LICENSE.txt
README.md
pyproject.toml
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src/phylogenie/_typeguards.py
src/phylogenie/_typings.py
src/phylogenie/_utils.py
src/phylogenie/draw.py
src/phylogenie/main.py
src/phylogenie/msa.py
src/phylogenie/py.typed
src/phylogenie/tree_node.py
src/phylogenie.egg-info/PKG-INFO
src/phylogenie.egg-info/SOURCES.txt
src/phylogenie.egg-info/dependency_links.txt
src/phylogenie.egg-info/entry_points.txt
src/phylogenie.egg-info/requires.txt
src/phylogenie.egg-info/top_level.txt
src/phylogenie/generators/__init__.py
src/phylogenie/generators/_configs.py
src/phylogenie/generators/_factories.py
src/phylogenie/generators/_typeguards.py
src/phylogenie/generators/alisim.py
src/phylogenie/generators/dataset.py
src/phylogenie/generators/trees.py
src/phylogenie/io/__init__.py
src/phylogenie/io/fasta.py
src/phylogenie/io/newick.py
src/phylogenie/io/nexus.py
src/phylogenie/skyline/__init__.py
src/phylogenie/skyline/matrix.py
src/phylogenie/skyline/parameter.py
src/phylogenie/skyline/vector.py
src/phylogenie/treesimulator/__init__.py
src/phylogenie/treesimulator/core.py
src/phylogenie/treesimulator/gillespie.py
src/phylogenie/treesimulator/parameterizations/__init__.py
src/phylogenie/treesimulator/parameterizations/common.py
src/phylogenie/treesimulator/parameterizations/open_population.py
src/phylogenie/treesimulator/parameterizations/sir.py