LICENSE
MANIFEST.in
README.rst
setup.cfg
setup.py
bio_hansel/__init__.py
bio_hansel/const.py
bio_hansel/main.py
bio_hansel/metadata.py
bio_hansel/parsers.py
bio_hansel/subtype.py
bio_hansel/subtype_stats.py
bio_hansel/subtyper.py
bio_hansel/subtyping_params.py
bio_hansel/utils.py
bio_hansel.egg-info/PKG-INFO
bio_hansel.egg-info/SOURCES.txt
bio_hansel.egg-info/dependency_links.txt
bio_hansel.egg-info/entry_points.txt
bio_hansel.egg-info/not-zip-safe
bio_hansel.egg-info/requires.txt
bio_hansel.egg-info/top_level.txt
bio_hansel/aho_corasick/__init__.py
bio_hansel/data/enteritidis/kmers.fasta
bio_hansel/data/heidelberg/kmers.fasta
bio_hansel/data/tb_lineage/kmers.fasta
bio_hansel/data/tb_lineage/metadata.tsv
bio_hansel/data/typhi/kmers.fasta
bio_hansel/data/typhi/metadata.tsv
bio_hansel/data/typhimurium/kmers.fasta
bio_hansel/qc/__init__.py
bio_hansel/qc/checks.py
bio_hansel/qc/const.py
bio_hansel/qc/utils.py