LICENSE
README.md
pyproject.toml
setup.cfg
nellie/__init__.py
nellie/run.py
nellie.egg-info/PKG-INFO
nellie.egg-info/SOURCES.txt
nellie.egg-info/dependency_links.txt
nellie.egg-info/entry_points.txt
nellie.egg-info/requires.txt
nellie.egg-info/top_level.txt
nellie/feature_extraction/__init__.py
nellie/feature_extraction/hierarchical.py
nellie/im_info/__init__.py
nellie/im_info/im_info.py
nellie/segmentation/__init__.py
nellie/segmentation/filtering.py
nellie/segmentation/labelling.py
nellie/segmentation/mocap_marking.py
nellie/segmentation/networking.py
nellie/tracking/__init__.py
nellie/tracking/all_tracks_for_label.py
nellie/tracking/flow_interpolation.py
nellie/tracking/hu_tracking.py
nellie/tracking/voxel_reassignment.py
nellie/utils/__init__.py
nellie/utils/base_logger.py
nellie/utils/general.py
nellie/utils/gpu_functions.py
nellie/utils/torch_xp.py
nellie_napari/__init__.py
nellie_napari/batch_mode.py
nellie_napari/home.py
nellie_napari/logo.png
nellie_napari/napari.yaml
nellie_napari/nellie_analysis.py
nellie_napari/nellie_fileselect.py
nellie_napari/nellie_loader.py
nellie_napari/nellie_processor.py
nellie_napari/visualizer.py
tests/__init__.py
tests/unit/__init__.py
tests/unit/test_frangi_filter.py
tests/unit/test_im_info.py