--------------------------------------------------
Third party dependencies for backend component listed by License type
[Format: Name Version License URL]
--------------------------------------------------

 Name                 Version    License                                            URL
 boto3                1.21.29    Apache Software License                            https://github.com/boto/boto3
 botocore             1.24.29    Apache Software License                            https://github.com/boto/botocore
 importlib-metadata   4.11.3     Apache Software License                            https://github.com/python/importlib_metadata
 prometheus-client    0.8.0      Apache Software License                            https://github.com/prometheus/client_python
 pyOpenSSL            22.0.0     Apache Software License                            https://pyopenssl.org/
 s3transfer           0.5.2      Apache Software License                            https://github.com/boto/s3transfer
 tornado              6.1        Apache Software License                            http://www.tornadoweb.org/
 cryptography         36.0.2     Apache Software License; BSD License               https://github.com/pyca/cryptography
 packaging            21.3       Apache Software License; BSD License               https://github.com/pypa/packaging
 python-dateutil      2.8.2      Apache Software License; BSD License               https://github.com/dateutil/dateutil
 PySocks              1.7.1      BSD                                                https://github.com/Anorov/PySocks
 Flask                2.0.1      BSD License                                        https://palletsprojects.com/p/flask
 Jinja2               3.1.1      BSD License                                        https://palletsprojects.com/p/jinja/
 MarkupSafe           2.1.1      BSD License                                        https://palletsprojects.com/p/markupsafe/
 Werkzeug             2.0.3      BSD License                                        https://palletsprojects.com/p/werkzeug/
 amqp                 2.6.1      BSD License                                        http://github.com/celery/py-amqp
 billiard             3.6.4.0    BSD License                                        https://github.com/celery/billiard
 celery               4.4.7      BSD License                                        http://celeryproject.org
 click                8.1.0      BSD License                                        https://palletsprojects.com/p/click/
 flower               0.9.7      BSD License                                        https://github.com/mher/flower
 idna                 3.3        BSD License                                        https://github.com/kjd/idna
 itsdangerous         2.1.2      BSD License                                        https://palletsprojects.com/p/itsdangerous/
 kombu                4.6.11     BSD License                                        https://kombu.readthedocs.io
 numpy                1.21.5     BSD License                                        https://www.numpy.org
 pycparser            2.21       BSD License                                        https://github.com/eliben/pycparser
 scipy                1.7.0      BSD License                                        https://www.scipy.org
 vine                 1.3.0      BSD License                                        http://github.com/celery/vine
 biopython            1.78       Freely Distributable                               https://biopython.org/
 uWSGI                2.0.19.1   GNU General Public License v2 or later (GPLv2+)    https://uwsgi-docs.readthedocs.io/en/latest/
 brotlipy             0.7.0      MIT                                                https://github.com/python-hyper/brotlipy/
 dnachisel            3.2.6      MIT                                                https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/DnaChisel
 flametree            0.1.11     MIT                                                https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/Flametree
 proglog              0.1.9      MIT - copyright Edinburgh Genome Foundry           UNKNOWN
 Flask-Cors           3.0.10     MIT License                                        https://github.com/corydolphin/flask-cors
 attrs                21.4.0     MIT License                                        https://www.attrs.org/
 cffi                 1.15.0     MIT License                                        http://cffi.readthedocs.org
 docopt               0.6.2      MIT License                                        http://docopt.org
 humanize             4.0.0      MIT License                                        https://github.com/jmoiron/humanize
 iniconfig            1.1.1      MIT License                                        http://github.com/RonnyPfannschmidt/iniconfig
 jmespath             1.0.0      MIT License                                        https://github.com/jmespath/jmespath.py
 loguru               0.5.3      MIT License                                        https://github.com/Delgan/loguru
 pluggy               0.13.1     MIT License                                        https://github.com/pytest-dev/pluggy
 py                   1.11.0     MIT License                                        https://py.readthedocs.io/
 pydantic             1.8.1      MIT License                                        https://github.com/samuelcolvin/pydantic
 pyparsing            3.0.7      MIT License                                        https://github.com/pyparsing/pyparsing/
 pytest               6.2.2      MIT License                                        https://docs.pytest.org/en/latest/
 pytz                 2022.1     MIT License                                        http://pythonhosted.org/pytz
 redis                3.5.3      MIT License                                        https://github.com/andymccurdy/redis-py
 six                  1.16.0     MIT License                                        https://github.com/benjaminp/six
 toml                 0.10.2     MIT License                                        https://github.com/uiri/toml
 urllib3              1.26.9     MIT License                                        https://urllib3.readthedocs.io/
 zipp                 3.7.0      MIT License                                        https://github.com/jaraco/zipp
 tqdm                 4.63.1     MIT License; Mozilla Public License 2.0 (MPL 2.0)  https://tqdm.github.io
 certifi              2021.10.8  Mozilla Public License 2.0 (MPL 2.0)               https://certifiio.readthedocs.io/en/latest/
 python-codon-tables  0.1.10     Public Domain                                      https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/codon-usage-tables
 typing-extensions    4.1.1      Python Software Foundation License                 https://github.com/python/typing/blob/master/typing_extensions/README.rst
 ca-certificates      2021.10.8  ISC License
 icu                  68.2       MIT License
 jansson              2.14       MIT License
 libcxx               13.0.1     Apache-2.0 WITH LLVM-exception License
 libffi               3.4.2      MIT License
 libiconv             1.16       GPL and LGPL License
 libxml2              2.9.12     MIT
 libzlib              1.2.11     Zlib
 llvm-openmp          13.0.1     NCSA
 markupsafe           2.1.1      BSD-3-Clause
 ncurses              6.3        X11 AND BSD-3-Clause
 pcre                 8.45       BSD-3-Clause
 pip                  21.0.1     MIT
 python               3.7.12     Python-2.0
 python_abi           3.7-2      BSD-3-Clause
 readline             8.1        GPL-3.0-only
 setuptools           61.3.0     MIT
 sqlite               3.37.1     Unlicense
 tk                   8.6.12     TCL
 viennarna            2.4.17     MIT
 wheel                0.37.1     MIT
 xz                   5.2.5      LGPL-2.1 and GPL-2.0
 yaml                 0.2.5      MIT
 zlib                 1.2.11     Zlib

--------------------------------------------------
Third party dependencies for frontend component listed by License type
[Format: Module name Version License URL]
--------------------------------------------------

json-schema	0.4.0	(AFL-2.1 OR BSD-3-Clause)	https://github.com/kriszyp/json-schema
harmony-reflect	1.6.2	(Apache-2.0 OR MPL-1.1)	git+https://tvcutsem	github.com/tvcutsem/harmony-reflect
node-forge	1.3.1	(BSD-3-Clause OR GPL-2.0)	https://github.com/digitalbazaar/forge
type-fest	0.20.2	(MIT OR CC0-1.0)	https://github.com/sindresorhus/type-fest
jszip	3.7.1	(MIT OR GPL-3.0-or-later)	https://github.com/Stuk/jszip
tslib	1.14.1	0BSD	https://github.com/Microsoft/tslib
fornac	1.1.8	Apache*	https://github.com/pkerpedjiev/fornac
aria-query	4.2.2	Apache-2.0	https://github.com/A11yance/aria-query
axobject-query	2.2.0	Apache-2.0	https://github.com/A11yance/axobject-query
typescript	4.6.3	Apache-2.0	https://github.com/Microsoft/TypeScript
crc-32	1.2.1	Apache-2.0	https://github.com/SheetJS/js-crc32
exit-on-epipe	1.0.1	Apache-2.0	https://github.com/SheetJS/node-exit-on-epipe
printj	1.3.1	Apache-2.0	https://github.com/SheetJS/printj
readdir-glob	1.1.1	Apache-2.0	https://github.com/Yqnn/node-readdir-glob
	ampproject/remapping	2.1.2	Apache-2.0	https://github.com/ampproject/remapping
acorn-node	1.8.2	Apache-2.0	https://github.com/browserify/acorn-node
walker	1.0.8	Apache-2.0	https://github.com/daaku/nodejs-walker
	xtuc/long	4.2.2	Apache-2.0	https://github.com/dcodeIO/long.js
didyoumean	1.2.2	Apache-2.0	https://github.com/dcporter/didyoumean.js
human-signals	2.1.0	Apache-2.0	https://github.com/ehmicky/human-signals
doctrine	3.0.0	Apache-2.0	https://github.com/eslint/doctrine
eslint-visitor-keys	3.3.0	Apache-2.0	https://github.com/eslint/eslint-visitor-keys
bser	2.1.1	Apache-2.0	https://github.com/facebook/watchman
fb-watchman	2.0.1	Apache-2.0	https://github.com/facebook/watchman
faye-websocket	0.11.4	Apache-2.0	https://github.com/faye/faye-websocket-node
websocket-driver	0.7.4	Apache-2.0	https://github.com/faye/websocket-driver-node
websocket-extensions	0.1.4	Apache-2.0	https://github.com/faye/websocket-extensions-node
	humanwhocodes/config-array	0.9.5	Apache-2.0	https://github.com/humanwhocodes/config-array
jake	10.8.4	Apache-2.0	https://github.com/jakejs/jake
fast-diff	1.2.0	Apache-2.0	https://github.com/jhchen/fast-diff
xml-name-validator	3.0.0	Apache-2.0	https://github.com/jsdom/xml-name-validator
ansi-html-community	0.0.8	Apache-2.0	https://github.com/mahdyar/ansi-html-community
ejs	3.1.6	Apache-2.0	https://github.com/mde/ejs
filelist	1.0.2	Apache-2.0	https://github.com/mde/filelist
	surma/rollup-plugin-off-main-thread	2.2.3	Apache-2.0	https://github.com/surma/rollup-plugin-off-main-thread
	webassemblyjs/leb128	1.11.1	Apache-2.0	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
escodegen	1.2.0	BSD	https://github.com/Constellation/escodegen
estraverse	1.5.1	BSD	https://github.com/Constellation/estraverse
esutils	1.0.0	BSD	https://github.com/Constellation/esutils
esprima	1.0.4	BSD	https://github.com/ariya/esprima
source-map	0.1.43	BSD	https://github.com/mozilla/source-map
dotenv-expand	5.1.0	BSD-2-Clause
domutils	1.7.0	BSD-2-Clause	https://github.com/FB55/domutils
eslint-scope	5.1.1	BSD-2-Clause	https://github.com/eslint/eslint-scope
espree	9.3.1	BSD-2-Clause	https://github.com/eslint/espree
esrecurse	4.3.0	BSD-2-Clause	https://github.com/estools/esrecurse
css-select	2.1.0	BSD-2-Clause	https://github.com/fb55/css-select
css-what	3.4.2	BSD-2-Clause	https://github.com/fb55/css-what
domelementtype	1.3.1	BSD-2-Clause	https://github.com/fb55/domelementtype
domhandler	4.3.1	BSD-2-Clause	https://github.com/fb55/domhandler
entities	2.2.0	BSD-2-Clause	https://github.com/fb55/entities
nth-check	1.0.2	BSD-2-Clause	https://github.com/fb55/nth-check
glob-to-regexp	0.4.1	BSD-2-Clause	https://github.com/fitzgen/glob-to-regexp
uri-js	4.4.1	BSD-2-Clause	https://github.com/garycourt/uri-js
webidl-conversions	3.0.1	BSD-2-Clause	https://github.com/jsdom/webidl-conversions
regjsparser	0.8.4	BSD-2-Clause	https://github.com/jviereck/regjsparser
browser-process-hrtime	1.0.0	BSD-2-Clause	https://github.com/kumavis/browser-process-hrtime
dotenv	10.0.0	BSD-2-Clause	https://github.com/motdotla/dotenv
default-gateway	6.0.3	BSD-2-Clause	https://github.com/silverwind/default-gateway
damerau-levenshtein	1.0.8	BSD-2-Clause	https://github.com/tad-lispy/node-damerau-levenshtein
terser	5.12.1	BSD-2-Clause	https://github.com/terser/terser
	typescript-eslint/parser	5.17.0	BSD-2-Clause	https://github.com/typescript-eslint/typescript-eslint
	typescript-eslint/typescript-estree	5.17.0	BSD-2-Clause	https://github.com/typescript-eslint/typescript-eslint
stringify-object	3.3.0	BSD-2-Clause	https://github.com/yeoman/stringify-object
amdefine	1.0.1	BSD-3-Clause OR MIT	https://github.com/jrburke/amdefine
source-map-js	1.0.2	BSD-3-Clause	https://github.com/7rulnik/source-map-js
sprintf-js	1.0.3	BSD-3-Clause	https://github.com/alexei/sprintf.js
filesize	8.0.7	BSD-3-Clause	https://github.com/avoidwork/filesize.js
d3-array	2.12.1	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-array
d3-color	2.0.0	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-color
d3-format	2.0.0	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-format
d3-interpolate	2.0.1	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-interpolate
d3-path	2.0.0	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-path
d3-scale	3.3.0	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-scale
d3-shape	2.1.0	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-shape
d3-time	2.1.1	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-time
d3-time-format	3.0.0	BSD-3-Clause	https://github.com/d3/d3-time-format
makeerror	1.0.12	BSD-3-Clause	https://github.com/daaku/nodejs-makeerror
tmpl	1.0.5	BSD-3-Clause	https://github.com/daaku/nodejs-tmpl
duplexer2	0.1.4	BSD-3-Clause	https://github.com/deoxxa/duplexer2
esquery	1.4.0	BSD-3-Clause	https://github.com/estools/esquery
draft-js	0.10.5	BSD-3-Clause	https://github.com/facebook/draft-js
immutable	3.7.6	BSD-3-Clause	https://github.com/facebook/immutable-js
	xtuc/ieee754	1.2.0	BSD-3-Clause	https://github.com/feross/ieee754
ieee754	1.2.1	BSD-3-Clause	https://github.com/feross/ieee754
eslint-plugin-flowtype	8.0.3	BSD-3-Clause	https://github.com/gajus/eslint-plugin-flowtype
	humanwhocodes/object-schema	1.2.1	BSD-3-Clause	https://github.com/humanwhocodes/object-schema
babel-plugin-istanbul	6.1.1	BSD-3-Clause	https://github.com/istanbuljs/babel-plugin-istanbul
istanbul-lib-coverage	3.2.0	BSD-3-Clause	https://github.com/istanbuljs/istanbuljs
istanbul-lib-instrument	5.1.0	BSD-3-Clause	https://github.com/istanbuljs/istanbuljs
istanbul-lib-report	3.0.0	BSD-3-Clause	https://github.com/istanbuljs/istanbuljs
istanbul-lib-source-maps	4.0.1	BSD-3-Clause	https://github.com/istanbuljs/istanbuljs
istanbul-reports	3.1.4	BSD-3-Clause	https://github.com/istanbuljs/istanbuljs
abab	2.0.5	BSD-3-Clause	https://github.com/jsdom/abab
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	babel/helper-plugin-utils	7.16.7	MIT	https://github.com/babel/babel
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	typescript-eslint/utils	5.17.0	MIT	https://github.com/typescript-eslint/typescript-eslint
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source-list-map	2.0.1	MIT	https://github.com/webpack/source-list-map
tapable	2.2.1	MIT	https://github.com/webpack/tapable
watchpack	2.3.1	MIT	https://github.com/webpack/watchpack
webpack	5.70.0	MIT	https://github.com/webpack/webpack
webpack-dev-middleware	5.3.1	MIT	https://github.com/webpack/webpack-dev-middleware
webpack-dev-server	4.7.4	MIT	https://github.com/webpack/webpack-dev-server
webpack-sources	3.2.3	MIT	https://github.com/webpack/webpack-sources
ws	7.5.7	MIT	https://github.com/websockets/ws
ipaddr.js	2.0.1	MIT	https://github.com/whitequark/ipaddr.js
acorn-import-assertions	1.8.0	MIT	https://github.com/xtuc/acorn-import-assertions
charcodes	0.2.0	MIT	https://github.com/xtuc/charcodes
	webassemblyjs/ast	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/floating-point-hex-parser	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/helper-api-error	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/helper-buffer	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/helper-numbers	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/helper-wasm-bytecode	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/helper-wasm-section	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/ieee754	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/utf8	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/wasm-edit	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/wasm-gen	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/wasm-opt	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/wasm-parser	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
	webassemblyjs/wast-printer	1.11.1	MIT	https://github.com/xtuc/webassemblyjs
eslint-plugin-react	7.29.4	MIT	https://github.com/yannickcr/eslint-plugin-react
yargs	16.2.0	MIT	https://github.com/yargs/yargs
add-dom-event-listener	1.1.0	MIT	https://github.com/yiminghe/add-dom-event-listener
async-validator	1.11.5	MIT	https://github.com/yiminghe/async-validator
css-animation	1.6.1	MIT	https://github.com/yiminghe/css-animation
dom-align	1.12.2	MIT	https://github.com/yiminghe/dom-align
dom-scroll-into-view	1.2.1	MIT	https://github.com/yiminghe/dom-scroll-into-view
ms	2.1.2	MIT	https://github.com/zeit/ms
loose-envify	1.4.0	MIT	https://github.com/zertosh/loose-envify
v8-compile-cache	2.3.0	MIT	https://github.com/zertosh/v8-compile-cache
json-parse-better-errors	1.0.2	MIT	https://github.com/zkat/json-parse-better-errors
core-js-compat	3.21.1	MIT	https://github.com/zloirock/core-js
core-js-pure	3.21.1	MIT	https://github.com/zloirock/core-js
core-js	2.6.12	MIT	https://github.com/zloirock/core-js
common-tags	1.8.2	MIT	https://github.com/zspecza/common-tags
component-indexof	0.0.3	MIT*	https://github.com/component/indexof
	react-pdf/pdfkit	2.1.0	MIT*	https://github.com/diegomura/react-pdf
	react-pdf/png-js	2.1.0	MIT*	https://github.com/diegomura/react-pdf
blob	0.0.4	MIT*	https://github.com/rase-/blob
traverse	0.3.9	MIT*	https://github.com/substack/js-traverse
chainsaw	0.1.0	MIT*	https://github.com/substack/node-chainsaw
axe-core	4.4.1	MPL-2.0	https://github.com/dequelabs/axe-core
language-subtag-registry	0.3.21	ODC-By-1.0	https://github.com/mattcg/language-subtag-registry
argparse	2.0.1	Python-2.0	https://github.com/nodeca/argparse
mrnaid	1.0.0	UNLICENSED
big-integer	1.6.51	Unlicense	https://github.com/peterolson/BigInteger.js
fs-monkey	1.0.3	Unlicense	https://github.com/streamich/fs-monkey
memfs	3.4.1	Unlicense	https://github.com/streamich/memfs

--------------------------------------------------

NOTE #1: Although we try to keep this libraries list current, the latest
information about mRNAid third party libraries can be found by running the
following command(s) with activated virtual environment. However some licences
can be shown as UNKNOWN which needs to be handled manually.

# for backend use this command
# if pip-licences is not installed you can install it with command: 'pip install pip-licenses'
pip-licenses --with-urls --order=license

# for frontend use this command
# potentially install license-checker with this command: 'npm install -g license-checker'
license-checker --csv --direct| sort -k 2 -t ','| tr -d \" | tr ',' '\t'| tr '@' '\t'

--------------------------------------------------
