Metadata-Version: 2.1
Name: proteinko
Version: 4.0
Summary: Proteinko is used for modeling distributions of psysicochemical properties of proteins
Home-page: https://github.com/stefs304/proteinko
Author: Stefan Stojanovic
Author-email: stefs304@gmail.com
License: UNKNOWN
Description: # Протеинко 🇷🇸
        
        Протеинко се користи за моделовање дистрибуција хемијског састава као и 
        физикохемисјксих особина пептида.
        
        ---
        
        ### О Протеинку
        
        Протеин или пептид је секвенца амино киселина повезаних пептидним везама. Свака 
        аминокиселина окарактерисана је сопственим хемијски саставом и последично 
        одређеним физикохемијским особинама. 
        
        Помоћу Протеинка можемо моделовати дистрибуцију хемисјког састава пептида и 
        на тај начин преставити протеин као скуп једнодимензионих вектора од који сваки 
        представља дистрибуцију једног хемијсог елемента или једне физичке или хемијске 
        особине. 
        
        Главна особина али и ограничење Протеинка је то што подразумева линеарну или 
        близу линеарну тродимензионалну структуру протеина, односно да протеин у 
        свом природном окружењу или интеракцијама не заузума комплексну 
        глобуларну структуру. 
        
        Протеинко дакле пружа могућност изоловања одређених особина 
        линеарних пептида ради упоређивања са другим пептидима или откривања скривених 
        законитости у структури или интеракцијама. Најзначајније је то што Протеинко 
        омогућава представљање прептида на нумерички начин што отвара могућност 
        за коришћење различитих софтвера и алгоритама за манупулацију нумеричким 
        подацима.
        
        
        ![plot1](https://raw.githubusercontent.com/stefs304/proteinko/dev/resources/plot1.png)
        
        Протеинко може да моделује следеће особине:
        * Хемијски састав (C, H, N, O, S)
        * Хидрофобност
        * Донорске водоничне везе
        * Акцепторске водоничне везе
        * Изоелектрични потенцијал
        * Ван дер Валсов волумен, тј. запремина
        
        ### Инсталација
        ```bash
        pip install proteinko
        ```
        
        ### Употреба
        
        ```python
        from proteinko import Proteinko
        
        prot = Proteinko()
        
        # Излистај све подржане шеме
        prot.schemas
        
        # Моделуј дистрибуцију пептида, по једној од шема
        dist = prot.get_dist('ILKEPVHGV', schema='hydropathy')
        ```
        
Platform: UNKNOWN
Classifier: Programming Language :: Python :: 3.7
Classifier: Programming Language :: Python :: 3.6
Classifier: Programming Language :: Python :: 3.5
Classifier: Programming Language :: Python :: 3
Classifier: Programming Language :: Python :: 2.7
Classifier: Programming Language :: Python :: 2
Classifier: License :: OSI Approved :: MIT License
Classifier: Intended Audience :: Science/Research
Classifier: Intended Audience :: Healthcare Industry
Classifier: Topic :: Scientific/Engineering :: Bio-Informatics
Classifier: Topic :: Scientific/Engineering :: Chemistry
Description-Content-Type: text/markdown
