LICENSE
MANIFEST.in
README.md
setup.cfg
setup.py
limix/__init__.py
limix.egg-info/PKG-INFO
limix.egg-info/SOURCES.txt
limix.egg-info/dependency_links.txt
limix.egg-info/entry_points.txt
limix.egg-info/not-zip-safe
limix.egg-info/requires.txt
limix.egg-info/top_level.txt
limix/data/__init__.py
limix/data/bed_reader.py
limix/iSet/__init__.py
limix/iSet/iset.py
limix/iSet/linalg_utils.py
limix/iSet/mvSet.py
limix/iSet/mvSetFull.py
limix/iSet/mvSetInc.py
limix/io/__init__.py
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limix/io/plink.py
limix/io/examples/__init__.py
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limix/io/examples/data/gen/example.gen
limix/io/examples/data/gen/example.sample
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limix/io/test/test_readers.py
limix/io/test/data/csv/pheno.csv
limix/io/test/data/gen/example.gen
limix/io/test/data/gen/example.sample
limix/io/test/data/hdf5/data.h5
limix/mtSet/__init__.py
limix/mtSet/mtset.py
limix/mtSet/core/__init__.py
limix/mtSet/core/analyzeCore.py
limix/mtSet/core/definesetsCore.py
limix/mtSet/core/iset_utils.py
limix/mtSet/core/plink_reader.py
limix/mtSet/core/postprocessCore.py
limix/mtSet/core/preprocessCore.py
limix/mtSet/core/read_utils.py
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limix/plot/__init__.py
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limix/qtl/__init__.py
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limix/qtl/qtl.py
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limix/scripts/iSet_analyze.py
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limix/scripts/limix_runner.py
limix/scripts/mtSet_analyze.py
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limix/scripts/mtSet_postprocess.py
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limix/scripts/test/test_mtSet_simPheno.py
limix/stats/__init__.py
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limix/util/__init__.py
limix/util/geno_utils.py
limix/util/preprocess.py
limix/util/set_utils.py
limix/util/temp.py
limix/util/url.py
limix/util/util_functions.py
limix/varDecomp/__init__.py
limix/varDecomp/varianceDecomposition.py