Metadata-Version: 2.4
Name: MtbDb
Version: 0.0.1
Summary: MtbDb: Genomics Database Toolkit for Mycobacterium Tuberculosis.
Author-email: HengyuZhou <zhouhengyu23@mails.ucas.ac.cn>
Project-URL: Homepage, https://github.com/16627517673/mtbdb
Classifier: Programming Language :: Python :: 3
Classifier: License :: OSI Approved :: Apache Software License
Classifier: Operating System :: OS Independent
Requires-Python: >=3.8
Description-Content-Type: text/markdown
License-File: LICENSE
Requires-Dist: intervaltree>=3.0.2
Requires-Dist: numpy>=1.20.0
Requires-Dist: pandas>=1.2.0
Requires-Dist: scipy>=1.6.0
Requires-Dist: statsmodels>=0.12.0
Dynamic: license-file

# MtbDb: Genomics Database Toolkit for Mycobacterium Tuberculosis

MtbDb是一个专门为结核分枝杆菌（Mycobacterium Tuberculosis）基因组分析设计的Python工具包，提供了结核菌基因组数据库的高效查询和分析功能。

## 功能特性

- 🧬 结核菌基因组数据库查询
- 📊 基因变异分析(TBVA)
- 🔍 基因表达分析(TBGEA)
- 📈 统计分析和可视化
- 🔗 支持多种数据格式

## 安装

### 从TestPyPI安装
```bash
pip install -i https://test.pypi.org/simple/ MtbDb
```

### 从源码安装
```bash
git clone https://github.com/16627517673/mtbdb.git
cd mtbdb
pip install -e .
```

## 系统要求

- Python >= 3.8
- 依赖包：intervaltree, numpy, pandas, scipy, statsmodels

## 快速开始

```python
import mtbdb

# 基本使用示例
# TODO: 添加具体的使用示例
```

## 许可证

本项目采用 Apache License 2.0 许可证。详见 [LICENSE](LICENSE) 文件。

## 作者

HengyuZhou (zhouhengyu23@mails.ucas.ac.cn)

## 项目主页

https://github.com/16627517673/mtbdb
