MANIFEST.in
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setup.py
galgo/__init__.py
galgo/__main__.py
galgo/bioseq.py
galgo/blast.py
galgo/igv.py
galgo/interval.py
galgo/job_queue.py
galgo/matrix.py
galgo/plot.py
galgo/samutil.py
galgo/sh.py
galgo/sselogsumexp.c
galgo/utils.py
galgo.egg-info/PKG-INFO
galgo.egg-info/SOURCES.txt
galgo.egg-info/dependency_links.txt
galgo.egg-info/entry_points.txt
galgo.egg-info/requires.txt
galgo.egg-info/top_level.txt
galgo/alignment/__init__.py
galgo/alignment/basics.c
galgo/covfit/__init__.py
galgo/covfit/gmm_v2.c
galgo/covfit/pmm.c
galgo/tools/__init__.py
galgo/tools/assoc.py
galgo/tools/bam.py
galgo/tools/bam_aln.py
galgo/tools/bam_profile.py
galgo/tools/bam_summary.py
galgo/tools/bam_summary2.py
galgo/tools/bedg_binned_smooth.py
galgo/tools/blast.py
galgo/tools/covfit_gmm.py
galgo/tools/covfit_gmm_v2.py
galgo/tools/covfit_pmm.py
galgo/tools/fasta.py
galgo/tools/feature.py
galgo/tools/gc_profile.py
galgo/tools/igv.py
galgo/tools/imgt.py
galgo/tools/misc.py
galgo/tools/msa.py
galgo/tools/segdup.py
galgo/tools/vcf.py
scripts/bed2chain.py
src/logsumexp.c
src/logsumexp.h
src/sse_mathfun.h