README.rst
setup.cfg
setup.py
bin/sisua-analyze
bin/sisua-train
sisua/__init__.py
sisua/analyze.py
sisua/baselines.py
sisua/cross_analyze.py
sisua/label_threshold.py
sisua/train.py
sisua.egg-info/PKG-INFO
sisua.egg-info/SOURCES.txt
sisua.egg-info/dependency_links.txt
sisua.egg-info/not-zip-safe
sisua.egg-info/requires.txt
sisua.egg-info/top_level.txt
sisua/analysis/__init__.py
sisua/analysis/base.py
sisua/analysis/imputation_benchmarks.py
sisua/analysis/latent_benchmarks.py
sisua/analysis/protein_benchmark.py
sisua/analysis/results_sheet.py
sisua/analysis/sc_metrics.py
sisua/analysis/sc_monitor.py
sisua/data/__init__.py
sisua/data/const.py
sisua/data/normalization_recipes.py
sisua/data/path.py
sisua/data/single_cell_dataset.py
sisua/data/sisua_to_scvi.py
sisua/data/utils.py
sisua/data/data_loader/__init__.py
sisua/data/data_loader/cbmc_CITEseq.py
sisua/data/data_loader/centenarian.py
sisua/data/data_loader/dataset10x.py
sisua/data/data_loader/facs_gene_protein.py
sisua/data/data_loader/fashion_mnist.py
sisua/data/data_loader/mnist.py
sisua/data/data_loader/pbmc8k.py
sisua/data/data_loader/pbmc_CITEseq.py
sisua/data/data_loader/pbmcecc.py
sisua/data/data_loader/scvi_datasets.py
sisua/data/experimental_data/__init__.py
sisua/data/experimental_data/pbmc_8k_ecc_ly.py
sisua/inference/__init__.py
sisua/inference/_consts.py
sisua/inference/inference_base.py
sisua/inference/inference_dca.py
sisua/inference/inference_scvi.py
sisua/models/__init__.py
sisua/models/autoencoder.py
sisua/models/base.py
sisua/models/latents.py
sisua/models/networks.py
sisua/models/scscope_models.py
sisua/models/scvi_models.py
sisua/models/semi_supervised.py
sisua/models/variational_autoencoder.py
sisua/utils/__init__.py
sisua/utils/io_utils.py
sisua/utils/others.py
sisua/utils/plot_utils.py
sisua/utils/visualization.py