LICENSE
README.md
setup.py
autopeptideml/__init__.py
autopeptideml/autopeptideml.py
autopeptideml/config.py
autopeptideml/main.py
autopeptideml.egg-info/PKG-INFO
autopeptideml.egg-info/SOURCES.txt
autopeptideml.egg-info/dependency_links.txt
autopeptideml.egg-info/entry_points.txt
autopeptideml.egg-info/not-zip-safe
autopeptideml.egg-info/requires.txt
autopeptideml.egg-info/top_level.txt
autopeptideml/data/__init__.py
autopeptideml/data/readme_ex.md
autopeptideml/db/__init__.py
autopeptideml/db/db.py
autopeptideml/pipeline/__init__.py
autopeptideml/pipeline/pipeline.py
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autopeptideml/pipeline/smiles.py
autopeptideml/reps/__init__.py
autopeptideml/reps/engine.py
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autopeptideml/reps/lms.py
autopeptideml/reps/seq_based.py
autopeptideml/reps/utils/__init__.py
autopeptideml/reps/utils/peptideclm_tokenizer.py
autopeptideml/train/__init__.py
autopeptideml/train/architectures.py
autopeptideml/train/metrics.py
autopeptideml/train/trainer.py
autopeptideml/train/deep_learning/__init__.py
autopeptideml/train/deep_learning/dataset.py
autopeptideml/train/deep_learning/loss.py
autopeptideml/train/deep_learning/model.py
tests/test_apml.py
tests/test_db.py
tests/test_pipeline.py
tests/test_reps.py