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pyproject.toml
setup.py
MACS3/__init__.py
MACS3.egg-info/PKG-INFO
MACS3.egg-info/SOURCES.txt
MACS3.egg-info/dependency_links.txt
MACS3.egg-info/requires.txt
MACS3.egg-info/top_level.txt
MACS3/Commands/__init__.py
MACS3/Commands/bdgbroadcall_cmd.py
MACS3/Commands/bdgcmp_cmd.py
MACS3/Commands/bdgdiff_cmd.py
MACS3/Commands/bdgopt_cmd.py
MACS3/Commands/bdgpeakcall_cmd.py
MACS3/Commands/callpeak_cmd.py
MACS3/Commands/callvar_cmd.py
MACS3/Commands/cmbreps_cmd.py
MACS3/Commands/diffpeak_cmd.py
MACS3/Commands/filterdup_cmd.py
MACS3/Commands/pileup_cmd.py
MACS3/Commands/predictd_cmd.py
MACS3/Commands/randsample_cmd.py
MACS3/Commands/refinepeak_cmd.py
MACS3/IO/BAM.pyx
MACS3/IO/BedGraphIO.pyx
MACS3/IO/OutputWriter.py
MACS3/IO/Parser.pyx
MACS3/IO/PeakIO.pyx
MACS3/IO/__init__.py
MACS3/Signal/BedGraph.pyx
MACS3/Signal/CallPeakUnit.pyx
MACS3/Signal/FixWidthTrack.pyx
MACS3/Signal/PairedEndTrack.pyx
MACS3/Signal/PeakDetect.pyx
MACS3/Signal/PeakModel.pyx
MACS3/Signal/PeakVariants.pyx
MACS3/Signal/Pileup.pyx
MACS3/Signal/PosReadsInfo.pyx
MACS3/Signal/Prob.pyx
MACS3/Signal/RACollection.pyx
MACS3/Signal/ReadAlignment.pyx
MACS3/Signal/ScoreTrack.pyx
MACS3/Signal/SignalProcessing.pyx
MACS3/Signal/UnitigRACollection.pyx
MACS3/Signal/VariantStat.pyx
MACS3/Signal/__init__.py
MACS3/Signal/cPosValCalculation.c
MACS3/Signal/cPosValCalculation.h
MACS3/Signal/cPosValCalculation.pxd
MACS3/Signal/swalign.c
MACS3/Signal/swalign.h
MACS3/Utilities/Constants.py
MACS3/Utilities/OptValidator.py
MACS3/Utilities/__init__.py
MACS3/fermi-lite/bfc.c
MACS3/fermi-lite/bseq.c
MACS3/fermi-lite/bubble.c
MACS3/fermi-lite/example.c
MACS3/fermi-lite/fml.h
MACS3/fermi-lite/htab.c
MACS3/fermi-lite/htab.h
MACS3/fermi-lite/internal.h
MACS3/fermi-lite/khash.h
MACS3/fermi-lite/kmer.h
MACS3/fermi-lite/kseq.h
MACS3/fermi-lite/ksort.h
MACS3/fermi-lite/kstring.h
MACS3/fermi-lite/ksw.c
MACS3/fermi-lite/ksw.h
MACS3/fermi-lite/kthread.c
MACS3/fermi-lite/kvec.h
MACS3/fermi-lite/mag.c
MACS3/fermi-lite/mag.h
MACS3/fermi-lite/misc.c
MACS3/fermi-lite/mrope.c
MACS3/fermi-lite/mrope.h
MACS3/fermi-lite/rld0.c
MACS3/fermi-lite/rld0.h
MACS3/fermi-lite/rle.c
MACS3/fermi-lite/rle.h
MACS3/fermi-lite/rope.c
MACS3/fermi-lite/rope.h
MACS3/fermi-lite/unitig.c
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