LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
requirements-optional.txt
requirements.txt
setup.py
./magenpy/AnnotationMatrix.py
./magenpy/GWADataLoader.py
./magenpy/GenotypeMatrix.py
./magenpy/SampleTable.py
./magenpy/SumstatsTable.py
./magenpy/__init__.py
./magenpy/plot.py
./magenpy/config/paths.ini
./magenpy/data/1000G_eur_chr22.bed
./magenpy/data/1000G_eur_chr22.bim
./magenpy/data/1000G_eur_chr22.fam
./magenpy/data/ukb_height_chr22.fastGWA.gz
./magenpy/parsers/__init__.py
./magenpy/parsers/misc_parsers.py
./magenpy/parsers/plink_parsers.py
./magenpy/parsers/sumstats_parsers.py
./magenpy/simulation/AnnotatedGWASimulator.py
./magenpy/simulation/GWASimulator.py
./magenpy/simulation/MulticohortGWASimulator.py
./magenpy/simulation/__init__.py
./magenpy/stats/__init__.py
./magenpy/stats/gwa/__init__.py
./magenpy/stats/gwa/utils.py
./magenpy/stats/h2/__init__.py
./magenpy/stats/h2/ldsc.py
./magenpy/stats/ld/__init__.py
./magenpy/stats/ld/estimator.py
./magenpy/stats/ld/utils.py
./magenpy/stats/score/__init__.py
./magenpy/stats/score/utils.py
./magenpy/stats/transforms/__init__.py
./magenpy/stats/transforms/genotype.py
./magenpy/stats/transforms/phenotype.py
./magenpy/stats/variant/__init__.py
./magenpy/stats/variant/utils.py
./magenpy/utils/__init__.py
./magenpy/utils/compute_utils.py
./magenpy/utils/data_utils.py
./magenpy/utils/executors.py
./magenpy/utils/model_utils.py
./magenpy/utils/system_utils.py
bin/magenpy_ld
bin/magenpy_simulate
magenpy/.DS_Store
magenpy/AnnotationMatrix.py
magenpy/GWADataLoader.py
magenpy/GenotypeMatrix.py
magenpy/LDMatrix.pyx
magenpy/SampleTable.py
magenpy/SumstatsTable.py
magenpy/__init__.py
magenpy/plot.py
magenpy.egg-info/PKG-INFO
magenpy.egg-info/SOURCES.txt
magenpy.egg-info/dependency_links.txt
magenpy.egg-info/not-zip-safe
magenpy.egg-info/requires.txt
magenpy.egg-info/top_level.txt
magenpy/config/paths.ini
magenpy/data/1000G_eur_chr22.bed
magenpy/data/1000G_eur_chr22.bim
magenpy/data/1000G_eur_chr22.fam
magenpy/data/ukb_height_chr22.fastGWA.gz
magenpy/parsers/__init__.py
magenpy/parsers/misc_parsers.py
magenpy/parsers/plink_parsers.py
magenpy/parsers/sumstats_parsers.py
magenpy/simulation/AnnotatedGWASimulator.py
magenpy/simulation/GWASimulator.py
magenpy/simulation/MulticohortGWASimulator.py
magenpy/simulation/__init__.py
magenpy/stats/__init__.py
magenpy/stats/gwa/__init__.py
magenpy/stats/gwa/utils.py
magenpy/stats/h2/__init__.py
magenpy/stats/h2/ldsc.py
magenpy/stats/ld/__init__.py
magenpy/stats/ld/c_utils.pyx
magenpy/stats/ld/estimator.py
magenpy/stats/ld/utils.py
magenpy/stats/score/__init__.py
magenpy/stats/score/utils.py
magenpy/stats/transforms/__init__.py
magenpy/stats/transforms/genotype.py
magenpy/stats/transforms/phenotype.py
magenpy/stats/variant/__init__.py
magenpy/stats/variant/utils.py
magenpy/utils/__init__.py
magenpy/utils/compute_utils.py
magenpy/utils/data_utils.py
magenpy/utils/executors.py
magenpy/utils/model_utils.py
magenpy/utils/system_utils.py