二酸化炭素の放出・吸収量（フラックス）を解析する方法として、輸送モデル（forward model）と逆解法（inversion method）を組み合わせた研究が近年実施されるようになってきた。地球圏−生物圏国際協同研究計画（IGBP）主催の大気トレーサー輸送モデル相互比較計画（TransCom）は、多数の輸送モデルを用いることによって、逆解法を用いて炭素収支を解析する際に輸送モデルの違いに起因する不確かさ（uncertainty）を解明するためのプロジェクトである（Gurney et al., 2000）。 本報告における二酸化炭素放出量の解析は同プロジェクトで実施された手法（Baker et al., 2006）におおむね準拠しており、以下に概要を示す。前提条件として、(1)式で表される行列式によって観測データ行列dは各領域からの放出を表す行列mと大気輸送行列G（輸送モデルの結果を用いる）の積で表されると仮定する。
両式においてdobsは基礎放出量（化石燃料の燃焼及び陸上生態系・海洋との二酸化炭素交換から推定される放出量）の寄与を除いた各観測所の月平均濃度行列、Cdは各観測所の月平均濃度の標準偏差行列を示し、mpは各領域からの放出量の第一推定値行列、Cmは放出量第一推定値の標準偏差行列を示す。また、添字Tは転置行列を、-1は逆行列を示す。逆解法の具体的な手順は以下のとおりである。
本報告の解析においては、温室効果ガス世界資料センター（WDCGG）が収集した二酸化炭素月平均値を逆解法を用いた選別を行い利用している。データ選別手法（Maki et al., 2005）は以下のとおりである。
各観測地点に対して、解析期間（1984〜2005年）について、欠測値を内挿もしくは外挿で補完したデータセットを作成する。この際、連続した観測が一定期間以上ない観測地点は解析から除外される。観測値の不確かさは、フィッティングカーブと実測値の標準偏差で与えた。ただし、欠測分のデータは、大きな不確かさを与えて解析から実質的に除外した。