LICENSE
README.md
pyproject.toml
setup.cfg
src/phamerate/SequenceDB.py
src/phamerate/__init__.py
src/phamerate/__main__.py
src/phamerate/cli.py
src/phamerate/clustalo.py
src/phamerate/mmseqs.py
src/phamerate/multiprocess.py
src/phamerate/pangenome.py
src/phamerate/subprocess.py
src/phamerate.egg-info/PKG-INFO
src/phamerate.egg-info/SOURCES.txt
src/phamerate.egg-info/dependency_links.txt
src/phamerate.egg-info/entry_points.txt
src/phamerate.egg-info/requires.txt
src/phamerate.egg-info/top_level.txt
src/phamerate/fileio/__init__.py
src/phamerate/fileio/fasta.py
src/phamerate/fileio/genbank.py