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pytantan/_mask.py
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pytantan/_version.py
pytantan/lib.pyi
pytantan/lib.pyx
pytantan/py.typed
pytantan.egg-info/PKG-INFO
pytantan.egg-info/SOURCES.txt
pytantan.egg-info/dependency_links.txt
pytantan.egg-info/not-zip-safe
pytantan.egg-info/requires.txt
pytantan.egg-info/top_level.txt
pytantan/platform/__init__.pxd
pytantan/platform/__init__.py
pytantan/platform/pxd.in
pytantan/platform/pyx.in
pytantan/tantan/__init__.pxd
pytantan/tantan/alphabet.pxd
pytantan/tantan/lc.pxd
pytantan/tantan/options.pxd
pytantan/tantan/score_matrix.pxd
pytantan/tantan/utils.pxd
pytantan/tantan/version.hh
pytantan/tests/__init__.py
pytantan/tests/test_alphabet.py
pytantan/tests/test_doctest.py
pytantan/tests/test_mask.py
pytantan/tests/test_repeat_finder.py
vendor/tantan/COPYING.txt
vendor/tantan/Makefile
vendor/tantan/README.rst
vendor/tantan/src/LambdaCalculator.cc
vendor/tantan/src/LambdaCalculator.hh
vendor/tantan/src/Makefile
vendor/tantan/src/cbrc_linalg.cc
vendor/tantan/src/cbrc_linalg.hh
vendor/tantan/src/mcf_alphabet.cc
vendor/tantan/src/mcf_alphabet.hh
vendor/tantan/src/mcf_fasta_sequence.cc
vendor/tantan/src/mcf_fasta_sequence.hh
vendor/tantan/src/mcf_score_matrix.cc
vendor/tantan/src/mcf_score_matrix.hh
vendor/tantan/src/mcf_simd.hh
vendor/tantan/src/mcf_tantan_options.cc
vendor/tantan/src/mcf_tantan_options.hh
vendor/tantan/src/mcf_util.cc
vendor/tantan/src/mcf_util.hh
vendor/tantan/src/mcf_zstream.hh
vendor/tantan/src/tantan.cc
vendor/tantan/src/tantan.hh
vendor/tantan/src/tantan_app.cc
vendor/tantan/src/tantan_repeat_finder.cc
vendor/tantan/src/tantan_repeat_finder.hh