LICENSE
README.md
pyproject.toml
setup.cfg
setup.py
resmico/__init__.py
resmico/__main__.py
resmico/add_stats.py
resmico/bam2feat
resmico/bam2feat.py
resmico/contig_reader.cpp
resmico/contig_reader.hpp
resmico/contig_reader.py
resmico/evaluate.py
resmico/filter_contigs.py
resmico/models_fl.py
resmico/reader.cpp
resmico/reader.pyx
resmico/setup.py
resmico/train_binary_data.py
resmico/utils.py
resmico.egg-info/PKG-INFO
resmico.egg-info/SOURCES.txt
resmico.egg-info/dependency_links.txt
resmico.egg-info/entry_points.txt
resmico.egg-info/requires.txt
resmico.egg-info/top_level.txt
resmico/commands/__init__.py
resmico/commands/arguments.py
resmico/commands/bam2feat.py
resmico/commands/evaluate.py
resmico/commands/filter_contigs.py
resmico/commands/train.py
resmico/model/resmico.h5
resmico/model/stats_cov.json
resmico/tests/__init__.py
resmico/tests/test_bam2feat.py
resmico/tests/test_contig_reader.py
resmico/tests/test_evaluate.py
resmico/tests/test_filter.py
resmico/tests/test_models_fl.py
resmico/tests/test_train.py
resmico/tests/data/__init__.py
resmico/tests/data/format_data.py