0.648	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG00759	0.208	0.231	0.0	0.007	0.583	0.583	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG01051	0.582	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG01112	0.35	0.389	0.0	0.014	0.421	0.421	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG01500	0.868	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG01565	0.662	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.023	nan	nan	0	0
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG01595	0.149	0.166	0.0	0.014	0.5	0.5	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG02568	0.544	0.605	0.0	0.043	0.235	0.235	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG03052	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG03642	0.489	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	HG03742	0.8	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA12878	0.344	0.382	0.0	0.024	0.952	0.952	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	0
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA18939	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA19017	0.406	0.451	0.0	0.045	1.0	1.0	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA19238	0.356	0.396	0.0	0.018	0.633	0.633	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA19648	0.335	0.373	0.0	0.022	0.5	0.469	1	1
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA20502	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	123230019	123230075	DEL	57	NA20845	0.528	0.587	0.0	0.015	0.333	0.333	1	1
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG00096	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG00268	0.38	0.4	0.056	0.033	0.333	0.333	1	1
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG00419	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG00759	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG01051	0.819	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG01112	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG01500	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG01565	0.419	0.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG01583	0.774	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG01595	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG01879	0.893	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG02568	0.894	0.941	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG02922	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG03006	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG03052	0.751	0.791	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG03642	1.082	1.139	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	HG03742	0.677	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA12878	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA18525	0.755	0.794	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA18939	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA19017	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA19238	0.479	0.504	0.048	0.05	0.351	0.351	1	1
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA19239	0.461	0.485	0.091	0.064	nan	nan	0	1
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA19625	0.394	0.415	0.089	0.072	nan	nan	0	1
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA19648	0.98	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA20502	1.085	1.142	0.0	0.0	0.583	0.551	1	2
chr11	12401669	12402434	DEL	766	NA20845	0.804	0.846	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG00096	1.105	1.073	0.0	0.0	0.833	0.795	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG00268	1.268	1.231	0.0	0.0	0.697	0.697	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG00419	1.109	1.077	0.0	0.0	0.853	0.891	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG00759	1.142	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG01051	1.251	1.214	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG01112	1.051	1.021	0.0	0.0	0.726	0.726	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG01500	1.056	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG01565	1.323	1.285	0.0	0.0	0.774	0.774	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG01583	0.849	0.824	0.0	0.0	0.643	0.643	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG01595	1.045	1.015	0.0	0.004	0.687	0.687	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG01879	0.912	0.885	0.0	0.0	0.766	0.758	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG02568	1.244	1.208	0.0	0.0	0.693	0.693	2	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG02922	1.054	1.023	0.0	0.004	0.757	0.757	2	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG03006	1.156	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG03052	0.574	0.558	0.007	0.003	0.203	0.203	2	1
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG03642	0.489	0.475	0.004	0.0	0.857	0.857	1	1
chr11	124078676	124079309	DEL	634	HG03742	1.108	1.076	0.0	0.0	0.962	0.914	2	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA12878	0.946	0.918	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA18525	1.078	1.047	0.0	0.0	0.73	0.73	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA18939	1.096	1.064	0.0	0.0	0.747	0.747	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA19017	0.541	0.526	0.028	0.0	0.194	0.194	5	1
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA19238	1.191	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA19239	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA19625	1.051	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA19648	1.161	1.127	0.0	0.0	0.485	0.518	4	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA20502	1.108	1.076	0.0	0.0	0.943	0.891	2	2
chr11	124078676	124079309	DEL	634	NA20845	0.896	0.87	0.0	0.0	0.867	0.867	4	2
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG00268	0.435	0.435	0.0	0.2	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG00419	0.469	0.469	0.0	0.128	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG00759	0.581	0.581	0.005	0.185	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG01051	0.474	0.474	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG01112	0.136	0.136	0.0	0.082	0.737	0.737	2	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG01500	0.566	0.566	0.006	0.168	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG01565	0.11	0.11	0.0	0.104	0.737	0.737	2	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG01583	0.299	0.299	0.008	0.137	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG01595	0.341	0.341	0.0	0.141	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG01879	0.646	0.646	0.012	0.171	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG02568	0.505	0.505	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG02922	0.549	0.549	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG03006	0.55	0.55	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG03052	0.486	0.486	0.0	0.15	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG03642	0.0	0.0	0.009	0.133	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	HG03742	0.677	0.677	0.0	0.179	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.141	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA18525	0.341	0.341	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA19017	0.271	0.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA19238	0.561	0.561	0.0	0.166	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA19239	0.149	0.149	0.0	0.106	0.5	0.5	2	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA19625	0.683	0.683	0.0	0.169	nan	nan	0	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA19648	0.052	0.052	0.012	0.118	0.5	0.533	2	1
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr11	124830138	124830246	DEL	109	NA20845	0.459	0.459	0.0	0.158	nan	nan	0	0
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG00096	0.705	0.684	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG00268	0.978	0.95	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG00419	0.64	0.621	0.0	0.142	nan	nan	0	1
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG00759	1.37	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG01051	0.949	0.921	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG01112	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG01500	1.321	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG01565	1.345	1.306	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG01583	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG01595	1.408	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG01879	1.12	1.088	0.0	0.002	0.9	0.857	1	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG02568	1.244	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG02922	0.637	0.618	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG03006	0.493	0.478	0.005	0.076	nan	nan	0	1
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG03052	1.082	1.051	0.0	0.006	0.773	0.773	1	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG03642	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	HG03742	0.657	0.637	0.005	0.094	nan	nan	0	1
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA12878	0.464	0.451	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA18525	0.539	0.523	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.302	nan	nan	0	0
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA19017	1.044	1.014	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA19238	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA19239	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA19625	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA19648	1.573	1.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA20502	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	125719438	125719592	DEL	155	NA20845	0.942	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG00268	0.435	0.422	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG00419	0.0	0.0	0.009	0.211	nan	nan	0	0
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG00759	0.726	0.705	0.0	0.107	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG01051	1.121	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG01112	0.935	0.907	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG01500	0.623	0.604	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.149	nan	nan	0	0
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	0
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG01595	0.661	0.642	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG01879	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG02568	0.583	0.566	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG02922	1.339	1.3	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG03006	0.663	0.644	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG03052	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG03642	1.21	1.175	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	HG03742	0.78	0.757	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA12878	0.826	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.182	nan	nan	0	0
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA19017	0.483	0.469	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA19238	0.575	0.558	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	0
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA19625	1.261	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA19648	0.516	0.501	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	1
chr11	127456298	127456432	DEL	135	NA20845	0.482	0.468	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG00096	1.391	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG00268	0.543	0.543	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG00419	1.45	1.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG00759	1.142	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG01051	1.208	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG01112	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG01500	1.245	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	1
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG01583	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG01595	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG01879	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG02568	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG02922	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG03006	1.308	1.308	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG03052	0.707	0.707	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG03642	1.288	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	HG03742	1.559	1.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA12878	0.585	0.585	0.004	0.066	nan	nan	0	1
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA18525	0.683	0.683	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA18939	1.436	1.436	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA19017	1.141	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA19238	1.301	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA19239	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA19625	1.393	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA19648	0.413	0.413	0.0	0.125	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA20502	1.274	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	127787314	127787416	DEL	103	NA20845	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG00096	0.591	0.573	0.059	0.035	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG00268	0.616	0.598	0.039	0.041	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG00419	0.629	0.611	0.072	0.058	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG00759	0.581	0.564	0.057	0.033	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG01051	0.69	0.67	0.056	0.048	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG01112	0.798	0.775	0.065	0.039	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG01500	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG01565	1.455	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG01583	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG01595	1.28	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG01879	1.253	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG02568	0.991	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG02922	1.295	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG03006	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG03052	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG03642	1.313	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	HG03742	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA12878	1.066	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA18525	0.952	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA18939	0.454	0.44	0.057	0.044	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA19017	1.16	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA19238	1.15	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA19239	1.219	1.184	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA19625	0.552	0.536	0.084	0.052	nan	nan	0	1
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA19648	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA20502	1.392	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	128682712	128683409	DEL	698	NA20845	1.47	1.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG00096	1.124	1.051	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG00268	0.906	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG00419	1.152	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.206	nan	nan	0	0
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG01051	0.949	0.887	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG01112	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG01500	1.302	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG01565	0.926	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG01583	0.923	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG01595	0.448	0.419	0.0	0.043	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG01879	0.912	0.852	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG02568	0.35	0.327	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG02922	1.405	1.313	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG03006	1.365	1.275	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG03052	0.906	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG03642	0.67	0.626	0.011	0.135	nan	nan	0	1
chr11	130496397	130496642	DEL	246	HG03742	0.636	0.594	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA12878	1.17	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA18525	0.0	0.0	0.008	0.211	nan	nan	0	1
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA18939	0.567	0.53	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA19017	1.353	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA19238	0.644	0.601	0.0	0.1	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA19239	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA19625	1.314	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA19648	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.228	nan	nan	0	0
chr11	130496397	130496642	DEL	246	NA20845	0.838	0.783	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG00096	1.239	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG00268	0.906	0.846	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG00419	0.949	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG00759	0.955	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG01051	1.165	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG01112	0.993	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG01500	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG01565	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG01583	0.973	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG01595	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG01879	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG02568	1.05	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG02922	1.12	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG03006	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG03052	0.309	0.289	0.0	0.031	0.739	0.739	1	1
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG03642	1.21	1.131	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	HG03742	0.923	0.863	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA12878	1.17	1.093	0.005	0.002	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA18525	0.809	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA18939	1.172	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA19017	0.928	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA19238	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA19239	0.935	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA19625	0.841	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA19648	0.877	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA20502	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	130831825	130831908	DEL	84	NA20845	1.24	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG00096	0.743	0.743	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG00268	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG00419	1.045	1.045	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG00759	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG01051	0.884	0.884	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG01112	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG01500	1.094	1.094	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG01565	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG01583	0.699	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG01595	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG01879	0.76	0.76	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG02568	0.778	0.778	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG02922	0.878	0.878	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG03006	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG03052	0.508	0.508	0.0	0.019	0.905	0.905	1	1
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG03642	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	HG03742	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA12878	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA18525	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA18939	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA19017	1.141	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA19238	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA19239	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA19625	0.499	0.499	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA19648	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA20502	0.778	0.778	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	132501865	132501915	DEL	51	NA20845	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG00096	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG00268	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG00419	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG00759	1.225	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG01051	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG01112	0.584	0.584	0.0	0.034	0.909	0.909	1	1
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG01500	1.226	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG01565	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG01583	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG01595	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG01879	1.348	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG02568	1.011	1.011	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG02922	1.207	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG03006	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG03052	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG03642	1.391	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	HG03742	1.211	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA12878	1.238	1.238	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA18525	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA18939	1.323	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA19017	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA19238	1.212	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA19239	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA19625	0.683	0.683	0.0	0.049	0.667	0.667	1	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA19648	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA20502	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	18630468	18630533	DEL	66	NA20845	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG00096	1.01	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG00268	0.978	1.087	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG00419	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG00759	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG01051	0.776	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG01112	0.779	0.865	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG01500	0.868	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG01565	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG01583	0.873	0.971	0.0	0.0	0.913	0.913	2	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG01595	1.024	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG01879	0.874	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG02568	1.011	1.123	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG02922	0.9	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG03006	0.796	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG03052	0.795	0.884	0.0	0.0	0.575	0.575	2	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG03642	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	HG03742	0.964	1.071	0.0	0.0	0.64	0.674	1	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA12878	0.963	1.07	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA18525	0.988	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA18939	0.831	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA19017	0.851	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA19238	0.945	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA19239	0.799	0.888	0.0	0.0	0.558	0.558	1	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA19625	0.631	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA19648	0.542	0.602	0.085	0.045	nan	nan	0	1
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA20502	0.896	0.996	0.0	0.0	0.833	0.787	1	2
chr11	19094848	19095639	DEL	792	NA20845	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG00096	2.087	2.196	0.003	0.037	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG00268	2.101	2.212	0.002	0.052	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG00419	2.133	2.245	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG00759	2.283	2.403	0.0	0.034	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG01051	2.372	2.497	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG01112	2.298	2.418	0.003	0.015	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG01500	2.094	2.204	0.0	0.046	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG01565	1.896	1.996	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG01583	2.121	2.233	0.002	0.027	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG01595	2.453	2.582	0.004	0.022	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG01879	1.766	1.859	0.001	0.067	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG02568	2.449	2.578	0.0	0.024	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG02922	2.064	2.172	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG03006	1.839	1.935	0.002	0.058	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG03052	1.635	1.721	0.002	0.05	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	HG03642	1.571	1.654	0.002	0.04	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	HG03742	1.682	1.771	0.002	0.043	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	NA12878	2.348	2.471	0.0	0.027	0.229	0.229	1	1
chr11	190950	191169	DEL	220	NA18525	2.399	2.525	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	NA18939	2.419	2.546	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	NA19017	2.117	2.229	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	NA19238	1.821	1.917	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	NA19239	2.032	2.139	0.0	0.05	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	NA19625	1.656	1.743	0.0	0.056	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	NA19648	1.806	1.901	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr11	190950	191169	DEL	220	NA20502	1.91	2.011	0.0	0.04	nan	nan	0	2
chr11	190950	191169	DEL	220	NA20845	2.01	2.115	0.003	0.033	nan	nan	0	1
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG00096	0.838	0.838	0.0	0.0	0.64	0.67	1	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG00268	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG00419	1.226	1.226	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG00759	1.245	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG01051	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG01112	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG01500	0.792	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG01565	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG01583	1.472	1.472	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG01595	1.109	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG01879	1.215	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG02568	0.428	0.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG02922	1.164	1.164	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG03006	1.592	1.592	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG03052	0.641	0.641	0.0	0.071	0.405	0.405	1	1
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG03642	0.747	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	HG03742	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA12878	1.187	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA18525	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA18939	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA19017	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA19238	1.082	1.082	0.0	0.0	0.791	0.791	1	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA19239	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA19625	1.235	1.235	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA19648	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA20502	1.25	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	21813749	21813858	DEL	110	NA20845	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG00096	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG00268	0.344	0.362	0.0	0.0	1.0	1.0	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG00419	0.448	0.471	0.0	0.006	0.75	0.792	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG00759	0.664	0.699	0.0	0.009	0.524	0.524	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG01051	0.625	0.658	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG01112	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG01500	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG01565	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG01583	0.674	0.709	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG01595	0.779	0.82	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG01879	0.513	0.54	0.0	0.0	0.636	0.668	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG02568	0.505	0.532	0.0	0.0	0.833	0.833	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG02922	0.472	0.497	0.0	0.026	0.917	0.917	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG03006	1.289	1.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG03052	0.552	0.581	0.0	0.005	0.409	0.409	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG03642	0.399	0.42	0.0	0.0	0.5	0.5	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	HG03742	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA12878	0.507	0.534	0.0	0.0	0.8	0.8	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA18525	0.863	0.908	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA18939	0.614	0.646	0.0	0.008	0.607	0.607	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA19017	0.638	0.672	0.0	0.003	0.944	0.944	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA19238	0.602	0.634	0.0	0.003	0.833	0.833	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA19239	0.691	0.727	0.0	0.0	0.632	0.632	1	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA19625	0.578	0.609	0.0	0.006	nan	nan	0	1
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA19648	1.238	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA20502	0.731	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22010475	22010544	DEL	70	NA20845	0.436	0.459	0.0	0.022	0.5	0.5	1	1
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG00268	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG00419	1.216	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG00759	0.768	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG01051	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG01112	0.974	0.945	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG01500	0.755	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG01565	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG01583	0.424	0.412	0.0	0.075	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG02568	1.322	1.283	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG02922	1.12	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG03006	1.232	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG03052	1.215	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG03642	0.979	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	HG03742	1.313	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA12878	0.929	0.902	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA18525	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA19017	0.773	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA19238	1.013	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA19239	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA19625	1.367	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA19648	0.903	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA20502	0.684	0.664	0.0	0.065	nan	nan	0	2
chr11	22433876	22433992	DUP	117	NA20845	0.965	0.937	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG00096	0.514	0.481	0.0	0.015	0.8	0.838	2	1
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG00268	1.195	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG00419	1.173	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG00759	1.266	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG01051	0.712	0.665	0.0	0.033	0.661	0.661	2	1
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG01112	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG01500	1.377	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG01565	1.125	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG01583	1.198	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG01595	1.557	1.455	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG01879	0.722	0.674	0.0	0.035	0.655	0.688	2	1
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG02568	0.933	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG02922	1.317	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG03006	1.44	1.346	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG03052	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG03642	1.198	1.119	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	HG03742	1.272	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA12878	0.98	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA18525	1.033	0.966	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA18939	1.209	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA19017	1.266	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA19238	1.458	1.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA19239	1.124	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA19625	0.578	0.54	0.0	0.024	0.616	0.616	2	1
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA19648	0.593	0.554	0.0	0.034	0.804	0.857	2	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA20502	1.403	1.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23012584	23012637	DEL	54	NA20845	1.137	1.063	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG00096	0.743	0.682	0.0	0.054	0.87	0.911	1	1
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG00268	0.525	0.482	0.0	0.029	0.856	0.856	2	1
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG00419	1.429	1.311	0.0	0.0	0.848	0.896	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG00759	1.1	1.009	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG01051	1.337	1.227	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG01112	1.421	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG01500	0.604	0.554	0.0	0.044	0.621	0.621	3	1
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG01565	1.632	1.497	0.0	0.0	0.879	0.879	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG01583	0.699	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG01595	1.557	1.429	0.0	0.0	0.914	0.914	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG01879	1.728	1.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG02568	0.894	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG02922	1.317	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG03006	1.346	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG03052	0.751	0.689	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG03642	1.391	1.276	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	HG03742	0.718	0.659	0.0	0.021	0.583	0.58	2	1
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA12878	0.757	0.694	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA18525	1.15	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA18939	1.398	1.283	0.0	0.0	0.698	0.698	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA19017	0.831	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA19238	1.465	1.344	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA19239	1.328	1.218	0.0	0.0	0.827	0.827	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA19625	1.209	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA19648	1.341	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA20502	1.25	1.147	0.0	0.004	0.889	0.84	1	2
chr11	23313949	23314025	DEL	77	NA20845	0.505	0.464	0.0	0.035	0.9	0.9	2	1
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG00096	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG00268	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG00419	1.258	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG00759	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG01051	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG01112	1.295	1.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG01500	1.075	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG01565	0.904	0.904	0.0	0.002	0.947	0.947	1	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG01583	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG01879	0.987	0.987	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG02568	0.661	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG02922	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG03006	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG03642	1.365	1.365	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	HG03742	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA12878	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA18525	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA18939	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA19017	1.16	1.16	0.004	0.0	0.893	0.893	1	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA19238	1.273	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA19625	1.353	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA19648	1.135	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA20502	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23745403	23745712	DUP	310	NA20845	0.988	0.988	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG00096	1.429	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG00268	1.358	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG00419	0.981	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG01051	1.574	1.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG01112	1.168	1.062	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG01500	1.358	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG01879	1.253	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG02922	0.9	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG03052	1.127	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG03642	1.648	1.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	HG03742	1.313	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	NA12878	0.843	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	NA19625	1.104	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	NA19648	1.058	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	NA20502	0.896	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	23860742	23860886	DUP	145	NA20845	1.493	1.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG00096	0.991	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG00268	0.851	0.851	0.005	0.0	0.483	0.483	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG00419	1.024	1.024	0.0	0.0	0.88	0.929	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG00759	1.121	1.121	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG01051	0.841	0.841	0.0	0.0	0.385	0.385	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG01112	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG01500	1.056	1.056	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG01565	0.882	0.882	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG01583	0.674	0.674	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG01595	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG01879	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG02568	0.622	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG02922	1.142	1.142	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG03006	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG03052	0.486	0.486	0.065	0.0	nan	nan	0	1
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG03642	1.056	1.056	0.011	0.0	0.842	0.842	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	HG03742	0.677	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA12878	0.808	0.808	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA18525	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA18939	0.983	0.983	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA19017	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA19238	0.466	0.466	0.127	0.0	nan	nan	0	1
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA19239	1.165	1.165	0.0	0.0	0.902	0.902	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA19625	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA19648	1.083	1.083	0.0	0.0	0.737	0.691	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA20502	0.708	0.708	0.0	0.0	0.636	0.674	1	2
chr11	24460021	24460827	DEL	807	NA20845	0.85	0.85	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG00096	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG00268	0.0	0.0	0.012	0.184	nan	nan	0	0
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG00419	0.917	0.857	0.0	0.0	0.714	0.677	1	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG00759	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG01051	1.078	1.008	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG01112	0.604	0.564	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG01500	0.623	0.582	0.007	0.089	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG01565	1.279	1.195	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG01583	0.973	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG01595	1.344	1.256	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG01879	0.513	0.479	0.006	0.101	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG02568	0.855	0.799	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG02922	1.12	1.046	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG03006	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG03052	0.0	0.0	0.007	0.202	nan	nan	0	0
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG03642	0.592	0.554	0.0	0.078	0.333	0.333	3	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	HG03742	0.513	0.479	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA12878	0.74	0.691	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA18525	1.168	1.092	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA18939	0.888	0.83	0.007	0.078	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA19017	0.561	0.524	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA19238	0.616	0.576	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA19239	0.555	0.519	0.004	0.093	nan	nan	0	1
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA19625	0.736	0.688	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA19648	1.109	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA20502	0.0	0.0	0.02	0.202	nan	nan	0	0
chr11	26029428	26029664	DEL	237	NA20845	1.171	1.095	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG00096	0.8	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG00268	0.978	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG00419	0.64	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG00759	0.477	0.549	0.013	0.033	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG01051	0.604	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG01112	0.623	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG01500	0.849	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG01565	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG01583	0.599	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG01595	0.277	0.319	0.013	0.049	0.333	0.333	2	1
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG01879	0.589	0.677	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG02568	0.661	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG02922	0.703	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG03006	0.512	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG03052	0.596	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG03642	0.361	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	HG03742	0.677	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA12878	0.765	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA18525	0.737	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA18939	0.605	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA19017	0.619	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA19238	0.452	0.519	0.002	0.059	0.312	0.312	2	1
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA19239	0.826	0.95	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA19625	0.526	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA19648	0.774	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA20502	0.708	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26322472	26322715	DEL	244	NA20845	0.965	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG00096	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG00268	1.186	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG00419	1.024	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG00759	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG01051	1.229	1.193	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG01112	0.506	0.491	0.0	0.027	0.96	0.96	1	1
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG01500	0.849	0.824	0.0	0.016	0.352	0.352	1	1
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG01565	1.367	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG01583	0.849	0.824	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG01595	1.515	1.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG01879	1.177	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG02568	0.661	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG02922	0.593	0.575	0.0	0.052	0.917	0.917	1	1
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG03006	1.384	1.343	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG03052	1.127	1.094	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG03642	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	HG03742	1.262	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA12878	0.774	0.751	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA18525	0.898	0.872	0.0	0.023	0.442	0.442	1	1
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA18939	0.831	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA19017	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA19238	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA19239	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA19625	1.327	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA19648	0.645	0.626	0.0	0.035	0.654	0.613	1	1
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA20502	0.495	0.481	0.0	0.045	0.862	0.814	1	2
chr11	26405044	26405109	DEL	66	NA20845	1.263	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG00096	0.4	0.445	0.0	0.054	0.537	0.512	4	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG00268	0.398	0.443	0.0	0.069	0.444	0.444	1	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG00419	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG00759	1.1	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG01051	0.345	0.383	0.0	0.049	0.808	0.808	4	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG01112	1.11	1.233	0.0	0.0	0.826	0.826	4	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG01500	0.472	0.524	0.0	0.081	0.485	0.485	1	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG01565	0.838	0.931	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG01583	0.349	0.388	0.0	0.027	nan	nan	0	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG01595	0.555	0.616	0.0	0.018	nan	nan	0	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG01879	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG02568	1.089	1.21	0.0	0.0	0.784	0.784	2	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG02922	0.714	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG03052	0.85	0.945	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG03642	0.67	0.744	0.0	0.056	0.777	0.777	2	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	HG03742	0.451	0.502	0.0	0.106	0.909	0.957	4	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA12878	0.86	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA18525	0.305	0.339	0.0	0.053	0.737	0.737	4	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA18939	0.435	0.483	0.0	0.052	0.472	0.472	4	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA19017	0.715	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA19238	1.219	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA19239	1.043	1.159	0.0	0.0	0.725	0.725	1	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA19625	0.0	0.0	0.011	0.079	nan	nan	0	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA19648	0.49	0.545	0.0	0.076	0.756	0.765	2	2
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA20502	0.59	0.655	0.0	0.037	0.519	0.514	2	1
chr11	26679948	26680047	DEL	100	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG00096	0.4	0.421	0.016	0.098	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG00268	0.507	0.534	0.01	0.091	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG00419	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG00759	0.768	0.808	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG01051	0.0	0.0	0.022	0.198	nan	nan	0	0
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG01112	0.312	0.328	0.024	0.146	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG01500	0.0	0.0	0.031	0.193	nan	nan	0	0
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG01565	0.507	0.534	0.009	0.092	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG01583	0.449	0.473	0.013	0.047	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG01595	0.448	0.472	0.017	0.109	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG01879	0.0	0.0	0.017	0.182	nan	nan	0	0
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG02568	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG02922	0.922	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG03006	0.891	0.938	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG03052	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG03642	0.592	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	HG03742	0.759	0.799	0.0	0.0	0.857	0.902	1	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA12878	0.344	0.362	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA18525	0.539	0.567	0.009	0.068	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA18939	0.397	0.418	0.009	0.15	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA19017	0.425	0.448	0.008	0.084	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA19238	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA19239	0.393	0.414	0.008	0.088	nan	nan	0	1
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA19625	0.788	0.83	0.0	0.0	0.35	0.35	1	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA19648	0.567	0.597	0.0	0.0	0.7	0.747	1	2
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA20502	0.0	0.0	0.011	0.247	nan	nan	0	0
chr11	27657262	27657596	DEL	335	NA20845	0.299	0.314	0.009	0.078	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG00096	0.286	0.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG00268	0.398	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG00419	0.469	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG00759	0.208	0.273	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG01051	0.323	0.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG01112	0.195	0.256	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG01500	0.415	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG01565	0.132	0.174	0.0	0.102	0.846	0.846	2	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG01583	0.349	0.46	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG01595	0.256	0.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG01879	0.494	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG02568	0.0	0.0	0.021	0.064	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	0
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG03006	0.265	0.349	0.0	0.108	0.609	0.609	2	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG03052	0.486	0.639	0.011	0.128	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG03642	0.67	0.881	0.0	0.163	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	HG03742	0.062	0.081	0.0	0.094	0.6	0.632	2	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA12878	0.482	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA18525	0.27	0.355	0.016	0.117	0.484	0.484	2	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA19017	0.0	0.0	0.019	0.184	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA19238	0.452	0.595	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA19239	0.433	0.57	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA19625	0.237	0.311	0.013	0.129	nan	nan	0	1
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA19648	0.31	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA20502	0.425	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	27822222	27822418	DEL	197	NA20845	0.23	0.302	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG00096	0.762	0.762	0.0	0.0	0.75	0.716	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG00419	1.088	1.088	0.0	0.0	0.48	0.455	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG00759	0.664	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG01051	0.345	0.345	0.0	0.04	0.625	0.625	1	1
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG01112	1.012	1.012	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG01500	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG01565	0.463	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG01583	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG01595	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG01879	0.551	0.551	0.0	0.013	0.571	0.569	2	1
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG02568	0.933	0.933	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG02922	0.966	0.966	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG03006	0.815	0.815	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG03052	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG03642	0.592	0.592	0.0	0.007	0.333	0.333	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	HG03742	0.882	0.882	0.0	0.0	0.944	0.897	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA12878	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA18525	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA18939	0.605	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA19017	0.889	0.889	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA19238	0.657	0.657	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA19239	0.352	0.352	0.0	0.028	0.853	0.853	1	1
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA19625	0.578	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA19648	0.413	0.413	0.0	0.044	0.775	0.783	2	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA20502	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	2814636	2814707	DEL	72	NA20845	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG00096	0.248	0.261	0.07	0.0	0.444	0.466	1	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG00268	0.326	0.343	0.084	0.0	0.333	0.333	1	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG00419	0.746	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG00759	0.623	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG01051	0.863	0.908	0.0	0.004	0.726	0.726	2	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG01112	0.584	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG01500	0.604	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG01565	0.0	0.0	0.054	0.0	nan	nan	0	0
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG01583	0.399	0.42	0.078	0.0	0.333	0.333	1	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG01595	0.469	0.494	0.079	0.0	0.364	0.364	1	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG01879	0.665	0.7	0.005	0.004	1.0	0.952	1	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG02568	0.311	0.327	0.01	0.0	nan	nan	0	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG02922	0.703	0.739	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG03006	0.341	0.359	0.022	0.0	nan	nan	0	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG03052	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG03642	0.67	0.705	0.073	0.003	0.455	0.455	1	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	HG03742	0.492	0.518	0.0	0.0	0.693	0.689	2	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA12878	0.344	0.362	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA18525	0.665	0.7	0.0	0.0	0.669	0.669	2	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA18939	0.378	0.398	0.101	0.0	0.769	0.769	1	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA19017	0.464	0.488	0.061	0.0	0.375	0.375	1	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA19238	0.37	0.389	0.069	0.0	nan	nan	0	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA19239	0.745	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA19625	0.42	0.443	0.075	0.0	nan	nan	0	1
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA19648	0.748	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA20502	0.778	0.819	0.0	0.0	0.611	0.609	2	2
chr11	29139370	29140327	DEL	958	NA20845	0.345	0.363	0.039	0.0	0.667	0.667	1	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG00096	0.591	0.552	0.164	0.097	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG00268	0.435	0.406	0.097	0.06	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG00419	0.384	0.359	0.126	0.094	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG00759	0.706	0.66	0.098	0.062	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG01051	1.294	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG01112	0.526	0.491	0.088	0.071	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG01500	1.358	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG01565	1.389	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG01583	0.399	0.373	0.065	0.031	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG01595	0.747	0.698	0.111	0.07	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG01879	1.177	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG02568	0.622	0.581	0.07	0.049	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG02922	0.988	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG03006	0.644	0.602	0.112	0.063	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG03052	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG03642	0.695	0.65	0.077	0.058	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	HG03742	1.416	1.323	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA12878	0.482	0.45	0.088	0.062	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA18525	0.485	0.453	0.096	0.056	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA18939	1.134	1.06	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA19017	0.0	0.0	0.269	0.192	nan	nan	0	0
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA19238	0.534	0.499	0.115	0.051	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA19239	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA19625	0.552	0.516	0.086	0.08	nan	nan	0	1
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA19648	1.186	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA20502	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	29967582	29968470	DEL	889	NA20845	0.712	0.665	0.061	0.043	nan	nan	0	1
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG00096	0.981	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG00268	0.634	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG00419	0.725	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG00759	0.892	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG01051	0.669	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG01112	0.623	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG01500	1.207	1.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG01565	0.838	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG01583	0.948	1.2	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG01595	0.811	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG01879	0.551	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG02568	0.894	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG02922	0.768	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG03006	0.796	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG03052	0.376	0.475	0.0	0.037	0.667	0.667	1	1
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG03642	1.21	1.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	HG03742	0.636	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA12878	0.912	1.154	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA18525	0.755	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA18939	0.888	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA19017	0.735	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA19238	1.013	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA19239	0.704	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA19625	0.499	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA19648	0.671	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA20502	0.743	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	30471047	30471114	DEL	68	NA20845	0.505	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG00096	0.8	0.8	0.0	0.0	0.692	0.725	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG00268	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG00419	0.746	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG00759	0.809	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG01051	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG01112	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG01500	1.019	1.019	0.0	0.0	0.762	0.762	2	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG01565	0.684	0.684	0.0	0.011	0.75	0.75	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG01583	0.774	0.774	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG01595	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG01879	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG02568	0.622	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG02922	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG03006	0.796	0.796	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG03052	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG03642	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	HG03742	0.985	0.985	0.0	0.0	0.708	0.746	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA12878	0.722	0.722	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA18525	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA18939	1.077	1.077	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA19017	1.005	1.005	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA19238	1.068	1.068	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA19239	0.501	0.501	0.017	0.068	nan	nan	0	1
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA19625	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA19648	0.929	0.929	0.0	0.0	1.0	0.938	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA20502	0.802	0.802	0.0	0.0	0.688	0.728	1	2
chr11	31860035	31860571	DEL	537	NA20845	0.712	0.712	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG00096	0.781	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG00268	0.86	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG00419	0.768	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG00759	0.851	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG01051	0.388	0.363	0.0	0.026	0.538	0.538	1	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG01112	0.681	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG01500	0.66	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG01565	0.904	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG01583	0.699	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG01595	0.747	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG01879	0.779	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG02568	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG02922	0.483	0.451	0.0	0.006	0.444	0.444	1	1
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG03006	0.644	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG03052	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG03642	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	HG03742	1.067	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA12878	0.774	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA18525	0.809	0.756	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA18939	0.718	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA19017	0.677	0.632	0.0	0.027	0.389	0.389	1	1
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA19238	0.856	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA19239	0.535	0.5	0.0	0.034	0.583	0.583	1	1
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA19625	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA19648	0.877	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA20502	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	32353319	32353378	DEL	60	NA20845	0.689	0.644	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG00096	0.648	0.72	0.0	0.0	0.839	0.879	2	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG00268	0.543	0.604	0.046	0.11	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG00419	1.002	1.114	0.007	0.0	0.879	0.881	2	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG00759	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG01051	0.733	0.815	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG01112	0.292	0.325	0.104	0.101	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG01500	0.811	0.901	0.0	0.0	0.929	0.929	2	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG01565	0.309	0.343	0.055	0.084	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG01583	0.449	0.499	0.053	0.124	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG01595	0.896	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG01879	0.0	0.0	0.127	0.263	nan	nan	0	0
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG02568	0.739	0.821	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG02922	0.241	0.268	0.099	0.078	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG03006	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG03052	0.486	0.54	0.038	0.085	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG03642	1.004	1.116	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	HG03742	0.451	0.502	0.047	0.091	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA12878	0.31	0.344	0.011	0.053	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA18525	0.934	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA18939	0.435	0.483	0.046	0.072	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA19017	0.677	0.752	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA19238	0.917	1.019	0.0	0.0	0.671	0.671	4	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA19239	0.881	0.978	0.0	0.0	0.923	0.923	4	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA19625	0.788	0.876	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA19648	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA20502	0.637	0.708	0.04	0.108	nan	nan	0	1
chr11	34728119	34728613	DEL	495	NA20845	0.804	0.893	0.0	0.0	0.95	0.95	2	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG00096	0.972	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG00268	0.96	0.881	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG00419	1.024	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG00759	1.204	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG01051	1.143	1.049	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG01112	0.993	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG01500	1.0	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG01565	0.882	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG01583	1.073	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG01595	0.939	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG01879	0.817	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG02568	1.283	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG02922	1.054	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG03006	0.948	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG03052	1.127	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG03642	0.979	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	HG03742	0.903	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA12878	0.929	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA18525	1.096	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA18939	1.002	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA19017	1.102	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA19238	0.466	0.427	0.0	0.046	0.83	0.83	2	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA19239	0.935	0.858	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA19625	0.315	0.289	0.0	0.045	0.812	0.813	1	1
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA19648	1.47	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA20502	0.684	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37734275	37734347	DEL	73	NA20845	1.493	1.37	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG00096	1.01	1.278	0.0	0.0	0.527	0.523	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG00268	1.069	1.353	0.0	0.0	0.804	0.804	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG00419	1.301	1.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG00759	1.017	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG01051	1.078	1.365	0.0	0.0	0.596	0.596	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG01112	0.954	1.208	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG01500	1.094	1.385	0.0	0.0	0.8	0.8	5	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG01565	1.345	1.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG01583	1.173	1.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG01595	0.981	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG01879	1.158	1.466	0.0	0.003	0.797	0.836	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG02568	0.816	1.034	0.0	0.0	0.508	0.508	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG02922	0.395	0.5	0.0	0.042	0.638	0.638	2	1
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG03006	1.099	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG03052	0.994	1.258	0.0	0.0	0.746	0.746	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG03642	1.133	1.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	HG03742	1.067	1.35	0.0	0.0	0.696	0.732	1	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA12878	0.946	1.197	0.0	0.0	0.529	0.529	1	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA18525	0.845	1.069	0.0	0.0	0.751	0.751	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA18939	1.172	1.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA19017	0.947	1.199	0.0	0.0	0.648	0.648	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA19238	1.095	1.387	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA19239	1.016	1.286	0.0	0.0	0.781	0.781	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA19625	1.209	1.53	0.0	0.0	0.675	0.675	2	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA19648	0.954	1.208	0.009	0.0	0.667	0.625	1	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA20502	1.061	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37753363	37753417	DEL	55	NA20845	0.735	0.93	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG00096	1.0	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG00268	0.978	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG00419	1.365	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG00759	1.391	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG01051	1.1	1.028	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG01112	1.227	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG01500	1.17	1.093	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG01565	1.036	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG01583	1.797	1.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG01595	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG01879	0.968	0.905	0.0	0.0	0.567	0.54	1	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG02568	1.264	1.181	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG02922	1.449	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG03006	1.403	1.311	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG03052	1.546	1.445	0.0	0.0	0.853	0.853	1	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG03642	1.236	1.155	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	HG03742	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA18525	0.863	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA18939	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA19017	0.928	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA19238	1.383	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA19239	0.989	0.924	0.0	0.0	0.971	0.971	1	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA19625	1.209	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA19648	1.212	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA20502	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	37793218	37793347	DUP	130	NA20845	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG00096	0.877	0.923	0.0	0.0	0.861	0.821	4	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG00268	1.032	1.087	0.0	0.0	0.945	0.945	4	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG00419	1.109	1.167	0.0	0.0	0.938	0.962	4	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG00759	0.955	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG01051	0.949	0.999	0.0	0.0	0.842	0.842	4	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG01112	0.857	0.902	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG01500	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG01565	0.904	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG01583	0.973	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG01595	0.853	0.898	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG01879	0.912	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG02568	1.283	1.351	0.0	0.0	0.686	0.686	2	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG02922	0.922	0.971	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG03006	1.232	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG03052	1.038	1.093	0.0	0.0	0.65	0.65	3	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG03642	1.004	1.057	0.0	0.0	0.89	0.89	4	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	HG03742	0.821	0.864	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA12878	0.912	0.96	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA18525	0.881	0.927	0.004	0.0	0.84	0.84	1	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA18939	0.907	0.955	0.0	0.0	0.75	0.75	4	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA19017	0.928	0.977	0.0	0.0	0.885	0.885	3	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA19238	0.986	1.038	0.0	0.0	0.914	0.914	2	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA19239	0.501	0.528	0.05	0.081	nan	nan	0	1
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA19625	0.815	0.858	0.0	0.0	0.711	0.711	2	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA19648	1.058	1.113	0.0	0.0	0.776	0.781	4	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA20502	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	3982355	3982861	DEL	507	NA20845	1.079	1.136	0.0	0.0	0.849	0.849	4	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG00096	1.143	1.203	0.0	0.0	0.774	0.739	1	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG00268	1.032	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG00419	0.938	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG00759	0.498	0.524	0.0	0.055	0.375	0.375	3	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG01051	0.518	0.545	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG01112	1.11	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG01500	0.472	0.496	0.0	0.114	0.842	0.842	1	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG01565	0.904	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG01583	0.574	0.604	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG01595	0.576	0.606	0.0	0.0	0.278	0.278	1	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG01879	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG02568	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG02922	0.768	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG03006	1.175	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG03052	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG03642	1.159	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	HG03742	0.595	0.626	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA12878	0.808	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA18525	0.916	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA19017	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA19238	1.02	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA19239	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA19625	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA19648	1.109	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA20502	1.25	1.316	0.0	0.0	0.679	0.641	1	2
chr11	41729750	41729939	DEL	190	NA20845	0.62	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG00096	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG00268	0.815	0.815	0.004	0.0	0.864	0.864	1	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG00419	0.448	0.448	0.04	0.027	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG00759	0.0	0.0	0.364	0.209	nan	nan	0	0
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG01051	0.302	0.302	0.076	0.063	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG01112	0.467	0.467	0.077	0.06	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG01500	0.0	0.0	0.29	0.163	nan	nan	0	0
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG01565	0.463	0.463	0.058	0.055	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG01583	0.324	0.324	0.056	0.031	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG01595	0.405	0.405	0.104	0.074	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG01879	1.044	1.044	0.003	0.007	nan	nan	0	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG02568	0.0	0.0	0.12	0.106	nan	nan	0	0
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG02922	1.032	1.032	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG03006	0.436	0.436	0.059	0.029	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG03052	0.0	0.0	0.198	0.15	nan	nan	0	0
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG03642	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	HG03742	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA12878	0.447	0.447	0.05	0.02	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA18525	0.0	0.0	0.304	0.176	nan	nan	0	0
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA18939	0.0	0.0	0.253	0.157	nan	nan	0	0
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA19017	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA19238	0.452	0.452	0.066	0.037	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA19239	0.975	0.975	0.0	0.0	0.853	0.853	1	2
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA19625	0.447	0.447	0.043	0.025	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA19648	0.567	0.567	0.035	0.022	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA20502	0.425	0.425	0.089	0.057	nan	nan	0	1
chr11	41818199	41819025	DEL	827	NA20845	0.0	0.0	0.212	0.141	nan	nan	0	0
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG00096	0.362	0.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG00268	0.326	0.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG00419	0.171	0.19	0.028	0.118	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG00759	0.0	0.0	0.032	0.172	nan	nan	0	0
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG01051	0.108	0.12	0.022	0.147	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG01112	0.156	0.173	0.023	0.099	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG01500	0.0	0.0	0.052	0.187	nan	nan	0	0
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG01565	0.11	0.123	0.014	0.064	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG01583	0.1	0.111	0.016	0.096	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG01595	0.384	0.427	0.015	0.092	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG01879	0.38	0.422	0.006	0.004	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG02568	0.505	0.562	0.019	0.198	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG02922	0.373	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG03006	0.171	0.19	0.006	0.085	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG03052	0.508	0.565	0.065	0.254	nan	nan	0	0
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG03642	0.258	0.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	HG03742	0.287	0.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA12878	0.275	0.306	0.004	0.092	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA18525	0.593	0.659	0.019	0.234	nan	nan	0	0
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA18939	0.0	0.0	0.011	0.192	nan	nan	0	0
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA19017	0.29	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA19238	0.233	0.259	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA19239	0.596	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA19625	0.315	0.35	0.008	0.111	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA19648	0.284	0.315	0.021	0.101	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA20502	0.094	0.105	0.009	0.089	nan	nan	0	1
chr11	41822280	41822607	DEL	328	NA20845	0.597	0.664	0.028	0.198	nan	nan	0	0
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG00096	1.048	0.979	0.0	0.0	0.931	0.889	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG00268	1.34	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG00419	1.066	0.997	0.0	0.0	0.88	0.834	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG00759	1.287	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG01051	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG01112	1.227	1.146	0.0	0.0	0.935	0.935	3	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG01500	1.245	1.164	0.0	0.0	0.646	0.646	4	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG01565	1.169	1.092	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG01583	0.873	0.816	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG01595	1.173	1.096	0.0	0.0	0.338	0.338	2	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG01879	1.348	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG02568	0.855	0.799	0.017	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG02922	1.207	1.128	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG03006	1.308	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG03052	1.171	1.094	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG03642	1.21	1.131	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	HG03742	1.293	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA12878	1.084	1.013	0.0	0.0	0.828	0.828	2	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA18525	1.168	1.092	0.0	0.003	0.933	0.933	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA18939	1.115	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA19017	0.638	0.596	0.016	0.098	nan	nan	0	1
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA19238	0.986	0.921	0.0	0.0	0.973	0.973	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA19239	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA19625	0.999	0.933	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA19648	1.083	1.012	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA20502	0.849	0.794	0.0	0.0	0.643	0.607	1	2
chr11	42979714	42980092	DEL	379	NA20845	1.171	1.095	0.0	0.0	0.44	0.44	1	2
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG00096	0.0	0.0	0.027	0.152	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG00268	0.706	0.812	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG00419	0.0	0.0	0.006	0.132	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG00759	0.0	0.0	0.027	0.119	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG01051	0.259	0.297	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG01112	0.428	0.492	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG01500	0.434	0.499	0.004	0.058	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG01565	0.838	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG01583	0.499	0.574	0.014	0.022	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG01595	0.256	0.294	0.012	0.063	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG01879	0.475	0.546	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG02568	0.467	0.536	0.014	0.019	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG02922	0.417	0.479	0.022	0.044	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG03006	0.0	0.0	0.043	0.111	0.062	0.062	2	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG03052	0.464	0.533	0.013	0.041	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG03642	0.361	0.414	0.011	0.078	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	HG03742	0.533	0.613	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA12878	0.275	0.316	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA18939	0.0	0.0	0.026	0.155	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA19017	0.445	0.511	0.01	0.056	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA19238	0.0	0.0	0.007	0.105	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA19239	0.447	0.514	0.006	0.053	nan	nan	0	1
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA19625	0.0	0.0	0.016	0.124	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA19648	0.567	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA20502	0.0	0.0	0.042	0.132	nan	nan	0	0
chr11	43909603	43909911	DEL	309	NA20845	0.0	0.0	0.004	0.118	nan	nan	0	0
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG00096	0.896	0.943	0.0	0.0	0.737	0.772	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG00268	0.906	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG00419	1.109	1.167	0.0	0.0	0.962	0.985	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG00759	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG01051	0.755	0.795	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG01112	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG01500	1.019	1.072	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG01565	1.036	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG01583	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG01595	0.917	0.966	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG01879	0.949	0.999	0.0	0.0	0.957	0.996	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG02568	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG02922	0.417	0.439	0.114	0.066	nan	nan	0	1
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG03006	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG03052	1.149	1.209	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG03642	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	HG03742	0.8	0.842	0.007	0.005	0.882	0.838	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA12878	0.963	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA18525	0.773	0.813	0.0	0.004	0.607	0.607	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA18939	0.907	0.955	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA19017	0.928	0.977	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA19238	0.945	0.995	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA19239	0.962	1.012	0.003	0.0	0.737	0.737	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA19625	0.736	0.775	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA19648	1.161	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA20502	1.014	1.068	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr11	45356503	45357235	DEL	733	NA20845	0.942	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG00096	0.991	1.043	0.0	0.0	0.929	0.886	1	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG00268	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG00419	0.981	1.033	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG00759	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG01051	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG01112	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG01500	1.0	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG01565	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG01583	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG01595	1.003	1.055	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG01879	0.741	0.78	0.0	0.0	0.785	0.824	2	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG02568	0.778	0.819	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG02922	0.944	0.994	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG03006	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG03052	0.486	0.512	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG03642	0.773	0.813	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	HG03742	0.944	0.993	0.0	0.0	0.462	0.486	1	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA12878	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA18525	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA18939	0.813	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA19017	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA19238	1.027	1.081	0.0	0.0	0.651	0.651	1	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA19239	0.461	0.485	0.003	0.092	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA19625	0.736	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA19648	1.135	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA20502	1.061	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	4574499	4574818	DEL	320	NA20845	0.62	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG00096	0.762	0.847	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG00268	1.014	1.127	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG00419	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG00759	0.83	0.922	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG01051	0.41	0.455	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG01112	0.876	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG01500	0.924	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG01565	0.882	0.98	0.0	0.002	0.857	0.857	1	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG01583	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG01595	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG01879	0.627	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG02568	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG02922	0.659	0.732	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG03006	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG03052	0.464	0.515	0.042	0.066	nan	nan	0	1
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG03642	0.489	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	HG03742	0.944	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA12878	0.843	0.936	0.0	0.0	0.52	0.52	1	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA18525	0.988	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA18939	0.661	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA19017	0.715	0.795	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA19238	0.808	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA19239	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA19625	0.788	0.876	0.0	0.009	0.784	0.784	2	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA19648	1.083	1.204	0.0	0.0	0.455	0.485	1	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA20502	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	46020193	46020642	DEL	450	NA20845	0.781	0.868	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG00096	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG00268	0.942	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG00419	1.344	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG00759	1.432	1.39	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG01051	1.078	1.047	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG01112	1.324	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG01500	1.188	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG01565	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG01583	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG01595	1.301	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG01879	1.367	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG02568	0.389	0.377	0.0	0.041	0.5	0.5	1	1
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG02922	1.295	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG03006	1.08	1.049	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG03052	1.281	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG03642	1.442	1.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	HG03742	1.375	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA12878	1.221	1.186	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA18525	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA18939	1.19	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA19017	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA19238	1.178	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA19239	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA19625	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA19648	1.109	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA20502	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	55770111	55770189	DEL	79	NA20845	1.286	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG00096	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG00268	1.449	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG00419	1.322	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG00759	1.245	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG01051	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG01112	1.285	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG01500	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG01565	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG01583	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG01595	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG01879	1.234	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG02568	0.661	0.618	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG02922	1.164	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG03006	1.422	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG03052	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG03642	0.953	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	HG03742	1.067	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA12878	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA18525	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA18939	1.172	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA19017	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA19238	1.068	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA19239	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA19625	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA19648	1.135	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA20502	1.226	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56235866	56236129	DEL	264	NA20845	1.011	0.944	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG00096	1.029	0.999	0.0	0.0	0.479	0.48	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG00268	0.543	0.528	0.04	0.047	nan	nan	0	1
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG00419	1.216	1.18	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG00759	1.266	1.229	0.0	0.0	0.745	0.745	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG01051	1.208	1.173	0.0	0.0	0.852	0.852	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG01112	0.915	0.888	0.0	0.0	0.734	0.734	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG01500	1.453	1.41	0.005	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG01565	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG01583	1.248	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG01595	1.216	1.18	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG01879	1.044	1.014	0.0	0.0	0.611	0.642	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG02568	1.011	0.981	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG02922	1.098	1.066	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG03006	1.478	1.435	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG03052	1.038	1.008	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG03642	1.416	1.375	0.0	0.004	0.75	0.75	3	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	HG03742	1.457	1.414	0.0	0.0	0.823	0.823	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA12878	1.032	1.002	0.0	0.0	0.855	0.855	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA18525	1.204	1.169	0.0	0.0	0.777	0.777	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA18939	1.379	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA19017	1.315	1.276	0.0	0.0	0.716	0.716	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA19238	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA19239	1.409	1.368	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA19625	1.261	1.225	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA19648	1.109	1.077	0.0	0.0	0.682	0.639	2	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA20502	1.297	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	56439727	56440307	DEL	581	NA20845	0.804	0.78	0.023	0.045	nan	nan	0	1
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG00096	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG00268	0.869	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG00419	0.704	0.741	0.0	0.0	0.875	0.924	1	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG00759	0.706	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG01051	0.69	0.726	0.0	0.0	0.214	0.214	1	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG01112	0.633	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG01500	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG01565	0.617	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG01583	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG01595	0.64	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG01879	0.874	0.92	0.0	0.0	0.769	0.733	1	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG02568	0.972	1.023	0.0	0.0	0.143	0.143	1	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG02922	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG03006	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG03052	0.729	0.767	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG03642	0.67	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	HG03742	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA12878	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA18525	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA18939	0.51	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA19017	0.638	0.672	0.0	0.0	0.564	0.564	2	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA19238	0.89	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA19239	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA19625	0.631	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA19648	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA20502	1.085	1.142	0.0	0.0	0.842	0.892	1	1
chr11	60451053	60451796	DEL	744	NA20845	0.712	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG00096	0.476	0.462	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG00268	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG00419	0.597	0.58	0.004	0.063	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG00759	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG01051	0.582	0.565	0.007	0.063	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG01112	0.565	0.548	0.013	0.088	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG01500	0.528	0.513	0.008	0.083	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG01565	0.573	0.557	0.017	0.046	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG01583	0.599	0.582	0.008	0.075	0.385	0.385	3	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG01595	1.408	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG01879	1.31	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG02568	1.128	1.095	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG02922	1.032	1.002	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG03006	1.346	1.307	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG03052	1.06	1.029	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG03642	0.386	0.375	0.0	0.144	0.727	0.727	1	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	HG03742	1.313	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA12878	0.499	0.484	0.004	0.065	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA18525	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA18939	0.472	0.459	0.004	0.1	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA19017	0.58	0.563	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA19238	1.219	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA19239	1.124	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA19625	0.631	0.612	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA19648	0.0	0.0	0.014	0.183	nan	nan	0	0
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA20502	0.613	0.595	0.009	0.093	nan	nan	0	1
chr11	61944785	61945082	DEL	298	NA20845	1.401	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG00096	1.048	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG00268	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG00419	1.194	1.159	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG00759	0.913	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG01112	1.343	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG01500	1.471	1.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG01565	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG01583	1.098	1.066	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG01595	1.173	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG01879	1.263	1.226	0.0	0.009	0.595	0.625	1	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG02922	0.571	0.554	0.008	0.059	0.19	0.19	11	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG03006	1.384	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG03642	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	HG03742	1.211	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA12878	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA18525	1.402	1.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA18939	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA19017	1.16	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA19238	1.273	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA19239	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA19625	0.946	0.919	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA19648	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA20502	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62050374	62050519	DUP	146	NA20845	1.056	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG00096	0.743	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG00268	0.743	0.854	0.0	0.0	0.746	0.746	2	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG00419	0.81	0.932	0.0	0.0	0.643	0.679	1	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG00759	0.747	0.859	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG01051	0.345	0.397	0.0	0.0	0.792	0.792	4	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG01112	0.623	0.716	0.0	0.0	0.667	0.667	6	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG01500	0.849	0.976	0.0	0.004	0.773	0.773	3	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG01565	0.728	0.836	0.0	0.0	0.676	0.676	4	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG01583	0.699	0.803	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG01595	0.491	0.564	0.0	0.0	0.492	0.492	2	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG01879	0.76	0.873	0.0	0.006	0.67	0.703	4	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG02568	0.778	0.894	0.0	0.0	0.661	0.661	2	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG02922	0.263	0.303	0.035	0.013	nan	nan	0	1
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG03006	0.663	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG03052	0.574	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG03642	0.695	0.799	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	HG03742	0.698	0.802	0.0	0.0	0.515	0.526	4	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA12878	0.86	0.988	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA18525	1.06	1.219	0.0	0.0	0.808	0.808	4	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA18939	0.68	0.782	0.0	0.0	0.556	0.556	7	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA19017	0.773	0.889	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA19238	0.356	0.409	0.03	0.0	nan	nan	0	1
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA19239	0.772	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA19625	0.657	0.755	0.0	0.0	0.75	0.75	4	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA19648	0.619	0.712	0.0	0.0	0.8	0.75	4	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA20502	0.684	0.786	0.0	0.0	0.583	0.551	1	2
chr11	62182687	62183408	DEL	722	NA20845	0.712	0.818	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG00096	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG00268	0.924	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG00419	0.64	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG00759	0.685	0.721	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG01051	0.539	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG01112	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG01500	0.849	0.894	0.0	0.0	0.792	0.792	2	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG01565	0.309	0.325	0.059	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG01583	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG01595	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG01879	0.57	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG02568	0.389	0.409	0.062	0.0	0.792	0.792	14	1
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG02922	0.812	0.855	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG03006	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG03052	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG03642	0.85	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	HG03742	0.616	0.648	0.0	0.0	0.879	0.835	2	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA12878	0.946	0.996	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA18525	0.791	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA18939	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA19017	0.793	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA19238	0.726	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA19239	0.786	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA19625	0.604	0.636	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA19648	0.8	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA20502	0.708	0.745	0.0	0.0	0.474	0.484	2	2
chr11	63568332	63569299	DEL	968	NA20845	0.643	0.677	0.0	0.005	0.9	0.9	1	2
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.023	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.058	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.023	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG01879	0.285	0.361	0.0	0.032	0.765	0.803	1	1
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG02568	0.467	0.591	0.0	0.038	0.667	0.667	1	1
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG03052	0.243	0.308	0.0	0.036	0.647	0.647	1	1
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA19017	0.735	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA19238	0.329	0.416	0.0	0.016	0.84	0.84	1	1
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA19239	0.555	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr11	64268439	64268499	DEL	61	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	0
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG00096	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG00268	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG00419	0.789	0.789	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG00759	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG01051	0.679	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG01112	0.818	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG01500	0.924	0.924	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG01565	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG01583	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG01595	0.64	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG01879	0.361	0.361	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG02568	1.283	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG02922	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG03006	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG03052	1.193	1.193	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG03642	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	HG03742	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA12878	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA18525	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA18939	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA19017	1.083	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA19238	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA19239	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA19625	1.156	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA19648	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA20502	1.156	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6430872	6431067	DEL	196	NA20845	0.781	0.781	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG00096	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG00268	0.96	1.01	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG00419	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG00759	0.913	0.961	0.006	0.0	0.579	0.579	1	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG01051	0.755	0.795	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG01112	0.681	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG01500	0.83	0.874	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG01565	1.058	1.114	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG01595	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG01879	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG02568	0.505	0.532	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG03052	0.751	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG03642	0.979	1.03	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	HG03742	0.41	0.432	0.019	0.069	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA12878	0.963	1.014	0.0	0.0	0.899	0.899	2	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA18525	0.773	0.813	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA18939	0.794	0.835	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA19017	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA19238	0.794	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA19239	1.097	1.155	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA19625	0.736	0.775	0.0	0.0	0.819	0.819	2	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA19648	0.98	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6573063	6573511	DUP	449	NA20502	0.943	0.993	0.0	0.0	0.529	0.561	1	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG00096	0.915	0.963	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG00268	0.815	0.858	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG00419	1.002	1.055	0.004	0.0	0.834	0.832	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG00759	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG01051	0.388	0.409	0.039	0.04	0.438	0.438	6	1
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG01112	1.11	1.168	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG01500	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG01565	1.147	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG01583	1.223	1.287	0.0	0.0	0.832	0.832	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG01595	0.789	0.831	0.0	0.0	0.773	0.773	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG01879	0.987	1.039	0.0	0.0	0.699	0.703	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG02568	1.283	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG02922	0.966	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG03006	1.137	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG03052	0.817	0.86	0.005	0.0	0.708	0.708	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG03642	0.901	0.949	0.0	0.0	0.929	0.929	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	HG03742	1.354	1.425	0.0	0.0	0.841	0.843	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA12878	1.049	1.104	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA18525	0.988	1.04	0.002	0.001	0.746	0.746	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA18939	0.926	0.975	0.0	0.002	0.962	0.962	1	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA19017	0.87	0.916	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA19238	0.917	0.966	0.0	0.0	0.852	0.852	2	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA19239	0.826	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA19625	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA19648	1.058	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA20502	1.085	1.142	0.0	0.0	0.929	0.983	1	2
chr11	65884154	65884733	DEL	580	NA20845	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	HG00096	0.0	0.0	0.113	0.01	nan	nan	0	0
chr11	677313	677769	DEL	457	HG00268	0.489	0.515	0.017	0.004	nan	nan	0	1
chr11	677313	677769	DEL	457	HG00419	0.0	0.0	0.1	0.007	nan	nan	0	0
chr11	677313	677769	DEL	457	HG00759	0.374	0.393	0.0	0.0	0.483	0.483	12	1
chr11	677313	677769	DEL	457	HG01051	0.41	0.431	0.022	0.005	0.3	0.3	11	1
chr11	677313	677769	DEL	457	HG01112	0.37	0.389	0.032	0.007	0.5	0.5	13	1
chr11	677313	677769	DEL	457	HG01500	0.453	0.477	0.007	0.0	nan	nan	0	1
chr11	677313	677769	DEL	457	HG01565	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	HG01583	0.424	0.447	0.012	0.006	0.429	0.429	12	1
chr11	677313	677769	DEL	457	HG01595	0.0	0.0	0.056	0.0	nan	nan	0	0
chr11	677313	677769	DEL	457	HG01879	0.93	0.979	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	HG02568	0.0	0.0	0.063	0.0	nan	nan	0	0
chr11	677313	677769	DEL	457	HG02922	1.076	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	HG03006	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	HG03052	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	HG03642	0.386	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr11	677313	677769	DEL	457	HG03742	0.0	0.0	0.072	0.0	nan	nan	0	0
chr11	677313	677769	DEL	457	NA12878	0.499	0.525	0.003	0.0	0.25	0.25	9	1
chr11	677313	677769	DEL	457	NA18525	0.0	0.0	0.049	0.004	nan	nan	0	0
chr11	677313	677769	DEL	457	NA18939	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	NA19017	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	NA19238	0.397	0.418	0.003	0.0	0.361	0.361	13	1
chr11	677313	677769	DEL	457	NA19239	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	NA19625	0.499	0.526	0.009	0.012	0.232	0.232	10	1
chr11	677313	677769	DEL	457	NA19648	1.315	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	677313	677769	DEL	457	NA20502	0.425	0.447	0.013	0.0	nan	nan	0	1
chr11	677313	677769	DEL	457	NA20845	0.919	0.967	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG00096	0.0	0.0	0.069	0.0	nan	nan	0	0
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG00268	0.0	0.0	0.033	0.0	nan	nan	0	0
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG00419	0.96	0.932	0.0	0.0	0.545	0.517	1	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG00759	0.0	0.0	0.038	0.0	nan	nan	0	0
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG01051	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG01112	1.129	1.096	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG01500	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG01565	1.345	1.306	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG01583	0.549	0.533	0.011	0.0	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG01595	0.683	0.663	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG01879	1.006	0.977	0.0	0.0	0.613	0.584	1	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG02568	0.0	0.0	0.022	0.007	nan	nan	0	0
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG02922	0.461	0.448	0.01	0.0	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG03006	0.455	0.442	0.005	0.0	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG03052	1.038	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG03642	0.515	0.5	0.003	0.0	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	HG03742	0.0	0.0	0.026	0.0	nan	nan	0	0
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA12878	0.0	0.0	0.008	0.0	nan	nan	0	0
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA18525	0.988	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA18939	0.0	0.0	0.041	0.0	nan	nan	0	0
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA19017	0.599	0.582	0.002	0.002	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA19238	0.972	0.944	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA19239	0.488	0.473	0.018	0.0	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA19625	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA19648	1.212	1.177	0.0	0.0	0.882	0.827	1	2
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA20502	0.637	0.618	0.005	0.0	nan	nan	0	1
chr11	6881402	6881922	DEL	521	NA20845	0.0	0.0	0.039	0.0	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG00096	0.0	0.0	0.173	0.163	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG00268	0.0	0.0	0.2	0.21	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG00419	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG00759	0.685	0.761	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG01051	0.41	0.455	0.063	0.042	0.529	0.529	1	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG01112	0.506	0.562	0.045	0.039	nan	nan	0	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG01500	0.396	0.44	0.075	0.05	0.406	0.406	1	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG01565	0.706	0.784	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG01583	0.449	0.499	0.043	0.043	0.538	0.538	1	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG01595	0.853	0.948	0.0	0.0	0.727	0.727	3	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG01879	0.266	0.295	0.077	0.084	nan	nan	0	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG02568	1.011	1.123	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG02922	0.834	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG03006	0.379	0.421	0.073	0.045	0.524	0.524	1	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG03052	0.376	0.417	0.068	0.058	nan	nan	0	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG03642	0.0	0.0	0.171	0.136	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	HG03742	0.0	0.0	0.187	0.148	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA12878	0.0	0.0	0.111	0.14	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA18525	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA18939	0.378	0.42	0.078	0.039	nan	nan	0	1
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA19017	0.773	0.859	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA19238	0.972	1.08	0.0	0.0	0.683	0.683	3	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA19239	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA19625	1.104	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA19648	0.0	0.0	0.173	0.087	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA20502	0.0	0.0	0.287	0.181	nan	nan	0	0
chr11	69400834	69401399	DEL	566	NA20845	0.345	0.383	0.043	0.022	nan	nan	0	1
chr11	704205	704914	DEL	710	HG00096	0.705	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG00268	0.688	0.871	0.0	0.0	0.882	0.882	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG00419	0.746	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG00759	0.457	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG01051	0.431	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG01112	0.467	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG01500	0.585	0.74	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG01565	0.595	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG01583	0.699	0.885	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG01595	0.341	0.432	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG01879	0.589	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG02568	0.739	0.935	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG02922	0.637	0.806	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG03006	0.436	0.552	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG03052	0.817	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG03642	0.695	0.88	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	HG03742	0.636	0.805	0.0	0.0	0.643	0.611	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA12878	0.774	0.98	0.0	0.0	0.952	0.952	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA18525	0.485	0.614	0.047	0.029	nan	nan	0	1
chr11	704205	704914	DEL	710	NA18939	0.68	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA19017	0.754	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA19238	0.616	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA19239	0.704	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA19625	0.631	0.798	0.0	0.0	0.429	0.429	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA19648	1.058	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA20502	0.873	1.105	0.0	0.0	0.524	0.555	3	2
chr11	704205	704914	DEL	710	NA20845	0.689	0.872	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG00096	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG00268	0.743	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG00419	0.32	0.355	0.069	0.117	nan	nan	0	1
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG00759	0.623	0.692	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG01051	0.669	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG01112	0.701	0.779	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG01500	0.736	0.817	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG01565	0.684	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG01583	0.549	0.61	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG01595	0.512	0.569	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG01879	0.418	0.464	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG02568	0.544	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG02922	0.746	0.829	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG03006	0.569	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG03052	0.464	0.515	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG03642	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	HG03742	0.39	0.433	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA12878	0.602	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA18525	0.593	0.659	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA18939	0.454	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA19017	0.657	0.73	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA19238	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA19239	0.691	0.768	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA19625	0.499	0.555	0.0	0.0	0.4	0.4	2	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA19648	0.413	0.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA20502	0.873	0.97	0.0	0.0	0.667	0.63	1	2
chr11	70712844	70713313	DEL	470	NA20845	0.735	0.817	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG00096	0.61	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG00268	0.725	0.833	0.0	0.005	0.882	0.882	1	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG00419	0.682	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG00759	0.581	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG01051	0.669	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG01112	0.643	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG01500	0.641	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG01565	0.728	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG01583	0.948	1.09	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG01595	0.576	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG01879	0.646	0.742	0.0	0.0	0.667	0.635	1	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG02568	0.816	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG02922	0.285	0.328	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG03006	0.663	0.763	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG03052	0.376	0.432	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG03642	0.644	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	HG03742	0.8	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA12878	0.688	0.791	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA18525	0.674	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA18939	0.69	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA19017	0.976	1.122	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA19238	0.644	0.74	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA19239	0.867	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA19625	0.71	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA19648	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA20502	0.66	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72348053	72348196	DEL	144	NA20845	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG00096	1.22	1.284	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG00268	0.978	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG00419	1.13	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG00759	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG01051	0.906	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG01112	1.071	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG01500	0.849	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG01565	0.904	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG01583	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG01595	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG01879	1.12	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG02568	0.389	0.409	0.056	0.037	nan	nan	0	1
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG02922	0.944	0.994	0.0	0.0	0.722	0.722	3	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG03006	1.042	1.097	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG03052	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG03642	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	HG03742	1.087	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA12878	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA18525	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA18939	1.02	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA19017	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA19238	1.068	1.124	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA19239	1.043	1.098	0.0	0.0	0.923	0.923	5	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA19625	1.367	1.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA19648	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA20502	1.05	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	72914097	72915038	DEL	942	NA20845	1.034	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG00096	1.105	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG00268	0.978	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG00419	1.216	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG00759	0.892	0.939	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG01051	0.884	0.931	0.0	0.002	0.595	0.595	2	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG01112	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG01500	1.113	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG01565	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG01583	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG01595	0.939	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG01879	0.874	0.92	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG02568	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG02922	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG03006	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG03052	0.928	0.977	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG03642	1.03	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	HG03742	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA12878	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA18525	0.898	0.946	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA18939	1.039	1.094	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA19017	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA19238	0.89	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA19239	0.623	0.656	0.028	0.042	nan	nan	0	1
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA19625	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA19648	1.135	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA20502	1.061	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	73761760	73762331	DEL	572	NA20845	0.712	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG00096	0.724	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG00268	0.417	0.502	0.034	0.0	nan	nan	0	1
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG00419	0.832	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG00759	0.602	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG01051	0.625	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG01112	0.604	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG01500	0.623	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG01565	0.529	0.638	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG01583	0.699	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG01595	0.448	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG01879	0.684	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG02568	0.778	0.937	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG02922	0.615	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG03006	0.531	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG03052	0.574	0.692	0.0	0.0	0.899	0.899	2	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG03642	0.747	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	HG03742	0.513	0.618	0.0	0.0	0.889	0.936	1	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA12878	0.636	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA18525	0.683	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA18939	0.567	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA19017	0.754	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA19238	0.739	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA19239	0.664	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA19625	0.71	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA19648	0.619	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA20502	0.66	0.796	0.0	0.0	0.818	0.773	1	2
chr11	75886619	75887444	DEL	826	NA20845	0.413	0.498	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG00096	0.705	0.705	0.0	0.0	0.977	0.977	2	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG00268	0.706	0.706	0.004	0.0	0.5	0.5	2	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG00419	0.554	0.554	0.007	0.0	0.833	0.88	1	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG00759	0.685	0.685	0.0	0.0	0.792	0.792	2	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG01051	0.798	0.798	0.0	0.0	0.8	0.8	3	1
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG01112	0.643	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG01500	0.868	0.868	0.0	0.0	0.84	0.84	4	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG01565	0.948	0.948	0.0	0.0	0.205	0.205	2	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG01583	0.674	0.674	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG01595	0.683	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG01879	0.627	0.627	0.0	0.0	0.667	0.635	1	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG02568	0.583	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG02922	0.615	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG03006	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG03052	0.508	0.508	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG03642	0.489	0.489	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	HG03742	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA12878	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA18525	0.791	0.791	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA18939	0.68	0.68	0.0	0.0	0.602	0.602	2	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA19017	0.773	0.773	0.0	0.0	0.625	0.625	2	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA19238	0.726	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA19239	0.894	0.894	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA19625	0.657	0.657	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA19648	0.748	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA20502	0.637	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	78142644	78143519	DEL	876	NA20845	0.597	0.597	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG00096	0.857	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG00268	1.069	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG00419	0.768	0.808	0.0	0.0	0.938	0.947	3	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG00759	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG01051	1.014	1.067	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG01112	1.09	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG01500	1.0	1.052	0.0	0.0	0.769	0.769	3	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG01565	0.86	0.905	0.0	0.0	0.731	0.731	3	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG01583	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG01595	0.896	0.943	0.0	0.0	0.578	0.578	4	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG01879	0.949	0.999	0.0	0.0	0.822	0.863	4	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG02568	1.128	1.187	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG02922	0.483	0.508	0.108	0.078	nan	nan	0	1
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG03006	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG03052	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG03642	1.107	1.166	0.0	0.0	0.84	0.84	3	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	HG03742	0.882	0.929	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA12878	1.049	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA18525	1.042	1.097	0.0	0.0	0.765	0.765	4	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA18939	1.077	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA19017	1.025	1.079	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA19238	0.466	0.49	0.114	0.076	nan	nan	0	1
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA19239	1.07	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA19625	0.999	1.051	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA19648	0.98	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA20502	0.991	1.043	0.0	0.0	0.788	0.834	3	2
chr11	7846660	7847583	DEL	924	NA20845	0.873	0.919	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG00096	0.781	0.868	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG00419	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG00759	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG01051	1.057	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG01500	0.415	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG01583	0.873	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG01595	0.619	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG01879	0.722	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG02568	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG02922	0.79	0.878	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG03006	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG03052	0.839	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG03642	0.798	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	HG03742	0.903	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA12878	0.998	1.108	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA18525	1.006	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA18939	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA19017	0.754	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA19238	0.835	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA19239	0.881	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA19625	1.551	1.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA19648	0.387	0.43	0.0	0.02	0.786	0.737	1	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA20502	0.849	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81848875	81848932	DUP	58	NA20845	1.056	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG00096	0.877	0.877	0.0	0.0	0.806	0.844	2	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG00268	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG00419	1.088	1.088	0.003	0.0	0.813	0.77	2	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG00759	0.851	0.851	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG01051	1.121	1.121	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG01112	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG01500	0.868	0.868	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG01565	0.794	0.794	0.0	0.0	0.595	0.595	2	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG01583	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG01595	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG01879	0.494	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG02568	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG02922	0.417	0.417	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG03006	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG03052	1.104	1.104	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG03642	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	HG03742	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA12878	0.447	0.447	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA18525	1.15	1.15	0.0	0.0	0.984	0.984	2	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA18939	1.02	1.02	0.0	0.003	0.897	0.897	2	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA19017	0.522	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA19238	1.041	1.041	0.0	0.0	0.975	0.975	1	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA19239	1.057	1.057	0.0	0.0	0.869	0.869	2	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA19625	0.552	0.552	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA19648	1.238	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA20502	0.991	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	81860298	81861052	DEL	755	NA20845	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG00096	0.648	0.605	0.026	0.095	nan	nan	0	1
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG00268	1.195	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG00419	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG00759	1.391	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG01051	1.359	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG01112	1.402	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG01500	1.207	1.128	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG01565	1.367	1.278	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG01583	1.098	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG01595	1.6	1.495	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG01879	1.5	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG02568	1.4	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG02922	1.515	1.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG03006	1.308	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG03052	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG03642	0.592	0.554	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr11	82132213	82132582	DEL	370	HG03742	1.252	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA12878	1.066	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA18525	1.276	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA18939	1.266	1.183	0.0	0.0	0.771	0.771	1	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA19017	0.561	0.524	0.014	0.06	nan	nan	0	1
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA19238	1.328	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA19239	1.246	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA19625	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA19648	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA20502	1.344	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82132213	82132582	DEL	370	NA20845	0.735	0.687	0.037	0.101	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG00096	0.934	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG00268	0.561	0.624	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG00419	0.981	1.09	0.0	0.0	0.615	0.65	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG00759	0.789	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG01051	0.69	0.767	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG01112	0.584	0.649	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG01500	0.377	0.419	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG01565	0.507	0.564	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG01583	0.549	0.61	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG01595	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG01879	0.646	0.717	0.0	0.0	0.667	0.7	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG02568	0.778	0.864	0.0	0.008	0.667	0.667	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG02922	0.329	0.366	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG03006	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG03052	0.994	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG03642	0.644	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	HG03742	0.78	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA12878	0.963	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA18525	0.845	0.938	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA18939	0.756	0.84	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA19017	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA19239	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA19625	0.263	0.292	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA19648	0.696	0.774	0.0	0.0	0.643	0.686	1	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA20502	1.038	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82221827	82221933	DEL	107	NA20845	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG00096	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG00268	1.177	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG00419	1.088	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG00759	1.142	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG01051	0.345	0.363	0.0	0.11	nan	nan	0	1
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG01112	1.012	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG01500	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG01565	1.058	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG01583	0.724	0.762	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG01595	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG01879	1.12	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG02568	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG02922	1.12	1.179	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG03006	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG03052	0.464	0.488	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG03642	0.901	0.949	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	HG03742	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA12878	0.98	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA18525	0.916	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA18939	1.02	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA19017	0.483	0.509	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA19238	0.329	0.346	0.0	0.085	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA19239	1.043	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA19625	0.604	0.636	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA19648	0.8	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA20502	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	82600046	82600164	DEL	119	NA20845	0.896	0.943	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG00096	0.572	0.635	0.0	0.13	nan	nan	0	0
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG00419	0.021	0.024	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG01051	0.108	0.12	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG01112	0.136	0.151	0.0	0.06	0.143	0.143	1	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG01500	0.528	0.587	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG01565	0.397	0.441	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG01583	0.0	0.0	0.011	0.091	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG01595	0.064	0.071	0.01	0.036	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG01879	0.133	0.148	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG02568	0.583	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG02922	0.384	0.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG03006	0.171	0.19	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG03052	0.287	0.319	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG03642	0.129	0.143	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	HG03742	0.0	0.0	0.012	0.138	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA12878	0.189	0.21	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA18525	0.458	0.509	0.0	0.151	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA18939	0.019	0.021	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA19017	0.213	0.236	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA19238	0.26	0.289	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA19239	0.528	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA19625	0.631	0.701	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA19648	0.026	0.029	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA20502	0.071	0.079	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr11	8326057	8326195	DEL	139	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG00096	1.067	0.997	0.0	0.0	0.655	0.686	3	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG00268	1.449	1.354	0.0	0.0	0.647	0.647	3	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG00419	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG00759	1.079	1.009	0.0	0.0	0.76	0.76	3	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG01051	1.165	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG01112	0.74	0.691	0.0	0.004	0.817	0.817	2	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG01500	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG01583	0.799	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG01595	1.451	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG01879	0.779	0.728	0.0	0.0	0.773	0.811	3	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG02568	0.778	0.727	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG02922	1.054	0.985	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG03006	1.346	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG03052	0.95	0.888	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG03642	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	HG03742	1.128	1.055	0.006	0.004	0.773	0.813	3	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	NA12878	0.877	0.82	0.0	0.004	0.503	0.503	4	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	NA18525	1.006	0.94	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	NA18939	1.19	1.113	0.0	0.0	0.872	0.872	4	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	NA19239	1.192	1.114	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	NA19625	1.261	1.179	0.0	0.004	0.916	0.916	4	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	NA19648	0.929	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	83841535	83841585	DUP	51	NA20845	1.079	1.009	0.0	0.0	0.192	0.192	2	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG00096	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG00268	1.358	1.358	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG00419	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG00759	1.245	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG01051	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG01112	1.071	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG01500	0.962	0.962	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG01565	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG01583	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG01595	1.323	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG01879	1.101	1.101	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG02568	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG02922	1.273	1.273	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG03006	1.346	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG03052	0.795	0.795	0.0	0.034	0.372	0.372	1	1
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG03642	1.21	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	HG03742	1.334	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA12878	1.238	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA18525	1.509	1.509	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA18939	1.493	1.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA19017	0.387	0.387	0.0	0.05	0.667	0.667	1	1
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA19238	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA19239	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA19625	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA19648	1.341	1.341	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA20502	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	85203735	85203808	DEL	74	NA20845	1.447	1.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG00096	1.01	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG00268	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG00419	0.896	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG00759	0.415	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG01051	0.819	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG01112	0.896	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG01500	0.905	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG01565	0.816	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG01583	0.599	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG01595	0.576	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG01879	0.76	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG02568	0.7	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG02922	1.164	1.293	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG03006	0.986	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG03052	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG03642	1.03	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	HG03742	1.067	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA12878	0.585	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA18525	0.934	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA18939	0.605	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA19017	0.947	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA19238	0.876	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA19239	0.759	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA19648	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA20502	0.896	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86205668	86205762	DUP	95	NA20845	1.332	1.48	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG00096	1.162	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG00268	1.141	1.201	0.0	0.0	0.97	0.97	1	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG00419	1.237	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG00759	0.892	0.939	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG01051	0.97	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG01112	0.487	0.512	0.059	0.037	nan	nan	0	1
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG01500	1.132	1.191	0.0	0.0	0.906	0.906	1	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG01565	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG01583	1.073	1.13	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG01595	1.067	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG01879	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG02568	1.322	1.392	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG02922	1.01	1.063	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG03006	1.251	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG03052	0.574	0.605	0.076	0.041	nan	nan	0	1
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG03642	1.082	1.139	0.008	0.0	0.933	0.933	1	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	HG03742	0.287	0.302	0.081	0.054	nan	nan	0	1
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA12878	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA18525	1.24	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA18939	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA19017	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA19238	0.466	0.49	0.082	0.048	nan	nan	0	1
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA19239	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA19625	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA19648	1.29	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA20502	1.179	1.241	0.0	0.0	0.464	0.492	1	2
chr11	86285965	86286726	DEL	762	NA20845	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG00096	0.896	0.896	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG00268	0.869	0.869	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG00419	0.661	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG01051	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG01112	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG01500	0.887	0.887	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG01565	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG01583	0.699	0.699	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG01595	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG01879	0.912	0.912	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG02568	0.661	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG02922	0.505	0.505	0.068	0.008	nan	nan	0	1
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG03006	0.891	0.891	0.011	0.0	0.389	0.389	1	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG03052	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG03642	0.67	0.67	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	HG03742	0.78	0.78	0.0	0.0	0.722	0.76	1	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA12878	0.757	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA18525	1.078	1.078	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA18939	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA19017	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA19238	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA19239	0.935	0.935	0.0	0.0	0.214	0.214	1	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA19625	0.71	0.71	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA19648	0.748	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA20502	0.849	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	86624324	86625109	DEL	786	NA20845	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG00096	0.238	0.251	0.015	0.157	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG00268	0.0	0.0	0.032	0.276	nan	nan	0	0
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG00419	0.256	0.269	0.022	0.138	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG00759	0.249	0.262	0.016	0.109	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG01051	0.302	0.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG01112	0.312	0.328	0.005	0.136	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG01500	0.415	0.437	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG01565	0.221	0.232	0.009	0.146	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG01583	0.225	0.236	0.019	0.059	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG01595	0.192	0.202	0.054	0.129	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG01879	0.0	0.0	0.052	0.212	nan	nan	0	0
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG02568	0.505	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG02922	0.307	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG03006	0.246	0.259	0.025	0.111	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG03052	0.464	0.488	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG03642	0.258	0.271	0.014	0.145	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	HG03742	0.308	0.324	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA12878	0.224	0.235	0.005	0.084	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA18525	0.0	0.0	0.032	0.311	nan	nan	0	0
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA18939	0.255	0.269	0.042	0.168	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA19017	0.116	0.122	0.029	0.175	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA19238	0.739	0.778	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA19239	0.765	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA19625	0.552	0.581	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA19648	0.542	0.57	0.0	0.0	0.833	0.889	1	2
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA20502	0.212	0.223	0.022	0.133	nan	nan	0	1
chr11	89932513	89932852	DEL	340	NA20845	0.597	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG00096	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG00268	0.815	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG00419	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG00759	0.913	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG01051	1.165	1.088	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG01112	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG01500	1.264	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG01565	0.97	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG01583	1.073	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG01595	1.045	0.977	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG01879	0.608	0.568	0.027	0.034	nan	nan	0	1
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG02568	1.011	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG02922	0.615	0.574	0.04	0.027	nan	nan	0	1
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG03006	0.967	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG03052	0.508	0.475	0.049	0.039	nan	nan	0	1
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG03642	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	HG03742	1.364	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA12878	1.015	0.948	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA18525	1.024	0.957	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA18939	1.096	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA19017	1.044	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA19238	0.986	0.921	0.0	0.0	0.93	0.93	3	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA19239	0.623	0.582	0.042	0.052	nan	nan	0	1
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA19625	1.078	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA19648	0.567	0.53	0.018	0.03	nan	nan	0	1
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA20502	0.991	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91161907	91162542	DEL	636	NA20845	1.079	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG00096	0.819	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG00268	0.888	0.814	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG00419	0.938	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG00759	0.872	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG01051	0.992	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG01112	0.759	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG01500	0.962	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG01565	0.992	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG01583	1.098	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG01595	0.96	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG01879	1.177	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG02568	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG02922	0.988	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG03006	0.758	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG03052	1.082	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG03642	1.056	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	HG03742	1.026	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA12878	0.791	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA18525	1.204	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA18939	0.794	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA19017	1.025	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA19238	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA19239	1.233	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA19625	0.552	0.506	0.0	0.031	0.5	0.5	1	1
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA19648	1.083	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA20502	1.038	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	91925725	91925805	DEL	81	NA20845	1.011	0.927	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG00096	0.419	0.466	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG00268	0.326	0.362	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG00419	0.427	0.474	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG00759	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG01051	0.0	0.0	0.023	0.19	nan	nan	0	0
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG01112	0.487	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG01500	0.736	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG01565	0.794	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG01583	0.399	0.444	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG01595	0.363	0.403	0.014	0.087	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.251	nan	nan	0	0
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG02568	0.505	0.562	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG02922	1.054	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG03006	0.948	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG03052	0.464	0.515	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG03642	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	0
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA12878	0.843	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA18525	0.422	0.469	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA18939	0.378	0.42	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA19017	0.522	0.58	0.0	0.11	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA19238	0.452	0.502	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA19239	0.325	0.361	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA19625	1.025	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA19648	1.212	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA20502	0.613	0.681	0.008	0.039	nan	nan	0	1
chr11	93578001	93578212	DEL	212	NA20845	0.322	0.357	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG00096	1.058	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG00268	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG00419	0.832	0.924	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG00759	0.996	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG01051	0.863	0.958	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG01112	1.227	1.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG01500	1.0	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG01565	1.08	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG01583	0.799	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG01595	0.939	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG01879	1.025	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG02568	0.622	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG02922	0.812	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG03006	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG03642	1.056	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	HG03742	0.78	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA12878	0.98	1.089	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA18525	1.15	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA18939	0.907	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA19017	0.986	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA19238	1.095	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA19625	1.156	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA19648	1.083	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA20502	1.226	1.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	93885197	93885286	DUP	90	NA20845	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG00096	0.419	0.482	0.0	0.021	0.759	0.724	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG00268	0.58	0.666	0.0	0.013	0.735	0.735	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.023	nan	nan	0	0
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG00759	0.311	0.358	0.0	0.014	0.9	0.9	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG01051	0.194	0.223	0.0	0.009	0.5	0.5	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG01112	0.253	0.291	0.0	0.015	0.545	0.545	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG01500	0.83	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG01565	0.838	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	0
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG01595	0.853	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG01879	0.741	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG02568	0.739	0.849	0.0	0.024	0.812	0.812	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG02922	1.186	1.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.04	nan	nan	0	0
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG03052	0.464	0.533	0.0	0.004	0.826	0.826	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG03642	0.309	0.355	0.0	0.006	0.846	0.846	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	HG03742	0.472	0.542	0.0	0.026	0.958	0.991	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.058	nan	nan	0	0
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA18525	0.198	0.227	0.0	0.02	0.462	0.462	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA18939	0.51	0.586	0.0	0.013	0.9	0.9	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	0
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA19238	0.876	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA19239	0.691	0.794	0.0	0.015	0.706	0.706	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA19625	0.578	0.665	0.0	0.016	0.65	0.65	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA19648	0.825	0.949	0.0	0.01	0.793	0.744	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA20502	0.495	0.569	0.0	0.025	0.391	0.414	1	1
chr11	94091791	94091841	DEL	51	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	0
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG00096	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG00268	0.688	0.725	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG00419	0.618	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG00759	0.768	0.808	0.0	0.0	0.45	0.45	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG01051	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG01112	0.72	0.758	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG01500	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG01565	0.728	0.766	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG01583	0.499	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG01595	0.789	0.831	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG01879	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG02568	1.128	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG02922	0.659	0.693	0.0	0.0	0.312	0.312	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG03006	0.569	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG03052	0.795	0.837	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG03642	0.747	0.786	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	HG03742	0.574	0.605	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA12878	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA18525	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA18939	0.265	0.278	0.0	0.004	0.729	0.729	2	1
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA19017	0.648	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA19238	0.917	0.966	0.0	0.0	0.641	0.641	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA19239	0.881	0.927	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA19625	0.894	0.941	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA19648	0.645	0.679	0.0	0.0	0.778	0.729	1	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA20502	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94104086	94104163	DEL	78	NA20845	0.597	0.629	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG00096	0.572	0.724	0.0	0.0	0.765	0.801	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG00268	0.924	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG00419	0.597	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG00759	0.457	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG01051	0.367	0.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG01112	0.506	0.641	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG01500	0.736	0.931	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG01565	0.772	0.977	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG01583	0.749	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG01595	0.661	0.837	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG01879	0.513	0.649	0.0	0.006	0.429	0.45	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG02568	1.205	1.526	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG02922	0.549	0.695	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG03006	0.777	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG03052	0.486	0.615	0.035	0.028	nan	nan	0	1
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG03642	0.747	0.945	0.0	0.007	0.75	0.75	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	HG03742	0.574	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA12878	0.86	1.089	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA18525	0.773	0.978	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA18939	0.68	0.861	0.0	0.002	0.5	0.5	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA19017	0.793	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA19238	0.822	1.04	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA19239	0.732	0.926	0.0	0.0	0.799	0.799	2	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA19625	0.499	0.632	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA19648	0.645	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA20502	0.637	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	94883633	94884198	DEL	566	NA20845	0.643	0.814	0.0	0.007	0.833	0.833	1	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG00096	1.162	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG00268	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG00419	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG00759	0.54	0.54	0.009	0.08	nan	nan	0	1
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG01051	0.863	0.863	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG01112	0.643	0.643	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG01500	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG01565	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	1
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG01595	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG01879	0.684	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG02568	1.244	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG02922	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG03006	0.322	0.322	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG03052	0.596	0.596	0.009	0.091	nan	nan	0	1
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG03642	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	HG03742	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA12878	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA18525	1.06	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA18939	1.219	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA19017	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA19238	0.657	0.657	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA19239	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA19625	0.552	0.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA19648	1.109	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA20502	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95038133	95038234	DEL	102	NA20845	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG00096	1.296	1.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG00268	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG00419	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG00759	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG01051	0.97	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG01112	1.227	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG01500	1.264	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG01565	1.125	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG01583	1.123	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG01595	0.896	0.943	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG01879	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG02568	0.583	0.614	0.0	0.026	0.75	0.75	1	1
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG02922	1.032	1.086	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG03006	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG03052	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG03642	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	HG03742	1.128	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA12878	0.843	0.887	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA18525	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA18939	1.077	1.134	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA19017	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA19238	1.0	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA19239	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA19625	0.999	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA19648	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA20502	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	95918315	95918379	DEL	65	NA20845	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG00096	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG00268	1.34	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG00419	1.408	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG00759	1.349	1.31	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG01051	1.014	0.984	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG01112	1.09	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG01500	0.792	0.769	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG01565	1.544	1.499	0.005	0.0	0.436	0.436	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG01583	1.423	1.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG01595	1.259	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG01879	1.329	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG02568	1.283	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG02922	1.383	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG03006	1.422	1.38	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG03052	0.53	0.515	0.0	0.07	0.455	0.455	13	1
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG03642	1.21	1.175	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	HG03742	1.231	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA12878	0.843	0.818	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA18525	1.312	1.274	0.0	0.0	0.892	0.892	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA18939	1.304	1.266	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA19017	1.276	1.239	0.0	0.0	0.935	0.935	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA19238	1.246	1.21	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA19239	1.314	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA19625	1.288	1.25	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA19648	1.341	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA20502	1.392	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96493121	96493286	DEL	166	NA20845	1.286	1.249	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG00096	0.667	0.767	0.021	0.278	nan	nan	0	0
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG00268	0.163	0.187	0.023	0.105	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG00419	0.363	0.417	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG00759	0.249	0.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG01051	0.129	0.149	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG01112	0.526	0.604	0.035	0.228	nan	nan	0	0
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG01500	0.0	0.0	0.007	0.181	nan	nan	0	0
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG01565	0.132	0.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG01583	0.0	0.0	0.036	0.186	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG01595	0.363	0.417	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG01879	0.019	0.022	0.0	0.133	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG02568	0.117	0.134	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG02922	0.768	0.883	0.005	0.192	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG03006	0.455	0.523	0.014	0.227	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG03052	0.133	0.152	0.007	0.112	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG03642	0.695	0.799	0.021	0.23	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	HG03742	0.164	0.189	0.017	0.158	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA12878	0.396	0.455	0.007	0.211	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA18525	0.485	0.558	0.0	0.0	0.083	0.083	1	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA18939	0.076	0.087	0.016	0.134	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA19017	0.425	0.489	0.023	0.224	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA19238	0.164	0.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA19239	0.203	0.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA19625	0.079	0.091	0.026	0.118	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA19648	0.103	0.119	0.045	0.104	nan	nan	0	1
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA20502	0.778	0.895	0.008	0.27	nan	nan	0	0
chr11	96614759	96615086	DEL	328	NA20845	0.115	0.132	0.022	0.093	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG00096	1.067	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG00268	0.996	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG00419	0.554	0.518	0.0	0.026	0.741	0.782	1	1
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG01051	0.733	0.685	0.0	0.055	0.486	0.486	1	1
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG01112	1.051	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG01500	1.339	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG01565	1.103	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG01583	1.472	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG01595	0.725	0.678	0.008	0.058	0.719	0.719	1	1
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG01879	0.987	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG02568	1.05	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG02922	0.856	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG03006	1.005	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG03052	0.619	0.578	0.0	0.05	0.571	0.571	1	1
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG03642	1.288	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	HG03742	1.169	1.093	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA12878	0.826	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA18525	0.198	0.185	0.0	0.038	0.7	0.7	1	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA18939	0.34	0.318	0.0	0.035	0.952	0.952	1	1
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA19017	1.063	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA19238	1.123	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA19239	1.111	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA19625	1.261	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA19648	1.006	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA20502	0.684	0.639	0.0	0.0	0.923	0.977	1	2
chr11	98112017	98112089	DEL	73	NA20845	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG00096	0.457	0.42	0.019	0.107	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG00268	0.0	0.0	0.044	0.219	nan	nan	0	0
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG00419	1.088	0.998	0.0	0.0	0.768	0.727	2	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG00759	1.37	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG01051	0.669	0.613	0.012	0.062	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG01112	0.681	0.625	0.012	0.095	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG01500	1.245	1.142	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG01565	1.036	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG01583	0.474	0.435	0.02	0.085	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG01595	1.28	1.174	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG01879	0.608	0.557	0.007	0.071	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG02568	0.778	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG02922	1.273	1.168	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG03006	1.232	1.13	0.0	0.003	0.632	0.632	2	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG03052	0.508	0.466	0.016	0.073	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG03642	0.489	0.449	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	HG03742	0.595	0.546	0.021	0.086	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA12878	0.963	0.884	0.0	0.0	0.713	0.713	2	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA18525	0.845	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA18939	0.907	0.832	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA19017	0.657	0.603	0.013	0.061	0.316	0.316	2	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA19238	0.589	0.54	0.024	0.092	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA19239	0.542	0.497	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA19625	0.0	0.0	0.074	0.173	nan	nan	0	0
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA19648	0.903	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA20502	0.0	0.0	0.054	0.166	nan	nan	0	0
chr11	98248208	98248606	DEL	399	NA20845	0.528	0.485	0.017	0.055	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG00096	1.165	1.226	0.004	0.002	nan	nan	0	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG00268	0.988	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG00419	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG00759	0.0	0.0	0.263	0.115	nan	nan	0	0
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG01051	0.412	0.433	0.109	0.062	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG01112	0.86	0.905	0.005	0.0	0.783	0.826	1	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG01500	0.961	1.012	0.01	0.0	0.88	0.843	1	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG01565	0.908	0.956	0.0	0.0	0.48	0.48	1	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG01583	0.413	0.434	0.119	0.051	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG01595	0.502	0.528	0.149	0.077	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG01879	0.49	0.516	0.101	0.04	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG02568	0.46	0.485	0.073	0.077	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG02922	0.0	0.0	0.215	0.084	nan	nan	0	0
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG03006	0.49	0.516	0.083	0.048	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG03052	0.405	0.426	0.125	0.072	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG03642	1.151	1.211	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	HG03742	0.408	0.43	0.178	0.062	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA12878	1.02	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA18525	0.0	0.0	0.237	0.208	nan	nan	0	0
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA18939	0.503	0.53	0.078	0.05	nan	nan	0	1
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA19017	0.0	0.0	0.39	0.195	nan	nan	0	0
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA19238	0.0	0.0	0.279	0.151	nan	nan	0	0
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA19239	0.0	0.0	0.301	0.213	nan	nan	0	0
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA19625	1.073	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA19648	1.1	1.158	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA20502	0.828	0.871	0.0	0.0	0.625	0.59	1	2
chr12	101756301	101756957	DEL	657	NA20845	0.96	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG00096	0.309	0.344	0.0	0.07	0.75	0.75	1	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG00268	0.728	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG00419	0.248	0.276	0.0	0.057	0.882	0.882	1	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	0
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG01051	0.453	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG01112	0.494	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG01500	0.961	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG01565	0.392	0.436	0.0	0.061	0.769	0.769	1	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG01583	0.291	0.324	0.0	0.034	0.867	0.867	1	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG01595	0.482	0.535	0.0	0.042	0.64	0.64	1	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG01879	0.363	0.404	0.0	0.043	0.692	0.725	1	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG03006	0.163	0.182	0.0	0.045	0.478	0.478	1	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG03642	0.281	0.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA12878	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA18525	0.942	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA18939	0.593	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA19239	0.353	0.392	0.0	0.084	0.571	0.571	1	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA19625	0.102	0.114	0.0	0.059	0.176	0.176	1	1
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA19648	0.35	0.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA20502	0.621	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	102314060	102314162	DEL	103	NA20845	0.917	1.018	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG00096	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG00268	0.451	0.451	0.006	0.098	nan	nan	0	1
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG00419	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG00759	0.414	0.414	0.005	0.055	nan	nan	0	1
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG01051	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG01112	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG01500	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG01565	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG01583	0.461	0.461	0.027	0.03	nan	nan	0	1
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG01595	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG01879	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG02568	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG02922	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG03006	1.217	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG03052	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG03642	0.563	0.563	0.012	0.083	nan	nan	0	1
chr12	10407412	10407721	DEL	310	HG03742	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA12878	0.918	0.918	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA18525	0.506	0.506	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA18939	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA19017	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA19238	0.956	0.956	0.004	0.003	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA19239	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA19625	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA19648	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA20502	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10407412	10407721	DEL	310	NA20845	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG00096	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG00268	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG00419	0.993	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG00759	0.532	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG01051	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG01112	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG01500	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG01565	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG01583	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG01595	0.984	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG01879	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG02568	1.112	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG02922	0.675	0.711	0.0	0.032	0.391	0.391	1	1
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG03006	0.726	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG03052	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG03642	0.972	1.023	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	HG03742	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA12878	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA18525	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA18939	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA19017	0.785	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA19238	0.554	0.583	0.0	0.005	0.763	0.787	1	1
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA19239	0.849	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA19625	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA19648	1.225	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA20502	1.011	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104735396	104735458	DEL	63	NA20845	0.96	1.011	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG00096	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG00268	0.988	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG00419	0.765	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG00759	0.631	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG01051	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG01112	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG01500	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG01565	0.784	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG01583	1.044	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG01595	0.642	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG01879	0.727	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG02568	0.921	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG02922	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG03006	1.072	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG03052	0.874	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG03642	0.92	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	HG03742	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA12878	0.663	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA18525	1.238	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA18939	0.378	0.42	0.0	0.072	0.963	0.921	1	1
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA19017	0.654	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA19238	0.725	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA19239	0.744	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA19625	1.278	1.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA19648	1.075	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA20502	1.011	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	104975991	104976086	DEL	96	NA20845	0.873	0.97	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG00096	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG00268	1.196	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG00419	1.551	1.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG00759	1.223	1.187	0.005	0.0	0.806	0.849	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG01051	1.111	1.079	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG01112	1.152	1.119	0.0	0.0	0.857	0.812	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG01500	1.193	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG01565	1.052	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG01583	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG01595	1.506	1.462	0.0	0.0	0.732	0.732	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG01879	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG02568	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG02922	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG03006	1.29	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG03052	1.023	0.994	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG03642	1.202	1.167	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	HG03742	0.68	0.661	0.04	0.045	nan	nan	0	1
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA12878	0.85	0.826	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA18525	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA18939	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA19017	1.233	1.197	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA19238	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA19239	0.575	0.558	0.059	0.047	nan	nan	0	1
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA19625	0.537	0.521	0.063	0.059	nan	nan	0	1
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA19648	1.35	1.311	0.0	0.0	0.767	0.767	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA20502	1.057	1.027	0.0	0.0	0.821	0.87	1	2
chr12	105680973	105681595	DEL	623	NA20845	1.397	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG00096	0.801	0.801	0.0	0.0	0.926	0.926	2	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG00268	1.161	1.161	0.0	0.0	0.881	0.881	2	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG00419	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG00759	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG01051	0.967	0.967	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG01112	1.006	1.006	0.0	0.0	0.952	0.902	1	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG01500	0.961	0.961	0.0	0.0	0.654	0.682	1	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG01565	0.433	0.433	0.081	0.061	nan	nan	0	1
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG01583	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG01595	1.024	1.024	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG01879	0.926	0.926	0.0	0.0	0.755	0.72	2	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG02568	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG02922	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG03006	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG03052	1.109	1.109	0.0	0.0	0.878	0.878	2	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG03642	0.92	0.92	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	HG03742	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA12878	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA18525	0.854	0.854	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA18939	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA19017	1.009	1.009	0.0	0.0	0.75	0.716	1	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA19238	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA19239	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA19625	1.022	1.022	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA19648	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA20502	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106670754	106671374	DEL	621	NA20845	0.829	0.829	0.0	0.0	0.938	0.937	1	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG00096	1.019	0.935	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG00268	1.023	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG00419	1.075	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG00759	1.144	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG01051	1.132	1.038	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG01112	0.951	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG01500	0.81	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG01565	0.743	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG01583	1.117	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG01595	0.823	0.755	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG01879	0.836	0.767	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG02568	1.151	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG02922	1.076	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG03006	1.017	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG03052	0.693	0.636	0.0	0.021	0.428	0.428	2	1
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG03642	1.151	1.056	0.007	0.005	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	HG03742	0.875	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA12878	0.714	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA18525	1.055	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA18939	0.917	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA19017	1.121	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA19238	0.699	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA19239	0.979	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA19625	1.022	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA19648	1.025	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA20502	1.241	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	106699005	106699074	DEL	70	NA20845	1.026	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG00096	1.438	1.344	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG00268	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG00759	0.0	0.0	0.011	0.091	nan	nan	0	0
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG01051	1.585	1.481	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG01112	0.64	0.598	0.0	0.037	0.721	0.761	1	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG01500	0.694	0.649	0.0	0.052	0.56	0.584	1	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG01565	0.495	0.463	0.0	0.057	0.879	0.879	1	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG01583	0.801	0.749	0.0	0.05	0.538	0.538	1	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG01595	1.405	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG01879	1.272	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG02568	0.959	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG02922	1.498	1.4	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG03006	0.49	0.458	0.0	0.044	0.613	0.613	1	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG03052	1.045	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG03642	0.473	0.442	0.0	0.055	0.875	0.875	1	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	HG03742	1.108	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA12878	0.748	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA19017	1.159	1.083	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA19238	1.595	1.491	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA19239	1.201	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA19625	1.457	1.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA19648	0.475	0.444	0.0	0.025	0.526	0.526	1	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr12	10741654	10741741	DEL	88	NA20845	1.55	1.448	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG00096	0.0	0.0	0.01	0.145	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG00268	0.659	0.64	0.007	0.066	nan	nan	0	1
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG00419	0.62	0.602	0.008	0.058	nan	nan	0	1
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG00759	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG01051	0.782	0.759	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG01112	0.658	0.639	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG01500	0.0	0.0	0.009	0.171	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG01565	1.114	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG01583	0.51	0.495	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG01595	0.482	0.468	0.016	0.069	nan	nan	0	1
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG01879	0.836	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG02568	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG02922	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.142	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG03052	1.301	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG03642	0.0	0.0	0.01	0.137	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	HG03742	0.603	0.585	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA12878	0.986	0.958	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA18939	0.0	0.0	0.004	0.198	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA19017	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA19238	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA19625	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA20502	0.0	0.0	0.018	0.186	nan	nan	0	0
chr12	11068046	11068300	DEL	255	NA20845	0.415	0.403	0.013	0.095	nan	nan	0	1
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG00096	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG00268	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG00419	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG00759	0.848	0.893	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG01051	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG01112	0.658	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG01500	0.908	0.956	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG01565	0.681	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG01583	0.898	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG01595	0.663	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG01879	0.981	1.033	0.0	0.0	0.712	0.715	4	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG02568	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG02922	0.485	0.511	0.008	0.055	nan	nan	0	1
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG03006	0.89	0.937	0.002	0.002	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG03052	0.544	0.572	0.012	0.026	nan	nan	0	1
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG03642	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	HG03742	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA12878	0.833	0.877	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA18525	0.907	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA18939	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA19017	0.505	0.531	0.032	0.084	nan	nan	0	1
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA19238	0.791	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA19239	0.849	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA19625	1.278	1.345	0.0	0.0	0.771	0.771	2	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA19648	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA20502	0.897	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11113746	11114353	DEL	608	NA20845	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG00096	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG00268	1.075	1.075	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG00419	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG00759	0.375	0.375	0.078	0.016	0.286	0.301	3	1
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG01051	1.07	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG01112	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG01500	0.961	0.961	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG01565	1.011	1.011	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG01583	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG01595	0.402	0.402	0.063	0.003	nan	nan	0	1
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG01879	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG02568	0.537	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG02922	0.0	0.0	0.076	0.005	nan	nan	0	0
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG03006	0.545	0.545	0.05	0.004	nan	nan	0	1
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG03052	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG03642	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	HG03742	0.505	0.505	0.077	0.0	nan	nan	0	1
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA12878	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA18525	0.471	0.471	0.081	0.0	0.222	0.222	3	1
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA18939	0.467	0.467	0.03	0.0	nan	nan	0	1
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA19017	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA19238	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA19239	1.019	1.019	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA19625	0.92	0.92	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA19648	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA20502	1.149	1.149	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr12	112296432	112297167	DEL	736	NA20845	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG00096	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG00268	1.231	1.195	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG00419	0.517	0.502	0.039	0.083	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG00759	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG01051	0.967	0.939	0.006	0.0	0.541	0.541	2	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG01112	1.28	1.243	0.0	0.003	0.866	0.914	2	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG01500	1.122	1.089	0.0	0.0	0.812	0.779	2	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG01565	0.598	0.581	0.024	0.11	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG01583	0.51	0.495	0.008	0.08	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG01595	0.482	0.468	0.02	0.071	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG01879	0.672	0.653	0.006	0.081	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG02568	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG02922	0.591	0.574	0.014	0.086	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG03006	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG03052	0.0	0.0	0.02	0.206	nan	nan	0	0
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG03642	1.355	1.316	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	HG03742	0.408	0.396	0.006	0.099	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA12878	0.561	0.545	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA18525	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA18939	1.259	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA19017	0.598	0.581	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA19238	1.187	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA19239	0.992	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA19625	1.048	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA19648	1.4	1.36	0.0	0.004	0.88	0.88	4	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA20502	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11341898	11342212	DEL	315	NA20845	0.524	0.509	0.019	0.061	nan	nan	0	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG00096	0.728	0.837	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG00268	0.503	0.578	0.0	0.034	0.893	0.893	2	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG00419	0.6	0.689	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG00759	0.375	0.431	0.0	0.037	0.818	0.861	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG01051	0.515	0.591	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG01112	0.0	0.0	0.008	0.052	nan	nan	0	0
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	0
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG01565	0.351	0.403	0.0	0.019	0.706	0.706	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG01583	0.68	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG01595	0.341	0.392	0.0	0.01	0.533	0.533	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG01879	0.581	0.668	0.0	0.0	0.867	0.827	1	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG02568	0.882	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG02922	0.591	0.679	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG03006	0.363	0.418	0.0	0.012	0.85	0.85	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG03052	0.981	1.127	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG03642	0.818	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	HG03742	0.816	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA12878	0.748	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA18525	0.366	0.421	0.0	0.015	0.5	0.5	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA18939	0.845	0.971	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA19017	0.411	0.473	0.0	0.063	0.6	0.629	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA19238	0.949	1.091	0.0	0.0	0.917	0.945	1	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA19239	0.888	1.021	0.0	0.0	0.73	0.73	1	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA19625	0.409	0.47	0.008	0.022	0.75	0.75	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA19648	0.925	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA20502	0.391	0.449	0.0	0.039	0.591	0.626	1	1
chr12	114728332	114728398	DEL	67	NA20845	0.458	0.527	0.0	0.023	0.455	0.455	1	1
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG01112	0.0	0.0	0.009	0.065	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG01565	0.475	0.546	0.0	0.005	0.745	0.745	4	1
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG01879	0.454	0.522	0.0	0.014	0.68	0.712	1	1
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.006	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.018	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.04	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA19017	0.729	0.838	0.0	0.0	0.407	0.427	3	2
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA19238	0.672	0.773	0.0	0.0	0.762	0.786	2	2
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA19239	0.81	0.931	0.0	0.0	0.935	0.935	3	2
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.016	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.04	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr12	115023765	115023828	DEL	64	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	0
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG00096	0.764	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG00268	1.057	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG00419	0.745	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG00759	0.493	0.548	0.0	0.025	0.821	0.865	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG01051	0.432	0.48	0.0	0.022	0.368	0.368	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG01112	0.841	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG01500	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG01565	0.475	0.527	0.0	0.025	0.65	0.65	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG01583	0.607	0.674	0.0	0.034	0.381	0.381	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG01595	0.602	0.669	0.0	0.042	0.568	0.568	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG01879	0.345	0.383	0.007	0.05	0.857	0.898	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG02568	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG02922	1.013	1.125	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG03006	0.636	0.706	0.0	0.016	0.658	0.658	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG03052	0.362	0.403	0.0	0.031	0.5	0.5	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG03642	0.869	0.966	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	HG03742	0.369	0.41	0.0	0.043	0.913	0.913	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA12878	0.884	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA18525	0.331	0.368	0.0	0.05	0.867	0.867	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA18939	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA19017	0.99	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA19238	0.448	0.498	0.0	0.029	0.488	0.504	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA19239	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA19625	1.048	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA19648	0.4	0.445	0.0	0.052	0.773	0.773	1	1
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA20502	0.805	0.894	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr12	116208916	116208980	DEL	65	NA20845	0.851	0.946	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG00096	0.4	0.421	0.0	0.016	0.583	0.583	1	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG00268	0.225	0.237	0.0	0.037	0.875	0.875	1	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG00419	0.993	1.045	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG00759	0.473	0.498	0.0	0.007	0.28	0.295	1	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG01051	0.206	0.217	0.0	0.006	1.0	1.0	1	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG01112	0.713	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG01500	0.214	0.225	0.0	0.017	0.667	0.696	1	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG01583	0.655	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG01595	0.301	0.317	0.0	0.049	0.917	0.917	1	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG01879	0.618	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG02568	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG02922	0.633	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG03006	0.4	0.421	0.0	0.032	0.429	0.429	1	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG03052	0.682	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	HG03742	0.33	0.348	0.0	0.052	0.706	0.706	1	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA12878	0.969	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA18525	0.296	0.312	0.0	0.009	0.478	0.478	1	1
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA18939	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA19017	0.673	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA19238	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA19239	0.692	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA19625	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA19648	0.625	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA20502	0.575	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	117903558	117903614	DEL	57	NA20845	0.436	0.459	0.0	0.023	0.812	0.812	1	1
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG00096	1.128	1.035	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG00268	1.023	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG00419	1.034	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG00759	1.262	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG01112	1.006	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG01500	1.104	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG01565	1.279	1.174	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG01583	1.19	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG01595	1.124	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG01879	1.108	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG02568	0.921	0.845	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG02922	1.224	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG03006	0.872	0.8	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG03052	1.109	1.017	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG03642	0.997	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	HG03742	0.778	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA12878	1.361	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA18525	1.064	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA18939	1.097	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA19017	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA19238	1.121	1.028	0.0	0.0	0.86	0.887	1	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA19239	1.136	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA19625	1.099	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA19648	1.0	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA20502	0.782	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	11856188	11856244	DUP	57	NA20845	1.026	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG00096	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG00268	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG00419	0.6	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG00759	0.828	0.828	0.0	0.0	0.857	0.902	1	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG01051	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG01112	0.951	0.951	0.0	0.0	0.68	0.644	1	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG01500	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG01565	0.949	0.949	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG01583	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG01595	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG01879	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG02568	0.806	0.806	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG02922	0.802	0.802	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG03006	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG03052	1.066	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG03642	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	HG03742	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA12878	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA18525	1.064	1.064	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA18939	1.205	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA19017	0.99	0.99	0.0	0.0	0.931	0.889	1	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA19238	0.844	0.844	0.0	0.0	1.0	0.97	1	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA19239	0.94	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA19625	0.894	0.894	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA19648	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA20502	1.172	1.172	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	119441523	119442318	DEL	796	NA20845	1.004	1.004	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG00096	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG00268	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG00419	0.0	0.0	0.26	0.158	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG00759	0.0	0.0	0.37	0.198	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG01051	0.391	0.391	0.087	0.042	0.278	0.278	1	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG01112	0.475	0.475	0.055	0.046	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG01500	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG01565	0.392	0.392	0.084	0.051	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG01583	0.0	0.0	0.205	0.124	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG01595	0.482	0.482	0.058	0.024	0.375	0.375	1	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG01879	0.0	0.0	0.307	0.203	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG02568	0.844	0.844	0.0	0.005	0.75	0.75	2	2
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG02922	0.0	0.0	0.359	0.165	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG03006	0.545	0.545	0.055	0.052	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG03052	0.533	0.533	0.082	0.052	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG03642	0.511	0.511	0.063	0.042	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	HG03742	0.447	0.447	0.115	0.071	0.6	0.6	2	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA12878	1.054	1.054	0.0	0.0	0.771	0.771	3	2
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA18525	0.0	0.0	0.315	0.171	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA18939	0.0	0.0	0.35	0.159	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA19017	0.43	0.43	0.161	0.062	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA19238	0.488	0.488	0.105	0.059	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA19239	0.522	0.522	0.091	0.054	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA19625	0.383	0.383	0.074	0.069	nan	nan	0	1
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA19648	0.0	0.0	0.385	0.176	nan	nan	0	0
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA20502	1.126	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12026413	12027155	DEL	743	NA20845	0.393	0.393	0.116	0.076	nan	nan	0	1
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG00096	0.855	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG00268	0.78	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG00419	0.765	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG00759	0.71	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG01051	0.659	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG01112	0.75	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG01500	0.766	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG01565	0.619	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG01583	0.777	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG01595	0.883	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG01879	0.727	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG02568	0.767	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG02922	0.781	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG03006	0.745	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG03052	0.81	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG03642	0.537	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	HG03742	0.836	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA12878	1.037	1.25	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA18939	0.881	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA19017	1.047	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA19239	0.849	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA19625	1.073	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA19648	0.65	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA20502	0.667	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122230007	122230060	DEL	54	NA20845	0.655	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG00096	0.855	0.9	0.0	0.0	0.766	0.766	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG00268	0.815	0.858	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG00419	0.848	0.893	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG00759	0.887	0.934	0.0	0.0	0.694	0.731	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG01051	0.803	0.845	0.0	0.004	0.846	0.846	3	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG01112	0.53	0.558	0.0	0.0	0.804	0.849	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG01500	0.872	0.918	0.0	0.0	0.737	0.739	3	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG01565	0.743	0.782	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG01583	1.02	1.073	0.009	0.004	0.829	0.829	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG01595	0.843	0.888	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG01879	0.926	0.975	0.0	0.0	1.0	0.955	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG02568	0.844	0.888	0.0	0.007	0.8	0.8	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG02922	0.949	0.999	0.0	0.0	0.611	0.611	3	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG03006	0.745	0.784	0.0	0.0	0.76	0.76	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG03052	0.938	0.988	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG03642	0.69	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	HG03742	0.953	1.003	0.0	0.0	0.565	0.565	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA12878	0.901	0.949	0.0	0.0	0.616	0.616	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA18525	0.924	0.973	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA18939	0.881	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA19017	0.467	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA19238	0.831	0.874	0.0	0.0	0.605	0.587	3	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA19239	0.718	0.756	0.0	0.0	0.64	0.64	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA19625	0.716	0.753	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA19648	0.925	0.974	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA20502	0.966	1.016	0.0	0.0	0.796	0.752	2	2
chr12	12253382	12254214	DEL	833	NA20845	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG00096	0.164	0.15	0.0	0.004	0.833	0.833	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.017	nan	nan	0	0
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG00419	0.186	0.171	0.0	0.009	0.556	0.556	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG00759	0.296	0.271	0.0	0.01	0.889	0.936	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG01051	0.226	0.208	0.0	0.005	1.0	1.0	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG01112	0.165	0.151	0.0	0.004	0.909	0.861	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG01500	0.374	0.343	0.016	0.009	0.692	0.722	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG01565	0.66	0.606	0.015	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.008	nan	nan	0	0
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG01595	0.04	0.037	0.0	0.0	0.25	0.25	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG01879	0.4	0.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.008	nan	nan	0	0
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG02922	0.253	0.232	0.0	0.005	0.438	0.438	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG03006	0.254	0.233	0.009	0.009	0.833	0.833	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG03052	0.085	0.078	0.0	0.005	0.538	0.538	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG03642	0.179	0.164	0.01	0.0	0.875	0.875	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	HG03742	0.33	0.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA12878	0.187	0.172	0.0	0.008	0.632	0.632	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA18525	0.209	0.192	0.0	0.005	0.381	0.381	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA18939	0.288	0.264	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA19017	0.374	0.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA19238	0.514	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA19239	0.64	0.587	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA19625	0.256	0.234	0.0	0.002	0.5	0.5	1	1
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA19648	0.25	0.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.004	nan	nan	0	0
chr12	122947416	122947466	DEL	51	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.009	nan	nan	0	0
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG00096	1.328	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG00268	0.797	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG00419	0.786	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG00759	0.887	0.814	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG01051	0.844	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG01112	0.85	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG01500	0.872	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG01565	0.887	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG01583	1.408	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG01595	0.883	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG01879	0.563	0.517	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG02922	0.865	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG03006	0.963	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG03052	0.554	0.509	0.0	0.028	0.593	0.593	1	1
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG03642	0.69	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	HG03742	0.991	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA12878	0.935	0.858	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA18525	0.994	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA18939	1.133	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA19017	0.635	0.583	0.0	0.0	0.429	0.449	1	1
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA19238	0.435	0.399	0.0	0.032	0.811	0.836	1	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA19239	0.496	0.455	0.0	0.021	0.75	0.75	1	1
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA19625	1.227	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA19648	0.9	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA20502	0.989	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	123834077	123834140	DEL	64	NA20845	1.244	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG00096	0.91	1.011	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG00268	0.815	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG00419	0.889	0.988	0.0	0.0	0.565	0.565	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG00759	0.73	0.811	0.0	0.0	0.905	0.86	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG01051	0.885	0.983	0.0	0.0	0.753	0.753	4	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG01112	0.75	0.833	0.0	0.0	0.476	0.48	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG01500	0.872	0.969	0.0	0.0	0.695	0.697	4	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG01565	0.867	0.963	0.0	0.0	0.727	0.727	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG01583	0.971	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG01595	0.542	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG01879	0.763	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG02568	0.997	1.108	0.0	0.0	0.801	0.801	6	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG02922	0.401	0.445	0.049	0.006	0.333	0.333	6	1
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG03006	0.817	0.908	0.006	0.0	0.818	0.818	4	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG03052	0.917	1.019	0.0	0.0	0.581	0.581	4	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG03642	0.869	0.966	0.0	0.0	0.688	0.688	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	HG03742	0.603	0.67	0.0	0.003	0.914	0.914	4	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA12878	0.833	0.926	0.0	0.0	0.73	0.73	2	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA18525	0.907	1.007	0.0	0.003	0.889	0.889	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA18939	0.701	0.779	0.0	0.0	0.8	0.796	4	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA19017	0.617	0.685	0.0	0.0	0.8	0.764	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA19238	0.897	0.996	0.0	0.0	0.845	0.844	2	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA19239	0.823	0.914	0.0	0.0	0.748	0.748	2	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA19625	0.997	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA19648	0.95	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA20502	0.851	0.945	0.0	0.0	0.929	0.926	3	2
chr12	12465517	12466159	DEL	643	NA20845	0.764	0.849	0.0	0.004	0.9	0.9	3	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG00096	0.692	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG00268	0.745	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG01500	0.659	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG01879	0.636	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG02568	0.767	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG02922	0.675	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG03052	1.045	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	HG03642	0.665	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	NA12878	1.037	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	NA18525	1.133	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	NA19017	0.71	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	NA19238	0.758	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	NA19239	0.797	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124709001	124709118	DUP	118	NA20502	0.874	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG00096	0.528	0.636	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG00268	0.468	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG00419	0.455	0.548	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG00759	0.592	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG01051	0.556	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG01112	0.183	0.22	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG01500	0.766	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG01565	0.764	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG01583	0.655	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG01595	0.161	0.194	0.0	0.1	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG01879	0.327	0.394	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG02568	0.575	0.693	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG03006	0.272	0.328	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG03052	0.49	0.591	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG03642	0.332	0.4	0.0	0.123	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	HG03742	0.272	0.328	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA12878	0.289	0.348	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA18525	0.715	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA18939	0.288	0.347	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA19017	0.411	0.495	0.0	0.084	0.603	0.6	2	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA19238	0.25	0.302	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.217	nan	nan	0	0
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA19625	0.664	0.801	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA19648	0.725	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA20502	0.575	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	124795816	124795936	DEL	121	NA20845	0.262	0.316	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG00096	0.801	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG00268	0.763	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG00419	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG00759	0.631	0.613	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG01051	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG01112	0.75	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG01500	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG01565	0.268	0.26	0.0	0.054	0.667	0.667	1	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG01583	1.262	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG01595	0.703	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG01879	0.454	0.441	0.0	0.045	0.333	0.349	1	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG02922	0.506	0.492	0.0	0.047	0.364	0.364	1	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG03006	0.817	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG03642	0.665	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	HG03742	0.311	0.302	0.0	0.053	0.3	0.3	1	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA12878	0.561	0.545	0.0	0.029	0.474	0.474	1	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA18525	0.68	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA18939	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA19017	0.42	0.408	0.0	0.024	0.219	0.229	1	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	0
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA19239	0.34	0.33	0.0	0.055	0.806	0.806	1	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA19625	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	1
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA20502	0.759	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126825401	126825492	DEL	92	NA20845	0.687	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG00096	0.491	0.565	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG00268	0.451	0.518	0.015	0.195	nan	nan	0	0
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG00419	0.041	0.048	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG00759	0.118	0.136	0.009	0.141	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG01051	0.309	0.355	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG01112	0.073	0.084	0.009	0.094	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.194	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG01565	0.371	0.427	0.007	0.087	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG01583	0.049	0.056	0.017	0.136	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG01595	0.0	0.0	0.006	0.217	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG01879	0.163	0.188	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG02568	0.038	0.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG02922	0.063	0.073	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG03006	0.109	0.125	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG03052	0.426	0.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG03642	0.0	0.0	0.012	0.272	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	HG03742	0.33	0.38	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA12878	0.51	0.586	0.004	0.0	0.583	0.583	1	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA18525	0.122	0.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.242	nan	nan	0	0
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA19017	0.206	0.236	0.0	0.005	1.0	0.955	1	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA19238	0.356	0.409	0.0	0.0	0.893	0.866	2	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA19239	0.131	0.15	0.004	0.114	0.455	0.455	1	1
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA19625	0.089	0.103	0.0	0.154	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA19648	0.575	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA20502	0.299	0.344	0.0	0.085	nan	nan	0	2
chr12	126905101	126905415	DEL	315	NA20845	0.065	0.075	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG00268	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG00759	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG01051	0.803	0.803	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG01112	0.53	0.53	0.0	0.027	0.581	0.613	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG01500	1.211	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG01583	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG01879	0.509	0.509	0.0	0.027	0.966	0.922	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG02568	0.537	0.537	0.0	0.034	0.639	0.639	2	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG03006	0.0	0.0	0.008	0.053	nan	nan	0	0
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG03052	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG03642	1.202	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	HG03742	0.486	0.486	0.0	0.033	0.765	0.765	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA12878	0.357	0.357	0.0	0.026	0.783	0.783	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA18525	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA18939	0.521	0.521	0.0	0.007	0.486	0.508	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA19017	0.467	0.467	0.0	0.018	0.759	0.756	2	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA19238	0.501	0.501	0.0	0.027	1.0	0.97	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA19239	0.94	0.94	0.0	0.0	0.769	0.769	2	2
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA19625	0.511	0.511	0.0	0.035	0.861	0.861	2	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA19648	0.55	0.55	0.0	0.01	0.615	0.615	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA20502	0.575	0.575	0.0	0.023	0.862	0.913	1	1
chr12	127947266	127947318	DEL	53	NA20845	1.353	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG00096	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG00268	0.849	0.894	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG00419	0.765	0.806	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG00759	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG01051	0.823	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG01112	0.713	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG01500	1.068	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG01565	0.743	0.782	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG01583	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG01595	0.763	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG01879	0.926	0.975	0.0	0.004	1.0	0.955	1	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG02568	0.46	0.485	0.07	0.059	nan	nan	0	1
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG02922	0.527	0.555	0.063	0.027	nan	nan	0	1
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG03006	0.726	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG03052	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG03642	0.741	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	HG03742	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA12878	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA18525	1.064	1.12	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA18939	0.899	0.946	0.0	0.0	0.923	0.965	1	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA19017	0.99	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA19238	0.962	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA19239	1.058	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA19625	0.843	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA19648	1.05	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA20502	0.92	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	12807245	12807944	DEL	700	NA20845	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG00096	0.655	0.69	0.0	0.0	0.611	0.611	3	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG00268	0.329	0.347	0.09	0.032	0.211	0.211	6	1
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG00419	0.869	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG00759	1.025	1.079	0.0	0.0	0.806	0.765	2	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG01051	0.926	0.975	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG01112	0.75	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG01500	0.997	1.049	0.007	0.004	0.467	0.447	3	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG01565	0.991	1.043	0.0	0.0	0.64	0.64	5	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG01583	0.68	0.716	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG01595	0.723	0.761	0.0	0.0	0.692	0.692	3	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG01879	0.836	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG02568	0.921	0.969	0.0	0.0	0.563	0.563	4	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG02922	0.886	0.933	0.007	0.0	0.804	0.804	4	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG03006	0.926	0.975	0.0	0.0	0.706	0.706	5	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG03052	0.682	0.718	0.0	0.0	0.875	0.875	5	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG03642	0.767	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	HG03742	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA12878	0.952	1.003	0.0	0.0	0.693	0.693	2	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA18525	0.994	1.046	0.004	0.004	0.724	0.724	5	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA18939	0.665	0.7	0.0	0.0	0.758	0.766	2	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA19017	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA19238	1.028	1.082	0.0	0.003	0.853	0.88	1	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA19239	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA19625	0.716	0.753	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA19648	1.075	1.132	0.0	0.0	0.703	0.703	2	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA20502	0.782	0.823	0.0	0.0	0.617	0.653	2	2
chr12	128276666	128277449	DEL	784	NA20845	0.938	0.988	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG00096	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG00268	0.711	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG00419	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG00759	0.71	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG01051	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG01112	0.695	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG01500	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG01565	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG01583	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG01595	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG01879	0.527	0.527	0.083	0.03	nan	nan	0	1
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG02568	0.69	0.69	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG02922	1.013	1.013	0.0	0.0	0.611	0.611	2	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG03006	0.781	0.781	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG03052	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG03642	0.869	0.869	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	HG03742	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA12878	0.986	0.986	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA18525	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA18939	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA19017	1.028	1.028	0.0	0.003	0.824	0.863	1	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA19238	0.831	0.831	0.003	0.0	0.844	0.87	2	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA19239	0.483	0.483	0.084	0.048	nan	nan	0	1
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA19625	0.997	0.997	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA19648	0.9	0.9	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA20502	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	128811295	128812057	DEL	763	NA20845	1.004	1.004	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG00268	0.503	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG00419	0.662	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG00759	0.335	0.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG01051	0.556	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG01112	0.604	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG01500	0.57	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG01565	0.578	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG01583	0.898	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG01595	0.642	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG01879	0.581	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG02568	0.652	0.75	0.0	0.0	0.619	0.619	2	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG02922	0.549	0.63	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG03006	0.726	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG03052	0.618	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG03642	0.69	0.794	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	HG03742	0.719	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	NA12878	0.816	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	NA18525	0.767	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	NA18939	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	NA19238	0.745	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	NA19239	0.757	0.871	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	NA20502	0.92	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131093927	131094224	DUP	298	NA20845	0.589	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG00096	1.31	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG00268	1.109	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG00419	1.282	1.198	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG00759	1.38	1.29	0.0	0.0	0.816	0.775	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG01051	0.988	0.923	0.0	0.0	0.887	0.887	4	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG01112	1.372	1.282	0.009	0.0	0.844	0.799	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG01500	1.157	1.081	0.0	0.0	0.821	0.822	4	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG01565	1.135	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG01583	1.141	1.066	0.0	0.0	0.717	0.717	4	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG01595	1.225	1.145	0.0	0.0	0.724	0.724	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG01879	1.163	1.087	0.0	0.0	0.545	0.571	1	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG02568	0.959	0.896	0.0	0.0	0.697	0.697	2	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG02922	1.076	1.006	0.0	0.0	0.52	0.52	1	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG03006	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG03052	0.704	0.658	0.073	0.054	nan	nan	0	1
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG03642	1.202	1.123	0.0	0.0	0.87	0.87	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	HG03742	1.225	1.145	0.0	0.0	0.685	0.685	4	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA12878	0.969	0.906	0.0	0.0	0.964	0.964	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA18525	0.61	0.57	0.08	0.063	nan	nan	0	1
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA18939	1.241	1.159	0.0	0.0	0.854	0.893	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA19017	1.252	1.17	0.0	0.0	0.641	0.672	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA19238	1.239	1.158	0.0	0.0	0.74	0.718	1	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA19239	1.162	1.086	0.0	0.0	0.786	0.786	5	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA19625	1.022	0.955	0.0	0.0	0.793	0.793	2	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA19648	1.275	1.192	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA20502	1.241	1.16	0.0	0.0	0.833	0.787	3	2
chr12	13177427	13178188	DEL	762	NA20845	1.266	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG00096	0.564	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG00268	0.555	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG00419	0.745	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG00759	0.592	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG01051	0.515	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG01112	0.549	0.694	0.0	0.0	0.958	0.947	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG01500	0.481	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG01565	0.454	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG01583	0.388	0.492	0.0	0.054	0.75	0.75	7	1
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG01595	0.381	0.483	0.0	0.0	0.667	0.667	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG01879	0.49	0.621	0.0	0.0	0.667	0.698	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG02568	0.614	0.777	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG02922	0.591	0.748	0.0	0.0	0.889	0.889	5	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG03006	0.49	0.621	0.0	0.0	0.692	0.692	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG03052	0.256	0.324	0.0	0.07	0.333	0.333	6	1
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG03642	0.639	0.809	0.0	0.0	0.427	0.427	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	HG03742	0.525	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA12878	0.663	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA18525	0.785	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA18939	0.467	0.592	0.0	0.0	0.483	0.505	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA19017	0.635	0.804	0.0	0.0	0.515	0.539	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA19238	0.567	0.718	0.0	0.0	0.8	0.825	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA19239	0.235	0.298	0.0	0.095	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA19625	0.588	0.744	0.011	0.0	0.6	0.6	1	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA19648	0.563	0.712	0.0	0.0	0.679	0.679	6	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA20502	0.667	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	131928480	131928587	DEL	108	NA20845	0.502	0.635	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG00096	0.346	0.397	0.0	0.086	0.833	0.833	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG00268	0.572	0.657	0.0	0.082	0.714	0.714	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG00419	0.393	0.452	0.008	0.049	0.842	0.842	1	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG00759	0.848	0.975	0.0	0.0	0.739	0.702	1	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG01051	0.535	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG01112	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG01500	0.837	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG01565	0.949	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG01583	0.68	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG01595	0.341	0.392	0.0	0.054	0.5	0.5	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG02568	1.036	1.19	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG02922	0.422	0.485	0.0	0.056	0.579	0.579	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG03006	0.872	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG03052	0.512	0.588	0.0	0.082	0.407	0.407	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG03642	1.176	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	HG03742	0.428	0.492	0.0	0.059	0.407	0.407	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA12878	0.986	1.134	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA18525	0.453	0.521	0.0	0.078	0.87	0.87	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA18939	0.809	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA19017	0.804	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA19238	0.448	0.515	0.0	0.081	0.683	0.704	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA19239	0.548	0.63	0.0	0.076	0.604	0.604	1	1
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA19625	0.588	0.676	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA19648	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA20502	0.391	0.449	0.0	0.06	0.52	0.551	1	2
chr12	13199068	13199172	DEL	105	NA20845	0.546	0.627	0.0	0.005	0.5	0.5	1	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG00096	0.655	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG00268	0.659	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG00419	0.496	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG00759	0.414	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG01051	0.432	0.521	0.0	0.0	0.583	0.583	3	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG01112	0.475	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG01500	0.605	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG01565	0.578	0.696	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG01583	0.704	0.848	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG01595	0.512	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG01879	0.599	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG02568	0.882	1.063	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG02922	0.57	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG03006	0.49	0.591	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG03052	0.682	0.822	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG03642	0.844	1.017	0.0	0.0	0.235	0.235	1	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	HG03742	0.447	0.539	0.0	0.0	0.583	0.583	2	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA12878	0.748	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA18525	0.331	0.399	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA18939	0.27	0.325	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA19017	0.523	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA19238	0.633	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA19239	0.562	0.677	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA19625	0.588	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA19648	0.9	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA20502	0.851	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	132986994	132987423	DEL	430	NA20845	0.458	0.552	0.0	0.01	0.75	0.75	1	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG00096	0.637	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG00268	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG00419	0.745	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG00759	0.572	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG01051	0.7	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG01112	0.732	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG01500	0.445	0.445	0.007	0.073	nan	nan	0	1
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG01565	0.454	0.454	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG01583	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG01595	0.622	0.622	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG01879	0.727	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG02568	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG03006	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG03052	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG03642	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	HG03742	0.408	0.408	0.0	0.105	0.833	0.833	2	1
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA12878	0.867	0.867	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA18525	0.558	0.558	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA18939	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA19017	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA19238	1.358	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA19239	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA19625	1.048	1.048	0.007	0.0	0.739	0.739	1	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA19648	0.55	0.55	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA20502	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	133771505	133771657	DEL	153	NA20845	0.458	0.458	0.01	0.089	0.833	0.833	1	1
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG00096	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG00268	0.884	0.884	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG00419	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG00759	0.947	0.947	0.0	0.0	0.727	0.766	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG01051	0.947	0.947	0.0	0.0	0.657	0.657	2	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG01112	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG01500	1.033	1.033	0.0	0.0	0.833	0.799	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG01565	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG01583	0.825	0.825	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG01595	0.502	0.502	0.065	0.041	nan	nan	0	1
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG01879	0.89	0.89	0.0	0.0	1.0	0.955	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG02568	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG02922	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG03006	0.999	0.999	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG03052	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG03642	0.818	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	HG03742	0.875	0.875	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA12878	0.748	0.748	0.0	0.003	0.609	0.609	2	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA18525	0.384	0.384	0.09	0.052	nan	nan	0	1
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA18939	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA19017	1.047	1.047	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA19238	0.976	0.976	0.0	0.0	0.475	0.48	2	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA19239	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA19625	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA19648	1.125	1.125	0.0	0.0	0.2	0.2	1	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA20502	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1365582	1366374	DEL	793	NA20845	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG00096	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG00268	1.031	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG00419	0.931	0.98	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG00759	0.858	0.903	0.0	0.0	0.444	0.468	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG01051	0.906	0.953	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG01112	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG01500	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG01565	0.764	0.804	0.0	0.0	0.674	0.674	2	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG01583	0.655	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG01595	0.803	0.845	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG01879	0.817	0.86	0.0	0.0	0.75	0.716	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG02568	0.499	0.525	0.045	0.035	nan	nan	0	1
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG02922	0.886	0.933	0.0	0.0	0.836	0.836	2	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG03006	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG03052	1.002	1.055	0.0	0.0	0.935	0.935	2	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG03642	0.92	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	HG03742	0.885	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA12878	0.374	0.394	0.051	0.039	nan	nan	0	1
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA18525	1.133	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA18939	0.917	0.965	0.0	0.0	0.81	0.774	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA19017	0.617	0.649	0.0	0.0	0.643	0.673	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA19238	1.16	1.221	0.0	0.0	0.922	0.95	1	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA19239	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA19625	0.92	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA19648	1.15	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA20502	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13725912	13726562	DEL	651	NA20845	0.829	0.873	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG00096	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG00268	0.945	0.945	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.088	nan	nan	0	0
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG00759	0.572	0.572	0.0	0.043	0.485	0.51	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG01051	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG01112	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG01500	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG01565	0.392	0.392	0.0	0.082	0.905	0.905	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG01583	0.534	0.534	0.0	0.067	0.36	0.36	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG01879	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG02568	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG02922	0.738	0.738	0.0	0.067	0.452	0.452	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.123	nan	nan	0	0
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG03052	0.469	0.469	0.0	0.094	0.833	0.833	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG03642	0.626	0.626	0.0	0.057	0.52	0.52	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	HG03742	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA12878	0.629	0.629	0.0	0.051	0.422	0.422	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA18525	0.366	0.366	0.0	0.087	0.9	0.9	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA18939	0.485	0.485	0.0	0.053	0.395	0.413	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA19017	0.42	0.42	0.0	0.073	0.759	0.795	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	0
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA19625	0.613	0.613	0.0	0.037	0.355	0.355	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA19648	0.5	0.5	0.0	0.064	0.613	0.613	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA20502	0.598	0.598	0.0	0.091	0.676	0.716	1	1
chr12	13941609	13941706	DEL	98	NA20845	0.371	0.371	0.0	0.044	0.667	0.667	1	1
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG00096	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG00268	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG00419	1.241	1.205	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG00759	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG01051	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG01112	0.732	0.71	0.059	0.073	nan	nan	0	1
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG01500	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG01565	1.259	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG01583	0.595	0.577	0.067	0.098	nan	nan	0	1
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG01595	1.164	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG01879	1.253	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG02568	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG02922	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG03006	0.563	0.547	0.06	0.081	nan	nan	0	1
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG03052	1.109	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG03642	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	HG03742	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA12878	0.425	0.413	0.016	0.068	nan	nan	0	1
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA18525	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA18939	1.241	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA19017	1.14	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA19238	1.015	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA19239	1.11	1.078	0.0	0.0	0.974	0.974	1	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA19625	1.048	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA19648	0.55	0.534	0.028	0.14	nan	nan	0	1
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA20502	0.0	0.0	0.121	0.297	nan	nan	0	0
chr12	14052329	14052822	DEL	494	NA20845	0.371	0.36	0.076	0.108	nan	nan	0	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG00096	0.601	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG00268	0.763	0.763	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG00419	0.745	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG00759	0.414	0.414	0.04	0.035	nan	nan	0	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG01051	0.638	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG01112	0.695	0.695	0.0	0.0	0.167	0.158	1	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG01500	0.819	0.819	0.0	0.0	0.8	0.835	1	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG01565	0.681	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG01583	0.437	0.437	0.085	0.052	nan	nan	0	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG01595	0.703	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG01879	0.745	0.745	0.0	0.0	0.875	0.87	2	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG02568	0.307	0.307	0.161	0.188	nan	nan	0	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG02922	0.696	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG03006	0.381	0.381	0.063	0.035	0.833	0.833	1	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG03052	0.213	0.213	0.134	0.046	0.545	0.545	1	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG03642	0.332	0.332	0.055	0.047	nan	nan	0	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	HG03742	0.311	0.311	0.083	0.059	nan	nan	0	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA12878	0.697	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA18525	0.907	0.907	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA18939	0.701	0.701	0.0	0.0	0.667	0.697	1	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA19017	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA19238	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA19239	0.653	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA19625	0.562	0.562	0.032	0.053	0.75	0.75	1	1
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA19648	0.55	0.55	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA20502	0.621	0.621	0.0	0.0	0.857	0.908	1	2
chr12	1437990	1438610	DEL	621	NA20845	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG00096	0.965	0.965	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG00268	0.693	0.693	0.0	0.0	0.714	0.714	5	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG00419	0.92	0.92	0.0	0.0	0.67	0.67	4	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG00759	0.848	0.848	0.0	0.0	0.695	0.661	4	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG01051	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG01112	0.86	0.86	0.0	0.0	0.933	0.985	4	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG01500	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG01565	0.784	0.784	0.0	0.0	1.0	1.0	4	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG01583	0.85	0.85	0.0	0.0	0.333	0.333	4	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG01595	0.903	0.903	0.0	0.0	0.35	0.35	4	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG01879	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG02568	0.844	0.844	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG02922	0.359	0.359	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG03006	0.908	0.908	0.0	0.0	0.85	0.85	2	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG03052	0.469	0.469	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG03642	0.946	0.946	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	HG03742	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA12878	0.833	0.833	0.0	0.0	0.664	0.664	2	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA18525	0.994	0.994	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA18939	0.881	0.881	0.0	0.0	0.8	0.765	5	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA19017	0.785	0.785	0.0	0.0	0.75	0.716	2	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA19238	0.435	0.435	0.0	0.0	0.458	0.473	1	1
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA19239	0.914	0.914	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA19625	0.869	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA19648	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA20502	1.057	1.057	0.0	0.0	0.567	0.536	4	2
chr12	15568413	15569357	DEL	945	NA20845	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG00096	0.928	0.901	0.0	0.0	0.765	0.765	2	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG00268	1.196	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG00419	1.22	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG00759	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG01051	1.255	1.219	0.0	0.0	0.687	0.687	2	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG01112	0.786	0.763	0.0	0.0	0.757	0.799	2	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG01500	1.033	1.003	0.0	0.0	0.857	0.894	1	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG01565	1.094	1.062	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG01583	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG01595	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG01879	1.217	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG02568	0.882	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG02922	0.886	0.86	0.0	0.0	0.807	0.807	2	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG03006	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG03052	1.13	1.097	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG03642	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	HG03742	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA12878	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA18525	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA18939	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA19017	1.047	1.016	0.0	0.0	0.929	0.973	1	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA19238	1.147	1.114	0.0	0.0	0.574	0.557	1	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA19239	1.058	1.027	0.003	0.0	0.83	0.83	2	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA19625	0.588	0.571	0.068	0.072	0.533	0.533	3	1
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA19648	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA20502	1.103	1.071	0.0	0.0	0.698	0.699	2	2
chr12	16306763	16307385	DEL	623	NA20845	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG00096	0.946	1.051	0.0	0.0	0.862	0.862	1	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG00268	0.849	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG00419	0.703	0.781	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG00759	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG01051	0.617	0.686	0.0	0.0	0.71	0.71	2	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG01112	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG01500	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG01565	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG01583	0.68	0.755	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG01595	0.663	0.736	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG01879	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG02568	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG02922	0.886	0.985	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG03006	0.726	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG03052	0.554	0.616	0.092	0.053	nan	nan	0	1
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG03642	0.869	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	HG03742	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA12878	0.85	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA18525	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA18939	0.593	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA19017	0.934	1.038	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA19238	0.409	0.454	0.114	0.06	nan	nan	0	1
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA19239	0.875	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA19625	0.869	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA19648	0.675	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA20502	0.851	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	16883229	16884040	DEL	812	NA20845	0.829	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG00096	0.437	0.46	0.0	0.098	0.325	0.325	14	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG00268	0.468	0.493	0.01	0.08	0.182	0.182	8	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG00419	0.538	0.566	0.013	0.101	0.235	0.235	14	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG00759	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG01051	0.206	0.217	0.025	0.184	0.75	0.75	14	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG01112	0.805	0.847	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG01500	0.498	0.525	0.016	0.063	0.222	0.232	1	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG01565	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG01583	0.0	0.0	0.044	0.138	nan	nan	0	0
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG01595	0.381	0.402	0.007	0.092	0.477	0.477	6	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG01879	0.981	1.033	0.0	0.0	0.5	0.524	1	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG02568	1.227	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG02922	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG03006	0.345	0.363	0.006	0.086	0.264	0.264	14	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG03052	0.832	0.875	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG03642	0.537	0.565	0.014	0.109	0.268	0.268	6	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	HG03742	0.0	0.0	0.006	0.222	nan	nan	0	0
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA12878	0.0	0.0	0.004	0.261	nan	nan	0	0
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA18525	0.61	0.642	0.0	0.117	nan	nan	0	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA18939	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA19017	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA19238	0.923	0.971	0.0	0.0	0.742	0.765	1	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA19239	1.045	1.1	0.0	0.002	0.875	0.875	1	2
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA19625	0.613	0.646	0.012	0.054	nan	nan	0	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA19648	0.5	0.526	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA20502	0.644	0.678	0.009	0.139	0.35	0.371	6	1
chr12	1864004	1864320	DEL	317	NA20845	0.96	1.011	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG00096	0.564	0.594	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG00268	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG00419	0.951	1.001	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG00759	0.749	0.789	0.0	0.0	0.722	0.686	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG01051	0.864	0.91	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG01112	0.713	0.751	0.0	0.0	0.706	0.745	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG01500	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG01565	0.805	0.847	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG01583	0.753	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG01595	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG01879	0.381	0.402	0.047	0.077	nan	nan	0	1
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG02568	0.652	0.686	0.034	0.086	nan	nan	0	1
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG02922	0.401	0.422	0.016	0.071	nan	nan	0	1
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG03006	0.726	0.765	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG03052	0.959	1.01	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG03642	0.844	0.888	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	HG03742	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA12878	0.986	1.038	0.0	0.0	0.855	0.855	2	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA18525	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA18939	0.773	0.814	0.0	0.0	0.565	0.591	1	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA19017	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA19238	0.831	0.874	0.0	0.0	0.819	0.795	2	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA19239	0.431	0.454	0.008	0.083	nan	nan	0	1
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA19625	0.409	0.43	0.024	0.082	nan	nan	0	1
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA19648	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA20502	0.92	0.968	0.0	0.0	0.811	0.859	2	2
chr12	1924405	1924883	DEL	479	NA20845	0.655	0.689	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG00096	1.219	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG00268	1.092	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG00419	1.034	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG00759	0.414	0.38	0.0	0.032	0.833	0.877	1	1
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG01051	1.132	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG01112	1.372	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG01500	1.068	0.98	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG01565	1.362	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG01583	1.19	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG01595	1.345	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG01879	1.035	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG02568	1.036	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG02922	1.561	1.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG03006	1.362	1.25	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG03052	1.301	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG03642	1.202	1.103	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	HG03742	1.439	1.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA12878	1.088	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA18525	1.29	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA18939	1.402	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA19017	1.233	1.132	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA19238	1.226	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA19239	1.136	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA19625	0.997	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA19648	1.3	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA20502	0.575	0.527	0.0	0.029	0.778	0.824	1	1
chr12	20336932	20336990	DEL	59	NA20845	1.331	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG00096	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG00268	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG00419	0.641	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG00759	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG01051	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG01112	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG01500	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG01565	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG01583	0.74	0.719	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG01595	1.185	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG01879	0.0	0.0	0.017	0.164	nan	nan	0	1
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG02568	0.614	0.596	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG02922	0.738	0.717	0.004	0.059	nan	nan	0	1
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG03006	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG03052	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG03642	1.355	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	HG03742	0.914	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA12878	0.697	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA18525	0.889	0.863	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA18939	1.115	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA19017	0.934	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA19238	0.58	0.563	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA19239	1.149	1.116	0.0	0.0	0.755	0.755	1	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA19625	0.409	0.397	0.007	0.063	nan	nan	0	1
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA19648	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA20502	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	21861574	21861929	DEL	356	NA20845	1.309	1.271	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG00096	0.4	0.389	0.0	0.074	0.575	0.575	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG00268	1.213	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG00419	0.476	0.462	0.0	0.046	0.307	0.307	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG00759	0.769	0.747	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG01051	0.741	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG01500	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG01583	0.68	0.66	0.0	0.033	0.333	0.333	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG01595	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG01879	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG02568	1.419	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG02922	0.485	0.471	0.0	0.078	0.502	0.502	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG03006	0.763	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG03052	0.533	0.518	0.0	0.052	0.6	0.6	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG03642	0.435	0.422	0.0	0.067	0.594	0.594	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	HG03742	0.544	0.528	0.0	0.074	0.748	0.748	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA12878	0.374	0.363	0.0	0.026	0.533	0.533	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA18525	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA18939	0.791	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA19017	0.635	0.617	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA19238	0.422	0.41	0.0	0.075	0.769	0.762	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA19239	0.47	0.456	0.0	0.076	0.567	0.567	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA19625	0.741	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA19648	0.425	0.413	0.0	0.062	0.287	0.287	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA20502	0.598	0.58	0.0	0.076	0.469	0.461	2	1
chr12	22047473	22047575	DEL	103	NA20845	0.393	0.381	0.0	0.036	0.53	0.53	2	1
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG00096	0.746	0.697	0.05	0.035	0.5	0.5	1	1
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG00268	1.196	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG00419	1.303	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG00759	1.183	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG01051	1.399	1.308	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG01112	0.0	0.0	0.183	0.091	nan	nan	0	0
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG01500	0.605	0.566	0.084	0.042	nan	nan	0	1
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG01565	1.3	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG01583	0.583	0.545	0.06	0.027	0.176	0.176	3	1
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG01595	0.924	0.863	0.062	0.028	0.5	0.5	1	1
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG01879	1.108	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG02568	1.074	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG02922	1.076	1.006	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG03006	1.344	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG03052	1.151	1.076	0.006	0.0	0.294	0.294	1	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG03642	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	HG03742	1.264	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA12878	0.0	0.0	0.104	0.087	nan	nan	0	0
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA18525	1.308	1.222	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA18939	1.169	1.092	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA19017	0.785	0.734	0.088	0.035	nan	nan	0	1
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA19238	1.266	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA19239	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA19625	0.997	0.931	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA19648	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA20502	0.621	0.58	0.039	0.024	0.25	0.236	1	1
chr12	23939446	23940212	DEL	767	NA20845	0.655	0.612	0.044	0.028	0.154	0.154	1	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG00096	0.328	0.345	0.0	0.062	0.167	0.167	1	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG00419	0.0	0.0	0.023	0.092	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG00759	0.217	0.228	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG01051	0.0	0.0	0.009	0.101	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG01112	0.494	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG01500	0.267	0.281	0.013	0.022	nan	nan	0	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG01565	0.248	0.261	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG01583	0.558	0.588	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG01595	0.0	0.0	0.009	0.069	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG01879	0.218	0.229	0.0	0.017	nan	nan	0	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG02568	0.537	0.565	0.013	0.06	0.35	0.35	2	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG02922	0.253	0.266	0.009	0.048	nan	nan	0	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG03006	0.0	0.0	0.031	0.074	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG03642	0.0	0.0	0.012	0.089	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	HG03742	0.0	0.0	0.006	0.09	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA12878	0.4	0.421	0.0	0.039	0.279	0.279	2	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA18525	0.0	0.0	0.012	0.106	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA18939	0.0	0.0	0.012	0.11	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA19017	0.411	0.433	0.0	0.0	0.5	0.477	1	2
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA19238	0.606	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA19239	0.47	0.495	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA19625	0.307	0.323	0.023	0.039	nan	nan	0	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA19648	0.0	0.0	0.042	0.137	nan	nan	0	0
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA20502	0.322	0.339	0.022	0.083	0.167	0.157	1	1
chr12	24460412	24460701	DEL	290	NA20845	0.0	0.0	0.018	0.061	nan	nan	0	0
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG00096	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG00268	1.473	1.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG00419	1.158	1.124	0.0	0.0	0.944	0.944	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG00759	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG01051	1.194	1.159	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG01112	0.777	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG01500	1.3	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG01565	1.094	1.062	0.0	0.0	0.815	0.815	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG01583	0.923	0.896	0.0	0.0	0.801	0.801	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG01595	1.345	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG01879	1.117	1.085	0.0	0.0	0.821	0.86	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG02568	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG02922	1.329	1.29	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG03006	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG03052	0.704	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG03642	1.023	0.993	0.0	0.0	0.724	0.724	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	HG03742	1.302	1.265	0.0	0.0	0.72	0.72	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA12878	0.833	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA18525	1.072	1.041	0.0	0.0	0.793	0.793	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA18939	1.384	1.344	0.007	0.003	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA19017	1.289	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA19238	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA19239	0.81	0.786	0.0	0.0	0.788	0.788	2	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA19625	1.329	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA19648	0.65	0.631	0.0	0.034	0.917	0.917	3	1
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA20502	1.609	1.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940383	24940450	DEL	68	NA20845	0.502	0.487	0.0	0.038	0.667	0.667	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG00096	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG00268	1.005	1.005	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG00419	1.117	1.117	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG00759	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG01051	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG01112	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG01500	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG01565	0.867	0.867	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG01583	1.165	1.165	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG01595	1.164	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG01879	1.19	1.19	0.0	0.0	0.686	0.655	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG02568	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG02922	1.287	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG03006	1.29	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG03052	1.215	1.215	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG03642	1.304	1.304	0.0	0.0	0.483	0.483	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	HG03742	0.914	0.914	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA12878	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA18939	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA19017	1.215	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA19238	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA19239	0.94	0.94	0.004	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA19625	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA19648	0.5	0.5	0.064	0.05	nan	nan	0	1
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA20502	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	24940930	24941657	DEL	728	NA20845	0.567	0.567	0.04	0.023	nan	nan	0	1
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG00096	0.946	0.996	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG00268	0.884	0.931	0.0	0.004	0.548	0.548	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG00419	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG00759	0.73	0.768	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG01051	0.823	0.867	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG01112	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG01500	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG01565	0.887	0.934	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG01583	1.092	1.15	0.0	0.0	0.318	0.318	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG01595	0.964	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG01879	0.999	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG02568	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG02922	1.034	1.088	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG03006	0.89	0.937	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG03052	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG03642	1.023	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	HG03742	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA12878	0.969	1.02	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA18525	0.628	0.661	0.0	0.005	0.938	0.938	1	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA18939	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA19017	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA19238	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA19239	0.953	1.003	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA19625	0.383	0.404	0.0	0.075	0.9	0.9	1	1
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA19648	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA20502	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	26057033	26057206	DEL	174	NA20845	0.96	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG00096	0.801	0.92	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG00268	0.953	1.096	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG00419	1.055	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG00759	1.065	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG01051	1.008	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG01112	0.951	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG01500	0.819	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG01565	0.887	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG01583	0.388	0.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG01595	0.783	0.9	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG01879	0.817	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG02568	0.882	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG02922	0.907	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG03006	0.599	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG03052	0.917	1.054	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG03642	1.023	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	HG03742	1.011	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA12878	0.833	0.958	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA18525	1.064	1.223	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA18939	0.611	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA19238	0.844	0.97	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA19239	1.162	1.336	0.0	0.0	0.953	0.953	1	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA19625	0.971	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA19648	0.825	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA20502	1.011	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27356909	27356969	DUP	61	NA20845	0.764	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG00096	0.237	0.249	0.0	0.033	0.818	0.818	4	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG00268	0.537	0.566	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG00419	0.538	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG00759	0.67	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG01051	0.535	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG01112	0.622	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG01500	0.89	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG01565	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG01583	0.218	0.23	0.0	0.037	0.8	0.8	4	1
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG01595	0.582	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG01879	0.49	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG02568	0.23	0.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG02922	0.464	0.489	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG03006	0.509	0.535	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG03052	0.448	0.471	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG03642	0.435	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	HG03742	0.564	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA12878	0.629	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA18525	0.976	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA18939	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA19017	0.71	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA19238	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA19239	0.588	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA19625	0.307	0.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA19648	0.3	0.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA20502	0.437	0.46	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	27879861	27879947	DEL	87	NA20845	0.371	0.391	0.0	0.025	0.571	0.571	4	1
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG00096	0.328	0.377	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG00268	0.433	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG00419	0.476	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG00759	0.355	0.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG01051	0.556	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG01112	0.402	0.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG01500	0.623	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG01565	0.206	0.237	0.0	0.04	0.875	0.875	1	1
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG01583	0.316	0.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG01595	0.442	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG01879	0.327	0.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG02568	0.384	0.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG02922	0.506	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG03006	0.163	0.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG03052	0.299	0.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG03642	0.409	0.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	HG03742	0.175	0.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA12878	0.68	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA18525	0.697	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA18939	0.162	0.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA19017	0.654	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA19238	0.514	0.591	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA19239	0.418	0.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA19625	0.307	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA19648	0.05	0.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA20502	0.345	0.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28096471	28096539	DEL	69	NA20845	0.371	0.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG00096	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG00419	0.91	0.884	0.0	0.0	0.519	0.519	1	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG00759	1.4	1.359	0.0	0.0	0.964	0.985	1	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG01051	0.947	0.919	0.0	0.009	0.95	0.95	1	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG01500	0.944	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG01565	0.887	0.861	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG01583	0.607	0.589	0.0	0.035	0.561	0.561	2	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG01595	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG01879	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG03006	1.035	1.005	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG03052	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	HG03742	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	NA12878	0.595	0.578	0.0	0.032	0.178	0.178	1	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	NA19017	0.878	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	NA19239	0.562	0.545	0.0	0.035	0.524	0.524	2	2
chr12	28823496	28823578	DUP	83	NA19625	0.332	0.323	0.0	0.04	0.856	0.856	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG00096	0.983	0.983	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG00268	1.04	1.04	0.0	0.0	0.895	0.895	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG00419	1.117	1.117	0.0	0.0	0.929	0.929	3	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG00759	1.223	1.223	0.0	0.0	0.62	0.589	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG01051	1.297	1.297	0.0	0.0	0.801	0.801	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG01112	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG01500	0.819	0.819	0.0	0.0	0.521	0.543	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG01565	0.784	0.784	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG01583	1.117	1.117	0.0	0.0	0.729	0.729	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG01595	1.004	1.004	0.0	0.0	0.736	0.736	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG01879	0.799	0.799	0.0	0.004	0.321	0.337	3	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG02568	1.112	1.112	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG02922	1.034	1.034	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG03006	1.108	1.108	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG03052	1.002	1.002	0.0	0.0	0.88	0.88	3	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG03642	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	HG03742	0.914	0.914	0.0	0.0	0.839	0.839	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA12878	0.85	0.85	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA18525	0.942	0.942	0.0	0.0	0.806	0.806	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA18939	0.953	0.953	0.0	0.0	0.636	0.609	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA19017	1.103	1.103	0.0	0.0	0.621	0.65	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA19238	1.134	1.134	0.0	0.0	0.935	0.906	1	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA19239	1.123	1.123	0.0	0.0	0.886	0.886	3	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA19625	1.227	1.227	0.0	0.0	0.788	0.788	2	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA19648	1.075	1.075	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA20502	0.552	0.552	0.077	0.04	nan	nan	0	1
chr12	29111728	29112475	DEL	748	NA20845	0.96	0.96	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG00096	0.837	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG00268	0.832	0.924	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG00419	0.248	0.276	0.119	0.116	nan	nan	0	1
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG00759	0.434	0.482	0.008	0.061	nan	nan	0	1
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG01051	0.7	0.777	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG01112	0.366	0.406	0.035	0.08	0.667	0.632	1	1
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG01500	0.712	0.791	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG01565	0.991	1.101	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG01583	0.898	0.998	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG01595	1.004	1.115	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG01879	0.727	0.807	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG02568	0.806	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG02922	0.717	0.797	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG03006	0.89	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG03052	0.768	0.853	0.004	0.0	0.5	0.5	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG03642	0.767	0.852	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	HG03742	0.778	0.864	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA12878	0.969	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA18525	0.68	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA18939	0.342	0.38	0.032	0.078	nan	nan	0	1
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA19017	0.953	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA19238	0.725	0.806	0.0	0.0	0.8	0.825	1	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA19239	0.0	0.0	0.043	0.239	nan	nan	0	0
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA19625	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA19648	0.975	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA20502	0.782	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	2952913	2953450	DEL	538	NA20845	0.764	0.849	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG00096	1.074	0.985	0.0	0.0	0.656	0.656	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG00268	0.867	0.795	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG00419	1.344	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG00759	1.4	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG01051	1.132	1.038	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG01112	1.225	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG01500	1.086	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG01565	1.568	1.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG01583	0.437	0.401	0.011	0.125	nan	nan	0	1
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG01595	1.305	1.197	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG01879	1.163	1.067	0.0	0.0	0.703	0.736	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG02568	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG02922	1.224	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG03006	1.199	1.1	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG03052	1.173	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG03642	1.636	1.501	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	HG03742	1.244	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA12878	0.629	0.577	0.0	0.0	0.938	0.937	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA18525	1.142	1.048	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA18939	1.312	1.204	0.004	0.0	0.842	0.88	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA19017	1.084	0.994	0.0	0.0	0.8	0.838	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA19238	0.976	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA19239	1.071	0.982	0.0	0.0	0.878	0.878	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA19625	1.073	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA19648	1.15	1.055	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA20502	1.034	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30009527	30009822	DEL	296	NA20845	1.266	1.161	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG00096	0.564	0.594	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG00268	0.728	0.766	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG00419	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG00759	0.513	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG01051	0.679	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG01112	0.768	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG01500	0.641	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG01565	0.64	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG01583	0.631	0.664	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG01595	0.522	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG01879	0.563	0.593	0.0	0.071	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG02568	0.844	0.888	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG02922	0.549	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG03006	0.563	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG03052	0.896	0.943	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG03642	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	HG03742	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA12878	0.748	0.788	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA18525	0.549	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA18939	0.539	0.568	0.0	0.0	0.857	0.896	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA19017	0.299	0.315	0.012	0.092	nan	nan	0	1
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA19238	0.646	0.68	0.0	0.095	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA19239	0.692	0.729	0.0	0.0	0.655	0.655	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA19625	0.869	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA19648	0.675	0.711	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA20502	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233557	30233826	DEL	270	NA20845	0.415	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG00096	0.51	0.51	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG00268	0.693	0.693	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG00419	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG00759	0.493	0.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG01051	0.648	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG01112	0.768	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG01500	0.694	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG01565	0.537	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG01583	0.631	0.631	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG01595	0.522	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG01879	0.254	0.254	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG02568	0.671	0.671	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG02922	0.506	0.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG03006	0.581	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG03052	0.853	0.853	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG03642	0.818	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	HG03742	0.68	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA12878	0.714	0.714	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA18525	0.68	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA18939	0.539	0.539	0.0	0.0	0.857	0.896	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA19017	0.336	0.336	0.0	0.095	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA19238	0.435	0.435	0.0	0.097	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA19239	0.692	0.692	0.0	0.0	0.655	0.655	1	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA19625	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA19648	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA20502	0.713	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30233700	30233849	DEL	150	NA20845	0.48	0.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG00096	0.0	0.0	0.064	0.262	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG00268	0.0	0.0	0.123	0.246	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG00419	0.517	0.502	0.038	0.087	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG00759	0.493	0.479	0.035	0.098	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG01051	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG01112	0.0	0.0	0.117	0.251	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG01500	0.0	0.0	0.105	0.204	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG01565	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG01583	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG01595	0.622	0.604	0.037	0.078	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG01879	0.0	0.0	0.052	0.25	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG02568	0.0	0.0	0.064	0.192	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG02922	0.464	0.451	0.059	0.059	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG03006	0.908	0.882	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG03052	0.597	0.58	0.032	0.114	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG03642	0.0	0.0	0.055	0.212	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	HG03742	0.0	0.0	0.082	0.214	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA12878	0.459	0.446	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA18525	1.029	0.999	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA18939	1.241	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA19017	0.934	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA19238	1.187	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA19239	0.535	0.52	0.009	0.097	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA19625	0.46	0.447	0.041	0.069	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA19648	0.0	0.0	0.058	0.161	nan	nan	0	0
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA20502	0.575	0.558	0.053	0.101	nan	nan	0	1
chr12	30371300	30371728	DEL	429	NA20845	0.546	0.53	0.051	0.103	nan	nan	0	1
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG00096	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG00268	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG00419	0.662	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG00759	0.375	0.375	0.0	0.041	0.75	0.789	1	1
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG01051	0.761	0.761	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG01112	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG01500	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG01565	0.289	0.289	0.0	0.031	0.737	0.737	1	1
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG01583	0.486	0.486	0.0	0.025	0.4	0.4	1	1
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG01595	0.743	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG01879	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG02568	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG02922	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG03006	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG03052	0.832	0.832	0.0	0.023	0.372	0.372	1	1
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG03642	1.253	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	HG03742	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA12878	0.714	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA18525	1.238	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA18939	0.288	0.288	0.0	0.031	0.773	0.808	1	1
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA19017	0.542	0.542	0.0	0.025	0.531	0.557	1	1
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA19238	0.817	0.817	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA19239	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA19625	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA19648	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA20502	0.92	0.92	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	30500336	30500425	DEL	90	NA20845	0.775	0.775	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG00096	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG00268	0.901	1.002	0.0	0.003	0.842	0.842	2	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG00419	0.993	1.103	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG00759	0.434	0.482	0.037	0.075	nan	nan	0	1
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG01051	0.823	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG01112	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG01500	0.73	0.811	0.0	0.0	0.797	0.794	2	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG01565	0.268	0.298	0.072	0.107	0.556	0.556	2	1
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG01583	0.388	0.432	0.051	0.048	nan	nan	0	1
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG01595	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG01879	0.945	1.05	0.0	0.003	0.798	0.796	2	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG02568	0.882	0.98	0.0	0.0	0.602	0.602	2	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG02922	0.654	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG03006	0.963	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG03052	0.426	0.474	0.024	0.096	nan	nan	0	1
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG03642	1.125	1.25	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	HG03742	1.069	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA12878	0.901	1.002	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA18525	0.837	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA18939	0.503	0.559	0.057	0.139	0.714	0.747	2	1
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA19017	0.374	0.415	0.05	0.1	nan	nan	0	1
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA19238	0.883	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA19239	1.077	1.197	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA19625	0.818	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA19648	0.7	0.778	0.0	0.0	0.736	0.736	2	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA20502	0.828	0.92	0.0	0.0	0.743	0.787	2	2
chr12	30508156	30508633	DEL	478	NA20845	0.742	0.824	0.0	0.005	0.728	0.728	2	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG00096	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG00268	0.468	0.468	0.044	0.084	nan	nan	0	1
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG00419	0.393	0.393	0.067	0.052	nan	nan	0	1
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG00759	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG01051	0.453	0.453	0.032	0.066	nan	nan	0	1
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG01112	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG01500	0.463	0.463	0.043	0.07	nan	nan	0	1
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG01565	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG01583	0.0	0.0	0.139	0.178	nan	nan	0	0
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG01595	1.024	1.024	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG01879	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG02568	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG02922	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG03006	0.0	0.0	0.13	0.204	nan	nan	0	0
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG03052	1.151	1.151	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG03642	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	HG03742	0.0	0.0	0.083	0.171	nan	nan	0	0
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA12878	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA18525	0.471	0.471	0.023	0.071	nan	nan	0	1
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA18939	1.133	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA19017	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA19238	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA19239	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA19625	1.278	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA19648	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA20502	0.0	0.0	0.13	0.184	nan	nan	0	0
chr12	30918300	30918795	DEL	496	NA20845	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG00096	0.4	0.46	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG00268	0.537	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG00419	0.6	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG00759	0.532	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG01051	0.453	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG01112	0.475	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG01500	0.57	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG01565	0.537	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG01583	0.655	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG01595	0.582	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG01879	0.163	0.188	0.012	0.077	nan	nan	0	1
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG02568	0.652	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG02922	0.443	0.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG03006	0.708	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG03052	0.299	0.343	0.007	0.119	nan	nan	0	1
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG03642	0.741	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	HG03742	0.292	0.335	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA12878	0.663	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA18525	0.575	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA18939	0.503	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA19017	0.392	0.451	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA19238	0.58	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA19239	0.614	0.705	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA19625	0.639	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA19648	0.575	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA20502	0.759	0.872	0.0	0.0	0.556	0.588	1	2
chr12	3143060	3143454	DEL	395	NA20845	0.458	0.527	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG00096	0.946	0.946	0.0	0.0	0.958	0.958	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG00268	0.797	0.797	0.0	0.0	0.868	0.868	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG00419	0.951	0.951	0.0	0.0	0.769	0.769	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG00759	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG01051	0.926	0.926	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG01112	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG01500	1.104	1.104	0.0	0.0	0.822	0.858	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG01565	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG01583	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG01595	1.004	1.004	0.0	0.0	0.824	0.824	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG01879	0.872	0.872	0.0	0.007	0.75	0.786	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG02568	1.112	1.112	0.0	0.0	0.871	0.871	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG02922	0.865	0.865	0.0	0.0	0.533	0.533	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG03006	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG03052	0.469	0.469	0.068	0.033	nan	nan	0	1
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG03642	1.048	1.048	0.0	0.0	0.792	0.792	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	HG03742	0.875	0.875	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA12878	0.901	0.901	0.0	0.0	0.69	0.69	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA18525	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA18939	0.953	0.953	0.0	0.0	0.917	0.877	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA19017	0.953	0.953	0.0	0.0	0.837	0.799	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA19238	0.976	0.976	0.0	0.0	0.857	0.831	1	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA19239	0.966	0.966	0.0	0.0	0.78	0.78	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA19625	1.252	1.252	0.0	0.0	0.636	0.636	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA19648	1.125	1.125	0.0	0.0	0.688	0.688	3	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA20502	0.897	0.897	0.0	0.0	0.657	0.696	2	2
chr12	31723448	31724195	DEL	748	NA20845	0.829	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG00096	0.4	0.389	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG00268	0.971	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG00419	0.558	0.542	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG00759	1.4	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG01051	0.906	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG01112	1.262	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG01500	1.068	1.037	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG01565	1.011	0.982	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG01583	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG01595	0.944	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG01879	0.872	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG02568	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG02922	0.928	0.901	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG03006	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG03052	0.959	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG03642	0.818	0.794	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr12	32443055	32443160	DEL	106	HG03742	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA12878	0.85	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA18525	0.942	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA18939	0.467	0.454	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA19017	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA19238	1.239	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA19239	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA19625	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA19648	1.15	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA20502	0.736	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	32443055	32443160	DEL	106	NA20845	0.72	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG00096	0.0	0.0	0.008	0.238	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG00268	0.0	0.0	0.021	0.212	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG00419	0.0	0.0	0.064	0.25	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG00759	0.651	0.608	0.019	0.097	nan	nan	0	1
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG01051	0.0	0.0	0.022	0.187	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG01112	0.0	0.0	0.012	0.216	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG01500	0.0	0.0	0.012	0.241	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG01565	0.0	0.0	0.029	0.225	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG01583	0.0	0.0	0.013	0.236	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG01595	0.0	0.0	0.011	0.189	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG01879	0.0	0.0	0.013	0.247	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG02568	0.0	0.0	0.019	0.226	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG02922	0.0	0.0	0.037	0.207	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG03006	0.0	0.0	0.011	0.214	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG03052	0.0	0.0	0.008	0.247	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG03642	0.0	0.0	0.031	0.203	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	HG03742	0.0	0.0	0.008	0.225	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.183	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA18525	0.0	0.0	0.018	0.211	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA18939	0.0	0.0	0.02	0.247	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA19017	0.0	0.0	0.021	0.221	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA19238	0.0	0.0	0.005	0.205	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA19239	0.0	0.0	0.005	0.209	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA19625	0.0	0.0	0.044	0.222	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	0
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA20502	1.172	1.096	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	41183193	41183503	DEL	311	NA20845	0.0	0.0	0.05	0.173	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG00268	0.416	0.438	0.0	0.082	0.871	0.871	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG00419	0.31	0.327	0.0	0.037	0.828	0.828	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG00759	0.473	0.498	0.0	0.05	0.817	0.86	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG01112	0.0	0.0	0.006	0.075	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG01500	0.57	0.6	0.006	0.042	0.583	0.579	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG01565	0.33	0.348	0.0	0.048	0.654	0.654	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG01583	0.583	0.613	0.0	0.056	0.512	0.512	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG02568	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG02922	0.0	0.0	0.005	0.132	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	HG03742	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA12878	0.561	0.591	0.0	0.046	0.795	0.795	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA19017	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA19238	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA19239	0.522	0.55	0.0	0.045	0.584	0.584	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA19625	0.588	0.619	0.007	0.062	0.542	0.542	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA20502	0.483	0.508	0.0	0.058	0.885	0.926	2	1
chr12	41757437	41757525	DEL	89	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	0
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG00096	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG00268	1.248	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG00419	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG00759	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG01051	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG01112	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG01500	1.317	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG01565	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG01583	1.408	1.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG01595	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG01879	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG02568	1.458	1.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG02922	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG03006	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG03052	0.853	0.853	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG03642	1.253	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	HG03742	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA12878	0.833	0.833	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA18525	0.558	0.558	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA18939	0.0	0.0	0.022	0.179	nan	nan	0	1
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA19017	1.215	1.215	0.0	0.004	0.692	0.725	1	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA19238	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA19239	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA19625	1.329	1.329	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA19648	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA20502	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	41899444	41899690	DEL	247	NA20845	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG00096	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG00268	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG00419	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG00759	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG01051	0.391	0.412	0.057	0.027	nan	nan	0	1
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG01112	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG01500	0.961	1.012	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG01565	0.495	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG01583	0.631	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG01595	0.944	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG01879	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG02568	0.499	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG02922	0.633	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG03006	0.726	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG03052	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG03642	1.023	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	HG03742	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA12878	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA18525	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA18939	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA19017	1.009	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA19238	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA19239	0.94	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA19625	0.92	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA19648	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA20502	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	43045286	43045903	DEL	618	NA20845	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG00096	0.965	1.015	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG00268	0.797	0.839	0.0	0.002	0.92	0.92	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG00419	0.434	0.457	0.048	0.048	nan	nan	0	1
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG00759	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG01051	1.008	1.062	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG01112	0.658	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG01500	0.748	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG01565	1.073	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG01583	0.898	0.946	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG01595	0.883	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG01879	0.654	0.688	0.0	0.0	0.591	0.564	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG02568	1.266	1.332	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG02922	0.781	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG03006	0.835	0.879	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG03052	1.109	1.167	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG03642	0.69	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	HG03742	0.836	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA12878	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA18525	1.029	1.083	0.0	0.0	0.861	0.861	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA18939	0.485	0.511	0.051	0.057	nan	nan	0	1
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA19017	0.785	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA19238	0.831	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA19239	0.797	0.838	0.0	0.0	0.835	0.835	2	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA19625	1.048	1.103	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA19648	0.975	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA20502	1.31	1.379	0.0	0.0	0.923	0.872	1	2
chr12	4388696	4389281	DEL	586	NA20845	0.633	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG00096	0.928	0.977	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG00268	0.815	0.858	0.0	0.004	0.92	0.92	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG00419	0.662	0.697	0.046	0.046	nan	nan	0	1
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG00759	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG01051	1.029	1.083	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG01112	0.677	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG01500	0.748	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG01565	0.991	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG01583	0.85	0.894	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG01595	0.763	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG01879	0.654	0.688	0.0	0.0	0.591	0.564	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG02568	1.189	1.252	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG02922	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG03006	0.781	0.822	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG03052	1.045	1.1	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG03642	0.716	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	HG03742	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA12878	0.935	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA18525	0.959	1.009	0.0	0.0	0.861	0.861	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA18939	0.521	0.549	0.047	0.052	nan	nan	0	1
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA19017	0.878	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA19238	0.883	0.93	0.0	0.0	0.659	0.679	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA19239	0.901	0.948	0.0	0.0	0.835	0.835	2	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA19625	0.946	0.995	0.0	0.0	0.765	0.765	2	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA19648	1.0	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA20502	1.149	1.21	0.0	0.0	0.923	0.872	1	2
chr12	4388717	4389666	DEL	950	NA20845	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG00096	0.164	0.182	0.0	0.135	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG00268	0.225	0.25	0.016	0.153	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG00419	0.248	0.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG00759	0.532	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG01051	0.309	0.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG01112	0.329	0.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG01500	0.463	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG01565	0.495	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG01583	0.34	0.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG01595	0.341	0.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG01879	0.145	0.161	0.028	0.142	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG02568	0.0	0.0	0.017	0.254	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG02922	0.274	0.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG03006	0.327	0.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG03052	0.128	0.142	0.006	0.121	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG03642	0.639	0.71	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	HG03742	0.476	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA12878	0.374	0.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA18525	0.645	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA18939	0.333	0.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA19017	0.168	0.187	0.017	0.126	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA19238	0.356	0.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA19239	0.679	0.754	0.0	0.289	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA19625	0.102	0.114	0.045	0.126	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA19648	0.025	0.028	0.012	0.141	nan	nan	0	1
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA20502	0.575	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45011174	45011496	DEL	323	NA20845	0.436	0.485	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG00419	1.013	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG00759	0.789	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG01051	0.412	0.433	0.0	0.047	0.556	0.556	1	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	1
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG01565	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG01583	1.165	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG01595	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG01879	0.89	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG02568	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG02922	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG03006	0.49	0.516	0.0	0.05	0.5	0.5	1	1
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG03052	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG03642	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	HG03742	0.583	0.614	0.0	0.069	0.412	0.412	1	1
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA12878	0.425	0.448	0.0	0.037	0.333	0.333	1	1
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA18525	0.907	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA18939	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA19017	1.103	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA19238	0.897	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA19239	0.849	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA19625	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA19648	0.4	0.421	0.0	0.053	0.737	0.737	1	1
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.158	nan	nan	0	1
chr12	45948359	45948444	DEL	86	NA20845	0.698	0.735	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG00096	0.91	0.91	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG00268	1.04	1.04	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG00419	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG00759	1.045	1.045	0.0	0.0	0.591	0.596	2	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG01051	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG01112	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG01500	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG01565	1.156	1.156	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG01583	0.971	0.971	0.0	0.0	0.686	0.686	2	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG01595	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG01879	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG02568	0.46	0.46	0.048	0.019	nan	nan	0	1
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG02922	0.949	0.949	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG03006	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG03052	0.704	0.704	0.062	0.039	nan	nan	0	1
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG03642	0.818	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	HG03742	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA12878	0.799	0.799	0.003	0.003	0.469	0.469	1	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA18525	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA18939	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA19017	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA19238	1.094	1.094	0.0	0.0	0.907	0.935	1	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA19239	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA19625	0.971	0.971	0.008	0.0	0.588	0.588	1	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA19648	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA20502	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46472957	46473858	DEL	902	NA20845	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG00096	1.056	1.025	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG00419	1.272	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG00759	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG01051	1.05	1.019	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG01112	0.933	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG01500	1.015	0.985	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG01565	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG01583	1.141	1.108	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG01595	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG01879	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG02568	1.227	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG02922	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG03006	1.108	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG03052	1.066	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG03642	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	HG03742	1.108	1.076	0.0	0.0	0.552	0.552	1	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA12878	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA18525	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA18939	1.241	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA19017	0.374	0.363	0.117	0.084	nan	nan	0	1
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA19238	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA19239	0.496	0.482	0.094	0.048	nan	nan	0	1
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA19625	0.971	0.943	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA19648	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA20502	0.828	0.803	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr12	46631156	46632071	DEL	916	NA20845	1.048	1.017	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG00096	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG00268	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG00419	1.189	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG00759	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG01051	1.461	1.461	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG01112	1.134	1.134	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG01500	1.211	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG01565	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG01583	1.117	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG01595	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG01879	0.345	0.345	0.0	0.063	0.773	0.81	1	1
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG02568	1.343	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG02922	0.992	0.992	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG03006	1.29	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG03052	0.533	0.533	0.0	0.022	0.375	0.375	1	1
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG03642	0.563	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	HG03742	1.205	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA12878	0.765	0.765	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA18525	1.203	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA18939	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA19017	1.121	1.121	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA19238	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA19239	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA19625	1.201	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA19648	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA20502	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	47238793	47238892	DEL	100	NA20845	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG00096	0.728	0.766	0.0	0.0	0.571	0.571	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG00268	0.936	0.985	0.0	0.0	0.84	0.84	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG00419	0.91	0.958	0.0	0.0	0.75	0.75	4	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG00759	0.947	0.996	0.0	0.0	0.789	0.75	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG01051	0.679	0.715	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG01112	0.0	0.0	0.243	0.183	nan	nan	0	0
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG01500	1.033	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG01565	0.702	0.739	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG01583	0.923	0.971	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG01595	0.863	0.909	0.0	0.0	0.895	0.895	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG01879	0.727	0.765	0.0	0.0	0.765	0.73	1	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG02568	0.69	0.727	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG02922	0.759	0.799	0.0	0.0	0.775	0.775	4	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG03006	0.872	0.918	0.0	0.0	0.693	0.693	4	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG03052	0.789	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG03642	0.741	0.781	0.0	0.0	0.889	0.889	4	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	HG03742	1.03	1.085	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA12878	1.02	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA18525	0.889	0.936	0.0	0.0	0.741	0.741	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA18939	0.809	0.852	0.006	0.0	0.936	0.957	4	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA19017	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA19238	1.081	1.138	0.0	0.0	0.826	0.831	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA19239	1.097	1.155	0.0	0.0	0.902	0.902	4	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA19625	0.639	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA19648	1.1	1.158	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA20502	0.851	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	48910587	48911227	DEL	641	NA20845	0.873	0.919	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG00096	0.965	0.965	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG00268	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG00419	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG00759	0.69	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG01051	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG01112	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG01500	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG01565	0.475	0.475	0.049	0.011	nan	nan	0	1
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG01583	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG01595	1.024	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG01879	0.999	0.999	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG02568	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG02922	0.928	0.928	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG03006	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG03052	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG03642	0.639	0.639	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	HG03742	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA12878	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA18525	1.116	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA18939	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA19017	0.841	0.841	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA19238	0.751	0.751	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA19239	1.058	1.058	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA19625	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA19648	1.25	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA20502	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	49824037	49824642	DEL	606	NA20845	1.135	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG00096	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG00268	0.572	0.636	0.0	0.073	0.429	0.429	1	1
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG00419	0.951	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG00759	0.966	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG01051	0.535	0.595	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG01112	0.878	0.975	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG01500	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG01565	0.722	0.802	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG01583	1.19	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG01595	0.381	0.424	0.01	0.058	nan	nan	0	1
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG01879	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG02568	0.384	0.426	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG02922	0.907	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG03006	0.418	0.464	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG03052	0.832	0.924	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG03642	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	HG03742	1.011	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA12878	0.816	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA18525	1.046	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA18939	0.557	0.619	0.013	0.066	nan	nan	0	1
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA19017	0.878	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA19238	1.042	1.157	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA19239	0.783	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA19625	0.562	0.625	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA19648	1.15	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA20502	1.057	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52354757	52354890	DEL	134	NA20845	0.458	0.509	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG00096	0.637	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG00268	0.225	0.237	0.064	0.007	0.5	0.5	3	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG00419	0.538	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG00759	0.572	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG01051	0.206	0.217	0.04	0.0	0.75	0.75	6	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG01112	0.53	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG01500	0.338	0.356	0.106	0.0	nan	nan	0	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG01565	0.578	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG01583	0.51	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG01595	0.301	0.317	0.057	0.0	nan	nan	0	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG01879	0.4	0.421	0.015	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG02568	0.23	0.242	0.035	0.02	nan	nan	0	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG02922	0.506	0.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG03006	0.0	0.0	0.168	0.0	nan	nan	0	0
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG03052	0.597	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG03642	0.486	0.511	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	HG03742	0.603	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA12878	0.646	0.68	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA18525	0.663	0.697	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA18939	0.324	0.341	0.057	0.0	0.4	0.383	7	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA19017	0.673	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA19238	0.58	0.611	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA19239	0.562	0.591	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA19625	0.204	0.215	0.132	0.0	nan	nan	0	1
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA19648	0.65	0.684	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA20502	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	52395074	52395845	DEL	772	NA20845	0.218	0.23	0.07	0.0	nan	nan	0	1
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG00096	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG00268	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG00419	0.434	0.457	0.063	0.018	nan	nan	0	1
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG00759	0.947	0.996	0.0	0.0	0.538	0.512	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG01051	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG01112	0.914	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG01500	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG01565	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG01583	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG01595	0.703	0.74	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG01879	0.609	0.641	0.0	0.0	0.88	0.922	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG02568	0.614	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG02922	1.055	1.11	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG03006	0.799	0.841	0.0	0.0	0.512	0.512	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG03052	0.832	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG03642	0.92	0.969	0.0	0.005	0.667	0.667	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	HG03742	0.797	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA12878	0.85	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA18525	0.976	1.028	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA18939	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA19017	1.028	1.082	0.0	0.0	0.926	0.97	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA19238	0.91	0.958	0.0	0.0	0.56	0.578	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA19239	0.966	1.017	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA19625	0.843	0.888	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA19648	0.975	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA20502	1.034	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	54840588	54841243	DEL	656	NA20845	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG00096	1.128	1.128	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG00268	1.127	1.127	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG00419	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG00759	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG01051	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG01112	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG01500	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG01565	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG01583	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG01595	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG01879	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG02568	0.997	0.997	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG02922	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG03006	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG03052	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG03642	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	HG03742	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA12878	0.51	0.51	0.0	0.014	0.688	0.688	1	1
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA18525	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA18939	1.384	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA19017	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA19238	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA19239	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA19625	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA19648	1.3	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA20502	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	55127306	55127366	DEL	61	NA20845	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG00096	0.892	0.939	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG00268	0.971	1.022	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG00419	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG00759	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG01051	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG01112	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG01500	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG01565	0.929	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG01583	1.092	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG01595	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG01879	0.854	0.899	0.0	0.0	0.857	0.898	1	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG02568	1.151	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG02922	0.97	1.022	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG03006	0.944	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG03052	0.832	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG03642	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	HG03742	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA12878	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA18525	1.064	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA18939	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA19017	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA19238	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA19239	1.005	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA19625	0.332	0.35	0.115	0.081	nan	nan	0	1
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA19648	1.075	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA20502	0.966	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	56864062	56864799	DEL	738	NA20845	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG00096	0.601	0.583	0.0	0.0	0.476	0.476	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG00268	0.52	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG00419	0.434	0.422	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG00759	0.454	0.44	0.0	0.0	0.692	0.729	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG01051	0.329	0.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG01112	0.384	0.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG01500	0.605	0.588	0.0	0.0	0.941	0.982	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG01565	0.433	0.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG01583	0.486	0.471	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG01595	0.301	0.292	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG01879	0.472	0.459	0.0	0.0	0.889	0.848	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG02568	0.422	0.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG02922	0.359	0.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG03006	0.599	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG03052	0.32	0.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG03642	0.639	0.621	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	HG03742	0.486	0.472	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA12878	0.68	0.66	0.0	0.003	0.941	0.941	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA18525	0.506	0.491	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA18939	0.719	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA19017	0.486	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA19238	0.409	0.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA19239	0.287	0.279	0.0	0.021	0.526	0.526	1	1
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA19625	0.716	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA19648	0.35	0.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA20502	0.598	0.58	0.0	0.0	0.4	0.378	1	2
chr12	58267168	58267222	DEL	55	NA20845	0.589	0.572	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG00096	0.928	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG00268	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG00419	0.755	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG00759	1.459	1.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG01051	0.947	0.885	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG01112	1.116	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG01500	1.335	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG01565	1.3	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG01583	0.0	0.0	0.033	0.171	nan	nan	0	1
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG01595	1.124	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG01879	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG02568	0.921	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG02922	1.329	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG03006	1.017	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG03052	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG03642	0.563	0.526	0.008	0.104	nan	nan	0	1
chr12	59373902	59374227	DEL	326	HG03742	1.021	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA12878	0.799	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA18525	0.924	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA18939	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA19017	0.916	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA19238	1.107	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA19239	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA19625	1.124	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA19648	0.525	0.491	0.016	0.097	nan	nan	0	1
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA20502	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59373902	59374227	DEL	326	NA20845	1.397	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG00096	1.256	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG00268	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG00419	0.931	0.931	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG00759	1.183	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG01051	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG01112	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG01500	1.317	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG01565	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG01583	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG01595	1.546	1.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG01879	1.362	1.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG02568	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG02922	1.266	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG03006	1.162	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG03052	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG03642	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	HG03742	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA12878	1.31	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA18525	1.238	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA18939	1.259	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA19017	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA19238	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA19239	1.071	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA19625	0.639	0.639	0.0	0.008	0.68	0.68	1	1
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA19648	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA20502	1.287	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59694770	59694824	DEL	55	NA20845	1.135	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG00096	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG00268	1.075	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG00759	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG01051	0.638	0.709	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG01112	0.384	0.427	0.0	0.0	0.619	0.653	3	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG01500	0.855	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG02922	0.612	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG03052	0.469	0.521	0.0	0.003	0.524	0.524	3	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG03642	0.92	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	HG03742	0.797	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	NA12878	0.561	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	NA18939	0.917	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	NA19017	0.785	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	NA19239	0.797	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	NA19625	1.086	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	NA20502	1.103	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	59834242	59834292	DUP	51	NA20845	0.633	0.703	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG00096	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG00268	1.04	0.972	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG00419	1.158	1.082	0.0	0.0	0.895	0.895	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG00759	1.183	1.106	0.0	0.0	0.747	0.742	2	1
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG01051	1.235	1.154	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG01112	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG01500	1.033	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG01565	1.073	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG01583	0.995	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG01595	1.225	1.145	0.0	0.0	0.914	0.914	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG01879	1.09	1.019	0.0	0.0	0.684	0.717	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG02568	0.844	0.789	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG02922	1.16	1.084	0.0	0.0	0.619	0.619	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG03006	1.126	1.052	0.003	0.0	0.917	0.917	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG03052	1.13	1.056	0.0	0.0	0.851	0.851	2	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG03642	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	HG03742	1.244	1.163	0.0	0.0	0.698	0.698	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA12878	0.918	0.858	0.0	0.0	0.98	0.98	2	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA18525	1.011	0.945	0.0	0.0	0.929	0.929	3	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA18939	0.899	0.84	0.0	0.0	0.733	0.744	5	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA19017	1.233	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA19238	0.475	0.444	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA19239	1.227	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA19625	1.073	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA19648	1.225	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA20502	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	60754169	60755147	DEL	979	NA20845	1.113	1.04	0.0	0.0	0.839	0.839	3	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG00096	0.71	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG00268	0.815	0.791	0.0	0.0	0.837	0.837	2	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG00419	0.786	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG00759	0.414	0.402	0.149	0.075	nan	nan	0	1
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG01051	0.947	0.919	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG01112	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG01500	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG01565	0.33	0.321	0.068	0.039	nan	nan	0	1
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG01583	0.825	0.801	0.0	0.0	0.812	0.812	5	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG01595	0.843	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG01879	0.69	0.67	0.0	0.0	0.615	0.645	1	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG02568	0.959	0.931	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG02922	0.802	0.778	0.0	0.0	0.622	0.622	2	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG03006	1.017	0.987	0.0	0.0	0.668	0.668	6	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG03052	0.874	0.849	0.0	0.0	0.861	0.861	2	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG03642	0.895	0.869	0.0	0.0	0.28	0.28	1	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	HG03742	0.7	0.679	0.0	0.0	0.789	0.789	2	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA12878	0.884	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA18525	0.907	0.88	0.0	0.0	0.865	0.865	2	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA18939	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA19017	0.916	0.889	0.0	0.0	0.793	0.806	3	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA19238	0.87	0.845	0.0	0.0	0.615	0.629	3	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA19239	0.457	0.444	0.069	0.038	nan	nan	0	1
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA19625	0.767	0.744	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA19648	0.725	0.704	0.0	0.0	0.741	0.741	2	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA20502	0.759	0.737	0.0	0.0	0.517	0.548	1	2
chr12	61332513	61333365	DEL	853	NA20845	0.764	0.742	0.0	0.0	0.746	0.746	4	2
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG00096	0.874	0.971	0.0	0.24	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.234	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG00419	0.848	0.942	0.016	0.2	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG00759	0.0	0.0	0.007	0.178	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG01051	0.144	0.16	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG01112	0.658	0.732	0.014	0.227	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG01500	0.427	0.475	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG01565	0.598	0.665	0.015	0.219	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG01583	0.583	0.647	0.01	0.166	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG01879	0.563	0.626	0.0	0.177	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG02568	0.422	0.469	0.0	0.2	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG02922	0.654	0.727	0.0	0.186	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG03006	0.163	0.182	0.007	0.12	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG03052	0.586	0.652	0.009	0.183	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG03642	0.588	0.653	0.009	0.194	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	HG03742	0.68	0.756	0.0	0.253	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA12878	0.34	0.378	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA18525	0.628	0.697	0.0	0.234	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA18939	0.0	0.0	0.006	0.253	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA19017	0.523	0.581	0.006	0.154	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA19238	0.58	0.645	0.0	0.208	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA19239	0.614	0.682	0.004	0.227	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA19625	0.818	0.909	0.0	0.211	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA19648	0.588	0.653	0.01	0.203	nan	nan	0	1
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA20502	0.598	0.664	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr12	62295031	62295217	DEL	187	NA20845	0.546	0.606	0.0	0.181	nan	nan	0	1
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG00096	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG00268	1.161	1.128	0.0	0.003	0.944	0.944	1	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG00419	0.579	0.562	0.071	0.063	nan	nan	0	1
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG00759	1.144	1.11	0.0	0.0	0.793	0.835	1	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG01051	0.967	0.939	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG01112	1.244	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG01500	1.139	1.106	0.0	0.0	0.647	0.62	3	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG01565	0.681	0.661	0.059	0.038	nan	nan	0	1
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG01583	1.141	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG01595	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG01879	1.344	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG02568	0.882	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG02922	0.949	0.922	0.006	0.0	0.561	0.561	2	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG03006	1.181	1.146	0.0	0.0	0.811	0.811	3	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG03052	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG03642	1.432	1.39	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	HG03742	1.128	1.095	0.005	0.0	0.514	0.514	3	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA12878	1.122	1.09	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA18525	0.0	0.0	0.106	0.162	nan	nan	0	0
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA18939	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA19017	0.972	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA19238	1.147	1.114	0.0	0.0	0.894	0.891	2	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA19239	1.28	1.242	0.0	0.0	0.922	0.922	1	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA19625	0.537	0.521	0.063	0.057	nan	nan	0	1
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA19648	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA20502	1.195	1.161	0.0	0.0	0.667	0.63	3	2
chr12	62393959	62394495	DEL	537	NA20845	1.113	1.081	0.0	0.0	0.517	0.517	1	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG00096	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG00268	0.711	0.79	0.0	0.0	0.929	0.929	3	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG00419	0.31	0.345	0.071	0.073	0.321	0.321	2	1
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG00759	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG01051	0.515	0.572	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG01112	0.695	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG01500	0.605	0.673	0.011	0.082	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG01565	0.722	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG01583	0.801	0.89	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG01595	0.683	0.758	0.0	0.0	0.7	0.7	2	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG01879	0.654	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG02568	0.69	0.767	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG02922	0.781	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG03006	0.345	0.383	0.025	0.089	nan	nan	0	1
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG03052	0.789	0.877	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG03642	0.614	0.682	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	HG03742	0.68	0.756	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA12878	0.723	0.803	0.0	0.0	0.82	0.82	2	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA18525	0.663	0.736	0.0	0.0	0.938	0.938	3	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA18939	0.378	0.42	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA19017	0.729	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA19238	0.778	0.864	0.0	0.0	0.639	0.62	4	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA19239	0.783	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA19625	0.716	0.795	0.0	0.0	0.523	0.523	2	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA19648	0.575	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA20502	0.644	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	62907472	62907867	DEL	396	NA20845	0.786	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG00096	1.056	0.986	0.0	0.0	0.869	0.869	2	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG00268	0.797	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG00419	0.827	0.773	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG00759	1.085	1.014	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG01051	0.391	0.365	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG01112	0.988	0.923	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG01500	0.73	0.682	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG01565	0.867	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG01583	0.753	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG01595	0.924	0.863	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG01879	0.509	0.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG02568	0.844	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG02922	0.422	0.394	0.0	0.032	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG03006	0.708	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG03052	0.81	0.757	0.0	0.0	0.83	0.83	2	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG03642	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	HG03742	0.816	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA12878	0.85	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA18525	1.029	0.961	0.005	0.003	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA18939	1.205	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA19017	0.748	0.699	0.006	0.0	0.562	0.589	2	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA19238	0.87	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA19239	0.888	0.83	0.0	0.0	0.686	0.686	1	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA19625	0.664	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA19648	0.85	0.795	0.0	0.0	0.967	0.967	2	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA20502	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	64280105	64280331	DEL	227	NA20845	0.851	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG00096	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG00268	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG00419	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG00759	0.71	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG01051	1.111	1.111	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG01112	0.869	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG01500	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG01565	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG01583	0.995	0.995	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG01595	1.285	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG01879	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG02568	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG02922	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG03006	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG03052	0.341	0.341	0.0	0.06	0.5	0.5	1	1
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG03642	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	HG03742	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA12878	1.02	1.02	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA18525	1.203	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA18939	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA19017	0.411	0.411	0.0	0.04	0.63	0.66	1	1
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA19238	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA19239	0.444	0.444	0.0	0.063	0.646	0.646	1	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA19625	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA19648	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA20502	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67449131	67449222	DEL	92	NA20845	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG00096	1.074	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG00268	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG00419	1.365	1.276	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG00759	1.321	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG01051	1.461	1.366	0.0	0.006	0.8	0.8	1	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG01112	1.116	1.043	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG01500	1.175	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG01565	0.929	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG01583	1.092	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG01595	1.666	1.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG01879	0.999	0.934	0.0	0.0	0.806	0.808	2	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG02568	1.036	0.968	0.0	0.008	0.429	0.429	1	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG02922	1.266	1.183	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG03006	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG03052	1.748	1.634	0.0	0.007	0.969	0.969	1	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG03642	1.151	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	HG03742	1.536	1.435	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA12878	1.088	1.017	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA18525	1.064	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA18939	0.971	0.907	0.0	0.0	0.867	0.829	1	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA19017	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA19238	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA19239	1.188	1.111	0.0	0.0	0.927	0.927	1	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA19625	0.588	0.549	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA19648	0.85	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA20502	0.621	0.58	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr12	67536817	67537052	DEL	236	NA20845	1.244	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG00096	0.473	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG00268	0.815	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG00419	0.765	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG00759	0.848	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG01051	0.576	0.662	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG01112	0.732	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG01500	0.801	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG01565	0.495	0.569	0.0	0.047	0.84	0.84	1	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG01595	0.944	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG01879	0.999	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG02568	0.806	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG02922	0.675	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG03052	0.832	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG03642	1.023	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	HG03742	1.108	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA12878	1.071	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA18939	0.845	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA19017	1.084	1.246	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA19238	0.725	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA19239	0.77	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA19625	1.124	1.292	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA19648	0.8	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	68372223	68372297	DUP	75	NA20502	1.034	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG00096	0.692	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG00268	0.867	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG00419	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG00759	0.493	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG01051	0.247	0.274	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG01112	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG01500	0.303	0.336	0.019	0.083	0.6	0.626	4	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG01565	0.351	0.39	0.0	0.094	0.194	0.194	4	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG01583	0.728	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG01595	0.602	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG02922	0.295	0.328	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG03006	1.09	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG03052	0.192	0.213	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG03642	0.435	0.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	HG03742	0.651	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA12878	0.408	0.454	0.0	0.036	0.385	0.385	4	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA18525	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA18939	0.971	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA19017	0.748	0.831	0.0	0.0	0.905	0.864	1	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA19238	0.831	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA19239	0.77	0.856	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA19625	0.971	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA19648	0.975	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA20502	0.414	0.46	0.025	0.044	nan	nan	0	1
chr12	6907383	6907639	DEL	257	NA20845	0.611	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG00096	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG00268	0.867	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG00419	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG00759	0.887	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG01051	0.494	0.48	0.009	0.028	0.63	0.63	1	1
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG01112	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG01500	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG01565	1.052	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG01583	1.141	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG01595	0.944	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG02568	0.422	0.41	0.0	0.045	0.786	0.786	1	1
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG02922	1.245	1.208	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG03006	1.58	1.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG03052	0.576	0.559	0.0	0.042	0.857	0.857	1	1
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG03642	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	HG03742	1.225	1.189	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA12878	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA18525	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA18939	0.791	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA19017	0.505	0.49	0.0	0.053	0.964	0.99	1	1
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA19239	0.418	0.406	0.0	0.029	0.812	0.812	1	1
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA19625	0.383	0.372	0.0	0.018	0.6	0.6	1	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA19648	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA20502	0.897	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69174849	69174903	DEL	55	NA20845	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG00096	0.874	0.919	0.0	0.0	0.678	0.678	2	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG00268	0.919	0.967	0.0	0.0	0.394	0.394	1	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG00419	0.869	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG00759	0.927	0.976	0.0	0.0	0.882	0.929	1	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG01051	0.638	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG01112	0.658	0.693	0.0	0.0	0.4	0.379	1	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG01500	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG01565	0.454	0.478	0.052	0.029	nan	nan	0	1
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG01583	0.655	0.69	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG01595	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG01879	0.327	0.344	0.06	0.03	nan	nan	0	1
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG02568	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG02922	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG03006	0.745	0.784	0.011	0.0	0.64	0.64	1	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG03052	0.0	0.0	0.165	0.106	nan	nan	0	0
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG03642	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	HG03742	0.622	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA12878	0.748	0.788	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA18525	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA18939	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA19017	0.729	0.767	0.0	0.0	0.715	0.749	2	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA19238	0.943	0.992	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA19239	0.379	0.399	0.04	0.021	nan	nan	0	1
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA19625	0.946	0.995	0.0	0.0	0.816	0.816	2	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA19648	1.075	1.132	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA20502	0.575	0.605	0.039	0.018	nan	nan	0	1
chr12	69255776	69256522	DEL	747	NA20845	0.764	0.804	0.0	0.0	0.821	0.821	2	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG00096	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG00268	1.161	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG00419	1.365	1.325	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG00759	1.124	1.091	0.0	0.0	0.68	0.716	1	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG01051	1.173	1.139	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG01112	1.317	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG01500	1.157	1.123	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG01565	1.114	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG01583	1.165	1.131	0.0	0.0	0.616	0.616	2	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG01595	1.044	1.014	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG01879	0.509	0.494	0.099	0.059	nan	nan	0	1
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG02568	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG02922	0.97	0.942	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG03006	1.29	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG03052	1.237	1.201	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG03642	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	HG03742	1.322	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA12878	0.952	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA18525	1.308	1.27	0.0	0.0	0.969	0.969	2	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA18939	1.259	1.222	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA19017	0.673	0.653	0.077	0.045	nan	nan	0	1
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA19238	0.514	0.499	0.124	0.066	nan	nan	0	1
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA19239	1.227	1.192	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA19625	1.303	1.265	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA19648	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA20502	1.218	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72222021	72222764	DEL	744	NA20845	0.96	0.932	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG00096	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG00268	0.763	0.74	0.0	0.004	0.476	0.476	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG00419	0.807	0.783	0.006	0.0	0.652	0.652	4	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG00759	1.163	1.13	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG01051	1.008	0.979	0.0	0.0	0.804	0.804	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG01112	1.152	1.119	0.0	0.0	0.654	0.69	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG01500	0.837	0.812	0.0	0.0	0.885	0.848	4	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG01565	1.052	1.022	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG01583	1.141	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG01595	0.622	0.604	0.049	0.056	nan	nan	0	1
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG01879	0.836	0.811	0.0	0.0	0.833	0.795	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG02568	0.997	0.968	0.0	0.0	0.646	0.646	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG02922	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG03006	0.545	0.529	0.053	0.058	nan	nan	0	1
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG03052	1.215	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG03642	1.099	1.067	0.0	0.0	0.905	0.905	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	HG03742	0.642	0.623	0.055	0.072	nan	nan	0	1
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA12878	0.901	0.875	0.0	0.0	0.414	0.414	4	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA18525	0.488	0.474	0.025	0.048	nan	nan	0	1
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA18939	1.205	1.17	0.0	0.0	0.56	0.535	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA19017	0.897	0.871	0.0	0.0	0.563	0.537	4	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA19238	1.094	1.062	0.0	0.0	0.739	0.717	1	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA19239	0.568	0.551	0.014	0.063	nan	nan	0	1
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA19625	1.048	1.017	0.0	0.0	0.65	0.65	2	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA19648	0.95	0.923	0.0	0.005	0.947	0.947	1	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA20502	0.874	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72397797	72398318	DEL	522	NA20845	0.917	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG00096	0.255	0.238	0.0	0.02	0.652	0.652	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG00268	0.953	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG00419	0.993	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG00759	0.789	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG01051	0.885	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG01112	0.421	0.393	0.0	0.025	0.8	0.844	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG01500	0.659	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG01565	0.702	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG01583	0.607	0.567	0.0	0.011	0.211	0.211	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG01595	0.442	0.413	0.0	0.005	0.286	0.286	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG01879	0.69	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG02568	0.575	0.538	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG02922	0.738	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG03006	0.817	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG03052	0.853	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG03642	0.281	0.263	0.0	0.0	0.647	0.647	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	HG03742	0.272	0.254	0.0	0.022	1.0	1.0	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA12878	0.459	0.429	0.0	0.032	1.0	1.0	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA18525	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA18939	0.557	0.521	0.0	0.029	0.5	0.523	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA19017	0.841	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA19238	0.949	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA19239	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA19625	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA19648	0.325	0.304	0.0	0.032	0.923	0.923	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA20502	0.46	0.43	0.0	0.017	0.842	0.892	1	1
chr12	72739802	72739855	DEL	54	NA20845	0.415	0.388	0.0	0.039	0.778	0.778	1	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG00096	0.309	0.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG00268	0.277	0.351	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG00419	0.083	0.105	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG00759	0.177	0.225	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG01051	0.0	0.0	0.008	0.155	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG01112	0.475	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG01500	0.712	0.901	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG01565	0.289	0.366	0.007	0.062	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG01583	0.243	0.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG01595	0.542	0.686	0.004	0.147	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG01879	0.109	0.138	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG02568	0.307	0.388	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG02922	0.063	0.08	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG03006	0.309	0.391	0.013	0.08	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG03052	0.768	0.972	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG03642	0.256	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	HG03742	0.486	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA12878	0.442	0.56	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA18525	0.488	0.618	0.007	0.187	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA18939	0.198	0.25	0.005	0.084	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA19017	0.262	0.331	0.007	0.088	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA19238	0.198	0.25	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA19239	0.731	0.926	0.0	0.192	nan	nan	0	0
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA19625	0.537	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA19648	0.225	0.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA20502	0.644	0.815	0.0	0.176	nan	nan	0	1
chr12	72977690	72977852	DEL	163	NA20845	0.567	0.718	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG00096	0.491	0.459	0.109	0.003	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG00268	0.433	0.405	0.051	0.0	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG00419	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG00759	1.242	1.161	0.0	0.0	0.25	0.238	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG01051	0.0	0.0	0.191	0.0	nan	nan	0	0
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG01112	0.402	0.376	0.11	0.003	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG01500	1.068	0.998	0.0	0.0	0.805	0.84	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG01565	0.97	0.906	0.0	0.0	0.768	0.768	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG01583	0.655	0.613	0.0	0.0	0.542	0.542	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG01595	0.482	0.45	0.092	0.0	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG01879	0.381	0.357	0.112	0.005	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG02568	0.882	0.825	0.0	0.0	0.479	0.479	4	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG02922	0.591	0.552	0.056	0.0	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG03006	0.999	0.934	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG03052	0.874	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG03642	0.639	0.597	0.034	0.0	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	HG03742	0.525	0.491	0.093	0.0	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA12878	0.952	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	1	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA18525	0.837	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA18939	0.863	0.807	0.0	0.0	0.677	0.688	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA19017	0.579	0.541	0.056	0.002	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA19238	0.989	0.924	0.0	0.0	0.784	0.779	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA19239	0.562	0.525	0.071	0.0	nan	nan	0	1
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA19625	0.716	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA19648	0.975	0.911	0.0	0.0	0.704	0.704	2	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA20502	0.989	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74104692	74105402	DEL	711	NA20845	0.0	0.0	0.252	0.004	nan	nan	0	0
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG00096	1.11	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG00268	1.127	1.094	0.005	0.0	0.512	0.512	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG00419	1.096	1.064	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG00759	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG01051	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG01112	1.189	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG01500	1.246	1.21	0.004	0.0	0.939	0.98	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG01565	1.3	1.262	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG01583	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG01595	1.225	1.189	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG01879	1.108	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG02568	0.537	0.521	0.123	0.056	nan	nan	0	1
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG02922	1.203	1.168	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG03006	1.072	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG03052	1.13	1.097	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG03642	0.946	0.918	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	HG03742	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA12878	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA18525	0.854	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA18939	1.223	1.187	0.0	0.0	0.667	0.697	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA19017	1.177	1.143	0.003	0.0	0.781	0.818	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA19238	1.213	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA19239	0.483	0.469	0.086	0.049	nan	nan	0	1
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA19625	0.92	0.893	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA19648	0.775	0.753	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA20502	1.034	1.004	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74210707	74211414	DEL	708	NA20845	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG00268	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG00419	1.117	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG00759	0.73	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG01051	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG01112	0.567	0.567	0.0	0.06	0.146	0.138	2	1
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG01500	0.498	0.498	0.0	0.086	0.167	0.16	2	1
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG01565	0.578	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG01583	0.753	0.753	0.0	0.0	0.747	0.747	2	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG01595	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG01879	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG02568	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG02922	0.506	0.506	0.0	0.043	0.348	0.348	2	1
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG03006	0.636	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG03052	0.618	0.618	0.0	0.0	0.898	0.898	2	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG03642	1.023	1.023	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	HG03742	0.719	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA12878	0.374	0.374	0.0	0.086	0.547	0.547	2	1
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA18525	0.785	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA18939	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA19017	0.392	0.392	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA19238	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA19239	0.692	0.692	0.0	0.0	0.842	0.842	2	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA19625	0.434	0.434	0.0	0.081	0.388	0.388	2	1
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA19648	1.15	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA20502	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74571808	74572021	DEL	214	NA20845	0.349	0.349	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG00096	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG00268	0.971	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG00419	0.807	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG00759	1.025	0.996	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG01112	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG01500	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG01565	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG01583	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG01595	1.084	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG01879	1.144	1.111	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG02568	0.652	0.633	0.0	0.014	0.778	0.778	3	1
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG02922	1.192	1.157	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG03006	1.09	1.058	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG03052	0.704	0.683	0.0	0.066	0.485	0.485	2	1
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG03642	0.946	0.918	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	HG03742	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA12878	1.088	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA18525	1.186	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA18939	0.845	0.82	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA19017	1.346	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA19238	0.804	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA19239	0.457	0.444	0.0	0.038	0.906	0.906	3	1
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA19625	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA19648	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA20502	0.897	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	74911643	74911720	DEL	78	NA20845	0.829	0.805	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG00096	1.074	1.074	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG00268	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG00419	1.013	1.013	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG00759	0.947	0.947	0.0	0.0	0.63	0.663	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG01051	0.515	0.515	0.0	0.051	0.9	0.9	1	1
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG01112	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG01500	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG01565	1.217	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG01583	1.141	1.141	0.0	0.0	0.474	0.474	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG01595	0.783	0.783	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG01879	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG02568	1.343	1.343	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG02922	0.886	0.886	0.0	0.01	0.882	0.882	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG03006	0.872	0.872	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG03052	0.959	0.959	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG03642	1.048	1.048	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	HG03742	0.933	0.933	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA12878	0.884	0.884	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA18525	0.785	0.785	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA18939	1.348	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA19017	0.766	0.766	0.0	0.057	0.553	0.58	1	1
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA19238	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA19239	1.019	1.019	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA19625	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA19648	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA20502	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76240678	76240761	DEL	84	NA20845	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG00096	1.128	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG00268	1.075	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG00419	0.765	0.88	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG01051	0.998	1.147	0.0	0.002	0.636	0.636	1	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG01112	0.841	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG01500	0.766	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG01565	0.908	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG01583	0.825	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG01595	1.144	1.315	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG01879	0.89	1.023	0.0	0.002	0.955	0.911	1	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG02568	0.69	0.794	0.0	0.0	0.111	0.111	1	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG02922	1.171	1.346	0.0	0.002	0.583	0.583	1	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG03006	0.69	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG03052	0.768	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG03642	0.537	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	HG03742	0.914	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA12878	0.867	0.997	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA18525	1.055	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA18939	0.683	0.785	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA19017	0.953	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA19238	0.949	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA19239	1.005	1.156	0.0	0.0	0.531	0.531	1	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA19625	0.92	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA19648	0.875	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA20502	0.989	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	76646907	76646961	DUP	55	NA20845	0.851	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG00096	1.074	1.042	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG00268	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG00419	1.179	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG00759	1.223	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG01051	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG01112	1.244	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG01500	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG01565	0.991	0.962	0.0	0.004	0.818	0.818	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG01583	1.092	1.061	0.005	0.0	0.875	0.875	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG01595	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG01879	1.017	0.988	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG02568	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG02922	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG03006	1.217	1.181	0.0	0.0	0.735	0.735	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG03052	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG03642	1.304	1.266	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	HG03742	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA12878	0.952	0.925	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA18525	0.889	0.863	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA18939	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA19017	0.579	0.562	0.053	0.033	nan	nan	0	1
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA19238	0.949	0.922	0.0	0.0	0.892	0.865	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA19239	1.058	1.027	0.0	0.0	0.745	0.745	2	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA19625	1.176	1.141	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA19648	1.25	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA20502	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77674024	77674726	DEL	703	NA20845	1.309	1.271	0.006	0.0	0.528	0.528	1	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG00096	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG00268	0.884	0.858	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG00419	1.303	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG00759	1.558	1.513	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG01051	1.194	1.159	0.0	0.004	0.84	0.84	1	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG01112	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG01500	0.516	0.501	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG01565	0.433	0.421	0.0	0.083	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG01583	1.335	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG01595	1.205	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG01879	0.799	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG02568	0.614	0.596	0.0	0.103	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG02922	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG03006	1.308	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG03052	1.023	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG03642	0.384	0.372	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr12	77838822	77838924	DEL	103	HG03742	1.341	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA12878	0.85	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA18525	0.976	0.948	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA18939	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA19017	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA19238	1.384	1.344	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA19239	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA19625	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA19648	0.475	0.461	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA20502	1.448	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	77838822	77838924	DEL	103	NA20845	1.462	1.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG00096	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG00268	0.832	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG00419	0.869	0.843	0.0	0.005	1.0	1.0	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG00759	0.749	0.728	0.0	0.004	0.538	0.567	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG01051	0.638	0.619	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG01112	0.786	0.763	0.0	0.0	0.714	0.754	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG01500	0.819	0.795	0.0	0.004	0.765	0.798	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG01565	0.887	0.861	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG01583	0.801	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG01595	0.683	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG01879	0.908	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG02568	0.23	0.223	0.0	0.07	0.667	0.667	2	1
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG02922	0.97	0.942	0.0	0.004	0.8	0.8	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG03006	0.781	0.758	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG03052	0.405	0.393	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG03642	0.793	0.77	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	HG03742	0.778	0.755	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA12878	0.816	0.793	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA18525	0.872	0.846	0.0	0.008	0.75	0.75	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA18939	0.899	0.873	0.0	0.0	0.812	0.849	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA19017	0.561	0.544	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA19238	0.91	0.883	0.0	0.0	0.545	0.562	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA19239	0.496	0.482	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA19625	0.92	0.893	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA19648	0.8	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA20502	0.828	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	80614359	80614535	DEL	177	NA20845	0.677	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG00096	1.11	1.078	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG00268	1.231	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG00419	0.972	0.944	0.0	0.0	0.385	0.385	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG00759	1.242	1.206	0.0	0.0	0.769	0.81	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG01051	1.173	1.139	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG01112	1.298	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG01500	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG01565	1.011	0.982	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG01583	1.165	1.131	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG01595	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG01879	0.636	0.617	0.026	0.068	1.0	0.955	1	1
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG02568	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG02922	0.949	0.922	0.0	0.004	0.429	0.429	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG03006	1.308	1.27	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG03052	0.554	0.538	0.039	0.072	0.926	0.926	1	1
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG03642	1.227	1.192	0.0	0.0	0.529	0.529	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	HG03742	1.05	1.019	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA12878	1.173	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA18525	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA18939	1.223	1.187	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA19017	0.934	0.907	0.0	0.0	0.881	0.915	2	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA19238	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA19239	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA19625	1.073	1.042	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA19648	1.05	1.02	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA20502	1.402	1.361	0.0	0.0	0.917	0.866	1	2
chr12	82591869	82592360	DEL	492	NA20845	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG00096	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG00268	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG00419	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG00759	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.024	nan	nan	0	1
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG01112	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG01500	1.228	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG01565	0.537	0.521	0.0	0.018	0.407	0.407	1	1
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG01583	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG01595	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG01879	1.126	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG02568	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG02922	1.435	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG03006	1.181	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG03052	1.002	0.973	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG03642	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	HG03742	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA12878	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA18525	0.994	0.965	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA18939	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA19017	1.103	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA19238	1.305	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA19239	1.358	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA19625	0.409	0.397	0.0	0.009	0.85	0.85	1	1
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA19648	1.275	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA20502	1.057	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	83996947	83997000	DEL	54	NA20845	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG00096	1.074	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG00268	1.092	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG00419	1.427	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG00759	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG01051	1.338	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG01112	1.061	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG01500	1.246	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG01565	0.825	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG01583	1.214	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG01595	1.325	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG01879	0.636	0.594	0.0	0.022	0.711	0.744	1	1
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG02568	0.767	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG02922	0.506	0.473	0.0	0.042	1.0	1.0	1	1
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG03006	1.072	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG03052	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG03642	1.227	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	HG03742	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA12878	0.918	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA18525	1.36	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA18939	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA19017	1.047	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA19238	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA19239	0.535	0.5	0.0	0.024	0.897	0.897	1	1
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA19625	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA19648	0.45	0.421	0.0	0.051	0.913	0.913	1	1
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA20502	1.172	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	84582408	84582466	DEL	59	NA20845	0.589	0.551	0.0	0.038	0.917	0.917	1	1
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG00096	0.928	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG00268	1.196	1.118	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG00419	1.075	1.005	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG00759	0.71	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG01051	1.461	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG01112	0.768	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG01500	0.837	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG01565	0.825	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG01583	1.092	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG01595	0.763	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG01879	1.017	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG02568	1.036	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG02922	1.034	0.966	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG03006	0.963	0.9	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG03052	0.981	0.917	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG03642	1.278	1.195	0.0	0.0	0.591	0.591	1	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	HG03742	0.816	0.763	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA12878	0.867	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA18525	0.802	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA18939	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA19017	0.561	0.524	0.0	0.053	0.765	0.801	1	1
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA19238	0.989	0.924	0.0	0.0	0.949	0.978	1	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA19239	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA19625	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA19648	1.05	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA20502	1.195	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	86462879	86462969	DEL	91	NA20845	0.917	0.857	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG00096	0.564	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG00268	0.676	0.751	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG00419	0.62	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG00759	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG01051	0.453	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG01112	0.494	0.549	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG01500	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG01565	0.846	0.94	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG01583	0.316	0.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG01595	0.402	0.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG01879	0.454	0.505	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG02568	0.345	0.384	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG02922	0.549	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG03006	0.454	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG03052	0.426	0.474	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG03642	0.409	0.455	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	HG03742	0.544	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA12878	0.544	0.605	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA18525	0.732	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA18939	0.36	0.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA19017	0.318	0.353	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA19238	0.58	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA19239	0.731	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA19625	0.69	0.767	0.0	0.0	0.552	0.552	2	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA19648	0.4	0.445	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA20502	0.552	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89443764	89443912	DEL	149	NA20845	0.611	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG00096	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG00268	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG00419	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG00759	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG01051	0.885	0.885	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG01112	0.695	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG01500	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG01565	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG01583	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG01595	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG01879	0.327	0.327	0.016	0.113	nan	nan	0	1
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG02568	0.0	0.0	0.036	0.23	nan	nan	0	1
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG02922	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG03006	1.29	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG03052	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG03642	0.869	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	HG03742	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA12878	0.68	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA18525	0.976	0.976	0.0	0.0	0.694	0.694	1	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA18939	0.899	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA19017	0.99	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA19238	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA19239	1.097	1.097	0.0	0.0	0.915	0.915	1	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA19625	1.38	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA19648	1.3	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA20502	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	89611824	89612206	DEL	383	NA20845	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG00096	0.874	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG00268	0.936	1.076	0.0	0.0	0.522	0.522	1	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG00419	0.641	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG00759	0.73	0.839	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG01051	0.412	0.473	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG01112	0.86	0.988	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG01500	0.748	0.859	0.009	0.0	0.728	0.728	2	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG01565	0.722	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG01583	0.534	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG01595	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG01879	0.563	0.647	0.0	0.0	0.8	0.796	2	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG02568	0.652	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG02922	0.549	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG03006	0.654	0.752	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG03052	0.469	0.539	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG03642	0.639	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	HG03742	0.603	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA12878	0.799	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA18525	0.976	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA18939	0.665	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA19017	0.654	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA19238	1.015	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA19239	0.0	0.0	0.004	0.19	nan	nan	0	1
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA19625	0.613	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA19648	0.825	0.949	0.0	0.0	0.412	0.412	1	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA20502	0.667	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	92497623	92497918	DEL	296	NA20845	0.371	0.426	0.003	0.11	nan	nan	0	1
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG00096	1.001	0.935	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG00268	0.971	0.907	0.0	0.0	0.626	0.626	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG00419	0.848	0.793	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG00759	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG01051	1.132	1.058	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG01112	1.225	1.145	0.0	0.0	0.617	0.652	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG01500	1.371	1.281	0.003	0.0	0.838	0.803	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG01565	0.97	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG01583	1.238	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG01595	1.405	1.313	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG01879	1.126	1.053	0.0	0.0	0.59	0.618	1	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG02568	0.345	0.323	0.024	0.065	nan	nan	0	1
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG02922	1.139	1.065	0.0	0.0	0.886	0.886	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG03006	1.09	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG03052	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG03642	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	HG03742	0.933	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA12878	0.816	0.763	0.0	0.0	0.744	0.744	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA18525	1.011	0.945	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA18939	1.151	1.075	0.0	0.0	0.657	0.687	1	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA19017	0.841	0.786	0.0	0.004	0.68	0.712	1	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA19238	0.936	0.875	0.0	0.0	0.696	0.7	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA19239	1.136	1.062	0.0	0.0	0.93	0.93	1	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA19625	1.303	1.218	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA19648	1.325	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA20502	0.874	0.816	0.0	0.0	0.758	0.754	2	2
chr12	93210557	93211081	DEL	525	NA20845	0.982	0.918	0.0	0.009	0.6	0.6	3	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG00096	1.219	1.14	0.048	0.058	0.096	0.096	6	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG00268	1.092	1.021	0.004	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG00419	1.303	1.218	0.036	0.051	0.278	0.278	14	1
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG00759	1.124	1.051	0.0	0.0	0.895	0.85	1	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG01051	1.379	1.289	0.026	0.035	nan	nan	0	1
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG01112	1.207	1.128	0.0	0.0	0.7	0.739	1	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG01500	1.139	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG01565	1.217	1.138	0.03	0.054	0.348	0.348	14	1
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG01583	1.238	1.157	0.061	0.041	1.0	1.0	1	1
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG01595	1.205	1.126	0.062	0.08	0.3	0.3	14	1
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG01879	1.163	1.087	0.0	0.0	0.906	0.949	3	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG02568	1.189	1.111	0.0	0.0	0.663	0.663	2	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG02922	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG03006	1.29	1.205	0.0	0.0	0.821	0.821	2	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG03052	1.173	1.096	0.0	0.002	0.856	0.856	2	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG03642	1.074	1.004	0.0	0.0	0.69	0.69	2	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	HG03742	1.633	1.526	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA12878	1.003	0.938	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA18525	1.343	1.255	0.049	0.076	0.25	0.25	13	1
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA18939	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA19017	1.065	0.996	0.0	0.0	0.817	0.779	2	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA19238	1.121	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA19239	1.267	1.184	0.0	0.0	0.771	0.771	1	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA19625	1.457	1.361	0.053	0.074	0.304	0.304	16	1
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA19648	1.475	1.379	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA20502	0.92	0.859	0.0	0.0	0.609	0.645	1	2
chr12	93894814	93895703	DEL	890	NA20845	1.397	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG00096	1.056	1.056	0.0	0.0	0.979	0.979	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG00268	1.161	1.161	0.005	0.0	0.946	0.946	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG00419	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG00759	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG01051	0.803	0.803	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG01112	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG01500	1.033	1.033	0.0	0.0	0.788	0.822	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG01565	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG01583	0.947	0.947	0.0	0.0	0.676	0.676	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG01595	1.124	1.124	0.0	0.0	0.7	0.7	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG01879	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG02568	0.959	0.959	0.009	0.0	0.551	0.551	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG02922	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG03006	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG03052	1.151	1.151	0.0	0.0	0.474	0.474	3	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG03642	0.818	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	HG03742	0.914	0.914	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA12878	0.85	0.85	0.0	0.0	0.753	0.753	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA18525	1.168	1.168	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA18939	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA19017	1.028	1.028	0.0	0.0	0.8	0.764	1	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA19238	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA19239	0.966	0.966	0.0	0.0	0.861	0.861	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA19625	1.278	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA19648	1.05	1.05	0.0	0.0	0.873	0.873	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA20502	1.149	1.149	0.0	0.0	0.703	0.704	2	2
chr12	94143264	94144099	DEL	836	NA20845	0.546	0.546	0.066	0.042	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG00096	0.0	0.0	0.118	0.206	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG00268	0.0	0.0	0.139	0.217	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG00419	0.745	0.723	0.038	0.11	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG00759	0.69	0.67	0.01	0.072	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG01051	0.761	0.739	0.018	0.049	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG01112	0.585	0.568	0.031	0.105	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG01500	0.0	0.0	0.087	0.195	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG01565	0.0	0.0	0.091	0.214	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG01583	0.0	0.0	0.102	0.239	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG01595	0.422	0.409	0.042	0.095	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG01879	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG02568	0.0	0.0	0.055	0.195	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG02922	1.35	1.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG03006	0.509	0.494	0.039	0.086	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG03052	0.938	0.911	0.0	0.0	0.448	0.448	1	2
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG03642	0.563	0.546	0.055	0.123	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	HG03742	0.583	0.566	0.039	0.073	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA12878	0.0	0.0	0.013	0.162	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA18525	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA18939	0.0	0.0	0.078	0.281	nan	nan	0	0
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA19017	0.486	0.472	0.009	0.098	0.273	0.286	1	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA19238	0.593	0.576	0.01	0.051	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA19239	0.64	0.621	0.009	0.059	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA19625	0.792	0.769	0.024	0.079	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA19648	0.45	0.437	0.049	0.105	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA20502	0.667	0.647	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr12	95244023	95244449	DEL	427	NA20845	0.415	0.403	0.024	0.115	nan	nan	0	1
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG00096	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG00268	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG00419	1.075	1.075	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG00759	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG01051	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG01112	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG01500	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG01565	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG01583	1.141	1.141	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG01595	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG01879	1.235	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG02568	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG02922	1.118	1.118	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG03006	1.181	1.181	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG03052	0.426	0.426	0.041	0.083	nan	nan	0	1
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG03642	0.869	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	HG03742	1.03	1.03	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA12878	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA18525	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA18939	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA19017	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA19238	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA19239	1.214	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA19625	1.201	1.201	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA19648	1.075	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA20502	0.989	0.989	0.0	0.0	0.727	0.687	1	2
chr12	98631336	98631794	DEL	459	NA20845	1.004	1.004	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG00096	0.67	0.744	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG00268	0.501	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG00419	0.55	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG00759	0.578	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG01051	0.538	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG01112	0.502	0.558	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG01500	0.949	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG01565	0.611	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG01583	0.387	0.43	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG01595	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG01879	0.411	0.457	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG02568	0.384	0.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG02922	0.23	0.255	0.02	0.102	nan	nan	0	1
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG03006	0.556	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG03052	0.318	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG03642	0.464	0.516	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	HG03742	0.655	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA12878	0.751	0.835	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA18525	0.795	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA18939	0.25	0.277	0.0	0.118	nan	nan	0	1
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA19017	0.589	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA19238	0.684	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA19239	0.335	0.372	0.004	0.123	nan	nan	0	1
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA19625	0.635	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA19648	0.576	0.64	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA20502	0.555	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	101242063	101242380	DEL	318	NA20845	0.581	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG00096	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG00419	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG00759	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG01051	1.096	1.096	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG01500	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG01565	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG01595	0.768	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG03006	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG03642	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	HG03742	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	NA12878	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	NA18525	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	NA18939	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	NA19017	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	NA19239	0.489	0.489	0.0	0.064	0.976	0.976	1	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	NA20502	0.717	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	103875493	103875570	DUP	78	NA20845	0.731	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG00096	0.0	0.0	0.098	0.195	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG00268	0.0	0.0	0.125	0.196	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG00419	0.0	0.0	0.11	0.225	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG00759	0.0	0.0	0.116	0.211	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG01051	0.0	0.0	0.137	0.229	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG01112	0.305	0.296	0.027	0.033	nan	nan	0	1
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG01500	0.0	0.0	0.074	0.169	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG01565	0.0	0.0	0.111	0.188	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG01583	0.0	0.0	0.168	0.168	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG01595	0.0	0.0	0.13	0.205	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG01879	0.0	0.0	0.135	0.265	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG02568	0.346	0.336	0.033	0.025	nan	nan	0	1
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG02922	0.0	0.0	0.099	0.155	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG03006	0.0	0.0	0.136	0.208	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG03052	0.318	0.309	0.014	0.072	0.286	0.286	1	1
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG03642	0.0	0.0	0.049	0.183	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	HG03742	0.0	0.0	0.079	0.237	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA12878	0.0	0.0	0.024	0.175	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA18525	0.0	0.0	0.062	0.156	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA18939	0.0	0.0	0.067	0.196	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA19017	0.0	0.0	0.131	0.247	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA19238	0.0	0.0	0.013	0.214	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA19239	0.0	0.0	0.022	0.208	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA19625	0.0	0.0	0.176	0.258	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA19648	0.0	0.0	0.136	0.206	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA20502	0.0	0.0	0.037	0.141	nan	nan	0	0
chr13	104091776	104092258	DEL	483	NA20845	0.0	0.0	0.155	0.259	nan	nan	0	0
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG00096	0.597	0.558	0.05	0.05	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG00268	0.501	0.468	0.045	0.062	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG00419	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG00759	1.252	1.17	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG01051	0.518	0.484	0.086	0.052	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG01112	1.183	1.106	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG01500	0.58	0.542	0.089	0.062	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG01565	1.16	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG01583	0.387	0.361	0.079	0.047	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG01595	0.512	0.478	0.063	0.043	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG01879	0.607	0.568	0.075	0.063	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG02568	0.499	0.467	0.053	0.067	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG02922	0.522	0.487	0.097	0.059	0.421	0.421	3	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG03006	0.574	0.536	0.082	0.047	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG03052	1.166	1.09	0.0	0.0	0.634	0.634	2	2
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG03642	0.587	0.548	0.062	0.041	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	HG03742	0.539	0.504	0.067	0.073	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA12878	0.478	0.447	0.039	0.042	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA18525	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA18939	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA19017	0.662	0.619	0.07	0.054	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA19238	0.49	0.458	0.022	0.053	0.225	0.225	3	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA19239	0.566	0.529	0.057	0.055	0.19	0.19	3	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA19625	0.533	0.498	0.117	0.055	0.286	0.286	3	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA19648	0.0	0.0	0.327	0.224	nan	nan	0	0
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA20502	0.555	0.519	0.086	0.054	nan	nan	0	1
chr13	106449327	106449921	DEL	595	NA20845	0.796	0.744	0.063	0.046	nan	nan	0	1
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG00096	0.597	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG00268	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG00419	0.367	0.386	0.029	0.0	0.214	0.214	5	1
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG00759	0.405	0.426	0.078	0.0	0.235	0.235	2	1
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG01051	0.718	0.755	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG01112	0.574	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG01500	0.738	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG01565	0.895	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG01583	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG01595	0.63	0.663	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG01879	0.339	0.357	0.061	0.0	0.267	0.267	5	1
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG02568	0.807	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG02922	0.584	0.615	0.005	0.0	0.719	0.719	2	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG03006	0.628	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG03052	0.679	0.714	0.0	0.0	0.471	0.471	6	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG03642	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	HG03742	0.751	0.791	0.0	0.0	0.825	0.825	2	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA12878	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA18525	0.371	0.39	0.041	0.0	0.16	0.16	3	1
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA18939	0.374	0.394	0.028	0.0	0.308	0.308	2	1
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA19017	0.901	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA19238	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA19239	0.914	0.962	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA19625	0.406	0.427	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA19648	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA20502	0.902	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	108560567	108561472	DEL	906	NA20845	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG00096	1.212	1.177	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG00268	1.573	1.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG00419	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG01051	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG01112	0.95	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG01500	0.474	0.46	0.0	0.031	0.825	0.825	1	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG01565	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG01583	0.338	0.328	0.0	0.022	1.0	1.0	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG01595	1.063	1.032	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG01879	1.286	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG02568	1.268	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG02922	1.565	1.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG03006	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG03052	0.53	0.515	0.0	0.037	0.621	0.621	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG03642	1.247	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	HG03742	0.616	0.598	0.0	0.046	0.694	0.694	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA12878	0.717	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA18525	0.512	0.497	0.0	0.033	0.791	0.791	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA18939	0.642	0.623	0.0	0.027	0.659	0.659	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA19017	0.625	0.607	0.0	0.013	0.682	0.682	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA19238	1.315	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA19239	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA19625	0.609	0.591	0.0	0.023	0.615	0.615	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA19648	0.651	0.632	0.006	0.025	0.815	0.815	1	1
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA20502	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109267189	109267251	DEL	63	NA20845	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG00096	0.543	0.543	0.063	0.049	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG00268	0.553	0.553	0.055	0.043	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG00419	0.489	0.489	0.07	0.046	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG00759	0.501	0.501	0.088	0.06	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG01051	0.0	0.0	0.194	0.114	nan	nan	0	0
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG01112	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG01500	1.159	1.159	0.005	0.0	0.759	0.759	1	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG01565	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG01583	0.459	0.459	0.101	0.07	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG01595	0.551	0.551	0.081	0.053	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG01879	0.947	0.947	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG02568	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG02922	0.459	0.459	0.073	0.043	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG03006	0.0	0.0	0.275	0.191	nan	nan	0	0
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG03052	0.573	0.573	0.058	0.049	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG03642	0.562	0.562	0.056	0.046	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	HG03742	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA12878	0.376	0.376	0.055	0.033	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA18525	0.971	0.971	0.0	0.0	0.703	0.703	1	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA18939	0.98	0.98	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA19017	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA19238	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA19239	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA19625	0.558	0.558	0.053	0.038	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA19648	0.551	0.551	0.086	0.045	nan	nan	0	1
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA20502	1.202	1.202	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr13	109361752	109362442	DEL	691	NA20845	0.946	0.946	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG00096	0.887	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG00268	0.847	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG00419	0.835	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG00759	0.578	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG01051	1.077	1.196	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG01112	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG01500	1.247	1.386	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG01565	0.956	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG01583	0.991	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG01595	0.846	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG01879	0.75	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG02568	1.037	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG02922	0.605	0.672	0.0	0.022	0.429	0.429	1	1
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG03006	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG03052	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG03642	0.904	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	HG03742	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA12878	0.717	0.797	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA18525	0.83	0.922	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA18939	1.069	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA19017	0.552	0.613	0.0	0.02	0.759	0.759	1	1
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA19238	0.967	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA19239	0.849	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA19648	1.178	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA20502	1.318	1.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	111136027	111136077	DEL	51	NA20845	0.903	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG00096	0.76	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG00268	1.037	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG00419	0.917	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG00759	0.694	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG01051	0.578	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG01112	0.502	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG01500	0.457	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG01565	0.529	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG01583	0.676	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG01595	0.472	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG01879	0.607	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG02568	0.768	0.973	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG02922	0.689	0.872	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG03006	0.825	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG03052	0.785	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG03642	0.978	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	HG03742	0.616	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA12878	0.871	1.103	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA18525	0.83	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA18939	0.82	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA19017	0.589	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA19238	0.735	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA19239	0.695	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA19625	0.33	0.418	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA19648	1.102	1.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA20502	0.624	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113640435	113640557	DEL	123	NA20845	0.495	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG00096	0.796	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG00268	0.795	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG00419	0.509	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG00759	0.385	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG01051	0.498	0.674	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG01112	0.52	0.703	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG01500	0.72	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG01565	0.468	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG01583	0.821	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG01595	0.433	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG01879	0.679	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG02568	0.922	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG02922	0.855	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG03006	0.735	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG03052	0.647	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG03642	0.538	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	HG03742	0.443	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA12878	0.991	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA18525	0.901	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA18939	0.659	0.891	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA19017	0.478	0.646	0.0	0.03	0.81	0.81	2	1
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA19238	0.709	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA19239	0.804	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA19625	0.609	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA19648	0.626	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA20502	0.624	0.844	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	113663233	113663296	DEL	64	NA20845	0.495	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG00096	0.163	0.206	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG00268	0.138	0.175	0.0	0.03	nan	nan	0	0
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG00419	0.204	0.258	0.0	0.028	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG00759	0.116	0.146	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG01051	0.14	0.177	0.0	0.012	nan	nan	0	0
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG01112	0.072	0.091	0.0	0.007	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG01500	0.123	0.156	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG01565	0.183	0.232	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG01583	0.217	0.275	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG01595	0.079	0.1	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG01879	0.179	0.226	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG02568	0.231	0.292	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG02922	0.584	0.739	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG03006	0.215	0.272	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG03052	0.064	0.081	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG03642	0.147	0.186	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	HG03742	0.096	0.122	0.0	0.018	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA12878	0.154	0.195	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA18525	0.212	0.268	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA18939	0.16	0.203	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA19017	0.239	0.303	0.007	0.064	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA19238	0.232	0.294	0.0	0.025	nan	nan	0	0
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA19239	0.039	0.049	0.0	0.019	nan	nan	0	0
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA19625	0.203	0.257	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA19648	0.075	0.095	0.0	0.012	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA20502	0.185	0.234	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr13	113991046	113991116	DEL	71	NA20845	0.151	0.191	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG00096	0.869	0.914	0.0	0.0	0.69	0.69	2	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG00268	0.432	0.455	0.062	0.0	0.176	0.176	2	1
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG00419	0.774	0.815	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG00759	0.771	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG01051	0.678	0.714	0.0	0.002	0.667	0.667	1	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG01112	0.681	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG01500	0.843	0.888	0.0	0.0	0.709	0.709	2	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG01565	1.018	1.071	0.0	0.0	0.84	0.793	1	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG01583	0.652	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG01595	0.669	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG01879	0.804	0.846	0.0	0.0	0.759	0.759	3	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG02568	0.768	0.809	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG02922	0.709	0.747	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG03006	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG03052	0.869	0.915	0.0	0.0	0.955	0.955	2	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG03642	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	HG03742	0.616	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA12878	0.376	0.396	0.061	0.0	0.25	0.261	3	1
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA18525	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA18939	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA19017	0.846	0.891	0.0	0.0	0.768	0.768	2	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA19238	0.825	0.869	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA19239	0.785	0.826	0.004	0.0	0.89	0.89	2	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA19625	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA19648	0.902	0.95	0.0	0.005	0.69	0.69	2	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA20502	0.717	0.754	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	20342595	20343472	DEL	878	NA20845	0.817	0.86	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG00096	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG00268	0.76	0.76	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG00419	0.733	0.733	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG00759	0.944	0.944	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG01051	0.698	0.698	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG01112	0.663	0.663	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG01500	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG01565	1.14	1.14	0.0	0.0	0.773	0.73	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG01583	0.773	0.773	0.0	0.006	0.857	0.857	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG01595	0.61	0.61	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG01879	0.715	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG02568	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG02922	0.814	0.814	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG03006	0.619	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG03052	1.018	1.018	0.0	0.0	0.88	0.88	2	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG03642	0.538	0.538	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	HG03742	0.982	0.982	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA12878	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA18525	0.636	0.636	0.006	0.0	0.789	0.789	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA18939	0.606	0.606	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA19017	0.883	0.883	0.0	0.0	0.95	0.95	2	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA19238	0.787	0.787	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA19239	0.322	0.322	0.0	0.081	0.895	0.895	1	1
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA19625	0.888	0.888	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA19648	0.977	0.977	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA20502	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21122508	21122651	DEL	144	NA20845	0.645	0.645	0.0	0.005	1.0	1.0	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG00096	0.624	0.694	0.007	0.0	0.895	0.895	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG00268	0.795	0.883	0.0	0.0	0.709	0.709	2	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG00419	0.957	1.064	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG00759	0.636	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG01051	0.877	0.975	0.0	0.002	0.684	0.684	3	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG01112	0.448	0.498	0.056	0.031	0.357	0.357	9	1
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG01500	0.808	0.898	0.0	0.0	0.758	0.758	2	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG01565	0.753	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG01583	0.882	0.98	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG01595	0.65	0.722	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG01879	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG02568	0.615	0.683	0.0	0.0	0.464	0.464	2	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG02922	0.751	0.835	0.0	0.0	0.664	0.664	2	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG03006	0.789	0.877	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG03052	0.891	0.99	0.0	0.0	0.925	0.925	4	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG03642	0.953	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	HG03742	0.77	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA12878	0.837	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA18525	0.83	0.922	0.003	0.0	0.722	0.722	2	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA18939	0.784	0.871	0.006	0.0	0.581	0.581	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA19017	0.589	0.654	0.0	0.0	0.721	0.721	2	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA19238	0.684	0.759	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA19239	0.721	0.801	0.0	0.0	0.697	0.697	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA19625	0.838	0.931	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA19648	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA20502	0.855	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	21494548	21495275	DEL	728	NA20845	0.71	0.789	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG00096	1.113	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG00268	1.002	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG00419	1.283	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG00759	1.079	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG01051	0.778	0.707	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG01112	1.058	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG01500	0.957	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG01565	1.038	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG01583	1.111	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG01595	1.161	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG01879	1.286	1.169	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG02568	0.461	0.419	0.0	0.007	0.727	0.727	2	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG02922	1.241	1.129	0.0	0.004	0.667	0.667	1	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG03006	0.807	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG03052	0.965	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG03642	1.124	1.022	0.0	0.005	0.542	0.542	1	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	HG03742	1.367	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA12878	1.042	0.947	0.0	0.0	0.6	0.627	1	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA18525	0.804	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA18939	1.069	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA19017	1.048	0.953	0.0	0.0	0.613	0.613	1	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA19238	0.993	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA19239	0.676	0.614	0.0	0.022	0.517	0.517	1	1
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA19625	1.117	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA19648	1.203	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA20502	1.04	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22084932	22084993	DEL	62	NA20845	1.226	1.115	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG00096	0.597	0.664	0.0	0.035	0.308	0.308	1	1
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG00268	0.726	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG00419	0.693	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG00759	0.597	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG01051	0.598	0.665	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG01112	0.448	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG01500	0.404	0.449	0.0	0.084	0.607	0.607	1	1
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG01565	0.57	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG01583	0.362	0.403	0.0	0.077	0.444	0.444	1	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG01595	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG01879	0.536	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG02568	0.576	0.64	0.0	0.035	0.462	0.462	1	1
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG02922	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG03006	0.502	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG03052	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG03642	0.318	0.353	0.0	0.085	0.909	0.909	1	1
chr13	22574676	22574770	DEL	95	HG03742	0.289	0.321	0.0	0.014	0.471	0.471	1	1
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA12878	0.427	0.474	0.0	0.06	0.742	0.776	1	1
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA18525	0.194	0.216	0.0	0.046	0.4	0.4	1	1
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA18939	0.588	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA19017	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA19238	0.671	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA19239	0.553	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA19625	1.142	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA19648	1.128	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA20502	0.717	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	22574676	22574770	DEL	95	NA20845	0.194	0.215	0.0	0.027	0.7	0.7	1	1
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG00096	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG00268	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG00419	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG00759	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG01051	1.067	1.036	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG01112	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG01500	0.949	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG01565	0.956	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG01583	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG01595	1.142	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG01879	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG02568	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG02922	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG03006	0.968	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG03052	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG03642	1.051	1.02	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	HG03742	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA12878	1.008	0.978	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA18525	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA18939	0.945	0.917	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA19017	1.012	0.982	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA19238	0.438	0.426	0.01	0.045	nan	nan	0	1
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA19239	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA19625	0.761	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA19648	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA20502	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	26449350	26449911	DEL	562	NA20845	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG00096	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG00268	0.933	0.906	0.0	0.0	0.581	0.581	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG00419	0.0	0.0	0.308	0.222	nan	nan	0	0
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG00759	0.617	0.599	0.07	0.046	nan	nan	0	1
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG01051	1.176	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG01112	0.574	0.557	0.071	0.058	nan	nan	0	1
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG01500	0.58	0.563	0.061	0.035	nan	nan	0	1
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG01565	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG01583	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG01595	0.551	0.535	0.099	0.051	nan	nan	0	1
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG01879	1.143	1.11	0.0	0.0	0.716	0.716	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG02568	0.999	0.97	0.007	0.0	0.356	0.356	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG02922	1.127	1.094	0.0	0.0	0.675	0.675	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG03006	1.022	0.992	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG03052	1.145	1.112	0.0	0.0	0.673	0.673	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG03642	1.051	1.02	0.0	0.0	0.796	0.796	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	HG03742	1.233	1.197	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA12878	0.478	0.464	0.065	0.05	nan	nan	0	1
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA18525	0.53	0.514	0.072	0.057	nan	nan	0	1
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA18939	0.642	0.623	0.071	0.036	nan	nan	0	1
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA19017	1.196	1.161	0.0	0.0	0.792	0.792	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA19238	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA19239	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA19625	1.015	0.986	0.0	0.0	0.804	0.804	6	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA19648	1.178	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA20502	1.087	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	28268151	28269060	DEL	910	NA20845	0.731	0.71	0.086	0.074	nan	nan	0	1
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG00096	0.742	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG00268	0.657	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG00419	0.998	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG00759	0.694	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG01051	0.817	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG01112	0.717	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG01500	0.685	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG01565	0.57	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG01583	1.244	1.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG01595	0.61	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG01879	0.375	0.452	0.0	0.023	0.708	0.708	1	1
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG02568	0.73	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG02922	0.939	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG03006	1.022	1.231	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG03052	0.615	0.741	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG03642	0.538	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	HG03742	0.578	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA12878	0.769	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA18525	0.848	1.021	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA18939	0.57	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA19017	0.441	0.532	0.0	0.02	0.593	0.593	1	1
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA19238	0.374	0.451	0.0	0.016	0.733	0.733	1	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA19239	0.573	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA19625	0.863	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA19648	0.752	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA20502	0.855	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29602204	29602276	DEL	73	NA20845	0.796	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG00096	0.814	0.814	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG00268	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG00419	0.937	0.937	0.0	0.0	0.491	0.491	2	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG00759	0.906	0.906	0.0	0.0	0.964	0.964	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG01051	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG01112	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG01500	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG01565	0.672	0.672	0.0	0.0	0.667	0.63	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG01583	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG01595	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG01879	0.75	0.75	0.0	0.0	0.811	0.811	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG02568	0.999	0.999	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG02922	0.772	0.772	0.0	0.0	0.652	0.652	2	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG03006	0.843	0.843	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG03052	0.403	0.403	0.056	0.046	nan	nan	0	1
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG03642	1.051	1.051	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	HG03742	0.828	0.828	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA12878	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA18525	0.83	0.83	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA18939	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA19017	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA19238	0.464	0.464	0.06	0.053	nan	nan	0	1
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA19239	0.785	0.785	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA19625	0.914	0.914	0.0	0.0	0.69	0.69	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA19648	0.927	0.927	0.0	0.0	0.346	0.346	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA20502	0.879	0.879	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr13	29750820	29751681	DEL	862	NA20845	0.731	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG00096	0.778	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG00268	0.38	0.422	0.011	0.055	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG00419	0.407	0.453	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG00759	0.328	0.364	0.0	0.061	0.594	0.594	2	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG01051	0.638	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG01112	0.412	0.458	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG01500	0.597	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG01565	0.733	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG01583	0.0	0.0	0.008	0.136	nan	nan	0	0
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG01879	0.982	1.092	0.0	0.0	0.974	0.974	2	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG02568	1.153	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG02922	0.772	0.858	0.0	0.0	0.721	0.721	2	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG03006	0.556	0.618	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG03052	0.636	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG03642	0.391	0.435	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	HG03742	0.385	0.428	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA12878	0.359	0.399	0.0	0.045	0.5	0.523	2	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.118	nan	nan	0	0
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA18939	0.428	0.475	0.004	0.058	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA19017	0.681	0.756	0.0	0.0	0.67	0.67	2	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA19238	0.812	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA19239	0.811	0.901	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA19625	0.533	0.592	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA20502	0.486	0.539	0.007	0.053	nan	nan	0	1
chr13	31043601	31043825	DEL	225	NA20845	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG00096	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG00268	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG00419	0.835	0.835	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG00759	0.809	0.809	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG01051	0.778	0.778	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG01112	0.735	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG01500	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG01565	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG01583	0.87	0.87	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG01595	0.945	0.945	0.0	0.0	0.786	0.832	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG01879	1.125	1.125	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG02568	1.153	1.153	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG02922	0.897	0.897	0.006	0.0	0.75	0.75	2	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG03006	0.897	0.897	0.0	0.0	0.906	0.906	2	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG03052	0.806	0.806	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG03642	1.027	1.027	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	HG03742	0.944	0.944	0.006	0.0	0.742	0.742	2	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA12878	0.461	0.461	0.076	0.052	nan	nan	0	1
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA18525	0.989	0.989	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA18939	0.998	0.998	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA19017	0.993	0.993	0.005	0.0	0.486	0.486	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA19238	1.045	1.045	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA19239	1.042	1.042	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA19625	1.015	1.015	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA19648	1.128	1.128	0.005	0.0	0.8	0.8	1	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA20502	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	34192594	34193335	DEL	742	NA20845	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG00096	0.814	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG00268	0.38	0.422	0.0	0.047	0.556	0.556	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG00419	0.428	0.475	0.0	0.093	0.591	0.591	1	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG00759	0.751	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG01112	0.394	0.438	0.0	0.041	0.577	0.577	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG01500	0.931	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG01565	0.204	0.226	0.0	0.035	0.857	0.908	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG01583	0.29	0.322	0.0	0.057	0.636	0.636	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG01595	0.236	0.262	0.0	0.076	0.667	0.63	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG01879	0.464	0.516	0.0	0.068	0.793	0.793	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG02568	0.999	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG02922	0.563	0.626	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG03006	0.269	0.299	0.0	0.073	1.0	1.0	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG03052	0.763	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	HG03742	0.79	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA12878	0.427	0.474	0.0	0.066	0.759	0.793	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA18525	0.459	0.51	0.0	0.055	0.455	0.455	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA18939	0.722	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA19017	0.754	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA19238	0.464	0.516	0.0	0.048	0.543	0.543	1	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA19239	0.63	0.701	0.0	0.044	0.5	0.5	1	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA19625	0.254	0.282	0.0	0.02	nan	nan	0	1
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA19648	0.576	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA20502	0.717	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36806770	36806861	DEL	92	NA20845	0.667	0.741	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG00096	0.036	0.038	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG00268	0.657	0.691	0.0	0.039	0.538	0.538	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG00419	0.306	0.322	0.0	0.015	1.0	1.0	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG01051	0.997	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG01112	0.251	0.264	0.0	0.027	0.56	0.56	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.033	nan	nan	0	0
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG01565	0.488	0.514	0.0	0.032	1.0	0.944	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG01583	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG01595	0.531	0.559	0.0	0.053	0.958	0.905	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG01879	0.411	0.432	0.0	0.055	0.952	0.952	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG03006	1.04	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG03642	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36818914	36818975	DEL	62	HG03742	0.52	0.547	0.0	0.017	0.667	0.667	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA12878	0.427	0.449	0.0	0.032	0.6	0.627	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA18525	0.495	0.521	0.0	0.034	0.893	0.893	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA19017	0.607	0.639	0.0	0.024	0.528	0.528	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA19238	0.567	0.597	0.0	0.028	0.837	0.837	1	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA19239	1.004	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA19625	0.888	0.935	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr13	36818914	36818975	DEL	62	NA20845	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG00096	0.253	0.291	0.023	0.101	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG00419	0.265	0.304	0.0	0.11	0.421	0.421	2	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG00759	0.751	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG01051	0.0	0.0	0.018	0.18	nan	nan	0	0
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG01500	0.351	0.404	0.012	0.068	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG01565	0.0	0.0	0.017	0.171	nan	nan	0	0
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG01583	0.217	0.25	0.029	0.069	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG01595	0.276	0.317	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG01879	0.268	0.308	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG02922	0.709	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG03006	0.269	0.309	0.02	0.054	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG03052	0.53	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG03642	0.269	0.309	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	HG03742	0.289	0.332	0.0	0.037	0.423	0.423	2	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.142	nan	nan	0	0
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA18525	0.442	0.508	0.0	0.094	0.362	0.362	2	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA18939	0.232	0.266	0.01	0.039	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA19017	0.405	0.465	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA19238	0.387	0.445	0.006	0.099	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA19239	0.592	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA19625	0.203	0.233	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA19648	0.476	0.547	0.015	0.039	nan	nan	0	1
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA20502	0.555	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	37414451	37414779	DEL	329	NA20845	0.0	0.0	0.029	0.215	nan	nan	0	0
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG00096	1.086	1.086	0.0	0.0	0.653	0.653	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG00268	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG00419	0.896	0.896	0.0	0.0	0.556	0.556	3	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG00759	0.0	0.0	0.301	0.169	nan	nan	0	0
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG01051	0.359	0.359	0.111	0.051	nan	nan	0	1
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG01112	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG01500	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG01565	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG01583	0.58	0.58	0.069	0.05	nan	nan	0	1
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG01595	0.0	0.0	0.254	0.136	nan	nan	0	0
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG01879	0.732	0.732	0.0	0.0	0.769	0.769	3	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG02568	1.114	1.114	0.0	0.0	0.778	0.778	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG02922	1.085	1.085	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG03006	0.484	0.484	0.101	0.053	nan	nan	0	1
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG03052	0.933	0.933	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG03642	1.198	1.198	0.0	0.0	0.591	0.591	1	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	HG03742	0.539	0.539	0.081	0.045	nan	nan	0	1
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA12878	0.82	0.82	0.0	0.0	0.558	0.534	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA18525	0.901	0.901	0.0	0.0	0.715	0.715	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA18939	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA19017	1.177	1.177	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA19238	0.864	0.864	0.0	0.0	0.924	0.924	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA19239	0.965	0.965	0.0	0.0	0.785	0.785	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA19625	1.168	1.168	0.0	0.0	0.925	0.925	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA19648	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA20502	0.879	0.879	0.0	0.0	0.757	0.757	2	2
chr13	38048420	38049311	DEL	892	NA20845	0.796	0.796	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG00096	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG00268	1.158	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG00419	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG00759	1.098	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG01051	1.256	1.174	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG01112	1.255	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG01500	1.23	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG01565	1.302	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG01583	1.16	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG01595	1.516	1.417	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG01879	0.572	0.534	0.0	0.042	0.897	0.897	1	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG02568	0.538	0.503	0.0	0.047	0.476	0.476	1	1
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG02922	1.44	1.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG03006	1.183	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG03052	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG03642	1.32	1.234	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	HG03742	1.156	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA12878	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA18525	0.865	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA18939	1.408	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA19017	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA19238	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA19239	1.094	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA19625	0.787	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA19648	1.178	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA20502	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	38469767	38469832	DEL	66	NA20845	1.291	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG00096	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG00268	0.864	0.864	0.0	0.006	0.667	0.667	1	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG00419	0.978	0.978	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG00759	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG01051	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG01112	0.914	0.914	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG01500	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG01565	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG01583	0.87	0.87	0.0	0.004	0.692	0.692	5	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG01595	0.846	0.846	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG01879	0.482	0.482	0.014	0.055	nan	nan	0	1
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG02568	0.845	0.845	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG02922	0.918	0.918	0.0	0.0	0.812	0.812	4	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG03006	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG03052	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG03642	0.489	0.489	0.038	0.066	nan	nan	0	1
chr13	39154253	39154704	DEL	452	HG03742	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA12878	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA18525	0.689	0.689	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA18939	0.713	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA19017	0.552	0.552	0.003	0.063	nan	nan	0	1
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA19238	0.941	0.941	0.002	0.007	0.435	0.435	5	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA19239	0.399	0.399	0.026	0.034	nan	nan	0	1
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA19625	0.99	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA19648	1.203	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA20502	0.809	0.809	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	39154253	39154704	DEL	452	NA20845	0.839	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG00096	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG00268	0.691	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG00419	0.815	0.858	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG00759	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG01051	0.937	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG01112	0.646	0.679	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG01500	0.667	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG01565	0.834	0.878	0.0	0.0	0.5	0.472	1	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG01583	0.797	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG01595	0.787	0.829	0.0	0.0	0.727	0.77	1	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG01879	0.732	0.771	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG02568	0.615	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG02922	0.292	0.307	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG03006	0.646	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG03052	0.53	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG03642	0.587	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	HG03742	0.616	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA12878	0.769	0.809	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA18525	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA18939	0.82	0.863	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA19017	0.662	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA19238	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA19239	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA19625	0.635	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA19648	0.727	0.765	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA20502	1.156	1.217	0.0	0.004	0.929	0.929	1	2
chr13	39949745	39949939	DEL	195	NA20845	0.516	0.543	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG00096	0.869	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG00268	1.002	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG00419	0.876	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG00759	0.742	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG01051	0.738	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG01112	0.359	0.432	0.0	0.016	0.474	0.474	1	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG01500	0.826	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG01583	1.063	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG01595	1.024	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG01879	0.589	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG02568	1.076	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG02922	0.835	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG03006	0.646	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG03052	0.891	1.073	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG03642	0.807	0.972	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	HG03742	1.021	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA12878	1.008	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA18525	1.113	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA18939	0.606	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA19017	0.864	1.042	0.0	0.0	0.542	0.542	1	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA19238	1.032	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA19239	0.483	0.581	0.0	0.034	1.0	1.0	1	1
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA19625	0.444	0.535	0.0	0.08	0.8	0.8	1	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA19648	0.877	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA20502	1.179	1.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	41342478	41342557	DEL	80	NA20845	0.86	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG00096	0.308	0.324	0.056	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG00268	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG00419	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG00759	0.482	0.507	0.106	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG01051	0.439	0.462	0.027	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG01112	0.484	0.51	0.065	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG01500	0.931	0.98	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG01565	0.509	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG01583	0.58	0.61	0.078	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG01595	0.669	0.705	0.0	0.0	0.625	0.59	1	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG01879	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG02568	0.653	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG02922	0.605	0.637	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG03006	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG03052	0.954	1.004	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG03642	1.076	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	HG03742	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA12878	0.751	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA18525	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA18939	0.463	0.488	0.056	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA19017	0.772	0.813	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA19238	0.8	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA19239	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA19625	1.015	1.069	0.0	0.004	0.625	0.625	1	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA19648	0.451	0.475	0.049	0.0	nan	nan	0	1
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA20502	1.064	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43053246	43053893	DEL	648	NA20845	0.0	0.0	0.112	0.0	nan	nan	0	0
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG00096	1.14	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG00268	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG00419	0.774	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG00759	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG01051	0.678	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG01112	0.538	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG01500	0.685	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG01565	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG01583	1.136	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG01595	0.846	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG01879	0.786	0.763	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG02568	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG03006	0.807	0.783	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG03052	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG03642	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	HG03742	0.616	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA12878	1.042	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA18525	0.759	0.737	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA18939	0.855	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA19238	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA19239	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA19625	0.711	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA19648	1.203	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA20502	0.763	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	43801077	43801149	DUP	73	NA20845	0.645	0.627	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG00096	0.651	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG00268	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG00419	0.957	1.008	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG00759	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG01051	0.897	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG01112	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG01500	0.931	0.98	0.0	0.0	0.767	0.767	1	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG01565	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG01583	1.039	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG01595	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG01879	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG02568	0.538	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG02922	1.001	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG03006	0.789	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG03052	0.891	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG03642	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	HG03742	0.819	0.862	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA12878	1.076	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA18525	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA18939	0.446	0.469	0.009	0.068	nan	nan	0	1
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA19017	1.03	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA19238	0.812	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA19239	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA19625	1.041	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA19648	0.952	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA20502	0.763	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	44569426	44569871	DEL	446	NA20845	0.688	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG00096	0.977	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG00268	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG00419	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG00759	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG01051	0.957	0.929	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG01112	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG01500	0.966	0.938	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG01565	0.427	0.415	0.045	0.036	nan	nan	0	1
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG01583	0.991	0.962	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG01595	1.22	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG01879	1.036	1.006	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG02568	0.768	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG02922	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG03006	1.183	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG03052	1.251	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG03642	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	HG03742	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA12878	0.581	0.564	0.055	0.055	nan	nan	0	1
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA18525	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA18939	0.998	0.969	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA19017	1.104	1.071	0.0	0.0	0.59	0.59	1	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA19238	0.787	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA19239	1.158	1.124	0.0	0.0	0.881	0.881	1	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA19625	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA19648	1.128	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA20502	1.133	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	45042429	45043106	DEL	678	NA20845	1.054	1.023	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG00096	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG00268	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG00419	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG00759	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG01051	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG01112	0.556	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG01500	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG01565	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG01583	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG01595	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG01879	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG02568	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG02922	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG03006	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG03052	1.293	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG03642	0.587	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	HG03742	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA12878	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA18525	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA18939	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA19017	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA19238	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA19239	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA19625	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA19648	1.027	1.027	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA20502	1.133	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46897499	46897729	DEL	231	NA20845	0.409	0.409	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG00096	0.869	0.869	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG00268	0.726	0.726	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG00419	0.428	0.428	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG00759	0.424	0.424	0.0	0.124	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG01051	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG01112	0.592	0.592	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG01500	0.667	0.667	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG01565	0.387	0.387	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG01583	0.519	0.519	0.0	0.21	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG01595	0.413	0.413	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG01879	0.295	0.295	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG02568	0.653	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG02922	0.417	0.417	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG03006	0.377	0.377	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG03052	0.573	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG03642	0.709	0.709	0.0	0.0	0.182	0.182	1	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	HG03742	0.25	0.25	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA12878	0.837	0.837	0.0	0.0	0.059	0.061	1	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA18525	0.23	0.23	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA18939	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA19017	0.589	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA19238	0.542	0.542	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA19239	0.489	0.489	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA19625	0.508	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA19648	0.702	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA20502	0.555	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	46906887	46907036	DEL	150	NA20845	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG00096	1.24	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG00268	0.518	0.485	0.0	0.084	0.534	0.534	2	1
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG00419	1.12	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG00759	1.349	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG01051	0.638	0.596	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG01112	0.484	0.452	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG01500	1.071	1.001	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	1
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG01583	0.58	0.542	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG01595	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG01879	1.036	0.968	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG02568	0.538	0.503	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG02922	0.522	0.487	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG03006	1.255	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG03052	1.336	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG03642	0.953	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	HG03742	1.156	1.08	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA12878	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA18525	1.166	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA18939	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA19017	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA19238	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA19239	1.209	1.13	0.0	0.0	0.978	0.978	1	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA19625	1.117	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA19648	1.253	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA20502	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47517876	47518025	DEL	150	NA20845	0.914	0.854	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG00096	1.14	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG00268	1.193	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG00419	1.304	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG00759	1.252	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG01051	0.997	0.968	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG01112	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG01500	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG01565	1.241	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG01583	1.111	1.079	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG01595	0.965	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG01879	1.018	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG02568	0.807	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG02922	1.001	0.972	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG03006	1.399	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG03052	0.488	0.473	0.033	0.1	nan	nan	0	1
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG03642	1.149	1.115	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	HG03742	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA12878	1.025	0.995	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA18525	1.448	1.406	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA18939	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA19017	0.993	0.964	0.0	0.0	0.621	0.621	1	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA19238	1.058	1.027	0.0	0.0	0.936	0.936	1	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA19239	0.592	0.575	0.014	0.076	nan	nan	0	1
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA19625	1.117	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA19648	1.228	1.192	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA20502	1.341	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	47979453	47979881	DEL	429	NA20845	1.162	1.128	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG00096	0.416	0.478	0.0	0.07	0.405	0.405	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG00268	0.415	0.477	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG00419	0.448	0.515	0.009	0.09	0.667	0.667	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG00759	0.289	0.332	0.0	0.082	0.5	0.5	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG01051	0.219	0.252	0.0	0.08	0.5	0.5	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG01112	0.359	0.412	0.0	0.078	0.5	0.5	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG01500	0.369	0.424	0.0	0.055	0.444	0.444	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG01565	0.265	0.304	0.0	0.088	0.389	0.412	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG01583	0.411	0.472	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG01595	0.276	0.317	0.008	0.084	0.636	0.674	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG01879	0.482	0.554	0.006	0.0	1.0	1.0	3	2
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.158	nan	nan	0	0
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG03006	0.394	0.453	0.009	0.057	nan	nan	0	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG03052	0.17	0.195	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG03642	0.244	0.281	0.0	0.089	0.653	0.653	4	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	HG03742	0.578	0.664	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.222	nan	nan	0	0
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA18939	0.0	0.0	0.008	0.202	nan	nan	0	0
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA19017	0.441	0.507	0.0	0.104	0.471	0.471	5	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA19625	0.305	0.35	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA19648	0.175	0.202	0.0	0.073	0.625	0.625	2	1
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA20502	0.601	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	48419925	48420081	DEL	157	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG00096	1.303	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG00268	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG00419	1.202	1.167	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG00759	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG01051	0.439	0.426	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG01112	0.816	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG01500	1.019	0.989	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG01565	1.221	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG01583	1.111	1.079	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG01595	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG01879	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG02568	1.421	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG02922	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG03006	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG03052	0.604	0.587	0.006	0.077	nan	nan	0	1
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG03642	0.782	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	HG03742	1.31	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA12878	0.598	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA18525	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA18939	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA19017	0.809	0.786	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA19238	1.148	1.114	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA19239	1.081	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA19625	1.294	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA19648	1.153	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA20502	1.087	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	49141939	49142174	DEL	236	NA20845	1.076	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG00096	0.923	0.923	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG00268	0.968	0.968	0.0	0.0	0.862	0.862	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG00419	0.937	0.937	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG00759	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG01051	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG01112	1.022	1.022	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG01500	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG01583	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG01595	0.827	0.827	0.0	0.0	0.522	0.493	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG01879	0.965	0.965	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG02568	1.46	1.46	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG02922	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG03006	1.219	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG03052	0.774	0.774	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG03642	0.978	0.978	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	HG03742	0.867	0.867	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA12878	0.905	0.905	0.0	0.0	0.464	0.485	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA18525	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA18939	0.428	0.428	0.0	0.053	0.9	0.9	1	1
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA19017	1.104	1.104	0.0	0.004	0.686	0.686	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA19238	0.954	0.954	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA19239	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA19625	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA19648	1.027	1.027	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA20502	0.809	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55872248	55872323	DEL	76	NA20845	0.796	0.796	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG00096	0.0	0.0	0.013	0.252	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG00268	0.0	0.0	0.017	0.2	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG00419	0.0	0.0	0.027	0.144	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG00759	0.713	0.713	0.006	0.06	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG01051	0.498	0.498	0.008	0.067	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG01112	0.628	0.628	0.014	0.047	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG01500	0.0	0.0	0.019	0.168	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG01565	0.488	0.488	0.009	0.1	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG01583	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG01595	0.276	0.276	0.011	0.091	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG01879	0.0	0.0	0.015	0.249	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG02568	0.346	0.346	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG02922	1.283	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG03006	0.511	0.511	0.004	0.105	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG03052	0.657	0.657	0.009	0.061	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG03642	0.0	0.0	0.021	0.2	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	HG03742	1.156	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA12878	0.564	0.564	0.004	0.105	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA18525	0.0	0.0	0.016	0.174	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA18939	0.428	0.428	0.025	0.104	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA19017	0.405	0.405	0.008	0.089	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA19238	0.593	0.593	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA19239	0.0	0.0	0.003	0.198	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA19625	1.142	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA19648	0.451	0.451	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA20502	0.0	0.0	0.008	0.225	nan	nan	0	0
chr13	55941166	55941469	DEL	304	NA20845	0.258	0.258	0.024	0.059	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG01051	0.259	0.288	0.0	0.107	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG01112	0.323	0.359	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.167	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.135	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG01583	1.003	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG02568	0.692	0.768	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG02922	0.396	0.44	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG03052	0.36	0.401	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.21	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	HG03742	0.79	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA12878	0.418	0.465	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA18939	0.481	0.535	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA19017	0.46	0.511	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA19238	0.438	0.487	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.193	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA19625	0.305	0.338	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.221	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr13	56151096	56151219	DEL	124	NA20845	0.409	0.454	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG00096	1.448	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG00268	1.244	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG00419	1.365	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG00759	1.137	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG01051	1.236	1.155	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG01112	0.628	0.587	0.0	0.072	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG01500	1.388	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG01565	1.425	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG01583	0.749	0.7	0.01	0.067	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG01595	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG01879	1.608	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG02568	0.461	0.431	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG02922	0.48	0.448	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG03006	0.628	0.587	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG03052	0.0	0.0	0.008	0.21	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG03642	1.173	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	HG03742	1.367	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA12878	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA18525	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA18939	0.0	0.0	0.007	0.201	nan	nan	0	0
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA19017	0.662	0.619	0.007	0.091	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA19238	1.135	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA19239	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA19625	0.609	0.569	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA19648	1.077	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA20502	0.809	0.756	0.0	0.093	nan	nan	0	2
chr13	56366307	56366503	DEL	197	NA20845	0.667	0.623	0.006	0.038	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG00096	0.742	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG00268	1.175	1.098	0.0	0.0	0.697	0.697	1	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG00419	0.407	0.381	0.023	0.084	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG00759	1.04	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG01051	1.116	1.043	0.0	0.003	0.545	0.545	1	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG01112	0.932	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG01500	0.878	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG01565	0.448	0.418	0.038	0.085	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG01583	0.459	0.429	0.009	0.035	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG01595	0.728	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG01879	0.536	0.501	0.013	0.057	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG02568	0.999	0.934	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG02922	0.73	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG03006	0.816	0.762	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG03052	0.551	0.515	0.041	0.058	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG03642	0.0	0.0	0.041	0.207	nan	nan	0	0
chr13	58386042	58386447	DEL	406	HG03742	0.424	0.396	0.007	0.096	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA12878	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA18525	0.6	0.561	0.011	0.102	nan	nan	0	1
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA18939	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA19017	0.791	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA19238	1.058	0.988	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA19239	0.991	0.926	0.0	0.0	0.91	0.91	2	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA19625	0.685	0.64	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA19648	1.102	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA20502	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	58386042	58386447	DEL	406	NA20845	0.409	0.382	0.008	0.078	nan	nan	0	1
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG00096	0.796	0.838	0.0	0.0	0.429	0.429	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG00268	0.83	0.873	0.0	0.0	0.704	0.704	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG00419	1.1	1.158	0.0	0.01	0.619	0.619	1	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG00759	0.713	0.75	0.0	0.0	0.632	0.632	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG01051	0.478	0.504	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG01112	0.807	0.849	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG01500	0.843	0.888	0.0	0.0	0.577	0.577	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG01565	0.0	0.0	0.063	0.232	nan	nan	0	1
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG01583	0.749	0.788	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG01595	0.748	0.787	0.0	0.002	0.647	0.611	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG01879	0.625	0.658	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG02568	1.037	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG02922	1.001	1.054	0.0	0.0	0.722	0.722	2	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG03006	0.753	0.793	0.0	0.0	0.722	0.722	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG03052	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG03642	1.1	1.158	0.0	0.0	0.722	0.722	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	HG03742	0.732	0.77	0.0	0.002	0.6	0.6	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA12878	0.803	0.845	0.0	0.003	0.9	0.941	3	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA18525	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA18939	0.766	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA19017	0.0	0.0	0.015	0.186	nan	nan	0	1
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA19238	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA19239	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA19625	0.406	0.427	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA19648	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA20502	0.902	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60786161	60786488	DEL	328	NA20845	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG00096	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG00268	0.743	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG00419	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG00759	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG01051	0.877	0.877	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG01112	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG01500	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG01565	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG01583	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG01595	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG01879	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG02568	1.037	1.037	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG02922	0.772	0.772	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG03006	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG03052	0.785	0.785	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG03642	0.513	0.513	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	HG03742	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA12878	1.093	1.093	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA18525	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA18939	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA19017	0.386	0.386	0.0	0.133	nan	nan	0	1
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA19238	0.735	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA19239	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA19625	0.635	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA19648	0.426	0.426	0.024	0.07	nan	nan	0	1
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA20502	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	60881444	60881693	DEL	250	NA20845	0.882	0.882	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG00096	1.267	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG00268	0.432	0.396	0.09	0.053	nan	nan	0	1
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG00419	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG00759	0.771	0.707	0.094	0.054	nan	nan	0	1
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG01051	1.316	1.207	0.0	0.0	0.71	0.71	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG01112	1.04	0.954	0.0	0.0	0.962	0.962	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG01500	1.3	1.193	0.003	0.0	0.789	0.789	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG01565	1.241	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG01583	1.015	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG01595	1.102	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG01879	1.304	1.196	0.0	0.0	0.636	0.636	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG02568	0.461	0.423	0.081	0.044	nan	nan	0	1
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG02922	1.022	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG03006	1.166	1.069	0.003	0.0	0.818	0.818	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG03052	1.315	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG03642	1.149	1.054	0.007	0.0	0.56	0.56	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	HG03742	1.252	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA12878	0.956	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA18525	1.236	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA18939	1.016	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA19017	0.993	0.911	0.0	0.0	0.811	0.811	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA19238	1.251	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA19239	1.042	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA19625	1.041	0.955	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA19648	0.952	0.874	0.0	0.0	0.882	0.882	3	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA20502	1.017	0.933	0.0	0.0	0.707	0.707	4	2
chr13	61552987	61553884	DEL	898	NA20845	1.269	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG00096	1.14	1.107	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG00268	0.639	0.621	0.0	0.016	0.467	0.467	2	1
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG00419	0.448	0.435	0.0	0.019	0.885	0.885	2	1
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG00759	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG01051	0.937	0.91	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG01112	0.986	0.957	0.0	0.0	0.796	0.796	2	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG01500	0.808	0.784	0.0	0.0	0.947	0.947	2	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG01565	1.079	1.047	0.0	0.0	0.933	0.927	2	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG01583	0.797	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG01595	0.817	0.793	0.0	0.0	0.933	0.881	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG01879	1.108	1.075	0.0	0.007	0.862	0.862	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG02568	0.845	0.821	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG02922	1.189	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG03006	0.825	0.801	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG03052	0.763	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG03642	1.124	1.092	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	HG03742	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA12878	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA18525	0.618	0.6	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA18939	1.248	1.211	0.0	0.0	0.512	0.512	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA19017	1.122	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA19238	1.006	0.977	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA19239	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA19625	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA19648	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA20502	0.416	0.404	0.0	0.02	0.941	0.941	1	2
chr13	62913811	62913864	DEL	54	NA20845	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG00096	0.0	0.0	0.078	0.191	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG00268	0.657	0.614	0.045	0.093	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG00419	0.0	0.0	0.118	0.264	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG00759	0.0	0.0	0.071	0.206	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG01051	0.498	0.466	0.015	0.089	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG01112	0.0	0.0	0.054	0.198	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG01500	0.562	0.525	0.017	0.073	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG01565	1.18	1.103	0.0	0.0	0.75	0.708	2	2
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG01583	0.0	0.0	0.051	0.215	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG01595	0.591	0.552	0.032	0.095	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG01879	0.0	0.0	0.019	0.204	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG02568	0.692	0.646	0.013	0.093	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG02922	0.981	0.916	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG03006	0.484	0.452	0.052	0.093	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG03052	0.721	0.674	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG03642	0.0	0.0	0.057	0.205	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	HG03742	0.0	0.0	0.047	0.214	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA12878	0.0	0.0	0.043	0.202	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA18525	0.0	0.0	0.019	0.251	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA18939	0.0	0.0	0.026	0.196	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA19017	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA19238	1.212	1.133	0.0	0.0	0.654	0.654	2	2
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA19239	1.029	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA19625	1.32	1.233	0.0	0.0	0.731	0.731	3	2
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA19648	0.0	0.0	0.064	0.202	nan	nan	0	0
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA20502	0.532	0.497	0.014	0.125	nan	nan	0	1
chr13	65637801	65638216	DEL	416	NA20845	0.731	0.683	0.011	0.063	0.381	0.381	1	1
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG00096	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG00268	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG00419	1.141	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG00759	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG01051	1.156	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG01112	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG01500	0.773	0.773	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG01583	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG01595	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG01879	0.697	0.697	0.0	0.054	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG02568	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG02922	1.231	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG03006	0.95	0.95	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG03052	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG03642	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	HG03742	1.117	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA12878	0.734	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA18525	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA18939	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA19017	0.864	0.864	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA19239	0.785	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA19625	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA19648	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA20502	0.74	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	67861804	67861974	DUP	171	NA20845	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG00096	1.031	1.001	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG00268	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG00419	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG00759	1.137	1.104	0.0	0.0	0.962	0.962	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG01051	0.897	0.871	0.0	0.0	0.69	0.69	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG01112	1.148	1.114	0.0	0.0	0.533	0.533	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG01500	1.142	1.108	0.0	0.0	0.891	0.891	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG01565	1.18	1.146	0.0	0.0	0.882	0.923	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG01583	0.991	0.962	0.0	0.0	0.505	0.505	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG01595	1.142	1.108	0.0	0.0	0.887	0.838	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG01879	0.965	0.937	0.0	0.0	0.777	0.777	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG02568	0.922	0.895	0.0	0.0	0.85	0.85	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG02922	1.064	1.033	0.0	0.0	0.273	0.273	1	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG03006	1.004	0.975	0.0	0.0	0.525	0.525	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG03052	1.039	1.009	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG03642	0.978	0.949	0.0	0.0	0.847	0.847	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	HG03742	0.539	0.524	0.085	0.043	nan	nan	0	1
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA12878	0.871	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA18525	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA18939	1.052	1.021	0.0	0.0	0.893	0.893	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA19017	1.048	1.018	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA19238	1.148	1.114	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA19239	0.991	0.962	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA19625	1.066	1.035	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA19648	1.027	0.997	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA20502	1.225	1.19	0.0	0.0	0.773	0.773	2	2
chr13	68100521	68101466	DEL	946	NA20845	1.312	1.274	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG00096	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG00268	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG00419	0.713	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG00759	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG01051	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG01112	0.251	0.251	0.052	0.011	nan	nan	0	1
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG01500	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG01565	0.773	0.773	0.0	0.0	0.917	0.971	1	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG01583	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG01595	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG01879	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG02568	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG02922	0.73	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG03006	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG03052	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG03642	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	HG03742	0.366	0.366	0.064	0.008	nan	nan	0	1
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA12878	0.82	0.82	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA18525	0.971	0.971	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA18939	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA19017	0.809	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA19238	0.709	0.709	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA19239	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA19625	0.736	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA19648	0.902	0.902	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA20502	0.994	0.994	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68397289	68397946	DEL	658	NA20845	0.817	0.817	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG00096	0.326	0.326	0.0	0.157	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG00268	0.518	0.518	0.012	0.128	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG00419	0.428	0.428	0.028	0.115	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG00759	0.405	0.405	0.0	0.152	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG01051	0.518	0.518	0.012	0.102	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG01112	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG01500	0.562	0.562	0.017	0.098	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG01565	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG01583	0.0	0.0	0.037	0.179	nan	nan	0	0
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG01595	1.083	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG01879	0.5	0.5	0.017	0.096	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG02568	0.653	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG02922	0.438	0.438	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG03006	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG03052	0.424	0.424	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG03642	0.538	0.538	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	HG03742	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA12878	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA18525	0.936	0.936	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA18939	0.677	0.677	0.01	0.102	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA19017	0.0	0.0	0.038	0.201	nan	nan	0	0
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA19238	0.825	0.825	0.0	0.0	0.758	0.758	1	2
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA19239	0.502	0.502	0.008	0.075	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA19625	0.457	0.457	0.01	0.155	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA19648	0.476	0.476	0.02	0.11	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA20502	0.486	0.486	0.007	0.087	nan	nan	0	1
chr13	68977877	68978201	DEL	325	NA20845	0.968	0.968	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG00096	1.068	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG00268	1.002	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG00419	0.896	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG00759	1.349	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG01051	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG01112	1.291	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG01500	0.984	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG01565	1.262	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG01583	0.87	0.813	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG01595	0.906	0.846	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG01879	0.536	0.501	0.035	0.13	nan	nan	0	1
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG02568	0.499	0.467	0.068	0.125	nan	nan	0	1
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG02922	0.522	0.487	0.055	0.063	nan	nan	0	1
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG03006	0.986	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG03052	0.488	0.456	0.044	0.077	nan	nan	0	1
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG03642	1.296	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	HG03742	1.213	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA12878	0.837	0.782	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA18525	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA18939	1.034	0.966	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA19017	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA19238	1.148	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA19239	1.267	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA19625	1.193	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA19648	1.002	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA20502	0.809	0.756	0.005	0.0	0.765	0.765	1	2
chr13	69699225	69699710	DEL	486	NA20845	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG00096	0.905	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG00268	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG00419	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG00759	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG01051	0.997	0.968	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG01112	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG01500	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG01565	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG01583	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG01595	0.807	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG01879	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG02568	1.114	1.082	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG02922	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG03006	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG03052	1.23	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG03642	0.489	0.475	0.037	0.034	nan	nan	0	1
chr13	71123947	71124554	DEL	608	HG03742	0.809	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA12878	1.008	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA18525	0.954	0.926	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA18939	0.838	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA19017	1.104	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA19238	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA19239	1.107	1.074	0.0	0.0	0.891	0.891	1	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA19625	0.914	0.887	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA19648	0.977	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA20502	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71123947	71124554	DEL	608	NA20845	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG00096	1.393	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG00268	1.072	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG00419	1.222	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG00759	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG01051	0.658	0.639	0.0	0.037	0.966	0.966	1	1
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG01112	0.628	0.609	0.004	0.021	0.579	0.579	1	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG01500	1.177	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG01565	1.16	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG01583	0.749	0.727	0.0	0.026	0.375	0.375	1	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG01595	1.378	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG01879	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG02568	0.922	0.895	0.0	0.018	0.5	0.5	1	1
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG02922	1.314	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG03006	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG03052	1.198	1.163	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG03642	1.222	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	HG03742	1.156	1.122	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA12878	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA18525	0.477	0.463	0.0	0.01	0.733	0.733	1	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA18939	0.481	0.467	0.0	0.023	1.0	1.0	1	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA19017	1.104	1.071	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA19238	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA19239	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA19625	0.888	0.862	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA19648	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA20502	1.595	1.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	71924371	71924424	DEL	54	NA20845	1.14	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG00096	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG00268	0.778	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG00419	1.365	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG00759	0.578	0.561	0.051	0.032	nan	nan	0	1
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG01051	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG01112	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG01500	0.896	0.87	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG01565	1.058	1.027	0.0	0.0	0.656	0.695	1	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG01583	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG01595	0.453	0.44	0.074	0.037	nan	nan	0	1
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG01879	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG02568	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG02922	1.064	1.033	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG03006	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG03052	1.081	1.05	0.0	0.0	0.947	0.947	3	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG03642	1.027	0.997	0.0	0.0	0.722	0.722	3	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	HG03742	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA12878	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA18525	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA18939	1.194	1.159	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA19017	1.214	1.179	0.0	0.0	0.711	0.711	4	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA19238	0.929	0.902	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA19239	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA19625	0.939	0.912	0.0	0.0	0.55	0.55	3	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA19648	0.977	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA20502	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	73299589	73300302	DEL	714	NA20845	1.183	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG00268	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG00759	1.156	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG01595	1.181	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG02568	1.037	1.092	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG02922	1.064	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG03006	1.201	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG03052	0.997	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	HG03642	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	NA12878	0.683	0.719	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	NA19239	1.107	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	75625199	75625277	DUP	79	NA19648	1.002	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG00096	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG00268	0.691	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG00419	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG00759	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG01051	0.738	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG01112	1.004	0.975	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG01500	1.142	1.108	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG01565	1.14	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG01583	1.256	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG01595	1.122	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG01879	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG02568	0.269	0.261	0.0	0.053	0.833	0.833	1	1
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG02922	1.21	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG03006	1.148	1.114	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG03052	0.869	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG03642	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	HG03742	1.233	1.197	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA12878	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA18525	1.024	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA18939	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA19017	0.46	0.446	0.0	0.043	0.963	0.963	1	1
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA19238	0.916	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA19239	0.721	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA19625	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA19648	0.802	0.778	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA20502	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	76868478	76868542	DEL	65	NA20845	0.968	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG00096	1.194	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG00268	1.054	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG00419	1.1	1.068	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG00759	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG01051	0.997	0.968	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG01112	1.201	1.166	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG01500	1.212	1.177	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG01565	1.18	1.146	0.0	0.0	0.842	0.795	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG01583	1.16	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG01595	1.063	1.032	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG01879	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG02568	0.922	0.895	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG02922	1.189	1.155	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG03006	1.291	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG03052	1.124	1.091	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG03642	1.076	1.044	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	HG03742	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA12878	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA18525	1.289	1.252	0.003	0.0	0.974	0.974	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA18939	1.087	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA19017	1.104	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA19238	0.593	0.576	0.095	0.056	nan	nan	0	1
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA19239	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA19625	1.066	1.035	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA19648	1.052	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA20502	1.04	1.01	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr13	78171272	78172191	DEL	920	NA20845	1.119	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG00096	0.869	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG00268	0.864	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG00419	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG00759	0.655	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG01051	0.339	0.377	0.0	0.031	0.75	0.75	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG01112	0.914	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG01500	0.72	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG01565	0.956	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG01583	0.459	0.51	0.0	0.0	0.75	0.75	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG01595	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG01879	0.5	0.556	0.0	0.041	0.667	0.667	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG02568	0.538	0.598	0.0	0.036	0.312	0.313	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG02922	0.334	0.371	0.0	0.029	0.938	0.938	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG03006	0.986	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG03052	0.0	0.0	0.008	0.07	nan	nan	0	0
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG03642	0.807	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	HG03742	1.04	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA12878	0.444	0.493	0.005	0.036	0.63	0.658	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA18525	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA18939	0.784	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA19017	0.349	0.388	0.0	0.014	0.941	0.941	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA19239	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA19625	0.914	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA19648	0.526	0.585	0.0	0.011	0.217	0.217	1	1
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA20502	0.809	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	79757405	79757461	DEL	57	NA20845	0.71	0.789	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG00096	0.57	0.655	0.0	0.0	0.75	0.75	7	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG00268	0.657	0.755	0.018	0.0	nan	nan	0	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG00419	0.733	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG00759	0.462	0.532	0.006	0.0	0.875	0.875	7	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG01051	0.478	0.55	0.006	0.0	0.545	0.545	4	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG01112	0.448	0.515	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG01500	0.632	0.727	0.004	0.0	0.632	0.632	6	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG01565	0.529	0.608	0.0	0.0	0.325	0.327	2	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG01583	0.459	0.528	0.0	0.0	0.725	0.725	4	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG01595	0.591	0.679	0.0	0.0	0.667	0.706	1	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG01879	0.625	0.719	0.0	0.0	0.824	0.824	5	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG02568	0.499	0.574	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG02922	0.501	0.576	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG03006	0.52	0.598	0.005	0.0	0.467	0.467	4	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG03052	0.445	0.512	0.0	0.0	0.871	0.871	6	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG03642	0.244	0.281	0.043	0.0	0.273	0.273	1	1
chr13	81280265	81281194	DEL	930	HG03742	0.559	0.642	0.0	0.0	0.75	0.75	7	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA12878	0.632	0.726	0.004	0.0	0.522	0.52	10	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA18525	0.742	0.853	0.004	0.0	0.865	0.865	2	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA18939	0.428	0.492	0.0	0.006	0.368	0.368	6	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA19017	0.57	0.655	0.0	0.0	0.557	0.557	2	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA19238	0.58	0.667	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA19239	0.682	0.784	0.001	0.001	0.923	0.923	1	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA19625	0.406	0.467	0.0	0.0	0.5	0.5	5	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA19648	0.727	0.835	0.0	0.0	0.825	0.825	2	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA20502	0.486	0.558	0.007	0.0	0.84	0.84	6	2
chr13	81280265	81281194	DEL	930	NA20845	0.613	0.705	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG00096	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG00268	0.709	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG00419	1.263	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG00759	0.809	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG01051	0.738	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG01112	0.843	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG01500	0.966	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG01565	0.895	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG01583	1.184	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG01595	1.024	0.957	0.0	0.0	0.917	0.866	1	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG02568	0.768	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG02922	0.939	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG03006	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG03052	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG03642	0.904	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	HG03742	1.079	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA12878	0.854	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA18525	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA18939	1.319	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA19017	0.846	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA19238	0.916	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA19239	1.042	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA19625	1.015	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA19648	1.077	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA20502	0.925	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82169385	82169564	DUP	180	NA20845	0.968	0.905	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG00096	1.031	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG00268	1.4	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG00419	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG00759	1.195	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG01051	1.216	1.137	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG01112	1.004	0.938	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG01500	1.107	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG01565	1.119	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG01583	1.136	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG01595	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG01879	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG02922	1.022	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG03006	1.004	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG03052	1.145	1.07	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG03642	1.076	1.005	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	HG03742	0.867	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA12878	1.401	1.309	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA18525	1.06	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA18939	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA19017	1.15	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA19238	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA19239	1.274	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA19648	1.228	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA20502	0.971	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	82462079	82462420	DUP	342	NA20845	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG00096	1.212	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG00268	1.02	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG00419	0.794	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG00759	1.118	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG01051	1.156	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG01112	0.968	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG01500	1.036	0.951	0.0	0.0	0.596	0.596	2	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG01565	1.343	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG01583	0.894	0.82	0.0	0.0	0.451	0.451	2	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG01595	1.358	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG01879	0.0	0.0	0.008	0.189	nan	nan	0	0
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG02568	1.153	1.057	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG02922	0.814	0.747	0.0	0.005	0.969	0.969	2	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG03006	0.932	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG03052	0.806	0.739	0.017	0.105	nan	nan	0	1
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG03642	0.587	0.538	0.008	0.076	nan	nan	0	1
chr13	83801227	83801437	DEL	211	HG03742	0.462	0.424	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA12878	0.871	0.799	0.0	0.0	0.869	0.866	2	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA18525	0.954	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA18939	0.0	0.0	0.007	0.175	nan	nan	0	0
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA19017	0.975	0.894	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA19238	0.593	0.544	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA19239	1.248	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA19625	0.584	0.536	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA19648	0.526	0.483	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA20502	0.994	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83801227	83801437	DEL	211	NA20845	0.538	0.493	0.009	0.054	nan	nan	0	1
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG00096	0.905	0.952	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG00268	1.123	1.183	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG00419	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG00759	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG01051	0.937	0.986	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG01112	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG01500	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG01565	1.038	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG01583	0.821	0.865	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG01595	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG01879	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG02568	0.307	0.324	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG02922	1.106	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG03006	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG03052	0.891	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG03642	1.002	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	HG03742	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA12878	0.974	1.025	0.0	0.003	0.893	0.933	1	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA18525	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA18939	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA19017	1.03	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA19238	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA19239	1.119	1.178	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA19625	1.066	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA19648	1.002	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA20502	1.133	1.193	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	83829668	83829778	DEL	111	NA20845	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG00096	0.688	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG00268	0.605	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG00419	0.672	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG00759	0.597	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG01051	0.638	0.733	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG01112	0.556	0.639	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG01500	0.632	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG01565	0.773	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG01583	0.725	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG01595	0.748	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG01879	0.732	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG02568	1.191	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG02922	0.292	0.336	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG03006	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG03052	0.721	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG03642	0.953	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	HG03742	0.366	0.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA12878	0.649	0.746	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA18525	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA18939	0.784	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA19017	0.644	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA19238	0.748	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA19239	0.489	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA19625	0.761	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA19648	0.752	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA20502	0.578	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	84036242	84036376	DEL	135	NA20845	0.817	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG00096	0.914	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG00268	1.02	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG00419	1.019	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG00759	1.214	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG01051	0.997	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG01112	0.592	0.543	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG01500	1.071	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG01565	0.468	0.429	0.0	0.078	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG01583	0.991	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG01595	1.024	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG01879	1.197	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG02568	0.807	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG02922	1.189	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG03006	1.327	1.217	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG03052	1.103	1.012	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG03642	1.32	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	HG03742	1.059	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA12878	0.905	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA18525	0.971	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA18939	1.176	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA19017	1.287	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA19238	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA19239	1.094	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA19625	0.964	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA19648	0.827	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA20502	1.11	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85223246	85223355	DEL	110	NA20845	0.989	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG00096	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG00268	0.864	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG00419	0.611	0.571	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG00759	0.617	0.576	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG01051	0.897	0.838	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG01112	0.843	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG01500	0.826	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG01565	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG01583	0.918	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG01595	0.906	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG01879	1.036	0.968	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.194	nan	nan	0	0
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG02922	0.542	0.507	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	0
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG03052	0.615	0.575	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG03642	1.247	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	HG03742	0.693	0.648	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA12878	0.461	0.431	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA18525	0.936	0.875	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA18939	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA19017	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA19238	1.212	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA19625	0.457	0.427	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA19648	0.651	0.609	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA20502	1.295	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85929515	85929693	DEL	179	NA20845	0.753	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG00096	0.633	0.728	0.0	0.0	0.805	0.805	4	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG00268	0.639	0.735	0.0	0.0	0.769	0.769	3	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG00419	0.367	0.421	0.059	0.034	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG00759	0.328	0.376	0.071	0.048	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG01051	0.578	0.665	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG01112	0.699	0.804	0.0	0.0	0.787	0.787	2	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG01500	0.72	0.828	0.0	0.0	0.809	0.809	2	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG01565	0.59	0.678	0.0	0.0	0.475	0.448	4	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG01583	0.87	1.0	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG01595	0.709	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG01879	0.536	0.616	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG02568	0.461	0.53	0.056	0.073	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG02922	0.292	0.336	0.052	0.024	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG03006	0.233	0.268	0.071	0.041	0.824	0.824	1	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG03052	0.466	0.536	0.072	0.059	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG03642	0.88	1.011	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	HG03742	0.25	0.288	0.095	0.054	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA12878	0.342	0.393	0.116	0.071	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA18525	0.83	0.954	0.0	0.0	0.839	0.839	3	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA18939	0.677	0.778	0.0	0.002	0.647	0.647	3	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA19017	0.644	0.74	0.008	0.0	0.733	0.733	3	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA19238	0.709	0.815	0.0	0.0	0.873	0.873	2	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA19239	0.347	0.399	0.13	0.091	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA19625	0.279	0.321	0.148	0.099	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA19648	0.326	0.374	0.085	0.063	nan	nan	0	1
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA20502	0.717	0.824	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr13	85936698	85937632	DEL	935	NA20845	0.538	0.618	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG00096	0.923	0.863	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG00268	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG00419	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG00759	1.156	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG01051	0.977	0.913	0.0	0.0	0.667	0.667	5	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG01112	0.583	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG01500	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG01565	0.977	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG01583	1.16	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG01595	1.26	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG01879	1.215	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG02568	0.346	0.323	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG02922	0.563	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG03006	1.219	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG03052	0.615	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG03642	1.027	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	HG03742	1.233	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA12878	1.178	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA18525	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA18939	0.927	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA19017	1.196	1.117	0.003	0.0	0.788	0.788	5	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA19238	1.373	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA19239	0.605	0.565	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA19625	0.558	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA19648	1.178	1.101	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA20502	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	86674318	86675121	DEL	804	NA20845	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG00096	0.869	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG00268	1.279	1.173	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG00419	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG00759	1.407	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG01051	0.937	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG01112	1.327	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG01500	0.949	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG01565	1.038	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG01583	0.966	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG01595	1.24	1.138	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG01879	0.893	0.819	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG02568	0.884	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG02922	1.148	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG03006	1.022	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG03052	1.018	0.934	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG03642	0.953	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	HG03742	1.252	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA12878	0.734	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA18525	0.848	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA18939	0.909	0.834	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA19017	0.405	0.371	0.0	0.022	0.88	0.88	1	1
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA19238	1.315	1.207	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA19239	0.849	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA19625	1.244	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA19648	1.052	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA20502	1.11	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	88022747	88022806	DEL	60	NA20845	0.796	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG00096	1.122	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG00268	1.123	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG00419	1.161	1.085	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG00759	0.983	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG01051	1.376	1.286	0.003	0.0	0.636	0.636	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG01112	1.219	1.14	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG01500	1.23	1.149	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG01565	1.262	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG01583	1.063	0.994	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG01595	1.043	0.975	0.0	0.0	0.76	0.805	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG01879	1.322	1.235	0.0	0.0	0.813	0.813	2	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG02568	0.307	0.287	0.093	0.047	nan	nan	0	1
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG02922	1.106	1.033	0.002	0.002	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG03006	1.076	1.005	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG03052	1.06	0.991	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG03642	0.88	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	HG03742	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA12878	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA18525	0.901	0.842	0.004	0.0	0.957	0.957	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA18939	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA19017	1.232	1.152	0.0	0.0	0.656	0.656	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA19238	0.619	0.579	0.123	0.054	nan	nan	0	1
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA19239	1.209	1.13	0.003	0.0	0.929	0.929	1	2
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA19625	0.508	0.474	0.113	0.063	nan	nan	0	1
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA19648	0.526	0.492	0.1	0.039	nan	nan	0	1
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA20502	0.578	0.54	0.11	0.075	nan	nan	0	1
chr13	89421966	89422930	DEL	965	NA20845	1.377	1.287	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG00096	0.38	0.355	0.0	0.023	0.792	0.792	1	1
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG00268	0.83	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG00419	0.876	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG00759	1.195	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG01051	0.498	0.466	0.0	0.018	0.966	0.966	1	1
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG01112	0.699	0.654	0.0	0.031	0.426	0.426	1	1
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG01500	0.773	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG01565	0.692	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG01583	0.991	0.926	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG01595	0.768	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG01879	0.679	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG02568	0.231	0.215	0.0	0.011	nan	nan	0	1
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG02922	1.043	0.975	0.008	0.004	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG03006	0.861	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG03052	0.71	0.664	0.0	0.012	0.465	0.465	1	1
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG03642	0.831	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	HG03742	0.732	0.684	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA12878	1.025	0.958	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA18525	0.706	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA18939	0.927	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA19017	0.92	0.859	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA19238	0.426	0.398	0.0	0.035	1.0	1.0	1	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA19239	0.502	0.469	0.0	0.019	0.627	0.627	1	1
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA19625	0.33	0.308	0.0	0.019	0.529	0.529	1	1
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA19648	1.228	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA20502	0.971	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	90726943	90726998	DEL	56	NA20845	0.774	0.724	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG00096	0.561	0.591	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG00268	0.985	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG00419	0.856	0.901	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG00759	0.231	0.243	0.009	0.118	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG01051	1.057	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG01112	0.771	0.812	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG01500	0.984	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG01565	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG01583	0.435	0.458	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG01595	0.472	0.497	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG01879	0.786	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG02568	0.845	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG02922	0.563	0.593	0.0	0.121	nan	nan	0	1
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG03006	1.022	1.076	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG03052	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG03642	0.562	0.592	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr13	92111709	92111830	DEL	122	HG03742	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA12878	0.581	0.611	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA18525	0.442	0.465	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.195	nan	nan	0	0
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA19017	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA19238	0.903	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA19239	1.023	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA19625	1.091	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA19648	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA20502	1.11	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	92111709	92111830	DEL	122	NA20845	0.473	0.498	0.0	0.085	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG00096	1.05	1.019	0.0	0.0	0.848	0.848	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG00268	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG00419	0.285	0.277	0.084	0.055	nan	nan	0	1
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG00759	1.214	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG01051	1.077	1.045	0.0	0.0	0.622	0.622	2	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG01112	1.309	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG01500	0.861	0.836	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG01565	1.038	1.008	0.0	0.003	0.625	0.59	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG01583	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG01595	0.925	0.898	0.0	0.0	0.586	0.554	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG01879	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG02568	0.653	0.634	0.0	0.0	0.567	0.567	2	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG02922	0.522	0.506	0.048	0.032	nan	nan	0	1
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG03006	0.95	0.923	0.0	0.0	0.613	0.613	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG03052	0.975	0.947	0.0	0.0	0.747	0.747	2	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG03642	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	HG03742	1.04	1.01	0.0	0.0	0.855	0.855	2	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA12878	0.905	0.879	0.0	0.0	0.852	0.815	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA18525	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA18939	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA19017	0.975	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA19238	1.109	1.077	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA19239	1.145	1.112	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA19625	1.117	1.084	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA19648	0.777	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA20502	0.971	0.943	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr13	93056849	93057421	DEL	573	NA20845	0.989	0.961	0.0	0.002	0.409	0.409	1	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG00096	1.031	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG00268	1.002	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG00419	0.53	0.486	0.008	0.048	0.452	0.452	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG00759	0.578	0.53	0.0	0.086	0.568	0.568	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG01051	0.638	0.585	0.0	0.049	0.462	0.462	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG01112	0.574	0.526	0.0	0.024	0.342	0.342	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG01500	1.089	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG01565	0.977	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG01583	1.667	1.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG01595	0.492	0.451	0.014	0.056	0.645	0.683	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG02568	0.96	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG03006	1.112	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG03052	0.573	0.525	0.0	0.088	0.839	0.839	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG03642	1.051	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	HG03742	0.559	0.512	0.0	0.04	0.39	0.39	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA12878	1.042	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA18525	1.148	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA18939	0.82	0.752	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA19017	0.0	0.0	0.008	0.118	nan	nan	0	0
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA19238	0.451	0.414	0.0	0.064	0.68	0.68	1	1
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	0
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA19625	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA19648	1.052	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA20502	0.925	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	94392427	94392525	DEL	99	NA20845	0.516	0.474	0.0	0.066	0.381	0.381	1	1
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG00096	0.29	0.305	0.0	0.044	0.909	0.909	1	1
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG00268	0.881	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG00419	0.57	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG00759	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG01051	0.758	0.797	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG01112	0.341	0.359	0.0	0.034	0.65	0.65	1	1
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG01500	0.703	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG01565	0.692	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG01583	0.217	0.229	0.0	0.055	0.909	0.909	1	1
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG01595	0.689	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG01879	0.447	0.47	0.0	0.056	0.607	0.607	1	1
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG02568	0.346	0.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG02922	0.709	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG03006	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG03052	0.933	0.982	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG03642	0.538	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	HG03742	1.002	1.054	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA12878	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA18525	0.618	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA18939	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA19017	0.846	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA19238	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA19239	0.425	0.447	0.0	0.039	0.765	0.765	1	1
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA19625	0.685	0.721	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA19648	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	0
chr13	97347834	97347922	DEL	89	NA20845	0.344	0.362	0.0	0.052	0.786	0.786	1	1
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG00096	0.825	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG00268	0.743	0.896	0.0	0.005	1.0	0.958	1	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG00419	0.415	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG00759	0.637	0.767	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG01051	0.412	0.497	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG01112	0.388	0.468	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG01500	0.881	1.062	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG01565	0.622	0.749	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG01583	0.559	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG01595	0.585	0.705	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG01879	0.676	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG02568	0.309	0.372	0.0	0.013	nan	nan	0	1
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG02922	0.444	0.535	0.0	0.011	0.182	0.182	1	1
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG03006	0.73	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG03052	0.451	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG03642	0.609	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	HG03742	0.57	0.686	0.0	0.001	0.727	0.727	1	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA12878	0.756	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA18525	0.928	1.119	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA18939	0.689	0.83	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA19017	0.769	0.927	0.0	0.002	1.0	1.0	1	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA19238	0.698	0.841	0.0	0.002	0.864	0.864	1	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA19239	0.55	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA19625	0.54	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA19648	0.705	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA20502	0.669	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100423887	100423959	DEL	73	NA20845	0.613	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG00096	0.917	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG00268	1.141	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG00419	0.788	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG00759	0.915	1.017	0.0	0.0	0.87	0.915	1	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG01051	0.969	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG01112	0.832	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG01500	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG01565	1.036	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG01583	0.851	0.945	0.0	0.0	0.714	0.774	1	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG01595	0.868	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG01879	0.986	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG02568	0.926	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG02922	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG03006	0.985	1.095	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG03052	0.88	0.977	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG03642	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	HG03742	0.786	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA12878	1.22	1.355	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA18525	0.893	0.993	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA18939	1.088	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA19017	1.051	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA19238	0.843	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA19625	1.285	1.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA19648	1.184	1.316	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA20502	0.877	0.975	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr14	100723894	100723971	DUP	78	NA20845	0.569	0.633	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG00096	0.917	0.965	0.0	0.0	0.77	0.737	2	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG00268	0.536	0.564	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG00419	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG00759	0.438	0.461	0.029	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG01051	0.392	0.412	0.042	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG01112	0.481	0.506	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG01500	0.683	0.719	0.0	0.0	0.636	0.636	2	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG01565	0.435	0.458	0.056	0.005	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG01583	0.365	0.384	0.031	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG01595	0.807	0.85	0.0	0.0	0.867	0.867	2	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG01879	0.347	0.365	0.017	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG02568	0.424	0.447	0.048	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG02922	0.444	0.467	0.029	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG03006	0.858	0.903	0.016	0.007	0.785	0.785	2	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG03052	0.0	0.0	0.215	0.0	nan	nan	0	0
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG03642	0.558	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	HG03742	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA12878	1.134	1.194	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA18525	0.0	0.0	0.205	0.005	nan	nan	0	0
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA18939	0.689	0.725	0.0	0.0	0.859	0.858	2	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA19017	0.338	0.356	0.022	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA19238	0.0	0.0	0.208	0.004	nan	nan	0	0
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA19239	0.458	0.483	0.082	0.003	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA19625	0.437	0.46	0.045	0.0	nan	nan	0	1
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA19648	0.731	0.769	0.0	0.0	0.703	0.703	2	2
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA20502	0.0	0.0	0.142	0.0	nan	nan	0	0
chr14	105506303	105507055	DEL	753	NA20845	0.723	0.761	0.0	0.0	0.638	0.638	2	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG00096	0.293	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG00419	0.104	0.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG01595	0.262	0.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG02922	0.106	0.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG03006	0.164	0.198	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG03052	0.386	0.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	HG03742	0.177	0.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA12878	0.103	0.124	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA19017	0.075	0.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA19238	0.211	0.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	20554462	20554658	DEL	197	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG00096	0.88	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG00268	0.899	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG00419	0.933	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG00759	0.697	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG01051	0.711	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG01112	0.666	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG01500	0.719	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG01565	0.622	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG01583	0.729	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG01595	0.585	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG01879	0.603	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG02568	0.771	0.929	0.0	0.058	0.75	0.75	1	1
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG02922	0.613	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG03006	0.739	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG03052	0.923	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG03642	0.914	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	HG03742	0.746	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA12878	0.773	0.931	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA18525	0.683	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA18939	0.87	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA19017	0.844	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA19238	0.685	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA19239	0.72	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA19625	1.002	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA19648	0.932	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA20502	0.739	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21510510	21510567	DEL	58	NA20845	0.701	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG00096	0.568	0.552	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	0
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG00419	0.788	0.765	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG00759	0.458	0.444	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG01051	0.722	0.701	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG01112	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG01500	0.36	0.349	0.009	0.103	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG01565	0.0	0.0	0.005	0.138	nan	nan	0	0
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG01583	0.729	0.708	0.007	0.04	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG01879	1.022	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG02568	0.656	0.637	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG02922	0.55	0.534	0.0	0.038	0.25	0.25	1	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG03006	0.383	0.372	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG03052	0.987	0.958	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.083	nan	nan	0	0
chr14	21778185	21778397	DEL	213	HG03742	0.393	0.381	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA12878	0.481	0.467	0.006	0.046	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA18525	0.596	0.578	0.008	0.072	nan	nan	0	2
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	0
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA19017	0.0	0.0	0.015	0.133	nan	nan	0	0
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA19238	0.619	0.601	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA19625	0.36	0.349	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA19648	0.454	0.44	0.011	0.038	nan	nan	0	1
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA20502	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	21778185	21778397	DEL	213	NA20845	0.744	0.723	0.009	0.041	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG00096	0.642	0.623	0.009	0.09	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG00268	0.605	0.587	0.012	0.069	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG00419	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG00759	0.0	0.0	0.039	0.229	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG01051	0.474	0.46	0.007	0.123	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG01112	0.0	0.0	0.044	0.239	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG01500	0.0	0.0	0.028	0.266	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG01565	0.414	0.402	0.028	0.073	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG01583	0.0	0.0	0.038	0.143	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG01595	0.0	0.0	0.061	0.198	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG01879	0.456	0.443	0.017	0.069	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG02568	0.424	0.412	0.019	0.066	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG02922	0.0	0.0	0.08	0.227	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG03006	0.0	0.0	0.105	0.216	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG03052	0.729	0.708	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG03642	0.406	0.394	0.01	0.083	0.5	0.5	2	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	HG03742	0.648	0.629	0.022	0.081	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA12878	0.0	0.0	0.005	0.184	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA18525	0.508	0.493	0.012	0.088	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA18939	0.0	0.0	0.05	0.219	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA19017	0.0	0.0	0.039	0.222	nan	nan	0	0
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA19238	0.487	0.473	0.005	0.078	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA19239	1.153	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA19625	1.208	1.173	0.0	0.0	0.818	0.764	1	2
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA19648	0.529	0.514	0.029	0.087	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA20502	0.485	0.471	0.017	0.099	nan	nan	0	1
chr14	23922251	23922650	DEL	400	NA20845	0.547	0.531	0.016	0.08	nan	nan	0	1
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG00096	1.137	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG00268	1.297	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG00419	0.933	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG00759	1.512	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG01051	1.216	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG01112	1.22	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG01500	1.151	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG01565	1.595	1.491	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG01583	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG01595	1.332	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG01879	0.931	0.87	0.0	0.025	0.434	0.455	1	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG02568	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG02922	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG03006	1.204	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG03052	0.451	0.421	0.0	0.024	0.955	0.955	1	1
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG03642	0.914	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	HG03742	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA12878	1.185	1.108	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA18525	1.296	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA18939	1.251	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA19017	1.239	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA19238	0.606	0.566	0.0	0.008	0.592	0.592	1	1
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA19239	1.166	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA19625	1.568	1.465	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA19648	1.512	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA20502	0.9	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	24340566	24340618	DEL	53	NA20845	1.664	1.555	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG00096	0.422	0.444	0.086	0.049	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG00268	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG00419	0.829	0.873	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG00759	0.736	0.775	0.0	0.0	0.611	0.581	1	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG01051	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG01112	0.277	0.292	0.082	0.073	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG01500	0.521	0.549	0.066	0.041	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG01565	0.642	0.676	0.0	0.0	0.739	0.739	3	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG01583	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG01595	0.384	0.404	0.098	0.063	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG01879	0.365	0.384	0.067	0.048	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG02568	0.964	1.015	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG02922	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG03006	0.73	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG03052	0.322	0.339	0.099	0.063	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG03642	0.431	0.454	0.098	0.057	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	HG03742	0.687	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA12878	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA18525	0.298	0.313	0.087	0.035	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA18939	0.762	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA19017	0.713	0.751	0.0	0.0	0.905	0.905	3	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA19238	0.817	0.86	0.0	0.0	0.948	0.948	2	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA19239	0.786	0.827	0.0	0.0	0.697	0.697	2	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA19625	0.668	0.703	0.0	0.0	0.667	0.622	3	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA19648	0.857	0.902	0.0	0.0	0.507	0.507	4	2
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA20502	0.3	0.316	0.108	0.076	nan	nan	0	1
chr14	25262334	25263126	DEL	793	NA20845	0.569	0.599	0.0	0.0	0.471	0.471	3	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG00096	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG00268	1.193	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG00419	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG00759	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG01051	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG01112	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG01500	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG01565	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG01583	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG01595	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG01879	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	1
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG02922	1.29	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG03006	1.149	1.149	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG03052	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG03642	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	HG03742	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA12878	0.868	0.868	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA18525	0.771	0.771	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA18939	1.052	1.052	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA19017	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA19238	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA19239	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA19625	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA19648	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA20502	0.623	0.623	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	25635898	25635985	DEL	88	NA20845	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG00096	0.495	0.521	0.084	0.055	nan	nan	0	1
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG00268	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG00419	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG00759	0.935	0.985	0.0	0.0	0.552	0.524	1	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG01051	0.969	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG01112	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG01500	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG01565	0.787	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG01583	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG01595	0.807	0.85	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG01879	0.383	0.404	0.077	0.071	nan	nan	0	1
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG02568	0.848	0.893	0.006	0.0	0.75	0.75	1	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG02922	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG03006	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG03052	0.837	0.881	0.0	0.004	0.938	0.938	1	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG03642	1.066	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	HG03742	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA12878	0.498	0.524	0.122	0.073	nan	nan	0	1
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA18525	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA18939	0.798	0.84	0.0	0.0	0.759	0.793	1	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA19017	0.882	0.928	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA19238	1.014	1.067	0.007	0.0	0.816	0.816	1	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA19239	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA19625	0.463	0.487	0.114	0.087	nan	nan	0	1
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA19648	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA20502	0.785	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26283834	26284791	DEL	958	NA20845	0.657	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG00096	1.137	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG00268	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG00419	1.347	1.308	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG00759	1.075	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG01051	1.464	1.421	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG01112	1.276	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG01500	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG01565	1.357	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG01583	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG01595	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG01879	1.351	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG02568	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG02922	1.269	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG03006	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG03052	1.008	0.979	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG03642	0.66	0.641	0.01	0.041	nan	nan	0	1
chr14	26374143	26374252	DEL	110	HG03742	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA12878	0.842	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA18525	0.841	0.816	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA18939	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA19017	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA19238	1.185	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA19239	0.864	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA19625	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA19648	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA20502	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26374143	26374252	DEL	110	NA20845	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG00096	0.183	0.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG00268	0.484	0.444	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG00419	0.124	0.114	0.0	0.074	0.333	0.333	1	1
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG00759	0.438	0.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG01051	0.412	0.378	0.0	0.055	0.292	0.292	1	1
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG01112	0.481	0.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG01500	0.378	0.346	0.0	0.075	1.0	1.0	1	1
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG01565	0.394	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG01583	0.413	0.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG01595	0.363	0.333	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG01879	0.475	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG02568	0.617	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG02922	0.402	0.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG03006	0.456	0.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG03052	0.236	0.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG03642	0.178	0.163	0.0	0.025	0.444	0.444	1	1
chr14	26821872	26821968	DEL	97	HG03742	0.412	0.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA12878	0.189	0.173	0.0	0.089	0.917	0.917	1	1
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA18525	0.28	0.257	0.0	0.063	0.75	0.75	1	1
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA18939	0.435	0.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA19017	0.563	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA19238	0.448	0.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA19239	0.406	0.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA19625	0.411	0.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA19648	0.403	0.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA20502	0.369	0.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	26821872	26821968	DEL	97	NA20845	0.438	0.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG00096	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG00268	0.363	0.382	0.004	0.076	nan	nan	0	1
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG00419	0.788	0.829	0.008	0.0	0.933	0.933	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG00759	0.697	0.733	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG01051	0.0	0.0	0.02	0.153	nan	nan	0	0
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG01112	0.481	0.506	0.013	0.078	nan	nan	0	1
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG01500	0.791	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG01565	0.476	0.502	0.018	0.062	nan	nan	0	1
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG01583	0.0	0.0	0.02	0.173	nan	nan	0	0
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG01595	0.807	0.85	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG01879	0.803	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG02568	0.463	0.487	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG02922	0.666	0.701	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG03006	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG03052	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG03642	0.0	0.0	0.031	0.11	nan	nan	0	0
chr14	33391979	33392320	DEL	342	HG03742	0.844	0.889	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA12878	0.378	0.398	0.0	0.023	nan	nan	0	1
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA18525	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA18939	0.979	1.031	0.0	0.0	0.828	0.865	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA19017	0.676	0.711	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA19238	0.896	0.943	0.0	0.0	0.816	0.816	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA19239	0.72	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA19625	0.822	0.866	0.0	0.0	0.625	0.67	1	2
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA19648	0.277	0.292	0.033	0.1	nan	nan	0	1
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA20502	0.416	0.437	0.019	0.081	nan	nan	0	1
chr14	33391979	33392320	DEL	342	NA20845	0.635	0.668	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG00096	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG00268	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG00419	0.933	0.933	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG00759	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG01051	0.948	0.948	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG01112	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG01500	0.953	0.953	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG01565	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG01583	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG01595	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG01879	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG02568	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG02922	1.184	1.184	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG03006	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG03052	1.051	1.051	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG03642	0.736	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	HG03742	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA12878	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA18525	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA18939	0.653	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA19017	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA19238	0.922	0.922	0.0	0.0	0.975	0.975	1	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA19239	0.511	0.511	0.034	0.052	nan	nan	0	1
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA19625	0.591	0.591	0.023	0.019	nan	nan	0	1
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA19648	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA20502	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	33941731	33942389	DEL	659	NA20845	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG00096	0.752	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG00268	0.225	0.21	0.0	0.023	0.625	0.652	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG00419	0.684	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG00759	0.836	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG01051	0.68	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG01112	0.684	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.019	nan	nan	0	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG01565	0.414	0.387	0.0	0.011	0.474	0.474	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG01583	0.535	0.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG01595	0.384	0.358	0.0	0.01	0.471	0.471	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG01879	0.931	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG02922	0.233	0.217	0.0	0.0	1.0	1.0	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG03006	0.31	0.29	0.0	0.036	0.524	0.524	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG03052	0.558	0.521	0.0	0.013	0.6	0.6	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG03642	0.787	0.735	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	HG03742	0.334	0.312	0.0	0.005	0.375	0.375	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA12878	0.928	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA18525	0.806	0.753	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA18939	0.58	0.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.022	nan	nan	0	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA19239	0.602	0.563	0.0	0.021	0.396	0.396	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA19625	0.797	0.745	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA19648	0.302	0.283	0.0	0.015	0.333	0.333	1	2
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA20502	0.277	0.259	0.0	0.014	0.455	0.455	1	1
chr14	34472242	34472296	DEL	55	NA20845	0.438	0.409	0.0	0.016	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG00096	0.0	0.0	0.205	0.138	nan	nan	0	0
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG00268	0.778	0.778	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG00419	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG00759	1.095	1.095	0.0	0.0	0.883	0.93	2	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG01051	0.474	0.474	0.063	0.044	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG01112	0.407	0.407	0.058	0.043	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG01500	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG01565	1.077	1.077	0.0	0.0	0.638	0.638	2	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG01583	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG01595	0.444	0.444	0.048	0.048	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG01879	0.895	0.895	0.0	0.0	0.833	0.834	2	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG02568	1.273	1.273	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG02922	0.909	0.909	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG03006	0.328	0.328	0.066	0.054	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG03052	0.472	0.472	0.099	0.066	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG03642	0.609	0.609	0.051	0.041	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	HG03742	1.021	1.021	0.0	0.0	0.909	0.909	2	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA12878	0.515	0.515	0.05	0.037	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA18525	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA18939	0.635	0.635	0.059	0.039	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA19017	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA19238	1.093	1.093	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA19239	0.917	0.917	0.0	0.0	0.917	0.917	2	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA19625	0.0	0.0	0.234	0.146	nan	nan	0	0
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA19648	0.756	0.756	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA20502	0.392	0.392	0.115	0.084	nan	nan	0	1
chr14	34514028	34514838	DEL	811	NA20845	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG00096	1.228	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG00268	0.951	0.923	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG00419	1.14	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG00759	1.075	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG01051	1.072	1.041	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG01112	1.017	0.987	0.0	0.0	0.833	0.877	1	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG01500	0.737	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG01565	0.456	0.442	0.05	0.03	nan	nan	0	1
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG01583	1.312	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG01595	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG01879	1.169	1.134	0.0	0.0	0.862	0.823	1	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG02568	1.273	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG02922	1.205	1.17	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG03006	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG03052	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG03642	1.168	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	HG03742	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA12878	1.099	1.067	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA18525	1.121	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA18939	1.034	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA19017	0.826	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA19238	0.579	0.563	0.015	0.037	nan	nan	0	1
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA19239	1.087	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA19625	1.002	0.973	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA19648	1.512	1.468	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA20502	1.085	1.053	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr14	35702290	35702881	DEL	592	NA20845	0.92	0.893	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG00096	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG00268	0.847	0.822	0.0	0.0	0.92	0.96	1	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG00419	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG00759	0.577	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG01051	1.031	1.001	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG01112	1.109	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG01500	1.187	1.152	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG01565	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG01583	0.996	0.967	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG01595	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG01879	1.114	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG02568	0.848	0.824	0.0	0.007	0.375	0.375	1	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG02922	1.205	1.17	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG03006	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG03052	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG03642	1.015	0.986	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	HG03742	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA12878	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA18525	0.946	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA18939	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA19017	1.126	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA19238	0.856	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA19239	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA19625	1.182	1.148	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA19648	1.109	1.076	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA20502	1.154	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	38962936	38963588	DEL	653	NA20845	0.963	0.935	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG00096	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG00268	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG00419	0.435	0.423	0.04	0.056	0.167	0.167	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG00759	0.637	0.618	0.047	0.039	0.316	0.332	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG01051	0.948	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG01112	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG01500	0.53	0.515	0.033	0.053	0.15	0.15	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG01565	0.331	0.322	0.057	0.048	0.444	0.444	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG01583	0.729	0.708	0.018	0.038	0.444	0.41	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG01595	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG01879	0.968	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG02568	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG02922	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG03006	0.0	0.0	0.098	0.114	nan	nan	0	0
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG03052	0.858	0.833	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG03642	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	HG03742	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA12878	0.584	0.567	0.013	0.043	0.28	0.28	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA18525	0.403	0.391	0.044	0.027	0.211	0.211	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA18939	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA19017	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA19238	0.474	0.46	0.029	0.052	0.22	0.22	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA19239	1.113	1.081	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA19625	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA19648	0.579	0.563	0.039	0.033	0.19	0.19	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA20502	0.439	0.426	0.047	0.07	0.409	0.409	1	1
chr14	39004499	39005026	DEL	528	NA20845	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG00096	1.265	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG00268	1.4	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG00419	1.161	1.055	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG00759	1.512	1.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG01051	1.34	1.218	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG01112	1.664	1.513	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG01500	1.313	1.193	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG01565	1.388	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG01583	1.166	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG01595	1.554	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG01879	1.57	1.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG02568	1.427	1.297	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG02922	1.459	1.326	0.0	0.003	0.655	0.655	1	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG03006	1.168	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG03052	1.545	1.404	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG03642	1.371	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	HG03742	1.551	1.41	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA12878	0.739	0.672	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA18525	1.436	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA18939	1.36	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA19017	1.445	1.314	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA19238	1.515	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA19239	0.694	0.631	0.0	0.102	0.434	0.434	1	1
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA19625	1.208	1.098	0.0	0.0	0.9	0.964	1	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA19648	1.083	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA20502	1.085	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41112206	41112340	DEL	135	NA20845	1.861	1.692	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG00096	0.495	0.481	0.007	0.039	0.553	0.578	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG00268	0.45	0.436	0.0	0.048	0.606	0.632	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG00419	0.642	0.624	0.0	0.059	0.769	0.769	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	0
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG01051	0.392	0.38	0.0	0.052	0.507	0.507	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG01112	0.943	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG01500	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG01565	0.663	0.644	0.0	0.041	0.668	0.668	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG01583	0.365	0.354	0.0	0.043	0.582	0.587	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG01595	0.283	0.274	0.0	0.046	0.627	0.627	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG01879	0.475	0.461	0.0	0.05	0.422	0.443	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG02568	0.463	0.449	0.0	0.046	0.746	0.746	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG02922	0.529	0.513	0.0	0.057	0.366	0.366	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG03006	1.186	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG03052	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG03642	0.584	0.567	0.0	0.031	0.472	0.472	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	HG03742	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA12878	0.464	0.45	0.0	0.073	0.68	0.68	2	1
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA18939	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA19017	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA19238	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA19239	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA19625	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA19648	1.184	1.15	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA20502	1.062	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	41122391	41122487	DEL	97	NA20845	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG00096	0.788	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG00268	0.916	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG00419	0.29	0.305	0.027	0.072	nan	nan	0	1
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG00759	0.677	0.712	0.0	0.0	0.75	0.712	1	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG01051	0.763	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG01112	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG01500	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG01565	0.373	0.393	0.023	0.109	nan	nan	0	1
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG01583	0.826	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG01595	0.343	0.361	0.033	0.054	nan	nan	0	1
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG01879	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG02568	0.694	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG02922	0.825	0.868	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG03006	0.675	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG03052	0.901	0.949	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG03642	0.457	0.481	0.009	0.075	nan	nan	0	1
chr14	43372918	43373327	DEL	410	HG03742	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA12878	0.91	0.958	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA18525	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA18939	0.87	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA19017	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA19238	0.961	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA19239	0.517	0.545	0.012	0.097	nan	nan	0	1
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA19625	0.694	0.73	0.0	0.0	0.647	0.693	1	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA19648	0.479	0.504	0.014	0.094	nan	nan	0	1
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA20502	0.785	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	43372918	43373327	DEL	410	NA20845	0.876	0.922	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG00096	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG00268	1.297	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG00419	0.953	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG00759	1.234	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG01112	1.036	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG01583	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG01595	0.706	0.66	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG02922	1.142	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG03006	0.967	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG03642	0.812	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	HG03742	0.923	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	NA12878	0.91	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	NA19017	1.145	1.07	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	NA19238	1.198	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	NA19239	1.166	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	NA19648	0.983	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	NA20502	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	48719695	48719753	DUP	59	NA20845	1.16	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	HG00096	0.697	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	HG00419	0.373	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	HG00759	0.637	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	HG01112	0.573	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	HG01583	0.316	0.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	HG03742	0.511	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	NA12878	0.515	0.652	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	NA18525	0.823	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	49958443	49958589	DUP	147	NA18939	0.653	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	50118870	50119027	DUP	158	HG00419	0.269	0.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	50118870	50119027	DUP	158	HG00759	0.139	0.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	50118870	50119027	DUP	158	NA18525	0.385	0.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	50118870	50119027	DUP	158	NA18939	0.163	0.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG00096	0.458	0.482	0.083	0.058	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG00268	0.778	0.819	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG00419	0.415	0.436	0.102	0.069	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG00759	0.557	0.587	0.059	0.048	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG01051	0.474	0.499	0.092	0.066	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG01112	0.906	0.954	0.0	0.0	0.8	0.842	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG01500	0.324	0.341	0.071	0.043	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG01565	0.456	0.48	0.076	0.073	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG01583	0.559	0.588	0.083	0.041	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG01595	0.505	0.531	0.1	0.069	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG01879	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG02568	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG02922	1.015	1.068	0.0	0.002	0.688	0.688	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG03006	0.438	0.461	0.06	0.028	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG03052	0.944	0.994	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG03642	0.584	0.614	0.07	0.038	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	HG03742	0.53	0.558	0.062	0.046	nan	nan	0	1
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA12878	0.893	0.94	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA18525	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA18939	0.0	0.0	0.182	0.131	nan	nan	0	0
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA19017	0.826	0.869	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA19238	0.843	0.887	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA19239	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA19625	0.797	0.839	0.0	0.0	0.895	0.959	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA19648	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA20502	0.923	0.972	0.0	0.0	0.522	0.522	1	2
chr14	51408908	51409542	DEL	635	NA20845	0.547	0.576	0.073	0.033	nan	nan	0	1
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG00096	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG00268	0.899	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG00419	0.0	0.0	0.394	0.263	nan	nan	0	0
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG00759	0.378	0.378	0.02	0.041	0.538	0.567	5	1
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG01051	0.804	0.804	0.0	0.0	0.765	0.765	3	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG01112	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG01500	0.45	0.45	0.03	0.043	nan	nan	0	1
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG01565	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG01583	0.899	0.899	0.0	0.0	0.75	0.812	1	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG01595	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG01879	0.529	0.529	0.079	0.061	nan	nan	0	1
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG02568	0.81	0.81	0.0	0.0	0.867	0.867	6	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG02922	0.719	0.719	0.0	0.0	0.928	0.928	2	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG03006	1.013	1.013	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG03052	0.965	0.965	0.0	0.0	0.737	0.737	7	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG03642	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	HG03742	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA12878	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA18525	0.455	0.455	0.029	0.067	nan	nan	0	1
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA18939	0.888	0.888	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA19017	1.013	1.013	0.0	0.004	0.741	0.741	4	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA19238	0.487	0.487	0.027	0.045	nan	nan	0	1
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA19239	0.537	0.537	0.029	0.036	0.18	0.18	2	1
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA19625	0.874	0.874	0.0	0.0	0.708	0.713	4	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA19648	0.579	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA20502	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52378334	52378897	DEL	564	NA20845	0.876	0.876	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG00096	1.21	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG00268	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG00419	0.663	0.663	0.006	0.199	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG00759	0.498	0.498	0.0	0.141	nan	nan	0	0
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG01051	1.072	1.072	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG01112	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG01500	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG01565	0.58	0.58	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG01583	0.486	0.486	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG01595	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG01879	0.584	0.584	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG02568	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG02922	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG03006	0.255	0.255	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG03052	0.794	0.794	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG03642	0.33	0.33	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	HG03742	0.501	0.501	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA12878	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA18525	0.578	0.578	0.0	0.178	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA18939	0.49	0.49	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA19017	0.657	0.657	0.0	0.209	nan	nan	0	0
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA19238	0.527	0.527	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA19239	0.472	0.472	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA19625	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA19648	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA20502	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	52404332	52404457	DEL	126	NA20845	1.16	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG00096	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG00268	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG00419	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG00759	1.075	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG01051	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG01112	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG01500	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG01565	0.746	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG01583	0.608	0.568	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG01595	1.11	1.038	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG01879	1.105	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG02568	0.501	0.469	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG02922	1.036	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG03006	0.985	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG03052	1.137	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG03642	1.32	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	HG03742	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA12878	0.996	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA18525	1.086	1.015	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA18939	0.907	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA19017	1.332	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA19238	0.869	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA19239	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA19625	1.234	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA19648	1.134	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA20502	1.108	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	57847202	57847319	DEL	118	NA20845	1.16	1.085	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG00096	0.807	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG00268	1.037	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG00419	1.119	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG00759	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG01051	0.639	0.71	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG01112	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG01500	0.899	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG01565	0.476	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG01583	1.288	1.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG01595	0.666	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG01879	0.785	0.872	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG02568	0.463	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG02922	0.275	0.305	0.0	0.02	0.833	0.833	1	1
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG03006	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG03052	0.88	0.977	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG03642	0.964	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	HG03742	0.57	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA12878	0.618	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA18525	1.086	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA18939	0.653	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA19017	0.788	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA19238	0.869	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA19239	0.851	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA19625	1.028	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA19648	0.68	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA20502	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	58425190	58425270	DEL	81	NA20845	0.591	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG00096	1.247	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG00268	1.089	1.057	0.008	0.0	0.909	0.949	1	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG00419	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG00759	1.174	1.14	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG01051	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG01112	1.276	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG01500	1.259	1.222	0.0	0.0	0.8	0.8	2	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG01565	1.367	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG01583	1.677	1.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG01595	0.646	0.627	0.026	0.085	nan	nan	0	1
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG01879	1.205	1.17	0.0	0.0	0.692	0.725	1	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG02568	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG02922	0.93	0.903	0.0	0.002	0.708	0.708	1	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG03006	1.259	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG03052	1.437	1.396	0.0	0.0	0.964	0.964	1	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG03642	1.244	1.207	0.0	0.0	0.664	0.664	2	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	HG03742	1.375	1.335	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA12878	0.962	0.934	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA18525	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA18939	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA19017	1.163	1.13	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA19238	1.119	1.087	0.0	0.004	0.9	0.9	1	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA19239	1.1	1.068	0.0	0.0	0.852	0.852	2	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA19625	1.311	1.273	0.0	0.0	0.82	0.81	2	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA19648	1.159	1.125	0.006	0.0	0.618	0.618	2	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA20502	1.154	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	59853221	59853559	DEL	339	NA20845	1.379	1.339	0.0	0.0	0.903	0.903	2	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG00096	0.293	0.309	0.047	0.031	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG00268	0.761	0.801	0.0	0.056	0.132	0.126	4	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG00419	0.0	0.0	0.226	0.178	nan	nan	0	0
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG00759	0.279	0.293	0.051	0.051	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG01051	0.742	0.781	0.0	0.011	0.833	0.833	2	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG01112	0.0	0.0	0.108	0.123	nan	nan	0	0
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG01500	0.468	0.492	0.0	0.034	0.222	0.222	1	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG01565	0.373	0.393	0.049	0.087	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG01583	0.462	0.486	0.084	0.137	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG01595	0.0	0.0	0.219	0.181	nan	nan	0	0
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG01879	0.84	0.884	0.014	0.064	0.835	0.838	2	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG02568	0.733	0.771	0.009	0.044	0.571	0.571	5	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG02922	0.846	0.89	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG03006	0.0	0.0	0.126	0.116	nan	nan	0	0
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG03052	0.751	0.79	0.01	0.06	0.588	0.588	1	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG03642	0.457	0.481	0.048	0.059	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	HG03742	0.196	0.207	0.085	0.065	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA12878	0.275	0.289	0.016	0.041	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA18525	0.0	0.0	0.135	0.193	nan	nan	0	0
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA18939	0.0	0.0	0.082	0.169	nan	nan	0	0
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA19017	0.732	0.77	0.0	0.05	0.668	0.668	4	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA19238	0.896	0.943	0.0	0.041	0.438	0.438	4	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA19239	0.838	0.882	0.005	0.029	0.901	0.901	2	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA19625	0.797	0.839	0.0	0.031	0.857	0.8	5	2
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA19648	0.353	0.371	0.102	0.072	nan	nan	0	1
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA20502	0.0	0.0	0.164	0.175	nan	nan	0	0
chr14	59883503	59884059	DEL	557	NA20845	0.307	0.323	0.021	0.033	nan	nan	0	1
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG00096	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG00268	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG00419	1.223	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG00759	0.478	0.478	0.0	0.021	0.875	0.921	1	1
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG01051	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG01112	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG01500	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG01565	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG01583	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG01595	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG01879	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG02568	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG02922	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG03006	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG03052	0.729	0.729	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG03642	1.231	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	HG03742	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA12878	0.928	0.928	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA18525	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA18939	0.453	0.453	0.007	0.021	0.654	0.684	1	1
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA19017	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA19238	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA19239	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA19625	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA19648	1.159	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA20502	0.716	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62037745	62037802	DEL	58	NA20845	0.81	0.81	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG00096	0.917	0.965	0.0	0.0	0.923	0.883	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG00268	0.813	0.855	0.0	0.0	0.731	0.7	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG00419	0.85	0.894	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG00759	0.697	0.733	0.0	0.0	0.941	0.991	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG01051	0.907	0.955	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG01112	0.425	0.448	0.03	0.1	nan	nan	0	1
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG01500	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG01565	0.559	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG01583	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG01595	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG01879	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG02568	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG02922	1.036	1.091	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG03006	0.949	0.999	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG03052	0.944	0.994	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG03642	0.964	1.015	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	HG03742	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA12878	1.117	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA18525	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA18939	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA19017	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA19238	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA19239	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA19625	1.105	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA19648	1.033	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA20502	1.108	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	62630098	62630505	DEL	408	NA20845	0.909	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG00096	1.21	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG00268	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG00759	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG01051	1.423	1.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG01112	0.943	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG01500	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG01565	1.284	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG01583	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG01595	1.09	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG03006	1.387	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG03052	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG03642	1.091	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	HG03742	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	NA12878	1.117	1.084	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	NA18525	1.471	1.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	NA19648	1.487	1.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	NA20502	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	63816886	63816946	DUP	61	NA20845	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG00096	0.88	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG00268	0.674	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG00419	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG00759	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG01051	0.763	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG01112	0.721	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG01500	0.953	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG01565	0.559	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG01583	0.851	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG01595	0.656	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG01879	0.886	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG02568	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG02922	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG03006	0.93	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG03052	0.622	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG03642	0.761	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	HG03742	0.609	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA12878	0.842	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA18525	0.893	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA18939	0.662	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA19017	0.469	0.521	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA19238	0.803	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA19239	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA19625	0.822	0.914	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA19648	0.63	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA20502	0.623	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	64930889	64931022	DEL	134	NA20845	0.942	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG00096	0.357	0.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG00268	0.441	0.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG00419	0.187	0.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG00759	0.299	0.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG01051	0.351	0.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG01112	0.074	0.074	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG01500	0.324	0.324	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG01565	0.249	0.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG01583	0.243	0.243	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG01595	0.081	0.081	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG01879	0.146	0.146	0.0	0.114	0.667	0.636	2	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG02922	0.254	0.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG03006	0.164	0.164	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG03052	0.064	0.064	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG03642	0.305	0.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	HG03742	0.255	0.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA12878	0.223	0.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA18525	0.14	0.14	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA18939	0.326	0.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA19017	0.244	0.244	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA19238	0.382	0.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA19625	0.0	0.0	0.01	0.207	nan	nan	0	0
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA19648	0.076	0.076	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA20502	0.092	0.092	0.0	0.159	nan	nan	0	1
chr14	68377004	68377156	DEL	153	NA20845	0.241	0.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG00096	0.0	0.0	0.248	0.14	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG00268	0.0	0.0	0.247	0.166	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG00419	0.0	0.0	0.127	0.084	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG00759	0.0	0.0	0.295	0.156	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG01051	0.33	0.33	0.028	0.028	nan	nan	0	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG01112	0.37	0.37	0.068	0.042	0.445	0.468	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG01500	0.288	0.288	0.068	0.05	0.875	0.875	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG01565	0.0	0.0	0.07	0.057	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG01583	0.0	0.0	0.189	0.107	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG01595	0.424	0.424	0.046	0.03	0.58	0.58	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG01879	0.329	0.329	0.069	0.034	0.314	0.329	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG02568	0.81	0.81	0.0	0.0	0.845	0.845	2	2
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG02922	0.296	0.296	0.067	0.021	0.607	0.607	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG03006	0.347	0.347	0.06	0.034	0.633	0.633	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG03052	0.451	0.451	0.041	0.015	nan	nan	0	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG03642	0.0	0.0	0.146	0.085	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	HG03742	0.0	0.0	0.189	0.109	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA12878	0.0	0.0	0.253	0.17	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA18525	0.298	0.298	0.071	0.045	0.545	0.545	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA18939	0.0	0.0	0.156	0.093	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA19017	0.432	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA19238	0.0	0.0	0.192	0.114	nan	nan	0	0
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA19239	0.661	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA19625	0.488	0.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA19648	0.252	0.252	0.037	0.023	0.5	0.5	12	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA20502	0.416	0.416	0.115	0.053	nan	nan	0	1
chr14	68603032	68603740	DEL	709	NA20845	0.0	0.0	0.208	0.153	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.117	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG00419	0.0	0.0	0.009	0.077	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.087	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.123	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA20502	0.0	0.0	0.006	0.072	nan	nan	0	0
chr14	68995379	68995453	DEL	75	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG00096	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG00268	0.501	0.487	0.0	0.019	0.857	0.894	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG00419	0.394	0.382	0.0	0.033	1.0	1.0	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.018	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.026	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG01500	0.719	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG01595	0.424	0.412	0.0	0.015	0.652	0.652	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG03052	0.665	0.646	0.0	0.013	0.429	0.429	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG03642	0.482	0.468	0.0	0.005	0.706	0.706	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	HG03742	0.0	0.0	0.009	0.017	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA12878	0.842	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA18525	0.403	0.391	0.0	0.016	0.933	0.933	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA18939	0.49	0.475	0.0	0.014	0.933	0.893	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA19017	0.788	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA19625	0.463	0.449	0.0	0.022	0.87	0.812	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA19648	0.454	0.44	0.0	0.03	0.636	0.636	1	1
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA20502	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	72490793	72490843	DEL	51	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG00096	0.807	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG00268	0.501	0.557	0.056	0.047	nan	nan	0	1
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG00419	0.58	0.645	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG00759	0.617	0.685	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG01051	0.722	0.802	0.0	0.0	0.789	0.789	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG01112	0.573	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG01500	0.764	0.849	0.0	0.004	0.56	0.56	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG01565	1.005	1.116	0.004	0.0	0.824	0.824	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG01583	0.729	0.81	0.005	0.0	0.889	0.963	1	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG01595	0.646	0.718	0.0	0.0	0.909	0.909	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG01879	0.365	0.406	0.051	0.03	nan	nan	0	1
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG02568	1.118	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG02922	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG03006	0.73	0.811	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG03052	1.008	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG03642	0.863	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	HG03742	0.668	0.742	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA12878	0.756	0.84	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA18525	0.753	0.837	0.0	0.0	0.848	0.848	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA18939	0.707	0.786	0.003	0.003	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA19017	0.919	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA19238	0.777	0.863	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA19239	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA19625	0.9	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA19648	0.957	1.064	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA20502	0.9	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	73332948	73333810	DEL	863	NA20845	0.679	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG00096	0.807	0.896	0.0	0.0	0.947	0.99	1	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG00268	0.761	0.845	0.005	0.0	0.667	0.696	1	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG00419	0.87	0.967	0.0	0.0	0.475	0.475	2	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG00759	0.637	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG01051	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG01112	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG01500	0.755	0.839	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG01565	0.849	0.944	0.005	0.0	0.531	0.531	2	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG01583	0.875	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG01595	0.908	1.009	0.005	0.0	0.667	0.667	1	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG01879	0.347	0.385	0.045	0.003	0.214	0.224	4	1
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG02568	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG02922	0.698	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG03006	0.693	0.77	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG03052	0.729	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG03642	0.888	0.987	0.0	0.0	0.845	0.845	2	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	HG03742	0.786	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA12878	1.151	1.279	0.003	0.0	0.844	0.844	1	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA18525	0.823	0.915	0.017	0.0	0.837	0.837	2	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA18939	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA19017	0.919	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA19238	0.856	0.951	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA19239	0.681	0.757	0.0	0.004	0.655	0.655	1	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA19625	0.231	0.257	0.058	0.0	0.422	0.452	4	1
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA19648	0.756	0.84	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA20502	0.762	0.846	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr14	74545334	74546055	DEL	722	NA20845	1.029	1.143	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG00096	0.77	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG00268	0.674	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG00419	0.85	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG00759	0.756	0.796	0.0	0.0	0.773	0.813	3	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG01051	0.701	0.738	0.0	0.0	0.849	0.849	2	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG01112	0.758	0.798	0.0	0.0	0.875	0.921	3	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG01500	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG01565	0.0	0.0	0.257	0.0	nan	nan	0	0
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG01583	0.583	0.614	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG01595	0.727	0.765	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG01879	0.73	0.769	0.0	0.0	0.667	0.636	1	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG02568	0.926	0.974	0.0	0.006	0.6	0.6	1	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG02922	0.74	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG03006	0.712	0.749	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG03052	0.751	0.79	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG03642	0.635	0.668	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	HG03742	0.668	0.703	0.006	0.0	0.55	0.55	2	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA12878	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA18525	0.438	0.461	0.113	0.0	0.354	0.354	6	1
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA18939	0.598	0.63	0.0	0.0	0.471	0.492	1	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA19017	0.657	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA19238	0.817	0.86	0.0	0.0	0.687	0.687	2	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA19239	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA19625	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA19648	0.655	0.69	0.0	0.0	0.895	0.895	4	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA20502	0.6	0.632	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr14	75874535	75875372	DEL	838	NA20845	0.832	0.876	0.0	0.0	0.708	0.708	4	2
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG00096	0.0	0.0	0.065	0.17	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG00268	0.0	0.0	0.017	0.257	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG00419	0.0	0.0	0.145	0.156	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG00759	0.299	0.314	0.073	0.119	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG01051	0.0	0.0	0.089	0.266	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG01112	0.869	0.915	0.0	0.0	0.625	0.626	2	2
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG01500	0.378	0.398	0.04	0.128	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG01565	0.0	0.0	0.132	0.252	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG01583	0.486	0.512	0.043	0.074	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG01595	0.464	0.489	0.056	0.091	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG01879	0.456	0.48	0.028	0.088	0.364	0.381	1	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG02568	0.0	0.0	0.032	0.127	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG02922	0.402	0.423	0.054	0.062	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG03006	0.0	0.0	0.112	0.273	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG03052	1.18	1.242	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG03642	0.431	0.454	0.024	0.082	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	HG03742	0.275	0.289	0.03	0.086	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA12878	0.996	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA18525	0.525	0.553	0.029	0.082	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA18939	0.345	0.363	0.019	0.088	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA19017	0.394	0.415	0.04	0.104	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA19238	0.474	0.499	0.006	0.07	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA19239	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA19625	0.514	0.541	0.053	0.111	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA19648	0.68	0.716	0.015	0.139	nan	nan	0	1
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA20502	0.0	0.0	0.058	0.285	nan	nan	0	0
chr14	76813775	76814213	DEL	439	NA20845	0.46	0.484	0.018	0.067	nan	nan	0	1
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG00096	0.568	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG00268	0.484	0.538	0.0	0.0	0.75	0.783	1	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG00419	0.415	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG00759	0.517	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG01051	0.309	0.344	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG01112	0.499	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG01500	0.629	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG01565	0.29	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG01583	0.17	0.189	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG01595	0.343	0.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG01879	0.128	0.142	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG02568	0.386	0.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG03006	0.31	0.345	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG03052	0.322	0.358	0.0	0.031	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG03642	0.558	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	HG03742	0.491	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA12878	0.55	0.611	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA18525	0.946	1.051	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA18939	0.49	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA19017	0.45	0.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA19238	0.283	0.315	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA19239	0.301	0.335	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	1
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA19648	0.428	0.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA20502	0.323	0.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	76898946	76899173	DEL	228	NA20845	0.131	0.146	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG00096	0.495	0.45	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG00268	0.432	0.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG00419	0.332	0.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG00759	0.259	0.235	0.0	0.034	0.8	0.76	1	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG01051	0.103	0.094	0.0	0.02	0.5	0.5	1	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG01112	0.398	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG01500	0.504	0.458	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG01565	0.373	0.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG01583	0.243	0.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG01595	0.323	0.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG01879	0.338	0.307	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG02568	0.444	0.403	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG02922	0.508	0.461	0.0	0.007	0.667	0.667	1	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG03006	0.401	0.365	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG03052	0.193	0.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG03642	0.203	0.185	0.0	0.05	1.0	1.0	1	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	HG03742	0.275	0.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA12878	0.361	0.328	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA18525	0.35	0.318	0.0	0.017	0.55	0.55	1	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA18939	0.199	0.181	0.0	0.028	0.765	0.731	1	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA19017	0.432	0.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA19238	0.507	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA19239	0.472	0.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA19625	0.18	0.164	0.0	0.023	1.0	0.933	1	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA19648	0.328	0.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA20502	0.162	0.147	0.0	0.02	0.818	0.818	1	1
chr14	77372701	77372762	DEL	62	NA20845	0.285	0.259	0.0	0.017	0.8	0.8	1	1
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG00096	1.247	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG00419	1.181	1.147	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG00759	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG01051	1.155	1.121	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG01112	1.128	1.095	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG01565	0.808	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG02568	1.08	1.048	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG02922	1.226	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG03052	1.159	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG03642	1.117	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	HG03742	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA18525	1.191	1.156	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA18939	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA19017	1.295	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA19238	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA19239	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA19625	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA20502	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	78124955	78125062	DUP	108	NA20845	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG00096	1.045	1.045	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG00268	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG00419	1.057	1.057	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG00759	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG01051	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG01112	1.109	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG01500	0.809	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG01565	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG01583	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG01595	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG01879	0.42	0.42	0.08	0.058	nan	nan	0	1
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG02568	0.0	0.0	0.27	0.261	nan	nan	0	0
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG02922	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG03006	0.821	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG03052	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG03642	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	HG03742	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA12878	0.653	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA18525	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA18939	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA19017	0.995	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA19238	0.0	0.0	0.153	0.191	nan	nan	0	0
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA19239	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA19625	1.105	1.105	0.0	0.0	0.789	0.737	1	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA19648	1.109	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA20502	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79554299	79554923	DEL	625	NA20845	0.942	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.142	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.141	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG02568	0.0	0.0	0.012	0.234	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	1
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr14	79653926	79654025	DEL	100	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG00096	0.953	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG00268	0.743	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG00419	1.15	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG00759	0.418	0.464	0.0	0.096	0.619	0.652	1	1
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG01051	0.866	0.962	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG01112	0.832	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG01500	0.971	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG01565	0.891	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG01583	0.899	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG01595	0.929	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG01879	0.329	0.365	0.008	0.096	0.75	0.786	1	1
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG02568	0.926	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG02922	0.909	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG03006	0.967	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG03052	0.772	0.858	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG03642	0.964	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	HG03742	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA12878	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA18525	0.823	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA18939	0.925	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA19017	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA19238	0.369	0.41	0.0	0.091	0.647	0.647	1	1
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA19239	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA19625	0.72	0.8	0.0	0.0	0.818	0.877	1	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA19648	1.058	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA20502	1.223	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79953950	79954051	DEL	102	NA20845	0.766	0.852	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG00096	0.642	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG00268	0.709	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG00419	0.808	0.851	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG00759	0.697	0.733	0.0	0.0	0.913	0.867	1	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG01051	0.639	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG01112	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG01500	0.755	0.795	0.007	0.0	0.593	0.593	2	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG01565	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG01583	0.802	0.844	0.009	0.0	0.606	0.559	2	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG01595	0.525	0.552	0.0	0.0	0.464	0.464	2	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG01879	0.584	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG02568	0.0	0.0	0.286	0.152	nan	nan	0	0
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG02922	0.761	0.801	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG03006	0.62	0.653	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG03052	0.944	0.994	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG03642	0.736	0.775	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	HG03742	0.786	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA12878	0.842	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA18525	0.736	0.774	0.0	0.0	0.587	0.587	2	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA18939	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA19017	0.619	0.652	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA19238	0.474	0.499	0.116	0.071	nan	nan	0	1
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA19239	0.288	0.303	0.13	0.078	nan	nan	0	1
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA19625	0.668	0.703	0.0	0.0	0.893	0.888	2	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA19648	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA20502	0.577	0.607	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	79981189	79981994	DEL	806	NA20845	0.723	0.761	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG00096	1.173	1.173	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG00268	1.141	1.141	0.0	0.0	0.794	0.828	2	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG00419	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG00759	1.095	1.095	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG01051	0.763	0.763	0.0	0.0	0.804	0.804	2	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG01112	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG01500	0.899	0.899	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG01565	0.87	0.87	0.0	0.0	0.819	0.819	2	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG01583	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG01595	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG01879	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG02568	0.617	0.617	0.0	0.0	0.542	0.542	2	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG02922	0.74	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG03006	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG03052	1.309	1.309	0.0	0.0	0.928	0.928	2	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG03642	1.396	1.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	HG03742	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA12878	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA18525	0.981	0.981	0.006	0.0	0.9	0.9	3	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA18939	1.088	1.088	0.0	0.0	0.727	0.696	3	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA19017	0.863	0.863	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA19238	0.435	0.435	0.022	0.167	0.98	0.98	2	1
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA19239	0.969	0.969	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA19625	1.079	1.079	0.0	0.0	0.944	0.988	1	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA19648	1.159	1.159	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA20502	0.993	0.993	0.0	0.0	0.786	0.786	2	2
chr14	80481241	80481693	DEL	453	NA20845	0.985	0.985	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG00096	1.155	1.121	0.0	0.0	0.735	0.769	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG00268	1.124	1.091	0.0	0.0	0.8	0.835	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG00419	1.223	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG00759	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG01051	1.196	1.161	0.0	0.004	0.87	0.87	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG01112	1.128	1.095	0.0	0.0	0.621	0.59	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG01500	1.133	1.1	0.0	0.0	0.395	0.395	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG01565	1.181	1.146	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG01583	0.608	0.59	0.0	0.011	0.716	0.725	2	1
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG01595	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG01879	1.351	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG02568	1.196	1.161	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG02922	1.057	1.027	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG03006	1.277	1.24	0.007	0.003	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG03052	1.223	1.187	0.008	0.0	1.0	1.0	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG03642	1.32	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	HG03742	0.805	0.782	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA12878	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA18525	0.753	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA18939	1.052	1.021	0.0	0.0	0.697	0.729	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA19017	1.107	1.075	0.007	0.004	0.929	0.929	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA19238	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA19239	0.917	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA19625	1.285	1.248	0.0	0.0	0.64	0.597	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA19648	0.932	0.905	0.0	0.0	0.391	0.391	1	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA20502	0.646	0.628	0.0	0.017	0.66	0.66	2	2
chr14	82958734	82958784	DEL	51	NA20845	1.073	1.042	0.0	0.004	0.684	0.684	1	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG00096	0.697	0.639	0.0	0.085	0.48	0.502	13	1
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG00268	1.089	0.999	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG00419	1.244	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG00759	1.373	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG01051	1.381	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG01112	1.294	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG01500	0.539	0.495	0.0	0.089	0.3	0.3	13	1
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG01565	1.222	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG01583	0.899	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG01595	1.07	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG01879	1.223	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG02568	1.041	0.955	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG02922	0.899	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG03006	1.204	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG03052	1.223	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG03642	1.117	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	HG03742	1.06	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA12878	0.739	0.678	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA18525	1.016	0.932	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA18939	1.015	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA19017	1.314	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA19238	0.527	0.483	0.0	0.082	0.256	0.256	13	1
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA19239	1.153	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA19625	1.131	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA19648	0.705	0.647	0.0	0.094	0.273	0.273	13	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA20502	0.843	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83386736	83386899	DEL	164	NA20845	1.051	0.964	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG00096	0.165	0.174	0.012	0.062	0.667	0.697	1	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG00268	0.553	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG00759	0.0	0.0	0.022	0.169	nan	nan	0	0
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG01051	0.433	0.456	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG01112	0.545	0.574	0.0	0.0	0.727	0.766	1	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG01500	0.288	0.303	0.0	0.051	0.421	0.421	1	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG01565	0.435	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG01583	0.219	0.23	0.012	0.04	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG01595	0.222	0.234	0.016	0.067	0.714	0.714	1	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG01879	0.712	0.75	0.0	0.0	0.333	0.318	1	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG02568	0.386	0.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG02922	0.296	0.312	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG03006	0.255	0.269	0.0	0.117	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG03052	0.451	0.474	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG03642	0.406	0.427	0.005	0.05	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	HG03742	0.0	0.0	0.005	0.146	nan	nan	0	0
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA12878	0.618	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA18525	0.0	0.0	0.017	0.136	nan	nan	0	0
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA18939	0.308	0.324	0.008	0.044	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA19017	0.281	0.296	0.015	0.058	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA19238	0.685	0.721	0.0	0.0	0.2	0.2	1	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA19239	0.288	0.303	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA19625	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA19648	0.731	0.769	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA20502	0.623	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	83852035	83852358	DEL	324	NA20845	0.263	0.277	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG00096	0.348	0.326	0.041	0.102	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG00268	0.415	0.388	0.046	0.106	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG00419	0.477	0.445	0.077	0.051	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG00759	1.493	1.395	0.0	0.0	0.743	0.706	1	2
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG01051	0.66	0.617	0.077	0.081	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG01112	0.555	0.518	0.063	0.112	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG01500	1.205	1.126	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG01565	0.331	0.31	0.09	0.088	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG01583	0.316	0.295	0.071	0.12	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG01595	1.191	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG01879	0.475	0.444	0.041	0.121	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG02568	0.81	0.757	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG02922	0.423	0.395	0.095	0.114	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG03006	0.0	0.0	0.201	0.305	nan	nan	0	0
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG03052	0.0	0.0	0.132	0.352	nan	nan	0	0
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG03642	0.558	0.522	0.107	0.148	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	HG03742	0.609	0.569	0.056	0.081	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA12878	0.378	0.353	0.027	0.077	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA18525	0.683	0.638	0.035	0.112	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA18939	0.453	0.424	0.051	0.118	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA19017	1.201	1.122	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA19238	0.0	0.0	0.05	0.212	nan	nan	0	0
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA19239	1.009	0.943	0.004	0.002	0.68	0.68	1	2
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA19625	0.9	0.841	0.0	0.0	0.688	0.642	2	2
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA19648	0.504	0.471	0.024	0.073	nan	nan	0	1
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA20502	0.0	0.0	0.138	0.307	nan	nan	0	0
chr14	85139129	85139627	DEL	499	NA20845	0.416	0.389	0.087	0.13	nan	nan	0	1
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG00096	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG00268	0.622	0.622	0.0	0.042	0.841	0.877	1	1
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG00419	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG00759	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG01051	1.278	1.278	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG01112	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG01500	1.295	1.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG01565	1.16	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG01583	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG01595	0.646	0.646	0.0	0.023	0.655	0.655	1	1
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG01879	1.187	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG02568	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG02922	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG03006	1.058	1.058	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG03052	1.416	1.416	0.0	0.003	0.966	0.966	1	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG03642	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	HG03742	1.453	1.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA12878	0.945	0.945	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA18525	0.473	0.473	0.0	0.021	0.765	0.765	1	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA18939	0.399	0.399	0.0	0.032	0.815	0.779	1	1
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA19017	1.182	1.182	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA19238	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA19239	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA19625	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA19648	1.209	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA20502	0.554	0.554	0.0	0.047	0.808	0.808	1	1
chr14	87931379	87931433	DEL	55	NA20845	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG00096	1.118	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG00268	0.311	0.286	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG00419	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG00759	1.174	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG01051	1.474	1.353	0.006	0.002	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG01112	0.518	0.475	0.0	0.071	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG01500	0.468	0.429	0.0	0.067	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG01565	1.409	1.292	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG01583	1.069	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG01595	1.393	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG01879	0.986	0.905	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG02568	1.292	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG02922	1.544	1.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG03006	1.186	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG03052	0.965	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG03642	1.269	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	HG03742	1.493	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA12878	1.099	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA18525	1.104	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA18939	1.287	1.181	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA19017	0.544	0.499	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA19238	1.212	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA19239	1.323	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA19625	0.36	0.33	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA19648	1.361	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA20502	1.108	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	88568086	88568237	DEL	152	NA20845	1.16	1.065	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG00096	0.972	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG00268	1.107	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG00419	1.016	0.986	0.0	0.0	0.788	0.788	2	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG00759	0.577	0.56	0.04	0.0	nan	nan	0	1
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG01051	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG01112	0.906	0.88	0.0	0.0	0.922	0.958	2	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG01500	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG01565	0.767	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG01583	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG01595	0.969	0.941	0.0	0.0	0.726	0.726	2	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG01879	1.022	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG02568	0.887	0.861	0.008	0.0	0.5	0.5	1	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG02922	0.909	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG03006	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG03052	1.116	1.083	0.0	0.0	0.505	0.505	2	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG03642	0.812	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	HG03742	1.08	1.049	0.0	0.0	0.698	0.698	2	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA12878	0.928	0.901	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA18525	0.981	0.952	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA18939	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA19017	1.013	0.984	0.0	0.0	0.799	0.799	2	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA19238	0.79	0.767	0.0	0.0	0.79	0.79	2	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA19239	0.799	0.776	0.0	0.0	0.514	0.514	1	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA19625	0.977	0.948	0.0	0.0	0.882	0.945	1	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA19648	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA20502	0.923	0.896	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr14	90876474	90877274	DEL	801	NA20845	1.16	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG00096	0.807	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG00268	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG00419	0.891	0.99	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG00759	0.856	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG01051	0.701	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG01112	0.684	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG01500	0.827	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG01565	0.829	0.921	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG01583	0.875	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG01595	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG01879	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG02568	1.003	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG02922	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG03006	0.383	0.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG03052	1.094	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG03642	0.584	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	HG03742	0.648	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA12878	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA18525	0.946	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA18939	0.725	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA19017	0.826	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA19238	0.764	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA19239	0.878	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA19625	0.951	1.057	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA19648	0.504	0.56	0.0	0.023	0.5	0.5	1	1
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA20502	1.131	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	94267447	94267503	DEL	57	NA20845	0.744	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG00096	0.678	0.678	0.0	0.0	0.778	0.744	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG00268	0.916	0.916	0.0	0.0	0.897	0.936	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG00419	0.933	0.933	0.0	0.0	0.355	0.355	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG00759	0.935	0.935	0.0	0.0	0.591	0.622	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG01051	0.907	0.907	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG01112	0.943	0.943	0.0	0.0	0.579	0.609	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG01500	0.755	0.755	0.0	0.0	0.552	0.552	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG01565	0.746	0.746	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG01583	0.899	0.899	0.0	0.0	0.605	0.655	2	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG01595	0.747	0.747	0.0	0.0	0.514	0.514	2	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG01879	0.895	0.895	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG02568	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG02922	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG03006	0.511	0.511	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG03052	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG03642	0.787	0.787	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	HG03742	0.746	0.746	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA12878	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA18525	0.928	0.928	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA18939	0.925	0.925	0.007	0.0	0.793	0.829	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA19017	0.807	0.807	0.0	0.0	0.848	0.848	2	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA19238	0.922	0.922	0.0	0.0	0.744	0.744	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA19239	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA19625	0.437	0.437	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA19648	0.781	0.781	0.0	0.0	0.558	0.558	2	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA20502	0.462	0.462	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr14	96581539	96581879	DEL	341	NA20845	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG00096	0.367	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG00268	0.363	0.403	0.0	0.002	0.444	0.464	3	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG00419	0.228	0.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG00759	0.179	0.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG01051	0.227	0.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG01112	0.37	0.411	0.0	0.0	0.958	0.91	2	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG01500	0.468	0.519	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG01565	0.166	0.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG01583	0.219	0.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG01595	0.363	0.404	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG01879	0.128	0.142	0.0	0.069	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG02568	0.193	0.214	0.0	0.073	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG02922	0.338	0.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG03006	0.383	0.426	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG03052	0.15	0.167	0.006	0.061	nan	nan	0	1
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG03642	0.127	0.141	0.019	0.065	nan	nan	0	1
chr14	98774516	98774846	DEL	331	HG03742	0.314	0.349	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA12878	0.515	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA18525	0.403	0.448	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA18939	0.236	0.262	0.0	0.0	0.25	0.239	1	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA19017	0.225	0.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA19238	0.237	0.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA19239	0.144	0.16	0.003	0.095	nan	nan	0	1
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA19625	0.257	0.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA19648	0.302	0.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA20502	0.208	0.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr14	98774516	98774846	DEL	331	NA20845	0.416	0.462	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG00096	0.527	0.667	0.0	0.0	0.645	0.645	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG00268	0.985	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG00419	0.657	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG00759	0.828	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG01051	0.389	0.492	0.0	0.025	0.733	0.733	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG01112	0.307	0.388	0.0	0.0	0.417	0.417	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG01500	0.841	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG01565	0.303	0.383	0.0	0.005	0.846	0.846	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG01583	0.944	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG01595	0.276	0.35	0.0	0.01	0.571	0.571	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG01879	0.794	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG02568	0.967	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG02922	0.851	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG03006	0.207	0.263	0.0	0.015	0.619	0.619	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG03052	0.729	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG03642	0.422	0.534	0.0	0.01	0.643	0.643	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.022	nan	nan	0	0
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA12878	0.553	0.7	0.0	0.008	0.676	0.676	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA18525	0.462	0.585	0.0	0.012	0.792	0.792	1	1
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA18939	1.101	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA19017	0.813	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA19238	1.037	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA19239	0.807	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA19625	1.103	1.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA19648	0.797	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA20502	1.013	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100097884	100097934	DEL	51	NA20845	0.841	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG00096	0.885	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG00268	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG00419	1.059	1.115	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG00759	0.911	0.959	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG01051	0.756	0.796	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG01112	0.862	0.908	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG01500	1.01	1.063	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG01565	1.017	1.07	0.0	0.004	0.944	0.944	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG01583	1.043	1.098	0.0	0.005	0.613	0.613	2	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG01595	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG01879	0.832	0.875	0.0	0.0	0.786	0.748	2	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG02568	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG02922	1.004	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG03006	0.999	1.052	0.0	0.0	0.893	0.893	2	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG03052	0.994	1.047	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG03642	1.16	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	HG03742	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA12878	0.795	0.837	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA18525	0.888	0.935	0.0	0.0	0.763	0.763	2	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA18939	0.989	1.041	0.0	0.0	0.92	0.878	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA19017	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA19238	0.928	0.976	0.0	0.0	0.829	0.829	1	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA19239	0.417	0.439	0.016	0.058	nan	nan	0	1
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA19625	1.024	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA19648	1.234	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA20502	1.178	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100264017	100264557	DEL	541	NA20845	0.955	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG00096	1.205	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG00268	1.164	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG00419	1.207	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG00759	1.201	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG01051	1.145	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG01112	1.36	1.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG01500	1.234	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG01565	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG01583	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG01595	1.147	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG01879	1.229	1.293	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG02568	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG02922	1.222	1.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG03006	1.112	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG03052	0.994	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG03642	1.134	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	HG03742	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA12878	0.916	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA18525	1.066	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA18939	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA19017	1.374	1.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA19238	0.477	0.503	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA19239	1.076	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA19625	1.235	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA19648	1.208	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA20502	1.06	1.116	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	100714433	100714685	DEL	253	NA20845	0.75	0.79	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG00096	1.318	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG00268	1.254	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG00419	1.419	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG00759	1.49	1.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG01051	1.728	1.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG01112	1.418	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG01500	1.141	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG01565	1.752	1.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG01583	1.329	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG01595	1.657	1.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG01879	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG02568	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG02922	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG03006	1.225	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG03052	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG03642	1.529	1.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	HG03742	1.383	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA12878	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA18525	1.172	1.138	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA18939	1.324	1.286	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA19017	0.503	0.488	0.0	0.044	0.946	0.993	1	1
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA19238	1.105	1.073	0.0	0.0	0.837	0.837	1	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA19239	0.955	0.927	0.0	0.0	0.811	0.811	1	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA19625	1.34	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA19648	1.285	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA20502	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	100992299	100992366	DEL	68	NA20845	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG00096	0.621	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG00268	0.77	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG00419	0.0	0.0	0.2	0.15	nan	nan	0	0
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG00759	0.352	0.404	0.087	0.043	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG01051	0.238	0.273	0.049	0.049	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG01112	0.345	0.396	0.075	0.056	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG01500	0.617	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG01565	0.281	0.323	0.066	0.052	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG01583	0.0	0.0	0.296	0.155	nan	nan	0	0
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG01595	0.659	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG01879	0.397	0.456	0.058	0.042	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG02568	0.735	0.845	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG02922	0.72	0.828	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG03006	0.396	0.455	0.086	0.052	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG03052	0.685	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG03642	0.817	0.939	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	HG03742	0.346	0.397	0.071	0.05	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA12878	0.484	0.556	0.092	0.069	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA18525	0.87	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA18939	0.392	0.45	0.127	0.072	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA19017	0.503	0.578	0.09	0.056	nan	nan	0	1
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA19238	0.791	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA19239	0.0	0.0	0.235	0.174	nan	nan	0	0
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA19625	0.867	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA19648	0.887	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA20502	0.695	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	101341489	101342374	DEL	886	NA20845	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG00096	0.734	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG00268	0.394	0.415	0.134	0.072	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG00419	0.402	0.424	0.053	0.053	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG00759	0.766	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG01051	0.41	0.432	0.055	0.039	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG01112	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG01500	0.449	0.472	0.102	0.073	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG01565	0.433	0.455	0.028	0.024	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG01583	0.0	0.0	0.24	0.16	nan	nan	0	0
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG01595	0.425	0.447	0.071	0.037	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG01879	0.302	0.318	0.033	0.022	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG02568	0.0	0.0	0.202	0.135	nan	nan	0	0
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG02922	0.0	0.0	0.157	0.102	nan	nan	0	0
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG03006	0.396	0.417	0.075	0.056	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG03052	0.287	0.302	0.093	0.065	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG03642	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931435	25932384	DEL	950	HG03742	0.366	0.385	0.034	0.021	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA12878	0.346	0.364	0.048	0.021	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA18525	0.0	0.0	0.243	0.193	nan	nan	0	0
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA18939	0.41	0.432	0.048	0.028	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA19017	0.0	0.0	0.215	0.147	nan	nan	0	0
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA19238	0.396	0.416	0.091	0.058	nan	nan	0	1
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA19239	0.0	0.0	0.411	0.221	nan	nan	0	0
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA19625	0.0	0.0	0.318	0.168	nan	nan	0	0
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA19648	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA20502	1.06	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931435	25932384	DEL	950	NA20845	0.727	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG00096	0.753	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG00268	0.501	0.528	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG00419	0.381	0.401	0.018	0.027	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG00759	0.869	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG01051	0.346	0.364	0.0	0.01	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG01112	0.824	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG01500	0.449	0.472	0.015	0.03	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG01565	0.454	0.478	0.005	0.02	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG01583	0.0	0.0	0.111	0.244	nan	nan	0	0
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG01595	0.552	0.582	0.009	0.014	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG01879	0.208	0.219	0.0	0.01	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG02568	0.0	0.0	0.065	0.226	nan	nan	0	0
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG02922	0.0	0.0	0.06	0.18	nan	nan	0	0
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG03006	0.528	0.556	0.013	0.031	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG03052	0.331	0.349	0.027	0.04	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG03642	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931804	25932022	DEL	219	HG03742	0.407	0.428	0.005	0.011	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA12878	0.328	0.346	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA18525	0.0	0.0	0.055	0.218	nan	nan	0	0
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA18939	0.354	0.373	0.004	0.009	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA19017	0.0	0.0	0.045	0.197	nan	nan	0	0
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA19238	0.409	0.431	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.2	nan	nan	0	0
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA19625	0.0	0.0	0.074	0.259	nan	nan	0	0
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA19648	0.977	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA20502	1.06	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	25931804	25932022	DEL	219	NA20845	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG00096	0.734	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG00268	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG00419	0.932	0.905	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG00759	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG01051	0.778	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG01112	0.92	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG01500	0.898	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG01565	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG01583	0.696	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG01595	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG01879	0.851	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG02568	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG02922	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG03006	0.811	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG03052	0.53	0.515	0.0	0.042	0.419	0.419	1	1
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG03642	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	HG03742	0.732	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA12878	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA18525	0.942	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA18939	0.858	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA19017	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA19238	0.696	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA19239	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA19625	1.156	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA19648	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA20502	1.06	1.029	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	26552625	26552705	DEL	81	NA20845	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG00096	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG00268	0.376	0.376	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG00419	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG00759	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG01051	0.54	0.54	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG01112	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG01500	0.467	0.467	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG01565	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG01583	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG01595	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG01879	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG02568	0.929	0.929	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG02922	1.157	1.157	0.007	0.005	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG03006	0.886	0.886	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG03052	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG03642	0.791	0.791	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	HG03742	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA12878	0.467	0.467	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA18525	0.746	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA18939	0.839	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA19017	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA19238	1.159	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA19239	1.049	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA19625	0.447	0.447	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA19648	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA20502	0.636	0.636	0.0	0.086	nan	nan	0	2
chr15	27483242	27483346	DEL	105	NA20845	1.137	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG00096	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG00268	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG00419	1.006	0.977	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG00759	1.263	1.226	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG01051	1.49	1.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG01112	1.15	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG01500	1.552	1.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG01565	0.909	0.882	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG01583	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG01595	0.977	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG01879	1.493	1.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG02568	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG02922	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG03006	1.32	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG03052	1.304	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG03642	1.279	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	HG03742	1.383	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA12878	1.34	1.301	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA18525	1.279	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA18939	1.427	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA19017	1.393	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA19238	0.532	0.516	0.0	0.057	0.833	0.833	1	1
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA19239	1.473	1.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA19625	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA19648	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA20502	0.966	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	28035220	28035285	DEL	66	NA20845	1.5	1.457	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG00096	1.261	1.224	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG00268	1.486	1.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG00419	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG00759	1.076	1.045	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG01051	0.518	0.503	0.034	0.024	nan	nan	0	1
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG01112	1.092	1.06	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG01500	1.159	1.126	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG01565	1.19	1.155	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG01583	0.994	0.965	0.007	0.0	0.75	0.75	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG01595	0.977	0.949	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG01879	1.134	1.101	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG02568	0.851	0.827	0.0	0.019	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG02922	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG03006	1.037	1.007	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG03052	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG03642	1.16	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	HG03742	1.139	1.106	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA12878	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA18525	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA18939	1.194	1.159	0.0	0.002	0.474	0.496	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA19017	1.296	1.259	0.0	0.0	0.846	0.888	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA19238	1.078	1.046	0.0	0.0	0.685	0.685	2	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA19239	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA19625	0.946	0.918	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA19648	1.285	1.248	0.0	0.0	0.735	0.735	2	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA20502	0.942	0.915	0.0	0.0	0.667	0.63	1	2
chr15	36044776	36045532	DEL	757	NA20845	0.887	0.861	0.0	0.0	0.693	0.693	2	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG00096	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG00268	1.415	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG00419	1.017	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG00759	1.428	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG01051	1.274	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG01112	1.226	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG01500	1.122	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG01565	1.039	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG01583	1.516	1.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG01595	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG01879	0.624	0.583	0.0	0.043	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG02568	0.851	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG03006	1.094	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG03052	1.591	1.487	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG03642	1.424	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	HG03742	1.241	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA12878	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA18525	0.942	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA18939	0.914	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA19017	1.142	1.067	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA19238	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA19239	1.372	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA19625	1.182	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA19648	1.439	1.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA20502	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37522655	37522765	DUP	111	NA20845	1.091	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG00096	0.659	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG00268	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG00419	0.72	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG00759	0.766	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG01051	0.821	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG01112	0.709	0.688	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG01500	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG01565	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG01583	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG01595	0.977	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG01879	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG02568	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG02922	0.873	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG03006	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG03052	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG03642	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	HG03742	0.976	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA12878	0.717	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA18525	0.835	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA18939	0.774	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA19017	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA19239	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA19625	1.077	1.046	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA19648	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA20502	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	37538017	37538106	DUP	90	NA20845	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG00096	1.242	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG00268	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG00419	1.101	1.101	0.0	0.0	0.685	0.685	2	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG00759	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG01051	1.015	1.015	0.0	0.004	0.533	0.533	2	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG01112	0.939	0.939	0.0	0.0	0.86	0.86	2	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG01500	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG01565	0.995	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG01583	1.193	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG01595	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG01879	0.454	0.454	0.04	0.022	nan	nan	0	1
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG02568	0.89	0.89	0.0	0.0	0.85	0.85	2	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG02922	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG03006	0.999	0.999	0.006	0.0	0.767	0.767	2	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG03052	1.282	1.282	0.0	0.0	0.726	0.726	4	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG03642	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	HG03742	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA12878	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA18525	1.066	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA18939	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA19017	1.142	1.142	0.0	0.0	0.586	0.605	3	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA19238	1.078	1.078	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA19239	1.13	1.13	0.0	0.0	0.657	0.657	2	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA19625	1.051	1.051	0.0	0.0	0.492	0.492	2	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA19648	1.131	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA20502	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	38267555	38268311	DEL	757	NA20845	1.046	1.046	0.0	0.0	0.419	0.419	2	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG00096	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG00268	0.895	0.869	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG00419	1.25	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG00759	0.994	0.965	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG01051	1.102	1.069	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG01112	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG01500	1.122	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG01565	1.103	1.071	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG01583	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG01595	0.999	0.97	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG01879	0.794	0.771	0.0	0.0	0.789	0.785	2	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG02568	0.967	0.939	0.0	0.0	0.506	0.506	2	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG02922	0.851	0.826	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG03006	1.131	1.098	0.006	0.0	0.77	0.77	2	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG03052	0.773	0.751	0.0	0.0	0.684	0.684	3	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG03642	0.817	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	HG03742	1.037	1.007	0.0	0.0	0.656	0.623	3	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA12878	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA18525	0.853	0.828	0.0	0.0	0.724	0.724	3	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA18939	0.541	0.525	0.083	0.049	nan	nan	0	1
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA19017	0.987	0.958	0.0	0.0	0.875	0.833	3	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA19238	1.078	1.046	0.004	0.0	0.65	0.65	1	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA19239	1.09	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA19625	0.867	0.842	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA19648	1.259	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA20502	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39525854	39526501	DEL	648	NA20845	0.909	0.883	0.0	0.0	0.929	0.929	3	2
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG00096	0.0	0.0	0.148	0.276	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG00268	0.0	0.0	0.097	0.234	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG00419	0.0	0.0	0.17	0.283	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG00759	0.517	0.502	0.034	0.063	0.409	0.409	1	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG01051	0.0	0.0	0.116	0.246	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG01112	0.556	0.539	0.075	0.122	nan	nan	0	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG01500	0.654	0.635	0.087	0.113	nan	nan	0	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG01565	0.757	0.735	0.04	0.059	0.217	0.217	2	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG01583	0.0	0.0	0.203	0.247	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG01595	0.0	0.0	0.149	0.259	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG01879	0.567	0.55	0.021	0.083	nan	nan	0	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG02568	0.0	0.0	0.061	0.23	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG02922	0.742	0.72	0.059	0.091	nan	nan	0	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG03006	0.0	0.0	0.169	0.278	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG03052	0.575	0.558	0.067	0.11	nan	nan	0	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG03642	0.0	0.0	0.108	0.32	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	HG03742	0.59	0.573	0.052	0.117	nan	nan	0	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA12878	0.0	0.0	0.019	0.274	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA18525	0.0	0.0	0.087	0.247	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA18939	0.0	0.0	0.071	0.272	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA19017	1.18	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA19238	0.587	0.569	0.006	0.103	nan	nan	0	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA19239	0.605	0.588	0.022	0.102	0.59	0.59	1	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA19625	0.578	0.561	0.062	0.096	0.353	0.353	1	1
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA19648	0.0	0.0	0.106	0.239	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA20502	0.0	0.0	0.16	0.284	nan	nan	0	0
chr15	39744385	39744852	DEL	468	NA20845	0.909	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG00096	0.452	0.422	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG00268	0.573	0.536	0.0	0.0	0.778	0.813	1	1
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG00419	1.038	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG00759	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG01051	0.972	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG01112	0.958	0.895	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG01500	0.86	0.804	0.0	0.004	0.4	0.4	1	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG01565	0.627	0.586	0.0	0.004	0.273	0.273	1	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG01583	1.242	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG01595	0.999	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG01879	1.021	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG02568	1.045	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG02922	1.244	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG03006	0.811	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG03052	0.972	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG03642	1.028	0.961	0.0	0.006	0.5	0.5	1	1
chr15	40896391	40896443	DEL	53	HG03742	0.997	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA12878	0.605	0.566	0.0	0.0	0.481	0.481	1	1
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA18525	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA18939	0.989	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA19017	0.909	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA19238	0.832	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA19239	1.036	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA19625	0.604	0.565	0.0	0.011	0.733	0.733	1	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA19648	0.617	0.576	0.0	0.005	0.889	0.889	1	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA20502	1.13	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	40896391	40896443	DEL	53	NA20845	1.068	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG00268	0.895	0.995	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG00419	0.868	0.965	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG00759	0.849	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG01051	0.756	0.84	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG01565	0.952	1.058	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG01583	0.969	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG01595	0.722	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG01879	0.699	0.777	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG02568	0.813	0.903	0.0	0.0	0.55	0.55	2	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG02922	0.851	0.946	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG03006	0.773	0.859	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG03052	0.597	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG03642	0.844	0.937	0.0	0.004	0.55	0.55	2	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	HG03742	0.468	0.52	0.017	0.058	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	NA18525	0.853	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	NA18939	0.672	0.746	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	NA19017	0.813	0.903	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	NA19238	0.941	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	NA19239	0.565	0.628	0.003	0.001	nan	nan	0	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	NA19625	0.762	0.846	0.0	0.0	0.534	0.534	2	2
chr15	41604020	41604430	DUP	411	NA19648	0.874	0.971	0.005	0.002	0.767	0.767	2	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG00096	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG00268	0.734	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG00419	0.635	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG00759	0.735	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG01051	0.583	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG01112	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG01500	0.692	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG01565	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG01583	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG01595	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG01879	0.548	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG02568	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG02922	0.153	0.153	0.0	0.056	0.375	0.375	1	1
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG03006	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG03052	0.442	0.442	0.0	0.035	0.542	0.542	1	1
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG03642	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	HG03742	0.63	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA12878	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA18525	0.675	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA18939	0.727	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA19017	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA19238	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA19239	0.673	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA19625	0.709	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA19648	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA20502	1.06	1.06	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46100398	46100481	DEL	84	NA20845	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG00096	1.148	1.115	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG00268	1.254	1.217	0.0	0.0	0.727	0.73	2	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG00419	0.996	0.967	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG00759	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG01051	1.102	1.069	0.0	0.0	0.823	0.823	2	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG01112	1.016	0.986	0.0	0.0	0.783	0.783	2	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG01500	1.103	1.071	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG01565	1.039	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG01583	0.944	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG01595	1.275	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG01879	1.191	1.156	0.0	0.0	0.707	0.673	4	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG02568	1.006	0.977	0.0	0.0	0.643	0.643	3	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG02922	0.589	0.572	0.058	0.033	nan	nan	0	1
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG03006	1.15	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG03052	1.171	1.137	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG03642	1.292	1.254	0.0	0.0	0.749	0.749	2	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	HG03742	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA12878	0.864	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA18525	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA18939	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA19017	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA19238	0.982	0.954	0.0	0.0	0.952	0.952	3	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA19239	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA19625	0.919	0.893	0.009	0.0	0.714	0.714	1	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA19648	0.951	0.923	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA20502	0.966	0.937	0.0	0.0	0.744	0.736	2	2
chr15	46730282	46731083	DEL	802	NA20845	1.0	0.971	0.0	0.0	0.595	0.595	2	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG00096	0.659	0.616	0.007	0.12	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG00268	1.254	1.172	0.0	0.003	1.0	0.957	1	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG00419	0.741	0.693	0.056	0.068	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG00759	0.538	0.503	0.042	0.079	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG01051	1.339	1.251	0.0	0.0	0.815	0.815	2	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG01112	0.594	0.555	0.035	0.07	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG01500	0.598	0.559	0.016	0.073	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG01565	0.909	0.849	0.0	0.0	0.644	0.644	2	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG01583	1.043	0.975	0.0	0.0	0.757	0.757	2	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG01595	0.659	0.616	0.031	0.086	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG01879	0.0	0.0	0.053	0.258	nan	nan	0	0
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG02568	0.58	0.543	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG02922	0.633	0.592	0.058	0.11	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG03006	1.395	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG03052	0.663	0.62	0.058	0.106	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG03642	1.107	1.035	0.0	0.0	0.944	0.944	3	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	HG03742	0.773	0.722	0.043	0.112	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA12878	0.968	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA18525	0.497	0.465	0.02	0.071	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA18939	0.672	0.628	0.03	0.099	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA19017	0.503	0.47	0.066	0.091	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA19238	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA19239	0.565	0.528	0.01	0.076	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA19625	0.473	0.442	0.055	0.124	nan	nan	0	1
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA19648	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA20502	0.942	0.88	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr15	46860705	46861165	DEL	461	NA20845	0.591	0.552	0.051	0.079	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	0
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG00268	0.77	0.811	0.006	0.004	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG00419	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG00759	0.476	0.501	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG01112	0.345	0.363	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG01500	0.505	0.531	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG01565	0.714	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	0
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG01595	0.34	0.358	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG01879	0.926	0.975	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG02568	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG02922	0.436	0.459	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG03006	0.339	0.357	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG03052	0.398	0.419	0.0	0.074	0.769	0.769	2	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr15	47720633	47720807	DEL	175	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA12878	1.072	1.128	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA18525	0.0	0.0	0.016	0.134	nan	nan	0	0
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA18939	0.392	0.412	0.0	0.127	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA19238	1.064	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA19625	0.368	0.387	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA19648	0.437	0.46	0.021	0.03	nan	nan	0	2
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.167	nan	nan	0	0
chr15	47720633	47720807	DEL	175	NA20845	0.25	0.263	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG00096	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG00268	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG00419	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG00759	1.149	1.115	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG01051	1.577	1.531	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG01112	1.36	1.321	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG01500	1.215	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG01565	1.428	1.386	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG01583	1.317	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG01595	1.339	1.3	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG01879	1.153	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG02568	0.619	0.601	0.0	0.015	0.333	0.333	1	1
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG03006	1.075	1.043	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG03052	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG03642	1.318	1.28	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	HG03742	1.363	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA12878	1.003	0.974	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA18525	1.297	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA18939	1.352	1.313	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA19017	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA19238	1.18	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA19239	0.552	0.535	0.0	0.031	0.923	0.923	1	1
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA19625	1.051	1.02	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA19648	1.208	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA20502	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48445190	48445241	DEL	52	NA20845	1.387	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG00096	1.148	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG00268	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG00419	0.784	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG00759	1.159	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG01051	1.317	1.387	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG01112	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG01500	1.197	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG01565	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG01583	1.217	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG01595	0.807	0.85	0.007	0.0	0.583	0.583	1	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG01879	1.134	1.194	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG02568	0.31	0.326	0.0	0.126	nan	nan	0	1
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG02922	1.113	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG03006	1.301	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG03052	1.072	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG03642	1.055	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	HG03742	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA12878	1.132	1.192	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA18525	0.977	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA18939	0.839	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA19017	1.374	1.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA19238	1.009	1.063	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA19239	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA19625	0.919	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA19648	0.745	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA20502	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	48896293	48896408	DEL	116	NA20845	1.103	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG00096	1.129	1.189	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG00268	1.218	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG00419	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG00759	1.097	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG01051	0.842	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG01112	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG01500	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG01565	1.06	1.116	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG01583	1.043	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG01595	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG01879	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG02568	1.122	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG02922	1.069	1.126	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG03006	1.056	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG03052	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG03642	1.134	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	HG03742	0.0	0.0	0.072	0.104	nan	nan	0	0
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA12878	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA18525	0.64	0.673	0.02	0.043	nan	nan	0	1
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA18939	0.541	0.569	0.034	0.049	0.138	0.144	5	1
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA19017	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA19238	0.928	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA19239	1.09	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA19625	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA19648	1.157	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA20502	1.06	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50747025	50747691	DEL	667	NA20845	0.864	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG00096	1.28	1.347	0.0	0.003	0.512	0.512	1	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG00268	1.074	1.131	0.0	0.004	0.967	0.99	1	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG00419	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG00759	1.138	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG01051	0.994	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG01112	1.092	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG01500	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG01565	0.541	0.569	0.046	0.136	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG01583	1.093	1.151	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG01595	1.211	1.275	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG01879	1.153	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG02568	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG02922	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG03006	1.094	1.151	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG03052	0.994	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG03642	1.16	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	HG03742	1.119	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA12878	1.072	1.128	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA18525	0.995	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA18939	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA19017	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA19238	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA19239	1.063	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA19625	0.709	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA19648	0.437	0.46	0.024	0.121	nan	nan	0	1
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA20502	0.4	0.421	0.054	0.096	nan	nan	0	2
chr15	50921353	50921795	DEL	443	NA20845	1.023	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG00096	0.847	0.974	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG00268	0.806	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG00419	0.868	0.998	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG00759	0.766	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG01051	0.821	0.943	0.0	0.002	0.929	0.929	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG01112	0.939	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG01500	1.047	1.204	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG01565	0.995	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG01583	0.87	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG01595	0.829	0.953	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG01879	0.775	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG02568	0.077	0.089	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG02922	0.982	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG03006	0.905	1.04	0.0	0.005	0.783	0.783	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG03052	0.95	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG03642	0.844	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	HG03742	0.875	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA12878	0.553	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA18525	1.048	1.205	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA18939	0.97	1.115	0.0	0.0	0.607	0.58	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA19017	0.909	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA19238	0.928	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA19239	0.995	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA19625	0.88	1.011	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA19648	0.745	0.857	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA20502	1.036	1.191	0.0	0.0	0.52	0.551	1	2
chr15	56766064	56766219	DEL	156	NA20845	0.977	1.124	0.0	0.009	0.867	0.867	1	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG00096	0.715	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG00268	0.627	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG00419	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG00759	0.931	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG01051	0.713	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG01112	0.441	0.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG01500	0.467	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG01565	0.411	0.433	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG01583	0.373	0.392	0.0	0.018	0.9	0.9	1	1
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG01595	0.51	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG01879	0.51	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG02568	1.122	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG02922	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG03006	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG03052	0.464	0.489	0.0	0.026	0.526	0.526	1	1
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG03642	0.29	0.305	0.0	0.023	0.467	0.467	1	1
chr15	56785305	56785364	DEL	60	HG03742	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA12878	0.726	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA18525	0.799	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA18939	0.56	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA19017	0.677	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA19238	0.437	0.459	0.0	0.04	0.719	0.719	1	1
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA19239	0.619	0.651	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA19625	0.499	0.525	0.0	0.021	0.333	0.333	1	1
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA19648	0.72	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA20502	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	56785305	56785364	DEL	60	NA20845	0.432	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG00096	0.772	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG00268	0.752	0.792	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG00419	0.763	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG00759	0.662	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG01051	0.389	0.409	0.025	0.019	0.722	0.722	1	1
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG01112	0.613	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG01500	0.785	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG01565	0.736	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG01583	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG01595	0.722	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG01879	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG02568	0.929	0.978	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG02922	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG03006	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG03052	0.729	0.768	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG03642	1.055	1.11	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	HG03742	0.59	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA12878	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA18525	0.782	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA18939	0.672	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA19017	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA19238	0.955	1.005	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA19239	0.807	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA19625	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA19648	0.617	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA20502	0.447	0.471	0.033	0.008	0.333	0.353	5	1
chr15	57587086	57587889	DEL	804	NA20845	0.602	0.634	0.037	0.012	0.765	0.765	1	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG00096	0.452	0.502	0.008	0.14	nan	nan	0	0
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG00268	0.555	0.617	0.0	0.187	nan	nan	0	0
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG00419	0.275	0.306	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG00759	0.683	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG01051	0.248	0.276	0.0	0.075	0.522	0.522	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG01112	0.326	0.362	0.0	0.116	0.846	0.846	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG01500	0.823	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG01565	0.238	0.264	0.0	0.091	0.864	0.864	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG01583	0.472	0.524	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG01595	0.361	0.401	0.0	0.104	0.6	0.6	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG01879	0.34	0.378	0.0	0.115	0.917	0.873	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG02568	0.232	0.258	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG02922	0.371	0.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG03006	0.537	0.597	0.0	0.227	nan	nan	0	0
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG03052	0.243	0.27	0.0	0.073	0.882	0.882	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG03642	0.185	0.205	0.0	0.054	0.5	0.5	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	HG03742	0.305	0.339	0.0	0.069	0.731	0.769	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA12878	0.398	0.442	0.0	0.159	nan	nan	0	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA18525	0.444	0.493	0.0	0.088	0.909	0.909	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA18939	0.242	0.269	0.0	0.103	0.773	0.81	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA19017	0.697	0.774	0.0	0.192	nan	nan	0	0
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA19238	0.382	0.424	0.0	0.058	0.9	0.9	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA19239	0.861	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA19625	0.223	0.248	0.009	0.084	0.667	0.667	2	1
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA19648	0.463	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA20502	0.259	0.288	0.0	0.08	0.933	0.881	2	2
chr15	58282108	58282214	DEL	107	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	0
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG00096	0.941	0.991	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG00268	1.2	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG00419	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG00759	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG01051	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG01112	1.15	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG01500	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG01565	1.212	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG01583	1.143	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG01595	1.02	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG01879	1.304	1.373	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG02568	0.542	0.57	0.0	0.03	0.467	0.467	1	1
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG02922	1.135	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG03006	0.792	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG03052	1.105	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG03642	1.186	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	HG03742	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA12878	1.037	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA18525	0.87	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA18939	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA19017	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA19238	1.2	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA19239	1.157	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA19625	1.418	1.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA19648	1.079	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA20502	0.942	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	61717238	61717318	DEL	81	NA20845	0.568	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	HG00096	0.696	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	HG01565	0.952	0.89	0.018	0.004	0.778	0.778	2	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	HG01595	0.786	0.735	0.0	0.005	0.786	0.786	1	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	HG01879	0.624	0.583	0.0	0.0	0.444	0.467	1	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	HG02568	0.29	0.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	HG03642	0.448	0.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	NA12878	1.02	0.953	0.0	0.0	0.736	0.736	2	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	NA18525	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	NA18939	0.69	0.645	0.0	0.0	0.844	0.837	2	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	NA19017	0.774	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	NA19238	0.805	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	63441742	63441819	DUP	78	NA19625	0.63	0.589	0.015	0.0	0.636	0.636	1	2
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG00096	0.019	0.018	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG00268	0.018	0.017	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG00419	0.021	0.02	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG01112	0.057	0.054	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG01500	0.355	0.332	0.0	0.018	0.778	0.778	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG01583	0.025	0.023	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG01879	1.21	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG02568	0.503	0.47	0.0	0.031	0.6	0.6	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG02922	0.546	0.51	0.0	0.017	0.722	0.722	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG03006	0.632	0.59	0.0	0.015	0.714	0.714	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG03052	0.442	0.413	0.0	0.01	0.667	0.667	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG03642	0.422	0.394	0.0	0.007	0.25	0.25	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA12878	0.622	0.582	0.0	0.015	0.775	0.775	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA18525	0.036	0.033	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA18939	0.56	0.523	0.0	0.017	0.82	0.815	2	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA19017	0.58	0.543	0.0	0.014	0.636	0.668	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA19238	0.055	0.051	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA19239	0.673	0.629	0.0	0.027	0.55	0.55	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA19625	0.565	0.528	0.0	0.022	0.95	0.95	1	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA19648	0.026	0.024	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA20502	0.047	0.044	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr15	64664107	64664226	DEL	120	NA20845	0.023	0.021	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG00096	0.678	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG00268	1.003	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG00419	0.805	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG00759	0.662	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG01051	0.67	0.705	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG01112	0.69	0.726	0.0	0.004	0.636	0.636	1	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG01500	0.393	0.413	0.014	0.04	nan	nan	0	1
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG01565	0.563	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG01583	0.745	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG01595	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG01879	0.794	0.836	0.0	0.0	0.8	0.791	2	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG02568	1.122	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG02922	0.546	0.574	0.0	0.0	0.25	0.25	2	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG03006	0.867	0.913	0.0	0.0	0.71	0.71	4	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG03052	0.597	0.628	0.0	0.0	0.514	0.514	4	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG03642	0.58	0.611	0.0	0.0	0.417	0.417	2	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	HG03742	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA12878	0.467	0.491	0.004	0.05	0.471	0.471	1	1
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA18525	0.942	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA18939	0.541	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA19017	0.735	0.774	0.0	0.0	0.711	0.747	2	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA19238	0.873	0.919	0.0	0.0	0.967	0.967	3	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA19239	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA19625	0.552	0.581	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA19648	0.848	0.893	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA20502	0.919	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	64843787	64844213	DEL	427	NA20845	0.546	0.574	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG00096	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG00268	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG00419	0.614	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG00759	0.704	0.741	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG01051	0.346	0.364	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG01112	0.23	0.242	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG01500	0.393	0.413	0.009	0.124	0.742	0.742	2	1
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG01565	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG01583	0.944	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG01595	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG01879	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG02568	0.851	0.896	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG02922	0.808	0.85	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG03006	1.112	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG03052	0.552	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG03642	0.659	0.694	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr15	66706536	66706683	DEL	148	HG03742	0.824	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA12878	0.605	0.637	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA18525	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA18939	1.231	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA19017	1.142	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA19238	0.928	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA19239	0.525	0.552	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA19625	0.473	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA19648	0.822	0.866	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA20502	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66706536	66706683	DEL	148	NA20845	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG00096	0.508	0.493	0.098	0.056	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG00268	0.609	0.591	0.1	0.05	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG00419	1.059	1.028	0.0	0.0	0.581	0.581	3	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG00759	0.952	0.924	0.0	0.005	0.947	0.947	3	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG01051	0.518	0.503	0.079	0.032	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG01112	1.073	1.042	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG01500	0.0	0.0	0.226	0.124	nan	nan	0	0
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG01565	0.563	0.546	0.034	0.024	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG01583	0.944	0.917	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG01595	0.51	0.495	0.045	0.021	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG01879	1.247	1.211	0.0	0.0	0.694	0.661	2	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG02568	1.122	1.09	0.0	0.0	0.564	0.564	2	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG02922	0.567	0.551	0.053	0.026	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG03006	0.0	0.0	0.229	0.133	nan	nan	0	0
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG03052	1.282	1.244	0.0	0.0	0.707	0.707	2	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG03642	0.975	0.947	0.0	0.0	0.706	0.706	3	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	HG03742	0.732	0.711	0.09	0.03	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA12878	1.037	1.007	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA18525	0.551	0.535	0.049	0.021	nan	nan	0	1
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA18939	1.101	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA19017	1.296	1.259	0.0	0.0	0.755	0.719	2	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA19238	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA19239	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA19625	1.156	1.122	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA19648	1.208	1.173	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA20502	0.0	0.0	0.219	0.126	nan	nan	0	0
chr15	66877660	66878428	DEL	769	NA20845	1.046	1.015	0.0	0.0	0.84	0.84	4	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG00096	0.809	0.93	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG00268	1.092	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG00419	1.08	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG00759	1.056	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG01051	0.929	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG01112	0.766	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG01500	0.916	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG01565	0.779	0.895	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG01583	0.82	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG01595	0.637	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG01879	0.832	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG02568	0.851	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG02922	0.72	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG03006	0.98	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG03052	0.928	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG03642	1.081	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	HG03742	0.936	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA12878	0.968	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA18525	0.942	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA18939	0.895	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA19017	0.484	0.556	0.0	0.008	0.679	0.712	1	1
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA19238	0.9	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA19239	0.969	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA19625	0.919	1.057	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA19648	1.054	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA20502	1.13	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	67924247	67924301	DEL	55	NA20845	0.614	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG00096	0.753	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG00268	1.021	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG00419	0.784	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG00759	0.952	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG01051	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG01112	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG01500	0.654	0.727	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG01565	0.822	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG01583	0.87	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG01595	0.701	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG01879	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG02568	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG02922	0.72	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG03006	0.943	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG03052	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG03642	0.501	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr15	68519530	68519614	DEL	85	HG03742	0.752	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA12878	0.882	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA18525	1.084	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA18939	0.933	1.036	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA19017	0.929	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA19238	0.887	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA19239	0.646	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA19625	0.657	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA19648	0.72	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA20502	0.871	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	68519530	68519614	DEL	85	NA20845	1.023	1.137	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG00096	0.828	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG00268	0.77	0.885	0.0	0.0	0.82	0.784	2	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG00419	0.932	1.071	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG00759	0.435	0.5	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG01051	0.799	0.919	0.0	0.0	0.677	0.677	2	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG01112	0.709	0.815	0.0	0.0	0.8	0.8	2	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG01500	0.692	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG01565	0.498	0.572	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG01583	0.87	1.0	0.0	0.0	0.587	0.587	2	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG01595	0.744	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG01879	0.699	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG02568	0.697	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG02922	0.655	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG03006	0.886	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG03052	0.707	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG03642	1.081	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	HG03742	0.427	0.491	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA12878	0.813	0.934	0.0	0.0	0.917	0.917	2	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA18525	0.755	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA18939	0.765	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA19017	0.6	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA19238	0.859	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA19239	0.794	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA19625	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA19648	1.002	1.152	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA20502	1.013	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	70298315	70298428	DEL	114	NA20845	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG00096	1.318	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG00268	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG00419	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG00759	1.387	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG01051	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG01112	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG01500	1.085	1.053	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG01565	1.298	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG01583	1.416	1.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG01595	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG01879	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG02568	1.509	1.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG02922	1.397	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG03006	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG03052	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG03642	1.503	1.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	HG03742	1.241	1.204	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA12878	1.037	1.007	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA18525	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA18939	1.399	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA19017	1.413	1.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA19238	1.119	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA19239	0.565	0.549	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA19625	1.287	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA19648	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA20502	1.46	1.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	72137595	72137703	DEL	109	NA20845	0.955	0.927	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG00096	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG00268	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG00419	1.207	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG00759	0.621	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG01051	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG01112	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG01500	0.767	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG01565	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG01583	1.143	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG01595	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG01879	1.002	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG02568	0.426	0.448	0.0	0.029	0.385	0.385	1	1
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG02922	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG03006	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG03052	0.994	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG03642	1.028	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	HG03742	0.569	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA12878	0.985	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA18525	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA18939	0.709	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA19017	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA19238	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA19239	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA19625	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA19648	0.822	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA20502	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	74125325	74125406	DEL	82	NA20845	0.955	1.005	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG00096	0.489	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG00268	0.627	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG00419	0.487	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG00759	0.352	0.445	0.0	0.018	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG01051	0.475	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG01112	0.441	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG01500	0.393	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG01565	0.476	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG01583	0.571	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG01595	0.212	0.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG01879	0.454	0.574	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG02568	0.697	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG02922	0.458	0.58	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG03006	0.49	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG03052	0.464	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG03642	0.527	0.667	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	HG03742	0.407	0.515	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA12878	0.657	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA18525	0.515	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA18939	0.429	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA19017	0.677	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA19238	0.491	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA19239	0.309	0.392	0.0	0.049	0.905	0.905	1	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA19625	0.447	0.565	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA19648	0.411	0.521	0.0	0.061	0.667	0.667	1	1
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA20502	0.589	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	75091295	75091373	DEL	79	NA20845	0.568	0.719	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG00096	0.395	0.439	0.0	0.039	0.308	0.308	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG00268	0.573	0.637	0.0	0.049	0.486	0.509	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG00419	0.635	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG00759	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG01112	0.364	0.405	0.0	0.072	0.3	0.3	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG01500	0.598	0.665	0.0	0.058	0.405	0.405	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG01565	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG01583	0.795	0.883	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG01595	0.722	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG01879	0.851	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG02568	0.271	0.301	0.0	0.066	0.857	0.857	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG02922	0.917	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG03006	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG03052	0.552	0.614	0.0	0.051	0.367	0.367	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG03642	0.448	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	HG03742	0.508	0.565	0.0	0.04	0.462	0.486	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA18525	0.693	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA18939	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA19017	0.716	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA19238	0.818	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA19239	0.995	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA19625	0.972	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA19648	0.514	0.571	0.0	0.072	0.571	0.571	1	1
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA20502	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	79084263	79084355	DEL	93	NA20845	0.432	0.48	0.0	0.071	0.9	0.9	1	1
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG00096	0.659	0.64	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG00268	0.34	0.33	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG00419	0.297	0.288	0.011	0.123	nan	nan	0	1
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG00759	0.373	0.362	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG01051	0.346	0.336	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG01112	0.728	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG01500	0.393	0.381	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG01565	0.606	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG01583	0.82	0.796	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG01595	0.489	0.475	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG01879	0.945	0.917	0.0	0.0	0.471	0.448	1	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG02568	0.426	0.413	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG02922	0.829	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG03006	0.943	0.915	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG03642	0.844	0.819	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	HG03742	0.671	0.652	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA12878	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA18525	0.977	0.949	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA18939	0.839	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA19017	1.084	1.052	0.0	0.0	0.923	0.969	1	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA19238	0.846	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA19239	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA19625	0.578	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA19648	0.848	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA20502	0.589	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	84280619	84280828	DEL	210	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG00096	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG00268	1.074	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG00419	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG00759	1.304	1.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG01051	1.274	1.341	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG01112	0.996	1.049	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG01500	1.047	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG01565	0.714	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG01583	0.969	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG01595	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG01879	1.021	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG02568	1.2	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG02922	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG03006	0.528	0.556	0.0	0.045	0.727	0.727	1	1
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG03052	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG03642	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	HG03742	1.22	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA12878	1.02	1.074	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA18525	1.03	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA18939	1.194	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA19017	1.161	1.222	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA19238	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA19239	0.955	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA19625	1.129	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA19648	1.234	1.299	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA20502	1.178	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	85972517	85972603	DEL	87	NA20845	0.977	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG00096	0.734	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG00268	1.092	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG00419	1.525	1.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG00759	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG01051	0.907	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG01112	1.36	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG01500	1.328	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG01565	0.909	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG01583	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG01595	0.999	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG01879	0.832	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG02568	0.813	0.76	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG02922	1.2	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG03006	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG03052	1.127	1.053	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG03642	1.424	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	HG03742	1.017	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA12878	0.934	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA18525	1.137	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA18939	0.989	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA19017	0.639	0.597	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA19238	1.119	1.045	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA19239	0.794	0.742	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA19625	1.129	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA19648	1.079	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA20502	1.036	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87306623	87306844	DEL	222	NA20845	1.023	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG00096	1.035	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG00268	0.878	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG00419	0.72	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG00759	0.828	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG01051	0.713	0.666	0.0	0.023	0.324	0.324	1	1
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG01112	0.537	0.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG01500	1.178	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG01565	0.822	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG01583	1.193	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG01595	0.574	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG01879	0.51	0.477	0.0	0.048	0.867	0.91	1	1
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG02568	0.735	0.687	0.0	0.044	0.3	0.3	1	1
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG02922	0.524	0.49	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG03006	0.867	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG03052	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG03642	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	HG03742	1.119	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA12878	0.83	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA18525	0.862	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA18939	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA19017	1.006	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA19238	1.064	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA19239	0.895	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA19625	1.287	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA19648	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA20502	0.942	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	87890976	87891049	DEL	74	NA20845	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG00096	0.546	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG00268	0.663	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG00419	0.593	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG00759	0.559	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG01051	0.475	0.5	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG01112	0.517	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG01500	0.711	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG01565	0.714	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG01583	0.447	0.471	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG01595	0.574	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG01879	0.227	0.239	0.113	0.08	nan	nan	0	1
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG02568	0.774	0.815	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG02922	0.524	0.551	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG03006	0.698	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG03052	0.442	0.465	0.0	0.0	0.675	0.675	2	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG03642	0.554	0.583	0.0	0.0	0.563	0.563	2	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	HG03742	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA12878	0.588	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA18525	0.782	0.823	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA18939	0.522	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA19017	0.658	0.693	0.0	0.0	0.684	0.718	3	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA19238	0.709	0.747	0.0	0.0	0.784	0.784	2	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA19239	0.471	0.496	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA19625	0.341	0.359	0.0	0.0	0.7	0.7	2	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA19648	0.386	0.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA20502	0.447	0.471	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92354988	92355974	DEL	987	NA20845	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG00096	1.43	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG00268	1.271	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG00419	0.974	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG00759	1.252	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG01051	0.518	0.503	0.0	0.026	0.885	0.885	1	1
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG01112	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG01500	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG01565	1.179	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG01583	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG01595	1.296	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG01879	1.058	1.028	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG02568	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG02922	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG03006	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG03052	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG03642	1.186	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	HG03742	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA12878	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA18525	0.746	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA18939	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA19017	1.18	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA19238	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA19239	0.915	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA19625	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA19648	1.581	1.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA20502	1.178	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	92433073	92433130	DEL	58	NA20845	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG00096	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG00268	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG00419	0.868	0.868	0.0	0.0	0.614	0.614	2	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG00759	0.931	0.931	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG01051	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG01112	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG01500	1.047	1.047	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG01565	0.757	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG01583	1.168	1.168	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG01595	1.126	1.126	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG01879	1.04	1.04	0.0	0.0	0.852	0.894	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG02568	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG02922	1.135	1.135	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG03006	0.924	0.924	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG03052	1.083	1.083	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG03642	1.213	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	HG03742	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA12878	0.83	0.83	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA18525	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA18939	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA19017	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA19238	0.477	0.477	0.043	0.056	nan	nan	0	1
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA19239	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA19625	0.972	0.972	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA19648	0.925	0.925	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA20502	1.083	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95227318	95227966	DEL	649	NA20845	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG00096	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG00268	0.34	0.358	0.027	0.03	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG00419	1.017	1.07	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG00759	0.89	0.937	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG01051	0.41	0.432	0.008	0.016	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG01112	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG01500	0.748	0.787	0.0	0.0	0.391	0.391	1	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG01565	0.801	0.843	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG01583	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG01595	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG01879	0.378	0.398	0.003	0.013	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG02568	0.387	0.407	0.006	0.055	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG02922	0.0	0.0	0.045	0.09	nan	nan	0	0
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG03006	0.641	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG03052	0.0	0.0	0.045	0.097	nan	nan	0	0
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG03642	0.501	0.527	0.009	0.02	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	HG03742	0.549	0.578	0.014	0.022	0.32	0.337	2	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA12878	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA18525	0.373	0.393	0.014	0.019	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA18939	0.373	0.393	0.011	0.021	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA19017	0.0	0.0	0.057	0.095	nan	nan	0	0
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA19238	0.0	0.0	0.037	0.092	nan	nan	0	0
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA19239	0.417	0.439	0.024	0.034	nan	nan	0	1
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA19625	1.077	1.134	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA19648	1.208	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA20502	1.013	1.066	0.0	0.0	0.667	0.706	1	2
chr15	95691675	95692335	DEL	661	NA20845	0.341	0.359	0.019	0.027	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG00096	0.979	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG00268	0.43	0.452	0.024	0.086	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG00419	1.038	1.093	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG00759	0.994	1.046	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG01051	0.432	0.455	0.011	0.043	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG01112	0.92	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG01500	0.673	0.709	0.0	0.0	0.391	0.391	1	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG01565	0.822	0.865	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG01583	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG01595	0.616	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG01879	0.416	0.438	0.003	0.058	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG02568	0.387	0.407	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG02922	0.0	0.0	0.051	0.274	nan	nan	0	0
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG03006	0.603	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG03052	0.0	0.0	0.055	0.238	nan	nan	0	0
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG03642	0.475	0.5	0.009	0.064	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	HG03742	0.529	0.557	0.01	0.027	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA12878	0.916	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA18525	0.373	0.393	0.012	0.068	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA18939	0.354	0.373	0.008	0.047	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA19017	0.0	0.0	0.034	0.31	nan	nan	0	0
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA19238	0.0	0.0	0.03	0.268	nan	nan	0	0
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA19239	0.43	0.453	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA19625	1.077	1.134	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA19648	1.259	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA20502	1.036	1.091	0.0	0.0	0.667	0.706	1	2
chr15	95691872	95692323	DEL	452	NA20845	0.341	0.359	0.019	0.076	nan	nan	0	1
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG00096	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG00268	1.074	1.074	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG00419	0.275	0.275	0.0	0.038	0.696	0.696	1	1
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG00759	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG01051	0.734	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG01112	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG01500	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG01565	0.757	0.757	0.011	0.018	0.567	0.567	1	1
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG01583	0.621	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG01595	0.68	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG01879	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG02568	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG02922	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG03006	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG03052	0.619	0.619	0.0	0.016	0.367	0.367	1	1
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG03642	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	HG03742	0.895	0.895	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA12878	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA18525	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA18939	0.839	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA19017	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA19239	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.023	nan	nan	0	1
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA19648	0.694	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA20502	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96662195	96662247	DEL	53	NA20845	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG00096	0.922	0.971	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG00268	1.057	1.112	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG00419	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG00759	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG01051	0.389	0.409	0.0	0.033	0.708	0.708	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG01112	0.46	0.484	0.0	0.022	0.538	0.538	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG01500	0.542	0.571	0.0	0.023	0.433	0.433	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG01583	0.472	0.497	0.0	0.018	0.353	0.353	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG01595	0.404	0.425	0.0	0.044	0.864	0.864	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG01879	1.002	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG02568	0.232	0.244	0.0	0.026	0.5	0.5	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG02922	0.436	0.459	0.0	0.027	0.846	0.846	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG03006	0.396	0.417	0.0	0.026	0.7	0.7	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG03052	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG03642	1.265	1.332	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	HG03742	0.814	0.856	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA12878	0.743	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA18525	0.497	0.524	0.0	0.015	0.667	0.667	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA18939	0.672	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA19017	0.522	0.55	0.0	0.016	0.484	0.508	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA19238	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	0
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA19625	0.578	0.608	0.0	0.022	0.75	0.75	1	1
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA19648	1.285	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA20502	1.248	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	96771724	96771775	DEL	52	NA20845	0.5	0.526	0.0	0.014	0.737	0.737	1	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG00096	0.395	0.395	0.005	0.038	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG00268	1.128	1.128	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG00419	0.805	0.805	0.005	0.003	0.445	0.445	4	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG00759	0.911	0.911	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG01051	0.324	0.324	0.017	0.076	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG01112	0.46	0.46	0.016	0.071	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG01500	0.449	0.449	0.018	0.052	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG01565	0.0	0.0	0.037	0.152	nan	nan	0	0
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG01583	0.795	0.795	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG01595	0.34	0.34	0.006	0.05	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG01879	0.416	0.416	0.005	0.09	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG02568	0.697	0.697	0.0	0.0	0.778	0.778	5	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG02922	0.48	0.48	0.013	0.061	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG03006	0.0	0.0	0.021	0.174	nan	nan	0	0
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG03052	0.685	0.685	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG03642	0.0	0.0	0.036	0.096	nan	nan	0	0
chr15	98817015	98817425	DEL	411	HG03742	1.2	1.2	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA12878	1.02	1.02	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA18525	0.906	0.906	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA18939	0.448	0.448	0.005	0.08	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA19017	0.561	0.561	0.027	0.098	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA19238	0.368	0.368	0.004	0.083	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA19239	0.942	0.942	0.0	0.0	0.771	0.771	1	2
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA19625	0.657	0.657	0.005	0.035	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA19648	0.437	0.437	0.026	0.047	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA20502	0.518	0.518	0.01	0.079	nan	nan	0	1
chr15	98817015	98817425	DEL	411	NA20845	0.796	0.796	0.0	0.004	0.923	0.923	1	2
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG00096	0.0	0.0	0.132	0.07	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG00268	1.003	0.974	0.0	0.0	0.811	0.848	2	2
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG00419	0.593	0.576	0.063	0.033	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG00759	0.0	0.0	0.174	0.093	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG01051	0.41	0.398	0.028	0.006	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG01112	0.556	0.539	0.042	0.023	0.192	0.192	2	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG01500	0.524	0.508	0.034	0.016	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG01565	0.411	0.399	0.073	0.039	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG01583	1.143	1.11	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG01595	0.0	0.0	0.178	0.053	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG01879	0.491	0.477	0.009	0.009	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG02568	0.58	0.564	0.02	0.015	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG02922	0.655	0.636	0.038	0.019	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG03006	0.434	0.421	0.048	0.034	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG03052	0.95	0.923	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG03642	0.0	0.0	0.108	0.108	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	HG03742	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA12878	0.951	0.923	0.006	0.0	0.691	0.691	2	2
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA18525	0.0	0.0	0.151	0.105	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA18939	0.0	0.0	0.162	0.086	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA19017	0.0	0.0	0.138	0.082	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA19238	0.614	0.596	0.009	0.02	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA19239	0.377	0.366	0.018	0.035	0.882	0.882	1	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA19625	1.024	0.995	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA19648	0.36	0.349	0.036	0.036	nan	nan	0	1
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA20502	0.0	0.0	0.258	0.079	nan	nan	0	0
chr15	98900055	98900632	DEL	578	NA20845	0.637	0.618	0.045	0.011	nan	nan	0	1
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG00096	0.734	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG00268	0.895	0.895	0.0	0.0	0.387	0.405	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG00419	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG00759	0.89	0.89	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG01051	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG01112	0.824	0.824	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG01500	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG01565	1.168	1.168	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG01583	0.745	0.745	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG01595	1.105	1.105	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG01879	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG02568	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG02922	0.982	0.982	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG03006	1.037	1.037	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG03052	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG03642	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	HG03742	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA12878	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA18525	1.048	1.048	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA18939	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA19017	0.542	0.542	0.021	0.066	nan	nan	0	1
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA19238	0.873	0.873	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA19239	0.969	0.969	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA19625	1.051	1.051	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA19648	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA20502	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99125300	99125733	DEL	434	NA20845	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG00096	0.828	0.92	0.0	0.0	0.705	0.705	8	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG00268	0.376	0.418	0.103	0.063	nan	nan	0	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG00419	0.402	0.447	0.045	0.041	nan	nan	0	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG00759	0.662	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG01051	0.0	0.0	0.256	0.188	nan	nan	0	0
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG01112	0.23	0.255	0.095	0.07	nan	nan	0	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG01500	0.785	0.873	0.0	0.0	0.692	0.692	7	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG01565	0.627	0.697	0.0	0.0	0.564	0.564	6	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG01583	0.671	0.745	0.0	0.0	0.798	0.798	4	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG01595	0.361	0.401	0.051	0.038	0.237	0.237	2	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG01879	0.737	0.819	0.0	0.0	0.789	0.829	6	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG02568	0.0	0.0	0.307	0.198	nan	nan	0	0
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG02922	0.873	0.97	0.0	0.0	0.818	0.818	7	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG03006	0.49	0.545	0.069	0.035	nan	nan	0	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG03052	0.818	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG03642	0.765	0.85	0.0	0.0	0.759	0.759	6	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	HG03742	0.0	0.0	0.353	0.263	nan	nan	0	0
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA12878	0.778	0.864	0.0	0.0	0.831	0.831	6	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA18525	0.391	0.434	0.126	0.069	nan	nan	0	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA18939	0.354	0.394	0.042	0.038	0.239	0.25	2	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA19017	0.793	0.881	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA19238	0.914	1.015	0.0	0.0	0.642	0.642	2	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA19239	0.753	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA19625	0.368	0.409	0.073	0.047	nan	nan	0	1
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA19648	0.745	0.828	0.0	0.0	0.854	0.854	6	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA20502	1.013	1.125	0.0	0.0	0.777	0.775	4	2
chr15	99656561	99657404	DEL	844	NA20845	0.318	0.354	0.059	0.066	nan	nan	0	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG00096	0.895	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG00268	0.988	1.098	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG00419	0.317	0.353	0.016	0.04	nan	nan	0	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG00759	0.598	0.665	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG01051	0.847	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG01112	0.663	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG01500	0.821	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG01565	0.737	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG01583	0.852	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG01595	0.808	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG01879	0.433	0.481	0.029	0.023	0.333	0.333	1	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG02568	1.015	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG02922	0.478	0.531	0.046	0.029	nan	nan	0	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG03006	0.784	0.871	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG03052	0.384	0.427	0.03	0.052	nan	nan	0	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG03642	0.167	0.186	0.067	0.063	nan	nan	0	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	HG03742	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA12878	0.751	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA18525	1.104	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA18939	0.429	0.477	0.026	0.017	nan	nan	0	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA19017	0.355	0.395	0.02	0.119	0.667	0.704	3	1
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA19238	0.236	0.263	0.046	0.168	nan	nan	0	0
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA19239	0.8	0.889	0.012	0.092	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA19625	0.79	0.878	0.0	0.006	0.875	0.948	1	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA19648	0.934	1.038	0.009	0.08	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA20502	1.008	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10771053	10771583	DEL	531	NA20845	0.913	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG00096	0.855	0.95	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG00268	1.007	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG00419	1.043	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG00759	0.575	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG01051	0.726	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG01112	0.471	0.523	0.03	0.033	nan	nan	0	1
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG01500	0.761	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG01565	0.998	1.109	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG01583	0.878	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG01595	0.76	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG01879	1.011	1.123	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG02568	0.893	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG02922	0.765	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG03006	0.845	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG03052	0.768	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG03642	1.06	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	HG03742	0.764	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA12878	0.536	0.596	0.013	0.031	nan	nan	0	1
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA18525	0.842	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA18939	0.94	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA19017	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA19238	1.182	1.313	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA19239	1.048	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA19625	0.819	0.909	0.0	0.0	0.833	0.769	1	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA19648	1.017	1.13	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA20502	1.109	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	10924958	10925626	DEL	669	NA20845	0.444	0.493	0.051	0.034	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.083	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG01112	0.428	0.451	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG01500	0.401	0.422	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG01583	0.532	0.56	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG01879	0.309	0.326	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG02568	0.731	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG02922	0.478	0.503	0.0	0.024	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG03052	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA12878	0.536	0.564	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA18939	0.266	0.279	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA19238	0.266	0.28	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA19625	0.339	0.357	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	0
chr16	14075622	14075741	DEL	120	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	0
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG00096	0.692	0.91	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG00268	0.755	0.994	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG00419	0.68	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG00759	0.621	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG01051	0.46	0.605	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG01112	0.449	0.591	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG01500	0.741	0.975	0.0	0.0	0.75	0.789	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG01565	0.333	0.438	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG01583	0.958	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG01595	0.594	0.782	0.0	0.0	0.833	0.774	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG01879	0.722	0.95	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG02568	0.609	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG02922	0.526	0.692	0.0	0.012	0.778	0.778	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG03006	0.784	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG03052	0.792	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG03642	0.614	0.808	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	HG03742	0.832	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA12878	0.643	0.847	0.0	0.0	0.571	0.6	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA18525	1.048	1.378	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA18939	0.715	0.941	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA19017	0.502	0.66	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA19238	0.428	0.564	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA19239	0.568	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA19625	0.988	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA19648	0.989	1.302	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA20502	0.529	0.696	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	1500688	1500926	DEL	239	NA20845	0.641	0.844	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG00096	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG00268	0.445	0.433	0.047	0.045	nan	nan	0	1
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG00419	0.884	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG00759	0.898	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG01051	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG01112	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG01500	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG01565	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG01583	1.197	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG01595	0.95	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG01879	1.073	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG02568	0.568	0.552	0.057	0.057	nan	nan	0	1
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG02922	1.267	1.23	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG03006	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG03052	0.936	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG03642	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	HG03742	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA12878	0.769	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA18525	0.786	0.763	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA18939	1.185	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA19017	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA19238	0.871	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA19239	0.451	0.438	0.04	0.049	nan	nan	0	1
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA19625	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA19648	0.934	0.907	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA20502	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	17664255	17664877	DEL	623	NA20845	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG00096	1.038	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG00268	0.93	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG00419	1.043	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG00759	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG01051	1.089	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG01112	1.263	1.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG01500	0.962	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG01565	0.76	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG01583	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG01595	0.76	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG01879	0.969	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG02568	0.974	1.12	0.019	0.009	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG02922	0.813	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG03006	1.113	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG03052	1.44	1.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG03642	1.228	1.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	HG03742	0.967	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA12878	1.037	1.192	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA18525	0.786	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA18939	0.899	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA19017	0.627	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA19238	1.063	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA19239	0.859	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA19625	1.101	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA19648	1.017	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA20502	1.058	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23797654	23797734	DEL	81	NA20845	0.789	0.907	0.0	0.036	0.231	0.231	1	1
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG00096	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG00268	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG00419	0.703	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG00759	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG01051	0.774	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG01112	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG01500	0.942	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG01565	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG01583	1.277	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG01595	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG01879	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG02568	1.056	1.025	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG02922	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG03006	0.639	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG03052	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG03642	0.753	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	HG03742	0.585	0.568	0.0	0.04	0.654	0.654	1	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA12878	0.465	0.451	0.0	0.021	0.481	0.506	1	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA18525	0.505	0.49	0.0	0.021	0.618	0.618	1	1
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA18939	0.776	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA19017	0.335	0.325	0.0	0.021	0.556	0.586	1	1
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA19238	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA19239	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA19625	0.423	0.411	0.0	0.037	0.714	0.774	1	1
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA19648	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA20502	0.731	0.709	0.0	0.041	0.484	0.484	1	1
chr16	23809467	23809526	DEL	60	NA20845	0.74	0.718	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG00096	0.0	0.0	0.01	0.175	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG00268	0.368	0.368	0.006	0.082	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG00419	0.476	0.476	0.023	0.057	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG00759	0.0	0.0	0.055	0.163	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG01051	0.0	0.0	0.011	0.16	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG01112	0.0	0.0	0.008	0.214	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG01500	0.361	0.361	0.01	0.059	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG01565	0.0	0.0	0.031	0.16	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG01583	0.0	0.0	0.013	0.133	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG01879	0.433	0.433	0.007	0.067	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG02568	1.177	1.177	0.0	0.0	0.423	0.423	2	2
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG02922	0.335	0.335	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG03006	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG03052	0.792	0.792	0.0	0.005	1.0	1.0	1	2
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG03642	0.753	0.753	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr16	23910886	23911192	DEL	307	HG03742	0.315	0.315	0.029	0.084	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA12878	0.411	0.411	0.006	0.082	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA18525	0.542	0.542	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA18939	0.756	0.756	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA19017	0.251	0.251	0.016	0.064	0.332	0.35	4	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA19238	0.34	0.34	0.01	0.076	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA19239	0.0	0.0	0.006	0.211	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA19625	0.508	0.508	0.014	0.068	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA19648	0.0	0.0	0.047	0.192	nan	nan	0	1
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr16	23910886	23911192	DEL	307	NA20845	0.345	0.345	0.006	0.054	nan	nan	0	1
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG00096	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG00268	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG00419	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG00759	0.875	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG01051	1.355	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG01112	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG01500	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG01565	1.117	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG01583	0.905	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG01595	1.188	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG01879	0.804	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG02568	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG02922	0.407	0.395	0.0	0.063	0.714	0.714	1	1
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG03006	0.866	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG03052	0.6	0.582	0.0	0.077	0.552	0.552	1	1
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG03642	1.395	1.354	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	HG03742	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA12878	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA18525	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA18939	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA19017	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA19238	1.211	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA19239	0.655	0.636	0.0	0.054	0.333	0.333	1	1
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA19625	1.073	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA19648	1.127	1.094	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA20502	1.285	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	24170811	24170907	DEL	97	NA20845	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG00096	1.079	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG00268	0.794	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG00419	0.929	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG00759	0.875	0.972	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG01051	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG01112	0.663	0.737	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG01500	1.022	1.135	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG01565	1.069	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG01583	0.905	1.005	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG01595	0.974	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG01879	0.763	0.848	0.0	0.021	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG02568	0.771	0.857	0.013	0.0	0.75	0.75	1	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG02922	0.741	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG03006	0.887	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG03052	0.744	0.826	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG03642	0.977	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	HG03742	1.079	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA12878	1.055	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA18525	0.804	0.894	0.008	0.003	0.857	0.857	1	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA18939	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA19017	0.502	0.558	0.042	0.008	0.194	0.205	8	1
chr16	243155	243821	DEL	667	NA19238	1.034	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA19239	1.062	1.18	0.005	0.0	0.647	0.647	1	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA19625	1.101	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA19648	0.824	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA20502	1.058	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	243155	243821	DEL	667	NA20845	1.135	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG00096	1.201	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG00268	1.065	1.121	0.005	0.0	0.65	0.65	2	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG00419	0.975	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG00759	1.105	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG01051	1.016	1.07	0.0	0.0	0.797	0.797	2	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG01112	0.385	0.405	0.056	0.036	nan	nan	0	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG01500	0.421	0.443	0.049	0.043	nan	nan	0	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG01565	1.093	1.151	0.005	0.0	0.598	0.555	2	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG01583	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG01595	1.022	1.075	0.0	0.0	0.635	0.684	2	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG01879	0.433	0.456	0.07	0.037	0.5	0.5	1	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG02568	0.528	0.556	0.081	0.059	nan	nan	0	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG02922	0.55	0.579	0.037	0.028	nan	nan	0	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG03006	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG03052	0.792	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG03642	0.335	0.352	0.069	0.051	nan	nan	0	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	HG03742	0.899	0.947	0.0	0.001	0.808	0.808	2	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA12878	0.5	0.527	0.044	0.03	nan	nan	0	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA18525	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA18939	0.94	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA19017	0.0	0.0	0.299	0.192	nan	nan	0	0
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA19238	0.0	0.0	0.374	0.199	nan	nan	0	0
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA19239	0.0	0.0	0.531	0.219	nan	nan	0	0
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA19625	0.423	0.446	0.091	0.056	nan	nan	0	1
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA19648	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA20502	1.008	1.061	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr16	25639366	25640144	DEL	779	NA20845	0.518	0.545	0.025	0.016	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG00096	0.305	0.351	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG00268	0.407	0.468	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG00419	0.589	0.677	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG00759	0.667	0.767	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG01051	0.629	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG01112	0.449	0.517	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG01500	0.842	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG01565	0.309	0.355	0.013	0.069	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG01583	0.931	1.071	0.0	0.0	0.588	0.588	2	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.117	nan	nan	0	0
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG01879	0.66	0.759	0.0	0.0	0.611	0.611	2	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG02568	0.568	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG02922	0.478	0.55	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG03006	0.392	0.45	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG03052	1.248	1.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG03642	0.977	1.122	0.0	0.0	0.923	0.923	2	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	HG03742	0.315	0.362	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA12878	0.322	0.37	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA18525	0.449	0.516	0.0	0.062	0.7	0.7	3	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA19017	1.025	1.178	0.0	0.0	0.667	0.704	2	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA19238	0.679	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA19239	0.655	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA19625	0.819	0.941	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA19648	0.714	0.821	0.0	0.059	0.087	0.087	2	1
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA20502	1.134	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	26963254	26963386	DEL	133	NA20845	0.666	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG00096	1.018	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG00268	1.065	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG00419	1.043	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG00759	1.22	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG01051	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG01112	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG01500	1.022	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG01565	1.069	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG01583	1.224	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG01595	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG01879	0.908	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG02568	1.056	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG02922	1.22	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG03006	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG03052	1.32	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG03642	1.088	1.145	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	HG03742	1.214	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA12878	0.947	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA18525	0.973	1.024	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA18939	1.144	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA19017	0.544	0.572	0.064	0.049	nan	nan	0	1
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA19238	0.945	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA19239	1.092	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA19625	0.847	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA19648	1.154	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA20502	1.008	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	27306856	27307548	DEL	693	NA20845	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG00096	1.343	1.544	0.0	0.0	0.571	0.571	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG00268	0.91	1.046	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG00419	1.995	2.293	0.0	0.0	0.633	0.633	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG00759	2.094	2.407	0.0	0.0	0.862	0.862	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG01051	0.653	0.751	0.0	0.0	0.769	0.769	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG01112	0.77	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG01500	1.763	2.027	0.0	0.0	0.734	0.697	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG01565	1.378	1.584	0.0	0.0	0.516	0.479	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG01583	1.33	1.529	0.0	0.0	0.374	0.374	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG01595	1.497	1.72	0.0	0.0	0.473	0.509	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG01879	1.877	2.158	0.0	0.0	0.283	0.283	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG02568	1.543	1.773	0.0	0.0	0.34	0.34	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG02922	1.578	1.814	0.0	0.033	0.346	0.346	2	1
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG03006	1.876	2.157	0.0	0.0	0.54	0.54	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG03052	1.583	1.82	0.0	0.0	0.982	0.982	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG03642	1.953	2.245	0.0	0.0	0.86	0.86	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	HG03742	1.978	2.274	0.0	0.0	0.706	0.706	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA12878	2.055	2.363	0.0	0.002	0.911	0.868	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA18525	0.842	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA18939	1.532	1.761	0.0	0.0	0.534	0.534	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA19017	1.338	1.538	0.0	0.026	0.512	0.485	2	1
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA19238	2.068	2.377	0.0	0.0	0.905	0.905	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA19239	1.899	2.183	0.0	0.0	0.694	0.694	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA19625	2.075	2.384	0.0	0.0	0.757	0.699	3	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA19648	2.061	2.369	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA20502	1.184	1.361	0.0	0.0	0.504	0.504	2	2
chr16	33604996	33605259	DEL	264	NA20845	1.209	1.389	0.0	0.0	0.491	0.491	2	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG00096	0.895	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG00268	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG00419	0.635	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG00759	1.197	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG01051	0.847	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG01112	1.102	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG01500	0.741	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG01565	0.689	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG01583	1.038	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG01595	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG02568	0.934	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG02922	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG03006	0.742	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG03052	0.864	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG03642	0.725	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	HG03742	0.742	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA12878	0.876	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA18525	0.917	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA18939	1.123	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA19017	0.899	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA19238	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA19239	0.902	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA19625	1.129	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA19648	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA20502	1.033	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3467186	3467255	DUP	70	NA20845	0.789	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG00096	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG00268	1.278	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG00419	0.499	0.499	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG00759	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG01051	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG01112	0.899	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG01500	0.942	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG01565	1.164	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG01583	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG01595	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG01879	0.681	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG02568	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG02922	0.909	0.909	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG03006	0.99	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG03052	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG03642	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	HG03742	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA12878	1.108	1.108	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA18525	0.673	0.673	0.0	0.064	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA18939	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA19017	0.732	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA19238	0.99	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA19239	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA19625	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA19648	0.577	0.577	0.0	0.067	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA20502	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	3918273	3918501	DEL	229	NA20845	0.567	0.567	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG00096	0.611	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG00268	0.697	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG00419	0.589	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG00759	0.414	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG01051	0.629	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG01112	0.514	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG01500	0.821	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG01565	0.594	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG01583	0.931	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG01595	0.618	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG01879	0.639	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG02568	0.771	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG02922	0.454	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG03006	0.66	0.795	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG03052	0.528	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG03642	0.781	0.941	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	HG03742	0.787	0.948	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA12878	0.661	0.797	0.0	0.0	0.737	0.774	1	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA18525	0.617	0.744	0.0	0.006	0.611	0.611	1	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA18939	0.449	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA19017	0.23	0.277	0.0	0.0	0.571	0.603	1	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA19238	0.569	0.685	0.0	0.004	0.821	0.821	1	1
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA19239	0.742	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA19625	0.48	0.578	0.0	0.0	0.571	0.527	1	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA19648	0.852	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA20502	0.68	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	4037967	4038018	DEL	52	NA20845	0.678	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG00096	0.529	0.514	0.0	0.243	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG00268	0.484	0.47	0.017	0.151	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG00419	0.181	0.176	0.01	0.11	0.923	0.923	2	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG00759	0.552	0.536	0.01	0.168	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG01051	0.581	0.564	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG01112	0.663	0.644	0.01	0.167	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG01565	0.713	0.692	0.0	0.283	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG01583	0.239	0.233	0.0	0.071	0.571	0.571	2	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG01595	0.737	0.715	0.0	0.203	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.218	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG02568	0.162	0.158	0.0	0.098	0.625	0.625	2	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG02922	0.335	0.325	0.0	0.064	0.588	0.588	2	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.205	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG03642	0.335	0.325	0.0	0.084	0.917	0.917	2	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	HG03742	0.854	0.829	0.0	0.211	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA12878	0.411	0.399	0.0	0.147	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.192	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA19017	0.544	0.528	0.0	0.177	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA19238	0.679	0.66	0.0	0.211	nan	nan	0	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA19239	0.233	0.226	0.0	0.089	0.35	0.35	2	1
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA19625	0.536	0.521	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA19648	0.687	0.667	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA20502	0.605	0.587	0.0	0.184	nan	nan	0	0
chr16	49036072	49036207	DEL	136	NA20845	0.173	0.168	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG00096	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG00268	0.872	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG00419	1.088	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG00759	0.852	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG01051	1.016	1.07	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG01112	1.07	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG01500	0.882	0.928	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG01565	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG01583	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG01595	0.927	0.975	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG01879	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG02568	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG02922	0.909	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG03006	0.99	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG03052	0.48	0.505	0.089	0.058	nan	nan	0	1
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG03642	0.865	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	HG03742	0.899	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA12878	0.965	1.016	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA18525	1.048	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA18939	0.98	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA19017	0.836	0.88	0.0	0.0	0.478	0.505	3	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA19238	0.502	0.529	0.089	0.054	nan	nan	0	1
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA19239	1.033	1.088	0.0	0.0	0.873	0.873	2	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA19625	1.044	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA19648	1.017	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA20502	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49288297	49289119	DEL	823	NA20845	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG00096	0.916	0.964	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG00268	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG00419	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG00759	1.013	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG01051	0.315	0.331	0.063	0.143	nan	nan	0	1
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG01112	0.364	0.383	0.019	0.096	nan	nan	0	1
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG01500	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG01565	0.38	0.4	0.074	0.118	0.389	0.361	2	1
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG01583	0.346	0.364	0.05	0.129	nan	nan	0	1
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG01595	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG01879	0.413	0.434	0.039	0.115	0.667	0.667	1	1
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG02568	0.731	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG02922	0.622	0.654	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG03006	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG03052	0.72	0.758	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG03642	0.893	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	HG03742	0.742	0.781	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA12878	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA18525	0.954	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA18939	0.368	0.387	0.056	0.084	0.286	0.286	1	1
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA19017	0.397	0.418	0.025	0.164	0.472	0.447	2	1
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA19238	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA19239	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA19625	0.0	0.0	0.079	0.29	nan	nan	0	0
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA19648	0.742	0.781	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA20502	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49335847	49336301	DEL	455	NA20845	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG00096	0.855	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG00268	1.162	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG00419	1.088	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG00759	0.875	1.005	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG01051	0.508	0.584	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG01112	0.621	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG01500	0.721	0.829	0.0	0.038	0.457	0.481	1	1
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG01565	0.927	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG01583	0.958	1.101	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG01595	0.665	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG01879	0.639	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG02568	0.812	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG02922	0.837	0.962	0.0	0.012	0.368	0.368	1	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG03006	0.763	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG03052	0.816	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG03642	0.642	0.738	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	HG03742	0.899	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA12878	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA18525	0.748	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA18939	0.858	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA19017	0.251	0.288	0.0	0.043	0.909	0.906	2	1
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA19238	0.768	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA19239	1.055	1.213	0.0	0.0	0.605	0.605	1	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA19625	0.903	1.038	0.0	0.0	0.833	0.903	1	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA19648	1.237	1.421	0.0	0.0	0.32	0.32	1	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA20502	0.252	0.29	0.0	0.052	0.688	0.688	1	2
chr16	49499433	49499492	DEL	60	NA20845	0.74	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG00096	0.651	0.749	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG00268	0.755	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG00419	0.408	0.469	0.062	0.043	nan	nan	0	1
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG00759	0.736	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG01051	0.581	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG01112	0.621	0.713	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG01500	0.862	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG01565	0.452	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG01583	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG01595	0.641	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG01879	0.619	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG02568	0.69	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG02922	0.789	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG03006	0.804	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG03052	0.768	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG03642	1.06	1.219	0.0	0.006	0.4	0.4	1	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	HG03742	0.562	0.646	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA12878	0.876	1.007	0.0	0.0	0.585	0.614	2	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA18525	0.804	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA18939	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA19017	0.669	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA19238	0.738	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA19239	0.742	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA19625	0.762	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA19648	0.797	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA20502	0.806	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	49848032	49848751	DEL	720	NA20845	0.543	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.184	nan	nan	0	0
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG00759	0.299	0.344	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG01112	0.321	0.369	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG01500	0.581	0.668	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG01565	0.475	0.546	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG01595	0.618	0.71	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG01879	0.557	0.64	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG02568	0.893	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG02922	1.291	1.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG03006	0.619	0.711	0.008	0.047	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG03052	0.552	0.634	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG03642	0.502	0.577	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	HG03742	0.427	0.491	0.01	0.106	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA12878	1.215	1.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA18525	0.449	0.516	0.0	0.142	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA18939	0.511	0.587	0.005	0.073	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA19017	0.627	0.721	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA19238	1.137	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA19239	0.553	0.636	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA19625	0.395	0.454	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA19648	0.495	0.569	0.008	0.077	nan	nan	0	1
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr16	52904248	52904373	DEL	126	NA20845	1.11	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG00096	1.282	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG00268	0.794	0.794	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG00419	0.975	0.975	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG00759	0.875	0.875	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG01051	0.75	0.75	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG01112	0.471	0.471	0.009	0.03	nan	nan	0	1
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG01500	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG01565	1.331	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG01583	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG01595	0.546	0.546	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG01879	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG02568	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG02922	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG03006	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG03052	1.464	1.464	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG03642	1.256	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	HG03742	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA18525	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA18939	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA19017	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA19238	1.093	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA19239	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA19625	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA19648	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA20502	1.083	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	53713456	53713559	DEL	104	NA20845	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG00096	0.59	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG00268	0.872	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG00419	0.703	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG00759	0.552	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG01051	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG01112	1.07	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG01500	1.062	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG01565	0.404	0.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG01583	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG01595	0.475	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG01879	0.743	0.854	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG02568	1.015	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG02922	0.765	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG03006	0.825	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG03052	1.104	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG03642	1.172	1.347	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	HG03742	0.809	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA12878	0.697	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA18525	0.711	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA18939	0.388	0.446	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA19017	0.962	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA19238	0.798	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA19239	0.684	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA19625	0.508	0.584	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA19648	0.824	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA20502	1.008	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	55944694	55944838	DEL	145	NA20845	0.395	0.454	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG00096	0.387	0.43	0.0	0.029	0.783	0.783	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG00268	0.368	0.409	0.0	0.024	0.88	0.88	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG00419	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG00759	0.621	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG01051	0.29	0.323	0.0	0.024	0.769	0.769	1	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	0
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG01565	0.356	0.396	0.0	0.019	0.562	0.606	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG01583	0.718	0.798	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG01595	0.653	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG01879	0.681	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG02568	0.974	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG02922	0.359	0.399	0.0	0.011	0.312	0.313	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG03006	0.536	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG03052	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG03642	0.949	1.054	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	HG03742	0.45	0.5	0.0	0.016	0.684	0.684	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA18525	0.374	0.416	0.0	0.019	1.0	1.0	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA18939	0.49	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA19017	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA19238	0.458	0.509	0.0	0.022	0.629	0.629	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA19239	0.968	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA19625	0.564	0.627	0.012	0.017	0.579	0.627	1	1
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	0
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr16	58819558	58819633	DEL	76	NA20845	0.321	0.356	0.0	0.008	0.556	0.556	1	1
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG00096	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG00268	0.968	0.905	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG00419	1.315	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG00759	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG01051	1.355	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG01112	1.391	1.3	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG01500	1.252	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG01565	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG01583	1.011	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG01595	1.271	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG01879	0.557	0.52	0.0	0.066	0.588	0.588	1	1
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG02568	1.746	1.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG02922	1.22	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG03006	1.299	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG03052	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG03642	1.311	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	HG03742	1.135	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA12878	1.072	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA18525	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA18939	0.96	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA19017	1.077	1.007	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA19238	0.93	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA19239	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA19625	1.185	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA19648	1.044	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA20502	1.247	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59041475	59041574	DEL	100	NA20845	1.579	1.475	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG00096	1.302	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG00268	1.259	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG00419	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG00759	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG01051	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG01112	1.541	1.541	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG01500	1.202	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG01565	1.307	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG01583	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG01595	1.354	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG01879	0.619	0.619	0.0	0.031	0.562	0.562	1	1
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG02568	0.731	0.731	0.0	0.026	0.368	0.368	1	1
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG02922	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG03006	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG03052	1.392	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG03642	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	HG03742	1.349	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA18525	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA18939	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA19017	1.213	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA19238	0.591	0.591	0.0	0.047	0.849	0.849	1	1
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA19239	1.383	1.383	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA19625	0.621	0.621	0.0	0.062	0.864	0.797	1	1
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA19648	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA20502	1.209	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59347455	59347527	DEL	73	NA20845	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG00096	1.323	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG00268	1.298	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG00419	1.201	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG00759	1.473	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG01051	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG01112	1.284	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG01500	1.242	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG01565	1.26	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG01583	0.878	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG01595	1.093	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG01879	1.031	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG02568	1.137	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG02922	0.789	0.737	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG03006	1.258	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG03052	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG03642	1.004	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	HG03742	1.169	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA12878	0.804	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA18525	1.178	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA18939	1.083	1.012	0.0	0.0	0.964	0.964	1	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA19017	1.213	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA19238	0.532	0.497	0.0	0.076	0.368	0.368	1	1
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA19239	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA19625	0.762	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA19648	0.797	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA20502	0.957	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	59426814	59426924	DEL	111	NA20845	1.431	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG00096	1.221	1.185	0.0	0.0	0.631	0.631	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG00268	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG00419	1.156	1.122	0.0	0.0	0.727	0.727	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG00759	1.381	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG01051	1.283	1.245	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG01112	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG01500	0.441	0.428	0.107	0.072	nan	nan	0	1
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG01565	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG01583	1.038	1.008	0.0	0.0	0.722	0.722	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG01595	1.33	1.292	0.0	0.0	0.825	0.766	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG01879	1.196	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG02568	1.056	1.025	0.0	0.004	0.958	0.958	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG02922	1.1	1.068	0.0	0.0	0.465	0.465	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG03006	1.196	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG03052	1.272	1.235	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG03642	1.116	1.084	0.0	0.0	0.865	0.865	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	HG03742	1.281	1.244	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA12878	1.037	1.006	0.0	0.0	0.71	0.745	2	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA18525	1.01	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA18939	1.062	1.031	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA19017	1.087	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA19238	1.3	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA19239	0.568	0.551	0.097	0.064	0.452	0.452	1	1
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA19625	1.157	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA19648	1.182	1.147	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA20502	1.008	0.978	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	60466710	60467415	DEL	706	NA20845	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG00096	0.733	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG00268	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG00419	1.315	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG00759	1.473	1.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG01051	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG01112	0.663	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG01500	0.852	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG01565	0.879	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG01583	0.665	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG01595	1.045	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG01879	0.495	0.481	0.0	0.019	0.87	0.87	1	1
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG02568	0.568	0.552	0.0	0.038	0.917	0.917	1	1
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG02922	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG03006	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG03052	0.504	0.489	0.0	0.027	0.833	0.833	1	1
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG03642	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	HG03742	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA12878	0.876	0.85	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA18525	0.879	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA18939	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA19017	0.92	0.893	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA19238	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA19239	1.062	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA19625	1.073	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA19648	0.742	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA20502	1.159	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	61174185	61174244	DEL	60	NA20845	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG00096	0.488	0.488	0.0	0.023	0.7	0.7	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG00268	1.395	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG00419	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG00759	0.621	0.621	0.01	0.025	0.485	0.485	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG01112	0.578	0.578	0.014	0.025	0.625	0.625	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG01500	1.162	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG01565	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG01583	0.612	0.612	0.0	0.028	0.6	0.6	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG01595	0.641	0.641	0.0	0.022	0.793	0.854	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG01879	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG02568	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG02922	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG03006	1.258	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG03052	1.392	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG03642	1.311	1.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	HG03742	0.787	0.787	0.0	0.015	0.475	0.475	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA12878	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA18525	0.786	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA18939	0.715	0.715	0.0	0.026	0.66	0.66	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA19017	1.401	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA19238	0.561	0.561	0.0	0.017	0.707	0.707	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA19239	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA19625	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA19648	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA20502	0.529	0.529	0.0	0.018	0.63	0.63	1	1
chr16	63756306	63756388	DEL	83	NA20845	0.592	0.592	0.003	0.021	0.72	0.72	1	1
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG00096	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG00268	1.22	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG00419	0.975	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG00759	0.967	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG01051	1.186	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG01112	1.348	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG01500	1.863	1.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG01565	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG01583	1.197	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG01595	1.354	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG01879	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG02568	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG03006	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG03052	1.56	1.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG03642	1.646	1.598	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	HG03742	1.371	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA12878	1.162	1.128	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA18525	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA18939	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA19017	1.443	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA19238	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA19239	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA19625	1.383	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA19648	1.182	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA20502	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	63810514	63810580	DUP	67	NA20845	1.48	1.437	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG00096	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG00268	1.007	0.941	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG00419	0.703	0.657	0.0	0.046	0.606	0.606	1	1
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG00759	1.197	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG01051	1.065	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG01112	0.813	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG01500	1.202	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG01565	1.093	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG01583	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG01595	0.475	0.444	0.0	0.06	0.81	0.752	1	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG01879	0.908	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG02568	0.812	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG02922	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG03006	0.887	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG03052	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG03642	1.2	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	HG03742	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA12878	0.822	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA18525	1.01	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA18939	0.98	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA19017	0.878	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA19238	1.233	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA19239	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA19625	1.228	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA19648	0.852	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA20502	1.083	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	66049878	66049967	DEL	90	NA20845	0.703	0.657	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG00096	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG00268	1.143	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG00419	0.997	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG00759	0.829	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG01051	0.823	0.914	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG01112	0.942	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG01500	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG01565	0.689	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG01583	1.118	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG01595	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG01879	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG02568	0.893	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG02922	0.646	0.717	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG03006	0.948	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG03052	0.984	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG03642	1.088	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	HG03742	0.944	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA12878	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA18525	0.804	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA18939	0.94	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA19017	1.066	1.185	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA19238	0.886	0.985	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA19239	0.8	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA19625	1.411	1.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA19648	1.017	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA20502	1.083	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	68514334	68514474	DEL	141	NA20845	0.814	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG00096	0.346	0.384	0.053	0.042	nan	nan	0	1
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG00268	0.93	1.033	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG00419	0.816	0.907	0.0	0.0	0.776	0.776	2	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG00759	0.944	1.048	0.0	0.0	0.735	0.735	2	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG01051	0.823	0.914	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG01112	0.685	0.761	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG01500	0.781	0.868	0.0	0.0	0.522	0.549	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG01565	0.832	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG01583	0.931	1.035	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG01595	1.045	1.162	0.0	0.0	0.565	0.525	3	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG01879	0.639	0.71	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG02568	0.65	0.722	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG02922	0.837	0.93	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG03006	0.887	0.985	0.0	0.0	0.577	0.577	1	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG03052	0.792	0.88	0.0	0.005	0.853	0.853	2	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG03642	1.144	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	HG03742	0.922	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA12878	0.804	0.894	0.005	0.0	0.786	0.748	5	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA18525	0.767	0.852	0.0	0.0	0.702	0.702	2	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA18939	0.694	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA19017	0.836	0.929	0.0	0.0	0.762	0.748	5	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA19238	0.857	0.952	0.0	0.0	0.843	0.843	2	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA19239	0.728	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA19625	0.734	0.815	0.0	0.0	0.769	0.71	3	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA19648	0.879	0.977	0.0	0.0	0.746	0.746	4	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA20502	0.932	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	6957702	6958488	DEL	787	NA20845	0.74	0.822	0.0	0.0	0.833	0.833	4	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG00096	0.733	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG00268	0.31	0.373	0.0	0.031	0.667	0.667	1	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG00419	0.771	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG00759	0.621	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG01051	0.339	0.408	0.0	0.036	1.0	1.0	1	1
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG01112	0.599	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG01500	0.781	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG01565	0.808	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG01583	0.665	0.802	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG01595	0.451	0.544	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG01879	0.227	0.273	0.0	0.019	0.667	0.667	1	1
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG02568	0.284	0.342	0.0	0.02	0.8	0.8	1	1
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG02922	0.383	0.461	0.0	0.012	0.375	0.375	1	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG03006	0.639	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG03052	0.984	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG03642	0.67	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	HG03742	0.674	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA12878	0.84	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA18525	0.655	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA18939	0.98	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA19017	0.565	0.68	0.0	0.023	0.348	0.367	1	1
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA19238	0.281	0.338	0.0	0.019	1.0	1.0	1	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA19239	0.626	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA19625	0.621	0.748	0.0	0.033	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA19648	0.33	0.397	0.0	0.019	0.9	0.9	1	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA20502	0.705	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	74809778	74809840	DEL	63	NA20845	0.345	0.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG00096	0.0	0.0	0.208	0.0	nan	nan	0	0
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG00268	1.104	1.162	0.0	0.0	0.676	0.676	2	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG00419	0.453	0.477	0.055	0.0	0.757	0.757	4	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG00759	0.575	0.606	0.078	0.0	0.333	0.333	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG01051	0.895	0.943	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG01112	1.049	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG01500	0.0	0.0	0.245	0.0	nan	nan	0	0
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG01565	0.57	0.6	0.044	0.0	0.353	0.38	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG01583	0.479	0.504	0.054	0.0	0.318	0.318	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG01595	0.499	0.525	0.036	0.0	0.556	0.598	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG01879	0.846	0.89	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG02568	0.609	0.641	0.13	0.0	0.533	0.533	4	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG02922	0.502	0.529	0.082	0.002	0.591	0.591	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG03006	0.515	0.543	0.004	0.0	0.519	0.519	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG03052	0.984	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG03642	0.753	0.793	0.07	0.0	0.362	0.362	4	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	HG03742	0.562	0.592	0.054	0.0	0.43	0.43	4	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA12878	0.483	0.508	0.037	0.0	0.517	0.543	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA18525	0.0	0.0	0.176	0.0	nan	nan	0	0
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA18939	0.408	0.43	0.039	0.0	0.667	0.667	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA19017	0.418	0.44	0.049	0.0	0.818	0.864	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA19238	0.576	0.606	0.084	0.0	0.522	0.522	4	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA19239	1.135	1.195	0.0	0.001	0.953	0.953	3	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA19625	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA19648	1.127	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA20502	0.605	0.637	0.065	0.0	0.281	0.281	3	1
chr16	75429831	75430673	DEL	843	NA20845	0.0	0.0	0.215	0.0	nan	nan	0	0
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG00096	0.834	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG00268	0.484	0.557	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG00419	0.0	0.0	0.005	0.091	nan	nan	0	0
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.149	nan	nan	0	0
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG01051	0.847	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG01112	0.342	0.394	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG01500	0.461	0.53	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG01565	0.38	0.437	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG01583	0.426	0.489	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG01879	0.887	1.019	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG02568	0.731	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG02922	1.028	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG03006	1.155	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG03052	1.008	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG03642	0.53	0.609	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	HG03742	0.899	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA12878	0.393	0.452	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA18939	1.021	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA19017	0.983	1.13	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA19238	0.99	1.137	0.0	0.0	0.879	0.879	1	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA19239	0.582	0.669	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA19625	0.593	0.681	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA19648	0.522	0.6	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA20502	0.932	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76168648	76168753	DEL	106	NA20845	0.444	0.51	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG00096	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG00268	0.484	0.47	0.082	0.036	nan	nan	0	1
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG00419	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG00759	1.174	1.14	0.0	0.0	0.911	0.911	2	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG01051	1.258	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG01112	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG01500	1.162	1.128	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG01565	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG01583	0.878	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG01595	1.378	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG01879	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG02568	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG02922	0.98	0.952	0.0	0.0	0.757	0.757	2	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG03006	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG03052	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG03642	1.172	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	HG03742	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA12878	1.108	1.076	0.0	0.0	0.442	0.464	1	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA18525	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA18939	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA19017	1.234	1.198	0.0	0.0	0.81	0.768	2	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA19238	1.049	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA19239	1.15	1.116	0.0	0.0	0.816	0.816	1	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA19625	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA19648	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA20502	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76250294	76251090	DEL	797	NA20845	1.184	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG00096	0.977	0.977	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG00268	0.678	0.678	0.0	0.085	0.388	0.388	5	1
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG00419	0.363	0.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG00759	0.759	0.759	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG01051	0.472	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG01112	0.428	0.428	0.005	0.117	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG01500	0.902	0.902	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG01565	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG01583	0.585	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG01595	0.451	0.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.204	nan	nan	0	1
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG02568	0.244	0.244	0.0	0.107	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG02922	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG03006	0.639	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG03052	0.48	0.48	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG03642	0.586	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	HG03742	0.697	0.697	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA12878	0.447	0.447	0.0	0.128	nan	nan	0	1
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA18525	1.001	1.001	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA18939	0.572	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA19017	0.314	0.314	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA19238	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA19239	0.611	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA19625	0.48	0.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA19648	0.22	0.22	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA20502	0.252	0.252	0.0	0.072	0.412	0.412	3	2
chr16	76294912	76295032	DEL	121	NA20845	0.247	0.247	0.006	0.049	nan	nan	0	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG00096	1.547	1.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG00268	1.433	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG00419	1.179	1.081	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG00759	1.105	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG01051	1.694	1.554	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG01112	1.284	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG01500	0.701	0.643	0.0	0.071	0.333	0.351	1	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG01565	0.475	0.436	0.0	0.055	0.613	0.66	1	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG01583	0.426	0.391	0.0	0.118	0.636	0.636	1	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG01595	1.521	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG01879	1.712	1.571	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG02568	0.853	0.782	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG02922	1.459	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG03006	1.629	1.494	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG03052	1.392	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG03642	1.172	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	HG03742	0.719	0.66	0.0	0.067	0.409	0.409	1	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA12878	1.037	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA18525	0.655	0.601	0.0	0.061	0.5	0.5	1	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA18939	1.491	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA19017	1.443	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA19238	1.462	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA19239	1.441	1.322	0.0	0.0	0.865	0.865	1	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA19625	0.677	0.621	0.0	0.052	0.485	0.525	1	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA19648	0.632	0.58	0.0	0.097	0.733	0.733	1	1
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA20502	1.361	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	76548560	76548660	DEL	101	NA20845	1.307	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG00096	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG00419	0.907	0.907	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG00759	1.266	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG01051	1.041	1.041	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG01112	0.792	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG01500	1.282	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG01565	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG01583	1.304	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG01595	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG01879	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG02568	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG02922	1.004	1.004	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG03006	1.526	1.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG03052	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG03642	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	HG03742	0.809	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA12878	1.251	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA18525	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA18939	1.307	1.307	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA19017	1.38	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA19238	1.196	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA19239	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA19625	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA19648	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA20502	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	7761961	7762015	DUP	55	NA20845	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG00096	0.895	0.895	0.0	0.0	0.621	0.621	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG00268	0.484	0.484	0.042	0.031	nan	nan	0	1
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG00419	1.247	1.247	0.0	0.0	0.632	0.632	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG00759	1.358	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG01051	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG01112	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG01500	1.102	1.102	0.0	0.0	0.949	0.934	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG01565	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG01583	1.118	1.118	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG01595	0.903	0.903	0.0	0.0	0.825	0.766	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG01879	1.155	1.155	0.0	0.004	0.899	0.899	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG02568	0.934	0.934	0.0	0.0	0.701	0.701	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG02922	0.502	0.502	0.08	0.035	nan	nan	0	1
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG03006	1.381	1.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG03052	1.08	1.08	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG03642	1.256	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	HG03742	1.371	1.371	0.0	0.0	0.916	0.916	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA12878	0.465	0.465	0.037	0.065	nan	nan	0	1
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA18525	1.029	1.029	0.0	0.0	0.946	0.946	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA18939	1.001	1.001	0.0	0.0	0.61	0.61	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA19017	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA19238	1.108	1.108	0.0	0.0	0.886	0.886	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA19239	1.223	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA19625	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA19648	1.264	1.264	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA20502	1.109	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78171653	78172364	DEL	712	NA20845	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG00096	0.468	0.468	0.061	0.039	nan	nan	0	1
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG00268	0.426	0.426	0.118	0.053	nan	nan	0	1
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG00419	0.952	0.952	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG00759	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG01051	0.968	0.968	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG01112	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG01500	0.942	0.942	0.0	0.0	0.815	0.819	2	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG01565	0.475	0.475	0.072	0.051	nan	nan	0	1
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG01583	0.0	0.0	0.336	0.164	nan	nan	0	0
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG01595	0.998	0.998	0.0	0.0	0.765	0.71	1	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG01879	0.908	0.908	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG02568	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG02922	1.004	1.004	0.0	0.005	0.818	0.818	3	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG03006	0.99	0.99	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG03052	1.104	1.104	0.0	0.0	0.78	0.78	2	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG03642	1.032	1.032	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	HG03742	0.899	0.899	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA12878	0.429	0.429	0.077	0.029	nan	nan	0	1
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA18525	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA18939	0.837	0.837	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA19017	0.983	0.983	0.0	0.0	0.462	0.487	5	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA19238	1.108	1.108	0.0	0.0	0.895	0.895	3	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA19239	0.888	0.888	0.0	0.0	0.917	0.917	3	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA19625	0.423	0.423	0.072	0.036	nan	nan	0	1
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA19648	0.879	0.879	0.0	0.0	0.711	0.711	2	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA20502	1.235	1.235	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr16	78876665	78877564	DEL	900	NA20845	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG00096	0.326	0.304	0.011	0.097	0.522	0.522	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG00268	1.046	0.977	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG00419	1.201	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG00759	0.575	0.538	0.0	0.076	0.333	0.333	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG01051	0.315	0.294	0.0	0.066	0.429	0.429	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG01112	0.856	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG01500	0.0	0.0	0.01	0.161	nan	nan	0	0
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG01565	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	0
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG01879	1.238	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG02568	0.731	0.683	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG03006	1.031	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG03052	0.792	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG03642	0.586	0.548	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	HG03742	0.54	0.504	0.0	0.11	0.633	0.633	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA12878	0.536	0.501	0.0	0.065	0.353	0.371	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA18525	0.599	0.559	0.0	0.068	0.333	0.333	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA18939	0.633	0.592	0.0	0.097	0.378	0.378	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA19017	1.443	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA19238	0.945	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA19239	0.655	0.612	0.0	0.085	0.48	0.48	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA19625	0.819	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA19648	0.412	0.385	0.0	0.052	0.409	0.409	1	1
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA20502	0.882	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	80196900	80197002	DEL	103	NA20845	0.641	0.599	0.0	0.073	0.286	0.286	1	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG00096	0.773	0.814	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG00268	0.872	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG00419	0.748	0.787	0.0	0.0	0.453	0.453	2	2
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG00759	0.0	0.0	0.069	0.016	nan	nan	0	0
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG01051	0.339	0.357	0.069	0.0	nan	nan	0	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG01112	0.428	0.451	0.062	0.011	0.556	0.556	2	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG01500	0.0	0.0	0.166	0.0	nan	nan	0	0
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG01565	0.689	0.725	0.0	0.0	0.568	0.575	2	2
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG01583	0.639	0.672	0.033	0.0	nan	nan	0	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG01595	0.428	0.45	0.122	0.0	nan	nan	0	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG01879	0.516	0.543	0.007	0.0	0.143	0.143	7	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG02568	0.974	1.026	0.0	0.0	0.913	0.913	4	2
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG02922	0.311	0.327	0.076	0.0	0.429	0.429	12	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG03006	0.474	0.499	0.097	0.007	0.25	0.25	9	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG03052	0.072	0.076	0.186	0.0	nan	nan	0	0
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG03642	0.0	0.0	0.104	0.0	nan	nan	0	0
chr16	81173808	81174324	DEL	517	HG03742	0.0	0.0	0.17	0.0	1.0	1.0	1	0
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA12878	0.608	0.64	0.007	0.0	0.129	0.135	10	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA18525	0.449	0.473	0.03	0.007	0.4	0.4	10	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA18939	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA19017	0.481	0.506	0.02	0.004	0.575	0.607	2	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA19238	0.487	0.513	0.018	0.001	0.429	0.429	10	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA19239	0.64	0.674	0.028	0.011	0.179	0.179	7	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA19625	0.395	0.416	0.065	0.0	nan	nan	0	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA19648	1.264	1.331	0.0	0.003	0.824	0.824	2	2
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA20502	0.428	0.451	0.047	0.0	nan	nan	0	1
chr16	81173808	81174324	DEL	517	NA20845	0.987	1.039	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG00096	0.387	0.444	0.0	0.048	0.561	0.561	2	1
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG00268	0.697	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG00419	0.499	0.573	0.0	0.052	0.508	0.508	2	1
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG00759	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG01051	0.339	0.389	0.0	0.043	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG01112	0.835	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG01500	0.842	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG01565	0.642	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG01583	1.024	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG01595	1.057	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG01879	0.681	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG02568	0.853	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG02922	0.67	0.77	0.009	0.046	0.573	0.573	2	1
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG03006	0.825	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG03052	1.032	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG03642	0.753	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	HG03742	0.36	0.413	0.0	0.031	0.528	0.528	2	1
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA12878	0.411	0.473	0.0	0.046	0.326	0.342	2	1
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA18525	0.842	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA18939	0.49	0.563	0.0	0.054	0.89	0.89	2	1
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA19017	0.753	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA19238	0.753	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA19239	1.048	1.204	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA19625	0.79	0.908	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA19648	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA20502	0.957	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	81619267	81619360	DEL	94	NA20845	0.493	0.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG00096	0.0	0.0	0.141	0.0	0.4	0.4	3	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG00268	0.504	0.579	0.03	0.0	0.136	0.136	4	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG00419	0.725	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG00759	0.391	0.45	0.047	0.0	0.222	0.222	7	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG01051	0.411	0.473	0.059	0.012	0.292	0.292	8	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG01112	0.899	1.033	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG01500	0.0	0.0	0.235	0.0	nan	nan	0	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG01565	0.38	0.437	0.084	0.0	0.667	0.718	7	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG01583	0.506	0.581	0.024	0.004	0.429	0.429	5	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG01595	0.333	0.382	0.029	0.0	nan	nan	0	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG01879	0.0	0.0	0.131	0.0	nan	nan	0	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG02568	0.365	0.42	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG02922	0.0	0.0	0.13	0.0	nan	nan	0	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG03006	0.454	0.521	0.078	0.0	0.425	0.425	6	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG03052	0.588	0.676	0.037	0.0	0.45	0.45	8	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG03642	0.0	0.0	0.125	0.036	0.4	0.4	1	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	HG03742	0.899	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA12878	0.608	0.698	0.011	0.0	0.31	0.326	11	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA18525	0.954	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA18939	0.49	0.563	0.03	0.003	0.294	0.294	3	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA19017	0.418	0.481	0.064	0.0	0.333	0.352	9	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA19238	0.0	0.0	0.11	0.0	nan	nan	0	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA19239	0.0	0.0	0.061	0.004	0.333	0.333	3	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA19625	0.0	0.0	0.102	0.0	nan	nan	0	0
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA19648	0.55	0.632	0.042	0.0	0.273	0.273	3	1
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA20502	0.882	1.014	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	85149501	85150074	DEL	574	NA20845	0.0	0.0	0.126	0.007	nan	nan	0	0
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG00096	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG00268	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG00419	0.975	1.026	0.0	0.0	0.921	0.921	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG00759	0.414	0.436	0.08	0.058	nan	nan	0	1
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG01051	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG01112	1.006	1.059	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG01500	1.042	1.097	0.0	0.002	0.929	0.882	5	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG01565	1.022	1.076	0.0	0.009	0.526	0.567	3	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG01583	0.559	0.588	0.065	0.027	nan	nan	0	1
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG01595	0.475	0.5	0.038	0.019	nan	nan	0	1
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG01879	1.073	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG02568	0.853	0.897	0.0	0.0	0.778	0.778	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG02922	1.076	1.133	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG03006	1.072	1.129	0.0	0.006	0.633	0.633	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG03052	1.008	1.061	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG03642	0.921	0.969	0.0	0.0	0.667	0.667	5	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	HG03742	0.472	0.497	0.079	0.048	nan	nan	0	1
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA12878	0.715	0.753	0.0	0.006	0.917	0.873	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA18525	0.842	0.886	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA18939	0.96	1.01	0.0	0.011	0.783	0.783	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA19017	0.941	0.991	0.0	0.013	0.778	0.821	1	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA19238	0.945	0.995	0.0	0.0	0.838	0.838	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA19239	1.135	1.195	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA19625	1.073	1.129	0.0	0.0	0.679	0.627	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA19648	1.044	1.099	0.0	0.0	0.6	0.6	4	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA20502	1.134	1.193	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr16	85996941	85997565	DEL	625	NA20845	0.715	0.753	0.0	0.006	0.7	0.7	5	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG00096	0.611	0.643	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG00268	0.678	0.714	0.0	0.0	0.333	0.333	3	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG00419	0.544	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG00759	0.713	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG01051	0.46	0.484	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG01112	0.792	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG01500	0.581	0.612	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG01565	0.737	0.775	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG01583	0.506	0.532	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG01595	0.523	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG01879	0.578	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG02568	0.731	0.769	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG02922	0.454	0.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG03006	0.577	0.608	0.0	0.0	0.485	0.485	4	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG03052	0.384	0.404	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG03642	0.586	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	HG03742	0.202	0.213	0.067	0.049	nan	nan	0	1
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA12878	0.733	0.771	0.0	0.0	0.571	0.6	3	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA18525	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA18939	0.449	0.473	0.015	0.0	0.571	0.571	1	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA19017	0.732	0.77	0.0	0.0	0.786	0.744	1	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA19238	0.768	0.808	0.0	0.0	0.562	0.562	3	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA19239	0.64	0.674	0.0	0.0	0.35	0.35	2	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA19625	0.508	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA19648	0.385	0.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA20502	0.529	0.557	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr16	8775107	8775756	DEL	650	NA20845	0.641	0.675	0.0	0.006	0.857	0.857	1	2
chr16	87981799	87981853	DUP	55	HG00759	1.105	1.398	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	87981799	87981853	DUP	55	HG01565	1.307	1.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	87981799	87981853	DUP	55	HG02922	1.004	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	87981799	87981853	DUP	55	HG03006	0.804	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	87981799	87981853	DUP	55	HG03642	0.865	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	87981799	87981853	DUP	55	NA18525	0.991	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	87981799	87981853	DUP	55	NA19017	1.15	1.456	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG00096	0.427	0.491	0.08	0.024	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG00268	0.387	0.445	0.087	0.024	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG00419	0.0	0.0	0.175	0.07	nan	nan	0	0
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG00759	0.0	0.0	0.239	0.078	nan	nan	0	0
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG01051	0.315	0.362	0.045	0.01	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG01112	0.428	0.492	0.112	0.041	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG01500	0.401	0.461	0.061	0.029	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG01565	0.832	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG01583	0.825	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG01595	0.523	0.601	0.085	0.029	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG01879	0.846	0.972	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG02568	0.974	1.12	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG02922	0.0	0.0	0.453	0.101	nan	nan	0	0
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG03006	0.536	0.616	0.077	0.036	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG03052	0.864	0.993	0.0	0.0	0.56	0.56	4	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG03642	0.865	0.994	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	HG03742	0.854	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA12878	0.876	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA18525	0.393	0.452	0.045	0.014	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA18939	0.347	0.399	0.129	0.044	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA19017	0.899	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA19238	0.325	0.373	0.157	0.06	nan	nan	0	1
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA19239	0.931	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA19625	1.044	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA19648	0.797	0.916	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA20502	0.957	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr16	88862644	88863596	DEL	953	NA20845	0.937	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG00096	0.555	0.616	0.026	0.019	nan	nan	0	1
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG00268	0.86	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG00419	1.197	1.33	0.0	0.003	0.895	0.895	1	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG00759	1.042	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG01051	0.878	0.976	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG01112	0.742	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG01500	0.743	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG01565	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG01583	0.764	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG01595	0.713	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG01879	0.802	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG02568	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG02922	1.204	1.337	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG03006	0.629	0.699	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG03052	0.83	0.922	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG03642	0.714	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	HG03742	0.574	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA12878	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA18525	0.95	1.056	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA18939	0.642	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA19017	0.826	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA19238	0.829	0.921	0.0	0.0	0.913	0.948	1	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA19239	0.83	0.922	0.0	0.0	0.942	0.942	2	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA19625	1.003	1.115	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA19648	1.051	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA20502	0.759	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10006454	10006923	DEL	470	NA20845	0.547	0.608	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG00096	0.534	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG00268	0.801	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG00419	0.691	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG00759	0.663	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG01051	0.452	0.544	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG01112	0.524	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG01500	0.743	0.895	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG01565	0.358	0.432	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG01583	0.429	0.517	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG01595	0.689	0.83	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG01879	0.422	0.508	0.0	0.015	0.476	0.476	1	1
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG02568	0.322	0.387	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG02922	0.754	0.908	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG03006	0.65	0.783	0.0	0.034	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG03052	1.098	1.323	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG03642	1.102	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	HG03742	0.873	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA12878	1.191	1.435	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA18525	0.615	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA18939	0.642	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA19017	0.911	1.097	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA19238	0.784	0.944	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA19239	0.726	0.875	0.0	0.019	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA19625	0.631	0.76	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA19648	0.871	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA20502	0.531	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	10129992	10130047	DEL	56	NA20845	0.547	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG00096	0.0	0.0	0.025	0.02	nan	nan	0	0
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG00268	0.0	0.0	0.078	0.0	nan	nan	0	0
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG00419	0.414	0.461	0.071	0.007	0.25	0.25	3	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG00759	0.379	0.421	0.027	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG01051	0.351	0.39	0.029	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG01112	0.306	0.34	0.011	0.007	nan	nan	0	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG01500	0.619	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG01565	0.334	0.371	0.015	0.022	0.3	0.323	7	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG01583	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG01595	0.836	0.929	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG01879	0.0	0.0	0.069	0.053	nan	nan	0	0
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG02568	0.161	0.179	0.08	0.0	0.667	0.667	6	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG02922	0.413	0.459	0.017	0.014	0.25	0.25	3	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG03006	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG03052	0.781	0.868	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG03642	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	HG03742	0.735	0.816	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA12878	0.523	0.581	0.0	0.01	0.208	0.208	1	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA18525	0.0	0.0	0.047	0.016	nan	nan	0	0
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA18939	0.373	0.415	0.029	0.0	0.273	0.273	4	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA19017	1.038	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA19238	0.452	0.502	0.006	0.004	nan	nan	0	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA19239	1.037	1.153	0.004	0.003	0.943	0.943	6	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA19625	0.229	0.255	0.038	0.019	0.429	0.429	7	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA19648	1.299	1.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA20502	0.253	0.281	0.051	0.019	nan	nan	0	1
chr17	1097737	1098192	DEL	456	NA20845	0.0	0.0	0.094	0.047	nan	nan	0	0
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG00096	0.945	1.05	0.0	0.0	0.515	0.515	1	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG00268	0.821	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG00419	0.668	0.742	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG00759	0.734	0.816	0.0	0.0	0.933	0.871	1	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG01051	0.627	0.697	0.0	0.006	0.889	0.889	1	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG01112	0.437	0.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG01500	0.557	0.619	0.0	0.0	0.6	0.633	1	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG01565	0.406	0.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG01583	0.67	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG01595	0.246	0.273	0.096	0.072	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG01879	0.337	0.375	0.083	0.071	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG02568	0.523	0.581	0.049	0.024	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG02922	0.656	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG03006	0.336	0.373	0.072	0.062	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG03052	0.757	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG03642	0.327	0.364	0.073	0.068	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	HG03742	0.367	0.408	0.102	0.075	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA12878	0.794	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA18525	0.224	0.248	0.057	0.073	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA18939	0.394	0.438	0.047	0.045	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA19017	0.466	0.518	0.037	0.051	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA19238	0.347	0.385	0.025	0.048	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA19239	0.741	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA19625	0.631	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA19648	0.221	0.246	0.055	0.073	nan	nan	0	1
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA20502	0.835	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	11411691	11412308	DEL	618	NA20845	0.149	0.166	0.066	0.044	nan	nan	0	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG00096	0.513	0.54	0.08	0.0	0.143	0.143	1	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG00268	1.075	1.131	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG00419	0.461	0.485	0.087	0.002	0.231	0.231	1	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG00759	0.379	0.399	0.035	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG01051	0.979	1.03	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG01112	0.852	0.896	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG01500	0.929	0.978	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG01565	0.43	0.452	0.02	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG01583	0.563	0.593	0.04	0.004	0.286	0.26	1	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG01595	0.467	0.492	0.083	0.002	nan	nan	0	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG01879	0.991	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG02568	0.884	0.931	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG02922	0.729	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG03006	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG03052	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG03642	0.863	0.909	0.0	0.005	0.8	0.8	1	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	HG03742	0.918	0.967	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA12878	0.902	0.95	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA18525	0.0	0.0	0.162	0.002	nan	nan	0	0
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA18939	1.057	1.113	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA19017	0.487	0.513	0.033	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA19238	0.98	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA19239	0.86	0.905	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA19625	0.917	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA19648	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA20502	0.405	0.426	0.104	0.0	0.312	0.312	1	1
chr17	1602167	1602943	DEL	777	NA20845	0.398	0.419	0.056	0.004	0.4	0.4	5	1
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG00096	1.356	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG00268	1.211	1.132	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG00419	1.243	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG00759	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG01051	1.43	1.337	0.006	0.006	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG01112	1.463	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG01500	1.342	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG01565	1.48	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG01583	1.046	0.977	0.0	0.0	0.867	0.788	1	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG01595	1.402	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG01879	1.287	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG02568	0.482	0.451	0.046	0.017	nan	nan	0	1
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG02922	1.167	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG03006	1.594	1.489	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG03052	1.44	1.346	0.0	0.0	0.771	0.771	1	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG03642	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	HG03742	1.378	1.288	0.004	0.0	0.842	0.842	2	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA12878	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA18525	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA18939	1.389	1.298	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA19017	1.292	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA19238	1.401	1.31	0.0	0.0	0.75	0.722	3	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA19239	1.319	1.233	0.0	0.0	0.953	0.953	1	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA19625	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA19648	1.382	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA20502	1.189	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16079855	16080739	DEL	885	NA20845	1.442	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG00096	1.458	1.416	0.0	0.0	0.975	0.975	1	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG00268	1.377	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG00419	0.0	0.0	0.237	0.129	nan	nan	0	0
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG00759	1.421	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG01051	1.255	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG01112	1.485	1.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG01500	1.239	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG01565	1.373	1.333	0.0	0.0	0.826	0.89	1	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG01583	0.778	0.755	0.069	0.039	nan	nan	0	1
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG01595	0.763	0.74	0.074	0.033	nan	nan	0	1
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG01879	1.413	1.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG02568	0.0	0.0	0.259	0.121	nan	nan	0	0
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG02922	1.337	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG03006	1.3	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG03052	1.464	1.422	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG03642	1.31	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	HG03742	1.355	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA12878	0.974	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA18525	1.639	1.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA18939	1.264	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA19017	0.54	0.524	0.085	0.049	nan	nan	0	1
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA19238	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA19239	0.622	0.604	0.132	0.057	nan	nan	0	1
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA19625	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA19648	0.525	0.51	0.042	0.045	nan	nan	0	1
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA20502	1.506	1.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	16505451	16506298	DEL	848	NA20845	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG00096	0.0	0.0	0.253	0.142	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG00268	0.449	0.473	0.076	0.053	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG00419	0.599	0.63	0.073	0.052	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG00759	0.0	0.0	0.311	0.215	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG01051	0.0	0.0	0.275	0.2	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG01112	0.0	0.0	0.302	0.198	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG01500	0.557	0.587	0.104	0.063	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG01565	0.549	0.578	0.06	0.04	0.261	0.281	4	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG01583	0.51	0.536	0.037	0.027	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG01595	0.0	0.0	0.197	0.116	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG01879	0.485	0.511	0.071	0.055	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG02568	0.402	0.423	0.094	0.05	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG02922	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG03006	0.545	0.574	0.073	0.042	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG03052	0.854	0.899	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG03642	0.0	0.0	0.079	0.066	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	HG03742	0.735	0.773	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA12878	0.451	0.475	0.052	0.043	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA18525	0.0	0.0	0.299	0.198	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA18939	0.0	0.0	0.264	0.189	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA19017	0.53	0.557	0.06	0.038	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA19238	0.0	0.0	0.427	0.205	nan	nan	0	0
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA19239	0.511	0.538	0.082	0.047	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA19625	0.917	0.966	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA19648	0.802	0.844	0.0	0.0	0.929	0.931	2	2
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA20502	0.481	0.506	0.095	0.042	nan	nan	0	1
chr17	17230370	17231247	DEL	878	NA20845	0.0	0.0	0.188	0.083	nan	nan	0	0
chr17	185812	185874	DUP	63	HG00759	0.734	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	185812	185874	DUP	63	HG01112	0.961	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	185812	185874	DUP	63	HG03742	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	185812	185874	DUP	63	NA19239	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG00096	0.801	0.921	0.0	0.002	0.669	0.669	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG00268	0.782	0.898	0.0	0.0	0.633	0.633	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG00419	0.507	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG00759	0.663	0.762	0.0	0.0	0.833	0.893	1	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG01051	0.577	0.663	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG01112	0.721	0.828	0.0	0.0	0.938	0.935	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG01500	0.784	0.902	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG01565	0.692	0.796	0.0	0.0	0.25	0.232	1	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG01583	0.724	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG01595	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG01879	0.759	0.873	0.0	0.0	0.817	0.817	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG02568	0.965	1.109	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG02922	0.608	0.699	0.0	0.0	0.464	0.464	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG03006	0.818	0.94	0.0	0.001	0.636	0.636	1	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG03052	0.683	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG03642	0.685	0.787	0.004	0.0	0.5	0.5	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	HG03742	0.804	0.924	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA12878	0.758	0.871	0.0	0.0	0.438	0.437	1	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA18525	0.876	1.006	0.0	0.007	0.903	0.903	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA18939	0.332	0.381	0.053	0.014	0.368	0.368	3	1
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA19017	0.868	0.998	0.0	0.0	0.552	0.552	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA19238	0.889	1.022	0.0	0.0	0.567	0.546	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA19239	0.785	0.903	0.0	0.001	0.812	0.812	2	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA19625	0.86	0.989	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA19648	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA20502	0.86	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	18784666	18785274	DEL	609	NA20845	0.845	0.971	0.0	0.001	1.0	1.0	2	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG00096	0.493	0.548	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG00268	0.625	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG00419	0.322	0.358	0.038	0.003	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG00759	0.592	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG01051	0.301	0.335	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG01112	0.699	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG01500	0.867	0.963	0.0	0.0	0.952	0.902	1	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG01565	0.215	0.239	0.078	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG01583	0.751	0.834	0.0	0.0	0.643	0.584	3	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG01595	0.344	0.383	0.027	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG01879	0.696	0.773	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG02568	0.281	0.313	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG02922	0.656	0.729	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG03006	0.0	0.0	0.156	0.009	nan	nan	0	0
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG03052	0.366	0.407	0.086	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG03642	0.372	0.413	0.052	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	HG03742	0.436	0.485	0.076	0.003	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA12878	0.65	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA18525	0.354	0.393	0.072	0.007	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA18939	0.0	0.0	0.162	0.0	nan	nan	0	0
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA19017	0.0	0.0	0.304	0.004	nan	nan	0	0
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA19238	0.437	0.486	0.076	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA19239	0.489	0.543	0.065	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA19625	0.487	0.542	0.02	0.0	nan	nan	0	1
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA19648	0.995	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA20502	0.658	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	1912668	1913537	DEL	870	NA20845	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG00096	0.801	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG00268	0.684	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG00419	0.576	0.662	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG00759	0.663	0.762	0.0	0.0	0.538	0.503	1	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG01051	0.853	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG01500	1.135	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG01565	0.788	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG01583	0.831	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG01879	0.696	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG02568	0.884	1.016	0.0	0.008	0.3	0.3	1	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG03006	0.545	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG03052	0.439	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	HG03742	0.712	0.818	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	NA12878	0.74	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	NA18525	0.708	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	NA19238	0.964	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	NA19625	0.688	0.791	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr17	267605	267673	DUP	69	NA19648	0.525	0.604	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	NA20502	0.683	0.785	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	267605	267673	DUP	69	NA20845	0.721	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG00096	1.212	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG00268	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG00419	1.036	1.036	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG00759	1.137	1.137	0.0	0.0	0.792	0.822	2	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG01051	0.728	0.728	0.046	0.0	0.235	0.235	4	1
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG01112	1.288	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG01500	0.588	0.588	0.032	0.0	0.381	0.402	11	1
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG01565	0.979	0.979	0.0	0.0	0.741	0.773	2	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG01583	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG01595	1.132	1.132	0.0	0.0	0.506	0.506	2	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG01879	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG02568	1.367	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG02922	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG03006	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG03052	1.269	1.269	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG03642	1.28	1.28	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	HG03742	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA12878	1.173	1.173	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA18525	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA18939	1.036	1.036	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA19017	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA19238	1.145	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA19239	1.141	1.141	0.0	0.001	0.838	0.838	1	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA19625	1.233	1.233	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA19648	0.995	0.995	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA20502	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	27593174	27594117	DEL	944	NA20845	1.044	1.044	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG00096	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG00268	1.348	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG00419	1.036	1.006	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG00759	1.564	1.518	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG01051	0.753	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG01112	0.742	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG01500	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG01565	1.11	1.078	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG01583	0.724	0.703	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG01595	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG01879	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG02568	0.402	0.39	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG02922	0.632	0.614	0.0	0.013	0.545	0.545	1	1
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG03006	0.944	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG03052	1.22	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG03642	0.744	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	HG03742	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA12878	1.209	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA18525	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA18939	0.933	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA19017	0.657	0.638	0.0	0.01	0.515	0.515	1	1
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA19238	0.708	0.688	0.0	0.018	0.735	0.763	1	1
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA19239	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA19625	0.745	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA19648	0.968	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA20502	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	28450070	28450141	DEL	72	NA20845	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG00096	0.863	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG00268	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG00419	0.737	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG00759	0.948	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG01051	0.502	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG01112	0.742	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG01500	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG01565	1.051	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG01583	0.939	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG01595	0.787	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG01879	0.738	0.849	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG02568	0.523	0.601	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG02922	0.413	0.475	0.0	0.022	0.444	0.444	1	1
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG03006	0.65	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG03052	0.464	0.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG03642	0.774	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	HG03742	0.918	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA12878	0.992	1.141	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA18525	1.043	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA18939	0.767	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA19017	0.826	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA19238	0.377	0.433	0.0	0.043	0.609	0.586	1	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA19239	1.008	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA19648	1.134	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA20502	1.139	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30061595	30061671	DEL	77	NA20845	0.87	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG00096	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG00268	0.723	0.803	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG00419	0.898	0.998	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG00759	0.805	0.895	0.0	0.0	0.929	0.867	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG01051	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG01112	0.655	0.728	0.0	0.0	0.727	0.679	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG01500	0.661	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG01565	0.645	0.716	0.0	0.0	0.583	0.542	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG01583	0.885	0.983	0.0	0.0	1.0	0.909	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG01595	0.32	0.355	0.017	0.02	nan	nan	0	1
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG01879	0.717	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG02568	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG02922	0.0	0.0	0.217	0.131	nan	nan	0	0
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG03006	0.986	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG03052	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG03642	0.744	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	HG03742	0.746	0.829	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA12878	0.74	0.822	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA18525	0.391	0.435	0.085	0.057	nan	nan	0	1
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA18939	0.684	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA19017	0.741	0.824	0.0	0.0	0.476	0.476	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA19238	0.392	0.435	0.059	0.04	nan	nan	0	1
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA19239	0.874	0.971	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA19625	0.86	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA19648	0.664	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA20502	0.86	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30106610	30107555	DEL	946	NA20845	0.696	0.773	0.0	0.0	0.551	0.551	6	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG00096	0.822	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG00419	0.76	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG00759	0.948	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG01051	0.652	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG01112	1.245	1.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG01500	0.784	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG01565	1.003	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG01583	0.778	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG01595	0.541	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG01879	0.928	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG02568	0.442	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG02922	0.827	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG03006	0.986	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	HG03052	0.879	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA12878	0.992	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA18525	0.876	1.006	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA18939	0.829	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA19017	0.974	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA19238	1.1	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA19239	0.845	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA19625	0.602	0.692	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA19648	1.023	1.176	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA20502	0.86	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	30904218	30904278	DUP	61	NA20845	0.92	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG00096	1.13	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG00268	1.036	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG00419	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG00759	1.35	1.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG01051	1.355	1.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG01112	1.135	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG01500	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG01565	0.86	0.905	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG01583	0.858	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG01595	1.033	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG01879	1.055	1.11	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG02568	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG02922	0.438	0.461	0.008	0.069	nan	nan	0	1
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG03006	0.986	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG03052	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG03642	1.31	1.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	HG03742	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA12878	0.848	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA18525	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA18939	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA19017	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA19238	1.01	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA19239	0.978	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA19625	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA19648	1.134	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA20502	1.316	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	31797855	31798027	DEL	173	NA20845	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG00096	1.047	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG00268	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG00419	1.105	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG00759	1.113	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG01051	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG01112	1.07	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG01500	1.012	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG01565	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG01583	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG01595	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG01879	1.308	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG02568	1.407	1.481	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG02922	1.143	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG03006	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG03052	1.294	1.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG03642	1.28	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	HG03742	1.24	1.305	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA12878	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA18525	0.559	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA18939	1.098	1.156	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA19017	1.313	1.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA19238	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA19239	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA19625	0.545	0.573	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA19648	1.465	1.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA20502	0.936	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	32546793	32546925	DEL	133	NA20845	0.994	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG00096	1.212	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG00268	1.329	1.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG00419	0.99	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG00759	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG01051	1.205	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG01112	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG01500	1.424	1.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG01565	0.883	0.93	0.0	0.0	0.75	0.696	1	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG01583	1.153	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG01595	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG01879	1.476	1.554	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG02568	0.442	0.465	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG02922	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG03006	1.132	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG03052	1.074	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG03642	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	HG03742	1.263	1.329	0.009	0.0	0.84	0.84	1	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA12878	1.029	1.083	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA18525	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA18939	1.119	1.178	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA19017	1.144	1.204	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA19238	1.1	1.158	0.0	0.001	0.917	0.883	1	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA19239	1.171	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA19625	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA19648	0.94	0.989	0.0	0.0	0.6	0.557	1	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA20502	1.341	1.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	33231493	33231731	DEL	239	NA20845	1.119	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG00096	1.581	1.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG00268	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG00419	1.405	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG00759	1.256	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG01051	1.581	1.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG01112	1.266	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG01500	1.445	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG01565	1.624	1.517	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG01583	1.341	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG01595	1.427	1.333	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG01879	1.35	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG02922	1.216	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG03006	1.311	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG03052	1.44	1.346	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG03642	1.102	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	HG03742	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA12878	1.281	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA18525	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA18939	1.513	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA19017	1.207	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA19239	0.978	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA19625	1.462	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA19648	1.244	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA20502	1.417	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	37448147	37448754	DUP	608	NA20845	1.889	1.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG00096	0.965	1.073	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG00268	0.821	0.912	0.0	0.0	0.842	0.842	3	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG00419	0.921	1.023	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG00759	0.877	0.974	0.0	0.002	0.929	0.933	3	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG01051	0.903	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG01112	1.026	1.14	0.012	0.0	0.882	0.945	1	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG01500	0.929	1.032	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG01565	1.027	1.141	0.0	0.0	0.469	0.47	4	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG01583	0.885	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG01595	0.763	0.847	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG01879	0.654	0.727	0.0	0.002	0.789	0.789	1	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG02568	1.246	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG02922	0.9	1.0	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG03006	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG03052	0.513	0.57	0.08	0.042	0.135	0.135	4	1
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG03642	0.685	0.761	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	HG03742	0.873	0.97	0.0	0.0	0.364	0.364	3	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA12878	0.938	1.043	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA18525	1.118	1.242	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA18939	1.119	1.244	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA19017	0.847	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA19238	0.889	0.988	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA19239	0.785	0.873	0.005	0.003	0.783	0.783	2	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA19625	1.089	1.21	0.0	0.0	0.955	0.955	2	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA19648	0.94	1.044	0.008	0.0	0.6	0.646	3	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA20502	1.088	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	41153410	41154290	DEL	881	NA20845	0.895	0.994	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG00096	1.171	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG00268	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG00419	0.921	0.969	0.006	0.0	0.871	0.871	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG00759	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG01051	0.703	0.74	0.0	0.0	0.775	0.775	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG01112	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG01500	0.846	0.891	0.0	0.0	0.571	0.541	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG01565	0.836	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG01583	1.26	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG01595	1.156	1.217	0.0	0.0	0.679	0.679	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG01879	1.139	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG02568	1.286	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG02922	0.997	1.049	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG03006	1.153	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG03052	0.513	0.54	0.071	0.037	nan	nan	0	1
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG03642	0.982	1.034	0.0	0.0	0.683	0.683	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	HG03742	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA12878	0.974	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA18525	0.931	0.98	0.0	0.0	0.741	0.741	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA18939	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA19017	0.932	0.981	0.0	0.0	0.816	0.816	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA19238	0.934	0.983	0.0	0.0	0.82	0.79	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA19239	0.934	0.983	0.0	0.0	0.812	0.813	5	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA19625	0.774	0.815	0.0	0.0	0.745	0.745	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA19648	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA20502	1.037	1.092	0.0	0.0	0.761	0.761	6	2
chr17	42651493	42652145	DEL	653	NA20845	1.193	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG00096	0.308	0.342	0.0	0.101	0.875	0.875	2	1
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG00268	0.918	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG00419	1.013	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG00759	0.924	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG01051	0.427	0.474	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG01112	0.852	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG01500	0.372	0.413	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG01565	0.31	0.345	0.0	0.105	0.875	0.868	2	1
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG01583	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG01595	0.689	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG01879	0.886	0.984	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG02568	1.166	1.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG02922	0.973	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG03006	0.839	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG03052	0.732	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG03642	0.953	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	HG03742	0.758	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA12878	0.74	0.822	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA18525	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA18939	0.725	0.806	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA19017	0.868	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA19238	0.919	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA19239	0.963	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA19625	1.032	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA19648	0.525	0.584	0.0	0.087	0.471	0.507	3	1
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA20502	1.063	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	44086723	44086961	DEL	239	NA20845	1.044	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG00096	1.068	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG00268	0.977	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG00419	0.944	1.085	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG00759	0.971	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG01051	0.778	0.894	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG01112	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG01500	0.867	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG01565	0.764	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG01583	1.099	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG01595	0.959	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG01879	0.78	0.897	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG02568	0.924	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG02922	1.021	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG03006	0.986	1.133	0.0	0.0	0.379	0.379	1	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG03052	0.83	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG03642	1.131	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	HG03742	1.056	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA12878	0.974	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA18525	0.959	1.103	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA18939	0.891	1.024	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA19017	0.974	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA19238	1.07	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA19239	0.474	0.545	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA19625	1.175	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA19648	0.885	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA20502	1.164	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	48844118	48844503	DEL	386	NA20845	1.119	1.286	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG00096	0.493	0.479	0.0	0.026	0.867	0.867	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG00268	0.742	0.721	0.0	0.026	0.633	0.633	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG00419	1.52	1.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG00759	1.516	1.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG01051	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG01112	1.179	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG01500	0.846	0.822	0.0	0.027	0.525	0.554	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG01565	0.478	0.464	0.0	0.033	0.667	0.619	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG01583	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG01595	0.64	0.621	0.0	0.025	0.567	0.567	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG01879	0.78	0.758	0.0	0.017	0.938	0.938	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG02568	0.603	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG02922	0.656	0.637	0.0	0.036	0.4	0.4	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG03006	0.944	0.916	0.0	0.036	0.474	0.474	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG03642	1.548	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	HG03742	1.699	1.65	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA12878	0.613	0.596	0.0	0.02	0.526	0.526	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	0
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA18939	0.788	0.765	0.0	0.007	0.435	0.435	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA19017	0.402	0.391	0.0	0.021	0.852	0.852	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA19238	0.693	0.673	0.0	0.023	0.66	0.686	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA19239	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA19625	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA19648	0.498	0.483	0.0	0.011	0.857	0.796	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA20502	0.709	0.688	0.0	0.015	0.586	0.586	1	1
chr17	52705176	52705226	DEL	51	NA20845	1.317	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG00096	0.904	0.877	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG00268	0.664	0.645	0.057	0.037	nan	nan	0	1
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG00419	1.151	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG00759	1.113	1.081	0.0	0.0	0.808	0.754	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG01051	1.23	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG01112	0.895	0.869	0.0	0.0	0.9	0.84	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG01500	0.619	0.601	0.067	0.044	nan	nan	0	1
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG01565	1.027	0.997	0.0	0.0	0.773	0.832	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG01583	1.341	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG01595	1.402	1.361	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG01879	1.16	1.126	0.003	0.0	0.95	0.95	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG02568	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG02922	1.216	1.18	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG03006	0.65	0.631	0.056	0.025	nan	nan	0	1
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG03052	0.537	0.521	0.077	0.035	nan	nan	0	1
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG03642	1.399	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	HG03742	1.01	0.981	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA12878	0.92	0.893	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA18525	1.118	1.085	0.0	0.0	0.903	0.903	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA18939	0.58	0.563	0.066	0.055	nan	nan	0	1
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA19017	0.635	0.617	0.077	0.039	nan	nan	0	1
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA19238	0.693	0.673	0.092	0.062	nan	nan	0	1
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA19239	1.349	1.309	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA19625	1.462	1.42	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA19648	1.272	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA20502	1.189	1.155	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr17	52783840	52784529	DEL	690	NA20845	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG00096	0.904	0.904	0.003	0.0	0.875	0.875	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG00268	1.25	1.25	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG00419	0.622	0.622	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG00759	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG01051	0.728	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG01112	1.004	1.004	0.0	0.0	0.933	1.0	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG01500	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG01565	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG01583	0.939	0.939	0.0	0.0	0.5	0.55	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG01595	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG01879	1.413	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG02568	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG02922	0.948	0.948	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG03006	1.195	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG03052	0.781	0.781	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG03642	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	HG03742	0.896	0.896	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA12878	1.263	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA18525	1.062	1.062	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA18939	0.995	0.995	0.0	0.0	0.182	0.182	1	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA19017	0.508	0.508	0.071	0.0	0.581	0.581	12	1
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA19238	0.874	0.874	0.0	0.0	0.892	0.859	2	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA19239	1.023	1.023	0.006	0.0	0.633	0.633	2	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA19625	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA19648	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA20502	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5339116	5340114	DEL	999	NA20845	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG00096	1.068	1.068	0.0	0.0	0.621	0.621	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG00268	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG00419	1.312	1.312	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG00759	1.232	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG01051	1.38	1.38	0.0	0.0	0.52	0.52	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG01112	1.114	1.114	0.0	0.0	0.714	0.765	2	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG01500	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG01565	1.122	1.122	0.0	0.0	0.84	0.905	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG01583	0.939	0.939	0.0	0.0	0.556	0.611	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG01595	1.279	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG01879	1.118	1.118	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG02568	0.965	0.965	0.0	0.0	0.438	0.438	2	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG02922	1.362	1.362	0.004	0.002	0.895	0.895	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG03006	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG03052	0.903	0.903	0.0	0.0	0.896	0.896	2	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG03642	1.399	1.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	HG03742	1.102	1.102	0.0	0.0	0.589	0.589	2	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA12878	1.173	1.173	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA18525	0.987	0.987	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA18939	1.368	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA19017	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA19238	1.04	1.04	0.0	0.0	0.816	0.814	3	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA19239	0.578	0.578	0.113	0.05	nan	nan	0	1
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA19625	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA19648	0.94	0.94	0.0	0.0	0.933	0.867	1	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA20502	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	55490616	55491523	DEL	908	NA20845	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG00096	0.863	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG00268	0.918	1.02	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG00419	0.76	0.844	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG00759	0.474	0.526	0.051	0.029	nan	nan	0	1
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG01051	0.853	0.948	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG01112	0.764	0.849	0.0	0.0	0.611	0.655	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG01500	1.032	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG01565	0.812	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG01583	0.697	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG01595	0.836	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG01879	0.696	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG02568	0.844	0.938	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG02922	0.851	0.946	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG03006	0.671	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG03052	0.805	0.895	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG03642	0.625	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	HG03742	0.964	1.072	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA12878	0.974	1.083	0.0	0.0	0.903	0.903	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA18525	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA18939	0.87	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA19017	0.72	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA19238	0.799	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA19239	1.008	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA19625	0.803	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA19648	0.829	0.922	0.0	0.0	0.737	0.794	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA20502	0.784	0.872	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr17	5587680	5588655	DEL	976	NA20845	0.945	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG00096	0.555	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG00268	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG00419	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG00759	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG01051	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG01112	1.201	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG01500	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG01565	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG01583	1.126	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG01595	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG01879	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG02568	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG02922	1.483	1.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG03006	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG03052	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG03642	1.221	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	HG03742	0.827	0.827	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA12878	0.992	0.992	0.0	0.002	0.794	0.794	1	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA18525	1.248	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA18939	1.14	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA19017	1.165	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA19238	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA19239	1.111	1.111	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA19625	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA19648	0.47	0.47	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA20502	1.316	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	56210429	56211237	DEL	809	NA20845	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG00096	0.986	1.038	0.0	0.0	0.879	0.879	2	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG00268	0.996	1.049	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG00419	0.0	0.0	0.125	0.066	nan	nan	0	0
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG00759	0.426	0.449	0.063	0.016	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG01051	0.0	0.0	0.08	0.036	nan	nan	0	0
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG01112	0.48	0.506	0.054	0.006	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG01500	0.475	0.5	0.068	0.016	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG01565	0.406	0.427	0.059	0.014	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG01583	0.0	0.0	0.208	0.055	nan	nan	0	0
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG01595	0.0	0.0	0.142	0.053	nan	nan	0	0
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG01879	0.527	0.555	0.063	0.033	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG02568	0.924	0.973	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG02922	0.0	0.0	0.098	0.031	nan	nan	0	0
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG03006	0.0	0.0	0.199	0.082	nan	nan	0	0
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG03052	1.098	1.156	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG03642	0.417	0.439	0.09	0.022	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	HG03742	1.217	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA12878	0.866	0.912	0.0	0.0	0.866	0.866	2	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA18525	0.0	0.0	0.27	0.049	nan	nan	0	0
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA18939	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA19017	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA19238	1.01	1.063	0.001	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA19239	1.037	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA19625	0.516	0.543	0.084	0.02	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA19648	1.161	1.222	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA20502	0.455	0.479	0.074	0.013	nan	nan	0	1
chr17	57870250	57871180	DEL	931	NA20845	1.044	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG00096	0.863	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG00268	0.723	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG00419	0.691	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG00759	0.711	0.79	0.0	0.0	0.688	0.642	1	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG01051	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG01112	0.742	0.825	0.0	0.0	0.733	0.786	1	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG01500	0.578	0.642	0.0	0.0	0.667	0.632	1	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG01565	0.788	0.876	0.0	0.0	0.529	0.492	1	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG01583	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG01595	0.64	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG01879	0.696	0.773	0.0	0.004	1.0	1.0	1	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG02568	0.924	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG02922	0.389	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG03006	0.734	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG03052	0.757	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG03642	0.595	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	HG03742	0.735	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA12878	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA18525	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA18939	0.953	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA19017	0.593	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA19238	0.497	0.553	0.024	0.026	nan	nan	0	1
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA19239	0.652	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA19625	0.846	0.94	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA19648	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA20502	0.759	0.843	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr17	57920228	57920707	DEL	480	NA20845	0.721	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG00096	1.561	1.459	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG00268	1.407	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG00419	0.806	0.753	0.005	0.035	0.744	0.744	1	1
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG00759	1.777	1.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG01051	1.079	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG01112	1.157	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG01500	1.404	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG01565	1.695	1.584	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG01583	1.073	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG01595	1.673	1.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG01879	1.519	1.419	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG02568	1.045	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG02922	1.191	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG03006	1.3	1.215	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG03052	1.318	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG03642	1.25	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	HG03742	1.355	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA12878	1.119	1.046	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA18525	1.304	1.219	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA18939	1.43	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA19017	1.398	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA19238	1.341	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA19239	1.349	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA19625	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA19648	1.023	0.956	0.0	0.029	0.556	0.598	1	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA20502	1.088	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	58327217	58327285	DEL	69	NA20845	0.746	0.697	0.0	0.052	0.885	0.885	1	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG00096	0.555	0.584	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG00268	0.186	0.195	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG00419	0.322	0.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG00759	0.545	0.574	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG01051	0.402	0.423	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG01112	0.393	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG01500	0.495	0.522	0.0	0.0	0.267	0.253	1	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG01565	0.525	0.553	0.0	0.0	0.602	0.593	2	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG01583	0.308	0.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG01595	0.123	0.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG01879	0.295	0.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG02568	0.322	0.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG02922	0.401	0.422	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG03006	0.566	0.596	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG03052	0.293	0.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG03642	0.179	0.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	HG03742	0.276	0.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA12878	0.65	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA18525	0.615	0.647	0.0	0.003	0.8	0.8	2	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA18939	0.466	0.491	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA19017	0.127	0.134	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA19238	0.226	0.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA19239	0.37	0.39	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA19625	0.287	0.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA19648	0.276	0.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA20502	0.228	0.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	59868757	59868874	DEL	118	NA20845	0.298	0.314	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG00096	1.335	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG00268	1.094	1.094	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG00419	1.266	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG00759	1.279	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG01595	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG01879	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG02568	1.246	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	HG03052	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	NA18525	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	NA18939	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	NA19017	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	60934361	60934485	DUP	125	NA19648	1.825	1.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG00096	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG00268	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG00419	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG00759	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG01051	1.205	1.205	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG01112	1.135	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG01500	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG01565	0.478	0.478	0.132	0.042	nan	nan	0	1
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG01583	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG01595	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG01879	1.202	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG02568	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG02922	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG03006	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG03052	1.269	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG03642	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	HG03742	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA12878	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA18525	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA18939	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA19017	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA19238	1.13	1.13	0.0	0.0	0.892	0.859	1	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA19239	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA19625	0.917	0.917	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA19648	1.216	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA20502	1.316	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61475063	61475920	DEL	858	NA20845	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG00096	0.431	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG00268	0.821	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG00419	0.875	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG00759	0.841	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG01051	0.678	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG01112	0.524	0.582	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG01500	1.094	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG01565	0.669	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG01583	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG01595	0.861	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG01879	0.274	0.305	0.0	0.061	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG02568	0.723	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG02922	0.462	0.513	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG03006	0.44	0.489	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG03052	0.244	0.271	0.01	0.038	nan	nan	0	1
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG03642	0.566	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	HG03742	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA12878	0.613	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA18525	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA18939	0.829	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA19017	0.784	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA19238	0.663	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA19239	0.326	0.362	0.0	0.048	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA19625	0.803	0.892	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA19648	0.332	0.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA20502	0.658	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	61618779	61618940	DEL	162	NA20845	0.845	0.939	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG00096	0.555	0.584	0.075	0.002	0.538	0.538	13	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG00268	0.0	0.0	0.345	0.005	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG00419	0.345	0.364	0.019	0.0	0.889	0.889	11	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG00759	0.0	0.0	0.532	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG01051	0.0	0.0	0.208	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG01112	0.0	0.0	0.296	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG01500	0.454	0.478	0.058	0.0	0.375	0.396	17	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG01565	0.0	0.0	0.247	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG01583	0.0	0.0	0.168	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG01595	0.418	0.44	0.046	0.0	0.429	0.429	14	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG01879	0.633	0.666	0.0	0.0	0.899	0.899	4	2
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG02568	0.442	0.465	0.04	0.0	0.182	0.182	1	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG02922	0.632	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG03006	0.398	0.419	0.05	0.0	0.278	0.278	14	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG03052	0.635	0.668	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG03642	0.0	0.0	0.183	0.009	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	HG03742	0.344	0.363	0.055	0.0	0.35	0.35	9	2
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA12878	0.848	0.893	0.002	0.001	nan	nan	0	2
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA18525	0.0	0.0	0.34	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA18939	0.0	0.0	0.214	0.005	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA19017	0.318	0.334	0.039	0.0	0.5	0.5	5	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA19238	0.422	0.444	0.045	0.0	0.456	0.473	12	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA19239	0.756	0.796	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA19625	0.0	0.0	0.206	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA19648	0.332	0.349	0.048	0.0	nan	nan	0	1
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA20502	0.0	0.0	0.242	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62213208	62214203	DEL	996	NA20845	0.0	0.0	0.301	0.0	nan	nan	0	0
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG00096	1.335	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG00268	1.075	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG00419	1.312	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG00759	1.113	1.113	0.0	0.0	0.889	0.952	1	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG01051	1.405	1.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG01112	1.245	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG01500	1.342	1.342	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG01565	1.242	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG01583	1.797	1.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG01595	1.648	1.648	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG01879	1.498	1.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG02568	1.407	1.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG02922	0.535	0.535	0.0	0.031	0.684	0.684	2	1
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG03006	1.258	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG03052	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG03642	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	HG03742	1.401	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA12878	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA18525	1.714	1.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA18939	1.306	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA19017	0.53	0.53	0.0	0.031	0.808	0.808	2	1
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA19238	1.326	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA19239	0.682	0.682	0.0	0.036	0.25	0.25	2	1
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA19625	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA19648	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA20502	1.619	1.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	62605727	62605830	DEL	104	NA20845	0.597	0.597	0.0	0.023	0.417	0.417	2	1
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG00096	1.376	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG00268	1.133	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG00419	1.359	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG00759	1.635	1.587	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG01051	1.455	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG01112	1.376	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG01500	1.301	1.263	0.0	0.0	0.853	0.808	1	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG01565	1.504	1.46	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG01583	1.234	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG01595	1.328	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG01879	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG02568	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG02922	0.608	0.59	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG03006	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG03052	0.976	0.948	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG03642	1.489	1.445	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	HG03742	1.584	1.538	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA12878	0.938	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA18525	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA18939	1.306	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA19017	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA19238	1.296	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA19239	1.245	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA19625	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA19648	1.41	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA20502	1.24	1.204	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr17	64354546	64354742	DEL	197	NA20845	1.069	1.038	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG00096	0.78	0.822	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG00268	0.879	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG00419	0.852	0.897	0.008	0.0	0.5	0.5	1	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG00759	0.853	0.898	0.0	0.0	0.65	0.696	1	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG01051	0.878	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG01112	0.852	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG01500	0.743	0.782	0.0	0.0	0.652	0.688	1	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG01565	0.836	0.88	0.0	0.0	0.444	0.479	3	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG01583	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG01595	0.787	0.829	0.0	0.0	0.421	0.421	3	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG01879	0.654	0.688	0.0	0.0	0.533	0.533	3	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG02568	0.563	0.592	0.039	0.034	nan	nan	0	1
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG02922	0.802	0.845	0.0	0.0	0.592	0.592	2	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG03006	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG03052	0.83	0.874	0.0	0.0	0.706	0.706	5	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG03642	0.893	0.94	0.0	0.0	0.438	0.438	4	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	HG03742	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA12878	0.758	0.798	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA18525	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA18939	0.87	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA19017	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA19238	0.799	0.841	0.0	0.0	0.611	0.635	2	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA19239	0.667	0.702	0.0	0.0	0.681	0.681	2	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA19625	0.43	0.453	0.079	0.059	nan	nan	0	1
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA19648	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA20502	0.911	0.959	0.006	0.0	0.739	0.739	1	2
chr17	64985132	64986075	DEL	944	NA20845	0.721	0.759	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG00096	0.914	1.015	0.01	0.005	0.484	0.484	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG00268	0.996	1.107	0.0	0.0	0.451	0.451	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG00419	1.013	1.126	0.0	0.0	0.77	0.77	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG00759	0.924	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG01051	0.878	0.976	0.0	0.004	0.774	0.774	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG01112	0.764	0.849	0.0	0.0	0.728	0.734	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG01500	0.867	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG01565	0.86	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG01583	0.939	1.043	0.0	0.0	0.471	0.519	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG01595	0.836	0.929	0.0	0.002	0.544	0.544	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG01879	0.991	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG02568	1.045	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG02922	0.875	0.973	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG03006	0.944	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG03052	0.903	1.003	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG03642	1.072	1.191	0.0	0.0	0.773	0.773	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	HG03742	0.827	0.918	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA12878	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA18525	1.006	1.118	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA18939	0.995	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA19017	0.932	1.036	0.0	0.0	0.679	0.679	3	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA19238	0.527	0.586	0.083	0.002	nan	nan	0	1
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA19239	1.037	1.153	0.0	0.0	0.879	0.879	2	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA19625	1.003	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA19648	1.106	1.229	0.006	0.0	0.417	0.387	1	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA20502	0.86	0.956	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr17	65294469	65295266	DEL	798	NA20845	0.945	1.05	0.0	0.0	0.778	0.778	2	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG00096	0.513	0.498	0.0	0.02	0.792	0.792	1	1
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG00268	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG00419	1.289	1.252	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG00759	1.303	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG01051	1.179	1.145	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG01112	0.371	0.36	0.0	0.05	0.696	0.649	1	1
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG01500	1.156	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG01565	0.692	0.672	0.0	0.034	0.577	0.621	1	1
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG01583	1.073	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG01595	1.255	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG01879	0.97	0.942	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG02568	1.246	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG02922	1.24	1.204	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG03006	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG03052	1.147	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG03642	0.953	0.925	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	HG03742	1.01	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA12878	0.992	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA18525	1.453	1.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA18939	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA19017	0.974	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA19238	0.98	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA19239	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA19625	1.72	1.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA19648	1.244	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA20502	1.392	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	65514573	65514637	DEL	65	NA20845	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG00096	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG00268	0.821	0.864	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG00419	0.921	0.969	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG00759	0.426	0.449	0.098	0.018	nan	nan	0	1
chr17	667999	668787	DEL	789	HG01051	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG01112	0.983	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG01500	0.888	0.934	0.0	0.0	0.789	0.748	4	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG01565	0.883	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG01583	0.965	1.016	0.0	0.0	0.6	0.545	1	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG01595	0.615	0.647	0.144	0.022	0.24	0.24	4	1
chr17	667999	668787	DEL	789	HG01879	0.949	0.999	0.0	0.0	0.873	0.873	4	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG02568	1.085	1.142	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG02922	1.094	1.152	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG03006	1.09	1.148	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG03052	0.952	1.002	0.0	0.0	0.964	0.964	4	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG03642	1.34	1.41	0.0	0.0	0.75	0.75	4	2
chr17	667999	668787	DEL	789	HG03742	0.964	1.015	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA12878	0.938	0.988	0.0	0.0	0.531	0.531	1	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA18525	0.428	0.451	0.128	0.015	nan	nan	0	1
chr17	667999	668787	DEL	789	NA18939	1.181	1.244	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA19017	1.059	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA19238	0.799	0.841	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA19239	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA19625	1.261	1.328	0.0	0.0	0.791	0.791	2	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA19648	1.299	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA20502	1.29	1.358	0.0	0.0	0.62	0.62	4	2
chr17	667999	668787	DEL	789	NA20845	0.746	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG00096	0.452	0.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG00268	0.469	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG00419	0.414	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG00759	0.687	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG01051	0.552	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG01112	0.459	0.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG01500	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG01565	0.478	0.503	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG01583	0.349	0.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG01595	0.492	0.518	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG01879	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG02568	0.442	0.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG02922	0.365	0.384	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG03006	0.566	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG03052	0.488	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG03642	0.566	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	HG03742	0.459	0.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA12878	0.722	0.76	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA18525	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA18939	0.477	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA19017	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA19238	0.573	0.603	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA19239	0.756	0.796	0.0	0.003	0.846	0.846	1	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA19625	0.516	0.543	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA19648	0.387	0.407	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA20502	0.506	0.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	67900948	67901459	DEL	512	NA20845	0.398	0.419	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG00096	1.078	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG00268	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG00419	1.117	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG01051	0.703	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG01112	0.699	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG01500	0.764	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG01565	0.979	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG01583	0.751	0.863	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.024	nan	nan	0	0
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG01879	0.802	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG02568	0.322	0.37	0.0	0.022	0.8	0.8	1	1
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG02922	0.656	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG03006	0.419	0.482	0.0	0.03	0.429	0.429	1	1
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG03052	0.928	1.066	0.017	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG03642	0.819	0.941	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	HG03742	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA12878	0.848	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA18525	0.838	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA18939	0.311	0.357	0.0	0.019	0.76	0.76	1	1
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA19017	0.89	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA19238	0.738	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA19239	0.37	0.426	0.0	0.017	0.76	0.76	1	1
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA19625	0.545	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA19648	0.829	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA20502	0.987	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	70316495	70316552	DEL	58	NA20845	0.845	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG00096	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG00268	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG00419	0.484	0.509	0.062	0.0	0.353	0.353	17	1
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG00759	0.995	1.047	0.0	0.0	0.857	0.918	5	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG01051	0.753	0.792	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG01112	1.004	1.057	0.0	0.0	0.632	0.677	1	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG01500	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG01565	0.454	0.478	0.052	0.0	0.333	0.359	3	1
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG01583	0.429	0.452	0.064	0.009	0.333	0.303	1	1
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG01595	0.861	0.906	0.0	0.0	0.967	0.967	4	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG01879	0.907	0.955	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG02568	0.0	0.0	0.121	0.0	nan	nan	0	0
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG02922	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG03006	0.419	0.441	0.015	0.0	0.304	0.304	7	1
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG03052	0.952	1.002	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG03642	0.834	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	HG03742	0.941	0.991	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA12878	0.956	1.007	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA18525	0.447	0.471	0.079	0.0	0.5	0.5	17	1
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA18939	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA19017	0.466	0.491	0.05	0.0	0.24	0.24	5	1
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA19238	0.437	0.46	0.102	0.0	0.196	0.204	14	1
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA19239	0.0	0.0	0.277	0.0	nan	nan	0	0
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA19625	1.118	1.177	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA19648	1.023	1.077	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA20502	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	71369996	71370826	DEL	831	NA20845	0.423	0.445	0.086	0.0	0.833	0.833	7	1
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG00096	0.924	0.973	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG00268	0.84	0.884	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG00419	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG00759	0.782	0.823	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG01051	0.452	0.475	0.038	0.033	0.389	0.389	1	1
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG01112	0.699	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG01500	0.764	0.804	0.0	0.0	0.737	0.778	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG01565	0.931	0.98	0.0	0.0	0.722	0.778	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG01583	0.805	0.847	0.0	0.0	0.65	0.591	2	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG01595	0.91	0.958	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG01879	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG02568	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG02922	0.559	0.589	0.043	0.02	0.308	0.308	1	1
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG03006	0.944	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG03052	0.781	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG03642	0.923	0.971	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	HG03742	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA12878	0.92	0.969	0.0	0.0	0.438	0.437	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA18525	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA18939	0.974	1.025	0.0	0.0	0.655	0.655	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA19017	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA19238	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA19239	0.459	0.484	0.02	0.031	0.378	0.378	1	1
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA19625	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA19648	0.829	0.873	0.0	0.0	0.842	0.907	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA20502	0.81	0.852	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr17	73107713	73108273	DEL	561	NA20845	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG00096	0.842	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG00268	0.86	0.905	0.0	0.0	0.472	0.472	2	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG00419	1.013	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG00759	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG01051	1.154	1.215	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG01112	0.873	0.919	0.0	0.0	0.588	0.549	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG01500	0.784	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG01565	0.836	0.88	0.0	0.0	0.471	0.473	4	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG01583	1.073	1.129	0.0	0.0	0.526	0.478	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG01595	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG01879	1.012	1.066	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG02568	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG02922	0.802	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG03006	0.965	1.015	0.0	0.0	0.837	0.837	2	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG03052	0.781	0.822	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG03642	0.744	0.783	0.0	0.0	0.629	0.629	2	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	HG03742	0.873	0.918	0.0	0.0	0.556	0.556	2	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA12878	0.812	0.855	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA18525	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA18939	1.016	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA19017	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA19238	0.904	0.952	0.0	0.0	0.774	0.804	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA19239	1.067	1.123	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA19625	0.717	0.754	0.062	0.01	nan	nan	0	1
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA19648	0.912	0.96	0.0	0.0	0.75	0.808	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA20502	0.962	1.012	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr17	74849928	74850882	DEL	955	NA20845	0.771	0.811	0.0	0.0	0.644	0.644	2	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG00096	0.842	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG00268	0.742	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG00419	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG00759	0.569	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG01051	0.502	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG01112	0.742	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG01500	1.053	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG01565	0.573	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG01583	0.563	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG01595	0.566	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG01879	0.759	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG02568	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG02922	0.243	0.27	0.0	0.018	0.875	0.875	1	1
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG03006	0.671	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG03052	0.586	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG03642	0.655	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	HG03742	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA12878	0.541	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA18525	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA18939	0.58	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA19017	0.275	0.306	0.0	0.011	0.933	0.933	1	1
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA19238	1.07	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA19239	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA19625	0.401	0.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA19648	0.912	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA20502	0.481	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7508455	7508511	DEL	57	NA20845	0.969	1.077	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG00096	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG00268	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG00419	1.059	1.177	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG00759	0.936	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG01051	0.803	0.892	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG01112	0.502	0.558	0.0	0.088	0.269	0.288	1	1
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG01500	1.259	1.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG01565	0.86	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG01583	0.724	0.805	0.0	0.006	0.857	0.943	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG01595	0.959	1.066	0.0	0.0	0.391	0.391	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG01879	1.012	1.125	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG02568	0.884	0.982	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG02922	1.386	1.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG03006	0.503	0.559	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG03052	1.147	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG03642	1.102	1.224	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	HG03742	1.125	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA12878	0.956	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA18525	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA18939	0.788	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA19017	1.207	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA19238	1.13	1.256	0.0	0.0	0.943	0.979	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA19239	0.874	0.971	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA19625	0.831	0.924	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA19648	1.189	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA20502	1.164	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	75828393	75828578	DEL	186	NA20845	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG00096	1.047	1.103	0.0	0.0	0.545	0.545	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG00268	1.075	1.131	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG00419	0.921	0.969	0.0	0.0	0.728	0.728	4	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG00759	0.687	0.723	0.0	0.0	0.615	0.574	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG01051	1.004	1.057	0.0	0.0	0.611	0.611	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG01112	0.939	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG01500	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG01565	0.955	1.005	0.0	0.0	0.895	0.831	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG01583	0.751	0.79	0.0	0.0	0.788	0.866	4	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG01595	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG01879	0.907	0.955	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG02568	0.965	1.015	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG02922	0.729	0.768	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG03006	0.923	0.971	0.0	0.0	0.476	0.476	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG03052	1.367	1.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG03642	0.595	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	HG03742	0.666	0.701	0.0	0.0	0.835	0.835	4	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA12878	0.848	0.893	0.0	0.004	0.741	0.741	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA18525	0.801	0.843	0.0	0.0	0.708	0.708	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA18939	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA19017	1.207	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA19238	0.904	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA19239	0.519	0.546	0.007	0.076	nan	nan	0	1
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA19625	1.29	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA19648	1.092	1.15	0.0	0.0	0.462	0.429	3	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA20502	1.088	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	76582052	76582497	DEL	446	NA20845	0.92	0.968	0.0	0.002	0.533	0.533	3	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG00096	0.822	0.99	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG00268	0.918	1.106	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG00419	0.898	1.082	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG00759	0.426	0.514	0.012	0.131	nan	nan	0	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG01051	1.079	1.3	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG01112	0.306	0.368	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG01500	0.413	0.497	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG01565	0.692	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG01583	0.751	0.905	0.0	0.0	1.0	0.909	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG01595	0.812	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG01879	0.78	0.94	0.0	0.005	0.933	0.933	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG02568	1.005	1.211	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG02922	0.778	0.937	0.0	0.006	1.0	1.0	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG03006	0.377	0.455	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG03052	0.683	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG03642	0.863	1.04	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	HG03742	0.367	0.443	0.0	0.139	nan	nan	0	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA12878	0.307	0.37	0.0	0.113	0.818	0.818	1	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA18525	0.969	1.167	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA18939	0.746	0.899	0.0	0.002	0.75	0.75	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA19017	0.445	0.536	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA19238	0.799	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA19239	0.697	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA19625	0.688	0.829	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA19648	0.47	0.566	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA20502	0.886	1.067	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr17	77125448	77125603	DEL	156	NA20845	0.969	1.168	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG00268	0.723	0.915	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG00419	0.76	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG00759	0.474	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG01051	0.602	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG01112	0.677	0.857	0.0	0.0	0.5	0.536	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG01500	0.392	0.497	0.0	0.01	0.944	0.895	1	1
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG01565	0.883	1.118	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG01583	0.858	1.086	0.0	0.0	0.583	0.642	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG01595	0.443	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG01879	0.654	0.828	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG02568	0.965	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG02922	0.511	0.646	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG03006	0.86	1.088	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG03052	0.635	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG03642	0.625	0.791	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	HG03742	0.918	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA12878	0.974	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA18525	0.727	0.92	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA18939	0.684	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA19017	0.826	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA19238	0.663	0.839	0.0	0.0	0.792	0.762	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA19239	0.8	1.013	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA19625	0.889	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA19648	0.47	0.595	0.0	0.013	0.562	0.606	1	1
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA20502	0.936	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7755714	7755766	DEL	53	NA20845	0.597	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG00096	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG00268	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG00419	1.082	1.139	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG00759	1.066	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG01051	1.28	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG01112	0.546	0.575	0.058	0.036	nan	nan	0	1
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG01500	1.053	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG01565	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG01583	0.697	0.734	0.034	0.015	nan	nan	0	1
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG01595	1.058	1.113	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG01879	0.928	0.977	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG02568	1.166	1.227	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG02922	0.9	0.947	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG03006	0.0	0.0	0.234	0.154	nan	nan	0	0
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG03052	1.172	1.233	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG03642	1.102	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	HG03742	0.873	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA12878	0.397	0.418	0.033	0.03	0.393	0.393	1	1
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA18525	1.136	1.196	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA18939	0.933	0.982	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA19017	0.974	1.026	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA19238	0.995	1.047	0.0	0.0	0.781	0.811	1	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA19239	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA19625	0.516	0.543	0.05	0.03	nan	nan	0	1
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA19648	1.106	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA20502	0.987	1.039	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	78834683	78835348	DEL	666	NA20845	0.447	0.471	0.093	0.041	0.778	0.778	1	1
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG00096	0.739	0.822	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG00268	0.957	1.064	0.0	0.0	0.821	0.821	1	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG00419	0.921	1.023	0.0	0.0	0.333	0.333	4	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG00759	0.64	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG01051	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG01112	0.852	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG01500	0.95	1.055	0.0	0.0	0.732	0.773	2	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG01565	1.027	1.141	0.0	0.0	0.517	0.52	4	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG01583	0.965	1.073	0.0	0.0	0.958	0.871	2	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG01595	0.738	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG01879	0.886	0.984	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG02568	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG02922	0.778	0.864	0.0	0.0	0.659	0.659	2	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG03006	0.786	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG03052	0.366	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG03642	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	HG03742	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA12878	0.866	0.962	0.0	0.0	0.636	0.636	3	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA18525	0.82	0.911	0.003	0.0	0.476	0.476	3	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA18939	0.601	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA19017	0.826	0.918	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA19238	0.784	0.871	0.0	0.0	0.667	0.692	6	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA19239	0.778	0.864	0.0	0.0	0.25	0.25	6	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA19625	0.717	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA19648	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA20502	0.709	0.787	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr17	79691961	79692938	DEL	978	NA20845	0.795	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG00096	0.842	0.886	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG00268	1.094	1.152	0.0	0.0	0.635	0.635	2	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG00419	0.576	0.606	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG00759	0.948	0.998	0.0	0.0	0.737	0.789	3	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG01051	0.803	0.845	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG01112	0.808	0.85	0.0	0.0	0.882	0.824	3	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG01500	0.784	0.826	0.0	0.0	0.625	0.592	3	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG01565	0.692	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG01583	0.965	1.016	0.0	0.01	0.908	0.915	4	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG01595	0.836	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG01879	0.654	0.688	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG02568	0.0	0.0	0.078	0.134	nan	nan	0	1
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG02922	0.827	0.87	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG03006	1.027	1.082	0.0	0.0	0.945	0.945	2	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG03052	0.537	0.565	0.0	0.0	0.564	0.564	2	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG03642	0.834	0.877	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	HG03742	1.01	1.064	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA12878	0.902	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA18525	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA18939	0.85	0.894	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA19017	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA19238	0.799	0.841	0.0	0.0	0.654	0.63	3	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA19239	0.741	0.78	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA19625	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA19648	0.746	0.786	0.0	0.0	0.647	0.601	1	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA20502	1.063	1.119	0.0	0.003	0.867	0.867	1	2
chr17	7996773	7997282	DEL	510	NA20845	0.945	0.994	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr17	801623	802237	DEL	615	HG00096	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	801623	802237	DEL	615	HG00268	0.0	0.0	0.181	0.129	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	HG00419	0.0	0.0	0.153	0.08	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	HG00759	0.426	0.474	0.066	0.025	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	HG01051	0.0	0.0	0.243	0.05	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	HG01112	0.655	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	801623	802237	DEL	615	HG01500	0.0	0.0	0.158	0.081	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	HG01565	0.597	0.663	0.023	0.016	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	HG01583	0.429	0.477	0.052	0.03	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	HG01595	0.0	0.0	0.071	0.057	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	HG01879	0.443	0.492	0.1	0.035	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	HG02568	1.005	1.116	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr17	801623	802237	DEL	615	HG02922	0.365	0.405	0.075	0.027	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	HG03006	0.524	0.582	0.082	0.041	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	HG03052	0.805	0.895	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr17	801623	802237	DEL	615	HG03642	0.0	0.0	0.222	0.063	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	HG03742	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	801623	802237	DEL	615	NA12878	1.065	1.183	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	801623	802237	DEL	615	NA18525	0.0	0.0	0.282	0.083	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	NA18939	0.0	0.0	0.086	0.075	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	NA19017	0.868	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	801623	802237	DEL	615	NA19238	0.256	0.285	0.044	0.049	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	NA19239	0.385	0.428	0.046	0.032	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	NA19625	0.0	0.0	0.222	0.138	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	NA19648	0.0	0.0	0.155	0.095	nan	nan	0	0
chr17	801623	802237	DEL	615	NA20502	0.43	0.478	0.04	0.019	nan	nan	0	1
chr17	801623	802237	DEL	615	NA20845	0.0	0.0	0.1	0.029	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG00096	0.288	0.319	0.0	0.042	0.444	0.444	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG00268	0.371	0.412	0.0	0.034	0.708	0.708	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.167	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG01051	0.728	0.809	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG01565	0.549	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG01595	0.197	0.219	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG02922	0.267	0.297	0.0	0.077	0.778	0.778	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.149	nan	nan	0	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG03052	0.464	0.515	0.0	0.061	0.529	0.529	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG03642	0.327	0.364	0.0	0.061	0.386	0.386	2	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	HG03742	0.161	0.179	0.0	0.083	0.538	0.538	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA12878	0.289	0.321	0.0	0.065	0.8	0.8	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA18525	0.503	0.559	0.0	0.076	0.8	0.8	1	2
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA19017	0.487	0.541	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA19238	0.422	0.469	0.0	0.057	0.611	0.635	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA19625	0.373	0.414	0.0	0.059	0.5	0.5	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA19648	0.415	0.461	0.0	0.047	0.571	0.615	1	1
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA20502	0.709	0.787	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	81025596	81025682	DEL	87	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr17	887459	887633	DUP	175	HG00096	0.637	0.637	0.0	0.047	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG00268	1.622	1.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG00419	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG00759	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG01051	1.405	1.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG01112	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG01565	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG02568	0.683	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG02922	0.973	0.973	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG03006	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG03052	1.416	1.416	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG03642	1.042	1.042	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	HG03742	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA12878	1.137	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA18525	1.192	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA18939	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA19017	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA19238	1.281	1.281	0.0	0.0	0.711	0.685	3	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA19239	1.023	1.023	0.0	0.0	0.73	0.73	3	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA19625	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA19648	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA20502	1.392	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	887459	887633	DUP	175	NA20845	0.497	0.497	0.0	0.104	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG00096	0.678	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG00268	0.449	0.517	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG00419	0.76	0.873	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG00759	0.569	0.654	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG01051	0.477	0.548	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG01112	0.284	0.326	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG01500	0.754	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG01565	1.051	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG01583	0.536	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG01595	0.615	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG01879	0.485	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG02568	1.367	1.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG02922	1.021	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG03006	0.629	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG03052	0.952	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG03642	0.982	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	HG03742	0.85	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA12878	0.505	0.581	0.0	0.041	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA18525	0.717	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA18939	0.684	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA19017	0.974	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA19238	0.769	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA19239	0.756	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA19625	0.831	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA19648	1.134	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA20502	0.557	0.64	0.0	0.071	nan	nan	0	2
chr17	9065215	9065332	DEL	118	NA20845	0.746	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG00096	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG00268	1.036	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG00419	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG00759	0.284	0.276	0.0	0.063	1.0	0.933	1	1
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG01051	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG01112	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG01500	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG01565	0.86	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG01583	1.073	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG01595	0.689	0.669	0.0	0.027	0.172	0.172	1	1
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG01879	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG02568	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG02922	0.973	0.944	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG03006	0.902	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG03052	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG03642	0.982	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	HG03742	0.735	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA12878	0.776	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA18525	0.428	0.416	0.0	0.037	0.621	0.621	1	1
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA18939	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA19017	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA19238	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA19239	1.052	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA19625	0.545	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA19648	0.691	0.671	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA20502	0.911	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr17	9940740	9940820	DEL	81	NA20845	1.019	0.989	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG00096	0.338	0.338	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG00268	0.322	0.322	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG00419	0.42	0.42	0.016	0.079	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG00759	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG01051	1.135	1.135	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG01500	0.33	0.33	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG01565	0.515	0.515	0.0	0.114	0.8	0.8	2	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG01583	0.844	0.844	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG01595	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG01879	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG02568	1.096	1.096	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG02922	0.953	0.953	0.0	0.0	0.682	0.682	2	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG03006	0.411	0.411	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG03052	0.943	0.943	0.007	0.0	0.952	0.952	2	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG03642	0.5	0.5	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	HG03742	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA12878	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA18525	0.434	0.434	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA18939	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA19017	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA19238	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA19239	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA19625	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA19648	0.643	0.643	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA20502	0.496	0.496	0.0	0.094	nan	nan	0	2
chr18	10331018	10331158	DEL	141	NA20845	0.696	0.696	0.0	0.107	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG00096	0.808	0.851	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG00268	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG00419	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG00759	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG01051	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG01112	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG01500	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG01565	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG01583	0.77	0.81	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG01595	0.705	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG01879	0.762	0.802	0.0	0.0	0.438	0.458	1	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG02568	0.978	1.03	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG02922	0.282	0.296	0.027	0.003	0.429	0.429	1	1
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG03006	0.654	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG03052	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG03642	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	HG03742	0.727	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA12878	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA18525	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA18939	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA19017	0.78	0.821	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA19238	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA19239	0.36	0.379	0.117	0.049	nan	nan	0	1
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA19625	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA19648	0.874	0.92	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA20502	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	11855845	11856681	DEL	837	NA20845	0.696	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG00096	0.789	0.766	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG00268	1.215	1.18	0.0	0.0	0.667	0.639	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG00419	0.714	0.693	0.004	0.002	0.893	0.893	4	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG00759	0.932	0.904	0.0	0.0	0.837	0.837	4	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG01051	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG01112	0.959	0.931	0.0	0.0	0.706	0.706	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG01500	1.265	1.228	0.008	0.001	0.923	0.92	4	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG01565	0.945	0.917	0.0	0.0	0.561	0.561	4	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG01583	0.273	0.265	0.106	0.068	nan	nan	0	1
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG01595	0.913	0.886	0.0	0.003	0.944	0.944	1	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG01879	0.874	0.848	0.003	0.0	0.68	0.685	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG02568	0.665	0.646	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG02922	0.845	0.82	0.0	0.0	0.701	0.701	4	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG03006	0.897	0.871	0.0	0.0	0.556	0.556	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG03052	0.68	0.66	0.0	0.0	0.909	0.909	4	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG03642	0.65	0.631	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	HG03742	0.666	0.647	0.006	0.0	0.713	0.713	4	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA12878	0.801	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA18525	1.174	1.14	0.0	0.0	0.81	0.81	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA18939	0.891	0.865	0.0	0.002	0.8	0.8	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA19017	0.818	0.794	0.0	0.0	0.938	0.937	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA19238	1.02	0.99	0.002	0.0	0.742	0.742	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA19239	1.04	1.01	0.003	0.0	0.65	0.65	6	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA19625	0.835	0.81	0.0	0.0	0.857	0.857	5	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA19648	0.643	0.624	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA20502	0.802	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	1199563	1200309	DEL	747	NA20845	1.01	0.98	0.0	0.0	0.5	0.5	5	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG00096	0.62	0.62	0.101	0.038	0.923	0.923	1	1
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG00268	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG00419	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG00759	1.114	1.114	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG01051	0.883	0.883	0.005	0.0	0.933	0.933	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG01112	0.997	0.997	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG01500	0.44	0.44	0.053	0.035	0.35	0.366	1	1
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG01565	0.923	0.923	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG01583	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG01595	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG01879	1.041	1.041	0.0	0.0	0.839	0.879	2	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG02568	0.9	0.9	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG02922	0.585	0.585	0.063	0.016	0.722	0.722	1	1
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG03006	1.14	1.14	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG03052	1.074	1.074	0.0	0.0	0.565	0.565	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG03642	1.05	1.05	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	HG03742	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA12878	0.958	0.958	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA18525	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA18939	0.984	0.984	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA19017	0.809	0.809	0.004	0.0	0.75	0.75	1	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA19238	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA19239	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA19625	0.809	0.809	0.0	0.0	0.744	0.744	2	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA19648	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA20502	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	12503560	12504493	DEL	934	NA20845	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG00096	1.052	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG00268	1.054	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG00419	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG00759	0.952	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG01051	0.988	1.04	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG01112	0.884	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG01500	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG01565	0.88	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG01583	1.068	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG01595	1.017	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG01879	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG02568	0.978	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG02922	0.412	0.433	0.042	0.036	nan	nan	0	1
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG03006	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG03052	0.811	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG03642	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	HG03742	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA12878	0.993	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA18525	0.65	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA18939	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA19017	0.59	0.621	0.089	0.065	nan	nan	0	1
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA19238	1.113	1.172	0.0	0.0	0.634	0.634	1	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA19239	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA19625	0.496	0.522	0.05	0.039	nan	nan	0	1
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA19648	1.131	1.191	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA20502	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	14050840	14051384	DEL	545	NA20845	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG00096	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG00268	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG00419	0.924	0.924	0.005	0.0	0.538	0.538	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG00759	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG01051	0.904	0.904	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG01112	0.903	0.903	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG01500	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG01565	0.794	0.794	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG01583	0.77	0.77	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG01595	0.809	0.809	0.0	0.0	0.263	0.263	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG01879	1.004	1.004	0.0	0.0	0.609	0.638	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG02568	0.548	0.548	0.0	0.0	0.731	0.731	2	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG02922	0.932	0.932	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG03006	0.897	0.897	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG03052	0.723	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG03642	0.875	0.875	0.012	0.0	0.778	0.778	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	HG03742	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA12878	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA18525	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA18939	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA19017	0.0	0.0	0.492	0.0	nan	nan	0	0
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA19238	1.06	1.06	0.0	0.0	0.735	0.735	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA19239	1.0	1.0	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA19625	0.443	0.443	0.098	0.0	0.444	0.444	3	1
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA19648	1.26	1.26	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA20502	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	19562260	19563054	DEL	795	NA20845	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG00096	0.507	0.507	0.082	0.053	nan	nan	0	1
chr18	207028	207707	DEL	680	HG00268	1.019	1.019	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG00419	0.987	0.987	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG00759	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG01051	1.282	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG01112	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG01500	0.99	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG01565	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG01583	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG01595	0.768	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG01879	1.116	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG02568	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG02922	0.91	0.91	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG03006	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG03052	1.118	1.118	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG03642	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	HG03742	0.454	0.454	0.047	0.036	nan	nan	0	1
chr18	207028	207707	DEL	680	NA12878	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA18525	1.192	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA18939	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA19017	1.066	1.066	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA19238	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA19239	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA19625	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA19648	0.36	0.36	0.109	0.067	nan	nan	0	1
chr18	207028	207707	DEL	680	NA20502	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	207028	207707	DEL	680	NA20845	1.122	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG00096	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG00268	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG00419	1.05	1.019	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG00759	0.952	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG01051	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG01112	1.035	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG01500	1.228	1.192	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG01565	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG01583	0.77	0.747	0.0	0.0	0.389	0.389	1	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG01595	1.183	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG01879	0.428	0.415	0.005	0.026	nan	nan	0	1
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG02568	1.174	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG02922	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG03006	1.121	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG03052	1.249	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG03642	0.95	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	HG03742	1.13	1.097	0.0	0.0	0.543	0.543	1	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA12878	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA18525	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA18939	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA19017	1.218	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA19238	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA19239	1.2	1.165	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA19625	1.043	1.013	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA19648	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA20502	1.109	1.077	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21289351	21289933	DEL	583	NA20845	1.122	1.089	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG00096	0.789	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG00268	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG00419	1.05	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG00759	0.446	0.433	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG01051	0.757	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG01112	0.941	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG01500	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG01565	1.095	1.063	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG01583	0.348	0.337	0.0	0.065	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG01595	0.747	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG01879	0.614	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG02568	0.587	0.57	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG02922	0.563	0.547	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG03006	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG03052	0.8	0.777	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG03642	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	HG03742	0.828	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA12878	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA18525	0.777	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA18939	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA19017	1.047	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA19238	0.523	0.508	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA19239	0.4	0.388	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA19625	0.835	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA19648	0.771	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA20502	0.661	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	21490978	21491121	DEL	144	NA20845	0.763	0.741	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG00096	1.428	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG00268	1.537	1.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG00419	1.218	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG00759	1.195	1.117	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG01051	1.387	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG01112	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG01500	1.247	1.165	0.0	0.0	0.914	0.875	1	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG01565	1.61	1.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG01583	1.266	1.183	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG01595	1.307	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG01879	0.409	0.382	0.0	0.025	0.771	0.736	1	1
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG02568	1.096	1.024	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG02922	1.105	1.033	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG03006	0.99	0.925	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG03052	1.249	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG03642	0.875	0.818	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	HG03742	1.453	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA12878	0.801	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA18525	1.68	1.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA18939	1.466	1.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA19017	1.332	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA19238	1.342	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA19239	1.473	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA19625	1.122	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA19648	1.401	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA20502	1.77	1.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	2225885	2225936	DEL	52	NA20845	0.853	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG00096	1.222	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG00268	0.581	0.564	0.0	0.064	0.85	0.887	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG00419	0.409	0.397	0.0	0.048	1.0	1.0	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG00759	0.648	0.629	0.0	0.032	0.706	0.706	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG01051	0.462	0.449	0.0	0.048	0.72	0.72	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG01112	0.527	0.511	0.0	0.062	0.607	0.607	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG01500	1.448	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG01565	1.202	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG01583	0.521	0.506	0.0	0.044	0.353	0.353	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG01595	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.087	nan	nan	0	0
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG02922	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG03006	1.252	1.215	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG03052	1.249	1.213	0.008	0.008	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG03642	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	HG03742	0.727	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA12878	0.522	0.507	0.0	0.035	0.528	0.528	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA18525	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA18939	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA19238	1.046	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA19239	0.453	0.44	0.0	0.063	0.875	0.875	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA19625	0.574	0.557	0.0	0.062	0.682	0.682	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA19648	0.656	0.637	0.0	0.035	0.452	0.452	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA20502	0.543	0.527	0.0	0.073	0.852	0.852	1	1
chr18	23473581	23473650	DEL	70	NA20845	1.279	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG00096	0.319	0.336	0.086	0.046	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG00268	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG00419	0.0	0.0	0.131	0.108	nan	nan	0	0
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG00759	0.0	0.0	0.263	0.177	nan	nan	0	0
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG01051	0.0	0.0	0.267	0.154	nan	nan	0	0
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG01112	0.376	0.396	0.091	0.049	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG01500	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG01565	0.623	0.655	0.032	0.02	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG01583	0.0	0.0	0.299	0.126	nan	nan	0	0
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG01595	0.851	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG01879	0.744	0.783	0.0	0.0	0.602	0.631	2	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG02568	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG02922	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG03006	0.729	0.767	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG03052	0.877	0.923	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG03642	0.6	0.632	0.055	0.032	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	HG03742	0.262	0.276	0.07	0.051	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA12878	0.383	0.403	0.069	0.024	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA18525	0.0	0.0	0.239	0.164	nan	nan	0	0
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA18939	1.169	1.231	0.0	0.0	0.918	0.918	2	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA19017	0.99	1.042	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA19238	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA19239	0.933	0.982	0.0	0.0	0.878	0.878	1	2
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA19625	0.391	0.412	0.114	0.042	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA19648	0.334	0.352	0.073	0.044	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA20502	0.496	0.522	0.101	0.06	nan	nan	0	1
chr18	24571615	24572338	DEL	724	NA20845	0.0	0.0	0.23	0.158	nan	nan	0	0
chr18	2472723	2472837	DUP	115	HG02568	1.057	1.026	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr18	2472723	2472837	DUP	115	HG02922	0.997	0.968	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	2472723	2472837	DUP	115	NA19238	1.14	1.107	0.0	0.005	0.929	0.929	1	2
chr18	2472723	2472837	DUP	115	NA19239	1.067	1.036	0.0	0.0	0.878	0.878	1	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG00096	0.395	0.415	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG00268	0.947	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG00759	0.0	0.0	0.018	0.261	nan	nan	0	0
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG01051	0.567	0.597	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG01112	0.847	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG01500	0.513	0.54	0.016	0.122	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG01565	0.58	0.61	0.011	0.0	0.571	0.571	1	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG01583	0.397	0.418	0.014	0.088	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG01595	0.539	0.568	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG01879	0.353	0.372	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG02568	0.391	0.412	0.014	0.105	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG02922	1.018	1.072	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG03006	0.56	0.59	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG03052	0.921	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG03642	0.475	0.5	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	HG03742	0.706	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA12878	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA18525	0.452	0.475	0.007	0.094	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA18939	0.427	0.449	0.01	0.082	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA19017	0.59	0.621	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA19238	0.792	0.833	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA19239	0.52	0.547	0.01	0.085	nan	nan	0	1
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA19625	1.017	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA19648	1.003	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA20502	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	24791588	24791874	DEL	287	NA20845	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG00096	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG00268	0.715	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG00419	0.966	0.966	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG00759	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG01051	0.757	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG01112	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG01500	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG01565	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG01583	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG01595	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG01879	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG02568	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG02922	0.715	0.715	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG03006	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG03052	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG03642	1.075	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	HG03742	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA12878	0.749	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA18525	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA18939	1.244	1.244	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA19017	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA19238	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA19239	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA19625	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA19648	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA20502	0.543	0.543	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr18	26101420	26101563	DEL	144	NA20845	0.651	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG00096	0.667	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG00268	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG00419	0.567	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG00759	0.79	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG01051	0.778	0.894	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG01112	0.621	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG01500	0.898	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG01565	0.601	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG01583	0.323	0.371	0.0	0.019	0.667	0.667	1	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG01879	0.8	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG02568	0.548	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG02922	0.693	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG03006	0.579	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG03052	0.636	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG03642	0.525	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	HG03742	0.888	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA12878	0.888	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA18525	0.379	0.436	0.0	0.039	0.792	0.792	1	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA18939	0.557	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA19017	0.714	0.82	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA19238	0.664	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA19239	0.773	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA19625	0.678	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA19648	0.694	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA20502	0.566	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	27070556	27070609	DEL	54	NA20845	0.83	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG00096	0.338	0.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG00268	0.286	0.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG00419	0.399	0.459	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG00759	0.324	0.372	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG01051	0.084	0.097	0.016	0.162	0.583	0.583	1	1
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG01112	0.433	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG01500	0.587	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG01565	0.494	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG01583	0.273	0.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG01595	0.332	0.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG01879	0.279	0.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG02568	0.235	0.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG02922	0.238	0.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG03006	0.262	0.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG03052	0.153	0.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG03642	0.275	0.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	HG03742	0.363	0.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA12878	0.453	0.52	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA18525	0.47	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA18939	0.278	0.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA19017	0.304	0.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA19238	0.416	0.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA19239	0.44	0.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA19625	0.313	0.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA19648	0.231	0.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA20502	0.425	0.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	31143912	31144230	DEL	319	NA20845	0.561	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG00096	0.62	0.58	0.006	0.061	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG00268	0.59	0.551	0.006	0.087	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG00419	0.0	0.0	0.028	0.171	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG00759	0.0	0.0	0.022	0.161	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG01051	0.652	0.609	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG01112	0.771	0.721	0.004	0.102	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG01500	0.0	0.0	0.009	0.224	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG01565	0.0	0.0	0.01	0.223	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG01583	0.0	0.0	0.029	0.179	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG01595	0.0	0.0	0.019	0.149	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG01879	1.339	1.251	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG02922	0.65	0.607	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG03006	0.56	0.524	0.011	0.098	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG03052	0.745	0.697	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG03642	0.525	0.491	0.01	0.078	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	HG03742	0.565	0.528	0.013	0.081	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA12878	0.784	0.732	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA18525	0.0	0.0	0.01	0.229	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA18939	0.019	0.017	0.006	0.219	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA19017	0.761	0.711	0.017	0.129	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA19238	1.033	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA19239	0.653	0.611	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.236	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA19648	0.669	0.625	0.007	0.136	nan	nan	0	1
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA20502	0.0	0.0	0.012	0.199	nan	nan	0	0
chr18	32530967	32531232	DEL	266	NA20845	0.539	0.503	0.005	0.083	nan	nan	0	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG00096	1.184	1.184	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG00268	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG00419	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG00759	0.628	0.628	0.0	0.016	0.552	0.552	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG01051	1.282	1.282	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG01112	0.395	0.395	0.0	0.023	0.857	0.857	1	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG01500	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG01565	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG01583	0.273	0.273	0.0	0.034	0.667	0.667	1	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG01595	0.27	0.27	0.0	0.067	0.571	0.571	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG01879	0.474	0.474	0.0	0.03	0.517	0.542	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG02568	0.352	0.352	0.0	0.042	0.889	0.889	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG03006	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG03052	0.197	0.197	0.0	0.027	0.733	0.733	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG03642	0.6	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	HG03742	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA12878	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA18525	1.355	1.355	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA18939	0.557	0.557	0.0	0.02	0.692	0.692	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA19017	0.628	0.628	0.0	0.017	0.25	0.25	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA19238	0.631	0.631	0.0	0.035	0.918	0.918	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA19239	0.627	0.627	0.0	0.04	0.907	0.907	1	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA19625	0.6	0.6	0.0	0.052	0.619	0.619	1	1
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA19648	1.196	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA20502	1.251	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	3318055	3318128	DEL	74	NA20845	0.92	0.92	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG00096	0.583	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG00268	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG00419	0.462	0.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG00759	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG01051	0.567	0.567	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG01112	0.677	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG01500	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG01565	0.644	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG01583	0.397	0.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG01595	0.477	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG01879	0.781	0.781	0.0	0.0	0.211	0.221	1	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG02568	0.235	0.235	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG02922	0.498	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG03006	0.747	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG03052	0.548	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG03642	0.775	0.775	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	HG03742	0.606	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA12878	0.662	0.662	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA18525	0.921	0.921	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA18939	0.575	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA19017	0.552	0.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA19238	0.738	0.738	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA19239	0.92	0.92	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA19625	0.548	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA19648	0.566	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA20502	0.59	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	34060860	34061088	DEL	229	NA20845	0.651	0.651	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG00096	0.395	0.395	0.05	0.056	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG00268	0.536	0.536	0.036	0.033	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG00419	0.0	0.0	0.205	0.156	nan	nan	0	0
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG00759	0.466	0.466	0.042	0.032	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG01051	1.198	1.198	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG01112	0.414	0.414	0.077	0.05	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG01500	0.0	0.0	0.178	0.173	nan	nan	0	0
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG01565	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG01583	0.472	0.472	0.063	0.035	1.0	1.0	1	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG01595	0.0	0.0	0.25	0.221	nan	nan	0	0
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG01879	0.483	0.483	0.039	0.045	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG02568	1.057	1.057	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG02922	0.585	0.585	0.033	0.03	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG03006	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG03052	0.986	0.986	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG03642	0.775	0.775	0.036	0.039	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	HG03742	0.0	0.0	0.2	0.137	nan	nan	0	0
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA12878	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA18525	0.56	0.56	0.054	0.048	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA18939	0.501	0.501	0.042	0.042	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA19017	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA19238	0.993	0.993	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA19239	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA19625	0.861	0.861	0.009	0.0	0.917	0.917	1	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA19648	1.183	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA20502	0.496	0.496	0.058	0.061	nan	nan	0	1
chr18	35306041	35306639	DEL	599	NA20845	0.539	0.539	0.052	0.038	nan	nan	0	1
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG00096	1.24	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG00268	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG00419	1.197	1.162	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG00759	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG01051	1.303	1.265	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG01112	1.035	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG01500	1.027	0.997	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG01565	0.902	0.875	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG01583	1.117	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG01595	0.985	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG01879	1.19	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG02568	1.213	1.178	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG02922	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG03006	1.084	1.052	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG03052	1.052	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG03642	1.225	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	HG03742	1.009	0.98	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA12878	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA18525	0.993	0.965	0.0	0.0	0.969	0.969	1	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA18939	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA19017	1.047	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA19238	1.02	0.99	0.0	0.0	0.903	0.903	2	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA19239	0.627	0.608	0.086	0.045	nan	nan	0	1
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA19625	1.148	1.114	0.006	0.0	0.857	0.857	3	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA19648	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA20502	1.038	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	36144543	36145498	DEL	956	NA20845	1.167	1.133	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG00096	0.0	0.0	0.408	0.244	nan	nan	0	0
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG00268	0.0	0.0	0.139	0.116	nan	nan	0	0
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG00419	0.525	0.51	0.062	0.044	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG00759	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG01051	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG01112	0.865	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG01500	1.137	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG01565	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG01583	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG01595	0.622	0.604	0.044	0.036	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG01879	1.023	0.993	0.0	0.0	0.963	0.991	1	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG02568	0.783	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG02922	0.477	0.463	0.052	0.029	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG03006	0.448	0.435	0.036	0.021	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG03052	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG03642	0.6	0.583	0.056	0.019	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	HG03742	0.0	0.0	0.21	0.12	nan	nan	0	0
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA12878	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA18525	0.668	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA18939	0.0	0.0	0.349	0.233	nan	nan	0	0
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA19017	0.438	0.425	0.103	0.063	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA19238	0.523	0.508	0.056	0.065	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA19239	0.56	0.544	0.062	0.051	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA19625	0.469	0.456	0.093	0.032	nan	nan	0	1
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA19648	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA20502	0.0	0.0	0.182	0.126	nan	nan	0	0
chr18	38006382	38006996	DEL	615	NA20845	0.0	0.0	0.39	0.206	nan	nan	0	0
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG00096	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG00268	0.786	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG00419	0.819	0.819	0.0	0.004	0.905	0.905	1	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG00759	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG01051	0.546	0.546	0.0	0.002	0.733	0.733	1	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG01112	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG01500	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG01565	0.794	0.794	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG01583	0.571	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG01595	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG01879	0.446	0.446	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG02568	0.47	0.47	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG02922	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG03006	0.691	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG03052	0.614	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG03642	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	HG03742	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA12878	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA18525	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA18939	1.021	1.021	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA19017	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA19238	0.724	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA19239	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA19625	0.626	0.626	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA19648	0.643	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA20502	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	38445144	38445351	DEL	208	NA20845	0.965	0.965	0.0	0.0	0.36	0.36	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG00096	0.846	0.846	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG00268	1.233	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG00419	0.0	0.0	0.238	0.128	nan	nan	0	0
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG00759	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG01051	0.904	0.904	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG01112	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG01500	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG01565	1.116	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG01583	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG01595	0.415	0.415	0.051	0.036	nan	nan	0	1
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG01879	1.06	1.06	0.0	0.0	0.441	0.462	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG02922	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG03006	0.747	0.747	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG03052	0.723	0.723	0.0	0.0	0.625	0.625	2	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG03642	0.95	0.95	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	HG03742	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA12878	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA18525	0.415	0.415	0.093	0.051	nan	nan	0	1
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA18939	1.188	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA19017	1.028	1.028	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA19238	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA19239	0.893	0.893	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA19625	0.391	0.391	0.086	0.049	nan	nan	0	1
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA19648	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA20502	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	39585699	39586314	DEL	616	NA20845	0.808	0.808	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG00096	1.052	1.108	0.0	0.0	0.757	0.757	1	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG00268	0.768	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG00419	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG00759	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG01051	1.051	1.106	0.0	0.0	0.639	0.639	2	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG01112	0.847	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG01500	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG01565	0.837	0.881	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG01583	1.117	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG01595	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG01879	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG02568	0.978	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG02922	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG03006	0.915	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG03052	0.921	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG03642	1.0	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	HG03742	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA12878	0.975	1.026	0.0	0.0	0.723	0.723	2	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA18525	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA18939	0.965	1.016	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA19017	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA19238	0.456	0.48	0.075	0.051	nan	nan	0	1
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA19239	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA19625	1.095	1.153	0.008	0.0	0.812	0.813	1	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA19648	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA20502	0.944	0.994	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr18	42625417	42626103	DEL	687	NA20845	0.853	0.898	0.0	0.0	0.915	0.915	2	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG00096	0.996	0.996	0.0	0.0	0.561	0.561	2	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG00268	0.482	0.482	0.071	0.051	nan	nan	0	1
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG00419	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG00759	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG01051	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG01112	1.129	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG01500	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG01565	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG01583	0.0	0.0	0.223	0.147	nan	nan	0	0
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG01595	0.954	0.954	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG01879	0.614	0.614	0.077	0.038	nan	nan	0	1
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG02568	1.448	1.448	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG02922	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG03006	0.504	0.504	0.092	0.072	nan	nan	0	1
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG03052	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG03642	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	HG03742	0.706	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA12878	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA18525	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA18939	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA19017	0.647	0.647	0.041	0.024	nan	nan	0	1
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA19238	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA19239	0.44	0.44	0.081	0.05	nan	nan	0	1
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA19625	0.887	0.887	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA19648	1.157	1.157	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA20502	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	42838109	42838811	DEL	703	NA20845	0.471	0.471	0.06	0.048	nan	nan	0	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG00096	0.977	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG00268	0.59	0.541	0.0	0.05	0.592	0.618	1	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG00419	0.693	0.636	0.0	0.047	0.806	0.806	2	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG00759	1.094	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG01051	1.198	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG01112	0.564	0.518	0.0	0.034	0.688	0.688	1	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG01500	0.587	0.538	0.0	0.03	0.773	0.808	1	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.074	0.455	0.455	1	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG01583	0.745	0.683	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG01595	1.224	1.123	0.0	0.003	0.821	0.821	1	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG02568	1.096	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG02922	0.347	0.318	0.0	0.042	0.769	0.769	1	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG03006	1.196	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	0
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	HG03742	0.545	0.5	0.0	0.054	0.729	0.729	2	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA12878	1.167	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA18525	1.066	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA18939	0.817	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA19238	0.51	0.468	0.0	0.035	0.889	0.889	2	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA19625	0.391	0.359	0.0	0.04	0.9	0.9	1	1
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA19648	1.157	1.062	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA20502	0.967	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4324710	4324780	DEL	71	NA20845	0.494	0.453	0.0	0.027	0.777	0.777	2	2
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG00096	0.883	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG00268	0.411	0.472	0.0	0.055	0.778	0.745	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG00419	0.231	0.265	0.0	0.046	0.786	0.786	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG00759	0.547	0.628	0.0	0.023	0.429	0.429	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG01051	0.483	0.556	0.0	0.016	0.474	0.474	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG01112	1.016	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG01500	0.293	0.337	0.0	0.046	0.9	0.861	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG01565	0.365	0.419	0.0	0.052	0.875	0.875	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG01583	0.298	0.342	0.0	0.014	0.545	0.545	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG01595	0.892	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG01879	0.316	0.363	0.0	0.061	0.731	0.698	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG03052	0.438	0.504	0.0	0.039	0.571	0.571	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG03642	0.55	0.632	0.0	0.052	0.474	0.474	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	HG03742	0.868	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA18939	0.427	0.491	0.007	0.045	0.828	0.828	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA19239	0.387	0.444	0.0	0.047	0.909	0.909	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA19625	1.017	1.169	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA19648	0.386	0.443	0.0	0.053	0.929	0.929	1	1
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr18	43345201	43345281	DEL	81	NA20845	0.382	0.439	0.0	0.09	0.5	0.5	1	1
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG00419	0.84	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG00759	0.83	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG01051	0.925	0.864	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG01112	1.072	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG01565	1.267	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG01595	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG02568	0.822	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG02922	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG03006	1.046	0.978	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG03052	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	HG03742	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	NA12878	1.184	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	NA18939	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	NA19017	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	NA19238	0.563	0.527	0.0	0.043	0.655	0.655	1	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	NA19625	1.33	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	44715166	44715243	DUP	78	NA19648	0.823	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG00096	0.395	0.475	0.0	0.038	0.478	0.478	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG00268	0.893	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG01051	0.357	0.43	0.0	0.036	0.55	0.55	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG01112	0.245	0.295	0.0	0.042	0.438	0.438	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG01500	0.403	0.486	0.0	0.074	0.792	0.828	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG01583	0.348	0.419	0.0	0.02	nan	nan	0	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG01879	0.316	0.381	0.0	0.052	0.938	0.982	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG02568	0.626	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG02922	0.823	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	0
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG03052	0.636	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG03642	0.375	0.452	0.0	0.058	1.0	1.0	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	0
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA12878	0.383	0.462	0.0	0.054	0.957	0.957	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA18525	0.0	0.0	0.007	0.073	nan	nan	0	0
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA19017	0.476	0.573	0.0	0.041	0.704	0.704	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA19238	0.657	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA19239	0.373	0.45	0.0	0.029	0.462	0.462	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA19625	0.417	0.503	0.0	0.035	0.812	0.812	2	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA19648	0.334	0.403	0.0	0.046	0.812	0.812	1	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr18	46159351	46159429	DEL	79	NA20845	0.516	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG00096	0.771	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG00419	0.777	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG00759	0.648	0.589	0.008	0.0	0.471	0.471	1	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG01051	0.778	0.707	0.0	0.004	0.364	0.364	1	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG01112	0.339	0.308	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG01500	0.513	0.467	0.0	0.051	0.45	0.47	3	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG01565	0.515	0.468	0.0	0.051	0.759	0.759	2	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG01583	0.695	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG01595	0.664	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG01879	0.26	0.237	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG02568	0.744	0.676	0.0	0.018	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG02922	0.26	0.236	0.0	0.069	0.571	0.571	2	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG03006	0.803	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG03052	0.482	0.438	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG03642	0.35	0.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	HG03742	0.787	0.716	0.0	0.004	0.579	0.579	1	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA12878	0.801	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA18525	0.921	0.837	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA18939	0.78	0.709	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA19017	0.495	0.45	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA19238	0.496	0.451	0.0	0.055	0.796	0.796	2	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA19239	0.92	0.836	0.0	0.0	0.477	0.477	2	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA19625	0.443	0.403	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA19648	0.283	0.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA20502	0.236	0.215	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr18	46333864	46333970	DEL	107	NA20845	0.808	0.734	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG00096	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG00268	0.929	0.978	0.0	0.0	0.962	0.997	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG00419	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG00759	0.952	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG01051	0.967	1.018	0.0	0.0	0.607	0.607	2	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG01112	0.32	0.337	0.081	0.051	nan	nan	0	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG01500	0.632	0.666	0.063	0.042	0.783	0.818	1	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG01565	0.494	0.52	0.087	0.061	nan	nan	0	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG01583	0.844	0.889	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG01595	0.851	0.895	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG01879	0.781	0.822	0.0	0.0	0.529	0.555	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG02568	0.978	1.03	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG02922	0.498	0.524	0.086	0.054	0.778	0.778	1	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG03006	0.785	0.826	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG03052	0.57	0.6	0.072	0.053	nan	nan	0	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG03642	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	HG03742	0.505	0.531	0.062	0.038	nan	nan	0	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA12878	0.975	1.026	0.0	0.002	0.581	0.581	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA18525	0.939	0.989	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA18939	0.78	0.821	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA19017	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA19238	0.523	0.551	0.059	0.042	nan	nan	0	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA19239	0.587	0.618	0.087	0.038	nan	nan	0	1
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA19625	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA19648	1.286	1.353	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA20502	0.802	0.844	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chr18	4813612	4814505	DEL	894	NA20845	0.943	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG00096	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG00268	0.893	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG00419	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG00759	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG01051	0.883	0.929	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG01112	0.301	0.317	0.089	0.056	nan	nan	0	1
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG01500	0.55	0.579	0.064	0.043	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG01565	0.451	0.475	0.095	0.067	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG01583	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG01595	0.788	0.83	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG01879	0.818	0.861	0.0	0.0	0.529	0.555	1	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG02568	0.9	0.948	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG02922	0.455	0.479	0.087	0.057	nan	nan	0	1
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG03006	0.766	0.806	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG03052	0.482	0.508	0.063	0.057	nan	nan	0	1
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG03642	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	HG03742	0.464	0.489	0.057	0.04	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA12878	0.993	1.045	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA18525	0.993	1.046	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA18939	0.743	0.782	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA19017	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA19238	0.51	0.537	0.045	0.045	nan	nan	0	1
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA19239	0.56	0.589	0.073	0.042	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA19625	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA19648	1.286	1.353	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA20502	0.849	0.894	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr18	4813796	4814478	DEL	683	NA20845	0.92	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG00096	0.507	0.493	0.0	0.085	0.18	0.18	2	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG00268	0.608	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG00419	0.378	0.367	0.009	0.054	0.262	0.262	2	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG00759	0.972	0.944	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG01051	0.631	0.612	0.0	0.049	0.185	0.185	1	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG01112	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG01500	0.825	0.801	0.0	0.0	0.87	0.909	1	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG01565	0.58	0.563	0.0	0.065	0.368	0.368	1	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG01583	1.043	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG01595	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG01879	0.911	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG02568	0.391	0.38	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG02922	1.083	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG03006	0.56	0.544	0.0	0.067	0.227	0.227	4	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG03052	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG03642	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	HG03742	0.444	0.431	0.01	0.073	0.211	0.211	5	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA12878	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA18525	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA18939	0.575	0.559	0.0	0.069	0.321	0.321	1	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA19017	0.495	0.48	0.0	0.094	0.185	0.185	5	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA19238	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA19239	1.053	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA19625	0.6	0.582	0.0	0.081	0.409	0.409	1	1
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA19648	1.491	1.448	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA20502	1.227	1.191	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr18	49444746	49444902	DEL	157	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	0
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG00096	0.489	0.514	0.023	0.065	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG00268	0.429	0.451	0.018	0.093	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG00419	0.525	0.553	0.028	0.08	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG00759	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG01051	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG01112	0.0	0.0	0.046	0.282	nan	nan	0	0
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG01500	0.568	0.598	0.043	0.083	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG01565	0.322	0.339	0.041	0.096	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG01583	0.472	0.497	0.028	0.076	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG01595	0.975	1.026	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG01879	0.744	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG02568	1.213	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG02922	0.823	0.867	0.0	0.0	0.542	0.542	2	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG03006	0.411	0.433	0.024	0.072	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG03052	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG03642	0.55	0.579	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	HG03742	0.565	0.595	0.008	0.083	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA12878	0.479	0.504	0.008	0.06	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA18525	0.415	0.437	0.01	0.08	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA18939	0.984	1.036	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA19017	0.657	0.691	0.0	0.0	0.664	0.664	2	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA19238	0.402	0.424	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA19239	0.907	0.954	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA19625	1.043	1.098	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA19648	0.0	0.0	0.018	0.191	nan	nan	0	0
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA20502	0.0	0.0	0.066	0.198	nan	nan	0	0
chr18	4955590	4955987	DEL	398	NA20845	0.471	0.496	0.048	0.101	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG00096	0.507	0.493	0.033	0.106	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG00268	0.572	0.555	0.024	0.087	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG00419	0.441	0.428	0.11	0.104	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG00759	0.466	0.452	0.047	0.106	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG01051	0.378	0.367	0.042	0.111	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG01112	0.0	0.0	0.202	0.273	nan	nan	0	0
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG01500	0.678	0.659	0.032	0.057	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG01565	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG01583	0.819	0.795	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG01595	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG01879	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG02568	0.235	0.228	0.046	0.103	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG02922	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG03006	0.878	0.852	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG03052	0.68	0.66	0.048	0.11	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG03642	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	HG03742	1.171	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA12878	0.47	0.456	0.004	0.061	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA18525	0.47	0.456	0.018	0.103	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA18939	1.299	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA19017	0.476	0.462	0.042	0.065	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA19238	0.604	0.586	0.006	0.056	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA19239	0.987	0.958	0.0	0.0	0.902	0.902	1	2
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA19625	0.574	0.557	0.03	0.126	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA19648	0.617	0.599	0.042	0.04	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA20502	0.543	0.527	0.048	0.083	nan	nan	0	1
chr18	50462570	50463032	DEL	463	NA20845	0.696	0.675	0.05	0.029	nan	nan	0	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG00096	0.526	0.483	0.0	0.021	0.765	0.765	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG00268	0.25	0.23	0.0	0.011	0.864	0.828	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG00419	0.357	0.327	0.0	0.061	0.8	0.8	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG00759	0.466	0.427	0.0	0.038	0.87	0.87	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG01051	0.21	0.193	0.0	0.046	0.75	0.75	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG01112	1.185	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG01500	0.385	0.353	0.0	0.005	0.778	0.813	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG01565	0.623	0.571	0.0	0.035	0.689	0.689	2	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG01879	0.716	0.657	0.0	0.032	0.395	0.414	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG02568	0.939	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG02922	0.823	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG03006	0.392	0.36	0.0	0.048	0.857	0.857	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG03052	0.811	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr18	50930750	50930811	DEL	62	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA12878	0.784	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA18525	1.102	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA18939	0.52	0.477	0.0	0.018	0.75	0.75	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA19017	1.408	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA19238	0.899	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA19239	1.08	0.991	0.0	0.0	0.558	0.558	1	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA19625	0.861	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA19648	0.643	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA20502	0.33	0.303	0.0	0.028	0.727	0.727	1	1
chr18	50930750	50930811	DEL	62	NA20845	1.077	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG00096	0.864	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG00268	0.0	0.0	0.007	0.04	nan	nan	0	0
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG00419	0.84	0.933	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG00759	0.952	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG01051	0.799	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG01112	0.414	0.46	0.0	0.038	0.448	0.448	1	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG01500	0.605	0.672	0.0	0.03	0.6	0.627	1	1
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG01565	0.859	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG01583	0.993	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG01595	0.705	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG01879	0.316	0.351	0.0	0.05	0.909	0.952	1	1
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG02568	0.587	0.652	0.0	0.02	0.6	0.6	1	1
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG02922	0.758	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG03006	0.43	0.477	0.0	0.031	0.556	0.556	1	1
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG03052	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG03642	0.625	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	HG03742	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA12878	1.08	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA18525	0.704	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA18939	0.668	0.743	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA19017	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA19238	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA19239	0.827	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA19625	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA19648	0.72	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA20502	0.849	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	51319565	51319639	DEL	75	NA20845	0.785	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG00096	0.545	0.545	0.062	0.015	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG00268	0.465	0.465	0.077	0.04	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG00419	0.483	0.483	0.034	0.022	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG00759	0.567	0.567	0.059	0.034	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG01051	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG01112	0.865	0.865	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG01500	0.532	0.532	0.046	0.024	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG01565	1.052	1.052	0.004	0.0	0.674	0.674	2	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG01583	0.348	0.348	0.096	0.028	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG01595	0.0	0.0	0.152	0.055	nan	nan	0	0
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG01879	1.097	1.097	0.0	0.0	0.882	0.924	1	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG02568	1.096	1.096	0.0	0.0	0.662	0.662	2	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG02922	0.867	0.867	0.0	0.0	0.839	0.839	2	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG03006	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG03052	0.548	0.548	0.048	0.011	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG03642	0.925	0.925	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	HG03742	0.868	0.868	0.0	0.0	0.621	0.621	1	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA12878	0.975	0.975	0.003	0.0	0.807	0.807	2	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA18525	0.397	0.397	0.068	0.031	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA18939	0.0	0.0	0.158	0.099	nan	nan	0	0
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA19017	0.837	0.837	0.0	0.0	0.648	0.648	2	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA19238	1.127	1.127	0.0	0.0	0.661	0.661	2	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA19239	0.547	0.547	0.089	0.029	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA19625	0.496	0.496	0.06	0.039	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA19648	0.437	0.437	0.076	0.027	nan	nan	0	1
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA20502	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5209658	5210654	DEL	997	NA20845	1.032	1.032	0.004	0.0	0.632	0.632	1	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG00268	0.375	0.431	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG00419	0.567	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG00759	0.81	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG01051	0.42	0.483	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG01565	0.386	0.444	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG01583	0.869	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG01595	0.405	0.465	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG01879	0.39	0.449	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG02568	0.783	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG02922	0.65	0.747	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG03006	0.635	0.73	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG03052	0.438	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG03642	0.8	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	HG03742	0.444	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA12878	0.383	0.44	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA18525	0.361	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA18939	0.353	0.405	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA19017	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA19238	0.496	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA19625	0.704	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA20502	0.378	0.434	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5325026	5325315	DEL	290	NA20845	0.359	0.413	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG00096	0.714	0.714	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG00268	0.911	0.911	0.0	0.0	0.875	0.913	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG00419	1.239	1.239	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG00759	1.013	1.013	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG01051	0.967	0.967	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG01112	1.11	1.11	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG01500	0.917	0.917	0.0	0.0	0.96	0.918	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG01565	0.837	0.837	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG01583	0.72	0.72	0.011	0.0	0.533	0.533	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG01595	1.1	1.1	0.0	0.0	0.464	0.464	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG01879	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG02568	0.744	0.744	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG02922	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG03006	1.196	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG03052	1.206	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG03642	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	HG03742	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA12878	1.271	1.271	0.0	0.007	0.5	0.5	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA18525	0.849	0.849	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA18939	0.724	0.724	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA19017	0.894	0.894	0.0	0.0	0.621	0.621	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA19238	0.443	0.443	0.0	0.025	0.463	0.463	1	1
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA19239	0.827	0.827	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA19625	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA19648	0.694	0.694	0.0	0.0	0.368	0.368	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA20502	1.015	1.015	0.008	0.0	0.955	0.955	1	2
chr18	5352035	5352095	DEL	61	NA20845	0.651	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG00096	0.601	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG00268	0.733	0.771	0.0	0.004	0.667	0.639	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG00419	0.651	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG00759	0.851	0.895	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG01051	0.631	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG01112	0.489	0.515	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG01500	0.623	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG01565	0.751	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG01583	0.67	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG01595	0.705	0.743	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG01879	0.614	0.646	0.0	0.0	0.81	0.773	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG02568	0.431	0.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG02922	0.672	0.707	0.0	0.0	0.588	0.588	2	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG03006	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG03052	0.504	0.531	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG03642	0.625	0.658	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	HG03742	0.868	0.914	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA12878	0.418	0.44	0.02	0.024	nan	nan	0	1
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA18525	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA18939	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA19017	0.951	1.002	0.0	0.0	0.798	0.798	2	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA19238	0.724	0.763	0.0	0.003	0.667	0.667	1	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA19239	0.787	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA19625	0.469	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA19648	0.746	0.785	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA20502	0.496	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54244955	54245645	DEL	691	NA20845	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG00096	0.545	0.545	0.0	0.044	0.205	0.205	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG00268	0.643	0.643	0.0	0.063	0.462	0.482	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG00419	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG00759	1.013	1.013	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG01051	0.483	0.483	0.0	0.042	0.379	0.379	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG01112	0.414	0.414	0.0	0.091	0.633	0.633	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG01565	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG01583	1.216	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG01595	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG01879	0.762	0.762	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG02568	0.665	0.665	0.0	0.046	0.368	0.368	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG02922	1.192	1.192	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG03006	0.71	0.71	0.0	0.076	0.744	0.744	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG03052	0.57	0.57	0.0	0.037	0.27	0.27	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG03642	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	HG03742	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA12878	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA18525	0.47	0.47	0.0	0.086	0.676	0.676	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA18939	0.427	0.427	0.0	0.089	0.833	0.833	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA19017	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA19238	0.805	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA19239	0.853	0.853	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA19625	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA19648	0.771	0.771	0.0	0.05	0.333	0.333	1	1
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA20502	1.133	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5457105	5457205	DEL	101	NA20845	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG00096	0.883	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG00268	0.751	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG00419	1.239	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG00759	0.911	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG01051	0.504	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG01112	0.64	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG01500	0.862	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG01565	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG01583	0.943	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG01595	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG01879	0.725	0.806	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG02568	0.939	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG02922	0.0	0.0	0.01	0.189	nan	nan	0	0
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG03006	1.065	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG03052	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG03642	1.05	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	HG03742	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA12878	0.871	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA18525	0.903	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA18939	0.78	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA19017	0.476	0.529	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA19238	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA19239	0.947	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA19625	0.887	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA19648	0.9	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA20502	0.897	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	54741721	54741930	DEL	210	NA20845	0.785	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG00096	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG00268	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG00419	0.714	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG00759	1.175	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG01051	0.904	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG01112	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG01500	1.027	0.997	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG01565	1.159	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG01583	1.068	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG01879	0.837	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG02568	0.431	0.418	0.0	0.065	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG02922	0.498	0.484	0.0	0.055	0.346	0.346	2	1
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG03006	0.374	0.363	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG03052	0.504	0.489	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG03642	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	HG03742	1.171	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA12878	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA18525	0.921	0.894	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA18939	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA19017	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA19238	0.577	0.56	0.0	0.063	0.242	0.242	3	1
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA19239	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA19625	0.678	0.658	0.005	0.069	0.235	0.235	2	1
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA19648	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA20502	1.369	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	5492281	5492519	DEL	239	NA20845	0.539	0.523	0.0	0.045	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG00096	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG00268	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG00419	1.134	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG00759	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG01051	0.462	0.487	0.0	0.033	0.889	0.889	1	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG01112	0.809	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG01500	1.008	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG01565	0.88	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG01583	1.167	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG01595	1.058	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG01879	0.353	0.372	0.0	0.03	0.783	0.747	1	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG02568	0.47	0.494	0.0	0.032	0.786	0.786	1	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG02922	0.607	0.639	0.0	0.004	0.301	0.301	2	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG03006	0.616	0.649	0.0	0.021	0.733	0.733	1	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG03052	0.767	0.808	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG03642	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	HG03742	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA12878	0.557	0.587	0.0	0.015	0.462	0.462	1	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA18525	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA18939	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA19017	1.028	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA19238	0.684	0.72	0.0	0.01	0.667	0.667	1	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA19239	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA19625	0.183	0.192	0.0	0.017	0.615	0.615	1	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA19648	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA20502	0.307	0.323	0.0	0.011	0.833	0.833	1	1
chr18	55271044	55271094	DEL	51	NA20845	0.785	0.827	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG00096	0.451	0.501	0.0	0.009	0.536	0.536	2	1
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG00268	0.715	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG00419	0.735	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG00759	0.628	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG01051	0.631	0.701	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG01112	0.696	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG01500	1.192	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG01565	0.515	0.572	0.0	0.017	0.913	0.913	1	1
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG01583	0.174	0.193	0.0	0.01	0.75	0.75	1	1
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG01595	0.456	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG01879	0.8	0.888	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG02568	0.431	0.478	0.0	0.02	1.0	1.0	1	1
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG02922	0.542	0.602	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG03006	0.99	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG03052	0.811	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG03642	0.625	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	HG03742	0.585	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA12878	0.853	0.948	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA18525	1.048	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA18939	0.724	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA19017	0.419	0.465	0.0	0.014	1.0	1.0	1	1
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA19238	0.523	0.581	0.0	0.009	0.848	0.848	1	1
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA19239	1.013	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA19625	0.626	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA19648	0.617	0.686	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA20502	0.59	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57042133	57042185	DEL	53	NA20845	0.673	0.748	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG00096	0.902	0.95	0.0	0.0	0.909	0.909	3	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG00268	0.608	0.64	0.0	0.0	0.718	0.719	2	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG00419	0.924	0.972	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG00759	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG01051	0.841	0.885	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG01112	0.677	0.713	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG01500	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG01565	0.794	0.836	0.0	0.0	0.608	0.608	2	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG01583	0.72	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG01595	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG01879	0.967	1.018	0.0	0.0	0.588	0.616	1	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG02568	1.057	1.112	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG02922	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG03006	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG03052	0.373	0.392	0.058	0.023	nan	nan	0	1
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG03642	0.8	0.842	0.0	0.0	0.412	0.412	1	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	HG03742	0.767	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA12878	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA18525	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA18939	0.724	0.762	0.0	0.0	0.95	0.95	3	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA19017	0.457	0.481	0.082	0.039	0.2	0.2	1	1
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA19238	0.429	0.452	0.08	0.043	nan	nan	0	1
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA19239	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA19625	0.574	0.604	0.0	0.0	0.587	0.587	2	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA19648	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA20502	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	57546791	57547705	DEL	915	NA20845	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG00096	1.128	1.095	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG00268	1.278	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG00419	1.302	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG00759	0.962	0.934	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG01051	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG01112	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG01500	0.477	0.463	0.028	0.018	nan	nan	0	1
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG01565	1.052	1.021	0.0	0.0	0.2	0.2	1	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG01583	0.099	0.096	0.144	0.076	nan	nan	0	0
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG01595	1.1	1.068	0.01	0.0	0.812	0.812	1	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG01879	1.246	1.21	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG02568	0.705	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG02922	1.083	1.052	0.0	0.004	1.0	1.0	1	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG03006	1.046	1.016	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG03052	0.811	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG03642	1.325	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	HG03742	1.211	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA12878	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA18525	1.174	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA18939	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA19017	0.951	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA19238	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA19239	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA19625	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA19648	1.106	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA20502	0.944	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	58672178	58672862	DEL	685	NA20845	0.224	0.218	0.142	0.055	nan	nan	0	0
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG00096	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG00268	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG00419	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG00759	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG01051	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG01112	1.129	1.129	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG01500	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG01565	1.353	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG01583	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG01595	1.162	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG01879	1.144	1.144	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG02568	1.252	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG02922	1.127	1.127	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG03006	1.326	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG03052	0.723	0.723	0.0	0.042	0.432	0.432	1	1
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG03642	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	HG03742	1.312	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA12878	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA18525	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA18939	1.374	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA19017	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA19238	0.389	0.389	0.0	0.015	0.706	0.706	1	1
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA19239	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA19625	1.122	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA19648	1.491	1.491	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA20502	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	59769720	59769781	DEL	62	NA20845	1.145	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG00096	1.034	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG00268	0.661	0.87	0.0	0.0	0.8	0.767	3	1
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG00419	0.798	1.05	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG00759	0.648	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG01051	0.736	0.968	0.0	0.017	0.769	0.769	3	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG01112	1.053	1.386	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG01500	0.862	1.134	0.0	0.0	0.542	0.566	3	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG01565	0.923	1.215	0.0	0.005	0.632	0.632	3	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG01583	0.819	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG01595	0.664	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.018	nan	nan	0	0
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG02568	1.135	1.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG02922	0.823	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG03006	0.859	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG03052	0.373	0.49	0.0	0.012	0.933	0.933	1	1
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG03642	0.55	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	HG03742	0.949	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA12878	0.94	1.237	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA18525	1.066	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA18939	1.021	1.343	0.0	0.0	0.741	0.741	3	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA19017	1.047	1.377	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA19238	0.738	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA19239	0.893	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA19625	0.522	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA19648	0.874	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA20502	0.849	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	60812584	60812634	DEL	51	NA20845	0.651	0.856	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG00268	1.054	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG00759	1.114	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG01051	1.03	1.0	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG01565	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG01879	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG02568	0.783	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG02922	1.213	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG03006	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG03052	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	HG03742	0.949	0.921	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA18525	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA18939	1.114	1.081	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA19017	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA19238	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA19239	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA19648	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA20502	1.416	1.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	62996845	62996926	DUP	82	NA20845	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG00096	1.071	1.071	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG00268	1.465	1.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG00419	0.294	0.294	0.0	0.052	0.889	0.889	1	1
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG00759	1.195	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG01051	0.609	0.609	0.0	0.045	0.786	0.786	1	1
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG01112	0.47	0.47	0.0	0.073	0.897	0.897	1	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG01500	1.302	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG01565	1.524	1.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG01583	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG01595	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG01879	0.456	0.456	0.0	0.061	0.5	0.524	1	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG02568	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG02922	0.628	0.628	0.0	0.04	0.5	0.5	1	1
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG03006	1.102	1.102	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG03052	0.921	0.921	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG03642	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	HG03742	1.252	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA12878	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA18525	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA18939	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA19017	0.78	0.78	0.0	0.042	0.375	0.375	1	1
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	1
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA19239	0.547	0.547	0.0	0.073	0.75	0.75	1	1
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA19625	0.339	0.339	0.0	0.041	0.562	0.563	1	1
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA19648	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA20502	0.425	0.425	0.0	0.033	0.5	0.5	1	2
chr18	63208226	63208321	DEL	96	NA20845	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG00096	0.996	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG00268	1.269	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG00419	0.945	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG00759	0.668	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG01051	1.261	1.157	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG01112	1.091	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG01500	0.935	0.858	0.0	0.007	0.591	0.618	1	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG01565	1.288	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG01583	1.192	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG01595	1.058	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG01879	1.004	0.921	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG02568	1.331	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG02922	0.91	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG03006	1.42	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG03052	1.315	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG03642	1.25	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	HG03742	0.888	0.815	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA12878	0.697	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA18525	1.048	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA18939	1.374	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA19017	1.294	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA19238	1.113	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA19239	0.867	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA19625	0.548	0.503	0.0	0.016	0.824	0.824	1	1
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA19648	1.286	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA20502	0.873	0.801	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	63911475	63911537	DEL	63	NA20845	1.526	1.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG00096	0.958	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG00268	1.269	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG00419	1.071	1.001	0.006	0.004	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG00759	1.357	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG01051	1.072	1.002	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG01112	1.279	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG01500	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG01565	1.138	1.063	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG01583	1.216	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG01595	1.432	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG01879	1.246	1.164	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG02568	1.096	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG02922	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG03006	1.102	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG03052	0.964	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG03642	1.325	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	HG03742	1.332	1.245	0.005	0.006	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA12878	0.94	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA18525	1.21	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA18939	1.169	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA19017	0.704	0.658	0.028	0.036	nan	nan	0	1
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA19238	1.355	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA19239	1.187	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA19625	0.6	0.561	0.03	0.043	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA19648	0.926	0.865	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA20502	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	64049209	64049722	DEL	514	NA20845	1.167	1.091	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG00096	0.733	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG00268	0.929	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG00419	0.987	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG00759	0.344	0.316	0.0	0.033	0.842	0.842	1	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG01051	1.261	1.157	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG01112	0.903	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG01500	0.99	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG01565	0.537	0.492	0.0	0.03	0.667	0.667	1	1
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG01583	0.596	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG01595	0.975	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG01879	0.948	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG02568	1.331	1.221	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG02922	0.91	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG03006	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG03052	1.271	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG03642	0.95	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	HG03742	0.646	0.593	0.006	0.04	0.629	0.629	1	1
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA12878	0.958	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA18525	1.12	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA18939	0.538	0.494	0.0	0.032	0.389	0.389	1	1
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA19017	0.99	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA19238	1.06	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA19239	1.12	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA19625	0.887	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA19648	0.669	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA20502	0.873	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66073258	66073326	DEL	69	NA20845	0.965	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG00096	0.282	0.282	0.0	0.039	0.88	0.88	1	1
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG00268	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG00419	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG00759	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG01051	0.694	0.694	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG01112	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG01500	0.678	0.678	0.0	0.004	0.471	0.492	1	1
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG01565	0.902	0.902	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG01583	1.167	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG01595	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG01879	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG02922	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG03006	0.635	0.635	0.0	0.018	0.475	0.475	1	1
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG03052	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG03642	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	HG03742	1.252	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA12878	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA18525	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA18939	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA19017	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA19238	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA19239	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA19625	1.226	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA19648	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA20502	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66082127	66082181	DEL	55	NA20845	1.167	1.167	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG00096	0.921	0.921	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG00268	1.001	1.001	0.0	0.0	0.5	0.479	2	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG00419	0.588	0.588	0.008	0.111	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG00759	0.0	0.0	0.057	0.242	nan	nan	0	0
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG01051	0.715	0.715	0.026	0.101	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG01112	0.696	0.696	0.026	0.1	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG01500	0.403	0.403	0.025	0.098	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG01565	0.923	0.923	0.007	0.0	0.947	0.947	2	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG01583	0.546	0.546	0.045	0.063	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG01595	0.0	0.0	0.066	0.244	nan	nan	0	0
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG01879	0.762	0.762	0.024	0.075	0.324	0.339	1	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG02568	0.587	0.587	0.014	0.092	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG02922	0.953	0.953	0.0	0.0	0.588	0.588	2	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG03006	0.785	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG03052	0.46	0.46	0.02	0.11	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG03642	0.5	0.5	0.006	0.057	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	HG03742	0.0	0.0	0.078	0.266	nan	nan	0	0
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA12878	0.453	0.453	0.013	0.069	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA18525	0.795	0.795	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA18939	0.0	0.0	0.019	0.198	nan	nan	0	0
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA19017	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA19238	0.885	0.885	0.0	0.0	0.985	0.985	2	2
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA19239	0.427	0.427	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA19625	0.313	0.313	0.02	0.106	nan	nan	0	1
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA19648	0.0	0.0	0.039	0.267	nan	nan	0	0
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA20502	0.0	0.0	0.047	0.228	nan	nan	0	0
chr18	66228960	66229340	DEL	381	NA20845	0.516	0.516	0.021	0.098	nan	nan	0	1
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG00096	0.658	0.692	0.0	0.0	0.765	0.765	3	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG00268	0.893	0.941	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG00419	0.903	0.95	0.006	0.0	0.357	0.357	1	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG00759	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG01051	0.757	0.796	0.0	0.0	0.355	0.355	2	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG01112	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG01500	0.77	0.81	0.0	0.0	0.769	0.804	3	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG01565	0.301	0.316	0.094	0.068	nan	nan	0	1
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG01583	0.943	0.993	0.0	0.0	0.737	0.737	3	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG01595	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG01879	0.985	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG02568	0.783	0.824	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG02922	0.997	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG03006	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG03052	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG03642	1.15	1.211	0.004	0.0	0.929	0.929	2	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	HG03742	0.868	0.914	0.0	0.004	0.655	0.655	3	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA12878	0.94	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA18525	0.885	0.932	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA18939	0.78	0.821	0.0	0.0	0.594	0.594	1	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA19017	0.533	0.561	0.081	0.046	nan	nan	0	1
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA19238	0.939	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA19239	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA19625	0.756	0.796	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA19648	0.823	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA20502	1.062	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	68904095	68904783	DEL	689	NA20845	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.182	nan	nan	0	1
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG00268	1.287	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG00419	1.26	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.252	nan	nan	0	0
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG01051	1.324	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG01112	1.58	1.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG01500	0.642	0.589	0.0	0.09	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG01565	1.353	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG01583	1.49	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG01595	0.519	0.476	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG01879	1.339	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG02568	1.135	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG02922	1.538	1.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.251	nan	nan	0	0
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG03052	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG03642	0.55	0.505	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr18	70353219	70353421	DEL	203	HG03742	0.505	0.463	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.18	nan	nan	0	0
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA18939	0.594	0.545	0.004	0.107	nan	nan	0	1
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA19017	1.218	1.117	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA19238	1.368	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA19239	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA19625	1.461	1.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA19648	1.157	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA20502	1.133	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	70353219	70353421	DEL	203	NA20845	1.279	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG00096	0.432	0.497	0.005	0.077	nan	nan	0	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG00268	0.322	0.37	0.005	0.135	nan	nan	0	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG00419	0.441	0.507	0.029	0.068	0.31	0.31	1	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG00759	0.749	0.861	0.011	0.084	nan	nan	0	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG01051	0.462	0.531	0.03	0.043	nan	nan	0	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG01112	0.451	0.519	0.016	0.116	nan	nan	0	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG01500	0.99	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG01565	0.859	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG01583	1.018	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG01595	0.0	0.0	0.023	0.206	nan	nan	0	0
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG01879	0.781	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG02568	0.978	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG02922	0.845	0.971	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG03006	0.971	1.117	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG03052	0.964	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG03642	0.55	0.632	0.032	0.075	nan	nan	0	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	HG03742	0.0	0.0	0.055	0.226	nan	nan	0	0
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA12878	0.505	0.58	0.0	0.11	0.375	0.375	1	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA18525	0.759	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA18939	0.39	0.448	0.021	0.096	nan	nan	0	1
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA19017	0.856	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA19238	0.926	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA19239	0.813	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA19625	0.965	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA19648	1.183	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA20502	0.849	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73901640	73902034	DEL	395	NA20845	0.853	0.98	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG00096	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG00268	0.947	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG00419	1.008	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG00759	0.851	0.945	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG01051	0.778	0.864	0.007	0.005	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG01112	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG01500	0.587	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG01565	1.138	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG01583	1.068	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG01595	0.602	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG01879	0.893	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG02568	1.213	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG02922	0.65	0.722	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG03006	0.616	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG03052	0.723	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG03642	1.025	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	HG03742	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA12878	0.731	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA18525	0.921	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA18939	0.761	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA19017	0.324	0.359	0.0	0.025	0.611	0.611	1	1
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA19238	0.859	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA19239	0.827	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA19625	1.069	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA19648	1.029	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA20502	0.708	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	73967332	73967382	DEL	51	NA20845	0.673	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG00096	0.46	0.485	0.097	0.039	nan	nan	0	1
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG00268	1.001	1.053	0.0	0.0	0.895	0.934	3	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG00419	0.798	0.84	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG00759	1.053	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG01051	0.841	0.885	0.0	0.002	0.913	0.913	2	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG01112	0.865	0.911	0.0	0.0	0.673	0.673	4	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG01500	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG01565	0.365	0.384	0.041	0.031	nan	nan	0	1
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG01583	1.092	1.15	0.0	0.0	0.91	0.91	4	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG01595	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG01879	0.893	0.94	0.0	0.0	0.864	0.905	1	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG02568	0.705	0.742	0.0	0.0	0.631	0.631	4	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG02922	0.867	0.912	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG03006	0.747	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG03052	0.899	0.946	0.0	0.0	0.83	0.83	4	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG03642	1.0	1.053	0.0	0.0	0.588	0.588	5	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	HG03742	0.888	0.935	0.0	0.0	0.828	0.828	5	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA12878	0.279	0.293	0.077	0.034	nan	nan	0	1
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA18525	0.975	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA18939	0.872	0.918	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA19017	0.875	0.921	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA19238	1.006	1.059	0.0	0.0	0.766	0.766	5	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA19239	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA19625	0.965	1.016	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA19648	1.08	1.137	0.0	0.0	0.685	0.685	4	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA20502	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74347197	74348009	DEL	813	NA20845	0.471	0.496	0.064	0.03	nan	nan	0	1
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG00096	0.789	0.877	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG00268	0.893	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG00419	0.735	0.816	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG00759	0.77	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG01051	0.652	0.724	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG01112	0.828	0.92	0.0	0.0	0.917	0.917	4	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG01500	0.403	0.448	0.117	0.0	0.8	0.836	1	1
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG01565	0.794	0.883	0.0	0.0	0.489	0.489	8	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG01583	1.018	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG01595	0.498	0.553	0.011	0.0	1.0	1.0	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG01879	0.614	0.682	0.0	0.0	0.905	0.919	4	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG02568	1.018	1.131	0.006	0.0	0.417	0.417	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG02922	1.018	1.131	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG03006	0.841	0.934	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG03052	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG03642	0.375	0.417	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	74407967	74408541	DEL	575	HG03742	0.545	0.606	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA12878	1.062	1.18	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA18525	0.542	0.602	0.055	0.0	0.348	0.348	1	1
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA18939	0.78	0.866	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA19017	0.761	0.846	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA19238	0.751	0.835	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA19239	0.88	0.978	0.0	0.002	0.91	0.91	2	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA19625	0.991	1.101	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA19648	0.823	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA20502	0.967	1.075	0.0	0.0	0.858	0.858	2	2
chr18	74407967	74408541	DEL	575	NA20845	0.741	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG00096	0.169	0.204	0.026	0.128	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG00268	0.179	0.215	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG00419	0.084	0.101	0.012	0.127	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG00759	0.344	0.415	0.0	0.167	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG01051	0.473	0.57	0.0	0.232	nan	nan	0	0
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG01112	0.188	0.227	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG01500	0.348	0.42	0.03	0.208	nan	nan	0	0
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG01565	0.301	0.362	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG01583	0.074	0.09	0.019	0.116	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG01595	0.228	0.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG01879	0.409	0.493	0.0	0.227	nan	nan	0	0
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG02568	0.822	0.99	0.0	0.235	nan	nan	0	0
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG02922	0.477	0.574	0.013	0.217	nan	nan	0	0
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG03006	0.224	0.27	0.01	0.085	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG03052	0.351	0.423	0.0	0.123	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG03642	0.225	0.271	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	HG03742	0.101	0.122	0.011	0.115	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA12878	0.157	0.189	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA18525	0.578	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA18939	0.13	0.157	0.0	0.146	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA19017	0.209	0.252	0.0	0.11	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA19238	0.51	0.614	0.0	0.208	nan	nan	0	0
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA19239	0.24	0.289	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA19625	0.235	0.283	0.012	0.123	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA19648	0.579	0.697	0.0	0.201	nan	nan	0	1
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA20502	0.26	0.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	74769770	74770071	DEL	302	NA20845	0.382	0.46	0.016	0.194	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG00096	0.601	0.584	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG01051	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG01500	0.495	0.481	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG01565	0.386	0.375	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG02922	0.477	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG03052	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG03642	0.425	0.413	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	75267029	75267561	DEL	533	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA19238	1.154	1.12	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA19239	0.48	0.466	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA19625	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA19648	0.591	0.574	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	75267029	75267561	DEL	533	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG00096	0.319	0.336	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG00268	0.751	0.79	0.0	0.0	0.5	0.522	3	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG00419	0.588	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG00759	0.506	0.533	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG01051	0.652	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG01112	0.602	0.634	0.0	0.0	0.598	0.598	2	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG01500	0.788	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG01565	0.644	0.678	0.0	0.003	0.688	0.688	1	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG01583	0.596	0.627	0.0	0.0	0.412	0.412	1	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG01595	0.332	0.349	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG01879	0.651	0.685	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG02568	0.509	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG02922	0.693	0.73	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG03006	0.71	0.747	0.005	0.0	0.778	0.778	3	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG03052	0.658	0.692	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG03642	0.8	0.842	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	HG03742	0.646	0.68	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA12878	0.366	0.385	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA18525	0.993	1.046	0.004	0.0	0.737	0.737	2	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA18939	0.668	0.703	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA19017	0.59	0.621	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA19238	0.657	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA19239	0.747	0.786	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA19625	0.756	0.796	0.0	0.0	0.594	0.594	2	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA19648	0.643	0.677	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA20502	0.661	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	76664254	76665058	DEL	805	NA20845	0.561	0.591	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG00096	0.902	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG00268	0.465	0.489	0.0	0.013	0.655	0.684	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG00419	0.609	0.641	0.0	0.004	0.731	0.731	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG00759	0.365	0.384	0.0	0.012	1.0	1.0	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG01051	0.609	0.642	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG01112	0.0	0.0	0.01	0.04	nan	nan	0	0
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG01500	0.367	0.386	0.0	0.058	0.917	0.877	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG01565	0.236	0.249	0.0	0.007	0.909	0.909	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG01583	0.273	0.287	0.0	0.025	0.875	0.875	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG01879	0.428	0.45	0.0	0.018	0.792	0.829	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG02568	0.352	0.371	0.0	0.015	0.875	0.875	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG02922	0.715	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG03052	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA12878	0.435	0.458	0.0	0.023	0.926	0.926	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA18525	1.048	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA18939	0.668	0.703	0.0	0.02	0.659	0.659	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA19017	0.228	0.24	0.0	0.037	0.733	0.733	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA19238	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA19239	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA19625	0.287	0.302	0.0	0.02	1.0	1.0	1	1
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA19648	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA20502	0.897	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	77792972	77793024	DEL	53	NA20845	0.583	0.614	0.0	0.028	0.389	0.389	1	1
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG00096	0.846	0.89	0.0	0.003	1.0	1.0	1	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG00268	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG00419	0.693	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG00759	0.952	1.002	0.0	0.0	0.7	0.7	2	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG01051	0.862	0.907	0.006	0.0	0.846	0.846	1	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG01112	0.734	0.772	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG01500	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG01565	0.73	0.768	0.0	0.004	0.9	0.9	1	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG01583	1.018	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG01595	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG01879	0.8	0.842	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG02568	0.939	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG02922	0.477	0.502	0.039	0.008	0.267	0.267	13	1
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG03006	0.971	1.023	0.0	0.0	0.503	0.503	2	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG03052	0.767	0.808	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG03642	0.9	0.948	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	HG03742	0.868	0.914	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA12878	0.766	0.806	0.0	0.0	0.551	0.551	2	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA18525	0.903	0.951	0.0	0.0	0.644	0.644	2	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA18939	0.854	0.899	0.0	0.0	0.881	0.881	2	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA19017	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA19238	0.818	0.861	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA19239	0.84	0.884	0.0	0.0	0.888	0.888	2	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA19625	0.835	0.879	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA19648	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA20502	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9111533	9112128	DEL	596	NA20845	0.92	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG00096	0.507	0.564	0.011	0.06	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG00268	0.0	0.0	0.029	0.119	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG00419	0.0	0.0	0.037	0.074	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG00759	0.506	0.563	0.015	0.067	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG01051	0.441	0.49	0.012	0.052	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG01112	0.0	0.0	0.052	0.117	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG01500	0.0	0.0	0.015	0.146	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG01565	0.58	0.644	0.031	0.045	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG01583	0.0	0.0	0.029	0.085	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG01595	0.0	0.0	0.069	0.132	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG01879	0.0	0.0	0.024	0.124	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG02568	0.978	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG02922	0.0	0.0	0.051	0.161	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG03006	0.579	0.643	0.042	0.065	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG03052	0.351	0.39	0.015	0.051	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG03642	0.5	0.556	0.009	0.067	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	HG03742	0.262	0.292	0.016	0.05	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA12878	0.366	0.406	0.007	0.045	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA18525	0.524	0.582	0.031	0.058	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA18939	0.427	0.474	0.005	0.052	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA19017	1.085	1.205	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA19238	0.416	0.462	0.009	0.065	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA19239	0.44	0.489	0.004	0.065	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA19625	0.261	0.29	0.017	0.046	nan	nan	0	1
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA19648	0.0	0.0	0.075	0.094	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA20502	0.0	0.0	0.026	0.149	nan	nan	0	0
chr18	9225123	9225460	DEL	338	NA20845	0.0	0.0	0.015	0.086	nan	nan	0	0
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG00096	0.302	0.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG00268	0.307	0.324	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG00419	0.121	0.128	0.0	0.036	0.727	0.727	2	1
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG00759	0.151	0.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG01051	0.269	0.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG01112	0.164	0.173	0.0	0.032	1.0	1.0	2	1
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG01500	0.457	0.481	0.0	0.0	0.318	0.318	1	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG01565	0.321	0.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG01583	0.339	0.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG01595	0.393	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG01879	0.289	0.304	0.009	0.012	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG02568	0.166	0.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG02922	0.026	0.027	0.0	0.007	nan	nan	0	1
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG03006	0.22	0.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG03052	0.233	0.245	0.0	0.051	0.5	0.5	4	1
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG03642	0.159	0.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	HG03742	0.146	0.154	0.0	0.079	1.0	0.933	2	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA12878	0.278	0.293	0.0	0.0	0.5	0.526	1	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA18525	0.591	0.622	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA18939	0.24	0.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA19017	0.33	0.347	0.0	0.027	0.55	0.584	3	1
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA19238	0.378	0.398	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA19239	0.14	0.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA19625	0.27	0.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA19648	0.174	0.183	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA20502	0.266	0.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10839734	10839861	DEL	128	NA20845	0.335	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG00096	1.165	1.339	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG00268	0.82	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG00419	0.995	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG00759	0.755	0.868	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG01051	0.62	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG01112	0.821	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG01500	0.762	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG01565	0.642	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG01583	0.847	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG01595	1.101	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG01879	1.201	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG02568	0.789	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG02922	0.671	0.771	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG03006	1.209	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG03052	0.466	0.535	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG03642	0.54	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	HG03742	0.827	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA12878	1.057	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA18525	0.762	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA18939	0.763	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA19017	0.858	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA19238	0.883	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA19239	0.638	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA19625	0.901	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA19648	0.61	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA20502	0.771	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	10991507	10991637	DEL	131	NA20845	1.03	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG00096	0.798	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG00268	0.533	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG00419	1.092	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG00759	0.856	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG01051	0.485	0.558	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG01112	0.375	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG01500	0.457	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG01565	0.84	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG01583	0.931	1.071	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG01595	0.891	1.025	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG01879	0.567	0.652	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG02568	1.453	1.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG02922	0.878	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG03006	0.813	0.935	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG03052	0.647	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG03642	0.603	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	HG03742	0.876	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA12878	0.945	1.087	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA18525	1.019	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA18939	1.025	1.178	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA19017	0.858	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA19238	0.82	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA19239	0.98	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA19625	0.946	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA19648	0.77	0.885	0.0	0.028	0.385	0.385	1	1
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA20502	0.426	0.489	0.0	0.014	0.778	0.778	1	1
chr19	1134454	1134515	DEL	62	NA20845	1.185	1.362	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG00096	1.51	1.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG00268	1.209	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG00419	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG00759	1.057	1.057	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG01051	1.347	1.347	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG01112	1.126	1.126	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG01500	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG01565	1.334	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG01583	1.016	1.016	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG01595	1.18	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG01879	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG02568	0.581	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG02922	1.033	1.033	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG03006	1.187	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG03052	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG03642	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	HG03742	1.095	1.095	0.0	0.0	0.731	0.682	1	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA12878	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA18525	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA18939	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA19238	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA19239	0.918	0.918	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA19625	0.661	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA19648	1.075	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA20502	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	12042473	12043205	DEL	733	NA20845	1.133	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG00096	1.035	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG00268	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG00419	0.85	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG00759	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG01051	1.24	1.305	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG01112	0.939	0.988	0.0	0.0	0.737	0.737	3	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG01500	1.002	1.054	0.0	0.0	0.98	0.98	2	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG01565	1.013	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG01583	1.157	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG01595	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG01879	1.023	1.077	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG02568	0.664	0.699	0.0	0.0	0.785	0.785	2	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG02922	0.955	1.005	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG03006	1.055	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG03052	0.931	0.98	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG03642	0.444	0.468	0.036	0.036	nan	nan	0	1
chr19	14921673	14922508	DEL	836	HG03742	1.119	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA12878	0.964	1.015	0.0	0.0	0.64	0.673	2	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA18525	1.086	1.143	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA18939	1.156	1.217	0.0	0.0	0.754	0.744	2	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA19017	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA19238	1.151	1.211	0.0	0.0	0.585	0.585	1	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA19239	1.011	1.064	0.0	0.0	0.822	0.822	2	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA19625	1.021	1.075	0.0	0.0	0.78	0.78	2	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA19648	1.191	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA20502	1.144	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	14921673	14922508	DEL	836	NA20845	0.979	1.03	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG00096	1.251	1.317	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG00268	0.369	0.388	0.0	0.012	0.941	0.941	1	1
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG00419	1.044	1.099	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG00759	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG01051	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG01112	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG01500	0.632	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG01565	0.445	0.468	0.0	0.009	0.353	0.353	1	1
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG01583	0.988	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG01595	1.023	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG01879	0.423	0.445	0.0	0.022	0.737	0.737	1	1
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG02568	0.789	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG02922	1.136	1.196	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG03006	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG03052	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG03642	0.444	0.468	0.0	0.037	0.917	0.917	1	1
chr19	15734326	15734388	DEL	63	HG03742	0.487	0.512	0.0	0.021	0.278	0.298	1	1
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA12878	1.26	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA18525	0.838	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA18939	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA19017	0.858	0.903	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	0
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	0
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA19625	0.961	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA19648	0.784	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA20502	0.638	0.672	0.0	0.025	0.792	0.792	1	1
chr19	15734326	15734388	DEL	63	NA20845	0.979	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG00096	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG00268	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG00419	1.019	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG00759	1.258	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG01051	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG01112	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG01500	0.457	0.481	0.0	0.019	0.682	0.682	1	1
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG01565	1.112	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG01583	1.129	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG01595	1.311	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG01879	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG02568	1.287	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG02922	0.852	0.897	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG03006	0.484	0.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG03052	0.957	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG03642	0.635	0.668	0.0	0.032	0.706	0.706	1	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	HG03742	0.706	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA12878	0.519	0.546	0.0	0.035	0.448	0.472	1	1
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA18525	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA18939	0.807	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA19017	1.144	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA19238	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA19239	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA19625	1.201	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA20502	1.171	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	15750574	15750640	DEL	67	NA20845	0.412	0.434	0.0	0.039	0.7	0.7	1	1
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG00096	0.906	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG00268	1.004	1.154	0.0	0.0	0.742	0.742	1	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG00419	1.214	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG00759	0.956	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG01051	0.943	1.084	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG01112	1.009	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG01500	1.067	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG01565	1.013	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG01583	1.101	1.265	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG01595	0.734	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG01879	0.245	0.281	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG02568	0.996	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG02922	0.62	0.712	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG03006	1.231	1.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG03052	0.543	0.624	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG03642	1.111	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	HG03742	0.754	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA12878	0.89	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA18525	0.762	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA18939	0.894	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA19017	1.1	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA19238	0.93	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA19625	0.36	0.414	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA19648	0.843	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA20502	1.011	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	16786900	16787108	DEL	209	NA20845	1.301	1.495	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG00096	0.798	0.917	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG00268	0.0	0.0	0.038	0.257	nan	nan	0	0
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG00419	0.534	0.614	0.014	0.0	0.286	0.286	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG00759	0.881	1.013	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG01051	0.0	0.0	0.125	0.175	nan	nan	0	0
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG01112	0.986	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG01500	0.936	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG01565	0.717	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG01583	0.31	0.357	0.052	0.083	nan	nan	0	1
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG01595	0.839	0.964	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG01879	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG02568	1.038	1.193	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG02922	0.62	0.712	0.0	0.004	0.571	0.571	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG03006	0.791	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG03052	0.724	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG03642	0.667	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	HG03742	0.56	0.643	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA12878	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA18525	1.105	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA18939	0.741	0.852	0.0	0.0	0.667	0.627	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA19017	0.792	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA19238	0.82	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA19239	0.933	1.073	0.0	0.0	0.613	0.613	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA19625	0.48	0.552	0.037	0.071	nan	nan	0	1
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA19648	0.755	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA20502	0.958	1.101	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr19	17261335	17261798	DEL	464	NA20845	1.146	1.318	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG00096	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG00268	0.984	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG00419	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG00759	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG01051	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG01112	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG01500	0.936	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG01565	0.964	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG01583	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG01595	1.075	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG01879	1.179	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG02568	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG02922	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG03006	0.791	0.833	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG03052	0.905	0.953	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG03642	0.73	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	HG03742	0.998	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA12878	1.019	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA18525	1.105	1.163	0.0	0.0	0.962	0.99	1	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA18939	1.199	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA19017	0.99	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA19238	0.898	0.946	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA19239	1.12	1.179	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA19625	0.48	0.506	0.062	0.05	0.3	0.3	2	1
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA19648	1.017	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA20502	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	17995105	17995816	DEL	712	NA20845	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG00096	0.41	0.431	0.049	0.0	nan	nan	0	1
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG00268	0.861	0.906	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG00419	0.825	0.869	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG00759	1.032	1.086	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG01051	0.781	0.823	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG01112	0.915	0.963	0.006	0.0	0.882	0.882	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG01500	1.024	1.077	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG01565	1.038	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG01583	0.903	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG01595	1.023	1.076	0.008	0.0	0.722	0.722	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG01879	0.712	0.749	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG02568	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG02922	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG03006	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG03052	0.776	0.817	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG03642	0.762	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	HG03742	0.754	0.794	0.0	0.0	0.462	0.431	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA12878	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA18525	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA18939	0.785	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA19017	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA19238	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA19239	0.902	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA19625	0.811	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA19648	1.046	1.101	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA20502	0.878	0.924	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr19	18566051	18566665	DEL	615	NA20845	1.005	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG00096	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG00268	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG00759	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG01051	0.162	0.18	0.0	0.064	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG01112	0.469	0.522	0.0	0.043	0.214	0.214	2	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG01500	0.414	0.46	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG01565	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG01583	0.452	0.502	0.0	0.033	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG01595	0.551	0.612	0.0	0.039	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG01879	0.445	0.494	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG02568	1.162	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG02922	0.413	0.459	0.0	0.058	0.4	0.4	11	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG03006	0.593	0.659	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG03052	0.724	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG03642	0.381	0.423	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	HG03742	0.998	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA12878	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA18525	0.324	0.36	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA18939	0.48	0.533	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA19017	0.682	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA19238	0.599	0.665	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA19239	0.56	0.622	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA19625	0.901	1.001	0.0	0.0	0.278	0.278	1	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA19648	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA20502	0.0	0.0	0.009	0.108	nan	nan	0	2
chr19	18926123	18926292	DEL	170	NA20845	0.489	0.544	0.0	0.036	0.25	0.25	6	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG00096	0.647	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG00268	0.748	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG00419	0.728	0.837	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG00759	0.227	0.26	0.014	0.009	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG01051	0.593	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG01112	0.188	0.216	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG01500	0.305	0.35	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG01583	0.931	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG01595	0.839	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG01879	0.356	0.409	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG02922	1.033	1.187	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG03006	0.198	0.227	0.018	0.064	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG03052	0.854	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG03642	0.381	0.438	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	HG03742	0.803	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA18525	0.553	0.635	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA18939	0.632	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA19017	0.462	0.531	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA19238	0.867	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA19239	0.513	0.59	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA19625	0.751	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA19648	1.191	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA20502	0.958	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	19258012	19258291	DEL	280	NA20845	0.773	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG00096	0.992	1.044	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG00268	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG00419	0.898	0.945	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG00759	1.183	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG01051	0.835	0.879	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG01112	0.845	0.889	0.0	0.0	0.62	0.62	2	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG01500	1.111	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG01565	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG01583	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG01595	0.891	0.938	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG01879	1.023	1.077	0.0	0.0	0.6	0.6	9	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG02568	0.83	0.874	0.0	0.0	0.6	0.6	9	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG02922	0.929	0.978	0.0	0.0	0.746	0.746	12	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG03006	1.099	1.157	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG03052	0.854	0.899	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG03642	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	HG03742	1.217	1.281	0.0	0.0	0.765	0.714	1	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA12878	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA18525	0.857	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA18939	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA19017	0.748	0.788	0.005	0.0	0.688	0.73	1	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA19238	0.615	0.647	0.055	0.029	nan	nan	0	1
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA19239	1.073	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA19625	0.841	0.885	0.0	0.0	0.333	0.333	5	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA19648	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA20502	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	20441751	20442431	DEL	681	NA20845	1.211	1.274	0.0	0.001	0.176	0.176	1	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG00096	1.079	1.079	0.0	0.0	0.469	0.469	2	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG00268	0.922	0.922	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG00419	0.801	0.801	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG00759	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG01051	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG01112	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG01500	1.002	1.002	0.0	0.0	0.63	0.63	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG01565	1.161	1.161	0.0	0.0	0.747	0.747	4	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG01583	1.101	1.101	0.0	0.0	0.58	0.58	2	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG01595	1.075	1.075	0.0	0.0	0.65	0.65	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG01879	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG02568	0.498	0.498	0.103	0.029	0.45	0.45	4	1
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG02922	1.007	1.007	0.0	0.0	0.685	0.685	4	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG03006	0.923	0.923	0.0	0.004	0.875	0.875	4	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG03052	0.724	0.724	0.0	0.0	0.909	0.909	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG03642	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	HG03742	0.803	0.803	0.0	0.0	0.756	0.81	4	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA12878	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA18525	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA18939	0.872	0.872	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA19017	1.122	1.122	0.0	0.0	0.65	0.612	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA19238	0.867	0.867	0.0	0.0	0.9	0.9	4	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA19239	0.918	0.918	0.0	0.002	0.8	0.8	4	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA19625	0.871	0.871	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA19648	1.017	1.017	0.0	0.0	0.684	0.684	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA20502	0.585	0.585	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr19	21340483	21341157	DEL	675	NA20845	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG00096	0.647	0.647	0.0	0.083	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG00268	0.389	0.389	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG00419	1.262	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG00759	0.78	0.78	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG01051	1.374	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG01112	1.15	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG01500	1.132	1.132	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG01565	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG01583	0.254	0.254	0.046	0.059	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG01595	1.232	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG01879	1.401	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG02568	1.038	1.038	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG02922	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG03006	1.275	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG03052	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG03642	1.556	1.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	HG03742	0.633	0.633	0.0	0.057	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA12878	1.057	1.057	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA18525	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA18939	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA19017	0.528	0.528	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA19238	1.103	1.103	0.0	0.0	0.974	0.974	1	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA19239	0.638	0.638	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA19625	0.541	0.541	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA19648	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA20502	0.585	0.585	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr19	21717095	21717341	DEL	247	NA20845	0.515	0.515	0.01	0.055	nan	nan	0	1
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG00096	0.777	0.712	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG00268	1.025	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG00419	0.485	0.445	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG00759	1.057	0.97	0.0	0.0	0.833	0.774	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG01051	0.808	0.742	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG01112	0.751	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG01500	0.806	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG01565	0.84	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG01583	0.649	0.596	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG01595	0.787	0.722	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG01879	0.801	0.734	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG02568	0.747	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG02922	0.645	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG03006	0.747	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG03052	0.776	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG03642	0.825	0.757	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	HG03742	0.779	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA12878	0.816	0.748	0.0	0.0	0.895	0.942	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA18525	0.915	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA18939	0.589	0.54	0.0	0.006	0.714	0.759	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA19017	0.352	0.323	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA19238	0.426	0.39	0.005	0.09	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA19239	0.887	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA19625	0.721	0.661	0.015	0.0	0.286	0.286	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA19648	0.523	0.48	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA20502	0.692	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	23422658	23422776	DEL	119	NA20845	0.979	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG00096	0.971	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG00268	1.414	1.571	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG00419	1.189	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG00759	1.46	1.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG01051	0.404	0.449	0.0	0.035	0.812	0.812	1	1
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG01112	0.61	0.678	0.0	0.01	0.346	0.346	1	1
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG01500	1.111	1.234	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG01565	0.988	1.098	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG01583	1.496	1.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG01595	0.944	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG01879	1.023	1.137	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG02568	1.121	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG02922	1.187	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG03006	0.967	1.074	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG03052	1.164	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG03642	1.048	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	HG03742	0.56	0.622	0.0	0.04	0.387	0.415	1	1
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA12878	1.205	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA18525	1.181	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA18939	0.938	1.042	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA19017	1.012	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA19238	0.867	0.963	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA19239	1.12	1.245	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA19625	1.231	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA19648	1.278	1.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA20502	1.064	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	2674194	2674282	DEL	89	NA20845	1.494	1.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG00096	1.251	1.169	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG00268	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG00419	0.898	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG00759	1.686	1.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG01051	1.617	1.511	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG01112	1.42	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG01500	1.35	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG01565	1.384	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG01583	1.242	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG01595	1.363	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG01879	1.379	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG02568	1.37	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG02922	1.123	1.049	0.0	0.061	0.268	0.268	1	1
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG03006	1.341	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG03052	1.009	0.943	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG03642	1.476	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	HG03742	1.095	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA12878	1.131	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA18525	1.067	0.997	0.005	0.003	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA18939	1.526	1.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA19017	1.144	1.07	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA19238	1.434	1.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA19239	1.245	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA19625	1.532	1.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA19648	0.988	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA20502	1.038	0.97	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	31677810	31677895	DEL	86	NA20845	1.34	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG00096	1.381	1.29	0.0	0.0	0.694	0.694	1	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG00268	1.045	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG00419	1.359	1.27	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG00759	0.982	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG01051	1.428	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG01112	1.455	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG01500	1.339	1.252	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG01565	0.988	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG01583	1.355	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG01595	1.573	1.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG01879	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG02568	0.955	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG02922	1.187	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG03006	1.363	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG03052	0.879	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG03642	1.429	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	HG03742	1.8	1.683	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA12878	0.853	0.797	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA18525	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA18939	0.829	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA19017	1.496	1.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA19238	1.426	1.333	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA19239	1.245	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA19625	0.661	0.617	0.0	0.015	0.708	0.708	1	1
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA19648	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA20502	1.33	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	32609579	32609632	DEL	54	NA20845	1.236	1.156	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG00096	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG00268	0.717	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG00419	0.85	0.944	0.0	0.0	0.635	0.635	2	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG00759	0.378	0.419	0.049	0.0	0.25	0.269	10	1
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG01051	0.997	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG01112	0.986	1.095	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG01500	0.958	1.065	0.004	0.0	0.807	0.807	4	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG01565	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG01583	1.073	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG01595	0.76	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG01879	0.912	1.013	0.0	0.008	0.727	0.727	1	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG02568	1.079	1.199	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG02922	0.903	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG03006	0.879	0.977	0.0	0.0	0.894	0.894	4	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG03052	0.828	0.92	0.0	0.0	0.84	0.84	2	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG03642	1.238	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	HG03742	0.779	0.865	0.0	0.0	0.821	0.8	4	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA12878	0.816	0.906	0.0	0.0	0.694	0.704	4	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA18525	0.934	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA18939	0.916	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA19017	1.232	1.369	0.0	0.0	0.417	0.443	1	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA19238	0.93	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA19239	1.042	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA19625	1.201	1.335	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA19648	0.813	0.904	0.0	0.0	0.544	0.544	4	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA20502	1.091	1.212	0.0	0.0	0.767	0.767	4	2
chr19	33651821	33652658	DEL	838	NA20845	0.747	0.83	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG00096	0.928	1.031	0.0	0.0	0.454	0.454	2	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG00268	0.656	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG00419	0.267	0.297	0.06	0.003	nan	nan	0	1
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG00759	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG01051	0.755	0.838	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG01112	0.61	0.678	0.0	0.0	1.0	1.0	4	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG01500	0.327	0.363	0.113	0.002	0.188	0.188	5	1
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG01565	0.618	0.686	0.0	0.0	0.25	0.25	5	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG01583	0.79	0.878	0.0	0.0	0.429	0.429	6	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG01595	0.655	0.728	0.0	0.0	0.857	0.857	4	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG01879	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG02568	0.872	0.969	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG02922	0.723	0.803	0.0	0.0	0.875	0.875	5	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG03006	0.791	0.879	0.004	0.0	0.611	0.611	1	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG03052	0.621	0.69	0.0	0.0	0.6	0.6	12	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG03642	0.571	0.635	0.0	0.0	0.667	0.667	5	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	HG03742	0.608	0.676	0.0	0.0	0.667	0.622	1	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA12878	0.797	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA18525	0.648	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA18939	0.349	0.388	0.131	0.0	0.429	0.455	8	1
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA19017	0.792	0.88	0.0	0.0	0.342	0.338	2	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA19238	0.63	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA19239	0.653	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA19625	0.661	0.734	0.0	0.0	0.4	0.4	9	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA19648	0.872	0.968	0.0	0.0	0.455	0.455	6	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA20502	0.984	1.094	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr19	35360512	35361333	DEL	822	NA20845	0.309	0.343	0.068	0.014	nan	nan	0	1
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG00096	1.143	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG00268	0.656	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG00419	0.898	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG00759	0.755	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG01112	0.681	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG01500	0.784	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG01565	0.89	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG01583	1.157	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG01595	0.813	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG01879	0.823	0.946	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG02922	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG03052	0.414	0.476	0.0	0.032	1.0	1.0	1	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG03642	1.016	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	HG03742	0.73	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA12878	0.741	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA18525	1.067	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA18939	0.85	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA19017	0.836	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA19238	0.938	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA19239	0.685	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA19648	1.104	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA20502	0.825	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36599419	36599470	DUP	52	NA20845	1.005	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG00268	0.492	0.565	0.003	0.035	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG00419	0.0	0.0	0.007	0.137	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG00759	0.68	0.781	0.0	0.031	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG01051	0.701	0.805	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG01112	0.821	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG01500	0.022	0.025	0.0	0.189	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG01565	0.667	0.767	0.004	0.039	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG01583	0.734	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG01595	0.865	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG01879	0.044	0.051	0.028	0.182	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG02568	0.83	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG02922	0.336	0.386	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG03006	0.022	0.025	0.031	0.183	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG03052	0.013	0.015	0.016	0.198	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG03642	0.381	0.438	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	HG03742	0.681	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA12878	0.556	0.639	0.0	0.027	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA18525	0.438	0.504	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA18939	0.392	0.451	0.006	0.067	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA19017	0.616	0.708	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA19238	0.063	0.072	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA19239	0.016	0.018	0.0	0.136	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA19625	0.0	0.0	0.034	0.127	nan	nan	0	0
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA19648	0.465	0.534	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA20502	0.559	0.642	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr19	36662694	36662964	DEL	271	NA20845	0.361	0.415	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG00096	1.208	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG00268	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG00419	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG00759	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG01051	1.078	1.078	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG01112	1.22	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG01500	1.285	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG01565	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG01583	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG01595	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG01879	1.312	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG02568	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG02922	1.007	1.007	0.0	0.0	0.65	0.65	2	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG03006	1.231	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG03052	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG03642	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	HG03742	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA12878	1.112	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA18525	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA18939	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA19017	1.342	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA19238	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA19239	0.544	0.544	0.0	0.0	0.171	0.171	2	1
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA19625	1.141	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA19648	1.278	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA20502	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	36959725	36960411	DEL	687	NA20845	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG00096	0.0	0.0	0.027	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG00268	0.02	0.024	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG00419	0.024	0.028	0.014	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG00759	0.05	0.058	0.013	0.0	0.25	0.232	2	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG01051	0.027	0.031	0.016	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG01112	0.399	0.459	0.03	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG01500	0.457	0.526	0.03	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG01565	0.025	0.028	0.028	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG01583	0.028	0.032	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG01595	0.052	0.06	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG01879	0.423	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG02568	0.498	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG02922	0.49	0.564	0.0	0.0	0.129	0.129	2	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG03006	0.923	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG03052	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG03642	0.032	0.036	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	HG03742	0.535	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA12878	0.019	0.021	0.005	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA18525	0.038	0.044	0.0	0.002	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA18939	0.0	0.0	0.021	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA19017	0.0	0.0	0.017	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA19238	0.583	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA19239	0.949	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.007	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA19648	0.407	0.468	0.012	0.0	nan	nan	0	1
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA20502	0.027	0.031	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr19	3711008	3711333	DEL	326	NA20845	0.567	0.651	0.016	0.0	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG00096	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG00268	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG00419	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG00759	1.258	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG01051	0.485	0.485	0.022	0.007	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG01112	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG01500	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG01565	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG01583	0.0	0.0	0.063	0.035	nan	nan	0	0
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG01595	0.446	0.446	0.051	0.0	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG01879	0.0	0.0	0.106	0.014	nan	nan	0	0
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG02568	0.789	0.789	0.015	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG02922	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG03006	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG03052	0.0	0.0	0.113	0.02	nan	nan	0	0
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG03642	0.73	0.73	0.007	0.0	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	HG03742	0.706	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA12878	0.778	0.778	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA18525	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA18939	0.872	0.872	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA19017	0.55	0.55	0.04	0.0	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA19238	0.82	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA19239	0.591	0.591	0.017	0.0	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA19625	0.18	0.18	0.035	0.0	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA19648	0.407	0.407	0.019	0.009	nan	nan	0	1
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA20502	0.0	0.0	0.111	0.012	nan	nan	0	0
chr19	37460720	37461278	DEL	559	NA20845	0.0	0.0	0.167	0.024	nan	nan	0	0
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG00096	0.539	0.568	0.0	0.026	0.536	0.536	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG00268	0.553	0.582	0.0	0.047	0.667	0.667	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG00419	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG00759	0.478	0.503	0.0	0.061	0.867	0.933	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG01051	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG01112	0.375	0.395	0.0	0.027	0.529	0.529	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG01500	0.936	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG01565	0.717	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG01583	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG01595	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG01879	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG02568	0.996	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG03006	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG03052	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG03642	0.381	0.401	0.0	0.02	0.714	0.714	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	HG03742	1.071	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA12878	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA18525	0.857	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA18939	0.502	0.528	0.0	0.033	0.417	0.443	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA19017	0.44	0.463	0.0	0.041	0.524	0.557	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA19238	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA19239	0.436	0.459	0.0	0.018	0.633	0.633	1	1
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA19625	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA19648	1.017	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA20502	1.091	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37463442	37463510	DEL	69	NA20845	0.541	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG00096	1.014	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG00268	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG00419	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG00759	1.082	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG01051	0.916	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG01112	0.563	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG01500	1.089	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG01565	0.89	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG01583	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG01595	0.97	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG01879	1.001	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG02568	0.996	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG02922	0.697	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG03006	0.967	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG03052	0.517	0.483	0.0	0.017	0.952	0.952	1	1
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG03642	0.889	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	HG03742	0.998	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA12878	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA18525	0.819	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA18939	0.894	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA19017	0.77	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA19238	0.788	0.736	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA19239	0.793	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA19625	1.021	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA19648	0.843	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA20502	0.958	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	37686554	37686610	DEL	57	NA20845	0.953	0.891	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG00096	0.0	0.0	0.17	0.0	nan	nan	0	0
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG00268	0.758	0.842	0.009	0.0	0.119	0.119	2	1
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG00419	1.311	1.456	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG00759	0.0	0.0	0.041	0.0	nan	nan	0	0
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG01051	1.051	1.168	0.0	0.003	0.588	0.588	3	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG01112	0.516	0.574	0.03	0.0	0.412	0.412	6	1
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG01500	1.045	1.161	0.005	0.0	0.8	0.8	3	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG01565	0.89	0.988	0.0	0.002	0.857	0.857	1	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG01583	0.536	0.596	0.045	0.0	0.452	0.452	12	1
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG01595	0.708	0.787	0.046	0.019	0.519	0.519	6	1
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG01879	0.467	0.519	0.015	0.0	0.25	0.25	6	1
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG02568	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG02922	0.903	1.004	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG03006	1.099	1.221	0.012	0.003	0.765	0.765	3	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG03052	1.009	1.121	0.0	0.0	0.45	0.45	2	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG03642	0.952	1.058	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	HG03742	0.487	0.541	0.018	0.0	0.214	0.23	7	1
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA12878	1.019	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA18525	0.648	0.72	0.022	0.0	nan	nan	0	1
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA18939	0.0	0.0	0.036	0.024	nan	nan	0	0
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA19017	0.99	1.1	0.0	0.003	0.636	0.599	1	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA19238	1.024	1.138	0.0	0.005	0.948	0.948	2	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA19239	1.042	1.158	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA19625	0.961	1.068	0.0	0.0	0.658	0.658	2	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA19648	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA20502	0.0	0.0	0.088	0.02	nan	nan	0	0
chr19	47528255	47528724	DEL	470	NA20845	0.567	0.63	0.043	0.0	nan	nan	0	1
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG00096	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG00268	0.779	0.865	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG00419	0.558	0.62	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG00759	0.478	0.531	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG01051	0.728	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG01112	0.728	0.808	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG01500	0.762	0.847	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG01565	0.741	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG01583	0.621	0.69	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG01595	0.891	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG01879	0.712	0.791	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG02568	1.079	1.199	0.0	0.007	0.667	0.667	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG02922	0.749	0.832	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG03006	0.769	0.855	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG03052	0.66	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG03642	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	HG03742	0.754	0.838	0.006	0.0	0.661	0.648	2	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA12878	0.834	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA18525	0.724	0.805	0.0	0.0	0.4	0.42	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA18939	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA19017	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA19238	0.41	0.455	0.014	0.045	0.15	0.15	9	1
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA19239	0.762	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA19625	0.571	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA19648	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA20502	1.038	1.153	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr19	50368811	50369538	DEL	728	NA20845	0.592	0.658	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG00096	0.453	0.596	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG00268	0.697	0.917	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG00419	0.801	1.054	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG00759	0.151	0.199	0.0	0.0	1.0	0.929	3	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG01051	0.216	0.284	0.0	0.057	0.944	0.944	2	1
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG01112	0.329	0.432	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG01500	0.566	0.745	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG01565	0.371	0.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG01583	0.452	0.594	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG01595	0.341	0.448	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG01879	0.6	0.79	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG02568	0.498	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG02922	0.439	0.577	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG03006	0.44	0.578	0.0	0.006	0.429	0.429	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG03642	0.349	0.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	HG03742	0.389	0.512	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA12878	0.908	1.195	0.0	0.0	0.5	0.475	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA18525	0.514	0.677	0.0	0.0	0.778	0.817	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA18939	0.327	0.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA19017	0.352	0.463	0.0	0.053	0.853	0.906	2	1
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA19238	0.426	0.56	0.0	0.025	1.0	1.0	1	1
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA19239	0.296	0.389	0.0	0.039	0.5	0.5	2	1
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA19625	0.45	0.593	0.0	0.0	0.429	0.429	5	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA19648	0.494	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA20502	0.479	0.63	0.0	0.0	0.091	0.091	1	2
chr19	50834496	50834554	DEL	59	NA20845	0.386	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG00268	0.0	0.0	0.006	0.148	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG00759	0.78	0.867	0.006	0.081	nan	nan	0	1
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG01500	0.0	0.0	0.005	0.14	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG01583	0.536	0.596	0.016	0.082	nan	nan	0	1
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.117	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG02922	0.568	0.631	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG03642	0.286	0.317	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr19	52948969	52949075	DEL	107	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA18525	1.181	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA18939	0.0	0.0	0.007	0.147	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA19017	0.968	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.107	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr19	52948969	52949075	DEL	107	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG00096	0.906	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG00268	0.738	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG00419	0.801	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG00759	0.78	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG01051	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG01112	0.939	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG01500	0.849	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG01565	1.038	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG01583	0.819	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG01595	0.891	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG01879	0.778	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG02568	0.623	0.582	0.0	0.036	0.8	0.8	1	1
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG02922	1.033	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG03006	1.275	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG03052	1.035	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG03642	1.111	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	HG03742	1.046	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA12878	0.927	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA18525	0.972	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA18939	1.156	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA19017	0.88	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA19238	1.151	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA19239	1.33	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA19625	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA19648	1.017	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA20502	0.904	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	53176211	53176268	DEL	58	NA20845	1.082	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG00096	0.496	0.522	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG00268	0.0	0.0	0.051	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG00419	0.0	0.0	0.056	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG00759	0.0	0.0	0.042	0.006	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG01051	0.0	0.0	0.047	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG01112	0.0	0.0	0.056	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG01500	0.0	0.0	0.108	0.01	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG01565	0.0	0.0	0.022	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG01583	0.988	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG01595	0.0	0.0	0.054	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG01879	0.0	0.0	0.066	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG02568	0.0	0.0	0.053	0.011	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG02922	0.0	0.0	0.053	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG03006	0.0	0.0	0.078	0.011	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG03052	0.0	0.0	0.057	0.023	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG03642	0.0	0.0	0.084	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	HG03742	0.0	0.0	0.148	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA12878	0.0	0.0	0.1	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA18525	0.0	0.0	0.105	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA18939	0.0	0.0	0.073	0.01	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA19017	0.484	0.51	0.012	0.0	nan	nan	0	1
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA19238	0.0	0.0	0.105	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA19239	0.0	0.0	0.174	0.004	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA19625	0.0	0.0	0.117	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA19648	0.0	0.0	0.095	0.015	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA20502	0.0	0.0	0.086	0.0	nan	nan	0	0
chr19	54810732	54811514	DEL	783	NA20845	0.0	0.0	0.036	0.0	nan	nan	0	0
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG00096	0.453	0.503	0.021	0.0	0.278	0.278	9	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG00268	1.107	1.23	0.002	0.0	0.889	0.889	5	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG00419	0.461	0.512	0.035	0.0	0.636	0.636	4	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG00759	0.378	0.419	0.056	0.0	0.267	0.287	9	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG01051	0.916	1.018	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG01112	0.352	0.391	0.04	0.0	0.297	0.297	6	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG01500	0.958	1.065	0.0	0.004	0.737	0.737	2	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG01565	0.618	0.686	0.006	0.0	0.545	0.545	4	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG01583	0.48	0.533	0.022	0.0	nan	nan	0	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG01595	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG01879	0.334	0.371	0.076	0.0	0.833	0.833	9	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG02568	0.996	1.107	0.0	0.0	0.7	0.7	2	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG02922	0.929	1.033	0.0	0.0	0.786	0.786	2	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG03006	0.0	0.0	0.136	0.0	nan	nan	0	0
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG03052	1.293	1.437	0.0	0.0	0.909	0.909	3	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG03642	0.381	0.423	0.044	0.0	0.636	0.636	6	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	HG03742	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA12878	0.927	1.03	0.0	0.0	0.897	0.944	1	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA18525	0.476	0.529	0.064	0.0	0.247	0.259	8	1
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA18939	0.698	0.775	0.0	0.0	0.562	0.598	5	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA19017	0.902	1.003	0.0	0.0	0.636	0.676	3	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA19238	1.04	1.156	0.003	0.0	0.73	0.73	1	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA19239	1.073	1.193	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA19625	1.081	1.201	0.006	0.0	0.846	0.846	3	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA19648	1.104	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA20502	1.304	1.448	0.006	0.0	0.638	0.638	4	2
chr19	5509856	5510792	DEL	937	NA20845	0.824	0.916	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG00096	0.971	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG00268	0.943	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG00419	1.044	1.16	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG00759	0.881	0.979	0.0	0.0	0.667	0.718	1	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG01051	0.728	0.808	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG01112	0.915	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG01500	0.828	0.919	0.0	0.0	0.767	0.767	2	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG01565	0.395	0.439	0.087	0.067	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG01583	0.847	0.941	0.0	0.0	0.78	0.78	2	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG01595	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG01879	0.956	1.062	0.0	0.005	0.691	0.691	2	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG02568	0.872	0.969	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG02922	0.413	0.459	0.104	0.079	nan	nan	0	1
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG03006	0.747	0.83	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG03052	0.905	1.006	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG03642	0.952	1.058	0.0	0.004	0.5	0.5	1	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	HG03742	0.803	0.892	0.0	0.0	0.75	0.804	1	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA12878	0.853	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA18525	0.953	1.059	0.0	0.0	0.844	0.887	2	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA18939	0.85	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA19017	0.418	0.465	0.035	0.098	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA19238	0.441	0.49	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA19239	0.0	0.0	0.043	0.219	nan	nan	0	1
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA19625	0.571	0.634	0.041	0.032	nan	nan	0	1
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA19648	0.726	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA20502	1.038	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	56211480	56211945	DEL	466	NA20845	0.773	0.859	0.0	0.0	0.556	0.556	3	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG00096	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG00268	1.066	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG00419	1.408	1.482	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG00759	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG01051	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG01112	0.845	0.889	0.0	0.0	0.806	0.806	2	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG01500	1.285	1.352	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG01565	1.161	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG01583	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG01595	1.337	1.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG01879	1.201	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG02568	1.038	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG02922	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG03006	1.077	1.134	0.0	0.0	0.85	0.85	2	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG03052	1.061	1.116	0.025	0.079	nan	nan	0	1
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG03642	1.175	1.236	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	HG03742	1.095	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA12878	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA18525	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA18939	1.221	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA19017	1.122	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA19238	1.198	1.261	0.027	0.115	nan	nan	0	1
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA19239	1.12	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA19625	1.351	1.422	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA19648	1.075	1.132	0.0	0.0	0.971	0.971	2	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA20502	1.064	1.12	0.0	0.0	0.876	0.876	2	2
chr19	57151762	57152328	DEL	567	NA20845	1.185	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG00096	0.388	0.431	0.099	0.075	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG00268	0.0	0.0	0.282	0.165	nan	nan	0	0
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG00419	0.0	0.0	0.304	0.199	nan	nan	0	0
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG00759	0.0	0.0	0.291	0.177	nan	nan	0	0
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG01051	0.0	0.0	0.164	0.13	nan	nan	0	0
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG01112	0.493	0.548	0.119	0.08	0.846	0.846	1	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG01500	0.74	0.823	0.127	0.096	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG01565	0.494	0.549	0.058	0.047	0.25	0.25	1	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG01583	0.452	0.502	0.044	0.036	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG01595	0.472	0.524	0.112	0.088	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG01879	0.534	0.593	0.109	0.069	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG02568	0.415	0.461	0.096	0.066	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG02922	0.439	0.488	0.092	0.044	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG03006	0.0	0.0	0.276	0.207	nan	nan	0	0
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG03052	0.776	0.862	0.003	0.014	nan	nan	0	2
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG03642	0.0	0.0	0.294	0.189	nan	nan	0	0
chr19	57474871	57475609	DEL	739	HG03742	0.414	0.46	0.063	0.044	0.5	0.536	1	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA12878	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA18525	0.553	0.614	0.123	0.092	0.731	0.767	1	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA18939	0.0	0.0	0.377	0.242	nan	nan	0	0
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA19017	0.55	0.611	0.082	0.058	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA19238	0.52	0.578	0.077	0.052	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA19239	0.498	0.553	0.094	0.046	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA19625	0.931	1.034	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA19648	0.378	0.42	0.12	0.051	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA20502	0.426	0.473	0.079	0.051	nan	nan	0	1
chr19	57474871	57475609	DEL	739	NA20845	0.0	0.0	0.253	0.176	nan	nan	0	0
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG00096	1.035	1.035	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG00268	0.574	0.574	0.006	0.068	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG00419	1.529	1.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG01051	1.428	1.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG01112	1.408	1.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG01500	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG01565	1.112	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG01583	1.129	1.129	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG01595	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG01879	1.245	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG02568	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG02922	1.239	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG03006	1.451	1.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG03052	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	HG03642	1.746	1.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA12878	1.112	1.112	0.0	0.0	0.5	0.526	1	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA18939	1.287	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA19017	1.585	1.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA19238	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA19239	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA19625	0.991	0.991	0.009	0.0	0.421	0.421	1	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA20502	1.25	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	58034593	58034820	DUP	228	NA20845	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG00096	0.949	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG00268	0.594	0.66	0.074	0.0	0.545	0.545	3	1
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG00419	0.801	0.89	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG00759	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG01051	0.781	0.868	0.006	0.003	0.477	0.477	2	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG01112	0.774	0.861	0.009	0.0	0.838	0.838	2	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG01500	0.74	0.823	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG01565	0.939	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG01583	0.875	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG01595	0.839	0.932	0.0	0.004	0.923	0.923	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG01879	0.978	1.087	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG02568	0.955	1.061	0.0	0.005	0.604	0.604	2	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG02922	0.826	0.918	0.0	0.0	0.616	0.616	2	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG03006	1.055	1.172	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG03052	0.698	0.776	0.0	0.0	0.475	0.475	2	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG03642	0.73	0.811	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	HG03742	0.973	1.081	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA12878	0.816	0.906	0.003	0.002	0.812	0.812	2	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA18525	1.067	1.186	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA18939	0.741	0.824	0.0	0.0	0.833	0.784	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA19017	0.902	1.003	0.0	0.0	0.667	0.708	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA19238	0.867	0.963	0.003	0.002	0.8	0.8	3	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA19239	0.902	1.003	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA19625	0.871	0.968	0.009	0.0	0.333	0.333	2	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA19648	0.872	0.968	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA20502	1.091	1.212	0.0	0.0	0.632	0.632	4	2
chr19	5810116	5810752	DEL	637	NA20845	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG00096	0.906	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG00268	0.82	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG00419	0.801	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG00759	0.78	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG01051	0.755	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG01112	0.61	0.701	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG01500	0.784	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG01565	0.89	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG01583	0.917	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG01595	0.603	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG01879	0.867	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG02568	1.079	1.241	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG02922	0.852	0.979	0.0	0.0	0.478	0.478	1	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG03006	0.835	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG03052	1.009	1.16	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG03642	0.825	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	HG03742	0.608	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA12878	0.871	1.001	0.0	0.0	0.5	0.475	1	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA18525	0.724	0.832	0.0	0.0	0.5	0.525	1	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA18939	0.698	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA19017	0.836	0.961	0.0	0.0	0.615	0.654	1	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA19238	0.788	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA19239	0.871	1.001	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA19625	1.321	1.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA19648	1.075	1.236	0.0	0.0	0.935	0.935	2	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA20502	0.771	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6387622	6388182	DEL	561	NA20845	0.412	0.474	0.038	0.013	nan	nan	0	1
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG00096	0.863	0.908	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG00268	1.045	1.1	0.0	0.004	0.96	0.96	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG00419	0.971	1.022	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG00759	0.831	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG01051	0.916	0.964	0.0	0.0	0.763	0.763	2	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG01112	1.291	1.359	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG01500	1.22	1.284	0.0	0.0	0.677	0.677	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG01565	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG01583	0.988	1.04	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG01595	0.996	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG01879	0.823	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG02568	1.079	1.136	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG02922	1.007	1.06	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG03006	0.549	0.578	0.032	0.0	nan	nan	0	1
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG03052	0.931	0.98	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG03642	0.984	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	HG03742	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA12878	1.168	1.229	0.0	0.0	0.828	0.871	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA18525	0.495	0.522	0.027	0.0	0.341	0.358	10	1
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA18939	0.436	0.459	0.051	0.006	0.333	0.354	7	1
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA19017	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA19238	1.04	1.095	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA19239	0.887	0.933	0.0	0.0	0.645	0.645	2	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA19625	0.841	0.885	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA19648	1.307	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA20502	0.878	0.924	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr19	6508417	6508907	DEL	491	NA20845	1.159	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG00096	1.014	1.067	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG00268	0.881	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG00419	1.165	1.226	0.0	0.0	0.591	0.591	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG00759	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG01051	1.105	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG01112	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG01500	0.806	0.848	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG01565	0.939	0.988	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG01583	0.48	0.505	0.056	0.047	nan	nan	0	1
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG01595	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG01879	0.978	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG02568	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG02922	0.49	0.516	0.054	0.032	nan	nan	0	1
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG03006	1.077	1.134	0.0	0.0	0.259	0.259	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG03052	1.009	1.062	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG03642	0.603	0.635	0.073	0.029	0.357	0.357	2	1
chr19	7258360	7259292	DEL	933	HG03742	0.998	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA12878	1.038	1.093	0.0	0.0	0.774	0.736	2	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA18525	0.991	1.043	0.0	0.0	0.69	0.657	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA18939	0.916	0.964	0.0	0.0	0.818	0.869	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA19017	0.528	0.556	0.082	0.063	0.32	0.34	2	1
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA19238	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA19239	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA19625	1.231	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA19648	0.988	1.04	0.0	0.0	0.904	0.904	2	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA20502	1.33	1.4	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr19	7258360	7259292	DEL	933	NA20845	0.85	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG00096	1.079	1.135	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG00268	1.27	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG00419	1.189	1.252	0.005	0.0	0.852	0.852	1	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG00759	1.183	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG01051	1.105	1.163	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG01112	1.244	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG01500	1.089	1.146	0.0	0.002	0.84	0.84	1	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG01565	0.939	0.988	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG01583	1.383	1.456	0.005	0.004	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG01595	1.101	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG01879	1.29	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG02568	1.245	1.311	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG02922	0.49	0.516	0.054	0.0	nan	nan	0	1
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG03006	1.033	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG03052	1.397	1.47	0.0	0.003	0.923	0.923	1	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG03642	1.111	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	HG03742	1.582	1.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA12878	0.89	0.937	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA18525	1.029	1.083	0.003	0.005	0.516	0.542	1	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA18939	1.439	1.515	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA19017	1.386	1.459	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA19238	1.151	1.211	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA19239	0.871	0.917	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA19625	1.321	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA19648	1.162	1.223	0.009	0.004	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA20502	1.25	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	7876739	7877314	DEL	576	NA20845	1.365	1.437	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG00096	0.69	0.767	0.0	0.016	0.768	0.768	4	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG00268	0.922	1.025	0.0	0.003	0.632	0.632	3	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG00419	1.238	1.375	0.006	0.003	0.654	0.654	1	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG00759	0.705	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG01051	0.566	0.629	0.061	0.068	0.273	0.273	3	1
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG01112	0.939	1.043	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG01500	0.871	0.968	0.0	0.009	0.866	0.866	2	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG01565	0.692	0.769	0.01	0.007	0.4	0.4	3	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG01583	0.96	1.066	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG01595	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG01879	0.823	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG02568	0.789	0.876	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG02922	0.981	1.09	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG03006	0.615	0.684	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG03052	0.724	0.805	0.0	0.004	0.688	0.688	3	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG03642	0.635	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	HG03742	0.852	0.946	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA12878	0.871	0.968	0.0	0.005	0.882	0.929	3	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA18525	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA18939	0.894	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA19017	1.21	1.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA19238	0.489	0.543	0.009	0.054	nan	nan	0	1
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA19239	0.7	0.778	0.0	0.002	0.947	0.947	1	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA19625	0.781	0.868	0.0	0.004	0.857	0.857	3	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA19648	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA20502	0.958	1.064	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr19	8009844	8010325	DEL	482	NA20845	0.696	0.773	0.0	0.006	0.638	0.638	2	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG00096	0.891	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG00268	0.769	0.855	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG00419	0.577	0.641	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG00759	0.808	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG01051	0.8	0.889	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG01112	0.68	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG01500	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG01565	0.73	0.811	0.0	0.005	0.727	0.684	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG01583	1.0	1.111	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG01595	0.623	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG02568	0.619	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG02922	0.296	0.328	0.0	0.058	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG03006	0.747	0.829	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG03642	0.926	1.029	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	HG03742	0.686	0.762	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA12878	0.823	0.914	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA18525	0.686	0.762	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA18939	0.562	0.625	0.0	0.0	0.909	0.87	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA19017	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA19238	0.882	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA19239	0.313	0.348	0.0	0.092	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA19625	0.566	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA19648	0.808	0.898	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA20502	0.859	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102119423	102119614	DUP	192	NA20845	0.573	0.636	0.0	0.006	1.0	1.0	1	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG00096	1.176	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG00268	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG00419	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG00759	0.847	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG01051	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG01112	0.753	0.793	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG01500	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG01565	0.792	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG01583	0.878	0.924	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG01595	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG01879	0.655	0.689	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG02568	1.161	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG02922	0.697	0.733	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG03006	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG03052	0.492	0.518	0.0	0.025	0.64	0.64	1	1
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG03642	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	HG03742	0.803	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA12878	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA18525	1.161	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA18939	0.562	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA19017	0.919	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA19238	0.993	1.046	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA19239	0.652	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA19625	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA19648	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA20502	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102725817	102725882	DEL	66	NA20845	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG00096	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG00268	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG00419	0.68	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG00759	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG01051	1.025	1.025	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG01112	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG01500	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG01565	0.625	0.625	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG01583	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG01595	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG01879	0.691	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG02568	1.122	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG02922	0.781	0.781	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG03006	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG03052	0.278	0.278	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG03642	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	HG03742	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA12878	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA18525	0.809	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA18939	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA19017	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA19238	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA19239	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA19625	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA19648	0.581	0.581	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA20502	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	102934805	102934914	DEL	110	NA20845	0.716	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG00096	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG00268	1.172	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG00419	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG00759	1.38	1.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG01051	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG01112	0.716	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG01500	0.812	0.854	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG01565	0.625	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG01583	0.658	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG01595	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG01879	0.346	0.364	0.0	0.067	0.818	0.818	1	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG02568	0.387	0.407	0.014	0.076	nan	nan	0	1
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG02922	1.077	1.134	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG03006	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG03052	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG03642	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	HG03742	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA12878	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA18525	1.073	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA18939	0.689	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA19017	1.107	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA19238	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA19239	1.07	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA19625	1.003	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA19648	1.237	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA20502	0.905	0.953	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	103504420	103504584	DEL	165	NA20845	0.925	0.974	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG00096	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG00268	1.346	1.258	0.0	0.0	0.491	0.491	1	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG00419	0.577	0.539	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG00759	1.518	1.418	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG01051	1.148	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG01112	0.992	0.927	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG01500	1.226	1.146	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG01565	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG01583	1.195	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG01595	0.583	0.545	0.007	0.075	nan	nan	0	1
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG01879	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG02568	0.813	0.76	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG02922	0.697	0.651	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG03006	1.366	1.276	0.0	0.0	0.658	0.658	1	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG03052	1.305	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG03642	1.301	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	HG03742	0.588	0.549	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA12878	0.806	0.753	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA18525	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA18939	1.088	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA19017	1.276	1.192	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA19238	1.092	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA19239	0.705	0.658	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA19625	0.798	0.745	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA19648	1.06	0.991	0.0	0.005	0.81	0.81	1	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA20502	1.114	1.041	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr2	104560474	104560586	DEL	113	NA20845	0.595	0.556	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG00096	0.496	0.522	0.065	0.034	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG00268	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG00419	0.392	0.412	0.031	0.028	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG00759	0.355	0.373	0.039	0.036	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG01051	0.697	0.734	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG01112	0.331	0.348	0.06	0.044	0.429	0.451	1	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG01500	0.451	0.475	0.071	0.048	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG01565	0.334	0.351	0.086	0.053	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG01583	0.414	0.436	0.096	0.062	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG01595	0.422	0.445	0.046	0.036	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG01879	0.382	0.402	0.076	0.054	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG02568	0.0	0.0	0.118	0.1	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG02922	0.422	0.445	0.104	0.074	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG03006	0.0	0.0	0.189	0.142	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG03052	0.0	0.0	0.189	0.152	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG03642	0.425	0.448	0.081	0.066	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	HG03742	0.0	0.0	0.161	0.149	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA12878	0.531	0.559	0.061	0.034	nan	nan	0	1
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA18525	0.0	0.0	0.356	0.236	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA18939	0.653	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA19017	1.05	1.106	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA19238	0.0	0.0	0.302	0.183	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA19239	0.691	0.728	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA19625	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA19648	0.0	0.0	0.226	0.148	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA20502	0.0	0.0	0.159	0.135	nan	nan	0	0
chr2	106695055	106695893	DEL	839	NA20845	0.419	0.441	0.072	0.06	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG00096	0.478	0.478	0.0	0.003	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG00268	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG00419	0.474	0.474	0.004	0.009	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG00759	0.355	0.355	0.004	0.012	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG01051	0.738	0.738	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG01112	0.331	0.331	0.014	0.032	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG01500	0.505	0.505	0.007	0.025	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG01565	0.605	0.605	0.0	0.028	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG01583	0.439	0.439	0.005	0.024	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG01595	0.463	0.463	0.0	0.016	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG01879	0.382	0.382	0.008	0.02	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG02568	0.0	0.0	0.022	0.065	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG02922	0.422	0.422	0.004	0.021	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG03006	0.0	0.0	0.043	0.097	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG03642	0.4	0.4	0.009	0.027	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	HG03742	0.0	0.0	0.043	0.108	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA12878	0.6	0.6	0.008	0.019	nan	nan	0	1
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA18525	0.0	0.0	0.025	0.138	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA18939	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA19017	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA19238	0.0	0.0	0.02	0.107	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA19239	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA19625	0.643	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA19648	0.0	0.0	0.042	0.099	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA20502	0.0	0.0	0.03	0.091	nan	nan	0	0
chr2	106695492	106695752	DEL	261	NA20845	0.463	0.463	0.004	0.016	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG00096	0.79	0.79	0.0	0.0	0.877	0.877	2	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG00268	0.297	0.297	0.09	0.06	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG00419	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG00759	0.69	0.69	0.0	0.0	0.85	0.85	3	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG01051	0.308	0.308	0.053	0.032	0.118	0.118	1	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG01112	0.0	0.0	0.223	0.121	nan	nan	0	0
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG01500	0.397	0.397	0.081	0.036	0.077	0.077	1	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG01565	0.292	0.292	0.057	0.05	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG01583	0.293	0.293	0.122	0.07	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG01595	0.402	0.402	0.046	0.037	0.211	0.211	5	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG01879	0.564	0.564	0.091	0.028	0.167	0.167	5	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG02568	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG02922	0.401	0.401	0.028	0.025	0.143	0.143	1	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG03006	0.492	0.492	0.076	0.034	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG03052	0.642	0.642	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG03642	0.425	0.425	0.062	0.033	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	HG03742	0.431	0.431	0.069	0.063	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA12878	0.0	0.0	0.215	0.105	nan	nan	0	0
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA18525	0.809	0.809	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA18939	0.744	0.744	0.0	0.0	0.923	0.957	3	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA19017	0.45	0.45	0.08	0.027	0.143	0.143	1	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA19238	0.868	0.868	0.0	0.0	0.731	0.731	2	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA19239	0.378	0.378	0.106	0.032	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA19625	0.412	0.412	0.034	0.024	nan	nan	0	1
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA19648	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA20502	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	108855423	108856274	DEL	852	NA20845	0.485	0.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG00268	0.0	0.0	0.013	0.198	nan	nan	0	0
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG00419	0.742	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG00759	0.867	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG01051	0.943	1.048	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG01112	0.496	0.551	0.007	0.124	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG01500	0.325	0.361	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG01565	0.563	0.625	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG01583	0.341	0.379	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG01595	0.543	0.603	0.0	0.085	0.19	0.19	1	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG01879	0.455	0.505	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG02568	1.316	1.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG02922	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG03006	1.001	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG03052	0.963	1.07	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG03642	1.176	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	HG03742	0.431	0.479	0.012	0.076	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA12878	0.463	0.514	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA18525	0.387	0.43	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA18939	0.345	0.383	0.0	0.067	0.283	0.296	2	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA19017	0.919	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA19238	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA19239	0.483	0.536	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA19625	1.235	1.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA19648	0.429	0.477	0.015	0.08	nan	nan	0	1
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA20502	1.021	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111576391	111576633	DEL	243	NA20845	0.441	0.489	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG00096	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG00268	0.944	0.944	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG00419	0.948	0.948	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG00759	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG01051	0.779	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG01112	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG01500	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG01583	1.292	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG01595	1.247	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG01879	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG02568	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG02922	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG03006	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG03052	0.492	0.492	0.0	0.048	0.88	0.88	1	1
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG03642	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	HG03742	0.588	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA12878	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA18525	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA18939	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA19017	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA19238	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA19239	0.496	0.496	0.0	0.038	0.886	0.886	1	1
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA19625	0.592	0.592	0.013	0.05	0.542	0.542	1	1
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA19648	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA20502	1.393	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	111753542	111753596	DEL	55	NA20845	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG00096	0.496	0.482	0.101	0.054	nan	nan	0	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG00268	0.507	0.492	0.092	0.06	0.139	0.139	9	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG00419	0.0	0.0	0.26	0.186	nan	nan	0	0
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG00759	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG01051	0.0	0.0	0.302	0.201	nan	nan	0	0
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG01112	0.551	0.535	0.08	0.053	nan	nan	0	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG01500	0.469	0.455	0.131	0.063	0.696	0.696	1	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG01565	0.0	0.0	0.392	0.25	nan	nan	0	0
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG01583	1.268	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG01595	0.0	0.0	0.253	0.204	nan	nan	0	0
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG01879	0.655	0.636	0.097	0.061	nan	nan	0	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG02568	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG02922	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG03006	0.91	0.884	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG03052	0.963	0.935	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG03642	1.226	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	HG03742	1.038	1.008	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA12878	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA18525	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA18939	0.0	0.0	0.234	0.216	nan	nan	0	0
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA19017	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA19238	0.368	0.358	0.136	0.069	0.926	0.926	1	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA19239	0.626	0.608	0.102	0.051	0.422	0.422	1	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA19625	0.9	0.874	0.008	0.0	0.538	0.538	1	2
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA19648	0.505	0.49	0.109	0.066	0.923	0.923	1	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA20502	0.441	0.428	0.063	0.039	0.615	0.615	1	1
chr2	115628104	115628838	DEL	735	NA20845	0.815	0.791	0.051	0.029	nan	nan	0	1
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG00096	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG00268	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG00419	0.907	0.88	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG00759	0.69	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG01051	1.333	1.294	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG01112	0.973	0.945	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG01500	0.307	0.298	0.0	0.037	0.905	0.905	1	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG01565	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG01583	0.902	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG01595	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG01879	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG02568	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG02922	1.014	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG03052	1.134	1.101	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	HG03642	1.276	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA12878	0.977	0.949	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA18525	0.704	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA18939	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA19017	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA19238	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA19239	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA19625	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA19648	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA20502	0.395	0.383	0.0	0.031	0.778	0.778	1	2
chr2	116445166	116445225	DUP	60	NA20845	0.551	0.535	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG00096	0.459	0.446	0.066	0.063	nan	nan	0	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG00268	0.525	0.509	0.05	0.048	nan	nan	0	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG00419	1.195	1.161	0.0	0.0	0.835	0.835	2	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG00759	1.084	1.052	0.0	0.0	0.911	0.911	2	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG01051	0.779	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG01112	1.157	1.123	0.0	0.0	0.926	0.975	3	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG01500	1.172	1.138	0.0	0.0	0.753	0.753	2	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG01565	0.542	0.526	0.093	0.066	nan	nan	0	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG01583	0.585	0.568	0.038	0.031	nan	nan	0	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG01595	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG01879	0.564	0.548	0.072	0.063	nan	nan	0	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG02568	1.2	1.165	0.0	0.0	0.524	0.524	3	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG02922	1.056	1.025	0.0	0.0	0.853	0.853	4	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG03006	1.256	1.22	0.005	0.0	0.799	0.799	2	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG03052	0.984	0.956	0.0	0.0	0.478	0.478	1	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG03642	1.451	1.409	0.012	0.0	0.857	0.857	3	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	HG03742	1.215	1.179	0.0	0.0	0.888	0.888	2	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA12878	0.566	0.549	0.034	0.041	nan	nan	0	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA18525	1.038	1.008	0.0	0.0	0.825	0.825	2	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA18939	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA19017	0.582	0.565	0.063	0.058	nan	nan	0	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA19238	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA19239	1.135	1.102	0.0	0.0	0.865	0.865	2	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA19625	1.364	1.324	0.0	0.0	0.87	0.87	3	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA19648	0.682	0.662	0.064	0.054	0.364	0.364	2	1
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA20502	1.137	1.104	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr2	116662058	116662652	DEL	595	NA20845	1.035	1.005	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG00096	1.01	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG00268	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG00419	0.969	0.94	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG00759	1.123	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG01051	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG01112	1.322	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG01500	1.01	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG01565	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG01583	1.073	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG01595	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG01879	0.509	0.495	0.0	0.029	0.548	0.548	1	1
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG02568	0.464	0.451	0.0	0.017	0.571	0.571	1	1
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG02922	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG03006	1.092	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG03052	1.177	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG03642	1.451	1.409	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	HG03742	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA12878	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA18525	1.249	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA18939	0.997	0.968	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA19017	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA19238	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA19239	1.239	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA19625	1.261	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA19648	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA20502	1.207	1.172	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	116798836	116798906	DEL	71	NA20845	1.145	1.112	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG00096	0.68	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG00268	0.769	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG00419	0.969	1.113	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG00759	0.729	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG01051	0.656	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG01112	0.698	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG01500	0.938	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG01565	0.813	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG01583	0.707	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG01595	0.784	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG01879	0.837	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG02568	1.122	1.29	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG02922	1.077	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG03006	0.747	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG03052	0.749	0.861	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG03642	1.039	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	HG03742	0.784	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA12878	0.806	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA18525	0.862	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA18939	1.07	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA19017	0.778	0.895	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA19238	0.947	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA19239	0.848	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA19625	0.605	0.695	0.0	0.019	0.481	0.481	2	1
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA19648	0.909	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA20502	0.65	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	116942974	116943044	DEL	71	NA20845	0.793	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG00096	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG00268	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG00419	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG00759	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG01051	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG01112	0.533	0.533	0.06	0.034	nan	nan	0	1
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG01500	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG01565	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG01583	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG01595	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG01879	0.364	0.364	0.065	0.037	nan	nan	0	1
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG02568	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG02922	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG03006	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG03052	0.749	0.749	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG03642	0.876	0.876	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	HG03742	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA12878	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA18525	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA18939	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA19017	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA19238	1.013	1.013	0.0	0.0	0.721	0.721	1	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA19239	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA19625	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA19648	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA20502	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118881398	118882286	DEL	889	NA20845	0.837	0.837	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.227	nan	nan	0	0
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG00268	0.175	0.184	0.0	0.143	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG00419	0.165	0.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG00759	0.118	0.124	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG01051	0.144	0.151	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG01500	0.433	0.456	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG01565	0.229	0.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG01583	0.146	0.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG01595	0.08	0.085	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG01879	0.073	0.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG02568	0.039	0.041	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG02922	0.633	0.667	0.0	0.176	nan	nan	0	0
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG03006	0.583	0.613	0.016	0.213	nan	nan	0	0
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG03052	0.107	0.113	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG03642	0.1	0.105	0.0	0.12	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	HG03742	0.411	0.433	0.0	0.207	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA12878	0.103	0.108	0.005	0.079	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA18525	0.193	0.204	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA18939	0.109	0.115	0.0	0.146	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA19017	0.131	0.138	0.0	0.121	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA19238	0.184	0.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.226	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA19625	0.18	0.19	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA19648	0.151	0.159	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.253	nan	nan	0	0
chr2	118906129	118906281	DEL	153	NA20845	0.176	0.185	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG00096	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG00268	0.664	0.645	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG00419	0.66	0.64	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG00759	0.276	0.268	0.005	0.037	0.615	0.615	1	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG01051	1.23	1.194	0.0	0.002	0.867	0.867	1	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG01112	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG01500	0.487	0.473	0.0	0.022	nan	nan	0	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG01565	1.188	1.154	0.0	0.0	0.679	0.721	1	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG01583	0.463	0.45	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG01595	0.583	0.566	0.0	0.023	0.24	0.24	1	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG01879	1.146	1.113	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG02568	0.387	0.376	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG02922	1.288	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG03006	1.22	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG03052	1.155	1.122	0.012	0.0	0.469	0.469	1	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr2	119713987	119714124	DEL	138	HG03742	0.549	0.533	0.0	0.016	nan	nan	0	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA12878	0.651	0.632	0.0	0.041	0.25	0.25	1	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA18525	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA18939	1.269	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA19017	0.544	0.528	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA19238	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA19239	1.435	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA19625	0.952	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA19648	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA20502	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	119713987	119714124	DEL	138	NA20845	1.674	1.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG00096	0.441	0.441	0.073	0.05	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG00268	0.49	0.49	0.083	0.087	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG00419	0.453	0.453	0.096	0.066	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG00759	0.394	0.394	0.096	0.056	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG01051	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG01112	0.551	0.551	0.076	0.043	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG01500	0.0	0.0	0.219	0.147	nan	nan	0	0
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG01565	0.0	0.0	0.366	0.181	nan	nan	0	0
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG01583	0.0	0.0	0.37	0.235	nan	nan	0	0
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG01595	0.483	0.483	0.032	0.022	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG01879	0.309	0.309	0.121	0.068	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG02568	1.006	1.006	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG02922	0.95	0.95	0.0	0.0	0.909	0.909	2	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG03006	0.382	0.382	0.063	0.035	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG03052	0.877	0.877	0.0	0.0	0.935	0.935	2	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG03642	0.425	0.425	0.163	0.092	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	HG03742	0.509	0.509	0.103	0.094	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA12878	0.0	0.0	0.093	0.208	nan	nan	0	0
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA18525	0.0	0.0	0.231	0.157	nan	nan	0	0
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA18939	0.49	0.49	0.05	0.052	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA19017	1.013	1.013	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA19238	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA19239	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA19625	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA19648	0.0	0.0	0.365	0.292	nan	nan	0	0
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA20502	0.511	0.511	0.08	0.061	nan	nan	0	1
chr2	121797802	121798397	DEL	596	NA20845	0.0	0.0	0.32	0.178	nan	nan	0	0
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG00096	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG00268	0.787	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG00419	0.804	0.893	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG00759	0.808	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG01051	0.523	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG01112	1.084	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG01500	0.884	0.982	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG01565	0.823	0.915	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG01583	0.634	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG01595	0.825	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG01879	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG02568	0.967	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG02922	0.739	0.821	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG03006	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG03052	0.792	0.88	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG03642	0.976	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	HG03742	0.705	0.784	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA12878	0.908	1.009	0.0	0.0	0.519	0.519	1	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA18525	1.108	1.231	0.0	0.002	0.771	0.771	1	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA18939	0.834	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA19017	0.619	0.688	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA19238	0.836	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA19239	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA19625	0.798	0.886	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA19648	0.757	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA20502	0.65	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122314944	122315611	DEL	668	NA20845	1.057	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	HG01051	0.472	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	HG01595	0.704	0.704	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	HG02922	0.697	0.697	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	HG03052	1.284	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	NA12878	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	NA19017	1.201	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	NA19238	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	122623755	122623809	DUP	55	NA20845	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG00096	0.514	0.481	0.056	0.065	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG00268	0.0	0.0	0.084	0.145	nan	nan	0	0
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG00419	0.0	0.0	0.248	0.292	nan	nan	0	0
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG00759	0.591	0.553	0.039	0.073	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG01051	1.066	0.996	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG01112	0.0	0.0	0.099	0.225	nan	nan	0	0
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG01500	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG01565	1.167	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG01583	0.707	0.661	0.073	0.059	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG01595	1.227	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG01879	0.691	0.646	0.011	0.067	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG02568	1.161	1.085	0.0	0.0	0.263	0.263	1	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG02922	1.035	0.967	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG03006	0.492	0.459	0.034	0.045	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG03052	0.984	0.92	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG03642	0.425	0.398	0.05	0.08	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	HG03742	0.509	0.476	0.011	0.071	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA12878	0.326	0.304	0.01	0.07	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA18525	0.563	0.526	0.011	0.104	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA18939	0.0	0.0	0.068	0.215	nan	nan	0	0
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA19017	1.163	1.087	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA19238	0.461	0.43	0.005	0.064	nan	nan	0	1
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA19239	1.031	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA19625	1.312	1.226	0.0	0.002	0.864	0.864	1	2
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA19648	0.0	0.0	0.075	0.18	nan	nan	0	0
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA20502	0.0	0.0	0.051	0.179	nan	nan	0	0
chr2	123364885	123365367	DEL	483	NA20845	0.683	0.638	0.007	0.046	nan	nan	0	1
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG00096	0.808	0.785	0.0	0.0	0.854	0.854	2	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG00268	0.682	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG00419	0.763	0.74	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG00759	0.907	0.88	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG01051	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG01112	0.872	0.847	0.0	0.0	0.723	0.761	2	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG01500	0.92	0.893	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG01565	0.688	0.668	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG01583	0.707	0.686	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG01595	0.563	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG01879	0.455	0.442	0.027	0.109	nan	nan	0	1
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG02568	0.464	0.451	0.0	0.011	0.5	0.5	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG02922	0.718	0.697	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG03006	0.992	0.963	0.0	0.0	0.874	0.874	2	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG03052	0.62	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG03642	0.988	0.96	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	HG03742	0.823	0.799	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA12878	0.857	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA18525	0.686	0.666	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA18939	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA19017	0.844	0.82	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA19238	0.803	0.779	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA19239	0.691	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA19625	0.566	0.55	0.0	0.0	0.657	0.657	2	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA19648	0.82	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA20502	0.696	0.676	0.0	0.0	0.574	0.574	2	2
chr2	124093011	124093464	DEL	454	NA20845	0.683	0.663	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG00096	0.918	1.056	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG00268	0.979	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG00419	0.845	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG00759	1.084	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG01051	0.759	0.872	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG01112	0.826	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG01500	0.794	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG01565	0.959	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG01583	0.975	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG01595	1.126	1.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG01879	0.891	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG02568	0.89	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG02922	0.549	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG03006	0.801	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG03052	0.834	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG03642	1.426	1.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	HG03742	0.921	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA12878	1.234	1.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA18525	1.091	1.254	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA18939	0.889	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA19017	0.788	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA19238	0.513	0.59	0.0	0.053	0.957	0.957	1	1
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA19239	0.796	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA19625	1.132	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA19648	0.934	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA20502	0.998	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	12426560	12426638	DEL	79	NA20845	0.639	0.734	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG00096	1.01	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG00268	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG00419	0.886	0.828	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG00759	0.847	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG01051	0.841	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG01112	0.808	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG01500	0.775	0.725	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG01565	0.688	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG01583	0.975	0.911	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG01595	0.644	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG01879	0.637	0.595	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG02568	0.851	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG02922	0.802	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG03006	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG03052	0.899	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG03642	0.776	0.725	0.0	0.005	0.909	0.909	1	1
chr2	124804240	124804298	DEL	59	HG03742	0.705	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA12878	0.891	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA18525	0.756	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA18939	0.889	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA19017	0.919	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA19238	0.842	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA19239	1.044	0.975	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA19625	0.695	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA19648	0.757	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA20502	0.929	0.868	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	124804240	124804298	DEL	59	NA20845	0.419	0.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG00096	0.882	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG00268	1.154	1.079	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG00419	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG00759	0.828	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG01051	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG01112	0.716	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG01500	0.848	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG01565	0.938	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG01583	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG01595	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG01879	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG02568	0.348	0.326	0.0	0.021	0.636	0.636	1	1
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG02922	0.57	0.533	0.0	0.024	0.5	0.5	1	1
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG03006	1.074	1.004	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG03052	0.342	0.32	0.0	0.025	0.9	0.9	1	1
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG03642	1.076	1.006	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	HG03742	1.352	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA12878	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA18525	0.721	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA18939	0.907	0.847	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA19017	1.013	0.947	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA19238	0.645	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA19239	0.417	0.39	0.0	0.022	1.0	1.0	1	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA19625	1.261	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA19648	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA20502	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	125411207	125411265	DEL	59	NA20845	1.145	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG00096	1.286	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG00268	1.364	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG00419	1.175	1.141	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG00759	1.222	1.186	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG01051	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG01112	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG01500	1.353	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG01565	1.167	1.133	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG01583	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG01595	1.669	1.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG01879	1.383	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG02568	1.393	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG02922	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG03006	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG03052	1.262	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG03642	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	HG03742	1.313	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA12878	1.131	1.098	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA18525	1.407	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA18939	1.269	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA19017	0.506	0.492	0.0	0.09	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.217	nan	nan	0	1
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA19239	1.344	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA19625	1.183	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA19648	1.288	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA20502	1.114	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	126898361	126898607	DEL	247	NA20845	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG00096	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG00268	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG00419	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG00759	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG01051	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG01112	0.588	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG01500	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG01565	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG01583	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG01879	1.146	1.146	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG02568	1.006	1.006	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG02922	0.908	0.908	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG03006	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG03052	1.08	1.08	0.0	0.0	0.86	0.86	2	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG03642	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	HG03742	0.94	0.94	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA12878	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA18525	0.844	0.844	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA19017	1.107	1.107	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA19238	0.803	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA19239	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA19625	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA19648	0.909	0.909	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA20502	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	130037098	130037407	DUP	310	NA20845	0.881	0.881	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG00096	0.974	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG00268	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG00419	0.721	0.7	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG00759	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG01051	1.107	1.075	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG01112	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG01500	1.19	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG01565	0.75	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG01583	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG01595	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG01879	0.782	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG02568	1.006	0.977	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG02922	1.225	1.189	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG03006	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG03052	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG03642	1.126	1.093	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	HG03742	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA12878	0.84	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA18525	0.545	0.529	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA18939	0.871	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA19017	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA19238	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA19239	0.757	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA19625	0.875	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA19648	0.682	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA20502	0.72	0.699	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr2	133149367	133149469	DEL	103	NA20845	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG00096	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG00268	0.909	0.909	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG00419	0.556	0.556	0.041	0.028	nan	nan	0	1
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG00759	0.966	0.966	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG01051	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG01112	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG01500	0.884	0.884	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG01565	0.98	0.98	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG01583	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG01595	0.825	0.825	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG01879	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG02568	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG02922	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG03006	0.419	0.419	0.055	0.032	nan	nan	0	1
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG03052	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG03642	0.425	0.425	0.053	0.031	nan	nan	0	1
chr2	135281900	135282604	DEL	705	HG03742	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA12878	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA18525	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA18939	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA19017	0.825	0.825	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA19238	0.526	0.526	0.055	0.044	nan	nan	0	1
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA19239	0.522	0.522	0.071	0.042	nan	nan	0	1
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA19625	1.106	1.106	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA19648	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA20502	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135281900	135282604	DEL	705	NA20845	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG00096	1.332	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG00268	1.381	1.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG00419	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG00759	0.907	0.907	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG01051	1.384	1.384	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG01112	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG01500	1.398	1.398	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG01565	1.167	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG01583	1.219	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG01595	1.227	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG01879	1.201	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG02568	0.967	0.967	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG02922	0.802	0.802	0.0	0.047	0.483	0.483	1	1
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG03006	1.22	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG03052	1.594	1.594	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG03642	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	HG03742	1.195	1.195	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA12878	1.183	1.183	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA18525	1.337	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA18939	1.07	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA19017	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA19238	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA19239	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA19625	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA19648	1.338	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA20502	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	135899444	135899497	DEL	54	NA20845	1.322	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG00096	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG00268	1.049	0.98	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG00419	0.783	0.732	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG00759	1.064	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG01051	1.148	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG01112	1.194	1.116	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG01500	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG01565	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG01583	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG01595	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG01879	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG02568	0.967	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG03006	1.111	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG03642	1.151	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	HG03742	0.94	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA12878	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA18525	1.179	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA18939	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA19017	1.125	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA19239	1.109	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA19648	1.389	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA20502	0.673	0.629	0.0	0.03	0.364	0.364	1	2
chr2	136402703	136402781	DUP	79	NA20845	1.079	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG00096	1.653	1.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG00268	1.451	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG00419	1.278	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG00759	1.261	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG01051	1.435	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG01112	1.396	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG01500	1.371	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG01565	1.939	1.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG01583	1.463	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG01595	1.267	1.184	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG01879	1.619	1.513	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG02568	1.432	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG02922	1.225	1.145	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG03052	1.348	1.26	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	HG03642	1.401	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA12878	1.286	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA18525	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA18939	1.306	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA19017	1.182	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA19238	0.947	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA19239	1.135	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA19625	1.724	1.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA19648	1.641	1.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA20502	0.929	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	136445119	136445191	DUP	73	NA20845	1.3	1.215	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG00096	0.735	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG00268	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG00419	0.732	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG00759	0.769	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG01051	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG01112	0.514	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG01500	0.577	0.607	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG01565	0.688	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG01583	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG01595	0.644	0.677	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG01879	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG02568	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG02922	0.57	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG03006	1.165	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG03052	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG03642	0.576	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	HG03742	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA12878	0.728	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA18525	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA18939	0.689	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA19017	0.807	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA19238	0.355	0.374	0.0	0.029	0.667	0.667	1	1
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA19239	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA19625	0.695	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA19648	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA20502	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	137239410	137239471	DEL	62	NA20845	0.474	0.498	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG00096	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG00268	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG00419	1.113	1.081	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG00759	0.414	0.402	0.0	0.081	0.421	0.421	1	1
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG01051	1.005	0.975	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG01112	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG01500	0.884	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG01565	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG01583	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG01595	0.603	0.586	0.0	0.048	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG01879	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG02568	1.316	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG02922	0.781	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG03006	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG03052	1.412	1.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG03642	0.3	0.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	HG03742	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA12878	0.951	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA18525	0.862	0.837	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA18939	0.598	0.581	0.005	0.096	nan	nan	0	1
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA19017	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA19238	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA19239	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA19625	0.72	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA19648	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA20502	1.253	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138044145	138044306	DEL	162	NA20845	0.396	0.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG00096	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG00268	0.944	0.917	0.0	0.0	0.533	0.533	3	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG00419	1.237	1.201	0.0	0.0	0.808	0.808	3	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG00759	1.045	1.014	0.0	0.0	0.613	0.613	1	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG01051	1.025	0.995	0.0	0.0	0.684	0.684	3	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG01112	1.249	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG01500	1.208	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG01565	1.001	0.971	0.0	0.0	0.875	0.824	1	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG01583	0.878	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG01595	1.267	1.23	0.009	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG01879	0.946	0.918	0.0	0.0	0.858	0.858	4	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG02568	1.122	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG02922	0.57	0.553	0.082	0.108	nan	nan	0	1
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG03006	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG03052	1.07	1.039	0.0	0.0	0.799	0.799	4	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG03642	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	HG03742	1.43	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA12878	1.08	1.048	0.0	0.0	0.81	0.81	3	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA18525	0.967	0.939	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA19017	0.975	0.947	0.0	0.0	0.631	0.631	4	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA19238	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA19239	1.226	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA19625	0.875	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA19648	1.111	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA20502	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138469144	138469611	DEL	468	NA20845	1.211	1.176	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG00096	1.176	1.141	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG00268	0.542	0.526	0.036	0.069	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG00419	0.371	0.36	0.046	0.081	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG00759	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG01051	0.431	0.418	0.012	0.099	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG01112	0.0	0.0	0.078	0.169	nan	nan	0	0
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG01500	1.335	1.296	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG01565	1.522	1.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG01583	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG01595	1.006	0.976	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG01879	0.564	0.548	0.005	0.07	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG02568	0.503	0.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG02922	1.119	1.086	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG03006	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG03052	0.535	0.519	0.005	0.066	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG03642	1.176	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	HG03742	0.0	0.0	0.029	0.222	nan	nan	0	0
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA12878	0.514	0.499	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA18525	1.055	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA18939	1.124	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA19017	0.45	0.437	0.014	0.07	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA19238	0.474	0.46	0.008	0.08	nan	nan	0	1
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA19239	0.0	0.0	0.02	0.192	nan	nan	0	0
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA19625	1.003	0.974	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA19648	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA20502	1.462	1.42	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	138490123	138490496	DEL	374	NA20845	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG00096	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG00268	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG00419	1.134	1.134	0.0	0.004	0.826	0.826	1	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG00759	0.985	0.985	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG01051	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG01112	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG01500	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG01565	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG01583	1.17	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG01595	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG01879	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG02568	1.354	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG02922	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG03006	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG03052	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG03642	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	HG03742	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA12878	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA18525	0.844	0.844	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA18939	1.124	1.124	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA19017	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA19238	0.566	0.566	0.013	0.068	nan	nan	0	1
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA19239	0.77	0.77	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA19625	1.106	1.106	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA19648	1.06	1.06	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA20502	1.277	1.277	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	139975647	139976131	DEL	485	NA20845	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG00096	0.808	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG00268	1.014	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG00419	1.092	1.061	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG00759	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG01051	0.984	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG01112	1.028	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG01500	1.154	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG01565	0.771	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG01583	0.878	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG01595	1.066	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG01879	0.982	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG02568	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG02922	0.76	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG03006	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG03052	0.278	0.27	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG03642	1.126	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	HG03742	1.078	1.046	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA12878	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA18525	1.02	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA18939	0.852	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA19017	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA19238	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA19239	0.952	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA19625	0.875	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA19648	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA20502	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140246510	140246731	DEL	222	NA20845	1.145	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG00096	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG00268	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG00419	0.763	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG00759	0.512	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG01051	0.718	0.755	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG01112	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG01500	0.703	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG01565	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG01583	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG01595	0.402	0.423	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG01879	0.473	0.498	0.0	0.045	0.273	0.273	1	1
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG02568	0.658	0.693	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG02922	0.401	0.422	0.0	0.046	0.647	0.647	1	1
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG03006	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG03052	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG03642	1.226	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	HG03742	0.509	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA12878	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA18525	0.668	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA18939	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA19017	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA19238	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA19239	0.3	0.316	0.0	0.06	0.636	0.636	1	1
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA19625	0.54	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA19648	0.707	0.744	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA20502	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	140879423	140879517	DEL	95	NA20845	0.617	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG00096	0.184	0.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG00268	0.14	0.14	0.0	0.05	0.789	0.789	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG00419	0.124	0.124	0.0	0.075	0.917	0.917	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG00759	0.256	0.256	0.0	0.03	0.762	0.762	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG01051	0.205	0.205	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG01112	0.147	0.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG01500	0.252	0.252	0.0	0.049	0.675	0.675	2	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG01565	0.146	0.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG01583	0.098	0.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG01595	0.161	0.161	0.0	0.054	0.286	0.286	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG01879	0.291	0.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG02568	0.039	0.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG02922	0.063	0.063	0.0	0.033	0.8	0.8	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG03006	0.237	0.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG03052	0.107	0.107	0.0	0.055	0.667	0.667	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG03642	0.175	0.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	HG03742	0.216	0.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA12878	0.24	0.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA18525	0.334	0.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA18939	0.218	0.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA19238	0.158	0.158	0.0	0.057	0.5	0.5	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA19239	0.17	0.17	0.0	0.056	0.476	0.476	1	1
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA19625	0.129	0.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA19648	0.227	0.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA20502	0.255	0.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141707452	141707540	DEL	89	NA20845	0.352	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG00096	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG00268	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG00419	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG00759	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG01051	0.574	0.574	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG01112	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG01500	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG01565	0.688	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG01583	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG01595	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG01879	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG02568	1.316	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG02922	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG03006	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG03052	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG03642	1.401	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	HG03742	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA12878	0.926	0.926	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA18939	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA19017	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA19238	1.066	1.066	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA19239	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA19625	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA19648	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA20502	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	141959717	141959905	DEL	189	NA20845	0.507	0.507	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG00096	1.231	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG00268	0.997	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG00419	1.134	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG00759	1.32	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG01051	1.394	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG01112	0.753	0.691	0.005	0.003	0.483	0.508	1	1
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG01500	0.866	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG01565	1.251	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG01583	0.853	0.783	0.0	0.005	0.238	0.238	1	1
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG01595	1.448	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG01879	1.001	0.918	0.0	0.005	0.667	0.667	1	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG02568	0.967	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG02922	1.225	1.124	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG03006	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG03052	0.877	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG03642	1.401	1.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	HG03742	0.98	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA12878	1.406	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA18525	1.02	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA18939	1.143	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA19017	0.544	0.499	0.0	0.011	0.885	0.885	1	1
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA19238	0.632	0.579	0.0	0.0	0.703	0.703	1	1
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA19239	0.913	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA19625	0.643	0.59	0.0	0.005	0.667	0.667	1	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA19648	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA20502	0.905	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	142063684	142063742	DEL	59	NA20845	1.123	1.031	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG00096	1.12	1.088	0.005	0.0	0.788	0.788	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG00268	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG00419	1.401	1.361	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG00759	1.222	1.186	0.0	0.0	0.35	0.35	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG01051	0.964	0.936	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG01112	1.341	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG01500	0.938	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG01565	0.855	0.83	0.0	0.0	0.769	0.817	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG01583	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG01595	1.247	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG01879	0.509	0.495	0.0	0.048	0.853	0.853	1	1
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG02568	1.316	1.277	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG02922	1.077	1.045	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG03006	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG03052	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG03642	1.201	1.166	0.0	0.004	0.556	0.556	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	HG03742	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA12878	0.977	0.949	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA18525	1.179	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA18939	1.124	1.092	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA19017	0.994	0.965	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA19238	1.145	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA19239	1.187	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA19625	1.106	1.074	0.0	0.0	0.542	0.542	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA19648	1.439	1.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA20502	0.998	0.969	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr2	143135983	143136069	DEL	87	NA20845	1.101	1.069	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG00419	0.68	0.66	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.088	nan	nan	0	0
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG01112	0.331	0.321	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG01500	0.974	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG01565	1.001	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG01583	0.488	0.473	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG01595	0.704	0.683	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG01879	0.546	0.53	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG02568	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG02922	1.182	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG03006	0.564	0.548	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG03052	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG03642	0.851	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	HG03742	0.431	0.418	0.0	0.079	0.593	0.593	1	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA18525	0.862	0.837	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA18939	0.453	0.44	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA19017	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA19238	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA19239	1.044	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA19625	0.36	0.35	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA19648	0.0	0.0	0.015	0.102	nan	nan	0	0
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA20502	0.685	0.665	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr2	146842402	146842549	DEL	148	NA20845	0.749	0.727	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG00096	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG00268	0.804	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG00419	1.092	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG00759	0.552	0.536	0.07	0.094	nan	nan	0	1
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG01051	0.369	0.358	0.027	0.092	nan	nan	0	1
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG01112	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG01500	0.902	0.875	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG01565	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG01583	1.146	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG01595	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG01879	1.092	1.06	0.0	0.003	0.667	0.667	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG02568	0.929	0.902	0.0	0.023	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG02922	0.76	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG03006	0.91	0.884	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG03052	0.877	0.852	0.007	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG03642	0.851	0.826	0.0	0.005	1.0	1.0	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	HG03742	0.94	0.913	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA12878	0.977	0.949	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA18525	0.809	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA18939	0.472	0.458	0.018	0.069	nan	nan	0	1
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA19017	0.975	0.947	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA19238	0.921	0.894	0.0	0.003	0.72	0.72	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA19239	1.096	1.064	0.003	0.0	0.647	0.647	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA19625	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA19648	0.909	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA20502	0.812	0.789	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr2	148440412	148440880	DEL	469	NA20845	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG00096	0.863	0.863	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG00268	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG00419	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG00759	0.729	0.729	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG01051	0.779	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG01112	0.845	0.845	0.0	0.0	0.875	0.921	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG01500	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG01565	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG01583	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG01595	0.905	0.905	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG01879	0.982	0.982	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG02568	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG02922	0.992	0.992	0.0	0.002	0.714	0.714	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG03006	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG03052	0.471	0.471	0.05	0.019	nan	nan	0	1
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG03642	0.901	0.901	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	HG03742	0.725	0.725	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA12878	1.148	1.148	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA18525	0.756	0.756	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA18939	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA19017	0.356	0.356	0.102	0.028	nan	nan	0	1
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA19238	0.461	0.461	0.032	0.029	nan	nan	0	1
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA19239	0.913	0.913	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA19625	1.003	1.003	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA19648	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA20502	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	151393999	151394678	DEL	680	NA20845	0.859	0.859	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG00096	0.0	0.0	0.018	0.192	nan	nan	0	0
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG00268	0.0	0.0	0.007	0.191	nan	nan	0	0
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG00419	0.495	0.462	0.006	0.056	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG00759	0.453	0.424	0.016	0.093	0.35	0.35	2	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG01051	0.677	0.632	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG01112	0.0	0.0	0.016	0.201	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG01500	0.0	0.0	0.019	0.172	nan	nan	0	0
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG01565	0.0	0.0	0.014	0.199	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG01583	1.365	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG01595	0.0	0.0	0.021	0.189	nan	nan	0	0
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG01879	1.273	1.19	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG02568	1.161	1.085	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG02922	1.098	1.026	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG03006	1.329	1.242	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG03052	1.326	1.24	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG03642	0.601	0.561	0.008	0.059	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	HG03742	1.607	1.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA12878	0.446	0.417	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA18525	0.493	0.46	0.006	0.068	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA18939	0.526	0.492	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA19017	1.144	1.069	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA19238	0.711	0.664	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA19239	1.07	1.0	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA19625	0.54	0.505	0.008	0.079	nan	nan	0	1
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA19648	0.606	0.566	0.007	0.103	nan	nan	0	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA20502	1.578	1.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152041204	152041492	DEL	289	NA20845	1.41	1.317	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG00096	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG00268	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG00419	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG00759	1.498	1.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG01051	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG01112	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG01500	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG01565	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG01583	1.195	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG01595	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG01879	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG02568	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG02922	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG03006	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG03052	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG03642	0.901	0.901	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	HG03742	1.117	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA12878	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA18525	1.073	1.073	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA18939	0.453	0.453	0.0	0.082	0.586	0.613	1	1
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA19017	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA19238	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA19239	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA19625	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA19648	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA20502	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152723336	152723438	DEL	103	NA20845	1.211	1.211	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG00096	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG00268	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG00419	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG00759	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG01051	1.005	0.975	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG01112	1.01	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG01500	1.082	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG01565	1.021	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG01583	1.219	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG01595	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG01879	1.073	1.042	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG02568	1.084	1.052	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG02922	0.739	0.717	0.049	0.026	nan	nan	0	1
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG03006	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG03052	0.513	0.499	0.062	0.031	nan	nan	0	1
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG03642	1.126	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	HG03742	0.607	0.59	0.065	0.02	nan	nan	0	1
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA12878	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA18525	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA18939	0.871	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA19017	0.0	0.0	0.256	0.074	nan	nan	0	0
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA19238	0.414	0.402	0.048	0.025	nan	nan	0	1
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA19239	0.483	0.469	0.063	0.028	nan	nan	0	1
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA19625	0.952	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA19648	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA20502	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	152798538	152799202	DEL	665	NA20845	0.826	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG00096	0.753	0.731	0.0	0.051	0.471	0.471	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG00268	0.874	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG01051	0.841	0.816	0.0	0.043	0.146	0.146	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG01112	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG01500	1.298	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG01565	1.147	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG01583	0.463	0.45	0.0	0.076	0.706	0.706	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG01595	0.0	0.0	0.008	0.112	nan	nan	0	0
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG01879	0.546	0.53	0.0	0.055	0.579	0.579	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG02568	1.316	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG02922	1.014	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG03006	0.0	0.0	0.007	0.148	nan	nan	0	0
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG03052	0.449	0.436	0.015	0.033	0.839	0.839	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.117	nan	nan	0	0
chr2	153153401	153153488	DEL	88	HG03742	0.0	0.0	0.008	0.123	nan	nan	0	0
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA12878	0.934	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA18525	0.58	0.564	0.0	0.05	0.705	0.705	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.142	nan	nan	0	0
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA19017	1.257	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA19238	0.618	0.6	0.0	0.043	0.778	0.778	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA19239	0.444	0.431	0.0	0.065	0.549	0.549	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA19625	0.437	0.425	0.0	0.074	0.9	0.9	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA19648	1.288	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA20502	0.952	0.924	0.0	0.069	0.644	0.644	1	1
chr2	153153401	153153488	DEL	88	NA20845	1.211	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG00096	0.331	0.321	0.0	0.084	0.923	0.923	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG00268	0.56	0.543	0.0	0.096	0.475	0.475	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG00419	0.701	0.68	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG00759	0.69	0.67	0.0	0.068	0.718	0.718	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG01051	0.513	0.498	0.0	0.081	0.412	0.412	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.169	nan	nan	0	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG01500	0.721	0.7	0.0	0.062	0.478	0.478	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG01565	0.667	0.648	0.0	0.059	0.567	0.602	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG01583	0.414	0.402	0.0	0.054	0.8	0.8	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.167	nan	nan	0	0
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG02922	0.0	0.0	0.008	0.152	nan	nan	0	0
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG03006	0.364	0.354	0.0	0.067	0.593	0.593	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG03642	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	154064575	154064678	DEL	104	HG03742	0.47	0.457	0.0	0.077	0.667	0.667	1	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.187	nan	nan	0	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA18939	0.762	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.185	nan	nan	0	0
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA19625	0.579	0.562	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA20502	0.0	0.0	0.019	0.148	nan	nan	0	0
chr2	154064575	154064678	DEL	104	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG00096	0.0	0.0	0.017	0.191	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG00268	0.542	0.526	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG00419	0.0	0.0	0.011	0.184	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG01051	0.0	0.0	0.009	0.166	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG01112	0.0	0.0	0.008	0.193	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG01500	0.667	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG01565	0.188	0.182	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG01583	0.463	0.45	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG01595	0.0	0.0	0.009	0.108	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG01879	0.491	0.477	0.007	0.081	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG02568	0.387	0.376	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG02922	0.317	0.307	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG03006	0.455	0.442	0.0	0.112	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG03052	0.471	0.457	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG03642	0.0	0.0	0.006	0.133	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	HG03742	0.0	0.0	0.01	0.21	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA18525	0.0	0.0	0.009	0.217	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA18939	0.0	0.0	0.011	0.186	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA19017	0.619	0.601	0.006	0.084	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA19238	0.316	0.307	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA19239	0.378	0.367	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA19625	0.437	0.425	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA19648	0.656	0.637	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr2	154494940	154495150	DEL	211	NA20845	0.264	0.257	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG00096	0.551	0.535	0.0	0.046	0.27	0.27	1	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG00268	0.35	0.34	0.0	0.09	0.857	0.857	1	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG00759	1.202	1.167	0.0	0.0	0.758	0.758	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG01051	0.513	0.498	0.0	0.05	0.667	0.667	1	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG01112	1.506	1.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG01500	1.01	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG01565	0.98	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG01583	1.073	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG01595	1.036	1.006	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG01879	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG02568	0.503	0.488	0.0	0.075	1.0	1.0	1	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG02922	0.507	0.492	0.0	0.036	0.867	0.867	1	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG03052	0.535	0.519	0.0	0.047	0.593	0.593	1	1
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG03642	1.101	1.069	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	HG03742	1.038	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA12878	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA18525	1.091	1.059	0.0	0.006	0.848	0.848	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA18939	1.016	0.986	0.0	0.0	0.793	0.829	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA19017	1.107	1.074	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA19238	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA19239	0.574	0.557	0.0	0.07	0.707	0.707	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA19625	1.003	0.974	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA19648	0.934	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA20502	0.998	0.969	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr2	156750284	156750369	DEL	86	NA20845	0.859	0.834	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG00096	0.79	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG00268	0.734	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG00419	1.051	1.208	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG00759	0.69	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG01051	0.718	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG01112	0.165	0.19	0.0	0.027	0.917	0.965	1	1
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG01500	0.559	0.643	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG01565	0.5	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG01583	0.853	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG01595	0.623	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG01879	0.619	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG02568	0.619	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG02922	0.887	1.019	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG03006	0.692	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG03052	0.888	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG03642	0.851	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	HG03742	1.244	1.43	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA12878	0.754	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA18525	0.809	0.93	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA18939	0.979	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA19017	0.825	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA19238	0.638	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA19239	0.874	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA19625	0.9	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA19648	0.505	0.58	0.0	0.043	0.833	0.833	1	1
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA20502	0.812	0.934	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	159644058	159644119	DEL	62	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG00096	0.533	0.533	0.085	0.041	0.286	0.286	3	1
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG00268	0.542	0.542	0.066	0.046	nan	nan	0	1
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG00419	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG00759	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG01051	0.636	0.636	0.082	0.062	0.9	0.9	2	1
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG01112	0.937	0.937	0.0	0.0	0.944	0.897	1	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG01500	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG01565	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG01583	1.048	1.048	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG01595	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG01879	1.128	1.128	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG02568	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG02922	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG03006	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG03052	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG03642	1.276	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	HG03742	0.431	0.431	0.069	0.043	nan	nan	0	1
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA12878	0.754	0.754	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA18525	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA18939	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA19017	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA19238	1.013	1.013	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA19239	1.083	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA19625	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA19648	0.985	0.985	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA20502	0.511	0.511	0.083	0.04	nan	nan	0	1
chr2	159661933	159662894	DEL	962	NA20845	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG00096	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG00268	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG00419	0.989	0.989	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG00759	0.769	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG01051	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG01112	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG01500	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG01565	0.73	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG01583	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG01595	0.825	0.825	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG01879	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG02568	0.387	0.387	0.0	0.037	0.716	0.716	2	1
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG02922	0.486	0.486	0.0	0.048	0.7	0.7	3	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG03006	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG03052	0.535	0.535	0.0	0.053	0.652	0.652	3	1
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG03642	1.226	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	HG03742	0.607	0.607	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA12878	0.806	0.806	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA18525	0.704	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA18939	1.215	1.215	0.005	0.0	0.909	0.95	1	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA19017	1.144	1.144	0.0	0.0	0.629	0.629	1	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA19238	0.447	0.447	0.0	0.047	0.858	0.858	2	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA19239	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA19625	1.158	1.158	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA19648	1.262	1.262	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA20502	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	160694125	160694213	DEL	89	NA20845	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG00096	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG00268	0.927	0.927	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG00419	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG00759	0.709	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG01051	0.8	0.8	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG01112	1.084	1.084	0.0	0.002	0.75	0.789	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG01500	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.0	0.882	0.938	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG01583	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG01595	0.845	0.845	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG01879	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG02568	1.354	1.354	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG02922	0.465	0.465	0.067	0.007	nan	nan	0	1
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG03006	0.874	0.874	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG03052	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG03642	0.526	0.526	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	HG03742	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA12878	1.063	1.063	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA18525	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA18939	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA19017	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA19238	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA19239	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA19625	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA19648	0.934	0.934	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA20502	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	162001727	162002451	DEL	725	NA20845	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG00096	1.304	1.219	0.0	0.003	0.674	0.674	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG00268	0.682	0.637	0.0	0.006	0.441	0.441	1	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG00419	0.577	0.539	0.0	0.015	0.606	0.606	2	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG00759	0.68	0.635	0.0	0.006	0.827	0.827	2	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG01051	0.431	0.402	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG01112	0.918	0.858	0.0	0.006	0.455	0.478	1	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG01500	0.748	0.699	0.0	0.01	0.649	0.649	2	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG01565	1.126	1.052	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG01583	1.341	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG01595	0.704	0.658	0.0	0.006	0.88	0.88	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG01879	1.001	0.935	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG02568	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG02922	1.014	0.947	0.0	0.003	0.8	0.8	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG03006	0.838	0.783	0.0	0.013	0.434	0.434	2	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG03052	0.931	0.87	0.0	0.004	0.593	0.593	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG03642	0.751	0.702	0.0	0.025	0.7	0.7	1	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	HG03742	0.911	0.851	0.0	0.009	0.575	0.575	1	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA12878	0.926	0.865	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA18525	0.809	0.756	0.0	0.015	0.621	0.621	2	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA18939	0.925	0.864	0.0	0.012	0.536	0.534	2	1
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA19017	1.641	1.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA19238	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA19239	1.213	1.134	0.0	0.0	0.655	0.655	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA19625	1.261	1.178	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA19648	0.808	0.755	0.0	0.024	0.786	0.786	1	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA20502	1.37	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	166905634	166905709	DEL	76	NA20845	1.211	1.132	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG00096	0.625	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG00268	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG00419	0.824	0.868	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG00759	0.729	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG01051	0.39	0.41	0.047	0.021	nan	nan	0	1
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG01112	0.845	0.889	0.0	0.0	0.761	0.723	2	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG01500	0.866	0.911	0.0	0.0	0.777	0.777	2	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG01565	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG01583	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG01595	0.805	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG01879	0.4	0.421	0.059	0.026	0.524	0.524	1	1
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG02568	0.89	0.937	0.0	0.0	0.774	0.774	2	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG02922	0.676	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG03006	0.728	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG03052	0.535	0.563	0.066	0.018	nan	nan	0	1
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG03642	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	HG03742	0.882	0.928	0.0	0.0	0.846	0.846	2	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA12878	0.908	0.956	0.0	0.002	0.833	0.833	10	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA18525	0.774	0.815	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA18939	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA19017	0.75	0.79	0.0	0.0	0.846	0.846	2	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA19238	1.013	1.066	0.001	0.0	0.886	0.886	10	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA19239	1.07	1.126	0.0	0.0	0.723	0.723	1	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA19625	0.823	0.867	0.0	0.0	0.737	0.737	3	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA19648	0.732	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA20502	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	168666457	168667318	DEL	862	NA20845	0.903	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG00096	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG00268	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG00419	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG00759	0.847	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG01051	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG01112	0.753	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG01500	0.794	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG01565	0.938	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG01583	0.317	0.308	0.0	0.098	0.8	0.8	1	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG01595	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG01879	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG02568	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG02922	0.465	0.451	0.0	0.036	0.765	0.765	1	1
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG03006	1.038	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG03052	0.899	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG03642	0.726	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	HG03742	1.117	1.084	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA12878	0.857	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA18525	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA18939	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA19017	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA19238	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA19239	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA19625	1.261	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA19648	1.288	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA20502	0.812	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169403993	169404054	DEL	62	NA20845	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.135	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG00419	0.453	0.477	0.0	0.052	0.769	0.769	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG00759	0.493	0.519	0.0	0.036	0.472	0.472	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG01112	0.312	0.329	0.0	0.024	0.389	0.409	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG01500	0.631	0.664	0.0	0.029	0.4	0.4	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG01583	0.463	0.488	0.0	0.053	0.875	0.875	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG01595	0.422	0.445	0.0	0.04	0.6	0.6	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG03006	0.31	0.326	0.0	0.044	0.75	0.75	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG03642	1.301	1.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	169606131	169606207	DEL	77	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA18525	0.405	0.426	0.0	0.051	0.636	0.636	1	1
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr2	169606131	169606207	DEL	77	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.082	nan	nan	0	0
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG00096	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG00268	0.909	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG00419	1.031	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG00759	0.808	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG01051	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG01112	1.047	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG01500	0.721	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG01565	1.021	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG01583	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG01595	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG01879	0.619	0.601	0.0	0.078	0.371	0.371	1	1
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG02568	0.735	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG02922	0.802	0.779	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG03006	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG03642	0.851	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	HG03742	0.842	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA12878	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA18525	1.179	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA18939	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA19017	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA19238	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA19239	0.978	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA19625	0.952	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA19648	0.555	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA20502	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	170306053	170306147	DEL	95	NA20845	0.859	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG00096	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG00268	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG00419	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG00759	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG01051	0.297	0.297	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG01112	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG01500	0.559	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG01565	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG01583	0.634	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG01595	0.644	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG01879	0.746	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG02568	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG02922	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG03006	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG03052	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG03642	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	HG03742	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA12878	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA18525	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA18939	0.707	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA19017	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA19238	1.066	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA19239	0.548	0.548	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA19625	0.849	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA19648	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA20502	0.58	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	174842785	174842926	DEL	142	NA20845	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG00096	1.01	0.981	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG00268	0.769	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG00419	1.154	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG00759	0.985	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG01051	1.292	1.254	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG01112	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG01500	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG01565	0.667	0.648	0.0	0.0	0.875	0.93	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG01583	0.878	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG01595	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG01879	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG02568	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG02922	1.056	1.025	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG03006	0.874	0.849	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG03052	0.963	0.935	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG03642	1.051	1.02	0.0	0.005	0.667	0.667	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	HG03742	0.94	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA12878	0.891	0.865	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA18525	0.844	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA18939	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA19017	0.506	0.492	0.0	0.055	0.486	0.486	2	1
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA19238	0.816	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA19239	0.913	0.887	0.0	0.0	0.73	0.73	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA19625	0.772	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA19648	0.985	0.956	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA20502	1.091	1.059	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr2	177802995	177803095	DEL	101	NA20845	1.013	0.984	0.009	0.0	0.773	0.773	1	2
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG00096	0.0	0.0	0.075	0.221	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG00268	0.0	0.0	0.027	0.248	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG00419	0.639	0.62	0.051	0.088	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG00759	0.788	0.765	0.012	0.103	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG01051	0.39	0.378	0.033	0.115	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG01112	0.0	0.0	0.078	0.265	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG01500	0.595	0.578	0.036	0.087	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG01565	0.0	0.0	0.099	0.217	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG01583	0.536	0.521	0.037	0.057	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG01595	0.0	0.0	0.102	0.217	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG01879	0.728	0.706	0.024	0.089	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG02568	0.735	0.714	0.03	0.061	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG02922	1.182	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG03006	0.0	0.0	0.113	0.272	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG03052	1.348	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG03642	0.0	0.0	0.095	0.219	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	HG03742	0.0	0.0	0.081	0.26	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA18525	0.475	0.461	0.037	0.077	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA18939	0.653	0.634	0.024	0.047	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA19017	1.201	1.166	0.0	0.0	0.531	0.531	1	2
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA19238	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA19239	0.0	0.0	0.032	0.25	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA19625	0.669	0.649	0.034	0.085	nan	nan	0	1
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA19648	0.0	0.0	0.054	0.25	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA20502	0.0	0.0	0.059	0.193	nan	nan	0	0
chr2	178287642	178288052	DEL	411	NA20845	0.0	0.0	0.057	0.228	nan	nan	0	0
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG00096	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG00268	0.927	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG00419	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG00759	0.729	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG01051	0.328	0.365	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG01112	1.102	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG01500	1.028	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG01565	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG01583	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG01595	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG01879	1.146	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG02568	0.851	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG02922	0.845	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG03006	0.892	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG03052	0.77	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG03642	0.701	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	HG03742	1.019	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA12878	0.926	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA18525	1.266	1.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA18939	0.725	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA19017	0.9	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA19238	0.961	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA19239	1.083	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA19625	1.055	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA19648	0.959	1.066	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA20502	1.068	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	179191716	179191836	DEL	121	NA20845	0.925	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG00096	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG00268	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG00419	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG00759	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG01051	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG01112	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG01500	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG01565	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG01583	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG01595	1.307	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG01879	1.201	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG02568	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG02922	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG03006	1.074	1.074	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG03052	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG03642	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	HG03742	0.98	0.98	0.0	0.008	0.95	0.95	1	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA12878	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA18525	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA18939	0.979	0.979	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA19017	1.125	1.125	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA19238	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA19239	1.122	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA19625	0.695	0.695	0.052	0.061	nan	nan	0	1
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA19648	1.389	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA20502	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	180226925	180227456	DEL	532	NA20845	1.189	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG00096	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG00268	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG00419	1.031	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG00759	1.281	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG01051	1.517	1.473	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG01112	1.488	1.444	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG01500	1.118	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG01565	1.459	1.417	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG01583	1.511	1.467	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG01595	1.197	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG02568	0.464	0.451	0.0	0.085	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG02922	1.225	1.189	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG03006	1.129	1.096	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG03052	1.177	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG03642	1.426	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	HG03742	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA12878	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA18525	0.721	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA19017	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA19238	1.184	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA19239	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA19625	1.286	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA19648	1.515	1.471	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA20502	1.393	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	181083325	181083476	DUP	152	NA20845	1.3	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG00096	0.992	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG00268	1.329	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG00419	0.907	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG00759	1.182	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG01051	1.62	1.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG01112	1.175	1.078	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG01500	1.01	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG01565	1.209	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG01583	1.0	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG01595	1.267	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG01879	1.255	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG02568	0.406	0.373	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG02922	1.182	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG03006	1.329	1.219	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG03052	0.62	0.569	0.006	0.07	nan	nan	0	1
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG03642	1.026	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	HG03742	1.548	1.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA12878	1.063	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA18525	1.302	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA18939	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA19017	1.144	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA19238	1.316	1.207	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA19239	1.129	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA19625	1.312	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA19648	1.212	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA20502	1.23	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182151854	182151969	DEL	116	NA20845	1.101	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG00096	0.643	0.775	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG00268	0.42	0.506	0.0	0.015	0.591	0.591	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG00419	0.556	0.67	0.0	0.011	0.52	0.52	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG00759	0.591	0.712	0.0	0.039	0.737	0.737	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG01051	0.185	0.222	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG01112	0.588	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG01500	0.83	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG01565	0.167	0.201	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG01583	0.609	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG01595	0.261	0.315	0.0	0.031	0.556	0.556	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG01879	0.764	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG02568	0.271	0.326	0.0	0.0	0.571	0.571	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG02922	0.676	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG03006	0.346	0.417	0.0	0.018	0.929	0.929	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG03052	0.257	0.309	0.0	0.025	0.867	0.867	3	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG03642	0.951	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	HG03742	0.568	0.685	0.0	0.005	0.591	0.591	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA12878	0.326	0.392	0.0	0.017	1.0	1.0	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA18525	0.774	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA18939	0.834	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA19017	0.431	0.52	0.0	0.033	0.789	0.789	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA19238	0.75	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA19239	0.705	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA19625	0.669	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA19648	0.833	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA20502	0.58	0.699	0.0	0.035	0.682	0.682	1	1
chr2	1826537	1826595	DEL	59	NA20845	0.33	0.398	0.0	0.027	0.455	0.455	1	1
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG00096	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG00268	1.364	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG00419	1.072	1.041	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG00759	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG01051	1.271	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG01112	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG01500	1.226	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG01565	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG01583	1.268	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG01595	1.508	1.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG01879	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG02568	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG02922	1.14	1.107	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG03006	1.147	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG03052	1.476	1.433	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG03642	1.176	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	HG03742	1.371	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA12878	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA18525	1.231	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA18939	0.472	0.458	0.096	0.036	0.13	0.136	6	1
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA19017	1.125	1.093	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA19238	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA19239	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA19625	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA19648	1.212	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA20502	1.393	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182773617	182774288	DEL	672	NA20845	1.3	1.262	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG00096	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG00268	0.507	0.492	0.076	0.056	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG00419	1.092	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG00759	1.281	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG01051	1.087	1.055	0.0	0.0	0.852	0.852	2	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG01112	0.624	0.606	0.056	0.045	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG01500	0.469	0.455	0.107	0.069	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG01565	1.126	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG01583	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG01595	1.368	1.328	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG01879	1.219	1.183	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG02568	1.509	1.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG02922	1.267	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG03006	0.546	0.53	0.08	0.044	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG03052	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG03642	0.45	0.437	0.081	0.062	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	HG03742	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA12878	0.6	0.582	0.056	0.058	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA18525	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA18939	1.269	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA19017	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA19238	0.539	0.524	0.072	0.047	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA19239	0.574	0.557	0.064	0.041	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA19625	0.669	0.649	0.082	0.05	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA19648	0.909	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA20502	0.58	0.563	0.093	0.061	nan	nan	0	1
chr2	182856891	182857589	DEL	699	NA20845	1.278	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG00096	0.478	0.446	0.0	0.042	0.588	0.588	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG00268	1.014	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG00419	0.433	0.404	0.0	0.062	0.613	0.613	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG00759	0.572	0.534	0.0	0.08	1.0	1.0	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	0
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG01112	0.533	0.498	0.0	0.056	0.529	0.557	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.102	nan	nan	0	0
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG01565	0.5	0.468	0.0	0.059	0.821	0.873	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG01583	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG01595	0.744	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG01879	0.528	0.493	0.0	0.072	0.743	0.743	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG02568	0.464	0.434	0.0	0.041	0.6	0.6	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG02922	0.676	0.631	0.0	0.034	0.485	0.485	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG03006	0.674	0.63	0.0	0.042	0.526	0.526	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG03052	0.685	0.64	0.0	0.059	0.722	0.722	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG03642	0.425	0.398	0.0	0.039	0.706	0.706	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	HG03742	0.647	0.604	0.0	0.057	0.719	0.719	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.083	nan	nan	0	0
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA18525	0.457	0.427	0.0	0.039	0.543	0.543	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA18939	1.215	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	0
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA19238	0.408	0.381	0.0	0.042	0.786	0.786	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA19239	0.496	0.463	0.0	0.047	0.596	0.596	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA19625	1.209	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA20502	0.418	0.39	0.0	0.035	0.778	0.778	1	1
chr2	183354710	183354784	DEL	75	NA20845	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG00096	0.808	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG00268	0.752	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG00419	0.268	0.26	0.075	0.098	nan	nan	0	1
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG00759	0.985	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG01051	0.472	0.458	0.039	0.039	nan	nan	0	1
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG01112	0.312	0.303	0.037	0.055	nan	nan	0	1
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG01500	0.775	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG01565	0.688	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG01583	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG01595	0.503	0.488	0.102	0.035	0.364	0.364	1	1
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG01879	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG02568	0.58	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG02922	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG03006	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG03052	0.984	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG03642	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	HG03742	0.549	0.533	0.063	0.068	nan	nan	0	1
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA12878	0.754	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA18525	0.405	0.393	0.048	0.07	nan	nan	0	1
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA18939	0.0	0.0	0.146	0.188	nan	nan	0	0
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA19017	0.769	0.747	0.0	0.0	0.645	0.645	1	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA19238	0.816	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA19239	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA19625	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA19648	1.01	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA20502	0.0	0.0	0.123	0.218	nan	nan	0	0
chr2	19002864	19003361	DEL	498	NA20845	0.0	0.0	0.135	0.089	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG00268	0.455	0.505	0.0	0.025	0.906	0.906	1	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG00419	1.113	1.237	0.0	0.0	0.821	0.821	1	2
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG01112	0.533	0.592	0.0	0.017	0.593	0.624	1	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG01500	0.252	0.281	0.0	0.023	0.889	0.889	1	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG01565	0.542	0.602	0.0	0.018	0.745	0.742	2	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.063	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG02922	0.528	0.587	0.0	0.039	0.84	0.84	2	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG03006	0.546	0.607	0.0	0.039	0.807	0.807	2	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG03052	0.567	0.63	0.0	0.015	0.926	0.926	1	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	HG03742	0.431	0.479	0.0	0.018	0.793	0.793	1	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA12878	0.891	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA18525	1.055	1.173	0.0	0.0	0.897	0.897	1	2
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA18939	1.179	1.31	0.0	0.0	0.968	0.926	1	2
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA19017	0.544	0.604	0.0	0.014	0.769	0.769	1	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA19238	0.842	0.936	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA19625	1.081	1.201	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA19648	0.656	0.729	0.0	0.028	0.552	0.552	1	1
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	0
chr2	191635470	191635523	DEL	54	NA20845	0.573	0.636	0.0	0.03	0.778	0.778	1	1
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG01112	0.0	0.0	0.006	0.111	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.148	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	1
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.123	0.071	0.071	1	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	1
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.183	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	1
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	1
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	1
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA19625	0.0	0.0	0.008	0.148	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA19648	0.0	0.0	0.012	0.087	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA20502	0.0	0.0	0.009	0.125	nan	nan	0	0
chr2	191680779	191680874	DEL	96	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	1
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG00096	1.047	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG00268	0.927	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG00419	1.216	1.136	0.0	0.004	0.929	0.929	1	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG00759	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG01051	0.39	0.364	0.0	0.069	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG01112	0.863	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG01500	1.1	1.028	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG01565	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG01583	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG01595	0.925	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG01879	0.837	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG02568	0.503	0.47	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG02922	1.182	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG03006	1.165	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG03052	0.642	0.6	0.007	0.13	nan	nan	0	1
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG03642	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	HG03742	1.43	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA12878	0.831	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA18525	0.932	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA18939	1.016	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA19017	0.919	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA19238	1.053	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA19239	0.47	0.439	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA19625	0.823	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA19648	1.01	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA20502	1.184	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	193781793	193782004	DEL	212	NA20845	0.991	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG00096	0.239	0.265	0.0	0.079	0.333	0.333	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG00268	0.455	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG00419	0.206	0.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG00759	0.512	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG01051	0.164	0.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG01112	0.478	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG01500	0.541	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG01565	0.271	0.301	0.0	0.119	0.737	0.693	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG01583	0.171	0.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG01595	0.402	0.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG01879	0.309	0.344	0.0	0.104	0.778	0.778	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG02568	0.116	0.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG02922	0.106	0.117	0.0	0.107	0.889	0.889	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG03006	0.437	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG03052	0.107	0.119	0.0	0.105	0.6	0.6	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG03642	0.075	0.083	0.012	0.074	0.556	0.556	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	HG03742	0.549	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA12878	0.514	0.571	0.0	0.1	0.444	0.444	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA18525	0.246	0.274	0.0	0.104	0.762	0.762	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA18939	0.544	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA19017	0.45	0.5	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA19238	0.329	0.365	0.0	0.132	0.941	0.941	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA19239	0.444	0.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA19625	0.257	0.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA19648	0.151	0.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA20502	0.232	0.258	0.0	0.131	0.875	0.875	2	1
chr2	195477627	195477734	DEL	108	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.195	nan	nan	0	0
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG00096	0.735	0.773	0.0	0.0	0.591	0.591	2	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG00268	0.682	0.718	0.0	0.0	0.438	0.438	7	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG00419	0.639	0.673	0.0	0.0	0.471	0.471	8	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG00759	0.591	0.622	0.0	0.0	0.75	0.75	11	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG01051	0.738	0.777	0.0	0.004	0.818	0.818	11	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG01112	0.698	0.735	0.0	0.0	0.6	0.632	9	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG01500	0.667	0.702	0.0	0.0	0.615	0.615	5	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG01565	0.688	0.724	0.0	0.007	0.857	0.807	1	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG01583	0.609	0.642	0.0	0.0	0.4	0.4	4	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG01595	0.503	0.529	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG01879	0.582	0.613	0.0	0.002	0.627	0.627	10	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG02568	0.851	0.896	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG02922	0.633	0.667	0.0	0.0	0.417	0.417	3	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG03006	0.492	0.517	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG03052	0.599	0.631	0.0	0.004	0.412	0.412	9	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG03642	0.3	0.316	0.053	0.033	nan	nan	0	1
chr2	195842286	195842868	DEL	583	HG03742	0.529	0.557	0.01	0.0	0.383	0.383	4	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA12878	0.891	0.938	0.0	0.0	0.651	0.651	2	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA18525	0.739	0.778	0.0	0.0	0.444	0.444	8	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA18939	0.707	0.745	0.008	0.0	0.769	0.804	3	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA19017	0.675	0.711	0.0	0.0	0.7	0.7	5	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA19238	0.645	0.679	0.0	0.0	0.688	0.688	4	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA19239	0.548	0.577	0.0	0.0	0.444	0.444	10	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA19625	0.643	0.677	0.0	0.0	0.471	0.471	3	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA19648	0.656	0.691	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA20502	0.604	0.635	0.0	0.0	0.692	0.692	7	2
chr2	195842286	195842868	DEL	583	NA20845	0.617	0.649	0.0	0.012	0.875	0.875	9	2
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG00096	0.0	0.0	0.07	0.223	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG00268	0.0	0.0	0.042	0.211	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG00419	0.453	0.453	0.098	0.125	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG00759	0.414	0.414	0.033	0.055	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG01051	0.492	0.492	0.034	0.078	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG01112	0.0	0.0	0.04	0.08	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG01500	0.397	0.397	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG01565	0.479	0.479	0.054	0.088	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG01583	0.0	0.0	0.103	0.149	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG01595	0.422	0.422	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG01879	0.528	0.528	0.011	0.068	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG02568	0.0	0.0	0.063	0.182	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG02922	0.57	0.57	0.039	0.052	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG03006	0.0	0.0	0.079	0.233	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG03052	0.0	0.0	0.127	0.225	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG03642	0.0	0.0	0.063	0.258	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	HG03742	0.0	0.0	0.059	0.206	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA12878	0.0	0.0	0.024	0.223	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA18525	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA18939	0.399	0.399	0.031	0.138	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA19017	0.0	0.0	0.06	0.24	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA19238	0.474	0.474	0.026	0.122	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA19239	0.0	0.0	0.017	0.206	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA19625	0.0	0.0	0.047	0.225	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA19648	0.555	0.555	0.013	0.09	nan	nan	0	1
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA20502	0.0	0.0	0.085	0.217	nan	nan	0	0
chr2	196214818	196215228	DEL	411	NA20845	0.352	0.352	0.027	0.053	nan	nan	0	1
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG00096	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG00268	1.102	1.07	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG00419	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG00759	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG01051	0.39	0.378	0.0	0.049	0.885	0.885	2	1
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG01112	0.661	0.642	0.0	0.041	0.757	0.796	2	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG01500	0.595	0.578	0.0	0.029	0.681	0.681	2	1
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG01565	1.147	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG01583	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG01595	1.167	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG01879	1.255	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG02568	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG02922	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG03006	0.874	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG03052	0.513	0.499	0.0	0.023	0.577	0.577	2	1
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG03642	1.552	1.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	HG03742	0.803	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA12878	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA18525	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA18939	1.251	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA19017	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA19238	1.013	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA19239	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA19625	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA19648	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA20502	1.578	1.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	196327929	196328003	DEL	75	NA20845	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG00268	0.804	0.847	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	0
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG00759	0.493	0.519	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG01051	0.636	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG01112	0.404	0.425	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG01500	0.92	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG01565	0.98	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG01583	0.78	0.821	0.0	0.02	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG01595	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG01879	0.8	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG02568	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG02922	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG03006	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG03052	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG03642	1.151	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	HG03742	0.745	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA12878	1.037	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA18525	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA18939	0.399	0.42	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA19017	0.413	0.434	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA19238	0.579	0.609	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA19239	0.417	0.439	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA19625	0.772	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA19648	0.53	0.558	0.01	0.092	nan	nan	0	1
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA20502	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	198894512	198894649	DEL	138	NA20845	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG00096	0.845	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG00268	0.804	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG00419	0.824	0.916	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG00759	0.946	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG01051	0.902	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG01112	0.716	0.796	0.0	0.0	0.794	0.754	2	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG01500	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG01565	0.636	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG01583	0.853	0.948	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG01595	0.623	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG01879	0.582	0.647	0.0	0.0	0.66	0.66	2	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG02568	1.238	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG02922	0.929	1.032	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG03006	0.801	0.89	0.0	0.0	0.669	0.669	2	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG03052	0.877	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG03642	0.976	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	HG03742	0.647	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA12878	0.806	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA18525	0.58	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA18939	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA19017	0.9	1.0	0.0	0.0	0.942	0.942	2	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA19238	0.276	0.307	0.012	0.056	0.579	0.579	2	1
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA19239	0.783	0.87	0.0	0.003	0.619	0.619	4	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA19625	0.849	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA19648	0.985	1.094	0.0	0.0	0.482	0.482	2	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA20502	0.952	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	19987243	19987832	DEL	590	NA20845	0.705	0.783	0.0	0.007	0.812	0.812	2	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG00096	0.496	0.464	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG00268	0.507	0.474	0.006	0.08	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG00419	0.845	0.79	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG00759	0.828	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG01051	0.41	0.383	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG01112	0.606	0.566	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG01500	0.541	0.506	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG01565	0.521	0.487	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG01583	0.366	0.342	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG01595	0.563	0.526	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG01879	0.619	0.578	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG02568	0.929	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG02922	1.225	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG03006	0.692	0.647	0.003	0.101	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG03052	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG03642	1.064	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	HG03742	0.588	0.549	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.192	nan	nan	0	0
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA18525	1.038	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA18939	1.124	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA19017	0.807	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA19238	1.053	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA19239	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA19625	0.489	0.457	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA19648	0.404	0.378	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA20502	0.348	0.325	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr2	200312454	200312679	DEL	226	NA20845	0.771	0.72	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG00096	1.065	1.065	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG00268	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG00419	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG00759	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG01051	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG01112	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG01500	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG01565	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG01583	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG01595	0.986	0.986	0.02	0.062	nan	nan	0	1
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG01879	0.837	0.837	0.0	0.0	0.951	0.951	2	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG02568	0.735	0.735	0.0	0.0	0.722	0.722	2	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG02922	0.845	0.845	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG03006	0.965	0.965	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG03052	0.963	0.963	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG03642	0.551	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	HG03742	1.058	1.058	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA12878	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA18525	1.003	1.003	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA18939	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA19017	0.975	0.975	0.0	0.0	0.842	0.842	2	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA19238	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA19239	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA19625	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA20502	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999138	205999773	DEL	636	NA20845	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG00096	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG00268	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG00419	1.195	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG00759	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG01051	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG01112	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG01500	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG01565	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG01583	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG01595	0.945	0.945	0.03	0.087	nan	nan	0	1
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG01879	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG02568	0.735	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG02922	0.845	0.845	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG03006	1.001	1.001	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG03052	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG03642	0.551	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	HG03742	1.038	1.038	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA12878	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA18525	1.003	1.003	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA18939	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA19017	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA19238	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA19239	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA19625	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA19648	1.086	1.086	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA20502	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	205999231	205999657	DEL	427	NA20845	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG00096	0.863	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG00268	0.874	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG00419	0.721	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG00759	0.749	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG01051	1.128	1.054	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG01112	0.973	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG01500	0.875	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG01565	0.896	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG01583	1.012	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG01595	1.066	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG01879	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG02922	1.066	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG03006	0.874	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG03052	1.209	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG03642	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	HG03742	0.921	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA12878	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA18525	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA18939	1.17	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA19017	0.844	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA19238	0.434	0.406	0.0	0.011	0.75	0.75	1	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA19239	0.718	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA19625	1.029	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA19648	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA20502	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207822943	207823000	DEL	58	NA20845	0.859	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG00096	0.974	0.893	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG00268	1.241	1.139	0.0	0.0	0.906	0.906	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG00419	1.257	1.153	0.0	0.0	0.697	0.697	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG00759	1.32	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG01051	1.681	1.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG01112	1.12	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG01500	0.848	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG01565	1.397	1.281	0.0	0.0	0.794	0.844	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG01583	1.255	1.152	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG01595	1.086	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG01879	0.637	0.584	0.0	0.06	0.81	0.81	2	1
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG02568	0.851	0.781	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG02922	1.151	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG03006	1.238	1.136	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG03052	1.091	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG03642	1.201	1.102	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	HG03742	1.332	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA12878	1.08	0.991	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA18525	1.214	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA18939	1.251	1.148	0.0	0.0	0.969	0.987	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA19017	1.201	1.101	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA19238	0.987	0.905	0.0	0.0	0.973	0.973	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA19239	1.383	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA19625	1.235	1.133	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA19648	1.073	0.984	0.0	0.0	0.406	0.406	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA20502	1.045	0.958	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	207861827	207861910	DEL	84	NA20845	1.256	1.152	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG00096	1.323	1.236	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG00268	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG00419	1.072	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG00759	1.064	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG01051	1.23	1.15	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG01112	1.286	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG01500	1.154	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG01565	1.292	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG01583	1.073	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG01595	0.704	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG01879	1.11	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG02568	0.851	0.796	0.0	0.042	0.583	0.583	1	1
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG02922	1.119	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG03006	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG03052	1.241	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG03642	1.076	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	HG03742	1.225	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA12878	0.926	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA18525	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA18939	1.161	1.085	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA19017	1.163	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA19238	0.855	0.799	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA19239	1.122	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA19625	1.364	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA19648	1.439	1.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA20502	0.952	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	209632971	209633026	DEL	56	NA20845	0.991	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG00096	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG00268	0.769	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG00419	0.742	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG00759	0.473	0.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG01051	0.615	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG01112	0.68	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG01500	0.685	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG01565	0.636	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG01583	0.707	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG01595	0.523	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG01879	0.728	0.706	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG02568	0.774	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG02922	0.57	0.553	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG03006	0.71	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG03052	0.856	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG03642	0.651	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	HG03742	0.607	0.59	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA12878	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA18525	0.704	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA18939	0.852	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA19017	0.75	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA19238	0.474	0.46	0.0	0.044	0.467	0.467	1	1
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA19239	0.77	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA19625	0.617	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA19648	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA20502	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	21113168	21113255	DEL	88	NA20845	0.683	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG00096	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG00268	1.137	1.103	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG00419	1.195	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG00759	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG01051	1.087	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG01112	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG01500	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG01565	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG01583	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG01595	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG01879	0.6	0.583	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG02568	1.2	1.165	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG02922	1.351	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG03006	1.074	1.043	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG03052	1.113	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG03642	0.851	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	HG03742	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA12878	0.874	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA18525	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA18939	1.124	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA19017	1.444	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA19238	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA19239	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA19625	1.621	1.574	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA19648	1.389	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA20502	1.393	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	211132734	211133038	DEL	305	NA20845	1.145	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG00096	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG00419	1.237	1.302	0.0	0.004	0.833	0.833	1	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG00759	0.473	0.498	0.0	0.028	0.882	0.882	2	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG01051	1.087	1.144	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG01112	1.065	1.121	0.0	0.0	0.967	0.983	1	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG01500	1.217	1.281	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG01565	0.771	0.812	0.0	0.075	0.706	0.75	1	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG01583	0.609	0.642	0.0	0.027	0.529	0.529	1	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG01595	0.865	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG01879	1.11	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG02568	0.658	0.693	0.0	0.023	0.667	0.667	1	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG03006	1.147	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG03052	0.62	0.653	0.0	0.058	0.733	0.733	1	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG03642	1.589	1.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	HG03742	0.647	0.681	0.0	0.03	0.805	0.805	2	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA12878	0.36	0.379	0.0	0.064	0.96	0.96	1	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA18525	1.091	1.148	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA18939	0.562	0.592	0.0	0.072	0.973	0.931	1	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA19017	1.144	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA19238	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA19239	1.148	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA19625	0.643	0.677	0.0	0.025	0.308	0.308	1	1
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA19648	1.06	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA20502	0.905	0.953	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr2	212700043	212700116	DEL	74	NA20845	0.573	0.603	0.0	0.056	0.789	0.789	1	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG00096	0.955	1.151	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG00268	0.682	0.822	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG00419	0.289	0.348	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG00759	0.414	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG01051	0.738	0.889	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.21	nan	nan	0	0
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG01500	0.505	0.608	0.01	0.116	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG01565	0.521	0.628	0.007	0.144	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG01583	0.683	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG01595	0.513	0.618	0.008	0.148	nan	nan	0	0
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG01879	0.528	0.636	0.0	0.092	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG02568	0.967	1.166	0.0	0.02	0.667	0.667	1	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG02922	0.443	0.534	0.009	0.1	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG03006	0.346	0.417	0.008	0.088	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG03052	0.792	0.954	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG03642	0.3	0.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	HG03742	0.705	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA12878	0.411	0.496	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA18525	0.827	0.996	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA18939	0.744	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA19017	0.638	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA19238	0.138	0.166	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA19239	0.548	0.66	0.0	0.077	0.462	0.462	3	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA19625	0.206	0.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA19648	0.606	0.73	0.009	0.075	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA20502	0.65	0.783	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr2	215749625	215749807	DEL	183	NA20845	0.551	0.663	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG00096	0.771	0.812	0.0	0.0	0.55	0.55	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG00268	0.734	0.773	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG00419	1.031	1.085	0.0	0.0	0.718	0.718	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG00759	0.591	0.622	0.0	0.0	0.804	0.804	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG01051	0.636	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG01112	0.569	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG01500	0.703	0.74	0.0	0.0	0.774	0.774	1	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG01565	0.5	0.527	0.0	0.0	0.5	0.471	1	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG01583	0.975	1.026	0.0	0.0	0.561	0.561	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG01595	0.684	0.72	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG01879	0.364	0.383	0.037	0.02	nan	nan	0	1
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG02568	1.045	1.1	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG02922	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG03006	0.856	0.901	0.0	0.0	0.844	0.844	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG03052	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG03642	0.801	0.843	0.0	0.0	0.47	0.47	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	HG03742	0.666	0.701	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA12878	0.977	1.028	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA18525	0.756	0.796	0.0	0.0	0.749	0.749	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA18939	0.725	0.764	0.0	0.0	0.917	0.958	1	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA19017	0.732	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA19238	0.487	0.512	0.125	0.02	nan	nan	0	1
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA19239	0.874	0.92	0.0	0.0	0.955	0.955	3	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA19625	0.978	1.029	0.0	0.0	0.817	0.817	2	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA19648	0.985	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA20502	0.929	0.977	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr2	216858677	216859452	DEL	776	NA20845	0.595	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG00096	0.0	0.0	0.014	0.143	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG00268	0.927	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG00419	0.845	0.79	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG00759	1.143	1.068	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG01051	1.046	0.977	0.0	0.0	0.536	0.536	3	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG01112	1.084	1.013	0.0	0.0	0.625	0.658	3	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG01500	0.0	0.0	0.038	0.185	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG01565	0.417	0.39	0.053	0.095	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG01583	1.268	1.185	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG01595	1.046	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG01879	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG02568	1.084	1.013	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG02922	0.95	0.888	0.0	0.0	0.55	0.55	3	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG03006	0.455	0.425	0.043	0.057	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG03052	0.62	0.58	0.008	0.0	0.733	0.733	1	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG03642	0.801	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	HG03742	1.136	1.062	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA12878	0.429	0.4	0.017	0.051	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA18525	0.704	0.658	0.012	0.058	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA18939	0.889	0.831	0.006	0.0	0.75	0.784	1	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA19017	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA19238	1.079	1.008	0.0	0.0	0.686	0.686	1	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA19239	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA19625	0.643	0.601	0.041	0.059	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA19648	0.454	0.425	0.011	0.06	nan	nan	0	1
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA20502	0.534	0.499	0.0	0.05	nan	nan	0	2
chr2	217158346	217158727	DEL	382	NA20845	1.167	1.091	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG00096	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG00268	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG00419	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG00759	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG01051	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG01112	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG01500	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.005	0.45	0.424	1	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG01583	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG01595	0.805	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG01879	1.073	1.073	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG02568	1.277	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG02922	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG03006	1.056	1.056	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG03052	1.07	1.07	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG03642	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	HG03742	0.411	0.411	0.055	0.084	nan	nan	0	1
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA12878	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA18525	1.179	1.179	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA18939	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA19017	0.994	0.994	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA19238	0.987	0.987	0.0	0.0	0.949	0.949	1	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA19239	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA19625	0.823	0.823	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA19648	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA20502	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	218370124	218370613	DEL	490	NA20845	0.903	0.903	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG00096	0.0	0.0	0.241	0.185	nan	nan	0	0
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG00268	0.42	0.466	0.047	0.041	nan	nan	0	1
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG00419	0.845	0.939	0.004	0.0	0.72	0.72	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG00759	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG01051	0.554	0.615	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG01112	0.294	0.326	0.034	0.023	nan	nan	0	1
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG01500	0.739	0.822	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG01565	0.876	0.973	0.0	0.002	0.501	0.472	2	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG01583	0.39	0.433	0.051	0.024	nan	nan	0	1
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG01595	0.664	0.737	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG01879	0.764	0.849	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG02568	1.084	1.204	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG02922	0.0	0.0	0.094	0.094	nan	nan	0	0
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG03006	0.0	0.0	0.222	0.152	nan	nan	0	0
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG03052	0.428	0.475	0.047	0.016	nan	nan	0	1
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG03642	0.225	0.25	0.017	0.028	nan	nan	0	1
chr2	220052322	220052915	DEL	594	HG03742	0.705	0.784	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA12878	0.0	0.0	0.035	0.211	nan	nan	0	0
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA18525	0.457	0.508	0.009	0.036	nan	nan	0	1
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA18939	0.671	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA19017	0.75	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA19238	0.711	0.789	0.0	0.003	0.407	0.407	2	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA19239	0.763	0.848	0.0	0.003	0.733	0.733	1	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA19625	0.695	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA19648	0.0	0.0	0.195	0.22	nan	nan	0	0
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA20502	0.418	0.464	0.057	0.024	nan	nan	0	1
chr2	220052322	220052915	DEL	594	NA20845	0.0	0.0	0.329	0.276	nan	nan	0	0
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG00096	0.716	0.754	0.0	0.0	0.806	0.806	4	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG00268	0.892	0.939	0.0	0.0	0.633	0.633	6	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG00419	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG00759	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG01051	0.615	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG01112	0.771	0.812	0.0	0.0	0.485	0.485	4	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG01500	0.613	0.645	0.0	0.004	0.75	0.75	5	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG01565	0.396	0.417	0.086	0.0	0.7	0.659	4	1
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG01583	0.341	0.359	0.077	0.013	nan	nan	0	1
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG01595	0.865	0.91	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG01879	0.655	0.689	0.0	0.0	0.826	0.826	6	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG02568	0.58	0.611	0.0	0.0	0.348	0.348	2	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG02922	0.507	0.533	0.0	0.005	0.625	0.625	5	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG03006	0.838	0.882	0.0	0.0	0.567	0.567	6	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG03052	0.513	0.541	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG03642	0.601	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	HG03742	0.627	0.66	0.0	0.0	0.8	0.8	5	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA12878	0.84	0.884	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA18525	0.756	0.796	0.006	0.009	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA18939	0.617	0.649	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA19017	0.807	0.849	0.0	0.0	0.846	0.846	5	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA19238	0.697	0.734	0.0	0.003	0.565	0.565	5	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA19239	0.731	0.769	0.0	0.002	0.909	0.909	3	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA19625	0.386	0.406	0.019	0.0	nan	nan	0	1
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA19648	0.631	0.664	0.0	0.0	0.261	0.261	2	2
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA20502	0.418	0.44	0.015	0.0	0.154	0.154	1	1
chr2	220232623	220233135	DEL	513	NA20845	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG00096	0.882	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG00268	0.734	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG00419	1.031	1.145	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG00759	0.65	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG01051	0.513	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG01112	0.588	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG01500	0.595	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG01565	0.584	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG01583	0.561	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG01595	0.483	0.536	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG01879	0.491	0.546	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG02568	0.774	0.86	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG02922	0.38	0.422	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG03006	0.674	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG03052	0.0	0.0	0.029	0.129	nan	nan	0	1
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG03642	0.726	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	HG03742	0.999	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA12878	0.617	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA18525	0.756	0.84	0.0	0.0	0.701	0.701	2	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA18939	0.744	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA19017	0.863	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA19238	0.829	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA19239	0.77	0.855	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA19625	0.643	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA19648	0.959	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA20502	0.975	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220946309	220946587	DEL	279	NA20845	0.529	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG00096	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG00268	0.874	0.92	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG00419	0.309	0.325	0.12	0.099	nan	nan	0	1
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG00759	0.709	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG01051	0.902	0.95	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG01112	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG01500	0.794	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG01565	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG01583	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG01595	0.865	0.91	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG01879	0.855	0.9	0.0	0.0	0.981	0.981	2	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG02568	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG02922	0.887	0.933	0.0	0.0	0.631	0.631	2	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG03006	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG03052	0.663	0.698	0.0	0.0	0.826	0.826	2	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG03642	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	HG03742	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA12878	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA18525	0.844	0.889	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA18939	0.744	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA19017	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA19238	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA19239	0.874	0.92	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA19625	0.9	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA19648	0.985	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA20502	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	220994454	220995414	DEL	961	NA20845	0.815	0.858	0.006	0.006	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG00096	0.606	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG00268	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG00419	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG00759	0.769	0.809	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG01051	1.066	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG01112	0.79	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG01500	0.884	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG01565	0.459	0.483	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG01583	1.195	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG01595	0.503	0.529	0.0	0.069	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG01879	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG02568	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG02922	0.317	0.333	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG03006	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG03052	0.963	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG03642	1.176	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	HG03742	1.097	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA12878	0.771	0.812	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA18525	0.493	0.518	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA18939	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA19017	0.431	0.454	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA19238	0.421	0.443	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA19239	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA19625	0.0	0.0	0.013	0.166	nan	nan	0	1
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA19648	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA20502	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221046080	221046203	DEL	124	NA20845	0.749	0.788	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG00096	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG00268	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG00419	0.577	0.577	0.007	0.06	0.143	0.143	3	1
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG00759	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG01051	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG01112	1.047	1.047	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG01500	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG01565	1.334	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG01583	1.048	1.048	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG01595	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG01879	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG02568	1.2	1.2	0.0	0.007	0.643	0.643	1	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG02922	1.246	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG03006	0.947	0.947	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG03052	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG03642	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	HG03742	1.215	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA12878	0.908	0.908	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA18525	1.073	1.073	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA18939	0.852	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA19017	1.163	1.163	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA19238	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA19239	0.926	0.926	0.0	0.0	0.809	0.809	1	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA19625	0.9	0.9	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA19648	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA20502	1.137	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	22155530	22155870	DEL	341	NA20845	1.013	1.013	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG00096	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG00268	0.769	0.81	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG00419	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG00759	0.828	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG01051	0.431	0.453	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG01112	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG01500	0.902	0.949	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG01565	0.438	0.461	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG01583	0.926	0.975	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG01595	0.422	0.445	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG01879	0.764	0.804	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG02568	1.122	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG02922	1.014	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG03006	0.583	0.613	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG03052	0.899	0.946	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG03642	1.001	1.054	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	HG03742	0.47	0.495	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA12878	0.291	0.307	0.007	0.072	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA18525	0.598	0.63	0.006	0.09	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA18939	0.453	0.477	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA19017	0.919	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA19238	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA19239	0.9	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA19625	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA19648	1.111	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA20502	1.091	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	221882974	221883170	DEL	197	NA20845	0.837	0.881	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG00096	1.047	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG00268	0.682	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG00419	0.824	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG00759	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG01051	0.861	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG01112	0.863	0.909	0.0	0.0	0.704	0.669	1	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG01500	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG01565	0.625	0.658	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG01583	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG01595	0.805	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG01879	0.346	0.364	0.067	0.052	nan	nan	0	1
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG02568	0.967	1.018	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG02922	1.014	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG03006	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG03052	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG03642	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	HG03742	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA12878	0.806	0.848	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA18525	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA18939	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA19017	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA19238	0.684	0.72	0.0	0.0	0.758	0.758	1	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA19239	0.783	0.824	0.003	0.0	0.821	0.821	1	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA19625	0.9	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA19648	0.858	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA20502	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225219878	225220569	DEL	692	NA20845	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG00096	0.294	0.327	0.076	0.017	0.556	0.556	1	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG00268	0.262	0.291	0.043	0.007	nan	nan	0	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG00419	0.453	0.504	0.054	0.029	0.375	0.375	1	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG00759	0.177	0.197	0.178	0.067	nan	nan	0	0
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG01051	0.205	0.228	0.042	0.028	nan	nan	0	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG01112	0.478	0.531	0.0	0.0	0.818	0.861	1	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG01500	0.18	0.2	0.158	0.079	nan	nan	0	0
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG01565	0.459	0.51	0.0	0.0	0.3	0.282	1	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG01583	0.39	0.433	0.104	0.03	0.333	0.333	1	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG01595	0.422	0.469	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG01879	0.091	0.101	0.118	0.043	nan	nan	0	0
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG02568	0.271	0.301	0.048	0.016	nan	nan	0	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG02922	0.253	0.282	0.023	0.019	0.444	0.444	1	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG03006	0.182	0.202	0.124	0.06	nan	nan	0	0
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG03052	0.086	0.095	0.15	0.025	nan	nan	0	0
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG03642	0.35	0.389	0.08	0.013	nan	nan	0	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	HG03742	0.078	0.087	0.078	0.023	nan	nan	0	0
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA12878	0.874	0.971	0.0	0.0	0.824	0.824	5	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA18525	0.545	0.606	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA18939	0.598	0.665	0.0	0.0	0.8	0.765	1	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA19017	0.169	0.188	0.182	0.043	nan	nan	0	0
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA19238	0.566	0.629	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA19239	0.326	0.362	0.075	0.014	nan	nan	0	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA19625	0.309	0.343	0.068	0.004	nan	nan	0	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA19648	0.53	0.589	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA20502	0.325	0.361	0.057	0.015	0.5	0.5	1	1
chr2	225292994	225293946	DEL	953	NA20845	0.463	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG00096	1.194	1.095	0.0	0.0	0.885	0.885	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG00268	1.154	1.059	0.0	0.0	0.595	0.595	1	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG00419	1.134	1.04	0.0	0.0	0.92	0.92	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG00759	1.202	1.103	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG01051	1.292	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG01112	1.23	1.129	0.0	0.0	0.75	0.789	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG01500	1.371	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG01565	1.167	1.071	0.0	0.0	0.7	0.659	1	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG01583	1.316	1.208	0.0	0.0	0.636	0.636	4	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG01595	1.167	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG01879	1.237	1.135	0.0	0.0	0.765	0.765	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG02568	0.464	0.426	0.034	0.025	nan	nan	0	1
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG02922	0.612	0.562	0.089	0.062	nan	nan	0	1
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG03006	1.256	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG03052	1.262	1.158	0.0	0.0	0.92	0.92	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG03642	1.001	0.918	0.0	0.0	0.6	0.6	4	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	HG03742	1.254	1.15	0.0	0.0	0.852	0.852	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA12878	0.857	0.786	0.007	0.0	0.893	0.893	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA18525	1.161	1.065	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA18939	1.251	1.148	0.0	0.0	0.609	0.636	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA19017	1.276	1.17	0.0	0.0	0.9	0.9	4	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA19238	1.066	0.978	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA19239	1.044	0.958	0.0	0.0	0.771	0.771	3	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA19625	1.106	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA19648	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA20502	1.045	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	226734995	226735607	DEL	613	NA20845	1.189	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG00096	0.643	0.677	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG00268	0.734	0.773	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG00419	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG00759	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG01051	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG01112	0.826	0.87	0.0	0.0	0.727	0.766	1	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG01500	1.028	1.082	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG01565	0.688	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG01583	1.024	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG01595	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG01879	0.455	0.479	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG02568	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG02922	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG03006	0.92	0.968	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG03052	1.006	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG03642	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	HG03742	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA12878	0.788	0.83	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA18525	0.756	0.796	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA18939	0.725	0.764	0.0	0.0	0.714	0.683	1	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA19017	0.9	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA19238	0.408	0.429	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA19239	0.77	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA19625	1.055	1.11	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA19648	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA20502	1.37	1.442	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	227001141	227001316	DEL	176	NA20845	0.639	0.672	0.0	0.008	0.267	0.267	1	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG00096	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG00268	0.892	0.892	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG00419	0.247	0.247	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG00759	0.65	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG01051	0.697	0.697	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG01112	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG01500	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG01583	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG01595	1.207	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG01879	0.637	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG02568	1.277	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG02922	1.182	1.182	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG03006	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG03052	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG03642	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	HG03742	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA12878	0.549	0.549	0.0	0.043	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA18525	0.528	0.528	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA18939	0.417	0.417	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA19017	1.144	1.144	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA19238	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA19239	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA19625	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA19648	1.288	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA20502	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	227681548	227681718	DEL	171	NA20845	0.419	0.419	0.009	0.048	nan	nan	0	1
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG00096	0.753	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG00268	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG00419	0.721	0.7	0.0	0.0	0.69	0.69	2	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG00759	0.946	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG01051	0.923	0.896	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG01112	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG01500	1.154	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG01565	0.75	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG01583	1.0	0.97	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG01595	1.126	1.094	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG01879	0.837	0.812	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG02568	1.2	1.165	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG02922	1.351	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG03006	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG03052	1.027	0.997	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG03642	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	HG03742	0.95	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA12878	0.788	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA18525	1.02	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA18939	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA19017	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA19238	0.947	0.92	0.0	0.0	0.771	0.771	1	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA19239	0.952	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA19625	0.566	0.55	0.052	0.022	nan	nan	0	1
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA19648	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA20502	0.859	0.834	0.005	0.0	0.783	0.783	1	2
chr2	229327208	229327853	DEL	646	NA20845	1.101	1.069	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG00096	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG00268	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG00419	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG00759	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG01051	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG01112	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG01500	1.226	1.226	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG01565	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG01583	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG01595	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG01879	0.437	0.437	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG02568	0.542	0.542	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG02922	0.528	0.528	0.0	0.107	nan	nan	0	1
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG03006	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG03052	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG03642	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	HG03742	0.686	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA12878	1.063	1.063	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA18939	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA19017	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA19238	0.605	0.605	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA19239	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA19625	0.412	0.412	0.018	0.067	nan	nan	0	1
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA19648	1.237	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA20502	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229956769	229956954	DEL	186	NA20845	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG00096	0.79	0.878	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG00268	0.752	0.835	0.0	0.0	0.941	0.941	2	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG00419	0.639	0.71	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG00759	0.65	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG01051	0.513	0.57	0.022	0.084	nan	nan	0	1
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG01112	0.661	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG01500	1.082	1.202	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG01565	0.667	0.741	0.0	0.0	0.333	0.314	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG01583	0.731	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG01595	0.563	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG01879	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG02568	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG02922	0.76	0.845	0.0	0.005	1.0	1.0	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG03006	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG03052	0.856	0.951	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG03642	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	HG03742	0.705	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA12878	0.806	0.895	0.0	0.0	0.542	0.542	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA18525	0.756	0.84	0.006	0.0	0.867	0.867	2	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA18939	0.907	1.008	0.0	0.0	0.856	0.895	2	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA19017	0.694	0.771	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA19238	0.789	0.877	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA19239	0.874	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA19625	0.592	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA19648	0.555	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA20502	0.673	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	229957737	229958255	DEL	519	NA20845	0.595	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG00096	0.845	0.845	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG00268	0.682	0.682	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG00419	0.68	0.68	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG00759	0.473	0.473	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG01051	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG01112	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG01500	0.92	0.92	0.0	0.0	0.947	0.947	2	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG01565	0.771	0.771	0.0	0.0	0.304	0.286	3	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG01583	0.756	0.756	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG01595	0.684	0.684	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG01879	0.637	0.637	0.0	0.0	0.574	0.574	2	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG02568	0.697	0.697	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG02922	0.697	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG03006	0.747	0.747	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG03052	0.556	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG03642	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	HG03742	0.705	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA12878	0.857	0.857	0.0	0.0	0.582	0.582	2	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA18525	0.932	0.932	0.0	0.0	0.27	0.27	4	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA18939	0.617	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA19017	0.469	0.469	0.102	0.047	nan	nan	0	1
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA19238	0.632	0.632	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA19239	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA19625	0.617	0.617	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA19648	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA20502	0.696	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	230719766	230720674	DEL	909	NA20845	0.815	0.815	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG00096	1.212	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG00268	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG00419	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG00759	0.552	0.552	0.034	0.031	nan	nan	0	1
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG01051	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG01112	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG01500	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG01565	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG01583	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG01595	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG01879	1.037	1.037	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG02568	1.006	1.006	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG02922	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG03006	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG03052	0.599	0.599	0.051	0.047	nan	nan	0	1
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG03642	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	HG03742	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA12878	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA18525	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA18939	0.58	0.58	0.07	0.051	nan	nan	0	1
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA19017	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA19238	1.092	1.092	0.0	0.0	0.702	0.702	1	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA19239	0.6	0.6	0.027	0.034	nan	nan	0	1
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA19625	0.849	0.849	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA19648	1.389	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA20502	0.464	0.464	0.043	0.056	nan	nan	0	2
chr2	231207810	231208377	DEL	568	NA20845	0.419	0.419	0.067	0.057	nan	nan	0	1
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG00096	0.514	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG00268	0.56	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG00419	0.536	0.564	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG00759	0.552	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG01051	0.554	0.583	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG01112	0.606	0.638	0.0	0.0	0.757	0.719	2	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG01500	0.739	0.778	0.0	0.0	0.529	0.529	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG01565	0.625	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG01583	0.414	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG01595	0.563	0.593	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG01879	0.418	0.44	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG02568	0.542	0.57	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG02922	0.359	0.378	0.054	0.033	nan	nan	0	1
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG03006	0.546	0.575	0.0	0.0	0.759	0.759	2	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG03052	0.471	0.495	0.0	0.0	0.583	0.583	2	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG03642	0.375	0.395	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	HG03742	0.47	0.495	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA12878	0.634	0.668	0.003	0.0	0.821	0.821	3	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA18525	0.563	0.593	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA18939	0.635	0.668	0.004	0.0	0.667	0.697	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA19017	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA19238	0.618	0.651	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA19239	0.626	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA19625	0.463	0.487	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA19648	0.884	0.93	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA20502	0.696	0.733	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	231705918	231706902	DEL	985	NA20845	0.529	0.556	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG00096	0.845	0.889	0.0	0.007	0.857	0.857	7	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG00268	0.42	0.442	0.047	0.042	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG00419	0.536	0.564	0.0	0.0	0.333	0.333	2	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG00759	0.532	0.56	0.0	0.0	0.544	0.544	6	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG01051	0.431	0.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG01112	0.606	0.638	0.05	0.021	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG01500	0.433	0.456	0.062	0.03	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG01565	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG01583	0.78	0.821	0.0	0.0	0.692	0.692	3	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG01595	0.392	0.413	0.034	0.031	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG01879	0.691	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG02568	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG02922	0.845	0.889	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG03006	0.328	0.345	0.08	0.054	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG03052	0.642	0.676	0.0	0.0	0.857	0.857	5	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG03642	0.4	0.421	0.081	0.062	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	HG03742	0.862	0.907	0.0	0.0	0.741	0.741	2	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA12878	0.377	0.397	0.08	0.029	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA18525	0.88	0.926	0.0	0.0	0.54	0.54	4	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA18939	0.816	0.859	0.0	0.006	0.796	0.797	6	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA19017	0.469	0.494	0.095	0.061	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA19238	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA19239	0.522	0.549	0.081	0.047	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA19625	0.849	0.894	0.0	0.0	0.833	0.833	5	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA19648	0.682	0.718	0.0	0.0	0.781	0.781	6	2
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA20502	0.395	0.415	0.041	0.019	nan	nan	0	1
chr2	233332725	233333474	DEL	750	NA20845	0.374	0.394	0.09	0.051	nan	nan	0	1
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG00096	0.588	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG00268	0.472	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG00419	0.598	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG00759	0.473	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG01051	0.513	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG01112	0.422	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG01500	0.721	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG01565	0.584	0.671	0.01	0.0	0.385	0.409	1	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG01583	0.902	1.037	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG01595	0.503	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG01879	0.528	0.606	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG02568	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG02922	0.274	0.316	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG03006	0.564	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG03052	0.578	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG03642	1.101	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	HG03742	0.549	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA12878	0.668	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA18525	0.862	0.991	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA18939	0.653	0.75	0.0	0.0	0.938	0.98	1	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA19017	0.788	0.906	0.0	0.005	0.7	0.7	1	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA19238	0.658	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA19239	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA19625	0.592	0.68	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA19648	0.48	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA20502	0.673	0.774	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr2	234907661	234908025	DEL	365	NA20845	0.661	0.76	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG00096	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG00268	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG00419	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG00759	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG01051	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG01112	0.716	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG01500	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG01565	1.115	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG01583	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG01595	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG01879	0.628	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG02568	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG02922	0.697	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG03006	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG03052	0.685	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG03642	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	HG03742	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA12878	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA18525	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA18939	1.306	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA19017	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA19238	1.158	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA19625	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA19648	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA20502	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	236451182	236451241	DUP	60	NA20845	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG00096	0.882	0.98	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG00268	1.032	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG00419	1.195	1.328	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG00759	0.512	0.569	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG01051	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG01112	0.716	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG01500	0.812	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG01565	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG01583	0.902	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG01595	0.322	0.358	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG01879	0.709	0.788	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG02568	1.161	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG02922	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG03006	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG03052	0.963	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG03642	0.851	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	HG03742	0.686	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA12878	0.788	0.876	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA18525	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA18939	0.671	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA19017	0.863	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA19238	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA19239	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA19625	0.978	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA19648	1.187	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA20502	0.882	0.98	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238665546	238665721	DEL	176	NA20845	0.793	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG00096	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG00268	0.525	0.525	0.01	0.062	nan	nan	0	1
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG00419	0.866	0.866	0.0	0.0	0.913	0.913	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG00759	0.749	0.749	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG01051	0.923	0.923	0.0	0.004	0.833	0.833	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG01112	1.047	1.047	0.0	0.0	0.75	0.712	3	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG01500	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG01565	0.375	0.375	0.018	0.059	nan	nan	0	1
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG01583	0.829	0.829	0.0	0.0	0.551	0.551	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG01595	1.126	1.126	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG01879	1.073	1.073	0.0	0.0	0.628	0.628	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG02568	0.697	0.697	0.0	0.0	0.736	0.736	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG02922	1.246	1.246	0.0	0.003	0.581	0.581	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG03006	1.074	1.074	0.0	0.0	0.684	0.684	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG03052	1.177	1.177	0.006	0.0	0.877	0.877	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG03642	1.076	1.076	0.0	0.0	0.788	0.788	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	HG03742	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA12878	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA18525	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA18939	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA19017	1.032	1.032	0.0	0.0	0.754	0.754	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA19238	1.053	1.053	0.0	0.0	0.618	0.618	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA19239	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA19625	1.093	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA19648	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA20502	1.068	1.068	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr2	238746300	238746697	DEL	398	NA20845	1.167	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG00096	0.863	0.959	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG00268	0.664	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG00419	0.639	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG00759	0.65	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG01051	1.025	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG01112	0.606	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG01500	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG01565	0.917	1.019	0.0	0.0	0.714	0.759	1	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG01583	0.926	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG01595	0.603	0.67	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG01879	0.473	0.526	0.007	0.085	nan	nan	0	1
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG02568	0.426	0.473	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG02922	0.253	0.282	0.011	0.086	nan	nan	0	1
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG03006	0.728	0.809	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG03052	0.193	0.214	0.0	0.117	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG03642	0.726	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	HG03742	0.627	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA12878	0.874	0.971	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA18525	0.932	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA18939	0.762	0.846	0.0	0.0	0.824	0.788	1	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA19017	0.319	0.354	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA19238	0.816	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA19239	0.365	0.406	0.0	0.092	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA19625	0.283	0.314	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA19648	0.707	0.785	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA20502	0.882	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240288478	240288752	DEL	275	NA20845	0.705	0.783	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG00096	0.606	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG00268	0.647	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG00419	0.618	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG00759	0.591	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG01051	0.226	0.259	0.0	0.077	0.917	0.917	1	1
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG01112	0.404	0.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG01500	0.289	0.332	0.0	0.053	0.783	0.783	1	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG01565	0.438	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG01583	0.512	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG01595	0.342	0.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG01879	0.291	0.335	0.0	0.046	0.524	0.524	1	1
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG02568	0.348	0.4	0.0	0.037	0.6	0.6	1	1
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG02922	0.866	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG03006	0.455	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG03052	0.599	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG03642	0.676	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	HG03742	0.509	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA12878	0.634	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA18525	0.369	0.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA18939	0.472	0.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA19017	0.413	0.474	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA19238	0.316	0.363	0.0	0.064	0.833	0.833	1	1
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA19239	0.744	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA19625	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA19648	0.555	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA20502	0.58	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	240993559	240993641	DEL	83	NA20845	0.529	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG00096	0.698	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG00268	0.647	0.779	0.0	0.0	0.484	0.484	1	1
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG00419	0.783	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG00759	0.591	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG01051	0.246	0.296	0.0	0.018	0.857	0.857	1	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG01112	0.606	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG01500	0.559	0.674	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG01565	0.792	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG01583	0.488	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG01595	0.362	0.436	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG01879	0.546	0.658	0.0	0.006	0.533	0.533	1	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG02568	0.348	0.42	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG02922	0.718	0.865	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG03006	0.874	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG03052	0.342	0.412	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG03642	0.801	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	HG03742	0.451	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA12878	0.651	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA18525	0.774	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA18939	0.508	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA19017	0.413	0.497	0.0	0.006	0.767	0.767	2	1
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA19238	0.697	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA19239	0.574	0.692	0.0	0.0	0.581	0.581	1	1
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA19625	0.566	0.682	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA19648	0.48	0.578	0.0	0.016	0.643	0.643	1	1
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA20502	0.859	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241045592	241045648	DEL	57	NA20845	1.035	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG00096	0.533	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG00268	0.682	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG00419	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG00759	0.709	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG01051	0.451	0.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG01112	1.065	1.121	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG01500	0.721	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG01565	0.625	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG01583	0.622	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG01595	0.563	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG01879	0.637	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG02568	0.813	0.855	0.0	0.02	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG02922	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG03006	0.601	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG03052	0.556	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG03642	0.626	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	HG03742	0.627	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA12878	0.694	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA18525	0.493	0.518	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA19017	0.675	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA19238	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA19239	0.809	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA19625	0.617	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA19648	0.884	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA20502	0.627	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241547164	241547221	DEL	58	NA20845	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG00096	0.533	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG00268	0.647	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG00419	0.742	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG00759	0.394	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG01051	0.246	0.324	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG01112	0.386	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG01500	0.307	0.403	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG01565	0.354	0.466	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG01583	0.975	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG01595	0.342	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG01879	0.291	0.383	0.0	0.064	0.923	0.923	1	1
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG02568	0.89	1.171	0.0	0.018	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG02922	0.655	0.861	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG03006	0.237	0.311	0.0	0.055	0.75	0.75	1	1
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG03052	0.642	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG03642	0.776	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	HG03742	0.529	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA12878	0.96	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA18525	0.95	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA18939	0.544	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA19017	0.281	0.37	0.0	0.043	0.824	0.824	1	1
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA19238	0.513	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA19239	0.861	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA19625	0.283	0.372	0.0	0.03	0.769	0.769	1	1
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA19648	0.707	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA20502	0.766	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	241856654	241856726	DEL	73	NA20845	0.683	0.898	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG00096	0.698	0.735	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG00268	0.664	0.699	0.005	0.0	0.929	0.929	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG00419	0.824	0.868	0.0	0.0	0.475	0.475	2	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG00759	0.769	0.809	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG01051	0.554	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG01112	0.771	0.812	0.0	0.0	0.764	0.726	2	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG01500	0.775	0.816	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG01565	0.667	0.702	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG01583	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG01595	0.603	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG01879	0.564	0.594	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG02568	0.697	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG02922	0.718	0.756	0.003	0.0	0.971	0.971	2	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG03006	0.601	0.632	0.0	0.0	0.692	0.692	3	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG03052	0.385	0.405	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG03642	0.501	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	HG03742	0.529	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA12878	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA18525	0.756	0.796	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA18939	0.544	0.573	0.0	0.0	0.667	0.697	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA19017	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA19238	0.684	0.72	0.0	0.0	0.727	0.727	2	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA19239	0.678	0.714	0.0	0.0	0.808	0.808	3	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA19625	0.617	0.65	0.0	0.0	0.545	0.545	2	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA19648	0.631	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA20502	0.72	0.757	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr2	242017590	242018331	DEL	742	NA20845	0.661	0.696	0.005	0.004	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG00096	0.588	0.744	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG00268	0.367	0.465	0.0	0.004	0.667	0.667	1	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG00419	0.185	0.235	0.0	0.009	nan	nan	0	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG00759	0.374	0.474	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG01051	0.287	0.363	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG01112	0.331	0.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG01500	0.451	0.571	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG01565	0.479	0.607	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG01583	0.463	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG01595	0.302	0.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG01879	0.509	0.645	0.0	0.01	0.909	0.909	1	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG02568	0.967	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG02922	0.338	0.428	0.0	0.012	0.556	0.556	1	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG03006	0.109	0.138	0.0	0.006	nan	nan	0	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG03052	0.599	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG03642	0.576	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	HG03742	0.568	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA12878	0.497	0.629	0.0	0.0	0.579	0.579	1	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA18525	0.651	0.824	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA18939	0.308	0.39	0.0	0.0	0.429	0.448	1	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA19017	0.6	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA19238	0.316	0.4	0.0	0.0	0.677	0.677	2	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA19239	0.378	0.479	0.0	0.003	0.864	0.864	1	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA19625	0.476	0.602	0.0	0.012	0.312	0.312	1	1
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA19648	0.757	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA20502	0.569	0.72	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr2	242608433	242608488	DEL	56	NA20845	0.242	0.307	0.0	0.012	0.8	0.8	1	1
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG00096	0.827	0.918	0.0	0.0	0.542	0.542	2	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG00268	0.682	0.758	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG00419	0.66	0.733	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG00759	0.769	0.854	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG01051	0.533	0.592	0.0	0.008	0.871	0.871	2	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG01112	0.716	0.796	0.0	0.0	0.735	0.698	4	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG01500	0.631	0.701	0.0	0.003	0.841	0.841	2	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG01565	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG01583	0.512	0.569	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG01595	0.623	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG01879	0.546	0.606	0.0	0.0	0.778	0.778	5	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG02568	0.464	0.516	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG02922	0.823	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG03006	0.765	0.85	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG03052	0.727	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG03642	0.551	0.612	0.0	0.0	0.536	0.536	6	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	HG03742	0.607	0.675	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA12878	0.754	0.838	0.0	0.0	0.935	0.935	2	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA18525	0.739	0.821	0.0	0.0	0.923	0.923	3	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA18939	0.526	0.584	0.0	0.003	0.477	0.499	2	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA19017	0.75	0.834	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA19238	0.684	0.76	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA19239	0.665	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA19625	0.592	0.657	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA19648	0.353	0.393	0.063	0.013	0.333	0.333	1	1
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA20502	0.789	0.877	0.0	0.0	0.518	0.518	2	2
chr2	25052369	25052987	DEL	619	NA20845	0.617	0.685	0.0	0.0	0.427	0.427	4	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG00096	0.0	0.0	0.082	0.22	nan	nan	0	0
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG00268	0.297	0.342	0.065	0.082	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG00419	0.33	0.379	0.059	0.063	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG00759	0.434	0.498	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG01051	0.123	0.141	0.081	0.059	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG01112	0.0	0.0	0.221	0.213	nan	nan	0	0
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG01500	0.0	0.0	0.161	0.304	nan	nan	0	0
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG01565	0.0	0.0	0.147	0.183	nan	nan	0	0
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG01583	0.756	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG01595	0.261	0.301	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG01879	0.291	0.335	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG02568	0.464	0.534	0.047	0.036	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG02922	0.401	0.461	0.014	0.047	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG03006	0.601	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG03052	0.0	0.0	0.171	0.121	nan	nan	0	0
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG03642	0.45	0.518	0.0	0.02	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	HG03742	0.157	0.18	0.016	0.054	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA12878	0.0	0.0	0.041	0.106	nan	nan	0	0
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA18525	0.651	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA18939	0.598	0.688	0.0	0.0	0.8	0.765	1	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA19017	0.919	1.056	0.0	0.0	0.435	0.435	1	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA19238	0.355	0.408	0.023	0.096	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA19239	0.404	0.465	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA19625	0.386	0.444	0.039	0.078	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA19648	0.581	0.667	0.034	0.076	nan	nan	0	1
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA20502	0.604	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	2798774	2799246	DEL	473	NA20845	0.308	0.354	0.03	0.118	nan	nan	0	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG00096	0.514	0.62	0.0	0.009	0.433	0.433	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG00268	0.315	0.379	0.0	0.027	0.905	0.905	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG00419	0.598	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.013	nan	nan	0	0
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG01051	0.328	0.395	0.0	0.019	0.667	0.667	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG01112	0.202	0.243	0.0	0.01	0.867	0.912	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG01500	0.469	0.565	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG01565	0.542	0.653	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG01583	0.439	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG01595	0.442	0.533	0.0	0.044	0.824	0.824	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG01879	0.691	0.833	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG02568	0.271	0.326	0.0	0.041	0.625	0.625	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG02922	0.465	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG03006	0.71	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG03642	0.375	0.452	0.0	0.014	0.333	0.333	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	HG03742	0.274	0.33	0.0	0.017	0.895	0.895	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA12878	0.48	0.578	0.0	0.016	0.774	0.774	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA19017	0.3	0.362	0.0	0.016	0.833	0.833	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA19239	0.372	0.448	0.0	0.007	0.966	0.966	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA19625	0.283	0.341	0.0	0.007	0.6	0.6	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA19648	0.353	0.426	0.0	0.027	0.786	0.786	1	1
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA20502	0.894	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28661665	28661718	DEL	54	NA20845	0.176	0.212	0.0	0.024	0.667	0.667	1	1
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG00096	0.533	0.533	0.052	0.023	0.162	0.162	2	1
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG00268	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG00419	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG00759	0.749	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG01051	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG01112	0.937	0.937	0.0	0.0	0.81	0.769	1	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG01500	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG01583	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG01595	0.784	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG01879	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG02568	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG02922	0.676	0.676	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG03006	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG03052	0.749	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG03642	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	HG03742	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA12878	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA18525	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA18939	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA19017	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA19238	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA19239	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA19625	0.9	0.9	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA19648	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA20502	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	28720773	28721321	DEL	549	NA20845	0.969	0.969	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG00096	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG00268	0.927	0.927	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG00419	0.907	0.907	0.0	0.0	0.628	0.628	2	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG00759	0.808	0.808	0.0	0.0	0.69	0.69	3	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG01051	0.861	0.861	0.0	0.0	0.706	0.706	5	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG01112	0.918	0.918	0.0	0.0	0.83	0.789	4	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG01500	1.01	1.01	0.004	0.0	0.731	0.731	4	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG01565	0.917	0.917	0.0	0.004	0.748	0.795	4	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG01583	1.048	1.048	0.004	0.0	0.812	0.812	3	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG01595	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG01879	0.928	0.928	0.0	0.0	0.891	0.891	4	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG02568	1.277	1.277	0.0	0.0	0.647	0.647	3	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG02922	1.098	1.098	0.0	0.0	0.85	0.85	4	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG03006	0.747	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG03052	1.07	1.07	0.0	0.0	0.841	0.841	2	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG03642	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	HG03742	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA12878	1.268	1.268	0.0	0.0	0.896	0.896	4	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA18525	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA18939	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA19017	0.844	0.844	0.0	0.0	0.762	0.762	3	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA19238	0.934	0.934	0.0	0.0	0.888	0.888	6	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA19239	0.352	0.352	0.134	0.081	nan	nan	0	1
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA19625	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA19648	1.06	1.06	0.0	0.0	0.584	0.584	2	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA20502	1.137	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	30607638	30608490	DEL	853	NA20845	0.859	0.859	0.0	0.0	0.5	0.5	4	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG00096	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG00268	0.944	0.882	0.005	0.007	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG00419	1.051	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG00759	1.163	1.087	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG01051	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG01112	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG01500	1.082	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG01565	0.792	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG01583	1.097	1.025	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG01595	1.187	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG01879	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG02568	0.503	0.47	0.079	0.058	nan	nan	0	1
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG02922	0.676	0.631	0.059	0.051	nan	nan	0	1
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG03006	1.384	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG03052	0.984	0.92	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG03642	1.251	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	HG03742	0.784	0.732	0.042	0.056	nan	nan	0	1
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA12878	1.028	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA18525	1.038	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA18939	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA19017	1.032	0.964	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA19238	1.105	1.033	0.0	0.0	0.648	0.648	2	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA19239	0.509	0.476	0.031	0.053	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA19625	0.566	0.529	0.085	0.07	nan	nan	0	1
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA19648	0.985	0.92	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA20502	1.323	1.237	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr2	35007245	35007825	DEL	581	NA20845	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG00096	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG00759	1.36	1.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG01051	0.964	0.936	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG01112	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG01500	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG01583	0.829	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG01595	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG01879	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG03052	1.369	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	HG03742	1.548	1.503	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	NA18525	0.88	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	NA19017	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	NA19239	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	NA19648	0.72	0.699	0.0	0.027	0.808	0.808	1	2
chr2	35772266	35772319	DUP	54	NA20845	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG00096	0.827	0.803	0.008	0.0	0.643	0.643	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG00268	0.892	0.866	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG00419	0.732	0.71	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG00759	1.025	0.995	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG01051	1.025	0.995	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG01112	0.9	0.874	0.0	0.0	0.889	0.884	2	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG01500	0.92	0.893	0.0	0.003	0.731	0.731	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG01565	1.042	1.012	0.007	0.0	0.2	0.188	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG01583	0.853	0.828	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG01595	1.177	1.142	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG01879	0.8	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG02568	0.697	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG02922	0.929	0.902	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG03006	1.02	0.99	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG03052	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG03642	0.826	0.802	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	HG03742	0.842	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA12878	0.806	0.782	0.0	0.003	0.744	0.744	2	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA18525	0.862	0.837	0.0	0.0	0.438	0.438	1	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA18939	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA19017	0.0	0.0	0.291	0.171	nan	nan	0	0
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA19238	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA19239	0.496	0.481	0.058	0.034	nan	nan	0	1
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA19625	0.823	0.799	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA19648	0.732	0.711	0.0	0.0	0.618	0.618	2	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA20502	0.789	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	39712308	39712947	DEL	640	NA20845	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG00096	0.661	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG00268	0.839	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG00419	1.134	1.101	0.0	0.0	0.613	0.613	3	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG00759	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG01051	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG01112	0.992	0.963	0.009	0.0	0.955	0.907	3	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG01500	0.902	0.875	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG01565	0.855	0.83	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG01583	1.024	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG01595	0.965	0.937	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG01879	0.982	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG02568	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG02922	0.781	0.758	0.0	0.004	0.733	0.733	3	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG03006	0.692	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG03052	1.262	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG03642	1.051	1.02	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	HG03742	0.901	0.875	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA12878	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA18525	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA18939	0.961	0.933	0.0	0.004	0.394	0.412	3	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA19017	0.957	0.929	0.0	0.004	0.613	0.613	1	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA19238	0.461	0.447	0.0	0.079	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA19239	0.483	0.469	0.0	0.065	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA19625	0.463	0.45	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA19648	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA20502	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40291745	40291881	DEL	137	NA20845	0.859	0.834	0.0	0.005	0.857	0.857	3	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG00096	0.276	0.253	0.0	0.096	0.759	0.759	1	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG00268	0.315	0.289	0.0	0.071	0.59	0.59	1	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG00419	0.464	0.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG00759	0.453	0.416	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG01051	0.287	0.263	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG01112	0.624	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.232	nan	nan	0	0
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG01565	0.0	0.0	0.007	0.179	nan	nan	0	0
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG01583	0.268	0.246	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG01595	0.623	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG01879	0.364	0.334	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG02568	0.387	0.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.228	nan	nan	0	0
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG03006	0.255	0.234	0.0	0.083	1.0	1.0	1	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG03052	0.513	0.471	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG03642	0.538	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	HG03742	0.274	0.252	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA12878	0.257	0.236	0.0	0.06	0.581	0.581	1	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA18525	0.545	0.5	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA18939	0.326	0.299	0.0	0.115	0.824	0.861	1	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA19238	0.329	0.302	0.0	0.098	0.8	0.8	1	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA19239	0.548	0.503	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA19625	0.36	0.33	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA19648	0.177	0.162	0.0	0.065	1.0	1.0	1	1
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.176	nan	nan	0	0
chr2	40446946	40447073	DEL	128	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG00096	1.038	1.038	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG00268	1.119	1.119	0.0	0.0	0.622	0.622	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG00419	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG00759	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG01051	1.148	1.148	0.0	0.004	0.704	0.704	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG01112	1.157	1.157	0.0	0.0	0.714	0.752	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG01500	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG01565	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG01583	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG01595	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG01879	0.746	0.746	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG02568	0.658	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG02922	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG03006	1.293	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG03052	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG03642	1.101	1.101	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	HG03742	0.49	0.49	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA12878	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA18525	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA18939	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA19017	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA19238	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA19239	1.07	1.07	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA19625	0.978	0.978	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA19648	1.035	1.035	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA20502	0.72	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	43854261	43854480	DEL	220	NA20845	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG00096	0.514	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG00268	0.472	0.497	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG00419	0.515	0.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG00759	0.473	0.498	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG01051	0.267	0.281	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG01112	0.533	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG01500	0.451	0.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG01565	0.542	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG01583	0.585	0.616	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG01595	0.543	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG01879	0.418	0.44	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG02568	0.58	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG02922	0.486	0.511	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG03006	0.455	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG03052	0.0	0.0	0.025	0.234	nan	nan	0	0
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG03642	0.501	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	HG03742	0.392	0.412	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA12878	0.634	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA18525	0.58	0.611	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA18939	0.435	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA19017	0.638	0.671	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA19238	0.224	0.235	0.004	0.065	nan	nan	0	1
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA19239	0.326	0.343	0.012	0.065	nan	nan	0	1
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA19625	0.257	0.271	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA19648	0.606	0.638	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA20502	0.604	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44308491	44308817	DEL	327	NA20845	0.529	0.556	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG00096	0.928	0.867	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG00268	0.927	0.866	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG00419	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG00759	0.729	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG01051	0.328	0.307	0.0	0.02	0.4	0.4	1	1
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG01112	0.79	0.738	0.0	0.0	0.833	0.792	1	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG01500	0.739	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG01565	0.917	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG01583	0.707	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG01595	0.986	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG01879	1.037	0.969	0.0	0.0	0.457	0.457	1	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG02568	1.006	0.94	0.0	0.007	0.9	0.9	1	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG02922	0.823	0.77	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG03006	0.819	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG03052	0.407	0.38	0.0	0.046	0.481	0.481	1	1
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG03642	0.676	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	HG03742	0.94	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA12878	0.857	0.801	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA18525	0.739	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA18939	0.943	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA19017	0.319	0.298	0.0	0.023	0.587	0.587	2	1
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA19238	0.434	0.406	0.0	0.04	0.902	0.902	1	1
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA19239	0.535	0.5	0.0	0.033	0.673	0.673	1	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA19625	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA19648	0.909	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA20502	0.859	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	44664593	44664672	DEL	80	NA20845	1.057	0.988	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG00096	0.67	0.67	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG00268	0.315	0.315	0.004	0.071	nan	nan	0	1
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG00419	1.0	1.0	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG00759	0.0	0.0	0.026	0.199	nan	nan	0	0
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG01051	0.779	0.779	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG01112	0.606	0.606	0.0	0.004	0.25	0.238	1	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG01500	0.721	0.721	0.0	0.0	0.889	0.889	2	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG01565	0.521	0.521	0.0	0.0	0.833	0.784	3	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG01583	0.609	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG01595	0.805	0.805	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.247	nan	nan	0	0
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG02568	0.387	0.387	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG02922	0.633	0.633	0.0	0.0	0.417	0.417	3	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG03006	0.655	0.655	0.0	0.012	0.214	0.214	1	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG03052	0.663	0.663	0.0	0.0	0.312	0.312	2	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG03642	0.45	0.45	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr2	46312696	46312947	DEL	252	HG03742	0.294	0.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA12878	0.583	0.583	0.0	0.004	0.167	0.167	1	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA18525	0.967	0.967	0.0	0.008	0.711	0.711	2	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA18939	0.526	0.526	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA19017	0.188	0.188	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA19238	0.783	0.783	0.0	0.003	0.812	0.812	3	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA19239	0.404	0.404	0.005	0.092	nan	nan	0	1
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA19625	0.463	0.463	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA19648	0.682	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA20502	0.604	0.604	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	46312696	46312947	DEL	252	NA20845	0.22	0.22	0.0	0.083	0.833	0.833	2	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG00096	0.276	0.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG00268	0.105	0.105	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG00419	0.124	0.124	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG00759	0.335	0.335	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG01051	0.554	0.554	0.0	0.117	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG01112	0.184	0.184	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG01500	0.18	0.18	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG01565	0.208	0.208	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG01583	0.219	0.219	0.0	0.027	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG01595	0.483	0.483	0.007	0.104	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG01879	0.236	0.236	0.0	0.079	nan	nan	0	2
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG02568	0.445	0.445	0.0	0.106	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG02922	0.528	0.528	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG03006	0.328	0.328	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG03052	0.449	0.449	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	HG03742	0.118	0.118	0.006	0.087	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA12878	0.463	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA18525	0.519	0.519	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA18939	0.163	0.163	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA19017	0.469	0.469	0.009	0.196	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA19238	0.48	0.48	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA19239	0.561	0.561	0.0	0.184	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA19625	0.54	0.54	0.0	0.17	nan	nan	0	1
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA19648	0.606	0.606	0.009	0.175	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr2	46433782	46433944	DEL	163	NA20845	0.264	0.264	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG00096	0.606	0.589	0.056	0.039	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG00268	0.402	0.39	0.107	0.062	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG00419	1.031	1.0	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG00759	1.084	1.052	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG01051	0.472	0.458	0.085	0.039	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG01112	0.551	0.535	0.058	0.029	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG01500	1.046	1.016	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG01565	1.042	1.012	0.0	0.0	0.583	0.549	1	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG01583	0.536	0.521	0.069	0.031	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG01595	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG01879	0.546	0.53	0.056	0.048	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG02568	0.464	0.451	0.064	0.021	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG02922	0.486	0.471	0.096	0.047	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG03006	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG03052	1.155	1.122	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG03642	0.976	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	HG03742	0.529	0.514	0.07	0.039	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA12878	0.617	0.599	0.02	0.045	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA18525	1.214	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA18939	0.979	0.951	0.002	0.002	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA19017	0.788	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA19238	1.145	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA19239	1.122	1.089	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA19625	1.261	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA19648	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA20502	0.604	0.586	0.064	0.034	nan	nan	0	1
chr2	48990526	48991166	DEL	641	NA20845	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG00096	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG00268	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG00419	0.453	0.477	0.0	0.064	0.222	0.222	1	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG00759	0.453	0.477	0.009	0.083	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG01051	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG01112	0.312	0.329	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG01500	1.082	1.139	0.011	0.003	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG01565	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG01583	0.561	0.59	0.0	0.067	0.545	0.545	1	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG01595	0.483	0.508	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG02568	0.0	0.0	0.017	0.194	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG02922	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG03006	0.382	0.402	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG03052	0.984	1.036	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG03642	0.275	0.29	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	HG03742	1.019	1.072	0.008	0.004	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA12878	0.0	0.0	0.006	0.123	nan	nan	0	0
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA18525	0.475	0.5	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA18939	0.0	0.0	0.016	0.172	nan	nan	0	0
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA19017	0.957	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA19238	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA19239	0.509	0.536	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA19625	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA19648	0.53	0.558	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA20502	1.3	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	49561482	49561626	DEL	145	NA20845	0.396	0.417	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG00096	0.937	0.91	0.0	0.0	0.719	0.719	3	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG00268	0.892	0.866	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG00419	0.948	0.92	0.0	0.0	0.762	0.762	2	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG00759	1.045	1.014	0.0	0.0	0.744	0.744	2	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG01051	0.861	0.836	0.0	0.0	0.917	0.917	3	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG01112	0.771	0.749	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG01500	0.92	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG01565	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG01583	0.902	0.876	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG01595	0.986	0.957	0.0	0.0	0.611	0.611	2	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG01879	1.128	1.095	0.005	0.0	0.793	0.793	1	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG02568	0.735	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG02922	0.486	0.471	0.073	0.035	nan	nan	0	1
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG03006	0.929	0.902	0.0	0.0	0.63	0.63	2	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG03052	0.856	0.831	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG03642	1.076	1.045	0.0	0.0	0.737	0.737	3	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	HG03742	0.842	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA12878	0.926	0.899	0.0	0.0	0.761	0.761	2	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA18525	0.774	0.751	0.0	0.0	0.806	0.806	3	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA18939	1.052	1.021	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA19017	0.938	0.911	0.0	0.0	0.71	0.71	3	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA19238	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA19239	1.005	0.975	0.0	0.0	0.925	0.925	1	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA19625	0.926	0.899	0.0	0.0	0.737	0.737	3	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA19648	0.934	0.907	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA20502	1.161	1.127	0.0	0.0	0.885	0.885	3	2
chr2	50480975	50481759	DEL	785	NA20845	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG00096	0.974	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG00268	0.909	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG00419	0.824	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG00759	0.985	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG01051	0.902	0.876	0.0	0.0	0.769	0.769	2	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG01112	0.845	0.82	0.0	0.0	0.913	0.867	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG01500	0.559	0.543	0.087	0.061	nan	nan	0	1
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG01565	0.73	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG01583	0.512	0.497	0.045	0.042	nan	nan	0	1
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG01595	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG01879	0.855	0.83	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG02568	0.464	0.451	0.098	0.061	nan	nan	0	1
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG02922	0.0	0.0	0.227	0.147	nan	nan	0	0
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG03006	0.892	0.866	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG03052	0.321	0.312	0.089	0.056	nan	nan	0	1
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG03642	0.375	0.364	0.076	0.04	nan	nan	0	1
chr2	51224545	51225541	DEL	997	HG03742	1.078	1.046	0.006	0.0	0.55	0.55	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA12878	0.737	0.716	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA18525	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA18939	0.943	0.916	0.0	0.0	0.773	0.808	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA19017	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA19238	0.0	0.0	0.389	0.235	nan	nan	0	0
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA19239	0.992	0.963	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA19625	0.875	0.849	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA19648	1.187	1.152	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA20502	0.882	0.856	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr2	51224545	51225541	DEL	997	NA20845	0.969	0.941	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG00096	1.359	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG00268	1.154	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG00419	1.237	1.156	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG00759	1.261	1.179	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG01051	1.107	1.035	0.0	0.0	0.848	0.848	2	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG01112	1.359	1.27	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG01500	1.082	1.011	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG01565	1.48	1.383	0.0	0.0	0.634	0.597	2	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG01583	0.926	0.866	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG01595	1.307	1.222	0.0	0.0	0.893	0.893	2	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG01879	1.455	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG02568	1.122	1.049	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG02922	0.676	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG03006	1.384	1.293	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG03052	1.027	0.96	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG03642	1.401	1.31	0.0	0.0	0.682	0.682	3	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	HG03742	1.528	1.428	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA12878	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA18525	1.091	1.019	0.0	0.0	0.962	0.962	3	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA18939	1.306	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA19017	1.107	1.034	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA19238	1.289	1.205	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA19239	1.057	0.988	0.0	0.0	0.791	0.791	1	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA19625	1.183	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA19648	1.187	1.109	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA20502	1.161	1.085	0.0	0.0	0.464	0.464	1	2
chr2	5137508	5138165	DEL	658	NA20845	1.256	1.173	0.0	0.0	0.671	0.671	2	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG00096	1.506	1.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG00268	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG00419	0.0	0.0	0.088	0.279	nan	nan	0	0
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG00759	1.182	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG01051	1.23	1.15	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG01112	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG01500	0.956	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG01565	0.0	0.0	0.119	0.196	nan	nan	0	0
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG01583	0.585	0.547	0.036	0.056	0.192	0.192	6	1
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG01595	0.0	0.0	0.087	0.243	nan	nan	0	0
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG01879	0.528	0.493	0.032	0.108	0.194	0.194	6	1
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG02568	1.084	1.013	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG02922	1.267	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG03006	0.692	0.647	0.016	0.107	nan	nan	0	1
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG03052	1.54	1.44	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG03642	1.401	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	HG03742	0.725	0.677	0.03	0.107	0.413	0.413	6	1
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA12878	0.343	0.32	0.015	0.109	nan	nan	0	1
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA18525	1.214	1.134	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA18939	1.143	1.068	0.004	0.006	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA19017	0.582	0.543	0.03	0.124	0.464	0.464	6	1
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA19238	1.105	1.033	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA19239	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA19625	1.029	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA19648	0.959	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA20502	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	51973822	51974238	DEL	417	NA20845	0.771	0.72	0.04	0.066	nan	nan	0	1
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG00096	0.882	0.856	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG00268	0.717	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG00419	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG00759	0.808	0.785	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG01051	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG01112	0.937	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG01500	0.812	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG01565	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG01583	1.268	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG01595	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG01879	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG02568	1.006	0.977	0.0	0.0	0.822	0.822	2	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG02922	0.76	0.738	0.0	0.005	0.6	0.6	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG03006	1.038	1.008	0.0	0.0	0.909	0.909	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG03052	0.941	0.914	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG03642	0.926	0.899	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	HG03742	0.98	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA12878	0.96	0.932	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA18525	0.44	0.427	0.125	0.078	nan	nan	0	1
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA18939	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA19017	0.994	0.965	0.0	0.0	0.955	0.955	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA19238	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA19239	1.044	1.013	0.0	0.0	0.908	0.908	4	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA19625	0.695	0.674	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA19648	0.959	0.931	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA20502	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53292194	53293096	DEL	903	NA20845	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG00096	1.194	1.257	0.0	0.0	0.868	0.868	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG00268	1.014	1.068	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG00419	0.68	0.716	0.0	0.0	0.615	0.615	3	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG00759	0.847	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG01051	0.902	0.95	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG01112	0.955	1.005	0.0	0.0	0.774	0.815	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG01500	0.938	0.987	0.0	0.0	0.531	0.531	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG01565	0.75	0.79	0.0	0.0	0.441	0.415	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG01583	0.658	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG01595	0.925	0.974	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG01879	0.691	0.728	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG02568	0.735	0.774	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG02922	0.887	0.933	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG03006	0.637	0.671	0.0	0.0	0.562	0.562	3	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG03052	0.856	0.901	0.0	0.004	0.556	0.556	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG03642	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	HG03742	0.784	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA12878	0.891	0.938	0.0	0.0	0.862	0.862	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA18525	0.827	0.87	0.0	0.0	0.803	0.803	2	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA18939	0.653	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA19017	0.356	0.375	0.053	0.132	0.875	0.875	1	1
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA19238	0.421	0.443	0.006	0.119	0.409	0.409	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA19239	1.005	1.057	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA19625	0.592	0.623	0.0	0.0	0.522	0.522	4	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA19648	0.858	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA20502	1.045	1.1	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr2	53821472	53821844	DEL	373	NA20845	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG00096	0.68	0.715	0.0	0.0	0.604	0.604	6	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG00268	0.787	0.828	0.0	0.0	0.905	0.905	3	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG00419	0.866	0.911	0.008	0.0	0.791	0.791	6	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG00759	1.005	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG01051	0.369	0.389	0.079	0.073	nan	nan	0	1
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG01112	0.716	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG01500	0.703	0.74	0.0	0.0	0.692	0.692	5	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG01565	0.834	0.878	0.0	0.0	0.75	0.797	1	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG01583	0.804	0.847	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG01595	0.764	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG01879	0.764	0.804	0.0	0.0	0.929	0.929	2	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG02568	0.967	1.018	0.0	0.0	0.581	0.581	2	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG02922	0.908	0.956	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG03006	0.674	0.709	0.0	0.0	0.774	0.774	6	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG03052	0.0	0.0	0.188	0.144	nan	nan	0	0
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG03642	1.051	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	HG03742	0.901	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA12878	0.943	0.992	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA18525	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA18939	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA19017	0.844	0.889	0.0	0.0	0.78	0.78	4	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA19238	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA19239	0.887	0.934	0.0	0.0	0.422	0.422	2	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA19625	1.055	1.11	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA19648	0.909	0.957	0.0	0.0	0.941	0.941	5	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA20502	0.998	1.051	0.0	0.0	0.905	0.905	3	2
chr2	5449506	5450060	DEL	555	NA20845	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG00096	1.286	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG00268	1.381	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG00419	1.092	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG00759	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG01051	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG01112	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG01500	1.226	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG01565	0.834	0.81	0.007	0.074	0.25	0.266	6	1
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG01583	1.487	1.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG01595	1.267	1.23	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG01879	1.146	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG02568	1.471	1.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG02922	1.182	1.148	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG03006	1.329	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG03052	1.22	1.184	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG03642	1.151	1.118	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	HG03742	1.195	1.16	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA12878	0.908	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA18525	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA18939	1.251	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA19017	0.919	0.892	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA19238	1.066	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA19239	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA19625	0.54	0.525	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA19648	0.757	0.735	0.009	0.084	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA20502	1.393	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	54954310	54954544	DEL	235	NA20845	1.233	1.198	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG00096	1.212	1.177	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG00268	0.402	0.39	0.015	0.093	nan	nan	0	1
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG00419	1.216	1.181	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG00759	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG01051	0.923	0.896	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG01112	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG01500	0.451	0.438	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG01565	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG01583	1.609	1.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG01595	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG01879	1.219	1.183	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG02568	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG02922	1.161	1.127	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG03006	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG03052	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG03642	1.301	1.263	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	HG03742	1.156	1.122	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA12878	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA18525	1.038	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA18939	0.943	0.916	0.0	0.0	0.72	0.753	1	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA19017	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA19238	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA19239	1.044	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA19625	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA19648	0.404	0.392	0.0	0.118	nan	nan	0	1
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA20502	1.114	1.082	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr2	56071107	56071397	DEL	291	NA20845	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG00096	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG00268	1.032	1.032	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG00419	0.907	0.907	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG00759	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG01051	1.21	1.21	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG01112	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG01500	0.902	0.902	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG01565	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG01583	0.414	0.414	0.0	0.034	0.8	0.8	1	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG01595	1.126	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG01879	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG02568	1.393	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG02922	1.109	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG03006	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG03052	1.241	1.241	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	HG03742	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA12878	0.908	0.908	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA18525	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA18939	0.852	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA19017	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA19238	0.684	0.684	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA19239	1.018	1.018	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA19625	1.261	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	58912794	58912847	DUP	54	NA19648	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG00096	1.304	1.449	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG00268	0.699	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG00419	1.154	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG00759	1.045	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG01051	1.046	1.162	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG01112	1.295	1.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG01500	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG01565	1.105	1.228	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG01583	0.975	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG01595	1.348	1.497	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG01879	0.8	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG02568	1.006	1.118	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG02922	0.855	0.95	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG03006	1.293	1.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG03052	0.984	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG03642	0.726	0.806	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	HG03742	0.94	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA12878	1.011	1.124	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA18525	1.126	1.251	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA18939	0.417	0.463	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA19017	1.163	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA19238	1.224	1.36	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA19239	0.992	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA19625	1.261	1.401	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA19648	1.187	1.318	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA20502	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61501262	61501397	DEL	136	NA20845	1.211	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG00096	0.882	0.928	0.009	0.0	0.472	0.472	2	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG00268	0.857	0.902	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG00419	0.412	0.434	0.078	0.044	nan	nan	0	1
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG00759	0.355	0.373	0.086	0.048	nan	nan	0	1
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG01051	0.697	0.734	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG01112	0.275	0.29	0.066	0.04	0.148	0.156	1	1
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG01500	0.938	0.987	0.0	0.0	0.44	0.44	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG01565	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG01583	0.414	0.436	0.063	0.03	nan	nan	0	1
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG01595	0.965	1.016	0.0	0.0	0.967	0.967	2	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG01879	0.946	0.996	0.0	0.0	0.536	0.536	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG02568	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG02922	0.992	1.045	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG03006	0.419	0.441	0.034	0.019	nan	nan	0	1
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG03052	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG03642	0.976	1.027	0.0	0.0	0.65	0.65	2	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	HG03742	0.725	0.763	0.0	0.0	0.688	0.688	2	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA12878	1.028	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA18525	1.108	1.167	0.0	0.001	0.667	0.667	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA18939	0.435	0.458	0.053	0.036	nan	nan	0	1
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA19017	0.994	1.047	0.0	0.0	0.645	0.645	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA19238	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA19239	1.057	1.112	0.0	0.0	0.915	0.915	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA19625	0.952	1.002	0.0	0.0	0.378	0.378	2	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA19648	0.959	1.01	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA20502	1.137	1.197	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chr2	61880173	61881103	DEL	931	NA20845	1.167	1.229	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG00096	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG00268	0.787	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG00419	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG00759	0.591	0.622	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG01051	0.861	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG01112	0.771	0.812	0.0	0.0	0.739	0.702	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG01500	0.83	0.873	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG01565	0.771	0.812	0.0	0.0	0.812	0.863	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG01583	0.78	0.821	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG01595	0.845	0.889	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG01879	0.946	0.996	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG02568	0.89	0.937	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG02922	0.38	0.4	0.107	0.044	nan	nan	0	1
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG03006	0.747	0.786	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG03052	0.834	0.878	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG03642	0.851	0.896	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	HG03742	0.803	0.846	0.0	0.0	0.577	0.577	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA12878	0.874	0.92	0.0	0.0	0.483	0.483	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA18525	0.897	0.944	0.002	0.002	0.619	0.619	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA18939	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA19017	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA19238	0.882	0.928	0.005	0.001	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA19239	1.005	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA19625	0.823	0.867	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA19648	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA20502	0.743	0.782	0.002	0.004	nan	nan	0	2
chr2	62119680	62120675	DEL	996	NA20845	0.947	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG00096	1.065	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG00268	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG00419	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG00759	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG01051	0.779	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG01112	0.735	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG01500	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG01565	0.896	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG01583	1.243	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG01595	0.805	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG01879	0.891	0.938	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG02568	0.948	0.998	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG02922	0.57	0.6	0.049	0.062	nan	nan	0	1
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG03006	0.892	0.939	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG03052	1.091	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG03642	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	HG03742	0.999	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA12878	1.003	1.056	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA18525	1.029	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA18939	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA19017	0.975	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA19238	0.987	1.039	0.0	0.0	0.854	0.854	1	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA19239	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA19625	1.106	1.164	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA19648	1.288	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA20502	1.091	1.148	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr2	62483218	62483687	DEL	470	NA20845	1.035	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG00096	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG00268	1.049	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG00419	1.072	1.072	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG00759	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG01051	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG01112	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG01500	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG01565	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG01583	0.609	0.609	0.0	0.04	0.364	0.364	1	1
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG01595	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG01879	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG02568	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG02922	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG03006	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG03052	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG03642	1.552	1.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	HG03742	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA12878	1.217	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA18525	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA18939	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA19017	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA19238	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA19239	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA19625	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA19648	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA20502	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	66216530	66216599	DEL	70	NA20845	1.145	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG00096	1.047	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG00268	0.944	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG00419	1.051	0.964	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG00759	0.887	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG01051	0.902	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG01112	0.79	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG01500	0.812	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG01565	0.709	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG01583	0.975	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG01595	0.744	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG01879	0.873	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG02568	1.238	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG02922	0.908	0.833	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG03006	1.092	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG03052	0.342	0.314	0.0	0.033	0.909	0.909	1	1
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG03642	0.876	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	HG03742	1.078	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA12878	1.028	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA18525	1.249	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA18939	0.925	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA19017	1.088	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA19238	1.197	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA19239	0.913	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA19625	1.003	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA19648	1.035	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA20502	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	68979433	68979483	DEL	51	NA20845	0.771	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG00096	0.0	0.0	0.106	0.165	nan	nan	0	0
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG00268	0.734	0.773	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG00419	0.371	0.391	0.067	0.078	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG00759	0.414	0.436	0.056	0.065	0.611	0.611	2	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG01051	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG01112	0.624	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG01500	0.343	0.361	0.052	0.06	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG01565	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG01583	1.024	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG01595	0.362	0.381	0.017	0.045	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG01879	0.546	0.574	0.015	0.037	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG02568	0.0	0.0	0.092	0.127	nan	nan	0	0
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG02922	0.528	0.556	0.024	0.047	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG03006	0.291	0.307	0.043	0.04	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG03052	0.342	0.36	0.04	0.066	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG03642	0.375	0.395	0.043	0.038	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	HG03742	0.0	0.0	0.083	0.156	nan	nan	0	0
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA12878	0.0	0.0	0.074	0.158	nan	nan	0	0
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA18525	0.422	0.444	0.003	0.04	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA18939	0.0	0.0	0.133	0.129	nan	nan	0	0
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA19017	0.356	0.375	0.037	0.067	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA19238	0.382	0.402	0.031	0.088	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA19239	0.352	0.371	0.025	0.075	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA19625	0.0	0.0	0.112	0.152	nan	nan	0	0
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA19648	1.161	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA20502	0.534	0.562	0.038	0.055	nan	nan	0	1
chr2	70125033	70125561	DEL	529	NA20845	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG00096	0.716	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG00268	0.796	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG00419	0.763	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG00759	0.808	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG01051	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG01112	0.68	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG01500	0.83	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG01565	0.542	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG01583	0.731	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG01595	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG01879	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG02568	0.658	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG02922	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG03006	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG03052	1.048	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG03642	0.626	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	HG03742	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA12878	0.926	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA18525	0.563	0.593	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA18939	0.734	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA19017	0.413	0.434	0.0	0.057	0.846	0.846	1	1
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA19239	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA19625	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA19648	0.682	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA20502	1.01	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	71140007	71140082	DEL	76	NA20845	0.683	0.719	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG00096	0.643	0.714	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG00268	0.612	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG00419	0.556	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG00759	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG01051	0.759	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG01112	0.624	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG01500	0.469	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG01565	0.459	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG01583	0.683	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG01595	0.483	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG01879	0.619	0.687	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG02568	1.006	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG02922	0.823	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG03006	0.601	0.668	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG03052	0.984	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG03642	0.926	1.029	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	HG03742	0.627	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA12878	0.651	0.724	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA18525	0.616	0.684	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA18939	0.435	0.484	0.0	0.0	1.0	0.957	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA19017	0.3	0.333	0.0	0.039	0.844	0.844	2	1
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA19238	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA19239	0.691	0.768	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA19625	0.592	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA19648	1.01	1.122	0.0	0.0	0.476	0.476	1	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA20502	0.859	0.954	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	72191611	72191673	DEL	63	NA20845	0.573	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG00096	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG00268	0.437	0.46	0.0	0.132	nan	nan	0	1
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG00419	1.154	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG00759	0.907	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG01051	0.472	0.496	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG01112	0.992	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG01500	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG01565	0.688	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG01583	1.073	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG01595	0.583	0.614	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG01879	1.019	1.072	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG02568	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG02922	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG03006	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG03052	1.22	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG03642	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	HG03742	0.411	0.433	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA12878	1.166	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA18525	0.721	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA18939	1.143	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA19017	0.394	0.415	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA19238	1.053	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA19239	0.796	0.838	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA19625	0.9	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA19648	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA20502	1.253	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	73286754	73287040	DEL	287	NA20845	0.991	1.043	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG00096	0.698	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG00419	0.412	0.4	0.007	0.038	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG00759	0.0	0.0	0.008	0.196	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG01051	0.0	0.0	0.006	0.181	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.227	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG01565	0.0	0.0	0.028	0.184	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG01583	0.439	0.426	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG01595	1.368	1.328	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.196	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG02568	0.658	0.639	0.0	0.018	0.833	0.833	1	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG02922	0.992	0.963	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG03006	0.0	0.0	0.005	0.197	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG03052	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	HG03742	0.372	0.361	0.007	0.104	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA18525	1.214	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA18939	0.49	0.475	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA19017	0.957	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA19238	0.447	0.434	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA19239	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA19625	0.592	0.574	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA19648	0.417	0.404	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA20502	0.627	0.608	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr2	76557061	76557292	DEL	232	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr2	766949	767022	DUP	74	HG00096	0.854	0.982	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG00268	0.892	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG00419	0.701	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG00759	0.631	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG01051	0.595	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG01112	0.808	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG01500	0.523	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG01565	0.584	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG01583	0.902	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG01595	0.825	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG01879	0.637	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG02568	0.716	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG02922	1.182	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG03006	0.765	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG03642	0.926	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	HG03742	0.666	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA12878	0.668	0.768	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA18525	0.836	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA18939	0.916	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA19238	0.592	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA19239	0.744	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA19648	0.858	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA20502	0.789	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	766949	767022	DUP	74	NA20845	0.815	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG00096	1.01	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG00268	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG00419	0.989	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG00759	1.005	0.939	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG01051	1.107	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG01112	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG01500	1.172	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG01565	1.063	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG01583	0.975	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG01595	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG01879	1.128	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG02568	0.851	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG02922	1.035	0.967	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG03006	0.473	0.442	0.064	0.04	nan	nan	0	1
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG03052	0.792	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG03642	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	HG03742	1.097	1.025	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA12878	0.823	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA18525	0.897	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA18939	1.034	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA19017	1.05	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA19238	0.882	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA19239	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA19625	0.926	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA19648	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA20502	1.23	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	76844767	76845509	DEL	743	NA20845	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG00096	0.79	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG00268	0.804	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG00759	1.064	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG01051	0.923	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG01112	1.276	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG01500	1.109	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG01565	1.167	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG01583	0.804	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG01595	0.925	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG01879	1.173	1.076	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG02568	0.735	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG02922	1.14	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG03006	1.347	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG03052	0.492	0.451	0.0	0.027	0.72	0.72	1	1
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG03642	1.026	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	HG03742	1.313	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA12878	0.754	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA18939	0.889	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA19017	0.919	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA19238	0.868	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA19239	1.174	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA19625	1.081	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA19648	1.212	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA20502	0.511	0.469	0.0	0.059	0.64	0.64	1	1
chr2	77494881	77494936	DEL	56	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG00096	0.918	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG00268	0.0	0.0	0.174	0.298	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG00419	0.0	0.0	0.184	0.289	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG00759	0.0	0.0	0.104	0.263	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG01051	0.0	0.0	0.099	0.249	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG01112	0.937	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG01500	0.559	0.543	0.017	0.058	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG01565	0.521	0.506	0.085	0.104	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG01583	0.78	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG01595	0.0	0.0	0.137	0.266	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG01879	0.619	0.601	0.037	0.105	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG02568	0.58	0.564	0.018	0.13	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG02922	0.401	0.389	0.066	0.142	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG03006	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG03052	0.407	0.395	0.068	0.123	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG03642	0.0	0.0	0.138	0.267	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	HG03742	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA12878	0.343	0.333	0.012	0.086	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA18525	0.0	0.0	0.061	0.268	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA18939	0.0	0.0	0.042	0.252	nan	nan	0	0
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA19017	1.069	1.038	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA19238	1.053	1.022	0.0	0.0	0.838	0.838	1	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA19239	0.535	0.519	0.008	0.104	nan	nan	0	1
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA19625	1.029	0.999	0.0	0.0	0.722	0.722	3	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA19648	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA20502	0.789	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78117886	78118362	DEL	477	NA20845	0.0	0.0	0.159	0.258	nan	nan	0	0
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG00096	0.239	0.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG00268	0.612	0.775	0.0	0.004	0.409	0.409	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG00419	0.639	0.809	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG00759	0.315	0.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG01051	0.123	0.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG01112	0.22	0.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG01500	0.541	0.685	0.0	0.0	0.261	0.261	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG01565	0.438	0.554	0.0	0.0	0.308	0.29	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG01583	0.414	0.525	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG01595	0.523	0.662	0.0	0.0	0.385	0.385	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG01879	0.2	0.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG02568	0.271	0.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG02922	0.274	0.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG03006	0.51	0.645	0.0	0.0	0.182	0.182	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG03052	0.235	0.298	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG03642	0.275	0.348	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	HG03742	0.274	0.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA12878	0.171	0.217	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA18525	0.053	0.067	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA18939	0.345	0.436	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA19017	0.356	0.451	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA19238	0.737	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA19239	0.339	0.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA19625	0.36	0.456	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA19648	0.151	0.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA20502	0.58	0.735	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr2	78748487	78748630	DEL	144	NA20845	0.617	0.781	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG00096	0.367	0.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG00268	0.56	0.674	0.005	0.009	nan	nan	0	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG00419	0.268	0.323	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG00759	0.256	0.309	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG01051	0.123	0.148	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG01112	0.542	0.653	0.0	0.177	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG01500	0.343	0.413	0.005	0.069	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG01565	0.271	0.327	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG01583	0.098	0.117	0.009	0.104	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG01595	0.302	0.363	0.0	0.052	0.375	0.375	2	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG01879	0.2	0.241	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG02568	0.039	0.047	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG02922	0.148	0.178	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG03006	0.51	0.614	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG03052	0.428	0.516	0.0	0.144	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG03642	0.325	0.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	HG03742	0.255	0.307	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA12878	0.549	0.661	0.0	0.147	nan	nan	0	0
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA18525	0.229	0.276	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA18939	0.272	0.328	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.212	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA19238	0.237	0.285	0.0	0.071	0.4	0.4	2	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA19239	0.431	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA19625	0.437	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA19648	0.101	0.122	0.0	0.11	nan	nan	0	1
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA20502	0.395	0.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	78785986	78786119	DEL	134	NA20845	0.264	0.318	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG00096	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG00268	0.787	0.787	0.0	0.0	0.785	0.785	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG00419	0.948	0.948	0.0	0.0	0.646	0.646	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG00759	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG01051	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG01112	0.735	0.735	0.0	0.0	0.889	0.844	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG01500	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG01565	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG01583	0.853	0.853	0.0	0.0	0.625	0.625	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG01595	0.805	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG01879	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG02568	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG02922	0.76	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG03006	0.929	0.929	0.0	0.0	0.796	0.796	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG03052	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG03642	1.151	1.151	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	HG03742	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA12878	0.926	0.926	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA18525	0.721	0.721	0.0	0.0	0.731	0.731	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA18939	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA19017	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA19238	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA19239	0.47	0.47	0.115	0.052	nan	nan	0	1
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA19625	0.412	0.412	0.052	0.03	nan	nan	0	1
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA19648	0.959	0.959	0.0	0.0	0.67	0.67	2	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA20502	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	80679286	80680057	DEL	772	NA20845	0.925	0.925	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG00096	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG00268	0.857	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG00419	0.845	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG00759	0.69	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG01051	0.943	1.048	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG01112	0.698	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG01500	0.757	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG01565	0.834	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG01583	0.926	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG01595	0.664	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG01879	0.491	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG02568	0.658	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG02922	0.992	1.103	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG03006	0.637	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG03052	0.792	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG03642	0.951	1.057	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	HG03742	0.784	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA12878	0.806	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA18525	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA18939	0.762	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA19017	0.957	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA19238	1.039	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA19625	1.055	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA19648	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA20502	1.045	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81122883	81122971	DEL	89	NA20845	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG00096	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG00268	1.224	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG00419	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG00759	0.65	0.608	0.043	0.078	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG01051	0.41	0.383	0.016	0.081	nan	nan	0	1
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG01112	1.102	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG01500	0.703	0.657	0.034	0.085	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG01565	1.167	1.091	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG01583	0.878	0.82	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG01595	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG01879	0.637	0.595	0.012	0.062	nan	nan	0	1
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG02568	0.619	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG02922	1.098	1.026	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG03006	0.983	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG03052	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG03642	0.876	0.819	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	HG03742	1.097	1.025	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA12878	0.771	0.721	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA18525	1.108	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA18939	1.052	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA19017	0.975	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA19238	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA19239	1.213	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA19625	0.952	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA19648	0.934	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA20502	0.441	0.412	0.033	0.066	nan	nan	0	2
chr2	81771354	81771778	DEL	425	NA20845	1.366	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG00096	0.9	0.9	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG00268	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG00419	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG00759	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG01051	0.82	0.82	0.006	0.002	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG01112	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG01500	0.812	0.812	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG01565	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG01583	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG01595	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG01879	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG02568	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG02922	0.57	0.57	0.07	0.041	nan	nan	0	1
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG03006	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG03052	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG03642	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	HG03742	0.842	0.842	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA12878	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA18525	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA18939	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA19017	0.825	0.825	0.0	0.0	0.861	0.861	4	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA19238	0.882	0.882	0.0	0.0	0.711	0.711	4	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA19239	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA19625	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA19648	0.959	0.959	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA20502	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82092083	82092895	DEL	813	NA20845	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG00096	0.386	0.406	0.005	0.115	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG00268	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG00419	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG00759	0.985	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG01051	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG01112	0.863	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG01500	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG01565	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG01583	0.902	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG01595	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG01879	0.4	0.421	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG02568	0.503	0.53	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG02922	0.823	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG03006	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG03052	0.0	0.0	0.033	0.163	nan	nan	0	0
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG03642	1.076	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	HG03742	0.901	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA12878	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA18525	0.616	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA18939	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA19017	0.356	0.375	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA19238	0.0	0.0	0.007	0.203	nan	nan	0	0
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA19239	0.457	0.481	0.0	0.076	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA19625	0.54	0.569	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA19648	1.035	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA20502	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	82757145	82757444	DEL	300	NA20845	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG00096	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG00268	0.909	0.883	0.0	0.0	0.87	0.87	3	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG00419	0.577	0.56	0.076	0.035	nan	nan	0	1
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG00759	0.788	0.765	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG01051	0.943	0.916	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG01112	0.0	0.0	0.199	0.149	nan	nan	0	0
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG01500	0.938	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG01565	0.396	0.385	0.061	0.042	nan	nan	0	1
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG01583	0.878	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG01595	0.0	0.0	0.134	0.097	nan	nan	0	0
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG01879	0.982	0.954	0.006	0.0	0.751	0.751	2	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG02568	0.387	0.376	0.022	0.043	nan	nan	0	1
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG02922	0.802	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG03006	1.092	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG03052	1.113	1.08	0.0	0.0	0.747	0.747	2	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG03642	0.576	0.559	0.104	0.071	nan	nan	0	1
chr2	83035655	83036422	DEL	768	HG03742	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA12878	0.737	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA18525	0.493	0.478	0.111	0.067	nan	nan	0	1
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA18939	0.453	0.44	0.08	0.051	nan	nan	0	1
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA19017	0.544	0.528	0.055	0.016	nan	nan	0	1
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA19238	1.158	1.124	0.004	0.0	0.912	0.912	3	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA19239	0.874	0.849	0.0	0.0	0.806	0.806	3	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA19625	1.003	0.974	0.0	0.0	0.712	0.712	2	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA19648	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA20502	1.045	1.014	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr2	83035655	83036422	DEL	768	NA20845	0.396	0.385	0.062	0.034	nan	nan	0	1
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG00096	0.808	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG00268	1.119	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG00419	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG00759	0.926	0.866	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG01051	1.046	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG01112	0.918	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG01500	0.812	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG01565	0.75	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG01583	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG01595	1.046	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG01879	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG02568	1.006	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG02922	0.549	0.513	0.0	0.077	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG03006	1.038	0.97	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG03052	0.984	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG03642	1.051	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	HG03742	1.078	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA12878	0.737	0.689	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA18525	1.143	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA18939	1.034	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA19017	0.675	0.631	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA19238	0.908	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA19239	0.457	0.427	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA19625	1.029	0.962	0.0	0.018	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA19648	0.833	0.779	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA20502	1.091	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84110951	84111075	DEL	125	NA20845	1.211	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG00096	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG00268	0.935	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG00419	1.072	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG00759	1.104	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG01051	1.169	1.23	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG01112	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG01500	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG01565	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG01583	0.561	0.59	0.0	0.005	0.722	0.722	1	1
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG01595	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG01879	0.746	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG02568	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG02922	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG03006	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG03052	0.556	0.586	0.0	0.024	0.677	0.677	1	1
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG03642	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	HG03742	1.215	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA12878	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA18525	1.39	1.463	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA18939	1.279	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA19017	0.882	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA19239	0.509	0.536	0.0	0.012	0.804	0.804	1	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA19625	1.364	1.435	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA19648	1.212	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA20502	1.265	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	84918760	84918811	DEL	52	NA20845	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG00096	1.506	1.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG00268	1.329	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG00419	1.257	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG00759	1.439	1.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG01051	1.292	1.185	0.006	0.003	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG01500	1.118	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG01565	1.751	1.607	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG01583	1.121	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG01595	1.307	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG01879	1.273	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG02568	1.2	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG02922	1.119	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG03006	1.457	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG03052	1.07	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG03642	1.076	0.987	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	HG03742	1.45	1.33	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA12878	0.943	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA18525	1.354	1.243	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA18939	1.415	1.298	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA19017	1.426	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA19238	1.211	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA19239	1.318	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA19625	1.158	1.062	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA19648	1.363	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA20502	1.137	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	86570482	86570720	DUP	239	NA20845	1.674	1.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG00096	0.625	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG00268	0.56	0.622	0.0	0.24	0.405	0.405	2	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG00419	0.742	0.824	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG00759	0.355	0.394	0.0	0.245	0.938	0.938	1	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG01051	0.554	0.615	0.0	0.192	0.626	0.626	2	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG01112	0.588	0.653	0.0	0.292	0.661	0.696	2	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG01500	0.577	0.641	0.0	0.247	0.458	0.458	2	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG01565	0.417	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG01583	0.293	0.325	0.0	0.248	nan	nan	0	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG01595	0.724	0.805	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG01879	0.655	0.728	0.0	0.239	0.524	0.524	2	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG02568	0.735	0.817	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG02922	0.633	0.704	0.0	0.006	0.75	0.75	1	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG03006	0.601	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG03052	0.471	0.523	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG03642	0.475	0.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	HG03742	0.451	0.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA12878	0.617	0.686	0.006	0.176	0.76	0.76	1	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA18525	0.721	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA18939	0.689	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA19017	0.975	1.084	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA19238	0.632	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA19239	0.835	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA19625	0.566	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA19648	0.884	0.982	0.006	0.237	0.778	0.778	3	1
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA20502	0.812	0.903	0.0	0.225	0.38	0.38	2	2
chr2	88429838	88430152	DEL	315	NA20845	0.33	0.367	0.0	0.171	0.589	0.589	2	1
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG00096	0.863	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG00268	0.909	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG00419	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG00759	0.335	0.353	0.037	0.08	0.579	0.579	3	1
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG01051	0.533	0.561	0.048	0.039	0.533	0.533	1	1
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG01112	0.826	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG01500	0.0	0.0	0.189	0.177	nan	nan	0	0
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG01565	0.73	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG01583	0.0	0.0	0.208	0.136	nan	nan	0	0
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG01595	0.805	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG01879	0.637	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG02568	0.813	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG02922	0.823	0.867	0.0	0.003	0.887	0.887	2	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG03006	0.473	0.498	0.039	0.039	0.375	0.375	2	1
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG03052	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG03642	0.926	0.975	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	HG03742	0.784	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA12878	0.686	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA18525	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA18939	0.753	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA19017	0.319	0.336	0.056	0.1	0.6	0.6	1	1
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA19238	0.855	0.9	0.0	0.0	0.971	0.971	1	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA19239	0.9	0.948	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA19625	1.132	1.192	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA19648	0.833	0.877	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA20502	0.255	0.269	0.079	0.054	0.8	0.8	1	1
chr2	88821903	88822498	DEL	596	NA20845	0.595	0.626	0.057	0.048	0.5	0.5	1	1
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG00096	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG00268	1.067	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG00419	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG00759	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG01112	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG01500	0.848	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG01565	0.709	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG01583	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG01879	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG02568	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG02922	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG03006	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG03052	1.198	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG03642	1.126	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	HG03742	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA12878	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA18939	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA19017	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA19238	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA19239	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA19625	1.286	1.354	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA19648	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA20502	1.091	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	98385307	98385703	DUP	397	NA20845	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG00096	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG00268	1.276	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG00419	1.34	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG00759	1.123	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG01051	1.62	1.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG01112	1.414	1.373	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG01500	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG01565	1.313	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG01583	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG01595	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG01879	1.273	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG02568	0.503	0.488	0.0	0.033	0.714	0.714	1	1
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG02922	1.351	1.312	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG03006	1.566	1.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG03052	1.262	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG03642	0.901	0.875	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	HG03742	1.469	1.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA12878	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA18525	1.46	1.417	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA18939	1.143	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA19017	1.426	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA19238	1.421	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA19239	1.252	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA19625	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA19648	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA20502	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr2	99044800	99044870	DEL	71	NA20845	1.211	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG00096	1.045	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG00268	0.844	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG00419	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG00759	1.184	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG01051	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG01112	0.878	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG01500	0.823	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG01565	1.278	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG01583	0.412	0.385	0.0	0.036	1.0	0.917	1	1
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG01595	1.288	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG01879	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG02568	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG02922	1.191	1.113	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG03006	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG03052	0.414	0.387	0.0	0.066	0.727	0.727	1	1
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG03642	0.813	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	HG03742	0.541	0.506	0.0	0.053	0.742	0.742	1	1
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA12878	0.354	0.331	0.0	0.048	0.909	0.909	1	1
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA18525	0.698	0.652	0.0	0.037	0.625	0.653	1	1
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA18939	0.848	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA19017	0.985	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA19238	0.585	0.547	0.0	0.069	0.905	0.935	2	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA19239	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA19625	1.388	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA19648	1.117	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA20502	0.511	0.477	0.0	0.035	0.84	0.84	1	1
chr20	1069158	1069229	DEL	72	NA20845	0.644	0.602	0.0	0.026	0.579	0.579	1	1
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG00096	0.828	0.872	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG00268	1.069	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG00419	1.144	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG00759	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG01051	0.48	0.506	0.0	0.036	0.905	0.969	2	1
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG01112	0.899	0.946	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG01500	1.078	1.135	0.0	0.004	0.963	0.989	1	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG01565	0.99	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG01583	0.98	1.031	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG01595	1.265	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG01879	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG02568	0.831	0.875	0.0	0.032	0.441	0.441	2	1
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG02922	0.687	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG03006	0.954	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG03052	1.011	1.064	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG03642	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	HG03742	1.147	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA12878	1.133	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA18525	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA18939	1.006	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA19017	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA19238	0.521	0.548	0.0	0.04	0.604	0.624	1	1
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA19239	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA19625	0.531	0.559	0.0	0.075	0.808	0.808	1	1
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA19648	1.25	1.316	0.008	0.005	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA20502	1.143	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12488466	12488547	DEL	82	NA20845	1.074	1.131	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG00096	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG00268	1.294	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG00419	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG00759	1.316	1.23	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG01051	1.052	0.983	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG01112	1.246	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG01500	1.392	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG01565	1.335	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG01583	0.941	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG01595	1.175	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG01879	1.252	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG02568	0.554	0.518	0.02	0.091	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG02922	1.329	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG03006	1.213	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG03052	1.195	1.117	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG03642	1.49	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	HG03742	1.494	1.396	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA12878	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA18525	1.12	1.047	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA18939	1.222	1.142	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA19017	1.608	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA19238	1.156	1.08	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA19239	1.199	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA19625	1.415	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA19648	1.25	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA20502	1.362	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12583042	12583337	DEL	296	NA20845	1.074	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG00096	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG00268	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG00419	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG00759	0.702	0.702	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG01051	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG01112	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG01500	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG01565	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG01583	0.451	0.451	0.0	0.059	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG01595	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG01879	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG02568	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG02922	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG03006	0.497	0.497	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG03052	0.827	0.827	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG03642	1.408	1.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	HG03742	0.649	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA12878	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA18525	1.231	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA18939	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA19017	0.663	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA19238	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA19239	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA19625	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA19648	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA20502	1.07	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	12664890	12665021	DEL	132	NA20845	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG00096	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG00268	1.107	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG00419	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG00759	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG01051	1.052	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG01112	0.981	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG01500	0.961	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG01565	1.105	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG01583	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG01595	1.288	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG01879	1.272	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG02568	0.911	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG02922	0.916	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG03006	1.213	1.277	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG03052	1.126	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG03642	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	HG03742	0.498	0.524	0.0	0.028	0.875	0.875	1	1
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA12878	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA18525	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA18939	1.282	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA19017	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA19238	1.013	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA19239	1.001	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA19625	1.197	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA19648	1.649	1.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA20502	0.875	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	13147949	13148000	DEL	52	NA20845	1.026	1.08	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG00096	0.947	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG00268	0.975	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG00419	0.363	0.403	0.0	0.0	0.476	0.476	1	1
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG00759	0.833	0.926	0.0	0.003	0.696	0.696	1	1
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG01051	0.869	0.966	0.0	0.003	0.367	0.393	1	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG01112	1.246	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG01500	1.431	1.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG01565	0.944	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG01583	1.031	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG01595	1.129	1.255	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG01879	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG02568	0.435	0.484	0.0	0.007	1.0	1.0	1	1
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG02922	0.687	0.764	0.0	0.004	0.667	0.667	1	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG03006	0.974	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG03052	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG03642	0.758	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	HG03742	0.216	0.241	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA12878	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA18525	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA18939	0.651	0.723	0.0	0.003	0.64	0.672	1	1
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA19017	1.186	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA19238	0.485	0.539	0.0	0.007	0.96	0.992	1	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA19239	1.199	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA19625	0.735	0.816	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA19648	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA20502	1.204	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	14053044	14053107	DEL	64	NA20845	1.134	1.26	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG00096	0.0	0.0	0.04	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG00268	0.0	0.0	0.039	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG00419	0.462	0.462	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG00759	0.395	0.395	0.003	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG01051	0.412	0.412	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG01112	0.0	0.0	0.05	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG01500	0.0	0.0	0.128	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG01565	0.391	0.391	0.011	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG01583	0.0	0.0	0.018	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG01595	0.52	0.52	0.005	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG01879	0.596	0.596	0.015	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG02568	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG02922	0.779	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG03006	0.0	0.0	0.038	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG03052	0.0	0.0	0.044	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	HG03742	0.0	0.0	0.087	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA12878	0.0	0.0	0.135	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA18525	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA18939	0.434	0.434	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA19017	0.563	0.563	0.016	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA19238	0.457	0.457	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA19239	0.0	0.0	0.202	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA19625	0.435	0.435	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA19648	0.638	0.638	0.014	0.0	nan	nan	0	1
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA20502	0.0	0.0	0.059	0.0	nan	nan	0	0
chr20	15711606	15712437	DEL	832	NA20845	0.501	0.501	0.007	0.0	nan	nan	0	1
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG00096	1.124	1.124	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG00268	0.6	0.6	0.0	0.042	0.405	0.405	1	1
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG00419	1.034	1.034	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG00759	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG01051	1.487	1.487	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG01112	1.369	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG01500	1.392	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG01565	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG01583	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG01595	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG01879	0.397	0.397	0.0	0.029	0.292	0.292	1	1
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG02568	0.238	0.238	0.0	0.07	0.889	0.889	1	1
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG02922	1.168	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG03006	0.398	0.398	0.0	0.057	0.654	0.654	1	1
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG03052	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG03642	1.246	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	HG03742	1.19	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA12878	0.372	0.372	0.007	0.048	0.615	0.615	1	1
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA18525	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA18939	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA19017	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA19238	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA19239	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA19625	1.17	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA19648	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA20502	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16040301	16040395	DEL	95	NA20845	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG00096	0.868	0.914	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG00268	0.806	0.849	0.0	0.007	0.95	0.95	2	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG00419	0.946	0.996	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG00759	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG01051	0.915	0.963	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG01112	0.715	0.753	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG01500	0.902	0.949	0.0	0.0	0.72	0.686	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG01565	0.944	0.994	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG01583	0.902	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG01595	0.813	0.856	0.0	0.0	0.385	0.385	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG01879	0.894	0.941	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG02568	0.911	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG02922	1.054	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG03006	1.173	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG03052	1.034	1.089	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG03642	0.813	0.855	0.0	0.0	0.625	0.625	2	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	HG03742	0.931	0.98	0.0	0.004	0.778	0.778	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA12878	0.815	0.857	0.005	0.0	0.934	0.934	2	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA18525	0.955	1.005	0.007	0.013	0.952	0.911	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA18939	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA19017	1.126	1.185	0.0	0.011	0.6	0.632	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA19238	1.027	1.081	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA19239	0.959	1.009	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA19625	1.034	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA19648	0.665	0.7	0.024	0.0	0.264	0.264	2	1
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA20502	0.73	0.768	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr20	16221787	16222333	DEL	547	NA20845	0.955	1.005	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG00096	0.671	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG00268	0.919	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG00419	0.748	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG00759	0.669	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG01051	0.709	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG01112	0.756	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG01500	1.0	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG01565	0.576	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG01583	0.722	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG01595	0.745	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG01879	0.855	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG02568	1.346	1.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG02922	0.825	0.994	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG03052	0.896	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG03642	1.165	1.403	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	HG03742	0.931	1.121	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA12878	0.832	1.003	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA18939	0.749	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA19017	0.663	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA19238	0.685	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA19239	0.888	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA19625	1.007	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA19648	0.745	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA20502	0.803	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17624675	17624730	DUP	56	NA20845	0.764	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG00096	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG00268	0.806	0.849	0.0	0.002	0.905	0.905	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG00419	0.924	0.973	0.0	0.002	0.842	0.842	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG00759	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG01051	0.801	0.843	0.0	0.008	0.923	0.989	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG01112	0.858	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG01500	0.941	0.991	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG01565	0.714	0.751	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG01583	0.954	1.004	0.0	0.0	0.692	0.755	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG01595	0.836	0.88	0.0	0.0	0.417	0.417	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG01879	0.815	0.858	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG02568	0.831	0.875	0.0	0.0	0.917	0.917	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG02922	0.939	0.989	0.0	0.005	0.688	0.688	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG03006	0.984	1.036	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG03052	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG03642	0.84	0.884	0.0	0.0	0.312	0.313	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	HG03742	0.736	0.775	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA12878	1.204	1.268	0.0	0.0	0.732	0.732	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA18525	0.863	0.909	0.0	0.0	0.75	0.717	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA18939	0.887	0.934	0.0	0.0	0.542	0.569	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA19017	0.804	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA19238	0.471	0.496	0.008	0.112	nan	nan	0	1
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA19239	0.691	0.727	0.0	0.0	0.88	0.909	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA19625	1.17	1.232	0.0	0.0	0.529	0.529	2	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA19648	0.957	1.008	0.0	0.0	0.938	0.938	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA20502	1.046	1.101	0.0	0.0	0.654	0.654	3	2
chr20	17824861	17825352	DEL	492	NA20845	0.74	0.779	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG00096	1.065	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG00268	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG00759	1.228	1.365	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG01051	1.075	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG01112	1.369	1.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG01500	1.078	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG01565	0.898	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG01583	1.173	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG01879	1.172	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG02568	1.227	1.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG02922	1.214	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG03006	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG03052	1.218	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG03642	1.083	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	HG03742	1.126	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA12878	0.885	0.984	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA19017	1.025	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA19238	1.013	1.126	0.0	0.0	0.775	0.75	1	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA19239	1.227	1.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA19625	1.388	1.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA19648	0.904	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA20502	1.289	1.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	20657064	20657135	DUP	72	NA20845	1.432	1.591	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG00096	0.848	0.942	0.0	0.0	0.571	0.6	3	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG00268	0.713	0.792	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG00419	0.792	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG00759	0.57	0.634	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG01051	0.846	0.94	0.0	0.0	0.955	0.891	2	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG01112	0.613	0.681	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG01500	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG01565	0.737	0.818	0.0	0.0	0.669	0.669	2	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG01583	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG01595	0.858	0.954	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG01879	0.775	0.861	0.007	0.0	0.65	0.65	3	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG02568	0.238	0.264	0.109	0.07	nan	nan	0	1
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG02922	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG03006	0.775	0.861	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG03052	0.598	0.664	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG03642	0.785	0.873	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	HG03742	0.758	0.842	0.0	0.0	0.774	0.774	2	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA12878	0.921	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA18525	0.955	1.061	0.0	0.0	0.708	0.678	1	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA18939	0.651	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA19017	0.945	1.05	0.0	0.0	0.882	0.929	1	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA19238	0.828	0.919	0.0	0.0	0.588	0.569	3	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA19239	0.804	0.893	0.0	0.0	0.96	0.992	1	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA19625	1.007	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA19648	0.718	0.798	0.0	0.0	0.633	0.633	2	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA20502	0.705	0.784	0.0	0.0	0.529	0.529	1	2
chr20	2241052	2241648	DEL	597	NA20845	0.979	1.087	0.0	0.0	0.917	0.917	5	2
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG00096	0.276	0.307	0.009	0.05	nan	nan	0	1
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG00268	0.45	0.5	0.01	0.038	nan	nan	0	1
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG00419	0.0	0.0	0.014	0.14	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG01112	0.0	0.0	0.028	0.062	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG01500	0.0	0.0	0.024	0.098	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG01565	0.414	0.46	0.013	0.025	nan	nan	0	1
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG01583	0.593	0.659	0.0	0.061	nan	nan	0	2
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG01879	0.0	0.0	0.024	0.074	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG02568	0.594	0.66	0.0	0.028	nan	nan	0	2
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG02922	0.0	0.0	0.012	0.104	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG03006	0.0	0.0	0.009	0.099	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG03642	0.0	0.0	0.015	0.071	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA18525	0.0	0.0	0.01	0.112	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA18939	0.0	0.0	0.013	0.146	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA19017	0.0	0.0	0.061	0.102	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA19238	0.0	0.0	0.015	0.154	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA19239	0.0	0.0	0.011	0.12	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA19625	0.0	0.0	0.013	0.134	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA19648	0.0	0.0	0.024	0.143	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA20502	0.0	0.0	0.035	0.154	nan	nan	0	0
chr20	23103317	23103618	DEL	302	NA20845	0.0	0.0	0.012	0.114	nan	nan	0	0
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG00096	0.927	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG00268	1.144	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG00419	0.77	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG00759	1.425	1.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG01051	0.732	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG01112	0.368	0.423	0.0	0.016	0.933	0.933	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG01500	0.804	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG01565	0.898	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG01583	0.258	0.296	0.0	0.006	0.75	0.818	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG01595	0.858	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG01879	0.457	0.525	0.0	0.007	0.346	0.346	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG02568	0.911	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG02922	0.504	0.579	0.0	0.022	0.458	0.458	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG03006	0.517	0.594	0.0	0.022	0.5	0.5	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG03052	0.919	1.057	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG03642	0.758	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	HG03742	0.455	0.522	0.0	0.03	0.591	0.591	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA12878	1.08	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA18525	0.937	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA18939	1.183	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA19017	0.382	0.439	0.0	0.008	0.889	0.936	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA19238	0.556	0.64	0.0	0.025	0.65	0.672	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA19239	0.367	0.421	0.0	0.017	0.694	0.672	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA19625	0.925	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA19648	1.064	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA20502	0.243	0.28	0.0	0.0	0.875	0.875	1	1
chr20	23221077	23221133	DEL	57	NA20845	0.907	1.042	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG00096	0.828	0.92	0.026	0.048	1.0	0.952	1	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG00268	0.675	0.75	0.028	0.052	nan	nan	0	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG00419	0.88	0.978	0.046	0.056	0.5	0.5	2	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG00759	0.877	0.975	0.056	0.064	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG01051	0.64	0.712	0.027	0.055	0.375	0.35	1	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG01112	0.654	0.726	0.041	0.044	1.0	1.0	2	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG01500	0.745	0.828	0.082	0.116	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG01565	0.76	0.844	0.044	0.079	0.727	0.727	1	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG01583	0.825	0.917	0.044	0.1	nan	nan	0	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG01595	0.768	0.853	0.043	0.095	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG01879	0.735	0.817	0.045	0.136	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG02568	0.475	0.528	0.08	0.128	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG02922	0.664	0.738	0.026	0.092	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG03006	0.775	0.861	0.097	0.115	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG03052	0.758	0.843	0.008	0.0	0.806	0.806	4	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG03642	0.758	0.843	0.06	0.082	0.85	0.85	2	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	HG03742	0.628	0.697	0.039	0.048	0.717	0.717	2	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA12878	0.797	0.885	0.018	0.047	0.816	0.816	2	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA18525	0.882	0.98	0.035	0.058	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA18939	0.808	0.898	0.026	0.043	nan	nan	0	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA19017	0.885	0.983	0.069	0.111	nan	nan	0	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA19238	0.713	0.793	0.022	0.064	0.947	0.917	1	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA19239	0.832	0.924	0.039	0.057	0.607	0.612	3	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA19625	0.844	0.937	0.0	0.0	0.578	0.578	2	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA19648	0.771	0.857	0.068	0.072	0.571	0.571	2	1
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA20502	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2359923	2360518	DEL	596	NA20845	0.668	0.743	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG00096	0.671	0.706	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG00268	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG00419	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG00759	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG01051	0.686	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG01112	0.858	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG01500	0.823	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG01565	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG01583	0.722	0.76	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG01595	0.858	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG01879	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG02568	0.911	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG02922	0.687	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG03006	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG03052	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG03642	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	HG03742	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA12878	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA18525	0.955	1.005	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA18939	0.473	0.498	0.056	0.036	nan	nan	0	1
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA19017	0.925	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA19238	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA19239	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA19625	0.707	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA19648	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA20502	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	24456781	24457651	DEL	871	NA20845	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG00096	0.611	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG00268	0.225	0.25	0.0	0.083	0.455	0.455	2	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG00419	0.374	0.416	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG00759	0.263	0.292	0.0	0.086	1.0	1.0	2	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG01051	0.389	0.432	0.0	0.0	0.857	0.8	1	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG01112	0.47	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG01500	0.765	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG01565	0.737	0.818	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG01583	0.232	0.258	0.0	0.049	0.889	0.97	2	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG01595	0.158	0.176	0.0	0.088	0.667	0.667	2	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG01879	0.179	0.199	0.0	0.087	0.933	0.933	2	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG02568	0.356	0.396	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG02922	0.206	0.229	0.0	0.068	0.75	0.75	2	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG03006	0.378	0.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG03052	0.322	0.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG03642	0.244	0.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	HG03742	0.433	0.481	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA12878	0.549	0.61	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA18525	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA18939	0.493	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA19017	0.442	0.491	0.0	0.17	nan	nan	0	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA19238	0.271	0.301	0.0	0.069	0.75	0.726	2	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA19625	0.218	0.242	0.0	0.081	0.8	0.8	2	1
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA19648	0.452	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA20502	0.365	0.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	2514975	2515089	DEL	115	NA20845	0.692	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG00096	0.69	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG00268	0.788	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG00419	0.814	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG00759	0.263	0.317	0.0	0.019	0.933	0.933	1	1
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG01051	0.686	0.827	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG01112	0.654	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG01500	0.725	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG01565	0.921	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG01583	0.954	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG01595	0.723	0.871	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG01879	0.835	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG02568	1.108	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG02922	0.641	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG03006	0.577	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG03052	0.621	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG03642	0.758	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	HG03742	0.801	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA12878	0.903	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA18525	0.771	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA18939	0.572	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA19017	1.206	1.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA19238	0.685	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA19239	0.987	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA19625	1.116	1.344	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA19648	1.303	1.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA20502	0.924	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	30818914	30818980	DEL	67	NA20845	0.74	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG00096	0.828	0.92	0.0	0.0	0.591	0.563	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG00268	0.844	0.938	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG00419	0.88	0.978	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG00759	0.965	1.072	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG01051	0.892	0.991	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG01112	0.981	1.09	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG01500	0.961	1.067	0.0	0.0	0.72	0.686	3	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG01565	1.335	1.484	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG01583	0.773	0.859	0.0	0.0	0.607	0.619	2	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG01595	0.768	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG01879	0.696	0.773	0.0	0.002	0.824	0.824	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG02568	0.831	0.924	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG02922	1.054	1.171	0.0	0.002	0.786	0.786	3	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG03006	0.974	1.082	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG03052	0.942	1.047	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG03642	0.785	0.873	0.0	0.0	0.679	0.679	4	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	HG03742	0.693	0.77	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA12878	0.832	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA18525	0.974	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA18939	0.887	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA19017	0.764	0.849	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA19238	0.899	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA19239	0.874	0.971	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA19625	1.143	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA19648	0.878	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA20502	1.07	1.189	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr20	3084808	3085411	DEL	604	NA20845	0.979	1.087	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG00096	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG00268	1.125	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG00419	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG00759	0.746	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG01051	0.961	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG01112	0.572	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG01500	0.843	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG01565	0.852	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG01583	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG01595	0.723	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG01879	1.073	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG02568	0.831	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG02922	0.481	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG03006	0.656	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG03052	1.011	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG03642	0.867	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	HG03742	0.628	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA12878	0.832	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA18525	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA18939	0.611	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA19017	0.362	0.402	0.0	0.029	0.864	0.82	1	1
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA19238	0.813	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA19239	0.296	0.329	0.0	0.018	0.885	0.914	1	1
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA19625	0.98	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA19648	0.878	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA20502	0.815	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	31082723	31082778	DEL	56	NA20845	0.716	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG00096	0.828	0.828	0.0	0.0	0.593	0.585	2	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG00268	0.956	0.956	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG00419	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG00759	0.746	0.746	0.0	0.0	0.565	0.565	5	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG01051	0.709	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG01112	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG01500	0.725	0.725	0.089	0.025	nan	nan	0	1
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG01565	0.944	0.944	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG01583	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG01595	0.949	0.949	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG01879	0.934	0.934	0.0	0.0	0.77	0.77	2	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG02568	1.108	1.108	0.0	0.0	0.962	0.962	2	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG02922	1.008	1.008	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG03006	1.113	1.113	0.0	0.0	0.933	0.933	4	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG03052	0.827	0.827	0.0	0.0	0.636	0.636	3	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG03642	0.948	0.948	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	HG03742	0.519	0.519	0.09	0.051	nan	nan	0	1
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA12878	0.921	0.921	0.0	0.0	0.892	0.892	2	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA18525	1.157	1.157	0.0	0.0	0.737	0.77	1	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA18939	0.808	0.808	0.0	0.0	0.7	0.735	1	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA19017	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA19238	0.842	0.842	0.0	0.0	0.917	0.887	1	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA19239	0.592	0.592	0.117	0.041	nan	nan	0	1
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA19625	0.816	0.816	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA19648	1.117	1.117	0.0	0.0	0.69	0.69	4	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA20502	0.778	0.778	0.0	0.0	0.595	0.595	4	2
chr20	33716065	33716813	DEL	749	NA20845	1.193	1.193	0.005	0.0	0.684	0.684	1	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG00096	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG00268	0.825	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG00419	0.594	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG00759	0.724	0.804	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG01051	0.503	0.559	0.0	0.0	0.774	0.775	2	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG01112	0.613	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG01500	0.49	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG01565	0.368	0.409	0.07	0.003	1.0	1.0	13	1
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG01583	0.696	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG01595	0.723	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG01879	0.556	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG02568	0.594	0.66	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG02922	0.298	0.331	0.087	0.0	0.465	0.465	2	1
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG03006	0.557	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG03052	0.781	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG03642	0.515	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	HG03742	0.563	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA12878	0.761	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA18525	0.569	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA18939	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA19017	0.623	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA19238	0.585	0.65	0.003	0.0	0.952	0.922	1	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA19239	0.592	0.658	0.003	0.0	0.769	0.744	1	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA19625	0.68	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA19648	0.824	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA20502	0.705	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	36115828	36116779	DEL	952	NA20845	0.525	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG00096	0.602	0.668	0.0	0.0	0.714	0.68	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG00268	0.694	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG00419	0.638	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG00759	0.57	0.634	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG01051	0.618	0.686	0.0	0.0	0.4	0.373	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG01112	0.592	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG01500	0.49	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG01565	0.529	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG01583	0.696	0.773	0.0	0.0	0.562	0.516	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG01595	0.632	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG01879	0.517	0.574	0.0	0.006	0.636	0.636	2	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG02568	0.752	0.836	0.0	0.005	0.6	0.6	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG02922	0.573	0.636	0.0	0.023	0.375	0.375	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG03006	0.577	0.641	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG03052	0.735	0.817	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG03642	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	HG03742	0.606	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA12878	0.443	0.492	0.038	0.033	nan	nan	0	1
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA18525	0.239	0.265	0.076	0.03	nan	nan	0	1
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA18939	0.375	0.416	0.057	0.031	nan	nan	0	1
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA19017	0.663	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA19238	0.613	0.682	0.0	0.0	0.588	0.608	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA19239	0.649	0.721	0.0	0.0	0.562	0.58	2	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA19625	0.762	0.847	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA19648	0.718	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA20502	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37055110	37055815	DEL	706	NA20845	0.644	0.716	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG00096	1.006	1.059	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG00268	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG00419	0.858	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG00759	1.075	1.131	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG01051	0.572	0.602	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG01112	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG01500	1.108	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG01565	1.289	1.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG01583	1.392	1.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG01595	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG01879	0.308	0.324	0.0	0.015	0.714	0.714	3	1
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG02568	0.633	0.667	0.0	0.017	0.733	0.733	3	1
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG03006	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG03052	0.919	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG03642	1.111	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	HG03742	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA12878	0.992	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA18525	1.12	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA18939	0.927	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA19017	0.784	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA19238	0.628	0.661	0.0	0.006	0.689	0.712	3	1
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA19239	1.184	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA19625	0.503	0.53	0.0	0.005	0.5	0.5	3	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA19648	1.223	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA20502	1.167	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	37119293	37119369	DEL	77	NA20845	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG00096	0.158	0.153	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG00268	0.281	0.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG00419	0.462	0.449	0.0	0.179	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG00759	0.395	0.383	0.0	0.126	0.619	0.619	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG01051	0.206	0.2	0.0	0.106	0.786	0.733	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG01500	0.196	0.19	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG01565	0.529	0.514	0.0	0.148	nan	nan	0	0
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG01583	0.155	0.15	0.0	0.051	0.5	0.458	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG01879	0.06	0.058	0.0	0.088	0.143	0.143	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG02568	0.554	0.538	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.196	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG03006	0.239	0.232	0.0	0.116	0.85	0.85	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG03052	0.253	0.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG03642	0.135	0.131	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	HG03742	0.303	0.294	0.0	0.121	0.812	0.812	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA12878	0.159	0.155	0.0	0.084	0.571	0.571	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA18525	0.257	0.25	0.0	0.107	0.783	0.749	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA18939	0.158	0.153	0.0	0.099	0.8	0.84	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA19017	0.593	0.576	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA19238	0.157	0.152	0.0	0.115	0.25	0.242	2	2
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.193	nan	nan	0	0
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.185	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA19648	0.106	0.103	0.0	0.058	0.625	0.625	2	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA20502	0.219	0.212	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr20	38337632	38337769	DEL	138	NA20845	0.167	0.162	0.0	0.073	1.0	1.0	2	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG00096	1.243	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG00268	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG00419	0.968	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG00759	1.031	1.001	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG01051	1.487	1.443	0.0	0.0	0.676	0.725	1	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG01112	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG01500	1.078	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG01565	1.22	1.185	0.0	0.0	0.741	0.741	1	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG01583	1.031	1.001	0.0	0.0	0.588	0.539	1	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG01595	0.949	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG01879	1.351	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG02568	1.108	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG02922	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG03006	1.014	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG03052	1.218	1.183	0.0	0.0	0.654	0.654	1	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG03642	1.192	1.157	0.0	0.0	0.789	0.789	1	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	HG03742	1.277	1.24	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA12878	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA18525	1.176	1.141	0.0	0.0	0.636	0.609	1	2
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA18939	1.124	1.091	0.0	0.003	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA19017	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA19238	1.156	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA19239	1.072	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA19625	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA19648	1.011	0.981	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA20502	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	38513081	38513177	DEL	97	NA20845	1.217	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG00096	0.611	0.644	0.0	0.0	0.75	0.788	1	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG00268	0.263	0.276	0.0	0.071	nan	nan	0	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG00419	0.352	0.371	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG00759	0.702	0.739	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG01051	0.503	0.53	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG01500	0.784	0.825	0.0	0.0	0.727	0.764	1	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG01565	0.622	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG01595	0.632	0.666	0.0	0.007	0.615	0.615	1	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	HG03006	0.636	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	NA12878	0.602	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	NA18939	0.513	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	40943730	40943867	DUP	138	NA20845	0.573	0.603	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG00096	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG00268	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG00419	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG00759	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG01051	1.464	1.464	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG01112	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG01500	1.451	1.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG01565	0.852	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG01583	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG01595	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG01879	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG02568	1.346	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG02922	1.1	1.1	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG03006	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG03052	1.241	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG03642	1.733	1.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	HG03742	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA12878	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA18525	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA18939	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA19017	0.422	0.422	0.0	0.025	0.76	0.8	1	1
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA19238	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA19239	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA19625	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA19648	1.303	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA20502	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41516894	41516975	DEL	82	NA20845	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG00096	0.966	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG00268	0.713	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG00419	0.77	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG00759	0.68	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG01051	0.823	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG01112	1.001	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG01500	1.117	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG01565	0.322	0.37	0.011	0.04	nan	nan	0	1
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG01583	0.98	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG01595	0.768	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG01879	0.855	0.982	0.0	0.0	0.64	0.64	1	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG02568	1.108	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG02922	0.939	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG03006	0.736	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG03052	0.873	1.004	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG03642	0.934	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	HG03742	0.823	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA12878	0.407	0.468	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA18525	1.139	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA18939	0.473	0.544	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA19017	0.864	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA19238	0.699	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA19239	0.959	1.102	0.0	0.0	0.811	0.785	1	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA19625	0.98	1.126	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA19648	0.904	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA20502	1.094	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	41791262	41791447	DEL	186	NA20845	0.573	0.658	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG00096	0.533	0.592	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.246	nan	nan	0	0
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG00419	0.308	0.342	0.0	0.059	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG01051	0.366	0.407	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG01112	0.347	0.386	0.0	0.088	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.223	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG01583	0.438	0.487	0.009	0.028	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG01595	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG01879	1.014	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG02568	0.317	0.352	0.0	0.017	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG02922	0.664	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG03006	0.398	0.442	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG03052	0.483	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG03642	0.339	0.376	0.0	0.013	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA12878	0.425	0.472	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA18525	0.386	0.429	0.0	0.121	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA18939	0.306	0.34	0.0	0.13	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.204	nan	nan	0	0
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA19239	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA19625	0.912	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA20502	0.413	0.459	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr20	44359412	44359524	DEL	113	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG00096	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG00268	0.3	0.333	0.082	0.006	0.3	0.3	13	1
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG00419	0.286	0.318	0.035	0.0	nan	nan	0	1
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG00759	0.219	0.244	0.081	0.0	0.402	0.402	8	1
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG01051	0.64	0.712	0.0	0.004	0.944	0.883	6	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG01112	0.633	0.704	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG01500	0.843	0.937	0.0	0.0	0.774	0.778	4	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG01565	0.668	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG01583	0.722	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG01595	0.407	0.452	0.032	0.0	0.625	0.625	10	1
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG01879	0.477	0.53	0.0	0.0	0.411	0.411	6	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG02568	0.475	0.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG02922	0.825	0.916	0.0	0.0	0.643	0.643	4	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG03006	0.378	0.42	0.092	0.008	0.7	0.7	9	1
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG03052	0.598	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG03642	0.569	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	HG03742	0.693	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA12878	0.691	0.767	0.0	0.0	0.727	0.727	4	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA18525	0.661	0.735	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA18939	0.631	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA19017	0.744	0.827	0.007	0.0	0.683	0.656	4	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA19238	0.728	0.808	0.0	0.0	0.533	0.516	5	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA19239	0.818	0.909	0.0	0.0	0.7	0.699	3	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA19625	0.354	0.393	0.0	0.0	0.833	0.833	4	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA19648	0.585	0.65	0.0	0.0	0.967	0.967	2	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA20502	0.511	0.567	0.0	0.0	0.67	0.67	4	2
chr20	4807411	4808147	DEL	737	NA20845	0.668	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG00096	1.065	1.121	0.004	0.0	0.677	0.645	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG00268	1.107	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG00419	0.858	0.903	0.0	0.0	0.481	0.481	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG00759	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG01051	0.823	0.867	0.0	0.0	0.929	0.867	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG01112	0.981	1.032	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG01500	1.137	1.197	0.0	0.0	0.53	0.505	2	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG01565	0.898	0.945	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG01583	0.877	0.923	0.0	0.0	0.846	0.851	3	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG01595	1.197	1.26	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG01879	1.172	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG02568	1.346	1.417	0.0	0.0	0.583	0.583	2	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG02922	1.145	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG03006	0.994	1.046	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG03052	1.172	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG03642	0.813	0.855	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	HG03742	0.996	1.048	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA12878	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA18525	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA18939	1.163	1.224	0.0	0.0	0.844	0.804	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA19017	1.045	1.1	0.0	0.0	0.824	0.867	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA19238	1.113	1.171	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA19239	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA19625	0.544	0.573	0.067	0.011	nan	nan	0	1
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA19648	0.824	0.868	0.0	0.0	0.867	0.867	2	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA20502	1.216	1.28	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr20	48403992	48404614	DEL	623	NA20845	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	HG01879	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	HG02568	0.99	1.042	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	HG02922	1.054	1.109	0.0	0.004	0.833	0.833	1	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	HG03052	0.919	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	HG03742	0.671	0.706	0.0	0.0	0.712	0.712	2	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	NA19017	0.583	0.614	0.0	0.0	0.842	0.886	1	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	NA19238	1.284	1.352	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	NA19239	1.17	1.232	0.0	0.0	0.75	0.726	1	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	NA19625	1.224	1.289	0.0	0.0	0.409	0.409	1	2
chr20	48543735	48543815	DUP	81	NA19648	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG00096	1.124	1.092	0.0	0.0	0.909	0.955	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG00268	0.919	0.892	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG00419	1.012	0.983	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG00759	0.833	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG01051	0.778	0.755	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG01112	0.96	0.932	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG01500	0.647	0.628	0.0	0.0	0.625	0.656	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG01565	1.427	1.386	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG01583	1.16	1.126	0.0	0.0	0.471	0.513	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG01595	1.175	1.14	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG01879	1.073	1.042	0.0	0.004	0.5	0.5	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG02568	1.306	1.268	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG02922	0.733	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG03006	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG03052	0.506	0.491	0.0	0.105	0.663	0.663	2	1
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG03642	0.785	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	HG03742	0.801	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA12878	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA18525	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA18939	1.025	0.995	0.0	0.0	0.731	0.696	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA19017	1.045	1.015	0.0	0.0	0.957	0.993	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA19238	0.371	0.36	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA19239	1.128	1.095	0.0	0.003	0.917	0.887	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA19625	0.49	0.476	0.009	0.057	0.749	0.749	2	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA19648	0.931	0.904	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA20502	1.483	1.44	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr20	48734342	48734452	DEL	111	NA20845	0.811	0.788	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG00096	0.533	0.561	0.0	0.0	0.79	0.788	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG00268	0.488	0.513	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG00419	0.418	0.44	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG00759	0.57	0.6	0.0	0.0	0.622	0.622	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG01051	0.435	0.457	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG01112	0.552	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG01500	0.647	0.681	0.0	0.002	0.8	0.762	1	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG01565	0.576	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG01583	0.541	0.57	0.0	0.0	0.396	0.363	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG01595	0.61	0.642	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG01879	0.537	0.565	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG02568	0.475	0.5	0.0	0.0	0.5	0.5	5	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG02922	0.481	0.506	0.0	0.0	0.712	0.712	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG03006	0.557	0.586	0.0	0.0	0.712	0.712	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG03052	0.345	0.363	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG03642	0.325	0.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	HG03742	0.519	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA12878	0.638	0.671	0.0	0.0	0.854	0.854	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA18525	0.735	0.773	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA18939	0.493	0.519	0.0	0.0	0.637	0.648	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA19017	0.583	0.614	0.004	0.0	0.6	0.57	3	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA19238	0.613	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA19239	0.324	0.341	0.086	0.015	nan	nan	0	1
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA19625	0.463	0.487	0.0	0.0	0.675	0.675	2	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA19648	0.319	0.336	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA20502	0.438	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	50654651	50655493	DEL	843	NA20845	0.621	0.653	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG00096	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG00268	0.9	0.948	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG00419	1.254	1.32	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG00759	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG01051	0.618	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG01112	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG01500	1.157	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG01565	0.944	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG01583	0.464	0.488	0.0	0.033	0.889	0.883	2	1
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG01595	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG01879	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG02568	0.475	0.5	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG02922	0.435	0.458	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG03006	1.133	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG03052	0.781	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG03642	0.596	0.627	0.0	0.026	0.446	0.446	2	1
chr20	54213954	54214087	DEL	134	HG03742	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA12878	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA18525	0.918	0.967	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA18939	0.828	0.872	0.0	0.0	0.895	0.939	1	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA19017	0.422	0.444	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA19238	0.029	0.03	0.0	0.134	nan	nan	0	1
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA19239	1.128	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA19625	0.735	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA19648	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA20502	0.961	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54213954	54214087	DEL	134	NA20845	1.026	1.08	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG00096	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG00268	0.956	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG00419	1.364	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG00759	0.833	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG01051	0.915	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG01112	0.0	0.0	0.009	0.179	nan	nan	0	1
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG01500	0.921	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG01565	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG01583	0.67	0.651	0.0	0.073	0.304	0.332	1	1
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG01595	0.791	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG01879	0.457	0.444	0.0	0.079	0.346	0.346	1	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG02568	1.188	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG02922	0.733	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG03006	0.378	0.367	0.0	0.034	0.619	0.619	1	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG03052	0.552	0.536	0.0	0.067	0.414	0.414	1	1
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG03642	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	HG03742	0.909	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA12878	0.974	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA18525	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA18939	0.749	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA19017	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA19238	0.528	0.513	0.0	0.098	0.65	0.672	1	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA19239	0.818	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA19625	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA19648	0.824	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA20502	0.559	0.543	0.0	0.081	0.7	0.7	1	2
chr20	54940961	54941059	DEL	99	NA20845	1.36	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG00096	0.473	0.46	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG00268	0.769	0.747	0.0	0.0	0.381	0.381	1	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG00419	0.506	0.491	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG00759	0.636	0.617	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG01051	0.16	0.155	0.0	0.021	0.625	0.583	1	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG01112	0.245	0.238	0.0	0.043	0.605	0.605	2	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG01500	0.51	0.495	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG01565	0.46	0.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG01583	0.335	0.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG01595	0.271	0.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG01879	0.199	0.193	0.0	0.022	0.929	0.929	1	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG02568	0.277	0.269	0.0	0.011	0.8	0.8	1	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG02922	0.321	0.311	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG03006	0.139	0.135	0.0	0.03	0.706	0.706	1	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG03052	0.414	0.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG03642	0.271	0.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	HG03742	0.238	0.231	0.0	0.033	0.615	0.615	3	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA12878	0.496	0.481	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA18525	0.68	0.66	0.0	0.0	1.0	0.957	1	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA18939	0.237	0.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA19017	0.181	0.176	0.0	0.046	0.583	0.554	1	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA19238	0.271	0.263	0.0	0.039	0.259	0.251	1	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA19239	0.768	0.746	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA19625	0.218	0.211	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA19648	0.319	0.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA20502	0.17	0.165	0.0	0.025	0.923	0.923	1	1
chr20	55148174	55148243	DEL	70	NA20845	0.442	0.429	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG00096	0.572	0.636	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG00268	1.032	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG00419	0.0	0.0	0.094	0.214	nan	nan	0	0
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG00759	0.439	0.487	0.045	0.094	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG01051	0.366	0.407	0.023	0.07	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG01112	0.613	0.681	0.011	0.06	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG01500	0.608	0.675	0.007	0.084	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG01565	1.22	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG01583	0.902	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG01595	0.542	0.602	0.009	0.089	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG01879	0.517	0.574	0.006	0.107	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG02568	0.831	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG02922	0.916	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG03006	0.636	0.707	0.03	0.056	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG03052	0.575	0.638	0.022	0.081	0.268	0.268	2	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG03642	0.921	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	HG03742	0.0	0.0	0.062	0.205	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA12878	0.939	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA18525	0.459	0.51	0.011	0.077	0.636	0.665	1	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA18939	0.453	0.504	0.037	0.081	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA19017	0.563	0.625	0.013	0.068	0.24	0.253	1	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA19238	0.471	0.523	0.003	0.098	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA19239	0.508	0.564	0.006	0.059	nan	nan	0	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA19625	0.898	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA19648	0.638	0.709	0.022	0.043	0.2	0.2	2	1
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA20502	1.119	1.243	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chr20	5534545	5534921	DEL	377	NA20845	0.0	0.0	0.065	0.187	nan	nan	0	0
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG00096	0.0	0.0	0.093	0.125	nan	nan	0	0
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG00268	1.069	1.125	0.0	0.0	0.952	0.952	2	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG00419	0.858	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG00759	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG01051	0.732	0.77	0.0	0.006	0.739	0.74	2	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG01112	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG01500	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG01565	0.437	0.46	0.095	0.042	nan	nan	0	1
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG01583	0.541	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG01595	0.745	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG01879	0.735	0.774	0.0	0.0	0.549	0.549	2	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG02568	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG02922	0.871	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG03006	0.437	0.46	0.06	0.037	nan	nan	0	1
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG03052	0.0	0.0	0.087	0.133	nan	nan	0	0
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG03642	0.921	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	HG03742	0.909	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA12878	0.885	0.932	0.0	0.0	0.791	0.791	2	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA18525	0.79	0.831	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA18939	0.907	0.955	0.0	0.0	0.63	0.6	2	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA19017	0.824	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA19238	0.842	0.886	0.0	0.0	0.733	0.71	1	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA19239	0.931	0.98	0.0	0.0	0.74	0.765	2	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA19625	0.354	0.372	0.025	0.046	nan	nan	0	1
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA19648	0.824	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA20502	0.851	0.896	0.0	0.0	0.673	0.673	2	2
chr20	55587403	55587945	DEL	543	NA20845	0.979	1.03	0.0	0.007	0.571	0.571	3	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG00096	0.848	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG00268	0.938	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG00419	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG00759	1.075	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG01051	0.503	0.489	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG01112	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG01500	1.137	1.104	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG01565	0.691	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG01583	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG01595	0.858	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG01879	0.378	0.367	0.015	0.056	nan	nan	0	1
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG02568	0.475	0.461	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG02922	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG03006	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG03052	0.437	0.424	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG03642	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	HG03742	0.779	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA12878	0.832	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA18525	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA18939	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA19017	0.643	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA19238	0.514	0.499	0.0	0.063	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA19239	1.015	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA19625	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA19648	0.771	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA20502	0.34	0.331	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr20	55605486	55605751	DEL	266	NA20845	1.122	1.089	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG00096	0.769	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG00268	0.994	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG00419	0.99	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG00759	0.746	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG01051	0.686	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG01112	0.633	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG01500	0.765	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG01565	0.668	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG01583	0.309	0.356	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG01595	0.565	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG01879	0.477	0.548	0.0	0.061	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG02568	0.475	0.546	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	0
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG03006	0.696	0.8	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG03052	0.299	0.343	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG03642	0.813	0.934	0.0	0.006	0.357	0.357	1	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	HG03742	0.346	0.398	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA12878	0.868	0.997	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA18525	0.827	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA18939	0.453	0.521	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA19017	0.442	0.508	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA19238	0.656	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA19239	1.001	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA19625	0.599	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA19648	0.372	0.428	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA20502	0.827	0.95	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr20	58882200	58882326	DEL	127	NA20845	0.764	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr20	594427	594481	DEL	55	HG00268	1.294	1.487	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG00419	0.88	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG00759	0.921	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG01051	0.961	1.104	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr20	594427	594481	DEL	55	HG01500	0.902	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG01565	0.829	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG01583	0.825	0.948	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG01595	1.107	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG01879	0.537	0.617	0.0	0.028	0.519	0.519	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	HG02568	1.227	1.411	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG02922	0.046	0.053	0.0	0.063	0.05	0.05	1	0
chr20	594427	594481	DEL	55	HG03006	0.676	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	HG03052	0.46	0.528	0.0	0.063	0.762	0.762	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	HG03642	0.488	0.56	0.008	0.044	0.733	0.733	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	HG03742	0.736	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	NA12878	0.514	0.59	0.0	0.033	0.846	0.846	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	NA18525	0.937	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	NA18939	0.848	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	NA19017	0.462	0.531	0.0	0.027	0.731	0.769	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	NA19238	0.371	0.426	0.0	0.035	0.824	0.797	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	NA19239	0.973	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	594427	594481	DEL	55	NA19625	0.68	0.782	0.0	0.033	0.583	0.583	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	NA19648	0.452	0.52	0.0	0.012	0.895	0.895	1	1
chr20	594427	594481	DEL	55	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	0
chr20	594427	594481	DEL	55	NA20845	0.716	0.823	0.0	0.052	0.529	0.529	1	1
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG00096	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG00268	1.088	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG00419	0.902	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG00759	1.162	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG01051	0.32	0.337	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG01112	0.797	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG01500	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG01565	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG01583	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG01595	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG01879	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG02568	0.752	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG02922	1.077	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG03006	0.954	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG03052	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG03642	0.596	0.627	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	HG03742	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA12878	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA18525	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA18939	0.927	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA19017	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA19238	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA19239	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA19625	1.061	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA19648	0.585	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA20502	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	60080676	60081006	DEL	331	NA20845	0.788	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG00096	0.671	0.808	0.0	0.0	0.692	0.659	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG00268	0.338	0.407	0.077	0.051	nan	nan	0	1
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG00419	0.77	0.928	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG00759	0.263	0.317	0.118	0.063	nan	nan	0	1
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG01051	0.229	0.276	0.084	0.056	nan	nan	0	1
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG01112	0.511	0.615	0.0	0.0	0.95	0.95	2	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG01500	0.627	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG01565	0.253	0.305	0.087	0.072	nan	nan	0	1
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG01583	0.541	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG01595	0.52	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG01879	0.576	0.694	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG02568	0.356	0.429	0.062	0.043	nan	nan	0	1
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG02922	0.573	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG03006	0.596	0.719	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG03052	0.529	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG03642	0.65	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	HG03742	0.584	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA12878	0.478	0.576	0.075	0.047	nan	nan	0	1
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA18525	0.514	0.62	0.062	0.034	nan	nan	0	1
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA18939	0.739	0.891	0.0	0.0	0.848	0.807	2	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA19017	0.603	0.727	0.0	0.0	0.571	0.602	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA19238	0.728	0.877	0.0	0.0	0.542	0.524	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA19239	0.804	0.968	0.0	0.0	0.778	0.753	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA19625	0.544	0.656	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA19648	0.824	0.993	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA20502	0.0	0.0	0.548	0.29	nan	nan	0	0
chr20	61304237	61305144	DEL	908	NA20845	0.644	0.776	0.0	0.0	0.867	0.867	2	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG00096	0.789	1.038	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG00268	0.506	0.666	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG00419	0.55	0.724	0.0	0.015	nan	nan	0	1
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG01051	0.549	0.722	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG01112	0.531	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG01500	0.804	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG01565	0.552	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG01583	0.851	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG01595	0.497	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG01879	0.596	0.784	0.0	0.0	0.917	0.917	2	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG02568	0.95	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG02922	0.596	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG03006	0.656	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG03052	0.598	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG03642	0.704	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	HG03742	0.541	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA12878	0.407	0.536	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA18525	0.312	0.411	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA18939	0.453	0.597	0.0	0.028	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA19017	0.563	0.741	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA19238	0.756	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA19239	0.62	0.816	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA19625	0.735	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA19648	0.798	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA20502	0.608	0.8	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61716871	61717041	DEL	171	NA20845	0.883	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG00096	0.0	0.0	0.195	0.121	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG00268	0.263	0.292	0.047	0.041	nan	nan	0	1
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG00419	0.0	0.0	0.166	0.126	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG00759	0.0	0.0	0.099	0.122	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG01051	0.0	0.0	0.279	0.163	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG01112	0.286	0.318	0.04	0.02	nan	nan	0	1
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG01500	0.314	0.349	0.043	0.025	nan	nan	0	1
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG01565	0.0	0.0	0.25	0.176	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG01583	0.0	0.0	0.23	0.133	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG01595	0.0	0.0	0.113	0.087	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG01879	0.656	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG02568	0.0	0.0	0.297	0.176	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG02922	0.367	0.407	0.077	0.058	nan	nan	0	1
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG03006	0.0	0.0	0.292	0.175	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG03052	0.368	0.409	0.083	0.065	nan	nan	0	1
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG03642	0.0	0.0	0.25	0.183	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	HG03742	0.0	0.0	0.152	0.126	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA12878	0.0	0.0	0.257	0.124	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA18525	0.0	0.0	0.302	0.162	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA18939	0.0	0.0	0.248	0.135	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA19017	0.402	0.447	0.064	0.042	nan	nan	0	1
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA19238	0.942	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA19239	0.0	0.0	0.323	0.174	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA19625	0.0	0.0	0.187	0.101	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA19648	0.0	0.0	0.221	0.152	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA20502	0.0	0.0	0.571	0.276	nan	nan	0	0
chr20	61724701	61725601	DEL	901	NA20845	0.0	0.0	0.282	0.155	nan	nan	0	0
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG00096	0.671	0.882	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG00268	0.375	0.494	0.0	0.018	0.632	0.632	1	1
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG00419	0.814	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG00759	0.439	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG01051	0.274	0.361	0.0	0.02	0.6	0.643	1	1
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG01112	0.388	0.511	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG01565	0.437	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG01583	0.567	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG01595	0.474	0.624	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG01879	0.417	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG02568	0.713	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG02922	0.676	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG03006	0.398	0.523	0.0	0.041	0.294	0.294	1	1
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG03052	0.689	0.907	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG03642	0.352	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	HG03742	0.671	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA12878	0.903	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA18525	0.882	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA18939	0.394	0.519	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA19017	0.643	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA19238	0.728	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA19239	0.677	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA19625	0.599	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA19648	0.838	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA20502	0.851	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	61881911	61881968	DEL	58	NA20845	0.692	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG00096	0.75	0.833	0.032	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG00268	0.0	0.0	0.092	0.0	nan	nan	0	0
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG00419	1.1	1.222	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG00759	0.746	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG01051	0.503	0.559	0.015	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG01112	0.981	1.09	0.0	0.0	0.776	0.776	2	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG01500	0.0	0.0	0.155	0.0	nan	nan	0	0
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG01565	0.691	0.767	0.088	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG01583	0.387	0.43	0.058	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG01595	0.881	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG01879	0.715	0.795	0.011	0.007	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG02568	0.554	0.616	0.06	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG02922	1.008	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG03006	0.0	0.0	0.225	0.0	nan	nan	0	0
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG03052	0.873	0.97	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG03642	0.46	0.512	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	HG03742	0.519	0.577	0.02	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA12878	0.478	0.531	0.023	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA18525	1.139	1.265	0.003	0.0	0.94	0.979	2	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA18939	1.025	1.139	0.0	0.003	0.634	0.603	2	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA19017	0.905	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA19238	0.913	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA19239	1.043	1.159	0.0	0.0	1.0	0.968	1	2
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA19625	0.0	0.0	0.075	0.0	nan	nan	0	0
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA19648	0.452	0.502	0.017	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA20502	0.365	0.405	0.028	0.0	nan	nan	0	1
chr20	62267510	62268021	DEL	512	NA20845	0.573	0.636	0.054	0.005	nan	nan	0	1
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG00096	0.375	0.416	0.033	0.053	0.476	0.5	7	1
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG00268	0.769	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG00419	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG00759	0.768	0.853	0.0	0.0	0.516	0.516	2	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG01051	0.618	0.686	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG01112	0.797	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG01500	0.804	0.893	0.0	0.0	0.641	0.64	2	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG01565	0.714	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG01583	0.748	0.831	0.0	0.0	0.2	0.183	1	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG01595	0.587	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG01879	0.775	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG02568	0.673	0.748	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG02922	0.802	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG03006	0.755	0.839	0.0	0.0	0.648	0.648	2	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG03052	0.689	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG03642	0.542	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	HG03742	0.823	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA12878	0.726	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA18525	0.753	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA18939	0.868	0.964	0.0	0.0	0.9	0.857	1	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA19017	0.864	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA19238	0.885	0.983	0.0	0.003	0.824	0.821	2	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA19239	0.79	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA19625	0.762	0.847	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA19648	0.904	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA20502	0.851	0.946	0.0	0.0	0.638	0.638	2	2
chr20	62392041	62392585	DEL	545	NA20845	0.788	0.875	0.0	0.0	0.771	0.771	2	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG00096	0.73	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG00268	0.75	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG00419	0.418	0.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG00759	0.921	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG01051	0.526	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG01112	0.735	0.687	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG01500	0.765	0.715	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG01565	0.783	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG01583	0.619	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG01595	0.52	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG01879	0.576	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG02568	0.673	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG02922	0.481	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG03006	0.755	0.706	0.0	0.003	0.25	0.25	1	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG03052	0.345	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG03642	0.488	0.456	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	HG03742	0.649	0.607	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA12878	0.708	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA18525	0.808	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA18939	0.591	0.553	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA19017	0.744	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA19238	0.328	0.307	0.0	0.011	0.441	0.427	3	1
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA19239	0.635	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA19625	0.327	0.305	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA19648	0.479	0.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA20502	0.73	0.682	0.0	0.003	0.6	0.6	1	2
chr20	6877577	6877639	DEL	63	NA20845	0.501	0.468	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG00096	1.519	1.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG00268	0.919	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG00419	1.056	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG00759	1.316	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG01051	1.258	1.144	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG01112	1.307	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG01500	1.51	1.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG01565	1.312	1.193	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG01583	1.289	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG01595	1.31	1.191	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG01879	1.312	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG02568	0.752	0.684	0.0	0.052	0.722	0.722	1	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG02922	1.077	0.979	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG03006	1.392	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG03052	1.471	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG03642	0.867	0.788	0.0	0.04	0.382	0.382	1	1
chr20	7239157	7239235	DEL	79	HG03742	0.996	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA12878	0.956	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA18525	1.139	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA18939	1.222	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA19017	0.543	0.493	0.0	0.045	1.0	0.95	1	1
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA19238	0.685	0.623	0.0	0.058	0.821	0.849	1	1
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA19239	1.029	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA19625	1.061	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA19648	1.09	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA20502	1.046	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7239157	7239235	DEL	79	NA20845	1.408	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG00096	1.243	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG00268	1.219	1.139	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG00419	1.364	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG00759	2.193	2.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG01051	0.64	0.599	0.0	0.031	0.567	0.607	1	1
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG01112	1.491	1.394	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG01500	1.529	1.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG01565	1.634	1.528	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG01583	1.289	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG01595	2.146	2.006	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG01879	1.53	1.43	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG02568	1.148	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG02922	1.352	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG03006	1.372	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG03052	1.54	1.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG03642	1.49	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	HG03742	0.974	0.91	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA12878	1.346	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA18525	1.157	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA18939	1.597	1.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA19017	1.126	1.052	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA19238	1.398	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA19239	1.297	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA19625	1.388	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA19648	1.543	1.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA20502	1.629	1.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	7591060	7591122	DEL	63	NA20845	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG00096	1.4	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG00268	1.294	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG01051	1.464	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG01112	1.41	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG01500	1.431	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG01565	1.243	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG01583	1.109	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG03006	1.133	1.04	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG03642	1.652	1.516	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	HG03742	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	NA12878	1.08	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	NA19239	1.41	1.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	NA19625	1.252	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	NA19648	1.622	1.488	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr20	8187617	8187800	DUP	184	NA20502	1.459	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG00096	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG00268	0.769	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG00419	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG00759	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG01051	1.327	1.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG01112	0.592	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG01500	1.059	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG01565	0.806	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG01583	0.954	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG01595	0.226	0.238	0.0	0.017	0.714	0.714	1	1
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG01879	0.636	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG02568	0.911	0.958	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG02922	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG03006	0.716	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG03642	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	HG03742	0.584	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA12878	0.336	0.354	0.0	0.048	0.81	0.81	1	1
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA18525	0.735	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA18939	0.769	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA19238	0.713	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA19239	0.395	0.416	0.0	0.028	0.903	0.933	1	1
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA19625	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA19648	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA20502	0.268	0.282	0.0	0.023	0.889	0.889	1	1
chr20	9149569	9149622	DEL	54	NA20845	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG00096	0.572	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG00268	0.394	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG00419	0.44	0.463	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG00759	0.526	0.554	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG01051	0.48	0.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG01112	0.47	0.495	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG01500	0.823	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG01565	0.46	0.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG01583	0.49	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG01595	0.474	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG01879	0.616	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG02568	0.0	0.0	0.021	0.141	nan	nan	0	0
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG02922	0.137	0.145	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG03006	0.477	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG03052	0.621	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG03642	0.406	0.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	HG03742	0.433	0.456	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA12878	0.531	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA18525	0.533	0.561	0.0	0.004	0.25	0.239	1	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA18939	0.453	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA19017	0.241	0.254	0.007	0.097	nan	nan	0	1
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA19238	0.528	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA19239	0.24	0.252	0.013	0.08	nan	nan	0	1
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA19625	0.408	0.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA19648	0.293	0.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA20502	0.584	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9193751	9194025	DEL	275	NA20845	0.573	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG00096	1.183	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG00268	1.275	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG00419	1.254	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG00759	1.075	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG01051	1.121	1.088	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG01112	1.369	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG01500	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG01565	1.611	1.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG01583	1.315	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG01595	1.446	1.404	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG01879	0.914	0.888	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG02568	0.911	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG02922	0.893	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG03006	1.213	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG03052	0.437	0.424	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG03642	1.083	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	HG03742	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA12878	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA18525	0.808	0.785	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA18939	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA19017	1.226	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA19238	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA19239	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA19625	1.551	1.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA19648	1.117	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA20502	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9576455	9576609	DEL	155	NA20845	1.122	1.089	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG00096	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG00268	1.05	1.106	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG00419	0.462	0.486	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG00759	0.296	0.312	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG01051	0.984	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG01112	0.368	0.387	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG01500	0.725	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG01565	0.506	0.533	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG01583	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG01595	0.0	0.0	0.016	0.133	nan	nan	0	0
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG01879	0.378	0.397	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG02568	0.673	0.708	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG02922	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG03006	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG03052	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG03642	0.921	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	HG03742	1.017	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA12878	0.85	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA18525	0.588	0.619	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA18939	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA19017	0.824	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA19238	0.984	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA19239	0.437	0.46	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA19625	0.354	0.372	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA19648	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA20502	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9647997	9648154	DEL	158	NA20845	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG00759	0.789	0.738	0.0	0.022	0.787	0.787	2	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG01051	0.549	0.513	0.0	0.03	0.667	0.714	1	2
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG01112	0.633	0.592	0.0	0.036	0.613	0.613	1	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.077	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG02922	0.458	0.428	0.0	0.028	0.842	0.842	1	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG03052	0.46	0.43	0.0	0.02	0.808	0.808	1	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA12878	0.354	0.331	0.0	0.022	0.55	0.55	2	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA18939	0.473	0.442	0.0	0.03	0.741	0.705	1	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA19017	0.483	0.451	0.0	0.041	0.643	0.677	3	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA19238	0.613	0.573	0.0	0.036	0.318	0.314	2	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA19648	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA20502	1.07	1.0	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr20	9696761	9696815	DEL	55	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG00096	0.673	0.748	0.0	0.023	0.341	0.341	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG00268	0.402	0.446	0.006	0.054	0.692	0.692	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG00419	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG00759	0.48	0.533	0.0	0.027	0.419	0.419	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG01565	0.35	0.389	0.0	0.041	0.667	0.667	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG01583	0.304	0.338	0.0	0.059	0.8	0.8	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG01595	0.408	0.453	0.0	0.049	0.826	0.881	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG02568	0.433	0.481	0.0	0.027	0.837	0.837	2	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG03006	0.515	0.573	0.0	0.038	0.514	0.514	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.058	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG03642	0.759	0.843	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr21	16275282	16275361	DEL	80	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA12878	0.405	0.45	0.0	0.05	0.893	0.893	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA19017	0.449	0.499	0.0	0.045	0.917	0.917	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA19238	0.537	0.596	0.0	0.039	0.909	0.909	3	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA19625	0.293	0.325	0.0	0.079	0.733	0.733	1	1
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr21	16275282	16275361	DEL	80	NA20845	0.459	0.51	0.0	0.041	0.611	0.611	1	1
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG00096	1.154	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG00268	1.205	1.126	0.005	0.0	0.647	0.647	3	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG00419	1.261	1.179	0.0	0.0	0.794	0.794	3	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG00759	1.273	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG01051	1.327	1.24	0.0	0.0	0.73	0.73	2	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG01112	1.23	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG01500	1.382	1.292	0.0	0.0	0.882	0.842	3	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG01565	1.466	1.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG01583	1.242	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG01595	1.481	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG01879	1.474	1.378	0.0	0.0	0.809	0.771	2	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG02568	0.945	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG02922	1.333	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG03006	1.451	1.356	0.004	0.003	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG03052	1.212	1.133	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG03642	1.073	1.003	0.0	0.0	0.933	0.933	3	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	HG03742	1.182	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA12878	0.969	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA18525	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA18939	1.291	1.206	0.0	0.0	0.81	0.81	3	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA19017	1.23	1.149	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA19238	1.444	1.35	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA19239	0.7	0.654	0.101	0.028	nan	nan	0	1
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA19625	1.251	1.169	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA19648	1.278	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA20502	1.319	1.233	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17378116	17378849	DEL	734	NA20845	1.238	1.157	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG00096	1.307	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG00268	1.224	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG00419	1.539	1.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG00759	1.44	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG01051	1.414	1.297	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG01112	1.133	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG01500	1.308	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG01565	1.444	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG01583	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG01595	1.674	1.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG01879	1.255	1.152	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG02568	0.551	0.506	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG02922	1.511	1.386	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG03006	1.375	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG03052	1.212	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG03642	1.282	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	HG03742	1.244	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA12878	1.11	1.018	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA18525	1.357	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA18939	1.215	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA19017	1.288	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA19238	0.537	0.492	0.0	0.083	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA19239	1.508	1.383	0.0	0.0	0.964	0.964	1	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA19625	1.331	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA19648	1.304	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA20502	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	17618044	17618160	DEL	117	NA20845	1.468	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG00096	0.884	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG00268	0.785	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG00419	0.791	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG00759	0.709	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG01051	0.805	0.847	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG01112	0.703	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG01500	0.971	1.023	0.0	0.0	0.821	0.784	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG01565	0.788	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG01583	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG01595	0.858	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG01879	0.78	0.821	0.0	0.0	0.643	0.612	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG02568	0.354	0.373	0.05	0.019	nan	nan	0	1
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG02922	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG03006	0.802	0.844	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG03052	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG03642	0.733	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	HG03742	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA12878	0.793	0.835	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA18525	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA18939	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA19017	0.82	0.863	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA19238	0.798	0.84	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA19239	0.91	0.958	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA19625	1.011	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA19648	0.73	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA20502	0.839	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	18738487	18739345	DEL	859	NA20845	0.803	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG00096	1.134	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG00268	1.077	1.007	0.0	0.004	0.963	0.963	1	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG00419	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG00759	1.148	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG01051	0.87	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG01112	1.23	1.15	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG01500	1.177	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG01565	1.444	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG01583	0.761	0.711	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG01595	1.094	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG01879	0.38	0.356	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG02568	1.3	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG02922	0.933	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG03006	1.298	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG03052	0.404	0.378	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG03642	1.256	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	HG03742	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA12878	1.022	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA18525	1.357	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA18939	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA19238	0.578	0.54	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA19239	1.168	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA19625	1.038	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA19648	1.069	0.999	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA20502	1.151	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	21896514	21896630	DEL	117	NA20845	1.261	1.179	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG00096	0.365	0.365	0.0	0.048	0.875	0.875	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG00268	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG00419	0.577	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG01051	0.511	0.511	0.0	0.038	0.833	0.833	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG01112	0.957	0.957	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG01500	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG01583	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG01879	0.304	0.304	0.0	0.044	0.84	0.8	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.033	nan	nan	0	0
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG02922	0.067	0.067	0.0	0.028	0.833	0.833	2	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG03006	0.477	0.477	0.0	0.043	0.875	0.875	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG03052	0.628	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG03642	0.785	0.785	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	HG03742	0.518	0.518	0.0	0.057	0.892	0.892	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA12878	0.581	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA18525	0.353	0.353	0.0	0.057	0.818	0.818	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA18939	0.285	0.285	0.0	0.04	0.929	0.929	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA19017	0.898	0.898	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA19238	0.261	0.261	0.0	0.052	0.196	0.196	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA19239	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA19625	0.586	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA19648	0.365	0.365	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA20502	0.168	0.168	0.0	0.024	0.688	0.688	1	1
chr21	22051926	22051995	DEL	70	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG00096	0.519	0.546	0.0	0.028	0.656	0.656	1	1
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG00268	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG00419	0.855	0.9	0.0	0.01	0.537	0.537	1	1
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG00759	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG01051	0.87	0.916	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG01112	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG01500	0.56	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG01565	0.766	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG01583	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG01595	0.665	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG01879	0.742	0.781	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG02568	0.945	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG02922	0.822	0.865	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG03006	1.012	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG03052	0.785	0.827	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG03642	1.308	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	HG03742	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA12878	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA18525	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA18939	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA19017	1.073	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA19238	0.454	0.478	0.0	0.024	0.636	0.636	1	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA19239	0.747	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA19625	0.639	0.672	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA19648	0.652	0.686	0.0	0.011	0.3	0.3	1	1
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA20502	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	23746673	23746730	DEL	58	NA20845	0.94	0.99	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG00096	0.692	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG00268	0.42	0.42	0.011	0.094	0.656	0.656	2	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG00419	0.47	0.47	0.026	0.129	nan	nan	0	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG00759	1.294	1.294	0.0	0.0	0.694	0.694	1	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG01051	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG01112	0.43	0.43	0.005	0.064	nan	nan	0	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG01500	0.43	0.43	0.0	0.134	nan	nan	0	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG01565	0.0	0.0	0.103	0.191	nan	nan	0	0
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG01583	0.532	0.532	0.016	0.082	nan	nan	0	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG01595	1.159	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG01879	0.951	0.951	0.0	0.0	0.625	0.595	1	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG02568	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG02922	0.956	0.956	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG03006	1.279	1.279	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG03052	0.853	0.853	0.0	0.0	0.613	0.613	1	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG03642	0.654	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	HG03742	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA12878	0.388	0.388	0.012	0.074	nan	nan	0	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA18525	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA18939	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA19017	0.839	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA19238	0.949	0.949	0.0	0.0	0.932	0.932	2	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA19239	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA19625	0.852	0.852	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA19648	0.6	0.6	0.024	0.083	nan	nan	0	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA20502	0.36	0.36	0.043	0.148	nan	nan	0	1
chr21	25710159	25710603	DEL	445	NA20845	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG00096	1.288	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG00268	1.059	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG00419	1.09	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG00759	1.043	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG01051	1.044	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG01112	0.859	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG01500	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.206	nan	nan	0	0
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG01583	0.938	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG01595	0.494	0.52	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG01879	1.065	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG02568	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG02922	1.156	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG03006	1.279	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG03052	0.943	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG03642	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	HG03742	1.119	1.178	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA12878	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA18525	1.031	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA18939	0.531	0.559	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA19017	1.054	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA19238	1.224	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA19239	1.032	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA19625	0.852	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA19648	1.226	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA20502	0.839	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	27274751	27274949	DEL	199	NA20845	1.055	1.11	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG00096	1.365	1.276	0.003	0.0	0.634	0.634	1	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG00268	1.15	1.075	0.0	0.0	0.516	0.516	1	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG00419	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG00759	1.398	1.306	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG01051	1.066	0.996	0.0	0.0	0.764	0.764	4	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG01112	1.328	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG01500	1.214	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG01565	1.422	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG01583	1.116	1.043	0.005	0.0	0.859	0.859	2	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG01595	1.309	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG01879	1.141	1.067	0.0	0.0	0.864	0.823	2	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG02568	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG02922	1.222	1.142	0.0	0.0	0.607	0.607	1	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG03006	1.203	1.124	0.0	0.0	0.801	0.801	2	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG03052	1.279	1.195	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG03642	1.125	1.051	0.0	0.0	0.611	0.611	2	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	HG03742	1.244	1.162	0.0	0.0	0.935	0.935	1	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA12878	0.969	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA18525	1.031	0.964	0.0	0.0	0.907	0.907	2	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA18939	1.139	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA19017	1.093	1.021	0.0	0.0	0.531	0.531	2	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA19238	0.715	0.669	0.098	0.06	nan	nan	0	1
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA19239	1.318	1.232	0.0	0.0	0.913	0.913	3	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA19625	1.145	1.07	0.0	0.0	0.738	0.738	2	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA19648	1.33	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA20502	1.031	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	28476657	28477439	DEL	783	NA20845	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG00096	1.307	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG00268	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG00419	1.069	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG00759	1.21	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG01051	1.109	1.018	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG01112	1.094	1.003	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG01500	1.308	1.2	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG01565	1.225	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG01583	1.014	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG01595	1.202	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG01879	0.894	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG02568	0.866	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG02922	0.378	0.347	0.0	0.066	0.893	0.893	2	1
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG03006	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG03052	0.516	0.474	0.0	0.094	0.786	0.786	2	1
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG03642	1.125	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	HG03742	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA12878	1.092	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA18525	1.285	1.179	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA18939	1.366	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA19017	1.093	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA19239	1.277	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA19625	0.932	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA19648	0.939	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA20502	1.007	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	29109574	29109672	DEL	99	NA20845	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG00096	0.0	0.0	0.015	0.209	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG00268	0.0	0.0	0.033	0.235	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG00419	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG00759	0.542	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG01051	0.283	0.298	0.022	0.118	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG01112	0.156	0.164	0.024	0.091	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG01500	0.392	0.413	0.018	0.069	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG01565	0.438	0.461	0.024	0.111	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG01583	0.0	0.0	0.023	0.228	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG01595	0.687	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG01879	0.647	0.681	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG02568	0.394	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG02922	0.622	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG03006	0.229	0.241	0.034	0.114	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG03052	0.0	0.0	0.037	0.161	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG03642	0.262	0.275	0.01	0.1	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	HG03742	0.352	0.371	0.009	0.072	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA12878	0.0	0.0	0.009	0.213	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA18525	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA18939	0.0	0.0	0.057	0.24	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA19017	0.293	0.308	0.008	0.103	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA19238	0.399	0.42	0.005	0.095	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA19239	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA19625	0.0	0.0	0.055	0.277	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA19648	0.0	0.0	0.04	0.315	nan	nan	0	0
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA20502	0.432	0.454	0.034	0.08	nan	nan	0	1
chr21	30552224	30552588	DEL	365	NA20845	0.0	0.0	0.01	0.208	nan	nan	0	0
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG00096	0.884	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG00268	0.603	0.763	0.0	0.01	0.657	0.657	1	1
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG00419	0.855	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG00759	0.835	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG01051	0.914	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG01112	0.859	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG01565	0.372	0.471	0.0	0.023	1.0	1.0	1	1
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG01583	0.279	0.353	0.0	0.033	1.0	1.0	1	1
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG01595	0.536	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG01879	0.818	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG02568	0.709	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG02922	0.889	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG03006	0.325	0.411	0.0	0.015	0.421	0.421	1	1
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG03052	0.898	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG03642	0.706	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	HG03742	0.601	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA12878	0.969	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA18525	1.049	1.328	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA18939	0.854	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA19017	0.956	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA19238	0.715	0.906	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA19239	0.856	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA19625	0.905	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA19648	0.626	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA20502	0.863	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	33030348	33030398	DEL	51	NA20845	0.711	0.9	0.011	0.005	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG00096	0.692	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG00268	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG00419	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG00759	0.396	0.417	0.063	0.0	0.59	0.59	2	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG01051	0.326	0.343	0.025	0.006	0.3	0.3	2	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG01112	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG01500	0.467	0.492	0.042	0.0	0.333	0.349	2	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG01565	0.372	0.392	0.043	0.0	0.251	0.251	2	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG01583	0.456	0.48	0.06	0.0	nan	nan	0	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG01595	0.773	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG01879	0.361	0.38	0.0	0.0	0.3	0.3	2	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG02568	0.0	0.0	0.174	0.0	nan	nan	0	0
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG02922	0.356	0.374	0.019	0.0	nan	nan	0	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG03006	0.363	0.382	0.01	0.0	nan	nan	0	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG03642	0.654	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	HG03742	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA12878	0.74	0.779	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA18525	0.0	0.0	0.215	0.0	nan	nan	0	0
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA18939	0.569	0.599	0.031	0.0	0.364	0.364	1	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA19017	0.468	0.493	0.115	0.0	0.833	0.833	3	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA19238	0.702	0.739	0.003	0.0	0.75	0.75	1	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA19239	0.421	0.443	0.068	0.0	0.25	0.25	2	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA19625	0.319	0.336	0.045	0.0	0.8	0.8	2	1
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA19648	0.808	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA20502	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	36072586	36073498	DEL	913	NA20845	0.665	0.7	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.234	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG00268	0.42	0.385	0.0	0.112	nan	nan	0	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG00759	1.106	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.228	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG01112	0.449	0.412	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG01500	0.467	0.428	0.007	0.083	0.385	0.403	1	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG01565	0.547	0.502	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG01583	0.0	0.0	0.009	0.18	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG01595	0.0	0.0	0.013	0.173	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG01879	0.0	0.0	0.015	0.17	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG02922	0.0	0.0	0.011	0.167	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG03006	0.0	0.0	0.009	0.186	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG03052	0.0	0.0	0.01	0.146	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.194	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	HG03742	0.601	0.552	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.183	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA18525	0.561	0.515	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA18939	0.0	0.0	0.01	0.182	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA19239	0.475	0.436	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA19625	0.426	0.391	0.016	0.129	nan	nan	0	1
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.192	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr21	37014963	37015170	DEL	208	NA20845	0.413	0.379	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG00096	0.942	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG00268	0.785	0.785	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG00419	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG00759	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG01051	0.435	0.435	0.035	0.013	nan	nan	0	1
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG01112	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG01500	0.841	0.841	0.0	0.004	0.8	0.764	1	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG01565	1.007	1.007	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG01583	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG01595	0.687	0.687	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG01879	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG02568	0.433	0.433	0.026	0.013	nan	nan	0	1
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG02922	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG03006	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG03052	0.583	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG03642	0.706	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	HG03742	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA12878	0.687	0.687	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA18525	0.832	0.832	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA18939	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA19017	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA19238	0.784	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA19239	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA19625	0.293	0.293	0.021	0.026	nan	nan	0	1
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA19648	0.574	0.574	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA20502	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37699617	37700146	DEL	530	NA20845	0.848	0.848	0.0	0.005	0.909	0.909	1	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG00096	0.846	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG00268	1.077	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG00419	0.919	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG00759	0.626	0.659	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG01051	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG01112	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG01500	0.71	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG01565	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG01583	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG01595	0.773	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG01879	1.008	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG02568	1.182	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG02922	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG03006	1.05	1.105	0.0	0.0	0.83	0.83	2	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG03052	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG03642	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	HG03742	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA12878	0.846	0.89	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA18525	0.85	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA18939	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA19017	0.859	0.904	0.0	0.002	0.797	0.797	2	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA19238	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA19239	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA19625	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA19648	0.73	0.769	0.009	0.029	nan	nan	0	1
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA20502	0.552	0.581	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	37857287	37857636	DEL	350	NA20845	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG00096	0.808	0.755	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG00268	1.242	1.161	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG00419	1.325	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG00759	1.231	1.15	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG01051	0.544	0.508	0.0	0.098	0.812	0.812	2	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG01112	0.762	0.712	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG01500	0.71	0.663	0.0	0.081	0.45	0.448	2	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG01565	0.591	0.552	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG01583	0.532	0.498	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG01595	1.202	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG01879	0.685	0.64	0.0	0.065	0.374	0.372	2	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG02568	0.945	0.883	0.0	0.018	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG02922	0.333	0.312	0.008	0.055	0.571	0.571	2	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG03006	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG03052	1.257	1.175	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG03642	1.478	1.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	HG03742	0.0	0.0	0.008	0.135	nan	nan	0	0
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA18525	0.986	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA18939	1.215	1.135	0.0	0.0	0.758	0.758	1	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA19017	0.937	0.875	0.0	0.008	0.84	0.84	1	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA19238	1.183	1.106	0.0	0.0	0.956	0.956	1	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA19239	1.263	1.181	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA19625	0.426	0.398	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA19648	1.278	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA20502	0.54	0.504	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr21	39863887	39863992	DEL	106	NA20845	1.124	1.05	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG00096	0.308	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG00268	0.603	0.634	0.0	0.05	0.273	0.273	6	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG00419	0.192	0.203	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG00759	0.355	0.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG01051	0.413	0.435	0.0	0.101	0.889	0.889	3	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG01112	0.352	0.37	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.189	nan	nan	0	0
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG01565	0.394	0.415	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG01583	0.279	0.294	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG01595	0.472	0.497	0.0	0.0	0.375	0.352	3	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG01879	0.171	0.18	0.0	0.115	0.688	0.722	2	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG02568	0.079	0.083	0.0	0.124	0.75	0.75	2	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG02922	0.178	0.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG03006	0.382	0.402	0.0	0.076	0.515	0.515	6	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG03052	0.067	0.071	0.0	0.118	0.333	0.333	2	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG03642	0.105	0.11	0.0	0.074	0.667	0.667	2	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	HG03742	0.373	0.393	0.0	0.091	0.342	0.342	6	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA12878	0.088	0.093	0.0	0.036	0.727	0.727	2	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA18525	0.416	0.438	0.0	0.096	0.536	0.536	6	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA18939	0.285	0.3	0.0	0.195	nan	nan	0	0
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA19017	0.215	0.226	0.0	0.061	0.211	0.211	3	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA19238	0.289	0.304	0.0	0.1	0.556	0.556	2	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA19239	0.19	0.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA19625	0.346	0.364	0.0	0.047	0.25	0.25	1	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA19648	0.469	0.494	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA20502	0.12	0.126	0.0	0.082	0.556	0.556	2	1
chr21	41957248	41957367	DEL	120	NA20845	0.619	0.652	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG00096	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG00268	0.676	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG00419	0.62	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG00759	0.647	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG01051	0.544	0.625	0.0	0.005	0.525	0.525	2	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG01112	0.469	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG01500	0.841	0.966	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG01565	0.722	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG01583	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG01595	0.536	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG01879	0.495	0.568	0.0	0.0	0.6	0.571	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG02568	0.866	0.996	0.0	0.007	1.0	1.0	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG02922	0.711	0.817	0.01	0.0	1.0	1.0	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG03006	0.363	0.417	0.065	0.0	nan	nan	0	1
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG03052	0.539	0.619	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG03642	0.523	0.601	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	HG03742	0.56	0.643	0.0	0.0	0.452	0.452	2	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA12878	1.039	1.195	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA18525	0.868	0.998	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA18939	0.797	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA19017	0.683	0.785	0.0	0.002	0.688	0.688	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA19238	0.853	0.98	0.0	0.002	0.864	0.864	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA19239	0.815	0.937	0.0	0.001	0.909	0.909	1	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA19625	0.719	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA19648	0.834	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA20502	0.767	0.882	0.0	0.0	0.535	0.535	2	2
chr21	44501193	44502023	DEL	831	NA20845	0.803	0.922	0.0	0.0	0.8	0.8	2	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG00096	1.115	1.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG00268	0.986	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG00419	0.983	1.245	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG00759	0.918	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG01051	1.001	1.267	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG01112	0.82	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG01500	0.766	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG01565	1.05	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG01583	1.496	1.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG01595	0.944	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG01879	0.951	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG02568	0.354	0.449	0.0	0.042	1.0	1.0	1	1
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG02922	0.867	1.097	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG03006	1.088	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG03052	0.976	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG03642	1.151	1.457	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	HG03742	0.933	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA12878	0.969	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA18525	1.013	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA18939	0.835	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA19017	0.976	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA19238	0.88	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA19239	1.128	1.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA19625	0.958	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA19648	1.121	1.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA20502	0.959	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	45666087	45666158	DEL	72	NA20845	1.055	1.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG00096	0.769	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG00268	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG00419	0.577	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG00759	1.064	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG01051	0.457	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG01112	0.742	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG01500	0.616	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG01565	0.613	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG01583	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG01595	0.472	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG01879	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG02568	0.906	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG02922	0.289	0.321	0.0	0.023	0.917	0.917	1	1
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG03006	0.897	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG03052	0.853	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG03642	0.392	0.436	0.0	0.027	0.667	0.667	1	1
chr21	46572182	46572236	DEL	55	HG03742	0.601	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA12878	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA18525	1.067	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA18939	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA19017	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA19238	0.564	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA19239	0.693	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA19625	0.452	0.503	0.0	0.02	0.45	0.45	1	1
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA19648	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA20502	1.031	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	46572182	46572236	DEL	55	NA20845	0.94	1.045	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG00096	0.634	0.729	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG00268	0.767	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG00419	0.641	0.737	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG00759	0.542	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG01051	0.587	0.675	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG01112	0.469	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG01500	0.626	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG01565	0.591	0.679	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG01583	0.634	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG01595	0.644	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG01879	0.818	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG02568	0.827	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG02922	0.578	0.664	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG03006	0.344	0.395	0.012	0.106	nan	nan	0	1
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG03052	0.853	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG03642	0.693	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	HG03742	0.767	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA12878	0.934	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA18525	0.579	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA18939	0.626	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA19017	0.546	0.628	0.0	0.0	0.916	0.916	2	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA19238	0.922	1.059	0.0	0.0	0.902	0.902	2	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA19239	0.679	0.781	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA19625	0.665	0.765	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA19648	0.991	1.139	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA20502	0.719	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr21	47048967	47049264	DEL	298	NA20845	0.527	0.606	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG00096	0.0	0.0	0.169	0.0	nan	nan	0	0
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG00268	0.365	0.365	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG00419	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG00759	0.429	0.429	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG01051	0.716	0.716	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG01112	0.763	0.763	0.006	0.0	0.733	0.733	4	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG01500	0.0	0.0	0.089	0.0	nan	nan	0	0
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG01565	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG01583	0.0	0.0	0.014	0.0	nan	nan	0	0
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG01595	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG01879	0.376	0.376	0.0	0.0	0.5	0.5	9	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG02568	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG02922	0.483	0.483	0.026	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG03006	0.31	0.31	0.038	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG03052	0.529	0.529	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG03642	0.57	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	HG03742	0.437	0.437	0.014	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA12878	0.937	0.937	0.0	0.0	0.75	0.712	4	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA18525	0.404	0.404	0.056	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA18939	0.848	0.848	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA19017	0.768	0.768	0.0	0.0	0.684	0.724	1	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA19238	0.61	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA19239	0.614	0.614	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA19625	0.562	0.562	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA19648	0.314	0.314	0.014	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA20502	0.342	0.342	0.025	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18003573	18004242	DEL	670	NA20845	0.653	0.653	0.03	0.0	nan	nan	0	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG00419	0.606	0.606	0.0	0.029	0.435	0.435	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG00759	0.53	0.53	0.0	0.026	0.762	0.816	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG01051	0.265	0.265	0.0	0.043	0.857	0.857	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG01112	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.025	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG01565	0.256	0.256	0.0	0.035	0.833	0.833	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG01583	0.526	0.526	0.0	0.038	0.5	0.5	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG01595	0.441	0.441	0.0	0.013	0.5	0.542	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG01879	0.442	0.442	0.0	0.018	0.579	0.579	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG02922	0.56	0.56	0.0	0.021	0.294	0.321	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG03006	1.15	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG03052	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG03642	0.735	0.735	0.0	0.04	0.688	0.688	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA12878	0.469	0.469	0.0	0.033	0.533	0.561	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA19017	0.571	0.571	0.0	0.025	0.5	0.529	1	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA19238	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA19239	0.829	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr22	18977575	18977640	DEL	66	NA20845	0.365	0.365	0.0	0.032	0.833	0.833	1	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG00096	1.139	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG00268	0.852	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG00419	1.141	1.202	0.005	0.0	0.714	0.714	1	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG00759	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG01051	0.345	0.363	0.066	0.031	nan	nan	0	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG01112	0.578	0.608	0.065	0.024	nan	nan	0	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG01500	1.125	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG01565	1.126	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG01583	0.443	0.467	0.066	0.016	nan	nan	0	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG01595	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG01879	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG02568	0.837	0.881	0.0	0.0	0.549	0.549	2	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG02922	1.157	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG03006	1.283	1.351	0.0	0.0	0.833	0.885	1	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG03052	0.378	0.397	0.038	0.015	nan	nan	0	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG03642	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	HG03742	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA12878	0.562	0.592	0.068	0.037	nan	nan	0	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA18525	1.078	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA18939	0.565	0.595	0.085	0.029	nan	nan	0	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA19017	1.097	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA19238	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA19239	1.013	1.066	0.0	0.0	0.914	0.914	2	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA19625	0.503	0.529	0.069	0.04	nan	nan	0	1
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA19648	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA20502	0.711	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19099906	19100607	DEL	702	NA20845	0.966	1.017	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG00096	0.902	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG00268	0.893	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG00419	0.809	0.851	0.0	0.0	0.478	0.478	2	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG00759	1.06	1.116	0.0	0.0	0.722	0.774	1	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG01051	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG01112	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG01500	1.147	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG01565	1.024	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG01583	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG01595	0.701	0.738	0.0	0.0	0.846	0.781	1	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG01879	0.707	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG02568	0.942	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG02922	0.712	0.75	0.0	0.0	0.774	0.776	2	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG03006	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG03052	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG03642	1.26	1.326	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	HG03742	0.777	0.818	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA12878	0.694	0.73	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA18525	0.962	1.013	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA18939	1.0	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA19017	0.571	0.601	0.0	0.0	0.846	0.799	1	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA19238	0.438	0.461	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA19239	0.629	0.662	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA19625	0.592	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA19648	0.571	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA20502	0.948	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19247915	19248102	DEL	188	NA20845	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG00096	1.16	1.16	0.0	0.0	0.435	0.435	5	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG00268	0.852	0.852	0.0	0.0	0.909	0.909	2	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG00419	1.165	1.165	0.0	0.0	0.688	0.688	2	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG00759	0.833	0.833	0.0	0.0	0.714	0.765	1	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG01051	0.531	0.531	0.049	0.006	nan	nan	0	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG01112	1.132	1.132	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG01500	1.212	1.212	0.0	0.0	0.801	0.801	4	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG01565	1.792	1.792	0.0	0.007	0.375	0.375	1	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG01583	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG01595	1.143	1.143	0.0	0.0	0.6	0.65	3	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG01879	0.531	0.531	0.038	0.0	nan	nan	0	1
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG02568	0.963	0.963	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG02922	1.221	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG03006	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG03052	0.956	0.956	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG03642	1.17	1.17	0.0	0.0	0.875	0.875	4	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	HG03742	1.142	1.142	0.0	0.0	0.57	0.57	4	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA12878	0.919	0.919	0.0	0.0	0.798	0.796	4	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA18525	1.135	1.135	0.004	0.005	0.93	0.93	2	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA18939	1.218	1.218	0.0	0.0	0.895	0.895	7	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA19017	0.856	0.856	0.0	0.0	0.897	0.939	6	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA19238	1.064	1.064	0.0	0.0	0.857	0.825	4	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA19239	1.09	1.09	0.0	0.0	0.878	0.878	1	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA19625	0.532	0.532	0.072	0.0	nan	nan	0	1
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA19648	1.485	1.485	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA20502	0.895	0.895	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr22	19912544	19913442	DEL	899	NA20845	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG00096	0.0	0.0	0.376	0.217	nan	nan	0	0
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG00268	0.731	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG00419	0.999	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG00759	0.707	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG01051	0.822	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG01112	0.347	0.398	0.045	0.033	nan	nan	0	1
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG01500	0.281	0.323	0.08	0.067	0.667	0.667	1	1
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG01565	0.691	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG01583	0.665	0.764	0.081	0.041	nan	nan	0	1
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG01595	0.857	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG01879	0.774	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG02568	0.921	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG02922	0.839	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG03006	0.796	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG03052	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG03642	0.72	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	HG03742	0.729	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA12878	0.937	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA18525	0.808	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA18939	0.739	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA19017	0.483	0.555	0.09	0.055	nan	nan	0	1
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA19238	0.845	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA19239	0.875	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA19625	1.094	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA19648	0.514	0.591	0.111	0.075	nan	nan	0	1
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA20502	0.895	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	23576847	23577807	DEL	961	NA20845	0.522	0.6	0.033	0.017	nan	nan	0	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG00096	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG00419	0.404	0.449	0.0	0.044	0.652	0.652	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG01051	0.584	0.648	0.0	0.022	0.722	0.722	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.088	nan	nan	0	0
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG01500	0.606	0.673	0.0	0.033	0.645	0.645	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG01583	0.443	0.492	0.0	0.066	0.895	0.895	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG01595	1.169	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG01879	1.017	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.04	nan	nan	0	0
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG02922	0.916	1.018	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG03006	0.575	0.639	0.0	0.043	0.714	0.759	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG03052	1.082	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG03642	0.45	0.5	0.0	0.058	0.8	0.8	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA18525	0.558	0.62	0.0	0.033	0.436	0.436	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA18939	0.435	0.483	0.0	0.032	0.7	0.7	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA19017	0.527	0.585	0.0	0.035	0.516	0.546	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA19238	0.391	0.435	0.0	0.045	0.65	0.626	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA19239	0.982	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA19625	0.799	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA19648	0.6	0.666	0.0	0.035	0.409	0.409	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA20502	0.5	0.556	0.0	0.03	0.72	0.72	1	1
chr22	24054882	24054953	DEL	72	NA20845	0.313	0.348	0.0	0.029	0.75	0.75	1	1
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG00096	1.483	1.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG00268	1.238	1.202	0.0	0.0	0.969	0.969	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG00419	1.213	1.178	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG00759	1.136	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG01051	1.459	1.416	0.0	0.002	0.69	0.69	2	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG01112	1.502	1.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG01500	1.255	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG01565	1.229	1.193	0.0	0.0	0.654	0.654	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG01583	1.385	1.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG01595	1.506	1.462	0.0	0.0	0.568	0.615	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG01879	0.464	0.451	0.07	0.072	nan	nan	0	1
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG02568	0.0	0.0	0.14	0.11	nan	nan	0	0
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG02922	0.687	0.667	0.081	0.049	nan	nan	0	1
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG03006	1.394	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG03052	1.208	1.173	0.0	0.0	0.793	0.793	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG03642	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	HG03742	1.166	1.132	0.0	0.0	0.731	0.731	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA12878	0.937	0.91	0.0	0.0	0.8	0.792	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA18525	1.462	1.42	0.005	0.0	0.761	0.761	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA18939	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA19017	0.527	0.511	0.052	0.043	nan	nan	0	1
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA19238	1.08	1.049	0.0	0.0	0.64	0.664	2	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA19239	1.32	1.282	0.0	0.0	0.826	0.826	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA19625	1.242	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA19648	1.399	1.358	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA20502	1.211	1.176	0.0	0.0	0.76	0.76	3	2
chr22	24876424	24877005	DEL	582	NA20845	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG00096	1.139	1.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG00268	0.406	0.489	0.0	0.01	0.8	0.8	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG00419	0.856	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG00759	0.53	0.638	0.0	0.033	0.958	0.894	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG01051	1.167	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG01112	0.74	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG01500	0.541	0.652	0.0	0.019	0.586	0.586	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG01565	0.41	0.494	0.0	0.017	0.647	0.647	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG01583	0.499	0.601	0.0	0.023	0.75	0.75	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG01879	1.26	1.518	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG02568	1.005	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG02922	1.221	1.471	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG03006	1.482	1.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	0
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG03642	0.81	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	HG03742	0.826	0.995	0.0	0.02	0.656	0.656	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA12878	0.431	0.52	0.0	0.014	0.75	0.789	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA18939	0.391	0.472	0.0	0.004	0.917	0.917	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.026	nan	nan	0	0
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA19239	0.798	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA19648	0.6	0.722	0.0	0.014	0.857	0.857	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA20502	0.605	0.729	0.0	0.008	0.778	0.778	1	1
chr22	25576003	25576053	DEL	51	NA20845	0.496	0.598	0.0	0.022	0.429	0.429	1	1
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG00096	1.311	1.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG00268	1.157	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG00419	0.713	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG00759	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG01051	0.743	0.743	0.0	0.067	0.387	0.387	1	1
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG01112	0.624	0.624	0.0	0.072	0.407	0.407	1	1
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG01500	0.454	0.454	0.0	0.09	0.5	0.5	1	1
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG01565	0.742	0.742	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG01583	0.416	0.416	0.0	0.119	0.929	0.929	1	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG01595	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG01879	0.796	0.796	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG02568	1.256	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG02922	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG03006	0.863	0.863	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG03052	1.032	1.032	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG03642	1.17	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	HG03742	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA12878	0.675	0.675	0.0	0.059	0.35	0.368	1	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA18525	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA18939	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA19017	0.636	0.636	0.0	0.085	0.402	0.4	2	1
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA19238	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA19239	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA19625	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA19648	1.228	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA20502	1.527	1.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27375675	27375778	DEL	104	NA20845	0.887	0.887	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG00096	1.268	1.409	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG00268	0.731	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG00419	0.999	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG00759	0.959	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG01051	0.743	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG01112	0.878	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG01500	0.736	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG01565	0.717	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG01583	0.388	0.431	0.0	0.085	0.5	0.5	2	1
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG01595	1.117	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG01879	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG02568	1.465	1.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG02922	0.89	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG03006	1.084	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG03052	1.082	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG03642	1.23	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	HG03742	0.972	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA12878	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA18525	0.885	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA18939	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA19017	0.834	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA19238	0.877	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA19239	0.691	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA19625	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA19648	1.028	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA20502	0.948	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	27939815	27940007	DEL	193	NA20845	0.287	0.319	0.0	0.072	0.625	0.625	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG00096	1.203	1.203	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG00268	1.096	1.096	0.0	0.0	0.856	0.856	2	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG00419	1.213	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG00759	1.388	1.388	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG01051	1.432	1.432	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG01112	1.271	1.271	0.0	0.0	0.879	0.879	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG01500	1.06	1.06	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG01565	1.024	1.024	0.0	0.0	0.851	0.851	2	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG01583	1.33	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG01595	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG01879	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG02568	1.13	1.13	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG02922	0.483	0.483	0.073	0.041	nan	nan	0	1
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG03006	1.128	1.128	0.0	0.0	0.941	0.886	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG03052	0.0	0.0	0.161	0.074	nan	nan	0	0
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG03642	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	HG03742	1.166	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA12878	1.05	1.05	0.0	0.003	0.885	0.84	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA18525	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA18939	1.457	1.457	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA19017	1.141	1.141	0.0	0.0	0.866	0.817	2	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA19238	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA19239	0.522	0.522	0.094	0.061	nan	nan	0	1
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA19625	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA19648	1.228	1.228	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA20502	1.079	1.079	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr22	30336304	30337195	DEL	892	NA20845	1.044	1.044	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG00096	0.859	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG00268	0.67	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG00419	0.523	0.63	0.0	0.034	0.636	0.636	1	1
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG00759	0.82	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG01051	0.053	0.064	0.0	0.086	0.25	0.25	1	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG01112	0.647	0.78	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG01500	0.26	0.313	0.0	0.055	0.944	0.944	1	1
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG01565	0.589	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG01583	0.997	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG01595	0.623	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG01879	0.354	0.426	0.0	0.047	0.938	0.938	1	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG02568	1.005	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG02922	0.916	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG03006	0.752	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG03052	1.158	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG03642	0.72	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	HG03742	0.948	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA12878	0.431	0.52	0.0	0.042	0.633	0.667	1	1
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA18525	1.231	1.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA18939	0.826	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA19017	0.68	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA19238	0.329	0.396	0.0	0.063	0.633	0.658	1	1
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA19239	0.783	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA19625	0.562	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA19648	0.428	0.516	0.0	0.042	0.438	0.437	1	1
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA20502	0.605	0.729	0.0	0.048	0.269	0.269	1	2
chr22	30737506	30737593	DEL	88	NA20845	0.887	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG00096	0.795	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG00268	0.71	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG00419	0.713	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG00759	0.631	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG01051	0.584	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG01112	0.3	0.362	0.062	0.023	nan	nan	0	1
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG01500	0.757	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG01565	0.845	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG01583	0.803	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG01595	0.649	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG01879	0.354	0.426	0.023	0.016	nan	nan	0	1
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG02568	0.0	0.0	0.179	0.142	nan	nan	0	0
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG02922	0.763	0.919	0.0	0.0	0.438	0.407	3	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG03006	0.398	0.48	0.079	0.039	nan	nan	0	1
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG03052	0.931	1.122	0.0	0.0	0.61	0.61	2	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG03642	0.87	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	HG03742	0.802	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA12878	0.919	1.107	0.0	0.0	0.455	0.432	1	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA18525	0.847	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA18939	0.761	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA19017	0.812	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA19238	0.485	0.585	0.069	0.028	nan	nan	0	1
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA19239	1.013	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA19625	0.266	0.321	0.095	0.062	nan	nan	0	1
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA19648	0.857	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA20502	0.921	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31045422	31046206	DEL	785	NA20845	0.418	0.503	0.081	0.051	nan	nan	0	1
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG00096	1.16	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG00268	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG00419	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG00759	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG01051	1.167	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG01112	1.109	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG01500	1.212	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG01565	1.075	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG01583	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG01595	0.805	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG01879	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG02568	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG02922	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG03006	1.305	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG03052	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG03642	1.11	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	HG03742	0.996	1.049	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA12878	0.881	0.928	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA18525	0.962	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA18939	0.805	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA19017	1.031	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA19238	0.548	0.577	0.0	0.059	0.947	0.984	1	1
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA19239	0.43	0.452	0.0	0.064	0.837	0.837	1	1
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA19625	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA19648	0.942	0.992	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA20502	1.158	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	31917216	31917284	DEL	69	NA20845	1.227	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG00096	0.774	0.859	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG00268	0.0	0.0	0.009	0.128	nan	nan	0	0
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG00419	1.094	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG00759	0.58	0.645	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG01051	1.432	1.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG01112	0.855	0.95	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG01565	1.024	1.138	0.007	0.005	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG01583	0.499	0.554	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	0
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG01879	0.531	0.589	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG02568	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG02922	1.297	1.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG03006	0.885	0.983	0.0	0.0	0.857	0.807	1	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG03052	1.51	1.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG03642	0.42	0.467	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	HG03742	1.045	1.161	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA12878	0.412	0.458	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA18525	0.75	0.834	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA18939	0.674	0.749	0.0	0.074	0.5	0.5	1	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA19017	0.9	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA19238	1.143	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA19239	1.167	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA19625	0.651	0.723	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA19648	1.285	1.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA20502	0.0	0.0	0.007	0.155	nan	nan	0	1
chr22	33751615	33751766	DEL	152	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG00096	0.58	0.58	0.085	0.048	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG00268	0.649	0.649	0.089	0.054	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG00419	1.213	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG00759	0.707	0.707	0.056	0.036	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG01051	0.531	0.531	0.106	0.066	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG01112	0.532	0.532	0.072	0.043	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG01500	0.0	0.0	0.407	0.267	nan	nan	0	0
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG01565	0.512	0.512	0.117	0.077	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG01583	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG01595	0.519	0.519	0.081	0.049	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG01879	0.619	0.619	0.093	0.054	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG02568	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG02922	1.094	1.094	0.0	0.0	0.783	0.854	2	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG03006	0.0	0.0	0.37	0.217	nan	nan	0	0
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG03052	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG03642	0.48	0.48	0.057	0.035	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	HG03742	0.498	0.498	0.113	0.068	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA12878	0.506	0.506	0.077	0.047	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA18525	1.116	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA18939	0.761	0.761	0.066	0.031	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA19017	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA19238	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA19239	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA19625	0.562	0.562	0.105	0.038	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA19648	0.543	0.543	0.087	0.042	nan	nan	0	1
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA20502	0.0	0.0	0.391	0.189	nan	nan	0	0
chr22	35645163	35646142	DEL	980	NA20845	0.679	0.679	0.055	0.041	nan	nan	0	1
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG00096	0.924	0.973	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG00268	0.934	0.983	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG00419	0.904	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG00759	0.934	0.983	0.0	0.0	0.583	0.544	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG01051	0.849	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG01112	1.04	1.095	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG01500	1.017	1.071	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG01565	0.794	0.835	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG01583	1.108	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG01595	1.117	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG01879	0.95	1.001	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG02568	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG02922	0.789	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG03006	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG03052	1.007	1.06	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG03642	0.87	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	HG03742	0.826	0.87	0.006	0.011	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA12878	0.937	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA18525	0.673	0.709	0.0	0.0	0.435	0.435	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA18939	0.761	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA19017	0.944	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA19238	0.83	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA19239	0.752	0.792	0.004	0.0	0.818	0.818	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA19625	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA19648	0.314	0.331	0.109	0.029	nan	nan	0	1
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA20502	0.737	0.776	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr22	36133470	36134250	DEL	781	NA20845	0.757	0.797	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG00096	1.053	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG00268	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG00419	1.094	1.152	0.0	0.0	0.585	0.585	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG00759	0.959	1.009	0.0	0.0	0.607	0.601	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG01051	0.955	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG01112	0.948	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG01500	1.277	1.344	0.0	0.0	0.757	0.757	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG01565	0.947	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG01583	0.665	0.7	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG01595	0.935	0.984	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG01879	0.906	0.954	0.0	0.0	0.595	0.595	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG02568	1.088	1.146	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG02922	0.483	0.509	0.043	0.0	0.571	0.623	7	1
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG03006	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG03052	0.956	1.007	0.0	0.0	0.69	0.69	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG03642	0.96	1.01	0.0	0.0	0.899	0.899	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	HG03742	0.948	0.997	0.0	0.004	0.873	0.873	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA12878	1.012	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA18525	1.001	1.053	0.0	0.0	0.704	0.704	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA18939	0.913	0.961	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA19017	0.834	0.878	0.0	0.0	0.533	0.565	1	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA19238	1.049	1.104	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA19239	1.105	1.163	0.0	0.005	0.783	0.783	1	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA19625	0.976	1.027	0.0	0.0	0.757	0.757	2	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA19648	1.028	1.082	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA20502	0.842	0.887	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr22	37438374	37438890	DEL	517	NA20845	1.122	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG00096	0.902	1.003	0.0	0.0	0.819	0.819	2	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG00268	0.832	0.925	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG00419	0.809	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG00759	0.959	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG01051	0.716	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG01112	0.832	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG01500	0.822	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG01565	0.896	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG01583	0.859	0.954	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG01595	0.571	0.635	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG01879	0.928	1.032	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG02568	0.963	1.07	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG02922	0.789	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG03006	0.774	0.86	0.0	0.0	0.375	0.398	3	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG03052	0.403	0.447	0.075	0.043	nan	nan	0	1
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG03642	0.93	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	HG03742	0.826	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA12878	0.862	0.958	0.0	0.0	0.706	0.743	1	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA18525	0.827	0.919	0.0	0.0	0.579	0.579	3	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA18939	1.0	1.111	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA19017	0.878	0.975	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA19238	0.861	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA19239	0.936	1.04	0.0	0.0	0.676	0.676	3	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA19625	1.065	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA19648	0.914	1.015	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA20502	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	37983495	37984481	DEL	987	NA20845	0.861	0.957	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG00096	0.752	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG00268	0.771	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG00419	0.666	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG00759	0.58	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG01051	0.637	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG01112	0.508	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG01500	0.649	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG01565	0.691	0.833	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG01583	0.831	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG01595	0.597	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG01879	0.508	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG02568	0.628	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG02922	0.636	0.766	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG03006	0.664	0.8	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG03052	0.831	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG03642	1.05	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	HG03742	0.802	0.966	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA12878	0.825	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA18525	0.654	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA18939	0.87	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA19017	0.68	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA19238	0.344	0.415	0.031	0.059	nan	nan	0	1
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA19239	0.292	0.351	0.018	0.057	nan	nan	0	1
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA19625	0.592	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA19648	0.571	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA20502	0.737	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	39864621	39865203	DEL	583	NA20845	0.6	0.723	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG00096	0.881	0.927	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG00268	0.731	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG00419	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG00759	0.555	0.584	0.06	0.0	0.254	0.272	18	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG01051	0.716	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG01112	0.508	0.535	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG01500	0.325	0.342	0.068	0.003	nan	nan	0	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG01565	0.691	0.728	0.029	0.023	nan	nan	0	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG01583	0.443	0.467	0.043	0.0	nan	nan	0	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG01595	0.0	0.0	0.319	0.021	nan	nan	0	0
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG01879	0.84	0.884	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG02568	0.67	0.705	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG02922	0.916	0.964	0.0	0.0	0.808	0.741	2	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG03006	1.04	1.095	0.0	0.002	0.533	0.567	1	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG03052	0.629	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG03642	0.3	0.316	0.019	0.006	0.5	0.5	11	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	HG03742	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA12878	0.45	0.474	0.074	0.002	0.205	0.216	8	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA18525	0.5	0.527	0.1	0.002	0.391	0.391	11	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA18939	0.0	0.0	0.268	0.0	nan	nan	0	0
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA19017	0.856	0.901	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA19238	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA19239	0.844	0.889	0.01	0.001	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA19625	0.355	0.374	0.07	0.0	0.5	0.5	15	1
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA19648	0.485	0.511	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA20502	0.0	0.0	0.346	0.0	nan	nan	0	0
chr22	43101430	43102189	DEL	760	NA20845	0.418	0.44	0.073	0.028	0.286	0.286	3	1
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG00096	0.817	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG00268	0.812	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG00419	0.927	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG00759	0.833	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG01051	0.716	0.823	0.0	0.0	0.4	0.4	3	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG01112	0.855	0.983	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG01500	0.779	0.895	0.0	0.0	0.766	0.766	2	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG01565	0.794	0.912	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG01583	0.97	1.114	0.0	0.012	0.474	0.474	1	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG01595	0.597	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG01879	0.884	1.016	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG02568	1.172	1.347	0.0	0.0	0.519	0.519	2	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG02922	0.407	0.468	0.048	0.024	nan	nan	0	1
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG03006	0.863	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG03052	0.956	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG03642	0.69	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	HG03742	1.045	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA12878	0.787	0.905	0.0	0.0	0.762	0.724	1	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA18525	1.02	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA18939	0.739	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA19017	1.053	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA19238	0.97	1.115	0.0	0.0	0.948	0.947	2	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA19239	0.921	1.059	0.0	0.0	0.843	0.843	2	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA19625	0.858	0.986	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA19648	0.828	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA20502	0.921	1.059	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr22	43595149	43595747	DEL	599	NA20845	1.096	1.26	0.0	0.0	0.444	0.444	2	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG00096	0.924	1.113	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG00268	0.69	0.831	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG00419	0.785	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG00759	0.656	0.79	0.0	0.0	0.588	0.63	1	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG01051	0.398	0.479	0.086	0.037	nan	nan	0	1
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG01112	0.832	1.002	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG01500	0.757	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG01565	0.845	1.018	0.0	0.0	0.585	0.585	2	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG01583	0.831	1.001	0.0	0.0	0.847	0.847	2	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG01595	0.753	0.907	0.0	0.0	0.583	0.538	3	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG01879	0.729	0.879	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG02568	0.837	1.009	0.0	0.0	0.602	0.602	4	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG02922	0.738	0.889	0.0	0.0	0.75	0.818	3	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG03006	0.819	0.986	0.0	0.0	0.857	0.807	3	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG03052	0.453	0.546	0.032	0.004	nan	nan	0	1
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG03642	0.81	0.976	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	HG03742	0.729	0.878	0.0	0.0	0.869	0.869	2	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA12878	0.637	0.768	0.0	0.0	0.851	0.809	4	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA18525	0.866	1.043	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA18939	0.826	0.996	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA19017	0.955	1.15	0.0	0.0	0.824	0.778	5	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA19238	0.407	0.49	0.146	0.024	nan	nan	0	1
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA19239	0.844	1.017	0.0	0.0	0.772	0.772	2	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA19625	0.976	1.176	0.0	0.0	0.788	0.788	2	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA19648	0.885	1.067	0.0	0.0	0.792	0.792	4	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA20502	0.816	0.983	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr22	44930937	44931900	DEL	964	NA20845	0.809	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG00096	0.473	0.525	0.092	0.014	nan	nan	0	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG00268	0.487	0.541	0.039	0.003	nan	nan	0	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG00419	0.797	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG00759	0.934	1.037	0.0	0.0	0.667	0.633	7	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG01051	0.822	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG01112	0.832	0.924	0.008	0.0	0.8	0.8	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG01500	0.822	0.914	0.0	0.005	0.789	0.789	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG01565	0.896	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG01583	0.222	0.246	0.106	0.019	nan	nan	0	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG01595	0.805	0.894	0.0	0.0	0.75	0.692	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG01879	0.774	0.86	0.008	0.0	0.304	0.304	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG02568	0.837	0.93	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG02922	0.432	0.481	0.043	0.008	nan	nan	0	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG03006	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG03052	0.856	0.951	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG03642	0.87	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	HG03742	0.0	0.0	0.173	0.017	nan	nan	0	0
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA12878	0.619	0.687	0.044	0.016	0.235	0.248	3	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA18525	0.827	0.919	0.0	0.0	0.864	0.864	8	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA18939	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA19017	0.0	0.0	0.126	0.113	nan	nan	0	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA19238	0.423	0.47	0.022	0.005	nan	nan	0	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA19239	0.798	0.887	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA19625	0.562	0.624	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA19648	0.828	0.92	0.006	0.0	1.0	1.0	1	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA20502	1.053	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	45252401	45253090	DEL	690	NA20845	0.914	1.015	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG00096	0.731	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG00268	0.812	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG00419	0.642	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG00759	0.707	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG01051	0.318	0.403	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG01112	0.555	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG01500	1.125	1.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG01565	0.666	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG01583	0.748	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG01595	0.623	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG01879	0.774	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG02568	1.046	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG02922	0.661	0.837	0.0	0.0	0.5	0.458	1	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG03006	0.642	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG03052	0.503	0.637	0.0	0.087	0.227	0.227	1	1
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG03642	1.08	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	HG03742	0.559	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA12878	0.787	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA18525	0.943	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA18939	0.696	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA19017	0.263	0.333	0.0	0.066	0.583	0.618	1	1
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA19238	0.83	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA19239	0.982	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA19625	0.976	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA19648	0.628	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA20502	1.185	1.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	46751698	46751800	DEL	103	NA20845	0.783	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG00096	1.053	1.17	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG00268	1.096	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG00419	0.88	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG00759	0.858	0.953	0.0	0.0	0.8	0.857	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG01051	0.902	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG01112	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG01500	0.779	0.866	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG01565	0.794	0.882	0.0	0.0	0.779	0.779	2	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG01583	0.803	0.893	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG01595	1.143	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG01879	1.127	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG02568	1.005	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG02922	0.585	0.65	0.084	0.088	0.25	0.273	1	1
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG03006	0.841	0.934	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG03052	1.082	1.203	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG03642	0.78	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	HG03742	1.02	1.134	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA12878	0.825	0.917	0.0	0.0	0.636	0.67	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA18525	0.885	0.983	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA18939	1.109	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA19017	1.163	1.292	0.0	0.0	0.724	0.683	2	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA19238	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA19239	0.982	1.091	0.0	0.0	0.913	0.913	2	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA19625	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA19648	1.028	1.142	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA20502	0.948	1.053	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr22	47689104	47689576	DEL	473	NA20845	0.705	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG00096	0.516	0.621	0.013	0.065	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG00268	0.852	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG00419	0.737	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG00759	0.454	0.547	0.0	0.0	0.75	0.7	1	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG01051	0.0	0.0	0.026	0.132	nan	nan	0	0
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG01112	0.0	0.0	0.046	0.16	nan	nan	0	0
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG01500	1.19	1.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG01565	0.486	0.586	0.034	0.059	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG01583	0.36	0.434	0.011	0.066	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG01595	0.701	0.845	0.0	0.0	0.615	0.568	1	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG01879	0.0	0.0	0.022	0.192	nan	nan	0	0
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG02568	0.0	0.0	0.048	0.095	nan	nan	0	0
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG02922	0.56	0.674	0.036	0.042	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG03006	0.752	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG03052	0.0	0.0	0.089	0.288	nan	nan	0	0
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG03642	0.39	0.47	0.035	0.123	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	HG03742	0.705	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA12878	0.637	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA18525	0.731	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA18939	0.957	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA19017	0.373	0.449	0.007	0.059	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA19238	0.438	0.528	0.006	0.103	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA19239	0.353	0.425	0.004	0.114	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA19625	0.799	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA19648	0.485	0.585	0.009	0.088	nan	nan	0	1
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA20502	0.79	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	47696468	47696864	DEL	397	NA20845	0.679	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG00096	0.0	0.0	0.009	0.111	nan	nan	0	0
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG00268	0.507	0.611	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG00419	1.141	1.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG00759	0.959	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG01051	0.265	0.32	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG01112	0.347	0.418	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG01565	0.717	0.864	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG01583	0.443	0.534	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG01595	0.415	0.501	0.02	0.082	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG01879	0.752	0.905	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG02568	0.293	0.353	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG02922	0.865	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG03006	0.885	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG03052	0.73	0.879	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG03642	1.14	1.373	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	HG03742	0.972	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA12878	0.319	0.384	0.009	0.066	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA18525	0.885	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA18939	0.348	0.419	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA19017	0.812	0.978	0.0	0.0	0.941	0.997	1	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA19238	0.751	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA19239	0.43	0.518	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA19625	0.237	0.285	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA19648	0.371	0.447	0.011	0.096	nan	nan	0	1
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA20502	0.737	0.888	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr22	49077605	49077889	DEL	285	NA20845	0.94	1.132	0.0	0.006	0.5	0.5	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG00096	0.666	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG00268	1.055	1.272	0.0	0.009	0.871	0.871	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG00419	0.713	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG00759	0.757	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG01051	0.637	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG01112	0.763	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG01500	0.952	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG01565	0.87	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG01583	0.886	1.068	0.0	0.006	0.846	0.846	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG01595	0.727	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG01879	0.685	0.826	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG02568	0.586	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG02922	0.763	0.919	0.0	0.0	0.75	0.688	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG03006	0.619	0.746	0.0	0.0	0.917	0.974	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG03052	0.982	1.183	0.0	0.012	0.684	0.684	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG03642	0.93	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	HG03742	0.753	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA12878	0.806	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA18525	0.904	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA18939	0.826	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA19017	0.987	1.19	0.0	0.0	0.833	0.882	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA19238	0.861	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA19239	0.844	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA19625	0.769	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA19648	0.885	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA20502	0.842	1.015	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr22	50173550	50174212	DEL	663	NA20845	0.966	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG00096	1.268	1.334	0.0	0.0	0.877	0.877	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG00268	0.995	1.047	0.0	0.0	0.783	0.783	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG00419	1.189	1.252	0.0	0.0	0.682	0.682	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG00759	1.035	1.089	0.0	0.0	0.555	0.595	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG01051	0.955	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG01112	1.063	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG01500	1.082	1.139	0.0	0.0	0.542	0.542	1	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG01565	1.203	1.267	0.006	0.0	0.556	0.556	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG01583	1.205	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG01595	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG01879	1.282	1.35	0.0	0.0	0.687	0.687	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG02568	1.298	1.366	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG02922	1.043	1.098	0.0	0.0	0.8	0.825	3	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG03006	0.996	1.048	0.0	0.0	0.682	0.642	3	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG03052	1.057	1.113	0.0	0.0	0.774	0.774	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG03642	0.72	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	HG03742	1.142	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA12878	1.181	1.243	0.0	0.0	0.931	0.98	3	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA18525	0.924	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA18939	1.065	1.122	0.0	0.0	0.845	0.845	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA19017	0.571	0.601	0.072	0.037	nan	nan	0	1
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA19238	0.97	1.021	0.0	0.0	0.844	0.876	1	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA19239	1.013	1.066	0.0	0.0	0.732	0.732	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA19625	0.976	1.027	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA19648	1.342	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA20502	1.0	1.053	0.0	0.0	0.879	0.879	2	2
chr22	50975825	50976604	DEL	780	NA20845	1.122	1.181	0.0	0.0	0.579	0.579	2	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG00096	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG00268	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG00419	0.0	0.0	0.194	0.14	nan	nan	0	0
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG00759	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG01051	1.106	1.074	0.0	0.0	0.581	0.581	1	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG01112	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG01500	0.569	0.553	0.066	0.051	nan	nan	0	1
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG01565	1.091	1.059	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG01583	1.093	1.061	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG01595	1.125	1.092	0.0	0.0	0.759	0.801	1	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG01879	1.149	1.115	0.0	0.0	0.946	0.946	1	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG02568	1.177	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG02922	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG03006	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG03052	1.121	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG03642	0.42	0.408	0.084	0.047	0.25	0.232	1	1
chr3	100521568	100522471	DEL	904	HG03742	0.385	0.374	0.093	0.067	nan	nan	0	1
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA12878	0.406	0.394	0.032	0.032	nan	nan	0	1
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA18525	1.208	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA18939	1.068	1.037	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA19017	1.033	1.003	0.0	0.0	0.526	0.503	1	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA19238	0.951	0.923	0.0	0.0	0.968	0.968	1	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA19239	0.981	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA19625	1.467	1.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA19648	0.0	0.0	0.267	0.195	nan	nan	0	0
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA20502	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	100521568	100522471	DEL	904	NA20845	0.542	0.526	0.097	0.065	nan	nan	0	1
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG00096	0.904	1.004	0.006	0.0	0.722	0.692	3	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG00268	0.757	0.841	0.005	0.002	0.804	0.771	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG00419	0.834	0.926	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG00759	0.679	0.754	0.0	0.0	0.788	0.788	4	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG01051	0.724	0.804	0.0	0.0	0.532	0.532	4	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG01112	0.669	0.743	0.0	0.0	0.65	0.65	3	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG01500	0.89	0.989	0.0	0.0	0.893	0.892	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG01565	0.803	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG01583	0.841	0.934	0.0	0.0	0.538	0.538	3	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG01595	0.572	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG01879	0.7	0.778	0.0	0.0	0.402	0.402	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG02568	0.646	0.717	0.0	0.0	0.583	0.583	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG02922	0.644	0.715	0.0	0.0	0.533	0.533	3	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG03006	0.753	0.837	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG03052	0.592	0.658	0.0	0.0	0.7	0.7	5	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG03642	0.617	0.686	0.0	0.0	0.625	0.617	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	HG03742	0.655	0.728	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA12878	0.947	1.052	0.004	0.0	0.632	0.632	3	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA18525	0.946	1.051	0.004	0.0	0.442	0.44	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA18939	0.694	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA19017	0.646	0.718	0.0	0.0	0.929	0.896	3	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA19238	0.756	0.839	0.0	0.0	0.792	0.792	4	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA19239	0.426	0.473	0.111	0.007	nan	nan	0	1
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA19625	0.885	0.984	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA19648	0.699	0.776	0.0	0.0	0.768	0.768	2	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA20502	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10190058	10190864	DEL	807	NA20845	0.802	0.891	0.0	0.0	0.903	0.844	4	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG00096	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG00268	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG00419	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG00759	1.338	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG01051	0.563	0.547	0.0	0.018	0.556	0.556	1	1
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG01112	0.849	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG01500	1.05	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG01565	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG01583	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG01595	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG01879	1.292	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG02568	0.874	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG02922	1.308	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG03006	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG03052	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG03642	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	HG03742	1.021	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA12878	0.778	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA18525	1.059	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA18939	1.175	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA19017	1.162	1.129	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA19238	0.847	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA19239	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA19625	1.239	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA19648	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA20502	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	102956686	102956749	DEL	64	NA20845	1.366	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG00096	0.958	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG00268	1.428	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG00419	1.261	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG00759	1.59	1.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG01051	0.885	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG01112	0.669	0.625	0.0	0.035	0.886	0.886	1	1
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG01500	0.819	0.765	0.0	0.03	0.647	0.675	1	1
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG01565	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG01583	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG01595	1.302	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG01879	1.346	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG02568	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG02922	1.1	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG03006	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG03052	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG03642	1.334	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	HG03742	1.214	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA12878	1.065	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA18525	0.876	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA18939	1.406	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA19017	1.328	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA19238	0.443	0.414	0.0	0.054	0.8	0.8	1	1
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA19239	1.071	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA19625	0.683	0.638	0.0	0.045	0.6	0.6	1	1
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA20502	0.478	0.447	0.0	0.027	0.815	0.815	1	1
chr3	103308592	103308664	DEL	73	NA20845	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG00096	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG00268	0.482	0.468	0.0	0.061	0.771	0.804	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG00419	0.651	0.632	0.008	0.04	0.474	0.474	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG00759	1.396	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG01051	0.402	0.39	0.0	0.043	0.696	0.696	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG01112	0.651	0.632	0.0	0.049	0.472	0.472	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG01500	0.676	0.657	0.0	0.06	0.581	0.607	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG01565	0.0	0.0	0.007	0.162	nan	nan	0	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG01583	0.577	0.56	0.0	0.054	0.524	0.524	1	2
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG01595	0.71	0.69	0.0	0.043	0.545	0.576	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG02568	1.557	1.512	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG02922	0.0	0.0	0.006	0.129	nan	nan	0	0
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG03006	0.0	0.0	0.007	0.118	nan	nan	0	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG03052	0.677	0.657	0.008	0.064	0.524	0.524	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG03642	1.581	1.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103431676	103431763	DEL	88	HG03742	0.79	0.767	0.004	0.047	0.617	0.617	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA12878	0.812	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA18525	0.543	0.527	0.0	0.065	0.474	0.493	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA18939	0.463	0.449	0.01	0.065	0.97	0.97	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA19017	0.517	0.502	0.0	0.093	1.0	0.957	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA19238	0.625	0.607	0.0	0.033	0.466	0.466	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA19239	0.703	0.683	0.0	0.052	0.478	0.478	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA19625	0.746	0.724	0.0	0.055	0.351	0.351	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.107	nan	nan	0	0
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA20502	0.82	0.796	0.0	0.043	0.535	0.535	1	1
chr3	103431676	103431763	DEL	88	NA20845	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG00096	0.994	0.965	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG00268	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG00419	0.712	0.691	0.059	0.051	nan	nan	0	1
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG00759	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG01051	0.965	0.937	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG01112	1.156	1.123	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG01500	1.317	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG01565	1.503	1.459	0.0	0.0	0.857	0.81	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG01583	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG01595	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG01879	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG02568	1.025	0.996	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG02922	0.914	0.887	0.0	0.0	0.542	0.542	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG03006	1.273	1.236	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG03052	1.121	1.088	0.006	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG03642	1.284	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	HG03742	0.906	0.879	0.0	0.007	0.59	0.59	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA18525	0.998	0.969	0.0	0.0	0.696	0.668	2	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA18939	0.943	0.916	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA19017	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA19238	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA19239	1.058	1.027	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA19625	1.037	1.007	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA19648	1.123	1.09	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA20502	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103870224	103870829	DEL	606	NA20845	0.932	0.905	0.0	0.0	0.905	0.84	1	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG00096	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG00268	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG00419	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG00759	0.717	0.697	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG01051	0.895	0.869	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG01112	0.849	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG01500	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG01565	0.329	0.32	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG01583	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG01595	0.888	0.862	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG01879	0.879	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG02568	0.646	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG02922	0.955	0.927	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG03006	0.986	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG03052	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG03642	0.84	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	HG03742	0.328	0.318	0.008	0.117	nan	nan	0	1
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA12878	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA18525	0.805	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA18939	0.392	0.38	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA19017	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA19238	0.938	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA19239	0.864	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA19625	0.708	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA19648	0.873	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA20502	0.66	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	103974703	103974892	DEL	190	NA20845	0.499	0.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG00096	0.452	0.439	0.083	0.05	nan	nan	0	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG00268	1.015	0.985	0.003	0.0	0.631	0.606	6	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG00419	1.057	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG00759	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG01051	1.005	0.976	0.0	0.004	0.72	0.72	7	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG01112	0.506	0.491	0.067	0.05	nan	nan	0	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG01500	0.516	0.501	0.095	0.043	nan	nan	0	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG01565	0.926	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG01583	0.408	0.397	0.069	0.061	nan	nan	0	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG01595	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG01879	1.023	0.993	0.0	0.0	0.486	0.486	5	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG02568	0.987	0.959	0.0	0.0	0.717	0.717	6	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG02922	1.1	1.068	0.0	0.0	0.609	0.609	3	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG03006	1.022	0.992	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG03052	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG03642	1.185	1.151	0.0	0.0	0.722	0.778	5	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	HG03742	0.636	0.617	0.073	0.047	nan	nan	0	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA12878	0.423	0.41	0.055	0.039	0.372	0.372	2	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA18525	1.086	1.054	0.0	0.0	0.935	0.898	5	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA18939	1.281	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA19017	0.554	0.537	0.075	0.054	nan	nan	0	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA19238	1.172	1.138	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA19239	1.084	1.052	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA19625	1.113	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA19648	0.0	0.0	0.405	0.234	nan	nan	0	0
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA20502	0.501	0.486	0.069	0.042	nan	nan	0	1
chr3	104278168	104279030	DEL	863	NA20845	1.236	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG00096	0.669	0.625	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG00268	0.722	0.675	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG00419	0.996	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG00759	0.524	0.489	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG01051	1.287	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG01112	0.94	0.878	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG01500	0.623	0.582	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG01565	0.865	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG01583	1.225	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG01595	0.572	0.535	0.016	0.05	nan	nan	0	1
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG01879	1.22	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG02568	0.836	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG02922	1.163	1.087	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG03006	1.489	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG03052	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG03642	1.013	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	HG03742	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA12878	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA18525	1.059	0.99	0.0	0.0	0.686	0.714	1	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA18939	0.641	0.599	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA19017	1.199	1.121	0.0	0.0	0.879	0.919	1	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA19238	1.029	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA19239	0.981	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA19625	0.632	0.591	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA19648	1.173	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA20502	0.501	0.468	0.008	0.069	nan	nan	0	2
chr3	104645425	104645596	DEL	172	NA20845	0.846	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG00096	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG00268	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG00419	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG00759	0.717	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG01051	0.915	0.915	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG01112	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG01500	0.73	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG01565	0.7	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG01583	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG01595	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG01879	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG02568	0.987	0.987	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG02922	0.81	0.81	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG03006	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG03052	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG03642	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	HG03742	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA12878	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA18525	0.7	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA18939	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA19017	0.369	0.369	0.0	0.042	0.958	0.998	1	1
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA19238	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA19239	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA19625	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA19648	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA20502	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10487001	10487064	DEL	64	NA20845	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG00096	1.248	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG00268	0.774	0.71	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG00419	1.078	0.989	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG00759	1.067	0.978	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG01051	1.046	0.959	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG01112	1.048	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG01500	0.783	0.718	0.019	0.067	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG01565	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG01583	1.273	1.168	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG01595	1.342	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG01879	1.22	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG02568	0.798	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG02922	1.474	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG03006	1.345	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG03052	1.459	1.338	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG03642	0.519	0.476	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr3	105775488	105775664	DEL	177	HG03742	1.214	1.114	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA12878	0.947	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA18525	1.156	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA18939	1.068	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA19017	1.07	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA19238	1.107	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA19239	1.213	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA19625	1.315	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA19648	1.322	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA20502	1.48	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105775488	105775664	DEL	177	NA20845	1.301	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG00096	1.049	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG00268	0.74	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG00419	1.281	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG00759	0.853	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG01051	0.925	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG01112	0.958	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG01500	0.925	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG01565	0.659	0.616	0.0	0.063	0.686	0.648	1	1
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG01583	0.769	0.719	0.009	0.053	0.31	0.31	1	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG01595	1.066	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG01879	0.772	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG02568	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG02922	0.706	0.66	0.007	0.057	0.367	0.367	1	1
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG03006	1.202	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG03052	0.423	0.395	0.0	0.074	0.9	0.9	1	1
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG03642	0.889	0.831	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	HG03742	0.328	0.306	0.0	0.048	0.7	0.7	1	1
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA12878	0.998	0.932	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA18525	0.893	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA18939	0.854	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA19017	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA19238	0.638	0.597	0.0	0.037	0.522	0.522	1	1
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA19625	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA19648	1.272	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA20502	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	105848050	105848138	DEL	89	NA20845	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.225	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG00268	0.034	0.033	0.005	0.185	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG00419	0.0	0.0	0.004	0.152	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG00759	0.0	0.0	0.007	0.199	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG01051	0.0	0.0	0.007	0.166	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.209	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.197	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.158	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG01583	0.024	0.023	0.0	0.127	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.185	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG02922	0.021	0.02	0.006	0.137	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA18525	0.0	0.0	0.007	0.169	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.202	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA19648	0.025	0.024	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA20502	0.023	0.022	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr3	106813625	106813789	DEL	165	NA20845	0.0	0.0	0.006	0.186	nan	nan	0	0
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG00096	1.067	1.067	0.0	0.0	0.839	0.804	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG00268	0.826	0.826	0.008	0.0	0.957	0.996	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG00419	0.691	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG00759	0.776	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG01051	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG01112	1.03	1.03	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG01500	0.783	0.783	0.0	0.0	0.842	0.807	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG01565	1.05	1.05	0.0	0.0	0.889	0.84	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG01583	1.081	1.081	0.0	0.0	0.938	0.937	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG01595	0.888	0.888	0.0	0.0	0.778	0.821	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG01879	0.467	0.467	0.055	0.048	0.5	0.5	1	1
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG02568	1.215	1.215	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG02922	0.436	0.436	0.053	0.04	nan	nan	0	1
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG03006	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG03052	0.507	0.507	0.068	0.04	0.8	0.8	1	1
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG03642	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	HG03742	0.964	0.964	0.0	0.0	0.591	0.591	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA12878	0.862	0.862	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA18525	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA18939	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA19017	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA19238	0.938	0.938	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA19239	1.097	1.097	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA19625	0.961	0.961	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA19648	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA20502	1.093	1.093	0.0	0.0	0.48	0.48	1	2
chr3	107997419	107998041	DEL	623	NA20845	1.008	1.008	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG00096	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG00268	0.722	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG00419	0.559	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG00759	0.659	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG01051	0.543	0.624	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG01112	0.506	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG01500	0.854	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG01565	0.453	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG01583	0.529	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG01595	0.631	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG01879	0.682	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG02568	0.836	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG02922	0.498	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG03006	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG03052	0.507	0.583	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG03642	0.815	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	HG03742	0.771	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA12878	0.778	0.894	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA18525	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA18939	0.427	0.491	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA19017	0.701	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA19238	0.703	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA19239	0.697	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA19625	0.658	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA19648	1.098	1.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA20502	1.116	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10821757	10821920	DEL	164	NA20845	0.239	0.274	0.013	0.057	nan	nan	0	1
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG00096	0.615	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG00268	0.585	0.616	0.0	0.0	0.364	0.349	1	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG00419	0.549	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG00759	0.621	0.653	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG01051	0.583	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG01112	0.56	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG01500	0.587	0.618	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG01565	0.659	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG01583	0.697	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG01595	0.474	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG01879	0.377	0.397	0.076	0.003	0.8	0.8	5	1
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG02568	0.532	0.56	0.0	0.0	0.562	0.562	2	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG03006	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG03052	0.634	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG03642	0.766	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	HG03742	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA12878	0.862	0.908	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA18525	0.823	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA18939	0.445	0.468	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA19017	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA19238	0.3	0.315	0.114	0.0	0.542	0.542	6	1
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA19239	0.645	0.679	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA19625	0.607	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA19648	0.499	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA20502	0.615	0.647	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr3	108599221	108600080	DEL	860	NA20845	0.564	0.593	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG00096	0.344	0.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG00268	0.378	0.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG00419	0.336	0.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG00759	0.427	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG01051	0.322	0.312	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG01112	0.461	0.447	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG01500	0.498	0.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG01565	0.35	0.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG01583	0.192	0.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG01595	0.296	0.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG02568	0.228	0.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG02922	0.27	0.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG03006	0.305	0.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG03052	0.275	0.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG03642	0.408	0.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	HG03742	0.385	0.374	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA12878	0.49	0.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA18525	0.613	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA18939	0.32	0.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA19017	0.369	0.358	0.0	0.0	0.75	0.717	1	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA19238	0.326	0.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA19239	0.387	0.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA19625	0.379	0.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA19648	0.412	0.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA20502	0.296	0.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	109153079	109153198	DUP	120	NA20845	0.369	0.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG00096	0.723	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG00268	0.654	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG00419	0.732	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG00759	0.233	0.259	0.042	0.09	nan	nan	0	1
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG01051	0.623	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG01112	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG01500	0.765	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG01565	0.556	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG01583	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG01595	0.0	0.0	0.155	0.162	nan	nan	0	0
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG01879	0.754	0.838	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG02568	0.836	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG02922	0.623	0.692	0.0	0.011	0.556	0.556	1	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG03006	0.646	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG03052	0.465	0.517	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG03642	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	HG03742	0.578	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA12878	0.659	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA18525	0.77	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA18939	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA19017	0.627	0.697	0.0	0.0	0.846	0.885	1	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA19238	0.86	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA19239	0.671	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA19625	0.708	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA19648	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA20502	0.524	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	10991769	10992269	DEL	501	NA20845	0.65	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG00096	0.362	0.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG00268	0.232	0.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG00419	0.081	0.086	0.047	0.134	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG00759	0.601	0.633	0.037	0.228	nan	nan	0	0
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG01051	0.241	0.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG01112	0.289	0.304	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG01500	0.534	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG01565	0.371	0.39	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG01583	0.264	0.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG01595	0.0	0.0	0.043	0.178	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG01879	0.144	0.151	0.022	0.117	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG02568	0.0	0.0	0.059	0.236	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG02922	0.021	0.022	0.041	0.207	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG03006	0.108	0.113	0.015	0.114	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG03052	0.063	0.067	0.041	0.117	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG03642	0.099	0.104	0.021	0.153	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	HG03742	0.106	0.112	0.028	0.099	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA12878	0.245	0.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA18525	0.088	0.092	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA18939	0.018	0.019	0.035	0.21	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA19017	0.24	0.252	0.029	0.114	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA19238	0.0	0.0	0.007	0.237	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA19239	0.09	0.095	0.005	0.11	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA19625	0.076	0.08	0.008	0.103	nan	nan	0	1
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA19648	0.225	0.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA20502	0.137	0.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	115024235	115024576	DEL	342	NA20845	0.304	0.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG00096	0.0	0.0	0.039	0.243	nan	nan	0	0
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG00268	0.826	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG00419	0.366	0.407	0.013	0.069	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG00759	0.0	0.0	0.053	0.22	nan	nan	0	0
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG01051	0.382	0.425	0.016	0.07	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG01112	0.47	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG01500	0.516	0.573	0.023	0.042	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG01565	0.35	0.389	0.013	0.066	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG01583	0.721	0.801	0.0	0.0	0.235	0.235	1	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG01595	0.0	0.0	0.009	0.199	nan	nan	0	0
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG01879	0.467	0.518	0.009	0.081	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG02568	1.177	1.308	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG02922	0.81	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG03006	0.807	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG03052	0.444	0.493	0.009	0.076	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG03642	0.667	0.741	0.011	0.087	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	HG03742	0.752	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA12878	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA18525	0.333	0.37	0.008	0.084	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA18939	0.338	0.376	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA19017	0.701	0.779	0.0	0.0	0.623	0.651	2	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA19238	0.716	0.796	0.0	0.0	0.314	0.314	1	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA19239	0.826	0.917	0.0	0.0	0.514	0.514	1	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA19625	0.809	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA19648	0.948	1.053	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA20502	0.729	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	116204836	116205180	DEL	345	NA20845	0.39	0.434	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG00096	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG00268	1.324	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG00419	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG00759	1.454	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG01051	1.247	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG01112	1.102	1.03	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG01500	1.121	1.048	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG01565	0.947	0.885	0.0	0.0	0.958	0.905	2	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG01583	1.033	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG01595	1.184	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG01879	1.508	1.409	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG02568	1.063	0.994	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG02922	1.038	0.97	0.0	0.004	0.667	0.667	1	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG03006	1.22	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG03052	1.416	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG03642	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	HG03742	1.021	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA12878	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA18525	1.033	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA18939	1.175	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA19017	1.089	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA19238	0.677	0.633	0.003	0.075	nan	nan	0	1
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA19239	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA19625	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA19648	0.923	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA20502	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	117975610	117975970	DEL	361	NA20845	0.997	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG00096	0.0	0.0	0.013	0.191	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.176	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG00759	0.0	0.0	0.004	0.186	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG01051	0.563	0.517	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG01112	0.524	0.481	0.004	0.104	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG01500	0.623	0.571	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG01565	0.7	0.642	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG01583	0.601	0.551	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG01595	0.0	0.0	0.008	0.138	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG01879	1.131	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG02568	1.215	1.115	0.0	0.006	0.667	0.667	1	2
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG02922	0.0	0.0	0.006	0.137	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG03006	1.345	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG03052	0.0	0.0	0.007	0.137	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	HG03742	0.655	0.601	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA12878	0.0	0.0	0.005	0.175	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.184	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA18939	0.0	0.0	0.013	0.188	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA19017	0.0	0.0	0.005	0.181	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA19238	1.042	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA19239	1.2	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA19625	0.632	0.58	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA19648	0.549	0.504	0.008	0.087	nan	nan	0	1
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr3	118281607	118281829	DEL	223	NA20845	0.0	0.0	0.021	0.195	nan	nan	0	0
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG00096	0.669	0.704	0.01	0.02	0.489	0.478	2	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG00268	0.808	0.851	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG00419	0.549	0.578	0.03	0.042	0.529	0.529	5	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG00759	0.902	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG01051	0.523	0.55	0.046	0.056	0.611	0.611	5	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG01112	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG01500	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG01565	0.926	0.975	0.005	0.0	0.895	0.947	1	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG01583	0.673	0.708	0.025	0.035	0.526	0.526	2	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG01595	0.493	0.519	0.012	0.025	0.431	0.455	4	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG01879	1.059	1.115	0.0	0.0	0.907	0.907	2	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG02568	0.987	1.039	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG02922	0.727	0.765	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG03006	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG03052	0.92	0.968	0.0	0.0	0.461	0.461	2	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG03642	0.519	0.546	0.017	0.025	0.469	0.505	4	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	HG03742	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA12878	1.201	1.264	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA18525	0.508	0.535	0.014	0.042	0.5	0.521	4	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA18939	1.014	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA19017	0.849	0.893	0.0	0.0	0.826	0.79	1	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA19238	0.404	0.425	0.015	0.058	0.815	0.815	3	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA19239	0.452	0.475	0.0	0.03	0.387	0.387	1	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA19625	0.0	0.0	0.061	0.102	nan	nan	0	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA19648	1.148	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA20502	0.638	0.671	0.028	0.037	0.385	0.385	5	1
chr3	119419835	119420548	DEL	714	NA20845	0.672	0.708	0.0	0.0	0.733	0.79	3	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG00096	0.56	0.59	0.013	0.04	nan	nan	0	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG00268	0.671	0.706	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG00419	0.508	0.535	0.048	0.083	0.529	0.529	3	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG00759	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG01051	0.483	0.508	0.068	0.116	0.611	0.611	3	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG01112	0.632	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG01500	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG01565	0.824	0.867	0.0	0.0	0.895	0.947	1	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG01583	0.601	0.632	0.039	0.072	nan	nan	0	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG01595	0.414	0.436	0.022	0.052	0.316	0.333	2	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG01879	1.041	1.096	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG02568	0.949	0.999	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG03006	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG03052	0.909	0.957	0.0	0.0	0.461	0.461	2	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG03642	0.494	0.52	0.026	0.051	0.4	0.431	2	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	HG03742	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA12878	1.353	1.424	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA18525	0.455	0.479	0.016	0.086	0.5	0.521	2	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA18939	0.979	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA19017	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA19238	0.365	0.384	0.012	0.117	0.833	0.833	2	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA19239	0.426	0.448	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA19625	0.0	0.0	0.099	0.203	nan	nan	0	0
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA19648	1.198	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA20502	0.569	0.599	0.035	0.074	0.385	0.385	3	1
chr3	119419882	119420336	DEL	455	NA20845	0.607	0.639	0.0	0.0	0.679	0.731	2	2
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG00096	0.47	0.522	0.07	0.129	nan	nan	0	1
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG00268	0.516	0.573	0.024	0.074	nan	nan	0	1
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG00419	0.0	0.0	0.122	0.189	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG00759	0.0	0.0	0.136	0.362	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG01051	0.0	0.0	0.095	0.286	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG01112	0.0	0.0	0.102	0.302	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG01500	0.0	0.0	0.076	0.214	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG01565	0.0	0.0	0.339	0.333	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG01583	0.0	0.0	0.122	0.263	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG01595	0.0	0.0	0.124	0.238	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG01879	0.0	0.0	0.061	0.295	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG02568	0.0	0.0	0.08	0.28	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG02922	0.0	0.0	0.086	0.151	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG03006	0.0	0.0	0.179	0.314	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG03052	0.0	0.0	0.064	0.234	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG03642	0.0	0.0	0.056	0.139	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	HG03742	0.0	0.0	0.143	0.303	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA12878	0.0	0.0	0.038	0.215	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA18525	0.473	0.525	0.018	0.099	nan	nan	0	1
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA18939	0.0	0.0	0.075	0.285	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA19017	0.517	0.574	0.017	0.056	nan	nan	0	1
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA19238	0.0	0.0	0.041	0.282	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA19239	0.0	0.0	0.021	0.271	nan	nan	0	0
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA19625	0.354	0.393	0.039	0.104	nan	nan	0	1
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA19648	0.499	0.554	0.041	0.075	nan	nan	0	1
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA20502	0.478	0.531	0.061	0.09	nan	nan	0	1
chr3	119893984	119894448	DEL	465	NA20845	0.0	0.0	0.12	0.255	nan	nan	0	0
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG00096	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG00268	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG00419	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG00759	1.067	1.067	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG01051	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG01112	0.795	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG01500	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG01565	1.132	1.132	0.0	0.0	0.483	0.511	1	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG01583	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG01595	1.263	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG01879	1.041	1.041	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG02568	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG02922	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG03006	1.076	1.076	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG03052	0.338	0.338	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG03642	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	HG03742	1.041	1.041	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA12878	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA18525	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA18939	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA19017	1.07	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA19238	1.016	1.016	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA19239	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA19625	0.809	0.809	0.0	0.0	0.364	0.364	1	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA19648	1.098	1.098	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA20502	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	120845888	120846078	DEL	191	NA20845	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG00096	0.777	0.818	0.0	0.0	0.929	0.969	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG00268	0.74	0.779	0.0	0.0	0.615	0.591	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG00419	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG00759	0.659	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG01051	0.543	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG01112	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG01500	0.783	0.824	0.004	0.004	0.538	0.562	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG01565	0.618	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG01583	0.529	0.556	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG01595	0.395	0.415	0.056	0.0	0.25	0.264	3	1
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG01879	0.592	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG02568	0.646	0.68	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG02922	0.748	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG03006	0.664	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG03052	0.571	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG03642	0.716	0.754	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	HG03742	0.559	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA12878	0.795	0.837	0.0	0.003	0.889	0.889	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA18525	0.0	0.0	0.352	0.014	nan	nan	0	0
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA18939	0.623	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA19017	0.886	0.932	0.0	0.0	0.818	0.783	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA19238	0.756	0.795	0.0	0.0	0.792	0.792	2	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA19239	0.697	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA19625	0.632	0.666	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA19648	0.649	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA20502	0.797	0.839	0.0	0.005	0.727	0.727	1	2
chr3	121272649	121273453	DEL	805	NA20845	0.672	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG00096	0.868	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG00268	0.894	0.994	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG00419	1.017	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG00759	0.64	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG01051	0.925	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG01112	0.867	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG01500	0.89	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG01565	1.277	1.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG01583	0.961	1.068	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG01595	0.987	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG01879	0.359	0.399	0.0	0.06	0.84	0.84	1	1
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG02568	0.836	0.928	0.0	0.071	0.704	0.704	1	1
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG02922	0.851	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG03006	1.022	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG03052	0.846	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG03642	1.111	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	HG03742	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA12878	1.184	1.315	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA18525	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA18939	0.908	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA19017	0.387	0.431	0.0	0.06	1.0	0.957	1	1
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA19238	0.86	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA19239	0.929	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA19625	1.189	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA19648	1.023	1.137	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA20502	0.433	0.481	0.0	0.02	0.556	0.556	1	2
chr3	121821716	121821780	DEL	65	NA20845	1.171	1.301	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG00096	1.32	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG00268	1.41	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG00419	0.366	0.355	0.0	0.02	0.957	0.957	1	1
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG01051	1.207	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG01112	1.355	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG01500	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG01565	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG01583	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG01595	0.71	0.69	0.0	0.018	0.697	0.736	1	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG01879	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG02568	0.987	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG02922	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG03006	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG03052	1.078	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG03642	0.445	0.432	0.0	0.039	0.9	0.836	1	1
chr3	121863279	121863336	DEL	58	HG03742	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA12878	0.727	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA19017	1.236	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA19238	1.224	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA19239	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA19625	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA19648	1.472	1.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA20502	1.378	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	121863279	121863336	DEL	58	NA20845	0.0	0.0	0.007	0.08	nan	nan	0	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG00096	0.434	0.499	0.0	0.04	0.833	0.87	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG01500	0.623	0.716	0.0	0.043	0.7	0.73	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG02568	0.532	0.611	0.0	0.041	0.692	0.692	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG02922	0.457	0.525	0.0	0.02	0.6	0.6	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG03052	0.402	0.462	0.0	0.045	0.632	0.632	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA12878	0.355	0.408	0.0	0.034	0.875	0.875	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA18525	1.138	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA19017	0.295	0.339	0.0	0.035	0.593	0.567	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA19238	0.365	0.419	0.0	0.029	0.677	0.677	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA19239	0.49	0.564	0.0	0.048	0.651	0.651	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA19625	0.202	0.233	0.0	0.019	0.667	0.667	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA20502	0.569	0.654	0.0	0.02	0.615	0.615	1	1
chr3	12196517	12196572	DEL	56	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG00096	0.777	0.777	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG00268	1.187	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG00419	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG00759	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG01051	1.227	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG01112	1.446	1.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG01500	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG01565	1.379	1.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG01583	1.297	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG01595	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG01879	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG02568	1.443	1.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG02922	0.831	0.831	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG03006	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG03052	0.655	0.655	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG03642	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	HG03742	1.156	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA12878	0.795	0.795	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA18525	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA18939	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA19017	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA19238	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA19239	0.852	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA19625	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA19648	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA20502	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12364839	12364963	DEL	125	NA20845	1.193	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG00096	0.0	0.0	0.324	0.176	nan	nan	0	0
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG00268	1.049	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG00419	0.935	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG00759	0.0	0.0	0.389	0.217	nan	nan	0	0
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG01051	0.442	0.466	0.068	0.054	nan	nan	0	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG01112	0.56	0.59	0.063	0.039	nan	nan	0	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG01500	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG01565	0.762	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG01583	0.432	0.455	0.084	0.038	nan	nan	0	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG01595	0.73	0.768	0.0	0.0	0.933	0.985	1	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG01879	0.395	0.416	0.047	0.04	0.12	0.12	2	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG02568	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG02922	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG03006	0.448	0.472	0.084	0.061	nan	nan	0	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG03052	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG03642	0.445	0.468	0.049	0.034	nan	nan	0	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	HG03742	0.347	0.365	0.104	0.075	nan	nan	0	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA12878	0.0	0.0	0.304	0.187	nan	nan	0	0
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA18525	1.068	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA18939	0.0	0.0	0.309	0.215	nan	nan	0	0
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA19017	0.996	1.049	0.006	0.0	0.759	0.793	1	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA19238	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA19239	0.516	0.543	0.124	0.069	nan	nan	0	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA19625	0.455	0.479	0.069	0.032	0.444	0.444	3	1
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA19648	0.0	0.0	0.243	0.142	nan	nan	0	0
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA20502	1.07	1.126	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr3	124936320	124937213	DEL	894	NA20845	0.499	0.525	0.083	0.061	nan	nan	0	1
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG00096	0.651	0.748	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG00268	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG00419	0.336	0.386	0.066	0.052	nan	nan	0	1
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG00759	0.601	0.691	0.0	0.0	0.778	0.778	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG01051	0.603	0.693	0.0	0.0	0.867	0.867	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG01112	0.434	0.498	0.0	0.0	0.697	0.697	4	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG01500	0.676	0.777	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG01565	0.597	0.686	0.0	0.0	0.889	0.918	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG01583	0.841	0.967	0.0	0.0	0.804	0.804	4	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG01595	0.552	0.635	0.0	0.0	0.571	0.603	1	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG01879	0.7	0.805	0.0	0.0	0.905	0.905	2	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG02568	0.494	0.568	0.098	0.081	nan	nan	0	1
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG02922	0.519	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG03006	0.556	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG03052	0.507	0.583	0.079	0.061	nan	nan	0	1
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG03642	0.766	0.88	0.0	0.0	0.833	0.774	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	HG03742	0.54	0.62	0.0	0.0	0.571	0.571	6	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA12878	0.829	0.952	0.004	0.0	0.65	0.65	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA18525	0.735	0.845	0.011	0.0	0.864	0.84	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA18939	0.587	0.675	0.0	0.0	0.824	0.824	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA19017	0.277	0.318	0.073	0.063	nan	nan	0	1
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA19238	0.729	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA19239	0.793	0.912	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA19625	0.784	0.901	0.0	0.0	0.719	0.719	4	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA19648	0.898	1.032	0.0	0.003	0.575	0.575	4	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA20502	0.774	0.89	0.0	0.0	0.733	0.733	5	2
chr3	125398960	125399871	DEL	912	NA20845	0.607	0.698	0.0	0.0	0.8	0.743	5	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG00096	0.832	0.777	0.0	0.0	0.76	0.728	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG00268	0.963	0.9	0.0	0.0	0.833	0.8	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG00419	0.956	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG00759	0.659	0.616	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG01051	0.905	0.846	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG01112	0.922	0.861	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG01500	0.943	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG01565	0.844	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG01583	0.865	0.808	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG01595	0.927	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG01879	0.467	0.436	0.0	0.062	0.847	0.847	2	1
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG02568	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG02922	0.81	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG03006	0.789	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG03052	0.761	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG03642	0.963	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	HG03742	0.886	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA12878	0.812	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA18525	1.033	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA18939	0.908	0.848	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA19017	0.756	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA19238	0.951	0.889	0.0	0.0	0.872	0.872	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA19239	0.942	0.88	0.0	0.003	1.0	1.0	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA19625	0.835	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA19648	1.297	1.213	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA20502	0.638	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	12547607	12547685	DEL	79	NA20845	0.477	0.446	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG00096	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG00268	0.946	0.946	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG00419	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG00759	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG01051	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG01112	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG01500	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG01565	0.556	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG01583	1.201	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG01595	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG01879	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG02568	1.291	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG02922	0.561	0.561	0.023	0.064	nan	nan	0	1
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG03006	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG03052	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG03642	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	HG03742	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA12878	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA18525	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA18939	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA19017	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA19238	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA19239	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA19625	0.683	0.683	0.017	0.063	0.571	0.571	1	1
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA19648	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA20502	1.321	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	127529693	127530117	DEL	425	NA20845	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG00096	0.615	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG00268	0.602	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG00419	0.163	0.196	0.0	0.076	0.615	0.615	1	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG00759	0.194	0.234	0.0	0.07	0.818	0.818	1	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG01051	0.503	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG01112	0.289	0.348	0.0	0.028	0.649	0.649	2	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG01500	0.747	0.901	0.0	0.005	0.8	0.835	1	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG01565	0.185	0.223	0.0	0.076	0.625	0.59	1	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG01583	0.312	0.376	0.0	0.013	nan	nan	0	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG01595	0.493	0.594	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG01879	0.251	0.303	0.0	0.059	0.81	0.81	2	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG02568	0.304	0.366	0.0	0.078	0.667	0.667	1	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG02922	0.519	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG03006	0.556	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG03052	0.571	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG03642	0.815	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	HG03742	0.231	0.279	0.0	0.036	0.278	0.278	1	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA12878	0.541	0.652	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	0
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA18939	0.392	0.472	0.0	0.049	0.476	0.476	1	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA19017	0.351	0.422	0.0	0.028	0.211	0.22	1	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	1
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA19625	0.784	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA19648	0.798	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA20502	0.592	0.713	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	128173061	128173159	DEL	99	NA20845	0.65	0.784	0.0	0.0	0.333	0.359	1	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG00096	0.687	0.763	0.0	0.0	0.522	0.544	1	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG00268	0.705	0.784	0.0	0.0	0.76	0.78	3	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG00419	0.935	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG00759	0.834	0.926	0.005	0.0	0.819	0.819	2	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG01051	0.664	0.737	0.0	0.0	0.562	0.562	3	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG01112	0.614	0.683	0.0	0.0	0.923	0.923	3	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG01500	0.836	0.929	0.0	0.0	0.656	0.667	4	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG01565	0.659	0.732	0.0	0.0	0.867	0.918	2	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG01583	1.009	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG01595	0.592	0.658	0.0	0.0	0.728	0.768	2	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG01879	0.664	0.738	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG02568	1.215	1.35	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG02922	0.768	0.854	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG03006	0.556	0.618	0.0	0.0	0.438	0.438	1	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG03052	0.0	0.0	0.39	0.005	nan	nan	0	0
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG03642	0.741	0.823	0.0	0.0	0.55	0.511	2	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	HG03742	0.559	0.621	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA12878	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA18525	0.946	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA18939	0.623	0.692	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA19017	0.923	1.025	0.0	0.0	0.849	0.847	2	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA19238	0.703	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA19239	0.439	0.487	0.099	0.0	0.278	0.278	1	1
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA19625	0.835	0.927	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA19648	0.973	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA20502	0.66	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128314258	128315067	DEL	810	NA20845	0.542	0.602	0.0	0.0	0.875	0.812	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG00096	0.732	0.882	0.0	0.0	0.826	0.862	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG00268	0.826	0.995	0.0	0.0	0.723	0.722	2	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG00419	0.793	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG00759	0.621	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG01051	0.643	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG01112	0.759	0.914	0.0	0.0	0.727	0.727	2	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG01500	0.819	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG01565	0.669	0.806	0.0	0.0	0.75	0.708	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG01583	0.625	0.753	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG01595	0.414	0.499	0.0	0.0	0.889	0.938	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG01879	0.359	0.432	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG02568	0.646	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG02922	0.623	0.751	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG03006	0.628	0.756	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG03052	0.698	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG03642	0.815	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	HG03742	0.819	0.987	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA12878	0.93	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA18525	0.805	0.97	0.0	0.0	0.536	0.558	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA18939	0.623	0.75	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA19017	0.664	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA19238	0.716	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA19239	0.787	0.948	0.0	0.0	0.839	0.839	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA19625	0.658	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA19648	0.524	0.631	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA20502	1.025	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	128329875	128330110	DEL	236	NA20845	0.52	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG00096	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG00268	0.654	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG00419	0.691	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG00759	0.524	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG01051	0.422	0.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG01112	0.651	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG01500	0.249	0.286	0.09	0.053	nan	nan	0	1
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG01565	0.741	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG01583	0.793	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG01595	0.651	0.748	0.0	0.0	1.0	0.947	1	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG01879	0.754	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG02568	0.532	0.611	0.039	0.014	nan	nan	0	1
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG02922	0.54	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG03006	0.61	0.701	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG03052	0.465	0.535	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG03642	0.494	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	HG03742	0.578	0.665	0.0	0.0	0.839	0.839	2	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA12878	0.896	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA18525	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA18939	0.676	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA19017	0.443	0.509	0.076	0.039	nan	nan	0	1
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA19238	0.742	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA19239	0.335	0.386	0.048	0.04	nan	nan	0	1
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA19625	0.86	0.988	0.0	0.0	0.867	0.867	2	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA19648	0.549	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA20502	0.569	0.654	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	129048130	129048753	DEL	624	NA20845	0.65	0.748	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG00096	0.524	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG00268	0.688	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG00419	0.773	0.888	0.0	0.003	0.667	0.667	1	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG00759	0.388	0.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG01051	0.503	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG01112	0.56	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG01500	0.712	0.818	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG01565	0.432	0.497	0.034	0.025	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG01583	0.336	0.387	0.043	0.032	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG01595	0.0	0.0	0.11	0.1	nan	nan	0	0
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG01879	0.377	0.433	0.021	0.018	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG02568	0.456	0.524	0.014	0.007	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG02922	0.519	0.597	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG03006	0.269	0.309	0.031	0.008	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG03052	0.486	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG03642	0.42	0.483	0.035	0.027	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	HG03742	0.443	0.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA12878	0.829	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA18525	0.77	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA18939	0.338	0.389	0.043	0.035	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA19017	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA19238	0.521	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA19239	0.361	0.415	0.021	0.034	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA19625	0.582	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA19648	0.324	0.373	0.066	0.022	nan	nan	0	1
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA20502	0.638	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	129657316	129657872	DEL	557	NA20845	0.585	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG00096	0.976	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG00268	0.86	0.905	0.0	0.0	0.842	0.877	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG00419	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG00759	0.95	1.0	0.0	0.0	0.75	0.75	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG01051	0.744	0.783	0.0	0.0	0.8	0.8	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG01112	0.777	0.818	0.0	0.0	0.848	0.848	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG01500	0.747	0.787	0.0	0.0	0.576	0.601	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG01565	0.865	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG01583	1.033	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG01595	0.927	0.976	0.0	0.0	0.714	0.677	7	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG01879	0.951	1.001	0.004	0.0	0.843	0.843	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG02568	0.949	0.999	0.0	0.0	0.711	0.711	2	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG03006	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG03052	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG03642	0.988	1.04	0.0	0.0	0.712	0.721	2	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	HG03742	0.848	0.893	0.0	0.0	0.708	0.708	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA12878	0.49	0.516	0.072	0.04	nan	nan	0	1
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA18525	0.911	0.958	0.0	0.0	0.862	0.86	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA18939	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA19017	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA19238	0.847	0.891	0.0	0.0	0.822	0.822	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA19239	1.006	1.059	0.0	0.0	0.917	0.917	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA19625	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA19648	0.998	1.051	0.007	0.0	0.685	0.685	10	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA20502	0.706	0.743	0.0	0.0	0.194	0.194	9	2
chr3	130131996	130132924	DEL	929	NA20845	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG00096	1.519	1.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG00268	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG00419	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG00759	1.163	1.087	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG01051	1.005	0.94	0.0	0.0	0.792	0.792	4	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG01112	1.265	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG01500	1.299	1.214	0.0	0.0	0.711	0.742	1	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG01565	1.277	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG01583	1.153	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG01595	1.579	1.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG01879	1.184	1.107	0.0	0.0	0.778	0.778	4	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG02568	1.025	0.958	0.0	0.0	0.833	0.833	5	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG02922	1.225	1.145	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG03006	1.058	0.989	0.0	0.0	0.729	0.729	4	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG03052	1.184	1.106	0.0	0.0	0.714	0.714	5	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG03642	1.013	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	HG03742	1.195	1.117	0.0	0.0	0.866	0.866	4	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA12878	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA18525	0.946	0.884	0.0	0.0	0.848	0.835	4	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA18939	1.103	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA19017	0.646	0.604	0.087	0.06	nan	nan	0	1
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA19238	1.12	1.047	0.0	0.0	0.822	0.822	3	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA19239	1.148	1.073	0.0	0.0	0.867	0.867	2	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA19625	0.986	0.922	0.0	0.0	0.696	0.696	5	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA19648	1.173	1.096	0.0	0.0	0.577	0.577	4	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA20502	0.934	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	130260540	130261491	DEL	952	NA20845	1.236	1.155	0.0	0.0	0.697	0.697	4	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG00096	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG00268	1.152	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG00419	0.874	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG00759	0.659	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG01051	0.824	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG01112	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG01500	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG01565	1.215	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG01583	1.273	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG01595	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG01879	0.951	0.923	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG02568	0.646	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG02922	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG03006	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG03052	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG03642	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	HG03742	0.713	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA12878	0.795	0.772	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA18525	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA18939	0.481	0.467	0.0	0.052	0.583	0.583	1	1
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA19017	1.236	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA19238	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA19239	0.826	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA19625	0.733	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA19648	1.173	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA20502	0.25	0.243	0.0	0.022	0.812	0.812	1	2
chr3	131097978	131098062	DEL	85	NA20845	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG00096	0.687	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG00268	0.585	0.568	0.0	0.0	1.0	0.96	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG00419	1.261	1.224	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG00759	0.776	0.753	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG01051	0.865	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG01112	1.012	0.982	0.0	0.004	0.4	0.4	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG01500	0.979	0.95	0.0	0.0	0.741	0.773	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG01565	0.865	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG01583	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG01595	0.77	0.747	0.0	0.0	0.941	0.892	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG01879	1.077	1.045	0.0	0.0	0.821	0.821	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG02568	1.253	1.217	0.0	0.0	0.529	0.529	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG02922	0.831	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG03006	0.825	0.801	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG03052	0.465	0.452	0.0	0.021	0.955	0.955	1	1
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG03642	1.013	0.983	0.0	0.0	0.444	0.479	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	HG03742	1.002	0.973	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA12878	0.981	0.952	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA18525	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA18939	0.836	0.812	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA19017	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA19238	1.003	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA19239	0.4	0.388	0.0	0.033	0.892	0.892	1	1
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA19625	0.835	0.81	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA19648	0.923	0.896	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA20502	0.911	0.884	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr3	131879115	131879169	DEL	55	NA20845	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG00096	0.922	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG00268	0.877	0.923	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG00419	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG00759	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG01051	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG01112	0.958	1.008	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG01500	0.836	0.88	0.0	0.0	0.667	0.696	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG01565	0.926	0.975	0.0	0.0	0.905	0.854	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG01583	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG01595	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG01879	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG02568	0.874	0.92	0.011	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG02922	1.08	1.137	0.0	0.005	0.636	0.636	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG03006	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG03052	0.825	0.868	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG03642	1.309	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	HG03742	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA12878	0.913	0.961	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA18525	1.068	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA18939	1.032	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA19017	0.923	0.971	0.0	0.0	0.577	0.603	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA19238	0.847	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA19239	0.452	0.475	0.004	0.07	nan	nan	0	1
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA19625	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA19648	1.198	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA20502	0.979	1.031	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr3	133235085	133235461	DEL	377	NA20845	0.976	1.027	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG00096	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG00268	1.135	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG00419	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG00759	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG01051	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG01565	1.029	1.029	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG02568	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG02922	1.391	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG03052	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG03642	1.26	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	HG03742	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	NA19017	1.255	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	NA19625	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	NA20502	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	133849758	133849816	DUP	59	NA20845	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG00096	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG00268	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG00759	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG01051	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG01112	0.94	0.94	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG01500	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG01565	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG01583	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG01595	0.927	0.927	0.0	0.0	0.772	0.77	2	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG01879	1.041	1.041	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG02568	1.139	1.139	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG02922	0.436	0.436	0.059	0.051	nan	nan	0	1
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG03006	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG03052	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG03642	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	HG03742	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA12878	0.93	0.93	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA18525	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA18939	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA19017	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA19238	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA19239	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA19625	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA19648	0.749	0.749	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA20502	0.979	0.979	0.0	0.0	0.458	0.458	1	2
chr3	135014870	135015823	DEL	954	NA20845	1.084	1.084	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG00096	0.922	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG00268	1.032	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG00419	1.118	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG00759	0.814	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG01051	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG01112	0.47	0.522	0.0	0.018	0.56	0.56	1	1
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG01500	0.765	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG01565	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG01583	1.321	1.468	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG01595	1.006	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG01879	0.395	0.439	0.0	0.03	0.962	0.962	1	1
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG02568	1.253	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG02922	0.457	0.508	0.0	0.017	0.944	0.944	1	1
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG03006	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG03052	1.226	1.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG03642	0.963	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	HG03742	0.752	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA12878	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA18525	0.788	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA18939	1.032	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA19017	1.015	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA19238	0.742	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA19239	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA19625	0.961	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA19648	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA20502	0.751	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	139230575	139230625	DEL	51	NA20845	0.716	0.795	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG00096	0.814	0.856	0.0	0.0	0.814	0.849	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG00268	1.049	1.104	0.004	0.0	0.791	0.824	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG00419	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG00759	0.717	0.755	0.0	0.0	0.802	0.802	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG01051	1.066	1.122	0.0	0.0	0.623	0.623	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG01112	0.976	1.027	0.0	0.0	0.542	0.542	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG01500	1.103	1.161	0.0	0.0	0.852	0.853	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG01565	0.865	0.91	0.0	0.0	0.733	0.692	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG01583	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG01595	0.809	0.852	0.0	0.0	0.812	0.817	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG01879	0.897	0.945	0.0	0.0	0.57	0.57	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG02568	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG02922	0.768	0.809	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG03006	0.861	0.906	0.0	0.0	0.742	0.742	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG03052	0.93	0.979	0.0	0.0	0.541	0.541	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG03642	0.889	0.936	0.0	0.0	0.723	0.671	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	HG03742	0.405	0.426	0.054	0.047	nan	nan	0	1
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA12878	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA18525	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA18939	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA19017	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA19238	0.821	0.864	0.0	0.0	0.893	0.893	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA19239	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA19625	0.86	0.905	0.0	0.0	0.65	0.65	2	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA19648	0.524	0.552	0.037	0.029	nan	nan	0	1
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA20502	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	141572122	141572863	DEL	742	NA20845	0.737	0.776	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG00096	0.994	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG00268	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG00419	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG00759	1.241	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG01051	1.267	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG01112	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG01500	0.765	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG01565	0.371	0.39	0.0	0.013	0.381	0.36	1	1
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG01583	1.273	1.34	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG01595	0.592	0.623	0.0	0.07	0.897	0.946	1	1
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG01879	0.969	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG02568	1.101	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG02922	0.934	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG03006	1.184	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG03052	1.184	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG03642	1.185	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	HG03742	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA12878	0.879	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA18525	0.403	0.424	0.0	0.055	0.966	0.927	1	1
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA18939	0.997	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA19017	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA19238	0.847	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA19239	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA19625	1.037	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA19648	1.372	1.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA20502	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14160922	14160996	DEL	75	NA20845	0.716	0.753	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG00096	0.615	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG00268	0.585	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG00419	0.712	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG00759	0.465	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG01051	0.523	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG01112	0.614	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG01500	0.676	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG01565	0.35	0.402	0.075	0.059	nan	nan	0	1
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG01583	0.745	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG01595	0.197	0.227	0.027	0.023	nan	nan	0	1
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG01879	0.341	0.392	0.084	0.054	nan	nan	0	1
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG02568	0.57	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG02922	0.249	0.286	0.079	0.063	nan	nan	0	1
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG03006	0.377	0.433	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG03052	0.74	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG03642	0.593	0.681	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	HG03742	0.443	0.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA12878	0.71	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA18525	0.42	0.483	0.096	0.061	nan	nan	0	1
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA18939	0.552	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA19017	0.535	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA19238	0.599	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA19239	0.593	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA19625	0.43	0.494	0.042	0.03	nan	nan	0	1
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA19648	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA20502	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	14178152	14178845	DEL	694	NA20845	0.499	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG00096	1.085	1.014	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG00268	0.826	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG00419	1.098	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG00759	0.921	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG01051	0.824	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG01112	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG01500	0.997	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG01565	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG01583	1.321	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG01595	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG01879	1.149	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG02568	1.329	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG02922	0.779	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG03006	0.897	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG03052	1.142	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG03642	0.79	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	HG03742	0.886	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA12878	0.913	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA18525	1.226	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA18939	0.552	0.516	0.008	0.026	0.303	0.303	1	1
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA19017	0.83	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA19238	1.303	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA19239	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA19625	0.86	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA19648	0.823	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA20502	0.729	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	142543018	142543085	DEL	68	NA20845	0.997	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG00096	1.573	1.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG00268	1.049	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG00419	1.667	1.516	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG00759	1.202	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG01051	1.247	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG01112	1.482	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG01500	1.21	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG01565	1.338	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG01583	1.009	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG01595	1.095	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG01879	1.274	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG02568	0.912	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG02922	1.194	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG03006	1.237	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG03052	1.078	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG03642	1.111	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	HG03742	1.041	0.946	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA12878	0.938	0.853	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA18525	1.164	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA18939	1.335	1.213	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA19017	1.624	1.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA19238	1.107	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA19239	1.097	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA19625	0.506	0.46	0.0	0.062	0.75	0.75	1	1
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA19648	1.135	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA20502	1.23	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144486048	144486143	DEL	96	NA20845	1.691	1.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.197	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG00419	0.0	0.0	0.014	0.169	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG00759	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG01051	0.422	0.445	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.234	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG01583	0.553	0.582	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.167	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG01879	0.449	0.472	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG02568	0.342	0.36	0.0	0.128	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.186	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG03006	0.556	0.585	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG03052	0.444	0.467	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG03642	0.494	0.52	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	HG03742	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA12878	1.065	1.121	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA18939	0.0	0.0	0.005	0.208	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA19017	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA19239	1.213	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA19625	0.43	0.453	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	0
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA20502	0.501	0.527	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr3	144693110	144693236	DEL	127	NA20845	0.499	0.525	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG00096	0.633	0.581	0.055	0.079	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG00268	0.998	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG00419	1.139	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG00759	1.416	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG01051	0.603	0.553	0.035	0.065	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG01112	0.614	0.564	0.041	0.085	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG01500	0.676	0.62	0.056	0.086	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG01565	0.0	0.0	0.278	0.311	nan	nan	0	0
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG01583	1.225	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG01595	0.75	0.688	0.043	0.097	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG01879	1.274	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG02568	0.798	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG02922	1.308	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG03006	1.506	1.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG03052	1.205	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG03642	1.457	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	HG03742	1.484	1.361	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA12878	0.372	0.341	0.035	0.084	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA18525	0.455	0.418	0.021	0.136	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA18939	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA19017	1.033	0.948	0.0	0.0	0.786	0.821	1	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA19238	1.472	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA19239	0.658	0.604	0.023	0.094	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA19625	0.733	0.673	0.074	0.071	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA19648	1.048	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA20502	0.546	0.501	0.011	0.039	nan	nan	0	1
chr3	144888422	144888910	DEL	489	NA20845	1.258	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG00096	1.103	1.071	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG00268	1.066	1.035	0.005	0.0	0.828	0.862	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG00419	0.874	0.849	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG00759	1.319	1.28	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG01051	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG01112	1.12	1.088	0.0	0.0	0.677	0.677	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG01500	0.854	0.829	0.029	0.023	0.484	0.505	1	1
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG01565	1.029	0.999	0.0	0.0	0.92	0.869	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG01583	0.889	0.863	0.0	0.005	0.706	0.706	2	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG01595	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG01879	0.503	0.488	0.028	0.039	0.615	0.615	1	1
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG02568	0.532	0.516	0.014	0.082	0.444	0.444	1	1
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG02922	0.81	0.786	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG03006	1.094	1.062	0.0	0.0	0.743	0.743	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG03052	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG03642	1.062	1.031	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	HG03742	1.041	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA12878	0.778	0.755	0.005	0.0	0.615	0.615	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA18525	0.981	0.952	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA18939	0.89	0.864	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA19017	0.443	0.43	0.052	0.08	0.867	0.829	1	1
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA19238	1.12	1.088	0.0	0.0	0.821	0.821	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA19239	1.045	1.015	0.0	0.0	0.845	0.845	2	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA19625	0.481	0.467	0.013	0.027	0.65	0.65	1	1
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA19648	1.223	1.187	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA20502	0.797	0.774	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr3	145479208	145479862	DEL	655	NA20845	0.976	0.947	0.0	0.0	0.577	0.536	1	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG00096	0.524	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG00268	0.602	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG00419	0.488	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG00759	0.543	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG01051	0.322	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG01112	0.416	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG01500	0.783	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG01565	0.865	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG01583	0.336	0.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG01595	0.296	0.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG01879	0.269	0.341	0.0	0.013	1.0	1.0	1	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG02568	0.494	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG02922	0.291	0.368	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG03006	0.61	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG03052	0.486	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG03642	0.519	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	HG03742	0.52	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA12878	0.457	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA18525	0.525	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA18939	0.534	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA19017	0.295	0.374	0.0	0.008	0.636	0.665	1	1
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA19238	0.521	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA19239	0.581	0.735	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA19625	0.152	0.192	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA19648	0.324	0.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA20502	0.342	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	146218069	146218119	DEL	51	NA20845	0.607	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG00096	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG00268	0.774	0.774	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG00419	0.915	0.915	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG00759	0.911	0.911	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG01051	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG01112	0.669	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG01500	0.694	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG01565	0.453	0.453	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG01583	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG01595	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG01879	0.7	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG02568	0.38	0.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG02922	0.332	0.332	0.0	0.052	0.273	0.273	1	1
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG03006	0.556	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG03052	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG03642	0.469	0.469	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	HG03742	0.675	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA12878	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA18525	0.63	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA18939	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA19017	0.424	0.424	0.0	0.058	0.95	0.993	1	1
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA19238	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA19239	0.722	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA19625	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA19648	0.674	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA20502	0.979	0.979	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	148969920	148969997	DEL	78	NA20845	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG00096	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG00268	0.98	0.98	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG00419	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG00759	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG01051	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG01112	0.94	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG01500	0.943	0.943	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG01565	0.865	0.865	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG01583	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG01595	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG01879	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG02568	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG02922	0.997	0.997	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG03006	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG03052	0.359	0.359	0.109	0.0	nan	nan	0	1
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG03642	0.642	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	HG03742	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA12878	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA18525	1.051	1.051	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA18939	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA19017	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA19238	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA19239	0.4	0.4	0.049	0.0	0.133	0.133	6	1
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA19625	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA19648	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA20502	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	15012729	15013435	DEL	707	NA20845	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG00096	1.311	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG00268	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG00419	1.352	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG00759	1.377	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG01051	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG01112	0.958	0.93	0.0	0.022	0.426	0.426	1	1
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG01500	1.602	1.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG01565	1.112	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG01583	0.781	0.758	0.0	0.027	0.4	0.4	1	1
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG01595	1.519	1.475	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG01879	1.831	1.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG02568	1.215	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG02922	1.287	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG03006	1.336	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG03052	1.142	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG03642	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	HG03742	1.272	1.235	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA12878	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA18525	1.523	1.479	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA18939	1.086	1.054	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA19017	1.347	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA19238	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA19239	1.264	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA19625	1.391	1.35	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA19648	1.447	1.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA20502	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151332900	151332963	DEL	64	NA20845	1.561	1.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG00096	1.501	1.402	0.0	0.0	0.54	0.518	1	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG00268	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG00419	1.281	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG00759	0.679	0.634	0.034	0.106	nan	nan	0	1
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG01051	1.106	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG01112	1.446	1.351	0.004	0.003	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG01500	1.21	1.131	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG01565	0.988	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG01583	1.009	0.943	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG01595	1.046	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG01879	1.346	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG02568	1.253	1.171	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG02922	1.287	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG03006	1.489	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG03052	1.099	1.027	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG03642	0.84	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	HG03742	1.503	1.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA12878	0.862	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA18525	0.49	0.458	0.016	0.045	nan	nan	0	1
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA18939	1.246	1.164	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA19017	1.292	1.207	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA19238	1.329	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA19239	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA19625	1.088	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA19648	1.198	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA20502	1.366	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	151764935	151765381	DEL	447	NA20845	1.366	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG00096	0.488	0.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG00268	0.396	0.36	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG00419	0.346	0.314	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG00759	0.233	0.212	0.01	0.014	0.789	0.789	1	1
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG01051	0.402	0.366	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG01112	0.506	0.46	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG01500	0.356	0.324	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG01565	0.247	0.225	0.0	0.023	0.765	0.81	1	1
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG01583	0.457	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG01595	0.227	0.206	0.0	0.006	0.692	0.731	1	1
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG01879	0.7	0.636	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG02568	0.532	0.483	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG02922	0.395	0.359	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG03006	0.233	0.212	0.0	0.011	0.529	0.529	1	1
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG03052	0.592	0.538	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG03642	0.198	0.18	0.0	0.028	0.857	0.796	1	1
chr3	153386325	153386384	DEL	60	HG03742	0.27	0.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA12878	0.49	0.446	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA18525	0.245	0.223	0.0	0.013	0.478	0.498	2	1
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA18939	0.356	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA19017	0.535	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA19238	0.547	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA19239	0.516	0.469	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA19625	0.354	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA19648	0.274	0.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA20502	0.524	0.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	153386325	153386384	DEL	60	NA20845	0.531	0.483	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG00096	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG00268	0.998	0.998	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG00419	0.346	0.346	0.0	0.026	0.286	0.286	1	1
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG00759	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG01051	1.005	1.005	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG01112	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG01500	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG01565	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG01583	0.481	0.481	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG01595	0.671	0.671	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG01879	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG02568	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG02922	0.706	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG03006	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG03052	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG03642	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	HG03742	0.54	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA12878	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA18525	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA18939	0.641	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA19017	0.683	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA19238	0.716	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA19239	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA19625	0.582	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA19648	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA20502	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	157593571	157593657	DEL	87	NA20845	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG00096	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG00268	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG00419	0.773	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG00759	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG01051	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG01112	0.885	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG01500	0.285	0.3	0.105	0.065	nan	nan	0	1
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG01565	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG01583	0.889	0.936	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG01595	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG01879	0.987	1.039	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG02568	1.177	1.239	0.0	0.0	0.571	0.571	2	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG02922	0.768	0.809	0.0	0.0	0.619	0.619	3	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG03006	0.628	0.661	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG03052	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG03642	0.963	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	HG03742	0.867	0.913	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA12878	0.727	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA18525	1.016	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA18939	0.765	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA19017	0.904	0.952	0.0	0.0	0.826	0.819	2	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA19238	0.769	0.809	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA19239	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA19625	0.733	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA19648	0.873	0.919	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA20502	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	158287498	158288359	DEL	862	NA20845	0.802	0.844	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG00096	0.452	0.439	0.072	0.045	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG00268	0.636	0.618	0.053	0.029	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG00419	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG00759	0.543	0.527	0.043	0.04	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG01051	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG01112	0.596	0.579	0.054	0.038	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG01500	1.014	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG01565	1.071	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG01583	0.0	0.0	0.155	0.116	nan	nan	0	0
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG01595	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG01879	0.467	0.453	0.094	0.061	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG02568	0.836	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG02922	0.457	0.444	0.025	0.016	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG03006	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG03052	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG03642	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	HG03742	0.405	0.393	0.076	0.057	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA12878	0.44	0.427	0.012	0.051	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA18525	0.473	0.459	0.059	0.054	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA18939	0.498	0.484	0.055	0.035	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA19017	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA19238	0.573	0.556	0.066	0.042	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA19239	1.226	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA19625	0.506	0.491	0.103	0.065	nan	nan	0	1
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA19648	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA20502	0.934	0.906	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr3	159257018	159257691	DEL	674	NA20845	0.542	0.526	0.051	0.04	nan	nan	0	1
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG00096	1.049	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG00268	0.894	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG00419	0.976	0.895	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG00759	1.183	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG01051	1.086	0.996	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG01112	1.12	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG01500	1.442	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG01565	1.235	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG01583	1.057	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG01595	1.105	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG01879	0.574	0.527	0.0	0.038	0.853	0.853	1	1
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG02568	1.101	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG02922	0.976	0.895	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG03006	1.022	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG03052	0.888	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG03642	1.507	1.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	HG03742	1.176	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA12878	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA18525	0.981	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA18939	1.103	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA19017	0.978	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA19238	0.912	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA19239	1.045	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA19625	1.163	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA19648	0.823	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA20502	1.275	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	161509826	161509890	DEL	65	NA20845	1.301	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG00096	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG00268	0.843	0.843	0.0	0.0	0.727	0.698	1	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG00419	0.691	0.691	0.0	0.0	0.929	0.929	3	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG00759	0.931	0.931	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG01051	0.764	0.764	0.0	0.003	0.7	0.7	3	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG01112	0.813	0.813	0.0	0.0	0.814	0.814	4	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG01500	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG01565	0.865	0.865	0.0	0.0	0.789	0.746	3	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG01583	0.793	0.793	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG01595	0.75	0.75	0.0	0.0	0.768	0.811	2	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG01879	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG02568	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG02922	0.602	0.602	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG03006	0.825	0.825	0.0	0.0	0.81	0.81	3	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG03052	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG03642	0.889	0.889	0.0	0.0	0.726	0.674	4	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	HG03742	0.771	0.771	0.0	0.0	0.799	0.799	4	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA12878	0.389	0.389	0.063	0.029	nan	nan	0	1
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA18525	0.911	0.911	0.0	0.0	0.826	0.861	3	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA18939	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA19017	1.015	1.015	0.0	0.0	0.689	0.68	2	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA19238	0.899	0.899	0.0	0.0	0.714	0.714	5	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA19239	0.877	0.877	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA19625	0.986	0.986	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA19648	0.873	0.873	0.0	0.0	0.779	0.779	2	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA20502	1.002	1.002	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr3	162448908	162449811	DEL	904	NA20845	0.694	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.018	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.023	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.033	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.009	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.016	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.024	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.023	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.024	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.018	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.04	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.012	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr3	1629482	1629541	DEL	60	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	0
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG00096	1.338	1.227	0.0	0.0	0.789	0.757	1	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG00268	0.636	0.584	0.011	0.058	nan	nan	0	1
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG00419	1.078	0.989	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG00759	1.338	1.228	0.0	0.0	0.676	0.676	1	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG01051	0.523	0.48	0.021	0.104	nan	nan	0	1
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG01112	1.247	1.144	0.0	0.0	0.801	0.801	4	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG01500	1.21	1.11	0.0	0.001	0.843	0.83	4	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG01565	0.762	0.699	0.013	0.079	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG01583	0.577	0.529	0.005	0.094	0.611	0.611	1	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG01595	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG01879	1.508	1.383	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG02568	0.949	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG02922	1.329	1.219	0.0	0.003	0.8	0.8	2	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG03006	1.13	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG03052	1.057	0.97	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG03642	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	HG03742	1.176	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA12878	0.592	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA18525	1.103	1.012	0.0	0.0	0.758	0.727	3	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA18939	1.531	1.404	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA19017	1.292	1.185	0.0	0.0	0.8	0.765	1	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA19238	1.055	0.968	0.0	0.0	0.972	0.972	1	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA19239	1.11	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA19625	0.809	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA19648	0.624	0.572	0.014	0.087	0.542	0.542	1	1
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA20502	0.979	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	165987485	165987821	DEL	337	NA20845	1.214	1.114	0.0	0.0	0.786	0.846	1	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG00096	0.0	0.0	0.07	0.275	nan	nan	0	0
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG00268	0.98	0.98	0.0	0.0	0.914	0.877	2	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG00419	0.508	0.508	0.047	0.085	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG00759	0.524	0.524	0.021	0.071	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG01051	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG01112	0.434	0.434	0.026	0.13	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG01500	0.356	0.356	0.015	0.072	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG01565	0.432	0.432	0.048	0.109	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG01583	0.793	0.793	0.02	0.088	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG01595	0.987	0.987	0.0	0.0	0.52	0.493	1	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG01879	0.969	0.969	0.0	0.0	0.626	0.626	2	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG02568	1.139	1.139	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG02922	0.436	0.436	0.009	0.06	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG03006	0.61	0.61	0.024	0.115	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG03052	1.036	1.036	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG03642	0.445	0.445	0.028	0.104	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	HG03742	0.771	0.771	0.006	0.0	0.762	0.762	1	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA12878	0.0	0.0	0.025	0.219	nan	nan	0	0
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA18525	1.191	1.191	0.0	0.0	0.489	0.509	1	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA18939	0.534	0.534	0.044	0.14	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA19017	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA19238	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA19239	0.968	0.968	0.0	0.0	0.705	0.705	1	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA19625	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA19648	0.499	0.499	0.054	0.12	nan	nan	0	1
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA20502	0.888	0.888	0.0	0.0	0.871	0.871	2	2
chr3	168738458	168738838	DEL	381	NA20845	0.499	0.499	0.028	0.082	nan	nan	0	1
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG00096	0.651	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG00268	0.808	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG00419	0.752	0.73	0.0	0.008	0.768	0.768	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG00759	0.368	0.358	0.008	0.094	nan	nan	0	1
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG01051	0.965	0.937	0.006	0.004	nan	nan	0	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG01112	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG01500	0.925	0.898	0.0	0.0	0.852	0.816	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG01565	1.05	1.019	0.0	0.0	0.84	0.793	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG01583	0.925	0.898	0.0	0.0	0.672	0.672	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG01595	0.71	0.69	0.0	0.0	0.591	0.56	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG01879	0.861	0.836	0.0	0.0	0.792	0.792	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG02568	0.76	0.737	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG02922	0.976	0.947	0.0	0.003	0.408	0.408	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG03006	0.717	0.696	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG03052	0.634	0.616	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG03642	0.815	0.791	0.0	0.0	0.462	0.464	3	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	HG03742	0.732	0.711	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA12878	0.795	0.772	0.005	0.007	0.86	0.86	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA18525	0.525	0.51	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA18939	0.739	0.717	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA19017	0.775	0.752	0.0	0.0	0.917	0.958	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA19238	0.834	0.809	0.0	0.003	0.429	0.429	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA19239	0.903	0.877	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA19625	0.733	0.712	0.0	0.0	0.562	0.562	2	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA19648	0.848	0.824	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA20502	0.66	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	170565666	170565917	DEL	252	NA20845	0.52	0.505	0.008	0.077	nan	nan	0	1
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG00096	0.904	1.004	0.0	0.0	0.81	0.845	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG00268	0.86	0.956	0.0	0.0	0.792	0.825	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG00419	0.691	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG00759	0.679	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG01051	0.824	0.916	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG01112	0.867	0.964	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG01500	0.908	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG01565	1.091	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG01583	0.769	0.854	0.0	0.006	0.714	0.714	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG01595	0.809	0.899	0.0	0.0	0.647	0.613	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG01879	0.879	0.977	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG02568	0.608	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG02922	0.81	0.9	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG03006	0.933	1.036	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG03052	0.825	0.916	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG03642	0.914	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	HG03742	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA12878	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA18525	0.455	0.506	0.006	0.076	0.353	0.368	4	1
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA18939	0.836	0.929	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA19017	1.107	1.23	0.0	0.0	0.7	0.67	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA19238	0.873	0.97	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA19239	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA19625	0.91	1.012	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA19648	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA20502	0.751	0.835	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr3	172056679	172056821	DEL	143	NA20845	0.716	0.795	0.0	0.005	0.769	0.714	1	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG00096	0.452	0.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG00268	0.482	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG00419	0.224	0.235	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG00759	0.64	0.674	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG01051	0.503	0.529	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG01112	0.614	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG01500	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG01565	0.659	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG01583	0.288	0.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG01595	0.434	0.457	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG01879	0.162	0.17	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG02568	0.076	0.08	0.011	0.085	nan	nan	0	1
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG02922	0.208	0.219	0.007	0.097	nan	nan	0	1
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG03006	0.448	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG03052	0.338	0.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG03642	0.272	0.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	HG03742	0.482	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA12878	0.49	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA18525	0.385	0.405	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA18939	0.356	0.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA19017	0.387	0.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA19238	0.554	0.583	0.0	0.192	nan	nan	0	1
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA19239	0.619	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA19625	0.303	0.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA19648	0.274	0.289	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA20502	0.273	0.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	17513051	17513182	DEL	132	NA20845	0.564	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG00096	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG00268	1.049	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG00419	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG00759	0.776	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG01051	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG01112	0.66	0.64	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG01500	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG01565	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG01583	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG01595	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG01879	0.511	0.497	0.0	0.023	0.467	0.467	1	1
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG02568	1.215	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG02922	0.415	0.403	0.0	0.014	0.824	0.824	1	1
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG03006	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG03052	0.402	0.39	0.0	0.028	0.565	0.565	1	1
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG03642	1.062	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	HG03742	0.713	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA12878	0.812	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA18525	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA18939	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA19017	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA19238	0.508	0.493	0.0	0.032	0.723	0.723	1	1
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA19239	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA19625	0.708	0.688	0.0	0.047	0.571	0.571	1	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA19648	0.898	0.872	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA20502	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177667069	177667126	DEL	58	NA20845	1.041	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG01051	1.026	0.958	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG01112	0.56	0.524	0.0	0.008	0.62	0.62	2	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG01565	0.803	0.75	0.0	0.022	0.308	0.291	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG01595	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG01879	1.023	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG02568	1.101	1.029	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG02922	0.602	0.563	0.0	0.043	0.783	0.783	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.04	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG03052	0.423	0.395	0.0	0.037	0.952	0.952	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG03642	0.445	0.415	0.0	0.035	0.591	0.636	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	HG03742	0.636	0.594	0.0	0.03	0.575	0.575	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA12878	0.693	0.648	0.0	0.02	0.651	0.651	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA18525	0.963	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.033	nan	nan	0	0
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA19017	0.461	0.431	0.0	0.018	0.642	0.64	2	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA19238	0.586	0.548	0.0	0.013	0.635	0.635	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA19239	0.581	0.543	0.0	0.009	0.724	0.724	2	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA19648	1.198	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA20502	0.638	0.596	0.0	0.014	0.786	0.786	1	1
chr3	177896496	177896554	DEL	59	NA20845	0.0	0.0	0.006	0.034	nan	nan	0	0
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG00096	0.434	0.523	0.0	0.0	0.467	0.447	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG00268	0.327	0.394	0.0	0.0	0.721	0.71	6	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG00419	0.529	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG00759	0.368	0.444	0.0	0.0	0.556	0.556	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG01051	0.422	0.509	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG01112	0.596	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG01500	0.445	0.536	0.0	0.0	0.495	0.51	2	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG01565	0.515	0.62	0.0	0.003	0.5	0.529	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG01583	0.264	0.318	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG01595	0.355	0.428	0.0	0.0	0.556	0.526	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG01879	0.52	0.627	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG02568	0.304	0.366	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG02922	0.27	0.325	0.007	0.031	nan	nan	0	1
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG03006	0.269	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG03052	0.19	0.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG03642	0.395	0.476	0.0	0.0	0.4	0.371	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	HG03742	0.482	0.58	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA12878	0.406	0.489	0.0	0.0	0.317	0.317	8	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA18525	0.543	0.654	0.0	0.0	0.4	0.405	5	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA18939	0.445	0.536	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA19017	0.221	0.267	0.012	0.039	nan	nan	0	1
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA19238	0.495	0.596	0.0	0.0	0.5	0.5	7	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA19239	0.413	0.497	0.0	0.0	0.357	0.357	5	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA19625	0.329	0.396	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA19648	0.299	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA20502	0.296	0.357	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr3	1781984	1782293	DEL	310	NA20845	0.52	0.627	0.0	0.0	0.535	0.497	4	2
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG00096	0.0	0.0	0.098	0.068	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG00268	0.0	0.0	0.271	0.171	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG00419	0.346	0.323	0.063	0.051	nan	nan	0	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG00759	1.047	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG01051	0.342	0.319	0.076	0.042	nan	nan	0	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG01112	0.0	0.0	0.278	0.178	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG01500	0.0	0.0	0.209	0.139	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG01565	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG01583	0.529	0.494	0.015	0.015	nan	nan	0	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG01595	0.592	0.553	0.07	0.042	nan	nan	0	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG01879	0.0	0.0	0.232	0.179	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG02568	0.0	0.0	0.193	0.16	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG02922	0.0	0.0	0.107	0.073	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG03006	0.448	0.419	0.054	0.037	nan	nan	0	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG03052	0.0	0.0	0.194	0.142	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG03642	0.395	0.369	0.058	0.031	0.316	0.34	1	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	HG03742	0.443	0.414	0.108	0.073	nan	nan	0	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA12878	0.389	0.363	0.054	0.061	0.909	0.909	1	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA18525	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA18939	0.516	0.482	0.084	0.053	nan	nan	0	1
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA19017	0.0	0.0	0.275	0.185	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA19238	0.0	0.0	0.394	0.183	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA19239	0.0	0.0	0.35	0.166	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA19625	0.986	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA19648	0.886	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA20502	0.0	0.0	0.145	0.091	nan	nan	0	0
chr3	178550124	178550897	DEL	774	NA20845	0.607	0.567	0.054	0.041	nan	nan	0	1
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG00096	0.416	0.416	0.098	0.055	nan	nan	0	1
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG00268	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG00759	0.349	0.349	0.05	0.036	nan	nan	0	1
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG01051	0.684	0.684	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG01112	0.849	0.849	0.0	0.0	0.851	0.851	2	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG01500	0.943	0.943	0.0	0.0	0.667	0.696	1	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG01565	0.885	0.885	0.0	0.0	0.867	0.819	1	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG01583	0.505	0.505	0.088	0.059	nan	nan	0	1
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG01595	0.493	0.493	0.096	0.077	nan	nan	0	1
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG01879	0.987	0.987	0.005	0.0	0.922	0.922	2	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG02568	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG02922	0.478	0.478	0.096	0.058	nan	nan	0	1
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG03006	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG03052	0.846	0.846	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG03642	0.42	0.42	0.067	0.026	nan	nan	0	1
chr3	178567629	178568339	DEL	711	HG03742	0.771	0.771	0.0	0.0	0.781	0.781	2	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA12878	0.93	0.93	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA18525	0.876	0.876	0.0	0.0	0.621	0.647	1	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA18939	0.925	0.925	0.005	0.0	0.721	0.721	2	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA19017	0.959	0.959	0.0	0.0	0.862	0.824	2	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA19238	0.925	0.925	0.0	0.0	0.951	0.951	3	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA19239	0.839	0.839	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA19625	0.835	0.835	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA19648	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA20502	0.0	0.0	0.272	0.152	nan	nan	0	0
chr3	178567629	178568339	DEL	711	NA20845	0.976	0.976	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG00096	0.56	0.56	0.032	0.089	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG00268	0.0	0.0	0.11	0.276	nan	nan	0	0
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG00419	0.427	0.427	0.022	0.094	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG00759	0.582	0.582	0.055	0.06	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG01051	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG01112	1.193	1.193	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG01500	0.481	0.481	0.029	0.088	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG01565	0.988	0.988	0.0	0.0	0.565	0.598	1	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG01583	0.0	0.0	0.158	0.223	nan	nan	0	0
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG01595	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG01879	0.0	0.0	0.167	0.311	nan	nan	0	0
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG02568	0.342	0.342	0.035	0.069	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG02922	1.121	1.121	0.0	0.003	0.721	0.721	2	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG03006	0.556	0.556	0.054	0.084	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG03052	0.0	0.0	0.128	0.332	nan	nan	0	0
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG03642	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	HG03742	0.636	0.636	0.053	0.127	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA12878	0.0	0.0	0.016	0.243	nan	nan	0	0
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA18525	0.508	0.508	0.025	0.141	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA18939	0.356	0.356	0.038	0.109	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA19017	0.0	0.0	0.081	0.287	nan	nan	0	0
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA19238	0.43	0.43	0.005	0.098	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA19239	0.968	0.968	0.0	0.0	0.937	0.937	2	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA19625	0.91	0.91	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA19648	1.023	1.023	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA20502	0.455	0.455	0.012	0.098	nan	nan	0	1
chr3	179654342	179654808	DEL	467	NA20845	0.694	0.694	0.0	0.0	0.778	0.838	1	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG00096	0.615	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG00268	0.464	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG00419	0.915	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG00759	0.679	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG01051	0.523	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG01112	0.813	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG01500	0.908	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG01565	0.474	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG01583	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG01595	0.513	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG01879	0.682	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG02568	0.836	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG02922	0.436	0.484	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG03006	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG03052	0.761	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG03642	0.741	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	HG03742	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA12878	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA18525	0.823	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA18939	0.694	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA19017	0.572	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA19238	0.651	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA19239	0.413	0.459	0.0	0.048	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA19625	1.012	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA19648	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA20502	0.683	0.759	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	179883279	179883429	DEL	151	NA20845	0.434	0.482	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG00096	0.796	0.796	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG00268	0.533	0.533	0.077	0.047	nan	nan	0	1
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG00419	0.712	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG00759	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG01051	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG01112	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG01500	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG01565	0.535	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG01583	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG01595	0.829	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG01879	0.844	0.844	0.0	0.0	0.968	0.968	1	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG02568	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG02922	0.768	0.768	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG03006	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG03052	1.142	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG03642	0.815	0.815	0.0	0.0	0.571	0.615	1	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	HG03742	0.829	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA12878	0.558	0.558	0.043	0.045	nan	nan	0	1
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA18525	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA18939	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA19017	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA19238	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA19239	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA19625	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA19648	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA20502	0.66	0.66	0.075	0.051	nan	nan	0	1
chr3	180917895	180918620	DEL	726	NA20845	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG00096	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG00268	1.324	1.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG00419	1.037	1.007	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG00759	1.454	1.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG01051	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG01112	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG01500	1.157	1.123	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG01565	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG01583	1.201	1.166	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG01595	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG01879	1.131	1.098	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG02568	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG02922	0.664	0.645	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG03006	1.327	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG03052	0.571	0.554	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG03642	1.383	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	HG03742	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA12878	0.981	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA18525	1.182	1.148	0.0	0.0	0.848	0.815	1	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA18939	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA19017	1.162	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA19238	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA19239	1.264	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA19625	1.189	1.154	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA19648	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA20502	0.865	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	182007234	182007373	DEL	140	NA20845	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG00096	1.139	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG00268	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG00419	0.824	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG00759	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG01051	0.804	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG01112	1.03	1.084	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG01500	1.05	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG01565	0.906	0.954	0.0	0.0	0.737	0.696	1	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG01583	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG01595	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG01879	0.861	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG02568	0.836	0.88	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG02922	1.1	1.158	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG03006	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG03052	0.655	0.69	0.018	0.056	nan	nan	0	1
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG03642	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	HG03742	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA12878	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA18525	1.033	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA18939	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA19017	0.941	0.99	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA19238	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA19239	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA19625	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA19648	1.123	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA20502	0.706	0.743	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr3	183266531	183266944	DEL	414	NA20845	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG00096	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG00268	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG00419	1.118	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG00759	1.183	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG01051	1.066	1.035	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG01112	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG01500	0.979	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG01565	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG01583	1.153	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG01595	0.927	0.9	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG01879	1.418	1.377	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG02568	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG02922	1.152	1.119	0.0	0.025	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG03006	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG03052	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG03642	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	HG03742	1.291	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA12878	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA18525	1.173	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA18939	1.121	1.089	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA19017	1.458	1.415	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA19239	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA19625	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA19648	0.948	0.92	0.0	0.03	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA20502	0.615	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183751947	183751998	DUP	52	NA20845	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG00096	0.199	0.221	0.076	0.0	0.688	0.717	13	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG00268	0.516	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG00419	0.285	0.316	0.067	0.0	0.375	0.375	3	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG00759	0.446	0.496	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG01051	0.181	0.201	0.022	0.0	nan	nan	0	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG01112	0.181	0.201	0.06	0.003	0.176	0.176	10	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG01500	0.534	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG01565	0.453	0.503	0.027	0.0	0.235	0.222	13	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG01583	0.0	0.0	0.112	0.018	nan	nan	0	0
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG01595	0.276	0.307	0.043	0.003	0.5	0.528	13	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG01879	0.179	0.199	0.03	0.004	0.333	0.333	1	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG02568	0.494	0.549	0.034	0.0	nan	nan	0	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG02922	0.519	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG03006	0.287	0.319	0.058	0.005	0.343	0.343	12	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG03052	0.0	0.0	0.13	0.005	nan	nan	0	0
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG03642	0.0	0.0	0.079	0.006	nan	nan	0	0
chr3	183876797	183877385	DEL	589	HG03742	0.193	0.214	0.032	0.0	0.286	0.286	14	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA12878	0.423	0.47	0.019	0.0	0.333	0.333	13	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA18525	0.455	0.506	0.069	0.0	0.222	0.231	9	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA18939	0.605	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA19017	0.0	0.0	0.153	0.014	nan	nan	0	0
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA19238	0.339	0.376	0.026	0.0	nan	nan	0	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA19239	0.0	0.0	0.098	0.003	nan	nan	0	0
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA19625	0.354	0.393	0.028	0.005	0.3	0.3	9	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA19648	0.25	0.277	0.027	0.005	nan	nan	0	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA20502	0.296	0.329	0.077	0.0	0.268	0.268	6	1
chr3	183876797	183877385	DEL	589	NA20845	0.304	0.337	0.025	0.007	nan	nan	0	1
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG00096	0.741	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG00268	0.722	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG00419	0.366	0.421	0.008	0.092	nan	nan	0	1
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG00759	0.756	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG01051	0.0	0.0	0.009	0.146	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG01500	0.819	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.128	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG01595	0.306	0.352	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG02922	0.0	0.0	0.008	0.157	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG03006	0.646	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.203	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG03642	0.519	0.596	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr3	184125346	184125555	DEL	210	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA18939	0.409	0.47	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA19625	0.405	0.465	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA19648	1.073	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr3	184125346	184125555	DEL	210	NA20845	0.217	0.249	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG00096	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG00268	1.342	1.303	0.0	0.0	0.714	0.686	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG00419	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG00759	1.105	1.073	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG01051	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG01112	1.12	1.088	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG01500	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG01565	1.112	1.079	0.0	0.0	0.964	0.979	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG01583	0.985	0.956	0.0	0.0	0.507	0.507	2	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG01595	1.046	1.015	0.0	0.0	0.958	0.908	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG01879	0.538	0.523	0.052	0.077	nan	nan	0	1
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG02568	1.329	1.291	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG02922	0.997	0.968	0.0	0.007	0.646	0.646	2	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG03006	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG03052	1.163	1.129	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG03642	0.914	0.887	0.0	0.0	0.577	0.536	2	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	HG03742	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA12878	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA18525	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA18939	0.943	0.916	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA19017	0.535	0.519	0.03	0.057	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA19238	1.055	1.024	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA19239	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA19625	1.138	1.105	0.0	0.0	0.422	0.422	2	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA19648	1.322	1.284	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA20502	1.138	1.105	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr3	186868980	186869471	DEL	492	NA20845	1.062	1.032	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG00096	1.519	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG00268	1.135	1.041	0.0	0.0	0.721	0.751	6	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG00419	0.671	0.616	0.082	0.053	nan	nan	0	1
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG00759	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG01051	1.247	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG01112	1.211	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG01500	1.264	1.159	0.0	0.0	0.634	0.662	1	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG01565	1.4	1.284	0.0	0.0	0.794	0.792	6	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG01583	1.177	1.08	0.0	0.0	0.908	0.908	4	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG01595	1.204	1.104	0.0	0.0	0.932	0.883	4	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG01879	1.346	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG02568	1.025	0.941	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG02922	1.204	1.105	0.0	0.0	0.692	0.692	3	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG03006	0.52	0.477	0.107	0.071	nan	nan	0	1
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG03052	1.332	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG03642	1.185	1.088	0.0	0.0	0.662	0.655	4	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	HG03742	1.349	1.238	0.0	0.0	0.744	0.744	1	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA12878	0.541	0.496	0.079	0.06	nan	nan	0	1
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA18525	1.243	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA18939	1.353	1.241	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA19017	1.365	1.253	0.0	0.0	0.973	0.931	3	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA19238	1.316	1.207	0.0	0.0	0.903	0.903	4	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA19239	1.355	1.243	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA19625	1.088	0.998	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA19648	1.223	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA20502	1.321	1.212	0.0	0.0	0.897	0.897	4	2
chr3	18729954	18730777	DEL	824	NA20845	1.258	1.154	0.0	0.0	0.762	0.707	1	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG00096	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG00268	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG00419	1.352	1.352	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG00759	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG01051	1.247	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG01112	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG01500	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG01565	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG01583	1.321	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG01595	1.302	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG01879	1.113	1.113	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG02568	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG02922	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG03006	1.121	1.121	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG03052	1.564	1.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG03642	0.58	0.58	0.0	0.04	0.9	0.969	1	1
chr3	189995602	189995669	DEL	68	HG03742	1.291	1.291	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA18525	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA18939	1.281	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA19017	1.402	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA19238	1.159	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA19239	1.122	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA19625	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA19648	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA20502	1.207	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	189995602	189995669	DEL	68	NA20845	0.911	0.911	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG00268	0.705	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG00419	0.427	0.427	0.009	0.093	nan	nan	0	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG00759	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG01051	0.503	0.503	0.0	0.09	0.6	0.6	2	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG01112	0.958	0.958	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG01500	0.481	0.481	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG01565	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG01583	0.601	0.601	0.0	0.055	0.333	0.333	1	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG01595	0.414	0.414	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG01879	0.556	0.556	0.006	0.08	nan	nan	0	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG02922	0.831	0.831	0.007	0.068	nan	nan	0	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG03052	0.338	0.338	0.0	0.136	0.857	0.857	3	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.123	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	HG03742	0.0	0.0	0.018	0.143	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA12878	0.0	0.0	0.008	0.161	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA18939	0.516	0.516	0.007	0.069	0.273	0.273	3	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA19017	0.554	0.554	0.0	0.056	0.208	0.218	1	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA19238	0.573	0.573	0.0	0.112	0.477	0.477	3	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	0
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA19625	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA19648	0.599	0.599	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA20502	0.546	0.546	0.007	0.081	0.421	0.421	3	1
chr3	190478458	190478634	DEL	177	NA20845	0.39	0.39	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG00096	1.193	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG00268	1.376	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG00419	0.691	0.691	0.0	0.029	0.606	0.606	1	1
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG00759	0.679	0.679	0.0	0.025	0.861	0.861	1	1
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG01051	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG01112	1.563	1.563	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG01500	1.192	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG01565	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG01583	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG01595	1.5	1.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG01879	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG02568	1.177	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG02922	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG03006	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG03052	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG03642	1.902	1.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	HG03742	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA12878	0.507	0.507	0.0	0.042	0.694	0.694	1	1
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA18525	1.112	1.112	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA18939	1.157	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA19238	1.198	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA19239	1.277	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA19625	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA19648	1.322	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA20502	0.387	0.387	0.0	0.023	0.889	0.889	1	1
chr3	191141010	191141067	DEL	58	NA20845	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG00096	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG00268	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG00419	0.915	0.915	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG00759	1.144	1.144	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG01051	1.066	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG01112	1.193	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG01500	1.086	1.086	0.0	0.0	0.735	0.705	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG01565	1.297	1.297	0.0	0.0	0.75	0.756	5	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG01583	1.105	1.105	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG01595	0.967	0.967	0.0	0.0	0.9	0.95	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG01879	1.202	1.202	0.0	0.002	0.474	0.474	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG02568	1.291	1.291	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG02922	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG03006	1.148	1.148	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG03052	1.332	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG03642	0.889	0.889	0.0	0.0	0.607	0.654	2	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	HG03742	0.732	0.732	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA12878	0.676	0.676	0.007	0.0	0.846	0.846	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA18525	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA18939	0.427	0.427	0.039	0.042	nan	nan	0	1
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA19017	1.052	1.052	0.0	0.0	0.906	0.883	4	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA19238	1.003	1.003	0.0	0.003	0.913	0.913	2	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA19239	1.071	1.071	0.0	0.0	0.694	0.694	6	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA19625	1.265	1.265	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA19648	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA20502	0.956	0.956	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr3	191788548	191789027	DEL	480	NA20845	1.236	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG00096	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG00268	0.946	0.918	0.0	0.0	0.909	0.873	1	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG00419	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG00759	1.067	1.035	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG01051	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG01112	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG01500	0.854	0.829	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG01565	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG01583	1.105	1.073	0.0	0.0	0.938	0.937	1	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG01595	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG01879	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG02568	1.291	1.254	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG02922	1.142	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG03006	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG03052	0.93	0.903	0.0	0.0	0.817	0.817	2	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG03642	1.037	1.007	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	HG03742	0.906	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA12878	0.744	0.722	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA18525	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA18939	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA19017	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA19238	0.599	0.582	0.062	0.043	nan	nan	0	1
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA19239	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA19625	1.189	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA19648	0.873	0.848	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA20502	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192122750	192123465	DEL	716	NA20845	0.954	0.926	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG00096	1.067	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG00759	0.465	0.427	0.0	0.042	0.875	0.875	1	1
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.04	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG01500	1.121	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG01565	1.153	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG01583	1.033	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG01879	0.61	0.56	0.0	0.057	0.533	0.533	1	1
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG02568	1.709	1.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG03006	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG03052	0.317	0.291	0.0	0.042	0.864	0.864	1	1
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	HG03742	0.694	0.636	0.007	0.048	0.625	0.625	1	1
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA12878	0.761	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA18525	0.525	0.482	0.0	0.018	0.719	0.749	1	1
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA19017	1.015	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA19238	0.456	0.418	0.0	0.038	0.854	0.854	1	1
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA19239	0.503	0.462	0.004	0.039	0.689	0.689	1	1
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA19648	1.248	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr3	192673319	192673387	DEL	69	NA20845	0.542	0.497	0.0	0.064	0.889	0.957	1	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG00096	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG00268	0.0	0.0	0.149	0.126	nan	nan	0	0
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG00419	0.0	0.0	0.199	0.133	nan	nan	0	0
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG00759	0.485	0.485	0.037	0.033	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG01051	0.0	0.0	0.151	0.142	nan	nan	0	0
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG01112	0.0	0.0	0.042	0.085	nan	nan	0	0
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG01500	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG01565	0.762	0.762	0.01	0.0	0.882	0.833	1	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG01583	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG01595	0.0	0.0	0.154	0.147	nan	nan	0	0
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG01879	0.485	0.485	0.037	0.049	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG02568	0.57	0.57	0.021	0.012	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG02922	0.727	0.727	0.0	0.0	0.579	0.579	4	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG03006	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG03052	1.015	1.015	0.0	0.0	0.516	0.516	2	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG03642	0.445	0.445	0.033	0.036	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	HG03742	0.463	0.463	0.071	0.076	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA12878	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA18525	0.385	0.385	0.029	0.041	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA18939	0.0	0.0	0.133	0.16	nan	nan	0	0
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA19017	0.627	0.627	0.046	0.042	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA19238	0.534	0.534	0.009	0.056	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA19239	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA19625	0.379	0.379	0.047	0.035	nan	nan	0	1
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA19648	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA20502	0.0	0.0	0.17	0.145	nan	nan	0	0
chr3	192744357	192744899	DEL	543	NA20845	0.0	0.0	0.181	0.157	nan	nan	0	0
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG00096	0.66	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG00268	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG00419	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG00759	0.776	0.816	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG01051	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG01112	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG01500	1.032	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG01565	0.762	0.802	0.0	0.0	0.478	0.506	1	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG01583	0.865	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG01595	0.75	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG01879	0.79	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG02568	0.912	0.959	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG02922	0.831	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG03006	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG03052	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG03642	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	HG03742	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA12878	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA18525	1.103	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA18939	0.32	0.337	0.008	0.102	0.456	0.456	4	1
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA19017	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA19238	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA19239	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA19625	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA19648	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA20502	0.956	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	193232225	193232464	DEL	240	NA20845	0.629	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG00096	0.687	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG00268	0.55	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG00419	0.742	0.853	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG00759	0.601	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG01051	0.583	0.67	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG01112	0.669	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG01500	0.854	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG01565	0.659	0.757	0.0	0.0	0.5	0.472	1	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG01583	0.985	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG01595	0.533	0.612	0.0	0.0	0.818	0.864	1	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG01879	0.736	0.846	0.0	0.0	0.801	0.801	2	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG02568	1.025	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG02922	0.395	0.453	0.04	0.03	nan	nan	0	1
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG03006	0.771	0.886	0.0	0.0	0.631	0.631	4	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG03052	0.655	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG03642	0.296	0.341	0.112	0.05	nan	nan	0	1
chr3	194555604	194556262	DEL	659	HG03742	0.694	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA12878	0.406	0.466	0.033	0.049	nan	nan	0	1
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA18525	1.068	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA18939	0.587	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA19017	0.461	0.53	0.062	0.046	nan	nan	0	1
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA19238	0.925	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA19239	0.374	0.43	0.064	0.063	nan	nan	0	1
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA19625	0.708	0.814	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA19648	0.724	0.832	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA20502	0.774	0.89	0.0	0.0	0.412	0.412	4	2
chr3	194555604	194556262	DEL	659	NA20845	0.347	0.399	0.087	0.056	nan	nan	0	1
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG00096	0.814	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG00268	0.671	0.706	0.005	0.0	0.635	0.61	2	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG00419	0.712	0.749	0.0	0.004	0.7	0.7	2	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG00759	0.31	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG01051	0.824	0.868	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG01112	1.301	1.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG01500	0.819	0.862	0.0	0.003	0.545	0.523	1	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG01565	0.453	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG01583	0.457	0.481	0.0	0.0	0.267	0.267	2	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG01595	0.493	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG01879	0.556	0.586	0.0	0.0	0.374	0.374	2	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG02568	0.494	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG02922	0.54	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG03006	0.323	0.34	0.0	0.074	0.8	0.8	1	1
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG03052	0.317	0.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG03642	0.37	0.39	0.0	0.0	0.375	0.348	1	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	HG03742	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA12878	0.676	0.712	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA18525	0.77	0.811	0.0	0.0	0.348	0.334	1	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA18939	0.552	0.581	0.0	0.0	0.2	0.2	1	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA19017	0.72	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA19238	0.195	0.206	0.0	0.138	0.556	0.556	1	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA19239	0.361	0.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA19625	0.379	0.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA19648	0.1	0.105	0.016	0.091	0.714	0.714	1	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA20502	0.433	0.455	0.0	0.0	0.3	0.3	1	2
chr3	194744060	194744311	DEL	252	NA20845	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG00096	0.832	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG00268	0.929	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG00419	0.671	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG00759	0.911	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG01051	0.885	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG01112	0.759	0.709	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG01500	0.854	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG01565	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG01583	0.889	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG01595	0.671	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG01879	0.664	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG02568	0.608	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG02922	0.81	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG03006	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG03052	0.254	0.237	0.008	0.076	nan	nan	0	1
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG03642	0.568	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	HG03742	0.752	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA12878	0.964	0.901	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA18525	0.735	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA18939	0.605	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA19017	0.738	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA19238	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA19239	0.929	0.868	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA19625	0.658	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA19648	0.574	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA20502	0.66	0.617	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	195115649	195115891	DEL	243	NA20845	0.802	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG00096	0.235	0.247	0.173	0.116	nan	nan	0	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG00268	0.0	0.0	0.413	0.239	nan	nan	0	0
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG00419	0.346	0.364	0.108	0.078	nan	nan	0	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG00759	0.0	0.0	0.378	0.203	nan	nan	0	0
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG01051	0.603	0.635	0.0	0.0	0.6	0.6	5	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG01112	0.578	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG01500	0.356	0.375	0.133	0.08	nan	nan	0	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG01565	0.0	0.0	0.398	0.236	nan	nan	0	0
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG01583	0.481	0.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG01595	0.0	0.0	0.266	0.162	nan	nan	0	0
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG01879	0.251	0.264	0.132	0.071	0.667	0.667	1	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG02568	0.418	0.44	0.054	0.04	0.4	0.4	1	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG02922	0.498	0.525	0.0	0.0	0.633	0.633	2	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG03006	0.0	0.0	0.459	0.286	nan	nan	0	0
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG03052	0.275	0.289	0.163	0.088	nan	nan	0	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG03642	0.247	0.26	0.101	0.078	0.25	0.269	2	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	HG03742	0.0	0.0	0.264	0.183	nan	nan	0	0
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA12878	0.372	0.392	0.052	0.03	nan	nan	0	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA18525	0.368	0.387	0.105	0.051	nan	nan	0	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA18939	0.0	0.0	0.351	0.257	nan	nan	0	0
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA19017	0.369	0.388	0.166	0.083	nan	nan	0	1
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA19238	0.886	0.932	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA19239	0.826	0.869	0.002	0.002	0.738	0.738	2	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA19625	0.506	0.532	0.0	0.0	0.838	0.838	4	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA19648	0.549	0.578	0.009	0.0	0.651	0.651	6	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA20502	0.865	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195569206	195569923	DEL	718	NA20845	0.911	0.959	0.007	0.0	0.667	0.619	1	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG00096	0.868	0.964	0.0	0.0	0.722	0.754	1	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG00268	0.826	0.917	0.0	0.0	0.741	0.711	3	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG00419	0.752	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG00759	0.717	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG01051	0.603	0.67	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG01112	0.578	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG01500	0.694	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG01565	0.576	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG01583	0.745	0.828	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG01595	0.552	0.614	0.0	0.0	0.818	0.864	3	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG01879	0.736	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG02568	0.987	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG02922	0.457	0.508	0.055	0.023	nan	nan	0	1
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG03006	0.699	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG03052	0.444	0.493	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG03642	1.013	1.125	0.0	0.0	0.8	0.862	1	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	HG03742	0.829	0.921	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA12878	1.015	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA18525	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA18939	0.943	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA19017	0.923	1.025	0.003	0.0	0.429	0.41	2	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA19238	0.782	0.868	0.0	0.002	0.942	0.942	2	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA19239	0.71	0.788	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA19625	0.733	0.815	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA19648	1.198	1.331	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA20502	0.774	0.86	0.0	0.0	0.723	0.723	2	2
chr3	195812053	195812636	DEL	584	NA20845	0.737	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG00096	0.56	0.59	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG00268	0.413	0.435	0.06	0.002	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG00419	0.427	0.449	0.025	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG00759	0.446	0.469	0.047	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG01051	0.0	0.0	0.193	0.0	nan	nan	0	0
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG01112	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG01500	0.0	0.0	0.187	0.0	nan	nan	0	0
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG01565	0.0	0.0	0.155	0.005	nan	nan	0	0
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG01583	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG01595	0.0	0.0	0.132	0.0	nan	nan	0	0
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG01879	0.879	0.926	0.0	0.001	0.8	0.8	1	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG02568	0.646	0.68	0.065	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG02922	0.934	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG03006	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG03052	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG03642	0.0	0.0	0.187	0.0	nan	nan	0	0
chr3	196055919	196056883	DEL	965	HG03742	0.405	0.426	0.057	0.004	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA12878	0.541	0.57	0.04	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA18525	0.0	0.0	0.265	0.0	nan	nan	0	0
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA18939	0.498	0.525	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA19017	0.0	0.0	0.368	0.0	nan	nan	0	0
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA19238	1.029	1.083	0.0	0.0	0.581	0.581	1	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA19239	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA19625	0.607	0.639	0.075	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA19648	0.499	0.525	0.099	0.0	nan	nan	0	1
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA20502	1.047	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	196055919	196056883	DEL	965	NA20845	0.455	0.479	0.03	0.006	nan	nan	0	1
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG00096	0.705	0.742	0.0	0.0	0.667	0.696	11	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG00268	0.636	0.67	0.0	0.0	0.591	0.616	5	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG00419	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG00759	0.95	1.0	0.006	0.0	0.438	0.437	1	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG01051	0.583	0.614	0.0	0.0	0.652	0.652	4	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG01112	0.596	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG01500	0.854	0.899	0.0	0.0	0.879	0.852	4	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG01565	0.741	0.78	0.0	0.0	0.775	0.782	4	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG01583	0.961	1.012	0.0	0.0	0.524	0.524	2	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG01595	0.809	0.852	0.0	0.0	0.71	0.71	8	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG01879	0.377	0.397	0.042	0.0	0.1	0.1	2	1
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG02568	0.608	0.64	0.01	0.0	nan	nan	0	1
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG02922	0.0	0.0	0.168	0.0	nan	nan	0	0
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG03006	0.789	0.831	0.0	0.0	0.833	0.833	5	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG03052	0.761	0.801	0.0	0.0	0.625	0.625	7	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG03642	0.963	1.014	0.0	0.0	0.889	0.871	3	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	HG03742	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA12878	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA18525	0.823	0.866	0.0	0.0	0.699	0.671	4	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA18939	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA19017	0.83	0.874	0.0	0.0	0.55	0.526	10	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA19238	1.016	1.069	0.0	0.0	0.76	0.76	3	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA19239	0.787	0.828	0.0	0.0	0.941	0.941	3	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA19625	0.658	0.692	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA19648	0.724	0.762	0.0	0.0	0.778	0.778	7	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA20502	0.751	0.791	0.0	0.0	0.804	0.804	8	2
chr3	2028330	2029193	DEL	864	NA20845	0.694	0.73	0.0	0.0	0.615	0.571	7	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG00096	0.904	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG00268	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG00419	0.549	0.61	0.0	0.026	0.692	0.692	1	1
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG00759	0.33	0.366	0.0	0.033	0.625	0.625	1	1
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG01051	1.026	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG01112	0.849	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG01500	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG01565	0.762	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG01583	1.105	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG01595	0.71	0.789	0.0	0.034	0.641	0.677	1	1
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG01879	0.485	0.538	0.0	0.035	0.8	0.8	1	1
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG02568	1.139	1.266	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG02922	0.851	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG03006	1.058	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG03052	1.036	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG03642	1.062	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	HG03742	1.118	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA12878	0.845	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA18525	1.208	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA18939	0.89	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA19017	1.033	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA19238	1.029	1.143	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA19239	1.058	1.175	0.0	0.0	0.795	0.795	1	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA19625	1.163	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA19648	0.873	0.97	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA20502	1.047	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20492791	20492858	DEL	68	NA20845	1.019	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG00096	0.452	0.452	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG00268	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG00419	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG00759	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG01051	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG01112	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG01500	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG01565	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG01583	0.625	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG01595	0.651	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG01879	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG02568	0.798	0.798	0.0	0.037	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG02922	0.685	0.685	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG03006	0.897	0.897	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG03052	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG03642	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	HG03742	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA12878	0.829	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA18525	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA18939	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA19017	0.48	0.48	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA19238	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA19625	0.531	0.531	0.024	0.01	nan	nan	0	1
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA19648	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA20502	0.41	0.41	0.012	0.054	nan	nan	0	1
chr3	20919491	20919766	DEL	276	NA20845	0.759	0.759	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG00096	1.049	1.104	0.0	0.0	0.633	0.661	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG00268	1.152	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG00419	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG00759	1.183	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG01051	0.623	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG01112	1.084	1.141	0.0	0.0	0.514	0.514	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG01500	0.472	0.496	0.0	0.082	0.686	0.716	1	1
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG01565	0.854	0.899	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG01583	0.961	1.012	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG01595	1.026	1.08	0.0	0.0	0.905	0.857	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG01879	0.969	1.02	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG02568	0.968	1.019	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG02922	1.038	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG03006	0.807	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG03052	0.74	0.779	0.0	0.083	0.692	0.692	1	1
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG03642	1.235	1.3	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	HG03742	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA12878	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA18525	1.033	1.087	0.0	0.0	0.893	0.93	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA18939	1.175	1.236	0.0	0.006	0.939	0.939	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA19017	0.812	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA19238	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA19239	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA19625	0.961	1.012	0.0	0.0	0.478	0.478	1	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA19648	1.023	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA20502	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	20945212	20945311	DEL	100	NA20845	0.325	0.342	0.0	0.033	0.571	0.615	1	1
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG00096	1.139	1.139	0.0	0.0	0.639	0.612	1	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG00268	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG00419	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG00759	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG01051	1.046	1.046	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG01112	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG01500	1.157	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG01565	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG01583	1.177	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG01595	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG01879	0.736	0.736	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG02568	1.063	1.063	0.0	0.0	0.583	0.583	2	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG02922	0.768	0.768	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG03006	0.951	0.951	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG03052	1.078	1.078	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG03642	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	HG03742	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA12878	0.981	0.981	0.005	0.0	0.808	0.808	1	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA18525	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA18939	1.317	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA19017	0.996	0.996	0.0	0.0	0.769	0.736	1	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA19238	1.277	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA19239	0.529	0.529	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA19625	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA19648	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA20502	1.252	1.252	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	22887536	22887740	DEL	205	NA20845	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG00096	0.814	0.904	0.0	0.0	0.545	0.569	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG00268	1.032	1.147	0.0	0.0	0.571	0.549	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG00419	0.813	0.904	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG00759	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG01051	0.744	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG01112	0.398	0.442	0.026	0.062	nan	nan	0	1
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG01500	0.819	0.91	0.0	0.0	0.842	0.807	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG01565	0.515	0.572	0.027	0.037	nan	nan	0	1
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG01583	1.129	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG01595	0.375	0.417	0.028	0.084	nan	nan	0	1
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG01879	0.628	0.698	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG02568	1.063	1.182	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG02922	0.768	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG03006	0.699	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG03052	0.951	1.057	0.0	0.0	0.883	0.883	2	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG03642	0.519	0.576	0.012	0.05	nan	nan	0	1
chr3	23685700	23686174	DEL	475	HG03742	0.617	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA12878	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA18525	0.928	1.031	0.0	0.0	0.824	0.859	2	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA18939	0.73	0.811	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA19017	0.941	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA19238	0.964	1.071	0.0	0.0	0.763	0.763	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA19239	0.826	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA19625	0.607	0.674	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA19648	0.823	0.915	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA20502	0.524	0.582	0.03	0.067	nan	nan	0	1
chr3	23685700	23686174	DEL	475	NA20845	0.672	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG00096	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG00268	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG00419	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG00759	1.222	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG01051	1.026	0.996	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG01112	1.156	1.123	0.0	0.0	0.964	0.964	1	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG01500	1.086	1.054	0.004	0.0	0.546	0.57	2	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG01565	0.844	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG01583	1.105	1.073	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG01595	1.026	0.996	0.0	0.0	0.955	0.992	1	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG01879	0.736	0.714	0.0	0.0	0.652	0.652	3	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG02568	0.987	0.959	0.0	0.0	0.81	0.81	4	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG02922	0.893	0.867	0.0	0.0	0.692	0.692	3	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG03006	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG03052	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG03642	1.136	1.103	0.0	0.0	0.632	0.586	1	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	HG03742	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA12878	0.812	0.788	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA18525	0.911	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA18939	1.068	1.037	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA19017	0.59	0.573	0.082	0.044	nan	nan	0	1
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA19238	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA19239	1.006	0.977	0.0	0.0	0.783	0.783	3	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA19625	1.062	1.031	0.0	0.0	0.914	0.914	4	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA19648	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA20502	1.252	1.216	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr3	24289384	24289997	DEL	614	NA20845	1.193	1.158	0.0	0.0	0.68	0.631	1	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG00096	0.85	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG00268	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG00419	0.895	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG00759	0.621	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG01051	0.985	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG01112	0.723	0.676	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG01500	0.747	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG01565	0.566	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG01583	1.201	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG01595	0.927	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG01879	0.52	0.486	0.0	0.028	0.667	0.667	1	1
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG02568	0.949	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG02922	0.872	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG03006	0.699	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG03052	1.226	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG03642	1.309	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	HG03742	0.713	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA12878	0.964	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA18525	1.033	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA18939	0.605	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA19017	0.959	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA19238	0.729	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA19239	0.955	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA19625	0.809	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA19648	1.372	1.282	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA20502	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	25759232	25759297	DEL	66	NA20845	0.629	0.588	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG00096	1.211	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG00268	0.929	0.868	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG00419	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG00759	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG01051	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG01112	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG01500	1.264	1.181	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG01565	0.947	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG01583	1.129	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG01595	1.302	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG01879	1.346	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG02568	0.494	0.461	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG02922	1.474	1.378	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG03006	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG03052	1.332	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG03642	1.507	1.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	HG03742	1.176	1.099	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA12878	1.031	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA18525	1.366	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA18939	1.299	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA19017	1.531	1.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA19238	1.277	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA19239	1.213	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA19625	1.416	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA19648	1.447	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA20502	1.116	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26148985	26149121	DEL	137	NA20845	1.062	0.993	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG00096	0.777	0.777	0.0	0.0	0.9	0.862	1	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG00268	0.722	0.722	0.0	0.0	0.632	0.658	2	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG00759	0.349	0.349	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG01051	0.845	0.845	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG01112	0.289	0.289	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG01500	0.943	0.943	0.0	0.003	0.579	0.555	1	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG01565	0.535	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG01583	0.36	0.36	0.0	0.0	0.143	0.143	1	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG01595	0.414	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG01879	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG02568	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG02922	0.706	0.706	0.0	0.0	0.656	0.656	2	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG03006	0.395	0.395	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG03052	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG03642	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	HG03742	0.308	0.308	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA12878	0.304	0.304	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA18525	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA18939	0.676	0.676	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA19017	0.959	0.959	0.0	0.0	0.742	0.71	1	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA19238	1.068	1.068	0.0	0.0	0.795	0.795	2	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA19239	0.813	0.813	0.0	0.0	0.713	0.713	2	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA19625	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA19648	0.499	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA20502	0.387	0.387	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26451164	26451660	DEL	497	NA20845	0.52	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG00096	0.452	0.415	0.0	0.053	0.895	0.934	2	1
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG00268	0.74	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG00419	0.397	0.364	0.0	0.062	0.82	0.82	2	1
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG00759	0.911	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG01112	1.156	1.061	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG01500	0.658	0.604	0.0	0.042	0.375	0.391	1	1
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG01565	0.412	0.378	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG01583	0.913	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG01595	0.434	0.398	0.0	0.053	0.5	0.528	1	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG01879	0.826	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG02568	0.798	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG02922	0.934	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG03006	0.825	0.757	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG03052	0.909	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG03642	0.889	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	HG03742	1.127	1.034	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA12878	0.507	0.465	0.0	0.061	0.622	0.622	1	1
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA18939	0.481	0.441	0.0	0.068	0.578	0.578	2	1
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA19017	1.015	0.931	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA19238	1.055	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA19239	0.71	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA19625	0.86	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA19648	1.297	1.19	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA20502	0.865	0.794	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr3	26469887	26469982	DEL	96	NA20845	0.412	0.378	0.0	0.06	0.805	0.866	2	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG00096	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG00268	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG00419	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG00759	1.26	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG01051	1.327	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG01112	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG01500	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG01565	1.215	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG01583	1.321	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG01595	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG01879	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG02568	0.76	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG02922	0.872	0.847	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG03006	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG03052	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG03642	1.21	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	HG03742	0.752	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA12878	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA18525	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA18939	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA19017	0.83	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA19238	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA19239	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA19625	1.012	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA19648	0.898	0.872	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA20502	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27750306	27750399	DEL	94	NA20845	0.434	0.421	0.0	0.051	0.4	0.431	1	1
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG00096	0.814	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG00268	0.533	0.592	0.005	0.025	nan	nan	0	1
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG00419	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG00759	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG01051	0.744	0.827	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG01112	0.343	0.381	0.016	0.014	0.231	0.231	11	1
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG01500	0.819	0.91	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG01565	0.659	0.732	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG01583	0.36	0.4	0.0	0.027	nan	nan	0	1
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG01595	0.552	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG01879	0.251	0.279	0.009	0.018	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG02568	0.456	0.506	0.0	0.009	1.0	1.0	2	1
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG02922	0.374	0.415	0.012	0.035	nan	nan	0	1
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG03006	0.951	1.056	0.0	0.0	0.719	0.719	3	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG03052	0.74	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG03642	0.692	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	HG03742	0.636	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA12878	0.964	1.071	0.0	0.002	0.667	0.667	3	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA18525	0.911	1.012	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA18939	0.534	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA19017	0.535	0.595	0.0	0.045	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA19238	0.417	0.463	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA19239	0.864	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA19625	0.43	0.478	0.011	0.007	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA19648	0.424	0.471	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA20502	0.956	1.063	0.0	0.005	0.538	0.538	3	2
chr3	27832097	27832431	DEL	335	NA20845	0.759	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG00096	1.175	1.098	0.0	0.0	0.929	0.925	3	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG00268	1.049	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG00419	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG00759	1.086	1.015	0.0	0.0	0.787	0.787	4	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG01051	1.126	1.052	0.0	0.003	0.83	0.83	4	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG01112	1.193	1.115	0.0	0.0	0.85	0.85	4	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG01500	0.836	0.782	0.0	0.0	0.696	0.726	3	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG01565	1.091	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG01583	1.057	0.988	0.0	0.0	0.708	0.708	4	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG01595	0.908	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG01879	0.449	0.419	0.052	0.042	nan	nan	0	1
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG02568	0.949	0.887	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG02922	1.059	0.99	0.0	0.0	0.515	0.515	2	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG03006	1.076	1.006	0.0	0.0	0.586	0.586	5	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG03052	1.121	1.047	0.0	0.004	0.766	0.766	2	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG03642	1.185	1.108	0.0	0.0	0.899	0.889	4	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	HG03742	0.925	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA12878	0.778	0.727	0.0	0.003	0.75	0.75	1	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA18525	1.191	1.113	0.0	0.003	0.843	0.842	2	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA18939	1.175	1.098	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA19017	1.033	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA19238	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA19239	1.135	1.061	0.0	0.0	0.912	0.912	4	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA19625	1.113	1.04	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA19648	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA20502	1.207	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28765934	28766552	DEL	619	NA20845	0.954	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG00096	1.012	1.066	0.0	0.0	0.636	0.664	2	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG00268	0.894	0.941	0.0	0.0	0.9	0.938	1	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG00419	0.427	0.449	0.106	0.076	nan	nan	0	1
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG00759	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG01051	0.965	1.016	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG01112	1.03	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG01500	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG01565	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG01583	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG01595	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG01879	0.879	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG02568	0.836	0.88	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG02922	0.976	1.027	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG03006	0.43	0.453	0.051	0.048	nan	nan	0	1
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG03052	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG03642	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	HG03742	0.482	0.507	0.085	0.059	nan	nan	0	1
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA12878	0.981	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA18525	0.963	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA18939	0.356	0.375	0.028	0.033	nan	nan	0	1
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA19017	1.218	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA19238	0.43	0.452	0.011	0.023	nan	nan	0	1
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA19239	0.774	0.815	0.007	0.0	0.861	0.861	1	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA19625	0.885	0.932	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA19648	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA20502	1.002	1.055	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr3	28950217	28950806	DEL	590	NA20845	0.867	0.913	0.0	0.004	0.417	0.387	1	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG00096	0.687	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG00268	0.722	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG00419	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG00759	0.562	0.562	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG01051	0.643	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG01112	0.687	0.687	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG01500	0.676	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG01565	0.597	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG01583	0.769	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG01595	0.651	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG01879	0.628	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG02568	0.665	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG02922	0.706	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG03006	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG03052	0.803	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG03642	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	HG03742	0.308	0.308	0.032	0.07	nan	nan	0	1
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA12878	0.862	0.862	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA18525	0.805	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA18939	0.641	0.641	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA19017	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA19238	0.729	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA19239	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA19625	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA19648	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA20502	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	31109437	31109758	DEL	322	NA20845	0.585	0.585	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG00096	0.832	0.875	0.0	0.004	0.885	0.923	3	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG00268	0.774	0.815	0.0	0.0	0.727	0.758	2	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG00419	0.813	0.856	0.0	0.0	0.702	0.702	2	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG00759	0.717	0.755	0.0	0.0	0.81	0.81	2	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG01051	0.764	0.804	0.0	0.0	0.81	0.81	3	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG01112	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG01500	0.908	0.955	0.0	0.0	1.0	0.958	3	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG01565	0.762	0.802	0.0	0.0	0.519	0.521	2	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG01583	0.937	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG01595	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG01879	0.61	0.642	0.0	0.0	0.643	0.643	3	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG02568	0.912	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG02922	0.706	0.743	0.0	0.0	0.889	0.889	5	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG03006	1.004	1.057	0.0	0.0	0.903	0.903	1	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG03052	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG03642	0.741	0.78	0.0	0.0	0.455	0.49	3	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	HG03742	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA12878	1.048	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA18525	1.086	1.143	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA18939	0.73	0.768	0.0	0.0	0.604	0.604	2	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA19017	0.923	0.971	0.0	0.0	0.6	0.627	3	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA19238	0.912	0.96	0.0	0.0	0.969	0.969	1	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA19239	0.942	0.991	0.005	0.0	0.825	0.825	4	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA19625	0.986	1.038	0.0	0.003	0.773	0.773	4	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA19648	0.898	0.945	0.0	0.0	0.767	0.767	2	2
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA20502	0.501	0.527	0.085	0.025	0.217	0.217	7	1
chr3	32338801	32339722	DEL	922	NA20845	0.911	0.959	0.0	0.0	0.882	0.95	1	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG00096	0.47	0.495	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG00268	0.258	0.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG00419	0.224	0.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG00759	0.252	0.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG01051	0.221	0.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG01112	0.343	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG01500	0.587	0.618	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG01565	0.432	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG01583	0.24	0.253	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG01595	0.306	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG01879	0.179	0.189	0.0	0.014	0.471	0.471	1	1
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG02568	0.114	0.12	0.0	0.019	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG02922	0.208	0.219	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG03006	0.287	0.302	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG03052	0.148	0.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG03642	0.222	0.234	0.0	0.0	0.5	0.538	3	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	HG03742	0.212	0.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA12878	0.338	0.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA18525	0.403	0.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA18939	0.392	0.412	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA19017	0.387	0.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA19238	0.195	0.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA19239	0.439	0.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA19625	0.202	0.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA19648	0.25	0.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA20502	0.25	0.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32457817	32457935	DEL	119	NA20845	0.325	0.342	0.0	0.0	0.429	0.462	3	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG00096	0.434	0.434	0.0	0.056	0.812	0.848	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG00268	0.43	0.43	0.0	0.052	0.588	0.613	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG00419	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG00759	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG01051	0.784	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG01112	0.632	0.632	0.0	0.037	0.35	0.35	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG01500	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	0
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG01583	1.177	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG01595	1.066	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG01879	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG02568	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG02922	0.748	0.748	0.0	0.059	0.3	0.3	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG03006	0.538	0.538	0.0	0.07	0.526	0.526	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG03052	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG03642	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA12878	0.44	0.44	0.0	0.047	0.455	0.455	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA18525	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA18939	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA19017	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA19238	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA19239	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA19625	1.189	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA19648	0.424	0.424	0.0	0.072	0.7	0.7	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA20502	0.364	0.364	0.0	0.046	0.92	0.92	1	1
chr3	32940758	32940854	DEL	97	NA20845	0.412	0.412	0.0	0.057	0.786	0.73	1	1
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG00096	0.687	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG00268	0.843	0.887	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG00419	0.773	0.813	0.003	0.0	0.833	0.833	1	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG00759	0.601	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG01051	0.583	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG01112	0.687	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG01500	0.925	0.974	0.0	0.0	0.875	0.913	1	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG01565	0.803	0.845	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG01583	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG01595	0.73	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG01879	0.861	0.907	0.0	0.002	1.0	1.0	1	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG02568	0.608	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG02922	0.685	0.721	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG03006	0.879	0.925	0.0	0.0	0.69	0.69	3	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG03052	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG03642	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	HG03742	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA12878	0.862	0.908	0.002	0.0	0.692	0.692	1	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA18525	0.0	0.0	0.034	0.0	nan	nan	0	0
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA18939	0.676	0.712	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA19017	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA19238	0.782	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA19239	0.774	0.815	0.0	0.0	0.669	0.669	2	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA19625	0.885	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA19648	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA20502	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	33421845	33422633	DEL	789	NA20845	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG00096	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG00759	0.989	0.989	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG01051	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG01112	0.506	0.506	0.0	0.069	0.862	0.862	1	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG01500	0.392	0.392	0.008	0.053	0.75	0.719	1	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG01565	0.618	0.618	0.0	0.01	0.333	0.315	1	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG01583	1.201	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG01595	1.184	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG01879	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG02922	1.184	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG03052	1.205	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG03642	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	HG03742	1.272	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	NA19239	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	NA19648	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	NA20502	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	3723307	3723381	DUP	75	NA20845	0.781	0.781	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG00096	0.877	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG00268	0.43	0.478	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG00419	0.488	0.542	0.0	0.07	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG00759	0.427	0.474	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG01051	0.704	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG01112	0.849	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG01500	0.374	0.415	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG01565	0.618	0.686	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG01583	0.673	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG01595	0.513	0.57	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG01879	0.772	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG02568	1.101	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG02922	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG03006	0.807	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG03052	0.825	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG03642	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	HG03742	0.925	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA12878	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA18525	1.068	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA18939	0.374	0.415	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA19017	0.904	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA19238	1.016	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA19239	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA19625	0.784	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA19648	0.699	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA20502	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38154940	38155075	DEL	136	NA20845	0.585	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG00096	0.994	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG00268	1.29	1.183	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG00419	1.098	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG00759	1.028	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG01051	1.046	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG01112	1.373	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG01500	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG01565	1.318	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG01583	1.321	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG01595	1.322	1.213	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG01879	0.933	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG02568	0.76	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG02922	1.37	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG03006	0.466	0.428	0.0	0.037	0.912	0.912	1	1
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG03052	1.078	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG03642	1.457	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	HG03742	1.214	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA12878	0.879	0.807	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA18525	0.946	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA18939	1.299	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA19017	1.273	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA19238	1.159	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA19239	1.148	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA19625	1.088	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA19648	1.048	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA20502	0.934	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	38542403	38542481	DEL	79	NA20845	0.911	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG00096	0.796	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG00268	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG00419	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG00759	0.805	0.847	0.0	0.004	0.824	0.824	1	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG01051	0.804	0.847	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG01112	0.669	0.704	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG01500	0.925	0.974	0.0	0.0	0.96	0.998	1	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG01565	0.535	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG01583	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG01595	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG01879	0.341	0.359	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG02568	0.532	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG02922	0.851	0.896	0.0	0.004	0.875	0.875	1	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG03006	0.699	0.736	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG03052	1.057	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG03642	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	HG03742	0.713	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA12878	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA18525	0.805	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA18939	0.89	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA19017	0.996	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA19238	0.795	0.836	0.0	0.0	0.836	0.836	2	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA19239	0.993	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA19625	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA19648	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA20502	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	4034812	4034937	DEL	126	NA20845	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG00096	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG00268	0.619	0.601	0.057	0.039	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG00419	0.874	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG00759	1.028	0.998	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG01051	0.503	0.488	0.048	0.043	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG01112	0.578	0.561	0.033	0.04	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG01500	0.0	0.0	0.164	0.141	nan	nan	0	0
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG01565	1.194	1.159	0.0	0.0	0.935	0.991	1	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG01583	1.321	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG01595	0.71	0.69	0.047	0.039	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG01879	1.328	1.289	0.0	0.0	0.703	0.703	3	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG02568	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG02922	0.831	0.806	0.0	0.0	0.571	0.571	3	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG03006	0.448	0.435	0.051	0.032	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG03052	0.0	0.0	0.197	0.149	nan	nan	0	0
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG03642	0.593	0.575	0.067	0.041	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	HG03742	1.31	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA12878	0.372	0.361	0.01	0.027	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA18525	0.56	0.544	0.012	0.039	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA18939	1.05	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA19017	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA19238	1.094	1.062	0.0	0.0	0.776	0.776	1	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA19239	1.213	1.177	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA19625	0.506	0.491	0.069	0.054	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA19648	0.873	0.848	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA20502	0.797	0.774	0.051	0.032	nan	nan	0	1
chr3	41336622	41337193	DEL	572	NA20845	0.0	0.0	0.18	0.125	nan	nan	0	0
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG00096	0.633	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG00268	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG00419	1.057	1.057	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG00759	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG01051	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG01112	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG01500	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG01565	1.297	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG01583	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG01595	0.829	0.829	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG01879	0.682	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG02568	1.557	1.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG02922	0.498	0.498	0.0	0.029	0.739	0.739	1	1
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG03006	0.861	0.861	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG03052	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG03642	0.827	0.827	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	HG03742	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA12878	0.862	0.862	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA18525	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA18939	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA19017	0.332	0.332	0.0	0.019	0.591	0.618	1	1
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA19238	0.612	0.612	0.0	0.027	0.684	0.684	1	1
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA19239	0.761	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA19625	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA19648	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA20502	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	41896683	41896746	DEL	64	NA20845	1.019	1.019	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG00096	0.832	0.875	0.0	0.0	0.536	0.513	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG00268	0.998	1.05	0.005	0.0	0.792	0.76	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG00419	0.874	0.92	0.0	0.002	0.509	0.509	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG00759	0.64	0.674	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG01051	0.824	0.868	0.0	0.0	0.859	0.859	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG01112	0.741	0.78	0.0	0.0	0.503	0.503	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG01500	0.641	0.674	0.0	0.002	0.464	0.484	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG01565	0.721	0.759	0.0	0.012	0.833	0.787	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG01583	0.793	0.835	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG01595	0.552	0.582	0.0	0.0	0.6	0.568	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG01879	0.7	0.737	0.0	0.003	0.49	0.49	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG02568	1.215	1.279	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG02922	0.727	0.765	0.0	0.004	0.615	0.615	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG03006	0.843	0.887	0.0	0.005	0.44	0.44	3	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG03052	0.909	0.957	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG03642	0.741	0.78	0.0	0.0	0.723	0.716	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	HG03742	0.636	0.669	0.0	0.006	0.598	0.598	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA12878	1.048	1.104	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA18525	0.735	0.774	0.0	0.014	0.432	0.45	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA18939	0.943	0.993	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA19017	0.812	0.855	0.012	0.003	0.23	0.241	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA19238	0.795	0.836	0.0	0.002	0.654	0.654	1	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA19239	0.452	0.475	0.025	0.009	0.39	0.39	2	1
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA19625	0.733	0.772	0.0	0.0	0.506	0.506	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA19648	0.823	0.867	0.0	0.005	0.781	0.781	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA20502	0.66	0.695	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr3	42639891	42640531	DEL	641	NA20845	0.672	0.708	0.006	0.011	0.833	0.774	1	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG00096	0.615	0.559	0.0	0.045	0.6	0.626	1	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG00268	1.221	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG00419	1.159	1.054	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG00759	1.086	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG01051	1.247	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG01112	1.138	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG01500	1.37	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG01565	1.235	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG01595	0.513	0.466	0.0	0.007	0.583	0.616	1	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG01879	0.52	0.473	0.0	0.027	0.824	0.824	1	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG02568	1.063	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG03006	1.202	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG03052	0.719	0.653	0.0	0.044	0.892	0.892	1	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG03642	1.161	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	HG03742	0.52	0.473	0.0	0.02	0.886	0.886	1	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA18525	1.383	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA18939	1.406	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA19017	1.162	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA19238	0.456	0.414	0.0	0.022	0.974	0.974	1	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA19239	1.071	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA19625	0.481	0.437	0.0	0.019	0.75	0.75	1	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA19648	1.223	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA20502	0.774	0.704	0.0	0.018	0.432	0.432	1	1
chr3	45831051	45831105	DEL	55	NA20845	1.236	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG00096	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG00268	0.74	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG00419	0.712	0.818	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG00759	0.853	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG01051	0.664	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG01112	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG01500	0.676	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG01565	0.762	0.876	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG01583	0.601	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG01595	0.612	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG01879	0.574	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG02568	0.646	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG02922	0.664	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG03006	0.377	0.433	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG03052	0.74	0.851	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG03642	0.914	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	HG03742	0.752	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA12878	0.761	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA18525	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA18939	0.73	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA19017	0.812	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA19238	0.912	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA19239	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA19625	0.733	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA19648	0.848	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA20502	0.82	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	45922201	45922334	DEL	134	NA20845	0.585	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG00096	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG00268	1.118	1.177	0.0	0.0	0.719	0.69	1	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG00419	0.468	0.492	0.023	0.068	nan	nan	0	1
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG00759	0.679	0.714	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG01051	0.422	0.445	0.03	0.122	nan	nan	0	1
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG01112	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG01500	0.836	0.88	0.006	0.0	0.571	0.596	1	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG01565	0.782	0.824	0.0	0.005	0.847	0.897	2	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG01583	0.553	0.582	0.028	0.056	nan	nan	0	1
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG01595	1.046	1.101	0.0	0.0	0.833	0.789	1	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG01879	0.942	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG02568	0.532	0.56	0.022	0.071	nan	nan	0	1
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG02922	1.038	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG03006	0.986	1.038	0.0	0.0	0.86	0.86	2	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG03052	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG03642	0.914	0.962	0.008	0.0	0.668	0.668	2	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	HG03742	0.944	0.994	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA12878	0.812	0.854	0.0	0.004	0.833	0.833	1	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA18525	0.473	0.498	0.009	0.112	nan	nan	0	1
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA18939	0.979	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA19017	0.904	0.952	0.0	0.0	0.76	0.727	1	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA19238	0.651	0.686	0.008	0.06	nan	nan	0	1
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA19239	0.993	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA19625	1.037	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA19648	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA20502	1.025	1.079	0.0	0.0	0.839	0.839	2	2
chr3	54241147	54241562	DEL	416	NA20845	0.824	0.867	0.0	0.0	0.733	0.79	2	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG00096	0.805	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG00268	1.101	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG00419	1.057	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG00759	0.543	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG01051	0.684	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG01112	0.949	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG01500	0.463	0.425	0.0	0.022	0.815	0.85	1	1
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG01565	0.803	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG01583	0.553	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG01595	0.987	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG01879	1.059	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG02568	0.817	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG02922	0.872	0.8	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG03006	0.951	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG03052	0.867	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG03642	0.963	0.884	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	HG03742	0.713	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA12878	0.761	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA18525	0.954	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA18939	0.89	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA19017	0.904	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA19238	0.938	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA19239	1.058	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA19625	0.759	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA19648	0.798	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA20502	0.842	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	54955919	54955980	DEL	62	NA20845	0.781	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG00096	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG00268	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG00419	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG00759	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG01051	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG01112	1.12	1.12	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG01500	1.299	1.299	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG01565	1.132	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG01583	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG01595	1.263	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG01879	1.077	1.077	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG02568	0.608	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG02922	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG03006	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG03052	1.184	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG03642	1.26	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	HG03742	1.388	1.388	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA12878	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA18525	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA18939	1.264	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA19238	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA19239	1.213	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA19625	1.214	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA19648	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA20502	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	5506500	5506561	DEL	62	NA20845	1.041	1.041	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG00096	0.687	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG00268	0.396	0.455	0.007	0.058	0.581	0.605	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG00759	0.446	0.513	0.0	0.058	0.875	0.875	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG01051	0.402	0.462	0.0	0.029	0.5	0.5	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG01500	0.463	0.532	0.0	0.042	0.629	0.656	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG01565	0.144	0.166	0.0	0.03	0.8	0.847	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG01583	0.505	0.58	0.008	0.025	0.65	0.65	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG01879	0.646	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG02568	0.266	0.306	0.0	0.085	0.636	0.636	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG02922	0.81	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG03006	0.359	0.412	0.0	0.049	0.8	0.8	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG03052	0.402	0.462	0.0	0.038	0.25	0.25	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG03642	0.84	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	55358446	55358539	DEL	94	HG03742	0.308	0.354	0.0	0.077	0.818	0.818	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA12878	0.0	0.0	0.009	0.135	nan	nan	0	0
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA18525	0.385	0.443	0.0	0.051	0.556	0.579	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA18939	0.231	0.266	0.0	0.074	0.7	0.7	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA19017	0.535	0.615	0.0	0.056	0.714	0.747	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA19238	0.834	0.958	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA19625	0.215	0.247	0.0	0.024	0.9	0.9	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA19648	0.599	0.688	0.0	0.034	0.417	0.417	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA20502	0.353	0.406	0.0	0.027	0.65	0.65	1	1
chr3	55358446	55358539	DEL	94	NA20845	0.824	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG00096	0.0	0.0	0.007	0.143	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG00268	0.361	0.351	0.023	0.07	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG00419	0.0	0.0	0.029	0.153	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG00759	0.465	0.452	0.025	0.071	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG01051	0.402	0.39	0.008	0.071	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG01112	0.434	0.421	0.016	0.058	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.182	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG01565	0.0	0.0	0.02	0.164	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG01583	0.36	0.35	0.01	0.045	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG01595	0.73	0.709	0.01	0.04	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG01879	0.7	0.68	0.0	0.008	0.615	0.615	1	2
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG02922	0.374	0.363	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG03006	0.323	0.313	0.008	0.068	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG03052	0.655	0.636	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG03642	0.988	0.959	0.0	0.0	0.417	0.387	1	2
chr3	56604704	56604961	DEL	258	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.192	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA12878	0.0	0.0	0.014	0.123	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA18525	1.191	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA19017	0.387	0.376	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA19238	0.521	0.506	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.189	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA19625	0.506	0.491	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA19648	0.474	0.46	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA20502	0.0	0.0	0.025	0.185	nan	nan	0	0
chr3	56604704	56604961	DEL	258	NA20845	0.52	0.505	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr3	571750	572075	DEL	326	HG00096	0.289	0.349	0.016	0.085	nan	nan	0	1
chr3	571750	572075	DEL	326	HG00268	0.516	0.622	0.0	0.003	0.579	0.603	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG00419	0.569	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG00759	0.465	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG01051	0.241	0.291	0.032	0.075	nan	nan	0	1
chr3	571750	572075	DEL	326	HG01112	0.398	0.479	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG01500	0.498	0.6	0.0	0.0	0.917	0.957	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG01565	0.844	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG01583	0.505	0.608	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG01595	0.335	0.404	0.008	0.054	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG01879	0.269	0.324	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr3	571750	572075	DEL	326	HG02568	0.608	0.732	0.0	0.0	0.273	0.273	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG02922	0.166	0.2	0.008	0.067	nan	nan	0	1
chr3	571750	572075	DEL	326	HG03006	0.412	0.497	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG03052	0.55	0.662	0.055	0.241	nan	nan	0	0
chr3	571750	572075	DEL	326	HG03642	0.445	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	HG03742	0.482	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA12878	0.93	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA18525	0.7	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA18939	0.374	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA19017	0.664	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA19238	0.638	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA19239	0.232	0.28	0.005	0.094	nan	nan	0	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA19625	0.43	0.518	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA19648	0.374	0.451	0.0	0.0	0.528	0.528	2	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA20502	0.273	0.329	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	571750	572075	DEL	326	NA20845	0.455	0.549	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG00096	1.049	0.953	0.0	0.0	0.714	0.745	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG00419	1.24	1.128	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG00759	1.222	1.111	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG01051	1.287	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG01112	1.428	1.298	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG01500	1.397	1.27	0.0	0.0	0.683	0.713	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG01565	1.4	1.273	0.0	0.0	0.7	0.741	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG01583	1.201	1.092	0.0	0.004	0.882	0.882	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG01595	1.638	1.489	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG01879	1.274	1.158	0.0	0.003	0.914	0.914	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG02568	1.063	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG02922	1.433	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG03006	1.148	1.043	0.0	0.0	0.968	0.968	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG03052	1.163	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG03642	1.111	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	HG03742	1.233	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA12878	1.031	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA18525	1.278	1.162	0.0	0.0	0.784	0.816	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA18939	0.961	0.874	0.0	0.0	0.774	0.774	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA19017	1.125	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA19238	1.062	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA19239	1.174	1.067	0.0	0.0	0.935	0.935	1	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA19625	1.163	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA19648	1.098	0.998	0.0	0.0	0.891	0.891	2	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA20502	1.07	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	57320418	57320493	DUP	76	NA20845	1.366	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG00096	0.904	1.004	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG00268	0.963	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG00419	1.261	1.401	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG00759	0.717	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG01051	0.804	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG01112	0.813	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG01500	0.943	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG01565	0.803	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG01583	0.913	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG01595	1.144	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG01879	0.844	0.937	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG02568	1.139	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG02922	1.184	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG03006	0.897	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG03052	1.015	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG03642	0.617	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	HG03742	0.964	1.071	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA12878	0.93	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA18525	1.208	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA18939	1.228	1.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA19017	0.535	0.595	0.0	0.057	0.741	0.774	1	1
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA19238	0.638	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA19239	0.852	0.946	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA19625	0.885	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA19648	0.998	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA20502	0.66	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58321288	58321358	DEL	71	NA20845	0.781	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG00096	1.103	1.225	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG00268	0.86	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG00419	1.261	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG00759	0.911	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG01051	0.845	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG01112	0.741	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG01500	1.13	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG01565	0.762	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG01583	0.264	0.294	0.0	0.034	0.778	0.778	1	1
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG01595	0.691	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG01879	0.87	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG02568	1.443	1.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG02922	0.997	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG03006	1.076	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG03052	0.655	0.728	0.0	0.048	0.545	0.545	1	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG03642	0.988	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	HG03742	1.06	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA12878	1.099	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA18525	0.604	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA18939	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA19017	0.314	0.349	0.0	0.056	0.958	0.917	1	1
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA19238	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA19239	0.432	0.48	0.0	0.04	0.902	0.902	1	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA19625	0.986	1.096	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA19648	0.499	0.554	0.0	0.041	0.619	0.619	1	1
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA20502	0.638	0.708	0.0	0.017	0.467	0.467	1	2
chr3	58571882	58571945	DEL	64	NA20845	0.976	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG00096	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG00268	1.015	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG00419	0.732	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG00759	0.485	0.539	0.0	0.045	0.929	0.929	1	1
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG01051	0.402	0.447	0.0	0.024	0.652	0.652	1	1
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG01112	0.632	0.703	0.006	0.051	0.515	0.515	1	1
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG01500	0.409	0.455	0.0	0.058	0.885	0.923	1	1
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG01565	0.926	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG01583	0.769	0.854	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG01595	0.967	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG01879	0.754	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG02568	0.874	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG02922	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG03006	0.771	0.857	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG03052	0.888	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG03642	0.667	0.741	0.0	0.0	0.833	0.897	1	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	HG03742	0.578	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA12878	1.082	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA18525	0.473	0.525	0.0	0.034	0.645	0.672	1	1
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA18939	0.961	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA19017	0.978	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA19238	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA19239	0.903	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA19625	0.329	0.365	0.0	0.019	0.769	0.769	1	1
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA19648	0.624	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA20502	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59377953	59378021	DEL	69	NA20845	0.976	1.084	0.0	0.0	0.765	0.71	1	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG00096	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG00268	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG00419	0.895	0.895	0.0	0.0	0.924	0.924	4	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG00759	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG01051	0.764	0.764	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG01112	0.759	0.759	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG01500	0.765	0.765	0.0	0.0	0.483	0.504	1	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG01565	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG01583	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG01595	0.848	0.848	0.0	0.0	0.75	0.792	1	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG01879	0.485	0.485	0.099	0.049	nan	nan	0	1
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG02568	0.418	0.418	0.057	0.04	nan	nan	0	1
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG02922	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG03006	1.058	1.058	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG03052	1.099	1.099	0.0	0.0	0.926	0.926	5	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG03642	0.939	0.939	0.0	0.0	0.507	0.546	4	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	HG03742	0.964	0.964	0.004	0.0	0.733	0.733	4	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA12878	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA18525	0.84	0.84	0.0	0.0	1.0	0.96	5	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA18939	0.979	0.979	0.0	0.0	0.645	0.645	4	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA19017	0.867	0.867	0.0	0.0	0.808	0.844	5	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA19238	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA19239	1.097	1.097	0.0	0.0	0.779	0.779	4	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA19625	1.012	1.012	0.0	0.0	0.658	0.658	6	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA19648	1.123	1.123	0.0	0.0	0.535	0.535	4	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA20502	1.047	1.047	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	59699486	59700438	DEL	953	NA20845	0.911	0.911	0.0	0.0	0.931	0.922	4	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG00096	0.633	0.581	0.0	0.0	0.714	0.685	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG00268	0.894	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG00419	0.732	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG00759	0.737	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG01051	0.804	0.738	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG01112	1.138	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG01500	0.658	0.604	0.0	0.004	0.647	0.675	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG01565	0.679	0.623	0.0	0.0	0.769	0.726	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG01583	1.177	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG01595	0.73	0.67	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG01879	0.682	0.626	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG02568	0.874	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG02922	0.478	0.438	0.0	0.027	0.606	0.606	2	1
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG03006	0.574	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG03052	0.803	0.737	0.0	0.008	0.688	0.688	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG03642	0.889	0.816	0.0	0.0	0.571	0.615	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	HG03742	0.597	0.548	0.0	0.0	0.45	0.45	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA12878	0.913	0.838	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA18525	0.876	0.803	0.0	0.0	0.895	0.932	1	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA18939	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA19017	0.959	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA19238	0.873	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA19239	0.813	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA19625	0.986	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA19648	1.148	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA20502	1.116	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	60125513	60125565	DEL	53	NA20845	0.846	0.776	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG00096	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG00268	1.015	1.068	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG00419	0.773	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG00759	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG01051	1.126	1.185	0.005	0.0	0.76	0.76	1	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG01112	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG01500	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG01565	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG01583	0.865	0.91	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG01595	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG01879	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG02568	1.253	1.319	0.0	0.0	0.588	0.588	3	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG02922	0.768	0.809	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG03006	1.004	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG03052	1.036	1.09	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG03642	0.963	1.014	0.0	0.0	0.476	0.442	3	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	HG03742	0.829	0.872	0.0	0.0	0.765	0.765	3	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA12878	1.082	1.139	0.003	0.003	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA18525	0.876	0.922	0.004	0.0	0.929	0.891	3	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA18939	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA19017	0.996	1.049	0.0	0.0	0.739	0.707	1	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA19238	0.938	0.987	0.0	0.0	0.667	0.667	5	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA19239	0.864	0.91	0.004	0.0	0.889	0.889	4	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA19625	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA19648	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA20502	0.433	0.455	0.084	0.042	nan	nan	0	1
chr3	61416016	61416806	DEL	791	NA20845	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG00268	0.55	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG00419	0.59	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG00759	0.524	0.551	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG01051	0.322	0.339	0.0	0.042	0.812	0.812	2	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG01112	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG01500	0.374	0.393	0.008	0.07	0.375	0.391	2	1
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG01565	0.391	0.412	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG01583	0.649	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG01595	0.552	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG01879	0.449	0.472	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG02568	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG02922	0.249	0.262	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG03006	0.412	0.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG03052	0.444	0.467	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG03642	0.716	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	HG03742	0.193	0.203	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA12878	0.659	0.694	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA18525	0.665	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA18939	0.747	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA19017	0.48	0.505	0.0	0.0	0.308	0.294	1	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA19238	0.274	0.288	0.0	0.066	0.431	0.431	2	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA19239	0.671	0.706	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA19625	0.683	0.719	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA19648	0.175	0.184	0.0	0.026	0.312	0.312	2	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA20502	0.205	0.216	0.0	0.054	0.333	0.333	1	2
chr3	61666415	61666685	DEL	271	NA20845	0.217	0.228	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG00096	0.452	0.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG00268	0.636	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG00419	0.447	0.434	0.064	0.084	nan	nan	0	1
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG00759	0.659	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG01051	0.784	0.761	0.0	0.005	0.842	0.842	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG01112	0.723	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG01500	0.765	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG01565	0.576	0.56	0.0	0.0	0.7	0.741	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG01583	0.673	0.653	0.0	0.005	0.9	0.9	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG01595	0.691	0.67	0.0	0.0	0.8	0.758	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG01879	0.646	0.627	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG02568	0.532	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG02922	0.291	0.282	0.046	0.08	nan	nan	0	1
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG03006	0.305	0.296	0.051	0.093	nan	nan	0	1
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG03052	0.803	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG03642	0.84	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	HG03742	0.366	0.355	0.027	0.102	nan	nan	0	1
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA18525	0.7	0.68	0.0	0.0	0.636	0.663	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA18939	0.267	0.259	0.016	0.073	nan	nan	0	1
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA19017	0.59	0.573	0.0	0.0	0.625	0.653	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA19238	0.365	0.354	0.007	0.074	nan	nan	0	1
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA19239	0.852	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA19625	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA19648	0.624	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA20502	0.751	0.729	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chr3	63134847	63135305	DEL	459	NA20845	0.629	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG00096	0.615	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG00268	0.636	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG00419	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG00759	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG01051	0.734	0.734	0.0	0.0	0.478	0.478	1	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG01112	0.741	0.741	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG01500	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG01565	0.576	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG01583	0.913	0.913	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG01595	0.691	0.691	0.0	0.0	0.867	0.915	1	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG01879	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG02568	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG02922	0.914	0.914	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG03006	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG03052	0.55	0.55	0.049	0.049	nan	nan	0	1
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG03642	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	HG03742	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA12878	0.998	0.998	0.0	0.0	0.931	0.931	3	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA18525	0.648	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA18939	0.908	0.908	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA19017	0.683	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA19238	0.821	0.821	0.0	0.0	0.564	0.564	1	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA19239	0.323	0.323	0.035	0.068	nan	nan	0	1
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA19625	0.632	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA19648	0.773	0.773	0.007	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA20502	1.002	1.002	0.0	0.0	0.952	0.952	3	2
chr3	65123010	65123543	DEL	534	NA20845	0.434	0.434	0.018	0.028	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG00096	0.651	0.597	0.031	0.108	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG00268	1.514	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG00419	0.427	0.392	0.058	0.098	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG00759	1.454	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG01051	1.387	1.273	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG01112	0.0	0.0	0.043	0.269	nan	nan	0	0
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG01500	0.0	0.0	0.037	0.243	nan	nan	0	0
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG01565	1.215	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG01583	0.0	0.0	0.058	0.2	nan	nan	0	0
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG01595	0.612	0.561	0.028	0.099	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG01879	0.592	0.543	0.028	0.102	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG02568	0.494	0.453	0.014	0.127	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG02922	1.308	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG03006	1.184	1.086	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG03052	0.613	0.562	0.037	0.124	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG03642	1.358	1.246	0.0	0.0	0.636	0.685	1	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	HG03742	0.713	0.654	0.031	0.096	0.358	0.358	2	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA12878	0.423	0.388	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA18525	1.278	1.173	0.0	0.0	0.775	0.807	1	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA18939	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA19017	1.144	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA19238	1.316	1.207	0.0	0.0	0.959	0.959	1	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA19239	1.213	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA19625	0.531	0.487	0.013	0.111	nan	nan	0	1
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA19648	0.0	0.0	0.042	0.228	nan	nan	0	0
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA20502	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	6700872	6701254	DEL	383	NA20845	0.629	0.577	0.04	0.119	nan	nan	0	1
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG00096	0.579	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG00268	0.654	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG00419	0.529	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG00759	0.621	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG01051	0.241	0.226	0.012	0.066	nan	nan	0	1
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG01112	0.47	0.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG01500	0.641	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG01565	0.597	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG01583	0.408	0.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG01595	0.493	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG01879	0.503	0.47	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG02568	0.646	0.603	0.0	0.0	0.688	0.688	2	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG02922	0.415	0.388	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG03006	0.556	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG03052	0.444	0.415	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG03642	0.593	0.554	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	HG03742	0.54	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA12878	0.558	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA18525	0.683	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA18939	0.587	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA19017	0.369	0.345	0.0	0.0	0.571	0.547	2	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA19238	0.638	0.597	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA19239	0.619	0.579	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA19625	0.506	0.473	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA19648	0.374	0.35	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA20502	0.364	0.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	67832613	67832943	DEL	331	NA20845	0.672	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG00096	0.85	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG00268	0.808	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG00419	0.752	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG00759	0.407	0.395	0.056	0.074	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG01051	0.804	0.781	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG01112	0.885	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG01500	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG01565	0.0	0.0	0.1	0.217	nan	nan	0	0
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG01583	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG01595	0.848	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG01879	0.7	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG02568	0.874	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG02922	0.54	0.524	0.039	0.074	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG03006	0.735	0.714	0.01	0.074	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG03052	0.381	0.369	0.009	0.08	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG03642	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	HG03742	0.0	0.0	0.007	0.216	nan	nan	0	0
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA12878	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA18525	0.805	0.782	0.0	0.0	0.958	0.998	1	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA18939	0.552	0.536	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA19017	0.517	0.502	0.017	0.079	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA19238	0.795	0.771	0.0	0.0	0.972	0.972	1	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA19239	0.477	0.463	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA19625	0.405	0.393	0.01	0.069	nan	nan	0	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA19648	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA20502	0.41	0.398	0.007	0.107	0.3	0.3	1	1
chr3	70013451	70013889	DEL	439	NA20845	0.477	0.463	0.008	0.022	nan	nan	0	1
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG00096	0.633	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG00268	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG00419	1.24	1.306	0.0	0.0	0.758	0.758	1	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG00759	0.621	0.653	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG01051	0.885	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG01112	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG01500	0.943	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG01565	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG01583	1.033	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG01595	0.73	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG01879	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG02568	1.063	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG02922	0.955	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG03006	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG03052	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG03642	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	HG03742	0.79	0.832	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA12878	0.626	0.659	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA18525	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA18939	0.303	0.318	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA19017	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA19238	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA19239	0.722	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA19625	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA19648	1.073	1.129	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA20502	0.729	0.767	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	71953738	71953854	DEL	117	NA20845	0.629	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG00096	0.796	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG00268	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG00419	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG00759	0.485	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG01051	0.402	0.423	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG01112	0.614	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG01500	0.694	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG01565	0.535	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG01583	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG01595	0.71	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG01879	0.736	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG02568	0.57	0.6	0.0	0.05	0.786	0.786	1	1
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG02922	0.561	0.59	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG03006	0.843	0.887	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG03052	0.782	0.823	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG03642	0.617	0.65	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	HG03742	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA12878	0.829	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA18525	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA18939	0.623	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA19017	0.738	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA19238	0.612	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA19239	0.697	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA19625	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA19648	1.048	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA20502	0.66	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72369399	72369477	DEL	79	NA20845	0.52	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG00096	0.85	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG00268	1.152	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG00419	1.139	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG00759	1.377	1.449	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG01051	1.126	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG01112	1.102	1.16	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG01500	0.587	0.618	0.0	0.05	0.512	0.534	1	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG01565	1.112	1.17	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG01583	1.045	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG01595	1.184	1.246	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG01879	1.184	1.247	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG02568	0.76	0.8	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG02922	1.059	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG03006	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG03052	0.444	0.467	0.0	0.069	0.905	0.905	1	1
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG03642	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	HG03742	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA12878	0.93	0.979	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA18525	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA18939	1.121	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA19017	1.125	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA19238	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA19239	1.187	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA19625	1.29	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA19648	1.272	1.339	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA20502	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	72579346	72579441	DEL	96	NA20845	1.236	1.301	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG00096	0.0	0.0	0.115	0.209	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG00268	0.482	0.468	0.01	0.063	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG00419	0.976	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG00759	0.427	0.414	0.044	0.081	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG01051	0.684	0.664	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG01112	0.289	0.281	0.063	0.11	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG01500	0.801	0.778	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG01565	0.618	0.6	0.063	0.075	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG01583	1.045	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG01595	0.375	0.364	0.045	0.055	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG01879	0.431	0.418	0.044	0.08	0.125	0.125	1	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG02568	0.798	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG02922	0.914	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG03006	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG03052	0.909	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG03642	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	HG03742	0.906	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA12878	0.609	0.591	0.008	0.061	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA18525	1.278	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA18939	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA19017	0.554	0.537	0.011	0.061	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA19238	0.938	0.911	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA19239	0.968	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA19625	1.239	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA19648	0.399	0.388	0.035	0.035	nan	nan	0	1
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA20502	0.41	0.398	0.042	0.085	nan	nan	0	2
chr3	73063077	73063554	DEL	478	NA20845	0.434	0.421	0.045	0.104	nan	nan	0	1
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG00096	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG00268	0.98	0.98	0.0	0.0	0.541	0.519	1	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG00419	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG00759	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG01051	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG01112	0.795	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG01500	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG01565	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG01583	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG01595	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG01879	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG02568	0.949	0.949	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG02922	0.623	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG03006	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG03052	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG03642	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	HG03742	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA12878	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA18525	0.35	0.35	0.009	0.08	nan	nan	0	1
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA18939	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA19017	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA19238	1.12	1.12	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA19239	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA19625	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA19648	0.948	0.948	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA20502	1.252	1.252	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	73831168	73831278	DEL	111	NA20845	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG00096	0.687	0.687	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG00268	0.516	0.516	0.008	0.111	nan	nan	0	1
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG00419	1.098	1.098	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG00759	0.853	0.853	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG01051	0.583	0.583	0.022	0.074	nan	nan	0	1
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG01112	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG01500	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG01565	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG01583	1.297	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG01595	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG01879	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG02568	0.684	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG02922	1.038	1.038	0.0	0.007	0.85	0.85	2	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG03006	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG03052	0.402	0.402	0.008	0.105	nan	nan	0	1
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG03642	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	HG03742	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA12878	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA18525	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA18939	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA19017	0.83	0.83	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA19238	1.094	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA19239	0.464	0.464	0.004	0.108	nan	nan	0	1
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA19625	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA19648	1.173	1.173	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA20502	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	73939038	73939386	DEL	349	NA20845	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG00096	1.121	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG00268	1.359	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG00419	0.0	0.0	0.014	0.081	nan	nan	0	1
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG00759	1.319	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG01051	1.287	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG01112	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG01500	1.406	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG01565	1.421	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG01583	1.514	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG01595	1.243	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG01879	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG02568	1.177	1.08	0.0	0.041	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG02922	1.246	1.143	0.0	0.024	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG03006	1.04	0.954	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG03052	1.078	0.989	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG03642	1.037	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	HG03742	1.098	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA12878	0.778	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA18525	1.348	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA18939	1.424	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA19017	0.849	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA19238	1.081	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA19239	1.045	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA19625	0.885	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA19648	1.347	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA20502	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74387372	74387442	DEL	71	NA20845	1.019	0.935	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG00096	0.94	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG00268	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG00419	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG00759	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG01051	0.824	0.824	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG01112	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG01500	1.175	1.175	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG01565	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG01583	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG01595	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG01879	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG02568	1.063	1.063	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG02922	0.457	0.457	0.077	0.047	nan	nan	0	1
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG03006	1.148	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG03052	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG03642	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	HG03742	0.52	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA12878	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA18525	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA18939	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA19017	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA19238	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA19239	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA19625	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA19648	0.724	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA20502	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	74565355	74566008	DEL	654	NA20845	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG00096	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG00268	0.946	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG00419	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG00759	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG01051	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG01112	1.156	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG01500	1.281	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG01565	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG01583	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG01595	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG01879	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG02568	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG02922	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG03006	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG03052	0.359	0.349	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG03642	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	HG03742	0.829	0.805	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA12878	0.829	0.804	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA18525	0.893	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA18939	1.175	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA19017	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA19238	0.586	0.569	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA19239	1.277	1.24	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA19625	1.088	1.056	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA19648	1.372	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA20502	0.797	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	76735562	76735680	DEL	119	NA20845	1.344	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG00096	1.193	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG00268	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG00419	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG00759	1.357	1.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG01051	0.885	0.885	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG01112	0.976	0.976	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG01500	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG01565	1.071	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG01583	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG01595	1.184	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG01879	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG02568	1.101	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG02922	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG03006	1.13	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG03052	0.93	0.93	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG03642	0.469	0.469	0.0	0.017	0.722	0.778	1	1
chr3	77206298	77206352	DEL	55	HG03742	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA12878	0.744	0.744	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA18525	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA18939	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA19017	1.421	1.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA19238	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA19239	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA19625	1.214	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA19648	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA20502	0.66	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	77206298	77206352	DEL	55	NA20845	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG00096	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG00268	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG00419	0.61	0.61	0.008	0.0	0.857	0.857	1	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG00759	0.873	0.873	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG01051	0.784	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG01112	0.614	0.614	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG01500	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG01565	0.556	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG01583	0.661	0.661	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG01595	0.71	0.71	0.0	0.0	0.714	0.754	1	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG01879	0.305	0.305	0.047	0.089	nan	nan	0	1
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG02568	0.456	0.456	0.023	0.046	nan	nan	0	1
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG02922	0.789	0.789	0.0	0.0	0.634	0.634	2	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG03006	0.735	0.735	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG03052	0.275	0.275	0.05	0.093	nan	nan	0	1
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG03642	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	HG03742	0.559	0.559	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA12878	0.693	0.693	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA18525	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA18939	0.89	0.89	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA19017	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA19238	0.0	0.0	0.063	0.14	nan	nan	0	0
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA19239	0.774	0.774	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA19625	0.658	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA19648	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA20502	0.797	0.797	0.007	0.0	0.85	0.85	2	2
chr3	78342659	78343176	DEL	518	NA20845	0.716	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG00096	0.705	0.659	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG00268	0.482	0.45	0.006	0.089	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.231	nan	nan	0	0
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG00759	0.989	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG01051	0.885	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG01112	0.434	0.405	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG01500	0.0	0.0	0.021	0.193	nan	nan	0	0
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG01565	0.0	0.0	0.041	0.272	nan	nan	0	0
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG01583	0.36	0.337	0.018	0.131	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG01595	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG01879	1.059	0.99	0.005	0.0	0.897	0.897	1	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG02568	0.798	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG02922	1.121	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG03006	0.502	0.469	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG03052	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG03642	0.321	0.3	0.008	0.065	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	HG03742	0.617	0.576	0.008	0.051	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA12878	0.0	0.0	0.007	0.131	nan	nan	0	0
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA18525	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA18939	1.014	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA19017	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA19238	1.172	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA19239	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA19625	0.582	0.544	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA19648	0.674	0.63	0.008	0.07	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA20502	0.546	0.511	0.008	0.084	nan	nan	0	1
chr3	78779425	78779724	DEL	300	NA20845	1.431	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG00096	0.506	0.533	0.0	0.0	0.833	0.87	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG00268	0.636	0.67	0.0	0.0	0.933	0.972	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG00419	0.813	0.856	0.011	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG00759	0.737	0.776	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG01051	0.462	0.487	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG01112	0.669	0.704	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG01500	0.267	0.281	0.0	0.073	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG01565	0.659	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG01583	0.408	0.43	0.0	0.04	0.286	0.286	1	1
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG01595	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	1
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG02568	0.532	0.56	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG02922	0.706	0.743	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG03006	0.592	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG03052	0.634	0.668	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG03642	0.593	0.624	0.005	0.043	nan	nan	0	1
chr3	7905946	7906150	DEL	205	HG03742	0.289	0.304	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA12878	0.643	0.676	0.0	0.002	0.391	0.391	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA18525	0.788	0.829	0.0	0.0	0.667	0.694	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA18939	0.623	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA19017	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA19238	0.339	0.356	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA19239	0.697	0.733	0.0	0.003	1.0	1.0	1	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA19625	0.379	0.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA19648	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA20502	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	7905946	7906150	DEL	205	NA20845	0.347	0.365	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG00096	0.506	0.491	0.006	0.039	0.667	0.696	1	1
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG00268	1.273	1.236	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG00419	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG00759	1.047	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG01051	1.207	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG01112	1.012	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG01500	1.121	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG01565	1.359	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG01583	0.721	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG01595	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG02568	0.57	0.553	0.0	0.053	0.308	0.308	1	1
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG02922	0.415	0.403	0.0	0.033	0.684	0.684	1	1
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG03006	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG03052	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG03642	1.383	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	HG03742	1.041	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA12878	0.812	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA18525	1.016	0.986	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA18939	1.086	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA19017	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA19238	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA19239	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA19625	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA19648	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA20502	0.683	0.663	0.0	0.021	0.395	0.395	1	2
chr3	84404171	84404243	DEL	73	NA20845	0.889	0.863	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG00096	0.506	0.491	0.024	0.104	nan	nan	0	1
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG00268	0.55	0.534	0.015	0.091	nan	nan	0	1
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG00419	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG00759	0.485	0.471	0.015	0.062	nan	nan	0	1
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG01051	0.623	0.605	0.006	0.087	nan	nan	0	1
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG01112	0.56	0.544	0.016	0.077	nan	nan	0	1
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG01500	0.997	0.968	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG01565	0.412	0.4	0.019	0.093	nan	nan	0	1
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG01583	1.177	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG01595	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG01879	0.933	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG02568	0.949	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG02922	0.893	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG03006	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG03052	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG03642	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	HG03742	1.098	1.066	0.0	0.0	0.815	0.815	1	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA18525	0.473	0.459	0.008	0.112	nan	nan	0	1
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA18939	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA19017	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA19238	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA19239	0.955	0.927	0.0	0.0	0.838	0.838	1	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA19625	0.986	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA19648	0.649	0.63	0.005	0.077	0.341	0.341	6	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA20502	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86213403	86213720	DEL	318	NA20845	1.062	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG00096	0.868	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG00268	0.972	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG00419	0.529	0.494	0.0	0.026	0.429	0.429	2	1
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG00759	0.931	0.87	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG01051	0.402	0.376	0.0	0.028	0.81	0.81	1	1
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG01112	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG01500	0.836	0.782	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG01565	0.494	0.462	0.0	0.017	0.385	0.363	1	1
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG01583	0.793	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG01595	0.296	0.277	0.0	0.038	0.75	0.711	1	1
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG01879	1.202	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG02568	0.798	0.745	0.0	0.025	0.722	0.722	1	1
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG02922	1.204	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG03006	1.022	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG03052	0.93	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr3	86922289	86922364	DEL	76	HG03742	0.964	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA12878	1.167	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA18525	1.278	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA18939	0.409	0.383	0.0	0.031	0.821	0.821	1	1
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA19017	0.867	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA19238	1.107	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA19239	0.697	0.651	0.0	0.026	0.459	0.459	1	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA19625	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA19648	0.898	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA20502	0.569	0.532	0.0	0.042	0.815	0.815	1	2
chr3	86922289	86922364	DEL	76	NA20845	1.214	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG00096	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG00268	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG00419	1.057	0.988	0.0	0.0	0.801	0.801	2	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG00759	1.163	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG01051	0.483	0.451	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG01112	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG01500	0.943	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG01565	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG01583	0.553	0.516	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG01595	1.144	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.186	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG02568	0.798	0.745	0.0	0.0	0.753	0.753	2	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG02922	0.478	0.446	0.008	0.081	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG03006	0.699	0.654	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG03052	1.268	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG03642	1.605	1.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	HG03742	0.52	0.486	0.0	0.074	0.36	0.36	1	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA12878	1.201	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA18525	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA18939	0.961	0.898	0.0	0.0	0.939	0.939	2	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA19017	0.498	0.466	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA19238	0.0	0.0	0.004	0.192	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA19239	0.555	0.518	0.0	0.107	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA19625	0.531	0.496	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA19648	0.724	0.676	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA20502	0.865	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87446616	87446782	DEL	167	NA20845	0.564	0.527	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG00096	0.56	0.524	0.0	0.031	0.481	0.477	2	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG00268	0.378	0.354	0.0	0.05	0.802	0.835	2	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG00419	0.956	0.893	0.0	0.0	0.517	0.517	1	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG00759	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG01112	1.084	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG01500	0.819	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG01565	0.906	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG01583	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG01595	0.77	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG01879	0.574	0.537	0.0	0.024	0.446	0.446	2	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG02568	0.76	0.71	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG02922	1.163	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG03006	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG03052	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG03642	0.963	0.9	0.0	0.0	0.545	0.587	1	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	HG03742	0.289	0.27	0.0	0.037	0.795	0.795	2	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA12878	0.626	0.585	0.0	0.058	0.577	0.577	2	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA18525	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA18939	0.925	0.865	0.0	0.0	0.839	0.839	1	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA19017	0.517	0.483	0.0	0.047	0.867	0.862	2	1
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA19239	0.981	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA19625	0.784	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA19648	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA20502	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	87482522	87482606	DEL	85	NA20845	0.672	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG00096	0.759	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG00268	0.619	0.688	0.0	0.0	0.75	0.72	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG00419	0.651	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG00759	0.504	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG01051	0.724	0.804	0.0	0.002	0.917	0.917	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG01112	0.741	0.823	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG01500	0.836	0.929	0.0	0.0	0.68	0.71	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG01565	0.741	0.824	0.0	0.0	0.846	0.896	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG01583	0.817	0.908	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG01595	0.513	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG01879	0.269	0.299	0.0	0.05	0.733	0.733	1	1
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG02568	0.19	0.211	0.0	0.083	0.583	0.583	1	1
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG02922	0.561	0.623	0.0	0.054	0.7	0.7	1	1
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG03006	1.058	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG03052	0.994	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG03642	0.815	0.906	0.0	0.0	0.917	0.987	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	HG03742	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA12878	0.879	0.977	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA18525	0.805	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA18939	0.641	0.712	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA19017	0.756	0.841	0.0	0.0	0.579	0.554	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA19238	0.782	0.868	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA19239	0.361	0.401	0.0	0.04	0.828	0.828	2	1
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA19625	0.683	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA19648	0.998	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA20502	1.047	1.164	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr3	9254173	9254267	DEL	95	NA20845	0.672	0.747	0.0	0.0	0.5	0.464	1	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG00096	1.049	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG00268	1.084	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG00419	1.179	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG00759	1.125	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG01051	0.965	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG01112	1.156	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG01500	1.424	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG01565	1.277	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG01583	1.081	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG01879	1.472	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG02568	1.101	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG02922	1.578	1.448	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG03006	0.717	0.658	0.0	0.028	0.511	0.511	1	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG03052	1.543	1.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr3	95386737	95386807	DEL	71	HG03742	0.964	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA12878	0.964	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA18525	1.086	0.996	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA18939	0.641	0.588	0.0	0.045	0.744	0.744	1	1
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA19017	1.162	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA19238	1.198	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA19239	1.239	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA19625	0.986	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA19648	0.674	0.618	0.0	0.059	0.833	0.833	1	1
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA20502	1.321	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	95386737	95386807	DEL	71	NA20845	0.716	0.656	0.0	0.051	0.905	0.84	1	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG00096	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG00268	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG00419	1.261	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG00759	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG01051	1.207	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG01112	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG01500	1.353	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG01565	1.503	1.459	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG01583	0.817	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG01595	1.322	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG01879	1.328	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG02568	0.912	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG02922	1.391	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG03006	1.524	1.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG03052	0.444	0.431	0.0	0.028	0.774	0.774	1	1
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG03642	1.334	1.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	HG03742	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA12878	0.829	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA18525	1.348	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA18939	1.353	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA19017	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA19238	1.29	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA19239	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA19625	0.809	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA19648	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA20502	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96254461	96254513	DEL	53	NA20845	1.496	1.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG00096	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG00268	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG00419	1.322	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG00759	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG01051	1.207	1.171	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG01112	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG01500	1.317	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG01565	1.338	1.299	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG01583	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG01595	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG01879	1.005	0.976	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG02568	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG02922	1.038	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG03006	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG03052	1.226	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG03642	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	HG03742	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA12878	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA18525	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA18939	1.121	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA19017	1.439	1.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA19238	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA19239	0.516	0.501	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA19625	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA19648	1.272	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA20502	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	96988552	96988679	DEL	128	NA20845	1.258	1.221	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG00096	0.922	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG00268	1.066	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG00419	1.342	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG00759	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG01051	1.468	1.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG01112	1.138	1.064	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG01500	1.21	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG01565	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG01583	0.961	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG01595	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG01879	1.22	1.141	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG02568	1.253	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG02922	1.225	1.145	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG03006	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG03052	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG03642	1.185	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	HG03742	0.501	0.468	0.0	0.083	0.806	0.806	1	1
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA12878	0.896	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA18525	1.121	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA18939	1.317	1.231	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA19017	1.255	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA19238	0.99	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA19239	1.29	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA19625	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA19648	1.023	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA20502	1.366	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97277592	97277688	DEL	97	NA20845	1.236	1.155	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG00096	0.967	0.887	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG00268	1.032	0.947	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG00419	1.057	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG00759	1.086	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG01051	0.462	0.424	0.0	0.068	0.926	0.926	1	1
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG01112	1.156	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG01500	0.908	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG01565	1.194	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG01583	0.961	0.882	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG01595	0.868	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG01879	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG02568	0.987	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG02922	1.184	1.086	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG03006	1.121	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG03052	1.226	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG03642	0.939	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	HG03742	0.906	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA12878	0.896	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA18525	0.998	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA18939	1.139	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA19017	1.236	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA19238	1.342	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA19239	1.38	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA19625	0.582	0.534	0.0	0.067	0.304	0.304	1	1
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA19648	1.572	1.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA20502	1.264	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	97764334	97764421	DEL	88	NA20845	0.824	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG00096	1.012	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG00268	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG00419	0.773	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG00759	1.493	1.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG01051	0.985	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG01112	0.94	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG01500	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG01565	0.885	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG01583	0.553	0.537	0.0	0.042	0.889	0.889	1	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG01595	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG01879	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG02568	0.987	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG02922	0.893	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG03006	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG03052	0.973	0.944	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG03642	0.766	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	HG03742	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA12878	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA18525	1.191	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA18939	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA19017	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA19238	1.264	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA19239	1.11	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA19625	0.809	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA19648	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	98820753	98820838	DUP	86	NA20502	0.729	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG00096	0.0	0.0	0.278	0.177	nan	nan	0	0
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG00268	0.946	0.918	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG00419	1.179	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG00759	0.504	0.489	0.091	0.065	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG01051	0.603	0.586	0.08	0.06	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG01112	1.193	1.158	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG01500	0.498	0.484	0.096	0.053	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG01565	0.494	0.48	0.071	0.048	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG01583	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG01595	0.533	0.517	0.077	0.041	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG01879	1.077	1.045	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG02568	0.0	0.0	0.297	0.208	nan	nan	0	0
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG02922	1.121	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG03006	0.448	0.435	0.084	0.058	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG03052	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG03642	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	HG03742	0.463	0.449	0.092	0.077	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA12878	0.406	0.394	0.081	0.042	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA18525	1.191	1.156	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA18939	1.228	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA19017	1.218	1.182	0.0	0.0	0.968	0.926	1	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA19238	0.873	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA19239	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA19625	0.481	0.467	0.091	0.052	nan	nan	0	1
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA19648	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA20502	1.184	1.149	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr3	99628781	99629631	DEL	851	NA20845	0.52	0.505	0.074	0.043	nan	nan	0	1
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG00096	0.59	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG00268	0.698	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG00419	0.474	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG00759	0.683	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG01051	0.441	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG01112	0.53	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG01500	0.695	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG01565	0.765	0.922	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG01583	0.549	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG01595	0.794	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG01879	0.439	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG02568	0.514	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG03006	0.706	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG03642	0.455	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	HG03742	0.701	0.845	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA12878	0.709	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA18525	0.68	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA18939	0.686	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA19017	0.563	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA19238	0.801	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA19239	0.723	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA19625	0.4	0.482	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA19648	0.47	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA20502	0.568	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	100763989	100764113	DUP	125	NA20845	0.659	0.794	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG00096	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG00268	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG00419	1.028	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG00759	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG01051	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG01112	0.689	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG01500	0.869	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG01565	0.805	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG01583	1.145	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG01595	0.716	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG01879	0.562	0.591	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG02568	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG02922	0.925	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG03006	0.847	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG03052	1.188	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG03642	0.479	0.505	0.0	0.015	0.933	0.933	3	1
chr4	101152006	101152056	DEL	51	HG03742	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA12878	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA18525	0.977	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA18939	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA19017	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA19238	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA19239	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA19625	0.775	0.816	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA19648	1.039	1.094	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA20502	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101152006	101152056	DEL	51	NA20845	0.956	1.007	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG00096	0.716	0.716	0.0	0.066	0.663	0.692	2	1
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG00268	0.528	0.528	0.0	0.037	0.716	0.746	2	1
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG00419	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG00759	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG01051	0.922	0.922	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG01112	0.371	0.371	0.0	0.039	0.839	0.839	2	1
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG01500	1.164	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG01565	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG01583	0.477	0.477	0.0	0.081	0.604	0.604	2	1
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG01595	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG01879	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG02568	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG02922	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG03006	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG03052	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG03642	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	HG03742	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA12878	0.692	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA18525	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA18939	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA19017	1.216	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA19238	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA19239	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA19625	0.575	0.575	0.0	0.037	0.598	0.598	2	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA19648	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA20502	1.205	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101293066	101293136	DEL	71	NA20845	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG00096	0.429	0.394	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG00268	0.596	0.547	0.006	0.055	nan	nan	0	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG00419	0.948	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG00759	1.308	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.148	nan	nan	0	0
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG01112	0.954	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG01500	0.0	0.0	0.014	0.173	nan	nan	0	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG01565	0.544	0.499	0.008	0.049	0.308	0.308	1	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG01583	0.739	0.678	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG01595	0.581	0.533	0.0	0.094	0.448	0.448	1	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG01879	0.491	0.451	0.005	0.069	0.343	0.343	1	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG02568	1.371	1.258	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG02922	1.171	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG03006	0.547	0.502	0.0	0.051	0.417	0.417	1	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG03052	1.188	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG03642	0.599	0.55	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	HG03742	0.606	0.556	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	0
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA18525	0.576	0.528	0.0	0.066	0.414	0.414	1	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA18939	1.126	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA19017	0.799	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA19238	1.107	1.015	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA19239	1.205	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA19625	1.3	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA19648	1.41	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA20502	0.409	0.375	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr4	101390634	101390812	DEL	179	NA20845	0.553	0.507	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG00096	1.038	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG00268	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG00419	0.645	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG00759	0.607	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG01051	0.726	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG01112	0.848	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG01500	0.852	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG01565	0.342	0.36	0.0	0.042	0.765	0.765	1	1
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG01583	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG01595	0.794	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG01879	0.702	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG02568	0.61	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG02922	0.904	0.952	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG03006	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG03052	1.021	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG03642	0.767	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	HG03742	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA12878	0.979	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA18525	1.151	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA18939	0.879	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA19017	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA19238	1.018	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA19239	1.091	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA19625	0.8	0.842	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA19648	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA20502	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	101677689	101677755	DEL	67	NA20845	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG00096	0.483	0.582	0.0	0.019	0.556	0.58	1	1
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG00268	0.596	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG00419	0.585	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG00759	0.739	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG01051	0.804	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG01112	0.733	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG01500	1.043	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG01565	0.886	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG01583	1.002	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG01595	0.697	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG01879	0.421	0.507	0.0	0.043	0.64	0.64	1	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG02568	0.952	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG02922	0.966	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG03006	0.688	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG03052	0.865	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG03642	1.031	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	HG03742	0.701	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA12878	0.911	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA18525	0.977	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA18939	0.791	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA19017	0.672	0.809	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA19238	0.903	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA19239	0.939	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA19625	0.75	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA19648	1.237	1.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA20502	0.75	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	102712356	102712409	DEL	54	NA20845	0.871	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG00096	0.0	0.0	0.247	0.198	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG00268	0.0	0.0	0.371	0.234	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG00419	0.0	0.0	0.228	0.167	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG00759	0.0	0.0	0.327	0.202	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG01051	0.588	0.55	0.055	0.055	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG01112	0.601	0.561	0.052	0.052	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG01500	0.626	0.585	0.077	0.049	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG01565	0.987	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG01583	0.0	0.0	0.234	0.181	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG01595	0.0	0.0	0.288	0.198	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG01879	0.0	0.0	0.215	0.172	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG02568	0.495	0.463	0.058	0.048	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG02922	0.514	0.48	0.085	0.04	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG03006	0.0	0.0	0.247	0.162	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG03052	0.0	0.0	0.216	0.155	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG03642	0.0	0.0	0.185	0.136	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	HG03742	0.0	0.0	0.2	0.145	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA12878	0.405	0.378	0.062	0.064	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA18525	0.0	0.0	0.246	0.228	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA18939	0.0	0.0	0.207	0.175	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA19017	0.0	0.0	0.229	0.143	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA19238	0.483	0.452	0.072	0.057	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA19239	0.0	0.0	0.206	0.146	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA19625	0.0	0.0	0.213	0.14	nan	nan	0	0
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA19648	0.495	0.462	0.067	0.037	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA20502	0.637	0.595	0.064	0.048	nan	nan	0	1
chr4	104894032	104894690	DEL	659	NA20845	0.531	0.497	0.028	0.022	nan	nan	0	1
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG00096	1.199	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG00268	1.158	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG00419	1.21	1.131	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG00759	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG01051	1.412	1.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG01112	1.06	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG01500	1.338	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG01565	1.208	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG01583	1.312	1.226	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG01595	1.297	1.212	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG01879	1.07	1.0	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG02568	1.067	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG02922	1.151	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG03006	1.076	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG03642	1.174	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	HG03742	1.364	1.275	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA12878	0.979	0.915	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA18525	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA18939	1.389	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA19017	1.071	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA19238	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA19648	1.435	1.341	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA20502	1.103	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	105146317	105146584	DUP	268	NA20845	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG00096	0.59	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG00268	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG00419	0.323	0.371	0.007	0.051	nan	nan	0	1
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG00759	0.626	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG01051	0.353	0.406	0.012	0.04	nan	nan	0	1
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG01112	0.724	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG01500	0.574	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG01565	0.302	0.347	0.007	0.057	nan	nan	0	1
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG01583	1.049	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG01595	0.6	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG01879	0.79	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG02568	1.105	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG02922	0.596	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG03006	0.582	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG03052	0.854	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG03642	0.815	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	HG03742	0.701	0.806	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA12878	0.894	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA18525	0.767	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA18939	0.703	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA19017	0.835	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA19238	0.992	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA19239	0.812	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA19625	0.75	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA19648	0.668	0.768	0.0	0.028	nan	nan	0	1
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA20502	0.932	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	106237908	106238180	DEL	273	NA20845	0.638	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG00096	1.109	1.037	0.0	0.0	0.717	0.687	2	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG00268	1.09	1.019	0.0	0.0	0.718	0.748	1	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG00419	1.129	1.055	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG00759	1.195	1.116	0.0	0.0	0.724	0.724	2	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG01051	1.177	1.1	0.0	0.0	0.785	0.785	2	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG01112	1.078	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG01500	1.095	1.023	0.0	0.0	0.737	0.769	3	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG01565	0.987	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG01583	0.525	0.49	0.079	0.039	nan	nan	0	1
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG01595	1.065	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG01879	1.141	1.066	0.0	0.0	0.699	0.699	2	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG02568	1.029	0.961	0.0	0.0	0.644	0.644	4	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG02922	1.069	0.999	0.0	0.0	0.731	0.685	4	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG03006	0.618	0.577	0.061	0.043	0.525	0.525	2	1
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG03052	1.146	1.071	0.0	0.0	0.91	0.91	4	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG03642	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	HG03742	1.023	0.956	0.003	0.0	0.605	0.605	2	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA12878	1.046	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA18525	1.169	1.092	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA18939	1.108	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA19017	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA19238	1.094	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA19239	1.04	0.972	0.0	0.0	0.789	0.787	4	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA19625	1.325	1.239	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA19648	1.014	0.948	0.0	0.0	0.809	0.761	4	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA20502	1.0	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107374160	107375124	DEL	965	NA20845	0.51	0.477	0.053	0.044	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG00096	0.59	0.59	0.061	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG00268	0.817	0.817	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG00419	0.484	0.484	0.04	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG00759	0.417	0.417	0.063	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG01051	1.0	1.0	0.004	0.001	0.808	0.808	1	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG01112	0.795	0.795	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG01500	0.834	0.834	0.0	0.0	0.84	0.805	1	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG01565	0.785	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG01583	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG01595	0.0	0.0	0.153	0.0	nan	nan	0	0
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG01879	0.825	0.825	0.0	0.0	0.794	0.794	1	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG02568	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG02922	0.863	0.863	0.0	0.0	0.941	0.882	1	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG03006	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG03052	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG03642	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	HG03742	0.398	0.398	0.065	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA12878	0.523	0.523	0.033	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA18525	0.523	0.523	0.072	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA18939	0.51	0.51	0.055	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA19017	0.436	0.436	0.035	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA19238	0.496	0.496	0.033	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA19239	0.824	0.824	0.0	0.001	0.781	0.759	2	2
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA19625	0.7	0.7	0.038	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA19648	0.47	0.47	0.044	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA20502	0.659	0.659	0.037	0.0	nan	nan	0	1
chr4	107437718	107438504	DEL	787	NA20845	0.0	0.0	0.1	0.0	nan	nan	0	0
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG00096	0.447	0.434	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG00268	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG00419	0.686	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG00759	0.901	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG01051	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG01112	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG01500	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG01565	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG01583	0.882	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG01595	1.258	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG01879	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG02568	0.952	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG02922	1.11	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG03006	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG03052	1.188	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG03642	0.455	0.442	0.019	0.136	nan	nan	0	1
chr4	107840622	107840967	DEL	346	HG03742	1.023	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA12878	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA18525	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA18939	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA19017	0.899	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA19238	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA19239	1.154	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA19625	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA19648	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA20502	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	107840622	107840967	DEL	346	NA20845	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG00096	0.859	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG00268	0.392	0.496	0.0	0.021	0.88	0.917	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.036	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.063	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.02	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.018	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG02922	0.329	0.416	0.0	0.025	0.533	0.569	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG03006	0.459	0.581	0.0	0.038	1.0	1.0	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG03052	0.333	0.422	0.0	0.026	0.75	0.75	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG03642	0.312	0.394	0.0	0.016	0.6	0.6	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	HG03742	0.398	0.504	0.0	0.031	1.0	1.0	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA18525	0.767	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA18939	0.528	0.668	0.0	0.009	0.375	0.375	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA19017	0.599	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA19238	0.661	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA19239	0.812	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA19625	0.425	0.538	0.0	0.041	0.471	0.471	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA19648	0.47	0.595	0.0	0.019	0.778	0.826	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA20502	0.455	0.576	0.0	0.016	0.857	0.905	1	1
chr4	1086777	1086827	DEL	51	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG00096	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG00268	1.788	1.641	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG00419	1.089	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG00759	1.195	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG01051	1.177	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG01112	1.272	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG01500	1.234	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG01565	1.53	1.404	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG01583	1.216	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG01595	1.161	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG01879	1.334	1.223	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG02568	0.99	0.909	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG02922	1.295	1.188	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG03006	1.2	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG03052	1.042	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG03642	0.527	0.484	0.0	0.04	0.947	0.947	1	1
chr4	110748458	110748524	DEL	67	HG03742	0.91	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA12878	0.827	0.758	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA18525	1.169	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA18939	1.196	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA19017	0.635	0.583	0.0	0.062	0.756	0.79	1	1
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA19238	1.247	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA19239	0.761	0.698	0.0	0.021	0.366	0.377	1	1
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA19625	0.65	0.596	0.0	0.033	0.462	0.462	1	1
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA19648	1.187	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr4	110748458	110748524	DEL	67	NA20845	1.19	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG00096	0.0	0.0	0.015	0.122	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG00419	0.0	0.0	0.017	0.154	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG01112	0.0	0.0	0.005	0.097	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG01500	0.678	0.658	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.18	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG01595	0.0	0.0	0.006	0.163	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG01879	0.404	0.392	0.006	0.083	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG02568	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG02922	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG03006	0.0	0.0	0.011	0.172	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG03052	0.521	0.506	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.189	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.182	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA18939	0.0	0.0	0.024	0.2	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA19017	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA19238	0.56	0.543	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA19239	0.482	0.468	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA19625	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA19648	0.0	0.0	0.011	0.141	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.149	nan	nan	0	0
chr4	111516319	111516509	DEL	191	NA20845	0.0	0.0	0.005	0.148	nan	nan	0	0
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG00096	0.984	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG00268	0.817	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG00419	1.028	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG00759	0.758	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG01051	0.922	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG01112	0.618	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG01500	0.4	0.444	0.0	0.04	0.875	0.913	1	1
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG01565	0.725	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG01583	1.026	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG01595	0.716	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG01879	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG02568	0.61	0.677	0.0	0.015	0.167	0.167	1	1
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG02922	0.349	0.388	0.0	0.031	0.467	0.498	1	1
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG03006	1.006	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG03052	0.896	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG03642	1.055	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	HG03742	0.853	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA12878	0.894	0.994	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA18525	1.012	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA18939	1.038	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA19017	0.454	0.504	0.0	0.051	0.72	0.753	1	1
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA19238	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA19239	0.406	0.451	0.0	0.031	0.857	0.882	1	1
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA19625	0.675	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA19648	0.841	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA20502	1.205	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	111559451	111559511	DEL	61	NA20845	0.978	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG00096	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG00268	1.192	1.157	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG00419	1.17	1.136	0.0	0.004	0.771	0.771	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG00759	1.176	1.141	0.0	0.0	0.639	0.639	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG01051	1.0	0.971	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG01112	1.069	1.038	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG01500	1.147	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG01565	1.127	1.095	0.0	0.0	0.69	0.69	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG01583	1.216	1.181	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG01595	1.278	1.24	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG01879	0.421	0.409	0.0	0.089	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG02568	1.067	1.036	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG02922	0.411	0.399	0.007	0.055	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG03006	0.882	0.856	0.0	0.0	0.548	0.548	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG03052	0.5	0.485	0.0	0.103	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG03642	1.079	1.047	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	HG03742	0.929	0.902	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA12878	0.962	0.934	0.0	0.003	0.788	0.824	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA18525	1.204	1.169	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA18939	1.319	1.281	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA19017	1.071	1.04	0.0	0.055	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA19238	1.145	1.111	0.0	0.058	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA19625	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA19648	1.163	1.129	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA20502	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115146987	115147212	DUP	226	NA20845	0.935	0.908	0.008	0.021	0.48	0.517	1	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	0
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG00268	0.783	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG00419	1.089	1.057	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG00759	0.796	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG01051	0.53	0.514	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG01112	0.477	0.463	0.007	0.056	0.393	0.393	1	1
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG01500	0.0	0.0	0.008	0.152	nan	nan	0	0
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG01565	0.342	0.332	0.006	0.043	0.2	0.2	2	1
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG01583	0.787	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG01595	0.697	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG01879	0.755	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG02568	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG02922	0.945	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG03006	0.812	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG03052	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG03642	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	HG03742	0.872	0.846	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA12878	0.472	0.459	0.006	0.046	nan	nan	0	1
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA18525	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA18939	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA19017	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA19238	0.483	0.469	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA19239	0.824	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA19625	0.525	0.51	0.0	0.018	nan	nan	0	1
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	1
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115743887	115744132	DEL	246	NA20845	0.68	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG00096	0.966	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG00268	0.954	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG00419	0.907	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG00759	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG01051	1.334	1.247	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG01112	1.272	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG01500	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG01565	1.309	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG01583	1.002	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG01595	0.949	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG01879	1.334	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG02568	0.648	0.605	0.0	0.036	0.571	0.571	1	1
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG02922	1.274	1.191	0.0	0.0	0.926	0.988	1	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG03006	1.253	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG03052	1.5	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG03642	1.103	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	HG03742	1.308	1.222	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA12878	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA18525	0.977	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA18939	1.249	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA19017	1.18	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA19238	1.285	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA19239	1.129	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA19625	0.65	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA19648	1.014	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA20502	0.887	0.829	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	115891283	115891345	DEL	63	NA20845	1.275	1.192	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG00096	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG00268	1.039	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG00759	1.195	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG01051	0.569	0.532	0.0	0.071	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG01112	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG01565	1.148	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG01583	1.049	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG01595	1.258	1.176	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG01879	1.176	1.099	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG03006	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	HG03642	1.462	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	NA12878	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	NA18525	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	NA19238	1.03	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	NA20502	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117095262	117095394	DUP	133	NA20845	1.126	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG00096	1.163	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG00268	0.971	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG00419	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG00759	0.512	0.478	0.099	0.068	nan	nan	0	1
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG01051	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG01112	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG01500	0.487	0.455	0.081	0.062	nan	nan	0	1
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG01565	1.127	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG01583	1.073	1.003	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG01595	0.6	0.561	0.078	0.059	nan	nan	0	1
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG01879	1.105	1.033	0.0	0.0	0.88	0.88	2	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG02568	0.914	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG02922	0.904	0.845	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG03006	1.023	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG03052	1.271	1.188	0.0	0.0	0.968	0.968	2	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG03642	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	HG03742	1.232	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA12878	0.506	0.473	0.051	0.036	nan	nan	0	1
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA18525	1.029	0.962	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA18939	0.967	0.904	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA19017	1.035	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA19238	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA19239	1.091	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA19625	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA19648	0.445	0.416	0.133	0.076	nan	nan	0	1
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA20502	0.523	0.489	0.087	0.069	nan	nan	0	1
chr4	117367804	117368498	DEL	695	NA20845	1.126	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG00096	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG00268	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG00419	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG00759	0.398	0.398	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG01051	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG01112	1.007	1.007	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG01500	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG01565	0.564	0.564	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG01583	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG01595	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG01879	0.842	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG02568	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG02922	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG03006	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG03052	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG03642	0.695	0.695	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	HG03742	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA12878	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA18525	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA18939	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA19017	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA19238	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA19239	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA19625	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA19648	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA20502	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	119322762	119322885	DEL	124	NA20845	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG00096	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG00268	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG00419	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG00759	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG01051	0.588	0.588	0.006	0.083	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG01112	0.548	0.548	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG01500	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG01565	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG01583	0.382	0.382	0.04	0.074	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG01595	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG01879	0.439	0.439	0.0	0.121	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG02568	0.648	0.648	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG02922	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG03006	0.653	0.653	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG03052	0.417	0.417	0.035	0.083	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG03642	0.455	0.455	0.013	0.041	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	HG03742	0.682	0.682	0.019	0.06	nan	nan	0	1
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA12878	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA18525	1.256	1.256	0.0	0.0	0.892	0.892	1	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA18939	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA19017	1.126	1.126	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA19238	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA19239	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA19625	1.275	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA19648	0.0	0.0	0.031	0.18	nan	nan	0	0
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA20502	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	120027248	120027580	DEL	333	NA20845	0.616	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG00096	0.34	0.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG00268	0.358	0.358	0.0	0.0	0.5	0.48	1	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG00419	0.262	0.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG00759	0.152	0.152	0.0	0.038	0.3	0.3	1	1
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG01051	0.0	0.0	0.009	0.103	nan	nan	0	0
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG01112	0.212	0.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG01500	0.434	0.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG01565	0.161	0.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG01583	0.143	0.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG01595	0.194	0.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG01879	0.246	0.246	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG02568	0.229	0.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG02922	0.185	0.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG03006	0.124	0.124	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG03052	0.25	0.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG03642	0.096	0.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	HG03742	0.246	0.246	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA12878	0.253	0.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA18525	0.523	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA18939	0.229	0.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA19017	0.436	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA19238	0.458	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA19239	0.381	0.381	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA19625	0.175	0.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA19648	0.322	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA20502	0.318	0.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	122232649	122232766	DEL	118	NA20845	0.213	0.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG00096	1.002	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG00268	1.107	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG00419	0.827	0.773	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG00759	0.55	0.514	0.064	0.02	nan	nan	0	1
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG01051	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG01112	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG01500	1.251	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG01565	1.107	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG01583	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG01595	0.697	0.651	0.03	0.008	nan	nan	0	1
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG01879	0.895	0.836	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG02568	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG02922	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG03006	1.076	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG03052	1.354	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG03642	0.839	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	HG03742	1.374	1.284	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA12878	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA18525	1.064	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA18939	1.354	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA19017	1.044	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA19238	1.17	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA19239	0.926	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA19625	1.225	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA19648	1.138	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA20502	1.228	1.148	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	128752712	128753241	DEL	530	NA20845	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG00096	0.394	0.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG00268	0.92	0.893	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG00419	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG00759	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG01051	1.04	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG01112	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG01500	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG01565	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG01583	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG01595	1.374	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG01879	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG02568	1.524	1.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG02922	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG03006	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG03052	0.5	0.485	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG03642	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	HG03742	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA12878	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA18525	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA18939	0.791	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA19017	1.089	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA19238	1.094	1.062	0.0	0.0	0.519	0.504	1	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA19239	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA19625	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA19648	1.088	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA20502	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130068639	130068988	DEL	350	NA20845	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG00096	0.877	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG00268	0.971	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG00419	0.847	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG00759	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG01051	0.647	0.628	0.0	0.007	0.778	0.778	1	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG01112	0.724	0.703	0.005	0.007	0.387	0.387	1	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG01500	0.747	0.726	0.0	0.013	0.359	0.358	2	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG01565	0.785	0.762	0.0	0.004	0.516	0.516	1	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG01583	0.549	0.533	0.0	0.01	0.5	0.5	1	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG01595	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG01879	0.702	0.681	0.0	0.003	0.457	0.457	1	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG02568	1.105	1.073	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG02922	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG03006	0.494	0.48	0.0	0.0	0.895	0.895	1	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG03052	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG03642	1.246	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	HG03742	0.966	0.938	0.0	0.003	0.655	0.655	1	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA12878	0.321	0.311	0.0	0.013	nan	nan	0	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA18525	0.959	0.931	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA18939	0.774	0.751	0.0	0.007	0.677	0.677	1	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA19017	0.672	0.652	0.0	0.004	0.455	0.475	1	1
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA19238	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA19239	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA19625	0.45	0.437	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA19648	0.767	0.744	0.0	0.0	0.455	0.483	1	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA20502	0.728	0.706	0.0	0.004	0.7	0.739	1	2
chr4	130175089	130175155	DEL	67	NA20845	0.68	0.66	0.0	0.008	0.626	0.621	2	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG00096	0.948	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG00268	0.971	0.942	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG00419	0.605	0.587	0.008	0.077	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG00759	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG01051	0.687	0.667	0.006	0.072	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG01112	0.459	0.446	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG01500	0.991	0.962	0.0	0.0	0.926	0.966	1	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG01565	0.644	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG01583	0.644	0.625	0.009	0.039	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG01595	0.678	0.658	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG01879	0.579	0.562	0.018	0.049	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG02568	0.648	0.629	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG02922	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG03006	0.0	0.0	0.019	0.134	nan	nan	0	0
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG03052	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG03642	0.719	0.698	0.013	0.087	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	HG03742	0.436	0.423	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA12878	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA18525	0.401	0.39	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA18939	0.51	0.495	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA19017	0.654	0.635	0.008	0.002	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA19238	0.0	0.0	0.008	0.159	nan	nan	0	0
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA19239	0.457	0.443	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA19625	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA19648	0.717	0.696	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA20502	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	130626377	130626649	DEL	273	NA20845	0.446	0.433	0.009	0.052	nan	nan	0	1
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG00096	0.716	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG00268	0.732	0.711	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG00419	0.726	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG00759	0.777	0.755	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG01051	0.255	0.248	0.0	0.036	0.867	0.867	1	1
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG01112	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG01500	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG01565	0.805	0.782	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG01583	0.739	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG01595	0.794	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG01879	0.684	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG02568	0.838	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG02922	0.801	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG03006	0.759	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG03052	0.771	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG03642	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	HG03742	0.606	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA12878	0.675	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA18525	0.663	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA18939	0.492	0.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA19017	0.726	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA19238	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA19239	0.901	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA19625	0.2	0.194	0.0	0.027	1.0	1.0	1	1
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA19648	0.297	0.288	0.0	0.084	0.8	0.85	1	1
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA20502	0.796	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131445510	131445587	DEL	78	NA20845	0.659	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG00096	0.268	0.308	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG00268	0.562	0.646	0.0	0.198	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG00419	0.726	0.834	0.031	0.233	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG00759	0.0	0.0	0.036	0.185	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG01051	0.333	0.383	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG01112	0.0	0.0	0.009	0.182	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG01500	0.626	0.719	0.011	0.108	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG01565	0.0	0.0	0.025	0.181	nan	nan	0	0
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG01583	0.0	0.0	0.014	0.194	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG01595	0.194	0.222	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG01879	0.316	0.363	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG02568	0.076	0.088	0.0	0.157	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG02922	0.534	0.614	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG03006	0.194	0.223	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG03052	0.146	0.168	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG03642	0.168	0.193	0.01	0.076	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	HG03742	0.701	0.806	0.006	0.213	nan	nan	0	0
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA12878	0.337	0.388	0.006	0.149	nan	nan	0	0
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.213	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA18939	0.422	0.485	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA19017	0.0	0.0	0.011	0.19	nan	nan	0	0
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA19239	0.317	0.364	0.004	0.081	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA19625	0.375	0.431	0.009	0.0	0.75	0.75	2	2
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA19648	0.124	0.142	0.009	0.163	nan	nan	0	1
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA20502	0.0	0.0	0.011	0.222	nan	nan	0	0
chr4	131694825	131695074	DEL	250	NA20845	0.0	0.0	0.014	0.121	nan	nan	0	0
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG00096	1.002	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG00268	1.022	0.937	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG00419	1.291	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG00759	0.815	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG01051	1.059	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG01112	0.83	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG01500	1.199	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG01565	1.409	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG01583	0.978	0.897	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG01595	0.736	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG01879	1.632	1.497	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG02568	0.952	0.874	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG03006	1.253	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG03642	0.815	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	HG03742	1.099	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA12878	0.911	0.836	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA18525	1.081	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA18939	1.319	1.21	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA19017	1.162	1.066	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA19238	1.475	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA19239	1.281	1.175	0.0	0.0	0.94	0.968	1	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA19625	1.125	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA19648	1.336	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA20502	1.137	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	132033363	132033417	DUP	55	NA20845	0.956	0.877	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG00096	1.306	1.221	0.004	0.0	0.865	0.829	1	2
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG00268	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG00419	0.625	0.584	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG00759	0.758	0.709	0.007	0.098	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG01051	0.608	0.568	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG01112	0.477	0.446	0.021	0.059	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG01500	0.782	0.731	0.006	0.055	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG01565	0.805	0.753	0.021	0.119	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG01583	0.501	0.468	0.005	0.117	0.281	0.281	4	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG01595	0.6	0.561	0.013	0.066	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG01879	1.228	1.148	0.0	0.0	0.703	0.703	1	2
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.135	nan	nan	0	0
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG02922	0.74	0.691	0.007	0.077	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG03006	1.217	1.138	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG03052	0.646	0.604	0.009	0.068	0.131	0.131	2	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG03642	0.0	0.0	0.01	0.168	nan	nan	0	0
chr4	133445429	133445697	DEL	269	HG03742	0.0	0.0	0.011	0.219	nan	nan	0	0
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA12878	0.557	0.52	0.005	0.082	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA18525	0.471	0.44	0.005	0.109	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA18939	0.0	0.0	0.015	0.21	nan	nan	0	0
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA19017	0.0	0.0	0.007	0.18	nan	nan	0	0
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA19238	0.661	0.618	0.003	0.087	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA19239	0.482	0.45	0.004	0.066	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.212	nan	nan	0	0
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA19648	0.396	0.37	0.009	0.102	nan	nan	0	1
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA20502	0.0	0.0	0.023	0.203	nan	nan	0	0
chr4	133445429	133445697	DEL	269	NA20845	0.574	0.536	0.006	0.067	nan	nan	0	1
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG00096	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG00268	1.039	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG00419	1.291	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG00759	0.683	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG01051	1.098	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG01112	1.06	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG01500	0.904	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG01565	1.329	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG01583	0.644	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG01595	1.626	1.52	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG01879	1.369	1.279	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG02568	0.381	0.356	0.0	0.054	0.556	0.556	1	1
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG02922	0.308	0.288	0.0	0.076	0.923	0.865	1	1
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG03006	1.288	1.204	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG03052	0.396	0.37	0.0	0.043	0.769	0.769	1	1
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG03642	1.222	1.142	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	HG03742	0.701	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA12878	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA18525	0.924	0.864	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA18939	1.284	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA19017	0.599	0.56	0.0	0.046	0.69	0.722	1	1
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA19238	0.407	0.38	0.0	0.053	0.951	0.924	1	1
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA19239	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA19625	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA19648	0.89	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA20502	0.932	0.871	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr4	133962311	133962393	DEL	83	NA20845	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG00096	0.734	0.712	0.0	0.0	0.5	0.479	1	2
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG00268	0.0	0.0	0.053	0.0	0.7	0.672	2	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG00419	0.423	0.411	0.014	0.0	0.778	0.778	1	1
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG00759	0.0	0.0	0.124	0.0	0.6	0.6	1	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG01051	0.0	0.0	0.039	0.0	0.521	0.521	2	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG01112	0.0	0.0	0.064	0.0	nan	nan	0	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG01500	0.0	0.0	0.083	0.0	0.78	0.814	2	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG01565	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0	1.0	1	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG01583	0.0	0.0	0.033	0.0	0.5	0.5	4	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG01595	0.0	0.0	0.088	0.0	nan	nan	0	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG01879	0.281	0.273	0.036	0.0	0.4	0.4	1	1
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG02568	0.61	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG02922	0.0	0.0	0.075	0.0	0.364	0.388	5	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG03006	0.0	0.0	0.071	0.0	nan	nan	0	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG03052	0.0	0.0	0.051	0.0	0.429	0.429	5	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG03642	0.0	0.0	0.075	0.0	0.571	0.571	1	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	HG03742	0.0	0.0	0.082	0.0	0.75	0.75	1	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA12878	0.0	0.0	0.058	0.0	0.727	0.76	1	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA18525	0.0	0.0	0.099	0.0	0.217	0.217	2	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA18939	0.0	0.0	0.089	0.0	0.667	0.667	2	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA19017	0.0	0.0	0.148	0.0	nan	nan	0	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA19238	0.0	0.0	0.084	0.0	0.385	0.396	4	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA19239	0.0	0.0	0.052	0.0	0.533	0.549	2	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA19625	0.35	0.34	0.058	0.0	0.833	0.833	1	1
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA19648	0.0	0.0	0.073	0.0	0.595	0.56	4	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA20502	0.0	0.0	0.108	0.0	0.7	0.739	2	0
chr4	134132404	134133157	DEL	754	NA20845	0.319	0.31	0.007	0.0	1.0	0.929	1	1
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG00096	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG00268	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG00419	0.645	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG00759	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG01051	0.785	0.785	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG01112	1.131	1.131	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG01500	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG01565	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG01583	0.739	0.739	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG01595	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG01879	1.035	1.035	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG02568	1.295	1.295	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG02922	0.596	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG03006	1.059	1.059	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG03052	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG03642	0.839	0.839	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	HG03742	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA12878	0.911	0.911	0.0	0.0	0.842	0.805	1	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA18525	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA18939	0.29	0.29	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA19017	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA19238	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA19239	0.583	0.583	0.0	0.073	0.286	0.278	1	1
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA19625	1.025	1.025	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA19648	1.41	1.41	0.0	0.0	0.929	0.874	1	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA20502	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	134346775	134346898	DEL	124	NA20845	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG00096	0.984	0.92	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG00268	0.851	0.796	0.0	0.0	0.845	0.88	2	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG00419	1.028	0.961	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG00759	1.024	0.957	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG01051	1.04	0.972	0.0	0.006	0.8	0.8	2	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG01112	0.883	0.825	0.005	0.007	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG01500	0.956	0.893	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG01565	1.107	1.035	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG01583	0.715	0.669	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG01595	0.813	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG01879	0.649	0.607	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG02568	0.838	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG02922	0.719	0.672	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG03006	1.112	1.039	0.0	0.003	0.091	0.091	1	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG03052	0.688	0.643	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG03642	1.174	1.098	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	HG03742	0.777	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA12878	0.844	0.788	0.0	0.007	0.667	0.697	1	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA18525	0.942	0.88	0.0	0.01	0.789	0.789	1	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA18939	0.58	0.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA19017	0.363	0.339	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA19238	0.979	0.915	0.0	0.024	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA19239	0.951	0.889	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA19625	0.675	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA19648	1.014	0.948	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA20502	1.023	0.956	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	135171432	135171578	DEL	147	NA20845	0.808	0.755	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG00096	1.199	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG00268	1.413	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG00419	0.444	0.415	0.0	0.076	0.906	0.906	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG00759	0.55	0.514	0.0	0.033	0.667	0.667	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG01051	0.687	0.642	0.0	0.018	0.405	0.405	1	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG01112	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG01500	1.095	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG01565	0.544	0.508	0.0	0.039	0.962	0.962	1	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG01583	1.24	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG01595	0.639	0.597	0.0	0.06	0.611	0.611	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG01879	0.526	0.492	0.0	0.034	0.759	0.759	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG02568	0.457	0.427	0.0	0.041	1.0	1.0	1	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG02922	0.658	0.615	0.0	0.055	0.423	0.451	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG03006	0.618	0.577	0.0	0.027	0.705	0.705	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG03052	1.188	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG03642	1.342	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	HG03742	1.175	1.098	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA12878	0.725	0.678	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA18525	1.012	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA18939	0.633	0.592	0.0	0.03	0.718	0.718	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA19017	0.635	0.594	0.004	0.047	0.733	0.767	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA19238	1.183	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA19239	0.495	0.462	0.004	0.049	0.872	0.898	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA19625	0.7	0.654	0.0	0.033	0.6	0.6	1	1
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA19648	1.039	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA20502	1.432	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	137541616	137541686	DEL	71	NA20845	0.51	0.477	0.0	0.026	0.933	0.995	1	1
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG00096	0.877	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG00268	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG00419	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG00759	0.417	0.405	0.065	0.044	nan	nan	0	1
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG01051	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG01112	0.883	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG01500	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG01565	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG01583	1.002	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG01595	0.968	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG01879	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG02568	0.762	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG02922	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG03006	0.9	0.874	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG03052	0.917	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG03642	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	HG03742	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA12878	0.945	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA18525	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA18939	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA19017	0.944	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA19238	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA19239	0.913	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA19625	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA19648	1.088	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA20502	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138667026	138667831	DEL	806	NA20845	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG00096	0.734	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG00268	0.749	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG00419	0.696	0.675	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG00759	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG01051	0.883	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG01112	0.618	0.6	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG01500	0.991	0.962	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG01565	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG01595	0.871	0.846	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG01879	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG02568	0.457	0.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG02922	0.986	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG03006	0.847	0.822	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG03052	0.688	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG03642	0.503	0.489	0.0	0.077	0.478	0.478	1	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	HG03742	1.042	1.012	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA12878	0.844	0.819	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA18525	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA18939	1.108	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA19017	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA19238	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA19239	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA19648	0.618	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA20502	0.705	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	138778436	138778517	DUP	82	NA20845	1.041	1.011	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG00096	0.286	0.329	0.0	0.031	0.579	0.604	1	1
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG00268	0.647	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG00419	0.645	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG00759	0.834	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG01051	0.353	0.406	0.0	0.032	0.522	0.522	1	1
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG01112	0.83	0.954	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG01500	0.817	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG01565	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG01583	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG01595	0.678	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG01879	0.263	0.303	0.0	0.041	0.95	0.95	1	1
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG02568	1.181	1.357	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG02922	0.452	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG03006	0.547	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG03052	0.802	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG03642	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	HG03742	0.72	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA12878	0.709	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA18525	0.959	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA18939	0.756	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA19017	0.708	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA19238	0.814	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA19239	0.736	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA19625	0.75	0.862	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA19648	0.791	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA20502	0.773	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141497059	141497126	DEL	68	NA20845	0.765	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG00096	0.751	0.73	0.0	0.004	0.783	0.75	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG00268	0.851	0.827	0.0	0.01	0.667	0.64	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG00419	0.928	0.901	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG00759	0.872	0.847	0.0	0.004	0.944	0.944	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG01051	0.765	0.743	0.0	0.004	0.45	0.45	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG01112	1.06	1.029	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG01500	0.782	0.759	0.0	0.011	0.708	0.739	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG01565	0.624	0.606	0.008	0.065	nan	nan	0	1
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG01583	0.525	0.509	0.008	0.062	0.375	0.375	3	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG01595	0.89	0.865	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG01879	1.228	1.193	0.0	0.003	0.344	0.344	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG02568	0.381	0.37	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG02922	1.315	1.277	0.0	0.015	1.0	0.938	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG03006	1.094	1.062	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG03052	0.792	0.769	0.0	0.004	0.662	0.662	2	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG03642	0.647	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	HG03742	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA12878	0.725	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA18525	0.576	0.559	0.007	0.074	nan	nan	0	1
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA18939	0.985	0.956	0.0	0.0	0.79	0.79	2	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA19017	1.035	1.005	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA19238	1.107	1.074	0.0	0.018	nan	nan	0	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA19239	1.104	1.071	0.0	0.0	0.325	0.335	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA19625	0.675	0.656	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA19648	0.742	0.72	0.0	0.015	0.438	0.465	1	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA20502	0.659	0.64	0.0	0.0	0.63	0.636	2	2
chr4	141633307	141633603	DEL	297	NA20845	1.211	1.176	0.0	0.0	0.723	0.778	2	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG00096	0.626	0.72	0.0	0.0	1.0	0.958	2	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG00268	0.647	0.744	0.0	0.0	0.743	0.714	2	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG00419	0.444	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG00759	0.834	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG01051	0.628	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG01112	0.618	0.711	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG01500	0.886	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG01565	0.725	0.833	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG01583	0.668	0.768	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG01595	0.523	0.601	0.005	0.0	0.636	0.636	1	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG01879	0.597	0.686	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG02568	0.343	0.394	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG02922	0.226	0.26	0.012	0.051	nan	nan	0	1
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG03006	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG03052	0.542	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG03642	0.407	0.468	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	HG03742	0.587	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA12878	0.675	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA18525	0.855	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA18939	0.651	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA19017	0.617	0.71	0.0	0.003	0.526	0.503	1	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA19238	0.331	0.38	0.006	0.11	nan	nan	0	1
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA19239	0.469	0.539	0.002	0.072	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA19625	0.525	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA19648	0.495	0.569	0.0	0.0	0.667	0.708	1	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA20502	0.523	0.601	0.0	0.0	0.812	0.77	1	2
chr4	142422200	142422575	DEL	376	NA20845	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG00096	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG00268	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG00419	0.968	0.968	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG01051	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG01500	1.234	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG01565	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG01583	1.264	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG02922	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG03052	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	HG03742	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	NA18939	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	NA19238	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	NA20502	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142853439	142853528	DUP	90	NA20845	1.211	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG00096	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG00268	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG00419	1.19	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG00759	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG01051	0.883	0.857	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG01112	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG01500	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG01565	1.429	1.388	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG01583	0.882	0.857	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG01595	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG01879	0.93	0.903	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG02568	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG02922	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG03006	1.253	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG03052	0.458	0.445	0.0	0.065	0.519	0.519	1	1
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG03642	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	HG03742	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA12878	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA18525	0.907	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA18939	0.915	0.888	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA19017	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA19238	0.916	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA19239	1.078	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA19625	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA19648	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA20502	1.262	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	142975122	142975219	DEL	98	NA20845	1.275	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG00419	0.665	0.622	0.0	0.026	0.424	0.424	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG00759	0.493	0.461	0.0	0.038	1.0	1.0	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG01051	0.961	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG01500	0.0	0.0	0.007	0.044	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG01879	0.491	0.459	0.0	0.016	0.793	0.793	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG02568	0.305	0.285	0.0	0.04	0.692	0.692	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG02922	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG03052	0.938	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	HG03742	0.436	0.407	0.0	0.044	0.792	0.792	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA12878	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA18525	0.959	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA18939	0.528	0.493	0.0	0.014	0.97	0.97	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA19017	0.953	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA19238	0.89	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA19239	0.647	0.605	0.0	0.028	0.621	0.639	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA19625	0.525	0.491	0.0	0.028	0.909	0.909	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA19648	0.297	0.277	0.0	0.035	0.938	0.882	1	1
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr4	143029543	143029600	DEL	58	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	0
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG00096	0.841	0.816	0.0	0.0	0.93	0.931	2	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG00268	0.903	0.876	0.0	0.0	0.88	0.845	1	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG00419	0.766	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG00759	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG01051	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG01112	0.83	0.806	0.0	0.0	0.64	0.64	1	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG01500	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG01565	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG01583	0.882	0.857	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG01595	0.794	0.771	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG01879	0.456	0.443	0.055	0.048	nan	nan	0	1
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG02568	0.952	0.925	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG02922	0.986	0.958	0.0	0.0	0.4	0.375	1	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG03006	0.812	0.788	0.0	0.0	0.933	0.933	2	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG03052	0.354	0.344	0.068	0.051	nan	nan	0	1
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG03642	0.815	0.791	0.0	0.0	0.385	0.385	1	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	HG03742	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA12878	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA18525	1.029	0.999	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA18939	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA19017	0.853	0.828	0.0	0.0	0.625	0.598	3	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA19238	0.585	0.568	0.054	0.05	nan	nan	0	1
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA19239	0.939	0.911	0.0	0.0	0.659	0.678	1	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA19625	0.475	0.461	0.104	0.067	nan	nan	0	1
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA19648	0.94	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA20502	0.773	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	143857919	143858595	DEL	677	NA20845	0.935	0.908	0.007	0.0	0.733	0.724	2	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG00096	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG00268	0.988	0.959	0.0	0.0	0.759	0.728	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG00419	0.928	0.901	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG00759	0.777	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG01051	0.922	0.895	0.0	0.0	0.423	0.423	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG01112	0.724	0.703	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG01500	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG01565	0.664	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG01583	1.073	1.042	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG01595	1.22	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG01879	0.983	0.954	0.0	0.0	0.69	0.69	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG02568	0.457	0.444	0.057	0.052	nan	nan	0	1
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG02922	0.411	0.399	0.028	0.05	nan	nan	0	1
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG03006	0.97	0.942	0.0	0.0	0.528	0.528	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG03052	0.938	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG03642	0.983	0.954	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	HG03742	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA12878	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA18525	0.829	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA18939	1.038	1.007	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA19017	0.708	0.687	0.015	0.044	nan	nan	0	1
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA19238	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA19239	1.104	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA19625	1.3	1.262	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA19648	1.15	1.117	0.0	0.0	0.84	0.892	1	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA20502	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	144042349	144042845	DEL	497	NA20845	0.999	0.97	0.0	0.0	0.7	0.754	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG00096	0.653	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG00268	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG00419	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG00759	0.796	0.838	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG01051	0.608	0.64	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG01112	0.813	0.855	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG01500	0.747	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG01565	0.946	0.996	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG01583	1.002	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG01595	0.697	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG01879	0.956	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG02568	0.8	0.842	0.043	0.027	nan	nan	0	1
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG02922	0.658	0.692	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG03006	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG03052	0.76	0.8	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG03642	0.503	0.53	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	HG03742	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA12878	1.13	1.19	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA18525	0.698	0.734	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA18939	0.809	0.852	0.0	0.0	0.903	0.903	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA19017	0.744	0.784	0.0	0.0	0.808	0.773	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA19238	0.903	0.951	0.0	0.0	0.667	0.686	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA19239	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA19625	0.875	0.921	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA19648	1.039	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA20502	0.841	0.886	0.0	0.0	0.625	0.66	1	2
chr4	146053199	146053734	DEL	536	NA20845	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG00096	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG00268	0.869	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG00419	1.028	0.961	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG00759	1.005	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG01051	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG01112	1.113	1.04	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG01500	0.904	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG01565	1.127	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG01583	1.073	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG01595	0.832	0.778	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG01879	0.807	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG02922	1.048	0.98	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG03006	0.865	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG03052	1.021	0.954	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG03642	0.863	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	HG03742	0.815	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA12878	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA18525	1.186	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA18939	0.985	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA19017	0.853	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA19238	1.075	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA19239	0.824	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA19625	0.925	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA19648	0.816	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA20502	0.864	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	14705694	14705863	DUP	170	NA20845	1.148	1.073	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG00096	1.091	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG00268	0.409	0.397	0.049	0.027	nan	nan	0	1
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG00419	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG00759	1.024	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG01051	0.373	0.362	0.096	0.023	nan	nan	0	1
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG01112	0.883	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG01500	0.504	0.489	0.094	0.025	nan	nan	0	1
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG01565	0.423	0.41	0.075	0.025	nan	nan	0	1
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG01583	0.382	0.37	0.073	0.014	nan	nan	0	1
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG01595	0.89	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG01879	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG02568	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG02922	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG03006	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG03052	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG03642	1.198	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	HG03742	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA12878	1.012	0.983	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA18525	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA18939	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA19017	0.999	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA19238	0.916	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA19239	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA19625	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA19648	1.014	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA20502	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	147730166	147731076	DEL	911	NA20845	0.744	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG00096	1.36	1.248	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG00268	1.328	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG00419	1.089	0.999	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG00759	1.441	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG01051	1.452	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG01112	1.325	1.215	0.004	0.0	0.821	0.821	3	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG01500	1.338	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG01565	1.349	1.238	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG01583	1.192	1.094	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG01595	1.394	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG01879	1.369	1.256	0.0	0.0	0.827	0.827	2	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG02568	0.762	0.699	0.056	0.033	nan	nan	0	1
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG02922	1.295	1.188	0.0	0.0	0.638	0.598	2	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG03006	1.288	1.182	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG03052	1.25	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG03642	1.366	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	HG03742	1.213	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA12878	0.928	0.851	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA18525	1.343	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA18939	1.372	1.259	0.0	0.0	0.685	0.685	2	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA19017	1.071	0.983	0.0	0.0	0.833	0.871	1	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA19238	1.234	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA19239	1.116	1.024	0.0	0.0	0.92	0.919	2	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA19625	1.3	1.193	0.0	0.0	0.877	0.877	2	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA19648	1.187	1.089	0.0	0.0	0.714	0.672	1	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA20502	1.228	1.126	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	151026521	151027357	DEL	837	NA20845	1.169	1.072	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG00096	0.787	0.829	0.0	0.0	0.638	0.666	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG00268	1.056	1.111	0.0	0.0	0.835	0.834	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG00419	0.988	1.04	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG00759	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG01051	0.883	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG01112	0.848	0.893	0.0	0.0	0.631	0.631	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG01500	0.695	0.732	0.0	0.0	0.955	0.915	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG01565	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG01583	0.93	0.979	0.0	0.0	0.783	0.783	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG01595	0.736	0.774	0.0	0.0	0.895	0.895	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG01879	0.807	0.85	0.0	0.0	0.911	0.911	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG02568	1.067	1.123	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG02922	0.904	0.952	0.0	0.0	0.833	0.889	3	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG03006	0.688	0.724	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG03052	0.958	1.009	0.0	0.0	0.765	0.765	4	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG03642	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	HG03742	0.929	0.977	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA12878	1.046	1.101	0.0	0.0	0.73	0.763	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA18525	0.82	0.863	0.0	0.0	0.747	0.747	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA18939	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA19017	0.799	0.841	0.0	0.0	0.75	0.717	1	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA19238	0.929	0.977	0.0	0.0	0.85	0.826	3	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA19239	0.85	0.895	0.0	0.0	0.97	0.942	3	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA19625	0.925	0.974	0.0	0.0	0.575	0.575	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA19648	0.532	0.56	0.003	0.041	nan	nan	0	1
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA20502	0.91	0.957	0.0	0.0	0.765	0.772	2	2
chr4	152778551	152779028	DEL	478	NA20845	0.755	0.794	0.0	0.0	0.692	0.643	3	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG00096	1.467	1.346	0.0	0.0	0.974	0.984	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG00268	1.226	1.125	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG00419	1.311	1.203	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG00759	1.346	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG01051	0.981	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG01112	1.237	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG01500	1.234	1.132	0.007	0.0	0.683	0.654	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG01565	1.268	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG01583	0.859	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG01595	1.278	1.172	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG01879	1.158	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG02568	0.571	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG02922	0.74	0.679	0.0	0.024	0.931	0.873	1	1
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG03006	1.235	1.133	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG03052	0.896	0.822	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG03642	1.366	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	HG03742	1.156	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA12878	1.012	0.929	0.0	0.0	0.742	0.71	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA18525	1.343	1.232	0.0	0.003	0.756	0.756	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA18939	1.301	1.194	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA19017	1.325	1.216	0.0	0.0	0.889	0.85	1	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA19238	1.056	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA19239	1.142	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA19625	1.575	1.445	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA19648	1.435	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA20502	1.205	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155553884	155553936	DEL	53	NA20845	1.275	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG00096	0.984	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG00268	0.613	0.645	0.0	0.039	0.5	0.521	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG00419	1.129	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG01051	0.432	0.454	0.0	0.071	0.958	0.958	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG01112	0.936	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG01500	0.487	0.512	0.0	0.043	0.774	0.808	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG01565	0.805	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG01583	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG01595	0.445	0.469	0.0	0.053	0.458	0.458	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG01879	0.298	0.314	0.0	0.038	0.857	0.857	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG02568	1.181	1.243	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG02922	0.411	0.433	0.0	0.033	0.55	0.587	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG03006	0.423	0.446	0.0	0.037	1.0	1.0	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG03052	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG03642	0.407	0.429	0.0	0.009	0.375	0.375	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA12878	0.979	1.03	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA18525	0.584	0.615	0.0	0.031	0.541	0.541	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA18939	0.387	0.407	0.0	0.044	0.8	0.8	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA19017	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA19238	0.394	0.415	0.0	0.04	1.0	0.971	1	1
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA19239	1.078	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA19625	0.975	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA19648	1.014	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr4	155803011	155803090	DEL	80	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG00096	1.145	1.07	0.0	0.0	0.964	0.924	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG00268	1.022	0.955	0.0	0.0	1.0	0.96	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG00419	0.928	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG00759	0.834	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG01051	0.961	0.898	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG01112	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG01500	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG01565	0.846	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG01583	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG01595	0.949	0.886	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG01879	0.684	0.64	0.013	0.08	nan	nan	0	1
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG02568	1.067	0.997	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG02922	1.007	0.941	0.0	0.0	0.444	0.474	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG03006	0.97	0.907	0.0	0.0	0.781	0.781	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG03052	1.26	1.178	0.0	0.0	0.848	0.848	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG03642	0.887	0.829	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	HG03742	1.08	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA12878	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA18525	1.151	1.076	0.0	0.0	0.763	0.763	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA18939	0.915	0.855	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA19017	1.053	0.984	0.0	0.003	0.913	0.955	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA19238	1.208	1.129	0.0	0.0	0.788	0.766	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA19239	1.256	1.174	0.0	0.0	0.809	0.785	1	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA19625	1.25	1.169	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA19648	1.088	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA20502	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	155807957	155808330	DEL	374	NA20845	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG00096	1.288	1.182	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG00268	1.26	1.156	0.005	0.0	0.872	0.837	1	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG00419	1.17	1.073	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG00759	1.308	1.2	0.0	0.0	0.794	0.794	1	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG01051	1.0	0.918	0.0	0.0	0.431	0.431	4	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG01112	1.343	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG01500	1.373	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG01565	1.188	1.09	0.005	0.002	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG01583	1.192	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG01595	1.103	1.012	0.0	0.0	0.781	0.781	1	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG01879	1.123	1.03	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG02568	1.143	1.048	0.0	0.0	0.813	0.813	2	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG02922	1.069	0.98	0.0	0.0	0.782	0.779	2	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG03006	0.935	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG03052	0.583	0.535	0.069	0.051	nan	nan	0	1
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG03642	1.438	1.319	0.0	0.0	0.724	0.724	3	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	HG03742	1.175	1.078	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA12878	0.979	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA18525	1.081	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA18939	1.02	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA19017	1.18	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA19238	1.157	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA19239	1.243	1.14	0.0	0.0	0.774	0.777	3	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA19625	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA19648	1.014	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA20502	1.273	1.168	0.0	0.0	0.571	0.541	1	2
chr4	156222535	156223187	DEL	653	NA20845	1.339	1.228	0.0	0.007	0.885	0.953	1	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG00096	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG00268	0.783	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG00419	0.847	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG00759	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG01051	0.588	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG01112	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG01500	0.765	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG01583	0.62	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG01595	0.774	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG01879	0.632	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG02568	0.952	0.925	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG02922	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG03006	0.794	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG03052	0.771	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG03642	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	HG03742	0.701	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA12878	0.523	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA18525	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA18939	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA19017	0.871	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA19238	0.56	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA19239	0.863	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA19625	0.675	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA19648	0.47	0.456	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA20502	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157406911	157406987	DEL	77	NA20845	1.02	0.99	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG00096	0.769	0.747	0.007	0.0	0.781	0.815	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG00268	1.175	1.141	0.0	0.0	0.887	0.924	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG00419	0.827	0.803	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG00759	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG01051	1.216	1.181	0.0	0.0	0.778	0.778	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG01112	0.954	0.926	0.0	0.0	0.824	0.824	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG01500	0.956	0.928	0.0	0.0	0.896	0.897	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG01565	1.127	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG01583	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG01595	0.929	0.902	0.0	0.0	0.884	0.884	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG01879	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG02568	1.143	1.11	0.0	0.0	0.53	0.53	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG02922	1.171	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG03006	0.953	0.925	0.0	0.0	0.772	0.772	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG03052	1.0	0.971	0.0	0.0	0.771	0.771	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG03642	1.031	1.001	0.0	0.0	0.604	0.604	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	HG03742	0.966	0.938	0.0	0.0	0.893	0.893	3	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA12878	0.81	0.786	0.0	0.0	0.767	0.802	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA18525	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA18939	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA19017	0.999	0.969	0.0	0.0	0.717	0.686	2	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA19238	0.572	0.556	0.011	0.05	nan	nan	0	1
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA19239	0.951	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA19625	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA19648	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA20502	1.091	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	157557312	157557895	DEL	584	NA20845	0.956	0.929	0.0	0.0	0.763	0.709	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG00096	0.805	0.782	0.0	0.0	0.714	0.745	1	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	0.677	0.677	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG00419	0.887	0.861	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG00759	1.119	1.086	0.0	0.0	0.857	0.857	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG01051	1.177	1.143	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG01112	0.495	0.48	0.084	0.053	nan	nan	0	1
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG01500	1.06	1.029	0.0	0.0	0.786	0.753	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG01565	1.087	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG01583	0.501	0.486	0.086	0.048	nan	nan	0	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG01595	1.007	0.977	0.0	0.0	0.777	0.777	4	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG01879	0.877	0.852	0.0	0.0	0.57	0.57	4	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG02568	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG02922	1.069	1.038	0.0	0.004	0.125	0.117	1	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG03006	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG03052	0.875	0.85	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG03642	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	HG03742	0.891	0.865	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA12878	0.911	0.885	0.0	0.0	0.676	0.647	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA18525	1.012	0.982	0.0	0.0	0.753	0.753	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA18939	1.02	0.99	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA19017	1.235	1.199	0.0	0.0	0.639	0.639	4	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA19238	0.954	0.926	0.0	0.0	0.35	0.34	2	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA19239	1.015	0.985	0.0	0.0	0.522	0.507	5	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA19625	0.95	0.923	0.013	0.0	0.612	0.612	4	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA19648	1.064	1.033	0.0	0.0	0.2	0.188	1	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA20502	1.0	0.971	0.0	0.0	0.9	0.853	1	2
chr4	15861201	15861867	DEL	667	NA20845	0.85	0.825	0.0	0.0	0.562	0.559	2	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG00096	1.628	1.522	0.0	0.0	0.722	0.692	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG00268	1.141	1.066	0.0	0.0	0.683	0.711	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG00419	1.25	1.168	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG00759	1.308	1.223	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG01051	1.236	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG01112	1.237	1.156	0.0	0.0	0.97	0.97	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG01500	1.338	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG01565	1.631	1.524	0.0	0.003	0.756	0.756	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG01583	1.359	1.27	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG01595	1.355	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG01879	0.632	0.59	0.0	0.011	0.612	0.612	2	1
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG02568	1.524	1.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG02922	1.315	1.229	0.0	0.003	1.0	0.938	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG03006	1.182	1.105	0.0	0.0	0.703	0.703	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG03052	1.292	1.207	0.0	0.0	0.829	0.829	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG03642	1.043	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	HG03742	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA12878	1.265	1.183	0.0	0.006	0.605	0.578	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA18525	1.186	1.109	0.0	0.003	0.707	0.707	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA18939	0.985	0.92	0.0	0.0	0.964	0.964	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA19017	0.999	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA19238	1.062	0.993	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA19239	1.065	0.996	0.0	0.0	0.886	0.912	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA19625	0.925	0.865	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA19648	1.212	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA20502	1.251	1.169	0.0	0.0	0.828	0.874	1	2
chr4	160071246	160071317	DEL	72	NA20845	1.084	1.013	0.0	0.0	0.444	0.479	1	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG00096	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG00268	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG00419	0.746	0.785	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG00759	0.834	0.878	0.007	0.0	0.907	0.907	2	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG01051	1.138	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG01112	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG01500	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG01565	0.966	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG01583	0.715	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG01595	0.89	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG01879	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG02568	0.495	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG02922	1.048	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG03006	1.182	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG03052	1.042	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG03642	1.055	1.11	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	HG03742	0.436	0.459	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA12878	0.877	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA18525	0.89	0.936	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA19017	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA19238	0.992	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA19239	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA19625	0.325	0.342	0.0	0.063	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA19648	0.928	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA20502	0.682	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	161752431	161752598	DEL	168	NA20845	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG00096	0.913	0.961	0.0	0.0	0.69	0.661	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG00268	0.869	0.914	0.0	0.0	0.771	0.803	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG00419	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG00759	0.872	0.918	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG01051	0.824	0.867	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG01112	0.901	0.948	0.0	0.01	0.556	0.556	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG01500	0.886	0.933	0.0	0.0	0.968	0.967	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG01565	0.987	1.038	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG01583	1.026	1.079	0.0	0.005	0.846	0.846	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG01595	0.929	0.978	0.0	0.0	0.485	0.485	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG01879	0.404	0.425	0.0	0.069	0.074	0.074	1	1
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG02568	1.371	1.444	0.0	0.0	0.396	0.396	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG02922	1.089	1.147	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG03006	0.917	0.966	0.0	0.0	0.912	0.912	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG03052	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG03642	0.839	0.883	0.0	0.005	0.818	0.818	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	HG03742	0.777	0.818	0.0	0.0	0.396	0.396	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA12878	0.945	0.995	0.0	0.0	0.929	0.888	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA18525	0.942	0.991	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA18939	1.02	1.074	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA19017	0.508	0.535	0.009	0.073	nan	nan	0	1
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA19238	0.782	0.823	0.0	0.003	0.536	0.535	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA19239	0.875	0.921	0.0	0.0	0.838	0.862	1	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA19625	1.125	1.185	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA19648	1.088	1.146	0.0	0.0	0.974	0.916	2	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA20502	0.796	0.838	0.007	0.002	nan	nan	0	2
chr4	1618716	1618975	DEL	260	NA20845	1.063	1.119	0.0	0.008	0.543	0.504	2	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG00096	0.394	0.382	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG00268	0.988	0.959	0.0	0.0	0.929	0.891	1	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG00419	0.585	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG00759	0.531	0.515	0.006	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG01051	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG01112	0.353	0.343	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG01500	0.513	0.498	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG01565	0.544	0.528	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG01595	0.348	0.338	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG01879	0.772	0.75	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG02568	1.067	1.036	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG02922	0.945	0.918	0.0	0.004	0.875	0.82	1	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG03006	0.459	0.445	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG03052	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG03642	0.599	0.582	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	HG03742	0.587	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA12878	0.0	0.0	0.024	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA18525	0.698	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA18939	0.0	0.0	0.011	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA19017	0.454	0.441	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA19238	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA19239	0.609	0.591	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA19625	0.0	0.0	0.059	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA19648	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA20502	0.477	0.464	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053240	162053669	DEL	430	NA20845	0.0	0.0	0.007	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG00096	0.394	0.368	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG00268	0.988	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG00419	0.605	0.565	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG00759	0.474	0.443	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG01051	1.079	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG01112	0.353	0.33	0.011	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG01500	0.504	0.471	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG01565	0.544	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG01595	0.29	0.271	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG01879	0.772	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG02568	1.105	1.032	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG02922	0.925	0.864	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG03006	0.476	0.445	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG03052	0.958	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG03642	0.695	0.65	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	HG03742	0.587	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA12878	0.0	0.0	0.018	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA18525	0.741	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA18939	0.0	0.0	0.011	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA19017	0.454	0.424	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA19238	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA19239	0.622	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA19625	0.0	0.0	0.061	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA19648	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA20502	0.455	0.425	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	162053282	162053551	DEL	270	NA20845	0.0	0.0	0.007	0.0	nan	nan	0	0
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG00096	0.537	0.596	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG00268	0.0	0.0	0.005	0.196	nan	nan	0	0
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG00419	0.665	0.739	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG00759	0.683	0.758	0.0	0.004	0.306	0.306	2	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG01051	0.628	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG01112	0.318	0.353	0.0	0.101	0.611	0.611	2	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG01500	0.626	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG01583	0.0	0.0	0.008	0.181	nan	nan	0	0
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG01595	0.503	0.559	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG01879	0.597	0.663	0.0	0.0	0.327	0.327	2	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG02568	0.724	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG02922	0.575	0.639	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG03006	0.0	0.0	0.007	0.188	nan	nan	0	0
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG03052	0.188	0.208	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG03642	0.312	0.346	0.0	0.058	0.833	0.833	5	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	HG03742	0.644	0.716	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA12878	0.506	0.562	0.0	0.0	0.25	0.261	1	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA18525	0.419	0.465	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA18939	0.264	0.293	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA19017	0.763	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA19238	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA19239	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA19625	0.275	0.306	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA19648	0.0	0.0	0.01	0.158	nan	nan	0	0
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA20502	0.455	0.505	0.0	0.088	nan	nan	0	2
chr4	162381498	162381664	DEL	167	NA20845	0.255	0.283	0.0	0.127	0.667	0.644	2	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG00096	0.0	0.0	0.007	0.068	0.688	0.717	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG00419	0.423	0.389	0.007	0.052	0.494	0.494	2	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG01112	0.601	0.551	0.0	0.026	0.7	0.7	1	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.106	0.8	0.8	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG01583	0.334	0.306	0.0	0.036	0.929	0.929	1	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.091	0.714	0.714	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG01879	0.325	0.298	0.0	0.069	0.786	0.786	2	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG02568	0.267	0.245	0.0	0.043	0.9	0.9	1	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG03006	1.27	1.165	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG03052	0.417	0.382	0.0	0.052	0.72	0.72	1	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG03642	0.431	0.396	0.0	0.055	0.63	0.63	2	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.052	0.692	0.692	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.07	0.71	0.71	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.088	0.625	0.625	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.061	0.926	0.968	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.062	0.98	0.989	3	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.082	0.98	0.989	3	0
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA19625	0.275	0.252	0.0	0.047	0.754	0.754	2	1
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA19648	0.594	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA20502	0.364	0.334	0.0	0.04	0.484	0.459	2	2
chr4	162776133	162776210	DEL	78	NA20845	0.999	0.916	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG00096	1.038	1.008	0.0	0.0	0.676	0.706	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG00268	1.022	0.992	0.0	0.0	0.963	0.924	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG00419	0.786	0.764	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG00759	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG01051	1.059	1.028	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG01112	0.972	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG01500	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG01565	0.825	0.801	0.0	0.0	0.811	0.811	2	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG01583	0.882	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG01595	1.045	1.015	0.0	0.0	0.552	0.552	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG01879	0.983	0.954	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG02568	0.305	0.296	0.045	0.064	nan	nan	0	1
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG02922	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG03006	1.076	1.045	0.0	0.0	0.686	0.686	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG03052	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG03642	0.911	0.884	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	HG03742	1.023	0.994	0.0	0.0	0.613	0.613	2	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA12878	0.827	0.803	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA18525	0.802	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA18939	0.915	0.888	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA19017	0.962	0.934	0.0	0.0	0.5	0.523	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA19238	1.068	1.037	0.0	0.0	0.813	0.837	2	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA19239	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA19625	1.15	1.117	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA19648	1.014	0.985	0.0	0.0	0.667	0.708	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA20502	1.0	0.971	0.0	0.0	0.643	0.609	1	2
chr4	165448077	165448693	DEL	617	NA20845	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG00096	0.698	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG00268	0.783	0.944	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG00419	0.807	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG00759	0.815	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG01051	0.51	0.614	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG01112	0.406	0.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG01500	0.521	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG01565	0.644	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG01583	0.763	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG01595	0.561	0.676	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG01879	0.368	0.444	0.0	0.068	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG02568	0.267	0.321	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG02922	0.781	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG03006	0.565	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG03052	0.563	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG03642	0.791	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	HG03742	0.815	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA12878	0.962	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA18525	0.837	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA18939	0.616	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA19017	0.799	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA19238	0.407	0.49	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA19239	0.431	0.52	0.004	0.072	nan	nan	0	1
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA19625	0.4	0.482	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA19648	0.717	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA20502	0.91	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165500502	165500618	DEL	117	NA20845	0.659	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG00096	0.644	0.716	0.0	0.0	0.805	0.84	4	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG00268	0.596	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG00419	0.585	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG00759	0.645	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG01051	0.392	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG01112	0.654	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG01500	0.556	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG01565	0.463	0.515	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG01583	0.501	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG01595	0.407	0.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG01879	0.228	0.253	0.064	0.046	1.0	1.0	2	1
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG02568	0.686	0.762	0.0	0.0	0.667	0.667	4	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG02922	0.617	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG03006	0.547	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG03052	0.438	0.486	0.0	0.0	0.517	0.517	2	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG03642	0.431	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	HG03742	0.625	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA12878	0.776	0.862	0.0	0.0	0.75	0.717	5	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA18525	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA18939	0.475	0.528	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA19017	0.527	0.585	0.0	0.0	0.657	0.629	4	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA19238	0.598	0.664	0.0	0.0	0.684	0.665	3	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA19239	0.558	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA19625	0.65	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA19648	0.495	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA20502	0.523	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	165967103	165967663	DEL	561	NA20845	0.446	0.496	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG00096	1.091	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG00268	1.09	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG00419	1.069	1.038	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG00759	1.043	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG01051	0.883	0.857	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG01112	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG01500	1.008	0.979	0.0	0.0	0.567	0.591	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG01565	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG01583	1.264	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG01595	0.987	0.958	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG01879	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG02568	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG02922	1.377	1.337	0.0	0.002	0.893	0.952	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG03006	0.812	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG03052	0.458	0.445	0.063	0.04	nan	nan	0	1
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG03642	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	HG03742	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA12878	0.894	0.868	0.0	0.0	0.533	0.558	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA18525	1.029	0.999	0.0	0.0	0.842	0.842	2	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA18939	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA19017	1.307	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA19238	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA19239	0.951	0.924	0.0	0.0	0.5	0.486	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA19625	0.925	0.898	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA19648	1.014	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA20502	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	166614649	166615184	DEL	536	NA20845	1.296	1.259	0.0	0.007	0.705	0.759	2	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG00096	0.0	0.0	0.205	0.159	nan	nan	0	0
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG00268	0.46	0.43	0.066	0.076	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG00419	0.544	0.509	0.057	0.046	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG00759	0.0	0.0	0.189	0.194	nan	nan	0	0
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG01051	1.0	0.935	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG01112	0.442	0.413	0.035	0.046	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG01500	1.06	0.991	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG01565	0.523	0.489	0.067	0.045	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG01583	0.549	0.513	0.079	0.053	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG01595	0.542	0.507	0.061	0.048	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG01879	0.807	0.754	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG02568	0.99	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG02922	1.089	1.018	0.0	0.0	0.745	0.746	2	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG03006	0.0	0.0	0.253	0.189	nan	nan	0	0
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG03052	1.021	0.954	0.0	0.0	0.52	0.52	1	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG03642	0.959	0.896	0.0	0.0	0.368	0.368	1	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	HG03742	0.0	0.0	0.224	0.176	nan	nan	0	0
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA12878	0.371	0.347	0.009	0.054	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA18525	0.558	0.522	0.057	0.044	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA18939	0.95	0.888	0.005	0.0	0.844	0.844	1	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA19017	0.817	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA19238	1.03	0.963	0.0	0.0	0.727	0.749	1	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA19239	0.977	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA19625	0.45	0.421	0.039	0.043	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA19648	0.445	0.416	0.091	0.074	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA20502	0.387	0.361	0.068	0.068	nan	nan	0	1
chr4	167004317	167004917	DEL	601	NA20845	0.489	0.457	0.038	0.032	nan	nan	0	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG00096	0.501	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.187	nan	nan	0	0
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG00419	0.302	0.348	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG00759	0.55	0.632	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG01051	0.196	0.225	0.0	0.085	0.895	0.895	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG01112	0.389	0.447	0.0	0.109	0.931	0.931	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG01500	0.721	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG01565	0.383	0.44	0.0	0.079	0.611	0.611	3	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG01583	0.668	0.768	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG01595	0.407	0.467	0.0	0.003	0.6	0.6	1	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG01879	0.193	0.222	0.0	0.142	0.913	0.913	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG02568	0.229	0.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG02922	0.39	0.449	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG03006	0.159	0.183	0.0	0.07	0.727	0.727	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG03052	0.333	0.383	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG03642	0.192	0.22	0.0	0.089	0.909	0.909	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	HG03742	0.284	0.327	0.0	0.108	0.806	0.806	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA12878	0.439	0.504	0.0	0.084	0.444	0.465	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA18525	0.471	0.541	0.0	0.09	0.59	0.59	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA18939	0.193	0.222	0.0	0.09	0.913	0.913	3	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA19017	0.363	0.417	0.0	0.087	0.786	0.821	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA19238	0.382	0.439	0.0	0.076	0.545	0.53	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA19239	0.596	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA19625	0.225	0.259	0.014	0.104	0.75	0.75	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA19648	0.396	0.455	0.0	0.117	nan	nan	0	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA20502	0.068	0.078	0.011	0.116	0.6	0.568	2	1
chr4	167412029	167412139	DEL	111	NA20845	0.478	0.55	0.0	0.202	nan	nan	0	0
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG00096	0.429	0.429	0.012	0.108	nan	nan	0	1
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG00268	0.545	0.545	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG00419	1.069	1.069	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG00759	0.341	0.341	0.0	0.076	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG01051	0.412	0.412	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG01112	0.459	0.459	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG01500	0.991	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG01565	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG01583	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG01595	0.387	0.387	0.0	0.081	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG01879	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG02568	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG02922	1.212	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG03006	1.182	1.182	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG03052	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG03642	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	HG03742	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA12878	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA18525	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA18939	0.44	0.44	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA19017	1.126	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA19238	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA19239	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA19625	0.575	0.575	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA19648	0.717	0.717	0.0	0.1	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA20502	0.591	0.591	0.0	0.076	nan	nan	0	2
chr4	168806478	168806590	DEL	113	NA20845	0.914	0.914	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG00096	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG00268	0.988	0.923	0.0	0.0	0.87	0.835	1	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG00419	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG00759	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG01051	0.961	0.898	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG01112	1.184	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG01500	1.06	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG01565	1.389	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG01583	0.859	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG01595	1.103	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG01879	0.614	0.574	0.007	0.051	0.415	0.415	1	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG02568	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG02922	0.966	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG03006	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG03052	0.792	0.74	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG03642	0.791	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	HG03742	0.957	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA12878	1.046	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA18525	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA18939	0.941	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA19017	0.79	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA19238	0.356	0.333	0.0	0.065	0.703	0.723	1	1
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA19239	1.065	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA19625	1.4	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA19648	1.286	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA20502	0.819	0.765	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	168831941	168832038	DEL	98	NA20845	0.85	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG00096	0.984	1.093	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG00268	0.511	0.568	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG00419	0.958	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG00759	0.853	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG01051	0.667	0.741	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG01112	0.645	0.716	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG01500	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG01565	0.765	0.85	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG01583	0.525	0.583	0.0	0.023	nan	nan	0	1
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG01595	0.678	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG01879	0.895	0.994	0.0	0.0	0.343	0.343	4	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG02568	0.914	1.016	0.0	0.009	0.538	0.538	1	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG02922	0.514	0.571	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG03006	0.882	0.98	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG03052	0.292	0.324	0.009	0.033	nan	nan	0	1
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG03642	0.36	0.399	0.0	0.07	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	HG03742	0.891	0.99	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA12878	0.523	0.581	0.0	0.046	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA18525	1.291	1.434	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA18939	1.02	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA19017	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA19238	0.509	0.565	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA19239	1.129	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA19625	0.775	0.861	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA19648	0.569	0.632	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA20502	0.875	0.973	0.0	0.0	0.941	0.993	1	2
chr4	170151075	170151210	DEL	136	NA20845	0.786	0.874	0.0	0.0	0.571	0.615	1	2
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG00096	0.483	0.483	0.022	0.085	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG00268	0.579	0.579	0.04	0.12	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG00419	0.0	0.0	0.086	0.292	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG00759	0.0	0.0	0.072	0.294	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG01051	0.0	0.0	0.057	0.238	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG01112	0.0	0.0	0.07	0.292	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG01500	0.0	0.0	0.076	0.241	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG01565	0.503	0.503	0.027	0.08	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG01583	0.0	0.0	0.069	0.249	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG01595	0.484	0.484	0.021	0.093	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG01879	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG02568	0.838	0.838	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG02922	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG03006	1.112	1.112	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG03052	0.479	0.479	0.027	0.115	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG03642	0.36	0.36	0.024	0.094	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	HG03742	0.0	0.0	0.053	0.243	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA12878	0.456	0.456	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA18525	0.506	0.506	0.02	0.117	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA18939	0.0	0.0	0.018	0.335	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA19017	0.617	0.617	0.023	0.131	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA19238	1.132	1.132	0.0	0.0	0.88	0.855	1	2
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA19239	0.431	0.431	0.011	0.138	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA19625	0.625	0.625	0.04	0.098	nan	nan	0	1
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA19648	0.0	0.0	0.047	0.141	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA20502	0.0	0.0	0.029	0.24	nan	nan	0	0
chr4	170278462	170278879	DEL	418	NA20845	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG00096	0.626	0.575	0.0	0.01	0.385	0.401	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG00268	1.124	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG00419	0.524	0.481	0.0	0.027	0.727	0.727	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG00759	1.214	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG01051	0.549	0.504	0.0	0.026	0.667	0.667	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG01112	0.601	0.551	0.0	0.031	1.0	1.0	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG01500	1.286	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG01583	1.288	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG01595	1.413	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG01879	1.0	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG02568	0.457	0.419	0.0	0.053	0.538	0.538	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG03006	0.67	0.615	0.0	0.019	0.478	0.478	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG03052	0.479	0.44	0.0	0.03	0.885	0.885	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG03642	1.031	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	HG03742	0.796	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	0
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA18525	1.081	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA18939	0.967	0.887	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA19017	0.472	0.433	0.0	0.019	0.788	0.785	2	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA19239	1.142	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA19625	0.575	0.528	0.0	0.024	0.75	0.75	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA20502	0.523	0.48	0.0	0.028	0.897	0.849	1	1
chr4	173176433	173176487	DEL	55	NA20845	0.935	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG00096	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG00268	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG00419	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG00759	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG01051	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG01112	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG01500	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG01565	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG01583	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG01595	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG01879	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG02568	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG02922	0.843	0.843	0.0	0.0	0.867	0.812	1	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG03006	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG03052	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG03642	0.24	0.24	0.091	0.08	nan	nan	0	1
chr4	173773234	173773838	DEL	605	HG03742	0.493	0.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA12878	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA18525	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA18939	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA19017	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA19238	0.7	0.7	0.0	0.0	0.692	0.673	1	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA19239	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA19625	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA19648	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA20502	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	173773234	173773838	DEL	605	NA20845	0.659	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG00096	1.109	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG00268	0.903	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG00419	0.887	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG00759	1.043	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG01051	1.098	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG01112	0.972	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG01500	0.956	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG01565	1.107	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG01583	1.264	1.16	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG01595	1.336	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG01879	1.369	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG02568	0.876	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG02922	1.233	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG03006	0.97	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG03052	0.521	0.478	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG03642	0.875	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	HG03742	0.872	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA12878	0.962	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA18525	1.256	1.152	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA18939	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA19017	0.599	0.55	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA19238	0.979	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA19239	0.989	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA19625	1.15	1.055	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA19648	1.113	1.021	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA20502	0.796	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	175092968	175093095	DEL	128	NA20845	1.084	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG00096	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG00268	1.209	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG00419	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG00759	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG01051	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG01112	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG01500	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG01565	1.248	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG01583	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG01595	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG01879	0.86	0.86	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG02568	1.181	1.181	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG02922	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG03006	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG03052	1.292	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG03642	0.719	0.719	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr4	176917028	176917146	DEL	119	HG03742	1.118	1.118	0.0	0.004	0.727	0.727	1	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA12878	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA18525	1.256	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA18939	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA19017	1.053	1.053	0.006	0.008	0.963	0.921	2	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA19238	1.145	1.145	0.0	0.0	0.743	0.722	2	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA19239	1.23	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA19625	1.225	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA19648	1.088	1.088	0.0	0.0	0.762	0.717	1	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA20502	1.137	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	176917028	176917146	DEL	119	NA20845	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG00096	1.074	0.985	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG00268	0.63	0.578	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG00419	0.242	0.222	0.013	0.138	nan	nan	0	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG00759	0.796	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG01051	0.412	0.378	0.0	0.142	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG01112	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG01500	0.4	0.367	0.0	0.114	0.208	0.217	3	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG01565	1.047	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG01583	1.121	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG01595	0.697	0.639	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG01879	1.281	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG02568	1.067	0.979	0.0	0.0	0.529	0.529	1	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG02922	0.473	0.434	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG03006	1.094	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG03052	0.583	0.535	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG03642	1.079	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	HG03742	1.194	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA12878	0.877	0.805	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA18525	0.89	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA18939	0.369	0.339	0.004	0.138	0.393	0.393	1	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA19017	0.508	0.466	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA19238	1.043	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA19239	0.66	0.605	0.0	0.084	0.186	0.192	3	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA19625	0.35	0.321	0.0	0.132	0.714	0.714	1	1
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA19648	0.977	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA20502	0.705	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	178903649	178903876	DEL	228	NA20845	0.553	0.507	0.004	0.107	0.167	0.179	3	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG00096	0.376	0.396	0.02	0.086	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG00268	0.562	0.592	0.006	0.076	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG00419	0.746	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG00759	0.436	0.459	0.009	0.061	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG01051	0.745	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG01112	0.795	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG01500	0.452	0.476	0.014	0.075	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG01565	0.0	0.0	0.011	0.14	nan	nan	0	0
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG01583	0.334	0.351	0.006	0.042	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG01595	0.29	0.306	0.005	0.036	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG01879	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG02568	0.19	0.201	0.016	0.042	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	0
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG03006	0.0	0.0	0.021	0.17	nan	nan	0	0
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG03052	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG03642	0.863	0.908	0.0	0.029	nan	nan	0	2
chr4	180063822	180064151	DEL	330	HG03742	0.625	0.658	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA12878	0.388	0.408	0.012	0.062	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA18525	0.0	0.0	0.014	0.164	nan	nan	0	0
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA18939	0.387	0.407	0.009	0.056	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA19017	0.0	0.0	0.01	0.211	nan	nan	0	0
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA19238	0.35	0.368	0.008	0.058	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA19239	0.317	0.334	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA19648	0.532	0.56	0.016	0.053	nan	nan	0	1
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA20502	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180063822	180064151	DEL	330	NA20845	0.0	0.0	0.031	0.1	nan	nan	0	0
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG00096	0.501	0.468	0.069	0.055	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG00268	0.494	0.462	0.109	0.068	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG00419	0.464	0.433	0.093	0.074	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG00759	0.569	0.532	0.053	0.051	0.534	0.534	2	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG01051	0.961	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG01112	1.307	1.222	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG01500	0.626	0.585	0.084	0.06	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG01565	1.047	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG01583	1.371	1.282	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG01595	1.394	1.303	0.0	0.0	0.728	0.728	2	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG01879	1.316	1.23	0.004	0.0	0.816	0.816	1	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG02568	0.724	0.676	0.052	0.048	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG02922	0.658	0.615	0.1	0.054	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG03006	0.565	0.528	0.107	0.07	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG03052	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG03642	1.222	1.142	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	HG03742	1.09	1.018	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA12878	0.0	0.0	0.172	0.201	nan	nan	0	0
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA18525	1.081	1.011	0.0	0.0	0.607	0.607	3	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA18939	0.668	0.625	0.092	0.06	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA19017	1.198	1.12	0.0	0.0	0.879	0.878	2	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA19238	1.005	0.939	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA19239	0.507	0.474	0.055	0.045	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA19625	1.0	0.935	0.0	0.0	0.768	0.768	4	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA19648	0.866	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA20502	0.455	0.425	0.098	0.058	nan	nan	0	1
chr4	180097876	180098507	DEL	632	NA20845	0.531	0.497	0.081	0.029	nan	nan	0	1
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG00096	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG00268	1.022	0.992	0.0	0.003	0.808	0.775	1	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG00419	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG00759	1.195	1.16	0.003	0.0	0.828	0.828	1	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG01051	1.275	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG01112	1.272	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG01500	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG01565	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG01583	1.145	1.111	0.0	0.0	0.861	0.861	2	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG01595	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG01879	1.228	1.193	0.005	0.0	0.634	0.634	1	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG02568	1.029	0.999	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG02922	0.966	0.938	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG03006	0.547	0.531	0.081	0.056	nan	nan	0	1
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG03052	1.083	1.052	0.0	0.0	0.84	0.84	2	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG03642	1.031	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	HG03742	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA12878	0.877	0.852	0.0	0.0	0.79	0.788	2	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA18525	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA18939	1.038	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA19017	1.162	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA19238	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA19239	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA19625	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA19648	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA20502	1.16	1.126	0.0	0.0	0.877	0.868	2	2
chr4	180972431	180973157	DEL	727	NA20845	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG00096	1.056	0.987	0.0	0.0	0.889	0.928	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG00268	0.937	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG00419	0.706	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG00759	1.299	1.214	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG01051	0.706	0.66	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG01112	0.972	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG01500	0.504	0.471	0.0	0.03	0.781	0.815	1	1
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG01565	0.987	0.922	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG01583	1.073	1.003	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG01595	1.074	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG01879	1.105	1.033	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG02568	0.99	0.926	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG02922	1.151	1.076	0.0	0.0	0.607	0.648	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG03006	0.935	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG03052	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG03642	1.222	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	HG03742	0.834	0.779	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA12878	1.012	0.946	0.0	0.0	0.688	0.658	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA18525	0.855	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA18939	0.967	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA19017	1.198	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA19238	1.005	0.939	0.0	0.0	0.857	0.833	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA19239	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA19625	0.825	0.771	0.0	0.028	0.571	0.571	1	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA19648	1.261	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA20502	1.035	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	181243923	181243976	DEL	54	NA20845	1.148	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG00096	0.358	0.358	0.061	0.053	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG00268	0.0	0.0	0.156	0.189	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG00419	0.0	0.0	0.175	0.145	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG00759	0.0	0.0	0.259	0.223	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG01051	0.549	0.549	0.065	0.044	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG01112	0.0	0.0	0.245	0.212	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG01500	0.295	0.295	0.043	0.055	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG01565	0.0	0.0	0.317	0.256	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG01583	0.0	0.0	0.216	0.135	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG01595	0.0	0.0	0.214	0.136	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG01879	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG02568	0.61	0.61	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG02922	0.843	0.843	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG03006	0.547	0.547	0.067	0.077	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG03052	0.396	0.396	0.106	0.121	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG03642	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	HG03742	0.341	0.341	0.092	0.048	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA12878	0.0	0.0	0.117	0.205	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA18525	0.0	0.0	0.115	0.168	nan	nan	0	0
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA18939	0.492	0.492	0.077	0.066	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA19017	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA19238	0.388	0.388	0.041	0.061	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA19239	0.393	0.393	0.047	0.056	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA19625	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA19648	0.396	0.396	0.098	0.068	nan	nan	0	1
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA20502	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182056564	182057129	DEL	566	NA20845	0.638	0.638	0.0	0.0	0.909	0.979	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG00096	0.895	0.895	0.0	0.0	0.893	0.856	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG00268	0.647	0.647	0.0	0.0	0.792	0.76	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG00419	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG00759	0.853	0.853	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG01051	0.51	0.51	0.008	0.005	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG01112	0.83	0.83	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG01500	0.747	0.747	0.0	0.0	0.9	0.939	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG01565	0.544	0.544	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG01583	0.668	0.668	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG01595	0.794	0.794	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG01879	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG02568	0.571	0.571	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG02922	0.822	0.822	0.0	0.005	0.929	0.99	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG03006	1.076	1.076	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG03052	0.833	0.833	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG03642	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	HG03742	0.815	0.815	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA12878	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA18525	0.68	0.68	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA18939	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA19017	0.817	0.817	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA19238	0.343	0.343	0.0	0.111	0.491	0.505	12	1
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA19239	0.875	0.875	0.0	0.0	0.943	0.971	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA19625	0.95	0.95	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA19648	0.89	0.89	0.0	0.0	0.733	0.779	3	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA20502	1.296	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182250847	182251158	DEL	312	NA20845	0.659	0.659	0.0	0.0	0.583	0.542	1	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG00096	0.751	0.73	0.01	0.005	0.7	0.73	1	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG00268	0.834	0.81	0.0	0.002	0.696	0.725	1	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG00419	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG00759	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG01051	0.765	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG01112	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG01500	1.095	1.063	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG01565	0.946	0.919	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG01583	0.787	0.764	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG01595	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG01879	0.737	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG02568	1.295	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG02922	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG03006	0.67	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG03052	0.792	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG03642	1.222	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	HG03742	1.042	1.012	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA12878	0.591	0.573	0.0	0.005	0.875	0.915	1	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA18525	0.698	0.677	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA18939	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA19017	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA19238	0.432	0.42	0.0	0.078	0.575	0.592	1	1
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA19239	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA19625	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA19648	0.915	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA20502	0.75	0.728	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	182921898	182921992	DEL	95	NA20845	1.041	1.011	0.0	0.004	0.812	0.875	1	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG00096	0.358	0.398	0.0	0.0	0.5	0.479	4	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG00268	0.502	0.558	0.0	0.0	0.8	0.785	5	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG00419	0.484	0.538	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG00759	0.0	0.0	0.155	0.03	nan	nan	0	0
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG01051	0.157	0.174	0.044	0.007	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG01112	0.177	0.196	0.055	0.0	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG01500	0.156	0.174	0.06	0.025	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG01565	0.221	0.246	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG01583	0.31	0.344	0.091	0.012	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG01595	0.194	0.215	0.035	0.004	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG01879	0.175	0.195	0.05	0.018	0.155	0.155	2	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG02568	0.552	0.614	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG02922	0.329	0.365	0.0	0.0	0.833	0.791	4	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG03006	0.3	0.333	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG03052	0.0	0.0	0.181	0.012	nan	nan	0	0
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG03642	0.288	0.32	0.058	0.007	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	HG03742	0.474	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA12878	0.304	0.337	0.078	0.006	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA18525	0.349	0.388	0.0	0.0	0.385	0.385	7	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA18939	0.387	0.43	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA19017	0.0	0.0	0.385	0.038	nan	nan	0	0
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA19238	0.0	0.0	0.294	0.048	nan	nan	0	0
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA19239	0.266	0.296	0.088	0.019	nan	nan	0	1
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA19625	0.375	0.417	0.0	0.0	0.5	0.5	5	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA19648	0.495	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA20502	0.546	0.606	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187213956	187214734	DEL	779	NA20845	0.17	0.189	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG00096	0.68	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG00268	0.341	0.41	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG00419	0.645	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG00759	0.322	0.388	0.008	0.073	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG01051	0.373	0.449	0.028	0.114	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG01112	0.636	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG01500	0.73	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG01565	0.644	0.776	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG01583	0.62	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG01595	0.29	0.35	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG01879	0.807	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG02568	0.952	1.147	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG02922	0.617	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG03006	0.371	0.446	0.017	0.075	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG03052	0.688	0.828	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG03642	0.719	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	HG03742	0.246	0.297	0.009	0.112	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA12878	0.827	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA18525	0.715	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA18939	0.721	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA19017	0.327	0.394	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA19238	0.293	0.352	0.006	0.102	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA19239	0.0	0.0	0.006	0.227	nan	nan	0	0
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA19625	0.4	0.482	0.02	0.108	nan	nan	0	1
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA19648	0.693	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA20502	0.91	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	187614499	187614855	DEL	357	NA20845	0.298	0.359	0.016	0.137	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG00096	0.304	0.284	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.123	nan	nan	0	0
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG00419	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG00759	0.569	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG01051	0.432	0.403	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG01112	0.442	0.413	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG01500	0.0	0.0	0.013	0.085	nan	nan	0	0
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG01565	0.362	0.339	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG01583	0.238	0.223	0.0	0.032	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG01595	0.949	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG01879	0.755	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG02568	1.067	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG02922	0.493	0.461	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG03006	0.459	0.429	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG03052	0.729	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG03642	0.599	0.56	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	HG03742	0.417	0.39	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA18525	0.89	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA18939	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA19017	0.581	0.543	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA19238	0.394	0.369	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA19239	0.431	0.403	0.0	0.048	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA19625	0.7	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	1
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr4	188959366	188959488	DEL	123	NA20845	0.765	0.715	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG00096	0.823	0.866	0.0	0.0	0.95	0.91	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG00268	0.783	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG00419	0.887	0.934	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG00759	0.664	0.699	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG01051	0.53	0.557	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG01112	0.548	0.576	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG01500	0.747	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG01565	0.725	0.763	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG01583	0.787	0.828	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG01595	0.6	0.632	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG01879	0.79	0.831	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG02568	0.0	0.0	0.159	0.0	nan	nan	0	0
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG02922	0.575	0.606	0.0	0.0	0.9	0.96	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG03006	0.512	0.539	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG03052	0.708	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG03642	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	HG03742	0.531	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA12878	0.793	0.835	0.0	0.0	0.643	0.615	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA18525	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA19017	0.508	0.535	0.0	0.0	0.667	0.697	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA19238	0.687	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA19239	0.786	0.828	0.0	0.002	1.0	0.971	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA19625	0.575	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA19648	0.915	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA20502	0.841	0.886	0.019	0.0	0.688	0.651	1	2
chr4	189155582	189156166	DEL	585	NA20845	0.531	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG00096	0.447	0.514	0.01	0.256	nan	nan	0	0
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG00268	0.553	0.636	0.052	0.203	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG00419	0.504	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG00759	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG01051	0.471	0.541	0.005	0.23	nan	nan	0	0
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG01112	0.353	0.406	0.007	0.089	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG01500	0.382	0.439	0.016	0.109	0.0	0.0	1	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG01565	0.483	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG01583	0.358	0.411	0.045	0.205	nan	nan	0	0
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG01595	0.232	0.267	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG01879	0.228	0.262	0.012	0.137	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG02568	0.343	0.394	0.045	0.072	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG02922	0.164	0.189	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG03006	0.229	0.264	0.006	0.129	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG03052	0.208	0.239	0.007	0.085	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG03642	0.264	0.303	0.019	0.141	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	HG03742	0.303	0.349	0.008	0.061	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA12878	0.692	0.795	0.0	0.209	nan	nan	0	0
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA18525	0.297	0.341	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA18939	0.457	0.526	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA19017	0.236	0.271	0.008	0.084	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA19238	0.445	0.512	0.005	0.218	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA19239	0.672	0.773	0.0	0.0	0.889	0.915	7	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA19625	0.475	0.546	0.0	0.0	0.833	0.833	4	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA19648	0.606	0.697	0.0	0.0	0.571	0.588	3	2
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA20502	0.546	0.627	0.027	0.244	nan	nan	0	1
chr4	189793239	189793558	DEL	320	NA20845	0.213	0.244	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG00759	0.0	0.0	0.012	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG01565	0.443	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG01879	0.0	0.0	0.013	0.003	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG02568	0.457	0.427	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG02922	0.483	0.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG03006	0.0	0.0	0.014	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG03052	0.188	0.175	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	HG03742	0.303	0.283	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.009	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA19017	0.708	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA19239	0.52	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	190302417	190302714	DEL	298	NA20845	0.0	0.0	0.011	0.0	nan	nan	0	0
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG00096	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG00419	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG00759	0.55	0.534	0.024	0.064	nan	nan	0	1
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG01051	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG01112	0.671	0.652	0.026	0.079	nan	nan	0	1
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG01500	1.13	1.097	0.0	0.0	0.738	0.732	2	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG01565	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG01583	1.145	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG01595	0.0	0.0	0.185	0.211	nan	nan	0	0
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG01879	1.0	0.971	0.0	0.0	0.767	0.767	1	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG02568	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG02922	1.11	1.077	0.0	0.0	0.833	0.781	1	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG03006	0.829	0.805	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG03052	1.042	1.011	0.0	0.0	0.774	0.774	1	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG03642	1.055	1.024	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	HG03742	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA12878	0.911	0.885	0.0	0.0	0.764	0.731	2	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA18525	1.064	1.033	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA18939	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA19017	0.617	0.599	0.054	0.078	nan	nan	0	1
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA19238	0.649	0.63	0.006	0.041	nan	nan	0	1
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA19239	1.091	1.059	0.003	0.0	0.857	0.882	1	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA19625	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA19648	0.0	0.0	0.101	0.215	nan	nan	0	0
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA20502	0.364	0.353	0.032	0.04	nan	nan	0	1
chr4	19057466	19057962	DEL	497	NA20845	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG00096	1.002	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG00268	0.903	0.844	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG00419	1.089	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG00759	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG01051	1.177	1.1	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG01112	0.813	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG01500	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG01565	0.966	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG01583	1.121	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG01595	1.297	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG01879	1.035	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG02568	1.448	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG02922	1.11	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG03006	0.688	0.643	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG03052	0.958	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG03642	1.174	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	HG03742	1.27	1.187	0.0	0.0	0.558	0.558	1	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA12878	0.894	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA18525	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA18939	0.897	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA19017	1.38	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA19238	1.183	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA19239	1.015	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA19625	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA19648	0.767	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA20502	1.137	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	19376078	19376206	DEL	129	NA20845	0.999	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG00096	1.091	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG00268	1.107	1.035	0.0	0.0	0.791	0.792	2	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG00419	1.008	0.942	0.0	0.0	0.849	0.849	2	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG00759	0.569	0.532	0.105	0.069	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG01051	1.098	1.027	0.0	0.0	0.738	0.738	2	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG01112	0.548	0.512	0.063	0.044	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG01500	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG01565	0.644	0.602	0.09	0.068	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG01583	0.644	0.602	0.081	0.04	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG01595	0.542	0.507	0.098	0.064	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG01879	1.176	1.099	0.0	0.0	0.736	0.736	2	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG02568	0.952	0.89	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG02922	1.151	1.076	0.0	0.0	0.704	0.695	2	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG03006	0.618	0.577	0.095	0.069	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG03052	0.958	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG03642	0.527	0.493	0.096	0.071	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	HG03742	0.985	0.921	0.007	0.0	0.926	0.926	1	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA12878	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA18525	0.593	0.554	0.076	0.054	nan	nan	0	1
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA18939	0.0	0.0	0.303	0.24	nan	nan	0	0
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA19017	1.053	0.984	0.0	0.0	0.815	0.779	1	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA19238	1.17	1.094	0.004	0.0	0.717	0.697	2	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA19239	1.104	1.031	0.0	0.0	0.702	0.682	1	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA19625	1.1	1.028	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA19648	0.0	0.0	0.261	0.136	nan	nan	0	0
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA20502	1.023	0.956	0.0	0.0	0.96	0.909	1	2
chr4	20407542	20408530	DEL	989	NA20845	0.574	0.536	0.061	0.053	nan	nan	0	1
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG00096	1.396	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG00268	1.09	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG00419	1.17	1.093	0.005	0.002	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG00759	1.195	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG01051	1.648	1.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG01112	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG01500	1.399	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG01565	1.49	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG01583	1.002	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG01595	1.355	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG01879	1.491	1.394	0.0	0.0	0.814	0.814	1	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG02568	0.99	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG02922	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG03006	1.306	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG03052	1.271	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG03642	0.575	0.538	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr4	20474752	20474871	DEL	120	HG03742	1.08	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA12878	0.725	0.678	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA18525	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA18939	1.284	1.2	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA19017	0.635	0.594	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA19238	1.412	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA19239	1.167	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA19625	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA19648	1.138	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA20502	1.205	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	20474752	20474871	DEL	120	NA20845	0.0	0.0	0.007	0.192	nan	nan	0	1
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG00096	0.859	0.834	0.0	0.0	0.848	0.812	2	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG00268	0.937	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG00419	0.625	0.607	0.066	0.049	nan	nan	0	1
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG00759	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG01051	0.942	0.914	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG01112	0.989	0.96	0.0	0.0	0.338	0.338	2	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG01500	0.834	0.81	0.0	0.0	0.963	0.923	1	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG01565	0.966	0.938	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG01583	1.026	0.996	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG01595	1.045	1.015	0.0	0.0	0.773	0.773	2	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG01879	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG02568	0.914	0.888	0.0	0.0	0.615	0.615	2	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG02922	1.048	1.018	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG03006	1.094	1.062	0.005	0.0	0.811	0.811	1	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG03052	0.938	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG03642	1.103	1.07	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	HG03742	0.948	0.92	0.0	0.0	0.773	0.773	3	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA12878	0.725	0.704	0.0	0.0	0.634	0.636	2	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA18525	0.454	0.44	0.071	0.052	nan	nan	0	1
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA18939	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA19017	1.144	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA19238	0.0	0.0	0.431	0.233	nan	nan	0	0
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA19239	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA19625	0.95	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA19648	0.866	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA20502	1.114	1.082	0.0	0.0	0.801	0.846	2	2
chr4	21457451	21458399	DEL	949	NA20845	0.914	0.887	0.0	0.0	0.756	0.702	2	2
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG00096	0.304	0.277	0.0	0.008	1.0	0.958	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG00268	0.545	0.495	0.0	0.028	0.762	0.759	2	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG00419	0.403	0.367	0.0	0.017	0.75	0.75	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG00759	0.417	0.379	0.0	0.024	0.727	0.727	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG01051	0.843	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG01500	0.0	0.0	0.008	0.023	nan	nan	0	0
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG01565	0.403	0.366	0.0	0.02	0.5	0.5	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG01595	0.59	0.537	0.0	0.038	0.679	0.679	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG01879	0.281	0.255	0.0	0.004	0.833	0.833	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG02568	0.305	0.277	0.0	0.014	0.714	0.714	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG02922	0.308	0.28	0.0	0.0	1.0	0.938	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG03006	0.494	0.449	0.0	0.035	0.613	0.613	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr4	22432891	22432952	DEL	62	HG03742	0.322	0.293	0.0	0.017	0.729	0.729	2	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	0
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA18525	0.427	0.389	0.0	0.019	0.633	0.633	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA19238	0.458	0.416	0.0	0.006	0.378	0.389	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA19625	0.525	0.477	0.0	0.011	0.4	0.4	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA19648	0.396	0.36	0.0	0.029	0.941	1.0	1	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr4	22432891	22432952	DEL	62	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.058	nan	nan	0	0
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG00096	0.948	0.948	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG00268	0.545	0.545	0.0	0.057	0.512	0.534	1	1
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG00419	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG00759	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG01051	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG01112	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG01500	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG01565	0.362	0.362	0.0	0.078	0.667	0.667	1	1
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG01583	0.62	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG01595	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG01879	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG02568	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG02922	0.411	0.411	0.0	0.074	0.684	0.73	1	1
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG03006	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG03052	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG03642	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	HG03742	0.587	0.587	0.0	0.091	0.474	0.474	1	1
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA12878	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA18525	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA18939	0.51	0.51	0.0	0.042	0.436	0.436	1	1
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA19017	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA19238	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA19239	0.495	0.495	0.0	0.054	0.473	0.487	1	1
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA19625	1.225	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA19648	0.693	0.693	0.0	0.032	0.515	0.547	1	1
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA20502	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	22502064	22502162	DEL	99	NA20845	0.68	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG00096	0.913	0.913	0.0	0.0	0.562	0.539	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG00268	0.834	0.834	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG00419	0.665	0.665	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG00759	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG01051	0.942	0.942	0.0	0.005	0.478	0.478	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG01112	0.795	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG01500	0.886	0.886	0.0	0.0	0.897	0.859	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG01565	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG01583	0.811	0.811	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG01595	0.949	0.949	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG01879	0.719	0.719	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG02568	0.952	0.952	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG02922	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG03006	0.9	0.9	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG03052	0.646	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG03642	0.647	0.647	0.0	0.042	0.931	0.931	2	1
chr4	24027281	24027345	DEL	65	HG03742	0.966	0.966	0.0	0.008	0.731	0.731	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA12878	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA18525	0.82	0.82	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA18939	0.844	0.844	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA19017	1.162	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA19238	1.03	1.03	0.0	0.0	0.953	0.982	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA19239	1.205	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA19625	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA19648	0.94	0.94	0.0	0.0	0.269	0.253	1	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA20502	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24027281	24027345	DEL	65	NA20845	0.298	0.298	0.0	0.04	0.867	0.933	2	1
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG00096	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG00268	1.396	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG00419	1.21	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG00759	0.645	0.602	0.079	0.065	0.241	0.241	12	1
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG01051	1.53	1.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG01112	1.36	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG01500	1.182	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG01565	1.268	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG01583	1.359	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG01595	1.374	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG01879	1.509	1.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG02568	1.257	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG02922	0.0	0.0	0.303	0.212	nan	nan	0	0
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG03006	1.341	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG03052	1.229	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG03642	0.983	0.918	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	HG03742	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA12878	1.012	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA18525	1.343	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA18939	1.389	1.298	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA19017	1.253	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA19238	1.323	1.236	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA19239	0.634	0.593	0.117	0.076	0.167	0.172	13	1
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA19625	0.75	0.701	0.094	0.065	0.333	0.333	13	1
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA19648	1.385	1.294	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA20502	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	24966460	24967138	DEL	679	NA20845	1.233	1.152	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG00096	0.913	0.913	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG00268	0.971	0.971	0.006	0.002	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG00419	0.544	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG00759	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG01051	0.765	0.765	0.0	0.003	0.933	0.933	1	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG01112	1.325	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG01500	0.904	0.904	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG01565	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG01583	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG01595	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG01879	0.842	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG02568	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG02922	0.781	0.781	0.0	0.003	0.6	0.562	1	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG03006	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG03052	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG03642	0.791	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	HG03742	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA12878	0.675	0.675	0.07	0.002	nan	nan	0	1
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA18525	1.029	1.029	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA18939	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA19017	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA19238	0.776	0.776	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA19239	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA19625	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA19648	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA20502	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	2550339	2551281	DEL	943	NA20845	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG00096	0.93	0.854	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG00268	0.596	0.547	0.0	0.028	0.4	0.417	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG00419	0.605	0.555	0.0	0.011	0.552	0.552	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.088	nan	nan	0	0
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG01051	0.726	0.666	0.0	0.043	0.611	0.611	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG01112	0.724	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG01500	1.078	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG01565	0.523	0.48	0.0	0.059	0.793	0.793	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG01583	1.097	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG01595	0.503	0.462	0.0	0.028	0.8	0.8	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG02568	0.99	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG02922	0.596	0.547	0.0	0.066	0.5	0.533	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG03006	1.235	1.133	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG03052	1.0	0.917	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG03642	1.031	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	HG03742	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA12878	0.405	0.371	0.0	0.036	0.929	0.971	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA18939	0.475	0.436	0.0	0.051	0.821	0.821	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA19238	0.954	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA19239	1.027	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA19625	0.525	0.482	0.0	0.011	0.292	0.292	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA19648	0.445	0.408	0.0	0.033	0.917	0.974	1	2
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA20502	0.659	0.605	0.0	0.03	0.786	0.829	1	1
chr4	27543891	27543955	DEL	65	NA20845	0.914	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG00096	0.394	0.382	0.029	0.084	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG00268	0.477	0.463	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG00419	0.0	0.0	0.047	0.178	nan	nan	0	0
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG00759	0.569	0.552	0.026	0.076	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG01051	0.0	0.0	0.008	0.158	nan	nan	0	0
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG01112	0.0	0.0	0.019	0.167	nan	nan	0	0
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG01500	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG01565	0.0	0.0	0.046	0.175	nan	nan	0	0
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG01583	0.62	0.602	0.007	0.051	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG01595	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG01879	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG02568	1.562	1.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG02922	0.658	0.638	0.014	0.069	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG03006	0.653	0.634	0.017	0.083	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG03052	0.729	0.708	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG03642	0.0	0.0	0.027	0.116	nan	nan	0	0
chr4	28421593	28421942	DEL	350	HG03742	0.531	0.515	0.006	0.069	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA12878	0.456	0.442	0.006	0.08	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA18525	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA18939	1.231	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA19017	0.563	0.546	0.006	0.098	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA19238	0.674	0.654	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA19239	0.52	0.505	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA19625	0.6	0.583	0.01	0.084	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA19648	0.0	0.0	0.055	0.233	nan	nan	0	0
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA20502	0.591	0.574	0.026	0.088	nan	nan	0	1
chr4	28421593	28421942	DEL	350	NA20845	0.871	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG00096	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG00268	0.8	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG00419	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG00759	0.967	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG01051	0.961	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG01112	0.883	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG01500	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG01565	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG01583	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG01595	0.968	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG01879	0.93	0.979	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG02568	0.838	0.882	0.0	0.046	0.231	0.231	1	1
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG02922	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG03006	1.041	1.096	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG03052	0.792	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG03642	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	HG03742	1.08	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA12878	0.903	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA18525	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA18939	1.038	1.092	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA19017	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA19238	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA19239	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA19625	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA19648	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA20502	0.682	0.718	0.0	0.0	0.8	0.758	1	2
chr4	29779987	29780086	DEL	100	NA20845	0.999	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG00096	0.573	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG00268	0.715	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG00419	0.605	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG00759	0.607	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG01051	0.628	0.697	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG01112	0.583	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG01500	0.643	0.714	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG01565	0.705	0.783	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG01583	0.429	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG01595	0.581	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG01879	0.649	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG02568	0.571	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG02922	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG03006	0.459	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG03052	0.479	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG03642	0.384	0.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	HG03742	0.587	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA12878	0.759	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA18525	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA18939	0.563	0.625	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA19017	0.182	0.202	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA19238	0.267	0.297	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA19239	0.381	0.423	0.0	0.076	0.231	0.238	1	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA19625	0.5	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA19648	0.569	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA20502	0.705	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	3018209	3018391	DEL	183	NA20845	0.553	0.614	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG00096	0.734	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG00268	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG00419	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG00759	1.119	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG01051	1.04	1.04	0.0	0.0	0.845	0.845	2	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG01112	1.166	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG01500	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG01565	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG01583	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG01595	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG01879	0.895	0.895	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG02568	0.724	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG02922	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG03006	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG03052	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG03642	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	HG03742	0.417	0.417	0.0	0.087	0.5	0.5	1	1
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA12878	0.911	0.911	0.0	0.0	0.457	0.478	2	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA18525	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA18939	0.95	0.95	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA19017	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA19238	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA19239	0.913	0.913	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA19625	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA19648	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA20502	0.728	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	30683246	30683435	DEL	190	NA20845	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG00096	0.429	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG00268	0.451	0.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG00419	0.423	0.471	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG00759	0.512	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG01051	0.314	0.349	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG01112	0.742	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG01500	0.591	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG01565	0.443	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG01583	0.453	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG01595	0.271	0.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG01879	0.386	0.429	0.008	0.13	nan	nan	0	1
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG02568	0.457	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG02922	0.442	0.491	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG03006	0.494	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG03052	0.458	0.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG03642	0.479	0.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	HG03742	0.398	0.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA12878	0.523	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA18525	0.785	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA18939	0.387	0.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA19017	0.49	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA19238	0.623	0.693	0.0	0.0	0.667	0.686	1	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA19239	0.444	0.493	0.0	0.0	0.5	0.515	1	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA19625	0.45	0.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA19648	0.396	0.44	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA20502	0.409	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33172685	33173004	DEL	320	NA20845	0.595	0.661	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG00096	0.716	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG00268	0.579	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG00419	0.988	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG00759	0.531	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG01051	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG01112	0.459	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG01500	0.591	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG01565	0.322	0.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG01583	1.109	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG01595	0.639	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG01879	0.684	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG02568	1.029	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG02922	0.863	0.959	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG03006	0.706	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG03052	0.792	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG03642	1.055	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	HG03742	0.265	0.295	0.0	0.066	0.941	0.941	1	1
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA12878	0.709	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA18525	0.663	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA18939	0.703	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA19017	0.472	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA19238	0.687	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA19239	0.596	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA19625	0.675	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA19648	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA20502	0.637	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	33473013	33473084	DEL	72	NA20845	0.553	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG00096	0.921	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG00268	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG00419	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG00759	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG01051	0.275	0.267	0.0	0.041	0.85	0.85	1	1
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG01112	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG01500	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG01565	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG01583	0.525	0.509	0.0	0.027	0.318	0.318	1	1
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG01595	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG01879	1.105	1.073	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG02568	0.495	0.481	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG02922	0.986	0.958	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG03006	0.529	0.514	0.0	0.04	0.677	0.677	1	1
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG03052	1.313	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG03642	1.318	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	HG03742	0.625	0.607	0.0	0.007	0.571	0.571	1	1
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA12878	0.945	0.917	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA18525	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA18939	1.002	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA19017	1.162	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA19238	1.107	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA19239	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA19625	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA19648	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA20502	0.568	0.552	0.0	0.059	0.645	0.681	1	1
chr4	34573411	34573486	DEL	76	NA20845	0.595	0.578	0.0	0.038	0.5	0.538	1	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG00096	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG00419	0.645	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG00759	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG01051	0.314	0.33	0.0	0.0	0.5	0.5	12	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG01112	0.389	0.409	0.0	0.0	0.562	0.562	10	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG01500	0.365	0.384	0.005	0.0	0.264	0.275	8	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG01565	0.242	0.254	0.0	0.0	0.444	0.444	11	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG01583	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG01595	0.271	0.285	0.0	0.0	0.5	0.5	13	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG01879	0.368	0.388	0.0	0.0	0.217	0.217	7	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG02568	0.648	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG02922	0.575	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG03006	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG03052	0.479	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG03642	0.336	0.353	0.0	0.0	0.5	0.5	13	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	HG03742	0.284	0.299	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA18525	0.733	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA18939	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA19017	0.581	0.612	0.0	0.0	1.0	0.957	1	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA19238	0.687	0.723	0.0	0.0	0.542	0.547	2	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA19239	0.761	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA19625	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA19648	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA20502	0.705	0.742	0.0	0.0	0.818	0.775	1	2
chr4	34779788	34780532	DEL	745	NA20845	0.553	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG00096	1.074	1.074	0.0	0.0	0.875	0.874	2	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG00268	0.903	0.903	0.0	0.0	0.957	0.996	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG00419	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG00759	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG01051	0.902	0.902	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG01112	1.148	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG01500	0.886	0.886	0.0	0.0	0.9	0.863	2	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG01565	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG01583	1.455	1.455	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG01595	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG01879	1.07	1.07	0.0	0.0	0.781	0.781	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG02568	0.229	0.229	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG02922	1.13	1.13	0.0	0.0	0.81	0.863	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG03006	0.988	0.988	0.0	0.003	0.966	0.966	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG03052	1.292	1.292	0.0	0.0	0.767	0.767	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG03642	1.055	1.055	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	HG03742	0.985	0.985	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA12878	1.063	1.063	0.0	0.003	0.853	0.892	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA18525	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA18939	1.143	1.143	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA19017	1.271	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA19238	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA19239	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA19625	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA19648	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA20502	1.091	1.091	0.0	0.0	0.364	0.344	1	2
chr4	35165271	35165419	DEL	149	NA20845	0.956	0.956	0.0	0.0	0.789	0.733	1	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG00096	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG00268	1.124	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG00419	1.311	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG00759	1.138	1.063	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG01051	1.177	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG01112	1.095	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG01500	1.112	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG01565	0.362	0.339	0.0	0.043	0.952	0.952	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG01583	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG01595	0.426	0.398	0.0	0.04	0.913	0.913	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG01879	0.562	0.525	0.0	0.052	0.711	0.711	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG02568	0.533	0.498	0.0	0.022	0.615	0.615	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG03006	1.129	1.055	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr4	35849855	35849927	DEL	73	HG03742	0.55	0.514	0.0	0.036	0.417	0.417	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA12878	1.181	1.104	0.0	0.003	0.857	0.896	1	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA18525	0.523	0.489	0.0	0.03	0.737	0.737	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA18939	1.214	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA19017	0.436	0.407	0.0	0.05	0.688	0.719	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA19238	0.941	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA19239	0.989	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA19625	0.65	0.608	0.0	0.053	0.645	0.645	1	1
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA19648	1.014	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA20502	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	35849855	35849927	DEL	73	NA20845	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG00096	1.217	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG00268	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG00419	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG00759	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG01051	1.138	1.105	0.0	0.0	0.82	0.82	2	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG01112	1.219	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG01500	1.217	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG01565	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG01583	1.121	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG01595	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG01879	1.193	1.158	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG02568	0.838	0.814	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG02922	0.514	0.499	0.1	0.07	nan	nan	0	1
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG03006	1.129	1.096	0.0	0.0	0.949	0.949	2	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG03052	0.583	0.566	0.087	0.057	nan	nan	0	1
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG03642	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	HG03742	1.099	1.067	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA12878	1.012	0.983	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA18525	1.238	1.202	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA18939	1.214	1.178	0.0	0.0	0.984	0.984	2	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA19017	0.672	0.652	0.096	0.054	nan	nan	0	1
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA19238	1.196	1.161	0.0	0.0	0.75	0.729	3	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA19239	0.926	0.899	0.0	0.0	0.775	0.753	3	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA19625	1.275	1.238	0.0	0.0	0.515	0.515	2	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA19648	1.138	1.105	0.0	0.0	0.666	0.627	2	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA20502	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36020524	36021279	DEL	756	NA20845	0.893	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG00096	1.038	1.008	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG00268	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG00419	1.039	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG00759	1.119	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG01051	1.04	1.009	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG01112	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG01500	1.164	1.13	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG01565	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG01583	1.407	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG01595	1.355	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG01879	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG02568	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG02922	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG03006	1.182	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG03052	0.792	0.769	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG03642	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	HG03742	1.535	1.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA12878	0.81	0.786	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA18525	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA18939	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA19017	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA19238	1.272	1.235	0.0	0.0	0.712	0.733	1	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA19239	1.167	1.133	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA19625	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA19648	1.088	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA20502	1.432	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36492217	36492520	DEL	304	NA20845	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG00096	0.465	0.452	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG00268	0.443	0.43	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG00419	0.645	0.626	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG00759	1.327	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG01051	0.628	0.609	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG01112	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG01500	0.782	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG01565	0.604	0.586	0.0	0.09	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG01583	0.787	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG01595	0.523	0.507	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG01879	0.597	0.579	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG02568	0.724	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG02922	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG03006	0.529	0.514	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG03052	1.146	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG03642	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	HG03742	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA12878	0.911	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA18525	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA18939	0.809	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA19017	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA19238	0.929	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA19239	0.989	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA19625	0.4	0.388	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA19648	0.594	0.576	0.0	0.082	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA20502	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	36652565	36652676	DEL	112	NA20845	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG00096	0.841	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG00268	0.664	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG00419	0.555	0.538	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG00759	0.815	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG01051	0.628	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG01112	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG01500	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG01565	0.695	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG01583	0.549	0.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG01595	0.832	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG01879	0.404	0.392	0.0	0.002	0.65	0.65	2	1
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG02568	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG02922	0.288	0.279	0.0	0.01	0.769	0.721	2	1
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG03006	1.182	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG03052	0.802	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG03642	0.312	0.303	0.0	0.014	0.667	0.667	2	1
chr4	37125923	37125980	DEL	58	HG03742	0.644	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA12878	0.776	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA18525	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA18939	0.651	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA19017	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA19238	0.572	0.556	0.0	0.003	0.529	0.545	2	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA19239	0.805	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA19625	0.4	0.388	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA19648	0.594	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA20502	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37125923	37125980	DEL	58	NA20845	0.638	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG00096	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG00268	0.937	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG00419	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG00759	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG01051	1.295	1.257	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG01112	1.122	1.089	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG01500	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG01565	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG01583	0.835	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG01595	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG01879	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG02568	1.067	1.036	0.0	0.0	0.476	0.476	1	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG02922	0.555	0.539	0.04	0.08	nan	nan	0	1
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG03006	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG03052	1.104	1.072	0.0	0.007	0.982	0.982	2	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG03642	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	HG03742	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA12878	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA18525	0.593	0.576	0.019	0.093	nan	nan	0	1
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA18939	1.196	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA19017	0.871	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA19238	1.234	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA19239	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA19625	1.15	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA19648	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA20502	1.091	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	37554641	37555038	DEL	398	NA20845	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG00096	1.082	0.993	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG00268	1.192	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG00419	1.069	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG00759	0.55	0.504	0.0	0.008	0.727	0.727	1	1
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG01051	0.785	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG01112	1.298	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG01500	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG01565	1.047	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG01583	1.467	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG01595	0.581	0.533	0.0	0.011	0.567	0.567	1	1
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG01879	1.018	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG02568	1.086	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG02922	1.171	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG03006	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG03052	0.833	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG03642	0.695	0.638	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	HG03742	1.232	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA12878	1.012	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA18525	0.506	0.464	0.0	0.015	0.818	0.818	1	1
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA18939	0.528	0.484	0.0	0.015	0.545	0.545	1	1
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA19017	1.144	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA19238	1.024	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA19239	1.091	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA19625	0.575	0.528	0.0	0.012	0.583	0.583	1	1
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA19648	1.459	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA20502	1.251	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	38486099	38486154	DEL	56	NA20845	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG00096	1.038	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG00268	1.141	1.201	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG00419	0.907	0.955	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG00759	0.91	0.958	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG01051	0.785	0.826	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG01112	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG01500	0.608	0.64	0.063	0.0	nan	nan	0	1
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG01565	0.886	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG01583	1.026	1.079	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG01595	0.852	0.897	0.0	0.0	0.393	0.393	1	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG01879	0.877	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG02568	0.876	0.922	0.0	0.0	0.829	0.829	2	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG02922	0.925	0.973	0.0	0.0	0.833	0.889	1	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG03006	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG03052	0.896	0.943	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG03642	0.863	0.908	0.0	0.0	0.667	0.667	1	1
chr4	39539154	39539866	DEL	713	HG03742	0.834	0.878	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA12878	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA18525	1.221	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA18939	1.002	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA19017	0.871	0.917	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA19238	0.89	0.937	0.0	0.0	0.757	0.735	1	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA19239	0.901	0.948	0.0	0.002	0.836	0.861	2	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA19625	0.9	0.948	0.0	0.0	0.779	0.779	2	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA19648	0.965	1.015	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA20502	1.046	1.101	0.0	0.0	0.818	0.854	2	2
chr4	39539154	39539866	DEL	713	NA20845	0.935	0.984	0.0	0.0	1.0	0.929	1	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG00096	0.823	0.866	0.0	0.006	0.955	0.915	1	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG00268	0.783	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG00419	0.323	0.34	0.098	0.032	0.333	0.333	13	1
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG00759	0.569	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG01051	0.667	0.702	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG01112	0.813	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG01500	0.921	0.97	0.004	0.002	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG01565	0.966	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG01583	0.906	0.954	0.0	0.0	0.864	0.864	2	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG01595	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG01879	0.965	1.016	0.004	0.002	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG02568	1.257	1.323	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG02922	0.884	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG03006	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG03052	0.792	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG03642	0.767	0.807	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	HG03742	0.569	0.598	0.0	0.0	0.857	0.857	2	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA12878	0.877	0.924	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA18525	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA18939	0.897	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA19017	0.617	0.65	0.0	0.0	0.786	0.752	1	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA19238	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA19239	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA19625	0.775	0.816	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA19648	0.693	0.729	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA20502	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	39774976	39775813	DEL	838	NA20845	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG00096	0.573	0.535	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG00268	0.443	0.414	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG00419	0.907	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG00759	0.834	0.78	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG01051	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG01112	0.883	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG01500	0.991	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG01565	1.047	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG01583	1.002	0.936	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG01595	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG02568	0.533	0.498	0.0	0.034	0.417	0.417	1	1
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG02922	0.719	0.672	0.0	0.0	1.0	0.938	1	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG03006	0.723	0.676	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG03052	0.667	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG03642	1.031	0.963	0.0	0.0	0.913	0.913	2	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	HG03742	0.758	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA12878	0.928	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA18525	1.047	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA18939	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA19017	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA19238	1.119	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA19239	0.977	0.913	0.0	0.003	0.889	0.915	1	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA19625	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA19648	1.039	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA20502	0.432	0.404	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr4	41068089	41068205	DEL	117	NA20845	0.871	0.814	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	HG00096	0.322	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	HG00268	0.511	0.511	0.0	0.003	0.333	0.347	1	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	HG00419	0.403	0.403	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	HG00759	0.36	0.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	HG01500	0.626	0.626	0.0	0.0	0.382	0.399	1	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	HG01565	0.644	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	NA12878	0.304	0.304	0.0	0.081	0.875	0.837	2	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	NA18939	0.281	0.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41445194	41445294	DUP	101	NA20502	0.364	0.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG00096	0.877	0.877	0.0	0.0	0.684	0.656	1	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG00268	0.579	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG00419	0.524	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG00759	0.588	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG01051	0.49	0.49	0.0	0.0	0.725	0.725	2	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG01112	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG01500	0.678	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG01565	0.523	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG01583	0.453	0.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG01595	0.523	0.523	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG01879	0.544	0.544	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG02568	0.381	0.381	0.0	0.0	0.571	0.571	2	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG02922	0.37	0.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG03006	0.529	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG03052	0.292	0.292	0.047	0.089	nan	nan	0	1
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG03642	0.599	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	HG03742	0.625	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA12878	0.658	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA18525	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA18939	0.58	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA19017	0.49	0.49	0.0	0.0	0.744	0.711	2	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA19238	0.521	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA19239	0.52	0.52	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA19625	0.5	0.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA19648	0.569	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA20502	0.546	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	41960553	41961061	DEL	509	NA20845	0.553	0.553	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG00096	0.519	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG00268	0.886	0.886	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG00419	0.403	0.403	0.037	0.043	nan	nan	0	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG00759	0.322	0.322	0.079	0.062	0.946	0.946	2	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG01051	0.432	0.432	0.072	0.043	nan	nan	0	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG01112	0.689	0.689	0.0	0.0	0.632	0.632	2	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG01500	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG01565	0.443	0.443	0.061	0.038	0.238	0.238	3	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG01583	0.596	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG01595	0.252	0.252	0.085	0.072	0.962	0.962	2	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG01879	0.667	0.667	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG02568	0.99	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG02922	0.699	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG03006	0.759	0.759	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG03052	0.354	0.354	0.057	0.041	0.621	0.621	2	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG03642	0.479	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	HG03742	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA12878	0.776	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA18525	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA18939	0.369	0.369	0.08	0.07	0.558	0.558	2	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA19017	0.744	0.744	0.0	0.0	1.0	0.957	1	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA19238	0.814	0.814	0.0	0.0	1.0	0.971	1	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA19239	0.736	0.736	0.0	0.0	0.769	0.747	3	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA19625	0.225	0.225	0.152	0.074	0.545	0.545	2	1
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA19648	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA20502	0.614	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	42905160	42905861	DEL	702	NA20845	0.595	0.595	0.0	0.0	0.625	0.58	1	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG00096	0.948	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	0.92	0.883	1	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG00419	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG00759	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG01051	1.118	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG01112	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG01500	1.008	0.979	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG01565	0.725	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG01583	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG01595	0.813	0.789	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG01879	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG02568	0.457	0.444	0.048	0.024	nan	nan	0	1
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG02922	0.699	0.678	0.0	0.0	0.9	0.96	1	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG03006	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG03052	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG03642	1.055	1.024	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	HG03742	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA12878	0.945	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA18525	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA18939	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA19017	0.944	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA19238	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA19239	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA19625	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA19648	0.816	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA20502	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43269154	43269935	DEL	782	NA20845	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG00096	0.412	0.385	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG00268	0.375	0.35	0.012	0.071	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG00419	0.0	0.0	0.026	0.193	nan	nan	0	0
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG00759	0.0	0.0	0.007	0.176	nan	nan	0	0
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG01051	0.373	0.348	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG01112	0.459	0.429	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG01500	0.348	0.325	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG01565	0.403	0.376	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG01583	0.501	0.468	0.031	0.062	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG01595	0.436	0.407	0.025	0.05	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG01879	0.351	0.328	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG02568	1.105	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG02922	0.432	0.403	0.007	0.058	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG03006	0.476	0.445	0.016	0.066	nan	nan	0	1
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG03052	0.0	0.0	0.021	0.109	nan	nan	0	0
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG03642	0.719	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	HG03742	0.815	0.762	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA12878	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA18525	0.837	0.782	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	0
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA19017	1.126	1.052	0.005	0.0	0.667	0.638	1	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA19238	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA19239	1.142	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA19625	0.925	0.865	0.007	0.0	0.842	0.842	1	2
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA19648	0.0	0.0	0.029	0.208	nan	nan	0	0
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA20502	0.0	0.0	0.033	0.13	nan	nan	0	0
chr4	43751813	43752122	DEL	310	NA20845	0.0	0.0	0.062	0.117	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG00096	0.0	0.0	0.03	0.199	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG00268	0.0	0.0	0.046	0.231	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG00419	0.0	0.0	0.043	0.223	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG00759	0.0	0.0	0.025	0.19	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG01051	0.0	0.0	0.023	0.17	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG01112	0.0	0.0	0.059	0.187	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG01500	0.0	0.0	0.072	0.212	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG01565	0.0	0.0	0.043	0.2	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG01583	0.0	0.0	0.028	0.137	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG01595	0.0	0.0	0.025	0.167	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG01879	0.0	0.0	0.023	0.187	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG02568	0.152	0.152	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG02922	0.39	0.39	0.014	0.053	nan	nan	0	1
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG03006	0.0	0.0	0.012	0.179	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG03052	0.0	0.0	0.031	0.185	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG03642	0.0	0.0	0.032	0.14	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	HG03742	0.0	0.0	0.013	0.197	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA12878	0.0	0.0	0.004	0.199	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA18525	0.0	0.0	0.018	0.18	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA18939	0.0	0.0	0.031	0.196	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA19017	0.581	0.581	0.019	0.067	nan	nan	0	2
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA19238	0.0	0.0	0.01	0.21	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA19239	0.381	0.381	0.004	0.067	nan	nan	0	1
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA19625	0.0	0.0	0.038	0.091	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA19648	0.0	0.0	0.019	0.165	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA20502	0.0	0.0	0.079	0.176	nan	nan	0	0
chr4	43931499	43931838	DEL	340	NA20845	0.0	0.0	0.037	0.126	nan	nan	0	0
chr4	44870726	44870899	DUP	174	HG00096	0.644	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	HG00268	0.545	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	HG00759	0.531	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	HG01565	0.423	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	HG01595	0.29	0.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	HG01879	0.439	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	HG02922	0.329	0.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	NA12878	0.354	0.448	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	NA19238	0.623	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	44870726	44870899	DUP	174	NA19625	0.325	0.411	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG00096	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG00268	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG00419	1.19	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG00759	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG01051	0.471	0.457	0.09	0.071	nan	nan	0	1
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG01112	0.795	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG01500	0.852	0.827	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG01565	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG01583	0.882	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG01595	0.89	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG01879	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG02568	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG02922	0.534	0.519	0.086	0.056	nan	nan	0	1
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG03006	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG03052	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG03642	0.983	0.954	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	HG03742	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA12878	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA18525	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA18939	0.915	0.888	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA19017	0.999	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA19238	1.018	0.988	0.0	0.0	0.675	0.695	1	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA19239	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA19625	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA19648	0.717	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA20502	0.773	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55219493	55220351	DEL	859	NA20845	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG00096	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG00268	0.869	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG00419	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG00759	1.214	1.277	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG01051	1.197	1.26	0.0	0.004	0.958	0.958	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG01112	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG01500	1.164	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG01565	0.745	0.784	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG01583	0.692	0.728	0.008	0.025	0.609	0.609	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG01595	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG01879	0.93	0.979	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG02568	1.371	1.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG02922	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG03006	0.618	0.65	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	HG03642	0.839	0.883	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA12878	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA18525	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA18939	0.633	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA19017	1.071	1.128	0.0	0.0	0.933	0.976	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA19238	0.929	0.977	0.0	0.0	0.875	0.85	1	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA19239	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA19625	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA19648	1.014	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA20502	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	55649676	55649738	DUP	63	NA20845	0.871	0.917	0.0	0.0	0.5	0.538	1	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG00096	1.038	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG00268	1.073	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG00419	1.069	0.981	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG00759	0.91	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG01051	1.687	1.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG01112	1.042	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG01500	0.904	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG01565	1.007	0.924	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG01583	0.811	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG01595	0.794	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG01879	0.93	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG02568	0.99	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG02922	1.295	1.188	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG03006	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG03052	1.063	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG03642	1.079	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	HG03742	1.402	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA12878	1.012	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA18525	0.994	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA18939	1.002	0.92	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA19017	0.472	0.433	0.0	0.044	0.633	0.662	1	1
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA19238	1.005	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA19239	1.04	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA19625	1.5	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA19648	1.187	1.089	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA20502	1.273	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	56041534	56041626	DEL	93	NA20845	0.956	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG00096	0.0	0.0	0.009	0.05	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.135	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG00419	0.0	0.0	0.01	0.061	nan	nan	0	0
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG00759	0.057	0.06	0.0	0.075	0.857	0.857	1	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.148	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG01112	0.283	0.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG01500	0.382	0.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG01565	0.221	0.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG01583	0.191	0.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG01879	0.211	0.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG02922	0.041	0.043	0.0	0.061	0.571	0.536	1	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG03642	0.12	0.126	0.0	0.076	0.333	0.333	1	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	HG03742	0.095	0.1	0.0	0.034	0.917	0.917	1	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA12878	0.202	0.213	0.0	0.052	0.385	0.402	1	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA19238	0.165	0.174	0.0	0.075	0.333	0.324	1	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	0
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA19625	0.1	0.105	0.0	0.048	1.0	1.0	1	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA19648	0.173	0.182	0.012	0.025	nan	nan	0	1
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA20502	0.341	0.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57501858	57501984	DEL	127	NA20845	0.191	0.201	0.0	0.04	0.769	0.828	1	1
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG00096	0.734	0.815	0.0	0.0	0.947	0.908	4	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG00268	0.664	0.738	0.0	0.0	0.667	0.694	1	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG00419	0.726	0.807	0.005	0.0	0.612	0.612	4	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG00759	0.607	0.674	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG01051	0.608	0.676	0.0	0.0	0.539	0.539	2	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG01112	0.318	0.353	0.085	0.0	0.279	0.279	8	1
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG01500	0.695	0.772	0.0	0.0	0.762	0.769	5	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG01565	0.805	0.895	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG01583	0.787	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG01595	0.329	0.366	0.081	0.0	0.538	0.538	11	1
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG01879	0.667	0.741	0.005	0.0	0.938	0.938	3	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG02568	0.724	0.804	0.0	0.0	0.273	0.273	1	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG02922	0.781	0.868	0.0	0.0	0.75	0.8	5	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG03006	0.653	0.725	0.0	0.0	0.615	0.615	3	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG03052	0.583	0.648	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG03642	0.719	0.799	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	HG03742	0.796	0.884	0.0	0.0	0.646	0.646	4	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA12878	0.759	0.844	0.0	0.002	0.862	0.901	5	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA18525	0.785	0.872	0.0	0.0	0.81	0.81	5	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA18939	0.668	0.743	0.0	0.0	0.591	0.591	3	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA19017	0.69	0.767	0.0	0.0	0.838	0.876	4	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA19238	0.674	0.749	0.0	0.002	0.548	0.564	1	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA19239	0.812	0.902	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA19625	0.85	0.945	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA19648	0.816	0.907	0.004	0.0	0.888	0.881	4	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA20502	0.75	0.834	0.0	0.0	0.889	0.892	5	2
chr4	57761147	57762110	DEL	964	NA20845	0.829	0.921	0.0	0.0	0.714	0.769	5	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG00096	0.608	0.676	0.0	0.023	0.605	0.632	1	1
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG00268	0.307	0.341	0.014	0.024	0.905	0.869	1	1
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG00419	1.16	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG00759	0.853	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG01051	0.49	0.545	0.0	0.05	0.731	0.731	1	1
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG01112	1.095	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG01500	1.008	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG01565	0.725	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG01583	0.596	0.662	0.0	0.033	0.526	0.526	1	1
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG01595	0.968	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG01879	1.088	1.209	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG02568	0.914	1.016	0.0	0.01	0.909	0.909	1	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG02922	1.058	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG03006	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG03052	0.948	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG03642	0.959	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	HG03742	0.474	0.526	0.0	0.009	0.88	0.88	1	1
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA12878	0.894	0.994	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA18525	0.488	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA18939	0.897	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA19017	0.781	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA19238	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA19239	0.698	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA19625	0.95	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA19648	0.618	0.687	0.0	0.02	0.833	0.885	1	1
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA20502	0.455	0.505	0.0	0.025	0.909	0.861	1	2
chr4	59348231	59348282	DEL	52	NA20845	0.393	0.437	0.0	0.027	0.6	0.646	1	1
chr4	59985387	59985494	DUP	108	HG01565	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59985387	59985494	DUP	108	HG01583	1.049	1.105	0.006	0.004	nan	nan	0	2
chr4	59985387	59985494	DUP	108	HG02568	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59985387	59985494	DUP	108	HG02922	1.028	1.082	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	59985387	59985494	DUP	108	NA12878	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59985387	59985494	DUP	108	NA19239	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59985387	59985494	DUP	108	NA19625	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	59985387	59985494	DUP	108	NA20845	0.701	0.738	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG00096	0.555	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG00268	0.511	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG00419	0.565	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG00759	0.379	0.457	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG01051	0.432	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG01112	0.442	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG01500	0.487	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG01565	0.443	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG01583	0.572	0.69	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG01595	0.348	0.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG01879	0.597	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG02568	0.571	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG02922	0.329	0.396	0.0	0.015	0.267	0.284	1	1
chr4	612316	612381	DEL	66	HG03006	0.423	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG03052	0.583	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG03642	0.695	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	HG03742	0.644	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA12878	0.624	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA18525	0.698	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA18939	0.545	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA19017	0.563	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA19238	0.7	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA19239	0.653	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA19625	0.5	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA19648	0.668	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA20502	0.091	0.11	0.0	0.03	0.556	0.526	1	2
chr4	612316	612381	DEL	66	NA20845	0.319	0.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG00096	0.626	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG00268	0.783	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG00419	0.887	1.02	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG00759	0.834	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG01051	0.687	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG01112	0.777	0.893	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG01500	0.869	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG01565	0.604	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG01583	0.859	0.987	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG01595	0.852	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG01879	0.719	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG02568	0.686	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG03006	0.618	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG03052	0.792	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG03642	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	HG03742	0.758	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA12878	0.86	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA18525	0.855	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA18939	0.756	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA19017	1.216	1.398	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA19238	0.89	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA19239	0.736	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA19625	0.775	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA19648	0.866	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA20502	1.023	1.176	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr4	61669406	61669500	DUP	95	NA20845	0.616	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG00096	0.859	0.834	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG00268	0.0	0.0	0.012	0.196	nan	nan	0	0
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG00419	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG00759	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG01051	0.883	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG01112	0.477	0.463	0.008	0.058	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG01500	0.869	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG01565	0.886	0.86	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG01583	0.644	0.625	0.01	0.081	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG01595	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG01879	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG02568	0.0	0.0	0.018	0.2	nan	nan	0	0
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG02922	0.514	0.499	0.021	0.097	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG03006	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG03052	0.458	0.445	0.01	0.099	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG03642	1.174	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	HG03742	0.436	0.423	0.004	0.069	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA12878	0.776	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA18525	1.116	1.084	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA18939	1.284	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA19017	0.418	0.405	0.017	0.064	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA19238	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA19239	0.507	0.493	0.003	0.106	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA19625	1.425	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA19648	1.187	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA20502	0.614	0.596	0.007	0.09	nan	nan	0	1
chr4	62028315	62028602	DEL	288	NA20845	0.744	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG00096	0.948	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG00268	0.46	0.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG00419	0.827	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG00759	0.664	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG01051	0.588	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG01112	0.654	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG01500	0.886	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG01565	0.825	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG01583	0.715	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG01595	0.658	0.615	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG01879	0.737	0.689	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG02568	1.029	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG02922	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG03006	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG03052	0.958	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG03642	0.791	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	HG03742	0.587	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA12878	0.574	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA18525	0.715	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA18939	0.616	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA19017	0.708	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA19238	0.674	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA19239	0.71	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA19625	0.75	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA19648	0.767	0.717	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA20502	0.568	0.531	0.0	0.045	0.778	0.821	1	1
chr4	6300192	6300259	DEL	68	NA20845	0.616	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG00096	0.966	0.938	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG00268	0.732	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG00419	0.968	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG00759	0.739	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG01051	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG01112	0.742	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG01500	0.852	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG01565	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG01583	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG01595	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG01879	0.912	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG02568	0.952	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG02922	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG03006	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG03052	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG03642	0.431	0.419	0.0	0.05	0.6	0.6	1	1
chr4	63019408	63019506	DEL	99	HG03742	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA12878	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA18525	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA18939	1.301	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA19017	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA19238	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA19239	1.078	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA19625	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA19648	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA20502	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63019408	63019506	DEL	99	NA20845	0.616	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG00096	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG00268	0.409	0.397	0.048	0.092	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG00419	0.323	0.313	0.067	0.078	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG00759	0.0	0.0	0.124	0.254	nan	nan	0	0
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG01051	0.392	0.381	0.072	0.095	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG01112	0.495	0.48	0.032	0.087	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG01500	0.504	0.489	0.046	0.067	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG01565	0.0	0.0	0.17	0.184	nan	nan	0	0
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG01583	0.811	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG01595	0.0	0.0	0.177	0.29	nan	nan	0	0
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG01879	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG02568	0.533	0.518	0.025	0.059	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG02922	0.473	0.459	0.062	0.056	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG03006	0.538	0.522	0.054	0.091	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG03052	0.5	0.485	0.086	0.078	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG03642	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	HG03742	0.0	0.0	0.228	0.28	nan	nan	0	0
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA12878	0.911	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA18525	0.0	0.0	0.103	0.206	nan	nan	0	0
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA18939	0.0	0.0	0.088	0.184	nan	nan	0	0
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA19017	1.289	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA19238	1.094	1.062	0.0	0.0	0.886	0.861	1	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA19239	0.545	0.53	0.014	0.071	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA19625	0.65	0.631	0.028	0.079	nan	nan	0	1
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA19648	1.212	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA20502	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	63301189	63301672	DEL	484	NA20845	0.723	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG00096	0.904	0.877	0.0	0.0	0.885	0.923	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG00268	0.869	0.843	0.0	0.0	0.471	0.49	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG00419	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG00759	0.645	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG01051	0.824	0.8	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG01112	0.813	0.789	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG01500	0.852	0.827	0.0	0.0	0.731	0.763	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG01565	1.007	0.977	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG01583	0.93	0.903	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG01595	0.755	0.733	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG01879	1.018	0.988	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG02568	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG02922	0.801	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG03006	0.847	0.822	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG03052	0.563	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG03642	0.767	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	HG03742	0.985	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA12878	0.692	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA18525	1.055	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA18939	0.756	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA19017	0.926	0.899	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA19238	0.801	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA19239	0.913	0.887	0.0	0.0	0.825	0.849	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA19625	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA19648	0.0	0.0	0.012	0.048	nan	nan	0	1
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA20502	0.91	0.883	0.0	0.0	0.947	0.898	1	2
chr4	64028543	64028612	DEL	70	NA20845	0.723	0.702	0.0	0.006	0.786	0.73	1	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG00096	1.091	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG00268	0.851	0.896	0.007	0.0	0.831	0.837	2	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG00419	1.008	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG00759	0.891	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG01051	0.765	0.805	0.0	0.0	0.645	0.645	2	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG01112	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG01500	0.521	0.549	0.086	0.061	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG01565	0.805	0.848	0.0	0.0	0.746	0.746	2	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG01583	1.073	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG01595	0.445	0.469	0.048	0.036	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG01879	0.333	0.351	0.075	0.06	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG02568	0.724	0.762	0.108	0.074	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG02922	0.329	0.346	0.089	0.052	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG03006	0.776	0.817	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG03052	1.042	1.096	0.005	0.0	0.847	0.847	2	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG03642	0.503	0.53	0.058	0.04	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	HG03742	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA12878	0.945	0.995	0.0	0.0	0.6	0.603	2	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA18525	0.733	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA18939	0.387	0.407	0.091	0.052	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA19017	0.527	0.554	0.107	0.052	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA19238	0.0	0.0	0.275	0.179	nan	nan	0	0
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA19239	0.774	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA19625	0.425	0.447	0.083	0.051	nan	nan	0	1
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA19648	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA20502	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65097097	65097834	DEL	738	NA20845	0.723	0.761	0.0	0.0	0.538	0.5	1	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG00096	0.877	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG00268	0.664	0.645	0.02	0.018	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG00419	0.504	0.489	0.031	0.024	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG00759	0.55	0.534	0.0	0.02	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG01051	0.51	0.495	0.006	0.024	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG01112	0.53	0.515	0.013	0.038	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG01500	0.0	0.0	0.036	0.116	nan	nan	0	0
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG01565	0.644	0.625	0.036	0.014	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG01583	1.049	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG01595	0.678	0.658	0.01	0.02	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG01879	0.544	0.528	0.005	0.033	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG02568	0.99	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG02922	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG03006	0.706	0.685	0.029	0.027	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG03052	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG03642	0.551	0.535	0.029	0.026	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	HG03742	0.0	0.0	0.044	0.088	nan	nan	0	0
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA12878	0.0	0.0	0.004	0.076	nan	nan	0	0
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA18525	0.471	0.457	0.017	0.061	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA18939	0.0	0.0	0.027	0.08	nan	nan	0	0
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA19017	0.418	0.405	0.018	0.035	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA19238	0.0	0.0	0.017	0.098	nan	nan	0	0
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA19239	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA19625	0.525	0.51	0.016	0.027	nan	nan	0	1
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA19648	1.261	1.225	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA20502	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	65719067	65719554	DEL	488	NA20845	0.574	0.557	0.0	0.017	nan	nan	0	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG00096	0.966	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG00268	0.903	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG00419	0.524	0.583	0.0	0.139	0.897	0.897	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG01051	0.451	0.501	0.0	0.076	0.75	0.75	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG01112	0.936	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG01500	0.504	0.56	0.0	0.113	0.711	0.741	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG01565	0.725	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG01583	1.169	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG01595	0.949	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG01879	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG02568	0.419	0.466	0.0	0.073	0.389	0.389	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG02922	1.028	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG03006	1.164	1.294	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG03052	0.375	0.417	0.0	0.086	0.783	0.783	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.223	nan	nan	0	0
chr4	66011056	66011157	DEL	102	HG03742	0.891	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA12878	0.911	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA18525	0.454	0.504	0.0	0.082	0.531	0.531	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA18939	0.492	0.547	0.0	0.119	0.763	0.763	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA19017	0.499	0.555	0.0	0.1	0.75	0.784	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA19238	0.967	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA19239	1.268	1.409	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA19625	0.4	0.445	0.0	0.078	0.538	0.538	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA19648	0.569	0.632	0.0	0.095	0.593	0.63	1	1
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA20502	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	66011056	66011157	DEL	102	NA20845	0.542	0.602	0.0	0.087	0.842	0.907	1	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG00096	0.215	0.201	0.011	0.113	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG00268	0.553	0.517	0.016	0.249	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG00419	0.0	0.0	0.045	0.195	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG00759	0.796	0.744	0.0	0.0	0.143	0.143	2	2
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG01051	0.0	0.0	0.017	0.195	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG01112	0.0	0.0	0.016	0.213	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG01500	0.426	0.398	0.027	0.2	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG01565	0.584	0.546	0.059	0.218	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG01583	0.394	0.368	0.018	0.193	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG01595	0.707	0.66	0.012	0.21	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG01879	0.667	0.623	0.023	0.239	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG02568	0.0	0.0	0.04	0.336	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG02922	0.164	0.154	0.009	0.095	0.667	0.625	1	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG03006	0.565	0.528	0.031	0.204	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG03052	0.698	0.652	0.008	0.206	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG03642	0.024	0.022	0.022	0.095	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	HG03742	0.55	0.514	0.048	0.197	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA12878	0.481	0.449	0.007	0.203	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA18525	0.471	0.44	0.012	0.231	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA18939	0.229	0.214	0.023	0.088	0.083	0.083	2	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA19017	0.109	0.102	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA19238	0.178	0.166	0.004	0.099	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA19239	0.59	0.551	0.005	0.215	nan	nan	0	1
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA19625	0.475	0.444	0.037	0.221	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA19648	0.668	0.624	0.01	0.232	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA20502	0.682	0.638	0.007	0.239	nan	nan	0	0
chr4	66641109	66641420	DEL	312	NA20845	0.553	0.516	0.056	0.178	nan	nan	0	0
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG00096	1.002	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG00268	0.477	0.433	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG00419	0.766	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG00759	1.024	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG01051	1.295	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG01112	1.643	1.493	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG01500	1.138	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG01565	1.127	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG01583	1.026	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG01595	1.026	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG01879	1.263	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG02568	0.495	0.45	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG02922	1.459	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG03006	1.076	0.978	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.208	nan	nan	0	1
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG03642	1.318	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	HG03742	1.516	1.378	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA12878	0.995	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA18525	0.933	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA18939	1.02	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA19017	1.235	1.122	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	0
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	1
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA19625	1.05	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA19648	1.187	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA20502	0.978	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67117689	67117808	DEL	120	NA20845	1.169	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG00096	0.769	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG00268	0.937	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG00419	0.867	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG00759	0.702	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG01051	0.628	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG01112	0.477	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG01500	0.73	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG01565	0.866	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG01583	0.739	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG01595	0.813	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG01879	0.825	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG02568	0.914	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG02922	0.873	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG03006	0.988	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG03052	0.667	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG03642	0.911	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	HG03742	0.644	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA12878	0.903	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA18939	0.774	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA19017	0.98	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA19238	0.738	0.848	0.0	0.0	0.929	0.902	1	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA19239	0.837	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA19625	0.775	0.891	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA19648	0.668	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA20502	0.864	0.993	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	67484209	67484292	DUP	84	NA20845	0.361	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG00096	0.787	0.764	0.0	0.043	0.661	0.689	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG00419	0.565	0.548	0.0	0.053	0.793	0.793	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG00759	0.607	0.589	0.0	0.033	0.629	0.629	1	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG01051	0.765	0.743	0.0	0.059	0.636	0.636	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG01112	0.707	0.686	0.0	0.068	0.596	0.596	1	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG01500	1.217	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG01565	0.0	0.0	0.008	0.121	nan	nan	0	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG01583	1.002	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG01595	0.716	0.695	0.0	0.049	0.644	0.644	1	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	0
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG02922	0.617	0.599	0.0	0.052	0.75	0.8	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG03006	0.0	0.0	0.005	0.099	nan	nan	0	0
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG03052	0.479	0.465	0.0	0.033	1.0	1.0	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG03642	0.695	0.675	0.0	0.041	0.87	0.87	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	HG03742	0.796	0.773	0.0	0.05	0.63	0.63	1	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.118	nan	nan	0	0
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA18525	0.506	0.491	0.0	0.059	0.949	0.949	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA18939	0.651	0.632	0.0	0.059	0.542	0.542	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA19238	1.259	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA19239	0.85	0.825	0.0	0.051	0.553	0.569	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA19625	0.6	0.583	0.0	0.045	0.682	0.682	1	1
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA19648	0.519	0.504	0.0	0.043	0.519	0.551	1	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA20502	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	68873177	68873246	DEL	70	NA20845	1.382	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG00096	0.948	0.886	0.0	0.0	0.722	0.754	1	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG00268	0.92	0.859	0.0	0.0	0.833	0.868	1	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG00419	0.706	0.66	0.047	0.06	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG00759	0.0	0.0	0.039	0.292	nan	nan	0	0
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG01051	0.451	0.422	0.014	0.103	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG01112	1.237	1.156	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG01500	0.539	0.504	0.006	0.075	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG01565	0.0	0.0	0.065	0.178	nan	nan	0	0
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG01583	0.62	0.58	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG01595	0.465	0.434	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG01879	0.877	0.82	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG02568	1.295	1.211	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG02922	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG03006	0.547	0.511	0.005	0.066	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG03052	0.271	0.253	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG03642	1.031	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA18525	0.0	0.0	0.025	0.181	nan	nan	0	0
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA18939	0.422	0.394	0.016	0.114	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA19017	0.0	0.0	0.042	0.244	nan	nan	0	0
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA19238	1.005	0.939	0.0	0.0	0.714	0.694	1	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA19239	0.368	0.344	0.0	0.107	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA19625	0.425	0.397	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA19648	0.396	0.37	0.023	0.075	nan	nan	0	1
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA20502	0.864	0.808	0.0	0.0	0.8	0.758	3	2
chr4	69597936	69598288	DEL	353	NA20845	1.041	0.973	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG00096	1.082	1.082	0.0	0.0	0.893	0.856	1	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG00268	0.92	0.92	0.0	0.0	0.688	0.66	3	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG00419	1.028	1.028	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG00759	0.91	0.91	0.0	0.0	1.0	1.0	4	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG01051	0.902	0.902	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG01112	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG01500	1.008	1.008	0.0	0.0	0.817	0.844	2	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG01565	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG01583	1.216	1.216	0.007	0.0	0.92	0.92	1	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG01595	1.007	1.007	0.0	0.0	0.792	0.792	2	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG01879	0.491	0.491	0.066	0.047	0.353	0.353	1	1
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG02568	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG02922	0.843	0.843	0.0	0.0	0.589	0.58	2	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG03006	0.9	0.9	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG03052	0.667	0.667	0.076	0.055	nan	nan	0	1
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG03642	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	HG03742	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA12878	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA18525	1.029	1.029	0.004	0.0	0.9	0.9	3	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA18939	1.038	1.038	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA19017	0.999	0.999	0.0	0.0	0.636	0.609	2	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA19238	1.018	1.018	0.002	0.0	0.957	0.93	3	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA19239	1.091	1.091	0.002	0.0	0.862	0.861	2	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA19625	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA19648	1.212	1.212	0.0	0.0	0.762	0.717	1	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA20502	1.114	1.114	0.0	0.0	0.864	0.872	5	2
chr4	71372427	71373326	DEL	900	NA20845	0.765	0.765	0.0	0.0	0.739	0.687	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG00096	1.288	1.288	0.0	0.0	0.893	0.856	1	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG00268	0.937	0.937	0.0	0.0	0.688	0.66	3	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG00419	1.089	1.089	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG00759	0.91	0.91	0.0	0.0	0.935	0.935	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG01051	0.981	0.981	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG01112	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG01500	1.06	1.06	0.005	0.0	0.817	0.844	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG01565	0.785	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG01583	1.073	1.073	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG01595	0.91	0.91	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG01879	0.439	0.439	0.071	0.051	nan	nan	0	1
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG02568	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG02922	0.966	0.966	0.0	0.0	0.589	0.58	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG03006	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG03052	0.542	0.542	0.085	0.061	nan	nan	0	1
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG03642	1.055	1.055	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	HG03742	1.061	1.061	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA12878	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA18525	1.029	1.029	0.005	0.0	0.876	0.876	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA18939	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA19017	1.017	1.017	0.0	0.004	0.636	0.609	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA19238	1.043	1.043	0.002	0.0	0.957	0.93	3	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA19239	1.078	1.078	0.004	0.0	0.862	0.861	2	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA19625	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA19648	1.261	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA20502	1.137	1.137	0.0	0.0	0.864	0.872	3	2
chr4	71372491	71373121	DEL	631	NA20845	0.744	0.744	0.0	0.0	0.739	0.687	2	2
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG00096	0.34	0.391	0.0	0.054	0.8	0.835	1	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG00419	0.302	0.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG00759	0.588	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG01112	0.53	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG01565	0.0	0.0	0.003	0.134	nan	nan	0	0
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG01583	0.143	0.164	0.0	0.069	1.0	1.0	1	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG01879	0.0	0.0	0.007	0.162	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG02568	0.152	0.175	0.0	0.065	0.818	0.818	1	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG02922	0.0	0.0	0.009	0.124	nan	nan	0	0
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG03052	0.146	0.168	0.0	0.077	0.85	0.85	1	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG03642	0.36	0.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71926412	71926572	DEL	161	HG03742	0.227	0.261	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA12878	0.557	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.158	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA19017	0.182	0.209	0.0	0.091	0.48	0.459	1	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA19238	0.623	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA19239	0.457	0.525	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA19648	0.0	0.0	0.008	0.204	nan	nan	0	0
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	1
chr4	71926412	71926572	DEL	161	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG00268	0.392	0.392	0.0	0.069	0.69	0.718	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG00419	0.565	0.565	0.0	0.059	0.514	0.514	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG00759	0.588	0.588	0.0	0.052	0.742	0.742	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG01051	0.608	0.608	0.0	0.052	0.312	0.312	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG01112	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG01500	0.626	0.626	0.0	0.046	0.581	0.607	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG01565	0.383	0.383	0.0	0.051	0.591	0.591	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG01583	0.477	0.477	0.0	0.047	0.421	0.421	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG01595	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG01879	0.439	0.439	0.0	0.042	0.586	0.586	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG02568	0.419	0.419	0.0	0.018	0.364	0.364	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG02922	0.288	0.288	0.0	0.051	0.833	0.781	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG03006	0.582	0.582	0.0	0.052	0.41	0.41	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG03642	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73418754	73418842	DEL	89	HG03742	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA18525	0.331	0.331	0.0	0.045	0.75	0.75	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA18939	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA19238	0.407	0.407	0.0	0.038	0.5	0.515	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA19625	0.525	0.525	0.0	0.04	0.579	0.579	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA19648	0.445	0.445	0.0	0.048	0.762	0.81	1	1
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA20502	0.0	0.0	0.011	0.109	nan	nan	0	0
chr4	73418754	73418842	DEL	89	NA20845	0.489	0.489	0.01	0.059	0.846	0.911	1	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG00096	0.501	0.501	0.064	0.042	nan	nan	0	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG00268	0.0	0.0	0.271	0.212	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG00419	0.0	0.0	0.245	0.177	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG00759	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG01051	0.0	0.0	0.166	0.217	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG01112	0.353	0.353	0.076	0.049	nan	nan	0	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG01500	0.782	0.782	0.0	0.0	0.5	0.522	3	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG01565	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG01583	0.596	0.596	0.076	0.035	0.5	0.5	1	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG01595	0.445	0.445	0.084	0.062	nan	nan	0	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG01879	0.562	0.562	0.074	0.064	nan	nan	0	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG02568	1.295	1.295	0.0	0.0	0.524	0.524	5	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG02922	1.007	1.007	0.0	0.0	0.731	0.685	5	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG03006	0.406	0.406	0.037	0.037	nan	nan	0	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG03052	0.396	0.396	0.044	0.044	nan	nan	0	1
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG03642	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	HG03742	0.0	0.0	0.166	0.159	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA12878	0.0	0.0	0.087	0.145	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA18525	0.89	0.89	0.006	0.0	0.885	0.885	3	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA18939	0.0	0.0	0.278	0.22	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA19017	0.0	0.0	0.154	0.214	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA19238	0.0	0.0	0.14	0.209	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA19239	0.0	0.0	0.18	0.226	nan	nan	0	0
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA19625	1.15	1.15	0.0	0.0	0.566	0.566	6	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA19648	1.064	1.064	0.0	0.0	0.619	0.658	3	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA20502	1.364	1.364	0.0	0.0	0.862	0.872	3	2
chr4	73831245	73831819	DEL	575	NA20845	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG00096	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG00268	0.596	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG00419	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG00759	0.91	0.91	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG01051	0.981	0.981	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG01112	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG01500	1.06	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG01565	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG01583	1.145	1.145	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG01595	1.007	1.007	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG01879	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG02568	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG02922	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG03006	1.217	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG03052	1.167	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG03642	0.863	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	HG03742	0.455	0.455	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA12878	1.063	1.063	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA18525	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA18939	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA19017	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA19238	0.649	0.649	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA19239	0.609	0.609	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA19625	0.65	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA19648	1.237	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA20502	1.16	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	74747650	74747812	DEL	163	NA20845	1.084	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG00096	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG00268	0.358	0.376	0.043	0.106	nan	nan	0	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG00419	0.343	0.361	0.015	0.111	0.769	0.769	1	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG00759	0.341	0.359	0.019	0.117	nan	nan	0	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG01051	0.863	0.909	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG01112	0.565	0.595	0.006	0.047	nan	nan	0	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG01500	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG01565	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG01583	0.942	0.992	0.0	0.0	0.533	0.533	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG01595	1.007	1.06	0.0	0.0	0.944	0.944	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG01879	0.965	1.016	0.0	0.003	0.826	0.826	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG02568	0.8	0.842	0.0	0.0	0.875	0.875	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG02922	0.411	0.433	0.041	0.058	nan	nan	0	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG03006	0.476	0.501	0.032	0.064	nan	nan	0	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG03052	0.0	0.0	0.106	0.28	nan	nan	0	0
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG03642	0.455	0.479	0.022	0.043	nan	nan	0	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	HG03742	1.004	1.057	0.005	0.0	0.84	0.84	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA12878	1.012	1.066	0.0	0.0	0.875	0.905	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA18525	0.942	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA18939	0.879	0.926	0.0	0.0	0.75	0.75	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA19017	1.017	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA19238	0.42	0.442	0.028	0.116	nan	nan	0	1
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA19239	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA19625	1.15	1.211	0.0	0.0	0.5	0.5	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA19648	0.965	1.015	0.0	0.0	0.632	0.594	5	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA20502	0.921	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	75203186	75203605	DEL	420	NA20845	1.063	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG00096	0.25	0.278	0.0	0.132	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG00268	0.0	0.0	0.011	0.37	nan	nan	0	0
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG00419	0.887	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG00759	0.284	0.316	0.003	0.15	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG01051	0.647	0.719	0.0	0.011	0.824	0.824	2	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG01112	0.742	0.824	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG01500	0.869	0.966	0.0	0.0	0.68	0.71	1	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG01565	0.463	0.515	0.015	0.087	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG01583	0.477	0.53	0.023	0.075	0.231	0.231	1	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG01595	0.0	0.0	0.013	0.27	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG01879	0.79	0.877	0.0	0.002	0.667	0.667	3	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG02568	0.952	1.058	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG02922	0.617	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG03006	0.723	0.804	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG03052	0.729	0.81	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG03642	0.0	0.0	0.06	0.211	nan	nan	0	0
chr4	7635491	7635854	DEL	364	HG03742	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA12878	0.607	0.675	0.0	0.006	0.7	0.67	1	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA18525	0.244	0.271	0.005	0.147	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA18939	0.0	0.0	0.049	0.279	nan	nan	0	0
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA19017	0.708	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA19238	0.28	0.311	0.0	0.131	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA19239	0.863	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA19625	0.525	0.583	0.005	0.105	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA19648	0.42	0.467	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA20502	0.455	0.505	0.0	0.172	nan	nan	0	1
chr4	7635491	7635854	DEL	364	NA20845	0.404	0.449	0.005	0.05	nan	nan	0	1
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG00096	0.465	0.465	0.0	0.0	0.733	0.765	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG00268	0.63	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG00419	0.686	0.686	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG00759	0.683	0.683	0.0	0.0	0.438	0.438	3	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG01051	0.53	0.53	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG01112	0.601	0.601	0.0	0.0	0.79	0.79	4	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG01500	0.66	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG01565	0.604	0.604	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG01583	0.477	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG01595	0.581	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG01879	0.439	0.439	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG02568	0.61	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG02922	0.575	0.575	0.0	0.0	0.667	0.625	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG03006	0.547	0.547	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG03052	0.333	0.333	0.018	0.114	nan	nan	0	1
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG03642	0.479	0.479	0.0	0.0	0.55	0.55	2	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	HG03742	0.55	0.55	0.0	0.0	0.879	0.879	4	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA12878	0.624	0.624	0.0	0.0	0.722	0.755	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA18525	0.68	0.68	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA18939	0.703	0.703	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA19017	0.617	0.617	0.0	0.0	0.716	0.72	4	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA19238	0.789	0.789	0.0	0.0	0.641	0.623	4	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA19239	0.381	0.381	0.004	0.075	nan	nan	0	1
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA19625	0.525	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA19648	0.544	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA20502	0.568	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76479673	76479983	DEL	311	NA20845	0.68	0.68	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG00096	0.787	0.875	0.0	0.0	0.9	0.897	2	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG00268	0.732	0.814	0.0	0.0	0.9	0.864	2	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG00419	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG00759	0.721	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG01051	0.706	0.785	0.0	0.0	0.958	0.958	2	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG01112	0.565	0.628	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG01500	0.73	0.811	0.0	0.0	0.933	0.931	2	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG01565	0.886	0.984	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG01583	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG01595	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG01879	0.368	0.409	0.0	0.0	0.688	0.688	10	1
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG02568	1.029	1.143	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG02922	0.801	0.891	0.0	0.0	0.818	0.767	1	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG03006	0.67	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG03052	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG03642	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	HG03742	0.625	0.695	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA12878	0.827	0.919	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA18525	0.924	1.027	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA18939	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA19017	0.817	0.908	0.0	0.0	0.733	0.701	3	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA19238	0.948	1.053	0.0	0.0	0.851	0.854	2	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA19239	0.419	0.465	0.0	0.0	0.391	0.403	10	1
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA19625	0.85	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA19648	1.039	1.154	0.0	0.0	0.631	0.671	2	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA20502	1.069	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	76742956	76743790	DEL	835	NA20845	0.829	0.921	0.0	0.0	0.857	0.796	2	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG00096	0.501	0.501	0.0	0.013	0.281	0.293	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG00268	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG00419	0.383	0.383	0.0	0.02	0.957	0.957	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG00759	0.436	0.436	0.0	0.024	0.87	0.87	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG01051	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG01112	0.707	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG01500	0.365	0.365	0.0	0.024	0.786	0.753	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG01565	0.463	0.463	0.0	0.035	0.944	0.944	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG01583	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG01595	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG01879	0.772	0.772	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG02568	0.8	0.8	0.0	0.02	0.733	0.733	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG02922	0.39	0.39	0.0	0.025	0.706	0.753	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG03006	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG03052	0.479	0.479	0.0	0.042	0.833	0.833	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG03642	1.198	1.198	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	HG03742	0.55	0.55	0.0	0.024	0.667	0.667	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA12878	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA18525	0.733	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA18939	0.686	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA19017	0.309	0.309	0.0	0.043	0.704	0.673	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA19238	0.356	0.356	0.0	0.029	0.806	0.783	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA19239	0.419	0.419	0.0	0.031	1.0	0.971	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA19625	0.6	0.6	0.0	0.021	0.52	0.52	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA19648	0.544	0.544	0.0	0.02	0.37	0.394	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA20502	0.409	0.409	0.0	0.036	0.864	0.818	1	1
chr4	78199221	78199273	DEL	53	NA20845	0.383	0.383	0.0	0.014	0.765	0.824	1	1
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG00096	0.859	0.859	0.0	0.0	0.607	0.582	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG00268	0.869	0.869	0.0	0.0	0.9	0.938	2	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG00419	0.827	0.827	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG00759	0.815	0.815	0.0	0.0	0.802	0.802	2	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG01051	1.03	1.03	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG01112	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG01500	0.973	0.973	0.0	0.0	0.638	0.639	2	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG01565	0.765	0.765	0.0	0.0	0.575	0.575	2	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG01583	0.859	0.859	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG01595	0.871	0.871	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG01879	0.684	0.684	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG02568	0.381	0.381	0.025	0.093	0.333	0.333	1	1
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG02922	1.028	1.028	0.0	0.002	0.833	0.781	3	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG03006	0.723	0.723	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG03052	0.979	0.979	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG03642	0.863	0.863	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	HG03742	0.815	0.815	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA12878	0.894	0.894	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA18525	0.942	0.942	0.0	0.0	0.786	0.786	2	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA18939	0.844	0.844	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA19017	0.871	0.871	0.0	0.0	0.311	0.326	2	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA19238	0.878	0.878	0.0	0.0	0.794	0.771	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA19239	0.863	0.863	0.0	0.0	0.923	0.897	3	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA19625	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA19648	1.113	1.113	0.0	0.0	0.417	0.443	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA20502	0.955	0.955	0.0	0.0	0.652	0.618	1	2
chr4	78267972	78268471	DEL	500	NA20845	0.914	0.914	0.0	0.0	0.867	0.933	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG00096	0.734	0.734	0.0	0.0	0.733	0.765	3	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG00268	0.817	0.817	0.0	0.0	0.452	0.47	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG00419	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG00759	0.721	0.721	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG01051	0.745	0.745	0.0	0.01	0.474	0.474	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG01112	0.848	0.848	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG01500	0.921	0.921	0.0	0.0	0.537	0.514	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG01565	0.846	0.846	0.0	0.0	0.923	0.923	3	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG01583	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG01595	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG01879	0.351	0.351	0.006	0.064	nan	nan	0	1
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG02568	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG02922	0.74	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG03006	0.865	0.865	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG03052	0.771	0.771	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG03642	0.647	0.647	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	HG03742	0.796	0.796	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA12878	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA18525	0.837	0.837	0.006	0.0	0.955	0.955	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA18939	0.677	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA19017	0.871	0.871	0.0	0.004	0.933	0.976	1	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA19238	0.929	0.929	0.0	0.0	0.598	0.598	2	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA19239	0.482	0.482	0.013	0.108	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA19625	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA19648	0.94	0.94	0.0	0.0	0.438	0.465	3	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA20502	0.477	0.477	0.0	0.0	0.667	0.704	3	2
chr4	78269322	78269725	DEL	404	NA20845	0.648	0.648	0.0	0.0	0.786	0.846	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG00096	0.948	0.998	0.0	0.004	0.846	0.811	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG00268	0.988	1.04	0.0	0.0	0.929	0.967	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG00419	1.008	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG00759	0.872	0.918	0.0	0.0	0.414	0.414	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG01051	0.804	0.847	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG01112	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG01500	1.06	1.116	0.0	0.0	0.828	0.864	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG01565	0.785	0.827	0.0	0.0	0.522	0.522	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG01583	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG01595	0.774	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG01879	0.948	0.997	0.0	0.0	0.885	0.885	3	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG02568	1.181	1.243	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG02922	0.349	0.368	0.0	0.064	0.625	0.667	3	1
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG03006	0.917	0.966	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG03052	0.646	0.68	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG03642	0.719	0.757	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	HG03742	0.682	0.718	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA12878	1.012	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA18525	0.698	0.734	0.0	0.0	0.478	0.478	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA18939	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA19017	0.581	0.612	0.0	0.053	0.667	0.697	1	1
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA19238	0.827	0.87	0.0	0.0	0.924	0.898	2	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA19239	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA19625	0.925	0.974	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA19648	0.841	0.885	0.0	0.0	0.833	0.784	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA20502	0.955	1.005	0.0	0.0	0.818	0.864	1	2
chr4	78320774	78320863	DEL	90	NA20845	1.02	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG00096	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG00268	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG00419	0.484	0.47	0.007	0.017	0.607	0.607	1	1
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG00759	1.214	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG01051	1.059	1.028	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG01112	0.883	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG01500	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG01565	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG01583	1.383	1.343	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG01595	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG01879	0.948	0.92	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG02568	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG02922	1.151	1.117	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG03006	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG03052	1.042	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG03642	0.635	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	HG03742	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA12878	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA18525	0.75	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA18939	1.178	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA19017	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA19238	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA19239	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA19625	0.375	0.364	0.0	0.014	0.75	0.75	1	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA19648	1.336	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA20502	0.841	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	78396092	78396153	DEL	62	NA20845	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG00096	0.626	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG00268	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG00419	0.907	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG00759	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG01051	1.04	1.009	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG01112	1.042	1.012	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG01500	0.799	0.776	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG01565	0.866	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG01583	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG01595	0.852	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG01879	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG02568	0.457	0.444	0.0	0.049	0.75	0.75	1	1
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG02922	0.719	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG03006	0.865	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG03052	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG03642	0.671	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	HG03742	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA12878	0.877	0.852	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA18525	0.924	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA18939	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA19017	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA19238	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA19239	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA19625	0.575	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA19648	1.014	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA20502	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	79371145	79371219	DEL	75	NA20845	1.126	1.094	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG00096	1.181	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG00268	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG00419	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG00759	0.815	0.792	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG01051	0.981	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG01112	1.007	0.978	0.0	0.002	0.571	0.571	1	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG01500	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG01565	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG01583	1.026	0.996	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG01595	1.026	0.996	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG01879	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG02568	0.914	0.888	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG02922	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG03006	0.988	0.959	0.0	0.003	0.759	0.759	1	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG03052	1.021	0.991	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG03642	0.911	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	HG03742	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA12878	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA18525	0.942	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA18939	1.231	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA19017	0.563	0.546	0.027	0.019	nan	nan	0	1
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA19238	1.056	1.025	0.005	0.0	0.857	0.882	1	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA19239	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA19625	0.85	0.825	0.0	0.0	0.555	0.555	2	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA19648	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81509003	81509910	DEL	908	NA20845	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG00096	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG00268	1.362	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG00419	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG00759	1.365	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG01051	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG01112	1.254	1.172	0.0	0.0	0.938	0.938	2	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG01500	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG01565	1.309	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG01583	1.097	1.025	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG01595	1.239	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG01879	1.176	1.099	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG02568	1.181	1.104	0.011	0.014	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG02922	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG03006	1.306	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG03052	1.042	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG03642	1.174	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	HG03742	1.327	1.24	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA12878	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA18525	1.064	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA18939	1.284	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA19017	0.363	0.339	0.042	0.056	nan	nan	0	1
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA19238	1.094	1.022	0.0	0.0	0.93	0.958	2	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA19239	1.281	1.197	0.0	0.0	0.941	0.914	2	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA19625	1.125	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA19648	0.989	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA20502	1.046	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	81647252	81647782	DEL	531	NA20845	1.19	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG00096	0.859	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG00268	0.698	0.776	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG00419	0.887	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG00759	0.626	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG01051	0.628	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG01112	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG01500	0.695	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG01565	0.523	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG01583	0.429	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG01595	0.6	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG01879	0.544	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG02568	0.8	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG02922	0.637	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG03006	0.776	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	1
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG03642	0.839	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	HG03742	0.55	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA12878	0.692	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA18525	0.733	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA18939	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA19017	0.49	0.545	0.007	0.079	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA19238	0.839	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA19239	0.837	0.93	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA19625	0.975	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA19648	0.915	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA20502	0.591	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	82052312	82052512	DEL	201	NA20845	0.701	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG00096	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG00268	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG00419	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG00759	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG01051	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG01112	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG01500	1.06	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG01565	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG01583	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG01595	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG01879	0.456	0.456	0.0	0.012	0.889	0.889	1	1
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG02568	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG02922	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG03006	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG03052	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG03642	0.839	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	HG03742	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA12878	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA18525	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA18939	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA19017	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA19238	0.445	0.445	0.0	0.007	0.975	0.947	1	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA19239	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA19625	0.625	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA19648	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA20502	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83845205	83845272	DEL	68	NA20845	1.169	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG00096	0.841	0.841	0.0	0.0	0.37	0.361	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG00268	0.869	0.869	0.0	0.0	0.714	0.72	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG00419	0.827	0.827	0.0	0.0	0.947	0.947	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG00759	0.834	0.834	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG01051	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG01112	0.548	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG01500	1.043	1.043	0.0	0.0	0.955	0.923	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG01565	1.047	1.047	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG01583	0.954	0.954	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG01595	0.929	0.929	0.0	0.0	0.727	0.727	2	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG01879	0.93	0.93	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG02568	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG02922	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG03006	0.723	0.723	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG03052	0.333	0.333	0.059	0.053	nan	nan	0	1
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG03642	0.647	0.647	0.0	0.0	0.357	0.357	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	HG03742	0.777	0.777	0.0	0.0	0.489	0.489	4	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA12878	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA18525	1.012	1.012	0.0	0.0	0.69	0.69	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA18939	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA19017	0.835	0.835	0.0	0.0	0.764	0.762	2	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA19238	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA19239	1.027	1.027	0.0	0.0	0.818	0.842	2	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA19625	0.825	0.825	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA19648	0.717	0.717	0.0	0.0	0.9	0.847	3	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA20502	0.978	0.978	0.0	0.0	0.39	0.397	2	2
chr4	83984425	83984956	DEL	532	NA20845	0.871	0.871	0.0	0.0	0.717	0.729	2	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG00096	0.823	0.946	0.0	0.0	0.357	0.373	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG00268	0.903	1.037	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG00419	0.625	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG00759	0.626	0.719	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG01051	0.608	0.699	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG01112	0.689	0.792	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG01500	0.66	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG01565	0.725	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG01583	0.835	0.959	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG01595	0.639	0.734	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG01879	0.632	0.726	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG02568	0.838	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG02922	0.534	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG03006	0.688	0.791	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG03052	0.604	0.694	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG03642	0.695	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	HG03742	0.701	0.806	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA12878	0.928	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA18525	0.924	1.063	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA18939	0.598	0.687	0.006	0.0	0.889	0.889	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA19017	0.49	0.563	0.012	0.0	0.249	0.261	8	1
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA19238	0.852	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA19239	0.812	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA19625	0.825	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA19648	0.767	0.881	0.0	0.0	0.714	0.759	1	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA20502	0.864	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	84360420	84360714	DEL	295	NA20845	0.68	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG00096	0.68	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG00268	0.307	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG00419	0.665	0.765	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG00759	0.398	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG01051	0.451	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG01112	0.3	0.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG01500	0.73	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG01565	0.383	0.44	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG01583	0.62	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG01595	0.348	0.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG01879	0.544	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG02568	0.381	0.438	0.0	0.01	0.402	0.402	2	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG02922	0.288	0.331	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG03006	0.476	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG03642	0.527	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	HG03742	0.455	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA12878	0.557	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA18525	0.488	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA18939	0.387	0.445	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA19017	0.272	0.313	0.0	0.039	0.8	0.836	1	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA19238	0.56	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA19239	0.457	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA19625	0.525	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA19648	0.569	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA20502	0.568	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	8539845	8539895	DEL	51	NA20845	0.425	0.489	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG00096	0.877	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG00268	1.005	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG00419	1.089	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG00759	1.232	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG01051	0.843	0.774	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG01112	1.307	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG01500	0.834	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG01565	0.966	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG01583	0.906	0.831	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG01595	1.142	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG01879	0.895	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG02568	0.724	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG02922	1.336	1.226	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG03006	1.164	1.068	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG03052	1.021	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG03642	1.246	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	HG03742	0.91	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA12878	0.86	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA18525	1.047	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA18939	0.985	0.904	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA19017	0.672	0.616	0.0	0.016	0.556	0.554	2	1
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA19238	0.941	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA19239	1.135	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA19625	1.025	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA19648	0.841	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA20502	1.16	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	85950378	85950429	DEL	52	NA20845	0.871	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG00096	0.25	0.264	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG00268	0.46	0.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG00419	0.484	0.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG00759	0.417	0.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG01051	0.51	0.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG01112	0.813	0.855	0.0	0.216	nan	nan	0	0
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG01500	0.348	0.366	0.004	0.094	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG01565	0.423	0.445	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG01583	0.358	0.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG01595	0.271	0.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG01879	0.281	0.296	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG02568	0.552	0.581	0.0	0.216	nan	nan	0	0
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG02922	0.185	0.195	0.009	0.089	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG03006	0.318	0.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG03052	0.188	0.197	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG03642	0.312	0.328	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	HG03742	0.36	0.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA12878	0.337	0.355	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA18525	0.872	0.918	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA18939	0.211	0.222	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA19017	0.091	0.096	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA19238	0.712	0.75	0.0	0.0	1.0	0.971	1	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA19239	0.317	0.334	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA19625	0.125	0.132	0.0	0.126	nan	nan	0	1
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA19648	0.322	0.338	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA20502	0.477	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87066353	87066535	DEL	183	NA20845	0.553	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG00096	0.877	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG00268	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG00419	1.21	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG00759	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG01051	1.412	1.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG01112	0.618	0.6	0.0	0.017	0.684	0.684	1	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG01500	0.469	0.456	0.0	0.02	1.0	0.958	1	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG01565	1.248	1.212	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG01583	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG01595	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG01879	0.825	0.801	0.0	0.02	0.958	0.958	2	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG02568	0.571	0.555	0.0	0.025	0.786	0.786	2	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG02922	1.233	1.197	0.0	0.0	0.84	0.788	1	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG03006	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG03052	0.688	0.667	0.0	0.015	0.537	0.537	2	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG03642	1.366	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	HG03742	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA12878	0.81	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA18525	1.047	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA18939	0.58	0.563	0.0	0.014	0.611	0.611	1	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA19017	0.545	0.529	0.0	0.028	0.917	0.958	1	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA19238	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA19239	0.622	0.603	0.0	0.015	0.696	0.717	1	1
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA19625	1.55	1.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA19648	1.435	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA20502	1.228	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	87095092	87095152	DEL	61	NA20845	0.616	0.598	0.0	0.018	0.5	0.538	1	1
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG00096	0.716	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG00268	0.732	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG00419	1.17	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG00759	0.891	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG01051	0.785	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG01112	0.724	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG01500	0.66	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG01565	0.604	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG01583	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG01595	0.929	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG01879	0.755	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG02568	0.99	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG02922	0.781	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG03006	0.776	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG03052	0.521	0.579	0.0	0.043	0.724	0.724	1	1
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG03642	1.318	1.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	HG03742	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA12878	0.86	0.956	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA18525	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA18939	0.818	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA19017	0.871	0.968	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA19238	0.42	0.466	0.0	0.027	0.619	0.637	1	1
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA19239	0.926	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA19625	0.825	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA19648	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA20502	0.614	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	88925680	88925753	DEL	74	NA20845	0.871	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG00096	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG00268	0.92	0.893	0.003	0.0	1.0	0.96	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG00419	0.988	0.959	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG00759	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG01051	0.843	0.819	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG01112	0.848	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG01500	0.382	0.371	0.057	0.035	nan	nan	0	1
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG01565	1.087	1.056	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG01583	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG01595	0.387	0.376	0.069	0.035	nan	nan	0	1
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG01879	0.825	0.801	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG02568	0.381	0.37	0.092	0.046	nan	nan	0	1
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG02922	0.473	0.459	0.08	0.034	nan	nan	0	1
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG03006	0.935	0.908	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG03052	0.896	0.87	0.0	0.0	0.37	0.37	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG03642	0.911	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	HG03742	1.08	1.049	0.0	0.0	0.903	0.903	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA12878	1.012	0.983	0.0	0.0	0.903	0.944	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA18525	0.855	0.83	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA18939	0.457	0.444	0.106	0.036	nan	nan	0	1
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA19017	0.98	0.952	0.0	0.0	0.745	0.755	2	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA19238	0.394	0.383	0.084	0.048	nan	nan	0	1
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA19239	0.926	0.899	0.0	0.0	0.841	0.817	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA19625	0.6	0.583	0.03	0.023	nan	nan	0	1
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA19648	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA20502	0.932	0.905	0.007	0.0	0.45	0.475	1	2
chr4	90427882	90428681	DEL	800	NA20845	1.084	1.052	0.0	0.0	0.952	0.884	1	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG00096	1.002	0.936	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG00268	0.851	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG00419	1.028	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG00759	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG01051	1.314	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG01112	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG01500	1.303	1.218	0.0	0.0	0.714	0.745	1	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG01565	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG01583	1.073	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG01595	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG01879	1.316	1.23	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG02568	0.724	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG02922	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG03006	1.076	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG03052	0.938	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG03642	0.887	0.829	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	HG03742	1.289	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA12878	0.877	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA18525	0.75	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA18939	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA19017	0.399	0.373	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA19238	1.094	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA19239	0.964	0.901	0.0	0.0	0.971	0.999	1	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA19625	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA19648	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA20502	0.955	0.893	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr4	92420775	92420881	DEL	107	NA20845	0.893	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG00096	0.573	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG00268	0.647	0.605	0.0	0.0	0.537	0.559	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG00419	0.363	0.339	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG00759	0.265	0.248	0.0	0.033	0.775	0.775	2	1
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG01051	0.51	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG01112	0.468	0.437	0.0	0.003	0.393	0.393	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG01500	0.747	0.698	0.0	0.0	0.273	0.261	1	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG01565	0.765	0.715	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG01583	0.382	0.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG01595	0.736	0.687	0.0	0.0	0.345	0.345	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG01879	0.825	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG02568	0.305	0.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG02922	0.863	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG03006	0.626	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG03052	0.365	0.341	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG03642	0.288	0.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	HG03742	0.682	0.638	0.0	0.0	0.288	0.288	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA12878	0.658	0.615	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA18525	0.802	0.75	0.0	0.0	0.469	0.469	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA18939	0.281	0.263	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA19017	0.29	0.271	0.0	0.0	0.89	0.851	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA19238	0.865	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA19239	0.406	0.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA19625	0.35	0.327	0.0	0.0	0.727	0.727	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA19648	0.42	0.393	0.0	0.0	0.714	0.759	2	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA20502	0.455	0.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	94044040	94044095	DEL	56	NA20845	0.701	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG00096	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG00268	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG00419	1.049	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG00759	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG01051	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG01112	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG01500	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG01565	0.644	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG01583	1.145	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG01595	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG01879	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG02568	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG02922	0.493	0.493	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG03006	0.829	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG03052	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG03642	1.342	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	HG03742	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA12878	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA18525	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA18939	0.967	0.967	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA19017	1.071	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA19238	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA19239	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA19625	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA19648	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA20502	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95370285	95370389	DEL	105	NA20845	1.19	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG00096	1.163	1.129	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG00268	0.971	0.942	0.0	0.0	0.871	0.862	3	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG00419	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG00759	1.081	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG01051	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG01112	1.095	1.063	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG01500	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG01565	1.127	1.095	0.0	0.0	0.813	0.813	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG01583	1.24	1.204	0.006	0.0	0.676	0.676	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG01595	0.987	0.958	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG01879	1.088	1.056	0.0	0.0	0.786	0.786	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG02568	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG02922	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG03006	1.059	1.028	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG03052	0.854	0.829	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG03642	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	HG03742	1.109	1.076	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA12878	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA18525	1.047	1.016	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA18939	1.266	1.229	0.0	0.0	0.831	0.831	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA19017	1.017	0.987	0.005	0.0	0.928	0.887	4	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA19238	1.145	1.111	0.0	0.0	0.961	0.989	1	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA19239	1.015	0.985	0.0	0.0	0.877	0.877	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA19625	0.475	0.461	0.047	0.036	nan	nan	0	1
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA19648	0.965	0.937	0.005	0.0	0.772	0.772	2	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA20502	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	95637741	95638660	DEL	920	NA20845	1.126	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG00096	0.662	0.607	0.011	0.08	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG00268	1.141	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG00419	1.069	0.981	0.008	0.002	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG00759	0.531	0.487	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG01051	0.687	0.63	0.008	0.068	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG01112	1.307	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG01500	0.956	0.877	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG01565	1.349	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG01583	1.145	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG01595	0.0	0.0	0.009	0.185	nan	nan	0	0
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG01879	1.685	1.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG02568	1.029	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG02922	0.596	0.547	0.0	0.054	0.0	0.0	1	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG03006	0.512	0.469	0.007	0.093	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG03052	0.375	0.344	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG03642	0.767	0.704	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	HG03742	0.455	0.417	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA12878	0.675	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA18525	1.291	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA18939	0.545	0.5	0.006	0.076	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA19017	0.726	0.666	0.007	0.061	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA19238	1.132	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA19239	1.167	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA19625	0.475	0.436	0.006	0.075	nan	nan	0	1
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA19648	1.261	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA20502	1.0	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	96382454	96382660	DEL	207	NA20845	0.425	0.39	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG00096	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG00268	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG00419	0.706	0.685	0.0	0.023	0.5	0.5	1	1
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG01051	0.922	0.895	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG01112	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG01500	1.234	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG01565	1.228	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG01583	1.288	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG01595	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG01879	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG02568	1.448	1.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG02922	0.945	0.918	0.0	0.0	0.533	0.5	1	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG03006	0.776	0.754	0.0	0.023	0.462	0.462	1	1
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG03052	1.167	1.133	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG03642	0.911	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	HG03742	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA12878	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA18525	0.994	0.965	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA18939	0.686	0.666	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA19017	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA19238	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA19239	1.104	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA19625	0.725	0.704	0.0	0.0	0.688	0.688	2	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA19648	1.014	0.985	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA20502	0.796	0.773	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr4	97396874	97396946	DEL	73	NA20845	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG00096	0.358	0.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG00268	0.187	0.197	0.0	0.003	0.444	0.463	3	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG00419	0.222	0.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG00759	0.455	0.479	0.0	0.0	0.462	0.462	3	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG01051	0.177	0.186	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG01112	0.318	0.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG01500	0.678	0.713	0.0	0.0	0.227	0.237	2	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG01565	0.383	0.403	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG01583	0.191	0.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG01595	0.232	0.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG01879	0.298	0.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG02568	0.343	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG02922	0.185	0.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG03006	0.388	0.409	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG03052	0.104	0.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG03642	0.192	0.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	HG03742	0.246	0.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA12878	0.405	0.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA18525	0.611	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA18939	0.387	0.407	0.0	0.0	0.25	0.25	3	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA19017	0.381	0.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA19238	0.382	0.402	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA19239	0.228	0.24	0.0	0.041	0.211	0.217	5	1
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA19625	0.275	0.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA19648	0.272	0.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA20502	0.227	0.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr4	99176976	99177194	DEL	219	NA20845	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG00096	0.704	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG00268	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG00419	1.216	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG00759	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG01051	0.941	0.914	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG01112	0.717	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG01500	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG01565	0.835	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG01583	0.933	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG01595	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG01879	1.072	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG02568	0.87	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG02922	1.267	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG03006	1.09	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG03052	0.778	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG03642	1.183	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	HG03742	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA12878	0.794	0.771	0.005	0.004	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA18525	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA18939	0.691	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA19017	0.442	0.429	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA19238	0.971	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA19239	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA19625	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA19648	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA20502	0.912	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102198719	102198887	DEL	169	NA20845	0.625	0.607	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG00096	0.713	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG00268	1.065	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG00419	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG00759	0.543	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG01051	1.021	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG01112	0.987	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG01500	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG01565	0.957	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG01583	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG01595	1.167	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG01879	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG02568	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG02922	1.039	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG03006	0.876	0.922	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG03052	1.219	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG03642	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	HG03742	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA12878	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA18525	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA18939	0.992	1.044	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA19017	0.829	0.873	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA19238	0.919	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.214	nan	nan	0	0
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA19625	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA19648	1.02	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA20502	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	102323937	102324096	DEL	160	NA20845	1.143	1.203	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG00096	0.37	0.37	0.0	0.03	0.653	0.653	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG00268	0.722	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG00419	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG00759	0.368	0.368	0.0	0.062	0.798	0.84	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG01051	0.28	0.28	0.0	0.056	0.722	0.722	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG01500	1.043	1.043	0.0	0.0	0.71	0.742	1	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG01565	0.692	0.692	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG01583	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG01595	0.317	0.317	0.0	0.053	0.855	0.905	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	0
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG02568	0.794	0.794	0.0	0.008	0.444	0.444	3	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	0
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG03052	0.273	0.273	0.0	0.053	0.75	0.75	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG03642	0.296	0.296	0.0	0.017	0.712	0.712	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	HG03742	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA12878	0.794	0.794	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA18525	0.366	0.366	0.0	0.046	0.799	0.799	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA18939	0.531	0.531	0.0	0.058	0.654	0.654	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA19017	0.276	0.276	0.0	0.053	0.938	0.937	1	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA19239	0.449	0.449	0.0	0.032	0.78	0.78	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA19625	0.553	0.553	0.0	0.056	0.487	0.487	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA19648	0.398	0.398	0.0	0.057	0.635	0.635	2	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA20502	0.433	0.433	0.0	0.027	0.545	0.545	1	1
chr5	104877052	104877141	DEL	90	NA20845	0.776	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG00096	0.0	0.0	0.026	0.182	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG00268	0.395	0.439	0.012	0.073	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG00419	0.405	0.45	0.028	0.057	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG00759	0.717	0.797	0.0	0.0	0.621	0.623	2	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG01051	0.0	0.0	0.007	0.087	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG01112	0.0	0.0	0.037	0.101	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG01500	0.0	0.0	0.016	0.126	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG01565	0.0	0.0	0.055	0.121	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG01583	0.0	0.0	0.017	0.111	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG01595	0.0	0.0	0.025	0.159	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG01879	0.589	0.655	0.013	0.043	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG02568	0.34	0.378	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG02922	0.0	0.0	0.015	0.089	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG03006	0.375	0.417	0.008	0.047	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG03052	0.568	0.631	0.0	0.0	0.861	0.908	2	2
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG03642	0.37	0.411	0.015	0.044	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	HG03742	0.0	0.0	0.011	0.094	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.102	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA18525	0.0	0.0	0.017	0.176	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA18939	0.0	0.0	0.017	0.138	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA19017	0.497	0.553	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA19238	0.414	0.46	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA19239	0.308	0.342	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA19625	0.0	0.0	0.017	0.145	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA19648	0.0	0.0	0.012	0.093	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA20502	0.0	0.0	0.009	0.163	nan	nan	0	0
chr5	10574959	10575294	DEL	336	NA20845	0.41	0.455	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG00096	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG00268	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG00419	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG00759	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG01051	1.342	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG01112	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG01500	1.096	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG01565	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG01583	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG01595	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG01879	0.295	0.295	0.0	0.075	0.68	0.68	1	1
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG02568	0.681	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG02922	1.278	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG03006	0.608	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG03052	0.736	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG03642	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	HG03742	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA12878	0.946	0.946	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA18525	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA18939	1.39	1.39	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA19017	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA19238	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA19239	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA19625	1.157	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA19648	0.995	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA20502	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	105861515	105861608	DEL	94	NA20845	0.604	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG00096	0.992	0.992	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG00268	0.842	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG00419	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG00759	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG01051	0.661	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG01112	0.52	0.52	0.0	0.0	0.643	0.611	1	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG01500	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG01565	0.692	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG01583	1.076	1.076	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG01595	0.871	0.871	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG01879	0.393	0.393	0.0	0.04	1.0	1.0	1	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG02568	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG02922	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG03006	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG03052	0.631	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG03642	0.715	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	HG03742	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA12878	0.743	0.743	0.0	0.003	0.682	0.682	1	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA18525	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA18939	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA19017	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA19238	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA19648	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA20502	0.809	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106081772	106081845	DUP	74	NA20845	0.927	0.927	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG00096	1.173	1.138	0.005	0.003	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG00268	1.134	1.101	0.0	0.0	0.794	0.794	1	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG00419	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG00759	1.202	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG01051	1.322	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG01112	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG01500	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG01565	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG01583	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG01595	1.128	1.095	0.005	0.0	0.864	0.816	1	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG01879	1.018	0.988	0.0	0.0	0.676	0.676	1	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG02568	1.096	1.064	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG02922	0.956	0.928	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG03006	1.18	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG03052	0.715	0.694	0.022	0.065	nan	nan	0	1
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG03642	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	HG03742	1.17	1.136	0.0	0.0	0.968	0.984	1	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA12878	1.014	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA18525	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA18939	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA19017	1.216	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA19238	1.217	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA19239	1.065	1.034	0.0	0.0	0.724	0.724	2	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA19625	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA19648	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA20502	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106396217	106396759	DEL	543	NA20845	1.057	1.026	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG00096	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG00268	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG00419	1.256	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG00759	0.795	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG01051	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG01112	0.413	0.413	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG01500	0.937	0.937	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG01565	0.305	0.305	0.057	0.069	nan	nan	0	1
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG01583	0.526	0.526	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG01595	0.356	0.356	0.011	0.119	nan	nan	0	1
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG01879	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG02568	0.681	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG02922	1.184	1.184	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG03006	0.465	0.465	0.02	0.128	nan	nan	0	1
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG03052	0.841	0.841	0.0	0.0	0.889	0.842	1	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG03642	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	HG03742	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA12878	1.031	1.031	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA18525	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA18939	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA19017	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA19238	1.048	1.048	0.0	0.0	0.66	0.66	1	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA19239	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA19625	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA19648	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA20502	1.049	1.049	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	106970171	106970553	DEL	383	NA20845	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG00096	1.01	0.981	0.0	0.0	0.619	0.619	3	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG00268	1.082	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG00419	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG00759	1.124	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG01051	1.241	1.205	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG01112	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG01500	0.672	0.652	0.07	0.041	nan	nan	0	1
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG01565	0.957	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG01583	1.148	1.114	0.0	0.0	0.576	0.576	3	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG01595	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG01879	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG02568	1.021	0.991	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG02922	1.226	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG03006	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG03052	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG03642	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	HG03742	1.151	1.117	0.0	0.0	0.656	0.625	3	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA12878	0.794	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA18525	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA18939	0.939	0.911	0.0	0.0	0.816	0.816	3	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA19017	0.976	0.948	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA19238	0.997	0.967	0.0	0.0	0.854	0.854	1	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA19239	1.09	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA19625	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA19648	0.522	0.507	0.063	0.031	nan	nan	0	1
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA20502	1.003	0.974	0.0	0.0	0.522	0.522	3	2
chr5	107198488	107199331	DEL	844	NA20845	1.272	1.235	0.005	0.0	0.792	0.792	3	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG00096	0.451	0.475	0.013	0.092	nan	nan	0	1
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG00268	0.498	0.525	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG00419	1.135	1.194	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG00759	0.814	0.857	0.0	0.0	0.842	0.8	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG01051	0.701	0.738	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG01112	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG01500	1.034	1.089	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG01565	0.0	0.0	0.069	0.153	nan	nan	0	0
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG01583	0.861	0.906	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG01595	0.989	1.041	0.0	0.0	0.918	0.867	2	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG01879	0.947	0.996	0.0	0.0	0.825	0.825	2	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG02568	1.285	1.353	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG02922	0.499	0.525	0.01	0.063	nan	nan	0	1
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG03006	1.001	1.054	0.0	0.0	0.654	0.685	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG03052	1.114	1.173	0.0	0.0	0.76	0.72	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG03642	0.37	0.389	0.017	0.079	nan	nan	0	1
chr5	10756185	10756522	DEL	338	HG03742	0.499	0.525	0.013	0.111	nan	nan	0	1
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA12878	0.541	0.569	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA18525	0.741	0.78	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA18939	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA19017	0.451	0.475	0.007	0.106	nan	nan	0	1
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA19238	0.984	1.035	0.0	0.0	0.725	0.725	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA19239	0.949	0.999	0.0	0.0	0.61	0.61	1	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA19625	1.308	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA19648	1.094	1.152	0.0	0.0	0.675	0.675	2	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA20502	1.003	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	10756185	10756522	DEL	338	NA20845	0.819	0.863	0.0	0.0	0.353	0.353	1	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG00096	0.776	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG00268	0.79	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG00419	0.831	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG00759	1.027	0.934	0.0	0.0	0.963	0.915	1	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG01051	1.241	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG01112	0.933	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG01500	1.043	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG01565	0.937	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG01583	0.646	0.587	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG01595	0.871	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG01879	0.393	0.357	0.0	0.062	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG02568	0.681	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG02922	0.852	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG03006	0.661	0.601	0.0	0.0	0.905	0.864	1	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG03052	0.378	0.344	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG03642	0.616	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	HG03742	0.767	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA12878	0.777	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA18525	1.221	1.11	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA18939	1.063	0.966	0.0	0.0	0.694	0.694	1	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA19017	0.737	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA19238	0.466	0.424	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA19239	0.385	0.35	0.0	0.062	0.304	0.304	1	1
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA19625	0.704	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA19648	0.721	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA20502	0.821	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	107668727	107668869	DEL	143	NA20845	0.863	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG00096	0.902	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG00268	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG00419	0.932	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG00759	0.426	0.474	0.0	0.016	0.95	1.0	1	1
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG01051	0.721	0.801	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG01112	0.664	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG01500	0.619	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG01565	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG01583	0.933	1.036	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG01595	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG01879	0.625	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG02568	1.096	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG02922	0.956	1.062	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG03006	0.608	0.675	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG03052	0.441	0.491	0.0	0.025	0.542	0.572	1	1
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG03642	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	HG03742	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA12878	0.743	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA18525	1.064	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA18939	0.319	0.354	0.0	0.041	0.762	0.762	1	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA19017	1.05	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA19238	0.388	0.431	0.0	0.019	0.861	0.861	1	1
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA19239	0.359	0.399	0.0	0.028	0.9	0.9	1	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA19625	0.931	1.034	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA19648	0.373	0.414	0.0	0.017	0.938	0.938	1	1
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA20502	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109280556	109280611	DEL	56	NA20845	0.69	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG00096	1.209	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG00268	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG00419	0.831	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG00759	1.376	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG01051	1.382	1.341	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG01112	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG01500	1.273	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG01565	1.141	1.107	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG01583	1.076	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG01595	1.088	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG01879	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG02568	0.87	0.844	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG02922	1.143	1.109	0.0	0.004	0.81	0.81	1	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG03006	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG03052	1.009	0.98	0.0	0.004	0.769	0.729	1	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG03642	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	HG03742	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA12878	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA18525	1.186	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA18939	1.098	1.066	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA19017	0.59	0.572	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA19238	1.178	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA19239	1.27	1.233	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA19625	1.258	1.221	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA19648	1.467	1.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA20502	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	109664943	109665189	DEL	247	NA20845	1.316	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG00096	0.0	0.0	0.038	0.231	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG00268	0.0	0.0	0.016	0.208	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG00419	0.0	0.0	0.044	0.164	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG00759	0.0	0.0	0.004	0.176	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG01051	0.0	0.0	0.01	0.16	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG01112	0.0	0.0	0.029	0.205	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG01500	0.0	0.0	0.048	0.229	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG01565	0.0	0.0	0.039	0.148	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG01583	0.0	0.0	0.054	0.142	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG01595	0.0	0.0	0.013	0.146	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG01879	0.0	0.0	0.027	0.158	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG02568	0.0	0.0	0.018	0.105	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG02922	0.665	0.645	0.005	0.054	nan	nan	0	2
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG03006	0.0	0.0	0.039	0.17	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG03052	0.0	0.0	0.042	0.181	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG03642	0.0	0.0	0.013	0.203	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	HG03742	0.0	0.0	0.033	0.18	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA12878	0.574	0.558	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA18525	0.0	0.0	0.023	0.146	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA18939	0.0	0.0	0.009	0.243	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA19017	0.553	0.537	0.0	0.075	nan	nan	0	2
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA19238	0.647	0.628	0.004	0.07	nan	nan	0	2
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA19239	0.0	0.0	0.012	0.18	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA19625	0.0	0.0	0.033	0.182	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.187	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA20502	0.0	0.0	0.028	0.173	nan	nan	0	0
chr5	110694944	110695264	DEL	321	NA20845	0.0	0.0	0.028	0.085	nan	nan	0	0
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG00096	1.173	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG00268	0.756	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG00419	0.426	0.398	0.0	0.02	0.522	0.522	1	1
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG00759	1.182	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG01051	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG01112	0.7	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG01500	0.92	0.859	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG01565	1.12	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG01583	1.196	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG01595	0.989	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG01879	1.25	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG02568	0.529	0.495	0.0	0.073	0.619	0.619	1	1
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG02922	1.184	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG03006	0.447	0.418	0.007	0.038	0.92	0.878	1	1
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG03052	0.883	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG03642	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	HG03742	0.805	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA12878	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA18525	0.436	0.407	0.0	0.023	0.812	0.812	1	1
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA18939	1.098	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA19017	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA19238	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA19239	0.526	0.492	0.0	0.024	0.562	0.562	1	1
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA19625	0.578	0.541	0.0	0.055	0.667	0.667	1	1
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA19648	1.268	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA20502	1.14	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	111413284	111413350	DEL	67	NA20845	0.604	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG00096	0.415	0.437	0.059	0.067	nan	nan	0	1
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG00268	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG00419	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG00759	0.969	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG01051	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG01112	0.771	0.812	0.0	0.002	0.499	0.525	2	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG01500	0.866	0.912	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG01565	0.937	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG01583	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG01595	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG01879	0.75	0.79	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG02568	0.945	0.995	0.0	0.0	0.762	0.762	2	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG02922	0.976	1.028	0.0	0.0	0.506	0.506	2	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG03006	0.34	0.357	0.103	0.115	nan	nan	0	1
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG03052	0.946	0.996	0.0	0.0	0.808	0.853	2	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG03642	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	HG03742	0.997	1.05	0.0	0.0	0.812	0.774	1	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA12878	0.456	0.48	0.041	0.088	nan	nan	0	1
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA18525	1.029	1.083	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA18939	0.992	1.044	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA19017	0.792	0.834	0.0	0.002	0.644	0.644	2	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA19238	0.997	1.049	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA19239	1.09	1.148	0.0	0.0	0.811	0.811	2	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA19625	0.729	0.768	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA19648	1.045	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA20502	1.071	1.128	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	112477737	112478297	DEL	561	NA20845	1.014	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG00096	0.686	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG00268	0.945	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG00419	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG00759	0.543	0.571	0.0	0.0	0.857	0.814	1	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG01051	0.981	1.033	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG01112	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG01500	0.866	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG01565	0.652	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG01583	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG01595	0.594	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG01879	0.589	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG02568	0.945	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG02922	0.935	0.984	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG03006	0.626	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG03052	0.715	0.752	0.0	0.0	0.947	0.898	1	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG03642	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	HG03742	0.518	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA12878	0.693	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA18525	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA18939	0.815	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA19017	0.405	0.427	0.0	0.063	0.238	0.238	1	1
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA19238	0.802	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA19239	0.795	0.837	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA19625	0.88	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA19648	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA20502	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	113995887	113996139	DEL	253	NA20845	0.819	0.863	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG00096	0.631	0.631	0.018	0.0	0.4	0.4	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG00268	0.962	0.962	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG00419	0.648	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG00759	1.202	1.202	0.0	0.0	0.926	0.975	1	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG01051	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG01112	0.0	0.0	0.151	0.0	nan	nan	0	0
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG01500	0.973	0.973	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG01565	0.53	0.53	0.058	0.0	0.44	0.467	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG01583	0.526	0.526	0.026	0.004	0.381	0.381	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG01595	0.495	0.495	0.034	0.0	0.31	0.329	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG01879	0.875	0.875	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG02568	0.643	0.643	0.011	0.0	nan	nan	0	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG02922	0.54	0.54	0.015	0.0	0.4	0.4	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG03006	0.518	0.518	0.025	0.0	0.452	0.473	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG03052	0.399	0.399	0.055	0.0	0.364	0.384	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG03642	0.937	0.937	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	HG03742	0.345	0.345	0.047	0.013	0.846	0.888	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA12878	0.558	0.558	0.01	0.0	0.621	0.621	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA18939	0.584	0.584	0.012	0.003	0.436	0.436	3	1
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA19017	0.718	0.718	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA19238	0.867	0.867	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA19239	0.879	0.879	0.0	0.005	0.967	0.967	1	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA19625	0.817	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA19648	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA20502	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	114969401	114969875	DEL	475	NA20845	0.388	0.388	0.048	0.0	0.4	0.4	3	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG00096	0.0	0.0	0.039	0.236	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG00268	0.481	0.506	0.025	0.101	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG00419	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.235	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG01051	0.0	0.0	0.015	0.178	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.238	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG01500	0.46	0.484	0.023	0.104	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG01565	0.0	0.0	0.028	0.214	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG01583	0.383	0.403	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG01595	0.475	0.5	0.042	0.101	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG01879	0.0	0.0	0.026	0.235	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG02922	0.0	0.0	0.014	0.253	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG03006	0.0	0.0	0.066	0.27	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG03052	0.0	0.0	0.057	0.222	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG03642	0.0	0.0	0.025	0.205	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	HG03742	0.0	0.0	0.05	0.252	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA12878	0.473	0.498	0.0	0.101	nan	nan	0	2
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA18525	1.029	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA18939	0.0	0.0	0.061	0.224	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA19017	0.0	0.0	0.022	0.274	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA19239	0.0	0.0	0.004	0.207	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA19625	0.0	0.0	0.018	0.127	nan	nan	0	1
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA19648	0.0	0.0	0.051	0.262	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA20502	0.0	0.0	0.027	0.293	nan	nan	0	0
chr5	115130457	115130806	DEL	350	NA20845	0.0	0.0	0.075	0.177	nan	nan	0	0
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG00096	0.938	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG00268	1.151	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG00419	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG00759	1.318	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG01051	0.861	0.805	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG01112	1.238	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG01500	0.654	0.611	0.069	0.064	nan	nan	0	1
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG01565	1.018	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG01583	0.861	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG01595	1.029	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG01879	1.375	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG02568	1.248	1.166	0.01	0.0	0.733	0.733	1	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG02922	1.371	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG03006	1.233	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG03052	0.967	0.904	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG03642	0.986	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	HG03742	1.4	1.308	0.0	0.0	0.897	0.855	3	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA12878	1.098	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA18525	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA18939	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA19017	0.995	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA19238	1.307	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA19239	1.257	1.175	0.0	0.0	0.898	0.898	3	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA19625	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA19648	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA20502	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	116755975	116756544	DEL	570	NA20845	0.927	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG00096	1.119	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG00268	1.168	1.092	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG00419	1.175	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG00759	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG01051	1.241	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG01112	1.274	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG01500	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG01565	1.67	1.561	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG01583	1.267	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG01595	0.989	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG01879	1.286	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG02568	1.096	1.025	0.0	0.007	0.941	0.941	1	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG02922	0.727	0.679	0.032	0.032	nan	nan	0	1
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG03006	1.233	1.153	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG03052	1.261	1.179	0.0	0.0	0.931	0.882	1	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG03642	1.331	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	HG03742	1.151	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA12878	0.912	0.853	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA18525	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA18939	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA19017	1.234	1.154	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA19238	1.087	1.016	0.0	0.0	0.804	0.804	1	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA19239	1.257	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA19625	1.434	1.34	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA19648	1.094	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA20502	1.39	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117708290	117708885	DEL	596	NA20845	1.316	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG00096	0.794	0.836	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG00268	0.55	0.579	0.014	0.08	nan	nan	0	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG00419	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG00759	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG01051	1.181	1.244	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG01112	0.915	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG01500	0.866	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG01565	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG01583	0.454	0.478	0.02	0.069	0.2	0.2	2	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG01595	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG01879	0.679	0.714	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG02568	0.302	0.318	0.041	0.051	nan	nan	0	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG02922	0.872	0.918	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG03006	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG03052	0.883	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG03642	0.567	0.597	0.009	0.102	nan	nan	0	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	HG03742	0.518	0.545	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA12878	0.524	0.551	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA18525	0.872	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA18939	0.815	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA19017	1.087	1.144	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA19238	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA19239	0.487	0.513	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA19625	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA19648	0.473	0.497	0.0	0.12	0.632	0.632	1	1
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA20502	1.049	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	117868219	117868529	DEL	311	NA20845	0.992	1.044	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG00096	0.974	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG00268	1.031	0.963	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG00419	0.993	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG00759	1.008	0.942	0.0	0.0	0.893	0.94	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG01051	1.041	0.973	0.0	0.0	0.684	0.684	2	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG01112	0.789	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG01500	1.043	0.975	0.0	0.0	0.769	0.804	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG01565	0.937	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG01583	1.004	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG01595	0.95	0.888	0.0	0.0	0.778	0.735	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG01879	0.893	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG02568	0.529	0.495	0.057	0.04	nan	nan	0	1
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG02922	0.436	0.408	0.026	0.026	nan	nan	0	1
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG03006	0.983	0.919	0.005	0.0	0.866	0.863	2	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG03052	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG03642	1.282	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	HG03742	1.246	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA12878	0.963	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA18525	1.064	0.994	0.0	0.0	0.974	0.974	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA18939	1.045	0.976	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA19017	0.368	0.344	0.07	0.081	nan	nan	0	1
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA19238	0.544	0.508	0.022	0.039	nan	nan	0	1
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA19239	0.449	0.42	0.047	0.05	nan	nan	0	1
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA19625	1.107	1.034	0.008	0.0	0.423	0.423	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA19648	1.194	1.116	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA20502	1.071	1.001	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr5	119910221	119910853	DEL	633	NA20845	0.927	0.867	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG00096	1.028	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG00268	1.048	0.98	0.003	0.0	0.903	0.903	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG00419	1.236	1.155	0.0	0.0	0.853	0.853	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG00759	0.93	0.87	0.0	0.0	0.723	0.725	2	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG01051	1.081	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG01112	1.058	0.989	0.0	0.0	0.76	0.8	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG01500	1.043	0.975	0.0	0.0	0.852	0.891	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG01565	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG01583	1.148	1.073	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG01595	1.108	1.036	0.0	0.0	0.379	0.358	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG01879	1.179	1.102	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG02568	0.87	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG02922	0.976	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG03006	1.144	1.069	0.0	0.0	0.966	0.989	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG03052	1.114	1.041	0.0	0.0	0.565	0.535	3	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG03642	1.331	1.244	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	HG03742	1.17	1.093	0.0	0.0	0.855	0.815	2	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA12878	0.963	0.9	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA18525	1.151	1.076	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA18939	0.921	0.861	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA19017	1.161	1.085	0.0	0.0	0.665	0.665	2	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA19238	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA19239	1.09	1.019	0.0	0.0	0.892	0.892	1	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA19625	1.132	1.058	0.005	0.0	0.686	0.686	2	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA19648	0.522	0.488	0.076	0.054	nan	nan	0	1
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA20502	1.049	0.98	0.0	0.0	0.562	0.562	2	2
chr5	120595540	120596507	DEL	968	NA20845	0.927	0.867	0.0	0.0	0.642	0.642	2	2
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG00096	0.0	0.0	0.354	0.251	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG00268	0.0	0.0	0.204	0.149	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG00419	0.446	0.433	0.05	0.033	nan	nan	0	1
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG00759	0.601	0.583	0.055	0.035	nan	nan	0	1
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG01051	0.02	0.019	0.256	0.197	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG01112	0.0	0.0	0.309	0.193	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG01500	0.0	0.0	0.203	0.126	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG01565	0.0	0.0	0.312	0.203	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG01583	0.0	0.0	0.366	0.23	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG01595	0.495	0.48	0.052	0.034	nan	nan	0	1
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG01879	0.0	0.0	0.212	0.161	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG02568	0.0	0.0	0.279	0.18	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG02922	0.0	0.0	0.251	0.169	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG03006	0.0	0.0	0.198	0.158	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG03052	0.526	0.51	0.059	0.039	nan	nan	0	1
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG03642	0.666	0.646	0.028	0.015	nan	nan	0	2
chr5	121059232	121060007	DEL	776	HG03742	0.69	0.67	0.044	0.025	nan	nan	0	1
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA12878	0.0	0.0	0.195	0.149	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA18525	0.0	0.0	0.281	0.182	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA18939	0.0	0.0	0.246	0.187	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA19017	0.0	0.0	0.345	0.217	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA19238	0.0	0.0	0.399	0.243	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA19239	0.0	0.0	0.416	0.243	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA19625	0.0	0.0	0.189	0.126	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA19648	0.0	0.0	0.205	0.141	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA20502	0.0	0.0	0.28	0.204	nan	nan	0	0
chr5	121059232	121060007	DEL	776	NA20845	0.561	0.544	0.044	0.027	nan	nan	0	1
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG00096	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG00268	0.893	0.867	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG00419	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG00759	1.357	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG01051	0.741	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG01112	0.915	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG01500	0.884	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG01565	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG01595	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	HG03006	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	NA12878	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	NA18939	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	NA19017	0.903	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	NA19648	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	NA20502	1.003	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	121095024	121095112	DUP	89	NA20845	0.949	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG00096	0.74	0.672	0.0	0.017	0.462	0.462	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG00268	1.581	1.437	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG00759	0.892	0.811	0.005	0.046	0.784	0.826	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG01051	0.521	0.473	0.0	0.027	0.935	0.935	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG01112	0.7	0.636	0.0	0.032	1.0	0.95	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG01500	1.273	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG01565	1.263	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG01583	0.598	0.543	0.0	0.016	0.789	0.789	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG01595	0.574	0.522	0.0	0.033	0.871	0.823	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG01879	0.804	0.731	0.0	0.023	0.74	0.74	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG02568	0.454	0.412	0.0	0.026	0.429	0.429	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG03006	0.679	0.617	0.0	0.024	0.838	0.878	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG03052	1.514	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG03642	0.592	0.538	0.0	0.004	0.609	0.609	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA12878	0.811	0.737	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA18525	0.453	0.412	0.0	0.024	0.903	0.903	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA18939	0.035	0.032	0.0	0.049	0.029	0.029	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA19017	0.7	0.636	0.0	0.035	0.651	0.651	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA19238	0.582	0.529	0.0	0.028	1.0	1.0	1	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA19625	1.258	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA19648	1.368	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr5	122723707	122723763	DEL	57	NA20845	0.669	0.608	0.0	0.014	0.9	0.9	1	1
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG00096	1.064	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG00268	1.168	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG00419	1.094	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG00759	1.124	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG01051	1.482	1.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG01112	0.951	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG01500	1.079	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG01565	1.161	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG01583	1.028	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG01595	1.088	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG01879	1.215	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG02568	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG02922	1.08	1.2	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG03006	1.269	1.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG03052	1.387	1.542	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG03642	1.06	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	HG03742	1.17	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA12878	0.845	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA18525	0.994	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA18939	1.027	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA19238	1.113	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA19239	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA19625	1.207	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA19648	1.069	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA20502	1.117	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	125286790	125286846	DUP	57	NA20845	0.906	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG00096	0.0	0.0	0.061	0.215	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG00268	0.0	0.0	0.113	0.274	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG00419	0.0	0.0	0.176	0.308	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG00759	0.0	0.0	0.111	0.172	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG01051	0.421	0.467	0.053	0.062	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG01112	0.628	0.698	0.0	0.0	0.818	0.861	1	2
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG01500	0.248	0.275	0.045	0.053	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG01565	0.0	0.0	0.074	0.149	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG01583	0.0	0.0	0.085	0.225	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG01595	0.0	0.0	0.103	0.272	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG01879	0.0	0.0	0.046	0.183	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG02568	0.0	0.0	0.04	0.171	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG02922	0.0	0.0	0.045	0.144	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG03006	0.0	0.0	0.092	0.191	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG03052	0.0	0.0	0.105	0.262	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG03642	0.616	0.685	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr5	126458368	126458811	DEL	444	HG03742	0.0	0.0	0.039	0.17	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA12878	0.355	0.394	0.0	0.075	0.833	0.833	1	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA18525	0.453	0.504	0.028	0.072	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA18939	0.0	0.0	0.089	0.245	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA19017	0.424	0.471	0.017	0.049	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA19238	0.466	0.518	0.004	0.069	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA19239	0.5	0.556	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA19625	0.453	0.503	0.018	0.031	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA19648	0.0	0.0	0.061	0.197	nan	nan	0	0
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA20502	0.501	0.557	0.028	0.09	nan	nan	0	1
chr5	126458368	126458811	DEL	444	NA20845	0.259	0.288	0.036	0.067	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG00096	0.505	0.532	0.084	0.045	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG00268	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG00419	1.013	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG00759	0.523	0.551	0.099	0.058	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG01051	0.0	0.0	0.15	0.12	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG01112	0.0	0.0	0.146	0.094	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG01500	0.513	0.54	0.071	0.039	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG01565	0.0	0.0	0.166	0.138	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG01583	0.43	0.453	0.049	0.036	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG01595	0.801	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG01879	0.0	0.0	0.134	0.06	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG02568	0.416	0.438	0.047	0.042	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG02922	0.0	0.0	0.258	0.141	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG03006	0.804	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG03052	0.399	0.42	0.086	0.062	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG03642	0.468	0.493	0.034	0.034	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	HG03742	0.0	0.0	0.202	0.136	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA12878	0.0	0.0	0.243	0.14	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA18525	0.506	0.532	0.062	0.043	nan	nan	0	1
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA18939	0.0	0.0	0.179	0.141	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA19017	0.0	0.0	0.205	0.123	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA19238	0.984	1.035	0.0	0.0	0.914	0.914	1	2
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA19239	0.924	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA19625	0.0	0.0	0.236	0.159	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA19648	0.0	0.0	0.22	0.13	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA20502	0.0	0.0	0.233	0.146	nan	nan	0	0
chr5	127172319	127173286	DEL	968	NA20845	0.453	0.477	0.062	0.047	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG00096	0.523	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG00268	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG00419	0.952	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG00759	0.407	0.452	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG01500	0.513	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG01583	0.43	0.478	0.0	0.009	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG01595	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG02568	0.491	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG03006	0.751	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG03052	0.441	0.491	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG03642	0.493	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA18525	0.488	0.542	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA19238	0.971	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA19239	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	127172367	127172679	DEL	313	NA20845	0.496	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG00096	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG00268	1.014	0.947	0.0	0.0	0.703	0.703	3	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG00419	0.0	0.0	0.279	0.164	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG00759	1.124	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG01051	1.001	0.936	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG01112	1.076	1.006	0.0	0.0	0.944	0.897	1	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG01500	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG01565	0.591	0.552	0.06	0.036	0.219	0.233	2	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG01583	0.43	0.402	0.097	0.029	0.294	0.294	1	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG01595	0.0	0.0	0.224	0.124	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG01879	0.0	0.0	0.259	0.13	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG02568	0.491	0.459	0.086	0.043	nan	nan	0	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG02922	0.0	0.0	0.292	0.16	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG03006	0.554	0.518	0.073	0.041	nan	nan	0	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG03052	1.009	0.943	0.0	0.0	0.619	0.586	3	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG03642	0.394	0.369	0.055	0.04	nan	nan	0	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	HG03742	0.0	0.0	0.253	0.163	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA12878	0.473	0.442	0.072	0.029	nan	nan	0	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA18525	0.0	0.0	0.303	0.134	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA18939	1.045	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA19017	0.995	0.93	0.003	0.0	0.714	0.714	1	2
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA19238	0.0	0.0	0.484	0.23	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA19239	0.539	0.504	0.122	0.067	0.378	0.378	1	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA19625	0.377	0.353	0.098	0.052	nan	nan	0	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA19648	0.423	0.395	0.133	0.075	0.5	0.5	1	1
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA20502	0.0	0.0	0.328	0.158	nan	nan	0	0
chr5	127335985	127336914	DEL	930	NA20845	0.97	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG00096	0.686	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG00419	1.094	1.023	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG00759	0.853	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG01051	0.521	0.487	0.0	0.034	0.64	0.64	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG01500	0.477	0.446	0.0	0.028	0.552	0.577	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG01565	0.835	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG01583	0.0	0.0	0.011	0.022	nan	nan	0	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG01595	0.712	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG01879	0.5	0.467	0.0	0.027	0.941	0.941	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG02568	0.756	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG02922	0.499	0.466	0.0	0.004	0.19	0.19	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG03006	0.411	0.384	0.0	0.026	0.84	0.88	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG03052	0.925	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr5	12769656	12769710	DEL	55	HG03742	0.307	0.287	0.0	0.009	0.789	0.752	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA18525	0.889	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA18939	0.832	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA19017	0.995	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA19238	0.789	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA19239	0.847	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA19625	0.252	0.235	0.0	0.012	1.0	1.0	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA19648	0.522	0.488	0.0	0.031	0.68	0.68	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA20502	0.615	0.575	0.0	0.018	0.429	0.429	1	1
chr5	12769656	12769710	DEL	55	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG00096	0.812	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG00268	1.203	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG00419	0.75	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG00759	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG01051	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG01112	0.628	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG01500	0.654	0.635	0.0	0.034	0.722	0.755	1	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG01565	0.957	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG01583	0.933	0.905	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG01595	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG01879	0.554	0.538	0.0	0.016	0.5	0.5	1	1
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG02568	0.491	0.477	0.0	0.026	0.7	0.7	1	1
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG02922	0.852	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG03006	1.305	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG03052	0.336	0.327	0.0	0.023	1.0	0.947	1	1
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG03642	0.715	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	HG03742	0.94	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA12878	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA18525	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA18939	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA19017	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA19238	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA19239	0.872	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA19625	0.981	0.952	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA19648	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	12967841	12967901	DEL	61	NA20845	0.819	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG00096	1.064	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG00268	0.722	0.674	0.0	0.03	0.304	0.304	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG00419	0.689	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG00759	0.698	0.652	0.0	0.032	0.588	0.619	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG01051	0.581	0.543	0.0	0.019	0.621	0.621	1	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG01112	1.112	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG01500	1.061	0.992	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG01565	0.509	0.476	0.0	0.035	0.65	0.691	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG01583	0.861	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG01879	1.018	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG02568	0.756	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG02922	1.267	1.184	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG03006	1.108	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG03052	1.135	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	HG03742	0.633	0.591	0.019	0.034	0.394	0.414	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA12878	0.541	0.505	0.0	0.03	0.656	0.656	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA18525	0.575	0.538	0.0	0.049	0.656	0.656	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA18939	0.62	0.579	0.008	0.042	0.611	0.611	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA19017	0.534	0.499	0.0	0.028	0.6	0.6	1	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA19238	0.44	0.411	0.0	0.032	0.575	0.575	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA19239	1.116	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA19625	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA19648	1.094	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA20502	0.57	0.533	0.0	0.048	0.636	0.636	1	1
chr5	130804188	130804274	DEL	87	NA20845	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG00096	0.776	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG00268	1.065	0.996	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG00419	0.892	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG00759	0.93	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG01051	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG01112	1.22	1.14	0.0	0.0	0.688	0.653	1	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG01500	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG01565	1.141	1.066	0.0	0.0	0.576	0.612	1	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG01583	1.004	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG01595	1.316	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG01879	1.036	0.968	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG02568	0.454	0.424	0.0	0.03	0.333	0.333	1	1
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG02922	1.101	1.029	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG03006	1.233	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG03052	0.925	0.864	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG03642	1.06	0.991	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	HG03742	1.342	1.254	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA12878	0.997	0.932	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA18525	0.959	0.896	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA18939	1.08	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA19017	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA19238	1.022	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA19239	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA19625	1.107	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA19648	1.343	1.255	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA20502	1.208	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13248037	13248126	DEL	90	NA20845	0.819	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	0
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG00268	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG00419	0.709	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG00759	0.62	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG01051	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG01112	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG01565	0.692	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG01583	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG01595	0.712	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG01879	0.411	0.432	0.0	0.028	0.708	0.708	1	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG02568	0.87	0.915	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG02922	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG03006	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	0
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG03642	0.814	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	HG03742	0.211	0.222	0.0	0.021	0.938	0.893	1	1
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA12878	0.22	0.231	0.0	0.045	0.778	0.778	1	1
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA18525	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA18939	0.531	0.559	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA19017	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA19238	0.427	0.45	0.0	0.037	0.744	0.744	1	1
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA19239	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA19625	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA19648	0.199	0.209	0.0	0.048	0.5	0.5	1	1
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA20502	1.049	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	13399958	13400032	DEL	75	NA20845	0.323	0.341	0.0	0.043	0.417	0.417	1	1
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG00096	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG00268	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG00419	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG00759	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG01051	1.161	1.161	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG01112	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG01500	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG01565	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG01583	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG01595	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG01879	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG02568	1.285	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG02922	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG03006	1.206	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG03052	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG03642	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	HG03742	1.007	1.007	0.006	0.004	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA12878	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA18525	1.046	1.046	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA18939	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA19017	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA19238	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA19239	0.526	0.526	0.0	0.046	0.547	0.547	1	1
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA19625	1.157	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA19648	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA20502	1.208	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	134044227	134044316	DEL	90	NA20845	1.208	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG00096	0.595	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG00268	0.67	0.705	0.005	0.0	0.532	0.532	2	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG00419	0.507	0.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG00759	0.582	0.612	0.0	0.0	0.674	0.71	2	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG01051	0.38	0.4	0.0	0.0	0.385	0.385	2	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG01112	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG01500	0.654	0.689	0.0	0.001	0.875	0.915	3	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG01565	0.57	0.6	0.0	0.0	0.667	0.627	3	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG01583	0.43	0.453	0.0	0.004	0.364	0.364	3	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG01595	0.376	0.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG01879	0.447	0.47	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG02568	0.378	0.398	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG02922	0.54	0.569	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG03006	0.59	0.621	0.0	0.0	0.776	0.813	4	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG03052	0.252	0.266	0.0	0.0	0.462	0.437	3	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG03642	0.37	0.389	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	HG03742	0.46	0.484	0.0	0.0	0.508	0.501	4	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA12878	0.71	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA18525	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA18939	0.443	0.466	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA19017	0.276	0.291	0.066	0.004	nan	nan	0	1
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA19238	0.634	0.668	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA19239	0.577	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA19625	0.327	0.344	0.0	0.0	0.545	0.545	3	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA19648	0.398	0.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA20502	0.365	0.384	0.0	0.0	0.697	0.697	4	2
chr5	137532488	137533399	DEL	912	NA20845	0.582	0.613	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG00096	0.307	0.323	0.0	0.01	1.0	1.0	7	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG00268	0.103	0.109	0.029	0.073	nan	nan	0	1
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG00419	0.365	0.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG00759	0.64	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG01051	0.4	0.422	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG01112	0.359	0.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG01500	0.407	0.428	0.0	0.0	0.444	0.425	1	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG01565	0.509	0.536	0.0	0.005	0.667	0.627	1	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG01583	0.383	0.403	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG01595	0.514	0.542	0.0	0.02	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG01879	0.179	0.188	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG02568	0.416	0.438	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG02922	0.374	0.394	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG03006	0.357	0.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG03052	0.336	0.354	0.0	0.0	0.2	0.189	2	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG03642	0.493	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	HG03742	0.441	0.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA12878	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA18525	0.575	0.606	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA18939	0.319	0.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA19017	0.092	0.097	0.014	0.074	nan	nan	0	1
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA19238	0.285	0.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA19239	0.487	0.513	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA19625	0.302	0.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA19648	0.473	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA20502	0.547	0.576	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr5	137607291	137607726	DEL	436	NA20845	0.108	0.114	0.051	0.047	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG00096	0.631	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG00268	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG00419	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG00759	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG01051	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG01112	0.771	0.771	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG01500	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG01565	0.611	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG01583	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG01595	0.673	0.673	0.0	0.0	0.476	0.45	1	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG01879	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG02568	0.718	0.718	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG02922	0.291	0.291	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG03006	0.536	0.536	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG03642	0.986	0.986	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	HG03742	0.748	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA12878	0.693	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA18939	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA19017	0.847	0.847	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA19238	0.699	0.699	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA19239	0.641	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA19625	1.056	1.056	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA19648	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA20502	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141308378	141308606	DEL	229	NA20845	0.798	0.798	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG00096	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG00268	0.842	0.886	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG00419	0.608	0.64	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG00759	0.562	0.592	0.0	0.0	0.438	0.461	1	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG01051	0.26	0.274	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG01112	0.233	0.245	0.015	0.117	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG01500	0.389	0.41	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG01565	0.855	0.9	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG01583	1.076	1.133	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG01595	0.693	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG01879	0.589	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG02568	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG02922	0.893	0.94	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG03006	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG03052	0.505	0.531	0.0	0.018	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG03642	0.419	0.441	0.007	0.098	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	HG03742	0.288	0.303	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA12878	0.456	0.48	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA18525	0.994	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA18939	0.354	0.373	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA19017	0.405	0.427	0.006	0.068	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA19238	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA19239	0.487	0.513	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA19625	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA19648	0.348	0.366	0.01	0.076	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA20502	0.251	0.264	0.01	0.055	nan	nan	0	1
chr5	141459200	141459505	DEL	306	NA20845	0.0	0.0	0.006	0.121	nan	nan	0	0
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG00096	1.227	1.147	0.0	0.0	0.711	0.711	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG00268	1.375	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG00419	0.567	0.53	0.008	0.084	nan	nan	0	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG00759	0.0	0.0	0.006	0.197	nan	nan	0	0
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG01051	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG01112	1.327	1.241	0.0	0.0	0.968	0.919	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG01500	1.256	1.173	0.0	0.0	0.814	0.851	2	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG01565	0.692	0.647	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG01583	0.311	0.291	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG01595	0.0	0.0	0.011	0.175	nan	nan	0	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG01879	1.143	1.068	0.0	0.0	0.744	0.744	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG02568	0.265	0.247	0.014	0.109	nan	nan	0	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG02922	1.101	1.029	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG03006	0.0	0.0	0.009	0.172	nan	nan	0	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG03052	1.093	1.022	0.006	0.002	0.562	0.594	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG03642	1.06	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	HG03742	1.131	1.057	0.0	0.0	0.867	0.825	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA12878	0.558	0.521	0.0	0.08	0.375	0.375	1	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA18525	0.942	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA18939	1.027	0.96	0.0	0.0	0.767	0.767	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA19017	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA19238	1.191	1.113	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA19239	1.09	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA19625	0.83	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA19648	1.219	1.139	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA20502	0.547	0.511	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr5	143080256	143080458	DEL	203	NA20845	0.582	0.544	0.005	0.08	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG00096	0.37	0.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG00268	0.309	0.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG00419	0.203	0.189	0.009	0.126	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG00759	0.271	0.254	0.0	0.155	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG01051	0.3	0.281	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG01112	0.413	0.386	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG01500	0.212	0.198	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG01565	0.305	0.286	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG01583	0.12	0.112	0.0	0.107	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG01595	0.218	0.203	0.0	0.173	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG01879	0.125	0.117	0.009	0.102	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG02568	0.34	0.318	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG02922	0.54	0.505	0.012	0.261	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG03006	0.089	0.084	0.0	0.127	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG03052	0.441	0.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG03642	0.567	0.53	0.0	0.253	nan	nan	0	0
chr5	143353634	143353809	DEL	176	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.274	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA12878	0.152	0.142	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA18525	0.314	0.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA18939	0.336	0.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA19017	0.35	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA19238	0.142	0.133	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA19239	0.282	0.264	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA19625	0.0	0.0	0.012	0.257	nan	nan	0	1
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA19648	0.298	0.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA20502	0.228	0.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143353634	143353809	DEL	176	NA20845	0.065	0.06	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG00096	1.082	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG00268	0.412	0.474	0.0	0.027	0.792	0.792	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG00419	0.344	0.396	0.0	0.038	1.0	1.0	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG00759	0.814	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG01051	0.941	1.082	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG01112	0.377	0.433	0.0	0.023	0.842	0.886	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG01500	0.407	0.467	0.0	0.037	0.8	0.836	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG01565	0.815	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG01583	0.693	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG01595	0.95	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG01879	0.911	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG02568	1.134	1.304	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG02922	0.499	0.573	0.0	0.041	0.889	0.889	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG03006	0.965	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG03052	0.841	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG03642	0.888	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	HG03742	0.422	0.485	0.0	0.045	0.846	0.806	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA12878	0.794	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA18525	0.366	0.421	0.0	0.016	0.783	0.783	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA18939	0.443	0.509	0.0	0.047	0.733	0.733	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA19017	0.958	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA19238	0.932	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA19239	1.013	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA19625	0.931	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA19648	0.671	0.772	0.0	0.01	0.29	0.29	1	1
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA20502	0.775	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	143666853	143666917	DEL	65	NA20845	0.841	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG00096	0.758	0.758	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG00268	0.0	0.0	0.242	0.18	nan	nan	0	0
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG00419	0.567	0.567	0.064	0.038	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG00759	0.795	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG01051	0.38	0.38	0.078	0.056	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG01112	0.43	0.43	0.084	0.058	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG01500	0.778	0.778	0.0	0.0	0.737	0.77	1	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG01565	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG01583	0.215	0.215	0.051	0.035	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG01595	0.633	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG01879	0.822	0.822	0.0	0.0	0.517	0.517	2	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG02568	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG02922	0.436	0.436	0.037	0.037	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG03006	0.286	0.286	0.092	0.054	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG03052	0.82	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG03642	0.394	0.394	0.057	0.034	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	HG03742	0.652	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA12878	0.372	0.372	0.102	0.06	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA18525	0.384	0.384	0.089	0.051	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA18939	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA19017	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA19238	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA19239	0.5	0.5	0.066	0.036	nan	nan	0	1
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA19625	1.132	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA19648	0.821	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA20502	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	144871903	144872807	DEL	905	NA20845	0.992	0.992	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG00096	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG00268	1.151	1.118	0.003	0.0	0.621	0.621	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG00419	0.851	0.826	0.0	0.0	0.786	0.786	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG00759	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG01051	0.901	0.875	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG01112	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG01500	1.026	0.996	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG01565	1.222	1.186	0.0	0.0	0.894	0.893	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG01583	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG01595	0.831	0.807	0.0	0.0	1.0	0.944	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG01879	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG02568	0.87	0.844	0.0	0.0	0.912	0.912	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG02922	0.374	0.363	0.051	0.022	0.273	0.273	7	1
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG03006	1.18	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG03052	0.967	0.939	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG03642	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	HG03742	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA12878	0.879	0.853	0.0	0.0	0.755	0.755	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA18525	1.011	0.982	0.0	0.0	0.78	0.78	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA18939	0.85	0.825	0.0	0.0	0.869	0.869	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA19017	0.976	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA19238	0.569	0.553	0.096	0.019	0.286	0.286	14	1
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA19239	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA19625	0.931	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA19648	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA20502	0.821	0.797	0.0	0.0	0.691	0.691	2	2
chr5	145792433	145793415	DEL	983	NA20845	1.402	1.361	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG00096	0.577	0.54	0.0	0.03	0.413	0.413	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG00268	1.048	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG00419	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG00759	0.485	0.453	0.0	0.033	0.741	0.78	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG01051	0.511	0.477	0.0	0.038	0.444	0.444	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG01112	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG01500	1.238	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG01565	1.263	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG01583	0.55	0.514	0.0	0.051	0.947	0.947	1	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG01595	0.613	0.573	0.0	0.045	0.467	0.494	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG01879	0.589	0.551	0.0	0.063	0.971	0.971	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG02568	0.718	0.671	0.0	0.045	0.5	0.5	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG02922	0.956	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG03006	0.59	0.551	0.0	0.067	0.812	0.851	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG03642	0.542	0.507	0.0	0.04	0.5	0.5	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	HG03742	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA18525	1.046	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA18939	1.204	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA19017	1.253	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA19238	0.647	0.605	0.0	0.045	0.623	0.623	1	1
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	0
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA19625	0.905	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA19648	0.995	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA20502	0.935	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146380181	146380256	DEL	76	NA20845	0.561	0.524	0.0	0.065	0.591	0.591	1	1
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG00096	0.0	0.0	0.08	0.173	nan	nan	0	0
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG00268	0.0	0.0	0.032	0.156	nan	nan	0	0
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG00419	0.588	0.549	0.059	0.086	nan	nan	0	1
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG00759	0.989	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG01051	1.021	0.954	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG01112	0.0	0.0	0.027	0.175	nan	nan	0	0
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG01500	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG01565	0.0	0.0	0.112	0.166	nan	nan	0	0
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG01583	0.383	0.358	0.009	0.031	nan	nan	0	1
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG01595	0.336	0.314	0.018	0.073	nan	nan	0	1
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG01879	0.839	0.785	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG02568	0.907	0.848	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG02922	0.519	0.485	0.03	0.059	nan	nan	0	1
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG03006	1.108	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG03052	0.883	0.825	0.007	0.0	0.947	1.0	1	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG03642	1.011	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	HG03742	1.093	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA12878	0.743	0.695	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA18525	1.064	0.994	0.0	0.0	0.561	0.561	1	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA18939	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA19017	0.461	0.43	0.005	0.026	nan	nan	0	1
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA19238	0.0	0.0	0.015	0.22	nan	nan	0	0
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA19239	0.0	0.0	0.018	0.201	nan	nan	0	0
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA19625	0.377	0.353	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA19648	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA20502	0.843	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	146622654	146623087	DEL	434	NA20845	0.0	0.0	0.116	0.205	nan	nan	0	0
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG00096	0.361	0.35	0.0	0.071	0.385	0.385	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG00268	0.481	0.467	0.0	0.049	0.459	0.459	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG00419	0.385	0.374	0.0	0.061	0.391	0.391	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG00759	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG01051	0.481	0.467	0.0	0.048	0.276	0.276	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.177	nan	nan	0	0
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG01500	0.849	0.824	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG01565	0.713	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG01583	0.478	0.464	0.0	0.045	0.375	0.375	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG01595	0.791	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG01879	1.0	0.971	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG02568	0.832	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG02922	0.312	0.303	0.0	0.074	0.875	0.875	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG03006	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG03052	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG03642	0.419	0.407	0.0	0.068	0.625	0.625	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	HG03742	0.499	0.484	0.0	0.064	0.4	0.42	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA12878	1.047	1.017	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA18525	0.854	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA19017	0.608	0.59	0.0	0.072	0.386	0.386	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA19238	0.505	0.49	0.0	0.077	0.783	0.783	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA19239	0.398	0.386	0.0	0.062	0.725	0.725	1	1
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA19625	0.78	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA19648	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA20502	0.935	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148385841	148385940	DEL	100	NA20845	0.173	0.168	0.0	0.049	0.833	0.833	1	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG00268	0.189	0.239	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG00419	0.182	0.231	0.006	0.089	0.429	0.429	2	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG00759	0.174	0.221	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG01051	0.12	0.152	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG01112	0.753	0.954	0.0	0.208	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG01500	0.601	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG01565	0.163	0.206	0.0	0.097	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG01583	0.215	0.272	0.009	0.089	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG01595	0.059	0.075	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG01879	0.232	0.294	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG02568	0.718	0.909	0.0	0.198	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG02922	0.644	0.815	0.0	0.174	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG03006	0.214	0.271	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG03052	0.0	0.0	0.006	0.193	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG03642	0.099	0.125	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	HG03742	0.058	0.073	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA12878	0.186	0.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA18525	0.174	0.221	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA18939	0.761	0.964	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA19017	0.0	0.0	0.007	0.185	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA19238	0.136	0.172	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.184	nan	nan	0	0
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.195	nan	nan	0	0
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA19648	0.224	0.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA20502	0.205	0.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148401433	148401591	DEL	159	NA20845	0.604	0.764	0.005	0.178	nan	nan	0	1
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG00096	1.443	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG00268	1.392	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG00419	1.216	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG00759	1.415	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG01051	1.322	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG01112	0.61	0.56	0.0	0.048	0.824	0.867	1	1
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG01500	1.397	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG01565	1.385	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG01583	1.076	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG01595	0.97	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG01879	0.589	0.541	0.0	0.045	0.846	0.846	1	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG02568	0.794	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG02922	1.163	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG03006	1.644	1.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG03052	1.177	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG03642	1.257	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	HG03742	1.208	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA12878	1.301	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA18525	1.29	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA18939	0.956	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA19017	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA19238	0.569	0.522	0.0	0.039	0.688	0.688	1	1
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA19239	1.026	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA19625	1.081	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA19648	1.318	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA20502	1.664	1.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148571155	148571243	DEL	89	NA20845	1.186	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG00096	1.01	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG00268	1.134	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG00759	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG01051	1.141	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG01112	0.987	0.922	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG01500	0.778	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG01565	1.079	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG01583	1.076	1.006	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG01595	0.989	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG01879	1.107	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG02568	1.096	1.025	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG02922	1.246	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG03006	1.108	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG03052	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG03642	1.109	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	HG03742	0.94	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA12878	0.676	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA18525	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA18939	0.567	0.53	0.014	0.056	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA19017	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA19238	0.932	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA19239	1.18	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA19625	1.509	1.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA19648	0.945	0.883	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA20502	1.368	1.278	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr5	148706623	148706863	DUP	241	NA20845	1.359	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG00096	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG00268	0.876	0.876	0.0	0.0	0.673	0.673	2	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG00419	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG00759	0.795	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG01051	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG01112	0.807	0.807	0.0	0.0	0.661	0.628	2	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG01500	0.796	0.796	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG01565	0.0	0.0	0.14	0.237	nan	nan	0	0
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG01583	0.933	0.933	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG01595	0.594	0.594	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG01879	0.464	0.464	0.013	0.136	nan	nan	0	1
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG02568	1.361	1.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG02922	1.039	1.039	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG03006	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG03642	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	HG03742	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA12878	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA18525	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA18939	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA19017	1.032	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA19238	0.453	0.453	0.004	0.097	nan	nan	0	1
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA19239	0.731	0.731	0.0	0.0	0.897	0.897	2	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA19625	0.805	0.805	0.0	0.0	0.788	0.788	2	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA19648	0.423	0.423	0.027	0.054	nan	nan	0	1
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA20502	0.684	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149441747	149442173	DEL	427	NA20845	0.733	0.733	0.0	0.006	0.92	0.92	2	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG00096	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG00268	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG00419	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG00759	0.523	0.551	0.0	0.025	0.8	0.842	1	1
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG01051	0.751	0.79	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG01112	0.52	0.548	0.0	0.043	0.667	0.702	1	1
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG01500	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG01565	0.631	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG01583	0.574	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG01595	1.009	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG01879	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG02568	1.021	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG02922	0.623	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG03006	0.608	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG03052	0.315	0.332	0.0	0.029	0.789	0.833	1	1
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG03642	0.937	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	HG03742	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA12878	0.676	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA18525	0.628	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA18939	0.46	0.485	0.0	0.017	0.485	0.485	1	1
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA19017	0.424	0.446	0.0	0.02	0.76	0.76	1	1
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA19238	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA19239	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA19625	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA19648	0.746	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA20502	0.866	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149640665	149640734	DEL	70	NA20845	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG00096	0.668	0.742	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG00268	1.091	1.212	0.0	0.0	0.553	0.553	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG00419	0.75	0.833	0.0	0.0	0.348	0.348	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG00759	0.698	0.775	0.0	0.0	0.933	0.982	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG01051	0.34	0.378	0.0	0.033	0.824	0.824	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG01112	0.556	0.618	0.0	0.0	0.833	0.877	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG01500	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG01565	0.57	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG01583	0.753	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG01595	0.554	0.616	0.0	0.0	0.643	0.681	2	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG01879	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG02568	0.87	0.966	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG02922	0.582	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG03006	0.608	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG03052	0.61	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG03642	0.727	0.808	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	HG03742	0.786	0.874	0.0	0.0	0.8	0.84	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA12878	0.811	0.901	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA18525	0.488	0.542	0.0	0.035	0.84	0.84	3	1
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA18939	0.354	0.394	0.0	0.01	0.75	0.75	3	1
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA19017	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA19238	0.893	0.992	0.0	0.0	0.906	0.906	1	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA19239	0.436	0.485	0.0	0.032	0.645	0.645	3	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA19625	0.377	0.419	0.0	0.042	0.692	0.692	2	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA19648	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA20502	1.003	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	149686594	149686651	DEL	58	NA20845	0.755	0.839	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG00096	0.451	0.422	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG00268	1.46	1.365	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG00419	0.466	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG00759	0.0	0.0	0.011	0.119	nan	nan	0	1
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG01051	1.021	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG01112	0.52	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG01500	0.513	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG01565	0.367	0.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG01595	0.613	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG01879	0.464	0.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG02922	0.457	0.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG03642	0.616	0.576	0.007	0.078	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	HG03742	1.304	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA12878	0.895	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA18939	1.381	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA19017	0.442	0.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA19238	0.608	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA19239	0.975	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA20502	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	150210002	150210129	DEL	128	NA20845	1.208	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG00096	1.263	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG00419	0.496	0.482	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG01051	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG01112	1.184	1.149	0.0	0.0	1.0	0.95	1	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG01500	1.043	1.013	0.0	0.0	0.636	0.609	1	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG01565	1.222	1.186	0.0	0.0	0.508	0.504	2	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG01583	1.375	1.335	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG01595	0.772	0.749	0.0	0.067	nan	nan	0	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG01879	0.982	0.954	0.0	0.0	0.925	0.925	2	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG02568	0.302	0.294	0.0	0.098	0.25	0.25	1	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG02922	1.35	1.311	0.0	0.0	0.577	0.577	2	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG03006	1.197	1.163	0.0	0.0	0.806	0.77	1	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG03052	1.24	1.204	0.0	0.0	0.936	0.98	2	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG03642	0.666	0.646	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	HG03742	1.304	1.266	0.0	0.0	0.907	0.907	2	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA12878	0.912	0.886	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA18939	0.425	0.413	0.0	0.109	0.15	0.15	1	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA19017	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA19238	0.738	0.716	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA19239	0.616	0.598	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA19625	1.081	1.05	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA19648	0.298	0.29	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA20502	1.345	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	151476232	151476363	DEL	132	NA20845	0.561	0.544	0.0	0.039	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG00096	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG00268	0.687	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG00419	0.952	0.952	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG00759	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG01051	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG01112	1.112	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG01500	0.433	0.433	0.0	0.023	0.875	0.915	1	1
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG01565	0.692	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG01583	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG01595	0.732	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG01879	0.839	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG02568	1.323	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG02922	0.893	0.893	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG03006	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG03052	0.82	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG03642	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	HG03742	0.575	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA12878	0.372	0.372	0.0	0.02	0.783	0.783	1	1
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA18525	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA18939	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA19017	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA19238	0.776	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA19239	0.462	0.462	0.0	0.026	0.826	0.826	1	1
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA19625	0.729	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA19648	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA20502	1.071	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	153092141	153092204	DEL	64	NA20845	0.776	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG01879	0.0	0.0	0.006	0.087	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG02568	0.038	0.04	0.0	0.081	0.231	0.231	1	1
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG03006	0.0	0.0	0.006	0.102	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA18939	0.124	0.13	0.0	0.054	0.812	0.812	1	1
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA19239	0.244	0.257	0.0	0.033	0.286	0.286	1	1
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA19625	0.0	0.0	0.011	0.054	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr5	154315917	154316002	DEL	86	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG00096	1.028	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG00268	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG00419	0.75	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG00759	1.182	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG01051	0.841	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG01112	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG01500	0.884	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG01565	0.957	0.895	0.0	0.0	0.857	0.911	1	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG01583	1.148	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG01879	0.964	0.901	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG02568	1.059	0.989	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG02922	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG03006	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG03052	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG03642	0.937	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	HG03742	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	NA12878	0.895	0.837	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	NA19017	0.847	0.792	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	NA19238	1.068	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	NA19239	1.078	1.007	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	NA19625	0.981	0.917	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	NA20502	0.729	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	154567822	154567899	DUP	78	NA20845	1.057	0.988	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG00096	1.137	1.137	0.0	0.0	0.719	0.719	1	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG00268	0.704	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG00419	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG00759	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG01051	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG01112	0.807	0.807	0.0	0.0	0.875	0.921	1	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG01500	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG01565	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG01583	0.909	0.909	0.011	0.0	0.6	0.6	1	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG01595	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG01879	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG02568	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG02922	1.163	1.163	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG03006	0.697	0.697	0.0	0.0	0.947	0.992	1	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG03052	0.505	0.505	0.009	0.036	0.955	0.904	1	1
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG03642	1.109	1.109	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	HG03742	0.748	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA12878	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA18525	1.116	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA18939	0.779	0.779	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA19017	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA19238	0.505	0.505	0.0	0.02	0.59	0.59	1	1
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA19239	0.795	0.795	0.0	0.003	0.605	0.605	1	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA19625	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA19648	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA20502	0.843	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1551130	1551191	DEL	62	NA20845	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG00096	0.668	0.648	0.06	0.03	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG00268	0.0	0.0	0.307	0.19	nan	nan	0	0
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG00419	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG00759	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG01051	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG01112	1.22	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG01500	0.513	0.498	0.082	0.05	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG01565	0.0	0.0	0.235	0.183	nan	nan	0	0
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG01583	0.598	0.58	0.104	0.047	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG01595	1.247	1.21	0.0	0.0	0.618	0.654	1	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG01879	0.527	0.512	0.128	0.091	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG02568	0.567	0.551	0.09	0.043	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG02922	0.0	0.0	0.349	0.207	nan	nan	0	0
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG03006	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG03052	0.61	0.592	0.071	0.041	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG03642	0.641	0.622	0.058	0.038	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	HG03742	0.499	0.484	0.086	0.05	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA12878	0.422	0.41	0.098	0.04	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA18525	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA18939	1.151	1.118	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA19017	0.553	0.537	0.07	0.038	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA19238	0.0	0.0	0.376	0.206	nan	nan	0	0
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA19239	0.539	0.523	0.087	0.056	nan	nan	0	1
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA19625	0.0	0.0	0.379	0.266	nan	nan	0	0
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA19648	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA20502	1.208	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	155311785	155312580	DEL	796	NA20845	0.518	0.503	0.105	0.058	nan	nan	0	1
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG00096	0.866	0.912	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG00268	0.911	0.959	0.0	0.0	0.461	0.461	2	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG00419	1.054	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG00759	0.368	0.388	0.043	0.025	0.529	0.557	1	1
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG01051	0.661	0.696	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG01112	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG01500	0.937	0.987	0.0	0.0	0.32	0.306	1	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG01565	0.631	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG01583	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG01595	0.554	0.583	0.037	0.018	nan	nan	0	1
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG01879	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG02568	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG02922	0.976	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG03006	0.822	0.865	0.0	0.0	0.842	0.882	1	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG03052	0.378	0.398	0.057	0.03	nan	nan	0	1
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG03642	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	HG03742	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA12878	0.963	1.014	0.0	0.0	0.799	0.799	2	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA18525	0.854	0.899	0.0	0.0	0.96	0.96	3	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA18939	0.939	0.988	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA19017	0.774	0.814	0.0	0.0	0.858	0.858	2	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA19238	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA19239	0.834	0.878	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA19625	0.981	1.033	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA19648	0.945	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA20502	0.843	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159022307	159022990	DEL	684	NA20845	0.906	0.953	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG00096	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG00268	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG00419	0.932	0.932	0.0	0.0	0.784	0.784	2	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG00759	0.911	0.911	0.0	0.0	0.417	0.439	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG01051	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG01112	1.022	1.022	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG01500	1.026	1.026	0.0	0.0	0.76	0.727	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG01565	1.059	1.059	0.0	0.002	0.875	0.824	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG01583	1.196	1.196	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG01595	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG01879	0.929	0.929	0.006	0.0	0.545	0.545	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG02568	0.416	0.416	0.098	0.064	nan	nan	0	1
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG02922	1.122	1.122	0.0	0.0	0.519	0.519	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG03006	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG03052	1.051	1.051	0.006	0.0	0.452	0.428	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG03642	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	HG03742	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA12878	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA18525	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA18939	0.974	0.974	0.0	0.0	0.433	0.433	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA19017	1.087	1.087	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA19238	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA19239	1.039	1.039	0.0	0.0	0.809	0.809	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA19625	1.107	1.107	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA19648	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA20502	0.98	0.98	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr5	159331217	159332072	DEL	856	NA20845	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG00096	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG00268	0.704	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG00419	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG00759	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG01051	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG01112	0.735	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG01500	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG01565	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG01583	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG01595	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG01879	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG02568	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG02922	1.35	1.35	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG03006	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG03052	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG03642	1.257	1.257	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	HG03742	0.978	0.978	0.0	0.0	0.735	0.772	1	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA12878	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA18525	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA18939	0.885	0.885	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA19017	1.216	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA19238	0.893	0.893	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA19239	0.462	0.462	0.015	0.036	nan	nan	0	1
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA19625	1.333	1.333	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA19648	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA20502	0.661	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159549319	159549782	DEL	464	NA20845	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG01565	1.018	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG01595	0.673	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG01879	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG02568	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG02922	1.143	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG03006	0.697	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG03052	1.324	1.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	HG03742	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	NA19017	0.866	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	NA19238	0.854	0.829	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	NA19239	0.847	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	159742556	159742662	DUP	107	NA19625	1.107	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG00096	1.317	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.11	nan	nan	0	0
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG00419	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG00759	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG01051	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG01112	0.466	0.466	0.005	0.04	0.731	0.769	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG01500	0.584	0.584	0.0	0.027	0.432	0.452	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG01565	0.754	0.754	0.0	0.048	0.562	0.598	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG01583	1.315	1.315	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG01595	0.633	0.633	0.0	0.047	0.594	0.629	1	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG01879	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG02568	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG02922	0.644	0.644	0.0	0.027	0.261	0.261	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG03006	0.554	0.554	0.0	0.046	0.613	0.642	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG03642	0.321	0.321	0.0	0.046	0.5	0.5	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	HG03742	0.518	0.518	0.0	0.045	0.417	0.438	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA12878	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA18525	0.889	0.889	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA18939	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA19017	0.461	0.461	0.0	0.034	0.519	0.519	1	1
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA19238	1.242	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA19239	1.193	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA19625	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA19648	1.268	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA20502	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	160414116	160414214	DEL	99	NA20845	1.208	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG00096	0.848	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG00268	0.893	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG00419	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG00759	0.775	0.753	0.0	0.0	0.75	0.712	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG01051	0.821	0.797	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG01112	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG01500	0.813	0.79	0.0	0.0	0.947	0.99	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG01565	0.754	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG01583	1.315	1.277	0.0	0.0	0.45	0.45	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG01595	0.989	0.961	0.0	0.0	0.808	0.763	2	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG01879	0.75	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG02568	0.794	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG02922	0.831	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG03006	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	0.765	0.807	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG03642	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	HG03742	0.757	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA12878	0.473	0.459	0.075	0.032	nan	nan	0	1
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA18525	0.994	0.965	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA18939	0.708	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA19017	0.847	0.823	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA19238	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA19239	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA19625	0.981	0.952	0.008	0.0	0.833	0.833	3	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA19648	0.846	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA20502	0.957	0.929	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr5	16124846	16125527	DEL	682	NA20845	0.669	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG00096	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG00268	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG00419	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG00759	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG01051	0.901	0.901	0.0	0.0	0.619	0.619	5	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG01112	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG01500	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG01565	0.978	0.978	0.0	0.0	0.783	0.737	2	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG01583	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG01595	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG01879	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG02568	0.567	0.567	0.061	0.034	nan	nan	0	1
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG02922	0.561	0.561	0.073	0.04	0.341	0.341	2	1
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG03006	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG03052	0.462	0.462	0.054	0.033	0.16	0.169	1	1
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG03642	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	HG03742	0.805	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA12878	0.76	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA18525	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA18939	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA19017	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA19238	0.505	0.505	0.095	0.05	0.32	0.32	1	1
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA19239	0.526	0.526	0.09	0.044	0.143	0.143	1	1
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA19625	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA19648	0.97	0.97	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA20502	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	16149982	16150892	DEL	911	NA20845	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG00096	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG00268	0.842	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG00419	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG00759	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG01051	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG01112	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG01500	1.317	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG01565	1.242	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG01583	0.956	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG01595	1.365	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG01879	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG02568	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG02922	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG03006	1.055	1.024	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG03052	0.946	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG03642	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	HG03742	1.227	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA12878	0.828	0.804	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA18525	0.854	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA18939	1.186	1.152	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA19017	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA19238	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA19239	0.872	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA19625	1.107	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA19648	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA20502	0.501	0.487	0.017	0.072	nan	nan	0	1
chr5	161558846	161559237	DEL	392	NA20845	0.884	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG00096	0.722	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG00268	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG00419	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG00759	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG01051	0.561	0.561	0.0	0.044	0.593	0.593	1	1
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG01112	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG01500	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG01565	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG01583	0.454	0.454	0.0	0.036	0.417	0.417	1	1
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG01595	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG01879	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG02568	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG02922	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG03006	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG03052	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG03642	0.444	0.444	0.0	0.032	0.5	0.5	1	1
chr5	165669666	165669745	DEL	80	HG03742	0.307	0.307	0.0	0.049	0.9	0.945	1	1
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA12878	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA18525	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA18939	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA19017	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA19238	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA19239	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA19625	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA19648	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA20502	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	165669666	165669745	DEL	80	NA20845	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG00096	0.415	0.437	0.0	0.0	0.675	0.675	4	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG00268	0.258	0.271	0.037	0.026	nan	nan	0	1
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG00419	0.689	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG00759	0.543	0.571	0.0	0.0	0.833	0.877	3	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG01051	0.4	0.422	0.0	0.0	0.725	0.725	2	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG01112	0.395	0.415	0.0	0.0	0.667	0.702	3	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG01500	0.212	0.223	0.087	0.06	nan	nan	0	1
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG01565	0.183	0.193	0.069	0.069	nan	nan	0	1
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG01583	0.287	0.302	0.082	0.034	nan	nan	0	1
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG01595	0.564	0.594	0.0	0.0	0.211	0.199	4	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG01879	0.554	0.583	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG02568	0.718	0.756	0.0	0.0	0.5	0.5	4	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG02922	0.125	0.131	0.088	0.064	nan	nan	0	1
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG03006	0.483	0.508	0.0	0.0	0.333	0.349	3	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG03052	0.547	0.575	0.0	0.0	0.571	0.541	5	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG03642	0.641	0.675	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	HG03742	0.422	0.444	0.0	0.0	0.624	0.655	6	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA12878	0.389	0.409	0.085	0.056	nan	nan	0	1
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA18525	0.715	0.753	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA18939	0.62	0.652	0.0	0.0	0.176	0.176	2	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA19017	0.755	0.795	0.0	0.0	0.857	0.857	5	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA19238	0.531	0.559	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA19239	0.667	0.702	0.004	0.0	0.775	0.775	4	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA19625	0.478	0.503	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA19648	0.696	0.733	0.009	0.0	0.143	0.143	1	2
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA20502	0.319	0.336	0.058	0.051	nan	nan	0	1
chr5	166402763	166403636	DEL	874	NA20845	0.431	0.454	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG00096	0.83	0.776	0.005	0.0	1.0	1.0	3	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG00268	0.868	0.811	0.0	0.0	0.778	0.778	4	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG00419	0.831	0.776	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG00759	1.182	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG01051	1.302	1.216	0.0	0.0	0.711	0.711	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG01112	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG01500	1.061	0.992	0.0	0.0	0.772	0.807	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG01565	0.978	0.914	0.0	0.0	0.724	0.682	3	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG01583	1.004	0.939	0.007	0.0	0.938	0.937	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG01595	1.059	0.989	0.0	0.0	0.717	0.678	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG01879	1.036	0.968	0.005	0.0	0.926	0.926	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG02568	0.888	0.83	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG02922	0.602	0.563	0.076	0.042	0.875	0.875	1	1
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG03006	1.09	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG03052	1.009	0.943	0.0	0.0	0.905	0.857	1	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG03642	1.183	1.106	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	HG03742	1.035	0.968	0.004	0.0	0.603	0.575	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA12878	0.693	0.647	0.0	0.0	1.0	1.0	5	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA18525	0.976	0.913	0.0	0.0	0.889	0.889	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA18939	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA19017	1.271	1.188	0.0	0.0	0.816	0.816	3	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA19238	0.841	0.786	0.0	0.0	0.649	0.649	4	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA19239	0.962	0.899	0.0	0.0	0.857	0.857	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA19625	1.031	0.964	0.0	0.0	0.716	0.716	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA19648	0.97	0.906	0.0	0.0	0.829	0.829	2	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA20502	0.821	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166858784	166859533	DEL	750	NA20845	0.992	0.927	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG00096	0.523	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG00268	0.653	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG00419	0.547	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG00759	0.833	0.926	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG01051	0.601	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG01112	0.0	0.0	0.008	0.081	nan	nan	0	1
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG01500	0.76	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG01565	0.815	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG01583	0.478	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG01595	0.317	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG01879	0.679	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG02568	0.643	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG02922	0.54	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG03006	0.804	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG03052	0.673	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG03642	0.616	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	HG03742	0.499	0.554	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA12878	0.355	0.394	0.0	0.02	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA18525	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA18939	0.761	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA19017	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA19238	0.841	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA19239	0.68	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA19625	0.327	0.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA19648	0.423	0.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA20502	0.593	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	166885257	166885410	DEL	154	NA20845	0.927	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG00096	0.92	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG00268	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG00419	0.993	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG00759	0.62	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG01051	1.161	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG01112	0.305	0.296	0.0	0.074	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG01500	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG01565	0.754	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG01583	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG01595	0.989	0.961	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG01879	0.268	0.26	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG02568	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG02922	0.997	0.968	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG03006	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG03052	1.114	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG03642	0.814	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	HG03742	0.633	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA12878	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA18525	0.837	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA18939	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA19017	0.442	0.429	0.0	0.065	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA19238	0.401	0.39	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA19239	0.269	0.262	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA19625	1.283	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA19648	0.87	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	168131200	168131346	DEL	147	NA20845	0.669	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG00268	0.378	0.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.093	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG01051	0.08	0.08	0.0	0.046	0.7	0.7	1	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG01500	0.424	0.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG01565	0.081	0.081	0.0	0.085	0.364	0.342	1	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG01583	0.096	0.096	0.0	0.057	0.4	0.4	1	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG01595	0.198	0.198	0.0	0.064	0.615	0.581	1	2
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG02568	0.076	0.076	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.097	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.132	0.042	0.039	1	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG03642	0.345	0.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170158817	170158906	DEL	90	HG03742	0.0	0.0	0.009	0.136	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA12878	0.152	0.152	0.0	0.052	0.812	0.812	1	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA19238	0.116	0.116	0.0	0.062	0.19	0.19	1	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA19239	0.167	0.167	0.0	0.068	0.167	0.167	1	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	1
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr5	170158817	170158906	DEL	90	NA20845	0.237	0.237	0.0	0.051	0.727	0.727	1	1
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG00096	0.704	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG00268	1.014	1.014	0.0	0.0	0.889	0.889	2	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG00419	0.446	0.446	0.029	0.016	0.222	0.222	1	1
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG00759	0.737	0.737	0.0	0.0	0.756	0.796	2	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG01051	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG01112	0.879	0.879	0.0	0.0	0.803	0.809	2	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG01500	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG01565	0.774	0.774	0.0	0.0	0.36	0.382	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG01583	0.861	0.861	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG01595	0.851	0.851	0.0	0.0	0.755	0.767	2	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG01879	0.804	0.804	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG02568	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG02922	1.039	1.039	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG03006	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	0.944	0.895	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG03642	0.888	0.888	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	HG03742	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA12878	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA18525	0.942	0.942	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA18939	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA19017	0.94	0.94	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA19238	0.854	0.854	0.0	0.0	0.821	0.821	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA19239	0.949	0.949	0.001	0.0	0.817	0.817	2	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA19625	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA19648	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA20502	0.889	0.889	0.004	0.0	0.842	0.842	1	2
chr5	170324358	170325104	DEL	747	NA20845	0.863	0.863	0.008	0.0	0.8	0.8	1	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG00096	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG00268	0.893	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG00419	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG00759	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG01051	0.641	0.674	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG01112	0.538	0.566	0.0	0.0	0.933	0.982	1	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG01500	0.601	0.633	0.017	0.027	nan	nan	0	1
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG01565	0.448	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG01583	0.502	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG01595	0.554	0.583	0.0	0.0	0.5	0.472	1	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG01879	0.607	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG02568	1.361	1.433	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG02922	0.312	0.328	0.008	0.041	nan	nan	0	1
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG03006	0.554	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG03052	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG03642	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	HG03742	0.844	0.888	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA12878	1.047	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA18525	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA18939	0.868	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA19017	0.847	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA19238	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA19239	0.731	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA19625	0.327	0.344	0.01	0.073	nan	nan	0	1
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA19648	0.572	0.602	0.004	0.073	nan	nan	0	1
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA20502	0.843	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173012311	173012654	DEL	344	NA20845	0.819	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG00096	0.74	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG00268	0.808	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG00419	0.892	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG00759	0.698	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG01051	0.681	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG01112	0.646	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG01500	0.725	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG01565	0.631	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG01583	1.004	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG01595	0.594	0.66	0.0	0.0	0.786	0.742	1	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG01879	0.268	0.298	0.093	0.064	nan	nan	0	1
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG02568	0.945	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG02922	0.831	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG03006	0.679	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG03052	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG03642	0.592	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	HG03742	0.671	0.746	0.0	0.0	0.632	0.663	1	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA12878	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA18525	0.872	0.969	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA18939	0.744	0.826	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA19017	0.774	0.86	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA19238	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA19239	0.77	0.855	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA19625	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA19648	0.796	0.884	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA20502	0.912	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173090368	173091238	DEL	871	NA20845	0.798	0.887	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG00096	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG00268	0.395	0.416	0.0	0.065	0.929	0.929	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG00419	0.324	0.341	0.0	0.045	0.583	0.583	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG01051	0.16	0.169	0.0	0.043	0.688	0.688	1	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG01112	0.305	0.321	0.0	0.055	0.85	0.895	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG01500	0.495	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG01565	0.224	0.236	0.0	0.02	0.5	0.531	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG01583	0.502	0.529	0.0	0.052	0.45	0.45	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG02568	0.34	0.358	0.0	0.056	0.636	0.636	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG02922	0.478	0.503	0.0	0.07	0.842	0.842	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG03052	0.757	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG03642	0.419	0.441	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.118	nan	nan	0	0
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA12878	0.811	0.854	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.128	nan	nan	0	0
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.118	nan	nan	0	0
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA19017	0.59	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA19238	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA19239	0.359	0.378	0.0	0.037	0.382	0.382	1	1
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA19625	0.352	0.371	0.0	0.057	0.6	0.6	1	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA19648	0.846	0.89	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA20502	0.729	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	173640442	173640535	DEL	94	NA20845	0.345	0.363	0.012	0.019	0.429	0.429	1	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG00096	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG00268	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG00419	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG00759	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG01051	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG01112	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG01500	0.902	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG01565	0.672	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG01583	0.885	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG01595	0.871	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG01879	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG02568	0.794	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG02922	0.769	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG03006	0.965	1.016	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG03052	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG03642	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	HG03742	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA12878	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA18525	0.75	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA18939	0.602	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA19017	0.995	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA19238	0.505	0.531	0.064	0.064	nan	nan	0	1
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA19239	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA19625	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA19648	0.945	0.995	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA20502	1.003	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	17669329	17670062	DEL	734	NA20845	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG00096	0.686	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG00268	0.704	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG00419	0.831	0.955	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG00759	0.717	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG01051	0.541	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG01112	0.466	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG01500	1.061	1.22	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG01565	0.611	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG01583	0.741	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG01595	0.495	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG01879	0.411	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG02568	0.87	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG02922	0.644	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG03006	0.733	0.842	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG03642	0.616	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	HG03742	0.575	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA12878	0.879	1.01	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA18525	0.68	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA18939	0.726	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA19017	0.663	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA19625	0.78	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA19648	0.846	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA20502	0.729	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	177845669	177845719	DUP	51	NA20845	0.863	0.992	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG00096	0.668	0.703	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG00268	0.275	0.289	0.06	0.0	0.333	0.333	14	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG00419	0.304	0.32	0.032	0.0	nan	nan	0	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG00759	0.698	0.735	0.0	0.0	0.229	0.241	6	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG01051	0.26	0.274	0.025	0.0	nan	nan	0	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG01112	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG01500	0.354	0.372	0.094	0.0	nan	nan	0	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG01565	0.672	0.707	0.0	0.0	0.295	0.314	6	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG01583	0.502	0.529	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG01595	0.198	0.208	0.043	0.0	0.25	0.265	2	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG01879	0.625	0.658	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG02568	0.0	0.0	0.168	0.0	nan	nan	0	0
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG02922	0.686	0.722	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG03006	0.572	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG03052	0.483	0.509	0.0	0.0	0.417	0.395	1	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG03642	0.197	0.208	0.066	0.0	nan	nan	0	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	HG03742	0.46	0.484	0.0	0.0	0.333	0.35	5	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA12878	0.743	0.782	0.0	0.0	0.706	0.706	3	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA18525	0.697	0.734	0.0	0.0	0.611	0.611	2	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA18939	0.549	0.578	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA19017	0.313	0.33	0.077	0.0	0.556	0.556	10	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA19238	0.686	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA19239	0.321	0.338	0.121	0.0	0.5	0.5	19	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA19625	0.365	0.384	0.091	0.0	nan	nan	0	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA19648	0.249	0.262	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA20502	0.296	0.312	0.108	0.009	nan	nan	0	1
chr5	178118291	178119255	DEL	965	NA20845	0.367	0.386	0.075	0.0	nan	nan	0	1
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG00096	0.83	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG00268	0.859	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG00419	0.365	0.419	0.018	0.022	nan	nan	0	1
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG00759	0.872	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG01051	0.461	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG01112	0.807	0.928	0.0	0.0	0.941	0.991	1	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG01500	0.69	0.793	0.007	0.007	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG01565	0.387	0.445	0.024	0.028	nan	nan	0	1
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG01583	0.813	0.934	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG01595	0.594	0.682	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG01879	0.643	0.739	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG02568	0.756	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG02922	0.893	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG03006	0.322	0.37	0.094	0.044	nan	nan	0	1
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG03052	0.841	0.967	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG03642	0.764	0.879	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	HG03742	0.748	0.86	0.0	0.0	0.737	0.774	1	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA12878	0.946	1.087	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA18525	0.401	0.461	0.071	0.03	nan	nan	0	1
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA18939	0.638	0.733	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA19017	0.645	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA19238	0.531	0.61	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA19239	0.641	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA19625	0.553	0.636	0.0	0.0	0.3	0.3	1	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA19648	0.846	0.972	0.0	0.0	0.771	0.771	2	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA20502	0.593	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	179713144	179713728	DEL	585	NA20845	0.776	0.892	0.005	0.0	0.692	0.692	1	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG00096	0.325	0.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG00419	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG00759	0.601	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG01051	0.941	0.941	0.0	0.0	0.591	0.591	1	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG01112	0.502	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG01500	0.477	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG01565	0.346	0.346	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG01583	0.813	0.813	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG01595	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG01879	0.464	0.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG02568	0.832	0.832	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG02922	0.872	0.872	0.0	0.004	0.8	0.8	1	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG03006	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG03052	0.547	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG03642	0.468	0.468	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	180379375	180380140	DEL	766	HG03742	0.997	0.997	0.0	0.006	0.704	0.739	1	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA12878	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA18939	0.549	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA19017	0.479	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA19238	0.401	0.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA19239	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA19625	1.081	1.081	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA19648	0.647	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA20502	0.821	0.821	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr5	180379375	180380140	DEL	766	NA20845	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG00096	0.74	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG00268	0.808	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG00419	0.851	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG00759	0.291	0.334	0.114	0.063	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG01051	0.0	0.0	0.269	0.188	nan	nan	0	0
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG01112	0.574	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG01500	0.672	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG01565	0.713	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG01583	0.43	0.495	0.037	0.027	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG01595	0.534	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG01879	0.286	0.328	0.084	0.051	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG02568	0.87	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG02922	0.374	0.43	0.07	0.042	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG03006	0.804	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG03052	0.0	0.0	0.212	0.134	nan	nan	0	0
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG03642	0.296	0.34	0.078	0.043	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	HG03742	0.307	0.353	0.046	0.035	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA12878	0.743	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA18525	0.889	1.022	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA18939	0.655	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA19017	0.387	0.445	0.086	0.066	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA19238	0.349	0.402	0.059	0.037	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA19239	0.0	0.0	0.247	0.169	nan	nan	0	0
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA19625	0.629	0.723	0.086	0.067	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA19648	0.821	0.943	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA20502	0.433	0.498	0.046	0.034	nan	nan	0	1
chr5	180569234	180569988	DEL	755	NA20845	0.367	0.421	0.087	0.04	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG00096	0.686	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG00268	0.619	0.601	0.0	0.0	0.48	0.48	3	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG00419	0.324	0.315	0.061	0.06	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG00759	0.349	0.339	0.042	0.08	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG01051	0.4	0.389	0.053	0.045	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG01112	0.717	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG01500	0.884	0.858	0.0	0.0	0.958	0.957	2	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG01565	0.754	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG01583	0.622	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG01595	0.0	0.0	0.174	0.164	nan	nan	0	0
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG01879	0.286	0.277	0.007	0.065	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG02568	0.302	0.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG02922	0.561	0.545	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG03006	0.322	0.312	0.083	0.083	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG03052	0.631	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG03642	0.592	0.574	0.033	0.034	0.429	0.429	1	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	HG03742	0.671	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA12878	0.676	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA18525	0.331	0.322	0.028	0.097	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA18939	0.85	0.825	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA19017	0.608	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA19238	0.388	0.377	0.002	0.081	nan	nan	0	1
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA19239	0.808	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA19625	0.604	0.586	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA19648	0.448	0.435	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA20502	0.707	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	19078543	19079032	DEL	490	NA20845	0.841	0.817	0.0	0.0	0.538	0.538	2	2
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG00096	0.541	0.57	0.029	0.032	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG00268	0.0	0.0	0.239	0.159	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG00419	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG00759	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG01051	0.0	0.0	0.113	0.138	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG01112	0.0	0.0	0.236	0.25	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG01500	0.0	0.0	0.24	0.162	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG01565	0.611	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG01583	0.478	0.503	0.062	0.036	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG01595	0.396	0.417	0.034	0.015	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG01879	0.0	0.0	0.16	0.166	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG02568	0.0	0.0	0.229	0.265	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG02922	0.457	0.481	0.066	0.043	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG03006	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG03052	0.0	0.0	0.261	0.209	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG03642	0.468	0.493	0.053	0.037	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	HG03742	0.0	0.0	0.274	0.219	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA12878	0.0	0.0	0.122	0.1	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA18525	0.436	0.459	0.053	0.058	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA18939	0.0	0.0	0.251	0.198	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA19017	0.0	0.0	0.313	0.225	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA19238	0.453	0.477	0.044	0.055	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA19239	0.0	0.0	0.177	0.212	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA19625	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA19648	0.522	0.55	0.084	0.058	nan	nan	0	1
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA20502	0.0	0.0	0.282	0.208	nan	nan	0	0
chr5	1924587	1925201	DEL	615	NA20845	0.0	0.0	0.32	0.213	nan	nan	0	0
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG00096	1.137	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG00268	0.808	0.784	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG00419	0.669	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG00759	1.047	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG01051	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG01112	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG01500	1.167	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG01565	1.365	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG01583	0.956	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG01595	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG01879	0.804	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG02568	1.134	1.101	0.0	0.023	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG02922	0.457	0.444	0.0	0.071	0.812	0.812	1	1
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG03006	1.108	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG03052	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG03642	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	HG03742	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA12878	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA18525	1.081	1.05	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA18939	1.186	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA19017	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA19238	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA19239	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA19625	1.182	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA19648	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA20502	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25528271	25528345	DEL	75	NA20845	1.186	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG00096	0.451	0.422	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG00268	1.289	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG00419	0.993	0.928	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG00759	1.202	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG01051	1.262	1.179	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG01112	1.004	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG01500	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG01565	0.448	0.419	0.006	0.045	0.19	0.202	8	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG01583	1.052	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG01595	0.851	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG01879	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG02568	1.361	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG02922	0.872	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG03006	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG03052	1.261	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG03642	0.542	0.507	0.0	0.03	0.176	0.176	8	1
chr5	25653044	25653266	DEL	223	HG03742	0.805	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA12878	0.963	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA18525	0.959	0.896	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA18939	1.151	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA19017	1.05	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA19238	1.165	1.089	0.0	0.0	0.725	0.725	1	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA19239	1.065	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA19625	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA19648	0.448	0.418	0.0	0.03	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA20502	1.049	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	25653044	25653266	DEL	223	NA20845	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG00096	1.055	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG00268	0.515	0.473	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG00419	1.216	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG00759	1.124	1.031	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG01051	0.561	0.514	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG01112	1.094	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG01500	1.441	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG01565	0.53	0.486	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG01583	1.1	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG01595	1.167	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG01879	1.161	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG02568	0.529	0.486	0.0	0.143	nan	nan	0	1
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG02922	1.059	0.972	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG03006	1.233	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG03052	1.03	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG03642	1.06	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	HG03742	1.323	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA12878	0.929	0.852	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA18525	1.099	1.008	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA18939	1.257	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA19017	1.142	1.048	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA19238	0.958	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA19239	1.232	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA19625	1.484	1.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA19648	1.119	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA20502	0.524	0.481	0.0	0.11	nan	nan	0	1
chr5	26119155	26119392	DEL	238	NA20845	1.38	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG00096	0.433	0.394	0.0	0.016	0.379	0.379	1	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG00419	0.648	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG00759	0.407	0.37	0.0	0.0	0.409	0.431	1	1
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG01051	0.441	0.4	0.0	0.017	0.44	0.44	1	1
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG01112	0.404	0.367	0.0	0.014	0.476	0.501	1	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG01500	0.46	0.418	0.0	0.011	0.333	0.348	1	1
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG01565	0.754	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG01583	1.076	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG01595	0.712	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG01879	0.804	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG02568	0.832	0.756	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG02922	0.457	0.415	0.0	0.02	0.789	0.789	1	1
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG03006	0.858	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG03052	0.946	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG03642	0.863	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	HG03742	0.729	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA12878	0.355	0.323	0.0	0.027	0.583	0.583	1	1
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA18525	0.715	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA18939	0.921	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA19017	0.7	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA19238	0.336	0.306	0.0	0.035	0.711	0.711	1	1
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA19239	0.962	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA19625	0.83	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA19648	0.796	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA20502	0.98	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	26186255	26186315	DEL	61	NA20845	0.776	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG00096	0.74	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG00268	0.928	0.867	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG00759	0.582	0.543	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG01051	0.781	0.73	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG01112	0.502	0.469	0.012	0.064	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG01500	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG01565	0.468	0.438	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG01583	0.933	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG01595	0.653	0.61	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG01879	0.554	0.517	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG02568	0.416	0.389	0.023	0.07	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	0
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG03006	1.001	0.935	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG03052	0.715	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG03642	0.049	0.046	0.0	0.159	nan	nan	0	0
chr5	2769422	2769638	DEL	217	HG03742	0.594	0.556	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA12878	0.625	0.584	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA18525	0.488	0.456	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA18939	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA19017	0.847	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.189	nan	nan	0	0
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA19648	0.87	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA20502	0.388	0.362	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr5	2769422	2769638	DEL	217	NA20845	1.014	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG00096	0.794	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG00268	0.515	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG00419	0.588	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG00759	0.523	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG01051	0.701	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG01112	0.78	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG01500	0.743	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG01565	0.662	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG01583	0.574	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG01595	0.475	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG01879	0.857	1.033	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG02568	0.87	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG02922	0.976	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG03006	0.679	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG03052	0.62	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG03642	0.912	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	HG03742	0.642	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA12878	0.769	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA18525	0.68	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA18939	0.531	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA19017	0.884	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA19238	0.356	0.429	0.0	0.014	0.719	0.719	1	1
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA19239	0.757	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA19625	0.578	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA19648	0.796	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA20502	0.866	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	27871085	27871136	DEL	52	NA20845	1.035	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG00096	0.866	0.866	0.0	0.0	0.808	0.808	3	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG00268	0.842	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG00419	0.932	0.932	0.0	0.0	0.793	0.793	2	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG00759	0.892	0.892	0.0	0.0	0.637	0.639	2	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG01051	0.821	0.821	0.0	0.0	0.865	0.865	2	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG01112	0.789	0.789	0.0	0.0	0.65	0.652	3	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG01500	0.955	0.955	0.0	0.0	0.885	0.921	11	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG01565	0.815	0.815	0.0	0.0	0.77	0.77	2	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG01583	0.765	0.765	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG01595	0.851	0.851	0.0	0.0	0.895	0.896	2	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG01879	0.929	0.929	0.0	0.0	0.918	0.918	10	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG02568	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG02922	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG03006	0.465	0.465	0.049	0.031	0.481	0.504	2	1
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG03052	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG03642	1.036	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	HG03742	0.69	0.69	0.0	0.0	0.762	0.726	3	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA12878	0.845	0.845	0.0	0.0	0.484	0.484	1	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA18525	1.029	1.029	0.006	0.0	0.844	0.844	1	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA18939	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA19017	0.921	0.921	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA19238	0.919	0.919	0.0	0.0	0.973	0.973	1	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA19239	0.911	0.911	0.0	0.0	0.78	0.78	2	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA19625	1.056	1.056	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA19648	0.945	0.945	0.0	0.0	0.619	0.619	3	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA20502	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	29634254	29635117	DEL	864	NA20845	0.819	0.819	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG00096	0.767	0.807	0.0	0.009	0.933	0.933	1	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG00268	0.498	0.525	0.025	0.038	nan	nan	0	1
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG00419	0.284	0.299	0.083	0.045	0.25	0.25	1	1
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG00759	0.737	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG01051	0.0	0.0	0.18	0.08	nan	nan	0	0
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG01112	0.0	0.0	0.107	0.049	nan	nan	0	0
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG01500	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG01565	0.652	0.686	0.0	0.0	0.875	0.824	1	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG01583	0.765	0.805	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG01595	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG01879	0.25	0.263	0.03	0.034	nan	nan	0	1
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG02568	0.794	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG02922	0.0	0.0	0.234	0.094	nan	nan	0	0
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG03006	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG03052	0.0	0.0	0.27	0.105	nan	nan	0	0
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG03642	0.37	0.389	0.033	0.029	nan	nan	0	1
chr5	30915526	30916063	DEL	538	HG03742	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA12878	0.625	0.658	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA18525	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA18939	0.673	0.708	0.008	0.0	0.571	0.571	1	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA19017	0.0	0.0	0.093	0.088	nan	nan	0	0
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA19238	0.466	0.49	0.02	0.031	nan	nan	0	1
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA19239	0.706	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA19625	0.352	0.371	0.067	0.036	nan	nan	0	1
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA19648	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA20502	0.365	0.384	0.038	0.042	0.133	0.133	1	1
chr5	30915526	30916063	DEL	538	NA20845	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG00096	0.884	1.119	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG00268	0.739	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG00419	0.669	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG00759	0.582	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG01051	0.641	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG01112	0.448	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG01500	0.584	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG01565	0.387	0.49	0.0	0.024	nan	nan	0	1
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG01583	0.693	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG01595	0.416	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG01879	0.714	0.904	0.0	0.0	0.857	0.857	2	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG02568	1.059	1.34	0.0	0.0	0.625	0.625	2	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG02922	0.457	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG03006	0.483	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG03052	0.589	0.745	0.0	0.0	0.333	0.343	2	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG03642	0.641	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	HG03742	0.46	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA12878	0.676	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA18525	0.366	0.464	0.0	0.041	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA18939	0.744	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA19017	0.645	0.816	0.0	0.0	0.955	0.955	2	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA19238	0.686	0.868	0.0	0.0	0.901	0.901	2	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA19239	0.821	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA19625	0.453	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA19648	0.796	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA20502	0.912	1.154	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr5	32039256	32039572	DEL	317	NA20845	0.561	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG00096	0.686	0.826	0.0	0.011	0.714	0.714	1	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG00268	0.481	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG00419	0.689	0.83	0.0	0.0	0.391	0.391	1	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG00759	0.756	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG01051	0.741	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG01112	0.682	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG01500	0.628	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG01565	0.509	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG01583	0.646	0.778	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG01595	0.752	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG01879	0.643	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG02568	0.87	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG02922	0.748	0.901	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG03006	0.554	0.668	0.0	0.0	0.615	0.645	1	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG03052	0.631	0.76	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG03642	0.542	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	HG03742	0.69	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA12878	0.642	0.773	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA18525	0.959	1.155	0.0	0.003	0.852	0.852	1	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA18939	0.23	0.277	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA19017	0.718	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA19238	0.712	0.858	0.0	0.0	0.605	0.605	1	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA19239	0.795	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA19625	0.755	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA19648	0.721	0.869	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA20502	0.661	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32050167	32050302	DEL	136	NA20845	0.863	1.039	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG00096	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG00268	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG00419	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG00759	0.775	0.775	0.0	0.0	0.333	0.351	1	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG01051	0.541	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG01112	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG01500	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG01565	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG01583	0.717	0.717	0.0	0.0	0.641	0.641	2	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG01595	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG01879	0.429	0.429	0.02	0.0	nan	nan	0	1
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG02568	0.491	0.491	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG02922	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG03006	0.608	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG03052	0.462	0.462	0.021	0.005	nan	nan	0	1
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG03642	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	HG03742	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA12878	0.811	0.811	0.0	0.006	0.25	0.25	1	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA18525	0.942	0.942	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA18939	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA19017	0.0	0.0	0.094	0.004	nan	nan	0	0
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA19238	0.776	0.776	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA19239	0.411	0.411	0.011	0.003	0.583	0.583	3	1
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA19625	0.428	0.428	0.04	0.0	nan	nan	0	1
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA19648	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA20502	0.707	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	32085289	32085793	DEL	505	NA20845	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG00096	0.92	0.92	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG00268	0.876	0.876	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG00419	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG00759	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG01051	0.861	0.861	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG01112	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG01500	1.043	1.043	0.005	0.0	0.793	0.759	1	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG01565	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG01583	1.196	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG01595	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG01879	1.036	1.036	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG02568	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG02922	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG03006	1.072	1.072	0.0	0.0	0.96	0.994	1	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG03052	1.135	1.135	0.0	0.0	0.519	0.547	1	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG03642	0.542	0.542	0.03	0.026	nan	nan	0	1
chr5	33111844	33112649	DEL	806	HG03742	0.825	0.825	0.0	0.0	0.722	0.715	2	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA18525	0.846	0.846	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA18939	0.992	0.992	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA19017	0.94	0.94	0.005	0.0	0.7	0.7	1	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA19238	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA19239	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA19625	0.0	0.0	0.262	0.151	nan	nan	0	0
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA19648	0.796	0.796	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA20502	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33111844	33112649	DEL	806	NA20845	0.992	0.992	0.006	0.004	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG00096	0.677	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG00268	0.842	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG00419	0.324	0.303	0.0	0.033	0.688	0.688	1	1
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG01051	0.971	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG01112	1.166	1.09	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG01500	0.831	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG01565	0.367	0.343	0.0	0.027	0.375	0.398	1	1
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG01583	0.526	0.492	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG01595	0.336	0.314	0.0	0.032	0.846	0.799	1	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG01879	0.911	0.851	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG02568	0.378	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG02922	0.686	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG03006	0.661	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG03052	0.82	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG03642	0.616	0.576	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	HG03742	0.489	0.457	0.0	0.016	0.269	0.283	1	1
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA12878	0.845	0.789	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA18525	0.968	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA18939	0.744	0.695	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA19017	0.691	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA19238	0.324	0.302	0.004	0.021	0.647	0.647	1	1
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA19625	0.402	0.376	0.0	0.003	0.667	0.667	1	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA19648	1.02	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA20502	0.798	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33478759	33478826	DEL	68	NA20845	0.582	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG00096	0.794	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG01112	0.592	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG01500	0.937	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG01879	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG02568	0.454	0.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG03006	1.028	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG03052	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG03642	0.912	0.96	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	HG03742	0.863	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	NA12878	1.064	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	NA19017	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	NA19625	1.157	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	NA19648	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	33688462	33688529	DUP	68	NA20502	1.197	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG00096	1.173	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG00268	1.048	0.962	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG00419	0.871	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG00759	1.027	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG01051	0.861	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG01112	0.915	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG01500	1.273	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG01565	1.141	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG01583	1.004	0.921	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG01595	1.009	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG01879	1.018	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG02568	1.285	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG02922	1.184	1.086	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG03006	0.912	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG03052	0.736	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG03642	0.888	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	HG03742	0.767	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA12878	0.98	0.899	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA18525	0.767	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA18939	1.063	0.975	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA19017	1.124	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA19239	1.078	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA19625	1.031	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA19648	1.02	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA20502	0.957	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	35145864	35145918	DUP	55	NA20845	0.949	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG00096	0.613	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG00268	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG00419	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG00759	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG01051	0.701	0.701	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG01112	0.628	0.628	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG01500	0.69	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG01565	0.53	0.53	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG01583	0.67	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG01595	0.693	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG02568	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG03006	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG03642	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	HG03742	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA12878	0.811	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA18525	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA18939	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA19017	0.663	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA19239	0.539	0.539	0.0	0.018	0.532	0.532	1	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA19625	0.805	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA19648	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA20502	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38182566	38182628	DUP	63	NA20845	0.776	0.776	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG00096	0.866	0.794	0.0	0.064	0.385	0.385	1	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG00268	1.289	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG00419	1.459	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG00759	1.027	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG01051	0.941	0.863	0.0	0.003	0.786	0.786	1	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG01112	1.489	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG01500	1.415	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG01565	1.293	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG01583	1.291	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG01595	1.385	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG01879	1.304	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG02568	1.172	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG02922	0.665	0.61	0.006	0.068	0.759	0.759	1	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG03006	1.501	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG03052	0.61	0.559	0.0	0.09	0.6	0.633	1	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG03642	1.159	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	HG03742	0.882	0.809	0.006	0.068	0.577	0.606	1	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA12878	1.115	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA18525	1.343	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA18939	1.381	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA19238	0.556	0.511	0.0	0.074	0.778	0.778	1	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA19239	1.052	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA19648	1.318	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA20502	1.345	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	382846	382939	DUP	94	NA20845	1.316	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG00096	1.137	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG00268	1.168	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG00419	1.236	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG01051	0.781	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG01112	0.897	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG01500	1.043	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG01565	0.774	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG01583	1.148	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG01879	1.072	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG02568	1.021	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG02922	0.914	0.839	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG03006	1.358	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG03052	1.514	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG03642	0.912	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	HG03742	1.035	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA12878	1.031	0.945	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA18525	0.82	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA19017	1.087	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA19238	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA19239	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA19625	0.755	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA19648	1.119	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA20502	1.254	1.15	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	38511006	38511064	DUP	59	NA20845	1.143	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG00096	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG00268	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG00419	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG00759	1.124	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG01051	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG01112	0.987	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG01500	1.096	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG01565	1.141	1.201	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG01583	1.052	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG01595	0.871	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG01879	0.929	0.978	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG02568	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG02922	0.893	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG03006	1.287	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG03052	0.967	1.018	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG03642	1.233	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	HG03742	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA12878	0.422	0.445	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA18525	1.029	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA18939	1.169	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA19017	1.069	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA19238	0.388	0.409	0.0	0.081	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA19239	0.821	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA19625	1.182	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA19648	1.02	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA20502	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	39374343	39374477	DEL	135	NA20845	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG00096	1.137	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG00268	0.464	0.434	0.0	0.027	0.694	0.694	1	1
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG00419	0.952	0.89	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG00759	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG01051	1.201	1.123	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG01112	0.466	0.436	0.0	0.034	0.455	0.478	1	1
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG01500	1.397	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG01565	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG01583	0.813	0.76	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG01595	1.266	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG01879	0.822	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG02568	0.945	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG02922	1.184	1.107	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG03006	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG03052	1.051	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG03642	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	HG03742	0.997	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA12878	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA18525	0.959	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA18939	0.85	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA19238	1.009	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA19239	0.539	0.504	0.0	0.055	0.867	0.867	1	1
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA19625	1.333	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA19648	0.945	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA20502	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40548300	40548380	DEL	81	NA20845	0.927	0.867	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG00096	1.191	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG00268	0.533	0.517	0.013	0.061	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG00419	0.648	0.63	0.008	0.03	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG00759	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG01051	0.581	0.564	0.016	0.022	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG01112	0.0	0.0	0.01	0.129	nan	nan	0	0
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG01500	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG01565	0.02	0.02	0.016	0.098	nan	nan	0	0
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG01583	0.502	0.488	0.01	0.015	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG01595	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG01879	0.947	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG02568	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG02922	0.769	0.746	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG03006	0.483	0.469	0.011	0.04	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG03052	0.799	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG03642	0.518	0.503	0.006	0.033	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	HG03742	0.594	0.577	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA12878	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA18525	0.506	0.491	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA18939	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA19017	0.995	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA19238	0.466	0.452	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA19239	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA19625	1.107	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA19648	0.522	0.507	0.0	0.016	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA20502	0.57	0.553	0.02	0.049	nan	nan	0	1
chr5	40794621	40794979	DEL	359	NA20845	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG00096	0.992	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG00268	1.34	1.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG00419	1.114	1.114	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG00759	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG01051	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG01112	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG01500	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG01565	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG01583	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG01595	0.791	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG01879	1.089	1.089	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG02568	0.454	0.454	0.024	0.073	nan	nan	0	1
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG02922	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG03006	1.197	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG03052	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG03642	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	HG03742	1.093	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA18525	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA18939	1.169	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA19017	0.866	0.866	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA19238	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA19239	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA19625	1.132	1.132	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA19648	0.995	0.995	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA20502	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43216088	43216494	DEL	407	NA20845	1.272	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	HG00759	0.562	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	HG01051	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	HG01112	0.664	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	HG02922	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	HG03052	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	NA12878	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	NA19017	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	NA19238	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	NA19239	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	NA19625	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	NA19648	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43516480	43516549	DUP	70	NA20502	0.821	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	HG00096	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	HG00419	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	HG01565	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	HG01583	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	HG01595	1.256	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	HG02568	1.134	1.134	0.0	0.007	0.75	0.75	2	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	HG03642	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	NA18525	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	NA18939	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	NA19239	0.398	0.398	0.0	0.034	0.926	0.926	2	2
chr5	43523637	43523692	DUP	56	NA20845	0.733	0.733	0.0	0.0	0.702	0.702	2	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG00096	0.451	0.438	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG00268	1.151	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG00419	0.426	0.413	0.012	0.049	nan	nan	0	1
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG00759	0.388	0.376	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG01051	1.121	1.089	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG01112	0.7	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG01500	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG01565	0.468	0.455	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG01583	0.861	0.836	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG01595	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG01879	0.911	0.884	0.005	0.0	0.621	0.621	1	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG02568	0.945	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG02922	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG03006	1.376	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG03052	1.219	1.184	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG03642	0.838	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	HG03742	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA12878	0.389	0.377	0.005	0.065	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA18525	0.715	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA18939	1.116	1.083	0.0	0.0	0.969	0.969	1	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA19017	0.94	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA19238	0.841	0.817	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA19239	0.949	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA19625	0.931	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA19648	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA20502	0.912	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44125522	44125712	DEL	191	NA20845	1.057	1.026	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG00096	1.137	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG00268	0.979	0.951	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG00419	0.588	0.571	0.059	0.043	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG00759	0.504	0.489	0.055	0.044	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG01051	0.621	0.603	0.039	0.042	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG01112	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG01500	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG01565	0.0	0.0	0.265	0.2	nan	nan	0	0
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG01583	0.574	0.557	0.065	0.04	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG01595	0.0	0.0	0.112	0.117	nan	nan	0	0
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG01879	0.518	0.503	0.038	0.04	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG02568	0.454	0.44	0.06	0.066	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG02922	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG03006	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG03052	0.61	0.592	0.063	0.052	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG03642	0.814	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	HG03742	0.0	0.0	0.139	0.163	nan	nan	0	0
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA12878	0.608	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA18525	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA18939	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA19017	0.571	0.554	0.041	0.053	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA19238	0.505	0.49	0.034	0.038	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA19239	0.616	0.598	0.046	0.046	nan	nan	0	1
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA19625	0.931	0.903	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA19648	0.796	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795008	44795583	DEL	576	NA20845	0.345	0.335	0.064	0.058	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG00096	1.173	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG00268	1.082	1.051	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG00419	0.567	0.551	0.047	0.066	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG00759	0.465	0.452	0.023	0.066	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG01051	0.541	0.525	0.026	0.08	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG01112	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG01500	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG01565	0.0	0.0	0.154	0.32	nan	nan	0	0
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG01583	0.478	0.464	0.03	0.061	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG01595	0.0	0.0	0.077	0.193	nan	nan	0	0
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG01879	0.447	0.434	0.014	0.072	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG02568	0.491	0.477	0.017	0.119	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG02922	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG03006	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG03052	0.568	0.551	0.016	0.072	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG03642	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	HG03742	0.0	0.0	0.048	0.213	nan	nan	0	0
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA12878	0.676	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA18525	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA18939	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA19017	0.571	0.554	0.027	0.075	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA19238	0.518	0.503	0.009	0.052	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA19239	0.68	0.66	0.017	0.069	nan	nan	0	1
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA19625	0.855	0.83	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA19648	0.746	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA20502	0.866	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	44795282	44795589	DEL	308	NA20845	0.323	0.314	0.023	0.079	nan	nan	0	1
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG00096	0.866	0.809	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG00268	1.237	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG00419	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG00759	1.299	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG01051	1.221	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG01112	1.525	1.425	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG01500	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG01565	1.1	1.028	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG01583	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG01595	1.385	1.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG02568	0.983	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG02922	1.059	0.99	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG03006	1.215	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG03052	1.177	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG03642	1.307	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	HG03742	1.4	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA12878	0.811	0.758	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA18525	1.29	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA18939	1.08	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA19017	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA19238	1.152	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA19625	1.031	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA19648	1.243	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA20502	1.231	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45127240	45127670	DUP	431	NA20845	1.165	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG00096	0.83	0.806	0.0	0.005	0.857	0.857	1	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG00268	0.893	0.867	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG00419	0.486	0.472	0.092	0.0	0.65	0.65	3	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG00759	0.717	0.696	0.039	0.0	0.446	0.469	2	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG01051	1.071	1.04	0.0	0.008	0.767	0.767	1	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG01112	0.879	0.853	0.006	0.005	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG01500	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG01565	0.55	0.534	0.044	0.0	0.24	0.255	4	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG01583	0.837	0.813	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG01595	0.514	0.499	0.066	0.008	0.498	0.527	2	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG01879	1.357	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG02568	1.021	0.991	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG02922	0.893	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG03006	0.375	0.364	0.065	0.0	0.288	0.302	2	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG03052	0.694	0.674	0.027	0.0	0.212	0.224	3	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG03642	0.888	0.862	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	HG03742	0.882	0.856	0.0	0.0	0.845	0.887	2	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA12878	0.912	0.886	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA18525	0.0	0.0	0.09	0.0	nan	nan	0	0
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA18939	0.46	0.447	0.024	0.003	0.895	0.895	2	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA19017	0.903	0.876	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA19238	0.828	0.804	0.005	0.002	0.722	0.722	2	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA19239	0.423	0.411	0.023	0.016	0.843	0.843	2	1
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA19625	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA19648	0.821	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA20502	0.775	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	45527000	45527509	DEL	510	NA20845	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG00096	1.119	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG00268	1.134	1.04	0.0	0.0	0.892	0.892	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG00419	1.094	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG00759	1.279	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG01051	1.061	0.974	0.0	0.007	0.913	0.913	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG01112	1.067	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG01500	1.061	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG01565	1.018	0.934	0.0	0.0	0.842	0.793	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG01583	1.399	1.283	0.0	0.0	0.853	0.853	2	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG01595	1.266	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG01879	1.215	1.114	0.0	0.0	0.564	0.564	3	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG02568	0.983	0.902	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG02922	0.665	0.61	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG03006	0.858	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG03052	1.135	1.041	0.013	0.0	0.733	0.695	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG03642	0.912	0.837	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	HG03742	1.323	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA12878	0.794	0.728	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA18525	1.029	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA18939	0.939	0.861	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA19017	1.069	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA19238	1.242	1.14	0.0	0.0	0.843	0.843	1	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA19239	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA19625	1.081	0.992	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA19648	1.144	1.05	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA20502	1.163	1.067	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	50768177	50768338	DEL	162	NA20845	1.057	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG00096	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG00268	0.636	0.636	0.0	0.0	0.467	0.467	3	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG00419	0.486	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG00759	0.795	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG01051	0.641	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG01112	0.574	0.574	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG01500	0.92	0.92	0.0	0.0	0.639	0.666	4	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG01565	0.835	0.835	0.0	0.0	1.0	0.941	3	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG01583	0.526	0.526	0.0	0.0	0.7	0.7	2	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG01595	0.732	0.732	0.0	0.0	0.675	0.674	2	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG01879	0.643	0.643	0.0	0.0	0.621	0.621	1	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG02568	0.265	0.265	0.11	0.075	nan	nan	0	1
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG02922	0.229	0.229	0.107	0.071	nan	nan	0	1
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG03006	0.643	0.643	0.0	0.0	0.444	0.424	3	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG03052	0.547	0.547	0.0	0.0	0.4	0.379	1	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG03642	0.789	0.789	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	HG03742	0.537	0.537	0.0	0.0	0.667	0.7	3	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA12878	0.743	0.743	0.003	0.0	0.812	0.812	3	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA18525	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA18939	0.46	0.46	0.0	0.0	0.444	0.444	3	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA19017	0.534	0.534	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA19238	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA19239	0.763	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA19625	0.528	0.528	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA19648	0.448	0.448	0.0	0.0	0.518	0.518	2	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA20502	0.501	0.501	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr5	51170165	51170908	DEL	744	NA20845	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG00096	1.137	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG00268	1.014	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG00419	1.155	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG00759	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG01051	1.241	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG01500	0.937	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG01565	0.55	0.579	0.0	0.064	0.933	0.878	1	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG01583	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG01595	1.345	1.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG01879	1.143	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG02568	1.21	1.274	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG02922	1.309	1.378	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG03052	1.177	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG03642	1.183	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	HG03742	1.093	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA12878	0.693	0.729	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA18525	1.238	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA18939	1.204	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA19017	0.903	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA19238	1.372	1.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA19239	1.065	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA19648	1.045	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	51280422	51280494	DUP	73	NA20845	1.186	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG00096	0.631	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG00268	0.67	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG00419	0.567	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG00759	0.446	0.469	0.105	0.036	nan	nan	0	1
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG01051	0.641	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG01112	0.628	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG01500	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG01565	0.652	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG01583	0.55	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG01595	0.574	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG01879	0.0	0.0	0.198	0.126	nan	nan	0	0
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG02568	0.945	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG02922	0.644	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG03006	0.536	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG03052	0.336	0.354	0.14	0.06	nan	nan	0	1
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG03642	0.271	0.285	0.107	0.058	nan	nan	0	1
chr5	52458941	52459689	DEL	749	HG03742	0.805	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA12878	0.726	0.765	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA18525	0.314	0.33	0.092	0.065	nan	nan	0	1
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA18939	0.638	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA19017	0.239	0.252	0.145	0.064	nan	nan	0	1
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA19238	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA19239	0.0	0.0	0.517	0.167	nan	nan	0	0
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA19625	0.377	0.397	0.129	0.043	nan	nan	0	1
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA19648	0.398	0.419	0.068	0.035	nan	nan	0	1
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA20502	0.752	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52458941	52459689	DEL	749	NA20845	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG00096	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG00268	1.203	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG00419	1.074	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG00759	0.892	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG01051	0.881	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG01112	0.843	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG01500	0.99	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG01565	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG01583	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG01595	0.435	0.484	0.0	0.04	0.795	0.801	2	1
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG01879	0.839	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG02568	0.907	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG02922	1.059	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG03006	0.894	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG03052	0.841	0.934	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG03642	0.74	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	HG03742	0.882	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA12878	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA18525	0.418	0.465	0.0	0.042	0.718	0.718	2	1
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA18939	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA19017	0.995	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA19238	0.971	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA19239	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA19625	0.78	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA19648	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA20502	0.798	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	52784261	52784337	DEL	77	NA20845	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	53755531	53755619	DUP	89	HG01500	0.707	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	53755531	53755619	DUP	89	NA19017	0.571	0.554	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG00096	0.541	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG00268	0.876	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG00419	0.648	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG00759	0.795	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG01112	0.341	0.392	0.0	0.028	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG01500	0.531	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG01583	0.837	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG01595	0.554	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG01879	0.589	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG02568	0.718	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG02922	0.769	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG03006	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG03052	0.589	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	HG03642	0.666	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA18525	0.68	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA18939	0.779	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA19017	0.534	0.614	0.0	0.005	0.846	0.846	1	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA19238	0.647	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA19239	0.321	0.369	0.0	0.067	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA19625	0.679	0.781	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA19648	0.87	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA20502	0.57	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	54081758	54081907	DUP	150	NA20845	0.561	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG00096	0.415	0.461	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG00268	1.031	1.145	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG00419	1.236	1.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG00759	0.95	1.055	0.006	0.0	0.75	0.789	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG01051	0.961	1.068	0.0	0.0	0.761	0.761	2	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG01112	0.448	0.498	0.01	0.105	nan	nan	0	1
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG01500	1.026	1.14	0.0	0.0	0.897	0.937	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG01565	0.896	0.996	0.0	0.0	0.765	0.72	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG01583	1.076	1.196	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG01595	0.613	0.682	0.0	0.0	0.846	0.839	2	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG01879	1.018	1.131	0.0	0.004	0.787	0.787	2	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG02568	1.021	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG02922	1.163	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG03006	0.357	0.397	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG03052	0.788	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG03642	1.134	1.26	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	HG03742	0.479	0.533	0.004	0.092	nan	nan	0	1
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA12878	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA18525	0.872	0.969	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA18939	0.903	1.003	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA19017	1.179	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA19238	0.958	1.064	0.0	0.0	0.837	0.837	2	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA19239	1.013	1.126	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA19625	0.931	1.034	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA19648	1.02	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA20502	0.821	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	55870781	55871076	DEL	296	NA20845	1.014	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG00096	1.01	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG00268	0.773	0.709	0.0	0.066	0.359	0.359	1	1
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG00419	0.507	0.465	0.0	0.086	0.92	0.92	1	1
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG00759	1.686	1.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG01051	1.001	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG01112	1.381	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG01500	1.238	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG01565	1.303	1.196	0.0	0.0	0.893	0.949	1	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG01583	1.052	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	1
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG01879	1.197	1.098	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG02568	1.285	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG02922	0.904	0.829	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG03006	0.715	0.656	0.0	0.059	0.423	0.443	1	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG03052	0.904	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG03642	1.282	1.176	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	HG03742	1.553	1.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA12878	1.098	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA18525	0.663	0.608	0.0	0.064	0.396	0.396	1	1
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA18939	0.584	0.536	0.0	0.047	0.422	0.422	1	1
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA19017	0.534	0.49	0.0	0.084	0.5	0.5	1	1
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA19238	0.977	0.896	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA19239	1.155	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA19625	0.981	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA19648	1.293	1.186	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA20502	1.049	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56517060	56517159	DEL	100	NA20845	1.402	1.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG00096	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG00268	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG00419	1.013	1.066	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG00759	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG01051	0.761	0.801	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG01112	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG01500	0.813	0.856	0.0	0.0	0.72	0.753	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG01565	0.916	0.965	0.0	0.0	0.682	0.724	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG01583	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.0	0.217	0.23	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG01879	0.822	0.865	0.0	0.0	0.536	0.536	2	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG02568	1.456	1.532	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG02922	1.018	1.071	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG03006	0.751	0.79	0.0	0.0	0.947	0.992	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG03052	1.051	1.106	0.0	0.0	0.783	0.741	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG03642	1.196	1.259	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	HG03742	0.844	0.888	0.0	0.004	0.667	0.635	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA12878	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA18525	0.889	0.936	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA18939	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA19017	0.976	1.028	0.0	0.002	0.69	0.69	2	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA19238	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA19239	1.103	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA19625	1.081	1.138	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA19648	0.945	0.995	0.0	0.005	0.5	0.5	1	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA20502	0.98	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	56794813	56794874	DEL	62	NA20845	0.431	0.454	0.0	0.03	0.73	0.73	2	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.169	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG00268	0.137	0.133	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG00419	0.426	0.413	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG00759	0.388	0.376	0.0	0.008	0.2	0.19	1	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG01051	0.38	0.369	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG01112	0.493	0.479	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG01500	0.46	0.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG01565	0.244	0.237	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG01583	0.502	0.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG01595	0.336	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG01879	0.357	0.347	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG02568	0.378	0.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG02922	0.312	0.303	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG03006	0.143	0.139	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG03052	0.126	0.122	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr5	57923170	57923343	DEL	174	HG03742	0.038	0.037	0.0	0.126	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA12878	0.304	0.295	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA18525	0.68	0.66	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA18939	0.301	0.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA19017	0.147	0.143	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA19238	0.621	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA19239	0.205	0.199	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA19625	0.05	0.049	0.0	0.131	nan	nan	0	1
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA19648	0.149	0.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA20502	0.228	0.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	57923170	57923343	DEL	174	NA20845	0.043	0.042	0.011	0.082	nan	nan	0	1
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG00096	0.469	0.521	0.0	0.058	0.611	0.611	1	1
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG00268	0.911	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG00419	0.446	0.495	0.0	0.065	0.731	0.731	1	1
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG00759	0.892	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG01051	0.681	0.756	0.0	0.038	0.206	0.206	1	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG01112	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG01500	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG01565	1.324	1.471	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG01583	0.956	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG01595	0.594	0.66	0.0	0.071	0.893	0.945	1	1
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG01879	0.554	0.615	0.007	0.067	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG02568	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG02922	0.686	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG03006	1.18	1.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG03052	1.198	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG03642	0.863	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	HG03742	0.594	0.66	0.0	0.083	0.605	0.635	1	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA12878	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA18525	0.488	0.542	0.0	0.084	0.711	0.711	1	1
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA18939	1.116	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA19017	0.903	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA19238	1.035	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA19239	1.001	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA19625	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA19648	0.895	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA20502	0.912	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	58274026	58274160	DEL	135	NA20845	1.229	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG00096	1.209	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG00268	1.271	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG00419	1.439	1.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG00759	1.144	1.11	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG01051	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG01112	1.274	1.236	0.0	0.0	0.815	0.816	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG01500	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG01565	1.426	1.384	0.0	0.0	0.938	0.939	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG01583	1.148	1.114	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG01595	1.049	1.018	0.004	0.0	0.952	0.946	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG01879	1.125	1.092	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG02568	0.983	0.954	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG02922	1.184	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG03006	1.072	1.041	0.0	0.0	0.917	0.918	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG03052	1.472	1.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG03642	1.085	1.053	0.0	0.0	0.706	0.706	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	HG03742	1.189	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA12878	0.929	0.902	0.0	0.0	0.87	0.87	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA18525	1.125	1.092	0.0	0.0	0.902	0.902	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA18939	0.992	0.963	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA19017	1.069	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA19238	1.126	1.093	0.0	0.0	0.935	0.935	1	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA19239	1.078	1.046	0.0	0.0	0.735	0.735	1	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA19625	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA19648	1.02	0.99	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA20502	0.593	0.575	0.065	0.037	nan	nan	0	1
chr5	60379390	60380359	DEL	970	NA20845	1.121	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG00096	0.902	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG00268	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG00419	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG00759	1.066	0.996	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG01051	1.041	0.973	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG01112	1.076	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG01500	0.725	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG01565	0.937	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG01583	1.243	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG01595	0.89	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG01879	1.018	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG02568	0.907	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG02922	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG03006	0.912	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG03052	1.072	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG03642	1.183	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	HG03742	0.92	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA12878	0.879	0.821	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA18525	0.872	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA18939	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA19017	1.105	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA19238	0.751	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA19239	1.116	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA19625	1.031	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA19648	1.045	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA20502	1.208	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	61911374	61911446	DEL	73	NA20845	0.345	0.322	0.0	0.069	0.538	0.538	1	1
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG00096	0.812	0.788	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG00268	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG00419	0.729	0.708	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG00759	0.911	0.884	0.0	0.0	0.667	0.702	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG01051	1.141	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG01112	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG01500	1.008	0.979	0.0	0.0	0.855	0.818	2	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG01565	0.957	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG01583	1.004	0.975	0.0	0.002	0.944	0.944	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG01595	0.594	0.576	0.062	0.04	nan	nan	0	1
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG01879	0.964	0.936	0.0	0.0	0.773	0.773	2	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG02568	1.172	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG02922	0.976	0.948	0.0	0.0	0.598	0.598	2	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG03006	1.055	1.024	0.0	0.0	0.429	0.449	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG03052	1.198	1.163	0.0	0.0	0.862	0.91	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG03642	1.134	1.101	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	HG03742	0.805	0.782	0.0	0.0	0.667	0.7	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA12878	1.031	1.001	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA18525	0.453	0.44	0.085	0.073	nan	nan	0	1
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA18939	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA19017	0.847	0.823	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA19238	1.022	0.993	0.0	0.0	0.919	0.919	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA19239	1.026	0.996	0.0	0.0	0.887	0.887	2	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA19625	1.006	0.977	0.0	0.0	0.697	0.697	2	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA19648	0.945	0.918	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA20502	1.049	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62150225	62151129	DEL	905	NA20845	1.057	1.026	0.006	0.0	0.941	0.941	1	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG00096	0.541	0.506	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG00268	0.0	0.0	0.004	0.176	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG00419	0.0	0.0	0.042	0.26	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG01051	0.0	0.0	0.01	0.189	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG01112	0.0	0.0	0.019	0.238	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.212	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG01565	0.0	0.0	0.009	0.161	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG01583	0.0	0.0	0.027	0.179	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.226	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG01879	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG02568	0.529	0.495	0.0	0.123	nan	nan	0	1
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG02922	0.852	0.796	0.007	0.0	0.684	0.684	1	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG03006	0.643	0.601	0.011	0.113	nan	nan	0	1
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG03052	0.841	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	HG03742	0.537	0.502	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA12878	0.895	0.837	0.005	0.003	nan	nan	0	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA18525	0.663	0.619	0.01	0.091	nan	nan	0	1
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA18939	0.0	0.0	0.021	0.214	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA19017	1.105	1.033	0.0	0.0	0.742	0.742	1	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA19238	0.712	0.665	0.0	0.077	nan	nan	0	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA19239	1.103	1.031	0.0	0.0	0.766	0.766	1	2
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA19625	0.0	0.0	0.026	0.18	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA19648	0.671	0.628	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA20502	0.0	0.0	0.012	0.182	nan	nan	0	0
chr5	62687444	62687711	DEL	268	NA20845	0.0	0.0	0.005	0.273	nan	nan	0	0
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG00096	0.758	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG00268	0.859	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG00419	1.175	1.141	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG00759	1.396	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG01051	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG01112	1.022	0.993	0.0	0.0	0.571	0.602	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG01500	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG01565	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG01583	1.052	1.021	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG01595	1.029	0.999	0.0	0.0	1.0	0.944	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG01879	0.572	0.555	0.0	0.055	0.514	0.514	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG02568	1.021	0.991	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG03006	1.055	1.024	0.0	0.0	0.929	0.973	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG03642	0.789	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	HG03742	1.189	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA12878	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA18525	0.924	0.897	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA18939	1.169	1.135	0.0	0.0	0.476	0.476	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA19017	0.921	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA19238	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA19239	0.949	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA19625	1.056	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA19648	1.069	1.038	0.0	0.0	0.52	0.52	1	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA20502	1.14	1.107	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	63041487	63041583	DUP	97	NA20845	0.927	0.9	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG00096	1.137	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG00419	1.135	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG00759	1.047	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG01051	0.36	0.4	0.0	0.068	0.833	0.833	1	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG01112	0.843	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG01500	0.389	0.432	0.0	0.021	0.524	0.548	1	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG01565	0.631	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG01583	1.028	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG01595	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG01879	1.215	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG02568	0.945	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG02922	0.976	1.085	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG03006	0.822	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG03052	0.757	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG03642	1.036	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	HG03742	0.748	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA18525	0.872	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA18939	1.24	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA19017	0.884	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA19238	0.984	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA19239	0.718	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA19625	0.729	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA19648	0.87	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA20502	1.276	1.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	654937	655004	DUP	68	NA20845	1.208	1.342	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG00096	0.956	1.006	0.0	0.002	0.958	0.958	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG00268	1.1	1.158	0.004	0.004	0.734	0.734	2	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG00419	0.851	0.896	0.005	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG00759	0.911	0.959	0.0	0.0	0.826	0.87	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG01051	0.821	0.864	0.0	0.0	0.864	0.864	3	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG01112	0.807	0.85	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG01500	0.955	1.005	0.0	0.0	0.676	0.647	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG01565	0.855	0.9	0.007	0.002	0.944	0.889	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG01583	0.909	0.956	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG01595	0.91	0.958	0.0	0.0	0.947	0.997	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG01879	0.839	0.884	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG02568	0.87	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG02922	0.956	1.006	0.0	0.0	0.566	0.566	2	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG03006	0.912	0.96	0.0	0.0	0.81	0.848	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG03052	0.505	0.531	0.038	0.0	0.286	0.302	7	1
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG03642	0.863	0.908	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	HG03742	0.863	0.908	0.0	0.0	0.68	0.714	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA12878	1.115	1.174	0.004	0.0	0.969	0.969	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA18525	0.942	0.991	0.004	0.0	0.793	0.793	2	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA18939	0.815	0.857	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA19017	1.087	1.144	0.0	0.0	0.737	0.737	3	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA19238	0.841	0.885	0.0	0.0	0.869	0.869	2	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA19239	0.898	0.945	0.0	0.0	0.784	0.784	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA19625	0.956	1.006	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA19648	0.87	0.916	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA20502	0.957	1.008	0.0	0.0	0.925	0.925	2	2
chr5	67497321	67498199	DEL	879	NA20845	0.884	0.931	0.0	0.0	0.586	0.586	2	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG00096	0.451	0.518	0.0	0.084	1.0	1.0	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG00268	0.498	0.573	0.0	0.072	0.853	0.853	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG00419	0.669	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG00759	0.213	0.245	0.0	0.049	0.875	0.831	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG01051	0.461	0.529	0.0	0.071	0.851	0.851	2	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG01112	0.807	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG01565	0.754	0.866	0.01	0.0	0.882	0.83	1	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG01583	1.052	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	0
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG01879	0.911	1.047	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG02568	0.907	1.043	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG02922	0.956	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG03006	0.34	0.39	0.0	0.058	0.556	0.582	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG03052	0.82	0.942	0.0	0.0	0.619	0.586	1	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG03642	0.296	0.34	0.0	0.079	0.857	0.857	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	HG03742	0.537	0.617	0.0	0.061	0.613	0.644	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA12878	0.625	0.719	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA18525	0.0	0.0	0.006	0.118	nan	nan	0	0
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA18939	0.39	0.448	0.0	0.033	0.581	0.581	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA19017	0.7	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA19238	1.165	1.339	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA19239	0.872	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA19625	0.905	1.041	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA19648	0.995	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA20502	0.456	0.524	0.0	0.047	0.654	0.654	1	1
chr5	68105932	68106026	DEL	95	NA20845	0.712	0.818	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG00096	0.794	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG00268	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG00419	1.236	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG00759	0.717	0.696	0.0	0.0	0.619	0.652	1	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG01051	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG01112	1.022	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG01500	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG01565	0.754	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG01583	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG01595	1.068	1.037	0.0	0.0	0.913	0.967	1	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG01879	1.054	1.023	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG02568	0.87	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG02922	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG03006	0.786	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG03052	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG03642	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	HG03742	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA12878	1.25	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA18525	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA18939	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA19017	0.516	0.501	0.019	0.034	nan	nan	0	1
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA19238	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA19239	0.962	0.934	0.0	0.0	0.641	0.641	1	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA19625	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA19648	0.721	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA20502	0.821	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	74237344	74237616	DEL	273	NA20845	0.927	0.9	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG00419	0.588	0.653	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG00759	0.465	0.517	0.0	0.0	0.778	0.739	1	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG01051	0.621	0.69	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG01565	0.682	0.758	0.0	0.0	0.545	0.513	1	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG01583	0.622	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG01595	0.455	0.506	0.0	0.0	0.714	0.756	1	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG01879	0.589	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG02568	0.491	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG02922	0.395	0.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG03642	0.394	0.438	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	HG03742	0.614	0.682	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	NA18525	0.942	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	NA18939	0.478	0.531	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	NA19017	0.59	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	NA19238	0.841	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	NA19625	0.503	0.559	0.007	0.014	nan	nan	0	2
chr5	75435663	75435781	DUP	119	NA19648	0.423	0.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG00096	0.938	0.911	0.0	0.0	0.607	0.607	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG00268	0.911	0.884	0.0	0.0	0.663	0.663	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG00419	1.074	1.043	0.0	0.0	0.749	0.749	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG00759	0.911	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG01051	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG01112	1.04	1.01	0.0	0.0	0.88	0.926	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG01500	0.92	0.893	0.0	0.0	0.857	0.82	1	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG01565	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG01583	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG01595	1.049	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG01879	0.911	0.884	0.0	0.0	0.844	0.844	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG02568	0.945	0.918	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG02922	1.163	1.129	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG03006	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG03052	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG03642	0.542	0.527	0.052	0.043	nan	nan	0	1
chr5	77002878	77003684	DEL	807	HG03742	1.035	1.005	0.0	0.0	0.754	0.748	4	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA12878	0.845	0.82	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA18525	0.854	0.83	0.0	0.0	0.865	0.865	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA18939	1.009	0.98	0.0	0.0	0.652	0.652	2	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA19017	1.161	1.127	0.0	0.0	0.439	0.439	1	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA19238	0.997	0.967	0.0	0.0	0.821	0.821	3	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA19239	1.078	1.046	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA19625	1.081	1.05	0.0	0.0	0.905	0.905	3	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA19648	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA20502	1.14	1.107	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr5	77002878	77003684	DEL	807	NA20845	0.992	0.963	0.0	0.0	0.678	0.678	2	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG00096	1.209	1.13	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG00268	0.67	0.626	0.057	0.106	nan	nan	0	1
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG00419	1.216	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG00759	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG01051	0.521	0.487	0.029	0.117	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG01112	1.184	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG01500	1.079	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG01565	1.079	1.009	0.0	0.0	0.429	0.403	1	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG01583	1.172	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG01595	1.286	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG01879	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG02568	1.021	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG02922	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG03006	1.144	1.069	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG03052	1.324	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG03642	0.616	0.576	0.066	0.11	nan	nan	0	1
chr5	7907579	7908052	DEL	474	HG03742	0.633	0.591	0.012	0.064	nan	nan	0	1
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA12878	1.098	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA18525	1.29	1.206	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA18939	1.222	1.142	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA19017	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA19238	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA19239	1.296	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA19625	1.081	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA19648	1.119	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA20502	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	7907579	7908052	DEL	474	NA20845	1.272	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG00096	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG00268	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG00419	0.892	0.892	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG00759	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG01051	0.701	0.701	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG01112	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG01500	0.849	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG01565	0.896	0.896	0.0	0.0	0.636	0.676	3	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG01583	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG01595	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG01879	0.911	0.911	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG02568	1.021	1.021	0.01	0.003	0.607	0.607	2	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG02922	0.686	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG03006	0.447	0.447	0.082	0.0	nan	nan	0	1
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG03052	0.715	0.715	0.0	0.0	0.5	0.528	1	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG03642	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	HG03742	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA12878	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA18525	0.942	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA18939	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA19017	0.94	0.94	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA19238	0.906	0.906	0.0	0.0	0.811	0.811	1	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA19239	0.898	0.898	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA19625	0.805	0.805	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA19648	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA20502	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	80685482	80686462	DEL	981	NA20845	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG00096	0.559	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG00419	0.669	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG00759	0.368	0.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG01051	0.541	0.541	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG01112	0.682	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG01500	0.371	0.371	0.0	0.029	0.615	0.643	1	1
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG01565	0.57	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG01583	0.478	0.478	0.0	0.006	0.316	0.316	1	1
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG01595	0.633	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG01879	0.607	0.607	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG02568	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG02922	0.706	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG03006	0.786	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG03052	0.547	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG03642	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	HG03742	0.384	0.384	0.0	0.022	0.565	0.593	1	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA12878	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA18525	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA18939	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA19017	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA19238	0.673	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA19239	0.59	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA19625	0.805	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA19648	0.597	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA20502	0.388	0.388	0.0	0.019	0.381	0.381	1	2
chr5	8081265	8081321	DEL	57	NA20845	0.41	0.41	0.0	0.014	0.2	0.2	1	1
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG00096	0.956	1.062	0.0	0.0	0.636	0.636	2	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG00268	0.842	0.935	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG00419	0.689	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG00759	0.833	0.926	0.0	0.0	0.899	0.902	2	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG01051	0.621	0.69	0.0	0.0	0.843	0.843	2	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG01112	0.753	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG01500	0.743	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG01565	0.794	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG01583	0.765	0.85	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG01595	0.93	1.033	0.0	0.0	0.481	0.51	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG01879	0.607	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG02568	0.832	0.924	0.0	0.0	0.267	0.267	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG02922	0.0	0.0	0.093	0.102	nan	nan	0	0
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG03006	0.626	0.695	0.0	0.0	0.655	0.625	2	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG03052	0.757	0.841	0.0	0.0	0.842	0.798	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG03642	0.838	0.931	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	HG03742	0.748	0.831	0.0	0.0	0.895	0.939	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA12878	0.963	1.07	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA18525	0.872	0.969	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA18939	0.673	0.748	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA19017	0.774	0.86	0.0	0.0	0.897	0.897	2	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA19238	0.971	1.078	0.0	0.0	0.537	0.537	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA19239	0.821	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA19625	0.805	0.894	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA19648	1.02	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA20502	0.935	1.038	0.0	0.0	0.829	0.829	2	2
chr5	8236060	8236572	DEL	513	NA20845	0.755	0.839	0.0	0.003	0.471	0.471	1	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG00096	0.956	0.928	0.0	0.0	0.893	0.893	3	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG00268	0.773	0.751	0.0	0.0	0.786	0.786	2	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG00419	0.811	0.787	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG00759	0.814	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG01051	0.741	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG01112	0.825	0.801	0.0	0.0	0.737	0.7	1	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG01500	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG01565	0.916	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG01583	0.646	0.627	0.0	0.0	0.45	0.45	3	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG01595	0.811	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG01879	0.464	0.451	0.022	0.017	nan	nan	0	1
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG02568	0.605	0.587	0.0	0.0	0.19	0.19	2	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG02922	0.831	0.807	0.0	0.002	1.0	1.0	1	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG03006	0.947	0.92	0.0	0.0	0.697	0.73	1	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG03052	0.883	0.857	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG03642	0.937	0.91	0.0	0.0	0.639	0.639	2	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	HG03742	0.901	0.875	0.0	0.0	0.75	0.714	3	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA12878	0.811	0.787	0.0	0.0	0.781	0.781	2	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA18525	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA18939	0.832	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA19017	0.7	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA19238	1.048	1.018	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA19239	0.564	0.548	0.095	0.062	nan	nan	0	1
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA19625	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA19648	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.0	0.435	0.435	3	2
chr5	83589263	83590020	DEL	758	NA20845	0.798	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG00096	0.704	0.645	0.0	0.036	0.78	0.78	2	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG00268	1.203	1.103	0.0	0.0	0.763	0.763	1	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG00419	1.418	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG00759	1.376	1.263	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG01051	0.481	0.441	0.0	0.048	0.926	0.926	1	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG01500	0.619	0.568	0.006	0.051	0.457	0.477	1	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG01595	0.91	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG01879	0.0	0.0	0.006	0.089	nan	nan	0	0
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG02568	0.718	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG02922	1.028	0.943	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG03006	1.349	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG03052	1.009	0.926	0.0	0.0	0.833	0.832	2	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG03642	1.356	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	HG03742	0.825	0.756	0.0	0.029	0.396	0.416	1	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA12878	0.422	0.387	0.0	0.059	0.821	0.821	1	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA18525	0.558	0.512	0.0	0.036	0.625	0.625	1	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA18939	1.133	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA19017	1.179	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA19238	1.178	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA19239	1.116	1.024	0.0	0.0	0.787	0.787	1	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA19625	1.031	0.946	0.0	0.0	0.522	0.522	1	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA19648	0.647	0.593	0.0	0.071	0.8	0.8	1	2
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA20502	0.57	0.523	0.009	0.045	0.667	0.667	1	1
chr5	84814477	84814554	DEL	78	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG00096	1.01	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG00268	0.55	0.579	0.0	0.042	0.692	0.692	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG00419	0.729	0.768	0.0	0.031	0.395	0.395	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG00759	1.163	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG01051	0.621	0.653	0.0	0.025	0.576	0.576	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG01112	1.202	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG01500	0.707	0.745	0.0	0.037	0.636	0.665	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG01565	1.181	1.243	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG01583	1.435	1.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG01595	0.693	0.729	0.0	0.041	0.722	0.765	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG01879	1.465	1.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG02568	0.756	0.796	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG02922	1.329	1.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG03006	0.786	0.828	0.0	0.043	0.529	0.555	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG03052	1.198	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.083	nan	nan	0	0
chr5	84822817	84822887	DEL	71	HG03742	0.729	0.767	0.0	0.026	0.525	0.551	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA12878	0.439	0.462	0.0	0.035	0.649	0.649	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA18525	0.959	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA18939	0.673	0.708	0.004	0.049	0.766	0.766	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA19017	1.124	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA19238	1.449	1.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA19239	0.59	0.621	0.0	0.054	0.845	0.845	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA19625	0.578	0.609	0.0	0.036	0.621	0.621	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA19648	0.671	0.707	0.0	0.035	0.448	0.448	1	1
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA20502	1.163	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	84822817	84822887	DEL	71	NA20845	1.186	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG00096	0.74	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG00268	0.567	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG00419	0.75	0.728	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG00759	0.872	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG01051	0.981	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG01112	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG01500	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG01565	1.018	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG01583	0.789	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG01595	0.712	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG01879	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG02568	0.151	0.147	0.0	0.055	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG02922	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG03006	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG03052	0.483	0.469	0.0	0.041	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG03642	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	HG03742	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA12878	0.76	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA18525	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA18939	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA19017	0.295	0.286	0.0	0.048	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA19238	0.764	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA19239	0.411	0.399	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA19625	0.704	0.684	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA19648	0.597	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85350027	85350149	DEL	123	NA20845	0.755	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG00096	0.235	0.247	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG00268	0.498	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG00419	0.405	0.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG00759	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG01051	0.661	0.696	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG01112	0.43	0.453	0.0	0.072	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG01500	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG01565	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG01583	0.454	0.478	0.006	0.057	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG01595	0.574	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG01879	0.75	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG02568	0.491	0.517	0.0	0.064	0.444	0.444	3	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG02922	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG03006	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG03052	0.315	0.332	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG03642	0.419	0.441	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	HG03742	0.345	0.363	0.0	0.129	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA12878	0.642	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA18525	0.715	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA18939	0.885	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA19017	0.442	0.465	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA19238	0.311	0.327	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA19239	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA19625	0.201	0.212	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA19648	0.547	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA20502	0.479	0.504	0.0	0.069	nan	nan	0	2
chr5	85405341	85405510	DEL	170	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.128	nan	nan	0	1
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG00096	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG00268	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG00419	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG00759	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG01051	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG01112	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG01500	0.743	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG01565	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG01583	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG01595	0.93	0.93	0.0	0.0	0.611	0.577	1	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG01879	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG02568	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG02922	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG03006	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG03052	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG03642	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	HG03742	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA12878	0.743	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA18525	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA18939	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA19017	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA19238	1.061	1.061	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA19239	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA19625	0.528	0.528	0.036	0.0	nan	nan	0	1
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA19648	0.423	0.423	0.009	0.0	nan	nan	0	1
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA20502	0.935	0.935	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr5	86815116	86816041	DEL	926	NA20845	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	HG01879	1.197	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	HG02568	1.21	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	HG02922	1.329	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	HG03052	1.03	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	HG03742	1.151	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	NA19017	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	NA19238	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	NA19239	1.193	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	87328660	87328807	DUP	148	NA20845	0.625	0.584	0.006	0.071	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG00096	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG00268	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG00419	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG00759	1.202	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG01051	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG01112	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG01500	0.531	0.531	0.01	0.082	nan	nan	0	1
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG01565	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG01583	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG01595	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG01879	0.5	0.5	0.013	0.076	nan	nan	0	1
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG02568	0.681	0.681	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG02922	0.623	0.623	0.009	0.103	nan	nan	0	1
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG03006	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG03052	1.072	1.072	0.0	0.0	0.741	0.782	1	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG03642	0.937	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	HG03742	1.131	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA12878	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA18525	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA18939	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA19017	0.626	0.626	0.032	0.057	nan	nan	0	1
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA19238	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA19239	1.116	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA19625	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA19648	1.318	1.318	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA20502	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89003715	89004039	DEL	325	NA20845	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG00096	1.055	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG00268	1.271	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG00419	1.196	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG00759	1.144	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG01051	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG01112	1.417	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG01500	1.326	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG01565	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG01583	1.22	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG01595	1.444	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG01879	1.054	1.023	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG02568	0.681	0.661	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG02922	1.163	1.129	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG03006	1.287	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG03052	0.778	0.755	0.0	0.027	0.581	0.614	1	1
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG03642	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	HG03742	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA12878	0.946	0.919	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA18525	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA18939	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA19017	1.216	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA19238	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA19239	1.411	1.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA19625	1.107	1.074	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA19648	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA20502	1.208	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	89993274	89993331	DEL	58	NA20845	1.165	1.131	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG00096	0.974	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG00268	0.997	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG00419	0.993	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG00759	0.93	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG01051	0.32	0.356	0.0	0.069	0.533	0.533	1	1
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG01112	0.987	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG01500	0.813	0.904	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG01565	0.346	0.385	0.012	0.094	0.333	0.354	1	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG01583	1.291	1.435	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG01595	0.752	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG01879	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG02568	0.681	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG02922	0.727	0.808	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG03006	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG03052	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG03642	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	HG03742	0.949	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA12878	0.929	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA18525	0.732	0.814	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA18939	0.921	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA19017	0.967	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA19238	0.802	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA19239	0.86	0.955	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA19625	1.081	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA19648	0.87	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA20502	0.935	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9235644	9235869	DEL	226	NA20845	0.884	0.982	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG00096	1.245	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG00268	1.186	1.151	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG00419	1.378	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG00759	0.989	0.96	0.0	0.0	0.905	0.86	5	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG01051	0.601	0.583	0.005	0.007	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG01112	0.61	0.592	0.047	0.014	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG01500	1.061	1.03	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG01565	0.0	0.0	0.232	0.081	nan	nan	0	0
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG01583	0.502	0.488	0.055	0.018	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG01595	0.613	0.596	0.019	0.014	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG01879	1.054	1.023	0.0	0.0	0.829	0.829	5	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG02568	1.21	1.175	0.0	0.0	0.759	0.759	4	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG02922	0.976	0.948	0.0	0.0	0.6	0.6	5	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG03006	0.643	0.625	0.029	0.02	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG03052	1.198	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG03642	1.085	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	HG03742	1.323	1.285	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA12878	0.456	0.443	0.034	0.016	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA18525	0.488	0.474	0.087	0.017	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA18939	0.655	0.636	0.025	0.013	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA19017	1.087	1.055	0.0	0.0	0.874	0.874	6	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA19238	1.178	1.143	0.005	0.0	0.8	0.8	5	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA19239	1.116	1.084	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA19625	0.503	0.488	0.115	0.034	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA19648	0.671	0.652	0.051	0.023	nan	nan	0	1
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA20502	0.0	0.0	0.174	0.114	nan	nan	0	0
chr5	95966477	95967328	DEL	852	NA20845	0.496	0.482	0.031	0.016	nan	nan	0	1
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG00096	0.451	0.501	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG00268	0.464	0.515	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG00419	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG00759	0.833	0.926	0.0	0.0	0.778	0.819	1	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG01051	0.801	0.89	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG01112	0.682	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG01500	0.531	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG01565	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG01583	0.909	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG01595	0.772	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG01879	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG02568	0.832	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG02922	0.748	0.831	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG03006	0.894	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG03052	0.757	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG03642	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	HG03742	0.882	0.98	0.0	0.0	0.941	0.988	1	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA12878	0.71	0.788	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA18525	1.255	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA18939	0.779	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA19017	0.847	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA19238	0.945	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA19239	0.731	0.812	0.0	0.0	0.742	0.742	1	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA19625	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA19648	1.144	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA20502	0.752	0.836	0.0	0.003	1.0	1.0	1	2
chr5	97035240	97035573	DEL	334	NA20845	0.561	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG00096	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG00268	1.065	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG00419	1.216	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG00759	1.182	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG01051	0.961	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG01112	1.274	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG01500	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG01565	1.222	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG01583	1.291	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG01595	1.326	1.239	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG01879	1.072	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG02568	1.021	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG02922	1.08	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG03006	1.037	0.969	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG03052	1.156	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG03642	1.257	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	HG03742	1.227	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA12878	0.963	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA18525	1.186	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA18939	0.974	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA19017	0.866	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA19238	1.139	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA19239	1.078	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA19625	1.006	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA19648	0.497	0.465	0.06	0.042	nan	nan	0	1
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA20502	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97119779	97120559	DEL	781	NA20845	1.294	1.209	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG00096	1.064	1.064	0.004	0.002	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG00268	1.203	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG00419	0.729	0.729	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG00759	1.047	1.047	0.0	0.0	0.793	0.753	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG01051	0.921	0.921	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG01112	1.022	1.022	0.0	0.0	0.955	0.907	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG01500	0.866	0.866	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG01565	0.835	0.835	0.0	0.0	0.75	0.797	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG01583	1.052	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG01595	0.97	0.97	0.0	0.0	0.773	0.73	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG01879	0.822	0.822	0.0	0.0	0.523	0.523	2	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG02568	1.248	1.248	0.0	0.0	0.832	0.832	2	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG02922	0.935	0.935	0.0	0.0	0.655	0.655	2	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG03006	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG03052	0.925	0.925	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG03642	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	HG03742	0.978	0.978	0.0	0.0	0.664	0.677	2	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA12878	0.895	0.895	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA18525	0.942	0.942	0.0	0.0	0.772	0.772	2	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA18939	0.85	0.85	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA19017	1.197	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA19238	0.971	0.971	0.0	0.0	0.732	0.732	1	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA19239	0.5	0.5	0.079	0.0	0.208	0.208	10	1
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA19625	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA19648	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA20502	0.889	0.889	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	9734900	9735736	DEL	837	NA20845	0.906	0.906	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG00096	0.686	0.686	0.0	0.0	0.947	0.947	3	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG00268	0.687	0.687	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG00419	0.547	0.547	0.0	0.044	0.667	0.667	2	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG00759	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG01051	0.621	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG01112	0.269	0.269	0.0	0.069	0.617	0.615	2	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG01500	0.265	0.265	0.0	0.081	0.714	0.709	2	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG01565	0.591	0.591	0.0	0.0	0.714	0.759	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG01583	0.837	0.837	0.0	0.002	0.769	0.769	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG01595	0.732	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG01879	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG02568	0.567	0.567	0.0	0.012	0.75	0.75	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG02922	0.748	0.748	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG03006	0.197	0.197	0.0	0.08	0.789	0.754	1	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG03052	0.179	0.179	0.0	0.046	0.786	0.744	1	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG03642	0.715	0.715	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	HG03742	0.268	0.268	0.0	0.075	0.727	0.693	1	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA12878	0.439	0.439	0.0	0.094	0.806	0.806	2	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA18525	0.82	0.82	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA18939	0.593	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA19017	0.792	0.792	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA19238	0.738	0.738	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA19239	0.43	0.43	0.0	0.058	0.723	0.723	1	1
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA19625	0.83	0.83	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA19648	0.597	0.597	0.0	0.013	0.533	0.533	1	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA20502	0.729	0.729	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr5	97413946	97414039	DEL	94	NA20845	0.69	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG00096	0.938	0.987	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG00268	0.945	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG00419	1.013	1.066	0.006	0.0	0.71	0.71	2	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG00759	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG01051	0.721	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG01112	0.682	0.717	0.0	0.0	0.703	0.74	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG01500	0.778	0.819	0.0	0.0	0.611	0.585	2	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG01565	0.815	0.858	0.0	0.0	0.941	1.0	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG01583	0.861	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG01595	0.791	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG01879	0.875	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG02568	1.021	1.075	0.0	0.0	0.928	0.928	2	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG02922	1.143	1.203	0.0	0.004	0.63	0.63	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG03006	0.411	0.433	0.075	0.046	nan	nan	0	1
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG03052	0.904	0.952	0.005	0.0	0.867	0.915	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG03642	0.789	0.83	0.0	0.0	0.728	0.728	2	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	HG03742	0.652	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA12878	0.946	0.996	0.0	0.002	0.958	0.958	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA18525	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA18939	0.974	1.025	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA19017	0.534	0.562	0.062	0.043	nan	nan	0	1
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA19238	1.126	1.185	0.0	0.0	0.809	0.809	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA19239	0.885	0.932	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA19625	0.78	0.821	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA19648	0.97	1.021	0.0	0.0	0.729	0.729	2	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA20502	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	98477515	98478343	DEL	829	NA20845	0.712	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG00096	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG00268	1.34	1.253	0.0	0.0	0.565	0.565	1	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG00419	0.973	0.909	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG00759	1.202	1.123	0.0	0.0	0.962	0.913	1	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG01051	1.041	0.973	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG01112	1.256	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG01500	1.326	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG01565	1.263	1.18	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG01583	0.956	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG01595	1.464	1.368	0.0	0.006	0.485	0.513	1	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG01879	1.572	1.469	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG02568	0.945	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG02922	1.475	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG03006	1.358	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	HG03642	0.937	0.876	0.007	0.009	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA12878	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA18525	1.011	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA18939	1.116	1.043	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA19017	1.216	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA19238	1.333	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA19239	1.257	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA19625	1.333	1.246	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA19648	1.293	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA20502	0.821	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99161928	99162196	DUP	269	NA20845	1.38	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG00096	0.758	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG00268	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG00419	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG00759	1.085	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG01051	0.941	0.914	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG01112	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG01500	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG01565	0.835	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG01583	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG01595	1.326	1.287	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG01879	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG02568	0.983	0.954	0.0	0.022	0.917	0.917	1	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG02922	1.122	1.089	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG03006	1.072	1.041	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG03052	0.0	0.0	0.009	0.176	nan	nan	0	0
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG03642	0.912	0.886	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	HG03742	0.94	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA12878	0.845	0.82	0.005	0.007	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA18525	1.221	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA18939	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA19017	0.774	0.751	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA19238	0.621	0.603	0.0	0.061	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA19239	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA19625	0.805	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA19648	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA20502	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99494175	99494429	DEL	255	NA20845	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG00096	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG00268	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG00419	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG00759	1.279	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG01051	1.302	1.264	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG01112	1.417	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG01500	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG01565	1.242	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG01583	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG01595	1.266	1.229	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG01879	1.357	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG02568	0.87	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG02922	1.392	1.351	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG03006	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG03052	0.946	0.918	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG03642	1.109	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	HG03742	1.189	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA12878	0.862	0.837	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA18525	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA18939	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA19017	0.497	0.483	0.007	0.062	nan	nan	0	1
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA19238	1.152	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA19239	1.437	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA19625	1.182	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA19648	1.293	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA20502	1.231	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr5	99757275	99757673	DEL	399	NA20845	1.359	1.319	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG00096	0.489	0.489	0.072	0.053	nan	nan	0	1
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG00268	0.0	0.0	0.241	0.145	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG00419	0.0	0.0	0.159	0.124	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG00759	0.0	0.0	0.211	0.186	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG01051	0.0	0.0	0.303	0.238	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG01112	0.487	0.487	0.079	0.056	nan	nan	0	1
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG01500	0.0	0.0	0.327	0.216	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG01565	0.449	0.449	0.084	0.074	nan	nan	0	1
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG01583	0.0	0.0	0.214	0.132	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG01595	0.0	0.0	0.19	0.121	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG01879	0.0	0.0	0.221	0.163	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG02568	0.0	0.0	0.188	0.141	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG02922	0.0	0.0	0.283	0.162	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG03006	0.0	0.0	0.267	0.181	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG03052	0.0	0.0	0.167	0.152	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG03642	0.0	0.0	0.153	0.126	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	HG03742	0.0	0.0	0.295	0.16	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA12878	0.0	0.0	0.329	0.21	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA18525	0.0	0.0	0.248	0.188	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA18939	0.0	0.0	0.241	0.216	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA19017	0.0	0.0	0.308	0.203	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA19238	0.0	0.0	0.302	0.183	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA19239	0.0	0.0	0.412	0.159	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA19625	0.0	0.0	0.287	0.178	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA19648	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA20502	0.0	0.0	0.231	0.156	nan	nan	0	0
chr6	100034558	100035368	DEL	811	NA20845	0.0	0.0	0.251	0.162	nan	nan	0	0
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG00096	1.304	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG00268	1.345	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG00419	1.261	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG00759	1.533	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG01051	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG01112	1.497	1.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG01500	1.314	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG01565	1.429	1.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG01583	1.08	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG01595	1.149	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG01879	1.252	1.149	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG02568	0.874	0.802	0.0	0.058	0.171	0.171	1	1
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG02922	1.311	1.202	0.0	0.006	0.96	0.96	1	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG03006	1.417	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG03052	0.935	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG03642	1.546	1.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	HG03742	1.255	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA12878	1.045	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA18525	1.168	1.071	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA18939	1.247	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA19017	1.312	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA19238	1.195	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA19239	1.499	1.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA19625	0.989	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA19648	1.198	1.099	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA20502	1.14	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	101757353	101757457	DEL	105	NA20845	1.43	1.312	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG00096	0.435	0.435	0.05	0.004	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG00268	0.0	0.0	0.19	0.024	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG00419	0.508	0.508	0.018	0.003	0.16	0.16	1	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG00759	0.631	0.631	0.024	0.003	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG01051	0.0	0.0	0.087	0.012	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG01112	0.0	0.0	0.09	0.008	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG01500	0.0	0.0	0.107	0.015	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG01565	0.0	0.0	0.09	0.015	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG01583	0.552	0.552	0.021	0.003	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG01595	0.436	0.436	0.031	0.0	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG01879	0.93	0.93	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG02568	1.178	1.178	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG02922	1.082	1.082	0.0	0.0	0.423	0.423	1	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG03006	0.0	0.0	0.163	0.009	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG03052	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG03642	0.0	0.0	0.163	0.028	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	HG03742	0.598	0.598	0.017	0.004	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA12878	0.0	0.0	0.068	0.002	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA18525	0.0	0.0	0.128	0.014	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA18939	0.0	0.0	0.104	0.016	nan	nan	0	0
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA19017	0.979	0.979	0.0	0.0	0.556	0.531	2	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA19238	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA19239	1.105	1.105	0.0	0.0	0.911	0.911	1	2
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA19625	0.431	0.431	0.021	0.006	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA19648	0.649	0.649	0.028	0.002	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA20502	0.433	0.433	0.061	0.002	nan	nan	0	1
chr6	10264425	10265263	DEL	839	NA20845	0.0	0.0	0.148	0.029	nan	nan	0	0
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG00096	1.141	1.066	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG00268	1.017	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG00419	1.118	1.045	0.0	0.0	0.544	0.544	2	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG00759	1.475	1.378	0.0	0.0	0.817	0.778	2	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG01051	1.09	1.019	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG01112	1.118	1.045	0.0	0.0	0.617	0.617	2	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG01500	0.71	0.664	0.075	0.041	nan	nan	0	1
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG01565	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG01583	1.032	0.964	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG01595	1.228	1.147	0.0	0.0	0.693	0.693	2	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG01879	1.181	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG02568	1.216	1.136	0.0	0.0	0.487	0.487	4	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG02922	1.103	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG03006	0.61	0.57	0.116	0.058	0.952	0.998	1	1
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG03052	0.935	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG03642	0.449	0.42	0.097	0.062	nan	nan	0	1
chr6	102815119	102815822	DEL	704	HG03742	1.216	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA12878	1.096	1.024	0.003	0.0	0.699	0.699	2	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA18525	1.063	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA18939	1.105	1.033	0.0	0.0	0.681	0.711	2	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA19017	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA19238	1.027	0.959	0.0	0.0	0.781	0.781	4	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA19239	1.202	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA19625	1.166	1.09	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA19648	0.599	0.56	0.069	0.036	nan	nan	0	1
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA20502	0.456	0.426	0.094	0.051	nan	nan	0	1
chr6	102815119	102815822	DEL	704	NA20845	1.214	1.134	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG00096	0.471	0.496	0.0	0.083	0.0	0.0	1	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG00268	0.466	0.49	0.0	0.091	0.462	0.462	3	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG00419	1.098	1.156	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG00759	0.815	0.858	0.0	0.0	0.842	0.884	1	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.222	nan	nan	0	0
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG01112	0.802	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.224	nan	nan	0	0
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG01583	0.216	0.227	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG01595	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG01879	1.073	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG02568	0.646	0.68	0.0	0.148	0.0	0.0	1	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG02922	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG03006	0.377	0.397	0.0	0.068	0.0	0.0	1	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG03052	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG03642	1.097	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	HG03742	0.425	0.447	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA12878	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA18525	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA18939	0.927	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA19017	0.591	0.623	0.0	0.096	0.0	0.0	1	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA19238	0.923	0.971	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA19239	0.413	0.435	0.0	0.089	0.0	0.0	1	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA19625	0.482	0.507	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA19648	0.499	0.525	0.0	0.056	0.0	0.0	1	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA20502	0.433	0.456	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr6	10293995	10294140	DEL	146	NA20845	1.192	1.255	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG00096	0.905	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG00268	0.845	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG00419	0.813	0.746	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG00759	1.125	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG01051	1.09	1.0	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG01112	0.739	0.678	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG01500	0.977	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG01565	0.673	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG01583	0.792	0.726	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG01595	1.267	1.163	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG01879	0.662	0.607	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG02568	0.57	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG02922	0.728	0.668	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG03006	0.969	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG03052	0.701	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG03642	0.973	0.892	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	HG03742	1.139	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA12878	0.822	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA18525	1.011	0.928	0.012	0.0	0.76	0.792	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA18939	0.82	0.752	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA19017	0.795	0.729	0.0	0.0	0.667	0.638	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA19625	0.735	0.675	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA19648	0.848	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA20502	0.684	0.628	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr6	103027885	103027984	DUP	100	NA20845	0.889	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG00096	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG00268	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG00419	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG00759	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG01051	0.263	0.276	0.0	0.022	0.923	0.923	1	1
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG01112	0.487	0.512	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG01500	0.746	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG01565	0.143	0.15	0.0	0.052	0.545	0.545	1	1
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG01583	0.816	0.859	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG01595	0.634	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG01879	0.716	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG02568	0.418	0.44	0.0	0.016	1.0	1.0	1	1
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG02922	0.291	0.307	0.0	0.036	0.85	0.85	1	1
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG03006	0.735	0.774	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG03052	0.701	0.738	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG03642	0.449	0.473	0.0	0.006	0.211	0.211	1	1
chr6	104634908	104634964	DEL	57	HG03742	0.598	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA12878	0.822	0.865	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA18525	0.697	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA18939	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA19238	0.923	0.971	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA19239	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA19625	0.482	0.507	0.0	0.033	0.474	0.474	1	1
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA19648	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA20502	0.525	0.552	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr6	104634908	104634964	DEL	57	NA20845	0.715	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG00096	1.159	1.288	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG00268	0.94	1.044	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG00759	0.931	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG01051	0.545	0.606	0.0	0.059	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG01112	0.902	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG01500	1.137	1.263	0.007	0.004	0.862	0.826	1	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG01565	0.49	0.544	0.01	0.086	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG01595	0.495	0.55	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG01879	0.644	0.716	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG02568	1.178	1.309	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG02922	0.811	0.901	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG03006	0.0	0.0	0.005	0.162	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG03052	0.829	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG03642	0.524	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	HG03742	1.197	1.33	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA12878	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA18525	0.558	0.62	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA18939	0.463	0.515	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA19017	0.998	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA19238	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA19239	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA19625	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA19648	0.724	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA20502	0.479	0.532	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr6	11034634	11034769	DEL	136	NA20845	0.433	0.482	0.01	0.095	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG00096	1.123	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG00268	0.5	0.526	0.032	0.021	nan	nan	0	1
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG00419	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG00759	0.0	0.0	0.244	0.171	nan	nan	0	0
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG01051	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG01112	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG01500	0.906	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG01565	1.0	1.053	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG01583	0.0	0.0	0.121	0.067	nan	nan	0	0
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG01595	0.0	0.0	0.205	0.127	nan	nan	0	0
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG01879	1.002	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG02568	0.855	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG02922	0.77	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG03006	0.0	0.0	0.177	0.139	nan	nan	0	0
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG03052	0.999	1.052	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG03642	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	HG03742	1.023	1.077	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA12878	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA18525	1.098	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA18939	0.0	0.0	0.162	0.111	nan	nan	0	0
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA19017	0.333	0.35	0.048	0.055	nan	nan	0	1
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA19238	0.403	0.424	0.022	0.022	nan	nan	0	1
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA19239	0.413	0.435	0.04	0.032	nan	nan	0	1
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA19625	0.963	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA19648	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA20502	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111071012	111071568	DEL	557	NA20845	0.564	0.593	0.051	0.024	nan	nan	0	1
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG00096	0.942	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG00268	0.931	1.122	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG00419	0.773	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG00759	0.64	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG01051	0.687	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG01112	0.595	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG01500	0.764	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG01565	0.633	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG01583	0.864	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG01595	0.535	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG01879	0.877	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG02568	0.684	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG02922	0.416	0.501	0.0	0.012	0.625	0.625	1	1
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG03006	0.735	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG03052	0.765	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG03642	0.599	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	HG03742	0.579	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA12878	0.993	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA18525	0.715	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA18939	0.909	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA19017	0.943	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA19238	0.728	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA19239	0.788	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA19625	0.811	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA19648	0.886	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA20502	0.867	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	111832273	111832330	DEL	58	NA20845	0.78	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG00096	0.272	0.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG00268	0.379	0.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG00419	0.468	0.468	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG01051	0.222	0.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG01112	0.325	0.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG01500	0.479	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG01565	0.449	0.449	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG01583	0.432	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG01595	0.158	0.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG01879	0.394	0.394	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG02568	0.456	0.456	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG02922	0.416	0.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG03006	0.413	0.413	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG03052	0.361	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG03642	0.324	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	HG03742	0.386	0.386	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA12878	0.377	0.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA18525	0.453	0.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA18939	0.49	0.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA19017	0.499	0.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA19238	0.598	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA19239	0.362	0.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA19625	0.279	0.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA19648	0.324	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA20502	0.353	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	11308463	11308616	DUP	154	NA20845	0.39	0.39	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG00096	1.376	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG00268	1.483	1.44	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG00419	1.464	1.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG00759	1.358	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG01051	0.586	0.569	0.008	0.053	nan	nan	0	1
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG01112	1.208	1.173	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG01500	1.154	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG01565	1.327	1.288	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG01583	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG01595	1.188	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG01879	1.038	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG02568	1.216	1.18	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG02922	1.498	1.454	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG03006	1.291	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG03052	1.211	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG03642	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	HG03742	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA12878	1.302	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA18525	0.872	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA18939	1.497	1.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA19017	1.395	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA19238	1.195	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA19239	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA19625	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA19648	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA20502	1.437	1.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	118568833	118569060	DEL	228	NA20845	1.387	1.347	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG00096	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG00268	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG00419	0.915	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG00759	0.776	0.817	0.0	0.0	0.75	0.788	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG01051	0.767	0.808	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG01112	0.865	0.911	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG01500	0.906	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG01565	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG01583	0.912	0.96	0.0	0.0	0.651	0.651	2	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG01595	0.792	0.834	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG01879	0.751	0.791	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG02568	1.064	1.12	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG02922	0.374	0.394	0.131	0.07	nan	nan	0	1
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG03006	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG03052	0.999	1.052	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG03642	0.823	0.866	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	HG03742	0.618	0.65	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA12878	0.959	1.01	0.0	0.0	0.474	0.474	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA18525	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA18939	0.891	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA19017	0.943	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA19238	0.845	0.889	0.003	0.0	0.955	0.955	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA19239	0.879	0.925	0.0	0.002	0.526	0.526	1	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA19625	0.938	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA19648	1.073	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA20502	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119039465	119040415	DEL	951	NA20845	0.629	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG00096	0.326	0.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG00268	0.345	0.363	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG00419	0.468	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG00759	0.388	0.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG01051	0.202	0.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG01112	0.325	0.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG01500	0.497	0.523	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG01565	0.286	0.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG01583	0.336	0.354	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG01595	0.317	0.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG01879	0.286	0.301	0.0	0.082	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG02568	0.114	0.12	0.0	0.027	nan	nan	0	1
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG02922	0.208	0.219	0.0	0.034	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG03006	0.305	0.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG03052	0.234	0.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG03642	0.324	0.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	HG03742	0.29	0.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA12878	0.411	0.433	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA18525	0.471	0.495	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA18939	0.214	0.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA19017	0.323	0.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA19238	0.377	0.397	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA19239	0.31	0.326	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA19625	0.254	0.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA19648	0.274	0.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA20502	0.433	0.456	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119444006	119444247	DEL	242	NA20845	0.412	0.433	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG00096	1.267	1.231	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG00268	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG00419	0.976	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG00759	1.397	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG01112	1.244	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG01500	1.225	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG01565	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG01583	1.296	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG01595	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG01879	0.769	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG02568	1.178	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG02922	1.103	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG03006	1.202	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG03052	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG03642	0.998	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	HG03742	1.004	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA12878	1.045	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA19017	1.552	1.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA19238	0.975	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA19239	1.215	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA19625	1.09	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA19648	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA20502	1.277	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	119610598	119610698	DUP	101	NA20845	1.257	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG00096	1.231	1.195	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG00268	1.155	1.122	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG00419	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG00759	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG01051	0.626	0.608	0.074	0.053	nan	nan	0	1
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG01112	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG01500	0.994	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG01565	1.02	0.991	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG01583	0.936	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG01595	1.307	1.269	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG01879	0.984	0.955	0.0	0.0	0.767	0.767	1	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG02568	1.026	0.996	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG02922	1.352	1.313	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG03006	1.202	1.167	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG03052	0.956	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG03642	1.122	1.09	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	HG03742	0.926	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA12878	0.839	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA18525	1.081	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA18939	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA19017	1.127	1.094	0.0	0.0	0.982	0.939	4	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA19238	0.845	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA19239	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA19625	1.014	0.985	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA19648	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA20502	1.083	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	120928662	120929501	DEL	840	NA20845	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG00096	0.525	0.665	0.006	0.199	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.251	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG00419	0.508	0.643	0.053	0.192	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG00759	0.446	0.565	0.035	0.207	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG01051	0.061	0.077	0.036	0.128	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG01112	0.0	0.0	0.018	0.239	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG01500	0.0	0.0	0.037	0.191	nan	nan	0	0
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG01565	0.449	0.568	0.056	0.173	nan	nan	0	0
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG01583	0.0	0.0	0.023	0.206	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG01595	0.109	0.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG01879	0.483	0.611	0.006	0.191	nan	nan	0	0
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG02568	0.095	0.12	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG02922	0.645	0.816	0.069	0.205	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG03006	0.61	0.772	0.047	0.23	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG03052	0.191	0.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG03642	0.0	0.0	0.022	0.186	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	HG03742	0.183	0.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.202	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA18525	0.105	0.132	0.009	0.099	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA18939	0.249	0.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA19017	0.176	0.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA19238	0.11	0.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA19239	0.168	0.213	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA19625	0.203	0.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA19648	0.1	0.126	0.011	0.086	nan	nan	0	1
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA20502	0.57	0.722	0.009	0.235	nan	nan	0	0
chr6	121319292	121319616	DEL	325	NA20845	0.0	0.0	0.022	0.231	nan	nan	0	1
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG00096	0.815	0.905	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG00268	0.655	0.728	0.0	0.003	0.364	0.364	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG00419	0.549	0.61	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG00759	0.33	0.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG01051	0.485	0.539	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG01112	1.352	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG01500	0.817	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG01565	0.633	0.703	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG01583	0.432	0.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG01595	0.376	0.418	0.0	0.061	0.685	0.685	2	1
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG01879	0.68	0.755	0.0	0.003	0.615	0.615	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG02568	0.456	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG02922	0.395	0.439	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG03006	0.574	0.638	0.009	0.0	0.1	0.095	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG03052	0.361	0.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG03642	0.798	0.887	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	HG03742	0.386	0.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA12878	0.993	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.201	nan	nan	0	1
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA19017	0.407	0.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA19238	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA19239	0.465	0.517	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA19625	0.127	0.141	0.0	0.073	0.778	0.778	1	1
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA19648	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA20502	0.525	0.583	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr6	121629817	121629919	DEL	103	NA20845	0.737	0.819	0.0	0.005	0.333	0.333	1	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG00096	0.815	0.815	0.007	0.0	0.6	0.6	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG00268	0.845	0.845	0.0	0.0	0.846	0.846	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG00419	0.712	0.712	0.0	0.0	0.523	0.523	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG00759	0.757	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG01051	0.384	0.384	0.03	0.019	nan	nan	0	1
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG01112	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG01500	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG01565	0.878	0.878	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG01583	0.336	0.336	0.028	0.013	nan	nan	0	1
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG01595	0.713	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG01879	0.787	0.787	0.0	0.0	0.947	0.947	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG02568	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG02922	0.478	0.478	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG03006	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG03052	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG03642	0.673	0.673	0.0	0.0	0.944	0.944	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	HG03742	0.598	0.598	0.0	0.0	0.529	0.529	3	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA12878	0.839	0.839	0.0	0.0	0.867	0.867	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA18525	0.418	0.418	0.061	0.022	nan	nan	0	1
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA18939	0.713	0.713	0.0	0.0	0.517	0.54	3	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA19017	1.016	1.016	0.0	0.0	0.848	0.811	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA19238	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA19239	0.969	0.969	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA19625	0.786	0.786	0.0	0.0	0.79	0.79	2	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA19648	0.798	0.798	0.0	0.0	0.765	0.812	1	2
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA20502	0.456	0.456	0.027	0.009	nan	nan	0	1
chr6	121797437	121798052	DEL	616	NA20845	0.412	0.412	0.058	0.019	nan	nan	0	1
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG00096	0.76	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG00268	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG00419	0.62	0.689	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG00759	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG01051	0.646	0.718	0.0	0.003	1.0	1.0	1	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG01112	0.577	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG01500	0.497	0.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG01565	0.49	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG01583	0.768	0.853	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG01595	0.554	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG01879	0.716	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG02568	1.102	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG02922	0.686	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG03006	0.682	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG03052	0.786	0.874	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG03642	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	HG03742	0.347	0.386	0.009	0.08	nan	nan	0	1
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA12878	0.788	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA18525	0.906	1.007	0.0	0.003	0.381	0.366	1	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA18939	0.321	0.356	0.007	0.108	nan	nan	0	1
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA19017	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA19238	0.76	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA19239	0.788	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA19625	0.811	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA19648	0.823	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA20502	0.73	0.811	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr6	121808937	121809164	DEL	228	NA20845	0.607	0.674	0.0	0.004	0.857	0.857	1	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG00096	0.923	0.923	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG00268	1.207	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG00419	1.017	1.017	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG00759	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG01051	1.01	1.01	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG01112	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG01500	1.137	1.137	0.0	0.0	0.838	0.803	1	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG01565	0.796	0.796	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG01583	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG01595	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG01879	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG02568	1.064	1.064	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG02922	1.123	1.123	0.0	0.0	0.935	0.935	2	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG03006	0.888	0.888	0.0	0.0	0.833	0.795	1	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG03052	0.946	0.946	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG03642	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	HG03742	1.119	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA12878	0.719	0.719	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA18525	0.471	0.471	0.041	0.043	nan	nan	0	1
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA19017	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA19238	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA19239	1.021	1.021	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA19625	1.268	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA19648	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA20502	1.14	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	12393281	12394192	DEL	912	NA20845	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG00096	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG00268	0.397	0.371	0.0	0.061	0.939	0.939	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG00419	0.366	0.342	0.0	0.04	0.826	0.826	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.082	nan	nan	0	0
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG01051	0.565	0.528	0.0	0.04	0.767	0.767	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG01112	1.461	1.365	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG01500	1.048	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG01565	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG01583	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG01595	0.574	0.537	0.0	0.041	0.68	0.68	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG01879	0.483	0.451	0.0	0.048	0.811	0.811	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	0
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG03006	1.274	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG03642	0.474	0.443	0.0	0.027	0.889	0.889	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	HG03742	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA12878	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA18525	0.488	0.456	0.0	0.038	0.722	0.752	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA18939	0.481	0.45	0.0	0.025	0.581	0.606	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	0
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA19238	0.624	0.583	0.0	0.038	0.897	0.897	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA19239	0.633	0.592	0.0	0.036	0.81	0.81	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA19625	1.09	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA19648	0.449	0.42	0.0	0.038	0.818	0.869	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA20502	0.821	0.767	0.0	0.037	0.366	0.366	1	1
chr6	124317460	124317534	DEL	75	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG00096	0.0	0.0	0.007	0.143	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG00268	0.621	0.603	0.007	0.051	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG00419	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG00759	0.524	0.509	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG01051	0.727	0.706	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG01500	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG01565	0.469	0.456	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG01583	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG01595	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG01879	0.751	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG02922	0.0	0.0	0.019	0.104	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG03006	0.628	0.61	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG03642	0.449	0.436	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	HG03742	0.386	0.375	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA12878	0.308	0.299	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA18525	0.872	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA18939	0.837	0.813	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA19017	0.0	0.0	0.007	0.121	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA19238	0.572	0.555	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA19625	0.482	0.468	0.012	0.041	nan	nan	0	1
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA19648	0.773	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr6	126468009	126468247	DEL	239	NA20845	0.325	0.316	0.012	0.082	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG00096	0.616	0.598	0.069	0.055	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG00268	1.121	1.088	0.0	0.0	0.862	0.862	3	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG00419	1.159	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG00759	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG01051	0.545	0.529	0.085	0.044	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG01112	0.541	0.525	0.073	0.044	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG01500	0.994	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG01565	0.939	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG01583	0.48	0.466	0.098	0.049	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG01595	1.05	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG01879	0.519	0.504	0.082	0.052	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG02568	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG02922	1.165	1.131	0.0	0.0	0.947	0.947	3	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG03006	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG03052	1.19	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG03642	0.549	0.533	0.102	0.056	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	HG03742	0.598	0.581	0.112	0.059	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA12878	0.514	0.499	0.068	0.043	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA18525	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA18939	1.14	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA19017	1.146	1.112	0.0	0.0	0.909	0.95	1	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA19238	1.065	1.034	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA19239	1.279	1.242	0.0	0.0	0.86	0.86	2	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA19625	0.583	0.566	0.081	0.039	nan	nan	0	1
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA19648	1.173	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA20502	1.186	1.151	0.0	0.0	0.816	0.816	4	2
chr6	131418012	131418980	DEL	969	NA20845	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG00096	1.141	1.046	0.0	0.0	0.97	0.97	1	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG00268	1.224	1.123	0.0	0.003	0.811	0.811	1	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG00759	1.106	1.015	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG01051	0.929	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG01112	1.208	1.108	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG01500	1.012	0.929	0.0	0.0	0.778	0.812	1	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG01583	0.936	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG02568	0.722	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	HG03742	0.994	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	NA18939	0.944	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	NA19648	1.297	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	NA20502	1.026	0.941	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr6	131440528	131440607	DUP	80	NA20845	1.084	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG00096	1.032	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG00268	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG00419	0.813	0.904	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG00759	1.193	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG01051	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG01112	0.992	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG01500	0.941	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG01565	1.102	1.224	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG01583	1.128	1.253	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG01595	1.01	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG01879	0.966	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG02568	1.064	1.182	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG02922	0.999	1.109	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG03006	0.951	1.056	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG03052	0.468	0.52	0.0	0.026	0.478	0.478	1	1
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG03642	1.097	1.219	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	HG03742	1.023	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA12878	0.959	1.066	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA18525	1.028	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA18939	1.069	1.188	0.007	0.007	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA19017	0.573	0.637	0.0	0.035	0.793	0.829	1	1
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA19238	0.585	0.65	0.0	0.031	0.854	0.854	1	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA19239	0.943	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA19625	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA19648	0.873	0.97	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA20502	1.391	1.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	131684406	131684477	DEL	72	NA20845	0.932	1.035	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG00096	0.851	0.978	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG00268	0.931	1.07	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG00419	0.895	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG00759	0.776	0.892	0.0	0.0	0.65	0.683	1	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG01051	0.828	0.952	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG01112	0.685	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG01500	0.533	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG01565	0.796	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG01583	0.696	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG01879	1.002	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG02568	1.083	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG02922	0.707	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG03006	0.682	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG03052	0.68	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG03642	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	HG03742	0.676	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA12878	0.908	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA18525	0.889	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA18939	0.641	0.737	0.0	0.0	0.706	0.676	1	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA19238	0.91	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA19239	1.008	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA19625	0.837	0.962	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA19648	0.923	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA20502	0.867	0.996	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr6	133475444	133475511	DUP	68	NA20845	1.149	1.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG00096	0.416	0.438	0.075	0.047	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG00268	0.431	0.454	0.058	0.042	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG00419	1.017	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG00759	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG01051	0.485	0.51	0.053	0.043	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG01112	0.559	0.588	0.033	0.025	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG01500	0.533	0.561	0.066	0.04	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG01565	0.49	0.516	0.014	0.01	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG01583	1.056	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG01595	0.693	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG01879	0.894	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG02568	0.494	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG02922	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG03006	0.43	0.453	0.05	0.034	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG03052	0.935	0.984	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG03642	0.449	0.473	0.048	0.024	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	HG03742	0.463	0.488	0.058	0.04	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA12878	0.462	0.487	0.092	0.066	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA18525	0.994	1.046	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA18939	0.731	0.769	0.0	0.0	0.958	1.0	1	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA19017	1.053	1.109	0.0	0.0	0.759	0.726	1	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA19238	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA19239	0.969	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA19625	0.786	0.827	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA19648	0.0	0.0	0.287	0.135	nan	nan	0	0
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA20502	0.479	0.504	0.059	0.046	nan	nan	0	1
chr6	134268952	134269719	DEL	768	NA20845	0.282	0.297	0.045	0.02	nan	nan	0	1
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG00096	0.905	0.905	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG00268	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG00419	0.976	0.976	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG00759	0.757	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG01051	0.868	0.868	0.0	0.002	0.476	0.476	1	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG01112	0.829	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG01500	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG01565	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG01583	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG01595	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG01879	0.805	0.805	0.0	0.0	0.677	0.677	1	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG02568	0.874	0.874	0.0	0.0	0.775	0.775	4	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG02922	0.728	0.728	0.0	0.0	0.727	0.727	4	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG03006	0.951	0.951	0.0	0.0	0.745	0.711	4	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG03052	0.723	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG03642	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	HG03742	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA12878	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA18525	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA18939	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA19017	0.998	0.998	0.0	0.0	0.64	0.612	4	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA19238	0.533	0.533	0.073	0.001	nan	nan	0	1
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA19239	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA19625	0.913	0.913	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA19648	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA20502	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	134603589	134604447	DEL	859	NA20845	0.954	0.954	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG00096	0.091	0.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG00268	0.121	0.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG00419	0.0	0.0	0.009	0.272	nan	nan	0	0
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG00759	0.019	0.025	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG01051	0.02	0.026	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG01112	0.036	0.046	0.017	0.157	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG01500	0.018	0.022	0.013	0.153	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG01565	0.184	0.232	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG01583	0.0	0.0	0.006	0.251	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG01595	0.02	0.025	0.0	0.14	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG01879	0.0	0.0	0.008	0.221	nan	nan	0	0
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG02568	0.038	0.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG02922	0.0	0.0	0.015	0.237	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG03006	0.09	0.114	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG03052	0.0	0.0	0.018	0.287	nan	nan	0	0
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG03642	0.05	0.063	0.01	0.093	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	HG03742	0.0	0.0	0.029	0.299	nan	nan	0	0
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA12878	0.034	0.043	0.0	0.128	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA18525	0.105	0.132	0.005	0.157	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA18939	0.036	0.045	0.006	0.206	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA19017	0.0	0.0	0.023	0.221	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA19238	0.052	0.066	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA19239	0.0	0.0	0.005	0.281	nan	nan	0	0
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA19625	0.203	0.257	0.005	0.113	nan	nan	0	1
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA19648	0.075	0.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA20502	0.046	0.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136235615	136235925	DEL	311	NA20845	0.0	0.0	0.014	0.187	nan	nan	0	0
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG00096	0.833	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG00268	0.655	0.612	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG00419	0.783	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG00759	0.97	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG01051	0.889	0.83	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG01112	0.902	0.843	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG01500	0.923	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG01565	0.755	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG01583	0.768	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG01595	0.535	0.5	0.0	0.02	0.318	0.318	1	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG01879	0.644	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG02568	0.836	0.781	0.0	0.04	0.609	0.609	1	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG02922	0.78	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG03006	0.574	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG03052	0.744	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG03642	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	HG03742	1.042	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA12878	0.754	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA18525	0.41	0.383	0.0	0.012	0.517	0.539	1	1
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA18939	0.303	0.283	0.0	0.02	0.714	0.745	1	1
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA19017	0.628	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA19238	0.689	0.644	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA19239	0.775	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA19625	0.9	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA19648	0.923	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA20502	0.616	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	136631990	136632061	DEL	72	NA20845	0.954	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG00096	0.0	0.0	0.08	0.286	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG00268	0.0	0.0	0.128	0.27	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG00419	0.0	0.0	0.222	0.27	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG00759	0.0	0.0	0.132	0.331	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG01051	0.0	0.0	0.089	0.201	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG01112	0.0	0.0	0.142	0.333	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG01500	0.0	0.0	0.125	0.27	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG01565	0.0	0.0	0.231	0.283	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG01583	0.0	0.0	0.12	0.215	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG01595	0.0	0.0	0.187	0.293	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG01879	0.0	0.0	0.089	0.233	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG02568	0.342	0.332	0.036	0.093	nan	nan	0	1
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG02922	0.0	0.0	0.137	0.194	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG03006	0.0	0.0	0.188	0.312	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG03052	0.319	0.31	0.066	0.176	nan	nan	0	1
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG03642	0.0	0.0	0.097	0.267	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	HG03742	0.0	0.0	0.11	0.212	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA12878	0.0	0.0	0.039	0.217	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA18525	0.0	0.0	0.061	0.277	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA18939	0.0	0.0	0.099	0.215	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA19017	0.61	0.592	0.045	0.068	nan	nan	0	1
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA19238	0.533	0.517	0.01	0.115	nan	nan	0	1
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA19239	0.0	0.0	0.041	0.266	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA19625	0.482	0.468	0.071	0.105	nan	nan	0	1
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA19648	0.0	0.0	0.12	0.341	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA20502	0.0	0.0	0.078	0.278	nan	nan	0	0
chr6	137313691	137314188	DEL	498	NA20845	0.0	0.0	0.159	0.226	nan	nan	0	0
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG00096	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG00268	1.035	1.089	0.0	0.0	0.639	0.639	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG00759	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG01051	1.01	1.063	0.0	0.004	0.762	0.762	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG01112	1.19	1.253	0.0	0.003	0.893	0.893	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG01500	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG01565	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG01583	0.96	1.01	0.0	0.0	0.938	0.937	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG01595	0.95	1.001	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG01879	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG02568	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG02922	0.978	1.029	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG03006	1.22	1.284	0.0	0.0	0.867	0.908	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG03052	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG03642	0.848	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	HG03742	0.907	0.955	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA12878	0.976	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA18525	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA18939	1.194	1.257	0.0	0.007	1.0	0.958	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA19017	0.85	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA19238	0.91	0.957	0.0	0.003	0.971	0.971	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA19239	0.995	1.047	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA19625	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA19648	1.148	1.208	0.0	0.0	0.889	0.837	1	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA20502	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	137471304	137471397	DUP	94	NA20845	0.824	0.867	0.0	0.009	0.533	0.533	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG00096	1.159	1.159	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG00268	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG00419	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG00759	1.087	1.087	0.0	0.0	0.628	0.659	2	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG01051	1.09	1.09	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG01112	1.064	1.064	0.0	0.0	0.424	0.424	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG01500	1.19	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG01565	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG01583	0.864	0.864	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG01595	1.03	1.03	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG01879	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG02568	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG02922	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG03006	1.121	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG03052	0.616	0.616	0.0	0.068	0.779	0.779	2	1
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG03642	1.022	1.022	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	HG03742	1.216	1.216	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA12878	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA18525	1.081	1.081	0.0	0.0	0.886	0.85	2	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA18939	0.855	0.855	0.0	0.0	0.902	0.901	2	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA19017	1.22	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA19238	0.936	0.936	0.0	0.0	0.698	0.698	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA19239	1.06	1.06	0.0	0.0	0.837	0.837	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA19625	0.799	0.799	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA19648	1.347	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA20502	1.231	1.231	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr6	138426004	138426095	DEL	92	NA20845	0.759	0.759	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG00096	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG00268	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG00419	0.773	0.813	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG00759	0.815	0.858	0.0	0.0	0.952	1.0	1	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG01051	0.606	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG01112	0.865	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG01500	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG01565	0.755	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG01583	0.84	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG01595	0.95	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG01879	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG02568	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG02922	1.019	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG03006	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG03052	0.383	0.403	0.015	0.036	nan	nan	0	1
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG03642	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	HG03742	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA12878	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA18525	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA18939	0.909	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA19017	0.517	0.545	0.011	0.046	nan	nan	0	1
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA19238	0.949	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA19239	0.413	0.435	0.005	0.088	nan	nan	0	1
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA19625	1.116	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA19648	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA20502	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	138492158	138492557	DEL	400	NA20845	0.867	0.913	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG00096	0.923	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG00268	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG00419	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG00759	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG01051	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG01112	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG01500	1.225	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG01565	0.755	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG01583	0.72	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG01595	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG01879	0.912	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG02568	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG02922	0.874	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG03006	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG03052	1.063	1.032	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG03642	0.499	0.484	0.017	0.044	0.385	0.385	1	1
chr6	141055223	141055726	DEL	504	HG03742	1.062	1.031	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA12878	0.719	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA18525	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA18939	1.087	1.055	0.0	0.0	0.742	0.711	1	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA19017	1.109	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA19238	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA19239	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA19625	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA19648	1.173	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA20502	1.049	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	141055223	141055726	DEL	504	NA20845	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG00096	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG00268	0.879	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG00419	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG00759	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG01051	0.909	0.957	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG01112	0.829	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG01500	1.012	1.066	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG01565	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG01583	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG01595	0.891	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG01879	0.34	0.358	0.034	0.097	nan	nan	0	1
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG02568	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG02922	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG03006	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG03052	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG03642	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	HG03742	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA12878	0.908	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA18525	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA18939	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA19017	1.072	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA19238	0.962	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA19239	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA19625	1.141	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA19648	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA20502	0.981	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	143378319	143378809	DEL	491	NA20845	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG00096	0.362	0.402	0.0	0.077	0.545	0.545	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG00268	0.483	0.536	0.0	0.102	0.472	0.472	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG00759	0.272	0.302	0.0	0.029	0.375	0.394	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG01051	0.485	0.539	0.0	0.054	0.36	0.36	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG01112	0.252	0.28	0.0	0.057	0.6	0.6	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG01500	0.444	0.493	0.0	0.066	0.387	0.404	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG01565	0.612	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG01879	0.769	0.855	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG02922	0.395	0.439	0.0	0.046	0.444	0.444	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG03006	0.305	0.339	0.0	0.049	0.875	0.917	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG03052	0.234	0.26	0.0	0.046	0.688	0.688	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.107	nan	nan	0	0
chr6	145818662	145818760	DEL	99	HG03742	0.193	0.214	0.0	0.062	0.75	0.75	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA12878	0.839	0.932	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA18525	0.471	0.523	0.0	0.04	0.571	0.595	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA18939	0.178	0.198	0.0	0.049	0.647	0.675	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA19017	0.314	0.349	0.0	0.039	0.256	0.254	2	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA19238	0.494	0.549	0.0	0.08	0.617	0.617	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA19239	0.375	0.416	0.0	0.045	0.643	0.643	2	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA19625	0.456	0.507	0.0	0.052	0.524	0.524	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA19648	0.474	0.527	0.0	0.058	0.65	0.691	1	1
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA20502	0.593	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	145818662	145818760	DEL	99	NA20845	0.65	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG00096	0.0	0.0	0.043	0.113	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG00268	0.0	0.0	0.033	0.168	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG00419	0.0	0.0	0.101	0.145	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG00759	0.0	0.0	0.044	0.131	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG01051	0.0	0.0	0.051	0.189	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG01112	0.0	0.0	0.069	0.139	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG01500	0.622	0.622	0.01	0.073	nan	nan	0	1
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG01565	0.49	0.49	0.053	0.056	nan	nan	0	1
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG01583	0.0	0.0	0.082	0.172	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG01595	0.0	0.0	0.05	0.093	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG01879	0.537	0.537	0.02	0.051	nan	nan	0	1
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG02568	0.608	0.608	0.026	0.052	nan	nan	0	1
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG02922	0.25	0.25	0.019	0.069	nan	nan	0	1
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG03006	0.0	0.0	0.032	0.174	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG03052	0.0	0.0	0.068	0.148	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG03642	0.2	0.2	0.017	0.075	nan	nan	0	1
chr6	14745282	14745689	DEL	408	HG03742	0.0	0.0	0.018	0.147	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA12878	0.0	0.0	0.022	0.121	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA18525	0.0	0.0	0.037	0.187	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA18939	0.0	0.0	0.026	0.157	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA19017	0.0	0.0	0.047	0.167	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA19238	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA19239	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA19625	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA19648	0.649	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA20502	0.0	0.0	0.048	0.125	nan	nan	0	0
chr6	14745282	14745689	DEL	408	NA20845	0.412	0.412	0.027	0.059	nan	nan	0	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG00096	0.706	0.785	0.0	0.056	0.205	0.205	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG00268	0.379	0.422	0.0	0.057	0.314	0.314	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG00419	0.447	0.497	0.006	0.063	0.433	0.433	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG00759	0.504	0.561	0.0	0.031	0.32	0.336	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG01112	0.649	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG01500	0.746	0.829	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG01565	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG01583	0.48	0.533	0.0	0.039	0.421	0.421	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG01595	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG01879	0.411	0.457	0.0	0.032	0.258	0.258	1	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG02568	0.57	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG02922	0.458	0.509	0.0	0.049	0.312	0.312	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG03006	0.377	0.419	0.0	0.057	0.357	0.374	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG03052	0.234	0.26	0.0	0.044	0.5	0.5	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG03642	0.374	0.416	0.0	0.074	0.625	0.625	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	HG03742	0.695	0.772	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA12878	0.617	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA18525	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA18939	0.41	0.455	0.0	0.048	0.312	0.326	1	1
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA19017	0.647	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA19238	0.936	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA19239	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA19625	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA19648	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA20502	0.502	0.557	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr6	148506314	148506448	DEL	135	NA20845	0.65	0.722	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG00096	0.398	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG00268	0.31	0.437	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG00419	0.325	0.458	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG00759	0.31	0.437	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG01051	0.323	0.455	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.015	nan	nan	0	0
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG01500	0.444	0.625	0.0	0.0	0.875	0.913	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG01565	0.184	0.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG01583	0.528	0.743	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG01595	0.356	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG01879	0.34	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG02568	0.532	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG02922	0.416	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG03006	0.377	0.531	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG03052	0.468	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG03642	0.549	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	HG03742	0.405	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA12878	0.531	0.748	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA18525	0.366	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA18939	0.339	0.477	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA19017	0.536	0.755	0.0	0.0	0.889	0.929	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA19238	0.416	0.586	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA19239	0.517	0.728	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA19625	0.482	0.679	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA19648	0.374	0.527	0.0	0.029	0.744	0.791	2	1
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA20502	0.433	0.61	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	149019981	149020041	DEL	61	NA20845	0.368	0.519	0.017	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149632778	149632944	DUP	167	HG02922	0.999	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149632778	149632944	DUP	167	NA19238	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149632778	149632944	DUP	167	NA19625	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	149632778	149632944	DUP	167	NA19648	0.898	0.839	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG00096	0.797	0.916	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG00268	0.793	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG00419	0.305	0.351	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG00759	0.776	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG01051	0.828	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG01112	0.865	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG01500	0.835	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG01565	0.429	0.493	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG01583	0.312	0.359	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG01595	0.337	0.387	0.0	0.018	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG01879	0.59	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG02568	0.418	0.48	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG03006	0.646	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.101	nan	nan	0	0
chr6	150302658	150302804	DEL	147	HG03742	0.695	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA12878	0.377	0.433	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA18525	0.349	0.401	0.0	0.076	0.676	0.705	4	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.186	nan	nan	0	0
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA19239	0.504	0.579	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA19625	0.355	0.408	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA19648	0.674	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr6	150302658	150302804	DEL	147	NA20845	0.672	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG00096	0.851	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG00268	1.035	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG00419	1.057	0.961	0.008	0.0	0.625	0.625	1	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG00759	0.601	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG01051	0.505	0.459	0.0	0.044	0.323	0.323	1	1
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG01112	0.793	0.721	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG01500	0.746	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG01565	1.449	1.317	0.0	0.003	0.452	0.452	1	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG01583	0.96	0.872	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG01595	1.089	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG01879	0.358	0.325	0.0	0.027	0.826	0.826	1	1
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG02568	0.988	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG02922	0.395	0.359	0.0	0.07	0.867	0.867	1	1
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG03006	1.112	1.011	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG03052	0.914	0.831	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG03642	1.222	1.111	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	HG03742	0.869	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA12878	1.01	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA18525	1.046	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA18939	1.051	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA19017	0.462	0.42	0.0	0.049	0.645	0.674	1	1
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA19238	0.65	0.591	0.0	0.045	0.737	0.737	1	1
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA19239	1.163	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA19625	0.38	0.346	0.0	0.077	0.587	0.587	2	1
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA19648	0.898	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA20502	0.958	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	15279323	15279399	DEL	77	NA20845	0.867	0.788	0.0	0.005	0.917	0.917	1	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG00096	0.833	0.833	0.0	0.0	0.552	0.552	2	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG00268	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG00419	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG00759	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG01051	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG01112	0.784	0.784	0.0	0.0	0.696	0.696	2	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG01500	1.314	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG01565	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG01583	1.032	1.032	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG01595	1.327	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG01879	0.322	0.322	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG02568	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG02922	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG03006	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG03052	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG03642	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	HG03742	0.83	0.83	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA12878	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA18525	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA19017	1.22	1.22	0.0	0.0	1.0	0.957	1	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA19238	0.91	0.91	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA19239	1.111	1.111	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA19625	0.963	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA19648	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA20502	1.117	1.117	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	153180048	153180191	DEL	144	NA20845	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG00096	0.489	0.515	0.0	0.026	0.593	0.593	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG00268	0.535	0.563	0.0	0.018	0.548	0.548	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG00419	0.834	0.878	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG00759	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.058	nan	nan	0	0
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG01112	0.469	0.493	0.0	0.023	0.48	0.48	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG01583	0.444	0.467	0.0	0.025	0.4	0.4	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG01595	0.396	0.417	0.0	0.025	0.765	0.765	1	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG01879	0.698	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG02568	0.266	0.28	0.0	0.022	0.667	0.667	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG03006	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG03052	0.425	0.447	0.0	0.013	0.4	0.4	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG03642	0.399	0.42	0.0	0.031	0.6	0.6	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	HG03742	0.29	0.305	0.0	0.012	0.565	0.565	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA12878	0.754	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA18525	0.994	1.046	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA18939	0.428	0.45	0.0	0.011	0.516	0.539	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA19017	1.053	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA19238	0.429	0.451	0.0	0.011	0.838	0.838	1	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr6	153408248	153408307	DEL	60	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG00096	0.344	0.414	0.0	0.141	0.667	0.667	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG00268	0.655	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG00419	0.183	0.22	0.0	0.152	0.929	0.929	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG00759	0.388	0.468	0.0	0.181	0.773	0.811	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG01051	0.323	0.389	0.0	0.113	0.339	0.339	2	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG01112	0.343	0.413	0.0	0.157	0.789	0.789	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG01500	0.586	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.394	nan	nan	0	0
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.184	nan	nan	0	0
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG01595	0.396	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG01879	0.465	0.56	0.0	0.11	nan	nan	0	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG02568	0.475	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG02922	0.291	0.351	0.0	0.08	0.35	0.35	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG03006	0.43	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG03052	0.319	0.384	0.0	0.149	0.9	0.9	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG03642	0.611	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	HG03742	0.54	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA12878	0.137	0.165	0.0	0.108	1.0	1.0	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA18525	0.453	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA18939	0.267	0.322	0.0	0.166	0.88	0.843	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA19017	0.758	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA19238	0.221	0.266	0.0	0.15	1.0	1.0	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.271	nan	nan	0	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA19625	0.254	0.305	0.0	0.139	0.833	0.833	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA19648	0.274	0.331	0.0	0.166	0.75	0.706	1	1
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA20502	0.342	0.412	0.0	0.144	0.889	0.889	1	2
chr6	154463239	154463330	DEL	92	NA20845	0.217	0.261	0.0	0.128	0.467	0.467	1	1
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG00096	1.123	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG00268	1.173	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG00419	0.508	0.565	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG00759	1.145	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG01051	1.292	1.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG01112	0.811	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG01500	0.923	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG01565	1.102	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG01583	1.104	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG01595	0.614	0.682	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG01879	0.877	0.974	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG02568	1.33	1.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG02922	1.082	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG03006	0.969	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG03052	0.808	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG03642	0.823	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	HG03742	0.926	1.029	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA12878	0.976	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA18525	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA18939	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA19017	1.22	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA19238	0.988	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA19239	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA19625	1.04	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA19648	0.848	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA20502	1.414	1.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154817449	154817647	DEL	199	NA20845	0.78	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG00268	0.879	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG00419	1.22	1.284	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG00759	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG01051	0.505	0.531	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG01112	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG01500	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG01565	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG01583	1.104	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG01595	1.149	1.209	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG01879	0.894	0.942	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG02568	0.456	0.48	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG02922	0.437	0.46	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG03006	0.753	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG03052	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG03642	1.147	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	HG03742	0.791	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA12878	0.771	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA18525	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA18939	0.927	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA19017	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA19238	0.468	0.492	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA19239	0.323	0.34	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA19625	0.938	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA19648	0.699	0.735	0.0	0.089	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA20502	0.41	0.432	0.0	0.077	nan	nan	0	2
chr6	154882352	154882470	DEL	119	NA20845	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG00096	0.308	0.371	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG00759	0.175	0.21	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG01051	0.707	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG01500	0.604	0.727	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG01565	0.388	0.467	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG01595	0.554	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.092	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG02922	0.374	0.451	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG03006	0.251	0.303	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG03642	0.349	0.421	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	HG03742	0.405	0.488	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA12878	0.582	0.702	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA18525	0.366	0.441	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA18939	0.356	0.429	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	0
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA20502	0.319	0.385	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr6	161684136	161684238	DEL	103	NA20845	0.39	0.47	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG00096	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG00268	0.931	0.904	0.005	0.0	0.944	0.944	1	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG00419	0.895	0.869	0.0	0.0	0.522	0.522	7	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG00759	1.067	1.036	0.0	0.0	0.885	0.873	7	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG01051	0.424	0.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG01112	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG01500	0.479	0.466	0.075	0.05	nan	nan	0	1
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG01565	0.837	0.812	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG01583	0.864	0.839	0.0	0.0	0.63	0.63	6	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG01595	0.851	0.827	0.0	0.0	0.836	0.836	6	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG01879	1.091	1.059	0.0	0.0	0.708	0.708	6	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG02568	1.064	1.033	0.0	0.008	0.9	0.9	3	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG02922	0.936	0.909	0.0	0.0	0.889	0.889	6	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG03006	1.004	0.975	0.0	0.0	0.904	0.899	6	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG03052	0.956	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG03642	1.197	1.162	0.0	0.0	0.696	0.696	7	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	HG03742	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA12878	0.925	0.898	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA18525	1.098	1.066	0.0	0.0	0.686	0.714	1	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA18939	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA19017	0.869	0.843	0.0	0.0	0.81	0.844	9	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA19238	1.065	1.034	0.0	0.0	0.849	0.849	8	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA19239	1.118	1.085	0.0	0.0	0.774	0.774	7	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA19625	1.268	1.231	0.007	0.0	0.913	0.913	7	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA19648	0.349	0.339	0.053	0.041	nan	nan	0	1
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA20502	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	162725084	162725907	DEL	824	NA20845	0.975	0.947	0.0	0.0	0.84	0.84	6	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG00096	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG00268	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG00419	0.915	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG00759	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG01051	0.707	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG01112	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG01500	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG01565	1.265	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG01583	0.672	0.652	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG01595	1.109	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG01879	0.912	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG02568	0.228	0.221	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG02922	0.624	0.606	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG03006	0.933	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG03052	0.744	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG03642	0.623	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	HG03742	0.811	0.787	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA12878	0.993	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA18525	0.976	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA18939	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA19017	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA19238	0.936	0.908	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA19239	0.879	0.853	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA19625	1.04	1.009	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA19648	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA20502	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	163910456	163910697	DEL	242	NA20845	0.715	0.694	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG00096	1.231	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG00268	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG00419	0.752	0.752	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG00759	1.261	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG01051	1.191	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG01112	1.442	1.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG01500	1.19	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG01565	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG01583	1.152	1.152	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG01595	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG01879	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG02568	1.368	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG02922	1.227	1.227	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG03006	1.202	1.202	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG03052	1.19	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG03642	1.421	1.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	HG03742	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.169	nan	nan	0	0
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA18525	1.255	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA18939	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA19017	1.22	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA19238	1.273	1.273	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA19239	0.53	0.53	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.201	nan	nan	0	0
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA19648	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA20502	1.209	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	164250807	164250915	DEL	109	NA20845	1.365	1.365	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG00096	0.942	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG00268	0.604	0.671	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG00419	0.834	0.926	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG00759	0.815	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG01051	0.889	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG01112	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG01500	0.639	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG01565	0.714	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG01583	0.792	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG01595	1.089	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG01879	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG02568	0.912	1.013	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG02922	1.186	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG03006	0.861	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG03642	1.072	1.191	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	HG03742	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA12878	0.925	1.028	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA18525	0.854	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA18939	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA19017	0.979	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA19238	1.065	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA19239	1.008	1.12	0.0	0.0	0.814	0.814	1	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA19625	0.887	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA19648	0.973	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA20502	0.639	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	166226801	166226851	DUP	51	NA20845	0.932	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG00096	0.851	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG00268	1.0	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG00419	0.508	0.612	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG00759	0.233	0.281	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG01051	0.515	0.62	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG01112	0.685	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG01500	0.888	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG01565	0.286	0.344	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG01583	0.864	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG01595	0.356	0.429	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG01879	0.698	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG02568	1.102	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG02922	0.77	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG03006	0.807	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG03052	0.319	0.384	0.0	0.094	0.714	0.714	1	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG03642	0.374	0.451	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	HG03742	0.83	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA12878	0.891	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA18525	0.854	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA18939	0.41	0.494	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA19017	0.776	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA19238	0.611	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA19239	0.821	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA19625	0.431	0.519	0.0	0.104	0.769	0.769	1	1
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA19648	0.823	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA20502	1.163	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167178530	167178669	DEL	140	NA20845	0.715	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG00096	0.923	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG00268	0.716	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG00419	1.078	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG00759	0.815	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG01051	0.384	0.426	0.0	0.075	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG01112	0.631	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG01500	0.657	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG01565	0.612	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG01583	0.816	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG01595	0.792	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG01879	1.109	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG02568	0.836	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG03006	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG03052	0.383	0.425	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG03642	1.047	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	HG03742	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA12878	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA18525	0.994	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA18939	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA19017	0.425	0.472	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA19238	0.923	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA19239	0.452	0.503	0.0	0.076	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA19625	0.558	0.62	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA19648	1.023	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA20502	0.684	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167252234	167252411	DEL	178	NA20845	0.564	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG00096	1.141	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG00268	0.5	0.5	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG00419	0.447	0.447	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG00759	1.009	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG01112	0.379	0.379	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG01500	0.941	0.941	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG01565	0.653	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG01583	0.504	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG01595	0.436	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG01879	0.572	0.572	0.0	0.007	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG02568	0.494	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG02922	0.478	0.478	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG03006	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG03052	0.616	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG03642	0.449	0.449	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	HG03742	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA18525	0.697	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA18939	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA19017	0.481	0.481	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA19238	0.611	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA19239	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA19625	0.406	0.406	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA20502	0.57	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488571	167488857	DEL	287	NA20845	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG00096	1.086	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG00268	0.483	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG00419	0.468	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG00759	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG01112	0.433	0.456	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG01500	0.959	1.009	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG01565	0.469	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG01583	0.48	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG01595	0.416	0.438	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG01879	0.537	0.565	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG02568	0.57	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG02922	0.478	0.504	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG03006	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG03052	0.531	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG03642	0.524	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	HG03742	0.637	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA18525	0.732	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA18939	0.695	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA19017	0.462	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA19238	0.585	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA19239	1.034	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA19625	0.52	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA20502	0.57	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	167488659	167489084	DEL	426	NA20845	1.127	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG00096	0.942	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG00268	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG00419	0.63	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG00759	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG01051	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG01112	0.884	0.93	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG01500	0.977	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG01565	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG01583	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG01595	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG01879	0.68	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG02568	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG02922	0.77	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG03006	1.04	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG03052	0.786	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG03642	0.549	0.578	0.037	0.069	nan	nan	0	1
chr6	169261844	169262231	DEL	388	HG03742	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA12878	0.993	1.046	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA18525	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA18939	0.891	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA19017	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA19238	0.988	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA19239	1.085	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA19625	0.963	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA19648	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA20502	0.821	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	169261844	169262231	DEL	388	NA20845	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG00096	0.0	0.0	0.269	0.185	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG00268	0.0	0.0	0.308	0.204	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG00419	0.468	0.468	0.076	0.055	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG00759	0.0	0.0	0.284	0.187	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG01051	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG01112	0.451	0.451	0.052	0.025	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG01500	0.0	0.0	0.265	0.171	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG01565	0.633	0.633	0.072	0.046	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG01583	0.0	0.0	0.204	0.149	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG01595	0.535	0.535	0.063	0.043	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG01879	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG02568	0.0	0.0	0.238	0.208	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG02922	0.541	0.541	0.049	0.026	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG03006	0.592	0.592	0.087	0.047	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG03052	1.169	1.169	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG03642	0.0	0.0	0.195	0.146	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	HG03742	0.405	0.405	0.087	0.056	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA12878	0.0	0.0	0.172	0.152	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA18525	0.0	0.0	0.197	0.108	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA18939	0.0	0.0	0.198	0.155	nan	nan	0	0
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA19017	0.481	0.481	0.099	0.06	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA19238	0.598	0.598	0.114	0.051	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA19239	0.452	0.452	0.078	0.064	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA19625	0.558	0.558	0.043	0.023	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA19648	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA20502	0.525	0.525	0.067	0.064	nan	nan	0	1
chr6	18402112	18402924	DEL	813	NA20845	0.303	0.303	0.07	0.037	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG00096	0.0	0.0	0.301	0.332	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG00268	0.0	0.0	0.438	0.392	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG00419	0.468	0.468	0.096	0.099	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG00759	0.0	0.0	0.463	0.457	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG01051	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG01112	0.415	0.415	0.091	0.051	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG01500	0.0	0.0	0.438	0.375	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG01565	0.571	0.571	0.083	0.075	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG01583	0.0	0.0	0.331	0.324	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG01595	0.574	0.574	0.075	0.075	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG01879	0.716	0.716	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG02568	0.0	0.0	0.463	0.507	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG02922	0.562	0.562	0.07	0.045	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG03006	0.484	0.484	0.114	0.08	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG03052	1.275	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG03642	0.0	0.0	0.282	0.322	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	HG03742	0.309	0.309	0.086	0.089	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA12878	0.0	0.0	0.216	0.284	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA18525	0.0	0.0	0.217	0.222	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA18939	0.0	0.0	0.337	0.367	nan	nan	0	0
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA19017	0.425	0.425	0.104	0.091	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA19238	0.52	0.52	0.076	0.084	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA19239	0.465	0.465	0.052	0.111	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA19625	0.482	0.482	0.047	0.047	nan	nan	0	2
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA19648	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA20502	0.616	0.616	0.069	0.101	nan	nan	0	1
chr6	18402131	18402447	DEL	317	NA20845	0.303	0.303	0.075	0.07	nan	nan	0	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.013	nan	nan	0	0
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG00268	1.155	1.122	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG00419	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG00759	0.679	0.659	0.0	0.027	0.595	0.624	1	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG01051	0.909	0.882	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG01565	0.918	0.892	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG01583	0.936	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.025	nan	nan	0	0
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG01879	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG02568	0.798	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG02922	0.936	0.909	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG03006	0.682	0.662	0.0	0.021	0.455	0.476	1	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG03052	0.595	0.578	0.0	0.029	0.643	0.643	1	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG03642	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	HG03742	0.676	0.656	0.0	0.026	0.641	0.641	1	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA12878	0.36	0.349	0.0	0.04	0.966	0.966	1	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA18525	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA18939	0.445	0.432	0.0	0.007	0.846	0.883	1	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA19017	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA19238	1.13	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA19239	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA19625	0.507	0.492	0.0	0.005	0.652	0.652	1	1
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA19648	1.123	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr6	18943635	18943685	DEL	51	NA20845	0.564	0.547	0.0	0.034	0.706	0.706	1	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG00096	1.032	0.965	0.006	0.0	0.889	0.889	1	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG00268	1.0	0.935	0.0	0.0	0.71	0.71	5	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG00419	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG00759	1.087	1.015	0.0	0.0	0.791	0.788	2	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG01051	1.171	1.095	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG01112	1.244	1.163	0.003	0.0	0.765	0.765	5	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG01500	1.208	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG01565	1.122	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG01583	0.0	0.0	0.221	0.123	nan	nan	0	0
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG01595	0.594	0.555	0.045	0.031	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG01879	0.519	0.485	0.052	0.031	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG02568	0.912	0.852	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG02922	1.103	1.03	0.0	0.0	0.847	0.847	4	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG03006	0.52	0.486	0.055	0.044	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG03052	0.616	0.576	0.079	0.043	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG03642	0.948	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	HG03742	0.579	0.541	0.078	0.051	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA12878	1.045	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA18525	1.046	0.977	0.0	0.0	0.893	0.857	1	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA18939	1.194	1.116	0.0	0.0	0.596	0.571	1	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA19017	0.61	0.57	0.066	0.053	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA19238	1.04	0.971	0.0	0.0	0.892	0.892	5	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA19239	1.215	1.135	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA19625	0.532	0.498	0.087	0.053	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA19648	1.173	1.096	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA20502	0.433	0.405	0.098	0.065	nan	nan	0	1
chr6	19685573	19686511	DEL	939	NA20845	0.997	0.932	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG00268	0.0	0.0	0.013	0.034	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG00419	0.122	0.174	0.0	0.011	1.0	1.0	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG00759	0.194	0.277	0.0	0.01	0.875	0.833	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.022	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG01112	0.0	0.0	0.007	0.027	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.026	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG01565	0.265	0.379	0.0	0.022	0.6	0.6	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG02568	0.228	0.326	0.0	0.016	0.6	0.6	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG02922	0.166	0.238	0.0	0.033	0.5	0.5	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG03006	0.143	0.205	0.0	0.023	0.278	0.265	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.024	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG03642	0.249	0.356	0.0	0.023	0.556	0.556	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA12878	0.377	0.538	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA18939	0.214	0.305	0.0	0.024	0.786	0.753	1	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA19017	0.351	0.502	0.0	0.013	0.451	0.444	2	1
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.022	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.017	nan	nan	0	0
chr6	20259856	20259909	DEL	54	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.017	nan	nan	0	0
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG00096	1.123	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG00268	1.155	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG00419	0.651	0.608	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG01112	0.875	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG01500	0.941	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG01565	1.306	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG01583	0.96	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG01595	1.347	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG01879	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG02568	0.722	0.675	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG02922	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG03006	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG03052	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG03642	1.372	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	HG03742	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA12878	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA19017	1.035	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA19238	0.858	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA19239	1.021	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA19625	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA19648	1.347	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA20502	1.095	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	21082199	21082276	DUP	78	NA20845	1.062	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG00096	0.978	0.949	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG00268	1.104	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG00759	0.446	0.433	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG01051	0.586	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG01112	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG01500	1.048	1.017	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG01565	0.469	0.456	0.061	0.045	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG01583	0.552	0.536	0.074	0.039	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG01879	1.002	0.973	0.0	0.0	0.833	0.833	4	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG02568	0.494	0.48	0.08	0.063	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG02922	0.978	0.949	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG03006	1.112	1.08	0.0	0.0	0.893	0.935	1	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG03052	0.574	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG03642	0.0	0.0	0.294	0.224	nan	nan	0	0
chr6	22052769	22053729	DEL	961	HG03742	0.0	0.0	0.259	0.173	nan	nan	0	0
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA12878	0.959	0.931	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA18939	0.445	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA19017	1.035	1.005	0.0	0.0	0.967	0.925	3	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA19238	0.468	0.454	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA19239	0.543	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA19625	1.116	1.083	0.005	0.0	0.767	0.767	2	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA19648	1.297	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22052769	22053729	DEL	961	NA20845	0.542	0.526	0.09	0.066	nan	nan	0	1
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG00096	1.095	1.095	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG00268	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	0
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG01051	0.343	0.343	0.0	0.055	0.944	0.944	1	1
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG01112	0.974	0.974	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG01500	0.302	0.302	0.0	0.051	0.619	0.646	1	1
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG01565	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG01583	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG01595	1.228	1.228	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG01879	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG02568	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG02922	1.165	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG03006	0.502	0.502	0.007	0.069	0.594	0.622	1	1
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG03052	1.19	1.19	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG03642	0.499	0.499	0.0	0.058	0.611	0.611	1	1
chr6	22501806	22501905	DEL	100	HG03742	1.177	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA12878	0.925	0.925	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA18525	0.349	0.349	0.0	0.078	0.906	0.87	1	1
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA18939	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA19017	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA19238	1.208	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA19239	0.491	0.491	0.0	0.066	0.519	0.519	1	1
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA19625	1.306	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA19648	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA20502	1.391	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22501806	22501905	DEL	100	NA20845	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG00096	1.104	1.072	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG00268	0.948	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG00419	0.874	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG00759	0.873	0.848	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG01051	0.949	0.921	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG01112	1.172	1.138	0.0	0.0	0.755	0.755	2	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG01500	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG01565	0.918	0.892	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG01583	0.96	0.932	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG01595	1.03	1.0	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG01879	1.055	1.025	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG02568	0.38	0.369	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG02922	0.874	0.848	0.0	0.004	0.786	0.786	2	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG03006	0.933	0.906	0.0	0.0	0.548	0.575	3	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG03052	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG03642	1.122	1.09	0.0	0.0	0.682	0.682	3	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	HG03742	1.158	1.124	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA12878	0.702	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA18525	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA18939	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA19017	0.998	0.969	0.0	0.0	0.776	0.773	2	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA19238	1.078	1.047	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA19239	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA19625	0.786	0.763	0.0	0.0	0.781	0.781	2	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA19648	0.923	0.896	0.0	0.0	0.944	0.951	3	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA20502	1.117	1.085	0.0	0.0	0.607	0.607	3	2
chr6	22896627	22896820	DEL	194	NA20845	0.737	0.715	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG00096	0.127	0.133	0.0	0.137	0.243	0.243	2	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.202	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG00759	0.272	0.286	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG01051	0.121	0.128	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG01112	0.144	0.152	0.0	0.101	0.276	0.276	2	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.233	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG01565	0.388	0.408	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG01583	0.192	0.202	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG01595	0.356	0.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG01879	0.483	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG02568	0.152	0.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG02922	0.104	0.109	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG03006	0.413	0.434	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG03052	0.213	0.224	0.007	0.103	0.52	0.52	2	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG03642	0.025	0.026	0.0	0.095	0.267	0.267	2	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	HG03742	0.174	0.183	0.0	0.125	0.611	0.611	2	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA12878	0.325	0.343	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA18525	0.279	0.294	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA18939	0.018	0.019	0.006	0.211	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.241	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA19238	0.143	0.15	0.0	0.095	0.577	0.577	2	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA19239	0.297	0.313	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA19625	0.279	0.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA19648	0.125	0.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA20502	0.205	0.216	0.0	0.112	nan	nan	0	1
chr6	25529870	25530011	DEL	142	NA20845	0.564	0.593	0.0	0.148	nan	nan	0	0
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG00096	0.091	0.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG00268	0.06	0.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG00419	0.061	0.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG00759	0.058	0.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG01051	0.061	0.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG01112	0.072	0.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG01500	0.089	0.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG01565	0.061	0.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG01583	0.072	0.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG01595	0.079	0.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG01879	0.018	0.021	0.016	0.073	nan	nan	0	1
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG02568	0.114	0.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG02922	0.083	0.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG03006	0.036	0.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG03052	0.043	0.049	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG03642	0.05	0.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	HG03742	0.019	0.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA12878	0.137	0.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA18525	0.131	0.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA18939	0.071	0.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA19017	0.055	0.064	0.02	0.053	nan	nan	0	1
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA19238	0.13	0.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA19239	0.142	0.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA19625	0.025	0.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA19648	0.075	0.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA20502	0.068	0.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	25897984	25898300	DEL	317	NA20845	0.087	0.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG00096	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG00268	1.224	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG00419	1.068	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG00759	0.718	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG01051	0.929	0.868	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG01112	1.064	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG01500	0.746	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG01565	1.082	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG01583	1.068	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG01595	1.228	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG01879	0.447	0.418	0.005	0.02	0.583	0.583	1	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG02568	1.52	1.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG02922	0.999	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG03006	0.942	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG03052	0.553	0.516	0.0	0.013	0.692	0.692	1	1
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG03642	0.798	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	HG03742	0.676	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA12878	0.993	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA18525	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA18939	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA19017	0.924	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA19238	1.065	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA19239	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA19625	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA19648	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA20502	0.958	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	27038454	27038507	DEL	54	NA20845	1.062	0.993	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG00096	0.779	0.779	0.0	0.0	0.867	0.867	5	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG00268	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG00419	0.407	0.407	0.054	0.046	0.2	0.2	1	1
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG00759	0.834	0.834	0.0	0.0	0.712	0.678	4	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG01051	0.808	0.808	0.0	0.0	0.941	0.941	5	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG01112	0.721	0.721	0.0	0.0	0.824	0.824	5	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG01500	0.781	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG01565	0.347	0.347	0.038	0.035	nan	nan	0	1
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG01583	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG01595	0.733	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG01879	0.769	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG02568	0.874	0.874	0.0	0.0	0.347	0.347	4	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG02922	0.478	0.478	0.037	0.027	nan	nan	0	1
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG03006	0.933	0.933	0.0	0.0	0.757	0.723	4	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG03052	0.616	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG03642	0.499	0.499	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	HG03742	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA12878	0.805	0.805	0.0	0.0	0.655	0.655	5	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA18525	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA18939	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA19017	0.795	0.795	0.0	0.0	0.765	0.799	1	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA19238	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA19239	0.775	0.775	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA19625	0.71	0.71	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA19648	0.749	0.749	0.0	0.0	0.5	0.531	4	2
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA20502	0.296	0.296	0.051	0.043	0.727	0.727	1	1
chr6	28897457	28898113	DEL	657	NA20845	0.412	0.412	0.096	0.05	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG00096	0.127	0.16	0.008	0.115	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG00268	0.0	0.0	0.007	0.225	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG00419	0.427	0.541	0.014	0.126	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG00759	0.243	0.307	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG01051	0.727	0.92	0.0	0.164	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG01112	0.0	0.0	0.007	0.167	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG01500	0.675	0.854	0.0	0.212	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG01565	0.367	0.465	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG01583	0.78	0.987	0.007	0.138	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG01595	0.772	0.978	0.0	0.191	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG01879	0.653	0.827	0.0	0.167	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG02922	0.166	0.211	0.0	0.108	0.417	0.417	2	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG03006	0.628	0.795	0.011	0.177	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG03052	0.17	0.215	0.008	0.091	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG03642	0.0	0.0	0.009	0.144	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	HG03742	0.521	0.66	0.006	0.204	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA12878	0.206	0.26	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA18525	0.157	0.199	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA18939	0.463	0.586	0.006	0.176	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.18	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA19238	0.643	0.814	0.0	0.198	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.177	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA19625	0.583	0.738	0.0	0.142	nan	nan	0	1
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA19648	0.399	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA20502	0.525	0.664	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr6	29363897	29364040	DEL	144	NA20845	0.477	0.604	0.0	0.193	nan	nan	0	1
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG00096	0.652	0.652	0.0	0.0	0.845	0.845	10	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG00268	0.707	0.707	0.0	0.001	0.595	0.595	10	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG00419	0.386	0.386	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG00759	0.272	0.272	0.076	0.028	nan	nan	0	1
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG01051	0.606	0.606	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG01112	0.505	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG01500	0.764	0.764	0.0	0.0	0.721	0.752	2	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG01565	0.612	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG01583	0.336	0.336	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG01595	0.416	0.416	0.0	0.0	0.735	0.735	10	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG01879	0.537	0.537	0.0	0.0	0.469	0.469	6	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG02568	0.304	0.304	0.0	0.0	0.633	0.633	8	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG02922	0.686	0.686	0.0	0.0	0.769	0.769	9	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG03006	0.574	0.574	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG03052	0.34	0.34	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG03642	0.374	0.374	0.0	0.0	0.723	0.723	2	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	HG03742	0.521	0.521	0.0	0.0	0.742	0.742	10	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA12878	0.377	0.377	0.044	0.009	nan	nan	0	1
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA18525	0.994	0.994	0.0	0.0	0.697	0.726	9	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA18939	0.41	0.41	0.0	0.0	0.56	0.537	1	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA19017	0.573	0.573	0.003	0.0	0.806	0.842	10	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA19238	0.546	0.546	0.0	0.0	0.722	0.722	7	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA19239	0.543	0.543	0.0	0.0	0.733	0.733	9	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA19625	0.532	0.532	0.0	0.0	0.6	0.6	6	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA19648	0.299	0.299	0.038	0.009	nan	nan	0	1
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA20502	0.547	0.547	0.0	0.0	0.75	0.75	9	2
chr6	29650415	29651090	DEL	676	NA20845	0.564	0.564	0.0	0.0	0.478	0.478	2	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG00096	0.869	0.915	0.0	0.0	0.851	0.851	14	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG00268	0.776	0.817	0.0	0.0	0.435	0.435	1	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG00419	0.834	0.878	0.0	0.0	0.838	0.838	8	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG00759	0.718	0.756	0.0	0.0	0.571	0.544	15	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG01051	0.263	0.276	0.028	0.024	nan	nan	0	1
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG01112	0.884	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG01500	0.781	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG01565	0.857	0.902	0.0	0.0	0.701	0.701	8	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG01583	0.768	0.808	0.0	0.0	0.703	0.703	14	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG01595	0.653	0.688	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG01879	0.572	0.603	0.0	0.0	0.882	0.882	5	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG02568	0.722	0.76	0.0	0.0	0.523	0.523	16	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG02922	0.895	0.942	0.0	0.0	0.688	0.688	7	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG03006	0.879	0.925	0.0	0.0	0.577	0.551	13	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG03052	0.956	1.007	0.0	0.0	0.84	0.84	8	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG03642	0.773	0.814	0.0	0.0	0.643	0.643	13	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	HG03742	0.772	0.813	0.0	0.0	0.917	0.917	14	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA12878	0.788	0.829	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA18525	0.863	0.908	0.0	0.004	0.731	0.702	8	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA18939	0.606	0.638	0.0	0.0	0.599	0.574	2	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA19017	0.906	0.953	0.0	0.0	0.867	0.85	9	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA19238	0.832	0.875	0.0	0.0	0.846	0.846	6	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA19239	0.814	0.857	0.0	0.0	0.611	0.611	8	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA19625	0.811	0.854	0.0	0.0	0.818	0.818	9	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA19648	1.048	1.103	0.008	0.0	0.691	0.695	14	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA20502	0.981	1.032	0.0	0.0	0.861	0.861	14	2
chr6	29819215	29819858	DEL	644	NA20845	0.824	0.867	0.0	0.01	0.714	0.714	15	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG00096	0.507	0.534	0.005	0.0	0.143	0.143	3	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG00268	0.81	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG00419	0.752	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG00759	0.0	0.0	0.035	0.0	nan	nan	0	0
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG01051	0.202	0.213	0.0	0.0	0.833	0.833	10	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG01112	0.361	0.38	0.005	0.0	nan	nan	0	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG01500	0.0	0.0	0.054	0.0	nan	nan	0	0
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG01565	0.0	0.0	0.047	0.007	nan	nan	0	0
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG01583	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG01595	0.436	0.459	0.008	0.0	nan	nan	0	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG01879	0.465	0.49	0.0	0.0	0.625	0.625	2	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG02568	0.608	0.64	0.013	0.0	nan	nan	0	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG02922	0.0	0.0	0.013	0.009	nan	nan	0	0
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG03006	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG03052	0.361	0.38	0.009	0.0	0.833	0.833	2	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG03642	0.549	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	HG03742	0.869	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA12878	0.685	0.721	0.005	0.0	0.684	0.684	1	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA18525	0.453	0.477	0.011	0.0	0.211	0.219	10	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA18939	0.339	0.356	0.005	0.0	0.429	0.447	6	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA19017	0.813	0.856	0.0	0.0	0.667	0.697	1	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA19238	0.403	0.424	0.01	0.003	0.35	0.35	12	1
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA19239	0.0	0.0	0.033	0.009	nan	nan	0	0
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA19625	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA19648	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA20502	0.73	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30207801	30208224	DEL	424	NA20845	0.997	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG00096	0.435	0.435	0.0	0.027	0.435	0.435	1	1
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG00268	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG00419	0.427	0.427	0.0	0.062	0.688	0.688	1	1
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG00759	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG01051	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG01112	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG01500	0.693	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG01565	0.653	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG01583	1.152	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG01595	0.752	0.752	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG01879	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG02568	0.722	0.722	0.0	0.053	0.462	0.462	1	1
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG02922	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG03006	0.574	0.574	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG03052	0.638	0.638	0.0	0.041	0.5	0.5	1	1
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG03642	0.748	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	HG03742	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA12878	0.428	0.428	0.0	0.021	0.75	0.75	1	1
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA18525	0.715	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA18939	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA19017	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA19238	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA19239	0.788	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA19625	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA19648	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA20502	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30230519	30230591	DEL	73	NA20845	0.78	0.78	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG00096	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG00268	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG00419	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG00759	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG01051	0.727	0.727	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG01112	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG01500	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG01565	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG01583	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG01595	0.396	0.396	0.0	0.026	0.706	0.706	1	1
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG01879	1.02	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG02568	0.76	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG02922	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG03006	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG03052	0.616	0.616	0.0	0.053	0.4	0.4	1	1
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG03642	0.549	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	HG03742	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA12878	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA18525	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA18939	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA19017	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA19238	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA19239	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA19625	0.761	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA19648	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA20502	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30713700	30713772	DEL	73	NA20845	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG00268	0.948	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG00419	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG00759	0.563	0.625	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG01051	0.586	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG01112	0.793	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG01500	0.906	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG01565	0.816	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG01583	0.864	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG01595	0.554	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG01879	0.626	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG02568	1.026	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG02922	0.603	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG03006	0.807	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG03052	0.723	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG03642	1.022	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	HG03742	0.733	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA18939	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA19238	0.676	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA19239	0.814	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA19625	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA19648	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA20502	1.323	1.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30886430	30886570	DUP	141	NA20845	0.52	0.578	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG00096	0.616	0.708	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG00268	0.448	0.515	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG00419	0.529	0.608	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG00759	0.446	0.513	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG01051	0.384	0.441	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG01112	0.685	0.788	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG01500	0.586	0.674	0.0	0.0	0.625	0.652	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG01565	0.51	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG01583	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG01595	0.495	0.569	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG01879	0.68	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG02568	0.684	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG02922	0.791	0.909	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG03006	0.413	0.474	0.0	0.0	0.286	0.299	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG03052	0.68	0.782	0.0	0.005	0.917	0.917	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG03642	0.673	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	HG03742	0.579	0.666	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA12878	0.565	0.65	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA18525	0.784	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA18939	0.517	0.594	0.0	0.0	0.6	0.575	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA19017	0.702	0.807	0.0	0.0	0.529	0.506	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA19238	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA19239	0.581	0.668	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA19648	0.649	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA20502	0.707	0.813	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	30932630	30932804	DUP	175	NA20845	0.477	0.548	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG00096	0.724	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG00268	0.828	0.92	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG00419	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG00759	0.718	0.798	0.0	0.0	0.833	0.794	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG01051	0.485	0.539	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG01112	0.559	0.621	0.0	0.0	0.565	0.565	2	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG01500	0.373	0.414	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG01565	0.776	0.862	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG01583	0.72	0.8	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG01595	0.653	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG01879	0.358	0.398	0.008	0.032	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG02568	1.102	1.224	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG02922	0.853	0.948	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG03006	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG03052	0.935	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG03642	0.474	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	HG03742	0.29	0.322	0.009	0.094	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA12878	1.045	1.161	0.0	0.0	0.844	0.844	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA18525	0.383	0.426	0.009	0.066	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA18939	0.41	0.455	0.005	0.105	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA19017	0.462	0.513	0.009	0.082	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA19238	0.481	0.534	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA19239	0.362	0.402	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA19625	1.04	1.155	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA19648	0.998	1.109	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA20502	1.117	1.242	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr6	31023272	31023654	DEL	383	NA20845	0.282	0.313	0.015	0.068	nan	nan	0	1
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG00096	0.797	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG00268	0.983	1.13	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG00419	0.996	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG00759	0.718	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG01051	0.404	0.464	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG01112	0.847	0.974	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG01500	0.764	0.878	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG01565	0.429	0.493	0.0	0.003	0.889	0.889	2	1
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG01583	0.792	0.91	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG01595	0.614	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG01879	0.769	0.884	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG02568	0.608	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG02922	0.978	1.124	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG03006	0.664	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG03052	0.489	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG03642	0.648	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	HG03742	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA12878	0.891	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA18525	1.011	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA18939	0.695	0.799	0.0	0.0	0.765	0.798	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA19017	0.647	0.743	0.0	0.0	0.464	0.444	3	1
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA19238	0.65	0.747	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA19239	0.711	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA19625	0.634	0.729	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA19648	0.898	1.032	0.0	0.0	0.824	0.775	1	2
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA20502	0.433	0.498	0.0	0.008	0.912	0.912	2	1
chr6	31100184	31100237	DEL	54	NA20845	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG00096	0.652	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG00268	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG00419	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG00759	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG01051	0.707	0.744	0.0	0.0	0.849	0.849	2	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG01112	0.847	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG01500	0.746	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG01565	0.633	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG01583	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG01595	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG01879	0.483	0.508	0.019	0.044	nan	nan	0	1
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG02568	0.228	0.24	0.091	0.136	nan	nan	0	1
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG02922	0.0	0.0	0.19	0.143	nan	nan	0	0
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG03006	0.735	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG03052	0.85	0.895	0.0	0.0	0.787	0.787	2	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG03642	0.998	1.05	0.0	0.0	0.719	0.719	2	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	HG03742	0.811	0.853	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA12878	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA18525	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA18939	0.713	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA19017	0.906	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA19238	0.364	0.383	0.029	0.051	nan	nan	0	1
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA19239	0.956	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA19625	0.963	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA19648	0.998	1.051	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA20502	1.117	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	3195370	3195959	DEL	590	NA20845	0.65	0.684	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG00096	0.0	0.0	0.035	0.086	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG00268	1.414	1.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG00419	0.0	0.0	0.056	0.113	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG00759	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG01051	0.02	0.02	0.017	0.122	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG01112	0.631	0.613	0.009	0.037	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG01500	0.0	0.0	0.03	0.086	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG01565	0.0	0.0	0.02	0.098	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG01583	0.708	0.687	0.0	0.021	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG01595	0.02	0.019	0.008	0.106	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG01879	0.0	0.0	0.037	0.109	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG02922	0.0	0.0	0.058	0.094	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG03006	0.466	0.453	0.03	0.03	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG03052	0.0	0.0	0.012	0.095	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG03642	0.698	0.678	0.015	0.036	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	HG03742	0.579	0.562	0.005	0.057	nan	nan	0	2
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA12878	0.445	0.432	0.004	0.026	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA18525	0.436	0.423	0.018	0.044	nan	nan	0	2
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA18939	1.443	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA19017	0.554	0.538	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA19238	0.624	0.606	0.002	0.046	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA19239	0.0	0.0	0.016	0.1	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA19625	0.685	0.665	0.012	0.036	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA19648	0.574	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA20502	0.0	0.0	0.014	0.145	nan	nan	0	0
chr6	32512660	32513019	DEL	360	NA20845	0.0	0.0	0.022	0.114	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG00096	0.661	0.76	0.007	0.217	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG00268	0.81	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG00419	0.691	0.795	0.016	0.239	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG00759	0.601	0.691	0.0	0.0	0.688	0.722	3	2
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG01051	0.717	0.824	0.011	0.193	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG01112	0.433	0.497	0.008	0.081	nan	nan	0	2
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG01500	0.515	0.592	0.011	0.227	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG01565	0.939	1.079	0.045	0.238	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG01583	0.552	0.634	0.009	0.16	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG01595	0.713	0.819	0.0	0.229	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG01879	0.447	0.514	0.011	0.168	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG02568	0.684	0.786	0.012	0.236	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG02922	0.603	0.693	0.018	0.162	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG03006	0.466	0.536	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG03052	0.893	1.026	0.015	0.229	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG03642	0.2	0.229	0.023	0.091	0.625	0.625	1	1
chr6	32571334	32571609	DEL	276	HG03742	1.062	1.22	0.0	0.278	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA12878	0.599	0.689	0.0	0.037	nan	nan	0	2
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA18525	0.471	0.541	0.006	0.073	nan	nan	0	1
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA18939	1.033	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA19017	0.536	0.616	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA19238	0.325	0.373	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA19239	0.672	0.772	0.005	0.223	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA19625	0.355	0.408	0.007	0.07	nan	nan	0	1
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA19648	0.349	0.401	0.0	0.091	nan	nan	0	2
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA20502	0.433	0.498	0.018	0.175	nan	nan	0	0
chr6	32571334	32571609	DEL	276	NA20845	0.737	0.847	0.014	0.178	nan	nan	0	0
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG00096	0.0	0.0	0.028	0.137	nan	nan	0	0
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG00268	1.104	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG00419	0.386	0.429	0.029	0.063	nan	nan	0	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG00759	0.795	0.884	0.0	0.0	0.676	0.673	2	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG01051	0.0	0.0	0.008	0.132	nan	nan	0	0
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG01112	0.992	1.102	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG01500	0.497	0.552	0.005	0.064	0.448	0.468	5	1
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG01565	0.449	0.499	0.0	0.07	0.184	0.184	2	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG01583	0.936	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG01595	0.0	0.0	0.01	0.112	nan	nan	0	0
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG01879	0.0	0.0	0.02	0.158	nan	nan	0	0
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG02568	0.418	0.464	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG02922	0.291	0.324	0.027	0.059	nan	nan	0	1
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG03006	0.933	1.036	0.0	0.0	0.828	0.79	1	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG03052	0.85	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG03642	0.299	0.333	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr6	32614932	32615252	DEL	321	HG03742	0.386	0.429	0.011	0.072	0.804	0.804	6	1
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA12878	0.445	0.495	0.0	0.052	0.625	0.625	5	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA18525	0.68	0.755	0.006	0.057	0.484	0.504	5	1
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA18939	0.909	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA19017	0.998	1.109	0.0	0.0	0.841	0.832	4	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA19238	0.962	1.068	0.0	0.0	0.919	0.919	1	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA19239	0.543	0.603	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA19625	0.887	0.986	0.0	0.0	0.79	0.79	2	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA19648	0.474	0.527	0.0	0.053	nan	nan	0	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA20502	0.57	0.633	0.0	0.045	0.769	0.769	5	2
chr6	32614932	32615252	DEL	321	NA20845	0.455	0.506	0.004	0.015	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG00096	0.0	0.0	0.401	0.218	nan	nan	0	0
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG00268	0.948	0.998	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG00419	0.468	0.492	0.058	0.026	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG00759	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG01051	0.0	0.0	0.509	0.3	nan	nan	0	0
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG01112	0.865	0.911	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG01500	0.426	0.449	0.075	0.054	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG01565	0.367	0.387	0.046	0.031	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG01583	0.96	1.01	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG01595	0.0	0.0	0.392	0.24	nan	nan	0	0
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG01879	0.0	0.0	0.394	0.328	nan	nan	0	0
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG02568	0.494	0.52	0.031	0.016	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG02922	0.478	0.504	0.072	0.035	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG03006	0.915	0.963	0.0	0.0	0.714	0.681	8	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG03052	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG03642	0.349	0.368	0.053	0.05	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	HG03742	0.405	0.427	0.06	0.045	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA12878	0.48	0.505	0.052	0.025	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA18525	0.54	0.569	0.076	0.02	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA18939	0.927	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA19017	0.961	1.012	0.0	0.0	0.729	0.762	2	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA19238	0.962	1.012	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA19239	0.491	0.517	0.048	0.038	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA19625	0.837	0.881	0.0	0.0	0.799	0.799	4	2
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA19648	0.374	0.394	0.047	0.032	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA20502	0.547	0.576	0.076	0.037	nan	nan	0	1
chr6	32624896	32625863	DEL	968	NA20845	0.455	0.479	0.046	0.02	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG00096	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG00268	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG00419	0.488	0.514	0.009	0.054	nan	nan	0	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG00759	0.407	0.429	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG01051	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG01112	1.064	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG01500	0.586	0.617	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG01565	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG01583	0.624	0.657	0.0	0.053	0.731	0.731	2	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG01595	0.0	0.0	0.005	0.102	nan	nan	0	0
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG01879	0.411	0.433	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG02568	0.38	0.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG02922	1.123	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG03006	1.004	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG03052	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG03642	0.748	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	HG03742	0.328	0.345	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA12878	0.993	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA18525	0.349	0.367	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA18939	1.069	1.125	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA19017	0.961	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA19238	0.507	0.533	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA19239	0.762	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA19625	1.116	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA19648	1.223	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA20502	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	32795503	32795680	DEL	178	NA20845	0.412	0.433	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG00096	0.833	0.925	0.0	0.0	0.6	0.6	5	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG00268	0.81	0.901	0.0	0.0	0.758	0.758	3	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG00419	0.0	0.0	0.25	0.189	nan	nan	0	0
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG00759	0.582	0.647	0.0	0.0	0.5	0.525	5	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG01051	0.646	0.718	0.0	0.0	0.733	0.733	4	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG01112	0.631	0.701	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG01500	0.0	0.0	0.335	0.241	nan	nan	0	0
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG01565	0.571	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG01583	0.84	0.933	0.0	0.0	0.5	0.5	7	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG01595	0.396	0.44	0.092	0.071	nan	nan	0	1
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG01879	0.608	0.676	0.0	0.0	0.577	0.577	6	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG02568	0.874	0.971	0.0	0.0	0.739	0.739	4	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG02922	0.416	0.462	0.074	0.046	nan	nan	0	1
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG03006	0.7	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG03052	0.68	0.756	0.0	0.0	0.736	0.736	4	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG03642	0.599	0.665	0.0	0.0	0.845	0.845	6	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	HG03742	0.598	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA12878	0.839	0.932	0.0	0.0	0.82	0.82	4	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA18525	0.453	0.504	0.079	0.047	nan	nan	0	1
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA18939	0.267	0.297	0.075	0.05	nan	nan	0	1
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA19017	0.813	0.904	0.0	0.0	0.45	0.43	4	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA19238	0.377	0.419	0.093	0.06	nan	nan	0	1
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA19239	0.698	0.775	0.0	0.0	0.844	0.844	5	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA19625	1.065	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA19648	0.773	0.859	0.0	0.0	0.75	0.706	5	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA20502	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33125925	33126851	DEL	927	NA20845	0.0	0.0	0.241	0.184	nan	nan	0	0
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG00096	0.905	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG00268	0.897	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG00759	0.66	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG01051	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG01112	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG01565	0.571	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG01583	0.864	0.96	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG01595	0.436	0.484	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG01879	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG02568	0.988	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG02922	0.416	0.462	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG03006	0.7	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG03052	0.765	0.85	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG03642	0.599	0.665	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	HG03742	0.483	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA12878	0.856	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA18525	0.488	0.542	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA18939	0.392	0.436	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA19017	0.813	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA19238	0.364	0.404	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA19239	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA19625	1.09	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA19648	0.898	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA20502	1.003	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33126442	33126764	DEL	323	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG00096	0.67	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG00268	0.948	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG00419	0.813	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG00759	0.679	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG01051	0.464	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG01112	0.613	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG01500	0.533	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG01565	0.878	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG01583	0.336	0.386	0.0	0.009	0.375	0.375	1	1
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG01595	0.535	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG01879	0.59	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG02568	0.836	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG02922	0.603	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG03052	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG03642	0.2	0.229	0.0	0.026	0.6	0.6	1	1
chr6	33128973	33129031	DEL	59	HG03742	0.367	0.422	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA12878	0.668	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA18525	0.872	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA18939	0.695	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA19017	0.333	0.382	0.0	0.024	0.9	0.861	1	1
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA19238	0.702	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA19239	0.685	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA19625	0.989	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA19648	0.549	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA20502	0.821	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	33128973	33129031	DEL	59	NA20845	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG00096	0.797	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG00268	0.879	1.011	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG00419	0.996	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG00759	0.795	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG01051	0.606	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG01112	0.613	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG01500	0.861	0.99	0.0	0.0	0.909	0.949	1	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG01565	0.735	0.844	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG01583	1.056	1.213	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG01595	0.644	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG01879	0.733	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG02568	0.494	0.568	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG02922	1.019	1.172	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG03006	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG03052	0.85	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG03642	0.873	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	HG03742	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA12878	1.01	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA18525	0.872	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA18939	0.748	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA19017	0.869	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA19238	0.897	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA19239	0.859	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA19625	0.989	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA19648	1.048	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA20502	0.912	1.049	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr6	34386689	34386946	DEL	258	NA20845	0.889	1.021	0.006	0.008	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG00268	1.319	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG00419	1.281	1.244	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG00759	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG01051	1.292	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG01112	1.316	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG01500	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG01565	1.245	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG01583	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG01595	1.386	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG02568	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG02922	1.144	1.111	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG03006	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG03052	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG03642	1.446	1.404	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	HG03742	1.351	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA12878	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA18525	1.081	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA18939	1.586	1.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA19017	1.174	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA19238	1.124	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA19625	1.585	1.539	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA19648	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA20502	1.231	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	35649830	35649911	DUP	82	NA20845	1.344	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG00096	1.521	1.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG00268	1.086	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG00419	0.529	0.529	0.0	0.042	0.657	0.657	1	1
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG00759	0.543	0.543	0.0	0.032	0.375	0.394	1	1
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG01051	1.131	1.131	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG01112	1.19	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG01500	1.385	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG01565	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG01583	1.536	1.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG01595	1.327	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG01879	1.27	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG02568	0.684	0.684	0.0	0.052	0.474	0.474	1	1
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.118	nan	nan	0	0
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG03006	0.753	0.753	0.0	0.07	0.595	0.624	1	1
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG03052	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG03642	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	HG03742	1.312	1.312	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA12878	0.754	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA18525	0.505	0.505	0.0	0.045	0.811	0.845	1	1
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA18939	1.14	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA19017	0.444	0.444	0.0	0.055	0.893	0.854	1	1
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA19238	1.416	1.416	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA19239	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA19625	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA19648	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA20502	1.414	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36070119	36070193	DEL	75	NA20845	1.474	1.474	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG00096	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG00268	0.879	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG00419	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG00759	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG01051	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG01112	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG01500	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG01565	0.959	1.01	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG01583	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG01595	0.752	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG01879	0.733	0.772	0.009	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG02568	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG02922	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG03006	0.341	0.359	0.077	0.0	0.427	0.448	12	1
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG03052	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG03642	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	HG03742	0.791	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA12878	1.062	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA18525	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA18939	0.713	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA19017	0.795	0.837	0.0	0.0	0.955	0.935	3	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA19238	0.871	0.916	0.0	0.0	0.871	0.871	4	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA19239	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA19625	0.482	0.507	0.067	0.0	0.268	0.268	2	1
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA19648	0.923	0.972	0.0	0.0	0.625	0.588	1	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA20502	0.981	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	36581707	36582618	DEL	912	NA20845	0.303	0.319	0.049	0.002	0.5	0.5	2	1
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG00096	1.068	1.124	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG00268	1.19	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG00759	1.222	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG01051	1.191	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG01112	1.533	1.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG01500	1.083	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG01565	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG01583	0.984	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG01595	1.01	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG02568	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG02922	0.999	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG03006	1.112	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG03052	0.956	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG03642	0.923	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	HG03742	1.004	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA12878	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA18525	0.994	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA18939	1.23	1.294	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA19017	1.053	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA19238	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA19239	1.111	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA19625	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA19648	1.372	1.444	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr6	37819267	37819317	DUP	51	NA20845	1.062	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	380338	380414	DUP	77	HG00268	0.845	1.07	0.0	0.028	0.394	0.394	2	2
chr6	380338	380414	DUP	77	HG01112	0.721	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	380338	380414	DUP	77	HG01879	0.698	0.883	0.0	0.035	0.703	0.703	2	2
chr6	380338	380414	DUP	77	HG03006	0.592	0.749	0.0	0.03	0.334	0.333	2	2
chr6	380338	380414	DUP	77	NA20502	0.844	1.068	0.0	0.059	0.854	0.854	2	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG00096	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG00268	1.242	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG00419	1.423	1.382	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG00759	1.222	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG01051	1.212	1.176	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG01112	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG01500	1.35	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG01565	1.286	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG01583	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG01595	1.386	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG01879	1.199	1.164	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG02568	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG02922	1.04	1.01	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG03006	1.399	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG03052	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG03642	0.623	0.605	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr6	38370025	38370228	DEL	204	HG03742	1.255	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA12878	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA18525	1.15	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA18939	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA19017	1.331	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA19238	1.014	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA19239	1.305	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA19625	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA19648	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA20502	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38370025	38370228	DEL	204	NA20845	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG00096	0.489	0.489	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG00268	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG00419	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG00759	0.757	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG01051	0.384	0.384	0.0	0.026	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG01112	0.288	0.288	0.0	0.016	nan	nan	0	1
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG01500	1.225	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG01565	0.408	0.408	0.0	0.025	0.818	0.818	5	1
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG01583	0.576	0.576	0.0	0.031	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG01595	0.871	0.871	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG01879	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG02568	0.608	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG02922	0.728	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG03006	0.807	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG03052	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG03642	0.723	0.723	0.0	0.01	nan	nan	0	1
chr6	38498278	38498415	DEL	138	HG03742	0.926	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA12878	0.377	0.377	0.0	0.027	nan	nan	0	1
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA18525	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA18939	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA19017	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA19238	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA19239	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA19625	0.152	0.152	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA19648	1.098	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA20502	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	38498278	38498415	DEL	138	NA20845	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG00096	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG00268	0.879	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG00419	0.834	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG00759	0.272	0.264	0.0	0.011	0.882	0.926	1	1
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG01051	0.384	0.373	0.0	0.011	0.708	0.708	1	1
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG01112	0.757	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG01500	0.693	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG01565	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG01583	1.008	0.978	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG01595	0.95	0.923	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG01879	0.465	0.452	0.0	0.014	0.462	0.462	1	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG02922	0.624	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG03006	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.027	nan	nan	0	0
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG03642	0.998	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	HG03742	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA12878	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA18525	0.802	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA18939	0.517	0.502	0.0	0.029	0.97	0.929	1	1
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA19017	0.351	0.341	0.0	0.038	0.789	0.825	1	1
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA19239	0.53	0.514	0.0	0.023	0.457	0.457	1	1
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA19625	0.507	0.492	0.0	0.029	0.714	0.714	1	1
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA19648	0.873	0.848	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA20502	0.616	0.598	0.0	0.026	0.793	0.793	1	1
chr6	4021012	4021062	DEL	51	NA20845	0.65	0.631	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG00096	0.579	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG00268	0.362	0.381	0.048	0.002	0.263	0.263	6	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG00419	0.386	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG00759	0.601	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG01051	0.444	0.468	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG01112	0.379	0.399	0.053	0.016	0.19	0.19	10	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG01500	0.266	0.28	0.075	0.0	0.4	0.417	17	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG01565	0.367	0.387	0.128	0.017	0.333	0.333	12	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG01583	0.456	0.48	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG01595	0.238	0.25	0.074	0.0	0.6	0.6	15	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG01879	0.197	0.207	0.034	0.013	0.6	0.6	19	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG02568	0.684	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG02922	0.582	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG03006	0.484	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG03052	0.584	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG03642	0.549	0.578	0.007	0.005	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	HG03742	0.232	0.244	0.111	0.011	0.267	0.267	4	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA12878	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA18525	0.767	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA18939	0.535	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA19017	0.61	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA19238	0.624	0.657	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA19239	0.762	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA19625	0.659	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA19648	0.624	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA20502	0.365	0.384	0.07	0.0	0.333	0.333	5	1
chr6	41864720	41865292	DEL	573	NA20845	0.368	0.388	0.128	0.002	0.286	0.286	2	1
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG00096	0.887	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG00268	0.793	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG00419	0.651	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG00759	0.893	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG01051	0.242	0.222	0.0	0.054	0.909	0.909	1	1
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG01112	0.92	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG01500	0.728	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG01565	0.796	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG01583	1.056	0.968	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG01595	0.653	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG01879	0.733	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG02568	1.064	0.976	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG02922	0.895	0.821	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG03006	0.574	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG03052	0.765	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG03642	0.499	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	HG03742	0.965	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA12878	0.394	0.361	0.0	0.052	0.885	0.885	1	1
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA18525	0.959	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA18939	0.855	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA19017	0.869	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA19238	0.786	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA19239	0.724	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA19625	1.09	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA19648	0.649	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA20502	0.969	0.889	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr6	43614846	43614911	DEL	66	NA20845	0.834	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG00096	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG00268	0.673	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG00419	0.773	0.773	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG00759	0.563	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG01051	0.565	0.565	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG01112	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG01500	0.817	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG01565	0.776	0.776	0.009	0.009	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG01583	1.032	1.032	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG01595	0.634	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG01879	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG02568	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG02922	1.103	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG03006	0.61	0.61	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG03052	0.404	0.404	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG03642	0.848	0.848	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	HG03742	0.714	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA12878	0.942	0.942	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA18525	0.872	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA18939	0.784	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA19017	1.072	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA19238	0.806	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA19239	0.885	0.885	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA19625	0.938	0.938	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA19648	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA20502	0.753	0.753	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr6	44181076	44181227	DEL	152	NA20845	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG00096	0.905	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG00268	0.845	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG00419	0.895	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG00759	0.64	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG01051	0.586	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG01112	0.811	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG01500	0.923	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG01565	0.612	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG01583	0.648	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG01595	0.594	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG01879	0.698	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG02568	0.836	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG02922	0.374	0.416	0.0	0.029	0.938	0.938	1	1
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG03006	0.7	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG03052	1.318	1.464	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG03642	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	HG03742	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA12878	0.805	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA18939	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA19017	0.721	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA19238	0.715	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA19239	0.698	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA19625	0.71	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA19648	0.649	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA20502	0.912	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47127074	47127136	DEL	63	NA20845	0.65	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG00096	0.453	0.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG00268	0.457	0.481	0.0	0.048	0.553	0.553	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG01051	0.222	0.234	0.0	0.033	0.867	0.867	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG01112	0.64	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG01500	0.0	0.0	0.012	0.099	nan	nan	0	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG01565	0.561	0.591	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG01583	0.144	0.152	0.0	0.055	0.643	0.643	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG01595	0.356	0.375	0.0	0.059	0.609	0.609	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG03006	0.448	0.472	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG03642	0.2	0.21	0.0	0.046	1.0	1.0	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA12878	0.531	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA18525	0.401	0.422	0.0	0.032	0.857	0.823	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	0
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA19017	0.388	0.409	0.0	0.045	0.529	0.506	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA19238	0.39	0.41	0.003	0.037	0.537	0.537	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA19239	0.271	0.286	0.0	0.053	0.286	0.286	1	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA19648	0.674	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA20502	0.616	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	47280141	47280234	DEL	94	NA20845	0.282	0.297	0.0	0.058	0.889	0.889	1	1
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG00096	0.344	0.316	0.0	0.016	0.708	0.708	1	1
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG00268	0.604	0.554	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG00419	0.529	0.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG00759	0.446	0.409	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG01051	0.767	0.704	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG01112	0.739	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG01500	0.622	0.57	0.0	0.023	0.48	0.477	2	1
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG01565	0.959	0.88	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG01583	1.08	0.991	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG01595	0.911	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG01879	0.823	0.755	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG02568	0.836	0.767	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG02922	0.77	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG03006	0.825	0.757	0.0	0.005	0.947	0.992	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG03052	0.255	0.234	0.0	0.028	0.929	0.929	1	1
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG03642	0.723	0.663	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	HG03742	0.579	0.531	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA12878	0.822	0.754	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA18525	0.959	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA18939	0.499	0.458	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA19017	0.795	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA19238	0.988	0.906	0.0	0.005	0.579	0.579	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA19239	0.879	0.806	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA19625	0.583	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA19648	0.873	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA20502	0.57	0.523	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	48286295	48286349	DEL	55	NA20845	0.975	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG00096	0.942	0.942	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG00268	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG00419	0.691	0.691	0.049	0.041	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG00759	0.931	0.931	0.0	0.0	0.857	0.816	1	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG01051	0.949	0.949	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG01112	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG01500	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG01565	0.449	0.449	0.106	0.056	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG01583	0.456	0.456	0.069	0.056	0.548	0.548	2	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG01595	0.396	0.396	0.06	0.044	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG01879	0.966	0.966	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG02568	0.456	0.456	0.074	0.051	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG02922	0.603	0.603	0.057	0.034	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG03006	0.0	0.0	0.195	0.164	nan	nan	0	0
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG03052	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG03642	0.673	0.673	0.065	0.045	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	HG03742	0.521	0.521	0.076	0.056	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA12878	0.839	0.839	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA18525	0.906	0.906	0.0	0.0	0.75	0.72	1	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA18939	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA19017	1.035	1.035	0.0	0.0	0.96	0.996	1	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA19238	0.0	0.0	0.143	0.082	nan	nan	0	0
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA19239	0.0	0.0	0.143	0.143	nan	nan	0	0
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA19625	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA19648	0.524	0.524	0.087	0.077	0.789	0.839	1	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA20502	0.502	0.502	0.081	0.053	nan	nan	0	1
chr6	51199450	51200126	DEL	677	NA20845	0.0	0.0	0.183	0.125	nan	nan	0	0
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG00096	0.0	0.0	0.244	0.181	nan	nan	0	0
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG00268	1.069	1.038	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG00419	0.996	0.967	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG00759	1.3	1.262	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG01051	0.525	0.51	0.086	0.064	nan	nan	0	1
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG01112	0.0	0.0	0.227	0.159	nan	nan	0	0
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG01500	0.0	0.0	0.312	0.194	nan	nan	0	0
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG01565	1.204	1.169	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG01583	0.552	0.536	0.063	0.031	nan	nan	0	1
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG01595	1.386	1.346	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG01879	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG02568	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG02922	1.331	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG03006	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG03052	0.616	0.598	0.087	0.069	nan	nan	0	1
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG03642	0.599	0.581	0.095	0.051	0.467	0.467	1	1
chr6	51736109	51736805	DEL	697	HG03742	1.197	1.162	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA12878	0.548	0.532	0.041	0.033	0.219	0.219	1	1
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA18525	0.436	0.423	0.089	0.065	nan	nan	0	1
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA18939	1.051	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA19017	1.294	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA19238	1.286	1.249	0.0	0.0	0.898	0.898	3	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA19239	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA19625	0.33	0.32	0.142	0.087	nan	nan	0	1
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA19648	0.0	0.0	0.161	0.121	nan	nan	0	0
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA20502	0.0	0.0	0.282	0.157	nan	nan	0	0
chr6	51736109	51736805	DEL	697	NA20845	0.477	0.463	0.065	0.054	0.727	0.727	1	1
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG00096	1.123	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG00268	1.035	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG00419	0.956	1.062	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG00759	0.893	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG01051	0.808	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG01112	1.1	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG01500	0.994	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG01565	0.673	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG01583	0.984	1.093	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG01595	0.733	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG01879	1.002	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG02568	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG02922	0.895	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG03006	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG03052	0.723	0.803	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG03642	0.524	0.582	0.009	0.086	nan	nan	0	1
chr6	5205410	5205772	DEL	363	HG03742	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA12878	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA18525	0.837	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA18939	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA19017	0.869	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA19238	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA19239	0.827	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA19625	1.04	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA19648	0.624	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA20502	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5205410	5205772	DEL	363	NA20845	0.889	0.987	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG00096	0.742	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG00268	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG00419	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG00759	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG01051	0.909	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG01112	0.974	0.945	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG01500	0.657	0.638	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG01565	0.878	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG01583	0.84	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG01595	0.673	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG01879	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG02568	0.836	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG02922	0.77	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG03006	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG03052	0.765	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG03642	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	HG03742	0.811	0.787	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA12878	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA18525	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA18939	0.677	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA19017	0.739	0.718	0.01	0.051	0.33	0.326	2	1
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA19238	0.949	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA19239	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA19625	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA19648	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA20502	1.186	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	54101336	54101482	DEL	147	NA20845	0.759	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG00096	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG00268	0.931	0.931	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG00419	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG00759	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG01051	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG01112	0.884	0.884	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG01500	0.977	0.977	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG01565	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG01583	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG01595	1.168	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG01879	0.841	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG02568	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG02922	0.541	0.541	0.028	0.008	0.833	0.833	6	1
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG03006	0.915	0.915	0.0	0.0	0.714	0.748	1	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG03052	0.744	0.744	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG03642	1.022	1.022	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	HG03742	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA12878	1.028	1.028	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA18525	1.081	1.081	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.0	0.727	0.697	1	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA19017	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA19238	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA19239	0.995	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA19625	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA19648	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA20502	1.049	1.049	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr6	56915807	56916516	DEL	710	NA20845	1.084	1.084	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG00096	1.104	1.104	0.0	0.0	0.348	0.348	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG00268	1.328	1.328	0.0	0.0	0.585	0.585	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG00419	1.159	1.159	0.0	0.0	0.467	0.467	17	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG00759	1.106	1.106	0.0	0.0	0.475	0.499	15	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG01051	1.111	1.111	0.0	0.003	0.444	0.444	15	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG01112	1.262	1.262	0.0	0.0	0.545	0.545	17	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG01500	1.261	1.261	0.0	0.0	0.63	0.658	17	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG01565	1.224	1.224	0.0	0.0	0.458	0.458	15	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG01583	1.224	1.224	0.0	0.0	0.458	0.458	14	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG01595	1.069	1.069	0.0	0.0	0.43	0.43	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG01879	1.306	1.306	0.002	0.0	0.319	0.319	15	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG02568	1.292	1.292	0.0	0.003	0.375	0.375	12	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG02922	1.269	1.269	0.0	0.0	0.294	0.294	15	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG03006	1.327	1.327	0.0	0.0	0.477	0.5	17	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG03052	1.063	1.063	0.0	0.0	0.554	0.554	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG03642	1.322	1.322	0.0	0.0	0.391	0.391	15	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	HG03742	1.042	1.042	0.0	0.0	0.5	0.5	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA12878	1.096	1.096	0.0	0.0	0.421	0.421	14	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA18525	1.36	1.36	0.0	0.0	0.611	0.637	17	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA18939	1.069	1.069	0.0	0.0	0.548	0.572	17	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA19017	1.035	1.035	0.0	0.0	0.345	0.361	15	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA19238	1.468	1.468	0.0	0.0	0.493	0.493	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA19239	0.956	0.956	0.041	0.012	0.762	0.762	17	1
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA19625	1.369	1.369	0.0	0.0	0.329	0.329	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA19648	1.397	1.397	0.0	0.003	0.326	0.346	13	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA20502	1.117	1.117	0.0	0.0	0.568	0.568	16	2
chr6	57467845	57468583	DEL	739	NA20845	1.235	1.235	0.0	0.0	0.565	0.565	13	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG00096	0.724	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG00268	0.491	0.477	0.008	0.071	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG00419	0.468	0.454	0.018	0.047	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG00759	0.611	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG01051	0.868	0.843	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG01112	0.541	0.525	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG01500	0.533	0.517	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG01565	0.551	0.535	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG01583	0.492	0.478	0.009	0.076	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG01595	0.891	0.865	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG01879	0.796	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG02568	0.646	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG02922	0.354	0.343	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG03006	0.771	0.749	0.0	0.0	0.706	0.739	1	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG03052	0.701	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG03642	0.299	0.291	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	HG03742	0.56	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA12878	0.445	0.432	0.0	0.063	0.737	0.737	1	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA18525	0.279	0.271	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA18939	0.401	0.389	0.011	0.071	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA19017	0.388	0.377	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA19238	0.936	0.908	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA19239	0.504	0.489	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA19625	0.659	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA19648	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA20502	0.513	0.498	0.014	0.086	0.346	0.346	1	1
chr6	57618680	57618879	DEL	200	NA20845	0.152	0.147	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG00096	0.272	0.302	0.01	0.089	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG00268	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG00419	0.834	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG00759	0.795	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG01051	0.545	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG01112	0.775	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG01500	0.586	0.651	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG01565	0.714	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG01583	0.288	0.32	0.025	0.069	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG01595	0.832	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG01879	0.358	0.398	0.011	0.058	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG02568	0.418	0.464	0.012	0.096	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG02922	0.374	0.416	0.016	0.039	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG03006	0.287	0.319	0.039	0.064	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG03052	0.638	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG03642	0.499	0.554	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	HG03742	0.676	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA12878	0.377	0.419	0.02	0.095	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA18525	0.872	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA18939	0.606	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA19017	0.702	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA19238	0.572	0.635	0.004	0.075	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA19239	0.388	0.431	0.011	0.103	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA19625	0.735	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA19648	1.023	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA20502	0.57	0.633	0.032	0.078	nan	nan	0	1
chr6	5898451	5898882	DEL	432	NA20845	0.325	0.361	0.082	0.09	nan	nan	0	1
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG00096	0.942	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG00268	0.948	0.921	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG00419	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG00759	1.184	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG01051	1.232	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG01112	1.28	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG01500	1.03	1.0	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG01565	1.306	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG01583	0.96	0.932	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG01595	1.05	1.019	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG01879	1.002	0.973	0.0	0.0	0.286	0.286	6	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG02568	1.178	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG02922	1.082	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG03006	1.022	0.993	0.0	0.0	0.267	0.28	6	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG03052	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG03642	0.823	0.799	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	HG03742	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA12878	0.976	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA18525	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA18939	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA19017	1.035	1.005	0.0	0.0	0.821	0.786	1	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA19238	1.117	1.085	0.0	0.0	0.868	0.868	1	1
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA19239	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA19625	1.141	1.108	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA19648	0.998	0.969	0.0	0.0	0.941	0.886	1	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA20502	0.867	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	63852043	63852575	DEL	533	NA20845	1.214	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG00096	0.742	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG00268	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG00419	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG00759	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG01051	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG01112	0.847	0.847	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG01500	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG01565	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG01583	0.624	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG01595	0.762	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG01879	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG02568	0.912	0.912	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG02922	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG03006	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG03052	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG03642	0.673	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	HG03742	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA12878	0.993	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA18939	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA19017	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA19238	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA19239	0.594	0.594	0.0	0.061	0.429	0.429	2	1
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA19625	0.532	0.532	0.0	0.071	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA19648	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA20502	0.821	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	64955285	64955442	DEL	158	NA20845	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG00096	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG00268	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG00419	1.24	1.204	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG00759	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG01051	0.889	0.863	0.0	0.0	0.474	0.474	1	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG01112	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG01500	1.19	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG01565	0.898	0.872	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG01583	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG01595	0.733	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG01879	0.376	0.365	0.072	0.074	nan	nan	0	1
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG02568	0.95	0.922	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG02922	0.957	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG03006	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG03052	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG03642	1.372	1.332	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	HG03742	1.023	0.993	0.0	0.0	0.536	0.536	1	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA12878	0.736	0.715	0.004	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA18525	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA18939	0.784	0.761	0.0	0.0	0.654	0.682	1	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA19017	0.481	0.467	0.053	0.053	nan	nan	0	1
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA19238	0.526	0.511	0.031	0.04	nan	nan	0	1
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA19239	1.072	1.041	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA19625	1.141	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA19648	1.073	1.042	0.005	0.005	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	65910036	65910641	DEL	606	NA20845	0.954	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG00096	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG00268	1.069	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG00419	1.017	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG00759	1.048	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG01051	0.868	0.812	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG01112	1.064	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG01500	1.137	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG01565	0.959	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG01583	0.96	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG01595	1.228	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG01879	1.145	1.07	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG02568	0.608	0.568	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG02922	1.123	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG03006	0.735	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG03052	1.126	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG03642	1.222	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	HG03742	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA12878	0.805	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA18525	0.732	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA18939	1.426	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA19017	0.721	0.674	0.006	0.052	nan	nan	0	1
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA19238	1.04	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA19239	1.06	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA19625	1.293	1.209	0.006	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA19648	1.098	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA20502	1.117	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67111012	67111370	DEL	359	NA20845	1.235	1.155	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG00096	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG00268	1.017	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG00419	1.078	1.007	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG00759	1.242	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG01051	1.232	1.151	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG01112	1.226	1.146	0.0	0.0	0.59	0.59	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG01500	1.048	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG01565	1.143	1.068	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG01583	1.152	1.076	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG01595	1.168	1.092	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG01879	1.127	1.053	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG02568	1.368	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG02922	0.395	0.369	0.098	0.048	nan	nan	0	1
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG03006	1.022	0.956	0.0	0.0	0.957	0.913	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG03052	0.914	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG03642	1.172	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	HG03742	1.197	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA12878	0.976	0.912	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA18525	1.15	1.075	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA18939	1.14	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA19017	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA19238	1.052	0.984	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA19239	1.176	1.099	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA19625	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA19648	1.148	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA20502	0.935	0.874	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr6	67325065	67326027	DEL	963	NA20845	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG00096	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG00268	0.604	0.586	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG00419	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG00759	0.97	0.942	0.0	0.0	0.72	0.686	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG01051	0.909	0.882	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG01112	0.793	0.77	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG01500	0.799	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG01565	1.041	1.011	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG01583	0.744	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG01595	1.01	0.98	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG01879	1.109	1.077	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG02568	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG02922	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG03006	0.933	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG03052	0.999	0.97	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG03642	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	HG03742	1.062	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA12878	0.908	0.881	0.0	0.003	0.484	0.484	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA18525	1.081	1.049	0.0	0.0	0.737	0.707	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA18939	0.909	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA19238	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA19239	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA19625	1.369	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA19648	0.923	0.896	0.0	0.0	0.8	0.85	1	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA20502	1.231	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68479622	68479738	DUP	117	NA20845	1.019	0.989	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG00096	1.34	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG00419	1.525	1.399	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG00759	1.397	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG01051	1.414	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG01500	1.367	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG01565	1.327	1.217	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG01595	1.703	1.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG02568	1.482	1.359	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG02922	1.207	1.107	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG03006	1.202	1.103	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG03052	1.02	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG03642	1.272	1.167	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	HG03742	1.428	1.31	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA18525	0.994	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA18939	1.23	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA19017	0.739	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA19238	1.481	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA19239	1.318	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA19625	1.141	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA20502	1.231	1.13	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68499604	68499692	DUP	89	NA20845	1.409	1.292	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG00096	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG00268	1.0	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG00419	1.139	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG00759	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG01051	1.131	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG01112	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG01500	1.137	1.062	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG01565	1.163	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG01583	1.008	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG01595	0.752	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG01879	1.163	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG02568	0.836	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG02922	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG03006	0.915	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG03052	0.808	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG03642	0.973	0.909	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	HG03742	1.177	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA12878	0.822	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA18525	1.046	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA18939	0.944	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA19017	0.554	0.518	0.0	0.05	0.677	0.707	2	1
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA19238	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA19239	0.446	0.417	0.0	0.052	0.637	0.637	2	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA19625	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA19648	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA20502	0.889	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	68584793	68584884	DEL	92	NA20845	0.78	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG00096	0.978	0.949	0.0	0.0	0.899	0.899	6	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG00268	0.586	0.569	0.073	0.047	0.515	0.515	1	1
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG00419	0.976	0.948	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG00759	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG01051	1.191	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG01112	0.938	0.91	0.0	0.0	0.466	0.466	6	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG01500	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG01565	0.918	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG01583	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG01595	1.149	1.115	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG01879	1.002	0.973	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG02568	0.988	0.959	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG02922	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG03006	1.004	0.975	0.0	0.0	0.71	0.677	1	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG03052	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG03642	0.998	0.968	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	HG03742	1.004	0.974	0.0	0.0	0.657	0.657	1	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA12878	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA18525	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA18939	1.051	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA19017	1.035	1.005	0.0	0.0	0.562	0.537	2	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA19238	1.221	1.186	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA19239	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA19625	0.507	0.492	0.074	0.055	0.778	0.778	2	1
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA19648	1.198	1.163	0.0	0.0	0.913	0.97	1	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA20502	1.14	1.107	0.0	0.0	0.744	0.744	6	2
chr6	69138371	69139370	DEL	1000	NA20845	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG00096	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG00268	0.914	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG00419	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG00759	1.319	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG01051	0.949	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG01112	0.829	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG01500	0.994	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG01565	0.857	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG01583	1.128	1.095	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG01595	0.95	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG01879	0.358	0.347	0.022	0.063	nan	nan	0	1
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG02568	1.064	1.033	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG02922	1.019	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG03006	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG03052	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG03642	1.122	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	HG03742	0.946	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA12878	1.01	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA18525	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA18939	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA19017	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA19238	0.897	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA19239	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA19625	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA19648	1.223	1.187	0.0	0.0	0.519	0.488	1	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA20502	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	69471186	69471716	DEL	531	NA20845	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG00096	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG00268	0.793	0.793	0.006	0.0	0.764	0.764	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG00419	1.057	1.057	0.0	0.0	0.842	0.842	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG00759	0.854	0.854	0.0	0.0	0.834	0.83	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG01051	0.808	0.808	0.0	0.004	0.941	0.941	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG01112	0.884	0.884	0.004	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG01500	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG01565	0.918	0.918	0.0	0.0	0.754	0.754	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG01583	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG01595	0.693	0.693	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG01879	0.966	0.966	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG02568	1.102	1.102	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG02922	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG03006	1.022	1.022	0.0	0.002	0.828	0.791	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG03052	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG03642	0.898	0.898	0.0	0.0	0.903	0.903	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	HG03742	0.811	0.811	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA12878	0.976	0.976	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA18525	0.941	0.941	0.003	0.0	0.91	0.909	2	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA18939	0.927	0.927	0.0	0.0	0.821	0.857	1	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA19017	1.016	1.016	0.0	0.0	0.818	0.855	3	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA19238	0.975	0.975	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA19239	0.491	0.491	0.093	0.041	nan	nan	0	1
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA19625	0.71	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA19648	0.948	0.948	0.0	0.0	0.929	0.987	3	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA20502	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71333314	71334230	DEL	917	NA20845	0.867	0.867	0.0	0.0	0.613	0.613	2	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG00096	0.797	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG00268	0.621	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG00419	0.427	0.541	0.0	0.009	0.72	0.72	2	1
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG00759	0.621	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG01051	0.828	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG01112	0.775	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG01500	1.137	1.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG01565	1.02	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG01583	1.2	1.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG01595	0.673	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG01879	0.572	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG02568	0.57	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG02922	0.77	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG03006	0.628	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG03052	0.723	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG03642	0.623	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	HG03742	0.907	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA12878	0.822	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA18525	0.715	0.905	0.0	0.0	0.826	0.861	1	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA18939	0.517	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA19017	0.85	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA19238	0.741	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA19239	0.743	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA19625	0.659	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA19648	0.848	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA20502	0.753	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	71492706	71492770	DEL	65	NA20845	1.019	1.289	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG00096	0.598	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG00268	1.052	1.052	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG00419	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG00759	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG01051	0.909	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG01112	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG01500	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG01565	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG01583	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG01595	0.733	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG01879	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG02568	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG02922	0.915	0.915	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG03006	0.825	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG03642	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	HG03742	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA12878	0.925	0.925	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA18525	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA18939	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA19017	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA19238	1.117	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA19239	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA19625	1.547	1.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA19648	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA20502	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72155994	72156060	DUP	67	NA20845	0.975	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG00096	1.177	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG00268	1.0	0.971	0.0	0.0	0.531	0.531	3	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG00419	0.468	0.454	0.073	0.057	nan	nan	0	1
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG00759	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG01051	0.929	0.902	0.0	0.0	0.789	0.789	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG01112	0.992	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG01500	1.208	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG01565	0.857	0.832	0.0	0.0	0.576	0.576	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG01583	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG01595	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG01879	0.787	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG02568	0.836	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG02922	1.123	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG03006	1.094	1.062	0.0	0.0	0.562	0.566	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG03052	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG03642	0.898	0.872	0.0	0.0	0.792	0.792	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	HG03742	0.869	0.843	0.0	0.0	0.643	0.643	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA12878	1.01	0.981	0.0	0.007	0.712	0.712	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA18525	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA18939	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA19017	1.146	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA19238	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA19239	0.917	0.891	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA19625	0.963	0.935	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA19648	0.923	0.896	0.0	0.0	0.881	0.883	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA20502	0.935	0.908	0.0	0.0	0.632	0.632	4	2
chr6	72227079	72227726	DEL	648	NA20845	0.91	0.884	0.0	0.0	0.769	0.769	3	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG00096	1.032	1.032	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG00268	1.052	1.052	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG00419	1.159	1.159	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG00759	0.99	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG01051	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG01112	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG01500	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG01565	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG01583	0.96	0.96	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG01595	0.931	0.931	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG01879	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG02568	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG02922	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG03006	0.987	0.987	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG03052	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG03642	0.424	0.424	0.098	0.072	nan	nan	0	1
chr6	72416603	72417596	DEL	994	HG03742	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA12878	0.993	0.993	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA18525	0.819	0.819	0.0	0.0	0.806	0.774	1	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA18939	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA19017	0.961	0.961	0.0	0.0	0.857	0.859	3	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA19238	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA19239	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA19625	1.116	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA19648	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA20502	0.912	0.912	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	72416603	72417596	DEL	994	NA20845	0.867	0.867	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG00096	1.159	1.063	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG00268	1.276	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG00419	1.484	1.362	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG00759	1.048	0.961	0.0	0.0	1.0	0.952	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG01051	1.09	1.0	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG01112	1.352	1.241	0.0	0.0	0.897	0.897	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG01500	1.35	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG01565	1.245	1.142	0.0	0.002	0.689	0.689	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG01583	1.152	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG01595	1.446	1.326	0.0	0.0	0.61	0.61	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG01879	1.145	1.05	0.0	0.0	0.969	0.969	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG02568	0.76	0.697	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG02922	1.04	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG03006	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG03052	1.339	1.228	0.0	0.0	0.951	0.951	2	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG03642	1.546	1.418	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	HG03742	1.177	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA12878	0.891	0.817	0.0	0.003	1.0	1.0	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA18525	1.36	1.247	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA18939	1.087	0.997	0.0	0.003	0.725	0.757	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA19017	0.573	0.526	0.026	0.102	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA19238	0.494	0.453	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA19239	1.137	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA19625	1.116	1.024	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA19648	1.023	0.938	0.0	0.0	0.75	0.797	1	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA20502	1.277	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	72667161	72667629	DEL	469	NA20845	1.192	1.094	0.0	0.004	0.8	0.8	1	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG00096	1.267	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG00268	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG00419	1.281	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG00759	1.048	1.048	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG01051	1.212	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG01112	1.406	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG01500	0.604	0.604	0.0	0.039	0.743	0.775	1	1
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG01565	0.49	0.49	0.0	0.039	0.87	0.87	1	1
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG01583	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG01595	1.446	1.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG01879	1.288	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG02568	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG02922	1.165	1.165	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG03006	1.345	1.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG03052	1.126	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG03642	1.272	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	HG03742	1.428	1.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA12878	1.182	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA18525	1.264	1.264	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA18939	1.051	1.051	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA19017	1.46	1.46	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA19238	1.104	1.104	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA19239	1.215	1.215	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA19625	0.963	0.963	0.0	0.0	0.65	0.65	1	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA19648	1.148	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA20502	1.288	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73067738	73067795	DEL	58	NA20845	1.192	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG00096	0.815	0.858	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG00268	1.104	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG00419	0.549	0.578	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG00759	0.524	0.551	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG01051	1.05	1.105	0.0	0.003	0.64	0.64	1	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG01112	0.811	0.854	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG01500	0.746	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG01565	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG01583	0.96	1.01	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG01595	0.891	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG01879	0.966	1.017	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG02568	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG02922	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG03006	0.43	0.453	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG03052	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG03642	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA12878	0.411	0.433	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	0
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA18939	1.016	1.069	0.0	0.0	0.968	0.927	1	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA19017	0.961	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA19238	1.234	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA19239	1.008	1.061	0.0	0.0	0.854	0.854	1	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA19625	0.963	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA19648	0.724	0.762	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA20502	0.319	0.336	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr6	73152037	73152154	DEL	118	NA20845	0.542	0.57	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG00096	0.489	0.515	0.035	0.0	nan	nan	0	1
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG00268	0.483	0.508	0.035	0.003	nan	nan	0	1
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG00419	0.874	0.92	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG00759	1.009	1.062	0.0	0.0	0.75	0.714	1	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG01051	0.707	0.744	0.0	0.005	0.867	0.867	4	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG01112	0.829	0.873	0.0	0.0	0.798	0.798	2	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG01500	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG01565	0.776	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG01583	0.624	0.657	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG01595	0.713	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG01879	0.733	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG02568	1.026	1.08	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG02922	0.791	0.832	0.0	0.0	0.894	0.894	8	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG03006	0.807	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG03052	0.871	0.917	0.0	0.0	0.614	0.614	6	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG03642	0.873	0.919	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	HG03742	0.386	0.406	0.056	0.0	nan	nan	0	1
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA12878	0.976	1.028	0.003	0.0	0.84	0.84	4	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA18525	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA18939	0.588	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA19017	0.813	0.856	0.0	0.0	0.817	0.781	6	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA19238	0.858	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA19239	0.737	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA19625	0.685	0.721	0.0	0.0	0.583	0.583	5	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA19648	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA20502	1.003	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	73221994	73222816	DEL	823	NA20845	0.824	0.867	0.0	0.0	0.636	0.636	4	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG00096	0.616	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG00268	0.5	0.467	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG00419	0.508	0.475	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG00759	0.757	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG01051	0.525	0.491	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG01112	0.487	0.455	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG01500	0.799	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG01565	0.816	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG01583	0.48	0.448	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG01595	0.475	0.444	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG01879	0.519	0.485	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG02568	0.76	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG02922	0.811	0.758	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG03006	0.592	0.553	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG03052	0.404	0.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG03642	0.474	0.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	HG03742	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA12878	0.856	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA18525	0.872	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA18939	0.392	0.366	0.0	0.043	0.687	0.717	2	1
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA19017	0.554	0.518	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA19238	0.689	0.644	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA19239	0.543	0.507	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA19625	0.456	0.427	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA19648	0.349	0.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA20502	0.593	0.554	0.0	0.006	0.889	0.889	1	2
chr6	74232261	74232369	DEL	109	NA20845	0.303	0.284	0.0	0.052	0.417	0.417	1	1
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG00096	0.471	0.457	0.063	0.053	nan	nan	0	1
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG00268	0.948	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG00419	0.813	0.79	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG00759	1.048	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG01051	0.889	0.863	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG01112	0.739	0.718	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG01500	0.906	0.879	0.0	0.0	0.895	0.895	2	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG01565	0.653	0.634	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG01583	0.72	0.699	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG01595	0.97	0.942	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG01879	0.948	0.921	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG02568	0.836	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG02922	0.874	0.848	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG03006	0.987	0.958	0.0	0.0	0.902	0.902	2	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG03052	0.829	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG03642	0.673	0.654	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	HG03742	0.83	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA12878	0.411	0.399	0.064	0.039	nan	nan	0	1
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA18525	0.837	0.812	0.0	0.0	0.333	0.32	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA18939	0.873	0.848	0.0	0.0	0.96	0.92	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA19017	0.869	0.843	0.0	0.0	0.933	0.976	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA19238	0.676	0.656	0.0	0.0	0.935	0.935	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA19239	0.853	0.828	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA19625	0.659	0.64	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA19648	0.424	0.412	0.049	0.042	nan	nan	0	1
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA20502	0.912	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74832472	74833461	DEL	990	NA20845	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG00096	0.0	0.0	0.023	0.198	nan	nan	0	0
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG00268	0.31	0.357	0.02	0.089	0.389	0.389	14	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG00419	0.346	0.397	0.009	0.048	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG00759	0.873	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG01051	0.323	0.371	0.008	0.092	0.304	0.304	14	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG01112	0.27	0.311	0.015	0.112	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG01500	0.302	0.347	0.012	0.093	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG01565	0.429	0.493	0.02	0.059	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG01583	0.432	0.496	0.01	0.059	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG01595	0.337	0.387	0.011	0.084	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG01879	0.572	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG02568	1.064	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG02922	0.478	0.55	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG03006	0.395	0.454	0.032	0.063	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG03052	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG03642	0.474	0.545	0.009	0.066	0.571	0.571	1	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	HG03742	0.0	0.0	0.012	0.165	nan	nan	0	0
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA18525	0.645	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA18939	0.0	0.0	0.028	0.111	nan	nan	0	0
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA19017	0.832	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA19238	0.325	0.373	0.003	0.078	0.593	0.593	1	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA19239	0.827	0.951	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA19625	0.482	0.554	0.017	0.063	0.333	0.333	1	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA19648	0.499	0.574	0.022	0.057	nan	nan	0	1
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA20502	0.0	0.0	0.01	0.212	nan	nan	0	0
chr6	74932705	74933071	DEL	367	NA20845	0.325	0.374	0.009	0.059	0.643	0.643	1	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG00096	0.0	0.0	0.017	0.198	nan	nan	0	0
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG00268	0.259	0.297	0.017	0.093	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG00419	0.264	0.304	0.009	0.048	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG00759	0.815	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG01051	0.283	0.325	0.011	0.095	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG01112	0.325	0.373	0.018	0.117	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG01500	0.284	0.327	0.012	0.097	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG01565	0.429	0.493	0.02	0.061	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG01583	0.312	0.359	0.014	0.061	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG01595	0.297	0.341	0.011	0.086	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG01879	0.537	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG02568	1.026	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG02922	0.478	0.55	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG03006	0.395	0.454	0.033	0.065	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG03052	0.616	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG03642	0.449	0.516	0.009	0.069	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	HG03742	0.0	0.0	0.013	0.176	nan	nan	0	0
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.157	nan	nan	0	0
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA18525	0.662	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA18939	0.0	0.0	0.019	0.11	nan	nan	0	0
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA19017	0.832	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA19238	0.338	0.388	0.005	0.083	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA19239	0.762	0.876	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA19625	0.456	0.525	0.023	0.064	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA19648	0.474	0.545	0.024	0.061	nan	nan	0	1
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA20502	0.0	0.0	0.014	0.215	nan	nan	0	0
chr6	74932723	74932945	DEL	223	NA20845	0.347	0.399	0.009	0.06	nan	nan	0	1
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG00096	0.797	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG00268	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG00419	0.996	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG00759	0.679	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG01051	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG01112	0.884	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG01500	0.835	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG01565	1.082	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG01583	1.08	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG01595	0.832	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG01879	0.751	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG02568	0.988	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG02922	0.895	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG03006	0.7	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG03052	0.893	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG03642	0.998	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	HG03742	0.869	0.965	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA12878	0.891	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA18525	0.628	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA18939	0.695	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA19017	0.758	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA19238	0.364	0.404	0.0	0.031	0.744	0.744	1	1
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA19239	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA19625	1.09	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA19648	0.848	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA20502	0.753	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	75560355	75560409	DEL	55	NA20845	0.802	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG00096	0.688	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG00268	0.362	0.402	0.107	0.052	nan	nan	0	1
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG00419	0.874	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG00759	0.912	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG01051	0.808	0.898	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG01112	0.685	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG01500	0.764	0.848	0.0	0.0	0.696	0.667	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG01565	0.673	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG01583	0.864	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG01595	0.891	0.99	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG01879	0.662	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG02568	1.026	1.14	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG02922	0.791	0.878	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG03006	0.825	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG03052	0.723	0.803	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG03642	0.599	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	HG03742	0.618	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA12878	0.668	0.742	0.006	0.0	0.875	0.875	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA18939	0.606	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA19017	0.739	0.821	0.0	0.0	0.579	0.554	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA19238	0.689	0.765	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA19239	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA19625	0.355	0.394	0.087	0.048	nan	nan	0	1
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA19648	0.848	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA20502	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7781568	7782514	DEL	947	NA20845	0.802	0.891	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG00096	0.706	0.743	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG00268	0.793	0.835	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG00419	0.895	0.942	0.0	0.0	0.753	0.753	2	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG00759	0.776	0.817	0.0	0.0	0.611	0.582	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG01051	0.767	0.808	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG01112	0.793	0.835	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG01500	0.817	0.86	0.0	0.0	0.52	0.543	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG01565	0.653	0.687	0.0	0.0	0.474	0.474	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG01583	0.936	0.985	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG01595	0.693	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG01879	0.662	0.697	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG02568	0.494	0.52	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG02922	0.645	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG03006	0.807	0.85	0.0	0.0	0.577	0.551	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG03052	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG03642	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	HG03742	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA12878	0.908	0.955	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA18525	0.872	0.917	0.0	0.0	0.7	0.694	3	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA18939	0.784	0.825	0.0	0.0	0.852	0.889	2	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA19017	0.37	0.389	0.0	0.0	0.765	0.799	1	1
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA19238	0.91	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA19239	0.53	0.558	0.0	0.0	0.235	0.235	2	1
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA19625	0.887	0.934	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA19648	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA20502	0.867	0.912	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	78898237	78899013	DEL	777	NA20845	0.694	0.73	0.0	0.0	0.389	0.389	1	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG00096	1.104	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG00268	0.948	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG00419	0.976	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG00759	0.563	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG01051	0.687	0.789	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG01112	0.721	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG01500	1.048	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG01565	0.694	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG01583	0.576	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG01595	0.911	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG01879	0.769	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG02568	0.57	0.655	0.0	0.0	0.417	0.417	1	1
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG02922	1.165	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG03006	0.753	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG03052	0.765	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG03642	0.499	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	HG03742	0.907	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA12878	0.873	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA18525	0.872	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA18939	0.588	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA19017	0.222	0.255	0.0	0.029	0.75	0.784	1	1
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA19238	0.819	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA19239	0.737	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA19625	0.735	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA19648	0.873	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA20502	0.707	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	7906319	7906375	DEL	57	NA20845	0.867	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG00096	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG00268	0.897	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG00419	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG00759	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG01051	1.474	1.378	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG01112	1.614	1.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG01500	1.332	1.245	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG01565	0.561	0.525	0.0	0.009	0.538	0.538	1	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG01583	0.912	0.852	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG01595	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG01879	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG02568	1.254	1.172	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG02922	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG03006	0.484	0.453	0.0	0.021	0.966	0.989	1	1
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG03052	1.148	1.073	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG03642	1.347	1.259	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	HG03742	1.177	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA12878	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA18525	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA18939	1.247	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA19017	1.109	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA19238	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA19239	0.943	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA19625	1.116	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA19648	0.973	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA20502	1.231	1.151	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	79664444	79664503	DEL	60	NA20845	1.474	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG00096	0.416	0.389	0.0	0.039	0.963	0.963	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG00268	0.793	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG00419	0.325	0.304	0.0	0.047	0.8	0.8	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG01051	0.828	0.774	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG01112	0.956	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG01500	0.835	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG01565	0.327	0.305	0.0	0.048	0.733	0.733	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG01595	0.327	0.305	0.0	0.043	0.778	0.778	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG01879	0.841	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG02568	0.76	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG02922	0.562	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG03006	0.61	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG03052	0.468	0.437	0.0	0.044	0.591	0.591	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr6	80609906	80609977	DEL	72	HG03742	0.811	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA12878	0.813	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA18525	0.0	0.0	0.008	0.066	nan	nan	0	0
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA18939	0.374	0.35	0.0	0.042	0.375	0.391	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA19017	1.063	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA19238	0.416	0.389	0.0	0.024	0.703	0.703	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA19239	0.465	0.435	0.0	0.034	0.674	0.674	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA19625	0.279	0.261	0.0	0.058	0.833	0.833	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA19648	0.499	0.466	0.0	0.02	0.4	0.425	1	1
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA20502	0.684	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	80609906	80609977	DEL	72	NA20845	0.954	0.891	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG00096	1.014	0.984	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG00268	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG00419	1.057	1.027	0.0	0.0	0.781	0.781	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG00759	1.145	1.111	0.0	0.0	0.967	0.921	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG01051	0.848	0.823	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG01112	1.082	1.05	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG01500	1.172	1.138	0.0	0.0	0.853	0.89	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG01565	1.184	1.149	0.0	0.0	0.839	0.839	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG01583	0.648	0.629	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG01595	0.832	0.807	0.005	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG01879	1.055	1.025	0.0	0.003	0.833	0.833	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG02568	0.304	0.295	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG02922	0.52	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG03006	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG03052	1.041	1.011	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG03642	1.147	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	HG03742	1.1	1.068	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA12878	1.147	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA18525	1.011	0.982	0.0	0.0	0.543	0.565	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA18939	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA19017	0.906	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA19238	0.962	0.934	0.0	0.0	0.868	0.868	1	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA19239	1.124	1.091	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA19625	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA19648	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA20502	1.072	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	82176340	82176956	DEL	617	NA20845	0.997	0.968	0.0	0.0	0.494	0.494	2	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG00096	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG00268	0.879	0.926	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG00419	0.773	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG00759	0.912	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG01051	0.788	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG01112	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG01500	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG01565	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG01583	0.768	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG01595	0.891	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG01879	0.769	0.81	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG02568	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG02922	0.915	0.964	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG03006	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG03052	1.063	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG03642	1.172	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	HG03742	0.232	0.244	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA12878	0.942	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA18525	0.837	0.881	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA18939	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA19017	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA19238	0.936	0.985	0.0	0.0	0.865	0.865	1	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA19239	1.06	1.115	0.0	0.0	0.932	0.932	1	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA19625	0.786	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA19648	0.798	0.84	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA20502	0.753	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	84218939	84219053	DEL	115	NA20845	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG00096	1.014	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG00268	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG00419	1.24	1.204	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG00759	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG01051	1.111	1.078	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG01112	0.757	0.735	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG01500	1.172	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG01565	1.122	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG01583	0.816	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG01595	1.188	1.154	0.0	0.0	0.735	0.735	1	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG01879	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG02568	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG02922	1.019	0.99	0.0	0.002	0.724	0.724	2	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG03006	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG03052	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG03642	1.047	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	HG03742	0.888	0.862	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA12878	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA18525	1.412	1.371	0.0	0.0	0.864	0.829	1	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA18939	0.944	0.917	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA19017	0.333	0.323	0.071	0.039	nan	nan	0	1
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA19238	1.156	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA19239	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA19625	1.04	1.009	0.0	0.0	0.786	0.786	2	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA19648	1.148	1.114	0.005	0.0	0.609	0.573	1	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA20502	1.095	1.063	0.0	0.0	0.503	0.503	2	2
chr6	85220352	85220954	DEL	603	NA20845	1.127	1.094	0.004	0.0	0.64	0.64	1	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG00096	0.706	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG00268	0.948	0.921	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG00419	0.956	0.928	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG00759	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG01051	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG01112	0.902	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG01500	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG01565	1.143	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG01583	0.72	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG01595	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG01879	0.948	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.203	nan	nan	0	0
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG02922	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG03006	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG03052	1.254	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG03642	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	HG03742	0.984	0.956	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA12878	0.736	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA18525	1.116	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA18939	1.087	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA19017	0.906	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA19238	0.663	0.643	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA19239	0.762	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA19625	1.014	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA19648	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA20502	1.117	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	85613640	85613755	DEL	116	NA20845	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG00096	0.779	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG00268	0.914	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG00419	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG00759	0.99	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG01051	1.212	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG01112	0.847	0.892	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG01500	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG01565	1.061	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG01583	0.816	0.859	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG01595	0.95	1.001	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG01879	1.055	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG02568	0.874	0.92	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG02922	0.811	0.854	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG03006	1.166	1.227	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG03052	0.34	0.358	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr6	878278	878565	DEL	288	HG03642	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	HG03742	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA12878	0.771	0.811	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA18525	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA18939	0.927	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA19017	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA19238	1.014	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA19239	1.072	1.129	0.0	0.0	0.829	0.829	1	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA19625	1.014	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA19648	1.123	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA20502	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	878278	878565	DEL	288	NA20845	1.084	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG00096	1.304	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG00268	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG00419	1.037	1.037	0.0	0.0	0.548	0.548	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG00759	0.757	0.757	0.0	0.0	0.657	0.626	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG01051	0.707	0.707	0.0	0.005	0.929	0.929	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG01112	0.811	0.811	0.0	0.0	0.661	0.661	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG01500	0.835	0.835	0.0	0.0	0.536	0.559	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG01565	1.041	1.041	0.0	0.0	0.838	0.838	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG01583	1.152	1.152	0.0	0.0	0.712	0.712	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG01595	0.554	0.554	0.0	0.0	0.724	0.724	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG01879	0.555	0.555	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG02568	1.216	1.216	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG02922	0.915	0.915	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG03006	0.861	0.861	0.0	0.004	0.739	0.774	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG03052	0.871	0.871	0.0	0.004	0.842	0.842	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG03642	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	HG03742	0.753	0.753	0.0	0.0	0.877	0.877	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA12878	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA18525	1.011	1.011	0.0	0.0	0.818	0.852	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA18939	0.82	0.82	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA19017	0.85	0.85	0.0	0.008	0.85	0.889	1	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA19238	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA19239	0.413	0.413	0.0	0.043	0.767	0.767	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA19625	0.393	0.393	0.0	0.045	0.357	0.357	3	1
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.016	0.906	0.852	2	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA20502	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88032749	88032836	DEL	88	NA20845	0.975	0.975	0.0	0.0	0.557	0.557	2	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG00096	0.543	0.527	0.0	0.056	0.891	0.891	2	1
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG00268	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG00419	0.915	0.888	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG00759	1.028	0.998	0.0	0.0	0.704	0.67	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG01051	0.929	0.902	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG01112	1.19	1.155	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG01500	0.817	0.793	0.0	0.0	0.846	0.883	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG01565	0.939	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG01583	0.936	0.908	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG01595	0.832	0.807	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG01879	0.894	0.868	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG02568	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG02922	1.144	1.111	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG03006	1.148	1.115	0.0	0.0	0.742	0.708	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG03052	1.126	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG03642	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	HG03742	0.849	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA12878	0.908	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA18525	1.011	0.982	0.0	0.0	0.719	0.69	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA18939	1.372	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA19017	0.684	0.664	0.0	0.004	0.95	0.993	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA19238	0.611	0.593	0.0	0.034	0.578	0.578	2	1
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA19239	0.866	0.841	0.0	0.0	0.511	0.511	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA19625	0.609	0.591	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA19648	1.173	1.138	0.0	0.0	0.654	0.615	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA20502	1.3	1.262	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr6	88651308	88651380	DEL	73	NA20845	1.04	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG00096	0.543	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG00268	0.638	0.619	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG00419	0.305	0.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG00759	0.601	0.584	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG01051	0.464	0.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG01112	0.838	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG01500	0.639	0.621	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG01565	0.735	0.713	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG01583	0.408	0.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG01595	0.614	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG01879	0.537	0.521	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG02568	0.722	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG02922	0.77	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG03006	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG03052	0.234	0.227	0.0	0.012	0.941	0.941	1	1
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG03642	0.648	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	HG03742	0.753	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA12878	0.702	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA18525	0.75	0.728	0.0	0.0	0.583	0.56	1	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA18939	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA19017	0.684	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA19238	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA19239	0.743	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA19625	0.532	0.517	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA19648	0.499	0.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA20502	0.547	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89436067	89436120	DEL	54	NA20845	0.759	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG00096	0.0	0.0	0.032	0.199	nan	nan	0	0
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG00268	0.673	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG00419	0.468	0.52	0.055	0.041	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG00759	0.0	0.0	0.1	0.259	nan	nan	0	0
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG01051	0.0	0.0	0.043	0.187	nan	nan	0	0
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG01112	0.343	0.381	0.01	0.103	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG01500	0.408	0.454	0.032	0.112	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG01565	0.51	0.567	0.047	0.08	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG01583	0.552	0.613	0.051	0.103	0.6	0.6	2	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG01595	0.634	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG01879	0.367	0.407	0.025	0.078	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG02568	0.0	0.0	0.121	0.145	nan	nan	0	0
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG02922	0.562	0.624	0.042	0.099	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG03006	0.43	0.478	0.046	0.082	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG03052	1.105	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG03642	0.474	0.526	0.05	0.107	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	HG03742	0.0	0.0	0.05	0.247	nan	nan	0	0
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA12878	0.719	0.799	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA18525	0.575	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA18939	0.57	0.634	0.022	0.077	0.5	0.522	1	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA19017	0.998	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA19238	0.403	0.448	0.004	0.086	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA19239	0.465	0.517	0.011	0.061	nan	nan	0	1
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA19625	0.938	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA19648	0.823	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA20502	0.0	0.0	0.121	0.242	nan	nan	0	0
chr6	89921713	89922144	DEL	432	NA20845	0.282	0.313	0.037	0.13	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG00096	0.507	0.534	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG00268	0.724	0.762	0.013	0.199	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG00419	0.163	0.171	0.009	0.106	1.0	1.0	2	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG00759	0.563	0.592	0.0	0.197	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG01051	0.646	0.68	0.0	0.162	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG01112	0.144	0.152	0.0	0.093	0.882	0.882	2	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG01500	0.479	0.505	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG01565	0.245	0.258	0.0	0.111	1.0	1.0	2	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG01583	0.096	0.101	0.0	0.06	0.636	0.636	2	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG01595	0.317	0.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG02568	0.38	0.4	0.0	0.208	nan	nan	0	0
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG02922	0.624	0.657	0.0	0.131	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG03006	0.43	0.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG03052	0.329	0.347	0.0	0.158	nan	nan	0	0
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG03642	0.175	0.184	0.009	0.086	0.8	0.8	2	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	HG03742	0.174	0.183	0.009	0.065	0.526	0.526	2	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA12878	0.188	0.198	0.0	0.079	0.75	0.75	2	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA18525	0.471	0.495	0.0	0.178	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA18939	0.659	0.694	0.0	0.187	nan	nan	0	0
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA19017	0.591	0.623	0.0	0.169	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA19238	0.409	0.431	0.0	0.158	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA19239	0.472	0.496	0.0	0.157	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA19625	0.558	0.587	0.0	0.171	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA19648	0.175	0.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA20502	0.479	0.504	0.0	0.135	nan	nan	0	1
chr6	9014816	9014924	DEL	109	NA20845	0.152	0.16	0.0	0.12	0.882	0.882	2	1
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG00096	0.724	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG00268	1.19	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG00419	0.996	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG00759	1.048	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG01051	0.848	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG01112	1.334	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG01500	1.03	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG01565	1.0	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG01583	0.888	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG01595	1.228	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG01879	1.252	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG02568	0.874	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG02922	0.686	0.63	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG03006	1.058	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG03052	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG03642	1.197	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	HG03742	0.772	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA12878	1.028	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA18525	0.976	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA18939	0.998	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA19017	0.785	0.721	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA19238	0.923	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA19239	0.821	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA19625	0.862	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA19648	0.923	0.847	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA20502	0.753	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91457081	91457188	DEL	108	NA20845	1.149	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG00096	0.579	0.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG00268	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG00419	0.488	0.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG00759	0.64	0.64	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG01051	0.646	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG01112	0.631	0.631	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG01500	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG01565	0.653	0.653	0.004	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG01583	0.504	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG01595	0.634	0.634	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG01879	0.581	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG02568	0.608	0.608	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG02922	0.562	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG03006	0.646	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG03052	0.595	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG03642	0.474	0.474	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	HG03742	0.29	0.29	0.027	0.0	0.75	0.75	6	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA12878	0.685	0.685	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA18525	0.819	0.819	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA18939	0.499	0.499	0.0	0.0	0.595	0.57	2	1
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA19017	0.499	0.499	0.0	0.0	0.8	0.836	1	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA19238	0.65	0.65	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA19239	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA19625	0.482	0.482	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA19648	0.624	0.624	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA20502	0.661	0.661	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chr6	91855566	91856437	DEL	872	NA20845	0.737	0.737	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG00096	0.923	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG00268	0.966	0.938	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG00419	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG00759	0.931	0.904	0.0	0.0	0.808	0.848	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG01051	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG01112	0.992	0.963	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG01500	0.87	0.845	0.0	0.0	0.792	0.826	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG01565	0.837	0.812	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG01583	0.864	0.839	0.0	0.012	0.824	0.824	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG01595	0.693	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG01879	0.841	0.816	0.0	0.0	0.774	0.774	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG02568	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG02922	0.957	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG03006	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG03052	0.914	0.887	0.009	0.0	0.773	0.773	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG03642	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	HG03742	0.83	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA12878	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA18525	0.924	0.897	0.0	0.0	0.688	0.716	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA18939	0.374	0.363	0.038	0.081	nan	nan	0	1
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA19017	1.109	1.077	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA19238	1.156	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA19239	0.905	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA19625	0.761	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA19648	0.798	0.775	0.0	0.0	0.619	0.658	1	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA20502	0.753	0.731	0.0	0.0	0.694	0.694	2	2
chr6	93183732	93184208	DEL	477	NA20845	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG00096	0.815	0.761	0.0	0.0	0.963	0.963	4	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG00268	1.086	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG00419	0.956	0.893	0.0	0.0	0.913	0.913	3	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG00759	1.048	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG01051	1.151	1.076	0.004	0.004	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG01112	0.847	0.792	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG01500	1.03	0.963	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG01565	0.878	0.82	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG01583	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG01595	0.911	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG01879	1.02	0.953	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG02568	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG02922	0.499	0.467	0.08	0.042	nan	nan	0	1
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG03006	1.022	0.956	0.0	0.0	0.459	0.481	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG03052	0.999	0.934	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG03642	1.072	1.002	0.0	0.0	0.227	0.227	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	HG03742	0.917	0.857	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA12878	0.736	0.688	0.0	0.0	0.526	0.526	3	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA18525	1.046	0.977	0.0	0.0	0.548	0.526	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA18939	1.336	1.249	0.0	0.0	0.8	0.767	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA19017	1.238	1.157	0.0	0.0	1.0	0.957	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA19238	1.014	0.947	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA19239	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA19625	1.141	1.066	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA19648	0.848	0.793	0.0	0.0	0.833	0.816	3	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA20502	1.095	1.023	0.0	0.0	0.737	0.737	5	2
chr6	93539762	93540553	DEL	792	NA20845	1.149	1.074	0.0	0.0	0.724	0.724	4	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG00096	0.706	0.686	0.0	0.028	0.975	0.975	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG00268	0.621	0.603	0.0	0.041	0.575	0.575	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG00419	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG01112	0.739	0.718	0.0	0.025	0.75	0.75	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG01500	0.675	0.655	0.0	0.043	0.614	0.64	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG01565	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG01595	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG01879	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG02568	0.722	0.701	0.0	0.019	0.688	0.688	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG02922	1.123	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG03052	1.148	1.114	0.0	0.0	0.484	0.484	1	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG03642	0.574	0.557	0.0	0.052	0.957	0.957	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	HG03742	0.405	0.394	0.0	0.031	0.828	0.828	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA12878	1.233	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA18939	0.321	0.311	0.0	0.043	0.706	0.676	1	1
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA19017	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA19238	1.228	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA19239	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA19625	1.242	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA19648	1.472	1.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA20502	0.753	0.731	0.0	0.019	0.342	0.342	1	2
chr6	94397505	94397566	DEL	62	NA20845	1.214	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG00096	0.724	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG00268	0.914	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG00419	1.118	1.086	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG00759	0.99	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG01051	0.868	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG01112	0.613	0.595	0.0	0.056	0.317	0.317	1	1
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG01500	0.977	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG01565	0.449	0.436	0.0	0.089	0.731	0.731	1	1
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG01583	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG01595	0.871	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG01879	0.805	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG02568	0.722	0.701	0.0	0.073	0.333	0.333	1	1
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG02922	1.186	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG03006	0.43	0.418	0.0	0.082	0.517	0.542	1	1
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG03052	0.808	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG03642	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	HG03742	0.598	0.581	0.0	0.055	0.41	0.41	1	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA18525	0.889	0.863	0.0	0.0	0.714	0.744	1	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA18939	0.82	0.796	0.0	0.0	0.909	0.871	1	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA19017	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA19238	0.65	0.631	0.0	0.073	0.413	0.413	1	1
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA19239	0.646	0.627	0.0	0.083	0.448	0.448	1	1
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA19625	1.318	1.28	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA19648	0.923	0.896	0.0	0.0	0.938	0.996	1	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA20502	1.049	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	96580133	96580235	DEL	103	NA20845	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG00096	0.923	0.847	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG00268	0.931	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG00419	1.2	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG00759	1.3	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG01051	1.03	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG01112	1.208	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG01500	0.852	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG01565	1.224	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG01583	0.888	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG01595	0.97	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG01879	1.091	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG02568	1.406	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG02922	0.957	0.878	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG03006	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG03052	1.19	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG03642	1.072	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	HG03742	1.004	0.921	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA12878	0.908	0.833	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA18525	0.959	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA18939	1.123	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA19017	0.554	0.509	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA19238	1.027	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA19239	0.737	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA19625	0.887	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA19648	1.148	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA20502	1.345	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr6	97639328	97639454	DEL	127	NA20845	1.17	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG00096	0.629	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG00268	0.671	0.746	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG00419	0.745	0.828	0.0	0.0	0.844	0.844	4	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG00759	0.781	0.868	0.0	0.0	0.658	0.658	4	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG01051	0.499	0.555	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG01112	0.335	0.372	0.078	0.065	0.222	0.222	6	1
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG01500	0.653	0.726	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG01565	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG01583	0.76	0.845	0.0	0.0	0.565	0.612	2	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG01595	0.694	0.771	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG01879	0.732	0.814	0.0	0.0	0.778	0.815	3	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG02568	0.888	0.987	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG02922	0.738	0.82	0.007	0.007	0.562	0.562	3	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG03006	0.699	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG03052	0.706	0.784	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG03642	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	HG03742	0.655	0.728	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA12878	0.827	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA18525	0.852	0.946	0.0	0.0	0.905	0.905	5	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA18939	0.785	0.872	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA19017	0.884	0.983	0.0	0.0	0.816	0.816	2	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA19238	0.76	0.845	0.0	0.0	0.804	0.804	2	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA19239	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA19625	0.696	0.773	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA19648	0.737	0.818	0.0	0.0	0.83	0.886	2	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA20502	0.747	0.83	0.0	0.0	0.832	0.808	2	2
chr7	101081265	101082227	DEL	963	NA20845	0.711	0.79	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG00096	0.629	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG00268	0.989	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG00419	0.663	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG00759	0.581	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG01051	0.645	0.716	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG01112	0.708	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG01500	0.708	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG01565	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG01583	0.785	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG01595	0.673	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG01879	0.366	0.407	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG02568	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG02922	0.675	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG03006	0.809	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG03052	1.07	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG03642	0.991	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	HG03742	0.556	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA12878	0.672	0.747	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA18525	0.843	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA18939	0.712	0.791	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA19017	0.706	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA19238	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA19239	0.355	0.395	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA19625	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA19648	0.914	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA20502	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	101418913	101419034	DEL	122	NA20845	0.689	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG00096	0.315	0.379	0.009	0.098	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG00268	0.424	0.511	0.003	0.098	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG00419	0.248	0.299	0.011	0.095	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG00759	0.3	0.362	0.016	0.125	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG01051	0.229	0.276	0.006	0.122	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG01112	0.754	0.909	0.031	0.237	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG01500	0.327	0.394	0.011	0.067	0.25	0.25	1	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG01565	0.804	0.969	0.02	0.251	nan	nan	0	0
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG01583	0.491	0.591	0.0	0.0	1.0	0.923	1	2
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG01595	0.204	0.246	0.007	0.126	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG01879	0.568	0.684	0.017	0.261	nan	nan	0	0
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG02568	0.27	0.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG02922	0.169	0.203	0.015	0.102	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG03006	0.368	0.443	0.009	0.103	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG03052	0.235	0.284	0.007	0.12	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG03642	0.276	0.332	0.013	0.063	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	HG03742	0.774	0.933	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA12878	0.276	0.332	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA18525	0.319	0.385	0.01	0.103	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA18939	0.584	0.704	0.031	0.255	nan	nan	0	0
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA19017	0.358	0.431	0.015	0.12	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA19238	0.498	0.6	0.0	0.255	nan	nan	0	0
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA19239	0.355	0.428	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA19625	0.232	0.279	0.01	0.11	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA19648	0.762	0.918	0.059	0.275	nan	nan	0	1
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA20502	0.443	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	103874937	103875244	DEL	308	NA20845	0.667	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG00268	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG00419	0.994	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG00759	1.001	0.972	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG01051	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG01112	0.875	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG01500	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG01565	1.248	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG01583	1.177	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG01595	1.489	1.446	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG01879	1.08	1.049	0.0	0.003	0.887	0.879	2	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG02568	1.352	1.312	0.0	0.0	0.843	0.843	2	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG02922	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG03006	1.213	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG03052	1.433	1.392	0.0	0.0	0.594	0.594	2	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG03642	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	HG03742	1.171	1.137	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA12878	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA18525	1.313	1.275	0.0	0.0	0.971	0.971	1	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA18939	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA19017	1.524	1.48	0.0	0.0	0.829	0.829	2	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA19238	0.983	0.954	0.0	0.0	0.937	0.937	2	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA19239	0.947	0.92	0.0	0.0	0.957	0.957	2	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA19625	1.056	1.026	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA19648	1.143	1.11	0.007	0.0	0.909	0.905	2	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA20502	1.284	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	104204602	104204768	DUP	167	NA20845	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG00096	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG00268	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG00419	0.538	0.523	0.011	0.105	nan	nan	0	1
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG00759	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG01051	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG01112	1.043	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG01500	1.052	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG01565	1.206	1.171	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG01583	1.104	1.072	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG01595	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG01879	0.971	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG02568	1.429	1.387	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG02922	1.097	1.065	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG03006	1.213	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG03052	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG03642	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	HG03742	0.992	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA12878	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA18525	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA18939	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA19017	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA19238	1.193	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA19239	0.632	0.613	0.004	0.077	nan	nan	0	1
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA19625	1.134	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA19648	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA20502	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	10444480	10444933	DEL	454	NA20845	0.889	0.863	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG00096	0.907	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG00268	0.371	0.36	0.042	0.149	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG00419	0.497	0.483	0.035	0.09	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG00759	0.441	0.428	0.019	0.109	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG01051	0.874	0.848	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG01112	0.764	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG01500	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG01565	0.0	0.0	0.074	0.253	nan	nan	0	0
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG01583	0.368	0.357	0.014	0.105	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG01595	0.0	0.0	0.011	0.165	nan	nan	0	0
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG01879	0.989	0.96	0.0	0.0	1.0	0.955	1	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG02568	0.772	0.75	0.0	0.015	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG02922	0.759	0.737	0.0	0.004	0.933	0.933	1	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG03006	0.533	0.518	0.024	0.071	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG03052	1.177	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG03642	0.527	0.511	0.026	0.052	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	HG03742	0.992	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA12878	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA18525	0.408	0.396	0.008	0.066	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA18939	0.84	0.816	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA19017	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA19238	0.852	0.827	0.0	0.0	0.939	0.939	1	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA19239	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA19625	0.979	0.951	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA19648	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA20502	0.397	0.385	0.031	0.108	nan	nan	0	1
chr7	105733991	105734331	DEL	341	NA20845	0.844	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG00096	0.5	0.526	0.053	0.04	nan	nan	0	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG00268	0.389	0.409	0.064	0.062	nan	nan	0	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG00419	0.476	0.501	0.062	0.052	nan	nan	0	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG00759	0.501	0.527	0.061	0.039	nan	nan	0	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG01051	0.77	0.81	0.0	0.0	0.818	0.77	1	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG01112	0.764	0.804	0.0	0.0	0.853	0.853	4	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG01500	0.798	0.84	0.0	0.0	0.727	0.727	3	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG01565	0.719	0.757	0.0	0.0	0.294	0.294	1	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG01583	0.908	0.955	0.0	0.0	1.0	0.923	2	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG01595	1.061	1.117	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG01879	0.787	0.829	0.0	0.0	0.857	0.818	2	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG02568	0.85	0.894	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG02922	0.822	0.866	0.0	0.0	0.861	0.861	2	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG03006	0.956	1.006	0.0	0.0	0.567	0.567	1	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG03052	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG03642	0.477	0.502	0.067	0.057	0.361	0.361	2	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	HG03742	0.615	0.648	0.047	0.032	0.203	0.203	2	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA12878	0.793	0.835	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA18525	0.479	0.504	0.059	0.036	0.103	0.103	1	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA18939	0.438	0.461	0.083	0.072	nan	nan	0	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA19017	0.433	0.456	0.078	0.046	nan	nan	0	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA19238	0.97	1.021	0.0	0.0	0.528	0.528	3	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA19239	0.895	0.942	0.0	0.0	0.333	0.333	3	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA19625	1.108	1.166	0.0	0.0	0.614	0.614	2	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA19648	1.016	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA20502	0.537	0.565	0.083	0.042	nan	nan	0	1
chr7	107464069	107464744	DEL	676	NA20845	0.333	0.351	0.061	0.043	nan	nan	0	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG00096	0.648	0.745	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG00268	0.424	0.487	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG00419	0.476	0.547	0.009	0.014	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG00759	0.701	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG01051	0.0	0.0	0.008	0.171	nan	nan	0	0
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG01112	0.689	0.792	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG01500	0.617	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG01565	0.783	0.9	0.0	0.02	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG01583	0.221	0.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG01595	0.306	0.352	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG01879	0.659	0.758	0.0	0.196	nan	nan	0	0
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG02568	0.541	0.622	0.0	0.186	nan	nan	0	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.186	nan	nan	0	0
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG03006	0.202	0.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG03052	0.792	0.91	0.0	0.233	nan	nan	0	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG03642	0.125	0.144	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	HG03742	0.318	0.365	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA12878	0.207	0.238	0.0	0.086	0.842	0.842	2	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA18525	0.266	0.306	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA18939	0.055	0.063	0.0	0.126	nan	nan	0	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA19017	0.809	0.93	0.0	0.182	nan	nan	0	0
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA19239	0.566	0.65	0.004	0.184	nan	nan	0	0
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA19625	0.773	0.889	0.0	0.22	nan	nan	0	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA19648	0.051	0.058	0.0	0.12	0.471	0.441	2	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA20502	0.163	0.188	0.0	0.13	0.348	0.338	2	1
chr7	107683983	107684126	DEL	144	NA20845	0.489	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG00268	0.459	0.446	0.0	0.065	0.41	0.41	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG00419	0.0	0.0	0.009	0.11	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG01051	0.707	0.687	0.0	0.083	0.306	0.325	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.172	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG01565	0.0	0.0	0.008	0.117	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG01583	0.0	0.0	0.008	0.194	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.176	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG01879	0.678	0.658	0.0	0.042	0.295	0.31	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.093	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG02922	0.422	0.409	0.0	0.069	0.333	0.333	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG03052	0.706	0.685	0.0	0.084	0.419	0.419	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA18939	0.548	0.532	0.0	0.072	0.45	0.45	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA19017	0.433	0.42	0.0	0.113	0.606	0.606	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA19238	0.511	0.496	0.0	0.06	0.314	0.314	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA19239	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA19625	0.412	0.4	0.0	0.111	0.833	0.833	1	1
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.101	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr7	108501444	108501545	DEL	102	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.128	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG00096	1.277	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG00268	0.601	0.561	0.0	0.092	0.694	0.694	7	1
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.213	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.207	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG01051	1.31	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG01112	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG01500	0.0	0.0	0.005	0.258	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.223	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG01583	0.515	0.481	0.0	0.046	nan	nan	0	1
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.158	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG01879	0.494	0.462	0.0	0.114	0.696	0.729	7	1
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG02568	0.618	0.578	0.0	0.119	0.583	0.583	7	1
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG03006	1.443	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG03052	1.476	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG03642	0.0	0.0	0.007	0.172	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.176	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA12878	0.448	0.419	0.0	0.085	0.318	0.318	7	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.183	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA18939	0.0	0.0	0.007	0.181	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA19238	0.701	0.655	0.0	0.075	0.367	0.367	7	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA19239	1.474	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA19625	0.979	0.915	0.0	0.005	0.545	0.545	1	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA19648	0.94	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA20502	0.677	0.633	0.0	0.075	0.333	0.343	7	1
chr7	108884718	108884847	DEL	130	NA20845	0.444	0.415	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr7	110502	110600	DUP	99	HG00096	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG01051	0.645	0.645	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG01565	0.571	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG01595	0.531	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG02568	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG02922	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG03006	0.827	0.827	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG03052	0.749	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG03642	0.677	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	HG03742	0.516	0.516	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr7	110502	110600	DUP	99	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr7	110502	110600	DUP	99	NA18939	0.639	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	NA19238	0.721	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	NA19239	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	NA19625	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	110502	110600	DUP	99	NA20502	0.513	0.513	0.0	0.0	0.538	0.554	1	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG00096	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG00268	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG00419	1.242	1.206	0.005	0.0	0.676	0.676	1	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG00759	0.0	0.0	0.34	0.217	nan	nan	0	0
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG01051	1.29	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG01112	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG01500	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG01565	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG01583	1.275	1.238	0.0	0.0	0.852	0.847	2	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG01595	1.122	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG01879	1.318	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG02568	1.313	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG02922	1.202	1.167	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG03006	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG03052	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG03642	1.154	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	HG03742	0.516	0.501	0.064	0.058	nan	nan	0	1
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA12878	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA18525	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA18939	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA19017	1.261	1.224	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA19238	1.153	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA19239	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA19625	1.211	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA19648	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA20502	1.26	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111683362	111684011	DEL	650	NA20845	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG00096	0.962	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG00268	0.954	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG00419	1.139	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG00759	0.871	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG01051	0.811	0.744	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG01112	1.071	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG01500	0.944	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG01565	1.037	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG01583	0.76	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG01595	0.684	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG01879	1.044	0.958	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG02568	0.463	0.425	0.0	0.03	0.429	0.429	1	1
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG02922	0.443	0.406	0.0	0.021	0.579	0.579	1	1
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG03006	0.717	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG03052	1.048	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG03642	1.003	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	HG03742	0.854	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA12878	0.741	0.68	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA18525	0.799	0.733	0.01	0.003	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA18939	1.132	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA19017	0.866	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA19238	0.812	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA19239	0.908	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA19625	0.928	0.851	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA19648	0.889	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA20502	1.214	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	111927933	111928012	DEL	80	NA20845	1.066	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG00096	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG00268	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG00419	1.263	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG00759	1.122	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG01051	0.728	0.68	0.0	0.0	0.667	0.708	1	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG01112	0.652	0.609	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG01500	1.125	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG01565	1.523	1.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG01583	1.374	1.284	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG01595	1.204	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG01879	1.117	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG02568	1.043	0.975	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG02922	1.35	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG03006	1.195	1.117	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG03052	0.321	0.3	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG03642	0.376	0.352	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr7	114688005	114688161	DEL	157	HG03742	1.389	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA12878	1.103	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA18525	1.012	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA18939	1.15	1.075	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA19017	1.091	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA19238	0.97	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA19239	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA19625	1.185	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA19648	0.813	0.76	0.0	0.0	0.611	0.573	1	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA20502	1.19	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	114688005	114688161	DEL	157	NA20845	1.066	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG00096	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG00268	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG00419	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG00759	0.601	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG01051	0.666	0.646	0.0	0.0	0.364	0.342	1	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG01112	0.764	0.741	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG01500	0.69	0.669	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG01565	0.783	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG01583	1.153	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG01595	0.755	0.733	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG01879	0.256	0.249	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG02568	0.657	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG02922	0.78	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG03006	0.699	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG03052	0.792	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG03642	0.752	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	HG03742	0.834	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA18525	0.586	0.569	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA18939	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA19017	0.847	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA19238	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA19239	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA19625	0.541	0.525	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA19648	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA20502	0.677	0.657	0.0	0.0	0.8	0.777	1	2
chr7	117822247	117822378	DEL	132	NA20845	0.578	0.561	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG00096	1.018	1.018	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG00268	0.936	0.936	0.0	0.0	0.69	0.69	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG00419	0.725	0.725	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG00759	1.142	1.142	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG01051	1.414	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG01112	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG01500	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG01565	1.164	1.164	0.008	0.0	0.607	0.607	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG01583	1.325	1.325	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG01595	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG01879	0.806	0.806	0.0	0.0	0.765	0.801	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG02922	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG03006	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG03052	0.749	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG03642	0.828	0.828	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	HG03742	1.171	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA12878	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA18525	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA18939	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA19017	1.091	1.091	0.0	0.0	0.606	0.606	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA19238	1.153	1.153	0.0	0.0	0.93	0.93	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA19239	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA19625	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA19648	0.94	0.94	0.0	0.0	0.895	0.954	1	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA20502	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	11825726	11825776	DEL	51	NA20845	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG00268	0.3	0.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG00419	0.248	0.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG00759	0.24	0.24	0.0	0.066	0.852	0.852	1	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG01112	0.298	0.298	0.0	0.042	0.724	0.724	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG01500	0.327	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG01565	0.592	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG01595	0.551	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG02568	0.232	0.232	0.0	0.08	0.778	0.778	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG02922	0.105	0.105	0.0	0.081	0.706	0.706	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG03006	0.313	0.313	0.0	0.063	0.76	0.76	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG03642	0.176	0.176	0.009	0.05	0.643	0.643	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	HG03742	0.159	0.159	0.0	0.083	0.346	0.346	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA12878	0.345	0.345	0.0	0.062	0.741	0.741	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA18525	0.55	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA18939	0.091	0.091	0.0	0.054	0.533	0.533	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA19017	0.207	0.207	0.0	0.048	0.391	0.391	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA19239	0.145	0.145	0.0	0.06	0.311	0.311	1	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	1
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA19648	0.381	0.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.11	nan	nan	0	0
chr7	126775610	126775700	DEL	91	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG00096	0.962	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG00268	0.813	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG00419	0.828	0.952	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG00759	0.841	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG01051	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG01112	0.838	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG01500	0.853	0.98	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG01565	0.91	1.046	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG01583	0.589	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG01595	0.612	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG01879	0.696	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG02568	0.657	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG02922	0.822	0.945	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG03006	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG03052	0.492	0.566	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG03642	0.577	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	HG03742	0.873	1.004	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA12878	0.965	1.109	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA18525	1.083	1.244	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA18939	0.785	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA19017	0.884	1.017	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA19238	0.524	0.603	0.0	0.032	0.773	0.773	2	1
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA19239	0.711	0.817	0.0	0.0	0.607	0.607	1	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA19625	0.953	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA19648	0.635	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA20502	0.77	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	128391207	128391270	DEL	64	NA20845	0.911	1.047	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG00096	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG00268	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG00419	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG00759	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG01051	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG01112	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG01500	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG01565	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG01583	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG01595	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG01879	0.989	0.989	0.0	0.0	0.531	0.557	1	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG02568	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG02922	1.265	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG03006	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG03052	0.706	0.706	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG03642	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	HG03742	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA12878	0.793	0.793	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA18525	0.852	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA18939	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA19017	0.997	0.997	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA19238	0.315	0.315	0.064	0.047	nan	nan	0	1
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA19239	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA19625	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA19648	1.041	1.041	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA20502	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129224008	129224660	DEL	653	NA20845	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG00096	0.666	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG00268	0.724	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG00419	0.601	0.667	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG00759	0.741	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG01051	0.603	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG01112	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG01500	0.708	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG01565	0.613	0.682	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG01583	0.883	0.981	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG01595	0.612	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG01879	0.696	0.773	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG02568	1.043	1.159	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG02922	0.612	0.68	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG03006	0.809	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG03052	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG03642	0.778	0.864	0.0	0.014	0.917	0.917	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	HG03742	0.734	0.816	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA12878	0.81	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA18525	0.87	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA18939	0.621	0.69	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA19017	0.903	1.004	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA19238	0.367	0.408	0.005	0.013	nan	nan	0	1
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA19239	0.711	0.789	0.0	0.006	0.667	0.667	1	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA19625	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA19648	0.965	1.072	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA20502	0.77	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	129786498	129787059	DEL	562	NA20845	0.644	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG00096	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG00268	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG00419	1.305	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG00759	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG01051	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG01112	1.248	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG01500	0.907	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG01565	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG01583	1.03	1.0	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG01595	1.224	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG01879	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG02568	0.966	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG02922	0.801	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG03006	0.956	0.928	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG03052	1.284	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG03642	0.853	0.828	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	HG03742	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA18525	1.065	1.034	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA18939	1.315	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA19017	0.621	0.603	0.006	0.094	nan	nan	0	1
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA19238	0.865	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA19239	1.329	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA19625	1.34	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA19648	0.737	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA20502	0.98	0.952	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	134066831	134067111	DEL	281	NA20845	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG00096	1.259	1.222	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG00268	0.512	0.497	0.02	0.102	nan	nan	0	1
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG00419	0.456	0.442	0.024	0.121	nan	nan	0	1
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG00759	1.082	1.05	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG01051	0.0	0.0	0.024	0.199	nan	nan	0	0
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG01112	0.782	0.759	0.013	0.057	nan	nan	0	1
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG01500	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG01565	1.544	1.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG01583	1.128	1.095	0.0	0.0	0.722	0.667	1	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG01595	0.592	0.574	0.018	0.04	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG01879	1.135	1.102	0.0	0.0	0.97	0.984	1	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG02568	1.004	0.975	0.0	0.0	0.846	0.846	2	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG02922	1.16	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG03006	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG03052	1.433	1.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG03642	0.577	0.56	0.018	0.106	nan	nan	0	1
chr7	135131653	135131963	DEL	311	HG03742	0.496	0.482	0.006	0.133	nan	nan	0	1
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA12878	1.017	0.987	0.005	0.0	0.378	0.378	1	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA18525	1.278	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA18939	1.297	1.259	0.0	0.0	0.935	0.935	3	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA19017	0.884	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA19238	1.206	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA19239	1.342	1.303	0.0	0.0	0.877	0.877	2	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA19625	1.185	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA19648	1.245	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA20502	0.677	0.657	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr7	135131653	135131963	DEL	311	NA20845	1.111	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG00096	0.981	0.952	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG00268	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG00419	1.222	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG00759	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG01051	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG01112	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG01500	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG01565	1.312	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG01583	0.993	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG01595	1.326	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG01879	0.513	0.498	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG02568	0.0	0.0	0.014	0.171	nan	nan	0	1
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG02922	0.569	0.553	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG03006	0.974	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG03052	0.396	0.384	0.018	0.066	nan	nan	0	1
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG03642	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	HG03742	1.112	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA12878	0.853	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA18525	0.763	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA18939	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA19017	0.621	0.603	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA19238	0.577	0.56	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA19239	0.487	0.473	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA19625	0.515	0.5	0.0	0.062	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA19648	0.864	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA20502	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	136996508	136996739	DEL	232	NA20845	0.955	0.928	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG00096	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG00268	1.29	1.29	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG00419	1.18	1.18	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG00759	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG01051	1.29	1.29	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG01112	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG01500	0.98	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG01565	1.142	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG01583	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG01595	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG01879	0.421	0.421	0.0	0.119	nan	nan	0	1
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG02568	1.159	1.159	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG02922	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG03006	0.956	0.956	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG03052	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG03642	1.304	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	HG03742	1.231	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA18525	1.083	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA18939	1.205	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA19017	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA19238	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA19239	0.526	0.526	0.006	0.113	nan	nan	0	1
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA19625	1.237	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA19648	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA20502	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137208561	137208914	DEL	354	NA20845	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG00096	0.907	0.955	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG00268	0.813	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG00419	0.456	0.48	0.11	0.077	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG00759	0.28	0.295	0.09	0.064	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG01051	0.499	0.525	0.054	0.029	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG01112	0.801	0.843	0.0	0.0	0.368	0.368	3	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG01500	0.762	0.802	0.0	0.0	0.396	0.396	2	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG01565	0.635	0.668	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG01583	0.294	0.31	0.062	0.039	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG01595	0.367	0.387	0.108	0.051	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG01879	0.678	0.713	0.0	0.0	1.0	0.955	1	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG02568	0.695	0.732	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG02922	0.759	0.799	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG03006	0.441	0.464	0.082	0.048	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG03052	0.792	0.833	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG03642	0.226	0.238	0.087	0.056	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	HG03742	0.0	0.0	0.287	0.144	nan	nan	0	0
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA12878	0.827	0.871	0.0	0.0	0.842	0.842	3	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA18525	0.479	0.504	0.122	0.061	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA18939	0.292	0.308	0.078	0.051	nan	nan	0	1
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA19017	0.565	0.594	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA19238	0.681	0.717	0.0	0.0	0.646	0.646	4	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA19239	0.789	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA19625	0.541	0.57	0.0	0.0	0.536	0.536	2	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA19648	0.0	0.0	0.24	0.163	nan	nan	0	0
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA20502	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	137995518	137996406	DEL	889	NA20845	0.578	0.608	0.0	0.0	0.6	0.6	4	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG00096	0.74	0.823	0.009	0.0	0.561	0.561	2	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG00268	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG00419	0.725	0.805	0.007	0.0	0.867	0.867	3	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG00759	0.661	0.734	0.0	0.0	0.929	0.929	2	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG01051	0.686	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG01112	0.41	0.455	0.023	0.0	nan	nan	0	1
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG01500	0.78	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG01565	0.571	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG01583	1.03	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG01595	0.816	0.907	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG01879	0.989	1.099	0.008	0.005	0.635	0.606	4	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG02568	0.927	1.03	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG02922	0.907	1.008	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG03006	0.717	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG03052	0.578	0.642	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG03642	1.053	1.17	0.011	0.0	0.75	0.75	3	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	HG03742	0.734	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA12878	0.862	0.958	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA18525	0.941	1.045	0.0	0.0	0.804	0.804	2	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA18939	0.621	0.69	0.0	0.0	0.895	0.895	2	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA19017	0.922	1.025	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA19238	0.655	0.728	0.0	0.003	0.68	0.68	1	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA19239	0.803	0.892	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA19625	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA19648	0.914	1.016	0.0	0.0	0.857	0.812	5	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA20502	0.887	0.985	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	138358764	138359441	DEL	678	NA20845	0.711	0.79	0.0	0.0	0.774	0.774	2	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG00096	0.555	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG00268	0.636	0.707	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG00419	0.58	0.644	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG00759	0.481	0.534	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG01051	0.562	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG01112	0.466	0.517	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG01500	0.78	0.867	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG01565	0.338	0.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG01583	0.294	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG01595	0.612	0.68	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG01879	0.476	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG02568	0.541	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG02922	0.569	0.633	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG03006	0.533	0.592	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG03052	0.278	0.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG03642	0.451	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	HG03742	0.536	0.595	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA12878	0.741	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA18525	0.728	0.808	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA18939	0.584	0.649	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA19017	0.696	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA19238	0.629	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA19239	0.684	0.76	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA19625	0.18	0.2	0.0	0.118	0.722	0.722	1	1
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA19648	0.33	0.367	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA20502	0.7	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	139577515	139577603	DEL	89	NA20845	0.489	0.543	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG00096	0.629	0.699	0.0	0.0	0.35	0.35	1	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG00268	0.583	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG00419	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG00759	0.541	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG01051	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG01112	0.633	0.703	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG01500	0.671	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG01565	0.529	0.588	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG01583	0.662	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG01595	0.428	0.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG01879	0.696	0.773	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG02568	0.734	0.815	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG02922	0.59	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG03006	0.882	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG03052	0.535	0.594	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG03642	0.602	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	HG03742	0.595	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA12878	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA18525	0.728	0.808	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA18939	0.639	0.71	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA19017	0.734	0.815	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA19238	0.367	0.408	0.006	0.004	nan	nan	0	1
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA19239	0.632	0.702	0.004	0.003	0.963	0.963	1	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA19625	0.412	0.458	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA19648	0.864	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA20502	0.933	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	140231367	140231835	DEL	469	NA20845	0.822	0.913	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG00096	0.019	0.019	0.0	0.214	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG00268	0.477	0.477	0.0	0.148	nan	nan	0	1
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG00419	0.0	0.0	0.021	0.181	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG00759	0.28	0.28	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.184	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG01112	0.0	0.0	0.004	0.145	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG01595	0.449	0.449	0.0	0.182	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	1
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG02568	0.811	0.811	0.0	0.301	nan	nan	0	1
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG03006	0.588	0.588	0.0	0.232	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.203	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	HG03742	0.337	0.337	0.0	0.136	nan	nan	0	1
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA12878	0.483	0.483	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.229	nan	nan	0	1
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.16	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA19238	0.695	0.695	0.0	0.216	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA19239	0.566	0.566	0.0	0.183	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA19625	0.567	0.567	0.0	0.169	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA19648	0.533	0.533	0.0	0.187	nan	nan	0	0
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA20502	0.0	0.0	0.02	0.22	nan	nan	0	1
chr7	144382749	144382897	DEL	149	NA20845	0.467	0.467	0.007	0.163	nan	nan	0	1
chr7	14451264	14451430	DUP	167	HG00759	1.402	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14451264	14451430	DUP	167	HG02922	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14451264	14451430	DUP	167	HG03052	1.198	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14451264	14451430	DUP	167	NA19017	1.186	1.108	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG00096	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG00268	1.007	1.007	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG00419	0.435	0.435	0.104	0.069	nan	nan	0	1
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG00759	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG01051	0.811	0.811	0.0	0.0	0.714	0.759	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG01112	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG01500	0.635	0.635	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG01565	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG01583	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG01595	0.694	0.694	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG01879	0.787	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG02568	0.811	0.811	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG02922	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG03006	0.864	0.864	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG03052	0.813	0.813	0.0	0.0	0.565	0.565	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG03642	1.079	1.079	0.017	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	HG03742	0.834	0.834	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA12878	0.965	0.965	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA18525	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA18939	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA19017	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA19238	0.865	0.865	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA19239	0.934	0.934	0.0	0.0	0.578	0.578	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA19625	0.85	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA19648	0.965	0.965	0.0	0.0	0.938	0.879	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA20502	1.004	1.004	0.0	0.0	0.458	0.445	1	2
chr7	144589103	144590001	DEL	899	NA20845	1.0	1.0	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG00096	0.537	0.502	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG00268	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG00419	0.393	0.368	0.0	0.087	0.833	0.833	1	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG00759	0.721	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG01051	0.666	0.622	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG01112	0.466	0.435	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG01500	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG01565	0.635	0.593	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG01583	0.442	0.413	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG01595	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG01879	0.696	0.65	0.0	0.0	0.333	0.318	1	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG02568	0.309	0.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG02922	0.548	0.512	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG03006	1.121	1.048	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG03052	0.471	0.44	0.0	0.0	0.385	0.385	1	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG03642	0.803	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	HG03742	0.595	0.557	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA12878	0.845	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA18525	1.012	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA18939	0.877	0.819	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA19017	0.847	0.791	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA19238	0.485	0.453	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA19239	0.987	0.922	0.0	0.0	0.158	0.158	1	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA19625	0.361	0.337	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA19648	0.381	0.356	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA20502	0.747	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	145063221	145063384	DEL	164	NA20845	0.911	0.851	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG00096	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG00268	1.131	1.098	0.0	0.0	0.839	0.839	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG00419	0.953	0.925	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG00759	1.162	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG01051	0.936	0.909	0.0	0.0	0.842	0.895	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG01112	1.229	1.193	0.0	0.0	0.606	0.606	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG01500	1.052	1.022	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG01565	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG01583	1.202	1.167	0.0	0.0	0.684	0.632	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG01595	1.102	1.07	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG01879	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG02568	0.966	0.937	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG02922	0.443	0.43	0.104	0.074	nan	nan	0	1
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG03006	1.048	1.017	0.0	0.0	0.853	0.853	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG03052	1.07	1.039	0.0	0.0	0.842	0.842	2	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG03642	1.279	1.242	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	HG03742	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA12878	0.827	0.803	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA18525	1.047	1.017	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA18939	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA19017	0.997	0.968	0.004	0.0	0.893	0.893	2	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA19238	1.14	1.107	0.0	0.0	0.886	0.886	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA19239	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA19625	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA19648	1.194	1.159	0.0	0.0	0.913	0.974	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA20502	1.027	0.997	0.0	0.0	0.75	0.772	1	2
chr7	146253839	146254815	DEL	977	NA20845	0.978	0.949	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG00096	0.851	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG00268	0.954	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG00419	1.201	1.123	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG00759	1.322	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG01051	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG01112	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG01500	0.98	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG01565	1.354	1.265	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG01583	1.03	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG01595	1.245	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG01879	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG02568	1.004	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG02922	1.012	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG03006	1.268	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG03052	1.22	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG03642	0.878	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	HG03742	1.25	1.169	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA12878	0.913	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA18525	1.171	1.095	0.0	0.0	0.621	0.621	1	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA18939	1.004	0.939	0.005	0.004	0.808	0.808	1	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA19017	0.433	0.405	0.042	0.039	nan	nan	0	1
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA19238	1.324	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA19239	0.579	0.541	0.007	0.037	nan	nan	0	1
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA19625	1.082	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA19648	1.219	1.139	0.0	0.0	0.882	0.941	1	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA20502	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	14918495	14919029	DEL	535	NA20845	1.133	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG00096	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG00268	0.707	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG00419	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG00759	0.721	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG01051	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG01112	0.577	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG01500	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG01565	0.423	0.445	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG01583	1.079	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG01595	0.571	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG01879	0.623	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG02568	0.811	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG02922	0.865	0.91	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG03006	0.478	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG03052	0.62	0.653	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG03642	0.727	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	HG03742	0.933	0.982	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA12878	1.241	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA18525	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA18939	0.849	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA19017	0.433	0.456	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA19238	0.93	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA19239	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA19625	1.211	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA19648	0.66	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA20502	0.98	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150230449	150230558	DEL	110	NA20845	0.855	0.9	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG00096	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG00268	1.131	1.131	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG00419	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG00759	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG01051	1.019	1.019	0.0	0.0	0.635	0.598	8	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG01112	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG01500	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG01565	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG01583	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG01595	0.898	0.898	0.0	0.0	0.833	0.833	8	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG01879	1.08	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG02568	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG02922	1.118	1.118	0.0	0.0	0.595	0.595	8	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG03006	0.993	0.993	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG03052	1.134	1.134	0.0	0.0	0.866	0.866	2	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG03642	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	HG03742	0.973	0.973	0.0	0.0	0.642	0.642	8	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA12878	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA18525	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA18939	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA19017	0.979	0.979	0.0	0.0	0.856	0.856	8	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA19238	0.511	0.511	0.097	0.01	nan	nan	0	1
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA19239	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA19625	1.237	1.237	0.0	0.0	0.708	0.708	9	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA19648	1.092	1.092	0.004	0.0	0.639	0.666	8	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA20502	1.167	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150295360	150296211	DEL	852	NA20845	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG00096	0.629	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG00268	0.848	0.942	0.004	0.0	0.824	0.824	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG00419	0.828	0.92	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG00759	0.761	0.846	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG01051	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG01112	0.801	0.89	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG01500	0.889	0.988	0.002	0.002	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG01565	0.889	0.987	0.0	0.0	0.167	0.167	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG01583	0.736	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG01595	0.612	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG01879	0.513	0.57	0.0	0.0	0.683	0.716	2	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG02568	0.541	0.601	0.078	0.036	0.55	0.55	2	1
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG02922	1.033	1.148	0.0	0.01	0.795	0.795	2	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG03006	0.68	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG03052	0.727	0.808	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG03642	0.577	0.641	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	HG03742	0.754	0.838	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA12878	0.965	1.072	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA18525	0.852	0.946	0.0	0.002	0.857	0.857	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA18939	0.767	0.852	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA19017	0.546	0.606	0.061	0.044	nan	nan	0	1
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA19238	0.681	0.757	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA19239	0.75	0.833	0.0	0.007	0.952	0.952	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA19625	0.721	0.802	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA19648	0.787	0.875	0.0	0.0	0.643	0.686	1	2
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA20502	0.56	0.622	0.042	0.024	nan	nan	0	1
chr7	150718801	150719495	DEL	695	NA20845	0.6	0.667	0.0	0.007	1.0	1.0	2	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG00096	1.018	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG00268	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG00419	0.663	0.643	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG00759	0.581	0.564	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.203	nan	nan	0	0
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG01112	0.503	0.488	0.0	0.075	0.429	0.429	3	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG01500	0.363	0.352	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG01583	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG01595	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG01879	0.494	0.48	0.006	0.085	0.333	0.349	6	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG02568	0.309	0.3	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.102	nan	nan	0	0
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG03006	0.386	0.375	0.004	0.068	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG03642	1.053	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	HG03742	0.715	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA12878	1.103	1.071	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA18525	0.39	0.379	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA18939	0.53	0.514	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA19017	0.583	0.566	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA19238	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA19239	0.382	0.37	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA19625	0.567	0.55	0.0	0.085	0.444	0.444	3	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA19648	0.66	0.641	0.0	0.13	nan	nan	0	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA20502	0.373	0.363	0.0	0.07	0.875	0.901	3	1
chr7	151671198	151671374	DEL	177	NA20845	0.622	0.604	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG00096	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG00268	0.839	0.839	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG00419	0.601	0.601	0.0	0.026	0.667	0.667	1	1
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG00759	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG01051	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG01112	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG01500	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG01565	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG01583	0.883	0.883	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG01595	0.612	0.612	0.0	0.029	0.414	0.414	1	1
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG01879	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG02568	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG02922	0.759	0.759	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG03006	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG03052	1.22	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG03642	0.477	0.477	0.0	0.044	0.667	0.667	1	1
chr7	15168876	15168937	DEL	62	HG03742	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA12878	0.698	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA18525	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA18939	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA19017	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA19238	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA19239	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA19625	0.438	0.438	0.0	0.024	0.75	0.75	1	1
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA19648	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA20502	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15168876	15168937	DEL	62	NA20845	0.311	0.311	0.0	0.028	0.917	0.917	1	1
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG00096	0.87	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG00268	0.777	0.864	0.0	0.0	0.942	0.942	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG00419	0.808	0.897	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG00759	0.681	0.757	0.0	0.0	0.724	0.724	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG01051	0.707	0.786	0.0	0.0	0.786	0.739	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG01112	0.67	0.745	0.0	0.0	0.529	0.529	2	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG01500	0.762	0.847	0.003	0.0	0.851	0.851	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG01565	0.698	0.776	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG01583	0.858	0.954	0.0	0.0	0.767	0.764	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG01595	0.653	0.725	0.0	0.0	0.508	0.508	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG01879	0.714	0.794	0.0	0.0	0.294	0.281	1	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG02568	0.425	0.472	0.06	0.014	nan	nan	0	1
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG02922	0.633	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG03006	0.772	0.858	0.0	0.0	0.81	0.81	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG03052	0.642	0.713	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG03642	0.853	0.948	0.0	0.0	0.816	0.816	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	HG03742	0.814	0.904	0.0	0.0	0.838	0.838	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA12878	0.965	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA18525	0.905	1.006	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA18939	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA19017	0.677	0.753	0.004	0.0	0.739	0.739	5	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA19238	0.839	0.932	0.0	0.0	0.917	0.917	3	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA19239	0.961	1.067	0.002	0.0	0.846	0.846	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA19625	0.799	0.888	0.0	0.0	0.778	0.778	2	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA19648	0.813	0.903	0.0	0.0	0.925	0.987	4	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA20502	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152229587	152230510	DEL	924	NA20845	0.822	0.913	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG00096	0.389	0.432	0.065	0.033	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG00268	0.336	0.373	0.056	0.019	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG00419	0.0	0.0	0.169	0.09	nan	nan	0	0
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG00759	0.32	0.356	0.05	0.024	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG01051	0.333	0.37	0.062	0.016	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG01112	0.41	0.455	0.016	0.005	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG01500	0.762	0.847	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG01565	0.0	0.0	0.281	0.084	nan	nan	0	0
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG01583	0.417	0.463	0.029	0.013	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG01595	0.204	0.227	0.047	0.025	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG01879	0.714	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG02568	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG02922	0.654	0.726	0.0	0.0	0.859	0.859	2	2
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG03006	0.423	0.47	0.054	0.016	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG03052	0.235	0.261	0.064	0.017	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG03642	0.276	0.307	0.056	0.014	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	HG03742	0.278	0.309	0.03	0.019	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA12878	1.017	1.13	0.004	0.001	0.75	0.75	1	2
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA18525	0.355	0.394	0.085	0.025	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA18939	0.0	0.0	0.173	0.075	nan	nan	0	0
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA19017	0.433	0.481	0.037	0.014	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA19238	0.406	0.451	0.048	0.014	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA19239	0.408	0.453	0.074	0.017	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA19625	0.438	0.487	0.055	0.021	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA19648	0.457	0.508	0.07	0.028	nan	nan	0	1
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA20502	0.607	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152245349	152246306	DEL	958	NA20845	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG00096	0.407	0.452	0.025	0.073	nan	nan	0	1
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG00268	0.247	0.275	0.007	0.099	nan	nan	0	1
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG00419	0.973	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG00759	0.681	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG01051	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG01112	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG01500	0.581	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG01565	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG01583	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG01595	0.653	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG01879	0.714	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG02568	0.85	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG02922	0.654	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG03006	0.864	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG03052	0.727	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG03642	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	HG03742	0.258	0.287	0.008	0.069	nan	nan	0	1
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA12878	0.672	0.747	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA18525	0.994	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA18939	0.913	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA19017	1.016	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA19238	0.734	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA19239	0.895	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA19625	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA19648	1.067	1.185	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA20502	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708457	152708846	DEL	390	NA20845	0.622	0.691	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG00096	0.537	0.596	0.02	0.0	0.609	0.609	3	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG00268	0.512	0.569	0.004	0.0	0.667	0.667	2	1
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG00419	0.911	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG00759	0.701	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG01051	0.79	0.878	0.0	0.0	0.708	0.707	2	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG01112	0.819	0.91	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG01500	0.599	0.665	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG01565	0.698	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG01583	0.932	1.036	0.0	0.0	0.514	0.51	2	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG01595	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG01879	0.861	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG02568	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG02922	0.759	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG03006	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG03052	0.792	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG03642	0.803	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	HG03742	0.516	0.573	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA12878	0.724	0.804	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA18525	0.958	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA18939	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA19017	0.941	1.045	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA19238	0.76	0.845	0.0	0.0	0.768	0.768	2	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA19239	0.882	0.98	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA19625	0.825	0.916	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA19648	1.118	1.242	0.0	0.0	0.835	0.839	2	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA20502	1.004	1.115	0.0	0.0	0.75	0.729	1	2
chr7	152708477	152709366	DEL	890	NA20845	0.644	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG00096	0.537	0.596	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG00268	0.689	0.766	0.004	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG00419	0.538	0.598	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG00759	0.701	0.779	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG01051	0.374	0.416	0.0	0.0	1.0	0.941	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG01112	0.577	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG01500	0.708	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG01565	0.529	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG01583	0.491	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG01595	0.51	0.567	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG01879	0.604	0.671	0.0	0.0	0.625	0.655	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG02568	0.232	0.257	0.012	0.077	nan	nan	0	1
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG02922	0.295	0.328	0.0	0.028	nan	nan	0	1
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG03006	0.551	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG03052	0.599	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG03642	0.803	0.892	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	HG03742	0.615	0.684	0.0	0.0	0.422	0.422	2	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA12878	0.707	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA18525	0.763	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA18939	0.457	0.507	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA19017	0.433	0.481	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA19238	0.904	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA19239	0.434	0.482	0.003	0.068	nan	nan	0	1
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA19625	0.361	0.401	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA19648	0.584	0.649	0.0	0.0	0.647	0.607	1	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA20502	0.467	0.519	0.0	0.0	0.786	0.763	2	2
chr7	153166001	153166252	DEL	252	NA20845	0.555	0.617	0.0	0.007	0.778	0.778	1	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG00096	1.194	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG00268	1.025	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG00419	1.077	0.988	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG00759	1.242	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG01051	0.915	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG01112	1.043	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG01500	0.889	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG01565	1.015	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG01583	1.226	1.125	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG01595	1.02	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG01879	1.209	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG02568	1.236	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG02922	1.118	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG03006	1.434	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG03052	1.326	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG03642	1.329	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	HG03742	1.191	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA12878	0.931	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA18525	1.207	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA18939	1.187	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA19017	0.79	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA19238	0.59	0.541	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA19239	1.224	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA19625	1.211	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA19648	0.838	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA20502	1.167	1.071	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153183774	153183893	DEL	120	NA20845	1.133	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG00096	1.277	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG00268	1.06	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG00419	1.367	1.277	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG00759	1.462	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG01051	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG01112	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG01500	1.052	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG01565	0.952	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG01583	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG01595	1.081	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG01879	1.355	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG02568	0.657	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG02922	1.392	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG03006	1.158	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG03052	1.22	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG03642	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	HG03742	1.29	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA12878	0.793	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA18525	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA18939	1.205	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA19017	0.489	0.457	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA19238	0.996	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA19239	1.211	1.131	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA19625	1.082	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA19648	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA20502	0.887	0.829	0.0	0.0	0.333	0.343	1	2
chr7	153296462	153296619	DEL	158	NA20845	0.622	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	HG00759	0.881	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	HG01500	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	HG01595	1.02	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	HG03052	0.513	0.499	0.0	0.028	0.793	0.793	1	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	HG03642	0.853	0.828	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	HG03742	0.992	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	NA12878	0.982	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	NA19017	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	NA19238	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	NA19239	0.934	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	NA19625	1.108	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	NA19648	1.295	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	153529763	153529833	DUP	71	NA20502	1.027	0.997	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG00096	0.722	0.802	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG00268	0.742	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG00419	0.849	0.943	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG00759	0.601	0.668	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG01051	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG01112	0.559	0.621	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG01500	0.726	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG01565	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG01583	0.76	0.845	0.0	0.01	0.917	0.846	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG01595	0.684	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG01879	0.604	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG02568	1.12	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG02922	0.717	0.797	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG03006	0.625	0.694	0.0	0.0	0.474	0.474	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG03052	0.428	0.475	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG03642	1.053	1.17	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	HG03742	0.675	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA12878	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA18525	0.923	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA18939	0.767	0.852	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA19017	0.828	0.92	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA19238	0.301	0.335	0.0	0.101	0.415	0.415	2	1
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA19239	0.632	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA19625	0.928	1.031	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA19648	1.194	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA20502	0.863	0.959	0.0	0.0	0.611	0.594	1	2
chr7	155179573	155179716	DEL	144	NA20845	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG00096	1.203	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG00268	1.36	1.321	0.0	0.0	0.66	0.66	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG00759	1.262	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG01112	0.466	0.452	0.0	0.089	0.593	0.593	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG01500	1.125	1.092	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG01565	0.571	0.555	0.003	0.047	0.5	0.5	1	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG01583	0.834	0.81	0.0	0.064	0.5	0.542	1	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG01595	0.602	0.584	0.0	0.053	0.419	0.419	1	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG01879	1.245	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG02568	0.657	0.637	0.0	0.115	0.31	0.31	2	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.247	nan	nan	0	0
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG03052	0.513	0.499	0.0	0.101	0.469	0.469	1	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	0
chr7	155926191	155926284	DEL	94	HG03742	0.179	0.173	0.0	0.138	0.64	0.64	1	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA12878	0.586	0.569	0.0	0.086	0.458	0.458	1	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA18525	0.506	0.491	0.0	0.065	0.644	0.644	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA18939	0.603	0.585	0.0	0.068	0.649	0.649	2	1
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.185	nan	nan	0	0
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA19238	0.714	0.693	0.0	0.081	0.514	0.514	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA19239	0.553	0.537	0.0	0.082	0.655	0.655	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA19648	1.346	1.307	0.0	0.0	0.714	0.67	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA20502	1.354	1.314	0.0	0.0	0.88	0.906	1	2
chr7	155926191	155926284	DEL	94	NA20845	1.533	1.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG00096	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG00268	0.989	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG00419	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG00759	0.841	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG01051	0.978	0.949	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG01112	0.819	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG01500	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG01565	0.762	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG01583	0.932	0.905	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG01595	1.112	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG01879	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG02568	0.734	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG02922	1.012	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG03006	0.938	0.91	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG03052	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG03642	1.028	0.998	0.0	0.0	0.688	0.688	3	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	HG03742	0.973	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA12878	1.051	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA18525	1.189	1.154	0.0	0.0	0.912	0.912	3	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA18939	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA19017	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA19238	0.891	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA19239	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA19625	1.185	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA19648	0.584	0.567	0.011	0.043	0.167	0.178	12	1
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA20502	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157596374	157596615	DEL	242	NA20845	0.933	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG00096	0.352	0.424	0.0	0.041	1.0	1.0	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG00268	0.336	0.404	0.0	0.035	0.773	0.773	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG00419	1.305	1.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG00759	0.3	0.362	0.0	0.039	0.929	0.929	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG01051	0.749	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG01112	0.41	0.494	0.0	0.042	0.667	0.667	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG01500	0.762	0.918	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG01565	0.444	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG01583	0.417	0.502	0.0	0.021	0.583	0.632	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG01595	0.428	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG01879	0.0	0.0	0.01	0.064	nan	nan	0	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG02568	0.695	0.838	0.0	0.037	0.308	0.308	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG02922	0.422	0.508	0.0	0.029	0.462	0.462	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG03006	0.919	1.107	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG03052	0.342	0.412	0.0	0.037	0.923	0.923	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG03642	0.401	0.483	0.0	0.032	1.0	1.0	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	HG03742	0.357	0.43	0.0	0.046	0.947	0.947	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA12878	0.931	1.121	0.0	0.0	0.52	0.52	1	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA18525	0.958	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA18939	0.365	0.44	0.0	0.023	0.895	0.895	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA19017	0.546	0.658	0.0	0.028	0.962	0.962	2	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA19238	0.419	0.505	0.0	0.024	0.594	0.594	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA19239	0.447	0.539	0.0	0.029	0.771	0.771	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA19625	0.85	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA19648	0.216	0.26	0.0	0.013	0.889	0.833	1	1
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA20502	1.097	1.322	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	157825833	157825892	DEL	60	NA20845	0.422	0.509	0.0	0.024	0.5	0.5	1	1
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG00096	0.851	0.851	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG00268	0.618	0.618	0.029	0.086	nan	nan	0	1
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG00419	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG00759	1.142	1.142	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG01051	0.874	0.874	0.0	0.0	0.867	0.816	2	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG01112	0.726	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG01500	0.998	0.998	0.0	0.0	0.656	0.656	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG01565	1.015	1.015	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG01583	0.736	0.736	0.008	0.005	0.929	0.994	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG01595	0.775	0.775	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG01879	1.163	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG02568	0.734	0.734	0.037	0.05	0.2	0.2	1	1
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG02922	1.139	1.139	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG03006	1.14	1.14	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG03052	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG03642	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	HG03742	1.33	1.33	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA12878	0.465	0.465	0.007	0.09	nan	nan	0	1
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA18525	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA18939	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA19017	1.016	1.016	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA19238	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA19239	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA19625	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA19648	1.067	1.067	0.0	0.0	0.393	0.368	1	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA20502	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	15885459	15885880	DEL	422	NA20845	1.244	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG00096	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG00268	1.025	1.079	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG00419	0.87	0.916	0.0	0.0	0.789	0.789	2	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG00759	0.721	0.759	0.0	0.0	0.722	0.722	2	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG01051	0.624	0.657	0.008	0.0	0.636	0.676	1	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG01112	0.615	0.647	0.0	0.0	0.722	0.722	2	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG01500	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG01565	1.015	1.069	0.0	0.0	0.768	0.768	2	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG01583	0.662	0.697	0.0	0.0	0.75	0.812	2	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG01595	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG01879	0.769	0.81	0.0	0.0	0.778	0.781	3	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG02568	0.734	0.772	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG02922	0.822	0.866	0.0	0.0	0.696	0.696	3	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG03006	0.699	0.735	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG03052	0.813	0.856	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG03642	0.803	0.845	0.0	0.0	0.758	0.758	2	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	HG03742	0.536	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA12878	0.965	1.016	0.0	0.0	0.74	0.74	4	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA18525	1.136	1.196	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA18939	0.822	0.865	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA19017	0.358	0.376	0.009	0.091	nan	nan	0	1
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA19238	0.95	1.0	0.0	0.0	0.888	0.888	4	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA19239	0.803	0.845	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA19625	0.902	0.949	0.0	0.0	0.921	0.921	2	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA19648	0.787	0.829	0.0	0.0	0.861	0.85	4	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA20502	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	16683127	16683588	DEL	462	NA20845	0.533	0.561	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG00096	0.87	1.0	0.0	0.004	0.76	0.76	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG00268	0.742	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG00419	0.497	0.571	0.037	0.067	nan	nan	0	1
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG00759	0.641	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG01051	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG01112	0.931	1.07	0.0	0.0	0.792	0.792	2	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG01500	0.817	0.939	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG01565	0.719	0.827	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG01583	0.858	0.987	0.0	0.0	0.571	0.619	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG01595	0.877	1.008	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG01879	0.824	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG02568	0.734	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG02922	0.865	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG03006	0.735	0.845	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG03052	0.856	0.984	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG03642	0.652	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	HG03742	0.655	0.753	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA12878	0.827	0.951	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA18525	1.029	1.183	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA18939	0.749	0.861	0.0	0.0	0.711	0.711	2	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA19017	0.602	0.692	0.0	0.0	0.746	0.746	2	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA19238	0.708	0.813	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA19239	0.842	0.968	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA19625	0.953	1.096	0.0	0.0	0.882	0.882	2	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA19648	0.991	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA20502	1.05	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1795371	1795846	DEL	476	NA20845	1.011	1.162	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG00096	0.648	0.72	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG00268	0.689	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG00419	0.704	0.782	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG00759	0.541	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG01051	0.458	0.508	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG01112	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG01500	0.69	0.766	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG01565	0.529	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG01583	0.687	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG01595	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG01879	0.769	0.855	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG02568	0.734	0.815	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG02922	0.696	0.773	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG03006	0.496	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG03052	0.556	0.618	0.0	0.0	0.635	0.635	2	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG03642	0.477	0.529	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	HG03742	0.496	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA12878	0.586	0.651	0.011	0.0	0.714	0.714	1	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA18525	0.728	0.808	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA18939	0.657	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA19017	0.282	0.314	0.09	0.006	nan	nan	0	1
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA19238	0.786	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA19239	0.579	0.643	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA19625	0.644	0.716	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA19648	0.724	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA20502	0.607	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1838355	1839077	DEL	723	NA20845	0.644	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG00096	1.185	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG00268	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG00419	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG00759	1.122	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG01051	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG01112	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG01500	1.161	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG01565	0.867	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG01583	1.177	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG01595	1.265	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG01879	1.355	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG02568	0.966	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG02922	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG03006	1.195	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG03052	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG03642	0.426	0.398	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr7	18954298	18954417	DEL	120	HG03742	1.409	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA12878	1.051	0.983	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA18525	1.171	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA18939	1.351	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA19017	0.489	0.457	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA19238	1.088	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA19239	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA19625	0.515	0.482	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA19648	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA20502	1.167	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	18954298	18954417	DEL	120	NA20845	1.266	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG00096	0.204	0.258	0.0	0.019	0.615	0.615	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG00419	0.549	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG00759	0.641	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG01051	0.166	0.211	0.014	0.007	0.636	0.676	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG01112	0.149	0.189	0.0	0.039	0.75	0.75	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG01500	0.308	0.39	0.0	0.017	0.65	0.65	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG01565	0.275	0.348	0.0	0.046	0.75	0.75	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG01583	0.196	0.248	0.0	0.028	1.0	0.923	1	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG01595	0.184	0.232	0.0	0.028	0.8	0.8	1	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG01879	0.787	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG02568	0.695	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG02922	0.622	0.787	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG03006	0.625	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG03052	0.663	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG03642	0.451	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	HG03742	0.238	0.302	0.0	0.029	0.733	0.733	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA12878	0.793	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA18525	0.506	0.64	0.0	0.004	0.412	0.412	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA18939	0.31	0.393	0.0	0.012	0.778	0.778	1	1
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA19017	0.583	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA19238	0.655	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA19239	0.868	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA19625	0.747	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA19648	0.914	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA20502	0.397	0.502	0.0	0.0	0.4	0.412	1	2
chr7	1898671	1898738	DEL	68	NA20845	0.711	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG00096	0.944	0.944	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG00268	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG00419	0.58	0.58	0.0	0.037	0.304	0.304	1	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG00759	1.001	1.001	0.0	0.0	0.92	0.92	2	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG01051	0.79	0.79	0.0	0.005	0.929	0.987	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG01112	0.596	0.596	0.0	0.079	0.5	0.5	1	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG01500	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG01565	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG01583	0.589	0.589	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG01595	0.898	0.898	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG01879	0.879	0.879	0.0	0.0	0.947	0.904	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG02568	1.313	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG02922	0.358	0.358	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG03006	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG03052	0.278	0.278	0.009	0.089	0.556	0.556	1	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG03642	1.028	1.028	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	HG03742	1.002	1.002	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA12878	0.526	0.526	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA18525	0.515	0.515	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA19017	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA19238	0.446	0.446	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA19239	0.737	0.737	0.0	0.0	0.897	0.897	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA19625	0.361	0.361	0.0	0.072	0.385	0.385	1	1
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA19648	0.991	0.991	0.0	0.0	1.0	0.938	1	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA20502	0.747	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21587706	21587827	DEL	122	NA20845	1.155	1.155	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG00096	1.24	1.305	0.0	0.0	0.55	0.55	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG00268	1.113	1.172	0.0	0.0	0.898	0.898	4	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG00419	0.766	0.807	0.0	0.0	0.941	0.941	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG00759	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG01051	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG01112	0.931	0.98	0.0	0.0	0.44	0.44	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG01500	0.925	0.974	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG01565	0.867	0.913	0.0	0.0	0.929	0.929	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG01583	0.662	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG01595	0.775	0.816	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG01879	0.366	0.386	0.006	0.072	nan	nan	0	1
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG02568	0.618	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG02922	1.265	1.332	0.0	0.002	0.669	0.669	2	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG03006	0.772	0.813	0.007	0.0	0.833	0.833	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG03052	0.578	0.608	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG03642	0.878	0.924	0.0	0.004	0.8	0.8	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	HG03742	0.734	0.773	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA12878	0.896	0.943	0.0	0.0	0.682	0.682	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA18525	1.012	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA18939	0.785	0.827	0.0	0.0	0.947	0.947	2	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA19017	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA19238	1.219	1.283	0.0	0.0	0.777	0.777	2	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA19239	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA19625	0.902	0.949	0.0	0.0	0.562	0.562	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA19648	0.66	0.695	0.0	0.0	0.75	0.703	3	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA20502	0.607	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	21836904	21837195	DEL	292	NA20845	0.755	0.795	0.0	0.0	0.817	0.817	4	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG00096	0.481	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG00268	0.689	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG00419	0.745	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG00759	0.34	0.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG01051	0.416	0.527	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG01112	0.242	0.306	0.0	0.026	1.0	1.0	1	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG01500	0.544	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG01565	0.571	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG01583	0.858	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG01595	0.388	0.491	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG01879	0.439	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG02568	0.966	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG02922	0.443	0.561	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG03006	0.607	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG03052	0.513	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG03642	0.276	0.349	0.0	0.04	0.7	0.7	1	1
chr7	2240827	2240892	DEL	66	HG03742	0.139	0.176	0.0	0.023	0.429	0.429	1	1
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA12878	0.948	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA18525	0.39	0.494	0.0	0.036	0.739	0.739	1	1
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA18939	0.493	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA19017	0.734	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA19238	0.681	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA19239	0.539	0.683	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA19625	0.309	0.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA20502	0.817	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2240827	2240892	DEL	66	NA20845	0.733	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG00096	1.314	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG00759	0.401	0.389	0.0	0.013	0.889	0.889	1	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG01051	0.77	0.747	0.0	0.016	0.553	0.587	1	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG01112	0.819	0.796	0.0	0.009	0.415	0.415	1	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG01879	1.264	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG02922	0.464	0.45	0.0	0.018	0.941	0.941	1	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG03006	0.515	0.5	0.0	0.024	0.706	0.706	1	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG03052	0.856	0.831	0.0	0.048	0.825	0.825	1	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.039	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA19017	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA19238	0.695	0.674	0.0	0.026	0.862	0.862	1	1
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.041	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr7	23095966	23096018	DEL	53	NA20845	0.711	0.69	0.0	0.025	0.92	0.92	1	1
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG00096	1.055	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG00268	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG00419	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG00759	1.202	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG01051	1.144	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG01112	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG01500	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG01565	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG01583	1.055	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG01595	1.347	1.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG01879	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG02568	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG02922	1.139	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG03006	1.158	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG03052	1.091	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG03642	0.677	0.713	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	HG03742	0.992	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA12878	0.913	0.962	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA18939	0.73	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA19017	1.242	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA19238	0.904	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA19239	1.0	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA19625	0.773	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA19648	1.295	1.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA20502	0.98	1.032	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	24248533	24248604	DUP	72	NA20845	1.0	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG00096	0.74	0.937	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG00268	0.618	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG00419	0.745	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG00759	0.381	0.482	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG01051	0.333	0.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG01112	0.652	0.825	0.0	0.0	0.615	0.615	5	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG01500	0.599	0.758	0.0	0.0	0.909	0.909	3	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG01565	0.635	0.803	0.0	0.0	0.829	0.829	6	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG01583	0.589	0.745	0.0	0.0	0.75	0.812	5	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG01595	0.408	0.517	0.0	0.0	0.929	0.929	2	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG01879	0.366	0.464	0.0	0.0	1.0	0.955	5	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG02568	0.927	1.173	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG02922	0.422	0.534	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG03006	0.625	0.791	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG03052	0.513	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG03642	0.577	0.73	0.0	0.007	0.857	0.857	2	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	HG03742	0.536	0.678	0.0	0.0	0.8	0.8	5	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA12878	0.552	0.698	0.0	0.0	0.846	0.846	3	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA18525	0.816	1.033	0.0	0.0	0.72	0.72	5	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA18939	0.584	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA19017	0.583	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA19238	0.563	0.713	0.0	0.0	0.675	0.675	2	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA19239	0.763	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA19625	0.335	0.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA19648	0.686	0.868	0.0	0.0	1.0	0.938	1	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA20502	0.723	0.916	0.0	0.0	0.909	0.936	3	2
chr7	2514141	2514292	DEL	152	NA20845	0.378	0.478	0.0	0.024	nan	nan	0	1
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG00096	0.851	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG00268	0.777	0.777	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG00419	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG00759	0.501	0.501	0.0	0.033	0.72	0.72	1	1
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG01051	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG01112	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG01500	1.27	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG01565	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG01583	0.687	0.687	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.03	nan	nan	0	1
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG01879	1.19	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG02568	1.313	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG02922	1.118	1.118	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG03006	0.643	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG03052	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG03642	0.451	0.451	0.0	0.039	0.938	0.937	1	1
chr7	26877406	26877456	DEL	51	HG03742	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA12878	0.965	0.965	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA18525	0.799	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA18939	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA19017	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA19238	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA19239	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA19625	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA19648	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA20502	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26877406	26877456	DEL	51	NA20845	1.089	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG00096	1.148	1.072	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG00268	0.989	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG00419	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG00759	1.142	1.067	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG01051	1.227	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG01112	1.08	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG01500	1.089	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG01565	1.079	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG01583	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG01595	1.306	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG01879	1.154	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG02568	0.85	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG02922	0.443	0.414	0.082	0.015	0.409	0.409	1	1
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG03006	1.158	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG03052	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG03642	1.053	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	HG03742	1.27	1.187	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA12878	0.982	0.918	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA18525	1.1	1.028	0.0	0.0	0.697	0.697	1	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA18939	0.986	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA19017	0.659	0.616	0.04	0.037	nan	nan	0	1
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA19238	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA19239	1.184	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA19625	1.056	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA19648	0.914	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA20502	1.004	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	26939056	26939732	DEL	677	NA20845	0.933	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG00096	0.592	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG00268	0.583	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG00419	0.559	0.643	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG00759	0.421	0.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG01051	0.333	0.383	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG01112	0.503	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG01500	0.49	0.563	0.0	0.015	0.667	0.667	1	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG01565	0.592	0.681	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG01583	0.466	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG01595	0.428	0.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG01879	0.476	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG02568	0.27	0.311	0.028	0.0	nan	nan	0	1
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG02922	0.148	0.17	0.006	0.006	nan	nan	0	1
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG03006	0.423	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG03052	0.449	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG03642	0.426	0.49	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	HG03742	0.377	0.433	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA12878	0.586	0.674	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA18525	0.603	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA18939	0.511	0.588	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA19017	0.414	0.476	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA19238	0.341	0.392	0.026	0.003	0.708	0.708	4	1
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA19239	0.461	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA19625	0.515	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA19648	0.61	0.701	0.0	0.0	0.333	0.356	1	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA20502	0.653	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	2730709	2731292	DEL	584	NA20845	0.422	0.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG00096	0.0	0.0	0.007	0.281	nan	nan	0	0
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG00268	0.0	0.0	0.019	0.216	nan	nan	0	0
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG00419	0.538	0.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG00759	0.501	0.527	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG01051	0.77	0.81	0.0	0.005	0.571	0.538	1	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG01112	0.335	0.353	0.011	0.061	nan	nan	0	1
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG01500	0.0	0.0	0.051	0.257	nan	nan	0	0
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG01565	0.55	0.579	0.0	0.005	0.167	0.167	1	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG01583	0.343	0.361	0.061	0.128	nan	nan	0	1
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG01595	0.51	0.537	0.0	0.0	0.595	0.595	2	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG01879	0.769	0.81	0.0	0.0	0.444	0.44	2	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG02568	0.85	0.894	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG02922	0.717	0.755	0.0	0.005	0.231	0.231	1	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG03006	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG03052	0.77	0.811	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG03642	0.552	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	HG03742	0.655	0.689	0.0	0.0	0.714	0.714	2	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA12878	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA18525	0.603	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA18939	0.749	0.788	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA19017	0.583	0.614	0.0	0.0	0.944	0.944	3	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA19238	0.55	0.579	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA19239	0.737	0.776	0.0	0.0	0.786	0.786	3	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA19625	0.386	0.407	0.039	0.109	nan	nan	0	1
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA19648	0.0	0.0	0.07	0.273	nan	nan	0	0
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA20502	0.933	0.983	0.0	0.0	0.111	0.108	1	2
chr7	28214282	28214660	DEL	379	NA20845	0.422	0.444	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG00096	0.426	0.448	0.094	0.0	0.408	0.408	8	1
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG00268	0.424	0.446	0.075	0.0	0.33	0.33	8	1
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG00419	0.745	0.785	0.0	0.0	0.716	0.716	2	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG00759	0.941	0.991	0.0	0.0	0.814	0.814	2	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG01051	0.374	0.394	0.072	0.0	0.5	0.531	8	1
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG01112	0.466	0.49	0.039	0.0	0.24	0.24	6	1
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG01500	0.381	0.401	0.054	0.0	0.417	0.417	6	1
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG01565	0.635	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG01583	0.932	0.981	0.0	0.0	0.881	0.813	2	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG01595	0.735	0.773	0.0	0.0	0.926	0.926	2	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG01879	0.458	0.482	0.05	0.0	0.438	0.458	3	1
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG02568	1.004	1.057	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG02922	0.295	0.311	0.047	0.003	0.247	0.247	4	1
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG03006	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG03052	0.92	0.968	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG03642	1.053	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	HG03742	0.814	0.857	0.0	0.0	0.758	0.758	2	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA12878	0.0	0.0	0.127	0.0	nan	nan	0	0
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA18525	0.781	0.822	0.0	0.0	0.79	0.79	2	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA18939	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA19017	0.847	0.891	0.0	0.0	0.679	0.679	3	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA19238	0.708	0.745	0.0	0.0	0.641	0.641	3	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA19239	0.947	0.997	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA19625	0.953	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA19648	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA20502	0.0	0.0	0.224	0.0	nan	nan	0	0
chr7	28574294	28575147	DEL	854	NA20845	0.422	0.444	0.09	0.0	0.844	0.844	6	1
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG00096	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG00268	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG00419	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG00759	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG01051	0.645	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG01112	0.298	0.298	0.0	0.088	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG01500	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG01565	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG01583	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG01595	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG01879	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG02568	1.159	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG02922	1.075	1.075	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG03006	0.717	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG03052	1.006	1.006	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG03642	1.129	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	HG03742	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA12878	0.448	0.448	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA18525	0.852	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA18939	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA19017	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA19238	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA19239	1.046	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA19625	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA19648	1.397	1.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA20502	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	28596642	28596859	DEL	218	NA20845	0.289	0.289	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG00096	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG00268	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG00419	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG00759	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	0
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG01112	0.726	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG01500	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG01565	0.296	0.312	0.0	0.023	0.529	0.529	1	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG01583	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG01595	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG01879	0.714	0.752	0.0	0.0	0.522	0.498	1	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG02568	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG02922	0.844	0.888	0.0	0.005	0.667	0.667	1	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG03006	0.846	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG03052	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG03642	1.179	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	HG03742	0.794	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA12878	0.913	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA18525	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA18939	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA19017	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA19238	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA19239	0.711	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA19625	0.902	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA19648	1.143	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA20502	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	29565365	29565419	DEL	55	NA20845	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG00096	1.129	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG00268	1.095	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG00419	0.663	0.602	0.008	0.081	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG00759	1.442	1.311	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG01051	1.414	1.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG01112	1.238	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.191	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG01565	1.439	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG01583	1.423	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG01595	0.0	0.0	0.022	0.241	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG01879	1.154	1.049	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG02568	0.927	0.843	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG02922	0.569	0.518	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG03006	1.121	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG03052	0.642	0.583	0.006	0.107	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG03642	1.179	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	HG03742	1.489	1.353	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA12878	0.862	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA18525	1.056	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA18939	1.315	1.195	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA19017	0.621	0.565	0.012	0.087	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA19238	0.511	0.465	0.0	0.086	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA19239	0.539	0.49	0.0	0.071	0.457	0.457	1	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA19625	0.412	0.375	0.01	0.127	nan	nan	0	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA19648	1.245	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA20502	0.583	0.53	0.007	0.133	0.37	0.381	1	1
chr7	32168927	32169172	DEL	246	NA20845	1.289	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG00096	0.722	0.76	0.008	0.068	nan	nan	0	1
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG00268	0.813	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG00419	0.0	0.0	0.011	0.235	nan	nan	0	0
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG00759	0.941	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG01051	1.31	1.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG01112	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG01500	1.089	1.146	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG01565	1.037	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG01583	0.858	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG01595	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG01879	0.357	0.376	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG02568	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG02922	1.307	1.376	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG03006	0.938	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG03052	1.006	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG03642	1.229	1.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	HG03742	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA12878	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA18525	0.994	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA18939	1.169	1.23	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA19017	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA19238	1.114	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA19239	1.0	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA19625	1.108	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA19648	1.168	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA20502	1.26	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	32286850	32287119	DEL	270	NA20845	1.066	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG00096	0.759	0.843	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG00268	0.848	0.942	0.0	0.0	0.797	0.797	2	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG00419	0.89	0.989	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG00759	0.861	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG01051	0.707	0.786	0.0	0.0	0.75	0.797	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG01112	0.689	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG01500	0.726	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG01565	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG01583	0.858	0.954	0.0	0.0	0.857	0.791	2	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG01595	0.673	0.748	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG01879	0.787	0.875	0.0	0.0	0.875	0.917	1	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG02568	1.043	1.159	0.0	0.0	0.762	0.762	2	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG02922	0.865	0.961	0.0	0.005	0.786	0.786	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG03006	0.864	0.96	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG03052	0.941	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG03642	0.778	0.864	0.0	0.014	0.833	0.833	1	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	HG03742	0.794	0.882	0.0	0.0	0.688	0.688	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA12878	0.913	1.015	0.0	0.0	0.65	0.65	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA18525	0.887	0.986	0.0	0.003	0.917	0.917	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA18939	0.402	0.446	0.022	0.066	0.25	0.25	18	1
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA19017	0.772	0.857	0.0	0.0	0.763	0.763	2	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA19238	0.865	0.961	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA19239	0.75	0.833	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA19625	1.185	1.317	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA19648	0.686	0.762	0.0	0.0	0.95	0.949	2	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA20502	0.957	1.063	0.0	0.0	0.588	0.606	3	2
chr7	3253792	3254200	DEL	409	NA20845	0.844	0.938	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG00096	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG00419	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG00759	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG01051	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG01112	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG01500	1.052	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG01565	1.142	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG01583	1.374	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG01595	1.061	1.061	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG01879	0.952	0.952	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG02568	0.695	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG02922	0.991	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG03006	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG03052	1.027	1.027	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	HG03742	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA12878	0.724	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA18525	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA18939	0.767	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA19017	0.988	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA19238	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA19239	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA19625	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA19648	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA20502	1.237	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	3303993	3304234	DUP	242	NA20845	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG00096	1.036	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG00268	0.336	0.353	0.03	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG00419	0.0	0.0	0.253	0.004	nan	nan	0	0
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG00759	0.441	0.464	0.043	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG01051	0.374	0.394	0.044	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG01112	0.354	0.372	0.06	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG01500	0.435	0.458	0.053	0.002	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG01565	0.719	0.757	0.004	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG01583	0.368	0.387	0.038	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG01595	0.531	0.558	0.035	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG01879	0.385	0.405	0.055	0.0	0.162	0.17	6	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG02568	0.0	0.0	0.144	0.0	nan	nan	0	0
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG02922	0.0	0.0	0.4	0.0	nan	nan	0	0
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG03006	0.478	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG03052	0.0	0.0	0.085	0.0	nan	nan	0	0
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG03642	0.627	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36441167	36441941	DEL	775	HG03742	0.715	0.752	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA12878	0.465	0.49	0.058	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA18525	0.0	0.0	0.16	0.004	nan	nan	0	0
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA18939	0.347	0.365	0.053	0.002	0.131	0.131	8	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA19017	0.753	0.792	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA19238	0.0	0.0	0.316	0.003	nan	nan	0	0
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA19239	0.474	0.499	0.067	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA19625	0.386	0.407	0.056	0.0	0.25	0.25	5	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA19648	0.381	0.401	0.062	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA20502	0.42	0.442	0.054	0.0	nan	nan	0	1
chr7	36441167	36441941	DEL	775	NA20845	0.889	0.935	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	0
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG00419	0.704	0.741	0.0	0.037	0.381	0.381	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG00759	0.761	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG01112	0.54	0.568	0.0	0.058	0.517	0.517	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.102	nan	nan	0	0
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG01565	0.635	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG01583	0.687	0.723	0.0	0.068	0.464	0.503	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG01879	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG02568	0.27	0.285	0.0	0.04	0.9	0.9	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG02922	1.054	1.11	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG03006	0.294	0.31	0.006	0.073	0.913	0.913	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG03052	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG03642	0.727	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	HG03742	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA12878	0.62	0.653	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA18525	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA18939	0.347	0.365	0.0	0.078	0.929	0.929	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA19017	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA19238	0.406	0.428	0.0	0.059	0.646	0.646	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA19239	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA19625	0.593	0.624	0.0	0.068	0.63	0.63	1	1
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.131	nan	nan	0	0
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr7	36878879	36878968	DEL	90	NA20845	0.289	0.304	0.0	0.087	0.611	0.611	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG00096	0.463	0.421	0.0	0.029	0.741	0.741	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG00268	1.095	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG00759	0.531	0.482	0.0	0.024	0.567	0.567	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG01051	0.499	0.454	0.0	0.033	0.613	0.651	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG01112	0.633	0.576	0.0	0.019	0.514	0.514	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG01500	0.635	0.577	0.0	0.008	0.578	0.578	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG01583	0.515	0.468	0.0	0.047	0.381	0.413	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	0
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG02568	0.521	0.474	0.0	0.059	0.615	0.615	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG02922	1.054	0.959	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG03006	0.441	0.401	0.0	0.029	0.793	0.793	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG03052	0.492	0.447	0.0	0.021	0.5	0.5	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG03642	0.577	0.524	0.0	0.05	0.545	0.545	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	HG03742	0.476	0.433	0.0	0.052	0.839	0.839	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA12878	0.56	0.509	0.0	0.049	0.947	0.947	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA18939	0.52	0.473	0.0	0.052	0.9	0.9	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA19017	0.659	0.599	0.0	0.04	0.692	0.692	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA19238	0.55	0.5	0.0	0.032	0.922	0.922	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA19239	0.513	0.467	0.0	0.026	0.913	0.913	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA19625	0.747	0.679	0.0	0.019	0.613	0.613	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA19648	0.61	0.554	0.0	0.048	0.833	0.781	1	1
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr7	39380342	39380407	DEL	66	NA20845	0.622	0.566	0.0	0.035	0.636	0.636	1	1
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG00096	0.5	0.5	0.065	0.043	nan	nan	0	1
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG00268	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG00419	1.18	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG00759	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG01051	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG01112	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG01500	0.599	0.599	0.049	0.04	nan	nan	0	1
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG01565	0.0	0.0	0.278	0.205	nan	nan	0	0
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG01583	0.785	0.785	0.0	0.0	0.778	0.718	1	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG01595	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG01879	0.439	0.439	0.059	0.046	0.487	0.51	2	1
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG02568	1.197	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG02922	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG03006	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG03052	0.727	0.727	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG03642	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	HG03742	1.131	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA18525	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA18939	1.041	1.041	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA19017	0.395	0.395	0.067	0.056	0.643	0.643	2	1
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA19238	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA19239	1.066	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA19625	0.696	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA19648	0.457	0.457	0.093	0.06	nan	nan	0	1
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA20502	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39387270	39387889	DEL	620	NA20845	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG00096	1.203	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG00268	1.131	1.098	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG00419	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG00759	1.082	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG01051	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG01112	0.801	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG01500	1.152	1.119	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG01565	1.417	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG01583	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG01595	1.143	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG01879	1.044	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.235	nan	nan	0	0
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG02922	1.371	1.331	0.0	0.003	0.538	0.538	1	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG03006	1.232	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG03052	1.326	1.288	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG03642	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	HG03742	1.171	1.137	0.0	0.0	0.844	0.844	1	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA12878	0.81	0.786	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA18525	1.18	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA18939	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA19017	0.508	0.493	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA19238	0.55	0.534	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA19239	1.184	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA19625	0.49	0.475	0.0	0.062	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA19648	1.549	1.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA20502	1.587	1.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	39597373	39597638	DEL	266	NA20845	1.089	1.057	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG00096	0.629	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG00268	0.671	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG00419	0.787	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG00759	0.401	0.507	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG01051	0.374	0.474	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG01112	0.484	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG01500	0.581	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG01565	0.444	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG01583	0.711	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG01595	0.571	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG01879	0.623	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG02568	0.502	0.636	0.0	0.04	0.667	0.667	1	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG02922	0.316	0.4	0.0	0.031	0.846	0.846	1	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG03006	0.588	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG03052	0.492	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	HG03642	0.677	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA12878	0.758	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA18525	0.923	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA18939	0.657	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA19238	0.59	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA19239	0.803	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA19625	0.773	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA19648	0.635	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA20502	0.77	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	421688	421746	DUP	59	NA20845	0.622	0.787	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG00096	0.851	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG00268	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG00419	0.745	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG00759	0.901	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG01051	0.811	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG01112	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG01500	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG01565	0.444	0.468	0.0	0.062	1.0	1.0	1	1
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG01583	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG01595	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG01879	0.494	0.52	0.0	0.034	0.593	0.621	1	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG02568	0.888	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG02922	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG03006	0.882	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG03052	0.513	0.541	0.0	0.043	0.731	0.731	1	1
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG03642	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	HG03742	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA12878	0.965	1.016	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA18525	0.905	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA18939	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA19017	0.339	0.357	0.0	0.057	0.792	0.792	1	1
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA19238	0.38	0.4	0.0	0.04	0.861	0.861	1	1
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA19239	0.474	0.499	0.0	0.048	0.585	0.585	1	1
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA19625	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA19648	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA20502	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	42449326	42449403	DEL	78	NA20845	1.022	1.076	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG00096	0.981	0.952	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG00268	1.201	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG00419	1.056	1.025	0.005	0.0	0.64	0.64	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG00759	1.362	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG01051	1.248	1.212	0.0	0.0	0.519	0.551	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG01112	1.08	1.049	0.0	0.0	0.893	0.893	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG01500	1.116	1.083	0.0	0.0	0.88	0.88	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG01565	1.439	1.397	0.0	0.0	0.719	0.719	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG01583	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG01595	1.041	1.01	0.0	0.0	0.727	0.727	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG01879	1.19	1.156	0.0	0.0	0.885	0.844	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG02568	0.502	0.487	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG02922	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG03006	1.066	1.035	0.0	0.0	0.708	0.708	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG03052	0.984	0.956	0.0	0.0	0.8	0.8	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG03642	1.129	1.096	0.0	0.0	0.667	0.667	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	HG03742	1.171	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA12878	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA18525	1.012	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA18939	1.351	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA19017	1.073	1.041	0.0	0.0	0.63	0.63	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA19238	1.114	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA19239	0.592	0.575	0.027	0.0	0.2	0.2	5	1
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA19625	0.825	0.801	0.0	0.0	0.75	0.75	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA19648	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA20502	1.284	1.246	0.0	0.0	0.857	0.882	7	2
chr7	43220627	43221588	DEL	962	NA20845	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG00096	1.11	1.11	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG00268	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG00419	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG00759	0.901	0.901	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG01051	0.915	0.915	0.0	0.0	0.714	0.759	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG01112	1.155	1.155	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG01500	0.726	0.726	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG01565	0.571	0.571	0.05	0.045	nan	nan	0	1
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG01583	1.104	1.104	0.0	0.0	0.857	0.929	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG01595	0.979	0.979	0.0	0.0	0.577	0.577	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG01879	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG02568	0.888	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG02922	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG03006	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG03052	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG03642	0.903	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	HG03742	1.131	1.131	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	0.737	0.737	2	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA18525	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA18939	1.187	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA19017	1.016	1.016	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA19238	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA19239	0.842	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA19625	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA19648	0.889	0.889	0.0	0.0	1.0	0.938	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA20502	1.004	1.004	0.0	0.0	0.667	0.648	1	2
chr7	43734735	43735393	DEL	659	NA20845	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG00096	0.851	1.026	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG00268	0.689	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG00419	0.87	1.048	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG00759	0.561	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG01112	0.428	0.516	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG01583	0.638	0.768	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG01595	0.816	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG03642	0.627	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	HG03742	0.734	0.885	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	NA12878	0.845	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	NA18525	0.87	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	NA18939	0.877	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	44600172	44600320	DUP	149	NA19017	0.715	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG00096	0.148	0.17	0.0	0.063	0.917	0.917	1	1
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG00268	0.601	0.69	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG00419	0.518	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG00759	0.24	0.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG01051	0.333	0.383	0.0	0.0	0.857	0.807	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG01112	0.484	0.557	0.0	0.006	0.571	0.571	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG01500	0.435	0.501	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG01565	0.127	0.146	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG01583	0.54	0.62	0.0	0.0	0.5	0.542	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG01595	0.204	0.235	0.0	0.037	0.8	0.8	1	1
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG01879	0.275	0.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG02568	0.541	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG02922	0.527	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG03006	0.276	0.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG03052	0.342	0.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG03642	0.1	0.115	0.0	0.031	nan	nan	0	1
chr7	47219078	47219174	DEL	97	HG03742	0.635	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA12878	0.259	0.297	0.0	0.05	0.678	0.678	2	1
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA18525	0.479	0.551	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA18939	0.128	0.147	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA19017	0.508	0.584	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA19238	0.616	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA19239	0.645	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA19625	0.721	0.829	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA19648	0.762	0.876	0.0	0.0	0.75	0.703	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA20502	0.63	0.724	0.0	0.006	0.643	0.624	1	2
chr7	47219078	47219174	DEL	97	NA20845	0.222	0.255	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG00096	0.777	0.777	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG00268	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG00419	0.994	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG00759	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG01051	0.894	0.894	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG01112	0.726	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG01500	0.853	0.853	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG01565	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG01583	0.785	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG01595	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG02922	0.759	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG03006	0.781	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG03642	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	HG03742	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA12878	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA18525	0.532	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA18939	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA19017	0.433	0.433	0.0	0.019	0.414	0.414	1	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA19238	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA19239	0.487	0.487	0.0	0.038	0.571	0.571	1	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA19625	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA19648	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA20502	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	47986440	47986507	DUP	68	NA20845	1.066	1.066	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG00096	0.315	0.362	0.0	0.028	0.8	0.8	3	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG00268	0.459	0.528	0.0	0.027	0.534	0.534	2	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG00419	0.745	0.857	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG00759	0.3	0.345	0.0	0.032	0.5	0.5	4	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG01051	0.458	0.526	0.0	0.064	0.824	0.875	1	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG01112	0.391	0.449	0.0	0.028	0.537	0.537	2	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG01500	0.29	0.334	0.0	0.021	1.0	1.0	3	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG01565	0.635	0.729	0.0	0.0	0.517	0.517	2	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG01583	0.76	0.874	0.0	0.0	0.429	0.396	1	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG01595	0.265	0.305	0.0	0.014	0.429	0.429	3	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG01879	0.549	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG02568	0.657	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG02922	0.717	0.824	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG03052	0.685	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG03642	0.978	1.124	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	HG03742	0.298	0.342	0.0	0.013	0.658	0.658	2	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA18525	0.923	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA18939	0.767	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA19017	1.016	1.168	0.0	0.004	0.92	0.92	1	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA19238	0.917	1.054	0.0	0.0	0.711	0.711	1	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA19239	0.737	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA19625	0.928	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA19648	0.635	0.73	0.0	0.029	0.87	0.917	2	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA20502	0.63	0.724	0.0	0.031	0.447	0.446	2	1
chr7	51081675	51081733	DEL	59	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG00096	0.555	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG00268	0.389	0.468	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG00419	0.518	0.624	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG00759	0.381	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG01051	0.291	0.351	0.0	0.0	0.833	0.885	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG01112	0.354	0.426	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG01500	0.563	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG01565	0.423	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG01583	0.589	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG01595	0.51	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG01879	0.238	0.287	0.042	0.061	nan	nan	0	1
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG02568	0.502	0.605	0.0	0.026	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG02922	0.527	0.635	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG03006	0.478	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG03052	0.449	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG03642	0.502	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	HG03742	0.457	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA12878	0.638	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA18525	0.586	0.706	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA18939	0.475	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA19017	0.339	0.408	0.063	0.139	nan	nan	0	1
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA19238	0.275	0.332	0.014	0.12	0.703	0.703	2	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA19239	0.566	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA19625	0.644	0.776	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA19648	0.483	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA20502	0.723	0.872	0.0	0.0	0.706	0.727	1	2
chr7	5111315	5111781	DEL	467	NA20845	0.311	0.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG00096	0.87	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG00268	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG00419	1.035	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG00759	0.821	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG01051	1.019	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG01112	0.931	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG01500	1.089	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG01565	0.762	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG01583	0.809	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG01595	0.898	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG01879	0.568	0.631	0.0	0.065	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG02568	0.734	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG03006	1.195	1.328	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	HG03742	0.854	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA12878	0.655	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA18525	0.941	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA18939	0.95	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA19238	0.904	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA19239	0.842	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA19625	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA19648	0.94	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA20502	1.004	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51408351	51408515	DUP	165	NA20845	0.955	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG00096	0.87	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG00268	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG00419	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG00759	1.061	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG01051	1.082	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG01112	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG01500	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG01565	0.613	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG01583	0.785	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG01595	0.816	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG01879	1.062	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG02568	1.159	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG02922	0.844	0.819	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG03006	0.551	0.535	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG03052	0.877	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG03642	0.803	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	HG03742	0.397	0.385	0.0	0.049	0.792	0.792	1	1
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA12878	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA18525	0.87	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA18939	0.749	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA19017	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA19238	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA19239	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA19625	1.031	1.001	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA19648	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA20502	0.747	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	51638208	51638274	DEL	67	NA20845	0.755	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG00096	1.129	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG00268	0.777	0.755	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG00419	0.518	0.503	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG00759	0.701	0.681	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG01051	0.354	0.343	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG01112	0.559	0.542	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG01500	0.508	0.493	0.0	0.054	0.577	0.577	1	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG01565	0.465	0.452	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG01583	0.0	0.0	0.009	0.116	nan	nan	0	0
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG01595	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG01879	0.549	0.533	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG02568	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG02922	0.38	0.369	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG03006	0.404	0.393	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG03052	0.492	0.478	0.0	0.083	0.391	0.391	1	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr7	52192847	52192979	DEL	133	HG03742	0.695	0.674	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA12878	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA18525	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA18939	1.004	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA19017	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA19238	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA19239	1.105	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.209	nan	nan	0	0
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA19648	0.737	0.715	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA20502	0.537	0.521	0.009	0.065	nan	nan	0	1
chr7	52192847	52192979	DEL	133	NA20845	0.355	0.345	0.0	0.089	1.0	1.0	1	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG00096	0.574	0.574	0.008	0.044	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG00268	0.424	0.424	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG00419	0.0	0.0	0.005	0.181	nan	nan	0	0
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG00759	0.621	0.621	0.0	0.104	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG01051	1.019	1.019	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG01112	0.41	0.41	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG01500	0.0	0.0	0.016	0.199	nan	nan	0	0
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG01565	0.719	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG01583	1.006	1.006	0.0	0.0	0.667	0.723	2	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.206	nan	nan	0	0
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG01879	0.714	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG02568	1.468	1.468	0.0	0.0	0.923	0.923	2	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG02922	0.822	0.822	0.0	0.0	0.625	0.625	2	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.224	nan	nan	0	0
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG03052	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG03642	0.451	0.451	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	HG03742	0.337	0.337	0.0	0.112	0.455	0.455	3	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA12878	0.414	0.414	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA18525	0.55	0.55	0.0	0.061	0.2	0.2	3	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA18939	0.566	0.566	0.008	0.089	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA19017	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA19238	1.048	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA19239	0.553	0.553	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA19625	0.412	0.412	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA19648	0.356	0.356	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA20502	0.467	0.467	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr7	52520168	52520372	DEL	205	NA20845	0.0	0.0	0.012	0.18	nan	nan	0	0
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG00096	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG00268	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG00419	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG00759	0.881	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG01051	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG01112	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG01500	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG01565	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG01583	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG01595	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG01879	0.916	0.916	0.0	0.0	0.696	0.729	1	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG02568	1.004	1.004	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG02922	1.139	1.139	0.0	0.0	0.947	0.947	3	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG03006	0.956	0.956	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG03052	0.556	0.556	0.11	0.058	nan	nan	0	1
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG03642	1.179	1.179	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	HG03742	0.873	0.873	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA12878	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA18525	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA18939	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA19017	1.016	1.016	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA19238	1.232	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA19239	1.0	1.0	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA19625	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA19648	0.991	0.991	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA20502	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53495721	53496488	DEL	768	NA20845	1.0	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG00096	1.444	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG00268	0.989	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG00419	0.849	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG00759	1.282	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG01051	1.082	0.983	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG01112	0.391	0.356	0.0	0.035	0.955	0.955	1	1
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG01500	1.071	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG01565	1.037	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG01583	0.417	0.379	0.0	0.01	0.588	0.637	1	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG01595	1.143	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG01879	0.861	0.782	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG02568	0.657	0.597	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG02922	1.191	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG03006	0.404	0.368	0.0	0.02	0.708	0.708	1	1
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG03052	0.941	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG03642	1.179	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	HG03742	1.231	1.119	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA12878	0.913	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA18525	0.781	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA18939	0.95	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA19017	1.242	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA19238	1.081	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA19239	0.987	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA19625	0.812	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA19648	0.762	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA20502	1.167	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	53986197	53986252	DEL	56	NA20845	0.533	0.485	0.0	0.022	0.579	0.579	1	1
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG00096	0.574	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG00268	0.795	0.743	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG00419	0.787	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG00759	0.681	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG01051	0.645	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG01112	0.484	0.452	0.0	0.019	0.609	0.609	1	1
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG01500	0.907	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG01565	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG01583	0.871	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG01595	0.612	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG01879	0.769	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG02568	0.695	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG02922	0.612	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG03006	0.827	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG03052	0.749	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG03642	0.778	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	HG03742	0.595	0.557	0.0	0.018	0.607	0.607	1	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA12878	0.215	0.201	0.0	0.024	0.7	0.7	1	1
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA18525	0.923	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA18939	0.52	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA19017	0.696	0.651	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA19238	0.799	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA19239	0.776	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA19625	0.567	0.53	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA19648	0.483	0.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA20502	0.583	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54370331	54370392	DEL	62	NA20845	0.755	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG00096	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG00268	0.866	0.866	0.006	0.0	0.793	0.793	6	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG00419	0.87	0.87	0.0	0.0	0.892	0.892	6	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG00759	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG01051	0.582	0.582	0.0	0.0	0.885	0.833	2	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG01112	0.354	0.354	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG01500	0.925	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG01565	0.825	0.825	0.0	0.0	0.608	0.608	6	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG01583	0.368	0.368	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG01595	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG01879	1.044	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG02568	1.004	1.004	0.0	0.0	0.764	0.764	6	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG02922	0.97	0.97	0.0	0.001	0.626	0.626	6	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG03006	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG03052	0.663	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG03642	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	HG03742	1.112	1.112	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA12878	0.896	0.896	0.0	0.0	0.862	0.862	2	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA18525	1.029	1.029	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA18939	0.694	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA19017	0.847	0.847	0.0	0.0	0.741	0.741	5	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA19238	0.76	0.76	0.002	0.0	0.911	0.911	2	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA19239	0.842	0.842	0.0	0.0	0.923	0.923	5	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA19625	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA19648	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA20502	0.84	0.84	0.0	0.0	0.74	0.742	2	2
chr7	54522151	54522816	DEL	666	NA20845	0.755	0.755	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG00096	1.425	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG00268	0.459	0.429	0.061	0.04	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG00419	0.497	0.464	0.07	0.049	0.118	0.118	1	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG00759	1.382	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG01051	1.29	1.205	0.0	0.0	0.968	0.973	1	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG01112	0.559	0.522	0.097	0.065	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG01500	1.306	1.221	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG01565	0.635	0.593	0.064	0.031	0.19	0.19	1	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG01583	1.398	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG01595	1.306	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG01879	1.172	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG02568	0.618	0.578	0.09	0.052	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG02922	0.759	0.71	0.084	0.049	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG03006	1.305	1.22	0.003	0.0	0.756	0.756	1	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG03052	0.599	0.56	0.064	0.035	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG03642	1.079	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	HG03742	0.635	0.594	0.075	0.051	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA12878	0.982	0.918	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA18525	0.657	0.614	0.076	0.04	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA18939	0.0	0.0	0.202	0.148	nan	nan	0	0
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA19017	1.091	1.02	0.0	0.0	0.704	0.704	2	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA19238	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA19239	0.697	0.652	0.121	0.049	nan	nan	0	1
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA19625	1.159	1.084	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA19648	1.397	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA20502	1.05	0.981	0.006	0.0	0.702	0.701	2	2
chr7	54596490	54597436	DEL	947	NA20845	0.689	0.644	0.097	0.053	nan	nan	0	1
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG00096	0.851	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG00268	1.113	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG00419	0.787	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG00759	0.881	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG01051	0.874	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG01112	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG01500	0.744	0.827	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG01565	0.762	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG01583	1.03	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG01595	0.877	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG01879	0.696	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG02568	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG02922	0.907	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG03006	0.919	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG03052	0.834	0.927	0.0	0.0	0.554	0.554	2	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG03642	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	HG03742	0.814	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA12878	0.483	0.536	0.045	0.04	nan	nan	0	1
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA18525	1.065	1.183	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA18939	0.968	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA19017	0.96	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA19238	0.76	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA19239	0.842	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA19625	1.082	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA19648	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA20502	0.723	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	54668977	54669543	DEL	567	NA20845	0.689	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG00096	0.981	0.981	0.0	0.0	0.65	0.65	2	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG00268	0.919	0.919	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG00419	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG00759	1.001	1.001	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG01051	1.04	1.04	0.0	0.0	0.823	0.823	4	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG01112	0.95	0.95	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG01500	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG01565	0.931	0.931	0.0	0.0	0.85	0.85	3	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG01583	1.104	1.104	0.0	0.0	0.701	0.696	2	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG01595	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG01879	0.861	0.861	0.0	0.0	0.75	0.716	1	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG02568	1.197	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG02922	0.485	0.485	0.108	0.071	nan	nan	0	1
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG03006	1.176	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG03052	0.92	0.92	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG03642	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	HG03742	0.893	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA12878	1.017	1.017	0.0	0.0	0.876	0.876	2	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA18525	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA18939	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA19017	1.035	1.035	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA19238	0.485	0.485	0.11	0.052	0.171	0.171	1	1
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA19239	0.934	0.934	0.0	0.0	0.795	0.795	1	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA19625	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA19648	1.181	1.181	0.0	0.0	0.901	0.891	2	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA20502	1.167	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55134878	55135809	DEL	932	NA20845	0.755	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG00096	0.555	0.617	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG00268	0.795	0.883	0.006	0.0	0.722	0.722	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG00419	0.497	0.552	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG00759	0.481	0.534	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG01051	0.499	0.555	0.0	0.0	0.95	0.949	2	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG01112	0.54	0.6	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG01500	0.563	0.625	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG01565	0.508	0.564	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG01583	0.515	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG01595	0.531	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG01879	0.256	0.285	0.045	0.009	nan	nan	0	1
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG02568	0.618	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG02922	0.506	0.562	0.0	0.0	0.492	0.492	2	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG03006	0.551	0.613	0.0	0.0	0.933	0.933	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG03052	0.492	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG03642	0.577	0.641	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	HG03742	0.595	0.662	0.0	0.0	0.684	0.684	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA12878	0.569	0.632	0.009	0.0	0.812	0.812	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA18525	0.603	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA18939	0.548	0.609	0.0	0.0	0.846	0.846	4	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA19017	0.583	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA19238	0.524	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA19239	0.355	0.395	0.0	0.0	0.858	0.858	2	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA19625	0.567	0.63	0.0	0.0	0.857	0.857	3	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA19648	0.635	0.706	0.0	0.0	1.0	0.938	1	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA20502	0.49	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55363304	55364248	DEL	945	NA20845	0.444	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG00096	0.592	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG00268	0.0	0.0	0.014	0.068	nan	nan	0	0
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG00419	0.0	0.0	0.045	0.05	nan	nan	0	0
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG00759	0.26	0.299	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.088	nan	nan	0	0
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG01112	0.391	0.449	0.032	0.019	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG01500	0.653	0.751	0.0	0.005	0.368	0.368	1	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG01565	0.275	0.316	0.037	0.033	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG01583	0.392	0.451	0.0	0.009	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG01595	0.265	0.305	0.0	0.027	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG01879	0.439	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG02568	0.579	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG02922	0.253	0.291	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG03006	0.239	0.275	0.028	0.044	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG03052	0.171	0.197	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG03642	0.477	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	HG03742	0.218	0.251	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA12878	0.362	0.416	0.0	0.043	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	0
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA18939	0.31	0.357	0.011	0.03	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA19017	0.659	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA19238	0.275	0.316	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA19239	0.579	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA19625	0.593	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA19648	0.254	0.292	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA20502	0.35	0.402	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr7	55971784	55972148	DEL	365	NA20845	0.311	0.358	0.016	0.04	nan	nan	0	1
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG00096	0.703	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG00268	0.83	0.776	0.0	0.0	0.724	0.724	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG00419	0.725	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG00759	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG01051	0.936	0.875	0.0	0.0	0.739	0.696	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG01112	0.894	0.835	0.006	0.0	0.682	0.682	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG01500	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG01565	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG01583	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG01595	1.428	1.335	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG01879	1.071	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG02568	1.275	1.191	0.0	0.0	0.438	0.438	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG02922	1.107	1.035	0.0	0.0	0.792	0.792	2	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG03006	0.882	0.825	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG03052	1.027	0.96	0.0	0.0	0.719	0.719	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG03642	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	HG03742	1.231	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA12878	0.862	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA18525	1.118	1.045	0.0	0.0	0.784	0.784	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA18939	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA19017	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA19238	1.088	1.017	0.0	0.0	0.633	0.633	1	1
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA19239	1.066	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA19625	0.979	0.915	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA19648	0.94	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA20502	0.887	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	56005971	56006374	DEL	404	NA20845	1.066	0.997	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG00096	0.944	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG00268	0.954	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG00419	0.435	0.5	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr7	60155	60345	DEL	191	HG00759	0.441	0.506	0.0	0.05	0.244	0.244	4	1
chr7	60155	60345	DEL	191	HG01051	0.624	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG01112	0.223	0.257	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr7	60155	60345	DEL	191	HG01500	0.671	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG01565	0.698	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG01583	0.736	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG01595	0.775	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG01879	0.897	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG02568	0.811	0.932	0.0	0.0	0.273	0.273	1	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG02922	0.358	0.412	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr7	60155	60345	DEL	191	HG03006	1.085	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG03052	0.984	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG03642	1.43	1.643	0.0	0.0	0.48	0.48	1	2
chr7	60155	60345	DEL	191	HG03742	0.854	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	NA12878	0.948	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	NA18525	0.373	0.428	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr7	60155	60345	DEL	191	NA18939	0.84	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	NA19017	0.414	0.476	0.0	0.056	0.159	0.159	2	1
chr7	60155	60345	DEL	191	NA19238	0.76	0.874	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	60155	60345	DEL	191	NA19239	0.711	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	NA19625	1.082	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	NA19648	0.711	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	60155	60345	DEL	191	NA20502	0.583	0.671	0.009	0.055	nan	nan	0	1
chr7	60155	60345	DEL	191	NA20845	0.355	0.409	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG00096	0.833	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG00268	0.954	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG00419	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG00759	0.841	0.935	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG01051	0.374	0.416	0.044	0.022	0.235	0.25	9	1
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG01112	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG01500	1.052	1.169	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG01565	0.973	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG01583	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG01595	0.755	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG01879	0.806	0.895	0.0	0.0	0.53	0.506	2	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG02568	1.081	1.202	0.0	0.0	0.729	0.729	4	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG02922	0.759	0.844	0.0	0.0	0.66	0.66	2	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG03006	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG03052	0.834	0.927	0.0	0.0	0.691	0.691	2	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG03642	0.702	0.78	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	HG03742	0.794	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA12878	0.896	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA18525	0.923	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA18939	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA19017	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA19238	0.721	0.801	0.0	0.0	0.787	0.787	2	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA19239	0.842	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA19625	1.031	1.145	0.0	0.0	0.735	0.735	2	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA19648	1.219	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA20502	0.957	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6196158	6197117	DEL	960	NA20845	0.8	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG00096	0.361	0.337	0.142	0.077	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG00268	1.06	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG00419	0.621	0.581	0.07	0.05	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG00759	1.122	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG01051	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG01112	1.266	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG01500	0.653	0.611	0.05	0.032	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG01565	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG01583	0.932	0.871	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG01595	1.183	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG01879	0.604	0.565	0.042	0.047	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG02568	1.081	1.011	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG02922	1.307	1.222	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG03006	1.158	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG03052	0.685	0.64	0.05	0.028	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG03642	1.028	0.961	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	HG03742	0.695	0.649	0.066	0.054	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA12878	0.879	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA18525	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA18939	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA19017	0.489	0.457	0.084	0.035	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA19238	1.14	1.066	0.0	0.0	0.788	0.788	2	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA19239	0.539	0.504	0.043	0.039	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA19625	0.464	0.433	0.089	0.056	nan	nan	0	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA19648	0.61	0.57	0.053	0.031	0.105	0.112	1	1
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA20502	0.91	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64413378	64414031	DEL	654	NA20845	0.6	0.561	0.086	0.06	nan	nan	0	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG00096	0.962	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG00268	0.989	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG00419	0.393	0.361	0.0	0.003	0.667	0.667	1	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG00759	0.961	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG01051	1.186	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG01112	0.559	0.513	0.0	0.007	0.7	0.7	1	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG01500	1.179	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG01565	0.889	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG01583	0.809	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG01595	1.0	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG01879	0.934	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG02568	1.043	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG02922	0.358	0.329	0.0	0.009	0.818	0.818	1	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG03006	0.717	0.658	0.0	0.0	0.425	0.425	1	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG03052	0.77	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG03642	0.552	0.506	0.0	0.0	0.368	0.368	1	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	HG03742	0.615	0.565	0.0	0.003	0.417	0.417	1	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.009	nan	nan	0	0
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.01	nan	nan	0	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA18939	0.603	0.553	0.0	0.002	0.395	0.395	1	1
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA19017	1.195	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA19238	0.944	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA19239	1.079	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA19625	0.979	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA19648	0.737	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA20502	0.537	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	64853214	64853265	DEL	52	NA20845	0.978	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG00096	0.759	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG00268	0.742	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG00419	0.911	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG00759	0.601	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG01051	0.707	0.786	0.017	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG01112	0.764	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG01500	0.78	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG01565	0.91	1.011	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG01583	1.079	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG01595	0.775	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG01879	0.842	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG02568	1.004	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG02922	0.844	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG03006	0.809	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG03052	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG03642	0.878	0.975	0.002	0.0	0.7	0.7	1	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	HG03742	0.973	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA12878	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA18525	1.029	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA18939	0.639	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA19017	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA19238	0.695	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA19239	0.382	0.424	0.069	0.0	0.245	0.245	14	1
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA19625	0.902	1.002	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA19648	0.762	0.847	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA20502	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	6605181	6605826	DEL	646	NA20845	1.022	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG00096	0.787	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG00268	0.636	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG00419	0.559	0.621	0.024	0.053	nan	nan	0	1
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG00759	0.0	0.0	0.092	0.092	nan	nan	0	1
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG01051	0.811	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG01112	0.745	0.828	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG01500	0.907	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG01565	0.635	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG01583	0.883	0.981	0.0	0.0	0.222	0.205	1	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG01595	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG01879	0.806	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG02568	0.927	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG02922	0.464	0.515	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG03006	0.809	0.899	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG03052	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG03642	0.627	0.697	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	HG03742	0.576	0.64	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA12878	0.879	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA18525	0.887	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA18939	0.457	0.507	0.016	0.031	nan	nan	0	1
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA19017	0.696	0.774	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA19238	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA19239	0.842	0.936	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA19625	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA19648	0.559	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA20502	0.817	0.908	0.0	0.0	0.778	0.756	1	2
chr7	66397589	66397934	DEL	346	NA20845	0.6	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG00096	0.592	0.658	0.0	0.004	0.79	0.79	2	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG00268	0.795	0.883	0.0	0.0	0.435	0.435	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG00419	1.015	1.127	0.007	0.0	0.812	0.813	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG00759	0.941	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG01051	0.603	0.67	0.0	0.0	0.692	0.736	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG01112	0.652	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG01500	0.744	0.827	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG01565	0.55	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG01583	0.858	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG01595	0.592	0.657	0.008	0.004	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG01879	0.87	0.966	0.0	0.0	0.786	0.823	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG02568	0.386	0.429	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG02922	0.738	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG03006	0.754	0.837	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG03052	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG03642	0.803	0.892	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	HG03742	0.854	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA12878	0.776	0.862	0.0	0.0	0.789	0.789	2	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA18525	0.834	0.927	0.0	0.01	0.773	0.773	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA18939	0.712	0.791	0.0	0.004	0.947	0.947	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA19017	0.621	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA19238	0.714	0.794	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA19239	0.816	0.906	0.0	0.009	0.889	0.889	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA19625	0.85	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA19648	0.787	0.875	0.0	0.0	0.923	0.865	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA20502	0.957	1.063	0.0	0.0	0.737	0.716	1	2
chr7	66902564	66902767	DEL	204	NA20845	0.822	0.913	0.0	0.002	0.333	0.333	2	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG00096	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG00268	0.848	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG00419	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG00759	0.401	0.422	0.0	0.066	0.78	0.78	2	1
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG01051	1.04	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG01112	0.279	0.294	0.0	0.057	0.81	0.81	2	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG01500	0.381	0.401	0.0	0.07	0.759	0.759	2	1
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG01565	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG01583	1.079	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG01595	0.673	0.709	0.0	0.055	0.479	0.479	2	1
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG01879	0.714	0.752	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG02568	0.695	0.732	0.0	0.04	0.268	0.268	2	1
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG02922	1.012	1.066	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG03006	0.0	0.0	0.008	0.124	nan	nan	0	1
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG03052	0.984	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG03642	0.978	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	HG03742	0.278	0.293	0.0	0.115	0.775	0.775	2	1
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA12878	0.62	0.653	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA18525	1.065	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA18939	0.858	0.903	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA19017	1.242	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA19238	0.917	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA19239	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA19625	0.567	0.597	0.0	0.056	0.378	0.378	2	1
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA19648	0.864	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA20502	0.957	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	66991953	66992051	DEL	99	NA20845	0.733	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG00268	0.618	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG00419	0.331	0.31	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG00759	0.441	0.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG01051	0.187	0.175	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG01112	0.475	0.444	0.0	0.007	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG01500	0.163	0.153	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG01565	0.698	0.652	0.0	0.01	0.688	0.688	1	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG01583	0.27	0.252	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG01595	0.367	0.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG01879	0.366	0.342	0.0	0.032	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG02568	0.193	0.18	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG02922	0.38	0.355	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG03006	0.46	0.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG03052	0.449	0.42	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG03642	0.251	0.234	0.0	0.028	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	HG03742	0.357	0.334	0.0	0.025	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA12878	0.569	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	0
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA18939	0.475	0.444	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA19017	0.263	0.246	0.0	0.023	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA19239	0.329	0.307	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA19625	0.283	0.265	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA19648	0.61	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA20502	0.163	0.153	0.0	0.017	nan	nan	0	1
chr7	67113327	67113452	DEL	126	NA20845	0.444	0.415	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG00096	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG00268	0.813	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG00419	0.269	0.299	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG00759	0.591	0.656	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG01051	0.998	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG01112	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG01500	0.345	0.383	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG01565	0.508	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG01583	0.638	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG01595	0.286	0.317	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG01879	0.824	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG02568	0.695	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG02922	0.506	0.562	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG03006	0.331	0.368	0.0	0.093	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG03052	0.674	0.749	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG03642	0.978	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	HG03742	0.397	0.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA12878	0.0	0.0	0.006	0.121	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA18525	0.532	0.592	0.0	0.086	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA18939	0.42	0.467	0.009	0.03	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA19017	0.922	1.025	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA19238	0.786	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA19239	0.461	0.512	0.0	0.07	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA19625	0.464	0.515	0.0	0.023	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA19648	0.762	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA20502	0.303	0.337	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr7	68129065	68129198	DEL	134	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr7	682355	683311	DEL	957	HG00096	0.629	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG00268	0.742	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG00419	0.766	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG00759	0.681	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG01051	0.499	0.555	0.0	0.0	0.5	0.471	1	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG01112	0.67	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG01500	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG01565	0.698	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG01583	0.662	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG01595	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG01879	0.824	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG02568	0.811	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG02922	0.696	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG03006	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG03052	0.77	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG03642	0.502	0.557	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	HG03742	0.794	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA12878	0.81	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA18525	0.905	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA18939	0.676	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA19017	0.32	0.355	0.061	0.0	nan	nan	0	1
chr7	682355	683311	DEL	957	NA19238	0.773	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA19239	0.0	0.0	0.252	0.005	nan	nan	0	0
chr7	682355	683311	DEL	957	NA19625	0.593	0.658	0.0	0.0	0.75	0.75	4	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA19648	0.737	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA20502	0.84	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	682355	683311	DEL	957	NA20845	0.6	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG00096	0.796	0.838	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG00268	0.813	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG00419	0.849	0.894	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG00759	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG01051	0.936	0.985	0.0	0.0	0.462	0.49	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG01112	0.801	0.843	0.004	0.0	0.55	0.55	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG01500	0.998	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG01565	0.825	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG01583	0.957	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG01595	0.724	0.762	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG01879	0.971	1.022	0.0	0.0	0.833	0.838	3	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG02568	0.927	0.976	0.0	0.0	0.492	0.492	2	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG02922	0.675	0.71	0.0	0.0	0.671	0.671	2	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG03006	0.754	0.793	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG03052	0.877	0.923	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG03642	0.878	0.924	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	HG03742	0.834	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA12878	0.965	1.016	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA18525	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA18939	0.676	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA19017	0.301	0.317	0.085	0.0	0.474	0.474	1	1
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA19238	0.865	0.91	0.0	0.0	0.931	0.931	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA19239	0.579	0.609	0.023	0.002	nan	nan	0	1
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA19625	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA19648	0.864	0.909	0.0	0.0	0.467	0.438	2	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA20502	0.77	0.811	0.0	0.0	0.765	0.743	1	2
chr7	71756989	71757811	DEL	823	NA20845	0.778	0.819	0.0	0.0	0.369	0.369	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG00096	0.592	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG00268	0.698	0.775	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG00419	0.87	0.966	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG00759	0.481	0.534	0.0	0.0	0.65	0.65	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG01051	0.541	0.601	0.0	0.0	0.469	0.498	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG01112	0.54	0.6	0.0	0.0	0.843	0.843	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG01500	0.653	0.726	0.0	0.0	0.843	0.843	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG01565	0.613	0.682	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG01583	0.662	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG01595	0.551	0.612	0.008	0.0	0.944	0.944	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG01879	0.458	0.509	0.053	0.015	0.333	0.349	1	1
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG02568	0.772	0.858	0.0	0.0	0.598	0.598	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG02922	0.801	0.89	0.007	0.0	0.5	0.5	1	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG03006	0.68	0.756	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG03052	0.321	0.357	0.08	0.014	0.332	0.332	2	1
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG03642	0.702	0.78	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	HG03742	0.556	0.618	0.0	0.0	0.556	0.556	3	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA12878	0.75	0.833	0.0	0.0	0.653	0.653	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA18525	0.745	0.828	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA18939	0.639	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA19017	0.866	0.962	0.0	0.004	0.463	0.463	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA19238	0.367	0.408	0.015	0.012	nan	nan	0	1
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA19239	0.816	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA19625	0.747	0.83	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA19648	0.737	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA20502	0.723	0.804	0.0	0.0	0.778	0.781	2	2
chr7	75668003	75668708	DEL	706	NA20845	0.6	0.667	0.0	0.0	0.458	0.458	2	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG00096	0.592	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG00268	0.742	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG00419	0.601	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG00759	0.561	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG01051	0.562	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG01112	0.503	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG01500	0.581	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG01565	0.656	0.83	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG01583	0.589	0.745	0.0	0.006	1.0	0.923	1	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG01595	0.571	0.723	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG01879	0.293	0.371	0.0	0.022	0.643	0.673	1	1
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG02922	0.401	0.507	0.0	0.026	0.909	0.909	1	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG03006	0.717	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG03052	0.706	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG03642	0.552	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	HG03742	0.476	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA12878	0.931	1.178	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA18525	0.87	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA18939	0.493	0.624	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA19017	0.32	0.405	0.0	0.027	0.537	0.537	2	1
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA19238	0.695	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA19239	0.776	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA19625	0.412	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA19648	0.914	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA20502	0.677	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	75939594	75939675	DEL	82	NA20845	0.711	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG00096	0.0	0.0	0.016	0.051	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG00268	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG00419	1.035	1.09	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG00759	0.541	0.569	0.0	0.014	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG01051	0.0	0.0	0.013	0.045	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG01112	0.317	0.333	0.0	0.017	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG01500	0.0	0.0	0.011	0.146	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG01565	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG01583	0.515	0.542	0.0	0.036	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG01595	0.347	0.365	0.009	0.029	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG01879	0.33	0.347	0.011	0.031	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG02568	0.927	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG02922	0.358	0.377	0.0	0.018	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG03006	0.0	0.0	0.028	0.045	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG03052	0.663	0.698	0.0	0.0	0.211	0.211	1	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	HG03742	0.0	0.0	0.012	0.089	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA12878	0.414	0.435	0.006	0.021	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA18525	0.0	0.0	0.004	0.072	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA18939	0.438	0.461	0.012	0.016	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA19017	0.715	0.753	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA19238	0.786	0.828	0.0	0.009	0.897	0.897	1	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA19239	0.961	1.011	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA19625	0.567	0.597	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr7	76870544	76870797	DEL	254	NA20845	0.0	0.0	0.01	0.058	nan	nan	0	0
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG00096	1.148	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG00268	1.184	1.086	0.0	0.0	0.811	0.811	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG00419	1.015	0.931	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG00759	1.342	1.231	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG01051	1.123	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG01112	1.136	1.042	0.0	0.0	0.839	0.839	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG01500	1.361	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG01565	0.825	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG01583	1.153	1.058	0.0	0.0	0.941	0.981	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG01595	1.102	1.011	0.0	0.0	0.536	0.536	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG01879	1.264	1.159	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG02568	1.043	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG02922	1.075	0.987	0.0	0.002	0.433	0.433	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG03006	1.029	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG03052	0.471	0.432	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG03642	1.329	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	HG03742	1.27	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA12878	0.948	0.87	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA18525	1.136	1.042	0.0	0.0	0.771	0.771	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA18939	1.297	1.19	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA19017	1.091	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA19238	0.642	0.589	0.0	0.076	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA19239	1.276	1.171	0.0	0.0	0.672	0.672	1	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA19625	1.469	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA19648	0.914	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA20502	0.957	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	80709586	80709772	DEL	187	NA20845	1.289	1.182	0.0	0.008	0.875	0.875	1	2
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG00096	0.444	0.431	0.009	0.067	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG00268	0.0	0.0	0.021	0.182	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG00419	0.0	0.0	0.01	0.185	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG00759	0.0	0.0	0.033	0.203	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG01051	0.312	0.303	0.013	0.082	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG01112	0.559	0.542	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG01500	0.0	0.0	0.029	0.182	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG01565	0.317	0.308	0.005	0.102	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG01583	0.0	0.0	0.009	0.212	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG01595	0.49	0.475	0.0	0.047	nan	nan	0	2
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG01879	0.0	0.0	0.011	0.19	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG02568	0.0	0.0	0.039	0.129	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG02922	0.0	0.0	0.015	0.2	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG03006	0.0	0.0	0.029	0.185	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG03052	0.62	0.602	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG03642	0.0	0.0	0.024	0.164	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	HG03742	0.0	0.0	0.035	0.208	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA12878	0.414	0.402	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA18525	0.355	0.345	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA18939	0.0	0.0	0.034	0.143	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA19017	0.677	0.658	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA19238	0.0	0.0	0.005	0.197	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA19239	0.0	0.0	0.005	0.18	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA19648	0.584	0.567	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA20502	0.0	0.0	0.008	0.17	nan	nan	0	0
chr7	81358341	81358609	DEL	269	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.147	nan	nan	0	0
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG00096	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG00268	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG00419	0.0	0.0	0.076	0.0	nan	nan	0	0
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG00759	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG01051	0.437	0.424	0.032	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG01112	0.484	0.47	0.028	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG01500	0.544	0.529	0.007	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG01565	0.0	0.0	0.139	0.0	nan	nan	0	0
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG01583	0.417	0.405	0.028	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG01595	0.469	0.456	0.053	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG01879	1.19	1.156	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG02568	0.0	0.0	0.238	0.0	nan	nan	0	0
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG02922	1.075	1.044	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG03006	1.103	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG03052	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG03642	0.978	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	HG03742	0.873	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA12878	0.0	0.0	0.129	0.0	nan	nan	0	0
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA18525	0.55	0.534	0.05	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA18939	0.0	0.0	0.104	0.0	nan	nan	0	0
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA19017	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA19238	0.446	0.433	0.082	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA19239	0.553	0.537	0.08	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA19625	0.515	0.5	0.056	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA19648	0.0	0.0	0.168	0.0	nan	nan	0	0
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA20502	0.49	0.476	0.025	0.0	nan	nan	0	1
chr7	81441546	81442495	DEL	950	NA20845	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG00096	0.851	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG00268	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG00419	0.828	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG00759	0.521	0.506	0.006	0.116	nan	nan	0	1
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG01051	1.248	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG01112	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG01500	0.635	0.617	0.011	0.107	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG01565	1.121	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG01583	1.325	1.286	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG01595	1.143	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG01879	0.586	0.569	0.005	0.082	nan	nan	0	1
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG02568	0.309	0.3	0.013	0.151	nan	nan	0	1
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG02922	0.633	0.614	0.014	0.092	nan	nan	0	1
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG03006	0.441	0.428	0.0	0.11	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG03052	0.492	0.478	0.022	0.115	nan	nan	0	1
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG03642	1.229	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	HG03742	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA12878	0.724	0.703	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA18525	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA18939	0.968	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA19017	0.47	0.457	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA19238	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA19239	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA19625	1.159	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA19648	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA20502	0.28	0.272	0.009	0.11	nan	nan	0	2
chr7	81955925	81956209	DEL	285	NA20845	0.511	0.496	0.009	0.079	nan	nan	0	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG00096	0.777	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG00268	0.512	0.497	0.0	0.044	0.824	0.824	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG00419	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG00759	0.541	0.525	0.0	0.029	0.893	0.893	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG01051	0.832	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG01112	0.559	0.542	0.0	0.035	0.84	0.84	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG01500	0.526	0.511	0.0	0.024	0.75	0.75	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG01565	0.762	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG01583	0.442	0.429	0.0	0.038	0.467	0.506	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG01595	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG01879	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG02568	0.579	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG02922	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG03006	0.79	0.767	0.0	0.04	0.5	0.5	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG03052	0.899	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG03642	0.514	0.499	0.0	0.01	0.25	0.25	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	HG03742	0.179	0.173	0.0	0.024	0.692	0.692	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA12878	0.56	0.544	0.0	0.03	0.649	0.649	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA18525	0.373	0.362	0.0	0.045	0.826	0.826	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA18939	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA19017	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA19238	1.193	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA19239	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA19625	0.464	0.45	0.01	0.021	0.65	0.65	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA20502	0.373	0.363	0.0	0.015	0.85	0.875	1	1
chr7	82910895	82910958	DEL	64	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG00096	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG00268	0.495	0.462	0.006	0.033	0.857	0.857	1	1
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG00419	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG00759	1.082	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG01051	1.331	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG01112	1.434	1.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG01500	0.544	0.509	0.006	0.027	0.512	0.512	1	1
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG01565	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG01583	0.785	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG01595	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG01879	1.099	1.027	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG02568	0.695	0.65	0.0	0.05	0.5	0.5	1	1
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG02922	0.548	0.512	0.0	0.033	0.737	0.737	1	1
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG03006	1.25	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG03052	1.038	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG03642	0.903	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	HG03742	1.052	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA12878	0.948	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA18525	1.224	1.144	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA18939	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA19017	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA19238	0.878	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA19239	1.053	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA19625	0.541	0.506	0.0	0.034	0.5	0.5	1	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA19648	0.635	0.593	0.0	0.009	0.357	0.381	1	1
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA20502	1.004	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	83536468	83536535	DEL	68	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	0
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG00096	0.796	0.838	0.0	0.0	0.71	0.71	1	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG00268	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG00419	0.787	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG00759	0.741	0.78	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG01051	0.915	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG01112	1.061	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG01500	0.817	0.86	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG01565	0.867	0.913	0.0	0.0	0.711	0.711	2	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG01583	0.785	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG01595	0.775	0.816	0.0	0.0	0.684	0.684	3	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG01879	0.751	0.79	0.0	0.0	0.85	0.811	3	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG02568	0.695	0.732	0.0	0.0	0.595	0.595	2	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG02922	0.865	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG03006	0.864	0.909	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG03052	0.792	0.833	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG03642	0.903	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	HG03742	0.834	0.878	0.0	0.0	0.545	0.545	2	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA12878	0.896	0.943	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA18525	0.852	0.897	0.006	0.0	0.926	0.926	1	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA18939	0.694	0.73	0.006	0.0	0.667	0.667	3	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA19017	0.696	0.733	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA19238	0.865	0.91	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA19239	0.434	0.457	0.065	0.048	nan	nan	0	1
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA19625	0.953	1.004	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA19648	0.94	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA20502	0.957	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8546482	8547105	DEL	624	NA20845	0.844	0.889	0.0	0.0	0.714	0.714	2	2
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG00268	0.0	0.0	0.008	0.105	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG00419	0.0	0.0	0.014	0.148	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG01500	0.49	0.476	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.116	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG01879	0.513	0.498	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG02568	0.734	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG02922	1.033	1.003	0.0	0.0	0.863	0.863	2	2
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG03006	0.46	0.446	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG03052	0.535	0.519	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG03642	1.229	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8698628	8698847	DEL	220	HG03742	0.417	0.405	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA18525	0.0	0.0	0.011	0.172	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA18939	0.0	0.0	0.006	0.156	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA19017	1.148	1.114	0.0	0.0	0.759	0.759	3	2
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA19238	1.153	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA19239	0.513	0.498	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA19625	0.412	0.4	0.0	0.057	0.625	0.625	2	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA19648	0.406	0.395	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	0
chr7	8698628	8698847	DEL	220	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.138	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	HG00096	0.888	1.021	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	879158	879460	DEL	303	HG00268	0.0	0.0	0.008	0.21	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	HG00419	0.29	0.333	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG00759	0.0	0.0	0.031	0.237	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	HG01051	0.333	0.383	0.01	0.104	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG01112	0.0	0.0	0.017	0.192	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	HG01500	0.345	0.396	0.007	0.093	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG01565	0.719	0.827	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr7	879158	879460	DEL	303	HG01583	0.245	0.282	0.013	0.051	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG01595	0.449	0.516	0.004	0.109	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG01879	0.678	0.779	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	879158	879460	DEL	303	HG02568	0.502	0.577	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG02922	0.422	0.485	0.026	0.087	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG03006	0.294	0.338	0.0	0.125	0.769	0.769	11	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG03052	0.685	0.787	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr7	879158	879460	DEL	303	HG03642	0.376	0.432	0.02	0.091	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	HG03742	0.318	0.365	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	NA12878	0.965	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	879158	879460	DEL	303	NA18525	0.0	0.0	0.008	0.152	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	NA18939	0.0	0.0	0.008	0.196	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	NA19017	0.226	0.26	0.0	0.118	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	NA19238	1.022	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	879158	879460	DEL	303	NA19239	0.0	0.0	0.006	0.209	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	NA19625	0.0	0.0	0.009	0.193	nan	nan	0	0
chr7	879158	879460	DEL	303	NA19648	0.483	0.555	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	NA20502	0.443	0.51	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr7	879158	879460	DEL	303	NA20845	0.378	0.434	0.01	0.076	nan	nan	0	1
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG00096	1.222	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG00268	1.06	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG00419	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG00759	0.941	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG01051	1.456	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG01112	1.229	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG01500	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG01565	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG01583	1.374	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG01595	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG01879	0.549	0.533	0.0	0.015	0.972	0.928	1	1
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG02568	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG02922	1.223	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG03006	1.121	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG03052	1.155	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG03642	1.154	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	HG03742	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA12878	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA18525	1.029	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA18939	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA19017	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA19238	1.297	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA19239	0.974	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA19625	1.34	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA19648	1.295	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA20502	0.863	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	8916865	8916939	DEL	75	NA20845	0.955	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	904330	904386	DEL	57	HG00096	0.407	0.515	0.0	0.014	0.857	0.857	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.016	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	HG01500	0.49	0.62	0.0	0.022	0.583	0.583	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG01565	0.36	0.455	0.0	0.014	0.583	0.583	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG01583	0.392	0.497	0.0	0.048	0.889	0.821	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.011	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	HG01879	0.476	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	904330	904386	DEL	57	HG02568	0.463	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG02922	0.422	0.534	0.0	0.008	0.909	0.909	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	HG03052	0.193	0.244	0.0	0.005	0.667	0.667	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG03642	0.176	0.222	0.0	0.016	0.5	0.5	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.015	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	NA12878	0.845	1.069	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	904330	904386	DEL	57	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.032	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	NA18939	0.31	0.393	0.0	0.026	0.889	0.889	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	NA19017	0.301	0.381	0.0	0.034	0.762	0.762	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	NA19238	0.341	0.431	0.0	0.013	0.909	0.909	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr7	904330	904386	DEL	57	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.024	nan	nan	0	0
chr7	904330	904386	DEL	57	NA19648	0.381	0.482	0.0	0.014	0.538	0.574	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	NA20502	0.21	0.266	0.0	0.008	0.529	0.514	1	1
chr7	904330	904386	DEL	57	NA20845	0.311	0.394	0.0	0.03	0.636	0.636	1	1
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG00096	1.259	1.176	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG00268	1.307	1.222	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG00419	1.077	1.006	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG00759	1.021	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG01051	0.894	0.836	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG01112	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG01500	1.143	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG01565	1.142	1.068	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG01583	1.202	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG01595	1.204	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG01879	0.732	0.685	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG02568	1.352	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG02922	1.202	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG03006	1.232	1.151	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG03052	0.513	0.48	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG03642	1.304	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	HG03742	1.012	0.946	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA12878	1.069	0.999	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA18525	1.171	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA18939	1.461	1.365	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA19017	1.129	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA19238	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA19239	1.289	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA19625	1.366	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA19648	1.067	0.997	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA20502	1.284	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	92004289	92004393	DEL	105	NA20845	1.355	1.267	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG00096	1.073	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG00268	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG00419	0.953	0.953	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG00759	1.222	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG01051	0.832	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG01112	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG01500	1.143	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG01565	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG01583	1.398	1.398	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG01595	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG01879	0.531	0.531	0.007	0.096	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	1
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG02922	0.464	0.464	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG03006	0.956	0.956	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG03052	0.492	0.492	0.0	0.11	0.889	0.889	3	1
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG03642	0.928	0.928	0.01	0.005	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	HG03742	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA12878	1.206	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA18525	0.834	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA18939	0.584	0.584	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA19017	0.32	0.32	0.0	0.08	0.364	0.364	3	1
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA19238	0.616	0.616	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA19239	0.697	0.697	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA19625	1.288	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA19648	0.991	0.991	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA20502	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	93892582	93892780	DEL	199	NA20845	0.844	0.844	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG00096	1.333	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG00268	0.936	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG00419	1.015	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG00759	0.841	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG01051	0.728	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG01112	1.155	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG01500	0.835	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG01565	0.952	0.873	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG01583	0.883	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG01595	1.061	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG01879	0.568	0.521	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG02568	0.695	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG02922	0.844	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG03006	0.938	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG03052	1.006	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG03642	1.204	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	HG03742	0.854	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA12878	0.793	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA18525	0.763	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA18939	0.566	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA19017	1.11	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA19238	0.97	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA19239	1.013	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA19625	0.85	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA19648	0.889	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA20502	1.097	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	94678235	94678365	DEL	131	NA20845	0.778	0.713	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG00096	1.129	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG00268	1.148	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG00419	1.108	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG00759	1.262	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG01051	1.487	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG01112	1.155	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG01500	1.161	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG01565	1.269	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG01583	1.325	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG01595	1.163	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG01879	1.318	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG02568	0.966	0.878	0.0	0.008	0.286	0.286	1	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG02922	1.054	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG03006	1.25	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG03052	1.155	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG03642	1.229	1.117	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	HG03742	1.27	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA12878	0.879	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA18525	1.251	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA18939	1.077	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA19017	1.298	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA19238	0.629	0.572	0.0	0.039	0.825	0.825	1	1
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA19239	1.382	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA19625	1.198	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA19648	1.295	1.178	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA20502	0.77	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	97122720	97122795	DEL	76	NA20845	1.377	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG00096	0.796	0.915	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG00268	0.548	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG00419	0.559	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG00759	0.481	0.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG01051	0.166	0.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG01112	0.521	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG01500	0.653	0.751	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG01565	0.402	0.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG01583	0.638	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG01595	0.612	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG03052	0.364	0.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG03642	0.652	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	HG03742	0.437	0.502	0.0	0.0	0.238	0.238	1	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA12878	1.043	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA18525	0.674	0.775	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA18939	0.712	0.819	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA19017	0.847	0.973	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA19238	0.826	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA19648	0.787	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA20502	0.747	0.858	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr7	98971096	98971271	DUP	176	NA20845	0.467	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG00096	0.685	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG00268	0.548	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG00419	0.538	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG00759	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG01051	0.645	0.626	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG01112	0.484	0.47	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG01565	0.55	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG01595	0.592	0.574	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG01879	0.549	0.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG02922	0.464	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG03006	0.423	0.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	HG03052	0.278	0.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	NA12878	0.888	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	NA19017	0.621	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	NA19238	0.655	0.636	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	NA19625	0.541	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	NA20502	0.467	0.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr7	99031644	99031701	DUP	58	NA20845	0.667	0.647	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG00096	0.539	0.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG00268	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG00419	0.977	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG00759	0.718	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG01051	0.538	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG01112	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG01500	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG01565	0.676	0.711	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG01583	0.705	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG01595	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG01879	0.733	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG02568	0.964	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG02922	0.787	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG03006	0.767	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG03052	0.885	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG03642	0.971	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	HG03742	0.575	0.606	0.0	0.0	0.781	0.781	2	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA12878	0.757	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA18525	0.849	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA18939	0.622	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA19017	1.005	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA19238	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA19239	0.432	0.455	0.004	0.046	0.5	0.5	1	1
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA19625	0.54	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA19648	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA20502	0.885	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	104014161	104014505	DEL	345	NA20845	0.667	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG00096	0.892	0.866	0.004	0.0	0.643	0.643	5	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG00268	1.079	1.048	0.009	0.0	0.7	0.685	5	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG00419	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG00759	1.057	1.026	0.0	0.0	0.84	0.84	5	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG01051	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG01112	0.969	0.941	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG01500	1.07	1.038	0.0	0.0	0.833	0.833	5	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG01565	1.014	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG01583	1.046	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG01595	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG01879	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG02568	0.424	0.412	0.04	0.034	nan	nan	0	1
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG02922	0.595	0.578	0.032	0.023	nan	nan	0	1
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG03006	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG03052	0.453	0.44	0.089	0.057	nan	nan	0	1
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG03642	0.56	0.544	0.105	0.064	nan	nan	0	1
chr8	106796535	106797312	DEL	778	HG03742	0.437	0.424	0.071	0.063	nan	nan	0	1
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA12878	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA18525	0.955	0.928	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA18939	0.932	0.905	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA19017	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA19238	0.0	0.0	0.463	0.208	nan	nan	0	0
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA19239	0.524	0.509	0.098	0.045	nan	nan	0	1
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA19625	0.875	0.849	0.0	0.0	0.846	0.907	5	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA19648	1.012	0.982	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA20502	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	106796535	106797312	DEL	778	NA20845	0.867	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG00096	0.65	0.747	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG00268	0.46	0.529	0.0	0.0	0.917	0.897	1	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG00419	0.478	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG00759	0.219	0.252	0.0	0.031	0.471	0.471	2	1
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG01051	0.393	0.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG01112	0.578	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG01500	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG01565	0.253	0.291	0.0	0.019	0.357	0.357	1	1
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG01583	0.778	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG01595	0.532	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG01879	0.678	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG02568	1.002	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG02922	0.617	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG03006	0.548	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG03052	0.432	0.496	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG03642	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	HG03742	0.556	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA12878	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA18525	0.318	0.366	0.0	0.023	0.683	0.683	2	1
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA18939	0.53	0.609	0.0	0.0	0.562	0.538	1	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA19017	0.639	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA19238	0.606	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA19239	0.721	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA19625	0.643	0.739	0.0	0.0	0.727	0.679	1	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA19648	0.733	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA20502	0.605	0.696	0.0	0.0	0.095	0.095	1	2
chr8	1090332	1090383	DEL	52	NA20845	0.556	0.639	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG00096	0.984	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG00268	0.46	0.511	0.027	0.094	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG00419	0.0	0.0	0.019	0.273	nan	nan	0	0
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG00759	0.837	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG01051	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG01112	0.578	0.642	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG01500	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG01565	0.929	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG01583	0.511	0.568	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG01595	0.9	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG01879	0.907	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG02568	0.578	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG02922	0.393	0.437	0.01	0.086	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG03006	0.383	0.426	0.009	0.132	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG03052	1.123	1.248	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG03642	0.573	0.636	0.019	0.11	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	HG03742	0.0	0.0	0.011	0.227	nan	nan	0	0
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA12878	0.378	0.42	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA18525	1.062	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA18939	0.53	0.589	0.023	0.087	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA19017	1.034	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA19238	0.461	0.513	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA19239	0.485	0.539	0.004	0.11	nan	nan	0	1
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA19625	0.875	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA19648	0.0	0.0	0.046	0.198	nan	nan	0	0
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA20502	0.978	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	110234722	110235045	DEL	324	NA20845	0.578	0.642	0.018	0.065	nan	nan	0	1
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG00096	0.91	0.958	0.0	0.0	0.633	0.633	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG00268	1.168	1.229	0.0	0.0	0.886	0.867	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG00419	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG00759	0.817	0.86	0.0	0.0	0.602	0.602	2	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG01051	0.786	0.827	0.0	0.0	0.474	0.474	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG01112	0.988	1.04	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG01500	0.471	0.496	0.128	0.075	nan	nan	0	1
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG01565	0.971	1.023	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG01583	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG01595	0.961	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG01879	0.916	0.964	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG02568	1.002	1.055	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG02922	1.127	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG03006	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG03052	1.123	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG03642	1.07	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	HG03742	0.794	0.835	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA12878	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA18525	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA18939	0.731	0.77	0.0	0.0	0.667	0.697	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA19017	1.015	1.068	0.0	0.0	0.699	0.667	2	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA19238	0.923	0.971	0.003	0.0	0.877	0.877	2	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA19239	0.983	1.035	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA19625	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA19648	1.265	1.331	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA20502	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11228365	11229284	DEL	920	NA20845	0.889	0.936	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG00096	1.616	1.469	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG00268	1.274	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG00419	0.936	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG00759	1.037	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG01051	1.199	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG01112	1.156	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG01500	1.051	0.956	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG01565	1.246	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG01583	1.022	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG01595	1.268	1.152	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG01879	0.659	0.6	0.0	0.058	0.636	0.636	1	1
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG02568	1.079	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG02922	1.319	1.199	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG03006	1.242	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG03052	1.404	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG03642	1.27	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	HG03742	1.19	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA12878	0.929	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA18525	1.15	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA18939	0.969	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA19017	1.372	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA19238	1.213	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA19239	1.179	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA19625	1.184	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA19648	1.189	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA20502	0.978	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	112335893	112335977	DEL	85	NA20845	1.133	1.03	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG00096	0.687	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG00268	0.513	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG00419	0.977	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG00759	0.598	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG01051	0.724	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG01112	0.634	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG01500	0.671	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG01565	0.929	1.256	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG01583	0.584	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG01595	0.45	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG01879	0.724	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG02568	0.386	0.521	0.0	0.036	0.667	0.667	1	1
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG02922	0.574	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG03006	0.822	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG03052	0.518	0.7	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG03642	0.548	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	HG03742	0.694	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA12878	0.585	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA18525	0.708	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA18939	0.548	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA19017	0.827	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA19238	0.699	0.944	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA19239	0.727	0.983	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA19625	0.849	1.148	0.0	0.0	0.889	0.952	1	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA19648	0.556	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA20502	0.861	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11323932	11323993	DEL	62	NA20845	0.667	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG00096	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG00268	1.309	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG00419	0.915	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG00759	1.196	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG01051	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG01112	0.503	0.489	0.0	0.055	0.364	0.364	1	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG01500	0.562	0.546	0.0	0.053	0.571	0.571	1	1
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG01565	0.781	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG01583	0.851	0.827	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG01595	1.288	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG01879	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG02568	0.771	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG02922	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG03006	1.077	1.046	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG03052	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG03642	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	HG03742	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA12878	0.877	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA18525	1.062	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA18939	1.298	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA19017	0.94	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA19238	0.962	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA19239	1.219	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA19625	1.107	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA19648	0.379	0.368	0.0	0.079	0.739	0.739	1	1
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA20502	0.838	0.814	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114169632	114169724	DEL	93	NA20845	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG00096	0.873	0.801	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG00268	1.274	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG00419	1.372	1.259	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG00759	0.738	0.677	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG01051	0.662	0.607	0.011	0.076	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG01112	0.764	0.701	0.008	0.076	nan	nan	0	1
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG01500	1.269	1.164	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG01565	1.077	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG01583	1.289	1.183	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG01595	1.421	1.304	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG01879	1.539	1.412	0.0	0.0	0.911	0.911	1	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG02568	1.311	1.202	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG02922	1.191	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG03006	1.607	1.474	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG03052	0.95	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG03642	1.046	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	HG03742	1.131	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA12878	0.482	0.442	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA18525	1.327	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA18939	0.512	0.47	0.0	0.108	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA19017	0.733	0.672	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA19238	1.793	1.645	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA19239	1.546	1.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA19625	1.184	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA19648	1.442	1.323	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA20502	0.419	0.384	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr8	114862620	114862753	DEL	134	NA20845	1.222	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG00096	0.873	0.816	0.0	0.0	0.725	0.725	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG00268	0.743	0.694	0.0	0.0	0.751	0.735	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG00419	1.352	1.263	0.0	0.0	0.624	0.624	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG00759	1.096	1.025	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG01051	1.054	0.985	0.0	0.0	0.769	0.769	3	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG01112	1.267	1.185	0.0	0.0	0.746	0.746	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG01500	0.997	0.932	0.004	0.0	0.759	0.759	1	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG01565	0.57	0.533	0.052	0.021	1.0	1.0	1	1
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG01583	0.997	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG01595	0.869	0.812	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG01879	0.953	0.89	0.005	0.003	nan	nan	0	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG02568	0.887	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG02922	0.851	0.795	0.0	0.0	0.872	0.872	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG03006	1.15	1.075	0.0	0.002	0.931	0.931	1	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG03052	0.561	0.525	0.082	0.03	0.37	0.37	3	1
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG03642	1.294	1.21	0.006	0.0	0.729	0.729	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	HG03742	1.329	1.242	0.0	0.0	0.933	0.933	3	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA12878	0.843	0.788	0.0	0.0	0.853	0.853	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA18525	1.044	0.976	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA18939	1.289	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA19017	1.128	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA19238	1.16	1.084	0.0	0.0	0.921	0.921	2	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA19239	0.577	0.539	0.077	0.043	nan	nan	0	1
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA19625	1.081	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA19648	1.138	1.064	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA20502	1.164	1.088	0.008	0.0	0.941	0.941	1	2
chr8	114912661	114913372	DEL	712	NA20845	1.311	1.225	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG00096	0.817	0.793	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG00268	0.637	0.618	0.0	0.0	0.941	0.921	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG00419	1.061	1.03	0.0	0.0	0.537	0.537	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG00759	0.917	0.89	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG01051	0.703	0.682	0.0	0.0	0.615	0.615	2	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG01112	1.193	1.158	0.0	0.0	0.622	0.622	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG01500	0.925	0.898	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG01565	0.528	0.513	0.05	0.02	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG01583	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG01595	0.808	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG01879	0.898	0.871	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG02568	0.848	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG02922	0.766	0.743	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG03006	1.096	1.064	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG03052	0.453	0.44	0.087	0.03	0.323	0.323	2	1
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG03642	1.083	1.051	0.0	0.0	0.729	0.729	2	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	HG03742	1.171	1.137	0.0	0.0	0.967	0.967	2	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA12878	0.808	0.785	0.0	0.0	0.885	0.885	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA18525	1.044	1.013	0.0	0.0	0.762	0.762	2	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA18939	1.015	0.985	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA19017	0.977	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA19238	1.107	1.075	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA19239	0.406	0.394	0.076	0.042	nan	nan	0	1
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA19625	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA19648	0.873	0.847	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA20502	0.838	0.814	0.007	0.0	0.941	0.941	1	2
chr8	114912821	114913530	DEL	710	NA20845	1.111	1.079	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG00096	0.0	0.0	0.006	0.189	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG00268	0.0	0.0	0.007	0.178	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG00419	0.603	0.603	0.006	0.089	0.266	0.266	2	1
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG00759	0.439	0.439	0.019	0.11	0.391	0.391	4	1
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG01051	0.0	0.0	0.007	0.219	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG01112	0.0	0.0	0.043	0.219	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG01500	0.0	0.0	0.008	0.239	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG01565	0.0	0.0	0.062	0.191	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG01583	0.0	0.0	0.034	0.164	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG01595	0.736	0.736	0.008	0.08	nan	nan	0	1
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG01879	0.33	0.33	0.022	0.099	nan	nan	0	1
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.185	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG02922	0.0	0.0	0.027	0.225	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG03006	0.0	0.0	0.014	0.237	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG03052	0.0	0.0	0.017	0.241	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG03642	0.672	0.672	0.012	0.106	0.408	0.408	2	2
chr8	114934391	114934683	DEL	293	HG03742	0.655	0.655	0.007	0.08	0.483	0.483	2	1
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA18525	0.619	0.619	0.011	0.1	nan	nan	0	1
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA18939	1.499	1.499	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA19017	1.052	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA19238	0.0	0.0	0.004	0.186	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA19625	0.566	0.566	0.011	0.079	nan	nan	0	1
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA19648	0.0	0.0	0.021	0.199	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA20502	0.0	0.0	0.012	0.112	nan	nan	0	0
chr8	114934391	114934683	DEL	293	NA20845	0.644	0.644	0.025	0.05	nan	nan	0	1
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG00096	1.114	1.082	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG00268	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG00419	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG00759	1.396	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG01051	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG01112	1.323	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG01500	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG01565	1.394	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG01583	0.438	0.425	0.0	0.046	0.714	0.659	1	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG02568	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG02922	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG03052	0.885	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG03642	1.195	1.16	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	HG03742	1.25	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA12878	1.049	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA18939	1.069	1.038	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA19017	1.203	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA19238	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA19239	1.31	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA19625	0.875	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA20502	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115618921	115618980	DUP	60	NA20845	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG00096	1.003	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG00268	1.362	1.513	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG00419	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG00759	0.817	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG01051	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG01112	0.951	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG01500	0.87	0.967	0.0	0.0	0.607	0.607	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG01565	0.95	1.056	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG01583	0.949	1.054	0.0	0.0	0.556	0.513	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG01595	0.797	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG01879	0.714	0.794	0.0	0.0	0.667	0.667	2	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG02568	0.424	0.471	0.0	0.0	0.2	0.2	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG02922	0.787	0.874	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG03006	0.968	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG03052	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG03642	1.021	1.134	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	HG03742	0.218	0.243	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA12878	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA18525	0.725	0.806	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA18939	0.786	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA19017	0.883	0.981	0.0	0.0	0.653	0.651	2	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA19238	1.015	1.128	0.0	0.0	0.919	0.919	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA19239	0.812	0.903	0.0	0.0	0.903	0.903	2	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA19625	1.158	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA19648	1.163	1.293	0.0	0.005	0.848	0.848	2	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA20502	0.978	1.086	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr8	11596929	11597266	DEL	338	NA20845	0.8	0.889	0.0	0.006	0.429	0.429	1	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG00096	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG00268	0.495	0.481	0.024	0.017	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG00419	1.144	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG00759	0.0	0.0	0.192	0.076	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG01051	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG01112	0.0	0.0	0.226	0.136	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG01500	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG01565	0.422	0.41	0.035	0.023	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG01583	0.0	0.0	0.221	0.09	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG01595	0.634	0.615	0.028	0.011	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG01879	0.0	0.0	0.077	0.077	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG02568	0.0	0.0	0.093	0.057	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG02922	0.553	0.537	0.039	0.017	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG03006	0.657	0.638	0.034	0.015	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG03052	0.0	0.0	0.11	0.061	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG03642	0.0	0.0	0.118	0.075	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	HG03742	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA12878	0.413	0.401	0.029	0.007	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA18525	0.0	0.0	0.062	0.065	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA18939	1.079	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA19017	0.62	0.602	0.01	0.012	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA19238	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA19239	0.419	0.407	0.005	0.018	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA19625	0.0	0.0	0.164	0.061	nan	nan	0	0
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA19648	0.278	0.27	0.04	0.014	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA20502	0.326	0.316	0.031	0.014	nan	nan	0	1
chr8	115997801	115998360	DEL	560	NA20845	0.4	0.388	0.04	0.022	nan	nan	0	1
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG00096	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG00268	1.185	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG00419	1.164	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG00759	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG01051	1.189	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG01112	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG01500	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG01565	1.214	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG01583	1.192	1.157	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG01595	0.756	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG01879	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG02568	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG02922	1.0	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG03006	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG03052	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG03642	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	HG03742	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA12878	0.997	0.968	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA18525	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA18939	0.42	0.408	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA19017	1.278	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA19238	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA19239	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA19625	0.901	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA19648	1.138	1.105	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA20502	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	116452675	116452966	DEL	292	NA20845	1.178	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG00096	0.427	0.475	0.0	0.047	0.962	0.962	1	1
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG00268	0.725	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG00419	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG00759	0.977	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG01051	0.434	0.482	0.0	0.04	0.87	0.87	1	1
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG01112	0.932	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG01500	0.852	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG01565	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG01583	0.632	0.703	0.0	0.021	0.208	0.226	1	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG01595	0.736	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG01879	0.348	0.387	0.0	0.039	1.0	1.0	1	1
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG02568	0.848	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG02922	0.553	0.614	0.0	0.062	0.409	0.409	1	1
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG03006	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG03052	0.345	0.384	0.0	0.033	0.619	0.619	1	1
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG03642	1.07	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	HG03742	1.071	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA12878	1.066	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA18525	0.372	0.413	0.0	0.057	0.913	0.913	1	1
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA18939	0.896	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA19017	0.864	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA19238	1.041	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA19239	0.917	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA19625	0.952	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA19648	1.012	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA20502	0.605	0.672	0.0	0.037	0.643	0.643	1	1
chr8	119165526	119165598	DEL	73	NA20845	0.511	0.568	0.0	0.045	0.615	0.615	1	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG00096	0.734	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG00268	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG00419	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG00759	0.399	0.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG01051	0.744	0.827	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG01112	0.634	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG01500	0.798	0.886	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG01565	0.908	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG01583	0.681	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG01595	0.859	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG01879	0.714	0.794	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG02568	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG02922	0.404	0.449	0.0	0.009	0.846	0.846	1	1
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG03006	0.767	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.035	nan	nan	0	0
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG03642	0.523	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	HG03742	0.972	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA12878	1.083	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA18525	0.743	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA18939	0.585	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA19017	0.789	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA19238	0.91	1.011	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA19239	0.446	0.495	0.0	0.008	0.886	0.886	1	1
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA19625	0.978	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA19648	0.91	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA20502	0.791	0.879	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	119924819	119924872	DEL	54	NA20845	0.6	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG00096	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG00268	0.619	0.619	0.005	0.0	0.6	0.598	2	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG00419	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG00759	0.658	0.658	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG01051	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG01112	0.839	0.839	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG01500	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG01565	0.961	0.961	0.0	0.0	0.773	0.773	2	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG01583	0.876	0.876	0.0	0.0	0.833	0.903	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG01595	0.716	0.716	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG01879	0.989	0.989	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG02568	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG02922	0.915	0.915	0.0	0.0	0.521	0.521	2	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG03006	0.749	0.749	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG03052	0.324	0.324	0.053	0.0	0.091	0.091	1	1
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG03642	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	HG03742	0.714	0.714	0.0	0.0	0.89	0.89	2	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA12878	1.152	1.152	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA18525	0.885	0.885	0.0	0.0	0.675	0.675	2	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA18939	0.713	0.713	0.0	0.0	0.895	0.935	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA19017	0.864	0.864	0.0	0.0	0.947	0.992	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA19238	0.949	0.949	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA19239	0.917	0.917	0.0	0.0	0.559	0.559	2	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA19625	0.309	0.309	0.09	0.0	nan	nan	0	1
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA19648	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA20502	0.628	0.628	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr8	119932821	119933568	DEL	748	NA20845	0.933	0.933	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG00096	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG00268	1.114	1.082	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG00419	0.915	0.888	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG00759	0.877	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG01051	0.972	0.943	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG01112	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG01500	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG01565	0.676	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG01583	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG01595	1.145	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG01879	1.282	1.245	0.0	0.0	0.711	0.711	1	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG02568	0.54	0.524	0.0	0.028	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG02922	0.957	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG03006	0.712	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG03052	1.252	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG03642	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	HG03742	1.012	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA12878	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA18525	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA18939	1.115	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA19017	0.526	0.511	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA19238	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA19239	0.577	0.56	0.0	0.039	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA19625	1.312	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA19648	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA20502	1.094	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	120300236	120300388	DEL	153	NA20845	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG00096	0.966	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG00268	1.168	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG00419	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG00759	1.106	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG01051	0.889	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG01112	1.212	1.346	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG01500	1.088	1.209	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG01565	0.929	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG01583	1.241	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG01595	0.941	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG01879	1.154	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG02568	0.463	0.514	0.0	0.008	0.625	0.625	1	1
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG02922	0.829	0.922	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG03006	0.931	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG03052	0.583	0.648	0.0	0.039	0.833	0.833	1	1
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG03642	0.747	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	HG03742	1.052	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA12878	1.083	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA18525	1.0	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA18939	0.731	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA19017	0.977	1.086	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA19238	0.975	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA19239	0.432	0.48	0.0	0.035	0.65	0.65	1	1
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA19625	0.823	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA19648	1.442	1.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA20502	1.141	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	124567216	124567283	DEL	68	NA20845	1.044	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG00096	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG00268	0.849	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG00419	0.998	1.051	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG00759	0.478	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG01051	0.517	0.544	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG01112	0.708	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG01500	0.326	0.343	0.04	0.06	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG01565	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG01583	0.876	0.922	0.0	0.004	0.6	0.65	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG01595	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG01879	0.678	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG02568	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG02922	0.617	0.649	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG03006	0.785	0.827	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG03052	0.324	0.341	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG03642	0.797	0.839	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	HG03742	0.298	0.313	0.008	0.042	nan	nan	0	1
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA12878	0.997	1.05	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA18525	0.991	1.043	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA18939	0.695	0.731	0.0	0.0	0.765	0.799	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA19017	0.958	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA19238	0.554	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA19239	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA19625	0.798	0.84	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA19648	0.607	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA20502	0.978	1.029	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr8	125279967	125280235	DEL	269	NA20845	0.689	0.725	0.0	0.0	0.357	0.357	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG00096	1.133	1.133	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG00268	0.849	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG00419	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG00759	1.316	1.316	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG01051	1.137	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG01112	1.342	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG01500	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG01565	0.95	0.95	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG01583	1.265	1.265	0.0	0.0	0.75	0.812	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG01595	1.104	1.104	0.0	0.003	0.909	0.909	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG01879	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG02568	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG02922	1.17	1.17	0.0	0.0	0.414	0.414	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG03006	1.077	1.077	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG03052	1.166	1.166	0.0	0.0	0.528	0.528	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	HG03642	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA12878	1.049	1.049	0.0	0.0	0.457	0.457	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA18939	1.261	1.261	0.0	0.0	0.943	0.986	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA19017	1.109	1.109	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA19238	1.292	1.292	0.0	0.0	0.937	0.937	2	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA19239	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA19625	0.862	0.862	0.0	0.0	0.733	0.684	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA19648	1.694	1.694	0.0	0.0	0.618	0.618	1	2
chr8	126305707	126305910	DUP	204	NA20502	1.362	1.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG00096	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG00268	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG00419	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG00759	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG01051	0.889	0.936	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG01112	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG01500	0.381	0.401	0.052	0.039	nan	nan	0	1
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG01565	0.676	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG01583	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG01595	0.879	0.925	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG01879	0.55	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG02568	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG02922	0.978	1.03	0.0	0.0	0.867	0.867	4	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG03006	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG03052	0.41	0.432	0.069	0.062	nan	nan	0	1
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG03642	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	HG03742	0.585	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA12878	0.92	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA18525	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA18939	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA19017	0.432	0.455	0.079	0.035	nan	nan	0	1
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA19238	0.844	0.888	0.0	0.0	0.748	0.748	4	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA19239	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA19625	0.798	0.84	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA19648	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA20502	1.047	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128012268	128012942	DEL	675	NA20845	0.8	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG00096	1.244	1.383	0.0	0.0	0.743	0.743	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG00268	1.044	1.16	0.0	0.004	0.774	0.791	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG00419	0.0	0.0	0.009	0.178	nan	nan	0	0
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG00759	1.156	1.285	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG01051	0.6	0.666	0.0	0.049	0.5	0.5	1	1
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG01112	0.857	0.953	0.0	0.0	0.48	0.48	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG01500	1.124	1.249	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG01565	0.781	0.868	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG01583	1.289	1.432	0.0	0.0	0.778	0.718	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG01595	0.368	0.409	0.0	0.072	0.905	0.905	1	1
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG01879	0.44	0.488	0.0	0.092	0.773	0.773	1	1
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG02568	0.925	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	0
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG03006	0.42	0.467	0.0	0.088	0.406	0.406	1	1
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG03052	0.583	0.648	0.0	0.1	0.515	0.515	1	1
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG03642	1.046	1.162	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	HG03742	0.913	1.014	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA12878	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA18525	0.885	0.983	0.0	0.039	0.323	0.323	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA18939	0.512	0.569	0.0	0.091	0.634	0.663	1	1
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA19017	1.184	1.316	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA19238	0.488	0.542	0.0	0.087	0.69	0.69	2	1
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA19239	0.839	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA19625	1.158	1.287	0.0	0.0	0.522	0.559	1	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA19648	1.239	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA20502	1.141	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	128611294	128611392	DEL	99	NA20845	1.378	1.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG00096	1.152	1.212	0.0	0.0	0.807	0.807	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG00268	1.097	1.154	0.0	0.0	0.853	0.835	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG00419	0.728	0.766	0.0	0.0	0.38	0.38	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG00759	0.658	0.693	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG01051	0.827	0.87	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG01112	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG01500	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG01565	1.035	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG01583	1.095	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG01595	0.756	0.796	0.0	0.0	0.858	0.858	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG01879	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG02568	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG02922	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG03006	0.931	0.98	0.0	0.0	0.56	0.56	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG03052	1.252	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG03642	0.697	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	HG03742	1.23	1.295	0.0	0.0	0.815	0.815	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA12878	0.877	0.923	0.0	0.0	0.804	0.804	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA18525	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA18939	1.097	1.155	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA19017	0.94	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA19238	0.567	0.597	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA19239	0.839	0.883	0.0	0.0	0.857	0.857	2	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA19625	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA19648	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA20502	1.024	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129202894	129203016	DEL	123	NA20845	0.689	0.725	0.0	0.005	1.0	1.0	2	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG00096	1.282	1.198	0.004	0.0	0.861	0.861	1	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG00268	1.238	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG00419	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG00759	1.316	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG01051	1.282	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG01112	1.342	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG01500	1.124	1.05	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG01565	1.204	1.125	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG01583	1.484	1.387	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG01595	1.677	1.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG01879	1.337	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG02568	1.465	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG02922	1.297	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG03006	1.096	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG03052	0.691	0.646	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG03642	1.294	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	HG03742	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA12878	1.273	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA18525	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA18939	1.499	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA19017	1.41	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA19238	1.345	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA19239	1.337	1.249	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA19625	1.312	1.227	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA19648	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA20502	1.234	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	129922166	129922382	DEL	217	NA20845	1.222	1.142	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG00096	1.133	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG00268	0.884	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG00419	1.019	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG00759	1.236	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG01051	0.806	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG01112	1.323	1.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG01500	0.78	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG01565	0.993	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG01583	1.216	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG01595	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG01879	0.953	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG02568	1.234	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG02922	1.191	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG03006	1.023	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG03052	0.993	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG03642	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	HG03742	1.091	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA12878	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA18525	1.008	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA18939	0.841	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA19017	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA19238	1.081	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA19239	0.616	0.648	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA19625	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA19648	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA20502	1.094	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	132482148	132482310	DEL	163	NA20845	1.067	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG00096	0.91	0.958	0.0	0.0	0.676	0.676	4	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG00268	0.796	0.838	0.0	0.0	0.706	0.722	4	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG00419	0.915	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG00759	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG01051	0.765	0.805	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG01112	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG01500	0.852	0.897	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG01565	0.739	0.778	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG01583	0.949	0.999	0.0	0.0	0.938	0.923	7	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG01595	0.695	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG01879	0.421	0.443	0.079	0.045	0.25	0.25	13	1
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG02568	0.771	0.812	0.0	0.0	0.826	0.826	6	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG02922	0.404	0.425	0.079	0.054	0.249	0.249	12	1
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG03006	0.749	0.788	0.0	0.0	0.867	0.867	6	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG03052	0.885	0.932	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG03642	1.17	1.232	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	HG03742	0.913	0.961	0.0	0.0	0.893	0.893	4	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA12878	0.877	0.923	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA18525	0.867	0.913	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA18939	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA19017	0.789	0.831	0.0	0.0	0.545	0.521	1	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA19238	0.923	0.971	0.0	0.0	0.691	0.691	2	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA19239	0.812	0.855	0.0	0.0	0.933	0.933	6	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA19625	0.798	0.84	0.0	0.0	0.727	0.7	5	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA19648	1.189	1.251	0.0	0.0	0.789	0.789	7	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA20502	0.954	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133060635	133061581	DEL	947	NA20845	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG00096	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG00268	1.008	1.12	0.0	0.0	0.733	0.749	1	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG00419	0.936	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG00759	0.897	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG01051	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG01112	0.932	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG01500	0.834	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG01565	0.781	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG01583	0.997	1.108	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG01595	0.624	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG01879	0.641	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG02568	1.002	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG02922	0.851	0.945	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG03006	0.84	0.933	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG03052	0.821	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG03642	0.473	0.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	HG03742	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA12878	0.705	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA18525	1.079	1.199	0.0	0.0	0.81	0.81	2	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA18939	1.024	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA19017	0.714	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA19238	0.844	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA19239	0.812	0.903	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA19625	0.721	0.801	0.007	0.08	nan	nan	0	1
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA19648	1.113	1.236	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA20502	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	133578907	133579358	DEL	452	NA20845	0.822	0.914	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG00096	0.762	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG00268	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG00419	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG00759	1.057	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG01051	0.662	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG01112	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG01500	1.033	1.148	0.0	0.0	0.893	0.893	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG01565	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG01583	0.681	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG01595	0.593	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG01879	0.806	0.896	0.0	0.0	0.554	0.554	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG02568	0.848	0.942	0.0	0.0	0.536	0.536	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG02922	0.319	0.354	0.059	0.066	nan	nan	0	1
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG03006	0.73	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG03052	0.734	0.816	0.0	0.0	0.685	0.685	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG03642	1.095	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	HG03742	0.675	0.75	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA12878	0.963	1.07	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA18525	1.062	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA18939	0.676	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA19017	1.015	1.128	0.0	0.0	0.893	0.891	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA19238	0.804	0.893	0.0	0.0	0.635	0.635	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA19239	0.944	1.048	0.0	0.0	0.97	0.97	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA19625	0.592	0.658	0.025	0.022	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA19648	0.86	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA20502	0.931	1.035	0.0	0.0	0.718	0.718	2	2
chr8	134772000	134772568	DEL	569	NA20845	0.911	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.186	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG00268	0.23	0.277	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG00759	0.419	0.504	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG01051	0.165	0.199	0.009	0.094	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG01112	0.373	0.449	0.0	0.177	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG01500	0.471	0.568	0.0	0.139	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG01565	0.211	0.254	0.0	0.159	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG01583	0.584	0.703	0.0	0.161	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG01595	0.286	0.345	0.0	0.164	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG01879	0.421	0.508	0.01	0.182	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG02568	0.386	0.464	0.0	0.179	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG02922	0.595	0.717	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG03006	0.329	0.396	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG03052	0.345	0.416	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	HG03742	0.317	0.382	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA18525	0.478	0.576	0.0	0.18	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.161	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA19238	0.316	0.381	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA19239	0.288	0.347	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA19625	0.515	0.62	0.0	0.189	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA19648	0.379	0.457	0.0	0.149	nan	nan	0	1
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA20502	0.396	0.477	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr8	13594464	13594628	DEL	165	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG00096	0.836	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG00268	1.309	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG00759	0.578	0.53	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG01051	1.096	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG01112	0.932	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG01500	1.151	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG01565	0.401	0.368	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG01583	0.754	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG01595	0.613	0.563	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG01879	1.209	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG02568	1.234	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG02922	1.031	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG03006	0.95	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG03052	0.896	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG03642	0.373	0.343	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr8	137965805	137965918	DEL	114	HG03742	0.317	0.291	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA12878	0.86	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA18525	0.566	0.519	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA18939	1.005	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA19017	0.62	0.569	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA19238	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA19239	0.996	0.914	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA19625	0.978	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA19648	1.012	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA20502	0.885	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	137965805	137965918	DEL	114	NA20845	0.511	0.469	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG00096	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG00268	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG00419	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG00759	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG01051	0.351	0.37	0.0	0.047	0.895	0.895	3	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG01112	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG01500	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG01565	0.528	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG01583	0.681	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG01595	0.572	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG01879	0.311	0.328	0.0	0.034	0.857	0.857	3	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG02568	0.463	0.487	0.0	0.023	0.308	0.308	3	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG02922	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG03006	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG03052	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG03642	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	HG03742	0.794	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA12878	1.015	1.068	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA18525	0.92	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA18939	0.804	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA19017	0.62	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA19238	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA19239	0.354	0.372	0.0	0.027	0.667	0.667	3	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA19625	0.309	0.325	0.0	0.03	0.357	0.383	3	1
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA19648	0.708	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA20502	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138422602	138422684	DEL	83	NA20845	0.578	0.608	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG00096	0.0	0.0	0.224	0.167	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG00268	0.0	0.0	0.198	0.142	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG00419	0.0	0.0	0.251	0.189	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG00759	0.0	0.0	0.178	0.138	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG01051	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG01112	0.0	0.0	0.297	0.21	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG01500	0.526	0.51	0.074	0.061	nan	nan	0	1
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG01565	0.0	0.0	0.192	0.153	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG01583	0.0	0.0	0.214	0.092	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG01595	0.0	0.0	0.157	0.112	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG01879	0.403	0.391	0.07	0.06	nan	nan	0	1
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG02568	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG02922	0.51	0.496	0.041	0.021	nan	nan	0	1
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG03006	0.0	0.0	0.265	0.158	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG03052	0.842	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG03642	0.448	0.435	0.032	0.025	nan	nan	0	1
chr8	138742943	138743864	DEL	922	HG03742	0.0	0.0	0.09	0.065	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA12878	0.0	0.0	0.362	0.184	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA18525	0.0	0.0	0.255	0.194	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA18939	0.567	0.55	0.057	0.039	nan	nan	0	1
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA19017	0.883	0.858	0.0	0.0	0.607	0.58	1	2
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA19238	0.475	0.461	0.104	0.04	0.24	0.24	1	1
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA19239	1.114	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA19625	1.055	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA19648	0.405	0.393	0.066	0.055	nan	nan	0	1
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA20502	0.0	0.0	0.239	0.178	nan	nan	0	0
chr8	138742943	138743864	DEL	922	NA20845	0.0	0.0	0.181	0.121	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG00096	0.0	0.0	0.091	0.198	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG00268	0.0	0.0	0.085	0.132	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG00419	0.0	0.0	0.074	0.181	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG00759	0.0	0.0	0.052	0.103	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG01051	1.013	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG01112	0.0	0.0	0.073	0.137	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG01500	0.526	0.491	0.023	0.037	nan	nan	0	1
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG01565	0.0	0.0	0.127	0.167	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG01583	0.0	0.0	0.108	0.075	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG01595	0.0	0.0	0.046	0.102	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG01879	0.421	0.394	0.022	0.043	nan	nan	0	1
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG02568	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG02922	0.553	0.517	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG03006	0.0	0.0	0.031	0.109	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG03052	0.929	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG03642	0.573	0.535	0.008	0.013	nan	nan	0	1
chr8	138743347	138743803	DEL	457	HG03742	0.0	0.0	0.029	0.067	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA12878	0.0	0.0	0.085	0.171	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA18525	0.0	0.0	0.113	0.2	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA18939	0.603	0.564	0.011	0.034	nan	nan	0	1
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA19017	0.902	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA19238	0.58	0.542	0.024	0.034	nan	nan	0	1
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA19239	1.232	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA19625	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA19648	0.405	0.378	0.028	0.028	nan	nan	0	1
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA20502	0.0	0.0	0.163	0.198	nan	nan	0	0
chr8	138743347	138743803	DEL	457	NA20845	0.0	0.0	0.093	0.121	nan	nan	0	0
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG00096	0.984	1.036	0.0	0.0	0.759	0.759	1	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG00268	0.92	0.968	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG00419	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG00759	0.658	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG01051	0.662	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG01112	0.885	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG01500	0.725	0.763	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG01565	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG01583	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG01595	0.532	0.56	0.0	0.039	0.464	0.464	1	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG01879	0.824	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG02568	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG02922	0.957	1.007	0.0	0.0	0.381	0.381	1	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG03006	0.237	0.25	0.0	0.031	0.643	0.643	1	1
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG03052	1.058	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG03642	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	HG03742	0.843	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA12878	0.843	0.887	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA18525	0.849	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA18939	0.695	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA19017	0.902	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA19238	0.83	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA19239	0.675	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA19625	1.132	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA19648	1.315	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA20502	1.047	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140142582	140142651	DEL	70	NA20845	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG00096	0.464	0.489	0.0	0.081	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG00268	1.026	1.08	0.0	0.007	0.895	0.876	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG00419	0.998	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG00759	1.156	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG01051	0.0	0.0	0.01	0.15	nan	nan	0	1
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG01112	0.895	0.942	0.0	0.0	0.353	0.353	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG01500	0.943	0.992	0.0	0.0	0.709	0.709	2	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG01565	0.444	0.467	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG01583	0.778	0.819	0.0	0.0	0.867	0.8	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG01595	0.838	0.882	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG01879	0.751	0.791	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG02568	0.694	0.73	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG02922	0.532	0.56	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG03006	1.004	1.057	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG03052	0.0	0.0	0.011	0.097	nan	nan	0	0
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG03642	0.647	0.681	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	HG03742	1.052	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA12878	0.929	0.978	0.0	0.0	0.476	0.476	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA18525	0.495	0.521	0.0	0.053	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA18939	0.0	0.0	0.007	0.169	nan	nan	0	0
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA19017	0.47	0.495	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA19238	0.461	0.486	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA19239	0.799	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA19625	0.206	0.217	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA19648	1.037	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA20502	0.652	0.686	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr8	140161364	140161557	DEL	194	NA20845	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG00096	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG00268	0.946	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG00419	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG00759	0.598	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG01051	0.6	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG01112	0.242	0.269	0.0	0.023	0.6	0.6	1	1
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG01500	0.888	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG01565	0.528	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG01583	0.608	0.676	0.0	0.0	0.9	0.831	1	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG01595	0.634	0.704	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG01879	0.659	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG02568	1.426	1.585	0.0	0.008	0.929	0.929	1	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG02922	0.489	0.544	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG03006	0.767	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG03052	0.583	0.648	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG03642	1.17	1.3	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	HG03742	0.615	0.683	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA12878	0.98	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA18525	0.566	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA18939	0.878	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA19017	0.789	0.877	0.0	0.0	0.95	0.995	1	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA19238	0.817	0.908	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA19239	0.76	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA19625	0.952	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA19648	1.062	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA20502	0.687	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	140517178	140517275	DEL	98	NA20845	0.667	0.741	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG00096	0.743	0.94	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG00268	0.548	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG00419	0.832	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG00759	0.578	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG01051	0.744	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG01112	0.485	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG01500	0.761	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG01565	0.528	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG01583	0.73	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG01595	0.859	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG01879	0.696	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG02568	0.964	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG02922	0.787	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG03006	0.694	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG03052	0.95	1.203	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG03642	0.921	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	HG03742	0.734	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA18525	0.743	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA18939	0.567	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA19017	0.639	0.809	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA19238	0.712	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA19239	0.642	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA19625	0.952	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA19648	1.366	1.729	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA20502	0.931	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	142398327	142398400	DUP	74	NA20845	0.689	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG00096	0.464	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG00268	0.566	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG00419	0.561	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG00759	0.259	0.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG01051	0.145	0.174	0.0	0.029	nan	nan	0	1
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG01112	0.391	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG01500	0.489	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG01565	0.359	0.433	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG01583	0.584	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG01595	0.388	0.468	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG01879	0.458	0.552	0.0	0.0	0.72	0.72	2	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG02568	0.501	0.604	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG02922	0.468	0.564	0.0	0.007	0.667	0.667	3	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG03006	0.457	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG03052	0.497	0.598	0.0	0.0	0.462	0.462	3	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG03642	0.622	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	HG03742	0.496	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA12878	0.705	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA18525	0.602	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA18939	0.64	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA19017	0.432	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA19238	0.514	0.619	0.0	0.0	0.585	0.585	2	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA19239	0.511	0.616	0.0	0.0	0.85	0.85	3	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA19625	0.463	0.558	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA19648	0.556	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA20502	0.582	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143177175	143177637	DEL	463	NA20845	0.489	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG00096	0.78	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG00268	0.902	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG00419	0.749	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG00759	0.578	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG01051	0.744	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG01112	0.522	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG01500	0.798	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG01565	0.528	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG01583	0.9	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG01595	0.552	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG02568	0.463	0.514	0.0	0.036	0.889	0.889	1	1
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG02922	0.787	0.874	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG03006	0.603	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG03052	0.518	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG03642	0.921	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	HG03742	0.774	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA12878	0.705	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA18525	0.885	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA18939	0.768	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA19017	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA19238	0.672	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA19239	0.537	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA19625	0.618	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA19648	0.961	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA20502	0.931	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	143273215	143273266	DEL	52	NA20845	0.578	0.642	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG00096	0.39	0.433	0.087	0.035	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG00268	0.0	0.0	0.221	0.116	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG00419	0.0	0.0	0.164	0.125	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG00759	0.0	0.0	0.218	0.129	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG01051	0.0	0.0	0.193	0.126	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG01112	0.503	0.559	0.039	0.021	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG01500	0.0	0.0	0.278	0.161	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG01565	0.0	0.0	0.181	0.096	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG01583	0.0	0.0	0.172	0.102	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG01595	0.634	0.704	0.052	0.024	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG01879	0.44	0.488	0.045	0.025	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG02568	0.463	0.514	0.04	0.033	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG02922	0.0	0.0	0.152	0.067	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG03006	0.0	0.0	0.153	0.062	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG03052	0.0	0.0	0.181	0.129	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG03642	0.423	0.47	0.047	0.031	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	HG03742	0.615	0.683	0.067	0.04	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA12878	0.0	0.0	0.223	0.175	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA18525	0.0	0.0	0.296	0.186	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA18939	0.457	0.508	0.065	0.042	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA19017	0.0	0.0	0.206	0.106	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA19238	0.0	0.0	0.319	0.14	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA19239	0.485	0.539	0.094	0.038	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA19625	0.0	0.0	0.173	0.047	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA19648	0.0	0.0	0.181	0.098	nan	nan	0	0
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA20502	0.489	0.543	0.066	0.027	nan	nan	0	1
chr8	143494784	143495714	DEL	931	NA20845	0.0	0.0	0.19	0.102	nan	nan	0	0
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG00096	0.854	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG00268	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG00419	0.582	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG00759	0.498	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG01051	0.538	0.566	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG01112	0.578	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG01500	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG01565	0.676	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG01583	0.657	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG01595	0.552	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG01879	0.605	0.636	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG02568	0.0	0.0	0.227	0.0	nan	nan	0	0
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG02922	0.638	0.672	0.0	0.0	0.733	0.733	3	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG03006	0.676	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG03052	0.842	0.886	0.0	0.0	0.795	0.795	2	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG03642	0.548	0.576	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	HG03742	0.714	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA12878	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA18525	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA18939	0.512	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA19017	0.677	0.712	0.0	0.0	0.533	0.559	3	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA19238	0.448	0.472	0.006	0.0	0.706	0.706	3	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA19239	0.485	0.51	0.0	0.0	0.741	0.741	3	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA19625	0.566	0.596	0.0	0.0	0.5	0.536	3	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA19648	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA20502	0.605	0.637	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr8	144435966	144436748	DEL	783	NA20845	0.622	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG00096	0.706	0.743	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG00268	0.884	0.931	0.0	0.0	0.462	0.452	1	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG00419	0.957	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG01051	0.786	0.827	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG01112	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG01500	0.852	0.897	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG01565	0.57	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG01583	0.9	0.947	0.0	0.0	0.533	0.578	1	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG01595	0.388	0.409	0.0	0.002	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG01879	0.769	0.81	0.0	0.0	0.726	0.726	2	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG02568	0.308	0.325	0.0	0.0	0.5	0.5	1	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG02922	0.872	0.918	0.0	0.0	0.476	0.476	3	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG03006	0.438	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG03052	0.734	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG03642	0.373	0.393	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	HG03742	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA12878	0.292	0.308	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA18525	0.495	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA18939	0.347	0.366	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA19017	0.827	0.87	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA19238	0.883	0.93	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA19239	0.459	0.483	0.0	0.006	nan	nan	0	1
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA19625	0.335	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA19648	0.835	0.879	0.0	0.003	0.25	0.25	1	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA20502	0.861	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	144709682	144710111	DEL	430	NA20845	0.511	0.538	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG00096	0.966	0.966	0.0	0.0	0.885	0.885	3	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG00268	0.831	0.831	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG00419	0.686	0.686	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG00759	1.037	1.037	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG01051	0.992	0.992	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG01112	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG01500	1.142	1.142	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG01565	0.95	0.95	0.0	0.0	0.847	0.847	2	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG01583	0.851	0.851	0.0	0.0	0.733	0.714	2	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG01595	0.838	0.838	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG01879	1.044	1.044	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG02568	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG02922	1.063	1.063	0.006	0.002	0.85	0.85	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG03006	0.749	0.749	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG03052	1.08	1.08	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG03642	0.647	0.647	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	HG03742	0.992	0.992	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA12878	0.997	0.997	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA18525	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA18939	0.695	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA19017	0.395	0.395	0.11	0.057	nan	nan	0	1
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA19238	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA19239	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA19625	1.055	1.055	0.0	0.0	0.895	0.835	3	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA19648	0.961	0.961	0.0	0.0	0.755	0.755	2	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA20502	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	14587968	14588741	DEL	774	NA20845	1.0	1.0	0.0	0.0	0.938	0.937	1	2
chr8	146042931	146043066	DUP	136	HG00759	0.678	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146042931	146043066	DUP	136	HG01583	0.997	1.108	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	146042931	146043066	DUP	136	HG01595	0.348	0.386	0.0	0.059	nan	nan	0	2
chr8	146042931	146043066	DUP	136	HG03642	0.871	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG00096	0.26	0.274	0.104	0.04	0.625	0.625	7	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG00268	0.0	0.0	0.444	0.077	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG00419	0.354	0.372	0.086	0.02	0.5	0.5	3	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG00759	0.598	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG01051	0.0	0.0	0.272	0.122	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG01112	0.0	0.0	0.079	0.019	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG01500	0.0	0.0	0.452	0.091	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG01565	0.338	0.356	0.091	0.038	nan	nan	0	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG01583	0.486	0.512	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG01595	0.675	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG01879	0.806	0.848	0.0	0.0	0.842	0.842	5	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG02568	0.308	0.325	0.032	0.014	nan	nan	0	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG02922	0.617	0.649	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG03006	0.292	0.308	0.115	0.015	0.35	0.35	4	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG03052	0.648	0.682	0.0	0.0	0.619	0.619	4	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG03642	0.622	0.655	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	146057037	146057833	DEL	797	HG03742	0.317	0.334	0.125	0.02	1.0	1.0	5	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA12878	0.0	0.0	0.422	0.055	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA18525	0.372	0.391	0.087	0.017	nan	nan	0	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA18939	0.494	0.52	0.056	0.029	nan	nan	0	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA19017	0.301	0.317	0.059	0.032	nan	nan	0	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA19238	0.435	0.458	0.122	0.018	nan	nan	0	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA19239	0.0	0.0	0.662	0.144	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA19625	0.335	0.352	0.034	0.004	0.4	0.429	8	1
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA19648	0.0	0.0	0.218	0.034	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA20502	0.0	0.0	0.32	0.08	nan	nan	0	0
chr8	146057037	146057833	DEL	797	NA20845	0.311	0.327	0.023	0.003	nan	nan	0	1
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG00096	0.632	0.761	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG00268	0.513	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG00419	0.561	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG00759	0.439	0.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG01051	0.455	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG01112	0.578	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG01500	0.489	0.59	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG01565	0.57	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG01583	1.095	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG01595	0.47	0.567	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG01879	0.22	0.265	0.0	0.057	0.714	0.714	1	1
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG02568	0.501	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG02922	0.532	0.641	0.0	0.007	0.5	0.5	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG03006	0.657	0.792	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG03052	0.799	0.963	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG03642	0.772	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	HG03742	0.694	0.837	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA12878	0.585	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA18525	0.548	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA18939	0.786	0.947	0.0	0.0	0.48	0.459	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA19017	0.902	1.087	0.0	0.0	0.667	0.636	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA19238	0.395	0.476	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA19239	0.537	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA19625	0.746	0.899	0.0	0.0	0.909	0.974	1	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA19648	0.759	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA20502	0.954	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146075158	146075243	DEL	86	NA20845	0.578	0.696	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG00096	0.0	0.0	0.013	0.168	nan	nan	0	0
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG00268	0.0	0.0	0.004	0.212	nan	nan	0	0
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG00419	0.915	0.888	0.0	0.0	0.636	0.636	2	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG00759	0.797	0.774	0.0	0.075	0.111	0.111	1	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG01051	1.302	1.265	0.0	0.0	0.651	0.651	2	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG01112	0.0	0.0	0.035	0.243	nan	nan	0	0
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG01500	0.852	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG01565	1.288	1.251	0.0	0.0	0.711	0.711	2	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG01583	0.681	0.661	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG01595	0.593	0.576	0.027	0.087	nan	nan	0	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG01879	0.513	0.498	0.009	0.075	nan	nan	0	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG02568	0.617	0.599	0.0	0.094	0.2	0.2	1	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG02922	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG03006	0.457	0.443	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG03052	1.231	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG03642	0.971	0.943	0.0	0.0	0.618	0.618	2	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	HG03742	0.0	0.0	0.006	0.179	nan	nan	0	0
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA12878	0.0	0.0	0.006	0.177	nan	nan	0	0
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA18525	0.548	0.533	0.017	0.084	nan	nan	0	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.21	nan	nan	0	0
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA19017	1.297	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA19238	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA19239	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA19625	1.004	0.974	0.0	0.0	0.867	0.809	1	2
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.205	nan	nan	0	0
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA20502	0.652	0.633	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr8	146192869	146193180	DEL	312	NA20845	0.0	0.0	0.037	0.177	nan	nan	0	0
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG00096	0.613	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG00268	0.46	0.43	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG00419	0.333	0.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG00759	0.578	0.54	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG01051	0.413	0.386	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG01112	0.671	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG01500	0.798	0.745	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG01565	0.676	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG01583	0.486	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG01595	0.45	0.42	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG01879	0.55	0.514	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG02568	0.463	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG02922	0.447	0.417	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG03006	0.274	0.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG03052	0.518	0.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG03642	0.498	0.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	HG03742	0.635	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA18525	0.814	0.761	0.0	0.002	0.895	0.895	1	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA18939	0.475	0.444	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA19017	0.62	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA19238	0.659	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA19239	0.629	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA19625	0.283	0.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA19648	0.253	0.236	0.0	0.012	0.818	0.818	1	1
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA20502	0.14	0.131	0.0	0.015	0.909	0.909	1	1
chr8	15219341	15219425	DEL	85	NA20845	0.689	0.644	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG00096	0.409	0.43	0.039	0.115	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG00268	0.619	0.652	0.005	0.076	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG00419	0.437	0.46	0.014	0.099	0.639	0.639	2	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG00759	0.738	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG01051	0.724	0.762	0.008	0.004	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG01112	0.708	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG01500	0.0	0.0	0.028	0.234	nan	nan	0	0
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG01565	0.0	0.0	0.063	0.189	nan	nan	0	0
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG01583	0.414	0.435	0.009	0.063	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG01595	0.797	0.839	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG01879	0.311	0.328	0.013	0.062	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG02568	0.925	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG02922	0.213	0.224	0.031	0.075	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG03006	0.511	0.538	0.028	0.107	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG03052	0.993	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG03642	0.0	0.0	0.108	0.233	nan	nan	0	0
chr8	16821865	16822240	DEL	376	HG03742	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA12878	0.894	0.941	0.0	0.0	0.516	0.516	1	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA18525	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA18939	0.603	0.635	0.019	0.083	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA19017	0.376	0.396	0.007	0.117	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA19238	1.081	1.138	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA19239	0.734	0.772	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA19625	0.926	0.975	0.0	0.0	0.613	0.572	2	2
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA19648	0.481	0.506	0.038	0.082	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA20502	0.535	0.564	0.02	0.081	nan	nan	0	1
chr8	16821865	16822240	DEL	376	NA20845	0.578	0.608	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.085	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG00759	1.296	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG01051	0.579	0.531	0.0	0.066	0.811	0.811	1	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG01500	1.124	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG01565	0.486	0.446	0.0	0.021	0.88	0.88	1	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG01595	0.613	0.563	0.0	0.039	0.594	0.594	1	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG02568	0.0	0.0	0.017	0.077	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.077	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG03006	1.041	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG03052	0.691	0.634	0.0	0.019	0.421	0.421	1	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA12878	0.98	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA18525	1.062	0.974	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA18939	0.439	0.403	0.0	0.053	0.9	0.941	1	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA19239	0.472	0.433	0.0	0.03	0.884	0.884	2	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA19625	0.772	0.708	0.0	0.048	0.851	0.849	2	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA20502	0.885	0.812	0.0	0.049	0.537	0.537	1	1
chr8	16984984	16985045	DEL	62	NA20845	0.578	0.53	0.0	0.04	0.647	0.647	1	1
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG00096	1.022	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG00268	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG00419	1.144	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG00759	0.917	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG01051	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG01112	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG01500	1.142	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG01565	0.993	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG01583	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG01595	1.227	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG01879	1.191	1.156	0.005	0.0	0.788	0.788	1	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG02568	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG02922	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG03006	0.475	0.461	0.064	0.092	nan	nan	0	1
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG03052	1.08	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG03642	0.523	0.508	0.04	0.073	nan	nan	0	1
chr8	18475687	18476154	DEL	468	HG03742	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA12878	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA18525	1.15	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA18939	0.969	0.941	0.0	0.0	0.893	0.854	1	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA19017	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA19238	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA19239	1.101	1.069	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA19625	1.312	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA19648	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA20502	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	18475687	18476154	DEL	468	NA20845	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG00096	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG00268	0.407	0.407	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG00419	0.894	0.894	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG00759	0.897	0.897	0.0	0.0	0.586	0.586	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG01051	0.806	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG01112	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG01500	0.87	0.87	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG01565	0.76	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG01583	0.997	0.997	0.0	0.0	0.278	0.256	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG01595	0.92	0.92	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG01879	0.769	0.769	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG02568	1.195	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG02922	1.085	1.085	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG03006	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG03052	1.166	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG03642	0.871	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	HG03742	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA12878	0.585	0.585	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA18525	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA18939	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA19017	1.09	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA19238	0.857	0.857	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA19239	0.93	0.93	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA19625	0.746	0.746	0.0	0.0	0.917	0.982	1	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA19648	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA20502	0.768	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	19055258	19055530	DEL	273	NA20845	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG00096	0.854	0.949	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG00268	0.92	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG00419	0.624	0.693	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG00759	0.877	0.975	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG01051	0.413	0.459	0.013	0.057	nan	nan	0	1
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG01112	0.839	0.932	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG01500	0.852	0.947	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG01565	0.971	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG01583	1.143	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG01595	0.818	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG01879	0.788	0.875	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG02568	1.079	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG02922	0.787	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG03006	0.676	0.751	0.0	0.0	0.64	0.64	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG03052	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG03642	0.622	0.692	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	HG03742	0.913	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA12878	0.98	1.089	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA18525	1.062	1.18	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA18939	0.841	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA19017	0.526	0.585	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA19238	0.382	0.425	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA19239	0.446	0.495	0.0	0.087	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA19625	0.721	0.801	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA19648	1.113	1.236	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA20502	0.838	0.931	0.0	0.0	0.476	0.476	1	2
chr8	21210046	21210313	DEL	268	NA20845	0.733	0.815	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG00096	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG00268	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG00419	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG00759	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG01051	0.476	0.501	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG01112	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG01500	0.87	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG01565	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG01583	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG01595	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG01879	0.348	0.366	0.025	0.075	nan	nan	0	1
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG02568	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG02922	0.766	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG03006	0.749	0.788	0.0	0.0	0.619	0.619	2	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG03052	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG03642	0.846	0.891	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	HG03742	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA12878	1.049	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA18525	0.991	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA18939	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA19017	0.921	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA19238	0.699	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA19239	1.127	1.186	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA19625	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA19648	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA20502	0.978	1.029	0.0	0.0	0.581	0.581	1	2
chr8	21210560	21211025	DEL	466	NA20845	0.689	0.725	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG00096	0.446	0.512	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG00419	0.0	0.0	0.006	0.218	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.179	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG01051	0.248	0.285	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG01112	0.783	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG01500	0.0	0.0	0.005	0.234	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG01565	0.296	0.34	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG01583	0.292	0.336	0.0	0.128	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG01595	0.0	0.0	0.015	0.156	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG01879	0.605	0.695	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG02568	0.386	0.443	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG02922	0.468	0.538	0.028	0.075	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.141	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.148	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	HG03742	0.0	0.0	0.014	0.171	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA12878	0.327	0.376	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA18525	0.0	0.0	0.028	0.215	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA18939	0.293	0.336	0.024	0.1	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA19017	0.0	0.0	0.017	0.203	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA19238	0.369	0.424	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA19239	0.0	0.0	0.006	0.212	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA19625	0.283	0.325	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA19648	0.228	0.262	0.011	0.065	nan	nan	0	1
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA20502	0.0	0.0	0.018	0.212	nan	nan	0	0
chr8	2122088	2122354	DEL	267	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	0
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG00096	0.464	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG00268	0.637	0.708	0.0	0.0	0.756	0.758	2	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG00419	0.291	0.323	0.086	0.062	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG00759	0.319	0.354	0.034	0.042	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG01051	0.227	0.253	0.059	0.043	0.364	0.364	1	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG01112	0.503	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG01500	0.78	0.866	0.0	0.0	0.628	0.628	2	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG01565	0.528	0.587	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG01583	0.389	0.432	0.0	0.0	0.833	0.903	1	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG01595	0.327	0.363	0.043	0.023	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG01879	0.476	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG02568	0.27	0.3	0.094	0.078	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG02922	0.234	0.26	0.057	0.044	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG03006	0.402	0.446	0.0	0.0	0.746	0.746	2	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG03052	0.389	0.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG03642	0.597	0.664	0.0	0.0	0.512	0.512	2	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	HG03742	0.714	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA12878	0.533	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA18525	0.425	0.472	0.039	0.036	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA18939	0.0	0.0	0.304	0.232	nan	nan	0	0
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA19017	0.282	0.313	0.074	0.059	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA19238	0.277	0.308	0.048	0.033	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA19239	0.668	0.743	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA19625	0.257	0.286	0.087	0.075	nan	nan	0	1
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA19648	0.531	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA20502	0.605	0.672	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr8	23407217	23407862	DEL	646	NA20845	0.622	0.691	0.0	0.0	0.757	0.757	2	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG00096	1.17	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG00268	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG00419	1.185	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG00759	1.296	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG01051	1.137	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG01112	1.305	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG01500	1.269	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG01565	0.993	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG01583	1.168	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG01595	1.206	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG01879	0.568	0.531	0.0	0.075	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG02568	0.54	0.504	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG02922	1.425	1.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG03006	1.059	0.99	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG03052	1.306	1.221	0.0	0.0	0.537	0.537	1	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG03642	0.971	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	HG03742	1.032	0.964	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA12878	1.109	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA18525	1.327	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA18939	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA19017	1.334	1.247	0.0	0.0	0.941	0.986	1	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA19238	1.16	1.084	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA19239	1.035	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA19625	1.209	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA19648	1.163	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA20502	1.047	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	23898463	23898598	DEL	136	NA20845	1.178	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.045	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG00419	0.0	0.0	0.005	0.058	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG02922	0.617	0.599	0.0	0.016	0.64	0.64	1	1
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.063	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.048	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.037	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.033	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.077	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr8	25327221	25327278	DEL	58	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG00096	0.687	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG00268	0.867	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG00419	0.749	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG00759	0.857	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG01051	0.806	0.971	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG01112	0.867	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG01500	0.78	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG01565	0.803	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG01583	1.046	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG01595	0.961	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG01879	0.44	0.53	0.0	0.023	0.389	0.389	1	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG02568	0.848	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG02922	0.553	0.666	0.0	0.061	0.444	0.444	1	1
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG03006	0.804	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG03052	1.058	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG03642	1.046	1.26	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	HG03742	0.933	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA12878	0.825	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA18525	0.885	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA18939	0.932	1.123	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA19017	1.222	1.472	0.0	0.0	0.812	0.851	1	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA19238	0.804	0.969	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA19239	0.59	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA19625	0.849	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA19648	0.809	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA20502	0.791	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	27180312	27180401	DEL	90	NA20845	0.822	0.991	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG00096	0.0	0.0	0.004	0.132	nan	nan	0	0
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG00268	0.531	0.559	0.0	0.0	0.933	0.954	1	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG00419	0.416	0.438	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG00759	0.478	0.504	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG01051	0.538	0.566	0.0	0.007	0.667	0.667	2	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG01112	0.317	0.334	0.011	0.067	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG01500	0.308	0.324	0.008	0.107	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.168	nan	nan	0	0
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG01583	0.341	0.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG01595	0.388	0.409	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG01879	0.385	0.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG02568	0.154	0.162	0.0	0.045	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG02922	0.17	0.179	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG03006	0.219	0.231	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG03052	0.324	0.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG03642	0.398	0.419	0.016	0.048	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	HG03742	0.278	0.292	0.0	0.0	0.609	0.609	2	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA12878	0.172	0.181	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA18525	0.725	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA18939	0.457	0.481	0.0	0.0	0.3	0.287	1	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA19017	0.0	0.0	0.013	0.16	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA19238	0.514	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA19239	0.537	0.566	0.0	0.003	0.1	0.1	1	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA19625	0.309	0.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	1
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA20502	0.582	0.613	0.0	0.0	0.6	0.6	2	2
chr8	2778563	2778787	DEL	225	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	0
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG00096	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG00268	0.672	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG00419	0.665	0.7	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG00759	0.578	0.609	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG01051	0.682	0.718	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG01112	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG01500	0.761	0.801	0.0	0.0	0.88	0.88	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG01565	0.697	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG01583	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG01595	0.644	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG01879	0.678	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG02568	0.887	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG02922	0.362	0.381	0.023	0.007	0.3	0.3	14	1
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG03006	0.639	0.673	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG03052	0.691	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG03642	0.573	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	HG03742	0.595	0.627	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA12878	0.825	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA18525	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA18939	0.804	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA19017	0.902	0.95	0.0	0.0	0.538	0.514	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA19238	0.58	0.611	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA19239	0.786	0.828	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA19625	0.386	0.406	0.042	0.014	nan	nan	0	1
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA19648	0.733	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA20502	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	28463580	28464263	DEL	684	NA20845	0.744	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG00096	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG00268	0.407	0.428	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG00419	0.853	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG00759	0.698	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG01051	0.682	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG01112	0.848	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG01500	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG01565	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG01583	0.535	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG01595	0.756	0.796	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG01879	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG02568	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG02922	0.787	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG03006	0.657	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG03052	0.713	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG03642	0.697	0.734	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	HG03742	0.615	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA12878	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA18525	0.513	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA18939	0.64	0.674	0.0	0.0	0.714	0.683	1	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA19017	0.507	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA19238	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA19239	0.708	0.745	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA19625	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA19648	0.759	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA20502	0.885	0.931	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	29818284	29818407	DEL	124	NA20845	0.533	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG00096	1.04	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG00268	0.371	0.391	0.102	0.078	nan	nan	0	1
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG00419	0.478	0.503	0.068	0.048	nan	nan	0	1
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG00759	0.877	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG01051	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG01112	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG01500	1.07	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG01565	0.95	1.0	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG01583	1.07	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG01595	0.552	0.581	0.09	0.059	nan	nan	0	1
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG01879	0.788	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG02568	0.54	0.568	0.069	0.04	nan	nan	0	1
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG02922	0.957	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG03006	1.114	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG03052	0.0	0.0	0.266	0.208	nan	nan	0	0
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG03642	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	HG03742	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA12878	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA18525	0.531	0.559	0.095	0.063	nan	nan	0	1
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA18939	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA19017	1.034	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA19238	0.962	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA19239	0.0	0.0	0.307	0.193	nan	nan	0	0
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA19625	0.54	0.569	0.096	0.061	nan	nan	0	1
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA19648	0.607	0.639	0.035	0.025	nan	nan	0	1
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA20502	1.001	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	29837501	29838269	DEL	769	NA20845	0.444	0.468	0.051	0.035	nan	nan	0	1
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG00096	0.762	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG00268	0.548	0.577	0.06	0.0	0.074	0.072	1	1
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG00419	0.853	0.897	0.0	0.0	0.771	0.771	4	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG00759	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG01051	0.496	0.522	0.049	0.0	0.188	0.188	8	1
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG01112	0.988	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG01500	0.906	0.954	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG01565	0.803	0.845	0.0	0.0	0.655	0.655	4	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG01583	0.973	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG01595	0.572	0.603	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG01879	0.586	0.617	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG02568	0.617	0.649	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG02922	0.723	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG03006	0.84	0.884	0.0	0.0	0.82	0.82	4	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG03052	0.691	0.727	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG03642	0.448	0.472	0.086	0.0	0.111	0.111	1	1
chr8	30596302	30596894	DEL	593	HG03742	0.675	0.71	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA12878	0.98	1.032	0.0	0.0	0.747	0.747	4	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA18525	0.761	0.801	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA18939	0.804	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA19017	0.883	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA19238	0.896	0.944	0.0	0.005	0.836	0.836	4	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA19239	0.957	1.007	0.0	0.004	0.914	0.914	1	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA19625	1.055	1.111	0.0	0.0	0.44	0.437	2	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA19648	0.683	0.719	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA20502	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	30596302	30596894	DEL	593	NA20845	0.333	0.351	0.066	0.0	0.375	0.375	4	1
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG00096	0.687	0.642	0.0	0.093	nan	nan	0	1
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG00268	0.548	0.513	0.005	0.118	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG00419	1.144	1.069	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG00759	1.316	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG01051	0.951	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG01112	0.727	0.679	0.017	0.08	nan	nan	0	1
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG01500	1.16	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG01565	0.993	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG01583	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG01595	0.879	0.822	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG01879	1.136	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG02568	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG02922	0.553	0.517	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG03006	1.132	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG03052	1.339	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG03642	1.12	1.047	0.0	0.004	0.769	0.769	1	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	HG03742	1.141	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA12878	1.307	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA18525	1.451	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA18939	1.261	1.179	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA19017	0.752	0.703	0.009	0.11	nan	nan	0	1
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA19238	1.147	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA19239	0.708	0.661	0.0	0.112	nan	nan	0	1
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA19625	0.412	0.385	0.008	0.085	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA19648	1.265	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA20502	1.117	1.044	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34022524	34022805	DEL	282	NA20845	1.111	1.038	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG00096	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG00268	1.344	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG00419	0.873	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG00759	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG01051	0.972	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG01112	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG01500	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG01565	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG01583	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG01595	1.176	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG01879	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG02568	0.848	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG02922	0.872	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG03006	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG03052	1.188	1.153	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG03642	1.245	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	HG03742	0.913	0.886	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA12878	0.929	0.902	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA18525	0.973	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA18939	0.695	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA19017	0.583	0.566	0.0	0.014	0.767	0.803	1	1
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA19238	1.378	1.337	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA19239	1.114	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA19625	0.386	0.375	0.0	0.038	0.95	0.982	1	1
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA19648	0.986	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA20502	1.141	1.107	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34068159	34068210	DEL	52	NA20845	1.289	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG00096	0.464	0.451	0.0	0.035	0.967	0.967	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG00268	0.566	0.55	0.0	0.035	0.538	0.55	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG00419	0.749	0.727	0.0	0.046	0.578	0.578	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG00759	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG01051	1.323	1.285	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG01112	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG01500	1.287	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG01565	1.331	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG01583	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG01595	1.084	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG01879	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG02568	1.079	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG02922	0.723	0.702	0.0	0.026	0.312	0.312	1	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG03006	1.37	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG03052	0.669	0.65	0.0	0.067	0.824	0.824	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG03642	0.324	0.314	0.01	0.015	0.467	0.467	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	HG03742	0.754	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA12878	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA18525	0.584	0.567	0.0	0.022	0.5	0.5	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA18939	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA19017	0.639	0.62	0.0	0.023	0.65	0.681	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA19238	0.448	0.435	0.0	0.031	0.8	0.8	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA19239	0.603	0.585	0.0	0.037	0.607	0.607	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA19625	0.437	0.425	0.0	0.038	0.731	0.783	1	1
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA19648	1.062	1.031	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA20502	1.234	1.198	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34166427	34166495	DEL	69	NA20845	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG00096	1.04	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG00268	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG00419	0.457	0.457	0.015	0.087	nan	nan	0	1
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG00759	0.379	0.379	0.01	0.107	nan	nan	0	1
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG01051	1.158	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG01112	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG01500	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG01565	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG01583	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG01595	0.9	0.9	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG01879	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG02568	0.848	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG02922	1.063	1.063	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG03006	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG03052	0.799	0.799	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG03642	1.145	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	HG03742	0.933	0.933	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA12878	0.774	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA18525	0.318	0.318	0.007	0.094	nan	nan	0	1
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA18939	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA19017	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA19238	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA19239	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA19625	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA19648	1.088	1.088	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA20502	0.954	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34360005	34360382	DEL	378	NA20845	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG00096	1.282	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG00268	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG00419	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG00759	1.156	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG01051	0.413	0.413	0.0	0.012	0.75	0.75	1	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG01112	0.485	0.485	0.0	0.032	0.826	0.826	1	1
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG01500	1.015	1.015	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG01565	0.422	0.422	0.0	0.022	0.938	0.938	1	1
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG01583	0.365	0.365	0.0	0.029	0.833	0.903	1	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG01595	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG01879	0.641	0.641	0.0	0.029	0.553	0.553	1	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG02568	0.655	0.655	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG02922	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG03006	1.26	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG03052	0.345	0.345	0.0	0.024	0.812	0.812	1	1
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG03642	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	HG03742	0.675	0.675	0.0	0.024	0.514	0.514	1	1
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA12878	0.516	0.516	0.0	0.02	0.529	0.529	1	1
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA18525	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA18939	1.06	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA19017	0.601	0.601	0.0	0.033	0.75	0.786	1	1
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA19238	1.068	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA19239	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA19625	0.412	0.412	0.0	0.023	0.455	0.487	1	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA19648	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA20502	0.908	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	34426188	34426252	DEL	65	NA20845	0.6	0.6	0.0	0.031	0.611	0.611	1	1
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG00096	0.984	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG00268	0.531	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG00419	0.769	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG00759	0.738	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG01051	0.724	0.762	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG01112	0.652	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG01500	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG01565	0.76	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG01583	1.07	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG01595	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG01879	1.172	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG02568	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG02922	0.595	0.627	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG03006	0.548	0.577	0.0	0.019	0.483	0.483	1	1
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG03052	0.669	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG03642	0.859	0.904	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	HG03742	0.556	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA12878	0.636	0.67	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA18525	0.557	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA18939	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA19017	0.658	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA19238	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA19239	1.048	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA19625	0.939	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA19648	0.86	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA20502	0.885	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	35344709	35344766	DEL	58	NA20845	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG00096	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG00268	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG00419	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG00759	1.156	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG01051	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG01112	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG01500	1.07	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG01565	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG01583	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG01595	0.941	0.99	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG01879	1.081	1.138	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG02568	0.463	0.487	0.0	0.033	0.727	0.727	1	1
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG02922	1.042	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG03006	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG03052	0.907	0.955	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG03642	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	HG03742	0.794	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA12878	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA18525	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA18939	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA19017	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA19238	1.2	1.263	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA19239	1.127	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA19625	1.132	1.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA19648	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA20502	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	36836261	36836317	DEL	57	NA20845	0.933	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG00096	0.576	0.606	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG00268	0.672	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG00419	0.457	0.482	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG00759	0.459	0.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG01051	0.724	0.762	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG01112	0.727	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG01500	0.743	0.782	0.0	0.0	0.844	0.844	2	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG01565	0.824	0.867	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG01583	0.657	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG01595	0.613	0.646	0.0	0.0	0.354	0.354	2	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG01879	0.696	0.733	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG02568	0.54	0.568	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG02922	0.787	0.828	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG03006	0.621	0.654	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG03052	0.324	0.341	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG03642	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	HG03742	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA12878	0.843	0.887	0.0	0.0	0.595	0.595	2	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA18525	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA18939	0.457	0.481	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA19017	0.338	0.356	0.024	0.099	nan	nan	0	1
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA19238	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA19239	0.695	0.731	0.0	0.0	0.83	0.83	2	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA19625	0.54	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA19648	0.303	0.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA20502	0.512	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39511653	39512031	DEL	379	NA20845	0.622	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG00096	0.316	0.332	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG00268	0.743	0.782	0.0	0.0	0.696	0.711	1	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG00419	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG00759	0.419	0.441	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG01051	0.806	0.849	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG01112	0.559	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG01500	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG01565	0.507	0.534	0.0	0.049	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG01583	0.486	0.512	0.0	0.03	0.381	0.413	2	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG01595	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG01879	0.989	1.041	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG02568	1.041	1.096	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG02922	0.829	0.873	0.0	0.0	0.929	0.929	1	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG03006	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG03052	0.453	0.477	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG03642	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	HG03742	0.952	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA12878	0.344	0.362	0.004	0.05	nan	nan	0	1
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA18525	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA18939	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA19017	0.996	1.048	0.0	0.0	0.667	0.636	1	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA19238	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA19239	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA19625	0.54	0.569	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA19648	0.0	0.0	0.008	0.116	nan	nan	0	1
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA20502	0.908	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39737280	39737510	DEL	231	NA20845	0.378	0.398	0.009	0.053	nan	nan	0	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG00096	0.687	0.63	0.008	0.053	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG00268	0.601	0.552	0.024	0.049	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG00419	0.665	0.61	0.046	0.061	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG00759	1.077	0.988	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG01051	0.641	0.588	0.013	0.037	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG01112	0.969	0.889	0.0	0.0	0.76	0.76	5	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG01500	1.106	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG01565	1.457	1.337	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG01583	1.143	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG01595	0.532	0.488	0.014	0.103	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG01879	0.586	0.538	0.015	0.025	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG02568	0.925	0.849	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG02922	1.34	1.229	0.0	0.0	0.576	0.576	1	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG03006	1.077	0.988	0.0	0.0	0.704	0.704	3	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG03052	1.36	1.248	0.0	0.0	0.719	0.719	1	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG03642	0.697	0.639	0.012	0.069	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	HG03742	1.31	1.201	0.0	0.0	0.575	0.575	5	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA12878	0.774	0.71	0.0	0.0	0.808	0.808	1	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA18525	1.062	0.974	0.0	0.0	1.0	1.0	3	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA18939	0.585	0.537	0.014	0.108	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA19017	1.146	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA19238	1.041	0.955	0.0	0.0	0.972	0.972	1	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA19239	1.441	1.322	0.0	0.0	0.807	0.807	1	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA19625	1.312	1.204	0.0	0.005	0.955	0.978	1	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA19648	0.658	0.603	0.031	0.062	nan	nan	0	1
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA20502	1.047	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	3994862	3995320	DEL	459	NA20845	1.444	1.325	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG00096	0.52	0.598	0.0	0.039	0.625	0.625	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG00268	0.973	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG00419	0.478	0.55	0.008	0.034	0.294	0.294	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG00759	0.797	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG01051	0.289	0.333	0.0	0.024	0.929	0.929	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	0
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG01500	0.381	0.438	0.0	0.023	0.682	0.682	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG01565	0.739	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG01595	0.0	0.0	0.013	0.079	nan	nan	0	0
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG01879	0.879	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG02568	0.617	0.709	0.0	0.039	0.429	0.429	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG02922	0.574	0.66	0.0	0.047	0.458	0.458	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG03006	0.383	0.441	0.0	0.027	0.19	0.19	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG03052	0.561	0.645	0.0	0.035	0.375	0.375	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	0
chr8	39976061	39976151	DEL	91	HG03742	0.377	0.433	0.0	0.028	0.542	0.542	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA12878	0.499	0.573	0.0	0.023	0.344	0.344	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA18525	0.566	0.651	0.0	0.027	0.483	0.483	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA18939	0.622	0.714	0.0	0.025	0.265	0.277	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA19017	0.413	0.475	0.0	0.015	0.409	0.429	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA19238	0.316	0.364	0.0	0.044	0.9	0.9	1	1
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA19239	0.773	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA19625	1.184	1.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.075	nan	nan	0	0
chr8	39976061	39976151	DEL	91	NA20845	0.422	0.485	0.0	0.031	0.833	0.833	1	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG00096	0.353	0.353	0.072	0.033	nan	nan	0	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG00268	0.371	0.371	0.072	0.043	nan	nan	0	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG00419	0.998	0.998	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG00759	0.817	0.817	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG01051	0.558	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG01112	0.69	0.69	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG01500	0.489	0.489	0.047	0.041	nan	nan	0	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG01565	0.317	0.317	0.068	0.042	nan	nan	0	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG01583	0.924	0.924	0.0	0.0	0.5	0.542	1	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG01595	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG01879	0.44	0.44	0.046	0.023	nan	nan	0	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG02568	0.848	0.848	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG02922	1.085	1.085	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG03006	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG03052	0.648	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG03642	0.822	0.822	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	HG03742	0.675	0.675	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA12878	0.396	0.396	0.034	0.025	nan	nan	0	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA18525	0.778	0.778	0.0	0.0	0.605	0.605	2	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA18939	0.804	0.804	0.0	0.0	0.792	0.757	2	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA19017	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA19238	0.778	0.778	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA19239	0.878	0.878	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA19625	0.412	0.412	0.098	0.037	nan	nan	0	1
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA19648	0.0	0.0	0.265	0.157	nan	nan	0	0
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA20502	0.954	0.954	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr8	40469706	40470386	DEL	681	NA20845	0.467	0.467	0.079	0.032	nan	nan	0	1
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG00096	0.966	0.966	0.0	0.0	0.832	0.832	4	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG00268	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG00419	0.894	0.894	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG00759	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG01051	0.703	0.703	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG01112	0.727	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG01500	0.979	0.979	0.005	0.004	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG01565	1.035	1.035	0.006	0.003	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG01583	0.827	0.827	0.0	0.0	0.615	0.667	1	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG01595	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG01879	0.861	0.861	0.003	0.0	0.789	0.789	1	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG02568	0.617	0.617	0.022	0.018	nan	nan	0	1
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG02922	0.851	0.851	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG03006	1.114	1.114	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG03052	1.101	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG03642	0.971	0.971	0.012	0.004	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	HG03742	0.813	0.813	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA12878	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA18525	1.132	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA18939	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA19017	0.94	0.94	0.008	0.0	0.909	0.868	1	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA19238	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA19239	1.075	1.075	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA19625	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA19648	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA20502	0.908	0.908	0.002	0.002	nan	nan	0	2
chr8	42298940	42299584	DEL	645	NA20845	0.933	0.933	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG00096	0.966	0.903	0.0	0.0	0.531	0.531	2	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG00268	1.238	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG00419	0.853	0.797	0.0	0.0	0.852	0.852	2	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG00759	1.196	1.118	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG01051	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG01112	0.988	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG01500	1.197	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG01565	0.908	0.849	0.0	0.004	0.769	0.769	3	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG01583	1.022	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG01595	1.063	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG01879	1.008	0.942	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG02568	0.386	0.36	0.088	0.095	nan	nan	0	1
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG02922	1.17	1.093	0.0	0.0	0.68	0.68	2	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG03006	1.004	0.939	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG03052	1.231	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG03642	1.145	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	HG03742	1.19	1.113	0.0	0.0	0.577	0.577	3	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA12878	0.86	0.804	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA18525	1.168	1.091	0.005	0.0	0.849	0.849	2	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA18939	1.042	0.974	0.0	0.0	0.767	0.733	1	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA19017	0.789	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA19238	1.094	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA19239	0.537	0.502	0.018	0.082	nan	nan	0	1
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA19625	1.287	1.202	0.0	0.0	0.933	0.931	2	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA19648	1.29	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA20502	1.234	1.153	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	4318509	4319035	DEL	527	NA20845	0.956	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG00096	0.836	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG00268	0.831	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG00419	0.832	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG00759	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG01051	0.455	0.479	0.049	0.023	nan	nan	0	1
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG01112	0.82	0.863	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG01500	0.816	0.859	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG01565	0.401	0.422	0.05	0.038	nan	nan	0	1
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG01583	0.803	0.845	0.0	0.0	0.636	0.689	1	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG01595	0.716	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG01879	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG02568	0.848	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG02922	0.744	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG03006	0.694	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG03052	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG03642	0.747	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	HG03742	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA12878	0.86	0.905	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA18525	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA18939	0.951	1.001	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA19017	0.677	0.712	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA19238	0.811	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA19239	0.904	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA19625	0.669	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA19648	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA20502	0.885	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	48818953	48819925	DEL	973	NA20845	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG00096	1.096	1.096	0.0	0.0	0.828	0.828	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG00268	1.114	1.114	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG00419	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG00759	0.877	0.877	0.0	0.0	0.462	0.462	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG01051	0.91	0.91	0.0	0.002	0.619	0.619	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG01112	1.081	1.081	0.0	0.0	0.677	0.677	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG01500	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG01565	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG01583	0.462	0.462	0.05	0.042	nan	nan	0	1
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG01595	1.084	1.084	0.0	0.0	0.755	0.755	2	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG01879	0.788	0.788	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG02568	1.118	1.118	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG02922	0.957	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG03006	0.986	0.986	0.0	0.0	0.923	0.923	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG03052	1.144	1.144	0.0	0.0	0.892	0.892	2	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG03642	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	HG03742	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA12878	0.361	0.361	0.048	0.039	nan	nan	0	1
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA18525	1.15	1.15	0.0	0.0	0.595	0.595	1	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA18939	1.207	1.207	0.0	0.0	0.793	0.759	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA19017	0.883	0.883	0.0	0.0	0.52	0.545	1	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA19238	0.949	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA19239	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA19625	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA19648	1.012	1.012	0.0	0.0	0.789	0.789	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA20502	1.071	1.071	0.0	0.0	0.783	0.783	3	2
chr8	49093381	49093979	DEL	599	NA20845	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG00096	0.464	0.464	0.0	0.09	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG00268	0.902	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG00419	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG00759	0.977	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG01051	0.496	0.496	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG01112	0.28	0.28	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG01500	1.07	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG01583	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG01595	0.838	0.838	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG02568	0.54	0.54	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG02922	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG03006	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG03052	0.885	0.885	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG03642	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	HG03742	0.397	0.397	0.0	0.091	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.134	nan	nan	0	0
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA18525	0.531	0.531	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA18939	0.366	0.366	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA19017	0.827	0.827	0.0	0.0	0.8	0.764	1	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA19238	0.804	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA19239	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA19625	0.952	0.952	0.0	0.0	0.9	0.964	1	2
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA19648	0.556	0.556	0.0	0.035	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA20502	0.652	0.652	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr8	50009190	50009334	DEL	145	NA20845	0.756	0.756	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG00096	0.984	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG00268	0.442	0.429	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG00419	0.915	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG00759	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG01051	0.476	0.462	0.007	0.071	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG01112	0.485	0.471	0.016	0.1	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG01500	1.07	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG01565	0.0	0.0	0.026	0.14	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG01583	0.414	0.401	0.0	0.117	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG01595	0.0	0.0	0.012	0.212	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG01879	0.33	0.32	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG02568	0.54	0.524	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG02922	0.659	0.64	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG03006	0.0	0.0	0.008	0.203	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG03052	0.0	0.0	0.009	0.209	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG03642	0.597	0.58	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr8	52023761	52024037	DEL	277	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.195	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.146	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA18525	1.008	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA18939	0.951	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.178	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA19238	0.0	0.0	0.005	0.228	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	0
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA19625	1.287	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA19648	0.91	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA20502	1.024	0.994	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	52023761	52024037	DEL	277	NA20845	0.4	0.388	0.011	0.05	nan	nan	0	1
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG00096	0.799	0.841	0.0	0.0	0.92	0.92	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG00268	0.425	0.447	0.088	0.054	nan	nan	0	1
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG00419	0.873	0.919	0.0	0.0	0.767	0.767	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG00759	0.778	0.818	0.0	0.0	0.58	0.58	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG01051	0.734	0.773	0.0	0.0	0.885	0.885	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG01112	0.988	1.04	0.0	0.0	0.575	0.575	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG01500	0.816	0.859	0.0	0.0	0.691	0.691	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG01565	0.76	0.8	0.0	0.0	0.692	0.692	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG01583	0.486	0.512	0.081	0.044	nan	nan	0	1
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG01595	0.572	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG01879	0.806	0.848	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG02568	0.887	0.933	0.0	0.0	0.727	0.727	3	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG02922	0.766	0.806	0.0	0.0	0.772	0.772	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG03006	0.767	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG03052	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG03642	0.822	0.865	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	HG03742	0.397	0.418	0.126	0.067	nan	nan	0	1
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA12878	0.98	1.032	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA18525	0.761	0.801	0.0	0.0	0.899	0.899	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA18939	0.823	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA19017	0.601	0.633	0.071	0.033	nan	nan	0	1
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA19238	0.804	0.846	0.0	0.0	0.97	0.97	2	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA19239	0.852	0.897	0.0	0.0	0.811	0.811	1	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA19625	0.926	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA19648	0.683	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA20502	0.396	0.417	0.13	0.085	nan	nan	0	1
chr8	53700881	53701702	DEL	822	NA20845	0.644	0.678	0.0	0.0	0.444	0.444	2	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG00096	1.244	1.131	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG00268	1.451	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG00419	1.331	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG00759	1.196	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG01051	0.765	0.695	0.025	0.084	nan	nan	0	1
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG01112	1.323	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG01500	1.632	1.483	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG01565	1.447	1.315	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG01583	1.119	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG01595	1.748	1.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG01879	0.0	0.0	0.022	0.29	nan	nan	0	0
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG02568	1.079	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG02922	0.574	0.522	0.01	0.087	nan	nan	0	1
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG03006	1.552	1.411	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG03052	1.49	1.355	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG03642	1.294	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	HG03742	1.587	1.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA12878	0.447	0.406	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA18525	1.203	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA18939	1.298	1.18	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA19017	1.485	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA19238	1.252	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA19239	1.415	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA19625	1.158	1.053	0.0	0.0	0.69	0.739	1	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA19648	1.467	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA20502	1.117	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56107697	56108054	DEL	358	NA20845	1.511	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG00268	0.23	0.256	0.0	0.012	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG00419	0.853	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG00759	0.199	0.222	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	0
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.044	nan	nan	0	0
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG01595	0.409	0.454	0.0	0.014	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG01879	0.275	0.305	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG02568	0.347	0.386	0.0	0.038	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG02922	0.787	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG03006	0.365	0.406	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG03052	0.54	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.088	nan	nan	0	0
chr8	56658598	56658734	DEL	137	HG03742	0.198	0.22	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA12878	0.653	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA18525	0.725	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.081	nan	nan	0	0
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA19239	0.485	0.539	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA19625	0.566	0.629	0.0	0.0	0.571	0.533	1	2
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA19648	0.253	0.281	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.123	nan	nan	0	1
chr8	56658598	56658734	DEL	137	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.084	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG00759	0.0	0.0	0.007	0.089	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG01112	0.0	0.0	0.011	0.118	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG01595	0.0	0.0	0.006	0.093	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG02568	0.732	0.672	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.087	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG03006	0.639	0.586	0.0	0.025	nan	nan	0	1
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG03052	0.799	0.733	0.0	0.041	0.341	0.341	1	1
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA18939	0.0	0.0	0.009	0.108	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA19017	0.0	0.0	0.006	0.111	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA19239	0.0	0.0	0.002	0.103	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA19625	0.695	0.637	0.0	0.041	nan	nan	0	1
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	0
chr8	56676277	56676407	DEL	131	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.087	nan	nan	0	0
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG00096	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG00268	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG00419	0.707	0.707	0.0	0.0	0.885	0.885	2	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG00759	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG01112	0.951	0.951	0.004	0.0	0.913	0.913	1	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG01500	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG01595	0.634	0.634	0.0	0.0	0.823	0.823	2	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG02568	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG02922	0.681	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG03006	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG03052	0.929	0.929	0.0	0.0	0.76	0.76	1	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	HG03642	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA18525	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA18939	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA19017	0.789	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA19238	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA19239	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA19625	1.132	1.132	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA19648	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA20502	1.35	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	5744849	5744923	DUP	75	NA20845	0.8	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG00096	1.04	1.095	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG00268	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG00419	1.185	1.248	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG00759	0.678	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG01051	0.951	1.001	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG01112	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG01500	0.707	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG01565	0.866	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG01583	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG01595	0.981	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG01879	0.733	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG02568	0.848	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG02922	1.0	1.052	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG03006	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG03052	1.036	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG03642	0.672	0.708	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	HG03742	0.496	0.522	0.0	0.036	0.593	0.593	1	1
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA12878	1.032	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA18525	1.115	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA18939	1.115	1.174	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA19017	1.052	1.108	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA19238	0.949	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA19239	1.258	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA19625	1.184	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA19648	0.733	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA20502	1.001	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	57598241	57598299	DEL	59	NA20845	0.6	0.632	0.0	0.019	0.619	0.619	1	1
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG00096	1.022	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG00268	1.026	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG00419	1.123	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG00759	1.396	1.469	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG01051	1.364	1.436	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG01112	1.007	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG01500	0.435	0.458	0.0	0.052	0.833	0.833	1	1
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG01565	0.993	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG01583	0.997	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG01595	0.92	0.968	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG01879	1.062	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG02568	1.311	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG02922	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG03006	1.242	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG03052	1.058	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG03642	1.145	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	HG03742	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA12878	0.739	0.778	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA18525	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA18939	1.079	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA19017	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA19238	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA19239	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA19625	1.107	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA19648	0.986	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA20502	1.024	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	58822615	58822684	DEL	70	NA20845	1.178	1.24	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG00096	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG00268	0.973	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG00419	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG00759	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG01051	0.703	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG01112	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG01500	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG01565	0.76	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG01583	0.778	0.778	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG01595	0.225	0.225	0.0	0.04	0.846	0.846	1	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG01879	0.366	0.366	0.0	0.051	0.75	0.75	1	1
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG02568	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG02922	0.638	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG03006	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG03052	0.885	0.885	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG03642	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	HG03742	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA12878	0.929	0.929	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA18525	0.672	0.672	0.0	0.029	0.357	0.357	1	1
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA18939	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA19017	0.564	0.564	0.0	0.027	0.865	0.906	1	1
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA19238	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA19239	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA19625	0.669	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA19648	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA20502	1.071	1.071	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	60925476	60925553	DEL	78	NA20845	0.711	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG00096	1.467	1.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG00268	0.92	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG00419	1.497	1.454	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG00759	0.738	0.716	0.0	0.051	0.638	0.638	1	1
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG01051	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG01112	1.305	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG01500	1.16	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG01565	1.225	1.189	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG01583	0.438	0.425	0.009	0.056	0.929	0.857	1	1
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG01595	0.511	0.496	0.0	0.04	0.433	0.433	1	1
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG01879	1.465	1.423	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG02568	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG02922	0.362	0.351	0.0	0.063	0.842	0.842	1	1
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG03052	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG03642	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	HG03742	1.448	1.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA12878	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA18525	1.292	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA18939	0.768	0.745	0.0	0.039	0.647	0.676	1	1
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA19017	0.714	0.693	0.0	0.044	0.561	0.588	1	1
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA19238	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA19239	1.193	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA19625	1.415	1.374	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA19648	0.784	0.761	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA20502	1.28	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61027289	61027367	DEL	79	NA20845	1.578	1.532	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG00096	0.464	0.534	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG00268	0.46	0.529	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG01051	0.91	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG01112	0.354	0.407	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG01500	0.254	0.292	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG01565	0.591	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG01583	0.341	0.391	0.0	0.065	0.357	0.387	2	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG01595	0.47	0.541	0.0	0.042	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG01879	0.568	0.653	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG02568	0.925	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG02922	0.617	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG03006	0.0	0.0	0.013	0.101	nan	nan	0	0
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG03052	0.734	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG03642	0.946	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	HG03742	0.258	0.296	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA12878	0.37	0.425	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA18525	0.372	0.427	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA18939	0.366	0.42	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA19017	0.507	0.583	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA19238	0.975	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA19239	0.786	0.904	0.0	0.0	0.935	0.935	1	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA19648	0.531	0.61	0.0	0.088	nan	nan	0	2
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA20502	0.559	0.642	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr8	61945872	61946021	DEL	150	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	1
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG00096	0.743	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG00268	0.601	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG00419	0.561	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG00759	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG01051	0.579	0.643	0.0	0.006	0.325	0.325	2	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG01112	0.541	0.601	0.0	0.0	0.824	0.824	2	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG01500	0.798	0.886	0.0	0.0	0.947	0.947	2	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG01565	0.422	0.469	0.0	0.007	0.795	0.795	2	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG01583	0.778	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG01595	0.368	0.409	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG01879	0.678	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG02568	0.578	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG02922	0.744	0.827	0.0	0.017	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG03006	0.621	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG03052	0.54	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG03642	0.647	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	HG03742	0.694	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA12878	0.688	0.764	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA18525	0.761	0.845	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA18939	0.731	0.813	0.0	0.0	0.773	0.739	2	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA19017	0.827	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA19238	0.87	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA19239	0.799	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA19625	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA19648	1.062	1.18	0.0	0.0	0.609	0.609	2	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA20502	1.187	1.319	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr8	62150345	62150487	DEL	143	NA20845	0.378	0.42	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG00096	1.114	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG00268	1.256	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG00419	1.164	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG00759	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG01051	0.972	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG01112	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG01500	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG01565	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG01583	1.119	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG01595	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG01879	0.971	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG02568	0.925	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG02922	1.191	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG03006	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG03052	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG03642	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	HG03742	1.052	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA12878	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA18525	1.008	0.979	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA18939	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA19017	0.263	0.255	0.042	0.048	nan	nan	0	1
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA19238	0.409	0.397	0.0	0.037	nan	nan	0	1
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA19239	1.14	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA19625	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA19648	1.189	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA20502	0.885	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	65334626	65335204	DEL	579	NA20845	0.733	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG00268	0.0	0.0	0.007	0.152	nan	nan	0	0
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG00419	1.133	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG00759	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG01112	0.391	0.391	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG01500	0.435	0.435	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG01565	0.0	0.0	0.01	0.124	nan	nan	0	1
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG01583	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG01595	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG01879	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG02568	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG02922	0.468	0.468	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG03006	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG03052	0.518	0.518	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG03642	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA12878	1.015	1.015	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA18525	1.292	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA18939	1.06	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA19017	1.184	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA19238	1.186	1.186	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA19239	0.891	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA19625	1.39	1.39	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA19648	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA20502	0.512	0.512	0.0	0.066	0.391	0.391	1	1
chr8	66311348	66311469	DEL	122	NA20845	0.333	0.333	0.0	0.04	nan	nan	0	1
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG00096	0.817	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG00268	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG00419	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG00759	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG01051	0.848	0.848	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG01112	0.801	0.801	0.0	0.0	0.722	0.722	3	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG01500	1.033	1.033	0.0	0.0	0.6	0.6	3	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG01565	0.76	0.76	0.0	0.0	0.335	0.335	2	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG01583	0.924	0.924	0.0	0.0	0.857	0.903	3	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG01595	1.022	1.022	0.0	0.0	0.96	0.96	3	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG01879	0.879	0.879	0.0	0.0	0.608	0.608	4	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG02568	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG02922	1.021	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG03006	0.73	0.73	0.0	0.0	0.812	0.813	3	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG03052	1.08	1.08	0.0	0.0	0.81	0.81	2	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG03642	0.871	0.871	0.0	0.0	0.535	0.535	4	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	HG03742	1.052	1.052	0.0	0.0	0.742	0.742	3	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA12878	0.86	0.86	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA18525	0.938	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA18939	0.804	0.804	0.0	0.0	0.958	0.917	1	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA19017	0.846	0.846	0.0	0.0	0.903	0.946	4	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA19238	0.936	0.936	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA19239	1.101	1.101	0.0	0.0	0.88	0.88	2	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA19625	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA19648	1.062	1.062	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA20502	0.535	0.535	0.074	0.048	nan	nan	0	1
chr8	67120745	67121717	DEL	973	NA20845	0.844	0.844	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG00096	1.207	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG00268	1.026	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG00419	0.915	0.855	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG00759	1.316	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG01051	1.489	1.391	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG01112	1.566	1.463	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG01500	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG01565	1.859	1.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG01583	1.532	1.432	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG01595	1.39	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG01879	1.328	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG02568	1.234	1.153	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG02922	1.382	1.292	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG03006	1.589	1.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG03052	1.447	1.352	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG03642	0.797	0.744	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr8	68873150	68873397	DEL	248	HG03742	1.349	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA12878	1.083	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA18525	1.168	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA18939	0.987	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA19017	1.09	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA19238	1.12	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA19239	1.297	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA19625	1.004	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA19648	1.34	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA20502	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	68873150	68873397	DEL	248	NA20845	1.556	1.454	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG00096	1.3	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG00268	1.274	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG00419	0.977	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG00759	0.977	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG01051	1.199	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG01112	1.137	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG01500	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG01565	1.267	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG01583	1.095	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG01595	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG01879	0.953	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG02568	1.388	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG02922	1.212	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG03006	1.15	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG03052	1.209	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG03642	0.896	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	HG03742	1.032	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA12878	0.911	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA18525	1.062	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA18939	0.731	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA19017	1.034	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA19238	0.975	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA19239	0.393	0.367	0.0	0.047	0.805	0.805	1	1
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA19625	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA19648	1.34	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA20502	0.978	0.914	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69027789	69027839	DEL	51	NA20845	0.933	0.872	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG00096	1.374	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG00268	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG00419	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG00759	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG01051	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG01112	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG01500	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG01565	1.014	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG01583	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG01595	1.268	1.268	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG01879	0.769	0.769	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG02568	0.887	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG02922	1.276	1.276	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG03006	1.105	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG03052	1.252	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG03642	1.419	1.419	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	HG03742	1.022	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA12878	0.98	0.98	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA18525	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA18939	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA19017	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA19238	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA19239	0.544	0.544	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA19625	1.004	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA19648	1.265	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA20502	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	69779769	69779890	DEL	122	NA20845	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG00096	0.947	0.92	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG00268	1.079	1.048	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG00419	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG00759	1.396	1.355	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG01051	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG01112	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG01500	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG01565	0.929	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG01583	1.314	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG01595	1.043	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG01879	0.44	0.427	0.077	0.047	nan	nan	0	1
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG02568	0.578	0.561	0.138	0.117	nan	nan	0	1
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG02922	0.617	0.599	0.057	0.031	nan	nan	0	1
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG03006	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG03052	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG03642	0.946	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	HG03742	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA12878	0.98	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA18525	1.238	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA18939	1.207	1.171	0.0	0.0	0.545	0.522	1	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA19017	1.128	1.095	0.0	0.0	0.667	0.636	1	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA19238	0.593	0.576	0.097	0.052	nan	nan	0	1
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA19239	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA19625	1.338	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA19648	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA20502	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	71451620	71452495	DEL	876	NA20845	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG00096	0.836	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG00268	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG00419	1.04	1.009	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG00759	0.917	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG01051	1.137	1.104	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG01112	0.913	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG01500	0.979	0.95	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG01565	0.718	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG01583	1.387	1.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG01595	0.409	0.397	0.041	0.083	nan	nan	0	1
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG01879	1.099	1.067	0.0	0.004	0.463	0.463	1	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG02568	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG02922	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG03006	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG03052	1.101	1.069	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG03642	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	HG03742	1.012	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA12878	0.877	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA18525	0.867	0.842	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA18939	1.188	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA19017	0.958	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA19238	1.173	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA19239	1.048	1.018	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA19625	0.875	0.849	0.0	0.0	0.474	0.508	1	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA19648	0.936	0.909	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA20502	1.117	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74087417	74087896	DEL	480	NA20845	0.867	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG00096	0.334	0.371	0.0	0.058	0.909	0.909	1	1
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG00268	0.655	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG00419	0.957	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG00759	0.449	0.498	0.0	0.041	0.28	0.28	1	1
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG01051	0.992	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG01112	0.746	0.828	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG01500	1.106	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG01565	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG01583	0.778	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG01595	0.388	0.432	0.0	0.043	0.778	0.778	1	1
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG01879	0.934	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG02568	0.732	0.814	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG02922	0.851	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG03006	0.913	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG03052	0.453	0.504	0.0	0.034	0.296	0.296	1	1
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG03642	1.07	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	HG03742	0.784	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA12878	0.825	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA18525	1.221	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA18939	0.823	0.914	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA19017	0.451	0.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA19238	0.896	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA19239	0.93	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA19625	0.643	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA19648	1.163	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA20502	1.094	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74607596	74607683	DEL	88	NA20845	0.778	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG00096	0.632	0.613	0.0	0.044	0.575	0.575	1	1
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG00268	1.132	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG00419	1.331	1.292	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG00759	1.096	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG01051	0.579	0.562	0.0	0.059	0.483	0.483	1	1
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG01112	0.988	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG01500	0.961	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG01565	1.183	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG01583	1.009	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG01595	0.879	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG01879	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG02568	0.386	0.374	0.0	0.117	0.6	0.6	1	1
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG02922	1.17	1.136	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG03006	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG03052	0.54	0.524	0.0	0.062	0.543	0.543	1	1
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG03642	1.145	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	HG03742	0.774	0.751	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA12878	1.187	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA18525	1.309	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA18939	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA19017	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA19238	0.606	0.589	0.0	0.057	0.526	0.526	1	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA19239	1.048	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA19625	0.489	0.475	0.013	0.032	0.391	0.419	1	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA19648	1.062	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA20502	0.279	0.271	0.0	0.09	0.842	0.842	1	1
chr8	74787761	74787858	DEL	98	NA20845	0.689	0.669	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG00096	0.836	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG00268	1.044	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG00419	0.936	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG00759	1.336	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG01051	0.744	0.723	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG01112	0.783	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG01500	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG01565	1.098	1.066	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG01583	0.73	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG01595	0.941	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG01879	0.366	0.356	0.0	0.02	0.783	0.783	1	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG02568	0.887	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG03006	0.804	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG03052	0.993	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG03642	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	HG03742	1.23	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA12878	0.86	0.835	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA18525	0.902	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA18939	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA19017	0.733	0.712	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA19238	0.989	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA19239	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA19625	1.081	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA19648	1.012	0.982	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA20502	0.675	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	75558342	75558398	DUP	57	NA20845	1.067	1.036	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.073	nan	nan	0	0
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG00268	0.46	0.447	0.0	0.023	0.967	0.988	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG00419	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG00759	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG01051	0.558	0.542	0.0	0.052	0.533	0.533	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG01112	0.466	0.452	0.0	0.016	0.833	0.833	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG01500	1.251	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG01565	1.183	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG01595	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG02922	0.447	0.434	0.0	0.049	0.905	0.905	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG03006	0.657	0.638	0.0	0.018	0.738	0.738	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG03052	0.734	0.713	0.0	0.053	0.971	0.971	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG03642	1.245	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	HG03742	1.161	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA12878	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA18525	1.256	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA18939	0.475	0.461	0.0	0.029	0.967	0.99	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA19238	0.659	0.64	0.0	0.027	0.883	0.883	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	0
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.029	nan	nan	0	0
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA19648	0.582	0.565	0.0	0.019	0.808	0.808	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA20502	0.466	0.452	0.0	0.01	0.5	0.5	1	1
chr8	76138134	76138191	DEL	58	NA20845	0.489	0.475	0.0	0.055	0.684	0.684	1	1
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG00096	1.152	1.118	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG00268	0.46	0.447	0.0	0.067	0.424	0.433	1	1
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG00419	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG00759	1.017	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG01051	1.013	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG01112	0.979	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG01500	1.278	1.241	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG01565	1.035	1.005	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG01583	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG01595	0.859	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG01879	0.513	0.498	0.0	0.044	0.257	0.257	1	1
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG02568	0.655	0.636	0.0	0.041	0.471	0.471	1	1
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG02922	1.212	1.177	0.007	0.0	0.409	0.409	1	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG03006	1.297	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG03052	0.497	0.482	0.0	0.122	0.652	0.652	2	1
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG03642	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	HG03742	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA12878	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA18525	1.115	1.082	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA18939	0.494	0.479	0.0	0.054	0.412	0.43	1	1
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA19017	1.015	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA19238	1.088	1.056	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA19239	1.173	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA19625	1.119	1.087	0.0	0.004	0.724	0.675	2	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA19648	0.885	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA20502	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76414046	76414151	DEL	106	NA20845	1.467	1.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG00096	0.687	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG00268	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG00419	0.749	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG00759	0.658	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG01051	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG01112	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG01500	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG01565	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG01583	1.119	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG01595	0.654	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG01879	0.403	0.403	0.0	0.081	nan	nan	0	1
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG02568	1.079	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG02922	0.702	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG03006	0.749	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG03052	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG03642	0.971	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	HG03742	0.734	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA12878	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA18525	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA18939	0.567	0.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA19017	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA19238	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA19239	0.747	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA19625	1.029	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA19648	0.86	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA20502	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	76840806	76841260	DEL	455	NA20845	0.622	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG00096	0.743	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG00268	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG00419	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG00759	1.176	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG01051	1.344	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG01112	1.09	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG01500	0.834	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG01565	0.866	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG01583	1.192	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG01595	1.472	1.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG01879	1.117	1.085	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG02568	0.578	0.561	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG02922	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG03006	0.566	0.55	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG03052	0.777	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG03642	1.133	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	HG03742	0.694	0.674	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA12878	0.619	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA18525	0.495	0.481	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA18939	1.042	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA19017	1.316	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA19238	0.514	0.499	0.0	0.08	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA19239	1.179	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA19625	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA19648	1.088	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA20502	1.141	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	79151402	79151507	DEL	106	NA20845	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG00096	0.845	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG00268	0.831	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG00419	0.998	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG00759	0.947	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG01051	0.476	0.547	0.007	0.033	0.64	0.64	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG01112	0.242	0.279	0.0	0.045	0.875	0.875	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG01500	0.906	1.042	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG01565	0.813	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG01583	0.851	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG01595	0.879	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG01879	0.385	0.442	0.0	0.083	0.923	0.923	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG02568	0.887	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG02922	0.829	0.953	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG03006	1.059	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG03052	0.345	0.397	0.0	0.055	0.522	0.522	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG03642	0.946	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	HG03742	0.813	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA12878	0.757	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA18525	1.221	1.403	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA18939	0.841	0.967	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA19017	0.507	0.583	0.0	0.035	0.471	0.493	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA19238	0.54	0.621	0.0	0.062	0.696	0.696	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA19239	0.498	0.572	0.0	0.029	0.628	0.628	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA19625	0.746	0.858	0.0	0.036	0.484	0.518	1	1
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA19648	0.835	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA20502	0.535	0.615	0.0	0.039	0.56	0.56	1	2
chr8	81219881	81219962	DEL	82	NA20845	0.8	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG00096	0.409	0.517	0.0	0.051	0.625	0.625	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG00268	0.778	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG00419	0.395	0.5	0.0	0.029	0.524	0.524	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG00759	0.379	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG01051	0.62	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG01112	0.429	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG01500	0.489	0.62	0.0	0.04	0.28	0.28	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG01565	0.359	0.454	0.0	0.041	0.833	0.833	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG01583	0.462	0.585	0.0	0.013	0.471	0.51	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG01595	0.552	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG01879	0.531	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG02568	1.079	1.366	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG02922	0.234	0.296	0.0	0.072	0.375	0.375	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG03006	0.292	0.37	0.0	0.051	0.824	0.824	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG03642	0.274	0.347	0.0	0.059	0.778	0.778	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	HG03742	0.159	0.201	0.0	0.038	0.667	0.667	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA12878	0.86	1.088	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA18525	0.637	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA18939	0.585	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA19017	0.695	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA19238	0.725	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA19239	0.301	0.382	0.0	0.03	1.0	1.0	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA19625	0.412	0.521	0.0	0.054	0.792	0.848	2	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA19648	0.531	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA20502	0.396	0.501	0.0	0.027	0.579	0.579	1	1
chr8	8245067	8245143	DEL	77	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG00096	0.91	0.958	0.004	0.0	0.778	0.778	3	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG00268	0.902	0.95	0.0	0.0	0.536	0.547	1	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG00419	0.499	0.525	0.055	0.033	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG00759	0.758	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG01051	0.0	0.0	0.163	0.109	nan	nan	0	0
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG01112	0.0	0.0	0.206	0.136	nan	nan	0	0
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG01500	0.435	0.458	0.078	0.05	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG01565	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG01583	0.839	0.883	0.0	0.0	0.933	0.989	1	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG01595	0.45	0.473	0.087	0.059	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG01879	0.33	0.347	0.075	0.044	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG02568	0.732	0.771	0.04	0.035	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG02922	0.766	0.806	0.0	0.0	0.76	0.76	2	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG03006	0.0	0.0	0.245	0.131	nan	nan	0	0
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG03052	0.993	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG03642	0.846	0.891	0.0	0.0	0.502	0.502	4	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	HG03742	0.476	0.501	0.074	0.053	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA12878	0.0	0.0	0.226	0.111	nan	nan	0	0
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA18525	0.301	0.317	0.111	0.06	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA18939	0.402	0.423	0.095	0.064	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA19017	0.864	0.91	0.0	0.0	0.548	0.575	1	2
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA19238	0.0	0.0	0.32	0.167	nan	nan	0	0
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA19239	0.511	0.538	0.081	0.038	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA19625	0.437	0.46	0.028	0.021	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA19648	0.405	0.426	0.079	0.038	0.364	0.364	1	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA20502	0.396	0.417	0.066	0.045	nan	nan	0	1
chr8	8385998	8386925	DEL	928	NA20845	0.711	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG00096	0.483	0.537	0.0	0.165	nan	nan	0	0
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG00268	0.548	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG00419	0.125	0.139	0.008	0.107	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG00759	0.199	0.222	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG01051	0.186	0.207	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG01112	0.168	0.186	0.008	0.094	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG01500	0.544	0.604	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG01565	0.243	0.27	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG01583	0.097	0.108	0.012	0.082	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	0
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG01879	0.568	0.631	0.0	0.171	nan	nan	0	0
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG02568	0.655	0.728	0.0	0.161	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG02922	0.425	0.473	0.0	0.152	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG03006	0.183	0.203	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG03052	0.518	0.576	0.0	0.158	nan	nan	0	0
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG03642	0.299	0.332	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84296948	84297096	DEL	149	HG03742	0.139	0.154	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA12878	0.516	0.573	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA18525	0.495	0.55	0.0	0.18	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA18939	0.128	0.142	0.007	0.082	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA19017	0.301	0.334	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA19238	0.237	0.264	0.0	0.102	0.515	0.515	2	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA19625	0.643	0.715	0.0	0.191	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA19648	0.126	0.141	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA20502	0.116	0.129	0.0	0.128	nan	nan	0	1
chr8	84296948	84297096	DEL	149	NA20845	0.267	0.296	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG00096	0.539	0.523	0.0	0.032	0.857	0.857	1	1
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG00268	1.168	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG00419	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG00759	0.538	0.523	0.0	0.029	0.929	0.929	1	1
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG01051	1.013	0.984	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG01112	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG01500	0.979	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG01565	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG01583	1.338	1.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG01595	1.145	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG01879	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG02568	1.272	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG02922	0.702	0.681	0.0	0.035	0.767	0.767	1	1
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG03006	1.315	1.277	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG03642	0.946	0.918	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	HG03742	1.19	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA12878	0.825	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA18525	0.619	0.601	0.007	0.042	0.659	0.659	1	1
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA18939	0.658	0.639	0.0	0.031	0.439	0.459	1	1
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA19017	1.24	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA19238	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA19239	0.406	0.394	0.0	0.034	1.0	1.0	1	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA19625	0.515	0.5	0.0	0.054	0.95	0.982	1	1
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA19648	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA20502	0.582	0.565	0.0	0.046	0.719	0.719	1	1
chr8	84349766	84349839	DEL	74	NA20845	1.311	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG00096	0.334	0.307	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG00268	0.672	0.617	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG00419	0.79	0.725	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG01051	0.899	0.825	0.0	0.011	0.65	0.65	3	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG01112	0.578	0.53	0.0	0.101	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG01500	0.0	0.0	0.007	0.191	nan	nan	0	0
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG01565	0.0	0.0	0.008	0.181	nan	nan	0	0
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG01583	0.389	0.357	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG01595	0.47	0.431	0.0	0.084	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG01879	0.44	0.403	0.0	0.061	0.154	0.154	1	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG02568	0.848	0.778	0.0	0.008	1.0	1.0	2	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG02922	0.851	0.78	0.0	0.008	0.716	0.716	2	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG03006	0.694	0.637	0.007	0.097	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG03052	0.648	0.594	0.004	0.054	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.11	nan	nan	0	0
chr8	84959372	84959555	DEL	184	HG03742	0.754	0.692	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA18525	0.584	0.536	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA18939	0.823	0.755	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA19017	0.658	0.603	0.0	0.011	0.579	0.607	3	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA19238	1.081	0.992	0.0	0.011	0.857	0.857	3	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA19239	1.009	0.926	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA19625	0.437	0.401	0.0	0.069	0.829	0.773	4	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	0
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA20502	0.256	0.235	0.01	0.076	nan	nan	0	1
chr8	84959372	84959555	DEL	184	NA20845	1.089	0.999	0.0	0.0	0.586	0.586	4	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG00096	1.449	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG00268	1.486	1.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG00419	1.476	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG00759	1.156	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG01051	1.53	1.404	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG01112	1.323	1.214	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG01500	1.414	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG01565	1.056	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG01583	1.168	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG01595	1.084	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG01879	1.191	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG02568	1.234	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG02922	1.17	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG03006	1.187	1.089	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG03052	1.49	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG03642	1.369	1.256	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	HG03742	1.23	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA12878	0.843	0.773	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA18525	0.46	0.422	0.01	0.076	0.4	0.4	1	1
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA18939	1.444	1.325	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA19017	1.353	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA19238	1.134	1.04	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA19239	1.245	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA19625	1.158	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA19648	1.088	0.998	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA20502	1.234	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	88502497	88502796	DEL	300	NA20845	1.311	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG00096	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG00268	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG00419	0.395	0.416	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG00759	0.399	0.42	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG01051	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG01112	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG01500	1.033	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG01565	0.845	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG01583	0.462	0.486	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG01595	0.634	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG01879	0.476	0.501	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.107	nan	nan	0	0
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG02922	0.851	0.895	0.0	0.005	0.833	0.833	1	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG03006	1.004	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG03052	0.993	1.046	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG03642	0.523	0.55	0.0	0.088	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	HG03742	0.516	0.543	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA12878	0.791	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA18525	0.478	0.503	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA18939	0.804	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	0
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA19238	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA19239	0.472	0.497	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	0
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA19648	0.506	0.532	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA20502	0.582	0.613	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89248981	89249106	DEL	126	NA20845	0.644	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG00096	1.207	1.128	0.005	0.007	nan	nan	0	2
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG00268	0.0	0.0	0.007	0.147	nan	nan	0	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.164	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.155	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG01051	1.096	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.153	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG01565	0.612	0.572	0.0	0.072	0.917	0.917	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG01583	0.681	0.637	0.009	0.077	0.379	0.411	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG01595	0.756	0.707	0.0	0.094	0.667	0.667	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG01879	0.458	0.428	0.0	0.067	0.735	0.735	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG02568	1.041	0.973	0.0	0.016	nan	nan	0	2
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG02922	0.638	0.596	0.0	0.068	0.609	0.609	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG03006	0.73	0.683	0.0	0.113	0.778	0.778	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.142	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.163	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	0
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA18939	0.512	0.478	0.0	0.101	0.949	0.907	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA19017	0.62	0.58	0.0	0.045	0.475	0.498	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA19238	1.371	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA19239	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA19625	1.518	1.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA19648	0.759	0.709	0.0	0.054	0.529	0.529	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA20502	0.605	0.566	0.0	0.072	0.714	0.714	1	1
chr8	89351927	89352023	DEL	97	NA20845	1.111	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG00096	0.576	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG00268	0.814	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG00419	0.915	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG00759	0.728	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG01051	0.62	0.713	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG01112	0.876	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG01500	0.852	0.979	0.0	0.0	0.407	0.407	1	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG01565	0.697	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG01583	0.876	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG01595	0.756	0.87	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG01879	0.678	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG02568	0.925	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG02922	0.851	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG03006	0.603	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG03052	0.81	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG03642	0.846	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	HG03742	0.724	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA12878	0.739	0.85	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA18525	1.132	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA18939	0.878	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA19017	0.583	0.67	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA19238	0.857	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA19239	0.917	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA19625	0.901	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA19648	1.088	1.25	0.0	0.005	0.591	0.591	1	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA20502	0.815	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	8997885	8998112	DEL	228	NA20845	0.844	0.971	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG00096	0.297	0.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG00268	0.318	0.292	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG00419	0.187	0.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG00759	0.199	0.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG01051	0.372	0.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG01112	0.447	0.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG01500	0.508	0.466	0.0	0.0	0.385	0.385	2	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG01565	0.296	0.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG01583	0.341	0.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG01595	0.307	0.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG01879	0.293	0.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG02568	0.27	0.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG02922	0.447	0.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG03006	0.365	0.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG03052	0.173	0.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG03642	0.349	0.32	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	HG03742	0.377	0.346	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA12878	0.722	0.663	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA18525	0.407	0.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA18939	0.183	0.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA19017	0.338	0.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA19238	0.356	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA19239	0.393	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA19625	0.154	0.142	0.0	0.013	0.462	0.431	1	1
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA19648	0.228	0.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA20502	0.489	0.448	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	94871802	94871856	DEL	55	NA20845	0.4	0.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG00096	0.743	0.743	0.0	0.0	0.504	0.504	2	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG00268	0.725	0.725	0.0	0.0	0.333	0.326	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG00419	0.873	0.873	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG00759	0.678	0.678	0.0	0.0	0.566	0.566	2	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG01051	0.517	0.517	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG01112	0.652	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG01500	0.743	0.743	0.0	0.0	0.286	0.286	3	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG01565	0.76	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG01583	0.559	0.559	0.0	0.0	0.308	0.284	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG01595	0.429	0.429	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG01879	0.659	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG02568	0.54	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG02922	0.681	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG03006	0.913	0.913	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG03052	0.497	0.497	0.094	0.057	nan	nan	0	1
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG03642	0.772	0.772	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	HG03742	0.794	0.794	0.0	0.0	0.142	0.142	2	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA12878	0.688	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA18525	0.389	0.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA18939	0.548	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA19017	0.695	0.695	0.0	0.0	1.0	0.955	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA19238	0.699	0.699	0.0	0.0	0.35	0.35	3	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA19239	0.812	0.812	0.0	0.0	0.583	0.583	2	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA19625	0.618	0.618	0.0	0.0	0.4	0.429	1	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA19648	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA20502	0.861	0.861	0.0	0.0	0.088	0.088	2	2
chr8	95183957	95184868	DEL	912	NA20845	0.6	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG00096	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG00268	0.849	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG00419	1.081	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG00759	0.359	0.335	0.0	0.132	nan	nan	0	1
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG01051	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG01112	0.783	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG01500	0.888	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG01565	0.866	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG01583	0.486	0.455	0.005	0.077	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG01595	0.45	0.42	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG01879	0.843	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG02568	0.617	0.576	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG02922	1.234	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG03006	0.657	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG03052	1.101	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG03642	0.523	0.489	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr8	97514680	97514786	DEL	107	HG03742	1.151	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA12878	1.083	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA18525	0.832	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA18939	0.804	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA19017	0.376	0.351	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA19238	0.962	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA19239	0.472	0.441	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA19625	1.107	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA19648	1.012	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA20502	1.094	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	97514680	97514786	DEL	107	NA20845	0.289	0.27	0.0	0.084	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG00096	1.263	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG00268	0.955	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG00419	1.081	1.011	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG00759	1.176	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG01051	0.992	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG01112	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG01500	1.142	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG01565	1.225	1.145	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG01583	1.241	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG01595	1.125	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG01879	1.411	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG02568	1.272	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG02922	1.297	1.212	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG03006	1.242	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG03052	0.518	0.484	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG03642	1.27	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	HG03742	1.31	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA12878	0.808	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA18525	1.292	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA18939	1.152	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA19017	1.165	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA19238	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA19239	1.35	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA19625	1.261	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA19648	1.012	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA20502	1.373	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99673162	99673441	DEL	280	NA20845	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG00096	1.374	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG00268	1.026	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG00419	1.081	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG00759	1.495	1.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG01051	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG01112	1.379	1.339	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG01500	1.323	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG01565	1.352	1.312	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG01583	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG01595	1.452	1.409	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG01879	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG02568	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG02922	0.542	0.527	0.005	0.073	nan	nan	0	1
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG03006	1.388	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG03052	1.144	1.111	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG03642	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	HG03742	1.548	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA12878	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA18525	0.991	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA18939	1.225	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA19017	1.269	1.232	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA19238	1.028	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA19239	1.284	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA19625	1.39	1.349	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA19648	1.391	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA20502	0.954	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr8	99869601	99869808	DEL	208	NA20845	1.278	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG00096	1.128	1.096	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG00268	1.215	1.18	0.0	0.0	0.816	0.816	1	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG00419	0.84	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG00759	0.509	0.494	0.089	0.01	0.273	0.288	1	1
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG01051	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG01112	1.293	1.255	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG01500	1.283	1.245	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG01565	1.309	1.271	0.0	0.0	0.897	0.897	1	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG01583	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG01595	0.94	0.912	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG01879	0.485	0.471	0.069	0.013	0.429	0.429	8	1
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG02568	0.0	0.0	0.13	0.006	nan	nan	0	0
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG02922	0.433	0.42	0.111	0.0	0.472	0.506	8	1
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG03006	0.951	0.924	0.0	0.0	0.481	0.481	1	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG03052	0.0	0.0	0.13	0.029	nan	nan	0	0
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG03642	1.275	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	HG03742	0.945	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA12878	0.899	0.873	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA18525	0.949	0.921	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA18939	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA19017	0.974	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA19238	0.539	0.523	0.104	0.011	0.333	0.333	9	1
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA19239	0.0	0.0	0.425	0.011	nan	nan	0	0
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA19625	0.0	0.0	0.198	0.0	nan	nan	0	0
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA19648	1.076	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA20502	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101000293	101001115	DEL	823	NA20845	1.193	1.158	0.0	0.0	0.686	0.686	2	2
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG00096	0.376	0.352	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG00268	0.0	0.0	0.023	0.234	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG00419	0.567	0.53	0.021	0.082	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG00759	1.017	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG01051	1.058	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG01112	0.513	0.48	0.008	0.041	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG01500	0.0	0.0	0.018	0.185	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG01565	1.159	1.083	0.0	0.004	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG01583	0.568	0.531	0.02	0.047	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG01595	1.19	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG01879	0.0	0.0	0.007	0.16	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG02568	0.427	0.399	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG03006	1.045	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG03052	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG03642	0.637	0.596	0.032	0.11	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	HG03742	0.0	0.0	0.013	0.247	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA12878	0.432	0.404	0.004	0.085	0.478	0.478	1	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA18525	0.483	0.452	0.022	0.143	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA18939	0.463	0.433	0.016	0.087	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA19017	0.535	0.5	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA19238	0.0	0.0	0.008	0.22	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA19239	1.029	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA19648	0.0	0.0	0.024	0.227	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.202	nan	nan	0	0
chr9	101347967	101348322	DEL	356	NA20845	0.45	0.421	0.011	0.109	nan	nan	0	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG00096	0.508	0.493	0.033	0.071	0.885	0.885	2	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG00268	0.0	0.0	0.142	0.15	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG00419	0.0	0.0	0.247	0.236	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG00759	0.0	0.0	0.156	0.156	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG01051	0.0	0.0	0.066	0.08	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG01112	0.0	0.0	0.073	0.121	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG01500	0.0	0.0	0.118	0.129	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG01565	0.408	0.396	0.088	0.064	0.792	0.792	1	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG01583	0.0	0.0	0.256	0.131	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG01595	0.585	0.568	0.056	0.05	0.958	0.958	2	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG01879	0.0	0.0	0.097	0.14	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG02568	0.0	0.0	0.106	0.08	0.523	0.523	2	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG02922	0.455	0.441	0.051	0.035	nan	nan	0	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG03006	0.0	0.0	0.207	0.18	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG03052	0.306	0.297	0.078	0.053	0.764	0.764	2	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG03642	0.561	0.544	0.075	0.069	0.658	0.658	2	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	HG03742	0.0	0.0	0.154	0.143	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA12878	0.536	0.521	0.028	0.043	0.794	0.794	2	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA18525	0.0	0.0	0.106	0.129	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA18939	0.0	0.0	0.153	0.15	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA19017	0.573	0.556	0.039	0.036	0.227	0.238	1	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA19238	0.741	0.719	0.018	0.04	0.805	0.805	2	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA19239	0.0	0.0	0.091	0.171	0.745	0.745	2	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA19625	0.677	0.657	0.063	0.044	0.723	0.723	2	1
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA19648	0.0	0.0	0.136	0.119	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA20502	0.0	0.0	0.112	0.112	nan	nan	0	0
chr9	10404415	10405176	DEL	762	NA20845	0.0	0.0	0.145	0.106	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG00096	0.47	0.456	0.027	0.076	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG00268	0.0	0.0	0.161	0.179	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG00419	0.0	0.0	0.293	0.279	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG00759	0.0	0.0	0.193	0.193	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG01051	0.0	0.0	0.081	0.097	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG01112	0.0	0.0	0.085	0.142	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG01500	0.0	0.0	0.124	0.149	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG01565	0.386	0.375	0.087	0.068	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG01583	0.0	0.0	0.283	0.152	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG01595	0.564	0.547	0.059	0.054	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG01879	0.0	0.0	0.108	0.177	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG02568	0.0	0.0	0.113	0.093	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG02922	0.422	0.41	0.053	0.036	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG03006	0.0	0.0	0.246	0.214	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG03052	0.262	0.255	0.066	0.056	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG03642	0.535	0.52	0.072	0.072	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	HG03742	0.0	0.0	0.182	0.169	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA12878	0.502	0.487	0.027	0.046	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA18525	0.0	0.0	0.096	0.155	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA18939	0.0	0.0	0.17	0.185	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA19017	0.554	0.538	0.036	0.039	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA19238	0.714	0.693	0.012	0.042	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA19239	0.0	0.0	0.083	0.206	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA19625	0.625	0.606	0.065	0.045	nan	nan	0	1
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA19648	0.0	0.0	0.128	0.142	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA20502	0.0	0.0	0.131	0.143	nan	nan	0	0
chr9	10404562	10405091	DEL	530	NA20845	0.0	0.0	0.148	0.127	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG00096	0.508	0.493	0.063	0.043	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG00268	0.447	0.434	0.046	0.031	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG00419	0.0	0.0	0.24	0.177	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG00759	0.936	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG01051	0.445	0.432	0.051	0.029	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG01112	0.399	0.388	0.066	0.048	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG01500	1.034	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG01565	0.0	0.0	0.223	0.184	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG01583	0.0	0.0	0.242	0.127	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG01595	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG01879	0.597	0.579	0.046	0.046	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG02568	0.0	0.0	0.276	0.122	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG02922	0.498	0.483	0.092	0.042	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG03006	0.0	0.0	0.145	0.126	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG03052	1.006	0.977	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG03642	0.51	0.495	0.049	0.041	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	HG03742	0.422	0.41	0.05	0.036	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA12878	0.415	0.403	0.043	0.028	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA18525	0.0	0.0	0.248	0.199	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA18939	0.0	0.0	0.258	0.16	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA19017	0.439	0.426	0.056	0.034	nan	nan	0	1
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA19238	0.0	0.0	0.243	0.213	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA19239	0.0	0.0	0.338	0.201	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA19625	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA19648	0.0	0.0	0.237	0.2	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA20502	0.0	0.0	0.298	0.181	nan	nan	0	0
chr9	104219699	104220378	DEL	680	NA20845	0.653	0.634	0.053	0.031	0.5	0.5	3	1
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG00096	0.79	0.908	0.0	0.0	0.732	0.732	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG00268	0.751	0.863	0.0	0.0	0.775	0.775	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG00419	0.672	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG00759	0.692	0.795	0.0	0.0	0.747	0.789	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG01051	0.635	0.73	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG01112	0.666	0.765	0.0	0.0	0.857	0.857	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG01500	0.794	0.912	0.0	0.0	0.825	0.82	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG01565	0.837	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG01583	0.667	0.767	0.0	0.0	0.573	0.573	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG01595	0.71	0.816	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG01879	0.69	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG02568	0.465	0.535	0.105	0.064	nan	nan	0	1
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG02922	0.888	1.02	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG03006	0.877	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG03052	0.787	0.905	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG03642	0.484	0.557	0.089	0.05	nan	nan	0	1
chr9	104569666	104570490	DEL	825	HG03742	0.704	0.809	0.0	0.0	0.788	0.829	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA12878	0.813	0.934	0.0	0.0	0.69	0.69	3	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA18525	0.752	0.864	0.0	0.0	0.875	0.839	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA18939	0.592	0.681	0.0	0.0	0.505	0.505	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA19017	0.716	0.823	0.0	0.0	1.0	0.955	1	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA19238	0.795	0.913	0.0	0.0	0.688	0.688	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA19239	0.855	0.983	0.0	0.0	0.697	0.697	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA19625	0.703	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA19648	0.973	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA20502	0.892	1.026	0.0	0.0	0.881	0.832	2	2
chr9	104569666	104570490	DEL	825	NA20845	0.9	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG00096	0.357	0.347	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG00268	0.25	0.243	0.0	0.127	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.166	nan	nan	0	0
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG00759	0.448	0.434	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG01051	0.476	0.462	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG01112	0.437	0.425	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG01500	0.0	0.0	0.018	0.217	nan	nan	0	0
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG01565	0.451	0.438	0.009	0.089	0.615	0.615	1	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG01583	0.222	0.216	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG01595	0.021	0.02	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG01879	0.168	0.163	0.0	0.094	nan	nan	0	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG02568	0.31	0.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG02922	0.26	0.252	0.007	0.069	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG03006	0.336	0.326	0.008	0.08	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG03052	0.284	0.276	0.0	0.073	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG03642	0.331	0.322	0.0	0.169	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	HG03742	0.804	0.781	0.0	0.0	0.17	0.179	4	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA12878	0.381	0.369	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA18525	0.286	0.278	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA19017	0.515	0.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.152	nan	nan	0	0
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA19239	0.561	0.545	0.0	0.003	0.75	0.75	1	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA19625	0.495	0.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA19648	0.615	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	0
chr9	105162485	105162668	DEL	184	NA20845	0.585	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG00096	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG00268	0.786	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG00419	0.924	0.924	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG00759	0.915	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG01051	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG01112	0.913	0.913	0.0	0.0	0.864	0.864	3	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG01500	1.015	1.015	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG01565	0.837	0.837	0.0	0.0	0.474	0.474	3	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG01583	0.482	0.482	0.045	0.115	nan	nan	0	1
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG01595	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG01879	0.0	0.0	0.011	0.306	nan	nan	0	1
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG02568	1.047	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG02922	0.455	0.455	0.053	0.102	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG03006	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG03052	1.115	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG03642	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	HG03742	0.583	0.583	0.009	0.066	nan	nan	0	1
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA12878	0.969	0.969	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA18525	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA18939	0.87	0.87	0.0	0.003	0.76	0.76	3	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA19017	1.079	1.079	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA19238	0.458	0.458	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA19239	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA19625	1.249	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA19648	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA20502	1.197	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	106195741	106196082	DEL	342	NA20845	0.36	0.36	0.021	0.101	nan	nan	0	1
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG00096	1.185	1.247	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG00268	0.769	0.809	0.0	0.0	0.838	0.838	2	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG00419	0.924	0.973	0.0	0.0	0.793	0.793	6	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG00759	0.549	0.578	0.02	0.02	nan	nan	0	1
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG01051	0.466	0.49	0.073	0.05	nan	nan	0	1
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG01112	0.875	0.921	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG01500	0.831	0.874	0.0	0.0	0.752	0.755	2	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG01565	0.451	0.474	0.035	0.032	nan	nan	0	1
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG01583	0.89	0.936	0.0	0.0	0.519	0.519	2	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG01595	0.459	0.484	0.067	0.052	nan	nan	0	1
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG01879	0.97	1.021	0.0	0.0	0.811	0.811	4	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG02568	0.931	0.98	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG02922	1.039	1.094	0.0	0.0	0.778	0.833	3	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG03006	0.84	0.884	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG03052	0.984	1.036	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG03642	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	HG03742	0.884	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA12878	0.709	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA18525	0.0	0.0	0.537	0.293	nan	nan	0	0
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA18939	0.0	0.0	0.27	0.209	nan	nan	0	0
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA19017	0.935	0.985	0.0	0.0	0.646	0.647	6	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA19238	0.983	1.035	0.0	0.0	0.791	0.791	3	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA19239	0.722	0.76	0.0	0.0	0.763	0.763	1	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA19625	0.989	1.041	0.0	0.0	0.658	0.658	4	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA19648	0.487	0.512	0.075	0.055	nan	nan	0	1
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA20502	0.728	0.766	0.007	0.0	0.682	0.644	1	2
chr9	107596188	107597107	DEL	920	NA20845	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG00096	0.733	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG00268	0.751	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG00419	0.567	0.597	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG00759	0.732	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG01051	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG01112	0.704	0.741	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG01500	0.72	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG01565	0.859	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG01583	0.667	0.702	0.021	0.0	0.625	0.625	1	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG01595	0.606	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG01879	0.298	0.314	0.061	0.0	0.214	0.214	1	1
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG02568	0.698	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG02922	0.476	0.501	0.052	0.004	0.158	0.169	1	1
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG03006	0.69	0.727	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG03052	0.503	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG03642	0.535	0.563	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	HG03742	0.563	0.592	0.0	0.0	0.588	0.559	1	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA12878	0.848	0.892	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA18525	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA18939	0.63	0.663	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA19017	0.496	0.522	0.048	0.0	0.211	0.221	1	1
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA19238	0.579	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA19239	0.722	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA19625	0.729	0.767	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA19648	0.461	0.485	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA20502	0.587	0.618	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	107932009	107932581	DEL	573	NA20845	0.833	0.877	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG00268	0.697	0.775	0.006	0.0	0.682	0.682	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG00759	0.895	0.994	0.0	0.0	0.75	0.711	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG01051	0.847	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG01500	0.664	0.738	0.0	0.0	0.647	0.619	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG01565	0.665	0.739	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG01583	0.89	0.988	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG01595	0.731	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG02568	0.659	0.733	0.0	0.066	nan	nan	0	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG02922	0.325	0.361	0.028	0.077	nan	nan	0	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG03006	0.821	0.912	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG03052	0.853	0.948	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG03642	0.51	0.566	0.0	0.064	nan	nan	0	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	HG03742	0.724	0.804	0.0	0.0	0.55	0.579	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA12878	0.969	1.076	0.0	0.003	1.0	1.0	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA18525	0.77	0.855	0.0	0.0	0.85	0.815	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA19017	0.706	0.785	0.013	0.0	0.522	0.498	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA19238	1.064	1.182	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA19239	1.082	1.203	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA19625	1.015	1.128	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA19648	0.717	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA20502	1.127	1.252	0.0	0.0	0.481	0.455	1	2
chr9	10908809	10909099	DUP	291	NA20845	0.878	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG00096	1.204	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG00268	0.947	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG00419	1.071	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG00759	1.241	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG01051	1.122	1.029	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG01112	0.875	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG01500	0.96	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG01565	1.03	0.945	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG01583	1.31	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG01595	1.086	0.996	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG01879	0.783	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG02568	1.241	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG02922	0.606	0.556	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG03006	1.101	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG03052	1.684	1.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG03642	1.173	1.076	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	HG03742	1.307	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA12878	0.813	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA18525	1.146	1.051	0.0	0.0	0.879	0.842	1	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA18939	1.055	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA19017	1.012	0.928	0.0	0.0	0.75	0.716	1	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA19238	0.956	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA19239	1.056	0.969	0.0	0.0	0.756	0.756	1	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA19625	0.547	0.501	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA19648	0.999	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA20502	1.221	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109173134	109173252	DEL	119	NA20845	0.991	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG00096	0.263	0.277	0.065	0.041	nan	nan	0	1
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG00268	0.786	0.828	0.0	0.0	0.684	0.684	3	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG00419	0.777	0.818	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG00759	0.854	0.899	0.0	0.0	0.765	0.807	3	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG01051	0.826	0.869	0.0	0.0	0.95	0.95	2	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG01112	0.704	0.741	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG01500	0.831	0.874	0.0	0.0	0.632	0.604	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG01565	0.73	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG01583	0.815	0.858	0.0	0.0	0.867	0.867	2	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG01595	0.606	0.638	0.0	0.0	0.717	0.717	2	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG01879	0.727	0.765	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG02568	0.815	0.857	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG02922	0.801	0.843	0.0	0.0	0.778	0.833	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG03006	0.858	0.903	0.0	0.0	0.913	0.913	3	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG03052	0.656	0.691	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG03642	0.612	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	HG03742	0.683	0.719	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA12878	0.899	0.947	0.0	0.0	0.837	0.837	2	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA18525	0.698	0.735	0.0	0.0	0.45	0.431	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA18939	0.907	0.955	0.0	0.0	0.727	0.727	2	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA19017	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA19238	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA19239	0.802	0.844	0.0	0.0	0.824	0.824	3	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA19625	0.677	0.712	0.0	0.0	0.9	0.9	2	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA19648	0.82	0.863	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA20502	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	109675911	109676565	DEL	655	NA20845	0.743	0.782	0.0	0.0	0.36	0.36	4	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG00096	0.639	0.735	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG00268	0.715	0.822	0.0	0.0	0.625	0.625	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG00419	0.672	0.773	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG00759	0.814	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG01051	0.593	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG01112	0.589	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG01500	0.517	0.594	0.0	0.0	0.9	0.861	5	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG01565	0.537	0.617	0.0	0.0	0.615	0.615	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG01583	0.766	0.88	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG01595	0.543	0.624	0.0	0.0	0.588	0.588	1	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG01879	0.317	0.364	0.047	0.043	nan	nan	0	1
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG02568	0.621	0.713	0.0	0.0	0.774	0.774	4	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG02922	0.758	0.871	0.0	0.0	0.733	0.758	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG03006	0.784	0.901	0.0	0.0	0.938	0.938	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG03052	0.525	0.603	0.0	0.0	0.636	0.636	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG03642	0.765	0.879	0.0	0.0	0.875	0.875	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	HG03742	0.724	0.832	0.0	0.0	0.636	0.637	4	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA12878	0.778	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA18525	0.698	0.803	0.0	0.0	0.812	0.779	1	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA18939	0.63	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA19017	0.706	0.812	0.0	0.0	0.7	0.668	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA19238	0.768	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA19239	0.401	0.461	0.096	0.049	nan	nan	0	1
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA19625	0.677	0.778	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA19648	0.922	1.06	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA20502	0.704	0.81	0.0	0.0	0.786	0.742	3	2
chr9	110326364	110327205	DEL	842	NA20845	0.54	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG00096	0.997	0.968	0.0	0.0	0.69	0.69	5	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG00268	0.912	0.885	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG00419	0.987	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG00759	0.814	0.79	0.0	0.0	0.976	0.925	4	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG01051	0.868	0.843	0.0	0.0	0.814	0.814	2	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG01112	0.875	0.849	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG01500	0.96	0.932	0.0	0.0	0.662	0.692	6	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG01565	0.773	0.75	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG01583	0.791	0.768	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG01595	0.877	0.852	0.0	0.0	0.902	0.902	4	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG01879	0.858	0.833	0.0	0.0	0.765	0.765	2	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG02568	0.582	0.565	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG02922	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG03006	0.802	0.779	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG03052	0.7	0.679	0.0	0.009	0.7	0.7	4	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG03642	0.816	0.792	0.0	0.0	0.462	0.462	5	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	HG03742	0.864	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA12878	1.021	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA18525	0.895	0.869	0.004	0.0	0.842	0.879	1	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA18939	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA19017	0.783	0.76	0.0	0.0	0.842	0.845	4	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA19238	0.808	0.784	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA19239	0.575	0.558	0.082	0.045	nan	nan	0	1
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA19625	0.26	0.253	0.071	0.055	nan	nan	0	1
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA19648	0.948	0.92	0.0	0.0	1.0	1.0	4	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA20502	0.963	0.935	0.0	0.0	0.712	0.719	6	2
chr9	112830194	112830900	DEL	707	NA20845	0.698	0.678	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG00096	0.47	0.522	0.024	0.022	nan	nan	0	1
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG00268	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG00419	0.441	0.49	0.049	0.034	0.941	0.941	1	1
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG00759	0.753	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG01051	0.656	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG01112	0.723	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG01500	0.738	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG01565	0.859	0.954	0.006	0.0	0.929	0.929	1	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG01583	0.469	0.522	0.026	0.024	nan	nan	0	1
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG01595	0.292	0.325	0.046	0.035	nan	nan	0	1
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG01879	0.876	0.974	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG02568	0.97	1.077	0.0	0.0	0.75	0.75	2	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG02922	0.736	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG03006	0.877	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG03052	0.94	1.045	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG03642	0.459	0.51	0.061	0.04	0.6	0.6	1	1
chr9	114333161	114333923	DEL	763	HG03742	0.683	0.759	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA12878	1.055	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA18525	0.842	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA18939	0.815	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA19017	0.706	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA19238	0.889	0.988	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA19239	0.895	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA19625	0.833	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA19648	1.153	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA20502	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114333161	114333923	DEL	763	NA20845	0.597	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG00096	0.602	0.602	0.058	0.0	nan	nan	0	1
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG00268	0.894	0.894	0.0	0.0	0.87	0.87	5	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG00419	0.966	0.966	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG00759	0.956	0.956	0.0	0.0	0.939	0.944	4	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG01051	1.016	1.016	0.0	0.004	0.882	0.882	5	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG01112	0.513	0.513	0.038	0.0	nan	nan	0	1
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG01500	0.941	0.941	0.0	0.0	0.7	0.67	3	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG01565	1.009	1.009	0.0	0.0	0.8	0.8	5	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG01583	1.013	1.013	0.0	0.0	0.794	0.794	4	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG01595	0.835	0.835	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG01879	0.932	0.932	0.01	0.0	0.714	0.714	3	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG02568	1.047	1.047	0.0	0.0	0.798	0.798	4	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG02922	0.888	0.888	0.0	0.0	0.818	0.804	5	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG03006	0.914	0.914	0.0	0.0	0.824	0.824	5	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG03052	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG03642	0.816	0.816	0.0	0.0	0.585	0.585	2	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	HG03742	1.005	1.005	0.0	0.0	0.552	0.581	1	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA12878	1.021	1.021	0.0	0.0	0.921	0.921	4	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA18525	0.931	0.931	0.005	0.0	0.74	0.734	4	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA18939	0.889	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA19017	0.935	0.935	0.0	0.0	0.875	0.876	2	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA19238	0.902	0.902	0.0	0.004	0.9	0.9	6	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA19239	0.962	0.962	0.0	0.002	0.789	0.789	5	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA19625	0.989	0.989	0.0	0.0	0.843	0.843	4	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA19648	1.025	1.025	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA20502	1.08	1.08	0.0	0.0	0.783	0.739	3	2
chr9	114653182	114653934	DEL	753	NA20845	0.923	0.923	0.002	0.002	0.849	0.849	4	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG00096	1.016	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG00268	0.929	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG00419	0.798	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG00759	1.037	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG01051	0.868	0.914	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG01112	0.856	0.901	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG01500	0.867	0.913	0.005	0.0	1.0	0.957	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG01565	0.622	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG01583	1.013	1.066	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG01595	1.232	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG01879	0.653	0.687	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG02568	0.388	0.408	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG02922	0.909	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG03006	1.138	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG03052	1.072	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG03642	1.02	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	HG03742	0.663	0.698	0.0	0.0	0.615	0.585	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA12878	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA18525	0.842	0.886	0.0	0.0	0.679	0.65	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA18939	0.741	0.78	0.0	0.0	0.839	0.839	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA19017	0.955	1.005	0.0	0.0	0.792	0.829	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA19238	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA19239	0.428	0.45	0.012	0.123	0.576	0.576	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA19625	0.703	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA19648	0.871	0.917	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA20502	0.751	0.791	0.0	0.0	0.765	0.722	1	2
chr9	114993240	114993610	DEL	371	NA20845	1.103	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG00096	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG00268	1.126	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG00419	1.008	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG00759	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG01051	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG01112	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG01500	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG01565	0.773	0.773	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG01583	1.186	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG01595	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG01879	1.137	1.137	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG02568	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG02922	1.342	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG03006	1.399	1.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG03052	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG03642	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	HG03742	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA12878	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA18525	1.307	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA18939	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA19017	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA19238	1.131	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA19239	1.069	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA19625	0.521	0.521	0.0	0.081	0.381	0.381	1	1
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA19648	1.23	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA20502	1.291	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115312345	115312548	DEL	204	NA20845	1.081	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG00096	1.053	1.17	0.0	0.0	0.677	0.677	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG00268	0.912	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG00419	0.483	0.537	0.117	0.047	nan	nan	0	1
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG00759	0.651	0.723	0.0	0.0	0.962	0.961	2	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG01051	0.646	0.717	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG01112	0.723	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG01500	0.849	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG01565	0.794	0.882	0.0	0.0	0.421	0.421	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG01583	0.964	1.071	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG01595	0.439	0.487	0.037	0.028	nan	nan	0	1
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG01879	0.727	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG02568	0.97	1.077	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG02922	0.844	0.938	0.0	0.0	0.846	0.79	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG03006	0.728	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG03052	0.962	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG03642	0.892	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	HG03742	0.925	1.027	0.0	0.0	0.962	0.988	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA12878	1.021	1.134	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA18525	1.003	1.114	0.0	0.0	0.567	0.591	1	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA18939	0.741	0.823	0.0	0.0	0.587	0.587	2	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA19017	0.878	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA19238	0.848	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA19239	0.882	0.98	0.0	0.0	0.727	0.727	2	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA19625	0.833	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA19648	0.743	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA20502	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	115909493	115910188	DEL	696	NA20845	0.878	0.976	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG00096	0.771	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG00268	0.876	0.973	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG00419	0.966	1.074	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG00759	0.712	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG01051	0.826	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG01112	0.704	0.782	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG01500	0.775	0.861	0.0	0.0	0.849	0.852	2	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG01565	0.73	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG01583	1.087	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG01595	0.647	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG01879	0.858	0.953	0.0	0.0	0.774	0.774	2	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG02568	0.543	0.603	0.055	0.035	nan	nan	0	1
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG02922	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG03006	0.69	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG03052	0.372	0.413	0.061	0.042	nan	nan	0	1
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG03642	0.739	0.821	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	HG03742	0.623	0.692	0.0	0.0	0.867	0.912	1	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA12878	0.692	0.769	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA18525	0.824	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA18939	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA19017	0.382	0.424	0.111	0.049	nan	nan	0	1
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA19238	0.727	0.808	0.0	0.0	0.697	0.697	1	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA19239	0.869	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA19625	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA19648	1.025	1.138	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA20502	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116397682	116398533	DEL	852	NA20845	0.608	0.675	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG00096	0.922	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG00268	0.965	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG00419	0.777	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG00759	0.895	0.942	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG01051	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG01112	1.046	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG01500	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG01565	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG01583	1.235	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG01595	0.867	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG01879	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG02568	1.047	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG02922	0.498	0.524	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG03006	0.858	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG03052	0.918	0.967	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG03642	0.918	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	HG03742	0.362	0.381	0.017	0.086	nan	nan	0	1
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA12878	0.796	0.838	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA18525	0.877	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA18939	0.704	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA19017	1.069	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA19238	1.064	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA19239	0.842	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA19625	1.106	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA19648	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA20502	1.033	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	116463148	116463353	DEL	206	NA20845	0.923	0.972	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG00096	0.752	0.792	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG00268	0.912	0.96	0.0	0.0	0.894	0.894	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG00419	0.567	0.597	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG00759	0.671	0.707	0.0	0.0	0.462	0.437	1	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG01051	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG01112	0.913	0.961	0.0	0.0	0.734	0.734	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG01500	0.794	0.835	0.0	0.0	0.932	0.974	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG01565	0.472	0.497	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG01583	0.964	1.014	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG01595	0.721	0.758	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG01879	0.503	0.53	0.016	0.045	nan	nan	0	1
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG02568	0.659	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG02922	0.888	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG03006	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG03052	0.394	0.414	0.009	0.052	nan	nan	0	1
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG03642	0.688	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	HG03742	0.623	0.656	0.0	0.0	0.753	0.752	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA12878	0.692	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA18525	0.806	0.848	0.0	0.002	0.661	0.633	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA18939	0.944	0.994	0.0	0.0	0.752	0.752	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA19017	0.878	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA19238	0.417	0.439	0.0	0.058	0.481	0.481	4	1
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA19239	0.895	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA19625	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA19648	0.999	1.052	0.0	0.0	0.768	0.768	2	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA20502	0.904	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	120044887	120045214	DEL	328	NA20845	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG00096	0.32	0.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG00268	0.447	0.566	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG00419	0.168	0.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG00759	0.264	0.335	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG01051	0.127	0.161	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG01112	0.209	0.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG01500	0.369	0.467	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG01565	0.268	0.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG01583	0.235	0.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG01595	0.439	0.555	0.0	0.0	0.333	0.333	2	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG01879	1.119	1.416	0.0	0.215	nan	nan	0	1
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG02568	0.272	0.344	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG02922	0.152	0.192	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG03006	0.336	0.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG03052	0.175	0.221	0.0	0.101	0.667	0.667	2	1
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG03642	0.51	0.645	0.009	0.028	0.8	0.8	1	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	HG03742	0.362	0.458	0.0	0.0	0.5	0.526	1	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA12878	0.225	0.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA18525	0.627	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA18939	0.204	0.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA19017	0.477	0.604	0.0	0.0	0.667	0.698	1	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA19238	0.337	0.426	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA19239	0.22	0.279	0.0	0.128	0.559	0.559	3	1
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA19625	0.13	0.165	0.0	0.126	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA19648	0.205	0.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA20502	0.188	0.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123396716	123396851	DEL	136	NA20845	0.495	0.627	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG00096	1.185	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG00268	1.215	1.105	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG00419	1.386	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG00759	1.302	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG01051	1.736	1.578	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG01112	1.54	1.4	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG01500	1.403	1.275	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG01565	1.846	1.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG01583	1.013	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG01595	0.731	0.665	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG01879	1.156	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG02568	0.427	0.388	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG02922	0.844	0.768	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG03006	1.81	1.645	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG03052	0.612	0.557	0.0	0.095	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG03642	1.071	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	HG03742	1.126	1.023	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA12878	0.917	0.833	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA18525	0.573	0.521	0.0	0.075	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA18939	0.833	0.757	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA19017	0.725	0.66	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA19238	0.808	0.735	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA19239	0.615	0.559	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA19625	1.379	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA19648	1.537	1.397	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA20502	1.338	1.217	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr9	123852315	123852455	DEL	141	NA20845	1.283	1.167	0.007	0.002	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG00096	0.809	0.899	0.0	0.0	0.732	0.732	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG00268	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG00419	0.735	0.817	0.0	0.0	0.635	0.635	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG00759	0.61	0.678	0.0	0.0	0.923	0.874	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG01051	0.847	0.941	0.0	0.0	0.745	0.745	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG01112	0.57	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG01500	0.757	0.841	0.005	0.0	0.862	0.901	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG01565	0.73	0.811	0.0	0.0	0.707	0.707	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG01583	0.395	0.439	0.084	0.058	nan	nan	0	1
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG01595	0.689	0.766	0.0	0.0	0.605	0.605	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG01879	0.671	0.746	0.0	0.0	0.576	0.576	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG02568	0.776	0.862	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG02922	0.823	0.914	0.0	0.0	0.639	0.596	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG03006	0.802	0.891	0.0	0.0	0.756	0.756	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG03052	0.634	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG03642	0.969	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	HG03742	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA12878	0.709	0.788	0.0	0.0	0.696	0.696	2	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA18525	0.806	0.895	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA18939	0.759	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA19017	0.878	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA19238	0.7	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA19239	0.748	0.832	0.0	0.0	0.781	0.781	1	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA19625	0.625	0.694	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA19648	0.871	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA20502	0.869	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124405186	124406096	DEL	911	NA20845	0.675	0.75	0.0	0.0	0.583	0.583	2	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG00096	0.263	0.303	0.009	0.088	nan	nan	0	1
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG00268	0.643	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG00419	0.672	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG00759	0.203	0.234	0.0	0.099	nan	nan	0	1
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG01051	0.699	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG01112	0.723	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG01500	0.314	0.361	0.009	0.069	nan	nan	0	1
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG01565	0.622	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG01583	0.791	0.909	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG01595	0.0	0.0	0.047	0.178	nan	nan	0	0
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG01879	0.653	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG02568	0.659	0.758	0.0	0.022	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG02922	0.671	0.771	0.0	0.0	0.4	0.373	1	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG03006	0.0	0.0	0.01	0.177	nan	nan	0	0
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG03052	0.525	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG03642	0.382	0.439	0.011	0.11	nan	nan	0	1
chr9	124411470	124411788	DEL	319	HG03742	0.462	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA12878	0.813	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA18525	0.358	0.412	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA18939	0.592	0.681	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA19017	0.802	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA19238	0.364	0.418	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA19239	0.949	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA19625	0.755	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA19648	0.82	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA20502	0.916	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124411470	124411788	DEL	319	NA20845	0.608	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG00096	0.677	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG00268	0.554	0.668	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG00419	0.714	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG00759	0.57	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG01051	0.445	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG01112	0.437	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG01500	0.498	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG01565	0.773	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG01583	0.618	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG01595	0.585	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG01879	0.709	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG02568	0.853	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG02922	0.541	0.652	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG03006	0.466	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG03052	0.262	0.316	0.0	0.055	nan	nan	0	1
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG03642	0.663	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	HG03742	0.643	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA12878	0.813	0.98	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA18525	0.895	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA18939	0.5	0.602	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA19017	0.859	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA19238	0.754	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA19239	0.815	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA19625	0.807	0.972	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA19648	0.82	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA20502	0.681	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124514514	124514724	DEL	211	NA20845	0.495	0.597	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG00096	0.527	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG00268	0.751	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG00419	0.966	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG00759	0.712	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG01051	0.381	0.438	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG01112	0.532	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG01500	0.517	0.594	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG01565	0.494	0.567	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG01583	0.84	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG01595	0.522	0.6	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG01879	0.653	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG02568	0.737	0.847	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG02922	0.303	0.348	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG03006	0.597	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG03052	0.503	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG03642	0.79	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	HG03742	0.503	0.578	0.0	0.0	0.615	0.648	1	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA12878	0.692	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA18525	0.949	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA18939	0.87	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA19017	0.63	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA19238	0.768	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA19239	0.668	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA19625	0.833	0.957	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA19648	0.743	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA20502	0.61	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124543838	124544124	DEL	287	NA20845	0.473	0.543	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG00096	0.451	0.502	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG00268	0.554	0.616	0.0	0.056	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.2	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG01051	0.0	0.0	0.0	0.118	nan	nan	0	0
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG01112	0.494	0.549	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG01500	0.425	0.472	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG01565	0.258	0.286	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG01595	0.543	0.603	0.0	0.065	0.194	0.194	4	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG01879	0.727	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG02568	0.194	0.215	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.17	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.217	nan	nan	0	0
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG03642	0.28	0.312	0.0	0.113	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA12878	0.64	0.711	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA18939	0.426	0.473	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA19239	0.361	0.401	0.0	0.049	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA19625	0.469	0.521	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	1
chr9	124642001	124642134	DEL	134	NA20845	0.653	0.725	0.0	0.074	0.312	0.312	10	1
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG00096	0.621	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG00268	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG00419	0.882	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG00759	0.854	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG01051	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG01112	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG01500	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG01565	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG01583	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG01595	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG01879	0.336	0.336	0.0	0.064	0.85	0.85	2	1
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG02568	1.009	1.009	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG02922	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG03006	0.821	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG03052	0.7	0.7	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG03642	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	HG03742	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA12878	0.692	0.692	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA18525	0.68	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA18939	0.87	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA19017	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA19238	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA19239	0.895	0.895	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA19625	0.677	0.677	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA19648	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA20502	1.08	1.08	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	124675017	124675115	DEL	99	NA20845	0.72	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG00096	0.865	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG00268	0.894	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG00759	0.57	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG01051	0.55	0.663	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG01112	0.551	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG01500	0.628	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG01565	0.472	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG01583	1.087	1.31	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG01595	0.48	0.579	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG01879	0.727	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG02568	0.892	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG02922	0.758	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG03006	0.858	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG03052	0.656	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG03642	0.688	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	HG03742	0.503	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA12878	0.709	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA18525	0.859	1.035	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA18939	0.555	0.669	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA19017	0.783	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA19238	0.862	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA19239	0.976	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA19625	0.833	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA19648	0.973	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA20502	0.986	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	130724040	130724132	DUP	93	NA20845	0.653	0.787	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG00096	0.724	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG00268	0.733	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG00419	0.693	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG00759	0.59	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG01051	0.275	0.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG01112	0.742	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG01500	0.978	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG01565	0.816	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG01583	0.568	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG01595	0.627	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG01879	0.764	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG02568	0.659	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG02922	0.476	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG03006	0.522	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG03052	0.7	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG03642	0.726	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	HG03742	0.362	0.458	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA12878	0.839	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA18525	0.877	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA18939	0.407	0.516	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA19017	0.42	0.532	0.0	0.049	0.889	0.848	1	1
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA19238	0.714	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA19239	0.762	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA19625	0.495	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA19648	0.538	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA20502	0.822	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	131825659	131825718	DEL	60	NA20845	0.81	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG00096	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG00268	0.751	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG00419	0.63	0.7	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG00759	0.57	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG01051	0.593	0.659	0.0	0.0	0.364	0.364	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG01112	0.513	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG01500	0.591	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG01565	0.537	0.596	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG01583	0.692	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG01595	0.668	0.743	0.0	0.0	0.893	0.893	4	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG01879	0.69	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG02568	0.737	0.819	0.005	0.005	0.798	0.798	4	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG02922	0.693	0.77	0.0	0.0	0.706	0.659	3	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG03006	0.616	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG03052	0.656	0.729	0.0	0.0	0.923	0.923	2	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG03642	0.459	0.51	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	HG03742	0.643	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA12878	0.778	0.865	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA18525	0.645	0.716	0.0	0.0	0.467	0.487	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA18939	0.704	0.782	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA19017	0.725	0.806	0.0	0.0	0.742	0.741	6	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA19238	0.66	0.733	0.0	0.0	0.87	0.87	7	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA19239	0.428	0.475	0.08	0.035	nan	nan	0	1
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA19625	0.703	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA19648	0.717	0.797	0.0	0.0	0.692	0.692	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA20502	0.822	0.913	0.0	0.0	0.444	0.42	1	2
chr9	132123553	132124393	DEL	841	NA20845	0.698	0.775	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG00096	0.922	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG00268	0.751	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG00419	0.798	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG00759	0.61	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG01051	0.402	0.529	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG01112	0.799	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG01500	0.646	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG01565	0.279	0.367	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG01583	0.568	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG01595	0.71	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG01879	0.634	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG02568	0.931	1.225	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG02922	0.433	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG03006	0.858	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG03052	0.678	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG03642	0.51	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	HG03742	0.503	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA12878	0.761	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA18525	0.824	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA18939	0.555	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA19017	0.745	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA19238	0.848	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA19625	1.041	1.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA19648	0.897	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA20502	0.822	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	134719247	134719313	DUP	67	NA20845	0.495	0.652	0.0	0.008	1.0	1.0	1	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG00096	0.922	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG00268	0.894	0.993	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG00419	0.756	0.84	0.0	0.0	0.941	0.941	3	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG00759	0.793	0.881	0.0	0.0	0.857	0.812	1	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG01051	0.931	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG01112	0.704	0.782	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG01500	0.904	1.005	0.0	0.0	0.666	0.668	2	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG01565	1.073	1.192	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG01583	0.791	0.879	0.0	0.005	0.706	0.706	3	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG01595	0.856	0.951	0.0	0.0	0.9	0.9	3	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG01879	1.081	1.202	0.0	0.0	0.828	0.828	4	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG02568	0.853	0.948	0.0	0.0	0.788	0.788	4	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG02922	0.671	0.746	0.0	0.0	0.833	0.835	4	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG03006	0.728	0.808	0.0	0.0	0.531	0.531	4	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG03052	0.897	0.996	0.0	0.0	0.825	0.825	2	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG03642	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	HG03742	0.724	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA12878	1.038	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA18525	0.519	0.577	0.044	0.002	0.846	0.811	1	1
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA18939	0.815	0.905	0.004	0.0	0.594	0.594	3	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA19017	0.821	0.912	0.0	0.0	0.905	0.948	3	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA19238	0.714	0.793	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA19239	0.895	0.995	0.0	0.0	0.761	0.761	2	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA19625	0.885	0.983	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA19648	0.845	0.939	0.008	0.005	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA20502	0.892	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	135200464	135201233	DEL	770	NA20845	0.675	0.75	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG00419	0.0	0.0	0.014	0.089	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.159	nan	nan	0	1
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG01051	0.381	0.381	0.0	0.076	0.471	0.471	1	1
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG01500	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.082	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.114	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.12	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG02922	0.476	0.476	0.0	0.064	0.417	0.446	1	1
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.123	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.128	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.124	nan	nan	0	1
chr9	135296997	135297073	DEL	77	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.071	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.086	nan	nan	0	1
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.133	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.118	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chr9	135296997	135297073	DEL	77	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	1
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG00096	0.621	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG00268	0.813	0.813	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG00419	0.861	0.861	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG00759	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG01051	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG01112	0.666	0.666	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG01500	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG01565	1.181	1.181	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG01583	1.235	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG01595	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG02568	0.815	0.815	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG02922	0.953	0.953	0.0	0.0	0.778	0.833	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG03006	0.821	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG03052	0.853	0.853	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG03642	1.249	1.249	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	HG03742	1.065	1.065	0.0	0.004	0.733	0.697	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA12878	0.709	0.709	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA18525	0.824	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA18939	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA19017	1.184	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA19238	0.754	0.754	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA19239	1.082	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA19625	1.119	1.119	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA19648	0.794	0.794	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA20502	1.08	1.08	0.0	0.0	0.833	0.882	1	2
chr9	13661164	13661347	DUP	184	NA20845	0.991	0.991	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG00096	0.583	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG00268	0.804	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG00419	0.966	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG00759	0.529	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG01051	0.339	0.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG01112	0.78	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG01500	0.775	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG01565	0.773	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG01583	0.766	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG01595	0.731	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG02922	0.953	1.095	0.0	0.0	0.882	0.945	1	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG03006	0.784	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG03642	0.969	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	HG03742	0.462	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA12878	1.021	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA18525	0.859	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA18939	0.704	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA19017	0.592	0.68	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA19238	0.916	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA19239	0.815	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA19625	0.703	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA19648	1.153	1.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA20502	0.704	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	137815581	137815641	DUP	61	NA20845	0.765	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG00096	0.752	0.952	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG00268	0.697	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG00419	0.357	0.452	0.018	0.071	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG00759	0.183	0.232	0.0	0.096	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG01051	0.402	0.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG01112	0.323	0.409	0.014	0.028	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG01500	0.461	0.584	0.01	0.083	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG01565	0.0	0.0	0.026	0.17	nan	nan	0	0
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG01583	0.692	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG01595	0.188	0.238	0.013	0.06	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG01879	0.28	0.354	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG02568	0.621	0.786	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG02922	0.281	0.356	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG03006	0.243	0.307	0.015	0.088	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG03052	0.372	0.471	0.0	0.114	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.162	nan	nan	0	0
chr9	139427520	139427786	DEL	267	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.154	nan	nan	0	0
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA12878	0.692	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA18525	0.609	0.771	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA18939	0.0	0.0	0.01	0.178	nan	nan	0	0
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA19017	0.0	0.0	0.014	0.184	nan	nan	0	0
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA19239	0.441	0.558	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA19625	0.39	0.494	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA19648	0.384	0.486	0.0	0.051	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA20502	0.211	0.267	0.0	0.052	nan	nan	0	1
chr9	139427520	139427786	DEL	267	NA20845	0.293	0.37	0.011	0.069	0.375	0.375	1	1
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG00096	1.053	1.053	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG00268	0.965	0.965	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG00419	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG00759	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG01051	0.762	0.762	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG01112	0.818	0.818	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG01500	0.849	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG01565	1.374	1.374	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG01583	0.494	0.494	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG01595	0.773	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG01879	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG02568	1.086	1.086	0.012	0.0	0.917	0.917	1	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG02922	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG03006	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG03052	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG03642	0.612	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	HG03742	0.945	0.945	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA12878	0.917	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA18525	0.483	0.483	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA18939	0.5	0.5	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA19017	0.974	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA19238	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA19239	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA19625	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA19648	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA20502	0.986	0.986	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	140185072	140185842	DEL	771	NA20845	0.9	0.9	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG00096	0.301	0.274	0.0	0.071	0.613	0.613	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG00268	0.304	0.276	0.0	0.065	0.909	0.909	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG00419	0.378	0.344	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG00759	0.325	0.296	0.0	0.042	0.842	0.798	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG01051	0.339	0.308	0.0	0.005	1.0	1.0	1	2
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG01112	0.399	0.363	0.0	0.045	0.649	0.649	2	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG01500	0.295	0.268	0.0	0.057	0.8	0.765	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG01565	0.279	0.254	0.0	0.043	0.786	0.786	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG01583	0.272	0.247	0.0	0.055	0.556	0.556	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG01595	0.292	0.266	0.0	0.031	0.65	0.65	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG01879	0.448	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG02568	0.272	0.247	0.0	0.058	0.818	0.818	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG02922	0.152	0.138	0.0	0.085	0.556	0.519	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG03052	0.197	0.179	0.0	0.05	0.824	0.824	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG03642	0.229	0.209	0.009	0.035	1.0	1.0	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	0
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA12878	0.363	0.33	0.0	0.076	0.917	0.917	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.113	nan	nan	0	0
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA19017	0.248	0.226	0.0	0.032	0.929	0.886	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA19238	0.202	0.184	0.0	0.049	0.382	0.382	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA19239	0.281	0.255	0.0	0.055	0.692	0.692	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA19648	0.333	0.303	0.0	0.062	0.733	0.733	1	1
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA20502	0.329	0.299	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	15602580	15602666	DEL	87	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG00096	0.433	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG00268	0.59	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.193	nan	nan	0	0
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG00759	0.427	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG01051	0.381	0.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG01112	0.133	0.14	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG01500	0.212	0.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG01565	0.279	0.294	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG01583	0.297	0.312	0.0	0.003	nan	nan	0	1
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG01595	0.376	0.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG01879	0.392	0.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG02568	0.272	0.286	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG02922	0.216	0.228	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG03006	0.261	0.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG03052	0.481	0.506	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG03642	0.102	0.107	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chr9	16847393	16847518	DEL	126	HG03742	0.382	0.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA12878	0.484	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA18525	0.251	0.264	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA18939	0.546	0.575	0.0	0.0	0.125	0.125	1	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA19017	0.305	0.322	0.0	0.094	0.923	0.967	1	1
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA19238	0.673	0.709	0.0	0.0	0.167	0.167	2	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA19239	0.788	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA19625	0.208	0.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA19648	0.41	0.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA20502	0.493	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	16847393	16847518	DEL	126	NA20845	0.36	0.379	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG00096	0.978	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG00268	0.393	0.382	0.0	0.031	0.933	0.933	1	1
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG00419	1.344	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG00759	1.404	1.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG01051	1.524	1.48	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG01112	0.494	0.48	0.0	0.029	0.9	0.9	1	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG01500	1.495	1.451	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG01565	1.417	1.375	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG01583	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG01595	1.044	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG01879	1.063	1.032	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG02568	0.892	0.866	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG02922	1.277	1.24	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG03006	1.362	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG03052	1.137	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG03642	1.224	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	HG03742	1.387	1.347	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA12878	1.245	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA18525	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA18939	1.315	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA19017	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA19238	1.266	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA19239	1.229	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA19625	1.145	1.112	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA19648	1.306	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA20502	1.01	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18387932	18387989	DEL	58	NA20845	1.441	1.399	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG00096	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG00268	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG00419	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG00759	1.241	1.241	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG01051	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG01112	0.875	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG01500	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG01565	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG01583	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG01595	1.358	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG01879	0.998	0.998	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG02568	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG02922	1.223	1.223	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG03006	1.269	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG03052	0.547	0.547	0.0	0.03	0.484	0.484	1	1
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG03642	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	HG03742	1.266	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA12878	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA18525	1.101	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA18939	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA19017	1.031	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA19238	1.172	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA19239	1.123	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA19625	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA19648	1.178	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA20502	1.315	1.315	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	18396974	18397065	DEL	92	NA20845	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG00096	0.639	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG00268	0.626	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG00419	0.609	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG00759	0.793	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG01051	0.741	0.852	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG01112	0.78	0.896	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG01500	0.923	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG01565	0.923	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG01583	0.741	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG01595	0.668	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG01879	0.503	0.579	0.0	0.0	0.867	0.867	3	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	0
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG02922	0.195	0.224	0.0	0.051	0.917	0.856	1	1
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG03006	0.653	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG03642	0.586	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	HG03742	0.503	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA12878	0.536	0.616	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA18525	0.788	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA18939	0.981	1.128	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA19017	0.477	0.549	0.0	0.06	0.71	0.743	1	1
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA19239	0.869	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA19625	1.015	1.167	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA19648	0.307	0.353	0.0	0.047	0.529	0.529	1	1
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA20502	1.197	1.376	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	18942025	18942107	DEL	83	NA20845	0.54	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG00096	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG00268	1.108	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG00419	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG00759	0.753	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG01051	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG01112	0.78	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG01500	0.849	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG01565	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG01583	1.161	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG01595	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG01879	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG02568	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG02922	0.563	0.563	0.102	0.063	nan	nan	0	1
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG03006	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG03052	1.006	1.006	0.0	0.0	0.519	0.519	1	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG03642	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	HG03742	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA12878	0.83	0.83	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA18525	0.967	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA18939	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA19017	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA19238	0.929	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA19239	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA19625	1.145	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA19648	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA20502	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	19547512	19548290	DEL	779	NA20845	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG00096	1.072	1.041	0.0	0.0	0.44	0.44	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG00268	1.144	1.111	0.0	0.0	0.923	0.923	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG00419	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG00759	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG01051	1.207	1.171	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG01112	1.027	0.997	0.0	0.0	0.759	0.759	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG01500	1.218	1.183	0.005	0.0	0.632	0.66	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG01565	1.46	1.417	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG01583	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG01595	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG01879	1.1	1.068	0.005	0.0	0.8	0.8	4	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG03006	1.082	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG03642	1.198	1.163	0.0	0.0	0.81	0.81	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	HG03742	1.085	1.054	0.0	0.0	0.724	0.762	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA12878	0.917	0.89	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA18525	1.253	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA18939	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA19017	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA19238	1.01	0.981	0.0	0.0	0.675	0.675	2	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA19239	1.363	1.323	0.0	0.0	0.809	0.809	1	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA19625	1.093	1.061	0.0	0.0	0.889	0.889	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA19648	0.973	0.945	0.0	0.0	0.615	0.615	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA20502	1.174	1.14	0.0	0.0	0.826	0.78	3	2
chr9	22385497	22386084	DUP	588	NA20845	1.261	1.224	0.0	0.004	0.765	0.765	1	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG00096	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG00268	1.287	1.287	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG00419	1.092	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG00759	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG01051	0.593	0.593	0.011	0.114	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG01112	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG01500	1.071	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG01565	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG01583	1.211	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG01595	0.0	0.0	0.073	0.236	nan	nan	0	0
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG01879	0.559	0.559	0.009	0.075	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG02568	0.815	0.815	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG02922	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG03006	1.343	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG03052	0.569	0.569	0.043	0.128	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG03642	0.79	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	HG03742	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA12878	0.484	0.484	0.004	0.084	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA18525	0.51	0.51	0.009	0.069	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA18939	0.63	0.63	0.021	0.123	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA19017	0.477	0.477	0.021	0.06	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA19238	0.0	0.0	0.009	0.229	nan	nan	0	0
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA19239	0.588	0.588	0.003	0.098	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA19625	0.547	0.547	0.019	0.111	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA19648	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA20502	0.634	0.634	0.012	0.075	nan	nan	0	1
chr9	22653359	22653768	DEL	410	NA20845	1.238	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG00096	0.903	0.876	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG00268	0.733	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG00419	1.26	1.224	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG00759	1.363	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG01051	0.91	0.884	0.0	0.004	0.565	0.565	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG01112	0.856	0.831	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG01500	0.849	0.824	0.0	0.0	0.955	0.998	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG01565	0.73	0.709	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG01583	0.346	0.336	0.059	0.066	nan	nan	0	1
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG01595	0.835	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG01879	1.044	1.014	0.0	0.0	0.848	0.848	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG02568	0.504	0.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG02922	0.476	0.462	0.051	0.081	nan	nan	0	1
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG03006	0.97	0.942	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG03052	0.394	0.382	0.072	0.093	nan	nan	0	1
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG03642	0.841	0.817	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	HG03742	0.884	0.859	0.0	0.0	0.923	0.972	1	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA12878	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA18525	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA18939	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA19017	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA19238	1.158	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA19239	1.069	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA19625	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA19648	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA20502	1.151	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22666399	22666923	DEL	525	NA20845	0.9	0.874	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG00096	0.94	0.913	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG00268	0.554	0.538	0.062	0.069	nan	nan	0	1
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG00419	0.525	0.51	0.035	0.026	nan	nan	0	1
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG00759	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG01051	0.91	0.884	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG01112	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG01500	0.535	0.52	0.036	0.026	nan	nan	0	1
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG01565	1.331	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG01583	0.803	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG01595	1.337	1.298	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG01879	1.231	1.195	0.0	0.0	0.553	0.553	1	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG02568	0.97	0.941	0.0	0.0	0.697	0.697	2	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG02922	0.909	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG03006	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG03052	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG03642	0.943	0.916	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	HG03742	0.452	0.439	0.033	0.065	nan	nan	0	1
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA12878	0.848	0.823	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA18525	1.056	1.026	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA18939	0.444	0.431	0.027	0.047	nan	nan	0	1
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA19017	0.916	0.89	0.0	0.0	0.432	0.438	2	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA19238	0.525	0.51	0.02	0.053	nan	nan	0	1
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA19239	1.149	1.116	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA19625	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA19648	1.153	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA20502	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	22991724	22992239	DEL	516	NA20845	0.878	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG00096	1.241	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG00268	1.126	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG00419	1.092	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG00759	1.322	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG01051	1.757	1.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG01112	1.426	1.333	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG01500	0.831	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG01565	1.159	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG01583	0.754	0.704	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG01595	1.441	1.347	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG01879	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG02568	1.047	0.979	0.0	0.0	0.833	0.833	5	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG02922	1.234	1.153	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG03006	1.465	1.369	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG03052	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG03642	0.484	0.453	0.019	0.087	nan	nan	0	1
chr9	23115019	23115320	DEL	302	HG03742	1.246	1.165	0.0	0.0	0.931	0.884	1	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA12878	1.003	0.938	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA18525	1.074	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA18939	1.222	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA19017	1.126	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA19238	1.266	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA19239	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA19625	0.599	0.559	0.008	0.064	nan	nan	0	1
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA19648	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA20502	0.939	0.878	0.0	0.0	0.8	0.756	5	2
chr9	23115019	23115320	DEL	302	NA20845	1.148	1.073	0.0	0.0	0.519	0.519	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG00096	1.335	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG00268	1.072	1.002	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG00419	1.05	0.981	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG00759	1.18	1.103	0.0	0.0	0.727	0.768	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG01051	0.889	0.831	0.0	0.004	0.824	0.824	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG01112	1.464	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG01500	0.48	0.448	0.0	0.108	nan	nan	0	1
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG01565	1.052	0.983	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG01583	0.964	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG01595	1.211	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG01879	1.1	1.028	0.005	0.0	0.833	0.833	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG02568	1.009	0.943	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG02922	1.321	1.234	0.0	0.0	0.853	0.914	2	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG03006	1.231	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG03052	1.312	1.226	0.0	0.0	0.657	0.657	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG03642	1.071	1.001	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	HG03742	1.226	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA12878	1.09	1.018	0.0	0.0	0.774	0.774	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA18525	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA18939	1.185	1.107	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA19017	1.394	1.302	0.0	0.0	0.651	0.622	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA19238	1.172	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA19239	1.002	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA19625	1.301	1.216	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA19648	1.23	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA20502	1.221	1.141	0.0	0.0	0.88	0.932	1	2
chr9	26010744	26010856	DEL	113	NA20845	1.036	0.968	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG00096	0.846	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG00268	1.072	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG00419	0.861	0.906	0.016	0.0	0.762	0.762	1	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG00759	0.915	0.964	0.0	0.0	1.0	0.947	1	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG01051	0.974	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG01112	0.837	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG01500	0.923	0.971	0.0	0.0	0.792	0.828	1	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG01565	0.923	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG01583	1.112	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG01595	1.19	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG01879	0.559	0.589	0.0	0.09	0.504	0.504	2	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG02568	0.931	0.98	0.0	0.017	0.8	0.8	2	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG02922	0.953	1.003	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG03006	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG03052	0.809	0.852	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG03642	0.892	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	HG03742	0.844	0.889	0.0	0.0	0.702	0.667	2	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA12878	0.605	0.637	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA18525	1.021	1.074	0.0	0.0	0.811	0.846	2	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA18939	1.111	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA19017	0.725	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA19238	0.566	0.595	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA19239	0.535	0.563	0.0	0.082	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA19625	0.859	0.904	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA19648	0.999	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA20502	0.822	0.865	0.0	0.0	0.879	0.83	2	2
chr9	26124278	26124388	DEL	111	NA20845	0.765	0.806	0.0	0.0	0.516	0.516	2	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG00096	1.354	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG00268	0.912	0.885	0.0	0.0	0.879	0.879	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG00419	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG00759	0.895	0.869	0.0	0.0	0.944	0.997	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG01051	1.122	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG01112	0.875	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG01500	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG01565	1.073	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG01583	1.013	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG01595	1.358	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG01879	0.41	0.398	0.036	0.073	nan	nan	0	1
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG02568	1.241	1.205	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG02922	1.212	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG03006	1.045	1.014	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG03052	1.268	1.231	0.0	0.0	0.833	0.833	3	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG03642	1.529	1.485	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	HG03742	1.166	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA12878	1.142	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA18525	1.092	1.06	0.005	0.0	0.697	0.668	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA18939	0.852	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA19017	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA19238	1.037	1.007	0.0	0.0	0.659	0.659	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA19239	1.029	0.999	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA19625	1.015	0.986	0.005	0.0	0.824	0.824	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA19648	0.999	0.97	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA20502	1.268	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	26459832	26460383	DEL	552	NA20845	1.216	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG00096	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG00268	0.947	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG00419	1.082	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG00759	0.976	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG01051	0.953	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG01112	0.97	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG01500	0.812	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG01565	0.622	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG01583	0.667	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG01595	0.815	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG01879	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG02568	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG02922	0.888	0.986	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG03006	0.896	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG03052	0.809	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG03642	0.892	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	HG03742	0.864	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA12878	0.882	0.98	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA18525	0.949	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA18939	0.722	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA19017	0.401	0.445	0.0	0.077	0.694	0.662	2	1
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA19238	0.949	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA19239	1.096	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA19625	0.573	0.636	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA19648	1.101	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA20502	0.728	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28011904	28011985	DEL	82	NA20845	0.867	0.963	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG00096	1.053	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG00268	0.84	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG00419	0.63	0.578	0.0	0.025	0.389	0.389	1	1
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG00759	0.834	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG01051	0.974	0.893	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG01112	1.312	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG01500	1.163	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG01565	0.987	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG01583	1.211	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG01595	0.982	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG01879	0.429	0.393	0.0	0.024	0.826	0.826	1	1
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG02568	0.737	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG02922	1.104	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG03006	0.914	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG03052	0.787	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG03642	0.79	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	HG03742	0.462	0.424	0.007	0.022	0.69	0.726	1	1
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA12878	0.83	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA18525	1.038	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA18939	0.518	0.476	0.007	0.025	0.833	0.833	1	1
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA19017	0.935	0.858	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA19238	0.862	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA19239	0.454	0.417	0.0	0.026	0.973	0.973	1	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA19625	1.432	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA19648	1.306	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA20502	1.057	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	28376991	28377041	DEL	51	NA20845	1.261	1.157	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.142	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.144	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.121	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG01051	0.0	0.0	0.007	0.131	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.145	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG01500	0.0	0.0	0.007	0.122	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG01583	0.0	0.0	0.0	0.143	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.112	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG01879	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG02568	0.582	0.646	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.103	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.173	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.148	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.125	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.136	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.122	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA19017	0.344	0.382	0.0	0.069	0.923	0.881	1	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.132	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA19239	0.428	0.475	0.0	0.058	0.513	0.513	1	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA19625	0.495	0.549	0.0	0.073	0.682	0.682	1	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.151	nan	nan	0	0
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.09	nan	nan	0	1
chr9	28584919	28585011	DEL	93	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.126	nan	nan	0	0
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG00096	1.204	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG00268	0.59	0.573	0.0	0.077	0.652	0.652	1	1
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG00419	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG00759	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG01051	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG01112	1.312	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG01500	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG01565	0.601	0.583	0.021	0.094	0.655	0.655	1	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG01583	1.186	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG01595	1.546	1.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG01879	0.392	0.38	0.0	0.095	0.733	0.733	1	1
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG02568	0.504	0.49	0.0	0.026	0.467	0.467	1	1
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG02922	0.844	0.82	0.0	0.0	0.867	0.929	1	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG03006	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG03052	0.765	0.743	0.0	0.073	0.657	0.657	1	1
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG03642	1.032	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	HG03742	1.246	1.21	0.0	0.0	0.871	0.917	1	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA12878	0.865	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA18525	0.967	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA18939	1.185	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA19017	0.993	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA19238	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.139	nan	nan	0	1
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA19625	1.119	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA19648	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA20502	0.904	0.878	0.0	0.0	0.583	0.618	1	2
chr9	29932800	29932891	DEL	92	NA20845	0.923	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG00096	1.128	1.055	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG00268	1.037	0.969	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG00419	1.134	1.06	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG00759	1.485	1.388	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG01051	0.762	0.712	0.0	0.048	0.59	0.59	1	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG01112	0.97	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG01500	0.941	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG01565	0.708	0.662	0.0	0.047	0.97	0.97	1	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG01583	1.063	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG01595	1.211	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG01879	0.988	0.924	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG02568	0.504	0.471	0.0	0.035	0.846	0.846	1	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.074	nan	nan	0	0
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG03052	0.394	0.368	0.0	0.026	0.895	0.895	1	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG03642	0.943	0.881	0.0	0.043	0.625	0.625	1	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	HG03742	1.186	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.101	nan	nan	0	0
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA18525	1.307	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA18939	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA19017	0.535	0.5	0.0	0.079	0.882	0.924	1	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA19239	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA19625	0.573	0.535	0.0	0.051	0.958	0.958	1	1
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA19648	0.922	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA20502	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	30004922	30004992	DEL	71	NA20845	1.373	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG00096	1.204	1.104	0.0	0.003	0.794	0.794	1	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG00268	0.983	0.902	0.004	0.003	0.5	0.5	1	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG00419	1.344	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG00759	1.566	1.437	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG01051	0.677	0.621	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG01112	0.475	0.436	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG01500	1.421	1.304	0.0	0.0	0.8	0.765	1	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG01565	1.202	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG01583	1.285	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG01595	1.504	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG01879	1.1	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG02568	1.358	1.246	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG02922	1.061	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG03006	1.25	1.147	0.0	0.0	0.968	0.968	1	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG03052	0.94	0.863	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG03642	0.663	0.608	0.0	0.077	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	HG03742	1.186	1.088	0.0	0.0	0.786	0.746	1	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA12878	0.346	0.317	0.0	0.112	0.176	0.176	1	1
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA18525	0.949	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA18939	1.278	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA19017	1.126	1.033	0.0	0.0	0.759	0.724	1	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA19238	1.104	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA19239	1.256	1.152	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA19625	0.625	0.573	0.01	0.088	nan	nan	0	2
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA19648	0.538	0.493	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA20502	0.0	0.0	0.008	0.192	nan	nan	0	1
chr9	31239842	31240052	DEL	211	NA20845	1.396	1.281	0.0	0.003	0.95	0.95	1	2
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG00096	0.47	0.495	0.044	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG00268	0.965	1.016	0.0	0.0	0.576	0.576	2	2
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG00419	0.0	0.0	0.129	0.027	nan	nan	0	0
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG00759	0.488	0.514	0.062	0.021	0.23	0.243	8	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG01051	0.36	0.379	0.045	0.015	0.24	0.24	2	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG01112	0.342	0.36	0.059	0.005	0.24	0.24	6	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG01500	0.498	0.525	0.08	0.0	0.243	0.254	6	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG01565	0.816	0.859	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG01583	0.815	0.858	0.0	0.0	0.462	0.462	2	2
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG01595	0.397	0.418	0.047	0.003	0.562	0.562	8	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG01879	0.354	0.373	0.086	0.0	0.225	0.225	8	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG02568	0.349	0.367	0.029	0.012	1.0	1.0	1	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG02922	0.758	0.798	0.009	0.0	0.688	0.737	2	2
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG03006	0.336	0.353	0.06	0.02	nan	nan	0	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG03052	0.743	0.783	0.0	0.0	0.726	0.726	2	2
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG03642	0.306	0.322	0.047	0.013	nan	nan	0	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	HG03742	0.402	0.423	0.053	0.0	0.214	0.226	3	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA12878	0.536	0.564	0.041	0.0	0.188	0.188	10	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA18525	0.0	0.0	0.25	0.004	nan	nan	0	0
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA18939	0.0	0.0	0.227	0.041	nan	nan	0	0
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA19017	0.439	0.462	0.059	0.01	nan	nan	0	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA19238	0.364	0.383	0.042	0.005	nan	nan	0	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA19239	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA19625	0.0	0.0	0.191	0.005	nan	nan	0	0
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA19648	0.0	0.0	0.189	0.036	nan	nan	0	0
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA20502	0.657	0.692	0.048	0.008	nan	nan	0	1
chr9	33213068	33213929	DEL	862	NA20845	0.788	0.829	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG00096	0.433	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG00268	0.947	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG00759	0.529	0.557	0.0	0.0	0.154	0.162	4	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG01051	0.423	0.446	0.0	0.006	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG01112	0.323	0.34	0.0	0.0	0.231	0.231	3	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG01500	0.443	0.466	0.014	0.0	0.155	0.162	2	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG01565	0.816	0.859	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG01583	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG01595	0.397	0.418	0.0	0.0	0.31	0.31	4	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG01879	0.336	0.353	0.0	0.0	0.194	0.194	4	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG02568	0.388	0.408	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG02922	0.606	0.638	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG03006	0.336	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG03052	0.743	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG03642	0.306	0.322	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	HG03742	0.402	0.423	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA12878	0.519	0.546	0.0	0.0	0.167	0.167	6	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA19017	0.458	0.482	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA19238	0.391	0.411	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA19239	1.056	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA20502	0.681	0.717	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chr9	33213125	33213403	DEL	279	NA20845	0.765	0.806	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG00096	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG00268	0.876	0.876	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG00419	1.134	1.134	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG00759	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG01051	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG01112	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG01500	0.812	0.812	0.006	0.0	0.955	0.998	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG01565	1.073	1.073	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG01583	1.087	1.087	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG01595	0.919	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG01879	0.932	0.932	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG02568	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG02922	0.888	0.888	0.0	0.0	0.842	0.902	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG03006	0.858	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG03052	0.743	0.743	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG03642	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	HG03742	1.025	1.025	0.0	0.003	0.583	0.614	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA12878	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA18525	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA18939	0.87	0.87	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA19017	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA19238	0.875	0.875	0.0	0.003	0.724	0.724	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA19239	0.962	0.962	0.0	0.0	0.629	0.629	1	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA19625	0.729	0.729	0.139	0.006	nan	nan	0	1
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA19648	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA20502	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	33909658	33910387	DEL	730	NA20845	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG00096	0.433	0.433	0.096	0.021	0.111	0.111	1	1
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG00268	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG00419	0.441	0.441	0.054	0.003	0.25	0.25	2	1
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG00759	1.139	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG01051	0.529	0.529	0.068	0.012	0.286	0.286	11	1
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG01112	1.065	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG01500	0.388	0.388	0.111	0.017	0.258	0.27	8	1
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG01565	0.966	0.966	0.007	0.005	0.609	0.609	1	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG01583	0.717	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG01595	0.961	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG01879	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG02568	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG02922	0.888	0.888	0.0	0.004	0.583	0.544	1	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG03006	0.485	0.485	0.069	0.004	nan	nan	0	1
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG03052	1.159	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG03642	0.51	0.51	0.089	0.0	nan	nan	0	1
chr9	36474157	36474999	DEL	843	HG03742	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA12878	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA18525	0.573	0.573	0.093	0.009	0.231	0.221	6	1
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA18939	0.944	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA19017	0.821	0.821	0.0	0.0	0.481	0.46	1	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA19238	0.956	0.956	0.0	0.0	0.587	0.587	1	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA19239	0.949	0.949	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA19625	0.989	0.989	0.01	0.0	0.682	0.682	1	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA19648	0.845	0.845	0.0	0.0	0.525	0.525	2	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA20502	0.798	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	36474157	36474999	DEL	843	NA20845	0.428	0.428	0.03	0.009	nan	nan	0	1
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG00096	0.94	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG00268	1.197	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG00419	1.092	1.214	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG00759	1.037	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG01051	1.058	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG01112	1.16	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG01500	1.144	1.271	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG01565	1.266	1.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG01583	1.334	1.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG01595	1.316	1.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG01879	0.914	1.015	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG02568	1.435	1.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG02922	1.104	1.227	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG03006	1.25	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG03052	1.072	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG03642	0.841	0.935	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	HG03742	0.985	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA12878	1.228	1.365	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA18525	1.146	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA18939	0.963	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA19017	1.26	1.4	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA19238	0.875	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA19239	1.029	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA19625	1.119	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA19648	1.101	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA20502	1.268	1.409	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	37008642	37008734	DEL	93	NA20845	0.653	0.725	0.0	0.091	0.773	0.773	1	1
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG00096	1.016	1.016	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG00268	0.912	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG00419	0.756	0.756	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG00759	1.241	1.241	0.0	0.0	0.821	0.778	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG01051	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG01112	0.913	0.913	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG01500	0.517	0.517	0.0	0.072	0.802	0.838	2	1
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG01565	0.88	0.88	0.0	0.0	0.409	0.409	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG01583	0.815	0.815	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG01595	1.232	1.232	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG01879	0.466	0.466	0.0	0.048	0.741	0.741	2	1
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG02568	0.621	0.621	0.0	0.053	0.317	0.317	2	1
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG02922	0.325	0.325	0.0	0.047	0.64	0.634	2	1
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG03006	1.045	1.045	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG03052	0.809	0.809	0.0	0.0	0.348	0.348	2	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG03642	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	HG03742	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA12878	0.951	0.951	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA18525	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA18939	1.241	1.241	0.0	0.0	0.548	0.548	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA19017	0.84	0.84	0.0	0.0	0.812	0.81	2	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA19238	1.145	1.145	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA19239	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA19625	1.067	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA19648	1.153	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA20502	1.151	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	4075064	4075150	DEL	87	NA20845	0.968	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG00096	1.091	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG00268	1.162	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG00419	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG00759	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG01051	1.122	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG01112	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG01500	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG01565	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG01583	0.914	0.914	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG01595	1.107	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG01879	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG02568	1.435	1.435	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG02922	1.039	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG03006	0.951	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG03052	1.421	1.421	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG03642	1.275	1.275	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	HG03742	1.146	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA12878	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA18525	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA18939	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA19017	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA19238	0.512	0.512	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chr9	508544	508825	DEL	282	NA19239	0.468	0.468	0.0	0.056	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA19625	1.301	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA19648	1.358	1.358	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA20502	1.209	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	508544	508825	DEL	282	NA20845	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG00096	0.357	0.376	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG00419	0.966	1.017	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG00759	0.732	0.771	0.0	0.0	0.889	0.842	1	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG01051	0.826	0.869	0.011	0.004	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG01112	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG01500	0.941	0.991	0.0	0.0	0.941	0.957	5	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG01565	0.386	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG01583	0.865	0.91	0.0	0.0	0.7	0.7	3	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG01879	0.876	0.923	0.0	0.0	0.733	0.733	7	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG02568	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG02922	0.693	0.729	0.0	0.0	0.715	0.718	4	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG03006	0.802	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG03052	0.743	0.783	0.0	0.0	0.658	0.658	4	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG03642	0.382	0.402	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	6701890	6702631	DEL	742	HG03742	0.985	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA12878	1.038	1.093	0.0	0.0	0.738	0.738	4	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA18525	0.985	1.037	0.0	0.0	0.75	0.719	1	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA18939	0.852	0.897	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA19017	0.974	1.025	0.0	0.0	0.762	0.754	3	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA19238	0.66	0.695	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA19239	0.722	0.76	0.0	0.0	0.933	0.933	4	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA19625	0.442	0.466	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA19648	0.999	1.052	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA20502	0.916	0.964	0.0	0.004	0.8	0.847	5	2
chr9	6701890	6702631	DEL	742	NA20845	0.991	1.043	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG00096	0.696	0.733	0.0	0.0	0.654	0.654	8	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG00268	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG00419	0.294	0.31	0.059	0.032	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG00759	0.0	0.0	0.261	0.135	nan	nan	0	0
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG01051	0.339	0.357	0.063	0.029	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG01112	0.285	0.3	0.096	0.038	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG01500	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG01565	0.343	0.361	0.105	0.04	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG01583	0.84	0.884	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG01595	0.272	0.286	0.082	0.065	0.75	0.75	2	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG01879	0.764	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG02568	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG02922	0.0	0.0	0.284	0.096	nan	nan	0	0
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG03006	0.672	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG03052	0.0	0.0	0.359	0.124	nan	nan	0	0
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG03642	0.752	0.792	0.0	0.0	0.615	0.615	7	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	HG03742	0.0	0.0	0.164	0.099	nan	nan	0	0
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA12878	0.467	0.492	0.048	0.025	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA18525	0.0	0.0	0.281	0.094	nan	nan	0	0
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA18939	0.333	0.351	0.079	0.023	0.8	0.8	1	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA19017	0.363	0.382	0.087	0.037	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA19238	0.323	0.34	0.185	0.044	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA19239	0.414	0.436	0.167	0.062	nan	nan	0	1
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA19625	0.729	0.767	0.0	0.0	0.583	0.583	5	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA19648	0.948	0.998	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA20502	0.564	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	6729099	6730088	DEL	990	NA20845	0.27	0.284	0.077	0.03	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG00096	0.489	0.515	0.016	0.055	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG00268	0.947	0.997	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG00419	0.672	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG00759	0.712	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG01051	0.296	0.312	0.042	0.093	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG01112	0.742	0.781	0.0	0.002	0.692	0.692	1	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG01500	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG01565	0.665	0.7	0.0	0.003	0.722	0.722	1	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG01583	0.0	0.0	0.224	0.201	nan	nan	0	0
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG01595	0.0	0.0	0.149	0.278	nan	nan	0	0
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG01879	0.392	0.412	0.009	0.052	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG02568	0.407	0.429	0.01	0.076	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG02922	0.758	0.798	0.0	0.0	0.212	0.198	2	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG03006	0.317	0.334	0.077	0.07	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG03052	0.722	0.76	0.0	0.001	0.889	0.889	1	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG03642	0.306	0.322	0.021	0.064	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	HG03742	0.221	0.233	0.063	0.071	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA12878	0.432	0.455	0.003	0.044	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA18525	0.806	0.848	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA18939	0.0	0.0	0.078	0.21	nan	nan	0	0
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA19017	0.0	0.0	0.103	0.242	nan	nan	0	0
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA19238	0.458	0.482	0.007	0.07	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA19239	0.401	0.422	0.021	0.057	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA19625	0.416	0.438	0.048	0.048	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA19648	0.0	0.0	0.053	0.186	nan	nan	0	0
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA20502	0.399	0.42	0.022	0.047	nan	nan	0	1
chr9	71804520	71804997	DEL	478	NA20845	0.0	0.0	0.118	0.176	nan	nan	0	0
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG00096	1.091	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG00268	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG00419	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG00759	1.098	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG01051	0.889	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG01112	0.627	0.609	0.0	0.016	0.743	0.743	1	1
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG01500	1.347	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG01565	1.502	1.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG01583	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG01595	1.546	1.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG01879	0.373	0.362	0.0	0.021	0.583	0.583	1	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG02568	0.853	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG02922	1.061	1.03	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG03006	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG03052	0.809	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG03642	0.918	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	HG03742	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA12878	0.709	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA18525	1.253	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA18939	1.259	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA19238	0.552	0.536	0.0	0.035	0.816	0.816	1	1
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA19239	1.163	1.129	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA19625	0.547	0.531	0.0	0.022	0.737	0.737	1	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA19648	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA20502	1.197	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	73757665	73757721	DEL	57	NA20845	0.45	0.437	0.0	0.048	0.933	0.933	1	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG00096	1.298	1.213	0.0	0.0	0.767	0.767	1	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG00268	1.108	1.036	0.003	0.0	0.802	0.802	2	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG00419	1.113	1.04	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG00759	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG01051	1.249	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG01112	1.369	1.28	0.0	0.0	0.793	0.793	1	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG01500	1.052	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG01565	1.438	1.344	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG01583	0.469	0.439	0.031	0.028	nan	nan	0	1
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG01595	1.608	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG01879	1.417	1.324	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG02568	1.319	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG02922	1.212	1.133	0.0	0.0	0.867	0.929	1	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG03006	1.082	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG03052	1.268	1.185	0.0	0.0	0.77	0.77	2	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG03642	0.0	0.0	0.107	0.089	nan	nan	0	0
chr9	74448956	74449927	DEL	972	HG03742	1.206	1.127	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA12878	1.003	0.938	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA18525	1.253	1.171	0.0	0.0	0.891	0.929	2	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA18939	1.278	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA19017	1.298	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA19238	0.983	0.919	0.0	0.0	0.763	0.763	2	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA19239	1.296	1.211	0.0	0.0	0.979	0.979	1	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA19625	1.119	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA19648	1.281	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA20502	1.08	1.009	0.0	0.0	0.66	0.662	2	2
chr9	74448956	74449927	DEL	972	NA20845	1.013	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG00096	0.884	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG00268	0.697	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG00419	0.651	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG00759	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG01051	0.677	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG01112	0.704	0.704	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG01500	0.923	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG01565	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG01583	0.593	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG01595	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG01879	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG02568	0.427	0.427	0.065	0.009	0.429	0.429	13	1
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG02922	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG03006	0.746	0.746	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG03052	0.656	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG03642	0.51	0.51	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	HG03742	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA12878	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA18525	0.859	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA18939	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA19017	0.821	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA19238	0.727	0.727	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA19239	0.895	0.895	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA19625	0.729	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA19648	0.615	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA20502	0.493	0.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	78866203	78866914	DEL	712	NA20845	0.72	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG00096	1.185	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG00268	0.786	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG00419	0.882	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG00759	0.895	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG01051	0.953	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG01112	0.97	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG01500	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG01583	0.766	0.744	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG01595	0.919	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG01879	0.709	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG02922	1.039	1.009	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG03006	1.549	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG03052	1.115	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG03642	1.096	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	HG03742	0.824	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA12878	1.09	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA18525	0.949	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA18939	1.0	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA19017	0.687	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA19238	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA19239	1.163	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA19625	1.197	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA19648	0.999	0.97	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA20502	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	80802257	80802327	DUP	71	NA20845	0.946	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG00096	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG00268	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG00419	0.966	0.938	0.0	0.0	0.638	0.638	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG00759	1.261	1.224	0.0	0.0	0.766	0.725	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG01051	0.995	0.966	0.0	0.0	0.759	0.759	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG01112	1.046	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG01500	0.701	0.681	0.0	0.0	0.9	0.896	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG01565	1.116	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG01583	1.087	1.056	0.0	0.0	0.694	0.694	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG01595	0.982	0.953	0.0	0.0	0.754	0.754	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG01879	0.97	0.941	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG02568	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG02922	0.953	0.925	0.0	0.0	0.528	0.525	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG03006	1.278	1.241	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG03052	1.072	1.04	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG03642	0.892	0.866	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	HG03742	1.085	1.054	0.0	0.0	0.66	0.662	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA12878	0.951	0.924	0.0	0.0	0.79	0.79	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA18525	1.074	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA18939	0.37	0.36	0.113	0.044	0.125	0.125	1	1
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA19017	1.031	1.001	0.0	0.0	0.875	0.917	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA19238	1.145	1.111	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA19239	1.042	1.012	0.0	0.0	0.914	0.914	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA19625	1.093	1.061	0.0	0.0	0.627	0.627	2	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA19648	1.178	1.144	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA20502	1.01	0.98	0.0	0.0	0.826	0.875	1	2
chr9	8081803	8082499	DEL	697	NA20845	0.968	0.94	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG00096	0.922	0.922	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG00268	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG00419	0.693	0.693	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG00759	1.017	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG01051	0.783	0.783	0.0	0.0	0.214	0.214	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG01112	0.913	0.913	0.0	0.0	0.429	0.429	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG01500	0.757	0.757	0.0	0.0	0.857	0.82	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG01565	0.794	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG01583	0.988	0.988	0.0	0.0	0.51	0.51	2	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG01595	1.003	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG01879	1.007	1.007	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG02568	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG02922	1.147	1.147	0.0	0.0	0.6	0.56	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG03006	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG03052	0.394	0.394	0.004	0.0	nan	nan	0	1
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG03642	0.892	0.892	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	HG03742	0.945	0.945	0.0	0.0	0.841	0.799	2	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA12878	0.865	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA18525	1.038	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA18939	0.852	0.852	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA19017	0.897	0.897	0.0	0.0	0.5	0.524	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA19238	1.037	1.037	0.0	0.0	0.945	0.945	2	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA19239	0.962	0.962	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA19625	0.911	0.911	0.0	0.0	0.818	0.818	4	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA19648	0.768	0.768	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA20502	0.986	0.986	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	81595179	81595965	DEL	787	NA20845	1.013	1.013	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG00096	1.298	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG00268	1.215	1.18	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG00419	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG00759	1.139	1.106	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG01051	1.439	1.398	0.0	0.005	0.706	0.706	1	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG01112	1.084	1.052	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG01500	1.218	1.183	0.0	0.0	0.879	0.841	1	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG01565	0.966	0.938	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG01583	0.988	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG01595	1.19	1.156	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG01879	1.361	1.322	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG02568	0.815	0.791	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG02922	1.212	1.177	0.0	0.003	0.786	0.733	1	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG03006	1.082	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG03052	0.481	0.467	0.009	0.083	nan	nan	0	1
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG03642	1.147	1.114	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	HG03742	1.106	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA12878	1.124	1.092	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA18525	1.11	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA18939	1.037	1.007	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA19017	0.878	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA19238	1.05	1.02	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA19239	1.123	1.09	0.0	0.002	0.854	0.854	1	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA19625	1.067	1.036	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA19648	1.178	1.144	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA20502	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	82475488	82475832	DEL	345	NA20845	1.328	1.29	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG00096	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG00268	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG00419	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG01051	0.953	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG01112	0.989	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG01500	0.72	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG01565	0.966	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG01583	0.568	0.568	0.042	0.056	0.3	0.3	9	1
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG01595	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG01879	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG02568	1.319	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG02922	0.953	0.953	0.0	0.0	0.489	0.457	2	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG03006	0.373	0.373	0.005	0.08	0.625	0.625	16	1
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG03052	0.962	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG03642	1.326	1.326	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	HG03742	1.045	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA12878	0.45	0.45	0.004	0.082	nan	nan	0	1
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA18525	0.376	0.376	0.02	0.075	0.368	0.353	16	1
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA18939	0.407	0.407	0.022	0.099	0.182	0.182	9	1
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA19017	0.878	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA19238	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA19239	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA19625	1.249	1.249	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA19648	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA20502	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	83071620	83072069	DEL	450	NA20845	0.563	0.563	0.052	0.061	0.214	0.214	11	1
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG00096	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG00268	1.072	1.041	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG00419	1.26	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG00759	0.997	0.968	0.0	0.0	0.955	0.953	2	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG01051	1.164	1.13	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG01112	0.475	0.462	0.055	0.052	nan	nan	0	1
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG01500	1.144	1.111	0.0	0.0	0.655	0.627	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG01565	0.987	0.959	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG01583	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG01595	1.086	1.054	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG01879	0.671	0.652	0.097	0.058	0.312	0.312	1	1
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG02568	0.892	0.866	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG02922	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG03006	1.101	1.069	0.0	0.0	0.677	0.677	2	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG03052	0.481	0.467	0.117	0.075	nan	nan	0	1
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG03642	1.376	1.336	0.0	0.0	0.76	0.76	2	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	HG03742	0.985	0.956	0.004	0.0	0.895	0.942	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA12878	0.363	0.353	0.062	0.054	nan	nan	0	1
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA18525	0.913	0.887	0.0	0.002	0.875	0.913	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA18939	1.074	1.043	0.0	0.0	0.514	0.514	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA19017	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA19238	0.566	0.549	0.088	0.051	nan	nan	0	1
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA19239	0.561	0.545	0.115	0.06	nan	nan	0	1
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA19625	0.807	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA19648	1.127	1.094	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA20502	1.151	1.117	0.0	0.0	0.968	0.976	1	2
chr9	8640832	8641676	DEL	845	NA20845	1.148	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG00096	0.987	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG00268	0.733	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG00419	0.735	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG00759	0.875	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG01051	0.995	0.966	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG01112	0.903	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG01500	0.997	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG01565	1.009	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG01583	0.766	0.744	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG01595	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG01879	0.709	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG02568	0.815	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG02922	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG03006	0.784	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG03052	0.415	0.403	0.0	0.031	0.574	0.574	2	1
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG03642	0.765	0.742	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	HG03742	0.744	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA12878	0.951	0.924	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA18525	0.743	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA18939	0.963	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA19017	1.222	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA19238	0.66	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA19239	0.561	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA19625	0.937	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA19648	0.64	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA20502	1.01	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	87677968	87678029	DEL	62	NA20845	0.54	0.525	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG00096	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG00268	0.858	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG00419	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG00759	0.793	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG01051	0.709	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG01112	0.894	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG01500	0.849	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG01565	0.644	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG01583	0.964	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG01595	0.898	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG01879	0.727	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG02568	0.737	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG02922	0.455	0.505	0.009	0.067	nan	nan	0	1
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG03006	0.896	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG03052	1.006	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG03642	1.173	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	HG03742	0.824	0.916	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA12878	0.899	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA18525	0.949	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA18939	1.037	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA19017	0.687	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA19238	0.929	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA19239	0.869	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA19625	1.119	1.244	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA19648	0.82	0.911	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA20502	1.151	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	89457908	89458279	DEL	372	NA20845	0.968	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG00096	0.997	0.968	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG00268	1.055	1.024	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG00419	1.05	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG00759	1.119	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG01051	0.487	0.473	0.051	0.018	nan	nan	0	1
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG01112	1.027	0.997	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG01500	1.144	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG01565	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG01583	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG01595	1.044	1.014	0.0	0.0	0.776	0.776	2	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG01879	0.914	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG02568	0.931	0.904	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG02922	0.606	0.589	0.061	0.022	nan	nan	0	1
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG03006	1.231	1.195	0.0	0.003	0.806	0.806	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG03052	1.028	0.998	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG03642	0.994	0.965	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	HG03742	0.422	0.41	0.074	0.011	nan	nan	0	1
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA12878	1.003	0.974	0.004	0.0	0.737	0.737	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA18525	1.235	1.199	0.0	0.0	0.825	0.861	2	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA18939	1.129	1.097	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA19017	0.649	0.63	0.043	0.022	nan	nan	0	1
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA19238	0.606	0.588	0.117	0.029	nan	nan	0	1
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA19239	0.548	0.532	0.091	0.024	nan	nan	0	1
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA19625	1.197	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA19648	0.973	0.945	0.0	0.002	0.857	0.857	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA20502	1.057	1.026	0.0	0.0	0.588	0.623	1	2
chr9	90065584	90066378	DEL	795	NA20845	1.283	1.246	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG00096	0.0	0.0	0.0	0.069	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.068	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG01051	0.233	0.268	0.0	0.006	0.385	0.385	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG01112	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG01500	0.221	0.255	0.0	0.049	0.538	0.563	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG01565	0.0	0.0	0.0	0.119	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG01583	0.247	0.284	0.0	0.042	0.857	0.857	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.055	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG01879	0.242	0.279	0.0	0.047	0.474	0.474	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG02568	0.465	0.535	0.0	0.054	nan	nan	0	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG02922	0.173	0.199	0.0	0.018	0.375	0.402	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.034	nan	nan	0	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.015	nan	nan	0	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG03642	0.382	0.439	0.0	0.048	0.9	0.9	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	HG03742	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.104	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.054	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.06	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA19017	0.229	0.263	0.009	0.027	0.857	0.818	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA19239	0.374	0.43	0.0	0.041	0.893	0.893	1	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.108	nan	nan	0	0
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA19648	0.64	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA20502	0.305	0.351	0.0	0.026	nan	nan	0	1
chr9	91501994	91502058	DEL	65	NA20845	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	1
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG00096	0.884	1.016	0.0	0.0	0.783	0.783	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG00268	0.929	1.068	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG00419	0.798	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG00759	0.692	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG01051	0.72	0.827	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG01112	0.799	0.918	0.0	0.0	0.56	0.56	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG01500	0.923	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG01565	0.794	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG01583	0.865	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG01595	0.794	0.912	0.0	0.0	0.8	0.8	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG01879	0.895	1.029	0.0	0.0	0.909	0.909	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG02568	0.388	0.446	0.084	0.035	nan	nan	0	1
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG02922	0.671	0.771	0.0	0.0	0.667	0.622	1	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG03006	0.728	0.836	0.0	0.0	0.684	0.684	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG03052	0.94	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG03642	1.045	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	HG03742	0.884	1.017	0.0	0.0	0.833	0.852	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA12878	0.623	0.716	0.0	0.0	0.933	0.933	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA18525	0.985	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA18939	0.963	1.107	0.0	0.0	0.75	0.75	3	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA19017	0.878	1.009	0.0	0.0	0.522	0.547	1	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA19238	0.417	0.48	0.012	0.042	nan	nan	0	1
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA19239	0.855	0.983	0.0	0.0	0.836	0.836	2	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA19625	0.963	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA19648	1.076	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA20502	0.681	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	91538463	91539035	DEL	573	NA20845	0.698	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG00096	1.091	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG00268	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG00419	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG00759	0.427	0.45	0.0	0.011	0.474	0.5	1	1
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG01051	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG01112	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG01500	0.406	0.427	0.0	0.024	0.727	0.76	1	1
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG01565	1.095	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG01583	0.247	0.26	0.0	0.04	0.727	0.727	1	1
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG01595	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG01879	0.839	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG02568	0.504	0.531	0.0	0.04	0.467	0.467	1	1
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG02922	0.649	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG03006	0.541	0.57	0.0	0.035	0.417	0.417	1	1
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG03052	1.137	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG03642	1.504	1.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	HG03742	0.563	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA12878	0.519	0.546	0.0	0.022	0.552	0.552	1	1
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA18525	0.269	0.283	0.0	0.034	0.833	0.799	1	1
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.056	nan	nan	0	0
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA19017	0.783	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA19238	0.889	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA19239	0.655	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA19625	0.807	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA19648	0.948	0.998	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA20502	0.845	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92098585	92098649	DEL	65	NA20845	0.54	0.569	0.0	0.027	0.5	0.5	1	1
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG00096	0.809	0.756	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG00268	0.929	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG00419	1.092	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG00759	0.966	0.903	0.0	0.0	0.367	0.387	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG01051	0.889	0.831	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG01112	0.837	0.782	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG01500	0.997	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG01565	1.138	1.063	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG01583	0.766	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG01595	1.117	1.044	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG01879	1.026	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG02568	0.776	0.725	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG02922	0.866	0.809	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG03006	1.045	0.976	0.0	0.0	0.828	0.828	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG03052	0.634	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG03642	0.637	0.596	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	HG03742	1.166	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA12878	0.727	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA18525	1.074	1.004	0.0	0.0	0.677	0.649	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA18939	0.852	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA19017	0.325	0.303	0.0	0.053	nan	nan	0	1
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA19238	0.97	0.906	0.0	0.0	0.949	0.949	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA19239	0.935	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA19625	0.755	0.705	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA19648	0.768	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA20502	0.622	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	92811241	92811420	DEL	180	NA20845	1.306	1.22	0.005	0.0	0.895	0.895	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG00096	1.072	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG00268	0.912	0.96	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG00419	1.071	1.128	0.0	0.0	0.417	0.417	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG00759	1.017	1.071	0.0	0.0	0.667	0.632	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG01051	0.741	0.78	0.0	0.0	0.72	0.72	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG01112	0.989	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG01500	0.997	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG01565	1.052	1.107	0.0	0.0	0.933	0.933	2	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG01583	0.593	0.624	0.051	0.051	0.385	0.385	1	1
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG01595	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG01879	0.951	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG02568	0.892	0.939	0.0	0.0	0.308	0.308	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG02922	1.082	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG03006	1.082	1.139	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG03052	0.765	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG03642	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	HG03742	1.005	1.058	0.0	0.0	0.885	0.84	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA12878	0.848	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA18525	1.146	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA18939	0.907	0.955	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA19017	1.012	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA19238	1.037	1.091	0.0	0.0	0.878	0.878	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA19239	0.962	1.013	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA19625	0.963	1.014	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA19648	0.897	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA20502	1.151	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95669496	95669990	DEL	495	NA20845	0.991	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG00096	0.658	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG00268	0.608	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG00419	0.672	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG00759	0.509	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG01051	0.423	0.487	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG01112	0.589	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG01500	0.646	0.743	0.0	0.0	0.615	0.599	2	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG01565	0.494	0.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG01583	0.741	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG01595	0.48	0.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG01879	0.615	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG02568	0.737	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG02922	0.281	0.324	0.167	0.104	nan	nan	0	1
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG03006	0.634	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG03052	0.612	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG03642	0.51	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	HG03742	0.462	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA12878	0.709	0.815	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA18525	0.859	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA18939	0.611	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA19017	0.63	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA19238	0.646	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA19239	0.695	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA19625	0.26	0.299	0.112	0.082	nan	nan	0	1
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA19648	0.615	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA20502	0.681	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	95811716	95812651	DEL	936	NA20845	0.563	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG00096	0.527	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG00419	1.113	1.28	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG00759	0.366	0.421	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG01051	0.487	0.56	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG01112	0.323	0.372	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG01500	0.812	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG01565	0.15	0.173	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG01583	0.865	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG01595	0.23	0.264	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG01879	0.392	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG02568	0.349	0.401	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG02922	0.346	0.398	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG03052	0.306	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG03642	0.408	0.469	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	HG03742	0.322	0.37	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA12878	0.588	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA18525	0.501	0.576	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA18939	0.296	0.341	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA19017	0.611	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA19238	0.323	0.371	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA19239	0.775	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA19625	0.312	0.359	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA20502	0.657	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470482	96470796	DEL	315	NA20845	0.36	0.414	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG00096	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG00419	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG00759	0.203	0.226	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG01051	0.423	0.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG01112	0.437	0.486	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG01500	0.591	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG01565	0.172	0.191	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG01583	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG01595	0.355	0.395	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG01879	0.317	0.352	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG02568	0.465	0.517	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG02922	0.325	0.361	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG03006	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG03052	0.35	0.389	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG03642	0.255	0.283	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	HG03742	0.422	0.469	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA12878	0.865	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA18525	0.43	0.477	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA18939	0.296	0.329	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA19017	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA19238	0.471	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA19239	0.762	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA19625	0.442	0.492	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA20502	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	96470895	96471229	DEL	335	NA20845	0.383	0.425	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG00268	0.858	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG00419	0.84	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG01051	0.699	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG01500	0.517	0.483	0.0	0.0	0.514	0.52	2	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG01595	0.48	0.449	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG01879	0.448	0.418	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG03006	0.877	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG03052	0.7	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	HG03742	0.603	0.564	0.0	0.0	0.513	0.487	2	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	NA12878	0.657	0.614	0.0	0.0	0.854	0.854	2	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	NA19017	0.63	0.589	0.0	0.0	0.778	0.768	2	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	NA19238	0.862	0.805	0.0	0.0	0.818	0.818	2	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	NA19239	0.775	0.724	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	NA19625	0.781	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99062582	99062920	DUP	339	NA19648	0.768	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG00096	0.79	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG00268	0.929	0.978	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG00419	0.945	0.995	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG00759	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG01051	1.016	1.07	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG01112	0.685	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG01500	0.978	1.03	0.0	0.0	0.75	0.784	1	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG01565	0.837	0.881	0.006	0.0	0.5	0.5	1	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG01583	1.038	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG01595	0.71	0.747	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG01879	0.839	0.883	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG02568	0.659	0.694	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG02922	0.52	0.547	0.033	0.05	0.432	0.428	2	1
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG03006	0.821	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG03052	0.809	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG03642	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	HG03742	0.824	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA12878	0.917	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA18525	0.985	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA18939	0.852	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA19017	0.916	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA19238	1.05	1.106	0.0	0.0	0.45	0.45	2	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA19239	1.123	1.182	0.0	0.0	0.733	0.733	2	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA19625	1.067	1.123	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA19648	0.871	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA20502	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99395914	99396742	DEL	829	NA20845	1.058	1.114	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG00096	0.846	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG00268	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG00419	0.945	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG00759	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG01051	0.995	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG01112	0.685	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG01500	0.997	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG01565	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG01583	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG01595	0.877	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG01879	1.026	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG02568	0.582	0.582	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG02922	0.455	0.455	0.034	0.047	nan	nan	0	1
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG03006	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG03052	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG03642	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	HG03742	0.864	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA12878	0.899	0.899	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA18525	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA18939	1.111	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA19017	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA19238	1.158	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA19239	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA19625	0.911	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA19648	0.845	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA20502	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chr9	99396376	99396881	DEL	506	NA20845	1.148	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG00268	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG00419	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG00759	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG02568	0.783	0.783	0.019	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG02922	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA18525	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA18939	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA19017	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA19238	1.037	1.037	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA19625	1.053	1.053	0.003	0.0	0.732	0.732	2	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA19648	0.647	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100421325	100421929	DEL	605	NA20502	0.843	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG00268	1.311	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG00419	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG00759	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG01595	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG02568	1.018	0.989	0.0	0.0	0.5	0.5	2	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG02922	1.178	1.144	0.0	0.004	0.952	0.98	1	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG03052	1.12	1.088	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	HG03642	1.317	1.279	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA12878	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA18525	1.037	1.007	0.003	0.002	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA18939	1.291	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA19017	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA19238	1.141	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA19625	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA19648	1.32	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	100833020	100833675	DEL	656	NA20502	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG00268	0.575	0.537	0.0	0.011	0.865	0.902	2	1
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG00419	0.918	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG00759	1.354	1.265	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG01595	0.975	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG02568	1.058	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG03052	0.0	0.0	0.009	0.049	nan	nan	0	0
chrX	101155257	101155309	DEL	53	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	0
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA18525	1.255	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA18939	0.461	0.431	0.0	0.018	0.786	0.821	2	1
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.014	nan	nan	0	1
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA19625	1.258	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chrX	101155257	101155309	DEL	53	NA20502	0.772	0.722	0.0	0.012	0.71	0.71	2	1
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG00268	1.005	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG00419	1.127	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG00759	0.796	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG01595	0.914	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG02568	0.705	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG02922	1.286	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG03052	1.077	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	HG03642	1.389	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA12878	0.81	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA18525	1.055	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA18939	1.015	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA19017	1.08	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA19238	1.244	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA19625	1.232	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA19648	1.035	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10240308	10240386	DEL	79	NA20502	1.334	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG00268	1.041	1.041	0.0	0.0	0.667	0.639	1	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG00419	1.106	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG00759	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG01595	0.813	0.813	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG02568	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG02922	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG03052	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	HG03642	1.149	1.149	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA18525	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA18939	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA19017	1.006	1.006	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA19238	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA19625	1.104	1.104	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA19648	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103402414	103403027	DEL	614	NA20502	0.866	0.866	0.0	0.0	0.737	0.737	1	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG00268	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG00419	0.876	0.923	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG00759	0.777	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG01595	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG02568	0.744	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG03052	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	HG03642	0.503	0.529	0.0	0.037	0.929	0.929	1	1
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA12878	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA18525	0.892	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA18939	0.904	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA19017	0.838	0.882	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA19238	1.037	1.092	0.0	0.0	0.63	0.63	1	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA19625	0.693	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA19648	0.595	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103468249	103468316	DEL	68	NA20502	0.655	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG00268	0.557	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG00419	0.417	0.439	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG00759	0.518	0.545	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG01595	0.528	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG02568	0.588	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG02922	0.471	0.496	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG03052	0.345	0.363	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	HG03642	0.575	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA12878	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA18525	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA18939	0.535	0.563	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA19017	0.54	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA19238	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA19625	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA19648	0.621	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	103558687	103558990	DEL	304	NA20502	0.609	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG00268	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG00419	1.148	1.148	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG00759	1.035	1.035	0.006	0.0	nan	nan	0	1
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG01595	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG02922	0.343	0.343	0.052	0.061	nan	nan	0	1
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG03052	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	104521995	104522481	DEL	487	HG03642	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA12878	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA18525	1.055	1.055	0.004	0.0	nan	nan	0	1
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA18939	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA19017	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA19238	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA19625	1.053	1.053	0.015	0.0	nan	nan	0	1
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA19648	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104521995	104522481	DEL	487	NA20502	0.726	0.726	0.0	0.006	0.867	0.867	1	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG00268	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG00419	1.127	1.127	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG00759	0.896	0.896	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG02922	0.321	0.321	0.055	0.084	nan	nan	0	1
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG03052	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	HG03642	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA12878	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA18525	1.037	1.037	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA18939	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA19017	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA19238	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA19625	1.027	1.027	0.016	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA19648	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	104522103	104522570	DEL	468	NA20502	0.702	0.702	0.0	0.006	0.867	0.867	1	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG00268	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG00419	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG00759	1.215	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG01595	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG02568	0.783	0.761	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG02922	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG03052	0.97	0.941	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	HG03642	1.221	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA12878	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA18525	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA18939	1.088	1.057	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA19017	0.838	0.814	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA19238	1.063	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA19625	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA19648	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	10457093	10457911	DEL	819	NA20502	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG00268	0.916	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG00419	0.438	0.402	0.0	0.046	0.656	0.656	1	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG00759	0.697	0.639	0.0	0.03	0.61	0.61	1	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG01595	1.25	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG02922	0.621	0.57	0.0	0.069	0.655	0.702	1	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.08	nan	nan	0	0
chrX	105334340	105334417	DEL	78	HG03642	0.694	0.637	0.0	0.071	0.485	0.485	1	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA12878	0.965	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA18525	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA18939	0.59	0.542	0.0	0.053	0.475	0.497	1	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA19017	0.894	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA19238	0.544	0.499	0.0	0.037	0.647	0.647	1	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA19625	0.359	0.33	0.0	0.067	0.938	0.938	1	2
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA19648	0.492	0.451	0.0	0.052	0.28	0.28	1	1
chrX	105334340	105334417	DEL	78	NA20502	0.936	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG00419	1.21	1.175	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG00759	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG01595	0.955	0.927	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG02568	0.744	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG02922	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105477495	105478143	DEL	649	HG03642	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA12878	1.223	1.187	0.0	0.0	0.8	0.764	1	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA18525	0.873	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA18939	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA19017	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA19238	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA19625	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA19648	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105477495	105478143	DEL	649	NA20502	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG00268	0.808	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG00759	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG01595	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG02922	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG03052	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	HG03642	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA12878	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA18939	0.959	0.959	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA19017	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA19238	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA19625	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA19648	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105581887	105582752	DEL	866	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG00268	0.969	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG00419	0.772	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG00759	1.035	0.968	0.0	0.0	0.566	0.566	2	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG01595	1.26	1.177	0.0	0.004	0.848	0.848	2	1
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG02568	0.823	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG02922	1.221	1.141	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG03052	1.056	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	HG03642	1.245	1.164	0.0	0.005	0.296	0.296	1	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA12878	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA18525	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA18939	1.273	1.19	0.0	0.003	0.797	0.828	2	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA19017	1.08	1.01	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA19238	0.752	0.703	0.0	0.0	0.206	0.206	1	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA19625	0.924	0.864	0.0	0.005	0.5	0.5	1	2
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA19648	0.958	0.895	0.0	0.005	0.529	0.529	1	1
chrX	105661482	105661550	DEL	69	NA20502	0.866	0.809	0.0	0.0	0.581	0.581	2	1
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG00268	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG00419	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG00759	1.135	1.135	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG01595	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG02568	0.94	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG02922	0.493	0.493	0.029	0.026	nan	nan	0	1
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG03052	0.345	0.345	0.047	0.032	nan	nan	0	1
chrX	105807018	105807804	DEL	787	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA12878	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA18525	0.91	0.91	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA18939	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA19017	0.522	0.522	0.067	0.052	nan	nan	0	1
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA19238	0.765	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA19625	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA19648	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105807018	105807804	DEL	787	NA20502	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG00268	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG00419	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG00759	1.414	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG01595	1.158	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG02568	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG02922	1.071	1.001	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG03052	1.056	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	HG03642	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA12878	1.309	1.224	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA18525	1.255	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA18939	1.051	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA19017	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA19238	1.257	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA19625	1.463	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA19648	0.932	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105839090	105839433	DEL	344	NA20502	1.381	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG00268	1.131	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG00419	1.419	1.326	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG00759	1.274	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG01595	1.463	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG02568	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG02922	1.093	1.021	0.0	0.0	0.7	0.653	1	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG03052	1.142	1.067	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	HG03642	1.078	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA12878	0.999	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA18525	0.946	0.884	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA18939	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA19017	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA19238	1.296	1.211	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA19625	1.361	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA19648	1.32	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	105938835	105939505	DEL	671	NA20502	1.147	1.072	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG00268	1.167	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG00419	0.96	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG00759	0.856	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG01595	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG02568	1.606	1.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG02922	0.9	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG03052	1.142	1.067	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	HG03642	0.838	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA12878	1.051	0.982	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA18525	0.873	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA18939	1.217	1.138	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA19017	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA19238	1.063	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA19625	1.335	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA19648	1.191	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106628964	106629030	DEL	67	NA20502	0.866	0.809	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG00268	0.108	0.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG00419	0.021	0.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG00759	0.119	0.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG01595	0.02	0.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG02922	0.043	0.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG03052	0.022	0.028	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chrX	106744574	106744763	DEL	190	HG03642	0.072	0.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA12878	0.103	0.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA18525	0.109	0.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA18939	0.055	0.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA19017	0.037	0.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA19238	0.091	0.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA19625	0.026	0.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA19648	0.104	0.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106744574	106744763	DEL	190	NA20502	0.023	0.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG00268	0.736	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG00419	1.231	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG00759	0.577	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG01595	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG02568	0.94	1.045	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG02922	0.643	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG03052	0.97	1.077	0.0	0.0	0.435	0.435	1	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	HG03642	0.958	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA12878	0.947	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA18525	0.946	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA18939	0.793	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA19017	0.82	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA19238	0.674	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA19625	1.001	1.113	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA19648	0.751	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106746040	106746316	DEL	277	NA20502	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG00268	0.754	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG00419	1.043	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG00759	0.816	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG01595	0.589	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG02568	0.783	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG02922	0.621	0.749	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG03052	0.927	1.116	0.0	0.002	0.438	0.438	1	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	HG03642	0.814	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA12878	0.81	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA18525	0.728	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA18939	0.701	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA19017	0.727	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA19238	0.778	0.937	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA19625	0.899	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA19648	0.88	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	106981593	106981941	DEL	349	NA20502	0.936	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG00268	1.014	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG00419	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG00759	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG01595	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG02568	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG02922	1.071	1.04	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	HG03642	0.766	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA12878	1.085	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA18939	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA19017	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA19238	1.173	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA19625	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA19648	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107659539	107659628	DEL	90	NA20502	0.983	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG00268	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG00419	1.21	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG00759	1.016	0.986	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG01595	1.219	1.184	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG02568	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG02922	1.264	1.227	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG03052	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	HG03642	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA12878	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA18525	1.146	1.113	0.0	0.0	0.583	0.61	1	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA18939	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA19017	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA19625	0.924	0.897	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA19648	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	107740379	107740911	DEL	533	NA20502	1.311	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG00268	1.167	1.091	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG00419	0.772	0.722	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG00759	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG01595	0.975	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG02568	1.449	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG02922	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG03052	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	HG03642	1.269	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA12878	0.879	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA18525	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA18939	0.978	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA19017	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA19238	0.868	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA19625	1.284	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA19648	1.243	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108032658	108032714	DEL	57	NA20502	0.983	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG00268	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG00419	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG00759	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG01595	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG02568	0.842	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG02922	0.814	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG03052	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	HG03642	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA12878	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA18525	1.11	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA18939	1.033	1.003	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA19017	0.652	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA19238	0.726	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA19625	0.719	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA19648	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108087559	108087624	DEL	66	NA20502	1.1	1.068	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG00759	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG01595	0.914	0.888	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG02568	0.783	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG03052	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	HG03642	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA12878	1.034	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA18525	0.928	0.901	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA18939	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA19017	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA19238	1.115	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA19625	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA19648	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	108264721	108265102	DEL	382	NA20502	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG00268	0.521	0.598	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG00419	0.876	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG00759	0.617	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG01595	0.711	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG02568	0.509	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG02922	0.836	0.961	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG03052	0.517	0.594	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	HG03642	0.766	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA12878	0.844	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA18525	0.746	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA18939	1.033	1.187	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA19017	0.708	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA19238	0.648	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA19625	0.642	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA19648	0.311	0.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109072643	109072758	DEL	116	NA20502	0.585	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG00268	0.646	0.593	0.0	0.0	0.889	0.928	1	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG00419	0.605	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG00759	0.677	0.621	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG01595	0.467	0.429	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG02568	0.353	0.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG02922	0.279	0.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG03052	0.452	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	HG03642	0.359	0.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA12878	0.5	0.458	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA18525	0.582	0.534	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA18939	0.424	0.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA19017	0.428	0.393	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA19238	0.493	0.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA19625	0.719	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA19648	0.44	0.404	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109080843	109080897	DEL	55	NA20502	0.375	0.344	0.0	0.0	0.75	0.75	1	1
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG00268	1.023	1.023	0.0	0.0	0.815	0.781	1	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG00419	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG00759	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG01595	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG02568	0.901	0.901	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG02922	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG03052	0.582	0.582	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chrX	109730872	109731029	DEL	158	HG03642	1.197	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA12878	1.171	1.171	0.0	0.0	0.914	0.958	1	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA18525	1.274	1.274	0.0	0.0	0.722	0.691	1	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA18939	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA19017	1.025	1.025	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA19238	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA19625	1.515	1.515	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA19648	1.398	1.398	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	109730872	109731029	DEL	158	NA20502	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG00268	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG00419	0.939	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG00759	0.816	0.859	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG01595	0.63	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG02568	0.744	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG02922	0.836	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG03052	0.883	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	HG03642	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA12878	0.706	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA18525	0.819	0.862	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA18939	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA19017	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA19238	0.778	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA19625	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA19648	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110094457	110095354	DEL	898	NA20502	0.866	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG00268	0.592	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG00419	0.668	0.668	0.01	0.0	0.412	0.412	1	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG00759	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG01595	0.671	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG02568	0.705	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG02922	0.921	0.921	0.0	0.0	0.778	0.726	1	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG03052	1.131	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	HG03642	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA12878	0.637	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA18525	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA18939	0.738	0.738	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA19017	0.95	0.95	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA19238	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA19625	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA19648	1.204	1.204	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11010862	11010997	DEL	136	NA20502	0.796	0.796	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG00268	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG00419	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG00759	1.095	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG01595	1.301	1.301	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG02568	1.175	1.175	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG02922	1.093	1.093	0.0	0.004	0.8	0.747	1	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG03052	1.034	1.034	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	HG03642	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA12878	0.758	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA18525	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA18939	1.088	1.088	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA19017	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA19238	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA19625	1.001	1.001	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA19648	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110414618	110414678	DEL	61	NA20502	1.194	1.194	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG00268	1.257	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG00419	1.085	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG00759	1.155	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG01595	1.158	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG02568	0.94	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG02922	0.879	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG03052	1.271	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	HG03642	0.982	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA12878	0.861	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA18525	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA18939	1.107	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA19017	1.062	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA19238	1.011	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA19625	1.207	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA19648	0.88	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110465342	110465394	DEL	53	NA20502	1.077	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG00268	0.987	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG00419	0.981	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG00759	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG01595	0.843	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG02568	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG02922	0.707	0.744	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG03052	0.571	0.601	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	HG03642	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA12878	0.741	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA18525	0.728	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA18939	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA19017	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA19238	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA19625	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA19648	0.751	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110595844	110595941	DEL	98	NA20502	0.89	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG00268	1.239	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG00419	1.398	1.357	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG00759	1.115	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG02568	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG02922	0.536	0.52	0.031	0.048	nan	nan	0	1
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG03052	1.142	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	HG03642	1.461	1.418	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA18525	0.873	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA18939	1.273	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA19017	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA19238	0.985	0.956	0.003	0.0	0.927	0.927	1	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA19625	1.207	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA19648	1.165	1.131	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	110807787	110808204	DEL	418	NA20502	0.983	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG00268	1.221	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG00419	1.127	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG00759	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG01595	0.935	0.984	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG02568	1.449	1.526	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG02922	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG03052	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	HG03642	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA12878	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA18525	1.146	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA18939	0.885	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA19017	1.285	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA19238	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA19625	0.911	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA19648	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111133753	111133816	DEL	64	NA20502	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG00268	0.862	0.837	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG00419	1.043	1.013	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG00759	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG02922	0.954	0.926	0.0	0.0	0.833	0.846	3	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG03052	0.927	0.9	0.0	0.0	0.694	0.694	2	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	HG03642	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA12878	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA18525	0.873	0.848	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA18939	0.959	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA19017	0.987	0.959	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA19238	0.726	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA19625	1.155	1.122	0.0	0.0	0.778	0.778	2	2
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA19648	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	111153256	111153863	DEL	608	NA20502	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG00419	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG00759	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG01595	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG02568	1.018	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG03052	0.883	0.858	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA12878	1.016	0.987	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA18525	0.728	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA18939	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA19017	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA19238	0.804	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA19625	1.155	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA19648	1.294	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	111912510	111912674	DEL	165	NA20502	1.358	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG00268	1.023	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG00419	0.876	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG00759	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG01595	1.077	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG02568	0.705	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG02922	0.75	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG03052	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	HG03642	0.575	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA12878	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA18525	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA18939	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA19017	0.466	0.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA19238	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA19625	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA19648	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112008322	112008380	DEL	59	NA20502	1.428	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG00268	0.952	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG00419	1.002	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG00759	0.757	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG01595	1.036	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG02568	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG02922	1.028	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG03052	1.034	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	HG03642	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA12878	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA18525	1.001	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA18939	0.627	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA19017	0.894	0.941	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA19238	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA19625	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA19648	1.217	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112052858	112053032	DEL	175	NA20502	1.404	1.478	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG00268	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG00759	1.135	1.102	0.0	0.0	0.679	0.679	1	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG01595	1.28	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG02568	1.018	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG02922	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG03052	0.991	0.962	0.005	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	HG03642	1.149	1.116	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA12878	1.12	1.087	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA18525	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA18939	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA19017	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA19238	1.128	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA19625	1.155	1.122	0.0	0.0	0.952	0.952	1	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA19648	1.087	1.056	0.008	0.0	0.68	0.68	1	2
chrX	112443765	112444514	DEL	750	NA20502	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG00268	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG00419	0.981	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG00759	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG01595	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG02568	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG03052	1.271	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	HG03642	1.341	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA12878	0.81	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA18525	0.873	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA18939	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA19017	1.211	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA19238	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA19625	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA19648	1.217	1.181	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	112597965	112598247	DEL	283	NA20502	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG00268	0.449	0.449	0.0	0.087	nan	nan	0	1
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG00419	0.376	0.376	0.0	0.048	nan	nan	0	1
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG00759	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	1
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG02568	1.645	1.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG02922	0.986	0.986	0.0	0.0	0.739	0.792	1	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG03052	1.379	1.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.14	nan	nan	0	1
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA18525	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.156	nan	nan	0	0
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA19017	1.155	1.155	0.0	0.0	0.788	0.788	1	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA19238	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA19625	0.924	0.924	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA19648	0.828	0.828	0.0	0.05	nan	nan	0	1
chrX	112788553	112788681	DEL	129	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	0
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG00268	0.754	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG00419	0.793	0.793	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG00759	0.597	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG01595	0.528	0.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG02568	0.392	0.392	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG02922	0.707	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG03052	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA18525	0.564	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA18939	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA19017	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA19238	0.83	0.83	0.0	0.0	0.786	0.786	1	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA19625	0.616	0.616	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA19648	0.621	0.621	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chrX	113148602	113148706	DEL	105	NA20502	0.749	0.749	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG00268	0.467	0.467	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG00419	0.23	0.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG00759	0.478	0.478	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG01595	0.366	0.366	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG02568	0.353	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG02922	0.279	0.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG03052	0.237	0.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	HG03642	0.455	0.455	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA12878	0.448	0.448	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA18525	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA18939	0.406	0.406	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA19017	0.466	0.466	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA19238	0.531	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA19625	0.257	0.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA19648	0.181	0.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113253298	113253376	DEL	79	NA20502	0.094	0.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG00268	1.041	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG00419	0.897	0.897	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG00759	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG01595	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG02568	0.548	0.548	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG02922	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG03052	0.733	0.733	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	HG03642	0.742	0.742	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA18525	0.928	0.928	0.0	0.0	0.833	0.796	2	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA18939	0.959	0.959	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA19017	0.931	0.931	0.0	0.004	0.808	0.808	2	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA19238	0.907	0.907	0.0	0.0	0.778	0.778	3	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA19625	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA19648	1.087	1.087	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chrX	113296407	113296905	DEL	499	NA20502	0.96	0.96	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG00268	1.131	1.057	0.015	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG00419	1.231	1.151	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG00759	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG01595	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG02568	0.705	0.659	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG02922	0.9	0.841	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG03052	0.97	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	HG03642	0.958	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA12878	0.93	0.869	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA18525	1.11	1.037	0.0	0.0	0.867	0.906	1	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA18939	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA19017	0.95	0.888	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA19238	1.102	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA19625	1.13	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA19648	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113775634	113776063	DEL	430	NA20502	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG00268	0.664	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG00419	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG00759	0.697	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG01595	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG02568	0.979	0.979	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG02922	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG03052	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	HG03642	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA12878	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA18525	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA18939	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA19017	0.857	0.857	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA19238	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA19625	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA19648	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	113997499	113997563	DEL	65	NA20502	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG00268	0.718	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG00419	0.73	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG00759	0.896	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG01595	0.732	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG02568	0.705	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG02922	0.921	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG03052	1.077	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	HG03642	0.958	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA12878	0.81	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA18525	0.837	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA18939	0.922	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA19017	0.782	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA19238	1.024	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA19625	0.642	0.738	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA19648	0.88	1.012	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chrX	114565895	114566055	DEL	161	NA20502	1.03	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG00268	0.628	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG00419	0.543	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG00759	0.538	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG01595	0.406	0.467	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG02568	0.274	0.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG02922	0.386	0.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG03052	0.323	0.372	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	HG03642	0.455	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA12878	0.534	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA18525	0.728	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA18939	0.572	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA19017	0.354	0.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA19238	0.557	0.641	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA19625	0.205	0.236	0.01	0.168	nan	nan	0	1
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA19648	0.181	0.208	0.009	0.101	nan	nan	0	1
chrX	114670492	114670787	DEL	296	NA20502	0.702	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG00268	0.826	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG00419	0.668	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG00759	0.816	0.793	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG01595	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG02568	0.862	0.837	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG02922	0.921	0.895	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG03052	0.797	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	HG03642	0.718	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA12878	0.706	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA18525	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA18939	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA19017	0.913	0.886	0.0	0.0	0.814	0.814	2	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA19238	0.752	0.73	0.0	0.0	0.567	0.567	2	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA19625	1.001	0.972	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA19648	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	114828525	114829308	DEL	784	NA20502	0.702	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG00268	1.257	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG00419	1.189	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG00759	1.394	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG01595	1.158	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG02568	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG02922	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG03052	1.271	1.188	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	HG03642	1.173	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA12878	1.154	1.079	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA18525	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA18939	1.088	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA19017	1.155	1.079	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA19238	1.504	1.405	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA19625	0.77	0.72	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA19648	1.191	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115208182	115208291	DEL	110	NA20502	0.983	0.919	0.0	0.0	0.619	0.619	1	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG00268	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG00419	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG00759	1.254	1.254	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG01595	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG02568	1.293	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG02922	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG03052	1.142	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	HG03642	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA18525	1.164	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA18939	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA19017	1.304	1.304	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA19238	1.134	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA19625	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA19648	1.191	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115216698	115216887	DEL	190	NA20502	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG00268	0.987	0.987	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG00419	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG00759	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG01595	1.057	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG02568	0.588	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG02922	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG03052	0.452	0.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	HG03642	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA12878	0.758	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA18525	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA18939	0.719	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA19017	1.341	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA19238	0.791	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA19625	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA19648	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115498834	115498888	DEL	55	NA20502	1.194	1.194	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG00268	1.167	1.133	0.003	0.0	0.556	0.532	1	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG00419	0.814	0.79	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG00759	0.936	0.909	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG01595	0.894	0.868	0.0	0.0	0.767	0.767	2	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG02568	0.705	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG02922	0.9	0.874	0.0	0.004	0.7	0.75	1	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG03052	0.797	0.774	0.0	0.0	0.444	0.444	2	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	HG03642	0.79	0.767	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA12878	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA18525	1.019	0.989	0.0	0.0	0.825	0.862	2	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA18939	0.83	0.806	0.0	0.0	0.693	0.663	2	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA19017	0.987	0.959	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA19238	0.933	0.906	0.002	0.0	0.538	0.538	1	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA19625	0.847	0.823	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA19648	0.751	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115505238	115506128	DEL	891	NA20502	0.772	0.75	0.0	0.0	0.286	0.286	1	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG00268	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG00419	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG00759	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG01595	0.813	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG02568	1.018	0.989	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG02922	1.028	0.999	0.0	0.0	0.713	0.705	2	1
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG03052	0.97	0.941	0.0	0.0	0.604	0.604	4	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	HG03642	1.317	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA12878	0.861	0.836	0.0	0.0	0.802	0.766	2	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA18939	1.051	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA19017	0.969	0.94	0.0	0.0	0.615	0.615	3	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA19238	1.128	1.095	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA19625	1.13	1.097	0.0	0.0	0.812	0.812	3	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA19648	1.191	1.156	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	115544162	115545105	DEL	944	NA20502	1.124	1.091	0.0	0.0	0.633	0.633	2	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG00268	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG00419	0.981	0.981	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG00759	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG01595	1.26	1.26	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG02568	0.666	0.666	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG02922	1.178	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG03052	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	HG03642	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA12878	1.042	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA18939	0.895	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA19017	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA19238	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA19625	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA19648	1.476	1.476	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116059928	116060015	DEL	88	NA20502	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG00268	1.221	1.356	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG00419	0.814	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG00759	1.075	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG01595	0.894	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG02568	0.94	1.045	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG02922	1.103	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG03052	0.97	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	HG03642	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA12878	1.051	1.168	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA18525	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA18939	1.162	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA19017	0.699	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA19238	1.231	1.368	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA19625	1.181	1.312	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA19648	0.88	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116126382	116126467	DEL	86	NA20502	0.913	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG00268	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG00419	1.043	1.043	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG00759	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG01595	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG02568	1.136	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG02922	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG03052	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	HG03642	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA12878	0.672	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA18525	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA19017	1.099	1.099	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA19238	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA19625	0.976	0.976	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA19648	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116503005	116503235	DEL	231	NA20502	1.334	1.334	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG00268	0.736	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG00419	1.002	1.151	0.0	0.0	0.913	0.913	1	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG00759	0.697	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG01595	0.671	0.771	0.0	0.0	0.812	0.812	1	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG02568	0.823	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG02922	0.729	0.837	0.0	0.004	0.819	0.813	2	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG03052	1.056	1.214	0.0	0.0	0.704	0.704	1	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	HG03642	0.838	0.963	0.0	0.0	0.586	0.586	2	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA12878	0.792	0.911	0.0	0.0	0.769	0.766	2	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA18525	0.855	0.983	0.0	0.0	0.923	0.965	1	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA18939	0.756	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA19017	0.764	0.878	0.0	0.0	0.3	0.3	1	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA19238	0.855	0.983	0.0	0.0	0.811	0.811	1	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA19625	0.565	0.649	0.0	0.0	0.472	0.472	2	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA19648	0.802	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116577188	116577462	DEL	275	NA20502	0.538	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG00268	0.916	0.84	0.0	0.0	0.889	0.928	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG00419	1.21	1.11	0.0	0.002	0.655	0.655	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG00759	1.215	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG01595	1.321	1.212	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG02568	1.058	0.97	0.0	0.0	0.316	0.316	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG02922	1.007	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG03052	0.819	0.751	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	HG03642	1.173	1.076	0.0	0.0	0.95	0.95	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA12878	1.292	1.185	0.0	0.0	0.941	0.898	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA18525	1.037	0.951	0.0	0.0	0.962	0.92	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA18939	1.015	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA19017	0.95	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA19238	1.089	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA19625	1.284	1.178	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA19648	1.294	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116611894	116611944	DEL	51	NA20502	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG00268	1.005	1.005	0.0	0.0	0.957	0.917	1	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG00419	0.876	0.876	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG01595	1.158	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG02568	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG02922	0.857	0.857	0.0	0.0	0.731	0.722	2	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG03052	1.207	1.207	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	HG03642	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.0	0.895	0.937	1	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA18525	1.183	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA18939	1.144	1.144	0.0	0.0	0.742	0.71	1	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA19017	1.062	1.062	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA19238	0.907	0.907	0.0	0.0	0.848	0.848	2	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA19625	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA19648	1.113	1.113	0.0	0.0	0.621	0.621	1	2
chrX	116842016	116842861	DEL	846	NA20502	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG00268	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG00419	0.689	0.669	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG00759	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG01595	1.138	1.105	0.006	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG02568	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG02922	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG03052	1.056	1.025	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	HG03642	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA12878	0.775	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA18525	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA18939	1.033	1.003	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA19017	0.82	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA19238	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA19625	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA19648	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116914925	116915073	DEL	149	NA20502	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG00268	1.257	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG00419	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG00759	1.195	1.16	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG01595	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG02568	1.116	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG02922	0.793	0.77	0.0	0.0	0.533	0.571	1	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG03052	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	HG03642	1.03	1.0	0.007	0.002	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA12878	0.827	0.803	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA18525	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA18939	1.051	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA19017	1.08	1.049	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA19238	0.966	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA19625	1.155	1.122	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA19648	1.294	1.257	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	116979882	116980149	DEL	268	NA20502	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG00268	0.61	0.593	0.082	0.048	nan	nan	0	1
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG00419	0.0	0.0	0.146	0.111	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG00759	0.0	0.0	0.227	0.155	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG01595	0.427	0.414	0.072	0.058	nan	nan	0	1
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG02568	0.0	0.0	0.191	0.16	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG02922	0.0	0.0	0.216	0.147	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG03052	0.0	0.0	0.097	0.059	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	HG03642	0.0	0.0	0.155	0.08	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA12878	1.034	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA18525	0.0	0.0	0.315	0.141	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA18939	0.0	0.0	0.237	0.181	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA19017	0.0	0.0	0.158	0.113	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA19238	0.0	0.0	0.309	0.145	nan	nan	0	0
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA19625	0.539	0.523	0.037	0.027	nan	nan	0	1
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA19648	0.337	0.327	0.065	0.035	nan	nan	0	1
chrX	117454126	117454959	DEL	834	NA20502	1.007	0.977	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG00268	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG00419	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG00759	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG01595	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG02568	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG02922	0.686	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG03052	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	HG03642	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA12878	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA18525	1.237	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA18939	1.217	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA19017	1.099	1.099	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA19238	1.167	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA19625	1.13	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA19648	1.035	1.035	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	117681322	117681409	DEL	88	NA20502	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG00268	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG00419	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG00759	0.856	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG01595	0.732	0.71	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG02568	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG02922	0.771	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG03052	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	HG03642	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA12878	1.034	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA18525	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA18939	0.885	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA19017	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA19625	1.001	0.972	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA19648	1.657	1.608	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	11830023	11830113	DEL	91	NA20502	1.311	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG00268	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG00419	1.294	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG00759	1.235	1.154	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG01595	1.382	1.291	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG02568	1.018	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG02922	1.307	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG03052	1.164	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	HG03642	1.102	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA12878	0.879	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA18525	1.201	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA18939	1.051	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA19017	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA19238	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA19625	1.284	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA19648	1.139	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118447777	118448592	DEL	816	NA20502	1.241	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG00268	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG00419	0.897	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG00759	0.757	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG01595	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG02568	0.588	0.618	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG02922	1.071	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG03052	1.379	1.452	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	HG03642	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA12878	0.689	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA18525	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA18939	0.922	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA19017	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA19238	1.05	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA19625	1.001	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA19648	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	118523301	118523365	DEL	65	NA20502	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG00268	1.23	1.23	0.0	0.0	0.966	0.993	1	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG00419	0.605	0.605	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG00759	1.115	1.115	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG01595	0.914	0.914	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG02568	0.431	0.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG02922	0.771	0.771	0.0	0.003	0.667	0.622	1	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG03052	0.625	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	HG03642	0.515	0.515	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA18525	1.274	1.274	0.0	0.0	0.781	0.747	1	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA18939	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA19017	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA19238	1.011	1.011	0.0	0.0	0.971	0.971	1	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA19625	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA19648	0.725	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	11932522	11932605	DEL	84	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG00268	0.898	0.898	0.0	0.0	0.726	0.696	2	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG00419	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG00759	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG01595	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG02922	0.986	0.986	0.0	0.0	0.7	0.75	3	1
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG03052	0.711	0.711	0.0	0.0	0.725	0.725	2	1
chrX	120588422	120589335	DEL	914	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA18525	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA18939	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA19017	0.987	0.987	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA19238	1.024	1.024	0.0	0.0	0.316	0.316	3	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA19625	1.053	1.053	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA19648	0.828	0.828	0.0	0.0	0.762	0.762	2	2
chrX	120588422	120589335	DEL	914	NA20502	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	0.714	0.685	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG00759	0.976	0.947	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG01595	1.077	1.046	0.0	0.0	0.864	0.864	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG02568	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG02922	1.136	1.103	0.0	0.0	0.938	0.996	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG03052	1.077	1.046	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	HG03642	1.054	1.023	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	0.793	0.757	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA18525	1.11	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA18939	0.959	0.931	0.004	0.0	0.545	0.57	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA19017	0.894	0.868	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA19238	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA19625	1.053	1.022	0.0	0.0	0.652	0.652	1	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA19648	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12114294	12115191	DEL	898	NA20502	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG00268	0.736	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG00419	0.96	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG00759	1.035	1.15	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG01595	0.732	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG02568	0.744	0.827	0.0	0.0	0.672	0.672	2	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG02922	0.836	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG03052	1.056	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	HG03642	0.958	1.064	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA12878	0.758	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA18939	0.646	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA19017	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA19238	0.7	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA19625	0.873	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA19648	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121386279	121386519	DEL	241	NA20502	1.007	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG00268	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG00759	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG01595	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG02922	1.243	1.243	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG03052	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	HG03642	1.102	1.102	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA12878	0.93	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA18939	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA19017	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA19238	1.141	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA19625	1.438	1.438	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA19648	1.165	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121912788	121912868	DEL	81	NA20502	1.17	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG00268	0.664	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG00419	1.012	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG00759	1.254	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG01595	0.732	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG02568	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG02922	1.264	1.264	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG03052	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	HG03642	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA12878	0.792	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA18525	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA18939	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA19017	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA19238	0.817	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA19625	0.924	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA19648	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	121977572	121977677	DEL	106	NA20502	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG00268	0.952	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG00419	0.563	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG00759	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG01595	0.853	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG02568	1.018	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG02922	1.071	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG03052	1.077	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	HG03642	1.102	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA12878	1.206	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA18525	0.801	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA18939	0.904	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA19017	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA19238	0.83	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA19625	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA19648	0.828	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122156938	122157080	DEL	143	NA20502	0.866	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG00268	0.934	0.906	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG00419	0.876	0.851	0.007	0.001	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG00759	0.916	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG01595	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG02568	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG03052	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	HG03642	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA12878	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA18525	1.183	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA18939	0.775	0.752	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA19017	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA19238	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA19625	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA19648	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122235285	122236168	DEL	884	NA20502	0.96	0.932	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG00268	0.987	0.987	0.0	0.0	0.79	0.824	2	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG00419	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG00759	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG02568	0.94	0.94	0.0	0.0	0.862	0.862	2	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG02922	0.964	0.964	0.0	0.0	0.68	0.635	1	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG03052	0.883	0.883	0.0	0.0	0.946	0.946	2	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	HG03642	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA12878	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA18525	0.928	0.928	0.0	0.0	0.75	0.784	1	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA18939	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA19017	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA19238	0.907	0.907	0.0	0.0	0.738	0.738	2	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA19625	0.899	0.899	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA19648	1.035	1.035	0.0	0.0	0.636	0.636	1	2
chrX	122315501	122316263	DEL	763	NA20502	0.819	0.819	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG00268	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG00419	0.668	0.668	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG00759	0.936	0.936	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG02922	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG03052	0.733	0.733	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	HG03642	0.934	0.934	0.0	0.005	0.91	0.91	2	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA12878	0.93	0.93	0.0	0.0	0.45	0.471	2	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	0.828	0.865	1	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA18939	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA19017	0.969	0.969	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA19238	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA19625	0.822	0.822	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA19648	0.854	0.854	0.0	0.0	0.632	0.632	1	1
chrX	122316013	122316578	DEL	566	NA20502	0.866	0.866	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG00268	0.934	0.934	0.0	0.0	0.829	0.795	2	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG00419	1.064	1.064	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG00759	0.757	0.757	0.0	0.0	0.435	0.435	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG01595	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG02568	0.94	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG02922	1.093	1.093	0.0	0.0	0.435	0.406	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG03052	0.754	0.754	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	HG03642	0.958	0.958	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.0	0.745	0.746	2	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA18525	0.691	0.691	0.007	0.0	0.625	0.598	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA18939	0.867	0.867	0.0	0.0	0.916	0.876	2	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA19017	1.043	1.043	0.0	0.0	0.694	0.694	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA19238	0.868	0.868	0.0	0.0	0.675	0.675	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA19625	0.847	0.847	0.0	0.0	0.8	0.8	2	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA19648	0.854	0.854	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chrX	122372569	122373422	DEL	854	NA20502	1.053	1.053	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG00268	1.113	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG00419	1.273	1.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG00759	1.553	1.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG01595	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG02922	1.071	1.128	0.008	0.004	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG03052	1.034	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	HG03642	1.03	1.084	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA12878	0.818	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA18525	1.128	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA18939	1.328	1.398	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA19017	1.565	1.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA19238	1.128	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA19625	1.078	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA19648	1.346	1.417	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	12271780	12271841	DEL	62	NA20502	1.311	1.38	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG00268	0.916	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG00419	1.283	1.246	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG00759	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG01595	1.25	1.213	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG02568	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG02922	1.028	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG03052	1.185	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	HG03642	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA12878	1.206	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA18525	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA18939	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA19017	1.192	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA19238	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA19625	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA19648	1.152	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122763589	122763676	DEL	88	NA20502	1.007	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG00268	0.79	0.79	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG00419	0.814	0.814	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG00759	0.279	0.279	0.022	0.0	nan	nan	0	1
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG01595	0.711	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG02568	0.353	0.353	0.07	0.0	0.273	0.273	5	1
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG02922	0.0	0.0	0.301	0.011	nan	nan	0	0
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG03052	0.97	0.97	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	HG03642	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA12878	0.413	0.413	0.06	0.0	nan	nan	0	1
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA18525	0.837	0.837	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA18939	0.258	0.258	0.055	0.0	nan	nan	0	1
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA19017	0.689	0.689	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA19238	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA19625	0.719	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA19648	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	122972835	122973660	DEL	826	NA20502	0.515	0.515	0.109	0.005	0.16	0.16	5	1
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG00268	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG00419	1.023	0.956	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG00759	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG01595	1.463	1.367	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG02568	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG02922	1.307	1.222	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG03052	1.357	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	HG03642	1.245	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA12878	0.982	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA18525	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA18939	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA19017	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA19238	1.128	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA19625	1.001	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA19648	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	123154776	123155087	DEL	312	NA20502	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG00268	1.239	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG00419	0.793	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG00759	0.856	0.8	0.0	0.004	0.773	0.773	1	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG01595	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG02568	1.097	1.025	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG02922	0.836	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG03052	0.927	0.866	0.0	0.0	0.583	0.583	1	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	HG03642	1.03	0.962	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA12878	1.085	1.014	0.0	0.0	0.724	0.691	1	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA18525	0.855	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA18939	0.996	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA19017	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA19238	0.843	0.787	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA19625	0.924	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA19648	0.932	0.871	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124553816	124554440	DEL	625	NA20502	0.843	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG00268	1.131	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG00419	0.918	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG00759	1.035	0.968	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG01595	1.301	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG02568	0.431	0.403	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG02922	1.693	1.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG03052	1.013	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	HG03642	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA12878	0.879	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA18525	1.037	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA18939	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA19017	1.416	1.323	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA19238	1.076	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA19625	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA19648	0.854	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	124992814	124993318	DEL	505	NA20502	1.007	0.941	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG00268	0.718	0.659	0.0	0.0	0.714	0.745	1	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG00419	0.71	0.651	0.0	0.0	0.631	0.631	2	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG00759	0.717	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG01595	0.61	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.235	nan	nan	0	1
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG02922	0.6	0.55	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG03052	0.431	0.395	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	HG03642	0.407	0.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA12878	0.482	0.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA18525	0.91	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA18939	0.59	0.542	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA19017	0.596	0.547	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA19238	0.817	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA19625	0.411	0.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA19648	0.466	0.427	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125077710	125077946	DEL	237	NA20502	0.257	0.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG00268	0.969	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG00419	0.668	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG00759	0.657	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG01595	0.61	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG02568	0.823	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG02922	0.6	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG03052	0.668	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	HG03642	0.838	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA12878	0.594	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA18525	0.619	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA18939	0.738	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA19017	0.615	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA19238	0.972	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA19625	0.488	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA19648	1.074	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125372640	125372765	DEL	126	NA20502	0.585	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG00268	0.485	0.584	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG00419	0.647	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG00759	0.418	0.504	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG01595	0.488	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG02568	0.744	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG02922	0.514	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG03052	0.646	0.779	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	HG03642	0.982	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA12878	0.775	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA18525	0.691	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA18939	0.701	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA19017	0.708	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA19238	0.583	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA19625	0.616	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA19648	0.544	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	125392060	125392136	DEL	77	NA20502	0.819	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG00268	0.969	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG00419	1.127	1.053	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG00759	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG01595	1.544	1.443	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG02568	0.783	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG02922	1.371	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG03052	1.002	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	HG03642	1.449	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA12878	0.81	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA18525	1.146	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA18939	1.365	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA19017	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA19238	1.309	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA19625	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA19648	1.268	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	126852500	126852551	DEL	52	NA20502	0.749	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG00268	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG00419	1.482	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG00759	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG01595	1.036	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG02568	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG02922	1.136	1.061	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG03052	1.228	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	HG03642	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA12878	1.111	1.038	0.0	0.003	0.513	0.537	1	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA18525	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA18939	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA19017	1.313	1.227	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA19238	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA19625	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA19648	1.346	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127026713	127026788	DEL	76	NA20502	1.287	1.203	0.0	0.009	0.786	0.786	1	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG00268	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG00419	0.71	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG00759	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG01595	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG02568	1.136	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG02922	0.75	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG03052	0.625	0.658	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	HG03642	1.149	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA12878	0.724	0.762	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA18525	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA18939	0.683	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA19017	0.727	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA19238	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA19625	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA19648	0.595	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127498484	127498582	DEL	99	NA20502	0.843	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG00268	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG00419	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG00759	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG01595	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG02568	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG02922	1.2	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG03052	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	HG03642	0.766	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA12878	0.465	0.465	0.0	0.054	0.41	0.43	1	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA18525	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA18939	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA19017	0.727	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA19238	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA19625	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA19648	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	127943444	127943542	DEL	99	NA20502	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG00268	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG00419	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG00759	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG01595	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG02568	1.371	1.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG02922	0.75	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG03052	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	HG03642	0.551	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA12878	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA18525	0.928	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA18939	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA19017	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA19238	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA19625	0.77	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA19648	0.854	0.854	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chrX	128041065	128041132	DEL	68	NA20502	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG00268	0.808	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG00419	1.127	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG00759	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG01595	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG02922	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG03052	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	HG03642	1.102	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA18939	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA19017	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA19238	0.881	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA19625	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA19648	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128046284	128046401	DEL	118	NA20502	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG00268	0.664	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG00419	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG01595	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG02568	0.979	0.979	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG02922	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG03052	0.991	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	HG03642	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA12878	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA18525	0.673	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA18939	1.291	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA19017	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA19238	0.907	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA19625	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA19648	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128216094	128216148	DEL	55	NA20502	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG00268	1.005	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG00419	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG00759	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG01595	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG02568	1.058	1.058	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG02922	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG03052	0.711	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	HG03642	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA12878	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA18525	1.019	1.019	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA18939	1.273	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA19017	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA19238	0.868	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA19625	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA19648	1.527	1.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128348971	128349037	DEL	67	NA20502	0.843	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG00268	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG00419	0.835	0.879	0.0	0.0	0.273	0.273	1	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG00759	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG01595	0.589	0.62	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG02568	0.47	0.495	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.0	0.514	0.51	4	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG03052	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	HG03642	0.766	0.807	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA12878	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA18525	0.855	0.9	0.0	0.0	0.5	0.523	1	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA18939	0.553	0.583	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA19017	0.708	0.745	0.0	0.0	0.526	0.526	2	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA19238	0.855	0.901	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA19625	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA19648	1.035	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	128794882	128795189	DEL	308	NA20502	0.562	0.591	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG00268	0.969	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG00419	1.189	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG00759	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG01595	1.362	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG02568	0.94	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG02922	0.921	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG03052	0.84	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	HG03642	1.125	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA12878	0.913	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA18525	1.292	1.185	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA18939	0.904	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA19017	1.136	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA19238	1.167	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA19625	1.207	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA19648	1.346	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130274755	130274825	DEL	71	NA20502	0.843	0.773	0.0	0.005	nan	nan	0	1
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG00268	1.113	1.04	0.0	0.0	0.933	0.894	1	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG00419	1.189	1.112	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG00759	1.195	1.117	0.003	0.0	nan	nan	0	1
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG01595	1.382	1.291	0.003	0.0	0.722	0.722	1	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG02568	1.097	1.025	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG02922	1.2	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG03052	1.293	1.208	0.003	0.0	0.912	0.912	1	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	HG03642	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA12878	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA18525	1.328	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA18939	1.144	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA19017	1.099	1.027	0.009	0.0	0.911	0.911	2	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA19238	1.387	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA19625	1.155	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA19648	1.113	1.04	0.0	0.0	0.85	0.85	1	1
chrX	130377774	130378680	DEL	907	NA20502	1.264	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG00268	1.248	1.211	0.005	0.003	nan	nan	0	2
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG00759	0.398	0.387	0.008	0.057	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG01595	0.427	0.414	0.0	0.044	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG02568	0.94	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG03052	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	HG03642	0.503	0.488	0.0	0.105	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA12878	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA18525	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA18939	0.461	0.448	0.0	0.106	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA19017	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA19238	0.609	0.591	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA19625	0.436	0.424	0.012	0.061	nan	nan	0	0
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA19648	0.699	0.679	0.0	0.082	nan	nan	0	1
chrX	131089382	131089611	DEL	230	NA20502	0.983	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG00268	0.969	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG00419	0.856	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG00759	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG01595	0.894	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG02568	0.94	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG02922	0.793	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG03052	0.916	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	HG03642	0.958	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA12878	1.189	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA18525	1.283	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA18939	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA19017	1.08	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA19238	1.102	1.03	0.0	0.0	0.582	0.582	1	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA19625	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA19648	0.802	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131138014	131138099	DEL	86	NA20502	0.726	0.678	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG00268	1.059	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG00419	1.043	0.957	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG00759	1.135	1.041	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG01595	1.382	1.268	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG02568	1.136	1.042	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG02922	1.243	1.14	0.0	0.0	0.952	0.889	1	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG03052	1.185	1.087	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	HG03642	1.054	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA12878	1.137	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA18525	1.365	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA18939	1.291	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA19017	1.285	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA19238	1.296	1.189	0.0	0.0	0.774	0.774	1	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA19625	1.104	1.013	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA19648	1.268	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131509268	131509620	DEL	353	NA20502	1.639	1.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG00268	1.005	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG00419	1.169	1.135	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG00759	1.235	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG02568	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG02922	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG03052	1.314	1.276	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	HG03642	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA12878	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA18525	1.019	0.989	0.0	0.0	0.656	0.628	1	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA18939	1.236	1.2	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA19017	0.652	0.633	0.062	0.032	nan	nan	0	1
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA19238	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA19625	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA19648	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131694553	131695226	DEL	674	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG00268	1.023	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG00419	0.939	0.912	0.0	0.002	0.864	0.864	1	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG00759	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG01595	1.158	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG02568	1.018	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG02922	0.664	0.645	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG03052	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	HG03642	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA12878	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA18525	1.11	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA18939	1.162	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA19017	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA19238	0.817	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA19625	0.924	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA19648	1.087	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131715059	131715696	DEL	638	NA20502	1.264	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG00268	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG00419	0.897	0.945	0.0	0.0	0.966	0.966	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG00759	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG01595	0.955	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG02568	0.744	0.783	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG02922	0.943	0.992	0.0	0.0	0.545	0.509	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG03052	0.991	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	HG03642	0.934	0.983	0.0	0.0	0.529	0.529	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA12878	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA18525	0.655	0.689	0.0	0.0	0.459	0.48	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA18939	0.978	1.029	0.0	0.0	0.8	0.836	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA19017	0.82	0.863	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA19238	1.089	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA19625	1.001	1.054	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA19648	1.139	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131744890	131745334	DEL	445	NA20502	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG00268	0.718	0.756	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG00419	0.981	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG00759	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG01595	0.732	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.0	0.25	0.25	1	1
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG02922	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG03052	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	HG03642	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA12878	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA18525	0.691	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA18939	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA19017	0.82	0.863	0.0	0.0	0.676	0.676	1	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA19238	0.868	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA19625	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA19648	0.828	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	131913728	131914343	DEL	616	NA20502	1.007	1.06	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG00268	0.79	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG00419	1.023	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG00759	0.836	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG01595	1.107	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG02568	0.783	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG02922	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG03052	0.905	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	HG03642	0.958	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA12878	1.068	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA18525	0.837	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA18939	1.162	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA19017	0.782	0.718	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA19238	0.881	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA19625	1.053	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA19648	0.958	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13205696	13205801	DEL	106	NA20502	0.866	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG00268	1.005	1.005	0.0	0.0	0.96	0.998	1	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG00419	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG00759	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG01595	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG02568	0.901	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG02922	1.114	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG03052	1.379	1.379	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	HG03642	0.718	0.718	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA12878	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA18939	1.254	1.254	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA19017	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA19238	1.115	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA19625	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA19648	1.191	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13216928	13217230	DEL	303	NA20502	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG00268	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG00419	0.584	0.584	0.0	0.0	0.777	0.777	2	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG00759	0.757	0.757	0.0	0.0	0.811	0.811	2	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG01595	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG02922	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	HG03642	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	0.737	0.772	2	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA18525	1.11	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA18939	0.756	0.756	0.004	0.002	0.773	0.808	3	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA19017	0.857	0.857	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA19238	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA19625	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132537103	132537908	DEL	806	NA20502	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG00268	1.203	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG00419	0.772	0.772	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG00759	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG01595	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG02922	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG03052	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	HG03642	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA12878	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA18525	0.928	0.928	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA18939	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA19017	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA19238	1.076	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA19625	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	132769210	132769480	DEL	271	NA20502	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG00268	1.239	1.158	0.0	0.039	0.833	0.799	1	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG00419	0.918	0.858	0.0	0.066	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG00759	0.936	0.875	0.0	0.012	0.9	0.9	6	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG01595	0.955	0.893	0.0	0.04	0.75	0.75	4	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG02568	0.783	0.732	0.0	0.008	0.429	0.429	5	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG02922	1.028	0.961	0.0	0.037	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG03052	0.883	0.826	0.0	0.012	0.527	0.527	4	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	HG03642	0.647	0.604	0.0	0.044	0.5	0.5	4	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA12878	0.81	0.757	0.0	0.04	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA18525	0.983	0.918	0.0	0.048	0.857	0.82	1	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA18939	1.051	0.983	0.0	0.048	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA19017	0.987	0.923	0.0	0.038	0.263	0.263	1	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA19238	0.985	0.921	0.0	0.044	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA19625	0.616	0.576	0.0	0.065	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA19648	0.854	0.798	0.0	0.026	nan	nan	0	2
chrX	133367997	133368233	DEL	237	NA20502	1.1	1.028	0.0	0.058	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG00268	0.575	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG00419	0.543	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG00759	0.458	0.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG01595	0.386	0.465	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG02568	0.353	0.425	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG02922	0.514	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG03052	0.582	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	HG03642	0.551	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA12878	0.431	0.519	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA18525	0.946	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA18939	0.48	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA19017	0.727	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA19238	0.557	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA19625	0.591	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA19648	0.492	0.593	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	133669226	133669299	DEL	74	NA20502	0.468	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG00268	1.041	1.041	0.0	0.0	0.848	0.813	7	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	0.758	0.758	6	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG00759	0.876	0.876	0.0	0.0	0.895	0.895	7	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG01595	0.935	0.935	0.0	0.0	0.785	0.785	6	1
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG02568	0.666	0.666	0.0	0.0	0.4	0.4	3	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG02922	0.921	0.921	0.0	0.0	0.688	0.642	7	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG03052	0.991	0.991	0.0	0.0	0.652	0.652	2	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	HG03642	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.001	0.909	0.911	7	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA18525	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA18939	0.978	0.978	0.0	0.0	0.958	0.95	3	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA19017	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA19238	0.83	0.83	0.0	0.0	0.859	0.859	6	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA19625	1.027	1.027	0.0	0.0	0.789	0.789	5	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA19648	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	13420981	13421696	DEL	716	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	0.68	0.68	7	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG00268	0.682	0.682	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG00419	1.043	1.043	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG00759	0.936	0.936	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG01595	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG02568	1.214	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG02922	0.921	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG03052	0.905	0.905	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	HG03642	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA18525	0.964	0.964	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA18939	0.683	0.683	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA19017	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA19238	0.778	0.778	0.0	0.002	nan	nan	0	1
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA19625	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA19648	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135052293	135052832	DEL	540	NA20502	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG00268	1.346	1.417	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG00419	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG00759	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG01595	1.077	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG02568	1.058	1.113	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG02922	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG03052	1.12	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	HG03642	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA12878	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA18525	1.183	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA18939	1.291	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA19017	1.062	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA19238	0.972	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA19625	1.258	1.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA19648	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135115762	135115821	DEL	60	NA20502	0.843	0.887	0.0	0.018	0.5	0.5	1	1
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG00268	1.131	1.098	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG00419	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG00759	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG01595	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG02568	0.627	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG02922	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG03052	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	HG03642	1.604	1.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA12878	0.81	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA18525	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA18939	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA19017	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA19238	1.076	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA19625	1.258	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA19648	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135326848	135326972	DEL	125	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG00268	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG00419	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG00759	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG02568	1.41	1.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG02922	0.771	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG03052	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	HG03642	1.006	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA12878	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA18525	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA18939	0.885	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA19017	1.118	1.177	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA19238	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA19625	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA19648	1.191	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	135563175	135563311	DEL	137	NA20502	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG00268	1.311	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG00419	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG00759	1.215	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG01595	1.209	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG02568	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG02922	0.921	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG03052	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	HG03642	1.125	1.093	0.013	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA18939	1.088	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA19017	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA19238	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA19625	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA19648	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137172446	137172505	DEL	60	NA20502	1.404	1.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG00268	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG00419	0.751	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG00759	0.777	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG01595	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG02568	0.783	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG02922	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG03052	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	HG03642	1.125	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA12878	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA18525	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA18939	0.646	0.68	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA19017	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA19238	1.03	1.085	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA19625	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA19648	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	137711562	137711945	DEL	384	NA20502	1.194	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG00268	0.718	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG00419	0.668	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG00759	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG01595	0.793	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG02568	0.94	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG02922	0.836	0.929	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG03052	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	HG03642	0.958	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA12878	0.81	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA18525	1.074	1.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA18939	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA19017	0.671	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA19238	0.544	0.605	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA19625	1.207	1.341	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA19648	0.88	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138350817	138350939	DEL	123	NA20502	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG00268	0.88	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG00419	0.522	0.479	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG00759	0.737	0.676	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG01595	0.813	0.746	0.009	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG02568	0.823	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG02922	0.889	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG03052	0.711	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	HG03642	0.407	0.373	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA12878	0.758	0.695	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA18525	0.701	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA18939	0.922	0.846	0.0	0.008	0.231	0.241	4	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA19017	0.857	0.786	0.0	0.0	0.643	0.643	1	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA19238	0.648	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA19625	0.77	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA19648	0.595	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	138438676	138438755	DEL	80	NA20502	0.632	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG00268	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG00419	1.169	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG00759	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG01595	1.331	1.331	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG02568	0.627	0.627	0.0	0.018	0.25	0.25	1	1
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.091	nan	nan	0	0
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG03052	1.336	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	HG03642	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA12878	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.07	nan	nan	0	1
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA18939	0.0	0.0	0.016	0.057	nan	nan	0	1
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA19017	0.522	0.522	0.0	0.033	nan	nan	0	1
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA19238	1.011	1.011	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA19625	1.13	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA19648	0.337	0.337	0.0	0.03	nan	nan	0	2
chrX	139045796	139045929	DEL	134	NA20502	1.1	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG00268	1.239	1.203	0.0	0.003	0.812	0.848	3	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG00419	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG00759	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG01595	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG02568	1.018	0.989	0.0	0.0	0.636	0.636	6	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG02922	1.178	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG03052	1.056	1.025	0.0	0.0	0.955	0.955	1	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	HG03642	1.173	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA12878	0.775	0.753	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA18525	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA18939	1.199	1.164	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA19017	0.857	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA19238	1.089	1.057	0.0	0.0	0.861	0.861	7	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA19625	0.873	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA19648	0.725	0.704	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chrX	139502853	139503094	DEL	242	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG00268	0.592	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG00759	0.936	0.936	0.0	0.0	0.593	0.593	1	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG01595	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG02568	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG02922	0.621	0.621	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG03052	0.625	0.625	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	HG03642	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA12878	0.741	0.741	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA18939	0.701	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA19017	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA19238	1.205	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA19625	0.924	0.924	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA19648	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140029452	140029502	DEL	51	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG00268	1.185	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG00419	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG00759	0.876	0.876	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG01595	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG02568	1.253	1.253	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG02922	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG03052	0.409	0.409	0.0	0.078	nan	nan	0	1
chrX	140375697	140375809	DEL	113	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA12878	0.965	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA18525	0.637	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA18939	0.885	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA19017	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA19238	0.544	0.544	0.0	0.067	nan	nan	0	1
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA19625	0.591	0.591	0.0	0.102	nan	nan	0	1
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA19648	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	140375697	140375809	DEL	113	NA20502	1.241	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG00268	0.88	0.854	0.0	0.0	0.355	0.34	1	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG00419	1.043	1.013	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG00759	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG01595	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG02568	1.449	1.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG02922	1.2	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	HG03642	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA12878	0.741	0.719	0.0	0.0	0.842	0.804	1	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA18525	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA18939	1.31	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA19017	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA19238	0.83	0.805	0.0	0.0	0.774	0.774	1	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA19625	0.899	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA19648	1.346	1.307	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	141232859	141232977	DEL	119	NA20502	0.749	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG00268	0.969	0.889	0.0	0.0	0.658	0.63	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG00419	0.522	0.479	0.0	0.0	0.627	0.627	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG00759	1.075	0.986	0.0	0.0	0.829	0.829	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG01595	0.996	0.914	0.0	0.0	0.613	0.613	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG02568	0.548	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG02922	0.9	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG03052	0.496	0.455	0.0	0.004	0.929	0.929	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	HG03642	0.862	0.791	0.0	0.0	0.838	0.838	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA12878	0.775	0.711	0.0	0.0	0.778	0.815	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA18525	1.055	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA18939	0.775	0.711	0.0	0.0	0.972	0.93	2	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA19017	0.95	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA19238	1.18	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA19625	0.359	0.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA19648	0.88	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	141924785	141924915	DEL	131	NA20502	0.819	0.752	0.0	0.0	0.85	0.85	2	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG00268	0.754	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG00419	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG00759	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG01595	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG02568	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG02922	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG03052	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	HG03642	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA12878	0.758	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA18939	0.738	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA19017	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA19238	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA19625	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA19648	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142051221	142051283	DEL	63	NA20502	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG00268	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG00419	1.283	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG00759	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG01595	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG02568	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG02922	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG03052	0.56	0.544	0.0	0.069	nan	nan	0	1
chrX	142197943	142198062	DEL	120	HG03642	1.269	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA12878	0.853	0.828	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA18525	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA18939	1.181	1.146	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA19017	0.987	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA19238	0.493	0.478	0.0	0.094	nan	nan	0	1
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA19625	0.642	0.623	0.009	0.012	nan	nan	0	1
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA19648	1.579	1.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142197943	142198062	DEL	120	NA20502	1.252	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG00268	0.916	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG00419	1.064	0.995	0.0	0.0	0.657	0.657	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG00759	0.956	0.893	0.0	0.0	0.741	0.741	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG01595	0.996	0.931	0.0	0.0	0.676	0.676	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG02568	0.744	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG02922	1.007	0.941	0.0	0.0	0.603	0.563	4	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG03052	0.991	0.926	0.0	0.0	0.761	0.761	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	HG03642	1.03	0.962	0.0	0.0	0.686	0.686	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA12878	0.861	0.805	0.0	0.003	0.763	0.8	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA18525	0.946	0.884	0.0	0.0	0.892	0.853	2	1
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA18939	0.978	0.914	0.0	0.0	0.825	0.789	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA19017	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA19238	1.076	1.005	0.0	0.0	0.864	0.864	2	1
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA19625	0.976	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA19648	1.01	0.944	0.0	0.0	0.745	0.745	2	2
chrX	142342209	142343067	DEL	859	NA20502	1.124	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG00268	1.149	1.045	0.006	0.0	0.647	0.675	1	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG00419	0.71	0.645	0.0	0.009	0.389	0.389	3	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG00759	0.836	0.76	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG01595	0.833	0.757	0.0	0.009	0.5	0.5	3	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG02568	0.353	0.32	0.0	0.077	0.625	0.625	3	1
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG02922	1.05	0.954	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG03052	0.754	0.686	0.0	0.0	0.763	0.763	4	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	HG03642	0.694	0.631	0.0	0.005	0.5	0.5	1	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA12878	0.835	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA18525	1.074	0.976	0.005	0.013	0.68	0.711	3	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA18939	1.07	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA19017	0.373	0.339	0.0	0.063	0.71	0.71	4	1
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA19238	0.583	0.53	0.0	0.06	0.304	0.304	1	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA19625	0.539	0.49	0.0	0.039	0.276	0.276	2	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA19648	0.854	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	142833364	142833487	DEL	124	NA20502	0.702	0.638	0.007	0.015	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG00268	1.131	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG00419	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG00759	1.195	1.195	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG01595	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG02568	1.528	1.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG02922	1.157	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG03052	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	HG03642	1.533	1.533	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA12878	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA18525	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA18939	1.162	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA19017	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA19238	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA19625	1.463	1.463	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA19648	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	143063721	143063896	DEL	176	NA20502	1.381	1.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG00268	0.934	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG00419	1.085	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG00759	1.035	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG01595	1.179	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG02568	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG02922	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA12878	1.12	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA18525	1.164	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA18939	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA19017	1.025	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA19625	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA19648	0.932	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	14406055	14406111	DEL	57	NA20502	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG00268	1.149	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG00419	1.252	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG00759	1.354	1.265	0.0	0.0	0.73	0.73	1	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG01595	1.138	1.064	0.0	0.0	0.72	0.72	1	1
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG02568	0.862	0.805	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG02922	0.493	0.461	0.054	0.032	nan	nan	0	1
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG03052	1.034	0.967	0.0	0.0	0.617	0.617	2	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	HG03642	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA12878	0.947	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA18525	1.055	0.986	0.0	0.0	0.75	0.784	1	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA18939	1.088	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA19017	0.95	0.888	0.0	0.0	0.963	0.963	1	1
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA19238	1.296	1.211	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA19625	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA19648	1.061	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144322610	144323238	DEL	629	NA20502	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG00268	1.346	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG00419	1.336	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG00759	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG02568	1.058	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG02922	1.221	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG03052	1.164	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	HG03642	1.317	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA12878	0.792	0.769	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA18525	1.237	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA18939	1.088	1.057	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA19017	1.248	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA19238	1.18	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA19625	1.232	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA19648	1.243	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144454642	144454828	DEL	187	NA20502	1.475	1.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG00268	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG00419	0.73	0.769	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG00759	1.195	1.258	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG02568	1.018	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG02922	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG03052	0.927	0.975	0.0	0.0	0.75	0.75	2	1
chrX	144887118	144887538	DEL	421	HG03642	1.054	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA12878	0.965	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA18525	0.764	0.804	0.0	0.0	0.857	0.896	1	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA18939	0.941	0.99	0.0	0.0	0.958	0.917	1	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA19017	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA19238	0.843	0.887	0.0	0.0	0.622	0.622	1	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA19625	0.822	0.865	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA19648	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	144887118	144887538	DEL	421	NA20502	0.866	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG00268	0.987	0.987	0.0	0.0	0.778	0.745	1	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG00419	1.002	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG02568	0.94	0.94	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG02922	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG03052	0.883	0.883	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	HG03642	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA18525	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA18939	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA19017	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA19238	0.855	0.855	0.0	0.0	0.914	0.914	1	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA19625	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA19648	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	145509550	145510407	DEL	858	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG00268	0.539	0.619	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG00419	0.584	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG00759	0.358	0.412	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG01595	0.671	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG02568	0.509	0.585	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG02922	0.429	0.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG03052	0.496	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	HG03642	0.67	0.771	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA12878	0.758	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA18525	0.582	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA18939	0.572	0.657	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA19017	0.484	0.557	0.0	0.012	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA19238	0.713	0.819	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA19625	0.513	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA19648	0.388	0.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146169503	146169738	DEL	236	NA20502	0.679	0.78	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG00268	0.664	0.621	0.0	0.201	nan	nan	0	0
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG00419	0.626	0.585	0.0	0.261	nan	nan	0	0
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG00759	0.438	0.409	0.0	0.24	nan	nan	0	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG01595	0.528	0.494	0.0	0.226	nan	nan	0	0
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG02568	0.353	0.329	0.0	0.182	nan	nan	0	0
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG02922	0.536	0.501	0.0	0.208	nan	nan	0	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG03052	0.237	0.222	0.0	0.136	0.588	0.588	2	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.29	nan	nan	0	0
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.213	nan	nan	0	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.198	nan	nan	0	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA18939	0.0	0.0	0.01	0.206	nan	nan	0	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA19017	0.186	0.174	0.0	0.096	0.842	0.842	2	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA19238	0.531	0.497	0.0	0.22	nan	nan	0	0
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA19625	0.282	0.264	0.0	0.114	0.562	0.562	2	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA19648	0.388	0.363	0.0	0.221	nan	nan	0	1
chrX	146559239	146559345	DEL	107	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.25	nan	nan	0	1
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG00268	0.736	0.688	0.0	0.004	0.714	0.685	1	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG00419	0.856	0.8	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG00759	1.215	1.135	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG01595	0.874	0.817	0.0	0.0	0.708	0.708	2	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG02568	0.627	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG02922	0.771	0.721	0.0	0.0	0.75	0.741	2	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG03052	0.905	0.846	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	HG03642	0.982	0.918	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA12878	0.844	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA18525	0.964	0.901	0.0	0.0	0.905	0.901	2	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA18939	0.849	0.793	0.0	0.0	0.714	0.747	1	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA19017	0.671	0.627	0.0	0.0	0.699	0.699	2	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA19238	0.881	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA19625	0.616	0.576	0.0	0.0	0.562	0.562	1	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA19648	0.751	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146683080	146683534	DEL	455	NA20502	0.679	0.634	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG00268	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG00419	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG00759	1.075	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG01595	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG02568	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG02922	1.007	1.007	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG03052	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	HG03642	0.311	0.311	0.0	0.036	0.8	0.8	1	1
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA12878	0.551	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA18525	0.728	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA18939	0.664	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA19017	0.764	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA19238	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA19625	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA19648	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146756968	146757031	DEL	64	NA20502	0.772	0.772	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG00268	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG00419	1.252	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG00759	1.274	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG02568	1.097	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG02922	0.429	0.451	0.025	0.116	nan	nan	0	1
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG03052	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	HG03642	0.958	1.008	0.0	0.049	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA12878	0.706	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA18525	0.928	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA18939	0.738	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA19017	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA19238	0.441	0.464	0.005	0.084	0.47	0.47	2	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA19625	0.411	0.432	0.017	0.08	nan	nan	0	1
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA19648	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849495	146849811	DEL	317	NA20502	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG00268	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG00419	1.273	1.19	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG00759	1.513	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG01595	1.26	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG02568	1.293	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG02922	0.964	0.901	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG03052	1.487	1.389	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	HG03642	0.67	0.627	0.0	0.069	0.433	0.433	1	1
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA12878	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA18525	1.274	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA18939	0.978	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA19017	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA19238	1.205	1.127	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA19625	1.361	1.272	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA19648	1.268	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	146849941	146850021	DEL	81	NA20502	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG00268	1.077	1.298	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG00419	0.73	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG00759	0.816	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG01595	0.874	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG02568	0.783	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG02922	0.868	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG03052	0.69	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	HG03642	0.766	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA12878	0.792	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA18525	0.801	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA18939	1.033	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA19017	0.633	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA19238	0.907	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA19625	0.668	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA19648	0.544	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	147434332	147434405	DEL	74	NA20502	0.585	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG00268	1.077	1.197	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG00419	0.939	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG00759	0.896	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG01595	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG02568	1.097	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG02922	0.75	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG03052	1.056	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	HG03642	1.03	1.144	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA12878	0.861	0.957	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA18525	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA18939	0.941	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA19017	1.025	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA19238	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA19625	0.95	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA19648	1.035	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	148303489	148303585	DEL	97	NA20502	0.913	1.014	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG00268	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG00419	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG00759	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG01595	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG02568	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG02922	1.157	1.157	0.0	0.008	0.708	0.661	3	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG03052	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	HG03642	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA12878	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA18525	0.819	0.819	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA18939	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA19017	0.782	0.782	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA19238	0.609	0.609	0.0	0.033	0.774	0.774	1	1
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA19625	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA19648	0.932	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149006503	149006571	DEL	69	NA20502	0.843	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG00268	1.203	1.124	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG00419	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG00759	1.215	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG01595	1.219	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG02568	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG02922	1.371	1.282	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG03052	1.336	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	HG03642	1.102	1.029	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA12878	0.896	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA18525	1.055	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA18939	1.162	1.086	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA19017	1.08	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA19238	1.335	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA19625	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA19648	0.958	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149084379	149084667	DEL	289	NA20502	1.217	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG00268	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG00419	0.918	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG00759	0.876	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG01595	0.793	0.741	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG02568	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG02922	0.579	0.541	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG03052	0.927	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	HG03642	1.006	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA12878	0.896	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA18525	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA18939	1.107	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA19017	0.801	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA19238	0.493	0.46	0.0	0.009	0.881	0.881	1	1
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA19625	0.899	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA19648	1.01	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	149549314	149549368	DEL	55	NA20502	0.89	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG00268	0.682	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG00419	0.751	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG00759	0.757	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG01595	0.671	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG02568	0.823	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG02922	0.814	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG03052	0.797	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	HG03642	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA12878	0.758	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA18525	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA18939	0.609	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA19017	1.155	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA19238	0.791	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA19625	1.155	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA19648	1.087	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150317479	150317600	DEL	122	NA20502	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG00268	1.059	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG00419	1.336	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG00759	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG01595	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG02568	0.705	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG02922	1.307	1.222	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG03052	1.422	1.329	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	HG03642	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA12878	0.982	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA18525	1.31	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA18939	1.291	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA19017	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA19238	1.231	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA19625	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA19648	1.372	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	150420005	150420375	DEL	371	NA20502	1.264	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG00268	1.005	1.058	0.0	0.082	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG00419	1.002	1.054	0.0	0.066	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG00759	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG01595	1.179	1.241	0.0	0.076	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG02568	0.392	0.412	0.0	0.082	0.818	0.818	1	1
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG02922	0.729	0.767	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG03052	0.991	1.043	0.0	0.063	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	HG03642	1.149	1.21	0.0	0.067	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA12878	0.887	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA18525	0.801	0.843	0.0	0.063	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA18939	0.904	0.951	0.0	0.068	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA19017	1.118	1.177	0.0	0.054	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA19238	0.868	0.914	0.0	0.061	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA19625	1.078	1.135	0.0	0.044	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA19648	0.802	0.845	0.0	0.054	nan	nan	0	2
chrX	151982308	151982367	DEL	60	NA20502	0.89	0.936	0.0	0.071	nan	nan	0	2
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.13	nan	nan	0	0
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG00419	0.0	0.0	0.009	0.079	nan	nan	0	0
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG00759	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.077	nan	nan	0	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.098	nan	nan	0	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG02922	0.321	0.357	0.014	0.021	0.833	0.778	1	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG03052	0.302	0.335	0.0	0.078	0.938	0.938	1	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.107	nan	nan	0	0
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA12878	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.087	nan	nan	0	0
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.099	nan	nan	0	0
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.065	nan	nan	0	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA19625	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chrX	151982765	151982839	DEL	75	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.095	nan	nan	0	0
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG00268	0.808	0.898	0.0	0.0	0.542	0.565	1	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG00419	0.751	0.835	0.0	0.0	0.682	0.682	1	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG00759	0.697	0.774	0.0	0.0	0.364	0.364	1	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG01595	0.711	0.79	0.0	0.011	0.551	0.551	2	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG02568	0.823	0.914	0.0	0.009	0.508	0.508	2	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG02922	0.793	0.881	0.0	0.0	0.733	0.786	1	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG03052	1.013	1.125	0.0	0.0	0.544	0.544	2	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	HG03642	0.79	0.878	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA12878	0.861	0.957	0.0	0.0	0.845	0.885	2	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA18525	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA18939	0.683	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA19017	0.671	0.745	0.014	0.019	0.842	0.842	3	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA19238	0.622	0.691	0.0	0.0	0.455	0.455	1	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA19625	0.847	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA19648	0.828	0.92	0.0	0.007	0.571	0.571	1	2
chrX	152107192	152107456	DEL	265	NA20502	0.749	0.832	0.0	0.011	0.789	0.789	1	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG00268	0.736	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG00419	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG00759	0.757	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG01595	0.61	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG02922	0.729	0.767	0.0	0.0	0.923	0.989	1	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG03052	0.56	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	HG03642	0.599	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA12878	0.706	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA18525	0.71	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA19017	0.838	0.882	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA19238	0.765	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA19625	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA19648	0.815	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152350641	152351384	DEL	744	NA20502	0.866	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG00268	0.987	0.987	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG00419	1.064	1.064	0.0	0.004	0.441	0.441	1	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG00759	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	0.526	0.526	1	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	0.892	0.892	2	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG02922	1.05	1.05	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG03052	1.056	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	HG03642	0.407	0.407	0.0	0.052	0.235	0.235	8	1
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.0	0.833	0.795	1	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA18939	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA19017	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA19238	0.791	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA19625	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA19648	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15238353	15238611	DEL	259	NA20502	1.287	1.287	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG00268	0.628	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG00419	1.002	1.318	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG00759	0.558	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG01595	0.549	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG02568	0.744	0.979	0.0	0.01	0.368	0.368	1	1
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	0
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG03052	0.452	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	HG03642	0.742	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA12878	0.689	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA18525	1.074	1.413	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA18939	0.535	0.704	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA19017	0.41	0.539	0.009	0.017	0.565	0.565	1	1
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA19238	0.376	0.495	0.0	0.016	1.0	1.0	3	1
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA19625	0.462	0.608	0.0	0.008	0.692	0.692	1	1
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA19648	0.518	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152746729	152746781	DEL	53	NA20502	0.679	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG00268	0.467	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG00419	0.543	0.714	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG00759	0.259	0.341	0.0	0.018	nan	nan	0	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG01595	0.264	0.348	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG02568	0.274	0.361	0.0	0.074	0.857	0.857	1	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG02922	0.214	0.282	0.0	0.075	0.545	0.509	1	0
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG03052	0.345	0.454	0.0	0.018	0.6	0.6	1	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	HG03642	0.647	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA12878	0.448	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA18525	0.455	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA18939	0.258	0.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA19017	0.168	0.221	0.0	0.059	0.263	0.263	1	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA19238	0.531	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA19625	0.205	0.27	0.0	0.036	0.5	0.5	1	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA19648	0.388	0.511	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	152807507	152807578	DEL	72	NA20502	0.421	0.554	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG00268	0.934	0.983	0.0	0.0	0.5	0.479	1	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG00419	1.043	1.098	0.0	0.0	0.517	0.517	1	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG00759	0.737	0.776	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG01595	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG02568	0.862	0.907	0.0	0.0	0.885	0.885	2	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG02922	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG03052	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	HG03642	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA12878	0.999	1.052	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA18525	1.11	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA18939	0.922	0.971	0.0	0.0	0.957	0.915	1	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA19017	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA19238	0.92	0.969	0.003	0.0	0.857	0.857	1	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA19625	0.924	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA19648	1.035	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152895321	152896285	DEL	965	NA20502	1.03	1.084	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG00268	0.862	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG00419	1.106	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG00759	1.414	1.297	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG01595	1.199	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG02568	0.862	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG02922	0.836	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG03052	1.164	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	HG03642	1.125	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA12878	0.844	0.774	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA18525	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA18939	1.199	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA19017	1.248	1.145	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA19238	0.726	0.666	0.0	0.0	0.862	0.862	1	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA19625	0.847	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA19648	1.398	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	152943315	152943369	DEL	55	NA20502	1.03	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG00268	0.952	1.002	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG00419	0.751	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG00759	0.816	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG01595	1.036	1.091	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG02922	0.75	0.789	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG03052	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	HG03642	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA12878	0.81	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA18525	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA18939	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA19017	0.931	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA19238	0.868	0.914	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA19625	0.822	0.865	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA19648	0.777	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15347791	15347956	DEL	166	NA20502	0.772	0.813	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG00268	0.871	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG00419	0.772	0.887	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG00759	0.637	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG01595	0.732	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG02568	0.979	1.126	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG02922	0.9	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG03052	0.883	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	HG03642	0.742	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA12878	0.861	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA18525	0.964	1.108	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA18939	0.978	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA19017	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA19238	0.817	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA19625	0.77	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA19648	0.673	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153629278	153629591	DEL	314	NA20502	0.913	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG00268	0.575	0.66	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG00419	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG00759	0.856	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG01595	0.894	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG02568	1.097	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG02922	0.836	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG03052	0.625	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	HG03642	0.67	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA12878	0.861	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA18525	0.873	1.004	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA18939	0.719	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA19017	0.764	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA19238	0.622	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA19625	0.616	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA19648	0.595	0.684	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chrX	153630779	153630975	DEL	197	NA20502	0.772	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG00268	0.548	0.608	0.0	0.055	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG00419	0.71	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG00759	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG01595	0.508	0.564	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG02568	0.588	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG02922	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG03052	0.948	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	HG03642	0.91	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA12878	0.689	0.766	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA18525	0.928	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA18939	0.775	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA19017	0.727	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA19238	0.817	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA19625	0.436	0.485	0.0	0.034	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA19648	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733651	153733836	DEL	186	NA20502	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG00268	0.449	0.541	0.0	0.063	nan	nan	0	1
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG00419	0.71	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG00759	0.677	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG01595	0.447	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG02568	0.783	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG02922	0.664	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG03052	0.883	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	HG03642	0.982	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA12878	0.706	0.851	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA18525	1.019	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA18939	0.738	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA19017	0.671	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA19238	0.778	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA19625	0.436	0.526	0.0	0.057	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA19648	0.738	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733755	153733868	DEL	114	NA20502	0.726	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG00268	0.557	0.64	0.0	0.049	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG00419	0.71	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG00759	0.518	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG01595	0.569	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG02568	0.862	0.99	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG02922	0.579	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG03052	0.883	1.015	0.0	0.0	0.702	0.702	2	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	HG03642	0.934	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA12878	0.689	0.792	0.0	0.004	nan	nan	0	1
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA18525	0.855	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA18939	0.701	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA19017	0.727	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA19238	0.739	0.849	0.0	0.0	0.963	0.963	1	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA19625	0.642	0.738	0.0	0.076	0.375	0.375	1	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA19648	0.725	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733767	153734279	DEL	513	NA20502	0.843	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG00268	0.467	0.591	0.0	0.063	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG00419	0.71	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG00759	0.677	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG01595	0.447	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG02568	0.783	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG02922	0.654	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG03052	0.883	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	HG03642	0.97	1.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA12878	0.706	0.894	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA18525	1.037	1.313	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA18939	0.738	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA19017	0.633	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA19238	0.778	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA19625	0.359	0.455	0.0	0.037	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA19648	0.712	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	153733776	153733831	DEL	56	NA20502	0.749	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG00268	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG00419	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG00759	0.518	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG01595	0.671	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG02568	0.666	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG02922	0.493	0.519	0.0	0.075	nan	nan	0	1
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG03052	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	HG03642	0.659	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA12878	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA18525	0.71	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA19017	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA19238	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA19625	0.616	0.649	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA19648	0.802	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154008834	154009031	DEL	198	NA20502	0.655	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG00268	0.916	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG00419	0.793	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG00759	0.996	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG01595	0.955	1.098	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG02568	0.901	1.036	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG02922	0.857	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG03052	1.099	1.263	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	HG03642	1.078	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA12878	1.154	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA18525	0.764	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA18939	0.738	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA19017	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA19238	0.92	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA19625	0.796	0.915	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA19648	0.932	1.071	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	154014130	154014233	DEL	104	NA20502	0.936	1.076	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG00268	1.131	1.191	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG00419	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG00759	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG01595	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG02568	0.783	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG02922	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG03052	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	HG03642	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA12878	0.792	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA18525	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA18939	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA19017	0.969	1.02	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA19238	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA19625	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA19648	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154017323	154017395	DEL	73	NA20502	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG00268	0.952	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG00419	0.751	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG00759	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG01595	0.61	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG02568	1.018	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG02922	1.071	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG03052	0.862	0.958	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	HG03642	0.742	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA12878	0.586	0.651	0.0	0.072	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA18525	0.801	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA18939	0.738	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA19017	0.727	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA19238	0.752	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA19625	0.796	0.884	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA19648	0.621	0.69	0.0	0.044	nan	nan	0	2
chrX	154285159	154285433	DEL	275	NA20502	0.585	0.65	0.0	0.086	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG00268	0.835	0.928	0.0	0.0	0.962	0.997	1	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG00419	0.897	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG00759	0.677	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG01595	0.63	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG02568	1.058	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG02922	0.729	0.809	0.0	0.0	0.333	0.311	1	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG03052	0.819	0.91	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	HG03642	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA12878	0.362	0.402	0.005	0.08	nan	nan	0	1
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA18525	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA18939	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA19017	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA19238	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA19625	0.847	0.941	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA19648	0.88	0.978	0.0	0.032	0.762	0.762	1	2
chrX	154285270	154285819	DEL	550	NA20502	0.96	1.066	0.0	0.069	0.769	0.769	1	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG00268	0.969	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG00419	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG00759	0.617	0.686	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG01595	0.63	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG02568	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG02922	1.05	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG03052	0.905	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	HG03642	0.67	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA12878	0.362	0.402	0.0	0.096	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA18525	0.728	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA18939	0.738	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA19017	0.727	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA19238	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA19625	0.77	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA19648	0.466	0.518	0.0	0.045	nan	nan	0	2
chrX	154285287	154285339	DEL	53	NA20502	0.257	0.286	0.0	0.088	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG00268	1.023	1.233	0.0	0.0	0.962	0.997	1	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG00419	0.96	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG00759	0.637	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG01595	0.65	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG02568	0.94	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG02922	0.836	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG03052	1.013	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	HG03642	0.838	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA12878	0.758	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA18525	0.819	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA18939	0.664	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA19017	0.894	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA19238	0.557	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA19625	0.719	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA19648	0.777	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154285781	154285841	DEL	61	NA20502	0.936	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG00268	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG00419	1.127	1.127	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG00759	1.016	1.016	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG02568	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG02922	1.028	1.028	0.0	0.0	0.591	0.552	2	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG03052	1.142	1.142	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA12878	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA18525	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA18939	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA19017	0.987	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA19238	0.933	0.933	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA19625	1.13	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA19648	0.984	0.984	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	154313357	154314049	DEL	693	NA20502	1.053	1.053	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG00268	0.718	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG00419	0.605	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG00759	0.577	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG01595	0.63	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG02568	0.94	1.081	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG02922	0.6	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG03052	0.646	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	HG03642	0.91	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA12878	0.758	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA18525	0.673	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA18939	0.683	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA19017	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA19238	0.596	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA19625	0.513	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA19648	0.647	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154314369	154314535	DEL	167	NA20502	0.796	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG00268	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG00419	0.835	0.835	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG00759	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG01595	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG02568	0.47	0.47	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG02922	0.45	0.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG03052	0.646	0.646	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	HG03642	0.599	0.599	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA12878	0.965	0.965	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA18525	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA18939	0.793	0.793	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA19017	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA19238	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA19625	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA19648	1.113	1.113	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	154403901	154403987	DEL	87	NA20502	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG00268	0.862	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG00419	0.751	0.835	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG00759	0.856	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG01595	0.833	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG02568	0.509	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG02922	0.471	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG03052	0.69	0.766	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	HG03642	0.647	0.718	0.0	0.014	0.769	0.769	1	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA12878	1.016	1.129	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA18525	0.801	0.89	0.0	0.0	0.44	0.421	1	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA18939	0.719	0.799	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA19017	0.913	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA19238	0.998	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA19625	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA19648	1.01	1.122	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	154403956	154404042	DEL	87	NA20502	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG00268	0.952	0.952	0.013	0.0	0.947	0.908	1	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG00419	0.939	0.939	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG00759	0.916	0.916	0.0	0.0	0.693	0.693	2	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG01595	1.036	1.036	0.0	0.0	0.412	0.412	1	1
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG02568	1.058	1.058	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG02922	0.986	0.986	0.0	0.0	0.778	0.726	1	1
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG03052	1.401	1.401	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	HG03642	1.078	1.078	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA12878	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA18525	1.074	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA18939	0.849	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA19017	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA19238	0.972	0.972	0.0	0.0	0.879	0.879	1	1
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA19625	1.309	1.309	0.0	0.0	0.6	0.6	1	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA19648	1.139	1.139	0.0	0.0	0.682	0.682	2	2
chrX	154778177	154778659	DEL	483	NA20502	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG00268	0.0	0.0	0.01	0.193	nan	nan	0	0
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG00419	0.438	0.425	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG00759	0.299	0.29	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG02568	0.47	0.456	0.0	0.0	0.333	0.333	3	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG02922	0.729	0.707	0.0	0.043	0.175	0.164	2	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG03052	0.539	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	HG03642	0.67	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA19017	0.931	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA19238	0.778	0.755	0.0	0.0	0.981	0.981	2	2
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA19625	0.436	0.424	0.0	0.009	nan	nan	0	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA19648	0.492	0.478	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	154790161	154790501	DEL	341	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	0
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG00268	1.257	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG00419	1.649	1.512	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG00759	1.175	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG01595	1.199	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG02568	1.293	1.186	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG02922	1.189	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG03052	1.336	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	HG03642	1.257	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA12878	1.137	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA18525	1.201	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA18939	1.217	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA19017	1.537	1.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA19238	1.128	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA19625	1.438	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA19648	1.087	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	15839688	15839741	DEL	54	NA20502	1.135	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG00268	1.382	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG00419	0.918	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG00759	0.876	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG01595	0.853	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG02568	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG02922	1.05	0.981	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG03052	1.034	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	HG03642	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA12878	0.999	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA18525	1.474	1.377	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA18939	1.015	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA19017	1.211	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA19238	1.154	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA19625	0.899	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA19648	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16312483	16312707	DEL	225	NA20502	0.866	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG00268	0.718	0.718	0.0	0.004	0.8	0.835	1	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG00419	0.543	0.543	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG00759	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG01595	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG02568	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG02922	0.75	0.75	0.0	0.0	0.7	0.75	1	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG03052	0.797	0.797	0.0	0.0	0.308	0.308	2	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	HG03642	0.862	0.862	0.0	0.0	0.294	0.294	1	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA18525	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA18939	0.793	0.793	0.0	0.0	0.643	0.672	1	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA19017	0.689	0.689	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA19238	1.05	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA19625	1.207	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA19648	0.88	0.88	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chrX	16364231	16364349	DEL	119	NA20502	1.053	1.053	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG00268	0.969	0.969	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG00419	0.939	0.939	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG00759	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG01595	0.528	0.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG02922	0.836	0.836	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG03052	0.905	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	HG03642	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA12878	1.068	1.068	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA18525	0.637	0.637	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA18939	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA19017	0.484	0.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA19238	1.102	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA19625	0.899	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA19648	0.984	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16556845	16556949	DEL	105	NA20502	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG00268	0.969	0.969	0.0	0.0	0.539	0.536	2	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG00419	0.73	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG00759	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG01595	0.752	0.752	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG02922	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG03052	0.69	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	HG03642	0.766	0.766	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA12878	1.034	1.034	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA18525	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA18939	0.646	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA19017	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA19238	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA19625	0.693	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA19648	0.828	0.828	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chrX	16694683	16695230	DEL	548	NA20502	1.194	1.194	0.0	0.0	0.852	0.852	1	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG00268	0.987	0.987	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG00419	1.023	1.023	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG00759	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG01595	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG02568	0.979	0.979	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG02922	0.75	0.75	0.0	0.003	0.906	0.909	2	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG03052	0.84	0.84	0.0	0.0	0.933	0.933	1	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA18525	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA19017	0.82	0.82	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA19238	0.83	0.83	0.0	0.0	0.736	0.736	2	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA19625	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA19648	1.035	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	16955572	16956564	DEL	993	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG00268	0.862	0.958	0.0	0.003	nan	nan	0	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG00419	0.271	0.301	0.0	0.031	1.0	1.0	1	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG00759	0.339	0.376	0.0	0.056	0.818	0.818	1	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG01595	0.406	0.452	0.0	0.031	0.286	0.286	1	2
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG02568	0.0	0.0	0.0	0.057	nan	nan	0	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG02922	0.279	0.31	0.0	0.064	0.8	0.857	1	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	0
chrX	17502753	17502822	DEL	70	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.096	nan	nan	0	0
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.062	nan	nan	0	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA18525	0.346	0.384	0.0	0.047	0.846	0.809	1	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA18939	0.517	0.574	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA19017	0.466	0.517	0.0	0.039	0.76	0.76	1	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA19625	0.282	0.314	0.0	0.037	1.0	1.0	1	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chrX	17502753	17502822	DEL	70	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.066	nan	nan	0	1
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG00268	0.862	1.038	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG00419	0.835	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG00759	0.757	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG01595	1.097	1.322	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG02568	0.823	0.991	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG02922	1.264	1.523	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG03052	0.905	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	HG03642	1.149	1.385	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA12878	1.206	1.453	0.0	0.0	0.839	0.879	1	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA18525	0.737	0.888	0.0	0.0	0.682	0.652	1	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA18939	0.904	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA19017	0.838	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA19238	0.979	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA19625	0.822	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA19648	0.932	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17544375	17544444	DEL	70	NA20502	1.053	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG00268	0.485	0.584	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG00419	0.626	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG00759	0.737	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG01595	0.691	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG02568	1.058	1.274	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG02922	0.664	0.8	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG03052	0.927	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	HG03642	0.599	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA12878	1.016	1.225	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA18525	0.801	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA18939	0.646	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA19017	0.894	1.077	0.0	0.0	0.407	0.407	1	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA19238	0.713	0.859	0.0	0.0	0.677	0.677	1	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA19625	0.719	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA19648	0.88	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17556037	17556180	DEL	144	NA20502	0.772	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG00268	0.952	1.002	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG00419	0.897	0.945	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG00759	0.896	0.943	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG01595	0.61	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG02568	1.018	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG02922	0.921	0.97	0.007	0.0	0.841	0.846	2	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG03052	0.905	0.953	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	HG03642	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA12878	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA18525	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA19017	0.428	0.451	0.063	0.045	nan	nan	0	1
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA19238	0.881	0.928	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA19625	1.053	1.108	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA19648	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	17637426	17638164	DEL	739	NA20502	1.17	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG00268	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG00419	0.793	0.835	0.0	0.0	0.824	0.824	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG00759	0.697	0.734	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG01595	0.874	0.92	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG02568	0.862	0.907	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG02922	0.75	0.789	0.0	0.004	1.0	0.933	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG03052	0.797	0.839	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	HG03642	0.623	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA12878	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA18525	1.019	1.073	0.0	0.0	0.4	0.383	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA18939	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA19017	0.801	0.843	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA19238	0.804	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA19625	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA19648	1.061	1.117	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chrX	18353048	18353340	DEL	293	NA20502	1.03	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG00268	0.916	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG00419	0.939	1.043	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG00759	0.717	0.796	0.0	0.0	0.757	0.757	2	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG01595	0.813	0.903	0.0	0.0	0.882	0.882	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG02568	0.744	0.827	0.0	0.0	0.598	0.598	2	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG02922	0.771	0.857	0.0	0.0	0.867	0.809	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG03052	0.69	0.766	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	HG03642	0.814	0.905	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA12878	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA18525	0.801	0.89	0.0	0.0	0.739	0.707	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA18939	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA19017	0.652	0.724	0.0	0.0	0.632	0.632	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA19238	0.83	0.922	0.0	0.0	0.871	0.871	1	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA19625	0.693	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA19648	0.854	0.949	0.0	0.0	0.808	0.808	2	2
chrX	18397745	18397880	DEL	136	NA20502	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG00268	0.754	0.794	0.0	0.0	0.742	0.774	2	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG00419	0.876	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG00759	0.916	0.964	0.0	0.0	0.851	0.851	2	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG01595	0.732	0.77	0.0	0.0	0.679	0.679	2	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG02568	0.744	0.783	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG02922	0.814	0.857	0.0	0.006	0.6	0.643	3	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG03052	0.711	0.748	0.0	0.0	0.718	0.718	2	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	HG03642	0.814	0.857	0.008	0.0	0.857	0.857	1	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA12878	0.724	0.762	0.0	0.0	0.88	0.84	2	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA18525	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA18939	0.683	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA19017	0.764	0.804	0.0	0.0	0.55	0.55	1	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA19238	0.765	0.805	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA19625	0.822	0.865	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA19648	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19073290	19073980	DEL	691	NA20502	0.96	1.01	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG00268	0.521	0.521	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG00419	0.647	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG00759	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG01595	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG02568	0.509	0.509	0.0	0.039	nan	nan	0	1
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.129	nan	nan	0	0
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chrX	19374800	19374936	DEL	137	HG03642	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA18525	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA18939	0.572	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.185	nan	nan	0	0
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA19238	0.0	0.0	0.0	0.181	nan	nan	0	1
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA19625	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19374800	19374936	DEL	137	NA20502	0.702	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG00268	0.467	0.453	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG00419	0.209	0.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG00759	0.199	0.193	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG01595	0.386	0.375	0.0	0.0	0.4	0.4	1	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG02568	0.235	0.228	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG02922	0.364	0.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG03052	0.215	0.209	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	HG03642	0.263	0.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA12878	0.517	0.502	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA18525	0.382	0.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA18939	0.166	0.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA19017	0.168	0.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA19238	0.324	0.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA19625	0.231	0.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA19648	0.207	0.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19411868	19411952	DEL	85	NA20502	0.304	0.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG00268	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG00419	1.294	1.256	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG00759	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG01595	1.158	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG02922	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG03052	1.228	1.192	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	HG03642	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA12878	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA18525	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA19017	1.192	1.158	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA19238	0.933	0.906	0.0	0.0	0.683	0.683	1	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA19625	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA19648	0.88	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	19635311	19635621	DEL	311	NA20502	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG00268	1.113	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG00419	1.231	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG00759	1.055	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG01595	1.097	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG02568	1.058	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG02922	0.343	0.361	0.0	0.037	0.526	0.491	1	1
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG03052	0.991	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	HG03642	1.054	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA12878	1.016	1.07	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA18525	1.11	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA18939	0.996	1.049	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA19017	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA19238	0.415	0.437	0.0	0.054	0.833	0.833	1	1
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA19625	1.13	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA19648	1.243	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20238579	20238666	DEL	88	NA20502	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG00268	0.952	0.952	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG00419	1.127	1.127	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG00759	0.816	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG01595	0.894	0.894	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG02568	0.627	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG02922	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG03052	1.164	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	HG03642	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA12878	1.016	1.016	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA18525	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA18939	1.051	1.051	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA19017	0.95	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA19238	1.024	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA19625	1.284	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA19648	0.854	0.854	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	20815391	20815496	DEL	106	NA20502	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG00268	1.095	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG00419	0.939	0.878	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG00759	1.195	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG01595	1.26	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG02568	1.449	1.354	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG02922	1.136	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG03052	1.164	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	HG03642	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA12878	0.947	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA18525	1.201	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA18939	1.144	1.069	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA19017	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA19238	1.076	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA19625	1.155	1.08	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA19648	1.191	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20860022	20860146	DEL	125	NA20502	1.17	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG00268	0.754	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG00419	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG00759	1.115	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG01595	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG02568	0.744	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG02922	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG03052	1.013	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	20886928	20887286	DEL	359	HG03642	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA12878	0.758	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA18525	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA18939	1.088	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA19017	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA19238	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA19625	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA19648	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	20886928	20887286	DEL	359	NA20502	0.89	0.89	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG00268	0.88	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG00419	0.939	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG00759	1.215	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG01595	0.732	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG02568	0.862	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG02922	0.954	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG03052	1.013	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	HG03642	1.042	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA12878	0.947	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA18525	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA18939	1.153	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA19017	1.015	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA19238	0.894	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA19625	0.783	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA19648	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21016021	21016078	DEL	58	NA20502	0.96	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG00268	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG00419	0.751	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG00759	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG01595	0.732	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG02568	1.058	1.113	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG02922	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG03052	0.97	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	HG03642	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA12878	1.034	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA18525	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA18939	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA19017	1.043	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA19238	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA19625	0.899	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA19648	0.802	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	21800758	21800920	DEL	163	NA20502	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG00268	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG00419	1.106	1.164	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG00759	0.657	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG01595	0.569	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG02568	1.175	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG02922	0.729	0.767	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG03052	0.743	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	HG03642	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA12878	0.861	0.907	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA18525	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA19017	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA19238	1.005	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA19625	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA19648	1.035	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22037606	22037703	DEL	98	NA20502	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG00268	1.032	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG00419	0.835	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG00759	0.737	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG01595	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG02568	0.901	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG02922	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG03052	1.013	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	HG03642	0.862	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA12878	0.999	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA18525	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA18939	0.959	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA19017	0.81	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA19238	0.778	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA19625	0.847	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA19648	0.958	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22339982	22340043	DEL	62	NA20502	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG00268	0.844	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG00759	1.065	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG01595	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG02922	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG03052	0.905	0.879	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	HG03642	1.269	1.232	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA12878	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA18939	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA19017	0.95	0.922	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA19238	1.154	1.12	0.0	0.0	0.739	0.739	1	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA19625	1.13	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA19648	0.828	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	22377636	22378087	DEL	452	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG00268	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG00419	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG00759	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG02568	0.744	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG02922	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG03052	0.733	0.771	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	HG03642	0.838	0.882	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA12878	0.861	0.907	0.0	0.0	0.444	0.424	1	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA18525	0.892	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA18939	0.849	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA19017	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA19238	0.933	0.982	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA19625	0.719	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA19648	0.906	0.954	0.014	0.0	nan	nan	0	2
chrX	23812115	23813045	DEL	931	NA20502	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG00268	0.772	0.887	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG00419	0.543	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG00759	0.856	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG01595	0.549	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG02568	0.666	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG02922	0.879	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG03052	0.528	0.607	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	HG03642	0.575	0.661	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA12878	0.715	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA18525	0.801	0.92	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA18939	0.959	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA19017	0.838	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA19238	0.894	1.028	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA19625	0.796	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA19648	0.802	0.922	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	24087236	24087303	DEL	68	NA20502	0.772	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG00268	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG00419	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG00759	0.956	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG01595	1.168	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG02568	1.371	1.281	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG02922	1.071	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG03052	1.056	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	HG03642	1.03	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA12878	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA18525	1.183	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA18939	1.236	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA19017	0.969	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA19238	1.076	1.005	0.0	0.0	0.86	0.86	1	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA19625	0.976	0.912	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA19648	1.294	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	24184274	24185041	DEL	768	NA20502	1.334	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG00268	1.257	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG00759	0.896	0.87	0.0	0.0	0.741	0.741	1	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG01595	1.362	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG02568	0.783	0.761	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG02922	1.093	1.061	0.0	0.0	0.77	0.795	4	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG03052	1.185	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	HG03642	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA12878	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA18525	1.055	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA18939	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA19017	1.304	1.266	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA19238	1.192	1.158	0.0	0.0	0.886	0.886	1	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA19625	1.078	1.047	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA19648	0.854	0.829	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	25317339	25318221	DEL	883	NA20502	1.03	1.0	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG00268	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG00419	0.918	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG00759	1.135	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG01595	1.24	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG02922	1.264	1.227	0.0	0.003	0.724	0.676	1	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG03052	0.948	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	HG03642	0.694	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA12878	1.171	1.137	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA18525	1.128	1.095	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA18939	0.996	0.967	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA19017	1.006	0.977	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA19238	1.192	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA19625	0.77	0.748	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA19648	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25658706	25658969	DEL	264	NA20502	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG00268	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG00759	0.677	0.677	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG01595	0.488	0.488	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG02568	0.548	0.548	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG02922	0.9	0.9	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG03052	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	HG03642	0.599	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA18525	0.746	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA18939	0.922	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA19017	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA19238	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA19625	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA19648	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25743848	25743910	DEL	63	NA20502	0.585	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG00268	0.898	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG00419	1.127	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG00759	1.215	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG01595	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG02568	1.606	1.501	0.0	0.0	0.684	0.684	1	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG02922	1.028	0.961	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG03052	0.991	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	HG03642	1.221	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA12878	0.775	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA18525	1.164	1.088	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA18939	1.051	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA19017	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA19238	1.115	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA19625	0.77	0.72	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA19648	1.294	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	25845880	25845966	DEL	87	NA20502	1.124	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG00268	0.916	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG00419	0.939	0.912	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG00759	0.896	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG01595	1.057	1.026	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG02568	1.253	1.217	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG02922	0.793	0.77	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG03052	0.883	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	HG03642	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA12878	0.672	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA18525	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA18939	0.719	0.698	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA19017	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA19238	0.855	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA19625	0.642	0.623	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA19648	0.777	0.754	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chrX	26662515	26662751	DEL	237	NA20502	0.796	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG00268	1.167	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG00419	0.626	0.608	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG00759	1.035	1.005	0.0	0.0	0.783	0.783	1	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG01595	0.813	0.789	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG02922	1.05	1.019	0.0	0.0	0.857	0.8	1	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG03052	1.271	1.234	0.0	0.0	0.647	0.647	1	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA12878	0.861	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA18525	0.983	0.954	0.0	0.0	0.966	0.991	1	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA18939	1.217	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA19017	1.323	1.284	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA19238	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA19625	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA19648	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27031915	27032235	DEL	321	NA20502	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG00268	1.131	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG00419	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG00759	0.996	0.967	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG01595	1.036	1.006	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG02568	0.94	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG02922	1.114	1.082	0.0	0.0	0.727	0.779	3	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG03052	0.84	0.816	0.0	0.0	0.908	0.908	2	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA18525	0.964	0.936	0.003	0.0	0.5	0.478	1	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA18939	0.941	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA19017	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA19625	0.847	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA19648	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	27037894	27038845	DEL	952	NA20502	0.866	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG00268	0.628	0.661	0.0	0.0	0.725	0.757	2	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG00419	0.438	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG00759	0.438	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG01595	0.325	0.342	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG02568	0.548	0.577	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG02922	0.643	0.677	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG03052	0.345	0.363	0.0	0.014	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	HG03642	0.335	0.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA12878	0.525	0.553	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA18525	0.691	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA18939	0.369	0.388	0.0	0.0	0.571	0.597	1	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA19017	0.699	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA19238	0.57	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA19625	0.308	0.324	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA19648	0.686	0.722	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chrX	2813405	2813728	DEL	324	NA20502	0.351	0.37	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG00268	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG00419	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG00759	1.215	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG01595	1.341	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG02568	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG02922	1.371	1.282	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG03052	1.401	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	HG03642	1.461	1.365	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA12878	1.034	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA18525	1.201	1.122	0.0	0.0	0.789	0.755	1	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA18939	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA19017	1.248	1.166	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA19238	1.257	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA19625	1.258	1.176	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA19648	1.268	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28697847	28698607	DEL	761	NA20502	1.17	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG00268	0.628	0.827	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG00419	0.25	0.329	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG00759	0.498	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG01595	0.244	0.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG02568	0.313	0.412	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG02922	0.579	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG03052	0.366	0.482	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	HG03642	0.479	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA12878	0.448	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA18525	0.782	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA18939	0.48	0.631	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA19017	0.466	0.613	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA19238	0.596	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA19625	0.282	0.372	0.0	0.004	nan	nan	0	1
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA19648	0.388	0.511	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	28978946	28979002	DEL	57	NA20502	0.375	0.493	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG00268	0.646	0.593	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG00419	1.21	1.11	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG00759	1.334	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG01595	1.138	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG02568	1.097	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG02922	1.178	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG03052	1.465	1.344	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	HG03642	1.509	1.384	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA12878	0.792	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA18525	1.074	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA18939	0.996	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA19017	1.211	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA19238	1.063	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA19625	1.463	1.343	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA19648	1.476	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29033920	29034025	DEL	106	NA20502	1.358	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG00268	1.023	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG00419	1.064	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG00759	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG01595	1.199	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG02568	1.449	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG02922	1.564	1.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG03052	1.185	1.108	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	HG03642	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA12878	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA18525	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA18939	1.217	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA19017	1.453	1.358	0.0	0.0	0.732	0.732	1	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA19238	1.076	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA19625	1.309	1.224	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA19648	0.984	0.919	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29073909	29074235	DEL	327	NA20502	1.287	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG00268	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG00419	1.252	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG00759	1.294	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG01595	1.057	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG02568	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG02922	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	HG03642	0.886	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA18525	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA18939	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA19017	0.764	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA19238	1.141	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA19625	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA19648	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29087035	29087280	DEL	246	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG00268	0.745	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG00419	0.584	0.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG00759	0.657	0.638	0.0	0.0	0.467	0.467	1	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG01595	0.711	0.691	0.0	0.0	0.533	0.533	1	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG02568	0.548	0.532	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG02922	0.621	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG03052	0.603	0.586	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	HG03642	0.575	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA12878	0.792	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA18525	0.892	0.866	0.0	0.0	0.652	0.624	1	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA18939	0.646	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA19017	0.633	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA19238	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA19625	0.603	0.586	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA19648	0.647	0.628	0.0	0.0	0.625	0.625	1	2
chrX	29556712	29556783	DEL	72	NA20502	0.691	0.67	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG00268	0.916	1.017	0.0	0.0	0.957	0.998	1	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG00419	1.085	1.206	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG00759	0.836	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG01595	0.914	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG02568	1.293	1.436	0.0	0.009	0.824	0.824	1	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG02922	1.178	1.309	0.0	0.0	0.727	0.779	1	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG03052	0.539	0.599	0.009	0.06	nan	nan	0	1
chrX	30242851	30243073	DEL	223	HG03642	0.886	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA12878	0.844	0.938	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA18525	1.183	1.314	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA18939	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA19017	1.267	1.408	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA19238	0.92	1.023	0.0	0.0	0.806	0.806	1	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA19625	0.95	1.055	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA19648	1.035	1.151	0.0	0.0	0.49	0.49	2	2
chrX	30242851	30243073	DEL	223	NA20502	0.983	1.092	0.0	0.0	0.8	0.8	2	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG00268	1.221	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG00419	0.459	0.459	0.098	0.069	0.455	0.455	13	1
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG00759	0.418	0.418	0.101	0.05	0.158	0.158	2	1
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG01595	0.935	0.935	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG02568	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG02922	1.071	1.071	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG03052	0.97	0.97	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	HG03642	0.862	0.862	0.005	0.0	0.857	0.857	1	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA12878	1.085	1.085	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA18525	0.491	0.491	0.069	0.045	0.149	0.156	4	1
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA19017	1.062	1.062	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA19238	1.27	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA19625	0.924	0.924	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.0	0.765	0.765	1	2
chrX	30347766	30348599	DEL	834	NA20502	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG00268	0.898	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG00759	0.757	0.735	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG01595	0.874	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG02568	0.744	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG02922	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG03052	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA12878	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA18939	0.885	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA19017	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA19238	0.648	0.629	0.0	0.078	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA19625	1.078	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA19648	0.492	0.478	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	30559712	30560013	DEL	302	NA20502	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG00268	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG00419	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG00759	1.274	1.237	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG01595	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG02568	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG02922	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG03052	0.927	0.9	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	HG03642	0.742	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA12878	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA18525	0.764	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA19017	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA19238	1.141	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA19625	1.053	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA19648	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31185139	31185973	DEL	835	NA20502	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG00268	1.257	1.22	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG00419	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG00759	1.025	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG01595	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG02568	0.744	0.723	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG02922	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG03052	0.883	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	HG03642	1.078	1.046	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA12878	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA18525	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA18939	1.181	1.146	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA19017	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA19238	1.205	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA19625	1.232	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA19648	1.191	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31346366	31346887	DEL	522	NA20502	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG00268	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG00419	0.897	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG00759	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG01595	1.138	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG02568	1.41	1.484	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG02922	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG03052	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	HG03642	1.125	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA12878	0.999	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA18525	1.128	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA18939	0.572	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA19017	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA19238	1.128	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA19625	1.155	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA19648	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31418407	31418507	DEL	101	NA20502	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG00268	1.095	1.063	0.0	0.0	0.788	0.822	1	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG00419	1.002	0.972	0.0	0.0	0.5	0.5	3	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG00759	0.996	0.967	0.0	0.0	0.607	0.607	3	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG01595	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG02568	1.175	1.141	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG02922	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG03052	0.948	0.92	0.0	0.0	0.81	0.81	1	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	HG03642	1.125	1.093	0.0	0.0	0.708	0.708	1	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA12878	0.844	0.82	0.0	0.0	0.625	0.655	3	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA18525	1.183	1.148	0.0	0.0	0.684	0.697	3	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA18939	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA19017	1.136	1.103	0.0	0.0	0.919	0.919	2	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA19238	1.076	1.044	0.0	0.0	0.921	0.921	1	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA19625	1.232	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA19648	0.906	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31505930	31506850	DEL	921	NA20502	1.053	1.023	0.007	0.0	0.906	0.906	2	1
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG00268	1.095	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG00419	1.294	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG00759	1.175	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG01595	1.097	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG02568	1.312	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG02922	1.093	1.021	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG03052	1.293	1.208	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	HG03642	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA12878	0.861	0.805	0.004	0.0	0.667	0.698	1	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA18525	1.201	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA18939	1.125	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA19017	1.025	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA19238	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA19625	1.361	1.272	0.015	0.0	nan	nan	0	2
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA19648	1.165	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	31811560	31812145	DEL	586	NA20502	1.1	1.028	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG00268	0.969	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG00419	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG00759	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG01595	1.524	1.424	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG02568	1.097	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG02922	1.028	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG03052	1.056	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	HG03642	1.533	1.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA12878	0.827	0.773	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA18525	1.356	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA18939	1.42	1.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA19017	1.23	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA19238	1.251	1.169	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA19625	1.053	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA19648	1.294	1.21	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	32235660	32235835	DEL	176	NA20502	1.311	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG00268	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG00419	1.064	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG00759	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG01595	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG02568	1.058	1.058	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG02922	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG03052	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	HG03642	1.173	1.173	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA18525	0.873	0.873	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA18939	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA19017	1.155	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA19238	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA19625	0.976	0.976	0.0	0.0	0.706	0.706	1	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA19648	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32332915	32333290	DEL	376	NA20502	1.229	1.229	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG00268	0.79	0.79	0.0	0.0	0.682	0.711	1	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG00419	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG00759	1.115	1.115	0.0	0.0	0.96	0.96	1	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG01595	0.752	0.752	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG02568	0.744	0.744	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG02922	0.964	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG03052	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	32391263	32391578	DEL	316	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA12878	0.844	0.844	0.0	0.0	0.955	0.911	1	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA18525	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA18939	1.144	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA19017	1.043	1.043	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA19238	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA19625	0.899	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA19648	0.828	0.828	0.0	0.0	0.722	0.722	1	2
chrX	32391263	32391578	DEL	316	NA20502	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG00268	1.05	0.982	0.0	0.0	0.931	0.972	1	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG00419	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG00759	1.493	1.396	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG01595	1.138	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG02568	1.214	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG02922	0.986	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG03052	1.314	1.228	0.0	0.0	0.779	0.779	2	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	HG03642	1.102	1.029	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA12878	1.016	0.95	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA18525	0.964	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA18939	1.125	1.052	0.0	0.003	0.674	0.645	2	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA19017	1.285	1.201	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA19238	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA19625	1.207	1.128	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA19648	1.165	1.089	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32468501	32468932	DEL	432	NA20502	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG00268	0.682	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG00419	0.605	0.729	0.0	0.0	0.692	0.692	1	1
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG00759	0.498	0.6	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG01595	0.65	0.783	0.0	0.006	0.8	0.8	1	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG02568	0.666	0.802	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG02922	0.364	0.439	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG03052	0.625	0.753	0.0	0.0	0.625	0.625	2	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	HG03642	0.718	0.866	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA12878	0.689	0.83	0.0	0.0	0.684	0.717	1	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA18525	0.819	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA18939	0.553	0.667	0.0	0.0	0.764	0.771	2	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA19017	0.54	0.651	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA19238	0.778	0.937	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA19625	0.693	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA19648	0.699	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	32886350	32886923	DEL	574	NA20502	0.796	0.959	0.0	0.0	0.611	0.611	1	1
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG00268	1.167	1.091	0.0	0.0	1.0	0.958	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG00419	1.21	1.131	0.005	0.0	0.586	0.586	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG00759	1.215	1.135	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG01595	1.199	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG02568	0.823	0.769	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG02922	1.264	1.181	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG03052	1.25	1.168	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	HG03642	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA12878	0.982	0.918	0.0	0.0	0.748	0.747	2	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA18525	1.037	0.969	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA18939	1.236	1.155	0.0	0.0	0.912	0.953	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA19017	1.248	1.166	0.0	0.0	0.697	0.697	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA19238	1.115	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA19625	1.181	1.104	0.0	0.0	0.846	0.846	1	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA19648	1.191	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33008942	33009462	DEL	521	NA20502	1.077	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG00268	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG00419	0.96	0.932	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG00759	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG01595	1.28	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG02568	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG02922	0.964	0.936	0.006	0.0	nan	nan	0	1
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG03052	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	HG03642	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA12878	1.034	1.003	0.0	0.0	0.739	0.774	1	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA18525	1.074	1.042	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA18939	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA19017	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA19238	1.167	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA19625	1.001	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA19648	0.958	0.93	0.0	0.0	0.738	0.738	2	2
chrX	33712810	33713294	DEL	485	NA20502	1.053	1.023	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG00268	1.059	1.028	0.003	0.0	0.647	0.62	1	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG00419	1.21	1.175	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG00759	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG01595	1.26	1.223	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG02568	0.666	0.646	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG02922	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG03052	1.185	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	HG03642	1.125	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA12878	0.965	0.937	0.003	0.0	0.88	0.922	1	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA18525	1.055	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA18939	1.31	1.272	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA19017	1.192	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA19238	1.05	1.019	0.0	0.0	0.842	0.842	1	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA19625	1.207	1.172	0.0	0.0	0.571	0.571	1	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA19648	1.061	1.03	0.005	0.0	0.882	0.882	1	2
chrX	34014937	34015879	DEL	943	NA20502	1.147	1.114	0.0	0.0	0.87	0.87	1	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG00268	0.503	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG00419	0.981	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG00759	0.956	0.956	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG01595	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG02568	0.705	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG02922	0.964	0.964	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG03052	0.927	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	HG03642	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA12878	0.827	0.827	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA18525	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA18939	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA19017	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA19238	0.92	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA19625	0.591	0.591	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA19648	1.23	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	34059695	34059766	DEL	72	NA20502	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG00268	0.88	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG00419	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG00759	1.294	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG01595	1.382	1.342	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG02568	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG03052	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	HG03642	0.982	0.953	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA12878	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA18939	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA19017	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA19238	1.037	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA19625	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA19648	0.673	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35027353	35027404	DEL	52	NA20502	1.311	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG00268	0.862	0.907	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG00419	0.835	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG00759	0.777	0.817	0.007	0.0	nan	nan	0	1
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG01595	0.61	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG02568	1.136	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG02922	0.943	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG03052	1.013	1.066	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	HG03642	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA12878	0.792	0.834	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA18525	0.855	0.9	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA18939	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA19017	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA19238	0.985	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA19625	0.539	0.568	0.049	0.045	nan	nan	0	1
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA19648	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	35323501	35324110	DEL	610	NA20502	0.726	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG00268	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG00419	1.064	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG00759	1.195	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG01595	1.036	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG02568	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG02922	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG03052	0.905	0.879	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	HG03642	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA12878	1.051	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA18525	0.983	0.954	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA18939	1.125	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA19017	0.987	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA19238	1.257	1.221	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA19625	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA19648	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36036371	36037056	DEL	686	NA20502	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG00268	0.287	0.287	0.0	0.034	0.895	0.857	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG00419	0.396	0.396	0.0	0.02	1.0	1.0	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG00759	0.518	0.518	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG01595	0.833	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG02568	0.627	0.627	0.0	0.015	0.75	0.75	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG02922	0.493	0.493	0.0	0.03	0.333	0.357	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG03052	0.409	0.409	0.0	0.017	0.611	0.611	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	HG03642	0.79	0.79	0.0	0.016	0.304	0.304	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA12878	0.276	0.276	0.0	0.023	0.875	0.917	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA18525	0.509	0.509	0.0	0.026	0.733	0.767	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA18939	0.258	0.258	0.0	0.054	0.824	0.788	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA19017	0.447	0.447	0.0	0.016	0.567	0.567	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA19238	0.35	0.35	0.0	0.015	0.645	0.645	1	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA19625	0.359	0.359	0.0	0.008	nan	nan	0	1
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.059	nan	nan	0	0
chrX	3609471	3609526	DEL	56	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.024	nan	nan	0	0
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG00268	1.077	1.046	0.0	0.0	0.862	0.826	1	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG00419	1.085	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG00759	1.314	1.276	0.0	0.0	0.794	0.794	1	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG01595	0.996	0.967	0.0	0.0	0.957	0.957	1	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG02568	1.253	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG02922	0.45	0.437	0.078	0.05	nan	nan	0	1
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG03052	0.862	0.837	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	HG03642	1.03	1.0	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA12878	1.051	1.02	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA18525	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	0.893	0.933	1	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA19017	1.285	1.248	0.0	0.0	0.97	0.97	1	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA19238	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA19625	1.027	0.997	0.007	0.0	0.895	0.895	1	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA19648	0.984	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36475654	36476549	DEL	896	NA20502	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG00268	1.185	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG00419	0.835	0.78	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG00759	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG01595	1.301	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG02568	0.548	0.512	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG02922	0.986	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG03052	1.293	1.208	0.0	0.0	0.905	0.905	1	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	HG03642	0.838	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA12878	1.12	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA18525	1.074	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA18939	1.199	1.121	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA19017	0.913	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA19238	0.933	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA19625	0.745	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA19648	1.087	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36512038	36512109	DEL	72	NA20502	1.124	1.05	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG00268	0.449	0.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG00419	0.438	0.461	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG00759	0.398	0.419	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG02568	0.588	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG02922	0.707	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG03052	0.539	0.567	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	HG03642	0.287	0.302	0.008	0.106	nan	nan	0	1
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA12878	0.517	0.544	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA18525	0.6	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA18939	0.48	0.505	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA19017	0.54	0.569	0.0	0.006	0.8	0.8	1	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA19238	0.57	0.6	0.0	0.008	0.759	0.759	1	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA19625	0.77	0.811	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA19648	0.466	0.49	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743043	36743359	DEL	317	NA20502	0.632	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG00268	0.521	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG00419	0.563	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG00759	0.538	0.597	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG01595	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG02568	0.588	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG02922	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG03052	0.388	0.431	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	HG03642	0.192	0.213	0.0	0.114	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA12878	0.706	0.785	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA18525	0.437	0.485	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA18939	0.609	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA19017	0.279	0.31	0.0	0.006	0.8	0.8	1	1
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA19238	0.311	0.346	0.0	0.008	0.759	0.759	1	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA19625	0.719	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA19648	0.492	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	36743057	36743108	DEL	52	NA20502	0.609	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG00268	0.808	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG00419	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG00759	1.075	1.044	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG01595	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG02568	1.253	1.217	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG02922	1.114	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG03052	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA12878	1.12	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA18525	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA18939	0.922	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA19017	0.876	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA19238	1.361	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA19625	1.155	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA19648	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37037673	37037735	DEL	63	NA20502	1.545	1.5	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG00268	0.844	0.774	0.007	0.0	0.833	0.799	1	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG00419	1.075	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG00759	1.095	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG01595	1.179	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG02568	1.332	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG02922	0.964	0.885	0.0	0.0	0.895	0.835	1	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG03052	1.12	1.028	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	HG03642	1.102	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA12878	0.904	0.83	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA18525	1.183	1.085	0.0	0.0	0.857	0.896	1	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA18939	0.904	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA19017	1.248	1.145	0.0	0.0	0.694	0.694	1	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA19238	0.933	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA19625	0.976	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA19648	1.346	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	37986665	37986738	DEL	74	NA20502	1.264	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG00268	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG00419	0.856	0.856	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG00759	0.478	0.478	0.067	0.035	nan	nan	0	1
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG01595	0.549	0.549	0.069	0.055	nan	nan	0	1
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG02568	0.509	0.509	0.069	0.031	nan	nan	0	1
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG02922	0.0	0.0	0.145	0.081	nan	nan	0	0
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG03052	0.0	0.0	0.159	0.076	nan	nan	0	0
chrX	38386513	38387335	DEL	823	HG03642	0.527	0.527	0.052	0.031	nan	nan	0	1
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA12878	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA18525	0.673	0.673	0.077	0.036	nan	nan	0	1
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA18939	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA19017	0.0	0.0	0.193	0.08	nan	nan	0	0
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA19238	0.0	0.0	0.309	0.128	nan	nan	0	0
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA19625	0.0	0.0	0.23	0.135	nan	nan	0	0
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA19648	0.984	0.984	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	38386513	38387335	DEL	823	NA20502	1.241	1.241	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG00268	1.041	1.041	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG00419	0.751	0.751	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG01595	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG02922	0.814	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG03052	0.797	0.797	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	HG03642	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA12878	0.724	0.724	0.0	0.0	0.957	0.913	1	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA18939	0.867	0.867	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA19017	0.931	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA19238	0.894	0.894	0.0	0.0	0.543	0.543	1	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA19625	1.104	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA19648	1.061	1.061	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	38903559	38904326	DEL	768	NA20502	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG00268	0.575	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG00419	0.897	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG00759	0.717	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG01595	0.691	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG02568	0.313	0.304	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG02922	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG03052	0.754	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	HG03642	0.599	0.581	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA12878	0.62	0.602	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA18525	0.764	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA18939	0.627	0.609	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA19017	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA19238	0.765	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA19625	0.77	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA19648	0.544	0.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	3973863	3973917	DEL	55	NA20502	0.89	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG00268	1.364	1.364	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG00419	1.294	1.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG00759	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG01595	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG02568	0.979	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG02922	1.286	1.286	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG03052	1.336	1.336	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA18525	1.437	1.437	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA18939	0.978	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA19017	1.285	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA19238	1.089	1.089	0.0	0.0	0.826	0.826	1	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA19625	0.796	0.796	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA19648	1.113	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40459354	40459424	DEL	71	NA20502	1.311	1.311	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG00268	0.808	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG00419	0.689	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG00759	0.358	0.398	0.004	0.029	nan	nan	0	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG01595	0.732	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG02568	0.274	0.305	0.009	0.028	nan	nan	0	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG02922	0.364	0.405	0.013	0.013	nan	nan	0	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG03052	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40461270	40461776	DEL	507	HG03642	0.67	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA12878	0.792	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA18525	0.473	0.526	0.009	0.041	nan	nan	0	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA18939	0.996	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA19017	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA19238	0.0	0.0	0.052	0.261	nan	nan	0	0
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA19625	0.385	0.428	0.023	0.023	0.25	0.25	3	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA19648	0.777	0.863	0.0	0.009	nan	nan	0	1
chrX	40461270	40461776	DEL	507	NA20502	0.585	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG00268	1.257	1.22	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG00419	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG00759	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG01595	1.362	1.322	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG02568	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG02922	1.221	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG03052	1.077	1.046	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	HG03642	0.766	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA12878	0.999	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA18525	1.11	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA18939	1.162	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA19017	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA19238	1.141	1.107	0.0	0.001	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA19625	1.104	1.072	0.01	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA19648	1.346	1.307	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40465562	40465732	DEL	171	NA20502	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG00268	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG00419	1.189	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG00759	1.075	1.132	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG01595	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG02568	1.058	1.113	0.017	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG02922	1.05	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG03052	1.12	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	HG03642	1.078	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA12878	0.844	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA18525	1.146	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA18939	0.904	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA19017	1.174	1.235	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA19238	0.791	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA19625	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA19648	0.57	0.599	0.0	0.017	0.95	0.95	1	1
chrX	40495454	40495512	DEL	59	NA20502	0.679	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG00268	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG00419	1.023	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG01595	0.935	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG02922	0.9	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG03052	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	HG03642	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA12878	0.62	0.62	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA18525	1.183	1.183	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA18939	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA19017	1.062	1.062	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA19238	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA19625	1.13	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA19648	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	40932142	40932816	DEL	675	NA20502	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG00268	1.221	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG00419	0.876	0.804	0.0	0.024	0.49	0.49	1	1
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG00759	0.597	0.548	0.0	0.038	0.543	0.543	1	1
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG01595	1.219	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG02568	1.214	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG02922	1.05	0.963	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG03052	1.357	1.245	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	HG03642	0.862	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA12878	0.81	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA18525	0.673	0.618	0.0	0.042	0.936	0.979	1	1
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA18939	0.572	0.525	0.0	0.034	0.919	0.961	1	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA19017	1.341	1.231	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA19238	1.115	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA19625	1.335	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA19648	0.673	0.617	0.0	0.034	0.815	0.815	1	1
chrX	41057619	41057684	DEL	66	NA20502	0.492	0.451	0.0	0.013	0.645	0.645	1	0
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG00268	0.826	0.869	0.0	0.0	0.87	0.907	3	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG00419	0.668	0.703	0.0	0.0	0.478	0.478	1	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG00759	0.876	0.922	0.0	0.0	0.727	0.727	3	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG01595	0.793	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG02568	0.627	0.66	0.0	0.0	0.354	0.354	2	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG02922	0.771	0.812	0.0	0.005	0.667	0.622	3	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG03052	0.927	0.975	0.0	0.0	0.667	0.667	3	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	HG03642	0.754	0.794	0.0	0.0	0.538	0.538	3	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA12878	1.102	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA18525	0.582	0.613	0.0	0.068	nan	nan	0	1
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA18939	0.959	1.01	0.0	0.0	0.714	0.683	4	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA19017	1.006	1.059	0.0	0.0	0.769	0.769	4	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA19238	0.83	0.873	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA19625	0.899	0.946	0.0	0.0	0.647	0.647	3	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA19648	1.01	1.063	0.0	0.0	0.762	0.762	1	2
chrX	4116403	4116518	DEL	116	NA20502	1.03	1.084	0.0	0.0	0.84	0.84	1	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG00268	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG00419	0.699	0.653	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG00759	1.095	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG01595	1.036	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG02568	0.94	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG02922	1.157	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG03052	0.539	0.503	0.0	0.058	nan	nan	0	1
chrX	4135699	4135814	DEL	116	HG03642	0.838	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA12878	0.827	0.773	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA18525	0.882	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA18939	0.978	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA19017	0.782	0.731	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA19238	0.765	0.715	0.0	0.0	0.958	0.958	1	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA19625	0.616	0.576	0.0	0.022	nan	nan	0	1
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA19648	0.932	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4135699	4135814	DEL	116	NA20502	0.749	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG00268	1.311	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG00419	1.106	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG00759	1.414	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG01595	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG02568	0.744	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG02922	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG03052	0.97	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	HG03642	1.125	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA12878	0.861	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA18525	1.183	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA18939	1.125	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA19017	0.987	0.923	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA19238	0.959	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA19625	0.95	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA19648	1.035	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41431520	41431837	DEL	318	NA20502	1.17	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG00268	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG00419	0.897	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG00759	1.016	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG01595	0.914	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG02568	0.705	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG02922	0.836	0.836	0.0	0.0	0.929	0.867	1	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG03052	0.991	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	HG03642	1.054	1.054	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA12878	0.792	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA18525	1.001	1.001	0.006	0.0	0.541	0.517	1	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA18939	1.291	1.291	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA19017	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA19238	1.115	1.115	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA19625	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA19648	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41571711	41572021	DEL	311	NA20502	1.053	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG00268	0.952	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG00419	0.876	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG00759	0.956	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG01595	0.853	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG02568	1.018	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG02922	0.9	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG03052	0.452	0.415	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	HG03642	0.599	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA12878	0.844	0.774	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA18525	1.074	0.985	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA18939	0.572	0.525	0.0	0.013	0.6	0.627	1	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA19017	0.913	0.837	0.0	0.0	0.727	0.727	1	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA19238	0.83	0.761	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA19625	0.642	0.589	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA19648	0.621	0.57	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	41646759	41646859	DEL	101	NA20502	0.866	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG00268	0.754	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG00419	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG00759	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG01595	0.996	0.996	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG02568	0.509	0.509	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG02922	0.0	0.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG03052	0.539	0.539	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	HG03642	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA12878	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA18525	0.946	0.946	0.0	0.0	0.621	0.594	1	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA18939	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA19017	0.894	0.894	0.0	0.0	0.594	0.594	1	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA19238	1.024	1.024	0.0	0.0	0.83	0.83	1	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA19625	0.719	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA19648	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4234416	4235092	DEL	677	NA20502	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG00268	0.952	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG00419	1.064	1.033	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG00759	0.876	0.851	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG01595	0.914	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG02568	0.705	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG02922	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG03052	0.927	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA12878	1.051	1.02	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA18525	1.019	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA18939	0.738	0.716	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA19017	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA19238	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA19625	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA19648	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43010555	43010674	DEL	120	NA20502	1.217	1.182	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG00268	1.095	1.063	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG00419	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG00759	0.856	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG02922	0.9	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG03052	0.97	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	HG03642	1.293	1.255	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA12878	0.93	0.903	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA18525	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA18939	0.793	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA19017	0.782	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA19238	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA19625	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA19648	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43017706	43017912	DEL	207	NA20502	0.796	0.773	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG00268	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG00419	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG00759	0.757	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG01595	0.853	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG02568	0.705	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG02922	0.761	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG03052	0.808	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	HG03642	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA12878	0.689	0.644	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA18525	0.983	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA18939	0.719	0.672	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA19017	0.857	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA19238	0.765	0.715	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA19625	1.22	1.14	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA19648	0.751	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43612929	43613072	DEL	144	NA20502	0.679	0.634	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG00268	0.592	0.554	0.0	0.027	0.703	0.733	1	1
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG00419	1.231	1.151	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG00759	1.115	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG01595	1.097	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG02568	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG02922	0.814	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG03052	1.293	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	HG03642	0.718	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.043	nan	nan	0	0
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA18525	0.892	0.833	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA18939	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA19017	1.304	1.219	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA19238	1.115	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA19625	0.796	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA19648	0.466	0.435	0.0	0.016	0.727	0.727	1	1
chrX	4379954	4380006	DEL	53	NA20502	0.515	0.481	0.0	0.024	0.962	0.962	1	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG00268	1.113	1.172	0.0	0.0	0.87	0.907	1	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG00419	1.002	1.054	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG00759	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG01595	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG02568	1.058	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG02922	1.028	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG03052	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	HG03642	1.245	1.311	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA12878	0.982	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA18525	1.055	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA18939	0.959	1.01	0.0	0.0	0.78	0.816	6	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA19017	0.857	0.902	0.0	0.0	0.895	0.895	5	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA19238	0.894	0.941	0.0	0.0	0.782	0.782	4	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA19625	1.155	1.216	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA19648	1.113	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43844741	43845580	DEL	840	NA20502	1.007	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG00268	0.09	0.1	0.0	0.063	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG00419	0.511	0.568	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG00759	0.577	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG01595	0.528	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG02568	0.509	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG02922	0.15	0.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG03052	0.474	0.527	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	HG03642	0.527	0.585	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA12878	0.637	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA18525	0.564	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA18939	0.369	0.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA19017	0.727	0.807	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA19238	0.506	0.562	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA19625	0.398	0.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA19648	0.492	0.546	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	43886095	43886212	DEL	118	NA20502	0.328	0.364	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG00268	0.592	0.658	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG00419	0.626	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG00759	0.577	0.642	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG01595	0.671	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG02568	0.666	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG02922	0.814	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG03052	0.733	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	HG03642	0.659	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA12878	1.034	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA18939	0.904	1.004	0.0	0.0	0.909	0.95	1	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA19017	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA19238	0.797	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA19625	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA19648	1.165	1.294	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44331448	44331580	DEL	133	NA20502	1.1	1.222	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG00268	0.898	0.945	0.004	0.0	0.481	0.478	2	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG00419	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG00759	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG01595	0.65	0.684	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG02568	0.783	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG02922	0.986	1.038	0.0	0.0	0.75	0.804	1	1
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG03052	0.733	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	HG03642	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA12878	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA18525	0.819	0.862	0.004	0.0	0.632	0.604	1	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA18939	0.83	0.874	0.0	0.0	0.923	0.965	1	1
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA19017	0.745	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA19238	0.855	0.901	0.0	0.0	0.815	0.815	2	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA19625	1.104	1.162	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA19648	0.854	0.899	0.0	0.0	0.375	0.375	1	2
chrX	44427162	44428047	DEL	886	NA20502	0.89	0.936	0.0	0.0	0.2	0.2	1	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG00268	1.077	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG00419	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG00759	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG01595	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG02568	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG02922	0.836	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG03052	1.034	1.089	0.0	0.0	0.908	0.908	2	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	HG03642	1.125	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA12878	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA18525	1.074	1.13	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA18939	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA19017	0.894	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA19238	0.998	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA19625	1.361	1.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA19648	1.035	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	45423273	45423945	DEL	673	NA20502	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG00268	0.987	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG00419	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG00759	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG01595	0.793	0.769	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG02568	0.979	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG02922	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG03052	1.034	1.004	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	HG03642	0.694	0.674	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA12878	0.724	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA18525	1.055	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA18939	1.144	1.11	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA19017	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA19238	0.907	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA19625	0.822	0.798	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA19648	1.01	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	46661728	46661810	DEL	83	NA20502	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG00268	0.458	0.58	0.0	0.038	0.48	0.501	1	1
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.028	nan	nan	0	1
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG00759	0.677	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG01595	0.427	0.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG02568	0.666	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG02922	0.729	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG03052	0.69	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	HG03642	0.527	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA12878	0.207	0.262	0.0	0.015	1.0	0.955	1	1
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA18525	0.309	0.392	0.0	0.041	0.895	0.935	1	1
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA18939	0.295	0.374	0.0	0.01	0.35	0.366	1	1
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA19017	0.671	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA19238	0.557	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA19625	0.642	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chrX	47093162	47093215	DEL	54	NA20502	0.117	0.148	0.0	0.007	0.25	0.25	1	1
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG00268	0.934	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG00419	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG00759	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG01595	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG02922	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG03052	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	HG03642	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA12878	0.947	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA18525	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA18939	1.051	1.051	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA19017	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA19238	0.778	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA19625	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA19648	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	47353120	47353759	DEL	640	NA20502	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG00268	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG00419	0.584	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG00759	0.478	0.503	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG01595	0.65	0.684	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG02922	0.921	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG03052	1.013	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	HG03642	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA12878	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA18525	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA18939	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA19017	1.025	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA19238	0.817	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA19625	1.078	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA19648	1.01	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	48449189	48449317	DEL	129	NA20502	1.334	1.404	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG00268	1.257	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG00419	1.482	1.359	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG00759	1.135	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG01595	0.894	0.82	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG02568	0.979	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG02922	0.964	0.885	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG03052	1.336	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	HG03642	1.03	0.945	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA12878	0.947	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA18525	0.964	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA18939	1.181	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA19017	0.931	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA19238	0.933	0.856	0.004	0.0	0.947	0.947	1	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA19625	1.515	1.39	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA19648	1.113	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49405260	49405467	DEL	208	NA20502	1.007	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG00268	1.077	1.077	0.0	0.0	0.735	0.767	1	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG00419	1.21	1.21	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG00759	0.796	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG01595	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG02568	0.744	0.744	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG02922	1.093	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG03052	0.797	0.797	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	HG03642	0.982	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA12878	0.965	0.965	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA18525	1.128	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA18939	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA19017	1.025	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA19238	1.037	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA19625	0.976	0.976	0.0	0.0	0.577	0.577	1	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA19648	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	49628078	49628804	DEL	727	NA20502	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG00268	1.418	1.377	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG00419	1.023	0.993	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG00759	1.294	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG01595	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG02568	0.705	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG02922	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG03052	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	HG03642	1.485	1.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA12878	0.758	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA18525	1.656	1.608	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA18939	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA19017	1.267	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA19238	1.348	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA19625	1.284	1.246	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA19648	1.165	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	51326952	51327067	DEL	116	NA20502	1.334	1.295	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG00268	1.508	1.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG00419	1.398	1.472	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG00759	1.354	1.425	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG01595	1.097	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG02568	1.058	1.113	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG02922	1.243	1.308	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG03052	1.293	1.361	0.0	0.009	0.926	0.926	1	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	HG03642	1.173	1.235	0.0	0.0	0.524	0.524	1	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA12878	1.395	1.469	0.0	0.003	0.872	0.913	1	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA18525	1.255	1.322	0.0	0.0	0.806	0.842	1	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA18939	1.144	1.204	0.0	0.002	0.657	0.629	1	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA19017	1.164	1.226	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA19238	1.218	1.283	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA19625	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA19648	1.113	1.172	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	53792163	53792218	DEL	56	NA20502	1.756	1.848	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG00268	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG00419	0.522	0.58	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG00759	0.637	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG01595	0.732	0.813	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG02568	0.783	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG02922	0.729	0.809	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG03052	0.582	0.646	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	HG03642	0.718	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA12878	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA18525	0.255	0.283	0.014	0.048	nan	nan	0	1
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA18939	0.553	0.615	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA19017	0.652	0.724	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA19238	0.739	0.821	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA19625	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA19648	0.777	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53800902	53801312	DEL	411	NA20502	0.655	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG00268	0.7	0.7	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG00419	0.856	0.856	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG00759	0.936	0.936	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG01595	0.853	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG02568	0.588	0.588	0.0	0.0	0.714	0.714	3	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG02922	0.729	0.729	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG03052	0.625	0.625	0.0	0.0	0.909	0.909	2	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	HG03642	0.527	0.527	0.0	0.0	0.864	0.864	2	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA12878	0.758	0.758	0.0	0.0	0.8	0.838	3	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA18525	0.764	0.764	0.01	0.0	0.824	0.861	3	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA18939	0.609	0.609	0.0	0.0	0.875	0.837	3	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA19017	0.801	0.801	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA19238	0.791	0.791	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA19625	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA19648	0.854	0.854	0.0	0.0	0.538	0.538	2	2
chrX	53819547	53820294	DEL	748	NA20502	0.772	0.772	0.0	0.0	0.812	0.812	2	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG00268	1.059	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG00419	1.315	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG00759	1.155	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG01595	1.077	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG02568	1.293	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG02922	1.436	1.317	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG03052	1.056	0.969	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	HG03642	1.245	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA12878	0.896	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA18525	1.292	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA18939	0.812	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA19017	0.987	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA19238	1.115	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA19625	0.899	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA19648	1.191	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54310880	54311004	DEL	125	NA20502	1.147	1.052	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG00268	0.826	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG00419	0.543	0.571	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG00759	0.876	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG01595	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG02922	0.621	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG03052	0.797	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	HG03642	0.718	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA12878	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA18525	0.71	0.747	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA18939	0.812	0.854	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA19017	0.838	0.882	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA19238	0.7	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA19625	0.591	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA19648	0.621	0.654	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54576156	54576222	DEL	67	NA20502	0.632	0.665	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG00268	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG00419	0.918	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG00759	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG01595	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG02568	0.94	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG02922	1.093	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG03052	1.056	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	HG03642	1.078	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA18525	1.164	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA18939	1.254	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA19017	1.202	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA19238	0.92	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA19625	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA19648	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54639392	54639573	DEL	182	NA20502	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG00268	0.826	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG00419	0.918	1.02	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG00759	0.757	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG01595	0.914	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG02568	0.823	0.914	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG02922	1.028	1.143	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG03052	0.754	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	HG03642	0.958	1.064	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA12878	0.861	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA18525	0.691	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA18939	0.812	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA19017	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA19238	0.83	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA19625	0.937	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA19648	0.647	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	54925379	54925430	DEL	52	NA20502	0.772	0.858	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG00268	1.4	1.285	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG00419	1.461	1.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG00759	0.876	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG01595	1.422	1.305	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG02568	0.548	0.503	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG02922	1.2	1.101	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG03052	1.12	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	HG03642	1.413	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA12878	0.896	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA18525	1.31	1.202	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA18939	1.42	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA19017	1.36	1.248	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA19238	1.212	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA19625	1.053	0.966	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA19648	1.178	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5538006	5538065	DEL	60	NA20502	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG00268	0.898	0.872	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG00419	0.981	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG00759	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG02568	0.94	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG02922	0.921	0.895	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG03052	1.013	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	HG03642	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA12878	0.879	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA18525	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA19017	0.838	0.814	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA19238	0.972	0.944	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA19625	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA19648	1.191	1.156	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	55721534	55722200	DEL	667	NA20502	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG00268	0.916	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG00419	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG00759	1.493	1.45	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG01595	0.874	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG02568	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG02922	1.028	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG03052	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	HG03642	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA12878	0.586	0.569	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA18525	0.946	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA18939	0.849	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA19017	1.528	1.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA19238	0.933	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA19625	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA19648	1.165	1.131	0.016	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56875182	56875284	DEL	103	NA20502	1.217	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG00268	0.718	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG00419	1.023	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG00759	0.538	0.522	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG01595	0.589	0.572	0.0	0.0	0.2	0.2	1	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG02568	0.823	0.799	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG02922	0.643	0.624	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG03052	0.539	0.523	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	56981660	56982346	DEL	687	HG03642	0.335	0.325	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA12878	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA18525	0.71	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA18939	0.572	0.555	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA19017	0.745	0.723	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA19238	0.713	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA19625	0.668	0.648	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA19648	0.621	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	56981660	56982346	DEL	687	NA20502	0.796	0.773	0.01	0.0	nan	nan	0	1
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG00268	0.987	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG00419	1.189	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG00759	1.035	1.005	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG01595	0.955	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG02568	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG02922	0.943	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG03052	0.797	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	HG03642	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA12878	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA18939	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA19017	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA19238	1.154	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA19625	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA19648	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5737304	5737475	DEL	172	NA20502	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG00268	0.772	0.813	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG00419	0.876	0.923	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG00759	0.717	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG01595	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG02568	1.371	1.443	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG02922	0.9	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG03052	0.797	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	HG03642	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA12878	0.758	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA18525	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA18939	0.756	0.796	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA19017	1.118	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA19238	0.83	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA19625	0.95	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA19648	1.191	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5739550	5739918	DEL	369	NA20502	0.702	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG00268	1.239	1.239	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG00419	1.44	1.44	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG00759	1.354	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG01595	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG02922	1.35	1.35	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG03052	1.444	1.444	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	HG03642	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA12878	1.154	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA18525	1.019	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA18939	1.015	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA19017	1.08	1.08	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA19238	1.192	1.192	0.0	0.0	0.8	0.8	1	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA19625	1.515	1.515	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA19648	1.113	1.113	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	57514064	57514155	DEL	92	NA20502	1.112	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG00268	0.592	0.624	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG00419	0.803	0.846	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG00759	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG01595	0.691	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG02568	0.431	0.454	0.0	0.0	0.556	0.556	1	1
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG02922	0.557	0.586	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG03052	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	HG03642	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA12878	0.93	0.979	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA18525	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA18939	0.904	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA19017	0.447	0.471	0.0	0.029	0.741	0.741	1	1
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA19238	0.92	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA19625	1.027	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA19648	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5770974	5771039	DEL	66	NA20502	1.1	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG00268	0.916	0.916	0.0	0.0	0.667	0.639	1	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG00419	1.002	1.002	0.0	0.0	0.875	0.875	1	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG00759	1.035	1.035	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG01595	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG02922	0.943	0.943	0.0	0.0	0.765	0.819	1	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG03052	0.905	0.905	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	HG03642	0.958	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA12878	0.982	0.982	0.0	0.0	0.714	0.748	1	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA18525	1.074	1.074	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA18939	1.015	1.015	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA19017	1.174	1.174	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA19238	1.011	1.011	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA19625	1.13	1.13	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA19648	1.191	1.191	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	5913070	5913342	DEL	273	NA20502	1.03	1.03	0.007	0.0	0.857	0.857	1	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG00268	1.059	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG00759	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG01595	0.813	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG02568	0.627	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG02922	0.943	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG03052	0.776	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	HG03642	1.03	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA12878	0.879	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA18525	0.983	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA19017	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA19238	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA19625	0.847	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA19648	0.88	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63097843	63097991	DEL	149	NA20502	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG00268	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG00419	1.106	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG00759	1.095	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG01595	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG02568	1.449	1.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG02922	1.157	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG03052	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	HG03642	0.742	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA12878	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA18525	0.983	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA18939	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA19017	1.174	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA19625	0.899	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA19648	1.243	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63127039	63127378	DEL	340	NA20502	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG00268	0.88	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG00419	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG00759	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG01595	0.833	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG02568	0.783	0.825	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG02922	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG03052	0.668	0.703	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	HG03642	1.006	1.059	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA12878	1.206	1.269	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA18525	0.873	0.919	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA18939	0.941	0.99	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA19017	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA19238	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA19625	0.745	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA19648	0.802	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	63164414	63164516	DEL	103	NA20502	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG00268	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG00419	0.71	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG00759	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG01595	0.975	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG02568	0.862	0.837	0.0	0.0	0.333	0.333	1	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG02922	0.986	0.957	0.0	0.0	0.833	0.893	1	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG03052	1.034	1.004	0.0	0.0	0.769	0.769	1	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	HG03642	1.03	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA18525	0.855	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA19017	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA19238	0.985	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA19625	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA19648	0.802	0.779	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64240820	64241709	DEL	890	NA20502	0.866	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG00268	1.113	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG00419	1.148	1.208	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG00759	1.274	1.341	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG01595	0.935	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG02568	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG02922	1.286	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG03052	1.077	1.134	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	HG03642	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA12878	1.12	1.179	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA18525	0.864	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA18939	1.015	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA19017	0.913	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA19238	1.011	1.064	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA19625	1.463	1.54	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA19648	1.087	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	64615650	64615703	DEL	54	NA20502	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG00268	0.808	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG00419	0.887	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG00759	0.657	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG01595	0.772	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG02568	0.47	0.54	0.018	0.046	nan	nan	0	1
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG02922	0.729	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG03052	0.302	0.347	0.049	0.056	nan	nan	0	1
chrX	65113960	65114553	DEL	594	HG03642	0.67	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA12878	0.827	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA18525	0.837	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA18939	0.793	0.912	0.0	0.0	0.714	0.683	1	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA19017	0.652	0.749	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA19238	0.0	0.0	0.049	0.103	nan	nan	0	0
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA19625	0.282	0.325	0.019	0.054	nan	nan	0	1
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA19648	0.88	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113960	65114553	DEL	594	NA20502	0.726	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG00268	0.826	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG00419	0.835	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG00759	0.637	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG01595	0.772	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG02568	0.353	0.405	0.028	0.066	nan	nan	0	1
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG02922	0.707	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG03052	0.28	0.322	0.054	0.078	nan	nan	0	1
chrX	65113961	65114415	DEL	455	HG03642	0.647	0.743	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA12878	0.741	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA18525	0.855	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA18939	0.812	0.933	0.0	0.0	0.714	0.683	1	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA19017	0.633	0.728	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA19238	0.0	0.0	0.048	0.142	nan	nan	0	0
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA19625	0.257	0.295	0.025	0.077	nan	nan	0	1
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA19648	0.88	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65113961	65114415	DEL	455	NA20502	0.796	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG00268	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG00419	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG00759	1.115	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG01595	1.28	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG02568	0.823	0.769	0.0	0.0	0.462	0.462	1	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG02922	1.243	1.161	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG03052	1.174	1.097	0.0	0.0	0.893	0.893	1	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	HG03642	0.994	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA12878	0.81	0.757	0.0	0.0	0.955	1.0	1	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA18525	1.237	1.156	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA18939	0.978	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA19017	1.397	1.306	0.0	0.0	0.967	0.967	1	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA19238	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA19625	1.207	1.128	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA19648	1.268	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65664331	65664404	DEL	74	NA20502	1.264	1.181	0.0	0.002	0.889	0.889	1	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG00268	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG00419	1.043	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG00759	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG01595	1.138	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG02568	0.901	0.901	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG02922	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG03052	1.077	1.077	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	HG03642	0.766	0.766	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA12878	0.844	0.844	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA18525	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA18939	0.775	0.775	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA19017	0.913	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA19238	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA19625	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA19648	1.087	1.087	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	6587841	6588003	DEL	163	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG00268	1.095	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG00419	0.71	0.651	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG00759	0.956	0.877	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG01595	0.996	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG02568	0.901	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG02922	1.114	1.022	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG03052	0.431	0.395	0.0	0.04	0.773	0.773	1	1
chrX	65918627	65918699	DEL	73	HG03642	1.365	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA12878	0.706	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA18525	0.873	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA18939	0.996	0.914	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA19017	0.764	0.701	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA19238	0.998	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA19625	1.053	0.966	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA19648	1.398	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	65918627	65918699	DEL	73	NA20502	1.03	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG00268	1.185	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG00419	0.897	0.839	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG00759	1.274	1.191	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG01595	1.24	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG02568	1.058	0.988	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG02922	1.007	0.941	0.0	0.0	0.769	0.718	1	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG03052	1.228	1.148	0.012	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	HG03642	1.149	1.074	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA12878	0.947	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA18525	1.164	1.088	0.0	0.003	0.848	0.887	1	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA18939	1.439	1.345	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA19017	1.285	1.201	0.0	0.0	0.256	0.256	1	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA19238	1.192	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA19625	1.463	1.368	0.004	0.0	0.818	0.818	1	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA19648	1.087	1.016	0.0	0.0	0.611	0.611	1	2
chrX	66028246	66029072	DEL	827	NA20502	1.217	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG00268	0.952	0.952	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG00419	0.0	0.0	0.015	0.128	nan	nan	0	0
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.137	nan	nan	0	0
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG01595	0.0	0.0	0.009	0.216	nan	nan	0	1
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG02922	0.771	0.771	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG03052	1.034	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66103777	66103901	DEL	125	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA12878	0.551	0.551	0.0	0.06	nan	nan	0	1
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.175	nan	nan	0	0
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA19017	1.267	1.267	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA19238	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA19625	0.616	0.616	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	0
chrX	66103777	66103901	DEL	125	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.204	nan	nan	0	0
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG00268	0.763	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.24	nan	nan	0	0
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.19	nan	nan	0	0
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.174	nan	nan	0	0
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG02568	0.666	0.74	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG02922	1.178	1.309	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG03052	0.754	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66333799	66333972	DEL	174	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.127	nan	nan	0	0
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA12878	0.586	0.651	0.0	0.047	nan	nan	0	1
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.199	nan	nan	0	0
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.24	nan	nan	0	0
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA19017	0.969	1.076	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA19238	0.817	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA19625	0.539	0.599	0.0	0.061	nan	nan	0	1
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.228	nan	nan	0	1
chrX	66333799	66333972	DEL	174	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.201	nan	nan	0	0
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG00268	0.467	0.453	0.081	0.018	nan	nan	0	1
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG00419	0.981	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG00759	1.016	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG01595	1.118	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG02568	0.862	0.837	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG02922	1.136	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG03052	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	HG03642	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.0	0.433	0.414	1	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA18525	0.892	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA18939	0.941	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA19017	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA19238	0.894	0.868	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA19625	1.284	1.246	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA19648	1.01	0.98	0.0	0.0	0.345	0.345	1	2
chrX	66456716	66457683	DEL	968	NA20502	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG00268	1.131	1.098	0.0	0.0	0.821	0.856	1	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG00419	0.918	0.891	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG00759	0.996	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG01595	0.935	0.908	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG02568	0.94	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG02922	1.028	0.999	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG03052	1.314	1.276	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA12878	0.913	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA18525	1.074	1.042	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA18939	0.904	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA19017	1.025	0.995	0.006	0.0	nan	nan	0	1
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA19238	1.128	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA19625	1.155	1.122	0.0	0.0	0.731	0.731	1	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA19648	1.243	1.206	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chrX	66993442	66994080	DEL	639	NA20502	1.077	1.045	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG00268	0.682	0.822	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG00419	0.605	0.729	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG00759	0.697	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG01595	0.488	0.588	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG02568	0.901	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG02922	0.771	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG03052	0.776	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	HG03642	0.67	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA12878	0.792	0.955	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA18525	0.746	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA18939	0.59	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA19017	0.782	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA19238	0.804	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA19625	0.719	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA19648	0.725	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67058941	67059021	DEL	81	NA20502	1.17	1.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG00268	0.736	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG00419	0.689	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG00759	0.538	0.538	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG01595	0.691	0.691	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG02568	0.666	0.666	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG02922	0.386	0.386	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG03052	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	HG03642	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA12878	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA18525	0.546	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA18939	0.59	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA19017	0.633	0.633	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA19238	0.713	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA19625	0.693	0.693	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA19648	0.57	0.57	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	67135096	67135182	DEL	87	NA20502	0.445	0.445	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG00268	1.095	1.095	0.0	0.0	0.697	0.727	1	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG00419	1.043	1.043	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG00759	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG01595	1.179	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG02568	1.41	1.41	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG02922	0.857	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG03052	1.12	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	HG03642	1.054	1.054	0.0	0.004	0.526	0.526	1	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA12878	0.844	0.844	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA18525	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA18939	1.033	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA19017	0.969	0.969	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA19238	1.154	1.154	0.0	0.0	0.909	0.909	1	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA19625	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA19648	1.165	1.165	0.0	0.005	0.72	0.72	1	2
chrX	67141679	67141784	DEL	106	NA20502	0.866	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG00268	0.664	0.764	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG00419	0.563	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG00759	0.657	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG01595	0.488	0.561	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG02568	0.235	0.27	0.0	0.033	0.857	0.857	1	1
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG02922	0.793	0.911	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG03052	0.625	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	HG03642	0.551	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA12878	0.965	1.109	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA18525	0.582	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA18939	0.48	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA19017	0.745	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA19238	0.765	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA19625	0.591	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA19648	0.466	0.536	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	67934875	67934950	DEL	76	NA20502	0.655	0.753	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG00268	0.521	0.578	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG00419	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG00759	0.657	0.73	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG01595	0.813	0.903	0.0	0.0	0.778	0.778	1	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG02568	0.744	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG02922	0.879	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG03052	0.948	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	HG03642	0.982	1.091	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA12878	0.792	0.88	0.0	0.0	0.789	0.827	1	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA18525	0.782	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA18939	0.627	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA19017	0.913	1.014	0.0	0.0	0.917	0.917	1	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA19238	0.635	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA19625	0.642	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA19648	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	68045255	68045436	DEL	182	NA20502	0.538	0.598	0.0	0.0	0.9	0.9	1	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG00268	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG00419	1.127	1.127	0.0	0.0	0.926	0.926	1	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG00759	1.155	1.155	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG01595	0.975	0.975	0.0	0.0	0.92	0.92	1	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG02922	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG03052	0.948	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	HG03642	1.149	1.149	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA12878	0.861	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	0.727	0.696	1	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA18939	1.107	1.107	0.0	0.0	0.784	0.819	1	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA19017	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA19238	1.167	1.167	0.002	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA19625	1.027	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA19648	1.191	1.191	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69200591	69201379	DEL	789	NA20502	1.007	1.007	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG00268	0.323	0.359	0.0	0.111	nan	nan	0	1
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG00419	0.0	0.0	0.008	0.151	nan	nan	0	0
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG00759	0.299	0.332	0.0	0.085	nan	nan	0	1
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG01595	0.427	0.474	0.009	0.074	nan	nan	0	1
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG02568	1.175	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG02922	0.921	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG03052	0.905	1.006	0.0	0.0	0.545	0.545	1	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	HG03642	0.718	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA12878	0.465	0.517	0.0	0.092	nan	nan	0	1
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA18525	0.801	0.89	0.0	0.0	0.76	0.795	1	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA18939	0.646	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA19017	0.708	0.787	0.0	0.0	0.773	0.773	1	2
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA19238	0.726	0.807	0.0	0.003	0.742	0.742	1	1
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA19625	0.436	0.485	0.0	0.083	nan	nan	0	1
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA19648	0.388	0.431	0.0	0.115	nan	nan	0	1
chrX	69303060	69303274	DEL	215	NA20502	0.421	0.468	0.0	0.08	nan	nan	0	1
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG00268	1.059	0.99	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG00419	1.273	1.19	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG00759	1.294	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG01595	1.26	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG02568	1.058	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG02922	1.114	1.041	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG03052	1.487	1.389	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	HG03642	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA12878	1.223	1.143	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA18525	0.983	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA18939	1.199	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA19017	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA19238	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA19625	1.181	1.104	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA19648	1.527	1.427	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	69842811	69842876	DEL	66	NA20502	1.334	1.247	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG00268	0.718	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG00419	1.127	1.127	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG00759	1.075	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG01595	0.488	0.488	0.085	0.052	nan	nan	0	1
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG02568	0.744	0.744	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG02922	0.6	0.6	0.076	0.034	nan	nan	0	1
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG03052	0.84	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	HG03642	0.335	0.335	0.098	0.045	nan	nan	0	1
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA12878	0.896	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA18525	0.855	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA18939	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA19017	0.969	0.969	0.0	0.0	0.559	0.559	1	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA19238	0.998	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA19625	1.078	1.078	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA19648	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70122996	70123933	DEL	938	NA20502	0.772	0.772	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG00268	0.646	0.718	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG00419	0.396	0.441	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG00759	0.478	0.531	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG01595	0.528	0.587	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG02568	0.744	0.827	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG02922	0.621	0.69	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG03052	0.496	0.551	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	HG03642	0.503	0.559	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA12878	0.775	0.861	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA18525	0.746	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA18939	0.756	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA19017	0.764	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA19238	0.765	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA19625	0.539	0.599	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA19648	0.802	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	70543854	70544799	DEL	946	NA20502	0.515	0.572	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG00268	0.754	0.794	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG00419	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG00759	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG01595	1.036	1.091	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG02922	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG03052	0.819	0.862	0.0	0.0	0.789	0.789	1	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	HG03642	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA12878	0.896	0.943	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA18525	1.001	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA18939	0.922	0.971	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA19017	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA19238	0.92	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA19625	0.796	0.838	0.0	0.0	0.471	0.471	1	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA19648	0.984	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	71357156	71357534	DEL	379	NA20502	0.936	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG00268	0.862	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG00419	0.918	0.891	0.009	0.005	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG00759	0.956	0.928	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG01595	0.874	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG02568	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG02922	0.814	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG03052	0.797	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	HG03642	0.934	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA12878	0.861	0.836	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA18525	0.928	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA18939	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA19017	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA19238	0.868	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA19625	0.976	0.947	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA19648	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72423763	72423821	DEL	59	NA20502	1.077	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG00268	0.754	0.705	0.0	0.0	0.612	0.611	2	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG00419	1.064	0.995	0.0	0.0	0.45	0.45	1	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG00759	0.836	0.782	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG01595	0.711	0.665	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG02568	0.588	0.549	0.0	0.0	0.556	0.556	1	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG02922	0.536	0.501	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG03052	0.776	0.725	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	HG03642	0.91	0.85	0.0	0.0	0.739	0.739	2	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA12878	0.568	0.531	0.0	0.008	0.704	0.737	3	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA18525	1.019	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA18939	1.015	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA19017	0.801	0.749	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA19238	1.024	0.957	0.0	0.0	0.868	0.868	1	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA19625	0.719	0.672	0.0	0.0	0.389	0.389	2	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA19648	0.751	0.702	0.0	0.0	0.615	0.615	5	2
chrX	72581020	72581450	DEL	431	NA20502	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG00268	1.059	1.028	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG00419	1.106	1.074	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG00759	1.115	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG01595	0.772	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG02568	0.901	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG03052	1.12	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	HG03642	1.102	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA12878	0.999	0.97	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA18525	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA18939	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA19017	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA19625	1.104	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA19648	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	72997307	72997441	DEL	135	NA20502	0.632	0.614	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG00268	0.61	0.678	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG00419	0.73	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG00759	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG01595	0.681	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG02568	1.058	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG02922	0.857	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG03052	0.84	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	HG03642	0.814	0.905	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA12878	0.758	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA18525	0.983	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA18939	0.664	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA19017	1.397	1.552	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA19238	0.868	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA19625	0.95	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA19648	0.751	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73022777	73022848	DEL	72	NA20502	1.358	1.509	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG00268	1.041	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG00419	0.876	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG00759	0.836	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG01595	0.813	0.979	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG02568	0.901	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG02922	0.771	0.929	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG03052	0.754	0.909	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	HG03642	0.862	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA12878	0.568	0.685	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA18525	0.91	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA18939	0.812	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA19017	1.062	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA19238	0.752	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA19625	1.104	1.33	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA19648	0.932	1.123	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73400777	73400871	DEL	95	NA20502	0.89	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG00268	1.436	1.394	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG00419	0.918	0.891	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG00759	0.856	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG01595	1.138	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG02568	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG02922	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG03052	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	HG03642	1.006	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA12878	1.068	1.037	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA18525	1.164	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA18939	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA19017	0.969	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA19238	1.011	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA19625	1.309	1.271	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA19648	1.294	1.257	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73426252	73426466	DEL	215	NA20502	1.1	1.068	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG00268	0.898	0.945	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG00419	1.085	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG00759	0.796	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG01595	0.996	1.048	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG02568	0.744	0.783	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG02922	0.707	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG03052	0.668	0.703	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	HG03642	0.958	1.008	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA12878	1.016	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA18525	1.001	1.053	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA18939	0.904	0.951	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA19017	0.857	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA19238	1.063	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA19625	0.745	0.784	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA19648	0.932	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73496220	73496586	DEL	367	NA20502	0.913	0.961	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG00268	0.287	0.33	0.0	0.017	0.533	0.557	1	1
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.061	nan	nan	0	0
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.063	nan	nan	0	0
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG02568	0.705	0.81	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG02922	0.3	0.345	0.0	0.025	0.571	0.612	1	1
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG03052	0.194	0.223	0.0	0.022	0.545	0.545	1	1
chrX	73550319	73550387	DEL	69	HG03642	0.263	0.303	0.0	0.012	nan	nan	0	1
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA12878	0.758	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.053	nan	nan	0	0
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.031	nan	nan	0	0
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA19017	0.242	0.278	0.0	0.025	0.778	0.778	1	1
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA19238	0.843	0.968	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA19625	0.257	0.295	0.0	0.022	0.75	0.75	1	1
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA19648	0.285	0.327	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73550319	73550387	DEL	69	NA20502	0.515	0.592	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG00268	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG00419	1.064	0.995	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG00759	1.294	1.21	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG01595	1.118	1.045	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG02568	1.058	0.988	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG02922	1.264	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG03052	1.357	1.269	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	HG03642	1.317	1.231	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA12878	1.051	0.982	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA18525	1.292	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA18939	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA19017	1.174	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA19238	1.218	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA19625	1.232	1.152	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA19648	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	73816785	73817680	DEL	896	NA20502	1.264	1.181	0.0	0.0	0.576	0.576	1	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG00268	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG00759	0.956	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG01595	1.321	1.321	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG02568	1.371	1.371	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG02922	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG03052	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA12878	0.913	0.913	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA18525	1.055	1.055	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA18939	1.125	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA19017	0.969	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA19238	0.985	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA19625	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA19648	1.243	1.243	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74154573	74154647	DEL	75	NA20502	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG00268	1.113	1.081	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG00419	1.189	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG00759	0.936	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG01595	1.097	1.065	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG02568	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG02922	1.071	1.04	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG03052	1.401	1.36	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	HG03642	0.958	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA12878	0.965	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA18525	1.219	1.184	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA18939	0.885	0.86	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA19017	0.913	0.886	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA19238	1.231	1.196	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA19625	1.489	1.446	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA19648	1.45	1.407	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74249631	74249755	DEL	125	NA20502	1.451	1.409	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG00268	0.754	0.705	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG00419	0.835	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG00759	0.896	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG01595	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG02568	1.116	1.043	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG02922	0.943	0.881	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG03052	1.034	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	HG03642	0.862	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA12878	1.171	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA18525	0.892	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA18939	0.922	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA19017	0.913	0.853	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA19238	1.05	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA19625	1.207	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA19648	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74464226	74464387	DEL	162	NA20502	1.194	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG00268	0.0	0.0	0.0	0.1	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG00759	0.0	0.0	0.0	0.064	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG01595	0.0	0.0	0.0	0.038	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG02568	0.548	0.609	0.0	0.0	0.769	0.769	1	1
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG02922	0.557	0.619	0.0	0.03	0.591	0.633	1	1
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG03052	0.84	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	74599737	74599800	DEL	64	HG03642	0.407	0.452	0.0	0.053	1.0	1.0	1	1
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.052	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA18525	0.0	0.0	0.0	0.067	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA18939	0.0	0.0	0.0	0.049	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA19017	0.0	0.0	0.0	0.089	nan	nan	0	1
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA19238	1.069	1.188	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA19625	0.411	0.456	0.0	0.032	1.0	1.0	1	1
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.046	nan	nan	0	0
chrX	74599737	74599800	DEL	64	NA20502	0.0	0.0	0.0	0.051	nan	nan	0	0
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG00268	0.969	1.021	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG00419	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG00759	0.936	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG01595	0.488	0.513	0.0	0.021	0.808	0.808	1	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG02568	0.588	0.618	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG02922	1.628	1.714	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG03052	1.271	1.338	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	HG03642	0.982	1.033	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA12878	0.947	0.997	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA18525	1.019	1.073	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA18939	0.904	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA19017	1.062	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA19238	1.037	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA19625	1.13	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA19648	1.061	1.117	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75111521	75111583	DEL	63	NA20502	0.679	0.715	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG00268	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG00419	1.002	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG00759	1.513	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG01595	1.097	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG02568	0.705	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG02922	1.543	1.442	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG03052	0.991	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	HG03642	0.838	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA12878	1.171	1.095	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA18525	1.074	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA18939	1.07	1.0	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA19017	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA19238	1.05	0.981	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA19625	0.899	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA19648	0.906	0.847	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75316532	75316821	DEL	290	NA20502	0.819	0.766	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG00268	1.167	1.091	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG00419	1.169	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG00759	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG01595	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG02568	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG02922	1.393	1.302	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG03052	1.056	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	HG03642	1.054	0.985	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA12878	1.189	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA18525	1.346	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA18939	1.162	1.086	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA19017	1.565	1.462	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA19238	1.154	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA19625	1.181	1.104	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA19648	1.217	1.137	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75418334	75418386	DEL	53	NA20502	1.311	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG00268	1.005	0.922	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG00419	1.169	1.072	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG00759	1.235	1.133	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG01595	1.341	1.23	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG02568	0.94	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG02922	1.2	1.101	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG03052	1.12	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	HG03642	1.102	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA12878	1.275	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA18525	0.964	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA18939	0.959	0.88	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA19017	1.285	1.179	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA19238	1.244	1.142	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA19625	1.284	1.178	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA19648	1.372	1.259	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75504175	75504302	DEL	128	NA20502	1.369	1.256	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG00268	1.059	1.059	0.0	0.0	0.694	0.666	1	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG00419	0.96	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG00759	0.777	0.777	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG01595	1.158	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG02568	0.783	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG02922	0.879	0.879	0.0	0.0	0.812	0.871	1	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG03052	1.056	1.056	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	HG03642	1.293	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA12878	1.016	1.016	0.0	0.004	0.667	0.636	1	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA18525	0.892	0.892	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA18939	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA19017	0.708	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA19238	1.063	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA19625	1.001	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA19648	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	75777695	75777807	DEL	113	NA20502	0.89	0.89	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG00268	0.575	0.537	0.0	0.074	nan	nan	0	1
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG00419	0.939	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG00759	0.836	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG01595	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG02568	0.783	0.732	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG02922	0.9	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG03052	0.97	0.906	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	HG03642	0.958	0.895	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA12878	0.345	0.322	0.0	0.08	0.833	0.873	1	1
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA18525	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA18939	1.254	1.172	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA19017	1.08	1.01	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA19238	0.998	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA19625	1.335	1.248	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA19648	1.035	0.968	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76030109	76030285	DEL	177	NA20502	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG00268	0.754	0.838	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG00419	0.981	1.09	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG00759	0.637	0.708	0.0	0.0	0.857	0.857	1	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG01595	0.711	0.79	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG02568	0.666	0.74	0.0	0.008	0.667	0.667	3	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG02922	0.707	0.786	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG03052	0.668	0.742	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	HG03642	1.149	1.277	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA12878	0.551	0.612	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA18525	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA18939	0.627	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA19017	0.652	0.724	0.0	0.0	0.554	0.554	2	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA19238	0.868	0.965	0.0	0.0	0.938	0.938	1	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA19625	0.899	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA19648	1.087	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76170971	76171308	DEL	338	NA20502	0.89	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG00268	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG00419	0.647	0.681	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG00759	0.757	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG01595	0.528	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG02568	0.901	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG02922	0.6	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG03052	0.69	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	HG03642	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA12878	0.792	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA18525	0.6	0.632	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA18939	0.701	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA19017	0.615	0.647	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA19238	0.739	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA19625	0.642	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA19648	0.906	0.954	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	76539575	76539653	DEL	79	NA20502	0.749	0.788	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG00268	0.826	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG00419	0.689	0.765	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG00759	0.896	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG01595	0.63	0.7	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG02568	1.058	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG02922	0.664	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG03052	0.776	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	HG03642	0.79	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA12878	0.844	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA18525	0.855	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA18939	0.627	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA19017	0.633	0.704	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA19238	0.998	1.109	0.0	0.0	0.895	0.895	1	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA19625	0.899	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA19648	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77757016	77757105	DEL	90	NA20502	1.124	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG00268	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG00419	0.981	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG00759	0.856	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG01595	0.874	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG02568	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG02922	0.729	0.767	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG03052	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	HG03642	1.125	1.185	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA12878	1.051	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA18525	1.055	1.111	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA18939	0.978	1.029	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA19017	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA19238	0.959	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA19625	0.693	0.73	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA19648	1.01	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77912083	77912156	DEL	74	NA20502	1.241	1.306	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG00268	1.149	1.116	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG00419	1.148	1.114	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG00759	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG01595	1.219	1.184	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG02568	1.214	1.179	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG02922	1.071	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG03052	1.099	1.067	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	HG03642	0.79	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA12878	0.896	0.87	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA18525	1.346	1.307	0.0	0.0	0.897	0.938	1	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA18939	1.199	1.164	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA19017	0.885	0.859	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA19625	1.412	1.371	0.0	0.0	0.486	0.486	1	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA19648	0.88	0.855	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	77922691	77922926	DEL	236	NA20502	1.241	1.205	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG00268	0.826	0.826	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG00419	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG01595	0.793	0.793	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG02568	1.097	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG02922	1.028	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG03052	0.991	0.991	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	HG03642	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA12878	0.758	0.758	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA18525	1.164	1.164	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA18939	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA19017	1.062	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA19238	1.024	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA19625	1.181	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA19648	1.165	1.165	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78024911	78025278	DEL	368	NA20502	0.831	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG00268	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG00419	0.918	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG00759	0.996	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG01595	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG02568	1.018	1.018	0.0	0.0	1.0	1.0	1	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG02922	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG03052	0.97	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	HG03642	0.838	0.838	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA12878	1.189	1.189	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA18525	0.837	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA18939	1.199	1.199	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA19017	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA19238	0.972	0.972	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA19625	1.258	1.258	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78192990	78193423	DEL	434	NA20502	1.147	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG00268	0.808	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG00419	1.231	1.296	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG00759	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG01595	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG02568	1.214	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG02922	0.729	0.767	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG03052	1.034	1.089	0.0	0.0	0.792	0.792	1	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	HG03642	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA12878	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA18525	0.892	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA18939	0.756	0.796	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA19017	1.043	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA19238	0.83	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA19625	0.873	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA19648	0.777	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78467635	78467721	DEL	87	NA20502	1.03	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG00268	1.203	1.203	0.0	0.0	0.853	0.817	1	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG00419	1.169	1.169	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG00759	0.737	0.737	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG01595	1.118	1.118	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG02568	1.528	1.528	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG02922	0.514	0.514	0.0	0.048	0.667	0.714	1	1
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG03052	0.496	0.496	0.0	0.034	0.901	0.901	2	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	HG03642	0.0	0.0	0.0	0.093	nan	nan	0	0
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA12878	0.431	0.431	0.0	0.056	0.786	0.823	1	1
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA18525	1.255	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA18939	1.061	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA19017	1.006	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA19238	1.063	1.063	0.0	0.0	0.538	0.538	1	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA19625	0.899	0.899	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA19648	1.579	1.579	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78590426	78590497	DEL	72	NA20502	1.124	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG00268	0.467	0.453	0.0	0.015	0.645	0.673	1	1
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG00419	0.584	0.567	0.0	0.021	0.636	0.636	1	1
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG00759	1.085	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG01595	1.24	1.203	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG02568	0.588	0.57	0.0	0.0	0.579	0.579	1	1
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG02922	0.729	0.707	0.0	0.006	0.265	0.284	1	1
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG03052	1.034	1.004	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	HG03642	0.527	0.511	0.0	0.017	0.826	0.826	1	1
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA12878	1.223	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA18525	1.183	1.148	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA18939	1.033	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA19017	0.568	0.552	0.004	0.008	0.897	0.897	1	1
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA19238	0.493	0.478	0.0	0.022	0.721	0.721	1	1
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA19625	0.822	0.798	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA19648	1.139	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78724855	78724910	DEL	56	NA20502	1.217	1.182	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG00268	0.934	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG00419	0.96	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG00759	1.155	1.216	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG01595	0.975	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG02568	0.823	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG03052	0.948	0.998	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	HG03642	1.054	1.109	0.0	0.0	0.816	0.816	2	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA12878	0.792	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA18525	0.801	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA18939	0.867	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA19017	0.708	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA19238	0.752	0.791	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA19625	1.027	1.081	0.0	0.0	0.409	0.409	1	2
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA19648	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	78738314	78738921	DEL	608	NA20502	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG00268	0.925	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG00419	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG00759	0.677	0.713	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG01595	0.853	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG02568	1.097	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG02922	0.879	0.925	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG03052	0.776	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	HG03642	0.742	0.781	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA12878	1.034	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA18525	0.737	0.776	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA18939	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA19017	0.782	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA19238	0.493	0.518	0.0	0.062	0.978	0.978	1	1
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA19625	1.001	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA19648	0.725	0.763	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79120207	79120284	DEL	78	NA20502	0.983	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG00268	1.059	0.99	0.0	0.0	0.871	0.835	1	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG00419	1.273	1.19	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG00759	1.135	1.061	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG01595	0.935	0.874	0.0	0.0	0.696	0.696	1	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG02568	0.979	0.915	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG02922	1.543	1.442	0.0	0.003	0.629	0.587	1	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG03052	1.207	1.128	0.0	0.004	0.893	0.893	1	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	HG03642	1.185	1.108	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA12878	0.93	0.869	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA18525	0.983	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA18939	1.217	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA19017	1.08	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA19238	0.907	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA19625	1.065	0.996	0.0	0.004	0.609	0.609	1	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA19648	1.087	1.016	0.0	0.0	0.68	0.68	1	2
chrX	79207268	79207347	DEL	80	NA20502	0.726	0.678	0.0	0.0	0.688	0.688	1	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG00268	0.557	0.54	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG00419	1.169	1.135	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG00759	0.876	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG01595	0.65	0.631	0.0	0.091	nan	nan	0	1
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG02568	1.175	1.141	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG02922	0.536	0.52	0.0	0.09	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG03052	0.582	0.565	0.007	0.082	nan	nan	0	1
chrX	79222117	79222290	DEL	174	HG03642	1.078	1.046	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA12878	0.982	0.953	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA18525	1.11	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA18939	0.978	0.949	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA19017	1.323	1.284	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA19238	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA19625	0.513	0.499	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA19648	0.725	0.704	0.0	0.071	nan	nan	0	1
chrX	79222117	79222290	DEL	174	NA20502	0.538	0.523	0.01	0.094	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG00268	0.575	0.558	0.0	0.03	0.667	0.696	1	1
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG00419	1.273	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG00759	1.155	1.121	0.0	0.0	0.645	0.645	1	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG01595	0.793	0.769	0.0	0.039	0.765	0.765	1	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG02568	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG02922	0.686	0.666	0.0	0.024	0.76	0.814	1	1
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG03052	0.431	0.418	0.0	0.042	0.88	0.88	1	1
chrX	79238236	79238301	DEL	66	HG03642	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA12878	1.292	1.254	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA18525	1.101	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA18939	1.254	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA19017	1.174	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA19238	1.102	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA19625	0.719	0.698	0.0	0.052	0.607	0.607	1	1
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA19648	0.414	0.402	0.0	0.023	0.8	0.8	1	1
chrX	79238236	79238301	DEL	66	NA20502	0.632	0.614	0.0	0.028	0.828	0.828	1	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG00268	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG00419	1.273	1.273	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG00759	0.856	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG01595	0.874	0.874	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG02568	1.175	1.175	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG02922	0.986	0.986	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG03052	0.883	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	HG03642	1.054	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA12878	0.999	0.999	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA18525	0.782	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA18939	0.812	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA19017	0.838	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA19238	0.739	0.739	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA19625	1.207	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA19648	0.828	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80139055	80139187	DEL	133	NA20502	0.843	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG00268	1.041	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG00419	0.772	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG00759	0.617	0.599	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG01595	1.057	1.026	0.0	0.0	0.667	0.667	1	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG02568	0.627	0.608	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG02922	0.857	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG03052	0.905	0.879	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	HG03642	0.766	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA12878	0.947	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA18525	1.128	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA18939	1.107	1.075	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA19017	0.782	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA19238	0.868	0.843	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA19625	1.181	1.147	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA19648	1.061	1.03	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80242587	80242660	DEL	74	NA20502	0.655	0.636	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG00268	1.382	1.292	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG00419	1.106	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG00759	0.777	0.726	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG01595	0.793	0.741	0.0	0.0	0.56	0.56	1	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG02568	1.058	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG02922	1.028	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG03052	1.013	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	HG03642	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA12878	1.016	0.95	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA18525	0.801	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA18939	0.959	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA19017	1.379	1.288	0.0	0.0	0.944	0.944	3	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA19238	0.972	0.909	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA19625	0.899	0.84	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA19648	0.673	0.629	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80292897	80293209	DEL	313	NA20502	0.866	0.809	0.0	0.0	1.0	1.0	1	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG00268	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG00419	1.085	1.085	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG00759	0.976	0.976	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG01595	0.894	0.894	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG02568	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG02922	0.836	0.836	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG03052	0.862	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	HG03642	1.078	1.078	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA12878	0.81	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA18525	0.946	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA18939	0.904	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA19017	0.876	0.876	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA19238	1.011	1.011	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA19625	1.053	1.053	0.008	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA19648	0.906	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80463065	80464024	DEL	960	NA20502	0.936	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG00268	0.88	0.854	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG00419	0.981	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG00759	1.135	1.102	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG01595	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG02568	0.783	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG02922	0.986	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG03052	1.077	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	HG03642	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA12878	0.999	0.97	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA18525	1.092	1.06	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA18939	0.941	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA19017	1.006	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA19238	0.94	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA19625	1.194	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA19648	0.854	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	80572219	80572994	DEL	776	NA20502	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG00268	0.898	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG00419	0.501	0.501	0.056	0.056	nan	nan	0	1
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG00759	0.0	0.0	0.241	0.228	nan	nan	0	0
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG01595	0.955	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG02568	0.47	0.47	0.059	0.05	nan	nan	0	1
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG02922	0.921	0.921	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG03052	0.0	0.0	0.371	0.326	nan	nan	0	0
chrX	81042501	81043081	DEL	581	HG03642	0.431	0.431	0.105	0.051	nan	nan	0	1
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA12878	0.0	0.0	0.09	0.161	nan	nan	0	0
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA18525	0.764	0.764	0.0	0.0	0.944	0.903	1	2
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA18939	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA19017	0.41	0.41	0.076	0.056	nan	nan	0	1
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA19238	0.0	0.0	0.125	0.262	nan	nan	0	0
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA19625	0.385	0.385	0.077	0.092	nan	nan	0	1
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA19648	1.01	1.01	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81042501	81043081	DEL	581	NA20502	0.328	0.328	0.105	0.073	nan	nan	0	1
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG00268	0.664	0.699	0.0	0.0	0.548	0.541	2	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG00419	0.876	0.923	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG00759	0.836	0.88	0.009	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG01595	0.813	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG02568	0.979	1.031	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG02922	0.664	0.699	0.0	0.0	0.722	0.673	2	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG03052	0.991	1.043	0.0	0.0	0.888	0.888	2	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	HG03642	0.886	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA12878	0.827	0.87	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA18525	0.91	0.958	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA18939	0.83	0.874	0.0	0.0	0.864	0.826	1	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA19017	0.969	1.02	0.0	0.0	0.794	0.794	2	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA19238	0.83	0.873	0.0	0.0	0.714	0.714	1	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA19625	1.053	1.108	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA19648	0.88	0.926	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	8122956	8123780	DEL	825	NA20502	0.843	0.887	0.0	0.0	0.591	0.591	2	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG00268	1.329	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG00419	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG00759	1.095	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG01595	0.874	0.817	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG02568	1.449	1.354	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG02922	0.771	0.721	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG03052	1.379	1.289	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	HG03642	1.006	0.94	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA12878	1.051	0.982	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA18525	1.128	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA18939	1.015	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA19017	1.099	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA19238	1.063	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA19625	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA19648	1.061	0.992	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	81480654	81480706	DEL	53	NA20502	0.772	0.722	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG00268	0.772	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG00419	0.689	0.872	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG00759	0.677	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG01595	0.508	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG02568	0.744	0.942	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG02922	0.579	0.732	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG03052	0.496	0.627	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	HG03642	0.527	0.667	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA12878	0.922	1.167	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA18525	0.655	0.829	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA18939	0.683	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA19017	0.671	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA19238	0.609	0.771	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA19625	0.668	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA19648	0.828	1.049	0.0	0.009	nan	nan	0	2
chrX	82765591	82765694	DEL	104	NA20502	0.655	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG00268	1.293	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG00419	1.169	1.072	0.0	0.0	0.797	0.797	2	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG00759	1.394	1.279	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG01595	0.935	0.858	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG02568	1.058	0.97	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG02922	1.114	1.022	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG03052	1.013	0.929	0.0	0.0	0.833	0.833	2	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	HG03642	1.102	1.011	0.0	0.0	0.641	0.641	2	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA12878	0.724	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA18525	1.074	0.985	0.0	0.0	0.892	0.893	2	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA18939	1.402	1.286	0.0	0.0	0.633	0.606	1	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA19017	1.174	1.077	0.0	0.0	0.922	0.922	2	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA19238	1.257	1.153	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA19625	0.796	0.73	0.0	0.0	0.77	0.77	2	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA19648	1.01	0.926	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	82829510	82830147	DEL	638	NA20502	1.053	0.966	0.0	0.0	1.0	1.0	2	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG00268	0.664	0.738	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG00419	0.647	0.719	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG00759	0.876	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG01595	0.732	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG02568	0.744	0.827	0.0	0.0	0.889	0.889	1	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG02922	0.536	0.595	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG03052	0.927	1.029	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	HG03642	0.886	0.984	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA12878	0.861	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA18525	1.001	1.112	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA18939	0.793	0.881	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA19017	0.745	0.828	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA19238	0.894	0.994	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA19625	1.078	1.198	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA19648	1.087	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	83026888	83027008	DEL	121	NA20502	0.89	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG00268	1.041	1.096	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG00419	1.127	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG00759	1.294	1.362	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG01595	0.813	0.856	0.0	0.06	0.478	0.478	1	1
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG02568	1.684	1.773	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG02922	0.964	1.015	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG03052	1.207	1.27	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	HG03642	0.91	0.958	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA12878	0.379	0.399	0.008	0.069	1.0	0.955	1	1
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA18525	0.946	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA18939	0.775	0.816	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA19017	1.043	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA19238	1.05	1.105	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA19625	1.361	1.432	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA19648	0.57	0.599	0.0	0.019	0.423	0.423	1	1
chrX	84482579	84482666	DEL	88	NA20502	1.124	1.183	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG00268	1.275	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG00419	1.377	1.252	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG00759	1.374	1.249	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG01595	1.219	1.108	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG02568	0.823	0.748	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG02922	0.986	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG03052	1.357	1.234	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	HG03642	1.078	0.98	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA12878	1.016	0.924	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA18525	1.164	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA18939	0.978	0.889	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA19017	0.987	0.898	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA19238	1.128	1.025	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA19625	1.258	1.144	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA19648	1.631	1.483	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84853876	84853938	DEL	63	NA20502	1.217	1.107	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG00268	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG00419	1.21	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG00759	1.434	1.34	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG01595	1.341	1.253	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG02568	1.253	1.171	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG02922	1.028	0.961	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG03052	1.304	1.218	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	HG03642	1.293	1.209	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA12878	1.378	1.288	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA18525	1.083	1.012	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA18939	1.236	1.155	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA19017	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA19238	1.478	1.381	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA19625	1.335	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA19648	0.984	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	84908626	84908705	DEL	80	NA20502	1.217	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG00268	1.275	1.238	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG00419	0.856	0.831	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG00759	1.354	1.315	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG01595	1.24	1.203	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG02568	1.293	1.255	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG03052	1.444	1.402	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	HG03642	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA12878	0.947	0.92	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA18525	0.819	0.795	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA18939	0.775	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA19017	0.689	0.669	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA19238	0.998	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA19625	1.027	0.997	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA19648	0.699	0.679	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85249719	85249791	DEL	73	NA20502	0.843	0.818	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG00268	1.167	1.091	0.004	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG00419	1.085	1.014	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG00759	1.175	1.098	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG01595	1.219	1.139	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG02568	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG02922	1.114	1.041	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG03052	1.099	1.027	0.0	0.0	0.941	0.941	1	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	HG03642	1.173	1.097	0.0	0.0	0.812	0.813	1	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA12878	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA18525	1.074	1.003	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA18939	1.015	0.948	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA19017	1.099	1.027	0.0	0.0	0.962	0.962	1	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA19238	0.985	0.921	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA19625	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA19648	1.113	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85334913	85335481	DEL	569	NA20502	1.217	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG00268	0.7	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG00419	0.689	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG00759	0.976	1.122	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG01595	1.057	1.215	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG02568	0.783	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG02922	0.836	0.961	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG03052	0.345	0.396	0.0	0.032	0.545	0.545	1	1
chrX	85358203	85358261	DEL	59	HG03642	0.479	0.55	0.0	0.016	0.5	0.5	1	1
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA12878	0.706	0.812	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA18525	0.983	1.129	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA18939	0.738	0.848	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA19017	0.391	0.45	0.0	0.033	0.866	0.866	2	1
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA19238	0.259	0.298	0.0	0.03	0.826	0.826	1	1
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA19625	1.027	1.18	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA19648	0.0	0.0	0.0	0.05	nan	nan	0	0
chrX	85358203	85358261	DEL	59	NA20502	0.0	0.0	0.011	0.045	nan	nan	0	0
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG00268	1.203	1.124	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG00419	1.043	0.975	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG00759	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG01595	1.097	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG02568	1.018	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG02922	1.264	1.181	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG03052	0.733	0.685	0.0	0.027	0.256	0.256	1	1
chrX	85725040	85725113	DEL	74	HG03642	0.934	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA12878	0.999	0.934	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA18525	1.001	0.935	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA18939	0.959	0.896	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA19017	0.959	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA19238	0.946	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA19625	0.796	0.744	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA19648	1.217	1.137	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	85725040	85725113	DEL	74	NA20502	0.936	0.875	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG00268	0.934	0.856	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG00419	1.023	0.938	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG00759	1.374	1.261	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG01595	1.036	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG02568	0.94	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG02922	0.9	0.826	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG03052	1.056	0.969	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	HG03642	1.221	1.12	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA12878	0.965	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA18525	0.928	0.851	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA18939	1.042	0.956	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA19017	0.987	0.906	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA19238	1.283	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA19625	1.065	0.977	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA19648	0.751	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85788275	85788408	DEL	134	NA20502	0.772	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG00268	1.041	0.947	0.0	0.0	0.832	0.868	2	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG00419	1.169	1.062	0.0	0.0	0.544	0.544	2	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG00759	1.294	1.177	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG01595	1.118	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG02568	0.744	0.677	0.0	0.015	0.567	0.567	2	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG02922	1.007	0.916	0.0	0.0	0.7	0.75	3	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG03052	1.12	1.019	0.0	0.007	0.597	0.597	2	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	HG03642	1.197	1.088	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA12878	0.706	0.642	0.0	0.0	0.677	0.646	2	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA18525	1.055	0.959	0.0	0.0	0.734	0.767	2	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA18939	1.051	0.956	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA19017	1.36	1.236	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA19238	0.998	0.907	0.0	0.0	0.286	0.286	3	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA19625	0.796	0.724	0.0	0.0	0.444	0.444	1	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA19648	0.906	0.824	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8580581	8580653	DEL	73	NA20502	0.913	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG00268	0.916	0.916	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG00419	0.459	0.459	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG00759	0.717	0.717	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG01595	0.63	0.63	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG02922	1.093	1.093	0.0	0.0	0.833	0.778	1	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG03052	0.711	0.711	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	HG03642	0.886	0.886	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA12878	0.706	0.706	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA18525	0.582	0.582	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA18939	0.83	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA19017	0.801	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA19238	0.648	0.648	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA19625	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA19648	0.673	0.673	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	85934792	85934889	DEL	98	NA20502	0.819	0.819	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG00268	0.969	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG00419	0.0	0.0	0.192	0.277	nan	nan	0	0
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG00759	0.577	0.561	0.016	0.052	nan	nan	0	1
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG01595	0.914	0.888	0.0	0.0	0.917	0.917	2	2
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG02568	0.0	0.0	0.082	0.239	nan	nan	0	0
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG02922	0.621	0.603	0.074	0.058	nan	nan	0	1
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG03052	0.668	0.649	0.053	0.069	nan	nan	0	1
chrX	86286771	86287222	DEL	452	HG03642	1.173	1.139	0.0	0.0	0.975	0.975	2	2
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA12878	0.379	0.368	0.013	0.067	nan	nan	0	1
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA18525	0.782	0.76	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA18939	0.424	0.412	0.034	0.068	nan	nan	0	1
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA19017	0.54	0.525	0.011	0.073	nan	nan	0	1
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA19238	0.0	0.0	0.026	0.217	nan	nan	0	0
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA19625	0.616	0.598	0.046	0.068	nan	nan	0	1
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA19648	1.087	1.056	0.007	0.0	0.797	0.797	2	2
chrX	86286771	86287222	DEL	452	NA20502	0.515	0.5	0.068	0.061	nan	nan	0	1
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG00268	0.969	1.227	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG00419	0.981	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG00759	0.836	1.059	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG01595	0.61	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG02568	0.823	1.041	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG02922	0.664	0.841	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG03052	0.56	0.709	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	HG03642	0.958	1.212	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA12878	0.947	1.199	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA18525	0.855	1.082	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA18939	0.849	1.074	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA19017	0.987	1.25	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA19238	0.959	1.214	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA19625	0.616	0.78	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA19648	0.673	0.852	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8675984	8676042	DEL	59	NA20502	0.655	0.83	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG00268	0.772	0.772	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG00419	0.835	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG00759	0.558	0.558	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG01595	0.894	0.894	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG02568	0.823	0.823	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG02922	0.664	0.664	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG03052	0.754	0.754	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	HG03642	0.91	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA12878	0.896	0.896	0.0	0.0	0.786	0.823	1	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA18525	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA18939	0.756	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA19017	0.633	0.633	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA19238	0.933	0.933	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA19625	0.873	0.873	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA19648	0.751	0.751	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	88419336	88419442	DEL	107	NA20502	0.843	0.843	0.0	0.0	0.631	0.631	2	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG00268	0.916	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG00419	1.106	1.034	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG00759	1.075	1.005	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG01595	1.097	1.026	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG02568	1.645	1.537	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG02922	1.328	1.242	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG03052	0.883	0.826	0.0	0.0	0.579	0.579	1	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	HG03642	0.814	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA12878	0.965	0.902	0.0	0.0	0.8	0.764	1	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA18525	0.892	0.833	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA18939	0.904	0.845	0.0	0.0	0.6	0.627	1	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA19017	1.062	0.992	0.0	0.0	0.943	0.943	2	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA19238	1.102	1.03	0.0	0.0	0.791	0.791	1	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA19625	0.822	0.768	0.0	0.0	0.75	0.75	1	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA19648	1.217	1.137	0.0	0.0	0.85	0.85	1	2
chrX	89320909	89321056	DEL	148	NA20502	1.077	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG00268	0.952	0.952	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG00419	0.626	0.626	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG00759	0.727	0.727	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG01595	0.539	0.539	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG02568	0.94	0.94	0.0	0.013	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG02922	0.707	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG03052	0.668	0.668	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	HG03642	0.85	0.85	0.0	0.01	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA12878	0.655	0.655	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA18525	0.546	0.546	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA18939	0.71	0.71	0.0	0.006	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA19017	0.652	0.652	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA19238	0.752	0.752	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA19625	0.822	0.822	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA19648	0.841	0.841	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	8948436	8948491	DEL	56	NA20502	0.702	0.702	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG00268	1.293	1.208	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG00419	1.21	1.131	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG00759	1.235	1.154	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG01595	1.443	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG02568	1.332	1.245	0.0	0.0	0.5	0.5	1	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG02922	1.221	1.141	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG03052	1.034	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	HG03642	1.173	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA12878	0.896	0.837	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA18525	1.128	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA18939	1.217	1.138	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA19017	0.857	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA19238	1.18	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA19625	1.335	1.248	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA19648	1.372	1.282	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92525640	92526108	DEL	469	NA20502	1.475	1.378	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG00268	0.7	0.778	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG00419	0.543	0.603	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG00759	0.796	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG01595	0.549	0.61	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG02568	0.509	0.566	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG02922	0.471	0.524	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG03052	0.56	0.622	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	HG03642	0.575	0.639	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA12878	0.81	0.9	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA18525	0.691	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA18939	0.59	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA19017	0.764	0.849	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA19238	0.713	0.792	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA19625	0.77	0.856	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA19648	0.595	0.662	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	92574087	92574165	DEL	79	NA20502	0.96	1.066	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG00268	0.754	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG00419	0.835	0.927	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG00759	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG01595	0.488	0.542	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG02568	0.901	1.001	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG02922	0.579	0.643	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG03052	0.733	0.814	0.0	0.0	0.694	0.694	2	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	HG03642	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA12878	0.672	0.746	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA18525	0.691	0.768	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA18939	0.59	0.656	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA19017	0.671	0.745	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA19238	0.804	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA19625	0.693	0.77	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA19648	0.932	1.035	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93149072	93149956	DEL	885	NA20502	0.585	0.65	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG00268	1.131	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG00419	0.939	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG00759	1.095	1.024	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG01595	1.301	1.215	0.0	0.0	0.844	0.844	3	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG02568	0.901	0.842	0.0	0.0	0.818	0.818	3	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG02922	1.071	1.001	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG03052	1.034	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	HG03642	1.054	0.985	0.0	0.0	0.895	0.895	3	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA12878	0.81	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA18525	0.964	0.901	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA18939	1.088	1.017	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA19017	1.174	1.097	0.0	0.0	0.935	0.935	3	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA19238	1.102	1.03	0.0	0.0	0.864	0.864	3	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA19625	1.001	0.936	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA19648	1.45	1.355	0.0	0.0	0.645	0.645	3	2
chrX	93167765	93168395	DEL	631	NA20502	1.17	1.094	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG00268	1.041	0.973	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG00419	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG00759	0.956	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG01595	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG02568	1.058	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG02922	1.264	1.181	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG03052	0.97	0.906	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	HG03642	1.149	1.074	0.0	0.0	0.867	0.867	1	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA12878	0.81	0.757	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA18525	0.91	0.85	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA18939	0.867	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA19017	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA19238	1.063	0.993	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA19625	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA19648	0.984	0.919	0.0	0.0	0.944	0.944	1	2
chrX	93239768	93239936	DEL	169	NA20502	0.89	0.831	0.0	0.0	0.7	0.7	1	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG00268	0.826	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG00419	0.876	0.974	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG00759	0.697	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG01595	0.914	1.016	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG02568	0.744	0.827	0.019	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG02922	0.664	0.738	0.011	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG03052	0.711	0.79	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	HG03642	0.623	0.692	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA12878	0.879	0.976	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA18525	0.637	0.708	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA18939	0.572	0.635	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA19017	0.95	1.056	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA19238	0.855	0.951	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA19625	0.822	0.913	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA19648	0.828	0.92	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93378325	93378391	DEL	67	NA20502	0.936	1.04	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG00268	1.005	0.976	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG00419	0.772	0.75	0.0	0.0	0.875	0.875	2	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG00759	1.016	0.986	0.004	0.0	0.643	0.643	4	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG01595	1.077	1.046	0.0	0.0	0.834	0.834	2	1
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG02568	1.018	0.989	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG02922	0.964	0.936	0.0	0.0	0.941	0.878	1	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG03052	0.991	0.962	0.0	0.0	0.745	0.745	4	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	HG03642	0.91	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA12878	0.947	0.92	0.0	0.0	0.839	0.801	2	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA18525	1.074	1.042	0.0	0.0	0.784	0.75	2	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA18939	1.07	1.039	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA19017	0.745	0.723	0.0	0.0	0.654	0.654	1	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA19238	1.089	1.057	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA19625	1.001	0.972	0.0	0.0	0.609	0.609	1	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA19648	1.243	1.206	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93487027	93488017	DEL	991	NA20502	0.96	0.932	0.0	0.0	0.677	0.677	2	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG00268	1.149	1.074	0.009	0.0	0.795	0.762	1	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG00419	0.918	0.858	0.0	0.0	0.947	0.947	1	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG00759	1.175	1.098	0.003	0.002	nan	nan	0	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG01595	1.057	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG02568	0.862	0.805	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG02922	0.836	0.781	0.0	0.0	1.0	0.933	1	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG03052	0.948	0.886	0.0	0.0	0.644	0.644	2	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	HG03642	0.647	0.604	0.0	0.003	0.636	0.636	3	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA12878	0.724	0.676	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA18525	1.201	1.122	0.0	0.003	0.587	0.592	2	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA18939	1.181	1.103	0.0	0.0	0.79	0.788	2	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA19017	1.08	1.01	0.005	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA19238	0.933	0.872	0.0	0.0	0.923	0.923	1	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA19625	0.77	0.72	0.0	0.0	0.25	0.25	1	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA19648	0.958	0.895	0.0	0.0	0.733	0.733	1	2
chrX	93729484	93730105	DEL	622	NA20502	0.749	0.7	0.0	0.0	0.818	0.818	1	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG00268	0.88	0.822	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG00419	1.106	1.034	0.0	0.007	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG00759	1.513	1.414	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG01595	1.179	1.102	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG02568	1.058	0.988	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG02922	1.05	0.981	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG03052	1.013	0.946	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	HG03642	1.197	1.119	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA12878	1.034	0.966	0.003	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA18525	0.837	0.782	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA18939	1.236	1.155	0.004	0.003	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA19017	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA19238	1.218	1.139	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA19625	1.027	0.96	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA19648	0.984	0.919	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	93742968	93743270	DEL	303	NA20502	0.96	0.897	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG00268	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG00419	0.981	0.917	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG00759	1.135	1.061	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG01595	1.443	1.348	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG02568	0.979	0.915	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG02922	0.964	0.901	0.007	0.004	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG03052	1.12	1.047	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	HG03642	1.149	1.074	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA12878	1.12	1.046	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA18525	0.983	0.918	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA18939	1.033	0.965	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA19017	1.136	1.062	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA19238	1.231	1.151	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA19625	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA19648	0.932	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	94632493	94632853	DEL	361	NA20502	1.1	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG00268	0.79	0.832	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG00419	0.918	0.967	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG00759	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG01595	0.772	0.813	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG02568	0.94	0.99	0.0	0.0	0.833	0.833	1	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG02922	1.028	1.083	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG03052	0.862	0.907	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	HG03642	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA12878	0.879	0.925	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA18525	0.855	0.9	0.006	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA18939	0.849	0.893	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA19017	0.82	0.863	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA19238	0.661	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA19625	1.001	1.054	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA19648	1.01	1.063	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9483027	9483833	DEL	807	NA20502	0.819	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG00268	0.521	0.521	0.079	0.047	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG00419	0.501	0.501	0.052	0.044	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG00759	1.075	1.075	0.0	0.0	0.615	0.615	1	2
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG01595	0.589	0.589	0.091	0.046	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG02568	0.313	0.313	0.092	0.074	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG02922	0.0	0.0	0.196	0.116	nan	nan	0	0
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG03052	0.409	0.409	0.063	0.047	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	HG03642	0.0	0.0	0.266	0.203	nan	nan	0	0
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA12878	0.0	0.0	0.101	0.115	nan	nan	0	0
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA18525	0.509	0.509	0.056	0.046	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA18939	0.941	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA19017	0.503	0.503	0.082	0.041	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA19238	0.959	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA19625	0.462	0.462	0.035	0.028	nan	nan	0	1
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA19648	0.802	0.802	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	95050841	95051476	DEL	636	NA20502	1.17	1.17	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG00268	0.916	0.964	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG00419	0.0	0.0	0.0	0.204	nan	nan	0	0
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG00759	0.319	0.335	0.008	0.099	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG01595	0.65	0.684	0.009	0.069	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG02568	1.253	1.319	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG02922	0.943	0.992	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG03052	0.0	0.0	0.0	0.188	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	HG03642	1.102	1.16	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA12878	0.0	0.0	0.0	0.15	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA18525	0.473	0.498	0.0	0.079	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA18939	0.0	0.0	0.01	0.167	nan	nan	0	0
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA19017	0.54	0.569	0.0	0.109	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA19238	0.48	0.505	0.0	0.072	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA19625	0.565	0.595	0.0	0.076	nan	nan	0	1
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA19648	0.802	0.845	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9698247	9698417	DEL	171	NA20502	1.217	1.281	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG00268	0.682	0.718	0.0	0.002	0.652	0.681	3	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG00419	0.584	0.615	0.007	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG00759	0.577	0.608	0.0	0.0	0.706	0.706	3	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG01595	0.528	0.556	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG02568	0.744	0.783	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG02922	0.493	0.519	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG03052	0.56	0.59	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	HG03642	0.599	0.63	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA12878	0.792	0.834	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA18525	0.782	0.824	0.0	0.0	0.63	0.602	4	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA18939	0.517	0.544	0.0	0.0	0.867	0.906	3	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA19017	0.615	0.647	0.0	0.005	0.714	0.714	1	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA19238	0.765	0.805	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA19625	0.436	0.459	0.0	0.0	0.273	0.273	3	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA19648	0.518	0.545	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97063505	97064183	DEL	679	NA20502	0.304	0.32	0.08	0.028	0.211	0.211	3	1
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG00268	1.149	1.116	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG00419	1.043	1.013	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG00759	0.876	0.851	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG01595	1.158	1.125	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG02568	0.431	0.418	0.031	0.116	nan	nan	0	1
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG02922	1.243	1.207	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG03052	0.97	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	HG03642	1.102	1.069	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA12878	0.93	0.903	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA18525	1.074	1.042	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA18939	0.867	0.842	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA19017	1.155	1.121	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA19238	1.05	1.019	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA19625	0.95	0.922	0.0	0.0	nan	nan	0	1
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA19648	1.061	1.03	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	97167898	97168315	DEL	418	NA20502	1.17	1.136	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG00268	0.736	0.688	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG00419	0.71	0.663	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG00759	0.737	0.689	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG01595	0.975	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG02568	0.588	0.549	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG02922	0.857	0.801	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG03052	0.927	0.866	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	HG03642	0.814	0.761	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA12878	0.965	0.902	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA18525	0.892	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA18939	0.867	0.81	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA19017	0.922	0.862	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA19238	1.024	0.957	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA19625	1.309	1.224	0.0	0.011	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA19648	0.802	0.75	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	97379824	97379889	DEL	66	NA20502	1.007	0.941	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG00268	0.987	1.097	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG00419	0.772	0.858	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG00759	0.796	0.885	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG01595	0.996	1.106	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG02568	1.214	1.349	0.0	0.008	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG02922	0.621	0.69	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG03052	0.754	0.838	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	HG03642	1.125	1.251	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA12878	0.775	0.861	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA18525	0.819	0.91	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA18939	0.627	0.697	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA19017	0.838	0.931	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA19238	0.92	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA19625	0.796	0.884	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA19648	0.984	1.093	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	9805013	9805108	DEL	96	NA20502	0.866	0.962	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG00268	1.059	1.028	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG00419	0.939	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG00759	1.394	1.353	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG01595	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG02568	1.332	1.293	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG02922	1.007	0.978	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG03052	0.797	0.774	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	HG03642	1.054	1.023	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA12878	1.016	0.987	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA18525	1.128	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA18939	1.199	1.164	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA19017	1.08	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA19238	1.27	1.233	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA19625	0.976	0.947	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA19648	1.346	1.307	0.0	0.002	nan	nan	0	2
chrX	98621706	98621774	DEL	69	NA20502	0.96	0.932	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG00268	1.364	1.252	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG00419	1.085	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG00759	1.294	1.187	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG01595	1.199	1.1	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG02568	0.627	0.575	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG02922	1.093	1.003	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG03052	1.293	1.186	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	HG03642	1.557	1.428	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA12878	0.879	0.806	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA18525	0.801	0.734	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA18939	1.144	1.049	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA19017	1.006	0.923	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA19238	1.167	1.07	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA19625	1.335	1.225	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA19648	1.191	1.092	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98760378	98760608	DEL	231	NA20502	1.194	1.095	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG00268	0.844	0.888	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG00419	0.814	0.857	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG00759	0.956	1.006	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG01595	0.752	0.791	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG02568	1.214	1.278	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG02922	0.793	0.835	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG03052	1.099	1.157	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	HG03642	1.03	1.084	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA12878	0.672	0.707	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA18525	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA18939	0.646	0.68	0.0	0.004	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA19017	0.764	0.804	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA19238	0.907	0.955	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA19625	0.976	1.027	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA19648	0.699	0.736	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	98793108	98793214	DEL	107	NA20502	0.866	0.912	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG00268	1.005	0.94	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG00419	0.939	0.878	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG00759	1.394	1.303	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG01595	1.118	1.045	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG02568	0.705	0.659	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG02922	1.393	1.302	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG03052	1.239	1.158	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	HG03642	1.066	0.996	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA12878	1.24	1.159	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA18525	1.164	1.088	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA18939	1.051	0.983	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA19017	1.155	1.079	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA19238	1.244	1.163	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA19625	1.104	1.032	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA19648	0.932	0.871	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99802682	99802737	DEL	56	NA20502	1.065	0.995	0.0	0.005	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG00268	0.916	1.103	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG00419	0.772	0.93	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG00759	0.717	0.864	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG01595	0.671	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG02568	0.627	0.755	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG02922	0.557	0.671	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG03052	0.733	0.883	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	HG03642	0.67	0.808	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA12878	0.741	0.892	0.0	0.003	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA18525	0.691	0.833	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA18939	0.627	0.756	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA19017	0.577	0.696	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA19238	0.778	0.937	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA19625	0.796	0.959	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA19648	0.751	0.904	0.0	0.0	nan	nan	0	2
chrX	99880024	99880118	DEL	95	NA20502	0.936	1.128	0.0	0.0	nan	nan	0	2
